AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780036427.01


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MsG0780036427.01.T01 AT3G26280 41.548 491 270 10 48 529 15 497 4.15e-121 365
MsG0780036427.01.T01 AT3G26180 41.344 491 270 11 48 529 16 497 1.10e-120 364
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MsG0780036427.01.T01 AT4G37360 31.992 472 292 12 65 526 29 481 1.45e-69 232
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MsG0780036427.01.T01 AT4G15350 30.485 433 289 5 77 501 45 473 2.08e-66 224
MsG0780036427.01.T01 AT3G52970 29.817 493 310 12 60 522 30 516 6.27e-66 223
MsG0780036427.01.T01 AT5G10610 30.655 473 311 8 63 531 29 488 1.83e-65 221
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MsG0780036427.01.T01 AT3G52970 29.730 481 312 12 60 522 30 502 2.81e-65 221
MsG0780036427.01.T01 AT4G31950 30.952 504 306 15 47 526 13 498 7.84e-65 219
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MsG0780036427.01.T01 AT2G46660 30.787 445 284 13 69 504 73 502 1.11e-64 219
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MsG0780036427.01.T01 AT3G20080 28.635 447 304 6 66 503 42 482 6.29e-61 209
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MsG0780036427.01.T01 AT3G61880 29.011 455 298 13 59 502 60 500 1.86e-59 206
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MsG0780036427.01.T01 AT2G22330 25.840 476 338 7 48 510 40 513 5.81e-55 194
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MsG0780036427.01.T01 AT1G58260 24.950 497 343 14 31 504 4 493 7.41e-53 188
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MsG0780036427.01.T01 AT3G20120 28.940 349 232 5 162 501 1 342 4.34e-50 177
MsG0780036427.01.T01 AT3G20120 28.940 349 232 5 162 501 1 342 4.34e-50 177
MsG0780036427.01.T01 AT3G10560 28.448 464 304 14 51 499 30 480 6.64e-49 177
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MsG0780036427.01.T01 AT2G45560 28.249 177 125 2 49 224 21 196 1.18e-22 97.4
MsG0780036427.01.T01 AT1G19630 23.445 418 287 13 51 460 20 412 2.69e-22 100
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MsG0780036427.01.T01 AT1G01600 24.520 469 303 17 64 494 24 479 5.20e-22 100
MsG0780036427.01.T01 AT3G14660 24.484 339 244 7 165 501 11 339 5.41e-22 98.2
MsG0780036427.01.T01 AT5G52400 23.349 424 279 12 98 504 101 495 7.10e-22 99.4
MsG0780036427.01.T01 AT5G24910 24.018 433 300 13 84 501 87 505 8.94e-22 99.4
MsG0780036427.01.T01 AT5G38450 24.051 474 313 14 57 501 34 489 1.71e-21 98.2
MsG0780036427.01.T01 AT3G19270 23.382 479 309 16 59 520 27 464 2.08e-21 97.8
MsG0780036427.01.T01 AT3G14610 24.096 415 284 10 98 501 91 485 2.41e-21 97.8
MsG0780036427.01.T01 AT3G14650 23.741 417 292 10 93 501 87 485 2.57e-21 97.8
MsG0780036427.01.T01 AT3G14660 23.501 417 293 10 93 501 87 485 4.03e-21 97.1
MsG0780036427.01.T01 AT1G24540 21.121 464 329 14 69 504 42 496 5.19e-21 96.7
MsG0780036427.01.T01 AT5G45340 22.462 463 316 12 40 497 8 432 5.42e-21 96.3
MsG0780036427.01.T01 AT1G75130 25.285 439 260 16 88 501 81 476 6.52e-21 96.3
MsG0780036427.01.T01 AT2G26170 27.869 244 168 5 258 497 166 405 6.89e-21 95.9
MsG0780036427.01.T01 AT3G14630 25.000 408 288 9 98 501 88 481 9.31e-21 95.9
MsG0780036427.01.T01 AT3G14630 25.000 408 288 9 98 501 143 536 1.21e-20 95.9
MsG0780036427.01.T01 AT4G00360 23.769 467 307 17 64 494 24 477 1.36e-20 95.9
MsG0780036427.01.T01 AT1G57750 28.889 180 119 4 328 504 299 472 2.63e-20 94.4
MsG0780036427.01.T01 AT5G52320 26.295 251 172 7 262 504 233 478 2.67e-20 94.4
MsG0780036427.01.T01 AT5G52320 26.295 251 172 7 262 504 233 478 2.75e-20 94.4
MsG0780036427.01.T01 AT1G69500 22.727 484 309 14 69 501 27 496 4.36e-20 94.0
MsG0780036427.01.T01 AT3G14690 23.206 418 293 12 93 501 87 485 8.74e-20 92.8
MsG0780036427.01.T01 AT4G39510 25.899 278 182 9 260 526 234 498 1.05e-19 92.8
MsG0780036427.01.T01 AT3G14690 23.206 418 293 12 93 501 122 520 1.10e-19 92.8
MsG0780036427.01.T01 AT4G27710 22.716 405 298 8 98 498 94 487 1.19e-19 92.4
MsG0780036427.01.T01 AT2G32440 22.955 440 299 11 66 494 44 454 1.82e-19 92.0
MsG0780036427.01.T01 AT2G32440 22.955 440 299 11 66 494 44 454 1.82e-19 92.0
MsG0780036427.01.T01 AT1G73340 23.673 452 300 12 59 499 36 453 2.23e-19 91.7
MsG0780036427.01.T01 AT3G26125 21.337 389 245 12 149 494 128 498 2.45e-19 91.7
MsG0780036427.01.T01 AT3G19270 22.958 453 296 15 59 499 27 438 3.56e-19 90.5
MsG0780036427.01.T01 AT1G05160 22.247 454 310 11 54 494 34 457 4.06e-19 90.9
MsG0780036427.01.T01 AT1G05160 22.247 454 310 11 54 494 34 457 4.06e-19 90.9
MsG0780036427.01.T01 AT2G29090 24.222 450 297 12 60 501 43 456 5.96e-19 90.1
MsG0780036427.01.T01 AT2G29090 24.222 450 297 12 60 501 43 456 5.96e-19 90.1
MsG0780036427.01.T01 AT4G19230 22.128 470 317 12 40 501 8 436 6.27e-19 90.1
MsG0780036427.01.T01 AT2G46950 24.645 422 283 11 88 497 141 539 7.20e-19 90.5
MsG0780036427.01.T01 AT5G38970 22.494 449 309 13 57 500 25 439 8.42e-19 89.7
MsG0780036427.01.T01 AT1G34540 24.034 466 314 20 60 502 23 471 1.07e-18 89.7
MsG0780036427.01.T01 AT2G46960 23.923 418 294 11 88 497 84 485 1.38e-18 89.4
MsG0780036427.01.T01 AT2G21910 22.520 373 265 14 151 504 115 482 1.71e-18 89.0
MsG0780036427.01.T01 AT5G38970 26.360 239 161 6 266 500 131 358 1.79e-18 87.8
MsG0780036427.01.T01 AT5G38970 26.360 239 161 6 266 500 131 358 1.79e-18 87.8
MsG0780036427.01.T01 AT3G30180 27.426 237 153 5 267 500 219 439 2.71e-18 88.2
MsG0780036427.01.T01 AT5G02900 27.041 196 133 5 328 517 272 463 4.87e-18 87.4
MsG0780036427.01.T01 AT2G23180 24.762 210 138 6 328 526 305 505 7.15e-18 87.0
MsG0780036427.01.T01 AT4G39490 21.799 289 194 8 268 529 236 519 1.25e-17 86.3
MsG0780036427.01.T01 AT4G19230 22.009 468 316 12 40 499 8 434 1.64e-17 85.9
MsG0780036427.01.T01 AT1G11680 22.833 473 312 18 74 526 48 487 3.70e-17 84.7
MsG0780036427.01.T01 AT1G47620 24.910 277 188 10 262 526 240 508 4.90e-17 84.3
MsG0780036427.01.T01 AT5G05690 29.444 180 123 2 323 499 144 322 7.49e-17 82.8
MsG0780036427.01.T01 AT4G39500 23.188 207 155 4 302 504 236 442 7.56e-17 83.6
MsG0780036427.01.T01 AT1G67110 32.432 148 96 3 357 503 341 485 9.47e-17 83.6
MsG0780036427.01.T01 AT4G39500 23.188 207 155 4 302 504 286 492 1.04e-16 83.6
MsG0780036427.01.T01 AT5G05690 29.444 180 123 2 323 499 263 441 1.38e-16 82.8
MsG0780036427.01.T01 AT4G32170 23.577 246 177 7 265 504 239 479 1.58e-16 82.8
MsG0780036427.01.T01 AT2G46960 25.256 293 208 5 206 497 87 369 1.82e-16 82.0
MsG0780036427.01.T01 AT4G20235 36.634 101 63 1 193 293 3 102 6.30e-16 75.5
MsG0780036427.01.T01 AT3G01900 23.179 453 304 16 70 500 32 462 1.13e-15 80.1
MsG0780036427.01.T01 AT5G35920 32.000 125 82 2 392 513 6 130 3.34e-15 73.6
MsG0780036427.01.T01 AT3G44970 22.247 454 306 13 62 501 31 451 3.76e-15 78.6
MsG0780036427.01.T01 AT1G57750 32.353 136 84 3 328 461 299 428 5.49e-15 77.8
MsG0780036427.01.T01 AT4G39480 20.716 391 260 14 149 504 114 489 7.75e-15 77.8
MsG0780036427.01.T01 AT2G29090 28.632 234 148 6 275 501 140 361 9.54e-15 76.6
MsG0780036427.01.T01 AT2G34490 25.926 189 135 3 325 510 287 473 1.68e-14 76.6
MsG0780036427.01.T01 AT2G42850 25.275 182 128 2 323 501 281 457 1.94e-14 76.3
MsG0780036427.01.T01 AT2G28850 27.604 192 128 6 325 510 283 469 2.55e-14 75.9
MsG0780036427.01.T01 AT2G28860 27.083 192 129 6 325 510 283 469 9.26e-14 74.3
MsG0780036427.01.T01 AT3G50660 28.426 197 124 4 322 503 295 489 1.53e-13 73.6
MsG0780036427.01.T01 AT5G36110 24.464 233 161 4 272 500 227 448 9.44e-13 70.9
MsG0780036427.01.T01 AT3G13730 23.874 222 154 4 284 499 253 465 2.07e-12 69.7
MsG0780036427.01.T01 AT2G34500 26.923 182 122 6 325 500 282 458 6.11e-12 68.6
MsG0780036427.01.T01 AT2G27690 21.581 468 314 16 80 519 38 480 6.28e-12 68.6
MsG0780036427.01.T01 AT5G48000 21.444 457 302 17 66 503 35 453 7.12e-11 65.1
MsG0780036427.01.T01 AT5G48000 21.444 457 302 17 66 503 35 453 7.12e-11 65.1
MsG0780036427.01.T01 AT5G48000 21.444 457 302 17 66 503 35 453 7.12e-11 65.1
MsG0780036427.01.T01 AT5G48000 21.444 457 302 17 66 503 35 453 7.12e-11 65.1
MsG0780036427.01.T01 AT5G48000 21.444 457 302 17 66 503 35 453 7.12e-11 65.1
MsG0780036427.01.T01 AT5G48000 21.444 457 302 17 66 503 35 453 7.12e-11 65.1
MsG0780036427.01.T01 AT5G48000 21.444 457 302 17 66 503 76 494 8.15e-11 65.1

Find 118 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 200 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CATCGGTGTTTGTGAATATT+TGG 0.087227 7:-7998492 MsG0780036427.01.T01:CDS
CAAATCTCCATTTACAATTT+TGG 0.089505 7:-7999825 MsG0780036427.01.T01:CDS
AGAGATTCCAAAATTGTAAA+TGG 0.215696 7:+7999818 None:intergenic
CCAAAAGGTCTTCCTATAAT+TGG 0.216079 7:-7999871 MsG0780036427.01.T01:CDS
CTGGTCTCTCTTGGGGCTAA+TGG 0.231996 7:+7998556 None:intergenic
AGTAAAGGTTTCATTCTAAA+TGG 0.233710 7:-7998535 MsG0780036427.01.T01:CDS
TCATCTTTCTTCCGATTATT+AGG 0.246980 7:+7999199 None:intergenic
CTGTCTCATGAAGTAAATTA+TGG 0.254048 7:+7999368 None:intergenic
ATTTAGAATGAAACCTTTAC+TGG 0.279837 7:+7998537 None:intergenic
ACCTTCTTAATTCATTTGAT+TGG 0.284996 7:-7998291 MsG0780036427.01.T01:CDS
TGAATATTTGGGCCATTCAT+AGG 0.289549 7:-7998480 MsG0780036427.01.T01:CDS
TGATATTTACATGTGATTCT+TGG 0.292207 7:+7998177 None:intergenic
CCAATTATAGGAAGACCTTT+TGG 0.298957 7:+7999871 None:intergenic
AACCTTTACTGGTCTCTCTT+GGG 0.300162 7:+7998548 None:intergenic
TGATGAGTTCTTCTTGATAT+TGG 0.303921 7:+7999912 None:intergenic
AGAATTTCTTGAGCTAGTTT+AGG 0.324992 7:+7999730 None:intergenic
TGACAAGACTTTCAAGGCTT+TGG 0.326263 7:-7999260 MsG0780036427.01.T01:CDS
TTCAGATCATATTCCTTTCA+TGG 0.327190 7:-7999320 MsG0780036427.01.T01:CDS
AACTTCAGCCACATCAGTTT+GGG 0.334855 7:-7998740 MsG0780036427.01.T01:CDS
CAACTTCAGCCACATCAGTT+TGG 0.336210 7:-7998741 MsG0780036427.01.T01:CDS
TCATCCTTTGTCATCCCTTC+AGG 0.355145 7:+7998262 None:intergenic
TGATGGAGATTTCCAATTAT+AGG 0.357104 7:+7999859 None:intergenic
ATCGGTGTTTGTGAATATTT+GGG 0.359013 7:-7998491 MsG0780036427.01.T01:CDS
CCTTCTTAATTCATTTGATT+GGG 0.365421 7:-7998290 MsG0780036427.01.T01:CDS
TTTCACCATACAATGATCAT+TGG 0.366863 7:-7999624 MsG0780036427.01.T01:CDS
TCGGGATCTTTCCATGCCTC+AGG 0.383536 7:+7998454 None:intergenic
AAACCTTTACTGGTCTCTCT+TGG 0.385897 7:+7998547 None:intergenic
GTTACTCGAGTTGAAGAATC+AGG 0.388414 7:-7999152 MsG0780036427.01.T01:CDS
AACATCTCAATCCTAATAAT+CGG 0.389424 7:-7999210 MsG0780036427.01.T01:CDS
TCACATCAAAGCCGTCCTTA+TGG 0.391192 7:-7999101 MsG0780036427.01.T01:intron
GCGATTCCCAATGGCATGCC+AGG 0.397327 7:+7998337 None:intergenic
TCAAAAGCTCGTATATCTTA+AGG 0.399290 7:-7998617 MsG0780036427.01.T01:CDS
TCAGATCATATTCCTTTCAT+GGG 0.400972 7:-7999319 MsG0780036427.01.T01:CDS
TCGTGTTGACAAGACTTTCA+AGG 0.403769 7:-7999266 MsG0780036427.01.T01:CDS
ATAGTATGTAGAATTGCTTT+TGG 0.405572 7:-7999430 MsG0780036427.01.T01:CDS
TCTCTTGGGGCTAATGGTGC+TGG 0.420586 7:+7998562 None:intergenic
CCCAATCAAATGAATTAAGA+AGG 0.422223 7:+7998290 None:intergenic
ACATCAGTTTGGGCGATGAC+TGG 0.426127 7:-7998730 MsG0780036427.01.T01:CDS
TAGGATTGAGATGTTCTTGA+AGG 0.429261 7:+7999218 None:intergenic
ATAGACATTGAAGGGTTGCC+AGG 0.434292 7:-7998238 MsG0780036427.01.T01:CDS
TCATTGTTTAAGAATCTCTC+TGG 0.438916 7:+7998421 None:intergenic
CTCTCTGGATAAAACTCGTC+GGG 0.442873 7:+7998436 None:intergenic
TGAGCTTTCTTCATTGCTCT+AGG 0.450252 7:+7998694 None:intergenic
ACATGTGATTCTTGGCTACA+AGG 0.455442 7:+7998185 None:intergenic
ATTTGCCCTGGCATGCCATT+GGG 0.456261 7:-7998343 MsG0780036427.01.T01:CDS
GATTTGAAGTGTCAAGTTGA+TGG 0.456835 7:+7999842 None:intergenic
GAGTTGATACCATTTGGTGC+AGG 0.457937 7:-7998373 MsG0780036427.01.T01:CDS
TGCCTCAGGGTCCCTATGAA+TGG 0.460444 7:+7998468 None:intergenic
CAATCCAGCCGTGAATCAAC+CGG 0.465176 7:-8000869 MsG0780036427.01.T01:CDS
TTAGTGGCGAGCTGCTTCCT+TGG 0.469971 7:-8000900 MsG0780036427.01.T01:CDS
ATCATATTCCTTTCATGGGG+TGG 0.470575 7:-7999315 MsG0780036427.01.T01:CDS
AATTTGCCCTGGCATGCCAT+TGG 0.476493 7:-7998344 MsG0780036427.01.T01:CDS
TCCTTTCCAAAAGGTCCAAA+AGG 0.478519 7:-7999886 MsG0780036427.01.T01:CDS
AAACCCTAACATGGAGAAAA+CGG 0.486012 7:-8000959 None:intergenic
TAGAGCTTAAGACAGACATT+AGG 0.489759 7:+7999452 None:intergenic
GAATATTTGGGCCATTCATA+GGG 0.491288 7:-7998479 MsG0780036427.01.T01:CDS
TCTCTCCAATGATCATTGTA+TGG 0.494410 7:+7999619 None:intergenic
GGAAAACGACGTCGGAGTTA+CGG 0.497732 7:-8000848 MsG0780036427.01.T01:CDS
ACCTTTACTGGTCTCTCTTG+GGG 0.498700 7:+7998549 None:intergenic
GAAGAAAGATGAAGAAGAGA+AGG 0.498932 7:-7999188 MsG0780036427.01.T01:CDS
ATGAAGGTGGTGAGAAAAGT+AGG 0.502632 7:-7999393 MsG0780036427.01.T01:CDS
GACGGCTTTGATGTGATCAT+TGG 0.503162 7:+7999108 None:intergenic
GTGAACGGTGGTTACCTTAG+TGG 0.504334 7:-8000916 MsG0780036427.01.T01:CDS
AAGGATGATATAGACATTGA+AGG 0.510022 7:-7998247 MsG0780036427.01.T01:CDS
ATTCTACGCCCTGCACCAAA+TGG 0.514784 7:+7998364 None:intergenic
TTCTTGTGTCTTGAAAGTCC+TGG 0.520491 7:+7998220 None:intergenic
TCATCATCATCCTTTCCAAA+AGG 0.522070 7:-7999895 MsG0780036427.01.T01:CDS
AGTTGATACCATTTGGTGCA+GGG 0.523385 7:-7998372 MsG0780036427.01.T01:CDS
GTTACGGTGGCGCGCGAGCA+AGG 0.528650 7:-8000832 MsG0780036427.01.T01:intron
GCTGGATTGCGCCGACTCCA+AGG 0.530644 7:+8000883 None:intergenic
GGTAAAAGTTATGAGCATGA+AGG 0.532207 7:-7999409 MsG0780036427.01.T01:CDS
GCCCCAAGAGAGACCAGTAA+AGG 0.532208 7:-7998550 MsG0780036427.01.T01:CDS
AAGGAAGCAGCTCGCCACTA+AGG 0.535839 7:+8000902 None:intergenic
AACGGAAAACAAATCAGTTA+CGG 0.537873 7:-8000941 MsG0780036427.01.T01:CDS
AATATGATCTGAAACAAAGA+AGG 0.548791 7:+7999330 None:intergenic
CGGGATCTTTCCATGCCTCA+GGG 0.549250 7:+7998455 None:intergenic
AAATCAGTTACGGCGGTGAA+CGG 0.555517 7:-8000931 MsG0780036427.01.T01:CDS
TTATCAATCCACCCCATGAA+AGG 0.556547 7:+7999307 None:intergenic
TCCACTGTGGCGATTCCCAA+TGG 0.562957 7:+7998328 None:intergenic
TTCATAGGGACCCTGAGGCA+TGG 0.567832 7:-7998465 MsG0780036427.01.T01:CDS
CAGACATTAGGATCTCACTA+AGG 0.568900 7:+7999464 None:intergenic
GGGTGGATTGATAAACTCAC+AGG 0.570357 7:-7999298 MsG0780036427.01.T01:CDS
GATCTGAAACAAAGAAGGAA+AGG 0.570755 7:+7999335 None:intergenic
CAGATCATATTCCTTTCATG+GGG 0.571192 7:-7999318 MsG0780036427.01.T01:CDS
ACTAAGGTTTGAAATTTCAG+AGG 0.571274 7:+7999480 None:intergenic
GCGAGCTGCTTCCTTGGAGT+CGG 0.573556 7:-8000894 MsG0780036427.01.T01:CDS
AGGATGATATAGACATTGAA+GGG 0.579131 7:-7998246 MsG0780036427.01.T01:CDS
GATATTATCATACAATGGCA+TGG 0.579985 7:-7999656 MsG0780036427.01.T01:CDS
ATCTGTGTGCCATGTGATGG+TGG 0.580527 7:+7999676 None:intergenic
TTTGATTGGGAAATGCCTGA+AGG 0.582964 7:-7998277 MsG0780036427.01.T01:CDS
TTCTCATGTGAGAAAATCTG+AGG 0.583556 7:-7999542 MsG0780036427.01.T01:CDS
GCAGGGCGTAGAATTTGCCC+TGG 0.586918 7:-7998355 MsG0780036427.01.T01:CDS
GAAGAAATTAGAAACATATG+TGG 0.593252 7:-7998670 MsG0780036427.01.T01:CDS
GTGGTCTACTAGATACATCA+TGG 0.598254 7:+7999695 None:intergenic
TTGATTGGGAAATGCCTGAA+GGG 0.600925 7:-7998276 MsG0780036427.01.T01:CDS
TGTCAGTAGCTGCTACAAGT+AGG 0.603578 7:+7998764 None:intergenic
CGATTCCCAATGGCATGCCA+GGG 0.605806 7:+7998338 None:intergenic
TCTCTCTGGATAAAACTCGT+CGG 0.612674 7:+7998435 None:intergenic
TGCAATTATCATTTCCACTG+TGG 0.618440 7:+7998315 None:intergenic
AGTCATCGCCCAAACTGATG+TGG 0.618955 7:+7998732 None:intergenic
AATATCTGTGTGCCATGTGA+TGG 0.629217 7:+7999673 None:intergenic
TCAGTTACGGCGGTGAACGG+TGG 0.630053 7:-8000928 MsG0780036427.01.T01:CDS
TTCGGAACATACCATAAGGA+CGG 0.637756 7:+7999090 None:intergenic
GATTCTTGGCTACAAGGCAA+AGG 0.644139 7:+7998191 None:intergenic
ACACAGATATTATCATACAA+TGG 0.648407 7:-7999661 MsG0780036427.01.T01:CDS
GGCCATTCATAGGGACCCTG+AGG 0.648427 7:-7998470 MsG0780036427.01.T01:CDS
TTACTCGAGTTGAAGAATCA+GGG 0.652823 7:-7999151 MsG0780036427.01.T01:CDS
AAAAGTTATGAGCATGAAGG+TGG 0.658076 7:-7999406 MsG0780036427.01.T01:CDS
GCCATTGGGAATCGCCACAG+TGG 0.668356 7:-7998329 MsG0780036427.01.T01:CDS
TCTAGTAGACCACCATCACA+TGG 0.668516 7:-7999685 MsG0780036427.01.T01:CDS
AAATTTCAGAGGAATGAACA+TGG 0.670710 7:+7999491 None:intergenic
GGTGGATTGATAAACTCACA+GGG 0.685368 7:-7999297 MsG0780036427.01.T01:CDS
AATGCCTGAAGGGATGACAA+AGG 0.690268 7:-7998266 MsG0780036427.01.T01:CDS
AATCACATGTAAATATCACA+AGG 0.696489 7:-7998172 MsG0780036427.01.T01:exon
AAACGACGTCGGAGTTACGG+TGG 0.701971 7:-8000845 MsG0780036427.01.T01:CDS
GGAAAACAAATCAGTTACGG+CGG 0.734739 7:-8000938 MsG0780036427.01.T01:CDS
AATCAACCGGAAAACGACGT+CGG 0.740392 7:-8000856 MsG0780036427.01.T01:CDS
GTGGATTGATAAACTCACAG+GGG 0.824893 7:-7999296 MsG0780036427.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TATATATATATATATATATA+TGG + Chr7:7998578-7998559 None:intergenic 0.0%
!! AATATAATAAAAATAGTGTT+CGG + Chr7:7999894-7999913 None:intergenic 10.0%
!!! ATTTTAAAAGAGATTTATTT+AGG + Chr7:7998727-7998746 None:intergenic 10.0%
!! AAGAGCTTATTTAATAAATA+TGG + Chr7:8000076-8000095 None:intergenic 15.0%
!! ATATTTATTAAATAAGCTCT+TGG - Chr7:8000075-8000094 MsG0780036427.01.T01:intron 15.0%
!! TATATATATATATATATGGC+CGG + Chr7:7998555-7998574 None:intergenic 15.0%
!! TATTTATTAAATAAGCTCTT+GGG - Chr7:8000076-8000095 MsG0780036427.01.T01:intron 15.0%
!!! AAACAATGATATAGATTTTA+AGG - Chr7:8000556-8000575 MsG0780036427.01.T01:intron 15.0%
!!! AACAATGATATAGATTTTAA+GGG - Chr7:8000557-8000576 MsG0780036427.01.T01:intron 15.0%
!! AAAAGGAATAATACTAGTAA+AGG + Chr7:7999017-7999036 None:intergenic 20.0%
!! AAGTTACATTTAAAAACTAG+AGG + Chr7:7998363-7998382 None:intergenic 20.0%
!! AGTTACATTTAAAAACTAGA+GGG + Chr7:7998362-7998381 None:intergenic 20.0%
!! CATCTAAAAATTTGTAGATA+GGG - Chr7:7998834-7998853 MsG0780036427.01.T01:intron 20.0%
!! TAAAATAGAACCAAAAACAT+CGG - Chr7:8000454-8000473 MsG0780036427.01.T01:intron 20.0%
!! TAGTAAAAATTTGTCATACA+TGG + Chr7:8000857-8000876 None:intergenic 20.0%
!! TCATCTAAAAATTTGTAGAT+AGG - Chr7:7998833-7998852 MsG0780036427.01.T01:intron 20.0%
!!! AAAGAGAGTATATTAATCTA+TGG + Chr7:7998666-7998685 None:intergenic 20.0%
!!! ACTATAATATTTGTTACAAC+CGG - Chr7:7998533-7998552 MsG0780036427.01.T01:CDS 20.0%
!!! AGTAGATGACAATATTTTAA+TGG - Chr7:7998490-7998509 MsG0780036427.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTATTATATTGTTCGCTTT+TGG - Chr7:7999903-7999922 MsG0780036427.01.T01:CDS 20.0%
! AACATCTCAATCCTAATAAT+CGG - Chr7:7999753-7999772 MsG0780036427.01.T01:CDS 25.0%
! AATCACATGTAAATATCACA+AGG - Chr7:8000791-8000810 MsG0780036427.01.T01:intron 25.0%
! ACACAGATATTATCATACAA+TGG - Chr7:7999302-7999321 MsG0780036427.01.T01:CDS 25.0%
! ACCTTCTTAATTCATTTGAT+TGG - Chr7:8000672-8000691 MsG0780036427.01.T01:intron 25.0%
! ACTAAAATACAGAGAGATTA+AGG + Chr7:7998387-7998406 None:intergenic 25.0%
! AGAGATTCCAAAATTGTAAA+TGG + Chr7:7999148-7999167 None:intergenic 25.0%
! AGTAAAGGTTTCATTCTAAA+TGG - Chr7:8000428-8000447 MsG0780036427.01.T01:intron 25.0%
! CCTTCTTAATTCATTTGATT+GGG - Chr7:8000673-8000692 MsG0780036427.01.T01:intron 25.0%
! CTAAAATACAGAGAGATTAA+GGG + Chr7:7998386-7998405 None:intergenic 25.0%
! CTAACATAACTTAGAAATTG+AGG + Chr7:8000010-8000029 None:intergenic 25.0%
! CTCAATTTCTAAGTTATGTT+AGG - Chr7:8000008-8000027 MsG0780036427.01.T01:intron 25.0%
! CTCTCTTTGTCTTTATATAT+AGG - Chr7:7998678-7998697 MsG0780036427.01.T01:CDS 25.0%
! GAAGAAATTAGAAACATATG+TGG - Chr7:8000293-8000312 MsG0780036427.01.T01:intron 25.0%
! GAATAATACTAGTAAAGGTA+AGG + Chr7:7999012-7999031 None:intergenic 25.0%
! GTTACATTTAAAAACTAGAG+GGG + Chr7:7998361-7998380 None:intergenic 25.0%
! TAAAAATTTGTAGATAGGGA+GGG - Chr7:7998838-7998857 MsG0780036427.01.T01:intron 25.0%
! TCTTTACACAAAACATAAAG+CGG + Chr7:7999942-7999961 None:intergenic 25.0%
! TGATATTTACATGTGATTCT+TGG + Chr7:8000789-8000808 None:intergenic 25.0%
! TGTATACTTAATTGTCTCTT+CGG + Chr7:7998451-7998470 None:intergenic 25.0%
! TTAGGAAATTAAGCTGAAAT+TGG - Chr7:8000026-8000045 MsG0780036427.01.T01:intron 25.0%
!! AATATGATCTGAAACAAAGA+AGG + Chr7:7999636-7999655 None:intergenic 25.0%
!! AGAAAAGCTAGAAATTTTCT+TGG + Chr7:7999405-7999424 None:intergenic 25.0%
!! ATAGTATGTAGAATTGCTTT+TGG - Chr7:7999533-7999552 MsG0780036427.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTAGAATGAAACCTTTAC+TGG + Chr7:8000429-8000448 None:intergenic 25.0%
!! CAAATCTCCATTTACAATTT+TGG - Chr7:7999138-7999157 MsG0780036427.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATGCTTGTTTTTTATGCATA+AGG - Chr7:8000824-8000843 MsG0780036427.01.T01:intron 25.0%
!!! TGCTTGTTTTTTATGCATAA+GGG - Chr7:8000825-8000844 MsG0780036427.01.T01:intron 25.0%
!!! TGGTTTTGTATTTCAAGAAA+AGG + Chr7:7999034-7999053 None:intergenic 25.0%
AAATTTCAGAGGAATGAACA+TGG + Chr7:7999475-7999494 None:intergenic 30.0%
AACGGAAAACAAATCAGTTA+CGG - Chr7:7998022-7998041 MsG0780036427.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
AAGGATGATATAGACATTGA+AGG - Chr7:8000716-8000735 MsG0780036427.01.T01:intron 30.0%
AATCACAACCATCAGATAAT+TGG + Chr7:7998229-7998248 None:intergenic 30.0%
AGGATGATATAGACATTGAA+GGG - Chr7:8000717-8000736 MsG0780036427.01.T01:intron 30.0%
CAAAAACCAAGAAACTACTT+AGG + Chr7:8000167-8000186 None:intergenic 30.0%
CCCAATCAAATGAATTAAGA+AGG + Chr7:8000676-8000695 None:intergenic 30.0%
CTAAAAATTTGTAGATAGGG+AGG - Chr7:7998837-7998856 MsG0780036427.01.T01:intron 30.0%
CTGTCTCATGAAGTAAATTA+TGG + Chr7:7999598-7999617 None:intergenic 30.0%
CTTTACACAAAACATAAAGC+GGG + Chr7:7999941-7999960 None:intergenic 30.0%
GATATTATCATACAATGGCA+TGG - Chr7:7999307-7999326 MsG0780036427.01.T01:CDS 30.0%
TCAAAAGCTCGTATATCTTA+AGG - Chr7:8000346-8000365 MsG0780036427.01.T01:intron 30.0%
TCAGATCATATTCCTTTCAT+GGG - Chr7:7999644-7999663 MsG0780036427.01.T01:CDS 30.0%
TCATCTTTCTTCCGATTATT+AGG + Chr7:7999767-7999786 None:intergenic 30.0%
TCATTGTTTAAGAATCTCTC+TGG + Chr7:8000545-8000564 None:intergenic 30.0%
TGATGAGTTCTTCTTGATAT+TGG + Chr7:7999054-7999073 None:intergenic 30.0%
TGATGGAGATTTCCAATTAT+AGG + Chr7:7999107-7999126 None:intergenic 30.0%
TGGAATCTCTCAAAAATCTA+TGG - Chr7:7999158-7999177 MsG0780036427.01.T01:CDS 30.0%
TTCAGATCATATTCCTTTCA+TGG - Chr7:7999643-7999662 MsG0780036427.01.T01:CDS 30.0%
TTGTGTAAAGACTCTCATAT+GGG - Chr7:7999951-7999970 MsG0780036427.01.T01:intron 30.0%
TTTCACCATACAATGATCAT+TGG - Chr7:7999339-7999358 MsG0780036427.01.T01:CDS 30.0%
TTTGTGTAAAGACTCTCATA+TGG - Chr7:7999950-7999969 MsG0780036427.01.T01:intron 30.0%
! ACTAAGGTTTGAAATTTCAG+AGG + Chr7:7999486-7999505 None:intergenic 30.0%
! AGAATTTCTTGAGCTAGTTT+AGG + Chr7:7999236-7999255 None:intergenic 30.0%
! AGTATTAACCATTGACTAGA+AGG - Chr7:7998404-7998423 MsG0780036427.01.T01:CDS 30.0%
! ATCGGTGTTTGTGAATATTT+GGG - Chr7:8000472-8000491 MsG0780036427.01.T01:intron 30.0%
! TTTTCTTGGAGCTAAAGAAA+TGG + Chr7:7999391-7999410 None:intergenic 30.0%
!!! GATTTTGAGTTGATACCATT+TGG - Chr7:8000584-8000603 MsG0780036427.01.T01:intron 30.0%
AAAAGTTATGAGCATGAAGG+TGG - Chr7:7999557-7999576 MsG0780036427.01.T01:CDS 35.0%
AAATATCACATGTGTGCTCT+CGG + Chr7:7998926-7998945 None:intergenic 35.0%
ACAAGTGTCCAATTATCTGA+TGG - Chr7:7998218-7998237 MsG0780036427.01.T01:CDS 35.0%
CAGATCATATTCCTTTCATG+GGG - Chr7:7999645-7999664 MsG0780036427.01.T01:CDS 35.0%
CCAAAAGGTCTTCCTATAAT+TGG - Chr7:7999092-7999111 MsG0780036427.01.T01:intron 35.0%
GAAGAAAGATGAAGAAGAGA+AGG - Chr7:7999775-7999794 MsG0780036427.01.T01:CDS 35.0%
GAATATTTGGGCCATTCATA+GGG - Chr7:8000484-8000503 MsG0780036427.01.T01:intron 35.0%
GGTAAAAGTTATGAGCATGA+AGG - Chr7:7999554-7999573 MsG0780036427.01.T01:CDS 35.0%
GGTTGTGATTAACTTATGCA+TGG - Chr7:7998239-7998258 MsG0780036427.01.T01:CDS 35.0%
TAGAGCTTAAGACAGACATT+AGG + Chr7:7999514-7999533 None:intergenic 35.0%
TAGGATTGAGATGTTCTTGA+AGG + Chr7:7999748-7999767 None:intergenic 35.0%
TATGCATGGTGCATAAGTTA+TGG - Chr7:7998253-7998272 MsG0780036427.01.T01:CDS 35.0%
TCAAGTCCTAAGTAGTTTCT+TGG - Chr7:8000158-8000177 MsG0780036427.01.T01:intron 35.0%
TCATCATCATCCTTTCCAAA+AGG - Chr7:7999068-7999087 MsG0780036427.01.T01:intron 35.0%
TCTCTCCAATGATCATTGTA+TGG + Chr7:7999347-7999366 None:intergenic 35.0%
TGAATATTTGGGCCATTCAT+AGG - Chr7:8000483-8000502 MsG0780036427.01.T01:intron 35.0%
TGCAATTATCATTTCCACTG+TGG + Chr7:8000651-8000670 None:intergenic 35.0%
TGTGTAAAGACTCTCATATG+GGG - Chr7:7999952-7999971 MsG0780036427.01.T01:intron 35.0%
TTCTCATGTGAGAAAATCTG+AGG - Chr7:7999421-7999440 MsG0780036427.01.T01:CDS 35.0%
TTGAGAAGTGAGTGAATTAG+AGG + Chr7:7998627-7998646 None:intergenic 35.0%
! CATCGGTGTTTGTGAATATT+TGG - Chr7:8000471-8000490 MsG0780036427.01.T01:intron 35.0%
! CCAATTATAGGAAGACCTTT+TGG + Chr7:7999095-7999114 None:intergenic 35.0%
! GATCTGAAACAAAGAAGGAA+AGG + Chr7:7999631-7999650 None:intergenic 35.0%
! TCTCTTTTCTCTCTTCAACT+TGG - Chr7:7999182-7999201 MsG0780036427.01.T01:CDS 35.0%
! TGCAAAGCTCTAATCAACAA+TGG - Chr7:7998962-7998981 MsG0780036427.01.T01:intron 35.0%
! TTAACCATTGACTAGAAGGA+AGG - Chr7:7998408-7998427 MsG0780036427.01.T01:CDS 35.0%
! TTCACAAACACCGATGTTTT+TGG + Chr7:8000467-8000486 None:intergenic 35.0%
!! ATTTTAATGGCTGTGCTAGT+TGG - Chr7:7998503-7998522 MsG0780036427.01.T01:CDS 35.0%
!! GATTTGAAGTGTCAAGTTGA+TGG + Chr7:7999124-7999143 None:intergenic 35.0%
!! TTACTCGAGTTGAAGAATCA+GGG - Chr7:7999812-7999831 MsG0780036427.01.T01:CDS 35.0%
AACTTCAGCCACATCAGTTT+GGG - Chr7:8000223-8000242 MsG0780036427.01.T01:intron 40.0%
AATATCTGTGTGCCATGTGA+TGG + Chr7:7999293-7999312 None:intergenic 40.0%
AATATGCAAGCTGGCCAAAA+GGG + Chr7:7998299-7998318 None:intergenic 40.0%
ACATGTGATTCTTGGCTACA+AGG + Chr7:8000781-8000800 None:intergenic 40.0%
AGTGTTCGGAACATACCATA+AGG + Chr7:7999880-7999899 None:intergenic 40.0%
ATCATATTCCTTTCATGGGG+TGG - Chr7:7999648-7999667 MsG0780036427.01.T01:CDS 40.0%
ATGAAGGTGGTGAGAAAAGT+AGG - Chr7:7999570-7999589 MsG0780036427.01.T01:CDS 40.0%
ATGAGGTAGGAGAAGATTGT+GGG - Chr7:7998163-7998182 MsG0780036427.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
ATTGGAGCACAAGCATACAT+TGG - Chr7:8000044-8000063 MsG0780036427.01.T01:intron 40.0%
CAGACATTAGGATCTCACTA+AGG + Chr7:7999502-7999521 None:intergenic 40.0%
CTGAGCATTAATATGCAAGC+TGG + Chr7:7998308-7998327 None:intergenic 40.0%
GGAAAACAAATCAGTTACGG+CGG - Chr7:7998025-7998044 MsG0780036427.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
GTGGTCTACTAGATACATCA+TGG + Chr7:7999271-7999290 None:intergenic 40.0%
GTGTAAAGACTCTCATATGG+GGG - Chr7:7999953-7999972 MsG0780036427.01.T01:intron 40.0%
TAATATGCAAGCTGGCCAAA+AGG + Chr7:7998300-7998319 None:intergenic 40.0%
TATGAGGTAGGAGAAGATTG+TGG - Chr7:7998162-7998181 MsG0780036427.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
TCCTTTCCAAAAGGTCCAAA+AGG - Chr7:7999077-7999096 MsG0780036427.01.T01:intron 40.0%
TCTCTCTGGATAAAACTCGT+CGG + Chr7:8000531-8000550 None:intergenic 40.0%
TGACAAGACTTTCAAGGCTT+TGG - Chr7:7999703-7999722 MsG0780036427.01.T01:CDS 40.0%
TGAGCTTTCTTCATTGCTCT+AGG + Chr7:8000272-8000291 None:intergenic 40.0%
TTATCAATCCACCCCATGAA+AGG + Chr7:7999659-7999678 None:intergenic 40.0%
TTCGGAACATACCATAAGGA+CGG + Chr7:7999876-7999895 None:intergenic 40.0%
TTCTTGTGTCTTGAAAGTCC+TGG + Chr7:8000746-8000765 None:intergenic 40.0%
TTGATTGGGAAATGCCTGAA+GGG - Chr7:8000687-8000706 MsG0780036427.01.T01:intron 40.0%
TTTGATTGGGAAATGCCTGA+AGG - Chr7:8000686-8000705 MsG0780036427.01.T01:intron 40.0%
! AAACCTTTACTGGTCTCTCT+TGG + Chr7:8000419-8000438 None:intergenic 40.0%
! AACCTTTACTGGTCTCTCTT+GGG + Chr7:8000418-8000437 None:intergenic 40.0%
! CACCATAACTTTTGCCCTTT+TGG - Chr7:7998282-7998301 MsG0780036427.01.T01:CDS 40.0%
! GTGGATTGATAAACTCACAG+GGG - Chr7:7999667-7999686 MsG0780036427.01.T01:CDS 40.0%
! TCGTGTTGACAAGACTTTCA+AGG - Chr7:7999697-7999716 MsG0780036427.01.T01:CDS 40.0%
!! ACCTTTTGGACCTTTTGGAA+AGG + Chr7:7999081-7999100 None:intergenic 40.0%
!! AGTTGATACCATTTGGTGCA+GGG - Chr7:8000591-8000610 MsG0780036427.01.T01:intron 40.0%
!! GGTGGATTGATAAACTCACA+GGG - Chr7:7999666-7999685 MsG0780036427.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTACTCGAGTTGAAGAATC+AGG - Chr7:7999811-7999830 MsG0780036427.01.T01:CDS 40.0%
!!! AGGAAGGTGTCTCATTTTCA+AGG - Chr7:7998424-7998443 MsG0780036427.01.T01:CDS 40.0%
AAATCAGTTACGGCGGTGAA+CGG - Chr7:7998032-7998051 MsG0780036427.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
AAGATTGTGGGGACTGATTG+TGG - Chr7:7998175-7998194 MsG0780036427.01.T01:exon 45.0%
AAGGTTGAGTCGTATGAGGT+AGG - Chr7:7998150-7998169 MsG0780036427.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
AATCAACCGGAAAACGACGT+CGG - Chr7:7998107-7998126 MsG0780036427.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
AATGCCTGAAGGGATGACAA+AGG - Chr7:8000697-8000716 MsG0780036427.01.T01:intron 45.0%
AGATTGTGGGGACTGATTGT+GGG - Chr7:7998176-7998195 MsG0780036427.01.T01:exon 45.0%
ATAGACATTGAAGGGTTGCC+AGG - Chr7:8000725-8000744 MsG0780036427.01.T01:intron 45.0%
CAACTTCAGCCACATCAGTT+TGG - Chr7:8000222-8000241 MsG0780036427.01.T01:intron 45.0%
CTCTCTGGATAAAACTCGTC+GGG + Chr7:8000530-8000549 None:intergenic 45.0%
GACACCTTCCTTCTAGTCAA+TGG + Chr7:7998415-7998434 None:intergenic 45.0%
GATTCTTGGCTACAAGGCAA+AGG + Chr7:8000775-8000794 None:intergenic 45.0%
GGCCAAAAGGGCAAAAGTTA+TGG + Chr7:7998287-7998306 None:intergenic 45.0%
TAAAGACTCTCATATGGGGG+AGG - Chr7:7999956-7999975 MsG0780036427.01.T01:intron 45.0%
TAATGGCTGTGCTAGTTGGA+AGG - Chr7:7998507-7998526 MsG0780036427.01.T01:CDS 45.0%
TCACATCAAAGCCGTCCTTA+TGG - Chr7:7999862-7999881 MsG0780036427.01.T01:CDS 45.0%
TCATCCTTTGTCATCCCTTC+AGG + Chr7:8000704-8000723 None:intergenic 45.0%
TCTAGTAGACCACCATCACA+TGG - Chr7:7999278-7999297 MsG0780036427.01.T01:CDS 45.0%
TGAGGTAGGAGAAGATTGTG+GGG - Chr7:7998164-7998183 MsG0780036427.01.T01:exon 45.0%
TGTCAGTAGCTGCTACAAGT+AGG + Chr7:8000202-8000221 None:intergenic 45.0%
! ACCTTTACTGGTCTCTCTTG+GGG + Chr7:8000417-8000436 None:intergenic 45.0%
! GACGGCTTTGATGTGATCAT+TGG + Chr7:7999858-7999877 None:intergenic 45.0%
! GGAAGACCTTTTGGACCTTT+TGG + Chr7:7999086-7999105 None:intergenic 45.0%
!! GAGTTGATACCATTTGGTGC+AGG - Chr7:8000590-8000609 MsG0780036427.01.T01:intron 45.0%
!! GGGTGGATTGATAAACTCAC+AGG - Chr7:7999665-7999684 MsG0780036427.01.T01:CDS 45.0%
!! GTCGTTTTCCGGTTGATTCA+CGG + Chr7:7998105-7998124 None:intergenic 45.0%
AATTTGCCCTGGCATGCCAT+TGG - Chr7:8000619-8000638 MsG0780036427.01.T01:intron 50.0%
ACATCAGTTTGGGCGATGAC+TGG - Chr7:8000233-8000252 MsG0780036427.01.T01:intron 50.0%
AGTCATCGCCCAAACTGATG+TGG + Chr7:8000234-8000253 None:intergenic 50.0%
ATCTGTGTGCCATGTGATGG+TGG + Chr7:7999290-7999309 None:intergenic 50.0%
ATTCTACGCCCTGCACCAAA+TGG + Chr7:8000602-8000621 None:intergenic 50.0%
ATTTGCCCTGGCATGCCATT+GGG - Chr7:8000620-8000639 MsG0780036427.01.T01:intron 50.0%
CAATCCAGCCGTGAATCAAC+CGG - Chr7:7998094-7998113 MsG0780036427.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
GAGCAAGGTTGAGTCGTATG+AGG - Chr7:7998146-7998165 MsG0780036427.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
GATTGTGGGGACTGATTGTG+GGG - Chr7:7998177-7998196 MsG0780036427.01.T01:exon 50.0%
GGAAAACGACGTCGGAGTTA+CGG - Chr7:7998115-7998134 MsG0780036427.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
GTGAACGGTGGTTACCTTAG+TGG - Chr7:7998047-7998066 MsG0780036427.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
!! GTAACTCCGACGTCGTTTTC+CGG + Chr7:7998116-7998135 None:intergenic 50.0%
!! TTTTCCGGTTGATTCACGGC+TGG + Chr7:7998101-7998120 None:intergenic 50.0%
AAACGACGTCGGAGTTACGG+TGG - Chr7:7998118-7998137 MsG0780036427.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
AAGGAAGCAGCTCGCCACTA+AGG + Chr7:7998064-7998083 None:intergenic 55.0%
CGATTCCCAATGGCATGCCA+GGG + Chr7:8000628-8000647 None:intergenic 55.0%
CGGGATCTTTCCATGCCTCA+GGG + Chr7:8000511-8000530 None:intergenic 55.0%
CTGGTCTCTCTTGGGGCTAA+TGG + Chr7:8000410-8000429 None:intergenic 55.0%
GCCCCAAGAGAGACCAGTAA+AGG - Chr7:8000413-8000432 MsG0780036427.01.T01:intron 55.0%
TCCACTGTGGCGATTCCCAA+TGG + Chr7:8000638-8000657 None:intergenic 55.0%
TCGGGATCTTTCCATGCCTC+AGG + Chr7:8000512-8000531 None:intergenic 55.0%
TCTCTTGGGGCTAATGGTGC+TGG + Chr7:8000404-8000423 None:intergenic 55.0%
TGCCTCAGGGTCCCTATGAA+TGG + Chr7:8000498-8000517 None:intergenic 55.0%
TTAGTGGCGAGCTGCTTCCT+TGG - Chr7:7998063-7998082 MsG0780036427.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
TTCATAGGGACCCTGAGGCA+TGG - Chr7:8000498-8000517 MsG0780036427.01.T01:intron 55.0%
GCAGGGCGTAGAATTTGCCC+TGG - Chr7:8000608-8000627 MsG0780036427.01.T01:intron 60.0%
GCCATTGGGAATCGCCACAG+TGG - Chr7:8000634-8000653 MsG0780036427.01.T01:intron 60.0%
GCGAGCTGCTTCCTTGGAGT+CGG - Chr7:7998069-7998088 MsG0780036427.01.T01:three_prime_UTR 60.0%
GCGATTCCCAATGGCATGCC+AGG + Chr7:8000629-8000648 None:intergenic 60.0%
GGCCATTCATAGGGACCCTG+AGG - Chr7:8000493-8000512 MsG0780036427.01.T01:intron 60.0%
GGGACTGATTGTGGGGTCTG+AGG - Chr7:7998184-7998203 MsG0780036427.01.T01:CDS 60.0%
TCAGTTACGGCGGTGAACGG+TGG - Chr7:7998035-7998054 MsG0780036427.01.T01:three_prime_UTR 60.0%
!! GCTGGATTGCGCCGACTCCA+AGG + Chr7:7998083-7998102 None:intergenic 65.0%
GTTACGGTGGCGCGCGAGCA+AGG - Chr7:7998131-7998150 MsG0780036427.01.T01:three_prime_UTR 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 7998014 8000971 7998014 ID=MsG0780036427.01;Name=MsG0780036427.01
Chr7 mRNA 7998014 8000971 7998014 ID=MsG0780036427.01.T01;Parent=MsG0780036427.01;Name=MsG0780036427.01.T01;_AED=0.53;_eAED=0.53;_QI=0|0.5|0.33|0.66|1|1|3|169|534
Chr7 exon 7998014 7998788 7998014 ID=MsG0780036427.01.T01:exon:4209;Parent=MsG0780036427.01.T01
Chr7 exon 7999102 7999961 7999102 ID=MsG0780036427.01.T01:exon:4208;Parent=MsG0780036427.01.T01
Chr7 exon 8000833 8000971 8000833 ID=MsG0780036427.01.T01:exon:4207;Parent=MsG0780036427.01.T01
Chr7 CDS 8000833 8000971 8000833 ID=MsG0780036427.01.T01:cds;Parent=MsG0780036427.01.T01
Chr7 CDS 7999102 7999961 7999102 ID=MsG0780036427.01.T01:cds;Parent=MsG0780036427.01.T01
Chr7 CDS 7998183 7998788 7998183 ID=MsG0780036427.01.T01:cds;Parent=MsG0780036427.01.T01
Chr7 three_prime_UTR 7998014 7998182 7998014 ID=MsG0780036427.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0780036427.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780036427.01.T01

ATGGAGAAAACGGAAAACAAATCAGTTACGGCGGTGAACGGTGGTTACCTTAGTGGCGAGCTGCTTCCTTGGAGTCGGCGCAATCCAGCCGTGAATCAACCGGAAAACGACGTCGGAGTTACGGTGGCGCGCGAGCAAGTATTATTCCTTTTCTTGAAATACAAAACCAATATCAAGAAGAACTCATCATCATCCTTTCCAAAAGGTCCAAAAGGTCTTCCTATAATTGGAAATCTCCATCAACTTGACACTTCAAATCTCCATTTACAATTTTGGAATCTCTCAAAAATCTATGGTTCTCTTTTCTCTCTTCAACTTGGTTTCAAGAAAGCAATTGTTGTTTGTTCACCTAAACTAGCTCAAGAAATTCTCAAAGATCATGACCATGATGTATCTAGTAGACCACCATCACATGGCACACAGATATTATCATACAATGGCATGGATATGATATTTTCACCATACAATGATCATTGGAGAGAGATAAGAAAAATTTGTATTGTCCATTTCTTTAGCTCCAAGAAAATTTCTAGCTTTTCTCATGTGAGAAAATCTGAGGTCAAGCAAATGATTGAAAAAATATCTAACCATGTTCATTCCTCTGAAATTTCAAACCTTAGTGAGATCCTAATGTCTGTCTTAAGCTCTATAGTATGTAGAATTGCTTTTGGTAAAAGTTATGAGCATGAAGGTGGTGAGAAAAGTAGGTTCCATAATTTACTTCATGAGACAGAAGCTATTTTCCTTTCCTTCTTTGTTTCAGATCATATTCCTTTCATGGGGTGGATTGATAAACTCACAGGGGCAAATGCTCGTGTTGACAAGACTTTCAAGGCTTTGGATGAGTTTCTTGAACAAGTCCTTCAAGAACATCTCAATCCTAATAATCGGAAGAAAGATGAAGAAGAGAAGGATATAGTTGACGAGTTACTCGAGTTGAAGAATCAGGGTCGTCTCTCAATTGATCTCACCAATGATCACATCAAAGCCGTCCTTATGAACCTACTTGTAGCAGCTACTGACACAACTTCAGCCACATCAGTTTGGGCGATGACTGGATTAATGAAGAATCCTAGAGCAATGAAGAAAGCTCAAGAAGAAATTAGAAACATATGTGGCAAAAAAGAGTTCATAGATGAAGATGATATTCAAAAGCTCGTATATCTTAAGGCTGTGATAAAAGAGACATTAAGATTCTATGCACCAGCACCATTAGCCCCAAGAGAGACCAGTAAAGGTTTCATTCTAAATGGATATAAAATAGAACCAAAAACATCGGTGTTTGTGAATATTTGGGCCATTCATAGGGACCCTGAGGCATGGAAAGATCCCGACGAGTTTTATCCAGAGAGATTCTTAAACAATGATATAGATTTTAAGGGACGAGATTTTGAGTTGATACCATTTGGTGCAGGGCGTAGAATTTGCCCTGGCATGCCATTGGGAATCGCCACAGTGGAAATGATAATTGCAAACCTTCTTAATTCATTTGATTGGGAAATGCCTGAAGGGATGACAAAGGATGATATAGACATTGAAGGGTTGCCAGGACTTTCAAGACACAAGAAGAATCACCTTTGCCTTGTAGCCAAGAATCACATGTAA

Protein sequence

>MsG0780036427.01.T01

MEKTENKSVTAVNGGYLSGELLPWSRRNPAVNQPENDVGVTVAREQVLFLFLKYKTNIKKNSSSSFPKGPKGLPIIGNLHQLDTSNLHLQFWNLSKIYGSLFSLQLGFKKAIVVCSPKLAQEILKDHDHDVSSRPPSHGTQILSYNGMDMIFSPYNDHWREIRKICIVHFFSSKKISSFSHVRKSEVKQMIEKISNHVHSSEISNLSEILMSVLSSIVCRIAFGKSYEHEGGEKSRFHNLLHETEAIFLSFFVSDHIPFMGWIDKLTGANARVDKTFKALDEFLEQVLQEHLNPNNRKKDEEEKDIVDELLELKNQGRLSIDLTNDHIKAVLMNLLVAATDTTSATSVWAMTGLMKNPRAMKKAQEEIRNICGKKEFIDEDDIQKLVYLKAVIKETLRFYAPAPLAPRETSKGFILNGYKIEPKTSVFVNIWAIHRDPEAWKDPDEFYPERFLNNDIDFKGRDFELIPFGAGRRICPGMPLGIATVEMIIANLLNSFDWEMPEGMTKDDIDIEGLPGLSRHKKNHLCLVAKNHM*