AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180001207.01

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MsG0180001207.01.T01 AT2G23200 31.378 341 174 8 318 604 448 782 1.37e-43 168
MsG0180001207.01.T01 AT3G24550 35.531 273 132 6 337 573 273 537 1.38e-43 166
MsG0180001207.01.T01 AT2G37050 29.782 413 186 11 241 570 468 859 1.44e-43 168
MsG0180001207.01.T01 AT2G21480 35.401 274 137 6 332 572 512 778 1.83e-43 167
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MsG0180001207.01.T01 AT3G55450 32.542 295 152 6 343 595 97 386 3.05e-43 161
MsG0180001207.01.T01 AT4G13190 36.397 272 132 7 344 577 71 339 3.86e-43 160
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MsG0180001207.01.T01 AT5G28680 35.870 276 131 8 335 574 512 777 7.76e-43 166
MsG0180001207.01.T01 AT1G75820 28.177 543 306 17 59 533 382 908 7.86e-43 166
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MsG0180001207.01.T01 AT1G54820 35.849 265 122 6 329 550 132 391 8.47e-43 160
MsG0180001207.01.T01 AT4G28650 26.465 563 302 19 67 550 409 938 8.61e-43 166
MsG0180001207.01.T01 AT4G28650 30.682 264 138 10 45 275 50 301 1.29e-15 81.3
MsG0180001207.01.T01 AT4G28650 27.751 209 135 4 74 276 320 518 5.75e-11 66.2
MsG0180001207.01.T01 AT5G56040 26.943 579 298 20 56 550 461 998 1.15e-42 166
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MsG0180001207.01.T01 AT5G35580 35.714 266 126 7 344 570 76 335 1.50e-42 160
MsG0180001207.01.T01 AT1G61590 35.075 268 129 7 344 572 99 360 1.89e-42 159
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MsG0180001207.01.T01 AT5G02290 35.000 280 136 6 335 572 59 334 2.77e-42 157
MsG0180001207.01.T01 AT1G56720 31.907 257 133 5 331 552 166 415 2.97e-42 160
MsG0180001207.01.T01 AT1G56720 31.907 257 133 5 331 552 166 415 2.97e-42 160
MsG0180001207.01.T01 AT1G56720 31.907 257 133 5 331 552 166 415 2.97e-42 160
MsG0180001207.01.T01 AT1G56720 31.907 257 133 5 331 552 166 415 2.97e-42 160
MsG0180001207.01.T01 AT5G61350 34.586 266 135 5 343 573 524 785 5.55e-42 163
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MsG0180001207.01.T01 AT4G34440 31.624 351 177 11 252 553 214 550 1.19e-41 161
MsG0180001207.01.T01 AT4G05200 34.843 287 147 6 310 563 333 612 1.28e-41 161
MsG0180001207.01.T01 AT1G49730 35.926 270 123 7 349 578 362 621 1.46e-41 160
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MsG0180001207.01.T01 AT2G18470 33.829 269 132 6 342 575 282 539 1.51e-41 160
MsG0180001207.01.T01 AT2G18470 33.829 269 132 6 342 575 282 539 1.51e-41 160
MsG0180001207.01.T01 AT1G69790 34.274 248 118 5 343 550 72 314 1.56e-41 155
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MsG0180001207.01.T01 AT3G17420 34.510 255 129 6 331 552 141 390 1.81e-41 157
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MsG0180001207.01.T01 AT2G04300 28.340 494 261 17 189 604 350 828 2.90e-41 161
MsG0180001207.01.T01 AT2G28960 30.769 390 183 11 238 555 436 810 3.75e-41 160
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MsG0180001207.01.T01 AT1G09440 31.907 257 133 5 331 552 144 393 3.82e-41 156
MsG0180001207.01.T01 AT5G63930 26.194 649 371 16 59 623 478 1102 4.32e-41 161
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MsG0180001207.01.T01 AT1G51880 29.925 401 188 12 239 556 433 823 7.78e-41 160
MsG0180001207.01.T01 AT5G24010 34.043 282 133 8 343 582 488 758 7.99e-41 159
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MsG0180001207.01.T01 AT5G18500 33.202 253 133 5 331 551 153 401 1.31e-40 155
MsG0180001207.01.T01 AT5G18500 33.202 253 133 5 331 551 153 401 1.31e-40 155
MsG0180001207.01.T01 AT5G18500 33.202 253 133 5 331 551 153 401 1.31e-40 155
MsG0180001207.01.T01 AT5G18500 33.202 253 133 5 331 551 153 401 1.31e-40 155
MsG0180001207.01.T01 AT2G05940 32.517 286 135 8 344 579 87 364 1.41e-40 154
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MsG0180001207.01.T01 AT2G42960 32.031 256 132 5 331 551 170 418 2.12e-40 154
MsG0180001207.01.T01 AT5G48380 29.590 463 215 16 182 547 97 545 3.24e-40 156
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MsG0180001207.01.T01 AT5G59270 36.402 239 115 5 344 550 349 582 3.64e-40 156
MsG0180001207.01.T01 AT3G53840 34.686 271 137 5 337 570 347 614 3.97e-40 156
MsG0180001207.01.T01 AT5G59270 36.402 239 115 5 344 550 352 585 4.25e-40 156
MsG0180001207.01.T01 AT1G61610 35.249 261 130 6 336 563 517 771 4.31e-40 157
MsG0180001207.01.T01 AT5G16900 31.172 401 204 11 238 577 442 831 4.87e-40 157
MsG0180001207.01.T01 AT5G16900 31.172 401 204 11 238 577 442 831 4.87e-40 157
MsG0180001207.01.T01 AT5G59270 36.402 239 115 5 344 550 368 601 5.24e-40 156
MsG0180001207.01.T01 AT3G59420 36.194 268 132 7 337 570 505 767 5.66e-40 157
MsG0180001207.01.T01 AT1G71830 32.787 305 158 9 344 606 302 601 6.08e-40 155
MsG0180001207.01.T01 AT1G55610 26.603 624 327 21 67 570 504 1116 6.19e-40 157
MsG0180001207.01.T01 AT1G55610 26.603 624 327 21 67 570 504 1116 6.19e-40 157
MsG0180001207.01.T01 AT5G44700 25.680 588 310 23 67 550 629 1193 8.32e-40 157
MsG0180001207.01.T01 AT5G44700 24.242 297 182 9 45 334 52 312 2.33e-11 67.8
MsG0180001207.01.T01 AT1G61610 38.605 215 95 4 336 517 517 727 9.27e-40 156
MsG0180001207.01.T01 AT4G23190 35.227 264 130 7 336 563 264 522 9.37e-40 154
MsG0180001207.01.T01 AT4G23190 35.227 264 130 7 336 563 264 522 9.37e-40 154
MsG0180001207.01.T01 AT3G24240 26.842 570 286 19 63 543 491 1018 1.05e-39 157
MsG0180001207.01.T01 AT4G11530 35.472 265 126 7 336 563 344 600 1.10e-39 155
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MsG0180001207.01.T01 AT5G59670 29.286 420 231 13 205 571 410 816 1.16e-39 156
MsG0180001207.01.T01 AT3G02810 32.727 275 142 6 343 577 63 334 1.38e-39 153
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MsG0180001207.01.T01 AT4G35600 35.223 247 112 5 343 547 86 326 1.47e-39 150
MsG0180001207.01.T01 AT4G30520 28.571 399 197 11 239 558 154 543 1.71e-39 154
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MsG0180001207.01.T01 AT2G02800 32.963 270 133 6 343 570 82 345 2.04e-39 150
MsG0180001207.01.T01 AT1G76360 34.538 249 120 4 343 551 162 407 2.06e-39 151
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MsG0180001207.01.T01 AT1G34210 36.100 241 117 5 344 550 305 542 2.79e-39 153
MsG0180001207.01.T01 AT3G18810 34.568 243 118 5 344 551 337 573 3.55e-39 154
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MsG0180001207.01.T01 AT3G51550 33.206 262 134 7 343 570 535 789 6.38e-39 154
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MsG0180001207.01.T01 AT1G34110 25.122 613 320 22 67 574 457 1035 1.04e-38 154
MsG0180001207.01.T01 AT2G19190 31.492 362 182 9 238 540 442 796 1.12e-38 153
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MsG0180001207.01.T01 AT1G17230 26.073 303 192 11 9 282 8 307 2.12e-12 71.2
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MsG0180001207.01.T01 AT3G09830 34.432 273 134 6 343 574 83 351 2.30e-38 147
MsG0180001207.01.T01 AT4G11480 37.200 250 118 7 336 551 313 557 2.31e-38 151
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MsG0180001207.01.T01 AT1G51790 28.246 439 227 16 205 574 411 830 4.76e-38 151
MsG0180001207.01.T01 AT4G20270 35.833 240 115 5 346 550 712 947 4.93e-38 151
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MsG0180001207.01.T01 AT2G30740 31.873 251 132 6 337 550 64 312 5.42e-38 145
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MsG0180001207.01.T01 AT2G30740 31.873 251 132 6 337 550 64 312 5.42e-38 145
MsG0180001207.01.T01 AT1G49730 39.024 205 85 4 349 518 332 531 5.46e-38 149
MsG0180001207.01.T01 AT5G11020 32.197 264 144 4 337 570 96 354 5.56e-38 145
MsG0180001207.01.T01 AT4G11470 36.882 263 127 7 335 563 335 592 5.98e-38 150
MsG0180001207.01.T01 AT5G11020 32.197 264 144 4 337 570 100 358 6.25e-38 145
MsG0180001207.01.T01 AT4G22130 30.556 252 142 2 332 551 383 633 6.40e-38 150
MsG0180001207.01.T01 AT4G04540 37.657 239 107 7 343 548 323 552 6.62e-38 149
MsG0180001207.01.T01 AT1G19390 31.683 303 161 5 337 598 444 741 6.76e-38 150
MsG0180001207.01.T01 AT1G24030 34.322 236 112 5 332 529 50 280 7.02e-38 142
MsG0180001207.01.T01 AT3G59110 30.859 256 135 5 331 551 177 425 7.02e-38 147
MsG0180001207.01.T01 AT4G21400 37.143 245 112 6 343 550 348 587 7.14e-38 150
MsG0180001207.01.T01 AT4G11480 36.719 256 119 7 336 551 313 565 7.16e-38 149
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MsG0180001207.01.T01 AT4G04540 37.657 239 107 7 343 548 352 581 9.60e-38 149
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MsG0180001207.01.T01 AT5G58940 33.798 287 145 7 323 571 125 404 3.38e-37 145
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MsG0180001207.01.T01 AT2G28250 33.688 282 133 9 335 570 201 474 7.26e-37 145
MsG0180001207.01.T01 AT2G28250 33.688 282 133 9 335 570 201 474 7.26e-37 145
MsG0180001207.01.T01 AT2G28250 33.688 282 133 9 335 570 201 474 7.26e-37 145
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MsG0180001207.01.T01 AT1G48210 31.086 267 138 7 343 570 67 326 1.51e-36 140
MsG0180001207.01.T01 AT1G48210 31.086 267 138 7 343 570 67 326 1.51e-36 140
MsG0180001207.01.T01 AT1G48210 31.086 267 138 7 343 570 67 326 1.51e-36 140
MsG0180001207.01.T01 AT1G53430 32.046 259 140 4 337 563 621 875 1.56e-36 147
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MsG0180001207.01.T01 AT2G35620 25.866 433 206 11 239 564 126 550 1.71e-36 145
MsG0180001207.01.T01 AT2G35620 25.866 433 206 11 239 564 126 550 1.71e-36 145
MsG0180001207.01.T01 AT2G13800 34.298 242 122 5 344 551 158 396 1.74e-36 143
MsG0180001207.01.T01 AT2G13800 34.298 242 122 5 344 551 158 396 1.74e-36 143
MsG0180001207.01.T01 AT1G60800 32.950 261 139 5 343 569 233 491 1.85e-36 144
MsG0180001207.01.T01 AT4G21230 38.537 205 89 4 344 515 333 533 1.95e-36 145
MsG0180001207.01.T01 AT1G51860 35.510 245 115 7 347 556 587 823 1.96e-36 146
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MsG0180001207.01.T01 AT4G04540 37.946 224 99 6 343 532 352 569 2.01e-36 144
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MsG0180001207.01.T01 AT4G35030 32.384 281 145 9 331 574 91 363 2.11e-36 142
MsG0180001207.01.T01 AT4G35030 32.384 281 145 9 331 574 91 363 2.11e-36 142
MsG0180001207.01.T01 AT4G35030 32.384 281 145 9 331 574 91 363 2.11e-36 142
MsG0180001207.01.T01 AT4G23150 33.333 246 126 5 336 548 328 568 2.21e-36 145
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MsG0180001207.01.T01 AT4G23260 36.641 262 127 7 336 563 331 587 2.89e-36 145
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MsG0180001207.01.T01 AT2G13800 34.298 242 122 5 344 551 275 513 3.27e-36 144
MsG0180001207.01.T01 AT3G17840 26.072 583 318 20 24 531 32 576 3.57e-36 144
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MsG0180001207.01.T01 AT3G17410 32.653 245 124 6 344 551 69 309 3.65e-36 139
MsG0180001207.01.T01 AT2G29000 29.333 375 196 11 237 551 433 798 3.71e-36 145
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MsG0180001207.01.T01 AT5G59260 36.250 240 113 5 344 547 355 590 4.23e-36 144
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MsG0180001207.01.T01 AT3G62220 33.198 247 124 6 344 553 69 311 4.26e-36 139
MsG0180001207.01.T01 AT5G62230 24.839 620 348 18 48 574 258 852 4.29e-36 145
MsG0180001207.01.T01 AT4G00330 35.206 267 132 7 343 572 118 380 4.89e-36 140
MsG0180001207.01.T01 AT4G00330 35.206 267 132 7 343 572 118 380 4.89e-36 140
MsG0180001207.01.T01 AT5G62710 35.294 255 126 6 344 564 278 527 4.91e-36 143
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MsG0180001207.01.T01 AT3G09010 31.373 255 138 5 328 550 31 280 5.14e-36 140
MsG0180001207.01.T01 AT5G62710 35.294 255 126 6 344 564 312 561 5.46e-36 143
MsG0180001207.01.T01 AT1G61360 38.158 228 104 4 337 531 410 633 5.60e-36 144
MsG0180001207.01.T01 AT1G61360 38.158 228 104 4 337 531 410 633 5.60e-36 144
MsG0180001207.01.T01 AT1G61360 38.158 228 104 4 337 531 410 633 5.60e-36 144
MsG0180001207.01.T01 AT4G27300 36.986 219 101 4 344 529 500 714 5.91e-36 145
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MsG0180001207.01.T01 AT2G26330 25.084 594 304 20 67 573 360 899 6.32e-36 145
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MsG0180001207.01.T01 AT3G59350 32.787 244 125 7 344 550 71 312 7.98e-36 139
MsG0180001207.01.T01 AT4G27290 32.245 245 128 4 336 547 503 742 8.02e-36 144
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MsG0180001207.01.T01 AT1G51870 34.286 245 118 7 347 556 586 822 9.08e-36 144
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MsG0180001207.01.T01 AT4G23320 34.351 262 133 6 336 563 175 431 1.08e-35 141
MsG0180001207.01.T01 AT1G21250 32.000 275 147 6 329 570 394 661 1.10e-35 144
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MsG0180001207.01.T01 AT1G48210 33.333 228 108 5 343 531 67 289 1.91e-35 136
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MsG0180001207.01.T01 AT3G59350 32.787 244 125 7 344 550 113 354 2.86e-35 138
MsG0180001207.01.T01 AT3G59350 32.787 244 125 7 344 550 113 354 2.94e-35 137
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MsG0180001207.01.T01 AT1G79620 35.593 236 110 5 321 521 615 843 6.00e-35 142
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MsG0180001207.01.T01 AT5G10290 30.641 359 171 8 239 524 147 500 8.21e-35 140
MsG0180001207.01.T01 AT3G55550 34.211 228 113 4 337 531 339 562 8.44e-35 140
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Find 150 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 283 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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GGTGTAATCCCTGAATTCTT+TGG 0.327661 1:+17398388 MsG0180001207.01.T01:CDS
TGCACTCCTTGGCTATTGTT+TGG 0.330738 1:+17399789 MsG0180001207.01.T01:CDS
CTTAGTGAGAACCGCGATTT+CGG 0.335999 1:-17399746 None:intergenic
CAGCTATGGCGTGATTCTTA+TGG 0.340944 1:+17401339 MsG0180001207.01.T01:CDS
AACAGCCCTGGCTCTAGTTC+TGG 0.354265 1:+17399249 MsG0180001207.01.T01:CDS
GAGAGTTTCAGGACTATTGC+AGG 0.356405 1:+17401508 MsG0180001207.01.T01:CDS
GCTTTCGGTTGTTGAACCTT+TGG 0.372648 1:+17398866 MsG0180001207.01.T01:CDS
AAATGTGGAAGGTGGTAGTA+TGG 0.378784 1:+17399551 MsG0180001207.01.T01:CDS
GGTTGTTAATGCTTTGCTTT+CGG 0.382563 1:+17398851 MsG0180001207.01.T01:CDS
CAAACTCAGATTATTGCAAA+TGG 0.385638 1:+17398020 MsG0180001207.01.T01:CDS
GGAATTTGCCATTGAGGAAA+AGG 0.389712 1:-17398304 None:intergenic
TGCAATGGAAACAGTTTATC+TGG 0.390667 1:+17398157 MsG0180001207.01.T01:CDS
AAACAATTCTTAAGACTAGA+AGG 0.392101 1:-17398325 None:intergenic
CTGGAAAGGGATTATTTGTT+CGG 0.400336 1:+17398946 MsG0180001207.01.T01:CDS
GCTCCTTGCACAGCAGTGGC+TGG 0.402312 1:-17401536 None:intergenic
TAGCTTTGTACTAAGGTTGT+TGG 0.413998 1:+17398813 MsG0180001207.01.T01:intron
TGTCTTTGAATACATGCCTC+AGG 0.415839 1:+17399831 MsG0180001207.01.T01:CDS
TGGGAGAAAGTTTCTTGTAA+TGG 0.417965 1:+17398040 MsG0180001207.01.T01:CDS
TGAAGTGAAATTGGCATGTA+AGG 0.420066 1:-17398187 None:intergenic
CGAAATCGCGGTTCTCACTA+AGG 0.421588 1:+17399747 MsG0180001207.01.T01:CDS
TCATTCCAGACTAAACTTGC+AGG 0.427810 1:+17400087 MsG0180001207.01.T01:CDS
CATCAAGCAGTAATCTTGAT+TGG 0.428241 1:+17397996 MsG0180001207.01.T01:CDS
AAGTTCCTGCAAGTTTAGTC+TGG 0.429737 1:-17400092 None:intergenic
TAAGGTTCGACACAGGCATT+TGG 0.435239 1:+17399765 MsG0180001207.01.T01:CDS
GAACTAGAGCCAGGGCTGTT+GGG 0.435658 1:-17399246 None:intergenic
GGATTAATAGCTTTGTACTA+AGG 0.436768 1:+17398806 MsG0180001207.01.T01:intron
ACCCTTGTAGCGGTGATAGC+TGG 0.437409 1:+17398927 MsG0180001207.01.T01:CDS
TTTCAGGACTATTGCAGGAT+TGG 0.438779 1:+17401513 MsG0180001207.01.T01:CDS
AACACCTCTAGCAACATCTA+AGG 0.446340 1:-17399932 None:intergenic
TAAAAGGATGAAATCTGAAA+TGG 0.447889 1:+17399693 MsG0180001207.01.T01:CDS
GCCCACTCGCCCAACAGCCC+TGG 0.448420 1:+17399237 MsG0180001207.01.T01:CDS
AGAGGTGTTGAATATCTTCA+TGG 0.449067 1:+17399946 MsG0180001207.01.T01:CDS
ACTTGATCTCATTCAGCCCT+TGG 0.450479 1:-17399723 None:intergenic
AGGCATTTGGTTGCACTCCT+TGG 0.451581 1:+17399778 MsG0180001207.01.T01:CDS
CTATGATCTTTGTTTCTGCA+TGG 0.457063 1:+17397927 MsG0180001207.01.T01:CDS
GTTTCGAGTAATGCATTGTA+TGG 0.457545 1:+17399133 MsG0180001207.01.T01:CDS
TTACCTCCAGAACTAGAGCC+AGG 0.459578 1:-17399255 None:intergenic
GTATCTTTCCAAAGAATTCA+GGG 0.463406 1:-17398396 None:intergenic
GGACATCGACGAGGAAGGCT+TGG 0.463718 1:+17401486 MsG0180001207.01.T01:CDS
CTCTTGAACTTGCTAAAAGC+TGG 0.466841 1:+17398894 MsG0180001207.01.T01:CDS
TCAAGTGTTGAGAGAAGTTA+CGG 0.470563 1:+17399583 MsG0180001207.01.T01:CDS
GCCTCATCAGCGTCCTGACA+TGG 0.473256 1:+17401557 MsG0180001207.01.T01:CDS
GGTGGATGTTCTCATCTTGT+CGG 0.474085 1:-17401396 None:intergenic
AAAGGTGATTGATCCAGAAA+TGG 0.475782 1:+17401465 MsG0180001207.01.T01:CDS
AGAACTAGAGCCAGGGCTGT+TGG 0.478696 1:-17399247 None:intergenic
AGTATACCACCTAGGTCTCC+TGG 0.478859 1:+17401779 MsG0180001207.01.T01:CDS
GAAAAGAACATATTGGGAAA+AGG 0.480045 1:+17399616 MsG0180001207.01.T01:CDS
TGTAATGGAAATCGTGTCAC+TGG 0.482263 1:+17398055 MsG0180001207.01.T01:CDS
TTCCAGCTATCACCGCTACA+AGG 0.482287 1:-17398929 None:intergenic
GGAGATGTTGTTGTTAAAAC+CGG 0.484960 1:+17399175 MsG0180001207.01.T01:CDS
TTCACTACGTGTCCCATGTC+AGG 0.485705 1:-17401570 None:intergenic
GCTGTATACGTCTACCTTTG+TGG 0.485891 1:-17401320 None:intergenic
AAAGGGATTATTTGTTCGGC+TGG 0.486992 1:+17398950 MsG0180001207.01.T01:CDS
TTAGTCAACATCTCTTTGAC+TGG 0.490862 1:+17399860 MsG0180001207.01.T01:CDS
GAACAAAGACTCATTTGAAA+AGG 0.492281 1:+17401447 MsG0180001207.01.T01:CDS
AGCCAGGGCTGTTGGGCGAG+TGG 0.492484 1:-17399239 None:intergenic
CACAACAAGATGAAGAATGA+TGG 0.495356 1:-17397897 None:intergenic
AAACTCAGATTATTGCAAAT+GGG 0.496156 1:+17398021 MsG0180001207.01.T01:CDS
ATCAGCAGATGTAAAGGAAT+CGG 0.501145 1:-17401807 None:intergenic
ATCAATCAAATTACTCATGT+TGG 0.504721 1:-17398263 None:intergenic
GGCATACTAGCAAGCTCCTT+AGG 0.505770 1:-17399091 None:intergenic
TCCAATATCAGGATTTCCAC+CGG 0.506435 1:-17399194 None:intergenic
GCCAGGGCTGTTGGGCGAGT+GGG 0.508833 1:-17399238 None:intergenic
TTAACTCGATTTGAATGCAA+TGG 0.512302 1:+17398142 MsG0180001207.01.T01:CDS
GAAAGCAAAGCATTAACAAC+CGG 0.514648 1:-17398849 None:intergenic
AATTTGATTGATGTGAGTAT+TGG 0.515135 1:+17398274 MsG0180001207.01.T01:CDS
TGTTGGTCAACCATGTAGTC+CGG 0.520384 1:+17398830 MsG0180001207.01.T01:CDS
TCTTGCATCAGCAGATGTAA+AGG 0.522971 1:-17401813 None:intergenic
TACAAAGGAGAGTTGGATGA+TGG 0.526122 1:+17399655 MsG0180001207.01.T01:CDS
TGTTTCATATTCTTCGTCGA+TGG 0.527144 1:+17401730 MsG0180001207.01.T01:CDS
CGGCATCGAAGCGAAATTGT+TGG 0.527708 1:-17398227 None:intergenic
GCATTAACAACCGGACTACA+TGG 0.530077 1:-17398840 None:intergenic
GGAGATGATTACTGGAAAGA+AGG 0.530140 1:+17401360 MsG0180001207.01.T01:CDS
CTAGAAGGAATTTGCCATTG+AGG 0.530571 1:-17398310 None:intergenic
ACCTCGTTACATGGTTCCGC+AGG 0.534496 1:+17401416 MsG0180001207.01.T01:CDS
GAATTTGCCATTGAGGAAAA+GGG 0.535615 1:-17398303 None:intergenic
GTAAAGGAATCGGCAAATCC+AGG 0.538007 1:-17401797 None:intergenic
TGGCCAGCCACTGCTGTGCA+AGG 0.538064 1:+17401533 MsG0180001207.01.T01:CDS
CGTCTACCTTTGTGGTGACT+CGG 0.540244 1:-17401312 None:intergenic
AGAACATCCACCTCGTTACA+TGG 0.544646 1:+17401407 MsG0180001207.01.T01:CDS
ACATCTAGCTCTTTCAAAGC+CGG 0.548894 1:-17399112 None:intergenic
CTGCTCAAGCACTCATGAAG+TGG 0.549814 1:+17401675 MsG0180001207.01.T01:CDS
GATGTTGTTGTTAAAACCGG+TGG 0.551039 1:+17399178 MsG0180001207.01.T01:CDS
TACCTTTGTGGTGACTCGGC+CGG 0.551272 1:-17401308 None:intergenic
AGAACATATTGGGAAAAGGC+GGG 0.554202 1:+17399620 MsG0180001207.01.T01:CDS
GAACTTGCTAAAAGCTGGAA+AGG 0.561270 1:+17398899 MsG0180001207.01.T01:CDS
GGCGTTACAGGAGGAACTAG+TGG 0.562513 1:+17399504 MsG0180001207.01.T01:intron
TGTAGCGGTGATAGCTGGAA+AGG 0.563135 1:+17398932 MsG0180001207.01.T01:CDS
TCTGAAATGGTTGGTGACCA+AGG 0.564718 1:+17399706 MsG0180001207.01.T01:CDS
CACTGTATACAAAGGAGAGT+TGG 0.564994 1:+17399648 MsG0180001207.01.T01:CDS
TCTAGCAACATCTAAGGCAA+TGG 0.566132 1:-17399926 None:intergenic
TAAGGAGCTTGCTAGTATGC+CGG 0.566570 1:+17399093 MsG0180001207.01.T01:CDS
TGAGGCTCCTTGCACAGCAG+TGG 0.573372 1:-17401540 None:intergenic
CCCATGTCAGGACGCTGATG+AGG 0.576947 1:-17401558 None:intergenic
GTAGCGGTGATAGCTGGAAA+GGG 0.577032 1:+17398933 MsG0180001207.01.T01:CDS
GTCTTTGAATACATGCCTCA+GGG 0.580713 1:+17399832 MsG0180001207.01.T01:CDS
ACAACATCTCCGCGAAACGA+TGG 0.581254 1:-17399163 None:intergenic
GGGCGAGTGGGCGAATCATG+AGG 0.582156 1:-17399226 None:intergenic
GGTCAGATACCATCGTTTCG+CGG 0.584917 1:+17399154 MsG0180001207.01.T01:CDS
TTTCATCCAAACAATAGCCA+AGG 0.585536 1:-17399795 None:intergenic
ATTGCCTTAGATGTTGCTAG+AGG 0.587343 1:+17399928 MsG0180001207.01.T01:CDS
ATGAAGTGGCAGAATCATGA+AGG 0.588660 1:+17401689 MsG0180001207.01.T01:CDS
TCTCACCGGCACTATACCTA+AGG 0.591023 1:+17399075 MsG0180001207.01.T01:CDS
TCGGCAAATCCAGGAGACCT+AGG 0.594777 1:-17401788 None:intergenic
AAGGTAGACGTATACAGCTA+TGG 0.597178 1:+17401325 MsG0180001207.01.T01:CDS
CTTAGTAATAATCATCTCAC+CGG 0.597454 1:+17399061 MsG0180001207.01.T01:CDS
AACCACTCGGATGGAAGAGA+AGG 0.599181 1:+17399899 MsG0180001207.01.T01:CDS
TATATGGCACCAGAGTATGC+AGG 0.599504 1:+17400120 MsG0180001207.01.T01:CDS
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TGAGATCAAGTCCGAAATCG+CGG 0.599688 1:+17399735 MsG0180001207.01.T01:CDS
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AAGCTCCTTAGGTATAGTGC+CGG 0.615452 1:-17399080 None:intergenic
AATGTGTTACCTGCATACTC+TGG 0.616148 1:-17400129 None:intergenic
TACCTCCAGAACTAGAGCCA+GGG 0.616555 1:-17399254 None:intergenic
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AAGAACATATTGGGAAAAGG+CGG 0.637601 1:+17399619 MsG0180001207.01.T01:CDS
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TCCAGCTATCACCGCTACAA+GGG 0.642521 1:-17398928 None:intergenic
CAACTCTCCTTTGTATACAG+TGG 0.645721 1:-17399647 None:intergenic
TGCGGAACCATGTAACGAGG+TGG 0.650581 1:-17401414 None:intergenic
CTTTGTTCAGTAGCATCCTG+CGG 0.660565 1:-17401432 None:intergenic
ATGTTGGTGAAGAAATCACT+CGG 0.662910 1:-17398247 None:intergenic
GAAATGGACATCGACGAGGA+AGG 0.663992 1:+17401481 MsG0180001207.01.T01:CDS
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AAGTTCAAGAGGATAACCAA+AGG 0.695842 1:-17398882 None:intergenic
GACGACGGCTTGAAACCACT+CGG 0.700349 1:+17399886 MsG0180001207.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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!!! TTTAAATCACTTTTTTTATT+GGG + Chr1:17401229-17401248 MsG0180001207.01.T01:intron 10.0%
!!! TTTTAAATCACTTTTTTTAT+TGG + Chr1:17401228-17401247 MsG0180001207.01.T01:intron 10.0%
!! TGTTATAAATCATTTCTATA+TGG - Chr1:17400862-17400881 None:intergenic 15.0%
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!!! TTTAAACTTTTGAAAAGAAA+TGG + Chr1:17401022-17401041 MsG0180001207.01.T01:intron 15.0%
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! ACTGCAAAAAAATCTCTTTA+TGG + Chr1:17401187-17401206 MsG0180001207.01.T01:intron 25.0%
! ATCAATCAAATTACTCATGT+TGG - Chr1:17398266-17398285 None:intergenic 25.0%
! GACATCATTGAAACAAATTT+GGG + Chr1:17398570-17398589 MsG0180001207.01.T01:intron 25.0%
! GTTATCAACTTTCAAAACAT+GGG + Chr1:17398983-17399002 MsG0180001207.01.T01:intron 25.0%
! TAAAAGGATGAAATCTGAAA+TGG + Chr1:17399693-17399712 MsG0180001207.01.T01:CDS 25.0%
! TATAGCAGAAAAATTCTGAA+GGG - Chr1:17398353-17398372 None:intergenic 25.0%
! TCTTATGTAACAAGTTATGA+TGG + Chr1:17400511-17400530 MsG0180001207.01.T01:intron 25.0%
! TGACATCATTGAAACAAATT+TGG + Chr1:17398569-17398588 MsG0180001207.01.T01:intron 25.0%
! TTAAATTTGTCTATACCTAG+TGG + Chr1:17400397-17400416 MsG0180001207.01.T01:intron 25.0%
! TTATAGCAGAAAAATTCTGA+AGG - Chr1:17398354-17398373 None:intergenic 25.0%
! TTCAAATACTGAAGTGAAAT+TGG - Chr1:17398199-17398218 None:intergenic 25.0%
! TTGACAAACATTATCTTCAA+GGG + Chr1:17398731-17398750 MsG0180001207.01.T01:intron 25.0%
! TTTGACAAACATTATCTTCA+AGG + Chr1:17398730-17398749 MsG0180001207.01.T01:intron 25.0%
!! AAAAACATGGTTTATGGTTT+TGG - Chr1:17400717-17400736 None:intergenic 25.0%
!! ACTTTGAAAAACATGGTTTA+TGG - Chr1:17400723-17400742 None:intergenic 25.0%
!!! AAGAAAATTGACTTGTAATC+AGG + Chr1:17400916-17400935 MsG0180001207.01.T01:intron 25.0%
!!! ATTGTTGGCTTAATAATTGT+TGG + Chr1:17399327-17399346 MsG0180001207.01.T01:intron 25.0%
!!! GTTGATAATGATATTGATAG+AGG + Chr1:17398784-17398803 MsG0180001207.01.T01:intron 25.0%
AGTATCTTTCCAAAGAATTC+AGG - Chr1:17398400-17398419 None:intergenic 30.0%
ATCAGATGTAGTGGTATTAT+TGG + Chr1:17400761-17400780 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
ATTCTTATGGAGATGATTAC+TGG + Chr1:17401352-17401371 MsG0180001207.01.T01:CDS 30.0%
CAAACTCAGATTATTGCAAA+TGG + Chr1:17398020-17398039 MsG0180001207.01.T01:CDS 30.0%
CTTAATAATTGTTGGTGTAG+GGG + Chr1:17399335-17399354 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
CTTAGTAATAATCATCTCAC+CGG + Chr1:17399061-17399080 MsG0180001207.01.T01:CDS 30.0%
GAAAAGAACATATTGGGAAA+AGG + Chr1:17399616-17399635 MsG0180001207.01.T01:CDS 30.0%
GAACAAAGACTCATTTGAAA+AGG + Chr1:17401447-17401466 MsG0180001207.01.T01:CDS 30.0%
GAACAAAGATTGCAGTTAAA+AGG + Chr1:17399677-17399696 MsG0180001207.01.T01:CDS 30.0%
GAACTACCAGATAAACTATT+AGG - Chr1:17398477-17398496 None:intergenic 30.0%
GATAAGAAGAAAGTTAGTGT+TGG + Chr1:17399279-17399298 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
GCTTAATAATTGTTGGTGTA+GGG + Chr1:17399334-17399353 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
GGTTATCAACTTTCAAAACA+TGG + Chr1:17398982-17399001 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
GTATCTTTCCAAAGAATTCA+GGG - Chr1:17398399-17398418 None:intergenic 30.0%
GTTGCACATGTTAATTATCT+AGG + Chr1:17400195-17400214 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
TAGCTGTTACAATCACAAAA+AGG - Chr1:17400489-17400508 None:intergenic 30.0%
TATACAGAACTTTGGGTAAA+TGG + Chr1:17398497-17398516 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
TGATCATGATTCGATAAATC+AGG - Chr1:17398625-17398644 None:intergenic 30.0%
TGATTCGATAAATCAGGTAT+CGG - Chr1:17398619-17398638 None:intergenic 30.0%
TGTCTTTCAATTCTCTTGAA+GGG + Chr1:17398445-17398464 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
TGTTGAATATCTTCATGGTT+TGG + Chr1:17399951-17399970 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
TTGAGAGATAATCAGTTAAC+CGG + Chr1:17398661-17398680 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
TTGTGAGAAAATCACTCATA+AGG + Chr1:17400983-17401002 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
! ACAACAAATTTTCATCCACA+GGG + Chr1:17399975-17399994 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
! ATCTGATATAGATTTTCACG+AGG - Chr1:17400748-17400767 None:intergenic 30.0%
! CACTCATAAGGATTTTCAAA+GGG + Chr1:17400995-17401014 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
! GGTTTATCTTTTCCAATATC+AGG - Chr1:17399208-17399227 None:intergenic 30.0%
! GTAGTTCTATACAGAACTTT+GGG + Chr1:17398490-17398509 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
! TCACTCATAAGGATTTTCAA+AGG + Chr1:17400994-17401013 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
! TTAACTCGATTTGAATGCAA+TGG + Chr1:17398142-17398161 MsG0180001207.01.T01:CDS 30.0%
! TTGAAACAAATTTGGGTTCA+TGG + Chr1:17398577-17398596 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
! TTTCAAAACATGGGTTTTTC+TGG + Chr1:17398992-17399011 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
!! CTGATGTTGATGACATATAT+GGG + Chr1:17401634-17401653 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
!! CTTTGGAAAGATACTTTTCA+AGG + Chr1:17398405-17398424 MsG0180001207.01.T01:CDS 30.0%
!! GGATTAATAGCTTTGTACTA+AGG + Chr1:17398806-17398825 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
!!! CGAACACTATTTTGAAACTT+CGG - Chr1:17398763-17398782 None:intergenic 30.0%
!!! GCTATAAATGCTAGTTTTGT+TGG + Chr1:17398367-17398386 MsG0180001207.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTTTTAGCTTGTAGTGATAA+AGG + Chr1:17400370-17400389 MsG0180001207.01.T01:intron 30.0%
AAACCATCGAATATCTTGCT+TGG + Chr1:17400003-17400022 MsG0180001207.01.T01:intron 35.0%
AAAGGTGATTGATCCAGAAA+TGG + Chr1:17401465-17401484 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
AACTTGGAAGCGAAGTAAAA+CGG - Chr1:17398697-17398716 None:intergenic 35.0%
AAGAACATATTGGGAAAAGG+CGG + Chr1:17399619-17399638 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
AAGTTCAAGAGGATAACCAA+AGG - Chr1:17398885-17398904 None:intergenic 35.0%
AGAAGACATAATAAGCGTGA+TGG + Chr1:17399381-17399400 MsG0180001207.01.T01:intron 35.0%
ATATGTGACTGTTAGAGTGA+CGG - Chr1:17400838-17400857 None:intergenic 35.0%
ATCAGCAGATGTAAAGGAAT+CGG - Chr1:17401810-17401829 None:intergenic 35.0%
ATCTGAATCTTAGATCCACT+AGG - Chr1:17400415-17400434 None:intergenic 35.0%
CACAACAAGATGAAGAATGA+TGG - Chr1:17397900-17397919 None:intergenic 35.0%
CATCAAGCAGTAATCTTGAT+TGG + Chr1:17397996-17398015 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
CCATATATGTCATCAACATC+AGG - Chr1:17401636-17401655 None:intergenic 35.0%
CTGGAAAGGGATTATTTGTT+CGG + Chr1:17398946-17398965 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
GAACTAAGACTAGCAAAACT+AGG - Chr1:17399026-17399045 None:intergenic 35.0%
GAATTTGCCATTGAGGAAAA+GGG - Chr1:17398306-17398325 None:intergenic 35.0%
GGCTTAATAATTGTTGGTGT+AGG + Chr1:17399333-17399352 MsG0180001207.01.T01:intron 35.0%
GGTTGTTAATGCTTTGCTTT+CGG + Chr1:17398851-17398870 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
GTGTCTTTCAATTCTCTTGA+AGG + Chr1:17398444-17398463 MsG0180001207.01.T01:intron 35.0%
GTTCATGGTAATTCGTTTAC+TGG + Chr1:17398592-17398611 MsG0180001207.01.T01:intron 35.0%
TACTTCGCTTCCAAGTTTAA+CGG + Chr1:17398700-17398719 MsG0180001207.01.T01:intron 35.0%
TGAAGTGAAATTGGCATGTA+AGG - Chr1:17398190-17398209 None:intergenic 35.0%
TGCAATGGAAACAGTTTATC+TGG + Chr1:17398157-17398176 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
TGGGAGAAAGTTTCTTGTAA+TGG + Chr1:17398040-17398059 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
TGTTTCATATTCTTCGTCGA+TGG + Chr1:17401730-17401749 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
TTAGTCAACATCTCTTTGAC+TGG + Chr1:17399860-17399879 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
TTTCATCCAAACAATAGCCA+AGG - Chr1:17399798-17399817 None:intergenic 35.0%
! ACTAAACTTGCAGGAACTTT+TGG + Chr1:17400096-17400115 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
! AGGATGAAATCTGAAATGGT+TGG + Chr1:17399697-17399716 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
! ATGTTGGTGAAGAAATCACT+CGG - Chr1:17398250-17398269 None:intergenic 35.0%
! CACAACAAATTTTCATCCAC+AGG + Chr1:17399974-17399993 MsG0180001207.01.T01:intron 35.0%
! GAAAGCAAAGCATTAACAAC+CGG - Chr1:17398852-17398871 None:intergenic 35.0%
! GGAGATGTTGTTGTTAAAAC+CGG + Chr1:17399175-17399194 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
! GGTAGTTCTATACAGAACTT+TGG + Chr1:17398489-17398508 MsG0180001207.01.T01:intron 35.0%
! GTGAGTTGCATGATTTCTTT+TGG - Chr1:17398118-17398137 None:intergenic 35.0%
! GTTACTTTCTTGATTGTCAC+AGG - Chr1:17400695-17400714 None:intergenic 35.0%
! GTTATAACCCTTTTCCTCAA+TGG + Chr1:17398296-17398315 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
! GTTTCGAGTAATGCATTGTA+TGG + Chr1:17399133-17399152 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
! TGCAGGAACTTTTGGATATA+TGG + Chr1:17400104-17400123 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
! TGGTGTGAAAATAAGTGTTG+CGG + Chr1:17399461-17399480 MsG0180001207.01.T01:intron 35.0%
!! AGAGGTGTTGAATATCTTCA+TGG + Chr1:17399946-17399965 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
!! CCTGATGTTGATGACATATA+TGG + Chr1:17401633-17401652 MsG0180001207.01.T01:intron 35.0%
!! CTATGATCTTTGTTTCTGCA+TGG + Chr1:17397927-17397946 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
!! TAGCTTTGTACTAAGGTTGT+TGG + Chr1:17398813-17398832 MsG0180001207.01.T01:intron 35.0%
!! TCAAGGTTTGACTGATTTGA+AGG + Chr1:17398422-17398441 MsG0180001207.01.T01:intron 35.0%
!! TCAAGTGTTGAGAGAAGTTA+CGG + Chr1:17399583-17399602 MsG0180001207.01.T01:CDS 35.0%
!! TTAGCTTGTAGTGATAAAGG+CGG + Chr1:17400373-17400392 MsG0180001207.01.T01:intron 35.0%
AAAGGGATTATTTGTTCGGC+TGG + Chr1:17398950-17398969 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
AAAGGTAATGACCCTTGTAG+CGG + Chr1:17398917-17398936 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
AAATGTGGAAGGTGGTAGTA+TGG + Chr1:17399551-17399570 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
AACACCTCTAGCAACATCTA+AGG - Chr1:17399935-17399954 None:intergenic 40.0%
AAGGTAGACGTATACAGCTA+TGG + Chr1:17401325-17401344 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
AAGTTCCTGCAAGTTTAGTC+TGG - Chr1:17400095-17400114 None:intergenic 40.0%
AATGTGTTACCTGCATACTC+TGG - Chr1:17400132-17400151 None:intergenic 40.0%
AGAACATATTGGGAAAAGGC+GGG + Chr1:17399620-17399639 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
AGTGTCAAAAATGTGGAAGG+TGG + Chr1:17399543-17399562 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
ATAGCATGTCTGCACATAAC+AGG + Chr1:17400559-17400578 MsG0180001207.01.T01:intron 40.0%
ATGAAGTGGCAGAATCATGA+AGG + Chr1:17401689-17401708 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
ATTGCCTTAGATGTTGCTAG+AGG + Chr1:17399928-17399947 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
CAACTCTCCTTTGTATACAG+TGG - Chr1:17399650-17399669 None:intergenic 40.0%
CAAGTCGAACTAATCCAAGT+CGG - Chr1:17400050-17400069 None:intergenic 40.0%
CACTGTATACAAAGGAGAGT+TGG + Chr1:17399648-17399667 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
CATCCAAGCAAGATATTCGA+TGG - Chr1:17400009-17400028 None:intergenic 40.0%
CTAGAAGGAATTTGCCATTG+AGG - Chr1:17398313-17398332 None:intergenic 40.0%
GGAATTTGCCATTGAGGAAA+AGG - Chr1:17398307-17398326 None:intergenic 40.0%
GGAGATATGACTCATTTGTG+AGG - Chr1:17400816-17400835 None:intergenic 40.0%
GGAGATGATTACTGGAAAGA+AGG + Chr1:17401360-17401379 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
GGATGTATCACTATCGCATT+CGG - Chr1:17399420-17399439 None:intergenic 40.0%
GGTGTAATCCCTGAATTCTT+TGG + Chr1:17398388-17398407 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
GTCTTTGAATACATGCCTCA+GGG + Chr1:17399832-17399851 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
GTGATACATCCTCATCATTC+TGG + Chr1:17399429-17399448 MsG0180001207.01.T01:intron 40.0%
GTTATGTGCAGACATGCTAT+CGG - Chr1:17400559-17400578 None:intergenic 40.0%
TACAAAGGAGAGTTGGATGA+TGG + Chr1:17399655-17399674 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
TAGCATGTCTGCACATAACA+GGG + Chr1:17400560-17400579 MsG0180001207.01.T01:intron 40.0%
TATGTGACTGTTAGAGTGAC+GGG - Chr1:17400837-17400856 None:intergenic 40.0%
TCATTCCAGACTAAACTTGC+AGG + Chr1:17400087-17400106 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
TCCAATATCAGGATTTCCAC+CGG - Chr1:17399197-17399216 None:intergenic 40.0%
TCTTGCATCAGCAGATGTAA+AGG - Chr1:17401816-17401835 None:intergenic 40.0%
TGTCTTTGAATACATGCCTC+AGG + Chr1:17399831-17399850 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
TTTCAGGACTATTGCAGGAT+TGG + Chr1:17401513-17401532 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
TTTCCTTCTCCAGAATGATG+AGG - Chr1:17399441-17399460 None:intergenic 40.0%
! AATTGTTGGTGTAGGGGTTT+TGG + Chr1:17399341-17399360 MsG0180001207.01.T01:intron 40.0%
! ACATTTTTGACACTCCTCGA+TGG - Chr1:17399537-17399556 None:intergenic 40.0%
! CAGCTTTTAGCAAGTTCAAG+AGG - Chr1:17398896-17398915 None:intergenic 40.0%
! CATCATTCTGGAGAAGGAAA+TGG + Chr1:17399441-17399460 MsG0180001207.01.T01:intron 40.0%
! CGAGGCTACTTTGAAAAACA+TGG - Chr1:17400730-17400749 None:intergenic 40.0%
! GATGTTGTTGTTAAAACCGG+TGG + Chr1:17399178-17399197 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
! GTGGATCTAAGATTCAGATG+AGG + Chr1:17400416-17400435 MsG0180001207.01.T01:intron 40.0%
! TCTAGCAACATCTAAGGCAA+TGG - Chr1:17399929-17399948 None:intergenic 40.0%
! TGTAATGGAAATCGTGTCAC+TGG + Chr1:17398055-17398074 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
! TTAGTGTTGGAGCGATTGTT+GGG + Chr1:17399292-17399311 MsG0180001207.01.T01:intron 40.0%
! TTGTTCGGCTGGTAATGTTT+CGG + Chr1:17398961-17398980 MsG0180001207.01.T01:intron 40.0%
!! ACATCTAGCTCTTTCAAAGC+CGG - Chr1:17399115-17399134 None:intergenic 40.0%
!! AGGAGTGTCAAAAATGTGGA+AGG + Chr1:17399540-17399559 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
!! ATCGAGGAGTGTCAAAAATG+TGG + Chr1:17399536-17399555 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
!! CTCTTGAACTTGCTAAAAGC+TGG + Chr1:17398894-17398913 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
!! GAACTTGCTAAAAGCTGGAA+AGG + Chr1:17398899-17398918 MsG0180001207.01.T01:CDS 40.0%
AAGCTCCTTAGGTATAGTGC+CGG - Chr1:17399083-17399102 None:intergenic 45.0%
ACCGGTGGAAATCCTGATAT+TGG + Chr1:17399193-17399212 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
ACTTGATCTCATTCAGCCCT+TGG - Chr1:17399726-17399745 None:intergenic 45.0%
AGAACATCCACCTCGTTACA+TGG + Chr1:17401407-17401426 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
AGCGATTGTTGGGATTGTGA+TGG + Chr1:17399302-17399321 MsG0180001207.01.T01:intron 45.0%
AGGCCTTTATTAGAGCCTTC+AGG - Chr1:17400796-17400815 None:intergenic 45.0%
CACAGTCAAGTATACCACCT+AGG + Chr1:17401771-17401790 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
CAGCTATGGCGTGATTCTTA+TGG + Chr1:17401339-17401358 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
CGATTGTTGGGATTGTGATG+GGG + Chr1:17399304-17399323 MsG0180001207.01.T01:intron 45.0%
CTCTTTGACTGGAAAGACGA+CGG + Chr1:17399871-17399890 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
CTTAGTGAGAACCGCGATTT+CGG - Chr1:17399749-17399768 None:intergenic 45.0%
CTTTGTTCAGTAGCATCCTG+CGG - Chr1:17401435-17401454 None:intergenic 45.0%
GAGAGTTTCAGGACTATTGC+AGG + Chr1:17401508-17401527 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
GCATTAACAACCGGACTACA+TGG - Chr1:17398843-17398862 None:intergenic 45.0%
GCCTTTATTAGAGCCTTCAG+GGG - Chr1:17400794-17400813 None:intergenic 45.0%
GCGATTGTTGGGATTGTGAT+GGG + Chr1:17399303-17399322 MsG0180001207.01.T01:intron 45.0%
GCTGTATACGTCTACCTTTG+TGG - Chr1:17401323-17401342 None:intergenic 45.0%
GCTTTCGGTTGTTGAACCTT+TGG + Chr1:17398866-17398885 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
GGCCTTTATTAGAGCCTTCA+GGG - Chr1:17400795-17400814 None:intergenic 45.0%
GGGTTTGCCACTGTATACAA+AGG + Chr1:17399640-17399659 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
GGTGGATGTTCTCATCTTGT+CGG - Chr1:17401399-17401418 None:intergenic 45.0%
GTAAAACGGTGGAACAACAC+CGG - Chr1:17398683-17398702 None:intergenic 45.0%
GTAAAGGAATCGGCAAATCC+AGG - Chr1:17401800-17401819 None:intergenic 45.0%
TAAGGTTCGACACAGGCATT+TGG + Chr1:17399765-17399784 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
TATATGGCACCAGAGTATGC+AGG + Chr1:17400120-17400139 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
TATTGGAGAAGAACCCCTGA+AGG + Chr1:17400778-17400797 MsG0180001207.01.T01:intron 45.0%
TCATCAACATCAGGTTCAGC+CGG - Chr1:17401627-17401646 None:intergenic 45.0%
TGAGATCAAGTCCGAAATCG+CGG + Chr1:17399735-17399754 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
TGCACTCCTTGGCTATTGTT+TGG + Chr1:17399789-17399808 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
TGGAATGAAGCTTGTCCTTC+TGG - Chr1:17400075-17400094 None:intergenic 45.0%
TGTTGGTCAACCATGTAGTC+CGG + Chr1:17398830-17398849 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
TTCTCACTAAGGTTCGACAC+AGG + Chr1:17399758-17399777 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
TTGGAAGCGAAGTAAAACGG+TGG - Chr1:17398694-17398713 None:intergenic 45.0%
! ACCCCTGAAGGCTCTAATAA+AGG + Chr1:17400790-17400809 MsG0180001207.01.T01:intron 45.0%
! CATCCTCATCATTCTGGAGA+AGG + Chr1:17399435-17399454 MsG0180001207.01.T01:intron 45.0%
! GTTAGTGTTGGAGCGATTGT+TGG + Chr1:17399291-17399310 MsG0180001207.01.T01:intron 45.0%
! TGTTGACTAAGAGTTCCCTG+AGG - Chr1:17399850-17399869 None:intergenic 45.0%
! TTAGTTCGACTTGCTCCAGA+AGG + Chr1:17400057-17400076 MsG0180001207.01.T01:intron 45.0%
!! CTAGTGGATTTAGTCCATCG+AGG + Chr1:17399520-17399539 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
!! CTGAAATGGTTGGTGACCAA+GGG + Chr1:17399707-17399726 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
!! TAAGGAGCTTGCTAGTATGC+CGG + Chr1:17399093-17399112 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
!! TCTGAAATGGTTGGTGACCA+AGG + Chr1:17399706-17399725 MsG0180001207.01.T01:CDS 45.0%
!!! TTAATTTTTCATTTTATTTA+AGG + Chr1:17400652-17400671 MsG0180001207.01.T01:intron 5.0%
AACCACTCGGATGGAAGAGA+AGG + Chr1:17399899-17399918 MsG0180001207.01.T01:CDS 50.0%
ACAACATCTCCGCGAAACGA+TGG - Chr1:17399166-17399185 None:intergenic 50.0%
ACTAGTTCCTCCTGTAACGC+CGG - Chr1:17399505-17399524 None:intergenic 50.0%
AGGAAGGCTTGGAGAGTTTC+AGG + Chr1:17401497-17401516 MsG0180001207.01.T01:CDS 50.0%
AGGCATTTGGTTGCACTCCT+TGG + Chr1:17399778-17399797 MsG0180001207.01.T01:CDS 50.0%
AGTATACCACCTAGGTCTCC+TGG + Chr1:17401779-17401798 MsG0180001207.01.T01:CDS 50.0%
CCTTGTCGAGATTTGGAAGC+CGG + Chr1:17401605-17401624 MsG0180001207.01.T01:intron 50.0%
CGAAATCGCGGTTCTCACTA+AGG + Chr1:17399747-17399766 MsG0180001207.01.T01:CDS 50.0%
CGGCTTCCAAATCTCGACAA+GGG - Chr1:17401607-17401626 None:intergenic 50.0%
CGTCTACCTTTGTGGTGACT+CGG - Chr1:17401315-17401334 None:intergenic 50.0%
CTGCTCAAGCACTCATGAAG+TGG + Chr1:17401675-17401694 MsG0180001207.01.T01:CDS 50.0%
CTGTCCCTTATCACAGTCAC+CGG + Chr1:17401289-17401308 MsG0180001207.01.T01:intron 50.0%
GAAATGGACATCGACGAGGA+AGG + Chr1:17401481-17401500 MsG0180001207.01.T01:CDS 50.0%
GGCATACTAGCAAGCTCCTT+AGG - Chr1:17399094-17399113 None:intergenic 50.0%
GGCTTCCAAATCTCGACAAG+GGG - Chr1:17401606-17401625 None:intergenic 50.0%
GGTCAGATACCATCGTTTCG+CGG + Chr1:17399154-17399173 MsG0180001207.01.T01:CDS 50.0%
GTAGCGGTGATAGCTGGAAA+GGG + Chr1:17398933-17398952 MsG0180001207.01.T01:CDS 50.0%
TACCTCCAGAACTAGAGCCA+GGG - Chr1:17399257-17399276 None:intergenic 50.0%
TAGCACCCCTTGTCGAGATT+TGG + Chr1:17401598-17401617 MsG0180001207.01.T01:intron 50.0%
TCCAGAAATGGACATCGACG+AGG + Chr1:17401477-17401496 MsG0180001207.01.T01:CDS 50.0%
TCCAGCTATCACCGCTACAA+GGG - Chr1:17398931-17398950 None:intergenic 50.0%
TCCTCGTCGATGTCCATTTC+TGG - Chr1:17401481-17401500 None:intergenic 50.0%
TCGATGGTTTCAGATCCCTG+TGG - Chr1:17399993-17400012 None:intergenic 50.0%
TCTCACCGGCACTATACCTA+AGG + Chr1:17399075-17399094 MsG0180001207.01.T01:CDS 50.0%
TGTAGCGGTGATAGCTGGAA+AGG + Chr1:17398932-17398951 MsG0180001207.01.T01:CDS 50.0%
TTACCTCCAGAACTAGAGCC+AGG - Chr1:17399258-17399277 None:intergenic 50.0%
TTCACTACGTGTCCCATGTC+AGG - Chr1:17401573-17401592 None:intergenic 50.0%
TTCCAGCTATCACCGCTACA+AGG - Chr1:17398932-17398951 None:intergenic 50.0%
! CGGCATCGAAGCGAAATTGT+TGG - Chr1:17398230-17398249 None:intergenic 50.0%
! GGGATTGTGATGGGGATTGT+TGG + Chr1:17399312-17399331 MsG0180001207.01.T01:intron 50.0%
!! GCAGCTGAAAGTTCTGGTTC+CGG + Chr1:17399483-17399502 MsG0180001207.01.T01:intron 50.0%
ACCCTTGTAGCGGTGATAGC+TGG + Chr1:17398927-17398946 MsG0180001207.01.T01:CDS 55.0%
ACCTCGTTACATGGTTCCGC+AGG + Chr1:17401416-17401435 MsG0180001207.01.T01:CDS 55.0%
ACGGCTTGAAACCACTCGGA+TGG + Chr1:17399890-17399909 MsG0180001207.01.T01:CDS 55.0%
AGAACTAGAGCCAGGGCTGT+TGG - Chr1:17399250-17399269 None:intergenic 55.0%
AGCCTTCTCTTCCATCCGAG+TGG - Chr1:17399904-17399923 None:intergenic 55.0%
CCGGCTTCCAAATCTCGACA+AGG - Chr1:17401608-17401627 None:intergenic 55.0%
CCTCATCAGCGTCCTGACAT+GGG + Chr1:17401558-17401577 MsG0180001207.01.T01:CDS 55.0%
GAACTAGAGCCAGGGCTGTT+GGG - Chr1:17399249-17399268 None:intergenic 55.0%
GACGACGGCTTGAAACCACT+CGG + Chr1:17399886-17399905 MsG0180001207.01.T01:CDS 55.0%
GCAAATCCAGGAGACCTAGG+TGG - Chr1:17401788-17401807 None:intergenic 55.0%
GCGTGCTAAAGTAGCCGACT+TGG + Chr1:17400033-17400052 MsG0180001207.01.T01:intron 55.0%
GGCGTTACAGGAGGAACTAG+TGG + Chr1:17399504-17399523 MsG0180001207.01.T01:intron 55.0%
GTTGCGGCAGCTGAAAGTTC+TGG + Chr1:17399477-17399496 MsG0180001207.01.T01:intron 55.0%
TCCTGCGGAACCATGTAACG+AGG - Chr1:17401420-17401439 None:intergenic 55.0%
TCGGCAAATCCAGGAGACCT+AGG - Chr1:17401791-17401810 None:intergenic 55.0%
TCGGCCGGTGACTGTGATAA+GGG - Chr1:17401296-17401315 None:intergenic 55.0%
TGCGGAACCATGTAACGAGG+TGG - Chr1:17401417-17401436 None:intergenic 55.0%
! TACCTTTGTGGTGACTCGGC+CGG - Chr1:17401311-17401330 None:intergenic 55.0%
!! AACAGCCCTGGCTCTAGTTC+TGG + Chr1:17399249-17399268 MsG0180001207.01.T01:CDS 55.0%
!! AGTTCTGGTTCCGGCGTTAC+AGG + Chr1:17399492-17399511 MsG0180001207.01.T01:intron 55.0%
CCCATGTCAGGACGCTGATG+AGG - Chr1:17401561-17401580 None:intergenic 60.0%
CTCGGCCGGTGACTGTGATA+AGG - Chr1:17401297-17401316 None:intergenic 60.0%
GCCTCATCAGCGTCCTGACA+TGG + Chr1:17401557-17401576 MsG0180001207.01.T01:CDS 60.0%
GGACATCGACGAGGAAGGCT+TGG + Chr1:17401486-17401505 MsG0180001207.01.T01:CDS 60.0%
TGAGGCTCCTTGCACAGCAG+TGG - Chr1:17401543-17401562 None:intergenic 60.0%
! TCTGGTTCCGGCGTTACAGG+AGG + Chr1:17399495-17399514 MsG0180001207.01.T01:intron 60.0%
!! AGCCCTGGCTCTAGTTCTGG+AGG + Chr1:17399252-17399271 MsG0180001207.01.T01:CDS 60.0%
CACCGGCCGAGTCACCACAA+AGG + Chr1:17401306-17401325 MsG0180001207.01.T01:CDS 65.0%
GCTCCTTGCACAGCAGTGGC+TGG - Chr1:17401539-17401558 None:intergenic 65.0%
GGGCGAGTGGGCGAATCATG+AGG - Chr1:17399229-17399248 None:intergenic 65.0%
TGGCCAGCCACTGCTGTGCA+AGG + Chr1:17401533-17401552 MsG0180001207.01.T01:CDS 65.0%
AGCCAGGGCTGTTGGGCGAG+TGG - Chr1:17399242-17399261 None:intergenic 70.0%
GCCAGGGCTGTTGGGCGAGT+GGG - Chr1:17399241-17399260 None:intergenic 70.0%
GCCCACTCGCCCAACAGCCC+TGG + Chr1:17399237-17399256 MsG0180001207.01.T01:CDS 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 17397881 17401838 17397881 ID=MsG0180001207.01;Name=MsG0180001207.01
Chr1 mRNA 17397881 17401838 17397881 ID=MsG0180001207.01.T01;Parent=MsG0180001207.01;Name=MsG0180001207.01.T01;_AED=0.18;_eAED=0.18;_QI=0|0.16|0|1|1|1|7|0|639
Chr1 exon 17397881 17398426 17397881 ID=MsG0180001207.01.T01:exon:17508;Parent=MsG0180001207.01.T01
Chr1 exon 17398816 17398971 17398816 ID=MsG0180001207.01.T01:exon:17509;Parent=MsG0180001207.01.T01
Chr1 exon 17399043 17399273 17399043 ID=MsG0180001207.01.T01:exon:17510;Parent=MsG0180001207.01.T01
Chr1 exon 17399514 17399967 17399514 ID=MsG0180001207.01.T01:exon:17511;Parent=MsG0180001207.01.T01
Chr1 exon 17400061 17400141 17400061 ID=MsG0180001207.01.T01:exon:17512;Parent=MsG0180001207.01.T01
Chr1 exon 17401305 17401584 17401305 ID=MsG0180001207.01.T01:exon:17513;Parent=MsG0180001207.01.T01
Chr1 exon 17401667 17401838 17401667 ID=MsG0180001207.01.T01:exon:17514;Parent=MsG0180001207.01.T01
Chr1 CDS 17397881 17398426 17397881 ID=MsG0180001207.01.T01:cds;Parent=MsG0180001207.01.T01
Chr1 CDS 17398816 17398971 17398816 ID=MsG0180001207.01.T01:cds;Parent=MsG0180001207.01.T01
Chr1 CDS 17399043 17399273 17399043 ID=MsG0180001207.01.T01:cds;Parent=MsG0180001207.01.T01
Chr1 CDS 17399514 17399967 17399514 ID=MsG0180001207.01.T01:cds;Parent=MsG0180001207.01.T01
Chr1 CDS 17400061 17400141 17400061 ID=MsG0180001207.01.T01:cds;Parent=MsG0180001207.01.T01
Chr1 CDS 17401305 17401584 17401305 ID=MsG0180001207.01.T01:cds;Parent=MsG0180001207.01.T01
Chr1 CDS 17401667 17401838 17401667 ID=MsG0180001207.01.T01:cds;Parent=MsG0180001207.01.T01
Gene Sequence

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Protein sequence

>MsG0180001207.01.T01

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