AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780038083.01

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MsG0780038083.01.T01 AT4G22730 28.485 165 118 0 376 540 70 234 3.75e-15 80.9
MsG0780038083.01.T01 AT4G22730 28.994 169 120 0 355 523 73 241 8.76e-13 73.2
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MsG0780038083.01.T01 AT5G27060 27.262 873 461 21 14 723 16 877 1.94e-55 209
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MsG0780038083.01.T01 AT1G58190 37.607 117 67 2 97 213 575 685 6.00e-11 67.4
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MsG0780038083.01.T01 AT3G24982 26.717 801 395 19 31 678 61 822 1.26e-47 185
MsG0780038083.01.T01 AT3G24982 27.923 573 360 14 143 701 115 648 3.39e-37 152
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MsG0780038083.01.T01 AT3G53240 29.630 513 330 19 231 727 61 558 4.39e-33 139
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MsG0780038083.01.T01 AT4G13810 28.777 556 305 14 106 605 14 534 7.80e-40 157
MsG0780038083.01.T01 AT4G13810 29.700 367 222 9 106 444 182 540 1.83e-28 122
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MsG0780038083.01.T01 AT4G00970 31.507 365 221 8 726 1077 266 614 2.20e-44 172
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MsG0780038083.01.T01 AT1G56140 31.310 313 187 3 274 586 97 381 1.91e-30 130
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MsG0780038083.01.T01 AT1G56140 29.304 273 191 1 263 535 107 377 2.66e-25 114
MsG0780038083.01.T01 AT1G56140 32.103 271 155 4 217 463 112 377 1.10e-23 108
MsG0780038083.01.T01 AT1G69730 35.161 310 186 7 782 1081 414 718 2.47e-44 174
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MsG0780038083.01.T01 AT2G25220 38.800 250 147 3 808 1056 141 385 2.90e-44 167
MsG0780038083.01.T01 AT2G19190 29.622 476 281 13 613 1081 414 842 2.91e-44 174
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MsG0780038083.01.T01 AT5G23400 27.660 470 329 9 191 655 95 558 1.45e-36 147
MsG0780038083.01.T01 AT5G23400 33.333 231 142 4 477 702 70 293 6.77e-21 99.0
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MsG0780038083.01.T01 AT4G22130 36.491 285 163 7 809 1081 250 528 1.66e-41 162
MsG0780038083.01.T01 AT4G04570 39.336 211 123 2 806 1014 177 384 1.73e-41 158
MsG0780038083.01.T01 AT1G51890 29.289 478 252 13 641 1081 346 774 1.78e-41 165
MsG0780038083.01.T01 AT4G04500 31.287 342 212 6 746 1077 288 616 1.79e-41 163
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MsG0780038083.01.T01 AT5G49290 27.667 300 168 12 108 398 429 688 4.40e-11 67.8
MsG0780038083.01.T01 AT1G29730 42.723 213 118 2 809 1020 636 845 2.05e-41 165
MsG0780038083.01.T01 AT1G29730 30.450 289 173 5 314 602 110 370 2.22e-23 107
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MsG0780038083.01.T01 AT1G29730 32.099 243 156 5 108 350 123 356 1.78e-22 104
MsG0780038083.01.T01 AT1G29730 35.577 208 126 4 517 717 92 298 6.41e-21 99.8
MsG0780038083.01.T01 AT1G29730 30.686 277 184 6 400 674 100 370 1.28e-20 99.0
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MsG0780038083.01.T01 AT1G56145 29.470 302 184 5 349 625 93 390 1.06e-27 122
MsG0780038083.01.T01 AT1G56145 31.679 262 174 3 109 370 120 376 7.43e-27 119
MsG0780038083.01.T01 AT1G56145 31.142 289 192 5 104 391 91 373 1.35e-25 115
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MsG0780038083.01.T01 AT1G56145 30.556 288 189 5 421 703 93 374 1.05e-22 105
MsG0780038083.01.T01 AT1G56145 35.754 179 112 2 86 262 194 371 8.85e-16 83.2
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MsG0780038083.01.T01 AT1G51890 29.289 478 252 13 641 1081 410 838 2.41e-41 165
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MsG0780038083.01.T01 AT5G49290 26.435 662 403 15 178 761 1 656 3.57e-41 162
MsG0780038083.01.T01 AT5G49290 27.404 624 387 16 84 678 4 590 1.05e-38 155
MsG0780038083.01.T01 AT2G19230 29.654 462 270 15 641 1084 418 842 3.72e-41 165
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MsG0780038083.01.T01 AT3G45430 30.245 367 217 10 724 1077 268 608 2.92e-40 159
MsG0780038083.01.T01 AT1G34300 34.247 292 174 5 800 1081 473 756 3.04e-40 161

Find 227 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 268 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TTTAGGGACAATAATCTTTC+TGG 0.137968 7:+39787336 MsG0780038083.01.T01:CDS
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TTGAGCCATAACAAATTTAT+AGG 0.195404 7:+39788125 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTGGACAATAACTCTCTTTC+AGG 0.199748 7:+39787408 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTAGCACACAACCCTATTTC+TGG 0.201909 7:+39787192 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTAGGAGGAAACAACCTTTA+TGG 0.203755 7:+39786895 MsG0780038083.01.T01:CDS
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CAAGAATATTCTTCTGGATT+TGG 0.211125 7:+39789099 MsG0780038083.01.T01:CDS
AATAGGAAAGGCACCCAATT+TGG 0.211420 7:+39787878 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTGGAGGATAGGACCATTAA+TGG 0.220440 7:-39787061 None:intergenic
GGTAGGATTCCTGTGGAAAT+TGG 0.225463 7:+39787285 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTCCCAACTTCAAAATTTCT+TGG 0.231028 7:-39787080 None:intergenic
TTGTTGTCACATTTGTATTT+AGG 0.232872 7:+39786877 MsG0780038083.01.T01:CDS
AGGATTGAAGGTTTGAAAAT+AGG 0.233027 7:-39786276 None:intergenic
AGGAATTGTGACTTATGTTT+AGG 0.234900 7:-39786600 None:intergenic
ATGTTTAGGGTTTGGATATT+TGG 0.238426 7:-39786586 None:intergenic
GAGCAATTCTTCAAACTCTT+TGG 0.241475 7:-39787654 None:intergenic
ATTTAATTGAACTCTAAAAT+AGG 0.243251 7:-39786956 None:intergenic
CCTTCAAGCTGCTATCCTTT+TGG 0.245284 7:+39786296 MsG0780038083.01.T01:CDS
AGAATTGCTCTAGCATTATT+AGG 0.248607 7:+39787667 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTCCTATTTCTGGTGGTATA+TGG 0.251003 7:-39787863 None:intergenic
AATGGTTTATGAGAACATTT+TGG 0.256370 7:+39788667 MsG0780038083.01.T01:CDS
TCTGACATTGCATTGATAAA+AGG 0.266054 7:-39787118 None:intergenic
CTTGAAAGAGTTAAGGTTTA+GGG 0.266590 7:+39787320 MsG0780038083.01.T01:CDS
GCCAACTTACCTATAGAAAA+TGG 0.267475 7:-39787150 None:intergenic
ATAAGTCACAATTCCTTAAA+TGG 0.273410 7:+39786607 MsG0780038083.01.T01:CDS
GTAGGAAGGTGGCCAGAAAT+AGG 0.276035 7:-39787204 None:intergenic
CTTGAACACAACCAACTTAC+TGG 0.278592 7:+39787696 MsG0780038083.01.T01:CDS
CTTAATTCACCTATTTCTTC+AGG 0.280122 7:-39786781 None:intergenic
ACTTCATTTGCTTGCACATT+TGG 0.290494 7:+39789187 MsG0780038083.01.T01:CDS
TATTGAAGGTTGTCAGGTTA+TGG 0.291491 7:-39787818 None:intergenic
GATCAAAACTAGAGGGAATA+AGG 0.294363 7:-39788292 None:intergenic
ATCAAGCAAGAATATTCTTC+TGG 0.298436 7:+39789093 MsG0780038083.01.T01:CDS
GTTGTTGCTTATCAAAAGTT+TGG 0.300719 7:-39787970 None:intergenic
TAAGTCAAGTGAACCCAAAT+TGG 0.305158 7:-39787892 None:intergenic
GGAATTGTGACTTATGTTTA+GGG 0.306164 7:-39786599 None:intergenic
GCCAAGCTTTGCTATCTTCA+TGG 0.310104 7:+39786437 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTGCAAATTTGCCTAAGATA+TGG 0.311562 7:+39788093 MsG0780038083.01.T01:CDS
AAGAAGCAATTGCATTTGAT+TGG 0.313119 7:+39788981 MsG0780038083.01.T01:CDS
AAATGTTGTTCAAATTGATT+TGG 0.316100 7:+39787389 MsG0780038083.01.T01:CDS
GTAGGATTCCTGTGGAAATT+GGG 0.324646 7:+39787286 MsG0780038083.01.T01:CDS
AAATTTAAGTTCCATATCTT+AGG 0.329692 7:-39788104 None:intergenic
CTTCAAAGCCTTGATCTTAG+TGG 0.333127 7:+39788182 MsG0780038083.01.T01:CDS
GACATACAATTTCTTTCATT+TGG 0.336633 7:+39787462 MsG0780038083.01.T01:CDS
AAGATTAAGATGAGTAAGTT+TGG 0.340044 7:-39786659 None:intergenic
GAAGTCGAGAAAGTTAAATT+AGG 0.343689 7:-39789169 None:intergenic
ATCAACTGCGTTATTTCATA+TGG 0.345770 7:-39786709 None:intergenic
GGAAGTATTCCTCACCATAT+TGG 0.348254 7:+39786628 MsG0780038083.01.T01:CDS
ACTTGAAAGAGTTAAGGTTT+AGG 0.354521 7:+39787319 MsG0780038083.01.T01:CDS
TGTGACTTATGTTTAGGGTT+TGG 0.357880 7:-39786594 None:intergenic
ATGGACACCTTTCATCCAAT+TGG 0.359138 7:+39787787 MsG0780038083.01.T01:CDS
TCCTTTGAATCCCATTGTTA+AGG 0.360292 7:+39789596 MsG0780038083.01.T01:CDS
TCTAAGGATGATATTTCTAT+AGG 0.365711 7:-39788011 None:intergenic
AGATTCCATTTCTGTCTCTA+AGG 0.365830 7:+39786504 MsG0780038083.01.T01:CDS
CTACGGAAATTGGAAAGTTA+AGG 0.372367 7:+39787223 MsG0780038083.01.T01:CDS
TATTTCCTATAAATTTGTTA+TGG 0.372691 7:-39788130 None:intergenic
TTAGCATTGGAAATACTGTT+TGG 0.373268 7:+39789477 MsG0780038083.01.T01:CDS
TGGACACCTTTCATCCAATT+GGG 0.375789 7:+39787788 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTCAATTAAATAAAATTAAC+GGG 0.377565 7:+39786968 MsG0780038083.01.T01:CDS
CTACTGAAAGCTCGAATGTT+GGG 0.377990 7:-39788371 None:intergenic
CTGTTATATTTCCAGTAAGT+TGG 0.379209 7:-39787707 None:intergenic
GTTTGGACAACATTCCAATA+TGG 0.379985 7:-39786642 None:intergenic
ACTTGATACTATGCCATTGA+TGG 0.380850 7:+39789548 MsG0780038083.01.T01:CDS
GGTTCCATTCCTGAAGAAAT+AGG 0.381937 7:+39786772 MsG0780038083.01.T01:CDS
CAGATTTACTTCTTGATGTT+GGG 0.382406 7:-39788460 None:intergenic
ATAGGAAAGGCACCCAATTT+GGG 0.384591 7:+39787879 MsG0780038083.01.T01:CDS
GTTCAATTAAATAAAATTAA+CGG 0.386238 7:+39786967 MsG0780038083.01.T01:CDS
TGGAAATATTGAAGGTTGTC+AGG 0.386404 7:-39787824 None:intergenic
GGCCATATACCACCAGAAAT+AGG 0.387079 7:+39787861 MsG0780038083.01.T01:CDS
GTTATGGAACTTTCCCCAAT+TGG 0.390812 7:-39787802 None:intergenic
ACTTACACAATTGAAATACT+TGG 0.391703 7:+39788235 MsG0780038083.01.T01:CDS
AAGTGTGATGTGTATAGTTT+TGG 0.392819 7:+39789450 MsG0780038083.01.T01:CDS
ATAAAGCAGTTGAAGTAGTT+GGG 0.393250 7:-39786357 None:intergenic
TTTCCTCATTTGAAACTGAA+TGG 0.396194 7:-39788796 None:intergenic
GTACATGGAGAAAGGTAGTT+TGG 0.397194 7:+39788937 MsG0780038083.01.T01:CDS
CGTAATATTGTGAATCTGTA+TGG 0.397557 7:+39788875 MsG0780038083.01.T01:CDS
ACTATACACATCACACTTCT+CGG 0.401047 7:-39789445 None:intergenic
TAAGGTCTCAAGTTGATCTA+AGG 0.402747 7:-39788027 None:intergenic
GATATATCTCTGTGAACAAT+TGG 0.406873 7:-39789073 None:intergenic
TGGTGAACTTGAAAGAGTTA+AGG 0.408288 7:+39787313 MsG0780038083.01.T01:CDS
GTGGCTCATGTCTCTGACTT+TGG 0.408461 7:+39789127 MsG0780038083.01.T01:CDS
GGTGAAATCCCACCGACAAT+TGG 0.410681 7:+39787429 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTTGATGACAAATATCTCAT+TGG 0.412239 7:+39788704 MsG0780038083.01.T01:CDS
AAGATAGCAAAGCTTGGCTT+TGG 0.414609 7:-39786432 None:intergenic
CACTAAGATCAAGGCTTTGA+AGG 0.418472 7:-39788181 None:intergenic
GGAAATATAACAGAAGTCTT+TGG 0.419361 7:+39787717 MsG0780038083.01.T01:CDS
CCAGATTTACTTCTTGATGT+TGG 0.419985 7:-39788461 None:intergenic
CCTCACAACATTTGCATTGG+TGG 0.428984 7:+39787582 MsG0780038083.01.T01:CDS
GTAACATTCCAAAAGAACTT+TGG 0.434661 7:+39786917 MsG0780038083.01.T01:CDS
TATGCCATTGATGGATAAGT+TGG 0.437186 7:+39789557 MsG0780038083.01.T01:CDS
CCAACATCAAGAAGTAAATC+TGG 0.438435 7:+39788461 MsG0780038083.01.T01:CDS
TAGGAAGGTGGCCAGAAATA+GGG 0.438607 7:-39787203 None:intergenic
ATTTACCTTAGAGACAGAAA+TGG 0.446390 7:-39786509 None:intergenic
TTGGCAACCTGCTCCATGGT+AGG 0.453544 7:-39789678 None:intergenic
GGTTCAATTCCTCGTGAAGT+TGG 0.453946 7:+39787357 MsG0780038083.01.T01:CDS
AAGCAAGTGCTTTGTTGAAG+TGG 0.454651 7:+39786392 MsG0780038083.01.T01:CDS
AAGGTAAATCTCACAAATAT+GGG 0.456428 7:+39786523 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTCACCTATTTCTTCAGGAA+TGG 0.456757 7:-39786776 None:intergenic
GACAAATATCTCATTGGAGT+TGG 0.456840 7:+39788710 MsG0780038083.01.T01:CDS
GTCGAATTTCAGTCAAAGCT+TGG 0.462718 7:-39788850 None:intergenic
TTCAAAATTTCTTGGAGGAT+AGG 0.463112 7:-39787072 None:intergenic
CTTTGACATCGCAAGCTCCT+TGG 0.464511 7:-39789697 None:intergenic
TCACTCAAGTTTCCAATTGT+CGG 0.464714 7:-39787441 None:intergenic
ATAAGCAAATTCATTTCCAT+TGG 0.468768 7:-39787510 None:intergenic
GATAAAGCAGTTGAAGTAGT+TGG 0.469384 7:-39786358 None:intergenic
CCAACTTCAAAATTTCTTGG+AGG 0.469891 7:-39787077 None:intergenic
CCAAAAGGATAGCAGCTTGA+AGG 0.472253 7:-39786296 None:intergenic
GTCAGATTCCCAATGGAAGT+TGG 0.476788 7:-39786853 None:intergenic
TGATATATCATATAACCAAT+TGG 0.477098 7:+39788337 MsG0780038083.01.T01:CDS
ATAGCAGCTTGAAGGATTGA+AGG 0.477129 7:-39786288 None:intergenic
ACATTTGGATATGCCGCTCC+AGG 0.478960 7:+39789202 MsG0780038083.01.T01:CDS
AAGTCAAGTGAACCCAAATT+GGG 0.479627 7:-39787891 None:intergenic
CAGATAGAGACTCTTGATCT+TGG 0.480867 7:+39787024 MsG0780038083.01.T01:CDS
GTGGCAATAATTCATGCAAA+TGG 0.486233 7:+39786461 MsG0780038083.01.T01:CDS
TCAGATTCCCAATGGAAGTT+GGG 0.490149 7:-39786852 None:intergenic
GGGACTATCCCAACTTCCAT+TGG 0.490525 7:+39786844 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTTGGTCAAAACCATCTCAA+TGG 0.493138 7:+39787480 MsG0780038083.01.T01:CDS
CAATAATGTTCCCTCCTACC+TGG 0.495499 7:-39788604 None:intergenic
CTCATTGGAGTTGGAGGGCA+AGG 0.498389 7:+39788719 MsG0780038083.01.T01:CDS
GATACTAAGTCCTTAACAAT+GGG 0.498647 7:-39789606 None:intergenic
TGGGGAGTGGACCTTCCAAT+TGG 0.498916 7:-39788352 None:intergenic
ATAAGCAACAACCATCTCTC+AGG 0.499213 7:+39787981 MsG0780038083.01.T01:CDS
CAATTGGAGGTGAGCAATCA+TGG 0.500227 7:-39789057 None:intergenic
ATCTCAAATGCAAATCTCAC+AGG 0.503024 7:+39786823 MsG0780038083.01.T01:CDS
CTTAGTGACAATCTTCTCTC+AGG 0.503098 7:+39786679 MsG0780038083.01.T01:CDS
CATAAAGGTATAACATCTCC+AGG 0.503319 7:-39789507 None:intergenic
CTCACAAATATGGGATTGAA+AGG 0.504165 7:+39786532 MsG0780038083.01.T01:CDS
CTTGCAGAAAATAATCTAAG+TGG 0.506312 7:+39788053 MsG0780038083.01.T01:CDS
TCTTCTGGATTTGGAATGTG+TGG 0.508445 7:+39789108 MsG0780038083.01.T01:CDS
TCCTTAACAATGGGATTCAA+AGG 0.513612 7:-39789597 None:intergenic
ACTTTCCAATTTCCGTAGGA+AGG 0.514033 7:-39787218 None:intergenic
ACAATGGGATTCAAAGGATG+AGG 0.514111 7:-39789591 None:intergenic
AAATATCTCATTGGAGTTGG+AGG 0.514112 7:+39788713 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTGTCACATTTGTATTTAGG+AGG 0.517129 7:+39786880 MsG0780038083.01.T01:CDS
GTGCGGTAATATCTCTGACT+TGG 0.517369 7:+39788430 MsG0780038083.01.T01:CDS
GCTCCATTCAGTTTCAAATG+AGG 0.520800 7:+39788793 MsG0780038083.01.T01:CDS
ATCTCGCCCTACCATGGAGC+AGG 0.522090 7:+39789671 MsG0780038083.01.T01:CDS
TGGCAACCTGCTCCATGGTA+GGG 0.523361 7:-39789677 None:intergenic
GAGGTAACAATAGTCCATAA+AGG 0.524239 7:-39789522 None:intergenic
TGATCCAACTTATCCATCAA+TGG 0.525682 7:-39789561 None:intergenic
GACAAGTTGCATAACTCCTT+AGG 0.525807 7:-39787942 None:intergenic
CTGCCTCACAACATTTGCAT+TGG 0.525891 7:+39787579 MsG0780038083.01.T01:CDS
CTCACAACATTTGCATTGGT+GGG 0.527428 7:+39787583 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTGACAATAACTTATCTGGT+AGG 0.529951 7:+39787268 MsG0780038083.01.T01:CDS
TACCATGGAGCAGGTTGCCA+AGG 0.530193 7:+39789680 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTGGTAATTTGCCATTGAGA+TGG 0.532446 7:-39787491 None:intergenic
CTCAGCATTCCAACTTCACG+AGG 0.532916 7:-39787366 None:intergenic
ACTTTCCCCAATTGGATGAA+AGG 0.532953 7:-39787794 None:intergenic
ATAGAGACTCTTGATCTTGG+TGG 0.533588 7:+39787027 MsG0780038083.01.T01:CDS
ATACTGTTTGGAAAACATCC+TGG 0.534021 7:+39789489 MsG0780038083.01.T01:CDS
TAGGATTCCTGTGGAAATTG+GGG 0.534059 7:+39787287 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTACTTCTTGATGTTGGGCA+AGG 0.537081 7:-39788455 None:intergenic
ATGTATGATAATGACTTCAC+TGG 0.539428 7:+39787552 MsG0780038083.01.T01:CDS
AATAATTCATGCAAATGGCT+TGG 0.541495 7:+39786466 MsG0780038083.01.T01:CDS
CATTGAAAGAAGCATCCAAA+AGG 0.542007 7:-39786311 None:intergenic
GTTTACGAGTACATGGAGAA+AGG 0.542996 7:+39788929 MsG0780038083.01.T01:CDS
GGTGCCTTTCCTATTTCTGG+TGG 0.543164 7:-39787870 None:intergenic
CGATACTAAGTCCTTAACAA+TGG 0.543258 7:-39789607 None:intergenic
ATTATTTCTCAACACTTCGA+TGG 0.543688 7:-39788399 None:intergenic
GGACTATCCCAACTTCCATT+GGG 0.544389 7:+39786845 MsG0780038083.01.T01:CDS
TAGGAATGTTTCCTGAGAGA+TGG 0.545499 7:-39787992 None:intergenic
TATTTCTGGCCACCTTCCTA+CGG 0.549918 7:+39787206 MsG0780038083.01.T01:CDS
CTCAAGTTTCCAATTGTCGG+TGG 0.550112 7:-39787438 None:intergenic
CTCCTTGGCAACCTGCTCCA+TGG 0.550945 7:-39789682 None:intergenic
GCTACTGAAAGCTCGAATGT+TGG 0.551993 7:-39788372 None:intergenic
TTATCTTCAAACCATCTCAC+AGG 0.552352 7:+39787912 MsG0780038083.01.T01:CDS
GTTAGAAATAACCACTTCAC+TGG 0.554829 7:+39787624 MsG0780038083.01.T01:CDS
CTTAACTTTCCAATTTCCGT+AGG 0.557063 7:-39787222 None:intergenic
TTTGGATGCTTCTTTCAATG+TGG 0.562163 7:+39786314 MsG0780038083.01.T01:CDS
AAAGCTCGAATGTTGGGGAG+TGG 0.565175 7:-39788365 None:intergenic
TCCATGAAGATAGCAAAGCT+TGG 0.566915 7:-39786438 None:intergenic
TTAAATTGTCCAAATTCACT+AGG 0.567729 7:-39788155 None:intergenic
GGAGCTTGCGATGTCAAAGC+GGG 0.570208 7:+39789701 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTCACAATCTCGCCCTACCA+TGG 0.572503 7:+39789665 MsG0780038083.01.T01:CDS
ATAGGAGAAAACCAGGTAGG+AGG 0.574111 7:+39788593 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTTGTCATCAAAATCTTGTG+TGG 0.574703 7:-39788693 None:intergenic
TAGGAGAAAACCAGGTAGGA+GGG 0.575018 7:+39788594 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTTATCAATGCAATGTCAGA+GGG 0.582818 7:+39787121 MsG0780038083.01.T01:CDS
AAAGGAAAATTAACCTGGAG+CGG 0.583842 7:-39789215 None:intergenic
ATTAGAGTTCCCACTGCAAG+AGG 0.584993 7:-39788521 None:intergenic
GGACACCTTTCATCCAATTG+GGG 0.586652 7:+39787789 MsG0780038083.01.T01:CDS
TCTCAATGGCAAATTACCAA+TGG 0.587848 7:+39787494 MsG0780038083.01.T01:CDS
TTCCAATTTCCGTAGGAAGG+TGG 0.591256 7:-39787215 None:intergenic
AGAAATAATAGTGGCTTGTG+CGG 0.598120 7:+39788413 MsG0780038083.01.T01:CDS
ATATCTCTGTGAACAATTGG+AGG 0.601272 7:-39789070 None:intergenic
TACTGAAAGCTCGAATGTTG+GGG 0.601901 7:-39788370 None:intergenic
CAATGGGATTCAAAGGATGA+GGG 0.602459 7:-39789590 None:intergenic
GTTTGAAAATAGGAATCTCA+TGG 0.602465 7:-39786266 None:intergenic
TCAAGTTTCCAATTGTCGGT+GGG 0.602695 7:-39787437 None:intergenic
ATATCATATAACCAATTGGA+AGG 0.603253 7:+39788341 MsG0780038083.01.T01:CDS
GAAGTGTTGAGAAATAATAG+TGG 0.604496 7:+39788404 MsG0780038083.01.T01:CDS
GAACATCTGATCAAAACTAG+AGG 0.605265 7:-39788300 None:intergenic
AACATCTGATCAAAACTAGA+GGG 0.609484 7:-39788299 None:intergenic
CATTGCATTGATAAAAGGAA+AGG 0.610505 7:-39787113 None:intergenic
GACAACATTCCAATATGGTG+AGG 0.612133 7:-39786637 None:intergenic
AATATCTCATTGGAGTTGGA+GGG 0.613269 7:+39788714 MsG0780038083.01.T01:CDS
CAACAAGGTCAGATTCCCAA+TGG 0.617608 7:-39786860 None:intergenic
TAAAGCAGTTGAAGTAGTTG+GGG 0.621624 7:-39786356 None:intergenic
TCTCACAGGGAAAATACCTA+AGG 0.622202 7:+39787926 MsG0780038083.01.T01:CDS
ATCAACCATAGGAGAAAACC+AGG 0.627490 7:+39788586 MsG0780038083.01.T01:CDS
GCTTTGCTATCTTCATGGAG+TGG 0.629780 7:+39786442 MsG0780038083.01.T01:CDS
TGGCATAGTATCAAGTGTAG+AGG 0.633137 7:-39789541 None:intergenic
CTTATCTGGTAGGATTCCTG+TGG 0.635254 7:+39787278 MsG0780038083.01.T01:CDS
AGGATTCCTGTGGAAATTGG+GGG 0.640120 7:+39787288 MsG0780038083.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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!!! TATTTCCTATAAATTTGTTA+TGG - Chr7:39788133-39788152 None:intergenic 15.0%
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! CACTTAGATTATTTTCTGCA+AGG - Chr7:39788055-39788074 None:intergenic 30.0%
! CATTGCATTGATAAAAGGAA+AGG - Chr7:39787116-39787135 None:intergenic 30.0%
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! TTTCCTCATTTGAAACTGAA+TGG - Chr7:39788799-39788818 None:intergenic 30.0%
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TATCTTCAAACCATCTCACA+GGG + Chr7:39787913-39787932 MsG0780038083.01.T01:CDS 35.0%
TATTGAAGGTTGTCAGGTTA+TGG - Chr7:39787821-39787840 None:intergenic 35.0%
TCACTCAAGTTTCCAATTGT+CGG - Chr7:39787444-39787463 None:intergenic 35.0%
TCCTTAACAATGGGATTCAA+AGG - Chr7:39789600-39789619 None:intergenic 35.0%
TCCTTTGAATCCCATTGTTA+AGG + Chr7:39789596-39789615 MsG0780038083.01.T01:CDS 35.0%
TCTCAAATGCAAATCTCACA+GGG + Chr7:39786824-39786843 MsG0780038083.01.T01:CDS 35.0%
TCTCAATGGCAAATTACCAA+TGG + Chr7:39787494-39787513 MsG0780038083.01.T01:CDS 35.0%
TGATCCAACTTATCCATCAA+TGG - Chr7:39789564-39789583 None:intergenic 35.0%
TGCATTTGATTGGAAAAAGC+GGG + Chr7:39788991-39789010 MsG0780038083.01.T01:CDS 35.0%
TGGAAATATTGAAGGTTGTC+AGG - Chr7:39787827-39787846 None:intergenic 35.0%
TGGTGAACTTGAAAGAGTTA+AGG + Chr7:39787313-39787332 MsG0780038083.01.T01:CDS 35.0%
TGTACAAGAGAGGCTATAAT+GGG - Chr7:39789375-39789394 None:intergenic 35.0%
TTAGGAGGAAACAACCTTTA+TGG + Chr7:39786895-39786914 MsG0780038083.01.T01:CDS 35.0%
TTATCTTCAAACCATCTCAC+AGG + Chr7:39787912-39787931 MsG0780038083.01.T01:CDS 35.0%
TTGGACAATAACTCTCTTTC+AGG + Chr7:39787408-39787427 MsG0780038083.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGATGCTTCTTTCAATG+TGG + Chr7:39786314-39786333 MsG0780038083.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGTCAAAACCATCTCAA+TGG + Chr7:39787480-39787499 MsG0780038083.01.T01:CDS 35.0%
! AGAAATAATAGTGGCTTGTG+CGG + Chr7:39788413-39788432 MsG0780038083.01.T01:CDS 35.0%
! CATAAAGGTATAACATCTCC+AGG - Chr7:39789510-39789529 None:intergenic 35.0%
! GGGTCTATTCCATTTTCTAT+AGG + Chr7:39787141-39787160 MsG0780038083.01.T01:CDS 35.0%
! TATGCCATTGATGGATAAGT+TGG + Chr7:39789557-39789576 MsG0780038083.01.T01:CDS 35.0%
! TGTGACTTATGTTTAGGGTT+TGG - Chr7:39786597-39786616 None:intergenic 35.0%
! TTCACCTATTTCTTCAGGAA+TGG - Chr7:39786779-39786798 None:intergenic 35.0%
! TTGGTAATTTGCCATTGAGA+TGG - Chr7:39787494-39787513 None:intergenic 35.0%
!! ATAGTTTTACCTCTTGCAGT+GGG + Chr7:39788512-39788531 MsG0780038083.01.T01:CDS 35.0%
!! CATTGAAAGAAGCATCCAAA+AGG - Chr7:39786314-39786333 None:intergenic 35.0%
!! TAAGGTCTCAAGTTGATCTA+AGG - Chr7:39788030-39788049 None:intergenic 35.0%
!! TTCCTATTTCTGGTGGTATA+TGG - Chr7:39787866-39787885 None:intergenic 35.0%
!!! CCTCCAAGAAATTTTGAAGT+TGG + Chr7:39787077-39787096 MsG0780038083.01.T01:CDS 35.0%
AAGATAGCAAAGCTTGGCTT+TGG - Chr7:39786435-39786454 None:intergenic 40.0%
ACAATGGGATTCAAAGGATG+AGG - Chr7:39789594-39789613 None:intergenic 40.0%
ACTTTCCAATTTCCGTAGGA+AGG - Chr7:39787221-39787240 None:intergenic 40.0%
ACTTTCCCCAATTGGATGAA+AGG - Chr7:39787797-39787816 None:intergenic 40.0%
ATAAGCAACAACCATCTCTC+AGG + Chr7:39787981-39788000 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
ATAGAGACTCTTGATCTTGG+TGG + Chr7:39787027-39787046 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
ATAGCAGCTTGAAGGATTGA+AGG - Chr7:39786291-39786310 None:intergenic 40.0%
ATAGGAGTCATGTACAAGAG+AGG - Chr7:39789385-39789404 None:intergenic 40.0%
ATCAACCATAGGAGAAAACC+AGG + Chr7:39788586-39788605 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
ATGGACACCTTTCATCCAAT+TGG + Chr7:39787787-39787806 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
CAATGGGATTCAAAGGATGA+GGG - Chr7:39789593-39789612 None:intergenic 40.0%
CAGATAGAGACTCTTGATCT+TGG + Chr7:39787024-39787043 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
CTACTGAAAGCTCGAATGTT+GGG - Chr7:39788374-39788393 None:intergenic 40.0%
CTTAGTGACAATCTTCTCTC+AGG + Chr7:39786679-39786698 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
CTTCAAAGCCTTGATCTTAG+TGG + Chr7:39788182-39788201 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
CTTGAACACAACCAACTTAC+TGG + Chr7:39787696-39787715 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
GACAACATTCCAATATGGTG+AGG - Chr7:39786640-39786659 None:intergenic 40.0%
GACAAGTTGCATAACTCCTT+AGG - Chr7:39787945-39787964 None:intergenic 40.0%
GCTCCATTCAGTTTCAAATG+AGG + Chr7:39788793-39788812 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
GGTTCCATTCCTGAAGAAAT+AGG + Chr7:39786772-39786791 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
GTACATGGAGAAAGGTAGTT+TGG + Chr7:39788937-39788956 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
GTAGGATTCCTGTGGAAATT+GGG + Chr7:39787286-39787305 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
GTCGAATTTCAGTCAAAGCT+TGG - Chr7:39788853-39788872 None:intergenic 40.0%
GTTATGGAACTTTCCCCAAT+TGG - Chr7:39787805-39787824 None:intergenic 40.0%
GTTTACGAGTACATGGAGAA+AGG + Chr7:39788929-39788948 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
TACAAAGCAGAGTTACACAC+AGG + Chr7:39788749-39788768 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
TACTGAAAGCTCGAATGTTG+GGG - Chr7:39788373-39788392 None:intergenic 40.0%
TAGGAATGTTTCCTGAGAGA+TGG - Chr7:39787995-39788014 None:intergenic 40.0%
TAGGATTCCTGTGGAAATTG+GGG + Chr7:39787287-39787306 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
TCAAGTTTCCAATTGTCGGT+GGG - Chr7:39787440-39787459 None:intergenic 40.0%
TCAGATTCCCAATGGAAGTT+GGG - Chr7:39786855-39786874 None:intergenic 40.0%
TCCATGAAGATAGCAAAGCT+TGG - Chr7:39786441-39786460 None:intergenic 40.0%
TCTCACAGGGAAAATACCTA+AGG + Chr7:39787926-39787945 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
TGGACACCTTTCATCCAATT+GGG + Chr7:39787788-39787807 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
TGGCATAGTATCAAGTGTAG+AGG - Chr7:39789544-39789563 None:intergenic 40.0%
TTACTTCTTGATGTTGGGCA+AGG - Chr7:39788458-39788477 None:intergenic 40.0%
TTAGCACACAACCCTATTTC+TGG + Chr7:39787192-39787211 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
TTGGAGGATAGGACCATTAA+TGG - Chr7:39787064-39787083 None:intergenic 40.0%
! AAGCAAGTGCTTTGTTGAAG+TGG + Chr7:39786392-39786411 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
! CACTAAGATCAAGGCTTTGA+AGG - Chr7:39788184-39788203 None:intergenic 40.0%
! CTCACAACATTTGCATTGGT+GGG + Chr7:39787583-39787602 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
! TAGGTATTTTCCCTGTGAGA+TGG - Chr7:39787926-39787945 None:intergenic 40.0%
! TCTTCTGGATTTGGAATGTG+TGG + Chr7:39789108-39789127 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
!! AATAGGAAAGGCACCCAATT+TGG + Chr7:39787878-39787897 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
!! ATAGGAAAGGCACCCAATTT+GGG + Chr7:39787879-39787898 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
!! GATAGTTTTACCTCTTGCAG+TGG + Chr7:39788511-39788530 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
!! GGAAGTATTCCTCACCATAT+TGG + Chr7:39786628-39786647 MsG0780038083.01.T01:CDS 40.0%
ACCATAGGAGAAAACCAGGT+AGG + Chr7:39788590-39788609 MsG0780038083.01.T01:CDS 45.0%
AGGATTCCTGTGGAAATTGG+GGG + Chr7:39787288-39787307 MsG0780038083.01.T01:CDS 45.0%
ATAGGAGAAAACCAGGTAGG+AGG + Chr7:39788593-39788612 MsG0780038083.01.T01:CDS 45.0%
ATTAGAGTTCCCACTGCAAG+AGG - Chr7:39788524-39788543 None:intergenic 45.0%
CAACAAGGTCAGATTCCCAA+TGG - Chr7:39786863-39786882 None:intergenic 45.0%
CAATAATGTTCCCTCCTACC+TGG - Chr7:39788607-39788626 None:intergenic 45.0%
CAATTGGAGGTGAGCAATCA+TGG - Chr7:39789060-39789079 None:intergenic 45.0%
CCAAAAGGATAGCAGCTTGA+AGG - Chr7:39786299-39786318 None:intergenic 45.0%
CCACCAATGCAAATGTTGTG+AGG - Chr7:39787585-39787604 None:intergenic 45.0%
CCTCACAACATTTGCATTGG+TGG + Chr7:39787582-39787601 MsG0780038083.01.T01:CDS 45.0%
CTCAAGTTTCCAATTGTCGG+TGG - Chr7:39787441-39787460 None:intergenic 45.0%
CTGCCTCACAACATTTGCAT+TGG + Chr7:39787579-39787598 MsG0780038083.01.T01:CDS 45.0%
CTTATCTGGTAGGATTCCTG+TGG + Chr7:39787278-39787297 MsG0780038083.01.T01:CDS 45.0%
GCTACTGAAAGCTCGAATGT+TGG - Chr7:39788375-39788394 None:intergenic 45.0%
GGACACCTTTCATCCAATTG+GGG + Chr7:39787789-39787808 MsG0780038083.01.T01:CDS 45.0%
GGACTATCCCAACTTCCATT+GGG + Chr7:39786845-39786864 MsG0780038083.01.T01:CDS 45.0%
GGCCATATACCACCAGAAAT+AGG + Chr7:39787861-39787880 MsG0780038083.01.T01:CDS 45.0%
GGTAGGATTCCTGTGGAAAT+TGG + Chr7:39787285-39787304 MsG0780038083.01.T01:CDS 45.0%
GGTTCAATTCCTCGTGAAGT+TGG + Chr7:39787357-39787376 MsG0780038083.01.T01:CDS 45.0%
GTCAGATTCCCAATGGAAGT+TGG - Chr7:39786856-39786875 None:intergenic 45.0%
GTGCGGTAATATCTCTGACT+TGG + Chr7:39788430-39788449 MsG0780038083.01.T01:CDS 45.0%
TAGGAAGGTGGCCAGAAATA+GGG - Chr7:39787206-39787225 None:intergenic 45.0%
TAGGAGAAAACCAGGTAGGA+GGG + Chr7:39788594-39788613 MsG0780038083.01.T01:CDS 45.0%
TTCCAATTTCCGTAGGAAGG+TGG - Chr7:39787218-39787237 None:intergenic 45.0%
TTGGGTGCCTTTCCTATTTC+TGG - Chr7:39787876-39787895 None:intergenic 45.0%
! CCTTCAAGCTGCTATCCTTT+TGG + Chr7:39786296-39786315 MsG0780038083.01.T01:CDS 45.0%
! GCCAAGCTTTGCTATCTTCA+TGG + Chr7:39786437-39786456 MsG0780038083.01.T01:CDS 45.0%
! GCTTTGCTATCTTCATGGAG+TGG + Chr7:39786442-39786461 MsG0780038083.01.T01:CDS 45.0%
!! TATTTCTGGCCACCTTCCTA+CGG + Chr7:39787206-39787225 MsG0780038083.01.T01:CDS 45.0%
!! TCCTACCTGGTTTTCTCCTA+TGG - Chr7:39788594-39788613 None:intergenic 45.0%
AAAGCTCGAATGTTGGGGAG+TGG - Chr7:39788368-39788387 None:intergenic 50.0%
ACATTTGGATATGCCGCTCC+AGG + Chr7:39789202-39789221 MsG0780038083.01.T01:CDS 50.0%
ACCAATCCCCCAATTTCCAC+AGG - Chr7:39787297-39787316 None:intergenic 50.0%
AGGAGCTTGCGATGTCAAAG+CGG + Chr7:39789700-39789719 MsG0780038083.01.T01:CDS 50.0%
CTCAGCATTCCAACTTCACG+AGG - Chr7:39787369-39787388 None:intergenic 50.0%
CTTTGACATCGCAAGCTCCT+TGG - Chr7:39789700-39789719 None:intergenic 50.0%
GGGACTATCCCAACTTCCAT+TGG + Chr7:39786844-39786863 MsG0780038083.01.T01:CDS 50.0%
GGTGAAATCCCACCGACAAT+TGG + Chr7:39787429-39787448 MsG0780038083.01.T01:CDS 50.0%
GTAGGAAGGTGGCCAGAAAT+AGG - Chr7:39787207-39787226 None:intergenic 50.0%
GTGGCTCATGTCTCTGACTT+TGG + Chr7:39789127-39789146 MsG0780038083.01.T01:CDS 50.0%
TCCTGTGGAAATTGGGGGAT+TGG + Chr7:39787293-39787312 MsG0780038083.01.T01:CDS 50.0%
TTCACAATCTCGCCCTACCA+TGG + Chr7:39789665-39789684 MsG0780038083.01.T01:CDS 50.0%
TTGGAACTGAGCCAGTGAAG+TGG - Chr7:39787638-39787657 None:intergenic 50.0%
!! GGTGCCTTTCCTATTTCTGG+TGG - Chr7:39787873-39787892 None:intergenic 50.0%
CTCATTGGAGTTGGAGGGCA+AGG + Chr7:39788719-39788738 MsG0780038083.01.T01:CDS 55.0%
GGAGCTTGCGATGTCAAAGC+GGG + Chr7:39789701-39789720 MsG0780038083.01.T01:CDS 55.0%
GGCCACCTTCCTACGGAAAT+TGG + Chr7:39787213-39787232 MsG0780038083.01.T01:CDS 55.0%
TACCATGGAGCAGGTTGCCA+AGG + Chr7:39789680-39789699 MsG0780038083.01.T01:CDS 55.0%
TGGCAACCTGCTCCATGGTA+GGG - Chr7:39789680-39789699 None:intergenic 55.0%
TGGGGAGTGGACCTTCCAAT+TGG - Chr7:39788355-39788374 None:intergenic 55.0%
TTGGCAACCTGCTCCATGGT+AGG - Chr7:39789681-39789700 None:intergenic 55.0%
ATCTCGCCCTACCATGGAGC+AGG + Chr7:39789671-39789690 MsG0780038083.01.T01:CDS 60.0%
CTCCTTGGCAACCTGCTCCA+TGG - Chr7:39789685-39789704 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 39786268 39789740 39786268 ID=MsG0780038083.01;Name=MsG0780038083.01
Chr7 mRNA 39786268 39789740 39786268 ID=MsG0780038083.01.T01;Parent=MsG0780038083.01;Name=MsG0780038083.01.T01;_AED=0.23;_eAED=0.23;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|1091
Chr7 exon 39786268 39789223 39786268 ID=MsG0780038083.01.T01:exon:4817;Parent=MsG0780038083.01.T01
Chr7 exon 39789421 39789740 39789421 ID=MsG0780038083.01.T01:exon:4816;Parent=MsG0780038083.01.T01
Chr7 CDS 39786268 39789223 39786268 ID=MsG0780038083.01.T01:cds;Parent=MsG0780038083.01.T01
Chr7 CDS 39789421 39789740 39789421 ID=MsG0780038083.01.T01:cds;Parent=MsG0780038083.01.T01
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