AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780041386.01

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MsG0780041386.01.T01 AT5G39350 24.079 407 259 8 41 401 238 640 1.33e-23 105
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MsG0780041386.01.T01 AT1G08070 30.000 240 133 4 256 463 1 237 1.40e-25 111
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MsG0780041386.01.T01 AT3G14730 23.274 391 244 9 38 377 177 562 3.97e-19 91.3
MsG0780041386.01.T01 AT3G14730 28.977 176 121 3 287 461 62 234 2.71e-15 79.3
MsG0780041386.01.T01 AT1G03540 30.261 499 303 4 72 529 113 607 1.56e-79 261
MsG0780041386.01.T01 AT1G03540 23.134 268 190 4 41 299 285 545 1.16e-15 80.5
MsG0780041386.01.T01 AT1G03540 29.208 202 136 5 265 463 41 238 1.87e-15 79.7
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MsG0780041386.01.T01 AT1G56570 29.575 541 306 9 30 528 51 558 1.98e-79 261
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MsG0780041386.01.T01 AT1G56570 22.703 370 237 8 159 486 47 409 1.71e-26 114
MsG0780041386.01.T01 AT3G22690 32.353 544 324 11 28 529 173 714 2.11e-79 267
MsG0780041386.01.T01 AT3G22690 24.773 440 257 6 90 457 102 539 6.58e-33 134
MsG0780041386.01.T01 AT3G22690 34.538 249 158 5 217 463 167 412 1.25e-31 130
MsG0780041386.01.T01 AT3G22690 34.286 210 135 3 238 445 86 294 1.42e-27 118
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MsG0780041386.01.T01 AT3G05340 25.789 380 235 7 120 499 33 365 8.21e-26 112
MsG0780041386.01.T01 AT1G77170 31.612 484 261 10 48 527 45 462 3.60e-75 245
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MsG0780041386.01.T01 AT2G40720 26.115 471 304 6 41 469 190 658 4.34e-40 155
MsG0780041386.01.T01 AT2G40720 28.685 251 167 5 223 463 99 347 2.92e-20 95.1
MsG0780041386.01.T01 AT2G40720 27.660 188 128 2 286 465 61 248 6.19e-15 78.6
MsG0780041386.01.T01 AT4G30700 30.495 505 314 4 62 529 160 664 1.04e-74 252
MsG0780041386.01.T01 AT4G30700 24.513 359 231 7 202 527 138 489 1.62e-25 111
MsG0780041386.01.T01 AT4G30700 25.379 264 172 6 47 295 346 599 1.52e-14 77.0
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MsG0780041386.01.T01 AT1G69350 27.062 388 237 8 123 469 101 483 4.88e-33 134
MsG0780041386.01.T01 AT1G69350 25.430 291 196 6 216 495 31 311 4.42e-19 91.7
MsG0780041386.01.T01 AT4G08210 27.941 544 347 6 27 528 145 685 5.74e-74 248
MsG0780041386.01.T01 AT4G08210 24.942 429 278 10 42 464 28 418 3.25e-33 134
MsG0780041386.01.T01 AT4G08210 24.631 203 121 4 292 463 12 213 6.19e-11 65.5
MsG0780041386.01.T01 AT4G04370 29.945 541 337 4 30 529 153 692 6.09e-74 249
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MsG0780041386.01.T01 AT3G18840 26.327 490 285 14 21 469 20 474 2.60e-39 152
MsG0780041386.01.T01 AT3G18840 25.352 355 191 11 178 461 13 364 6.61e-23 103
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MsG0780041386.01.T01 AT4G31070 25.339 221 159 5 257 473 28 246 2.26e-12 70.1
MsG0780041386.01.T01 AT2G41080 28.545 536 335 6 9 529 20 522 4.21e-68 231
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MsG0780041386.01.T01 AT5G08490 29.299 471 303 4 60 529 370 811 2.05e-67 233
MsG0780041386.01.T01 AT5G08490 22.976 531 335 14 52 523 53 568 1.59e-31 130
MsG0780041386.01.T01 AT5G08490 28.197 305 191 9 178 471 22 309 2.08e-23 105
MsG0780041386.01.T01 AT5G08490 20.621 354 206 6 28 379 474 754 4.81e-12 69.3
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MsG0780041386.01.T01 AT5G08490 29.299 471 303 4 60 529 370 811 2.05e-67 233
MsG0780041386.01.T01 AT5G08490 22.976 531 335 14 52 523 53 568 1.59e-31 130
MsG0780041386.01.T01 AT5G08490 28.197 305 191 9 178 471 22 309 2.08e-23 105
MsG0780041386.01.T01 AT5G08490 20.621 354 206 6 28 379 474 754 4.81e-12 69.3
MsG0780041386.01.T01 AT5G08490 29.524 210 124 8 260 463 7 198 1.63e-11 67.4
MsG0780041386.01.T01 AT5G52630 36.932 352 213 4 181 529 115 460 2.31e-67 228
MsG0780041386.01.T01 AT5G52630 28.745 247 174 2 225 471 56 300 4.43e-21 97.4
MsG0780041386.01.T01 AT5G52630 23.734 316 198 5 110 384 103 416 4.23e-15 78.6
MsG0780041386.01.T01 AT5G52630 23.208 293 211 6 66 349 161 448 6.10e-14 75.1
MsG0780041386.01.T01 AT4G25270 33.095 420 233 6 143 520 113 526 6.36e-67 225
MsG0780041386.01.T01 AT4G25270 24.156 385 246 7 42 385 113 492 8.30e-25 108
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MsG0780041386.01.T01 AT1G31920 25.982 331 203 3 70 358 80 410 3.86e-25 109
MsG0780041386.01.T01 AT1G31920 26.966 267 184 5 235 495 82 343 5.72e-23 103
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MsG0780041386.01.T01 AT3G56550 27.459 244 161 5 234 469 54 289 8.11e-25 108
MsG0780041386.01.T01 AT3G56550 23.701 308 215 8 56 351 143 442 5.20e-15 78.2
MsG0780041386.01.T01 AT2G02750 29.268 492 310 7 42 526 150 610 2.21e-58 204
MsG0780041386.01.T01 AT2G02750 28.808 302 195 5 185 485 44 326 1.11e-26 114
MsG0780041386.01.T01 AT2G02750 25.728 206 148 2 283 488 29 229 2.71e-16 82.4
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MsG0780041386.01.T01 AT5G41170 22.430 428 292 10 52 448 3 421 1.42e-22 100
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MsG0780041386.01.T01 AT1G13040 22.535 284 184 9 37 292 197 472 1.22e-12 70.9
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MsG0780041386.01.T01 AT2G19280 20.147 407 300 10 76 461 188 590 4.31e-12 69.3
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MsG0780041386.01.T01 AT1G10910 21.324 272 202 5 188 448 98 368 9.74e-12 68.2
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MsG0780041386.01.T01 AT1G53330 24.028 283 193 9 211 476 106 383 2.84e-11 66.2
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MsG0780041386.01.T01 AT5G62370 22.426 272 193 4 150 403 575 846 3.97e-11 66.2
MsG0780041386.01.T01 AT5G40400 21.677 489 286 16 57 519 167 584 4.20e-11 65.9
MsG0780041386.01.T01 AT5G40400 21.677 489 286 16 57 519 238 655 4.47e-11 65.9
MsG0780041386.01.T01 AT1G11710 20.000 430 278 10 144 519 154 571 4.51e-11 65.9
MsG0780041386.01.T01 AT5G46100 22.663 353 239 10 36 359 104 451 5.17e-11 65.5
MsG0780041386.01.T01 AT1G11710 20.000 430 278 10 144 519 183 600 6.03e-11 65.5

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TGCTTTGGTTTCTAGTTATA+TGG 0.186286 7:-90342005 MsG0780041386.01.T01:CDS
GTCAATTAGGGATAAGAATT+TGG 0.202896 7:-90341549 MsG0780041386.01.T01:CDS
GGGATAAGAATTTGGTTTCT+TGG 0.212285 7:-90341541 MsG0780041386.01.T01:CDS
CATGCTTTGGCATTTCATTT+AGG 0.226728 7:-90342148 MsG0780041386.01.T01:CDS
GTTTCTTGGAATGCAATAAT+TGG 0.229107 7:-90341527 MsG0780041386.01.T01:CDS
GGTTCTTCCTCTCTTATAAT+GGG 0.249244 7:-90341692 MsG0780041386.01.T01:CDS
TTGTGGCCTGCATTCAAATT+TGG 0.261465 7:-90341192 MsG0780041386.01.T01:CDS
CTCAAAGAAACATAATTTCT+TGG 0.274526 7:-90341937 MsG0780041386.01.T01:CDS
GGTTTCTAGTTATATGGAAT+TGG 0.275435 7:-90341999 MsG0780041386.01.T01:CDS
CAGAGCTTATGCAGGTTTAA+AGG 0.281227 7:-90342089 MsG0780041386.01.T01:CDS
GAAACAATGTTGCATGATAA+AGG 0.303104 7:+90342430 None:intergenic
TAGTACCGAGTTGGATGTTT+TGG 0.305335 7:-90342182 MsG0780041386.01.T01:CDS
ACGGATATGTTGATAAAGTA+TGG 0.308402 7:-90341353 MsG0780041386.01.T01:CDS
AGGTTCTTCCTCTCTTATAA+TGG 0.308847 7:-90341693 MsG0780041386.01.T01:CDS
TTAAAGGAGGAAGAAGCTTT+AGG 0.318879 7:-90342073 MsG0780041386.01.T01:CDS
CTACAAATGTTTCTTGCAAA+TGG 0.330261 7:-90342263 MsG0780041386.01.T01:CDS
TATCATGCAACATTGTTTCC+TGG 0.348758 7:-90342426 MsG0780041386.01.T01:CDS
GTTTCTAGTTATATGGAATT+GGG 0.357540 7:-90341998 MsG0780041386.01.T01:CDS
GTATGCAAAATGTGGGGATA+TGG 0.360066 7:-90341594 MsG0780041386.01.T01:CDS
TCCATACTCCTTTCTCGCCT+TGG 0.361924 7:+90341090 None:intergenic
TTCACAAATGTAACTTCATC+AGG 0.373994 7:+90341431 None:intergenic
GTGAGAGGAATGTGGTTTCT+TGG 0.374834 7:-90341844 MsG0780041386.01.T01:CDS
GAAAGTACTGAGTAAGAAAC+AGG 0.378785 7:+90341119 None:intergenic
CTCTACTTGAATGTGTTTGT+TGG 0.380547 7:-90342124 MsG0780041386.01.T01:CDS
GCATAGTAAATGATGTTATC+TGG 0.385732 7:-90341637 MsG0780041386.01.T01:CDS
TGTTACATCTTGGAATGCTT+TGG 0.392129 7:-90342020 MsG0780041386.01.T01:CDS
CTGCATTCAAATTTGGAACT+TGG 0.393156 7:-90341185 MsG0780041386.01.T01:CDS
CTCTCTTATAATGGGGCTGC+AGG 0.394859 7:-90341684 MsG0780041386.01.T01:CDS
AAACAATGTTGCATGATAAA+GGG 0.396135 7:+90342431 None:intergenic
CGTCGAGATGGTGTAGTCAT+TGG 0.406835 7:+90342222 None:intergenic
GGTTCGTCAAGTTCATGCTT+TGG 0.413513 7:-90342161 MsG0780041386.01.T01:CDS
TCCAAGGCGAGAAAGGAGTA+TGG 0.415640 7:-90341091 MsG0780041386.01.T01:CDS
CAAGAAATTATGTTTCTTTG+AGG 0.416261 7:+90341938 None:intergenic
TCTTGGACTACTTTAGTGAA+TGG 0.419346 7:-90341920 MsG0780041386.01.T01:CDS
TACAAATGTTTCTTGCAAAT+GGG 0.429445 7:-90342262 MsG0780041386.01.T01:CDS
AGCAGTCATAACCATGTTCC+AGG 0.430816 7:+90342408 None:intergenic
AACACAACATCAGGCTCAAA+TGG 0.440417 7:+90341236 None:intergenic
ACTTGAAAATGTGAAATGAT+TGG 0.440880 7:+90341733 None:intergenic
TAAACAAGCTCACAAATTGT+TGG 0.444001 7:-90342461 MsG0780041386.01.T01:CDS
TCTACTTGAATGTGTTTGTT+GGG 0.446090 7:-90342123 MsG0780041386.01.T01:CDS
AAAACAGACGGCAATTAGTT+GGG 0.447305 7:-90341021 MsG0780041386.01.T01:CDS
CACCCCTGTATCATCAAGTC+TGG 0.447873 7:-90341659 MsG0780041386.01.T01:CDS
TCGTGGAACATCATTCTCTC+TGG 0.448761 7:-90342316 MsG0780041386.01.T01:CDS
TGAGCCTGATGTTGTGTTGT+GGG 0.456316 7:-90341231 MsG0780041386.01.T01:CDS
TACATTTGTGAATGTGTTGT+CGG 0.458685 7:-90341420 MsG0780041386.01.T01:CDS
CGATGAAAGATGTTACATCT+TGG 0.464138 7:-90342030 MsG0780041386.01.T01:CDS
ATCTCCCTGCTCTTCCATAC+AGG 0.464366 7:+90341291 None:intergenic
CTCTGAAAGACGCAGTTTCG+TGG 0.473686 7:-90342333 MsG0780041386.01.T01:CDS
GTCGAGATGGTGTAGTCATT+GGG 0.474544 7:+90342223 None:intergenic
GTGGACCTGTATGGAAGAGC+AGG 0.480737 7:-90341296 MsG0780041386.01.T01:CDS
TGCTGAGAGGATTCGCAGAT+TGG 0.481095 7:-90341153 MsG0780041386.01.T01:CDS
CTTGAAAATGTGAAATGATT+GGG 0.485763 7:+90341734 None:intergenic
CAAGTTCCAAATTTGAATGC+AGG 0.487821 7:+90341186 None:intergenic
TATGCCAGACTTGATGATAC+AGG 0.492902 7:+90341655 None:intergenic
TGTAACAGTACACATGTTGC+GGG 0.496452 7:+90342540 None:intergenic
CAACATTGTTTCCTGGAACA+TGG 0.497391 7:-90342419 MsG0780041386.01.T01:CDS
GATCCCCACAACACAACATC+AGG 0.502012 7:+90341227 None:intergenic
GGGGATATGGATGCAGCATT+TGG 0.506798 7:-90341581 MsG0780041386.01.T01:CDS
GAGCACTCGAGGAGTTTGAT+AGG 0.508204 7:-90341475 MsG0780041386.01.T01:CDS
AGTTGCATGGTGGACCTGTA+TGG 0.511937 7:-90341305 MsG0780041386.01.T01:CDS
GGATCATTACTTGCAGCTTG+TGG 0.514097 7:-90341209 MsG0780041386.01.T01:CDS
GAGCAGTGTAAATGAATTGA+GGG 0.514329 7:-90341069 MsG0780041386.01.T01:CDS
TTGTCGGCATGCGTGCATGC+TGG 0.522224 7:-90341404 MsG0780041386.01.T01:CDS
TCTTGGAATGCAATAATTGG+AGG 0.522709 7:-90341524 MsG0780041386.01.T01:CDS
TTTGATAGGATGAAAGTTGT+GGG 0.524626 7:-90341461 MsG0780041386.01.T01:CDS
ACAAGCAGGTTAACAAAGCC+CGG 0.531991 7:-90341886 MsG0780041386.01.T01:CDS
TTGAGCCTGATGTTGTGTTG+TGG 0.532289 7:-90341232 MsG0780041386.01.T01:CDS
GGAGCAGTGTAAATGAATTG+AGG 0.536402 7:-90341070 MsG0780041386.01.T01:CDS
AGTGTATTGGATGCATGTGC+AGG 0.537718 7:-90341713 MsG0780041386.01.T01:CDS
TCTTTGAGGCATTTGATCAA+AGG 0.537854 7:+90341952 None:intergenic
GTATGGAATACAAGCAGAGA+TGG 0.543011 7:-90341336 MsG0780041386.01.T01:CDS
CGCTCTGAGCAACGTCGAGA+TGG 0.544264 7:+90342210 None:intergenic
TGAATTGAGGGACACAATGA+AGG 0.546458 7:-90341057 MsG0780041386.01.T01:CDS
CACGAAACTGCGTCTTTCAG+AGG 0.547698 7:+90342334 None:intergenic
TTCTTGCAAATGGGAAGAGC+TGG 0.551127 7:-90342253 MsG0780041386.01.T01:CDS
AGCGGTTATTAGTACCGAGT+TGG 0.552113 7:-90342191 MsG0780041386.01.T01:CDS
TCTTTGATCAGAGCTTATGC+AGG 0.553137 7:-90342097 MsG0780041386.01.T01:CDS
TTGATATGTATGCAAAATGT+GGG 0.554393 7:-90341601 MsG0780041386.01.T01:CDS
GTTTGATAGGATGAAAGTTG+TGG 0.555964 7:-90341462 MsG0780041386.01.T01:CDS
TGTGCAAAACAAGAGATTTG+TGG 0.558708 7:-90341801 MsG0780041386.01.T01:CDS
CTTGGACAGCAATGATCAGT+GGG 0.573880 7:-90341826 MsG0780041386.01.T01:CDS
GTACACATGTTGCGGGAACA+TGG 0.575824 7:+90342547 None:intergenic
TTGTAACAGTACACATGTTG+CGG 0.578537 7:+90342539 None:intergenic
ATGCCAGACTTGATGATACA+GGG 0.578730 7:+90341656 None:intergenic
GCATGCTGGTCTTGTTGAAG+AGG 0.580198 7:-90341390 MsG0780041386.01.T01:CDS
GTTCTTCCTCTCTTATAATG+GGG 0.589199 7:-90341691 MsG0780041386.01.T01:CDS
GTGCTCGTGTAGCTAGTCCA+TGG 0.595681 7:+90341492 None:intergenic
AGCTTATGCAGGTTTAAAGG+AGG 0.599353 7:-90342086 MsG0780041386.01.T01:CDS
ATTGGAGGTTATGCAAGCCA+TGG 0.601308 7:-90341509 MsG0780041386.01.T01:CDS
GATGGAGCATTATAGTTGCA+TGG 0.601713 7:-90341318 MsG0780041386.01.T01:CDS
GAGCCTGATGTTGTGTTGTG+GGG 0.605708 7:-90341230 MsG0780041386.01.T01:CDS
AGAGGGTGAAAAGCACTTCA+CGG 0.608096 7:-90341372 MsG0780041386.01.T01:CDS
TCACAAATGTAACTTCATCA+GGG 0.619406 7:+90341432 None:intergenic
ACTAGCTACACGAGCACTCG+AGG 0.621383 7:-90341486 MsG0780041386.01.T01:CDS
TCTTGGACAGCAATGATCAG+TGG 0.624771 7:-90341827 MsG0780041386.01.T01:CDS
CACAAATGTAACTTCATCAG+GGG 0.625143 7:+90341433 None:intergenic
CTGCAGCCCCATTATAAGAG+AGG 0.628220 7:+90341685 None:intergenic
CATGCTGGTCTTGTTGAAGA+GGG 0.639578 7:-90341389 MsG0780041386.01.T01:CDS
TGCATACATATCAACGAGCG+AGG 0.640944 7:+90341610 None:intergenic
GTTGATATGTATGCAAAATG+TGG 0.642737 7:-90341602 MsG0780041386.01.T01:CDS
TGCATGTACTGAAGAGATTG+TGG 0.644376 7:-90342579 MsG0780041386.01.T01:CDS
CAGAGAACTAGAAACTCAGA+GGG 0.644384 7:-90342289 MsG0780041386.01.T01:CDS
TTGGAGAGTATGCTGCTGAG+AGG 0.654290 7:-90341166 MsG0780041386.01.T01:CDS
TGATATGAGTGAGAGGAATG+TGG 0.665289 7:-90341852 MsG0780041386.01.T01:CDS
TCAGAGAACTAGAAACTCAG+AGG 0.668159 7:-90342290 MsG0780041386.01.T01:CDS
AGGGACACAATGAAGGAGCG+AGG 0.672577 7:-90341050 MsG0780041386.01.T01:CDS
ACGAACCAAAACATCCAACT+CGG 0.680126 7:+90342177 None:intergenic
TGGACCTGTATGGAAGAGCA+GGG 0.685033 7:-90341295 MsG0780041386.01.T01:CDS
TGCCAGACTTGATGATACAG+GGG 0.707101 7:+90341657 None:intergenic
GGAGCATTATAGTTGCATGG+TGG 0.730950 7:-90341315 MsG0780041386.01.T01:CDS
CATCTCGACGTTGCTCAGAG+CGG 0.753263 7:-90342209 MsG0780041386.01.T01:CDS
TGATATGTATGCAAAATGTG+GGG 0.755551 7:-90341600 MsG0780041386.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
! AAACAATGTTGCATGATAAA+GGG + Chr7:90341165-90341184 None:intergenic 25.0%
! ACTTGAAAATGTGAAATGAT+TGG + Chr7:90341863-90341882 None:intergenic 25.0%
! CAAGAAATTATGTTTCTTTG+AGG + Chr7:90341658-90341677 None:intergenic 25.0%
! CTCAAAGAAACATAATTTCT+TGG - Chr7:90341656-90341675 MsG0780041386.01.T01:CDS 25.0%
! CTTGAAAATGTGAAATGATT+GGG + Chr7:90341862-90341881 None:intergenic 25.0%
! TACAAATGTTTCTTGCAAAT+GGG - Chr7:90341331-90341350 MsG0780041386.01.T01:CDS 25.0%
! TTGATATGTATGCAAAATGT+GGG - Chr7:90341992-90342011 MsG0780041386.01.T01:CDS 25.0%
!!! GTTTCTAGTTATATGGAATT+GGG - Chr7:90341595-90341614 MsG0780041386.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTCACATTTTCAAGTGTAT+TGG - Chr7:90341867-90341886 MsG0780041386.01.T01:CDS 25.0%
CTACAAATGTTTCTTGCAAA+TGG - Chr7:90341330-90341349 MsG0780041386.01.T01:CDS 30.0%
GAAACAATGTTGCATGATAA+AGG + Chr7:90341166-90341185 None:intergenic 30.0%
GCATAGTAAATGATGTTATC+TGG - Chr7:90341956-90341975 MsG0780041386.01.T01:CDS 30.0%
GTCAATTAGGGATAAGAATT+TGG - Chr7:90342044-90342063 MsG0780041386.01.T01:CDS 30.0%
GTTGATATGTATGCAAAATG+TGG - Chr7:90341991-90342010 MsG0780041386.01.T01:CDS 30.0%
GTTTCTTGGAATGCAATAAT+TGG - Chr7:90342066-90342085 MsG0780041386.01.T01:CDS 30.0%
TAAACAAGCTCACAAATTGT+TGG - Chr7:90341132-90341151 MsG0780041386.01.T01:CDS 30.0%
TACATTTGTGAATGTGTTGT+CGG - Chr7:90342173-90342192 MsG0780041386.01.T01:CDS 30.0%
TCACAAATGTAACTTCATCA+GGG + Chr7:90342164-90342183 None:intergenic 30.0%
TCAGTACTTTCAAAAATCCA+AGG - Chr7:90342486-90342505 MsG0780041386.01.T01:CDS 30.0%
TCATATCATCAAAAACAGAC+CGG + Chr7:90341729-90341748 None:intergenic 30.0%
TCTACTTGAATGTGTTTGTT+GGG - Chr7:90341470-90341489 MsG0780041386.01.T01:CDS 30.0%
TGATATGTATGCAAAATGTG+GGG - Chr7:90341993-90342012 MsG0780041386.01.T01:CDS 30.0%
TTCACAAATGTAACTTCATC+AGG + Chr7:90342165-90342184 None:intergenic 30.0%
TTTGATAGGATGAAAGTTGT+GGG - Chr7:90342132-90342151 MsG0780041386.01.T01:CDS 30.0%
! ACGGATATGTTGATAAAGTA+TGG - Chr7:90342240-90342259 MsG0780041386.01.T01:CDS 30.0%
!! GGTTTCTAGTTATATGGAAT+TGG - Chr7:90341594-90341613 MsG0780041386.01.T01:CDS 30.0%
!! TGCTTTGGTTTCTAGTTATA+TGG - Chr7:90341588-90341607 MsG0780041386.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTTTGATGATATGAGTGAG+AGG - Chr7:90341734-90341753 MsG0780041386.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGGTGTTTTTGAGTCAATTA+GGG - Chr7:90342032-90342051 MsG0780041386.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTGGTGTTTTTGAGTCAATT+AGG - Chr7:90342031-90342050 MsG0780041386.01.T01:CDS 30.0%
AAAAACAGACGGCAATTAGT+TGG - Chr7:90342571-90342590 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
AAAACAGACGGCAATTAGTT+GGG - Chr7:90342572-90342591 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
AGGTTCTTCCTCTCTTATAA+TGG - Chr7:90341900-90341919 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
CAAGTTCCAAATTTGAATGC+AGG + Chr7:90342410-90342429 None:intergenic 35.0%
CACAAATGTAACTTCATCAG+GGG + Chr7:90342163-90342182 None:intergenic 35.0%
CATATCATCAAAAACAGACC+GGG + Chr7:90341728-90341747 None:intergenic 35.0%
CATGCTTTGGCATTTCATTT+AGG - Chr7:90341445-90341464 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
CGATGAAAGATGTTACATCT+TGG - Chr7:90341563-90341582 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
CTCTACTTGAATGTGTTTGT+TGG - Chr7:90341469-90341488 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
GAGCAGTGTAAATGAATTGA+GGG - Chr7:90342524-90342543 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
GCGAGGAATAAAAAAACAGA+CGG - Chr7:90342560-90342579 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
GGTTCTTCCTCTCTTATAAT+GGG - Chr7:90341901-90341920 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
GTTCTTCCTCTCTTATAATG+GGG - Chr7:90341902-90341921 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
GTTTGATAGGATGAAAGTTG+TGG - Chr7:90342131-90342150 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
TATCATGCAACATTGTTTCC+TGG - Chr7:90341167-90341186 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
TCTTGGAATGCAATAATTGG+AGG - Chr7:90342069-90342088 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
TCTTGGACTACTTTAGTGAA+TGG - Chr7:90341673-90341692 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
TGGTTATGTCAAAAACAAGC+AGG - Chr7:90341693-90341712 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
TGTGCAAAACAAGAGATTTG+TGG - Chr7:90341792-90341811 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
TGTTACATCTTGGAATGCTT+TGG - Chr7:90341573-90341592 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
TTAAAGGAGGAAGAAGCTTT+AGG - Chr7:90341520-90341539 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
TTGTAACAGTACACATGTTG+CGG + Chr7:90341057-90341076 None:intergenic 35.0%
! CTGCATTCAAATTTGGAACT+TGG - Chr7:90342408-90342427 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
! GGGATAAGAATTTGGTTTCT+TGG - Chr7:90342052-90342071 MsG0780041386.01.T01:CDS 35.0%
!! GAAAGTACTGAGTAAGAAAC+AGG + Chr7:90342477-90342496 None:intergenic 35.0%
!! TCTTTGAGGCATTTGATCAA+AGG + Chr7:90341644-90341663 None:intergenic 35.0%
!!! TCAGAGGCATTTTATCAAAC+AGG + Chr7:90341246-90341265 None:intergenic 35.0%
AACACAACATCAGGCTCAAA+TGG + Chr7:90342360-90342379 None:intergenic 40.0%
ACGAACCAAAACATCCAACT+CGG + Chr7:90341419-90341438 None:intergenic 40.0%
AGCTTATGCAGGTTTAAAGG+AGG - Chr7:90341507-90341526 MsG0780041386.01.T01:CDS 40.0%
CAACATTGTTTCCTGGAACA+TGG - Chr7:90341174-90341193 MsG0780041386.01.T01:CDS 40.0%
CAGAGAACTAGAAACTCAGA+GGG - Chr7:90341304-90341323 MsG0780041386.01.T01:CDS 40.0%
CAGAGCTTATGCAGGTTTAA+AGG - Chr7:90341504-90341523 MsG0780041386.01.T01:CDS 40.0%
GGAGCAGTGTAAATGAATTG+AGG - Chr7:90342523-90342542 MsG0780041386.01.T01:CDS 40.0%
GTATGCAAAATGTGGGGATA+TGG - Chr7:90341999-90342018 MsG0780041386.01.T01:CDS 40.0%
GTATGGAATACAAGCAGAGA+TGG - Chr7:90342257-90342276 MsG0780041386.01.T01:CDS 40.0%
TCAAAAATCCAAGGCGAGAA+AGG - Chr7:90342495-90342514 MsG0780041386.01.T01:CDS 40.0%
TCAGAGAACTAGAAACTCAG+AGG - Chr7:90341303-90341322 MsG0780041386.01.T01:CDS 40.0%
TCTTTGATCAGAGCTTATGC+AGG - Chr7:90341496-90341515 MsG0780041386.01.T01:CDS 40.0%
TGAATTGAGGGACACAATGA+AGG - Chr7:90342536-90342555 MsG0780041386.01.T01:CDS 40.0%
TGATATGAGTGAGAGGAATG+TGG - Chr7:90341741-90341760 MsG0780041386.01.T01:CDS 40.0%
TGCATGTACTGAAGAGATTG+TGG - Chr7:90341014-90341033 MsG0780041386.01.T01:CDS 40.0%
TGTAACAGTACACATGTTGC+GGG + Chr7:90341056-90341075 None:intergenic 40.0%
TTGTGGCCTGCATTCAAATT+TGG - Chr7:90342401-90342420 MsG0780041386.01.T01:CDS 40.0%
! ATGCCAGACTTGATGATACA+GGG + Chr7:90341940-90341959 None:intergenic 40.0%
! GATGGAGCATTATAGTTGCA+TGG - Chr7:90342275-90342294 MsG0780041386.01.T01:CDS 40.0%
! TATGCCAGACTTGATGATAC+AGG + Chr7:90341941-90341960 None:intergenic 40.0%
!! TAGTACCGAGTTGGATGTTT+TGG - Chr7:90341411-90341430 MsG0780041386.01.T01:CDS 40.0%
ACAAGCAGGTTAACAAAGCC+CGG - Chr7:90341707-90341726 MsG0780041386.01.T01:CDS 45.0%
AGCAGTCATAACCATGTTCC+AGG + Chr7:90341188-90341207 None:intergenic 45.0%
AGTGTATTGGATGCATGTGC+AGG - Chr7:90341880-90341899 MsG0780041386.01.T01:CDS 45.0%
ATTGGAGGTTATGCAAGCCA+TGG - Chr7:90342084-90342103 MsG0780041386.01.T01:CDS 45.0%
CTTGGACAGCAATGATCAGT+GGG - Chr7:90341767-90341786 MsG0780041386.01.T01:CDS 45.0%
GGATCATTACTTGCAGCTTG+TGG - Chr7:90342384-90342403 MsG0780041386.01.T01:CDS 45.0%
GGTTCGTCAAGTTCATGCTT+TGG - Chr7:90341432-90341451 MsG0780041386.01.T01:CDS 45.0%
GTCGAGATGGTGTAGTCATT+GGG + Chr7:90341373-90341392 None:intergenic 45.0%
GTGAGAGGAATGTGGTTTCT+TGG - Chr7:90341749-90341768 MsG0780041386.01.T01:CDS 45.0%
TCGTGGAACATCATTCTCTC+TGG - Chr7:90341277-90341296 MsG0780041386.01.T01:CDS 45.0%
TCTTGGACAGCAATGATCAG+TGG - Chr7:90341766-90341785 MsG0780041386.01.T01:CDS 45.0%
TGAGCCTGATGTTGTGTTGT+GGG - Chr7:90342362-90342381 MsG0780041386.01.T01:CDS 45.0%
TGCATACATATCAACGAGCG+AGG + Chr7:90341986-90342005 None:intergenic 45.0%
TTCTTGCAAATGGGAAGAGC+TGG - Chr7:90341340-90341359 MsG0780041386.01.T01:CDS 45.0%
TTGAGCCTGATGTTGTGTTG+TGG - Chr7:90342361-90342380 MsG0780041386.01.T01:CDS 45.0%
! AGCGGTTATTAGTACCGAGT+TGG - Chr7:90341402-90341421 MsG0780041386.01.T01:CDS 45.0%
! GGAGCATTATAGTTGCATGG+TGG - Chr7:90342278-90342297 MsG0780041386.01.T01:CDS 45.0%
! TGCCAGACTTGATGATACAG+GGG + Chr7:90341939-90341958 None:intergenic 45.0%
!! AGAGGGTGAAAAGCACTTCA+CGG - Chr7:90342221-90342240 MsG0780041386.01.T01:CDS 45.0%
!! CATGCTGGTCTTGTTGAAGA+GGG - Chr7:90342204-90342223 MsG0780041386.01.T01:CDS 45.0%
ATCTCCCTGCTCTTCCATAC+AGG + Chr7:90342305-90342324 None:intergenic 50.0%
CACCCCTGTATCATCAAGTC+TGG - Chr7:90341934-90341953 MsG0780041386.01.T01:CDS 50.0%
CACGAAACTGCGTCTTTCAG+AGG + Chr7:90341262-90341281 None:intergenic 50.0%
CGTCGAGATGGTGTAGTCAT+TGG + Chr7:90341374-90341393 None:intergenic 50.0%
CTGCAGCCCCATTATAAGAG+AGG + Chr7:90341911-90341930 None:intergenic 50.0%
GAGCACTCGAGGAGTTTGAT+AGG - Chr7:90342118-90342137 MsG0780041386.01.T01:CDS 50.0%
GAGCCTGATGTTGTGTTGTG+GGG - Chr7:90342363-90342382 MsG0780041386.01.T01:CDS 50.0%
GATCCCCACAACACAACATC+AGG + Chr7:90342369-90342388 None:intergenic 50.0%
GGGGATATGGATGCAGCATT+TGG - Chr7:90342012-90342031 MsG0780041386.01.T01:CDS 50.0%
GTACACATGTTGCGGGAACA+TGG + Chr7:90341049-90341068 None:intergenic 50.0%
TCCAAGGCGAGAAAGGAGTA+TGG - Chr7:90342502-90342521 MsG0780041386.01.T01:CDS 50.0%
TCCATACTCCTTTCTCGCCT+TGG + Chr7:90342506-90342525 None:intergenic 50.0%
TGCTGAGAGGATTCGCAGAT+TGG - Chr7:90342440-90342459 MsG0780041386.01.T01:CDS 50.0%
TGGACCTGTATGGAAGAGCA+GGG - Chr7:90342298-90342317 MsG0780041386.01.T01:CDS 50.0%
! CTCTCTTATAATGGGGCTGC+AGG - Chr7:90341909-90341928 MsG0780041386.01.T01:CDS 50.0%
! CTCTGAAAGACGCAGTTTCG+TGG - Chr7:90341260-90341279 MsG0780041386.01.T01:CDS 50.0%
! TTGGAGAGTATGCTGCTGAG+AGG - Chr7:90342427-90342446 MsG0780041386.01.T01:CDS 50.0%
!! AGTTGCATGGTGGACCTGTA+TGG - Chr7:90342288-90342307 MsG0780041386.01.T01:CDS 50.0%
!! GCATGCTGGTCTTGTTGAAG+AGG - Chr7:90342203-90342222 MsG0780041386.01.T01:CDS 50.0%
ACTAGCTACACGAGCACTCG+AGG - Chr7:90342107-90342126 MsG0780041386.01.T01:CDS 55.0%
AGGGACACAATGAAGGAGCG+AGG - Chr7:90342543-90342562 MsG0780041386.01.T01:CDS 55.0%
CATCTCGACGTTGCTCAGAG+CGG - Chr7:90341384-90341403 MsG0780041386.01.T01:CDS 55.0%
GTGCTCGTGTAGCTAGTCCA+TGG + Chr7:90342104-90342123 None:intergenic 55.0%
GTGGACCTGTATGGAAGAGC+AGG - Chr7:90342297-90342316 MsG0780041386.01.T01:CDS 55.0%
TTGTCGGCATGCGTGCATGC+TGG - Chr7:90342189-90342208 MsG0780041386.01.T01:CDS 60.0%
! CGCTCTGAGCAACGTCGAGA+TGG + Chr7:90341386-90341405 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 90341013 90342602 90341013 ID=MsG0780041386.01;Name=MsG0780041386.01
Chr7 mRNA 90341013 90342602 90341013 ID=MsG0780041386.01.T01;Parent=MsG0780041386.01;Name=MsG0780041386.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.49;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|529
Chr7 exon 90341013 90342602 90341013 ID=MsG0780041386.01.T01:exon:12359;Parent=MsG0780041386.01.T01
Chr7 CDS 90341013 90342602 90341013 ID=MsG0780041386.01.T01:cds;Parent=MsG0780041386.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780041386.01.T01

ATGCATGTACTGAAGAGATTGTGGTTGAAGACACCATGTTCCCGCAACATGTGTACTGTTACAATCACAACATCACAACTTAACTACATGATTAACACTTACATTGACAGCAACAACGTTAAACAAGCTCACAAATTGTTGGATGAAAACCCTTTATCATGCAACATTGTTTCCTGGAACATGGTTATGACTGCTTACGTGCAACACAATCAAATTCGACTCGCTCGCGACCTGTTTGATAAAATGCCTCTGAAAGACGCAGTTTCGTGGAACATCATTCTCTCTGGTTTTCAGAGAACTAGAAACTCAGAGGGACTCTACAAATGTTTCTTGCAAATGGGAAGAGCTGGTGTAGTGCCCAATGACTACACCATCTCGACGTTGCTCAGAGCGGTTATTAGTACCGAGTTGGATGTTTTGGTTCGTCAAGTTCATGCTTTGGCATTTCATTTAGGACTCTACTTGAATGTGTTTGTTGGGTCGTCTTTGATCAGAGCTTATGCAGGTTTAAAGGAGGAAGAAGCTTTAGGTCGAGCGTTTGATGATATATCGATGAAAGATGTTACATCTTGGAATGCTTTGGTTTCTAGTTATATGGAATTGGGAAAATTCGTTGATGCTCAAACTGCCTTTGATCAAATGCCTCAAAGAAACATAATTTCTTGGACTACTTTAGTGAATGGTTATGTCAAAAACAAGCAGGTTAACAAAGCCCGGTCTGTTTTTGATGATATGAGTGAGAGGAATGTGGTTTCTTGGACAGCAATGATCAGTGGGTATGTGCAAAACAAGAGATTTGTGGATGCATTGAAGCTTTTTGTTCTTATGTTTAAGACTGAAACTCGTCCCAATCATTTCACATTTTCAAGTGTATTGGATGCATGTGCAGGTTCTTCCTCTCTTATAATGGGGCTGCAGGTTCACCCCTGTATCATCAAGTCTGGCATAGTAAATGATGTTATCTGGCTGACCTCGCTCGTTGATATGTATGCAAAATGTGGGGATATGGATGCAGCATTTGGTGTTTTTGAGTCAATTAGGGATAAGAATTTGGTTTCTTGGAATGCAATAATTGGAGGTTATGCAAGCCATGGACTAGCTACACGAGCACTCGAGGAGTTTGATAGGATGAAAGTTGTGGGCGTTGCCCCTGATGAAGTTACATTTGTGAATGTGTTGTCGGCATGCGTGCATGCTGGTCTTGTTGAAGAGGGTGAAAAGCACTTCACGGATATGTTGATAAAGTATGGAATACAAGCAGAGATGGAGCATTATAGTTGCATGGTGGACCTGTATGGAAGAGCAGGGAGATTTGATGAAGCAGAAAATTTAATCAAGAATATGCCATTTGAGCCTGATGTTGTGTTGTGGGGATCATTACTTGCAGCTTGTGGCCTGCATTCAAATTTGGAACTTGGAGAGTATGCTGCTGAGAGGATTCGCAGATTGGAGAGCAGTCATCCTGTTTCTTACTCAGTACTTTCAAAAATCCAAGGCGAGAAAGGAGTATGGAGCAGTGTAAATGAATTGAGGGACACAATGAAGGAGCGAGGAATAAAAAAACAGACGGCAATTAGTTGGGTTGAGTGA
Protein sequence

>MsG0780041386.01.T01

MHVLKRLWLKTPCSRNMCTVTITTSQLNYMINTYIDSNNVKQAHKLLDENPLSCNIVSWNMVMTAYVQHNQIRLARDLFDKMPLKDAVSWNIILSGFQRTRNSEGLYKCFLQMGRAGVVPNDYTISTLLRAVISTELDVLVRQVHALAFHLGLYLNVFVGSSLIRAYAGLKEEEALGRAFDDISMKDVTSWNALVSSYMELGKFVDAQTAFDQMPQRNIISWTTLVNGYVKNKQVNKARSVFDDMSERNVVSWTAMISGYVQNKRFVDALKLFVLMFKTETRPNHFTFSSVLDACAGSSSLIMGLQVHPCIIKSGIVNDVIWLTSLVDMYAKCGDMDAAFGVFESIRDKNLVSWNAIIGGYASHGLATRALEEFDRMKVVGVAPDEVTFVNVLSACVHAGLVEEGEKHFTDMLIKYGIQAEMEHYSCMVDLYGRAGRFDEAENLIKNMPFEPDVVLWGSLLAACGLHSNLELGEYAAERIRRLESSHPVSYSVLSKIQGEKGVWSSVNELRDTMKERGIKKQTAISWVE*