AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene45438


Find 255 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 397 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE



Chromosome Type Strat End Strand Name
chr8.4 gene 78364866 78371135 78364866 ID=MS.gene45438
chr8.4 mRNA 78364866 78371135 78364866 ID=MS.gene45438.t1;Parent=MS.gene45438
chr8.4 exon 78371000 78371135 78371000 ID=MS.gene45438.t1.exon1;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 CDS 78371000 78371135 78371000 ID=cds.MS.gene45438.t1;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 exon 78368828 78370440 78368828 ID=MS.gene45438.t1.exon2;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 CDS 78368828 78370440 78368828 ID=cds.MS.gene45438.t1;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 exon 78368629 78368715 78368629 ID=MS.gene45438.t1.exon3;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 CDS 78368629 78368715 78368629 ID=cds.MS.gene45438.t1;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 exon 78367627 78368283 78367627 ID=MS.gene45438.t1.exon4;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 CDS 78367627 78368283 78367627 ID=cds.MS.gene45438.t1;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 exon 78367374 78367538 78367374 ID=MS.gene45438.t1.exon5;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 CDS 78367374 78367538 78367374 ID=cds.MS.gene45438.t1;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 exon 78366786 78367080 78366786 ID=MS.gene45438.t1.exon6;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 CDS 78366786 78367080 78366786 ID=cds.MS.gene45438.t1;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 exon 78366432 78366646 78366432 ID=MS.gene45438.t1.exon7;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 CDS 78366432 78366646 78366432 ID=cds.MS.gene45438.t1;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 exon 78366023 78366328 78366023 ID=MS.gene45438.t1.exon8;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 CDS 78366023 78366328 78366023 ID=cds.MS.gene45438.t1;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 exon 78365605 78365668 78365605 ID=MS.gene45438.t1.exon9;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 CDS 78365605 78365668 78365605 ID=cds.MS.gene45438.t1;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 exon 78365273 78365512 78365273 ID=MS.gene45438.t1.exon10;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 CDS 78365273 78365512 78365273 ID=cds.MS.gene45438.t1;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 exon 78364866 78365005 78364866 ID=MS.gene45438.t1.exon11;Parent=MS.gene45438.t1
chr8.4 CDS 78364866 78365005 78364866 ID=cds.MS.gene45438.t1;Parent=MS.gene45438.t1
Gene Sequence

>MS.gene45438

ATGGCAGCCATTAGTCTCACCATGCTTGTTGGAACATGTAACTTTACCTCTAGAATTTGGCTTTCTTGTGATATTGTTAGTCCAACTCCTAAGAAATTGCGTGAACAACATCACCAAGCAAAACAAGGTCTCACAAGTGCATCCAAATTGCATAAAATTTGGTTTTCCTTACATGATAAGCTTAGCTTGCACCACTTTATTCTTGGCTATTCATGCCTTAATGCTAATATTGATGCTCAATCATGAGCCTCAATGTACTTCAAAACTTCAAACTTTTACATCAGAGATCATTCAAGTGTTATCATCTGCAACTATTCTAATAGCAATATGCAAGATGTCAAAAACAAATGCTAATTTCCCGTGGATTATAAGGATTTGGTGGTTTTTCAGTTTCCTTTTGAGCATTATCAGCACAGCCCTTCATGTCCATTTCAGTATAAAAAATAAGGGTGTTATTGGTATAAAAGAATATGCAGATTTCCTTGGTTTGTTTGTTTCAACATGTCTGTTAGTTGTTTCAACAAGAGGGAAAACAGGCATAGTCATCATTGCAACAAATGGTAGCATATCTGAACCACTTTTGGAAGAGAAAAATGAGAAACATTCTTCTCAGTGTCTAAAAGAATCACCATATGGAAAAGCTACAATTTTTCAATTGATAAATTTCTCATGGCTCAATCCGTTGTTTGCGGTAGGGTATAAGAAACCTCTTCAATTGGATGACATTCCTAATCTTGACATCAAGGACTCTGCTGAATATCTAAATTGTGCATTTGATGAGAGTCTTAGACAAGTTAAGGAAAAAGATGGAACTACAAATCCATCTATCTACAAGGCAATCTATTTATTTGCTAGAAAGAAAGCGGCAATCAACGCGCTTTTCGCAATAATAAGCGCTTCAGCATCTTATGTTGGTCCATATTTGATCACTGACTTTGTGAATTTCCTCACCGAGAAGGACAGTCGCGGACTAAAGAGCGGATACCTTTTGTCTCTAGGTTTCTTATGTGCTAAAATGGTTGAGGTCATAGCTCAGAGGCAATGGATTTTCGGTGCTCGGCAACTAGGCCTCCGCCTAAGAGCCGCATTGATATCACACATATATAAGAAGGGCTTACATCTATCAAGCCGATCGCGTCAAAGTCATTCTGGTGGTGAGATAATGAACTACATGAGTGTAGATGTGCAGAGGATTACAGATTTCGTTTGGTATGTAAATGTTATTTGGATGCTGCCGATACAAATTTCCTTAGCTGTTATCGTTTTGCAGACAAATCTTGGATTAGGTTCATTGGCTGCATTAGCTGCTACACTAGCAGTTATGACTTTGAACATACCTTTAACGAAAATACAGAAAAGATACCAAACCAAGATCATGGATGCAAAAGACAACAGAATGAAGACCACTTCAGAAATTCTCAAAAACATGAGGACTTTGAAACTTCAAGCATGGGATAGTGAGTTTTTCCAAAGGATAGAATCATTGAGAAGTGTTGAATATGGATGGTTATCAAAGTCATTAAGACAACAGGCGTTTTCGGCTTTTATCTTCTGGGGTTCACCTACATTCATTTCAGTGATAACCTTTTGGACATGCATGTTCGTAGGGATTGAGCTGACAGCTGGAAGGGTCTTATCCGCATTTGCGACATTCCGAATGTTACAAGATCCTATCTTTAGTCTACCTGATCTACTCAATGTTATTGCTCAAGGAAAAGTTTCTGTCGATAGGATCGCTTCTTTTCTTAAGAAGGAAGAAATCCAACATGATGTAATTGAATATGTTTCCAAGGACAAAACAGAATTTGATGTAGTTATTGAGAAAGGAAGATTCAGTTGGGATCCTGAGACAACAATTCCAACACTTGATGAAATTGAGTTGAATGTTAAGAGAGGAATGAAGGTTGCAATTTGTGGTTCTGTTGGTTCCGGGAAATCTAGTATGCTCTCAGGAATTTTGGGAGAGATATTTAAACAATCAGGGAATGTTAAGATTAGTGGTACAAAGGCTTATGTTCCACAATCAGCATGGATACTTACTGGAAATATTAGGGACAATATAACCTTTGGAAAAGAGTTCGATGAAGATAAGTATGAAAAAACTGTTGAAGCATGTGCATTGAAAAAGGACTTTGAGCTATTCTCATGTGGTGATTTGACTGAGATTGGTGAAAGAGGGATTAATATGAGTGGTGGACAGAAACAAAGAATACAGATAGCTAGAGCTGTTTATCAAGATGCTGATATATACCTTTTTGATGATCCTTTCAGTGCTGTCGATGCTCATACCGGCACTCACCTCTTTAAGGTCAATTATTCTTTTTTGTACTTTAAATTTGTAAAATATTTCAATGTTTGAAGACTTGTTTGTGAAACAATTGCATTGCTTTAATGTTAGGTGTTTCATATGTTTTCCGCAGGAATGTCTTCTGGGGATTCTCAAAGAAAAAACTATACTATTTGTTACACACCAAGTTGAGTTTCTTCCAGCAGCAGACCTCATTCTGGTAAATGATGATGCTTGCTTGAAAGTTTGGTTCTATATTTATTTAGTCAATAAAGAGTATATCAAATTATGCTGTTGAAGAGATTATAGTCTGTTAAACTACGAATTTAATTCATATACACCGTCAGTTTAAAGATTTTCTACATTGGCAATCAATTGTAATCCTCACATCTTTAAAAACATTTGGTTGTAATCAATAAATACTTCTAAAGCCACACATATGATGATTGGTTTTGATTTTTTGACAGTGTAAAATATATCATTTTACTTTGGATTCCTTAATGTTTGATATACCTCTTCCACTTTTATCATATATCACGCTGCCACTGATCCAAATGAAAACCAGGTGATGCAAAATGGAAGGATTGCACAAGCCGGAACATTTGAAGAACTTCTAAAGCAAAATATAGGATTTGAATTATTAGTTGGTGCTCATAGCAAAGCACTAGAGTCAGTTCTTATGGTTGGAAATTCAAGTAAAGCAAATTTAAATCCAATACCTGAAGGAGAATGCATCACCTACTCAAACTCAAGTTCTGAACTTTTGCACACACAACTTGACACAGTGCAAGATAATCCTCCTACAGAAAGCAAAGGAAATAATGATGGAAAATTGGTTACAGATGAAGAAAGAGAAACAGGAAGCATATCAAAAGAAGTTTACTGGTCTTATTTGACAACTGTTAAAGGAGGAATTCTGGTTCCAATCATACTATTGGCACAGTCTTCATTCCAAATACTTCAGATTGCTAGTAACTATTGGATGGCTTGGGTTTGTCCTACAAAATCTGATGCTAAGCCTATATTTGATATGAATTTCATACTACTTATTTATATGGTACTTTCTGTTGCTGGTTCCCTTTGTGTTCTTCTGAGAGCCATGTTGGTGTTAAATGTTGGACTTTGGACAGCACAAACTTTTTTCACAAGAATGTTGCATAATGTGCAACGAGCCCCCATGTCATTTTTTGATTCTACCCCAACTGGAAGAATCTTGAACAGGGTAAGAATTCATATCTATCAATGCTATCTATGACTATTATTGTTATTGCACTATATAACAACACTGATATTGAAAGTCTTAATTTCAGGCCTCCACAGATCAAAGTGTGCTAGACTTGGAAATGGCAAACAAAATAGGATGGTGTGCTTTCTCAATAATACAAATTCTTGGCACTATTGCGGTGATGTGTCAGGCAGCATGGCAAGTATTTATCATCTTCATTCCAGTAACTGCAATTTGCATATGGTATCAAGTATGTATCCTTTTTCCTTTTTGCTCTCTCTCTCTATTAAAGGACATAAAACAAGTTTTACTCATAACTAATTCCAAAATTAATGCAAGATATAATATTTCGATTTTGCAATGTGTAAGCTATGTGAACCGAAGCTTATGCTCAAATTTTAAGTCCAACATTTAAAGTAGATAAAAATGCTCATATTTAAGTTATTTTTGTACTTACAAAGAAATCAGTCTCTTTCTCATGTCCTTCTCTATCCACCGTTGTTTTATGAAATCCTGACAGAAGTTGAATGATGTTTATTTCAGCGATATTATAATCCGACAGCAAGAGAACTGGCTCGCTTAGCACAGATACAAATTACTCCAATTCTCCACCATTTTTCAGAATCTTTAGCAGGAGCTGCATCAATACGAGCTTTTGATCAAGAAGGCCGTTTCATGAGCACAAATCTTGTCCTTCTGGATGGCTTCTCAAGGCCATGGTTTCACAACGTGTCTGCAATGGAATGGCTTTCTTACAGATTGAACTTGCTTTCAAATTTTGTTTTTGCCTTTTCACTTGTCTTGCTAGTGAGCCTCCCTGAAGGTTTCATAAATCCAAGTAAGTACAAACCTTTATTGAGAAAATATTAGTAATAGACAATAAAACCATGTGTTTTGCAAACATACGAAGTTATTTTCATATAATGCTCCTCACAGGAATTGAAAATGATCTTACTTTCATTTCCGGTATGTTACAGGCATTGCAGGGTTAGCAGTAACATATGGAATCAATTTGAATGTCTTGCAAGCTTCGGTTATATGGAACATTTGCAATGCAGAAAACAAGATGATATCAGTTGAAAGAATTCTTCAATATACAAATATCGCAAGTGAATCACCTCTTGTGATTGAAGACTGTCGGCCGCCAAGAAACTGGCCAGAAACTGGAACAATATGTTTCCAAAATTTGCAGGTTTGATATAGCAAGAATTAAGGACACACAAAATATATAATGAATCAAGTTTCTATGTCCAATTTTTCCTTACATATCTTCTACACAAACTTTTATGTTACAGATACGATATGCTGAACATCTACCATCTGTGTTGAAAAATATCACTTGCACATTTCCTGGAAGGAAGAAAATAGGTGTTGTAGGACGAACTGGCAGTGGTAAATCAACCCTCATACAGGCAATTTTCAGGATTGTTGAACCAAGAGAGGGATGCATTATGATTGACAATGTGGACATATGTGAGATAGGTCTCCATGACTTAAGGTCAAGGCTCAGCATTATCCCACAAGATCCAGCCTTGTTTGAAGGCACAGTCAGAGGAAACCTGGACCCTCTGGAGCAATACTCTGACAATGAAGTGTGGAAGGTAAACACTTCAATCAAAGTTAATGTATGTTTATCACTATTAGCACAGTTAAAAATATCTTCTCATTGAAGAGGAAAGAGAGTATCCAGATGAATACTCATTGGTTACATTTAGGGTGCGTTTGATACACTGAGGTACAAAACAATGAGAATGGCACAAGACAAACACTTGATACACTTTACAACTCTTTGTTATGTACATTTTTTTATGGAGAACAGCACAAGTAATATATTGTGAAATTTACTAAAACATCCTTAGTACTTTTTCTAAGAGCAAATTATGTATGGTAAGCTACACGTGAAATGGTCGTATTTTTTTCCCTTATCATCAGCTAAATGGTTTTTTCATTTTCAGGCACTAGATAAATGTCAGCTAGGACACCTAGTGAGGGCCAAGGAAGAGAAGTTGGACTCCCCAGGTTGGATTCATTGGCTATCAACTTGCACAGTTTATTATGCTTTTGGTAATAATAATCATAGTTACTGATAAAAACTGAATTGCTTTATACAGTGGTTGAAAATGGTGATAATTGGAGTGCTGGACAAAGGCAATTATTTTGCCTTGGAAGAGCTTTGCTGAAGAAAAGCAGCATTTTAGTACTAGATGAAGCAACAGCCTCAGTGGACTCTGCAACTGATGGGGTGATACAGGATATCATTTGTCAAGAGTTCAACAATCGAACAGTTGTCACAATAGCTCATCGAATCCACACAGTCATCGATAGCGACTTGGTTTTGGTTCTCAGCGATGGTAAGTGTTTGAGATTACAAATAGAACTAATTTGACCATTTAATTGTGTTGCAAAATAGAATTTTAAATAGGTTTTCAAATAAAAAAATGTACACCGACAGTGTAAATAAGCATTACACCGACAAAAATATGAAAGATATTGATAAATATTCAACAACCAAATGAAGTTACAAAATAATGACACTAGAGTTTGACATTATATGGGAAGAAGTATCTTAATATATATCTTTTTTTTGAGTAAATCTTAATATATATCTTATGTTACAGGGAGAATTGCAGAATATGATGAACCATCAAAGTTACTTGAAAGAGAAGATTCTTTCTTCTACAAACTTATAAAGGAGTACTCTAGCAGATCCCATAGCTTCAATAACTTGGCAACTCAACATGTCCAAGACAGGGAATAA

Protein sequence

>MS.gene45438.t1

MAAISLTMLVGTCNFTSRIWLSCDIVSPTPKKLREQHHQAKQGLTRYKKPLQLDDIPNLDIKDSAEYLNCAFDESLRQVKEKDGTTNPSIYKAIYLFARKKAAINALFAIISASASYVGPYLITDFVNFLTEKDSRGLKSGYLLSLGFLCAKMVEVIAQRQWIFGARQLGLRLRAALISHIYKKGLHLSSRSRQSHSGGEIMNYMSVDVQRITDFVWYVNVIWMLPIQISLAVIVLQTNLGLGSLAALAATLAVMTLNIPLTKIQKRYQTKIMDAKDNRMKTTSEILKNMRTLKLQAWDSEFFQRIESLRSVEYGWLSKSLRQQAFSAFIFWGSPTFISVITFWTCMFVGIELTAGRVLSAFATFRMLQDPIFSLPDLLNVIAQGKVSVDRIASFLKKEEIQHDVIEYVSKDKTEFDVVIEKGRFSWDPETTIPTLDEIELNVKRGMKVAICGSVGSGKSSMLSGILGEIFKQSGNVKISGTKAYVPQSAWILTGNIRDNITFGKEFDEDKYEKTVEACALKKDFELFSCGDLTEIGERGINMSGGQKQRIQIARAVYQDADIYLFDDPFSAVDAHTGTHLFKECLLGILKEKTILFVTHQVEFLPAADLILVMQNGRIAQAGTFEELLKQNIGFELLVGAHSKALESVLMVGNSSKANLNPIPEGECITYSNSSSELLHTQLDTVQDNPPTESKGNNDGKLVTDEERETGSISKEVYWSYLTTVKGGILVPIILLAQSSFQILQIASNYWMAWVCPTKSDAKPIFDMNFILLIYMVLSVAGSLCVLLRAMLVLNVGLWTAQTFFTRMLHNVQRAPMSFFDSTPTGRILNRASTDQSVLDLEMANKIGWCAFSIIQILGTIAVMCQAAWQVFIIFIPVTAICIWYQRYYNPTARELARLAQIQITPILHHFSESLAGAASIRAFDQEGRFMSTNLVLLDGFSRPWFHNVSAMEWLSYRLNLLSNFVFAFSLVLLVSLPEGFINPSIAGLAVTYGINLNVLQASVIWNICNAENKMISVERILQYTNIASESPLVIEDCRPPRNWPETGTICFQNLQIRYAEHLPSVLKNITCTFPGRKKIGVVGRTGSGKSTLIQAIFRIVEPREGCIMIDNVDICEIGLHDLRSRLSIIPQDPALFEGTVRGNLDPLEQYSDNEVWKALDKCQLGHLVRAKEEKLDSPVVENGDNWSAGQRQLFCLGRALLKKSSILVLDEATASVDSATDGVIQDIICQEFNNRTVVTIAHRIHTVIDSDLVLVLSDGRIAEYDEPSKLLEREDSFFYKLIKEYSSRSHSFNNLATQHVQDRE