AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene057086


Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MS.gene057086.t1 MTR_5g091190 90.678 118 6 2 1 118 6 118 3.53e-61 188
MS.gene057086.t1 MTR_7g035145 80.488 41 8 0 81 121 15 55 1.58e-17 73.9
Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MS.gene057086.t1 AT2G42975 73.684 57 11 2 63 118 74 127 3.11e-18 78.6

Find 40 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTCTTTCAAATCTTCAAGTA+TGG 0.255349 5.3:+73296777 None:intergenic
CATCCCAAAGGAACAAGTTC+TGG 0.296211 5.3:-73288090 MS.gene057086:intron
ATCAACTTTGGCTTCTTCCT+TGG 0.301291 5.3:+73296750 None:intergenic
ATCTTCTTCTCGTGCACAAC+TGG 0.315548 5.3:-73304297 MS.gene057086:CDS
TCGTGCACAACTGGATCTTT+TGG 0.328038 5.3:-73304288 MS.gene057086:CDS
AAAGGGAAAGGAAGTCATTT+GGG 0.329806 5.3:-73288029 MS.gene057086:CDS
TCTTCAAGTATGGCTTGATT+AGG 0.347714 5.3:+73296787 None:intergenic
TCTGAGGATGATTCTTCAAT+TGG 0.371085 5.3:-73306043 MS.gene057086:intron
TACCTTGGTGTCATCAACTT+TGG 0.415811 5.3:+73296738 None:intergenic
CAATCCCCTCTTTCACTAAA+GGG 0.432478 5.3:-73288046 MS.gene057086:CDS
CAATCACAAGGGACTGAAAC+CGG 0.442863 5.3:-73306070 MS.gene057086:CDS
TCGCGAACAGCTTGCGCAGT+TGG 0.451182 5.3:-73303281 MS.gene057086:CDS
TAAAGGGAAAGGAAGTCATT+TGG 0.451358 5.3:-73288030 MS.gene057086:CDS
TCCTTTCCCTTTAGTGAAAG+AGG 0.457432 5.3:+73288040 None:intergenic
TTGCGCAGTTGGTTGGAGAA+AGG 0.457947 5.3:-73303270 MS.gene057086:CDS
TGCGCAGTTGGTTGGAGAAA+GGG 0.462113 5.3:-73303269 MS.gene057086:CDS
CGTGTGAGAAAGGAAGGGCT+TGG 0.464216 5.3:+73306151 None:intergenic
CCTTTCCCTTTAGTGAAAGA+GGG 0.480787 5.3:+73288041 None:intergenic
AGAAGTGGTGGTTAGATTGA+TGG 0.485237 5.3:+73306183 None:intergenic
GATGATTTCAGCCTTCCCTT+AGG 0.492206 5.3:-73303244 MS.gene057086:CDS
ACAATCCCCTCTTTCACTAA+AGG 0.494140 5.3:-73288047 MS.gene057086:CDS
CCCTCTTTCACTAAAGGGAA+AGG 0.524176 5.3:-73288041 MS.gene057086:CDS
GGTTAGATTGATGGTGGCCA+TGG 0.534595 5.3:+73306192 None:intergenic
GAACAGCTTGCGCAGTTGGT+TGG 0.536982 5.3:-73303277 MS.gene057086:CDS
CTTTCCCTTTAGTGAAAGAG+GGG 0.567645 5.3:+73288042 None:intergenic
GCTTGGATGAAGAGAAGAAG+TGG 0.571593 5.3:+73306168 None:intergenic
AGATTTGAAAGAAGAATCCA+AGG 0.573153 5.3:-73296767 MS.gene057086:CDS
AGAATCATCCTCAGAAACTC+CGG 0.580828 5.3:+73306051 None:intergenic
GACTGAAACCGGAGTTTCTG+AGG 0.581814 5.3:-73306059 MS.gene057086:CDS
TCTACAAGCTCATCAGTCAC+TGG 0.588562 5.3:-73304254 MS.gene057086:intron
AAGGGAAAGGAAGTCATTTG+GGG 0.589853 5.3:-73288028 MS.gene057086:CDS
AAAACATGTGCTCAATCACA+AGG 0.605787 5.3:-73306082 MS.gene057086:CDS
CTTCTAGGTTATGAAAGTGA+TGG 0.609052 5.3:-73303325 MS.gene057086:intron
GCTATGAATCTATGATGATG+TGG 0.624058 5.3:+73287985 None:intergenic
AAGCATGGTTGAATTTGATG+AGG 0.629627 5.3:+73306116 None:intergenic
TGGATGAAGAGAAGAAGTGG+TGG 0.661347 5.3:+73306171 None:intergenic
AGCCAAAGTTGATGACACCA+AGG 0.680038 5.3:-73296740 MS.gene057086:intron
AAACATGTGCTCAATCACAA+GGG 0.709012 5.3:-73306081 MS.gene057086:CDS
AGGGAAAGGAAGTCATTTGG+GGG 0.716353 5.3:-73288027 MS.gene057086:CDS
AGTGGTGGTTAGATTGATGG+TGG 0.725189 5.3:+73306186 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content


Chromosome Type Strat End Strand Name
chr5.3 gene 73287986 73306212 73287986 ID=MS.gene057086
chr5.3 mRNA 73287986 73306212 73287986 ID=MS.gene057086.t1;Parent=MS.gene057086
chr5.3 exon 73306044 73306212 73306044 ID=MS.gene057086.t1.exon1;Parent=MS.gene057086.t1
chr5.3 CDS 73306044 73306212 73306044 ID=cds.MS.gene057086.t1;Parent=MS.gene057086.t1
chr5.3 exon 73304255 73304326 73304255 ID=MS.gene057086.t1.exon2;Parent=MS.gene057086.t1
chr5.3 CDS 73304255 73304326 73304255 ID=cds.MS.gene057086.t1;Parent=MS.gene057086.t1
chr5.3 exon 73303228 73303340 73303228 ID=MS.gene057086.t1.exon3;Parent=MS.gene057086.t1
chr5.3 CDS 73303228 73303340 73303228 ID=cds.MS.gene057086.t1;Parent=MS.gene057086.t1
chr5.3 exon 73296741 73296818 73296741 ID=MS.gene057086.t1.exon4;Parent=MS.gene057086.t1
chr5.3 CDS 73296741 73296818 73296741 ID=cds.MS.gene057086.t1;Parent=MS.gene057086.t1
chr5.3 exon 73287986 73288102 73287986 ID=MS.gene057086.t1.exon5;Parent=MS.gene057086.t1
chr5.3 CDS 73287986 73288102 73287986 ID=cds.MS.gene057086.t1;Parent=MS.gene057086.t1
Gene Sequence

>MS.gene057086

ATGGCCACCATCAATCTAACCACCACTTCTTCTCTTCATCCAAGCCCTTCCTTTCTCACACGAAAACATAACAACCTCATCAAATTCAACCATGCTTCTTCTTTAAGCAAAACATGTGCTCAATCACAAGGGACTGAAACCGGAGTTTCTGAGGATGATTCTTCAATTGGTATGTATACCAACAGTTCCTATCCCACTTTTTTTATTAAATTGAATTCAAACATTAGTATGGCCCAAGCATGAATTCCATACAAACTATTGAATCACAGAATAAAATATAATTGTTCTTTCTTAGATTGTGTCAGTTGTATGTTAATAATATTTTATTTCATTGTTCTATTCTATAACTTGACACCTGGCTCATTTCTCTCCACAAGGGGAGAAATATATCTTCTCTCCAAAAAAGGAGAAAAATATATCATAGCTTTTTTAAATTAAATTTGAATAATTTCCAGTAAATTTATGGGAAATTTATAATTTGTGGGCTAATTGTATGTCTGGTTTCATTGTTTGGGAGTTAAAATTGATGGTAGGGATTTTAAATTATTTTCGAGTAAAATTAATTATTTTAACATTGATTCTAGCTTTAAAGTTAAAAATTCTAGTTTTTTATTTTAAAATTGATTTTAAGTTAAATTTATTGTTTAAGTTACCTTTATATTAATATATTTAAATCTCTCAAAAAAAATTAATATATTTAAATATAAGTCACTTTACTTTAGATTCACATTGAAAGGATTATATAATACAGTTTCGGTTGTCAATTATAAGCAAATTTTGGCTTTTTAGGTACATTTAATTAATGATGTATACGACCGTATACATCATTAATTAAATGAATCTAAAAAATCAAAATTTGCTTATAATGGACAACGGAGTAAGGATTTAAATATATTTCCATTCCTTTCATTTTTACCAATTTTTGTTTTTAGTTTGGTTATTTTCCTTTTGCTTTTAGTCATAGTAATAGTAAATATACTAGTTTTCTCTTTGGTCCTGGCTGTTTCTTTAGTCACTCAAAATTTATTTAATATCGAAATCGGTCCATCTAATATTTATTTTAGTCCTTATCTAGCTTATATTAAAGGACTAAAATTAATACAGTAGAAACTCTTTAATTTAATACTCGGTAAATTAATAAACTCTCTAAAATAATAAATTTGTCTGGTCCCGACTTGGGCCAATGTAAAAAATTGAAAAACTCGATAAAATAATAAGATAATAATTTTTCGGGAGATCCCTTTATAATTTTCGGTCCCAAGAAAATCATAAATTAATAATTCATAGAAACTGAAAAAAAATATATTAAGAATACATTGAACACATTTGTTCCTCTTGTTTACATTTACTGTACTTCAAAAGTCATTATTGAGTCCTAAAGTTCGCTGCAACGTAATTCTAAGAGGCATAGGCTAATTTGTCTTTTTGTTTGGTATGTACAATATAATTACTTAAAAACTCTTTAAATTAATAATTATTAATTTATTGATAAATTAATAACTCTCTAAATTAATAAATTTCTCCGGTCCTGACATTATTAATTTATAGAGTTTTAACTGTAGTTAAGATTTACAAAAGCAAAAAATAATATATTTATAGTGTCTAGAATGTATTTAAACCAAATAATAAGAATAATGTTGGCAACACACCTTTAATGCATTCTATTTGATTGGTTAAAAGTCGAAGAAAATAAAACGGAGGATTGAGTACATCAAAATCAGCGTCAGTATCTATTCATCATGTTTCAAAGTTTCTTTTATTGTTTTATCAGACTAGTAAAAAAATATTACTACTACGAAATATTTCAGAATATGTTGATATGAGGTTCTAGTTCATGTCACTATAGGAGAAATGACTGAATTGTTTTTGATGACTTTTATTGTTAGGATCTTTATCTTCTTCTCGTGCACAACTGGATCTTTTGGAGCAATTTACATCTACAAGCTCATCAGTCACTGGTATGCAAGTTCACTTCTCTTTAAATCAAAATCAATGAATATGTTTAGTACAGAAAAACCAATTGTTCAATGCTTTTGCAAATCTCTAAAGGAAAAAATTTCATAACAAACGTAGTATCTTTGAAATCATGTGGTGCGAAGTGGTTGTGTTGCTGTGCCATATCATTGAAAATTCAAGTGATATAAGAAAGAAACTTTTATGTATTATCTGTCCAAAAATAATTTTTTTGAAAGGATCTGTCCAAAAATAATGTCTATGAAAAGAAATGTAGACACATTTTTCATATCGAGTAATCAATTTCCTATTTCTCCCATACCCTGATCTCTAAACTGTACCGCGCGGGCTATCAGACCTGCACCCCAGTTGCCCTCCAGAACAAACAGTTGAACCTAACACACATTTGGGCCTTGCCCCTCTTTTGTGCCTACGAACCATACTCAACATGGTATGATACTATACACTAGAGAGAATGAATTTTCTGGTGTCAAAACTTTACATTACCTTCACATGGAACTTTTATGTGTTATATGTCCAAAATTAATGTCTATGAAGAGAAATATAGACACATTGTTCATATCAAATGATCAATTTCCTATTTCTCCCATACCCTGATCTCTATGTTAATGTGTCACTACTGATATGGATTTGGATTCCGTCCAATGGGAAAAGTATGCGGTTATACACAGTTTTCAATCTCGGCTCTTAATTTGATATCGCGTGGTTGAGATAAAATATTGTGTGACACAGTTTCTACTCTAAATCAAATCCCTACTGATATGCATGTATGTCTCAAAGATTCATCTGAAAGGGAAATTTTTTTTATAGCAATGTCTCCGTAACCTATTTCTTAGATTTGGTTTAACTTCTTTCTTTGATTTTGGATAACAACTATGAGAGCATTTCTGGCTTCTAGGTTATGAAAGTGATGGCAGCTCTCAGAGACTTACAATTCGCGAACAGCTTGCGCAGTTGGTTGGAGAAAGGGATGATGATTTCAGCCTTCCCTTAGGTAAAAACTTGAAGAAAGTGAGTGCAAAGTTCTTAACAACATCACAAAGGAGAAATATCAAGAGACAGAGTTATCTAAATGAAGTGTCTCAAAGGAATGATTCAACTTTTTTCGCAACTATAGGAGCATTTGTACTTCTTCCACCTCTTATAATATTAGGAATAGCTATATTAACTGGTTATGTACAGCTTTTACCTTGAGTCATAATATATTTACTGATACTTAAATAGAAGTCTTTGCATATCACTTAATTACCCCATTTACTACCAAGGCCTGTCTATTATTTTTTTTCTTGACATATTCCTTTTTGCATTTAGTTTAGTGCTTTAGTCAACAGGTGATCAAATTCCTCGAAGGAAGCACTTTTTCTTCCATCACCACATAACTTACTCTTCAGCCAAAATAATATTAAAGGGGGGTGTTGAAAAATTGCATTTCTAGTATGGCATGACTAGGTAGAAGAGAAAAGAAAGATTTATCTCCTTTTGGTATAAAATTTAAGGGAGATGAGACATAAAGCTATGTAGATGGAAACTACTGATTGTGAAGGAAGATTAGGCACATACATATTCTGTTACAGTAATCCATCATACATTTATCCACTAATCCTTTTAAAAAAAGTCAATATTAAAGTCCAACTTATCTAAGCACAAACTAATAAATAAGACCTTAGCTTAGCGAATCTCTAATAAACTGCTCCTAGCATCCTTTATGAGAGAGTCATCTGTGAAAACATAAAAAATTCGACACATAAAAGGGGTCAGTCCATATACATGTATGTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATAATAGAAGAAAAAGATGAAATAGAATCAATTAAAGCATAGCACAATACAATTCAAGCACATATCTCAATTTTTTTTTTTTGAGTAAGCAAAATATTGAAGCTGATATGAACAAATTTGAGGAAACCAGAACGAACATACTCCCAGATAAAATGACAACCAATATTGATATGTTTGGAATGTTTTTGGCAAAATATCATGCTTGAATCAACAATAACTCAGATGCGAGGCTAGCAACAATTGCTTGCTTATTTGATTTCCAAGCTATCAATGAGTCACCAAGGAATATTCAGTAACCGGTTGTGGATTTTATAGAAACTTGGCAGCTTCCCCAATCCGCGCTCACATAGGCAGTAACTTTGAGACTGGAAACCATTACAGTCCCAACTGCCTTATCATACATACGCAACAAGCCACCATAGATAACAATAGAGCAAATTAAAGGTAGTTTCAACATTATGCACGAGTAGAACCACATTGCTAAGAGATAAGCTATGAGTTTGATTGACTAAAATGCCATTTCCTGTCACTAAAAACACCTCAGACCCCCACTTATCAAACTCGACCATGACATGAAATAATTCCTCATTCTATGCGATCCACGCCGATCTTTCAATTTTTCTCCAGGACGCCACAACACTCCAGAAAACTATCAGTATTGAAGACTCAACCACGTTGCAAATAAAACTAAGCCCACACACCAGCAATCTACAGTTATGCAGAGAAATTGAGCAGAAAAAACAAAACGAACCATACTCATAAAAGGAAAAGCTAGCCACTTCAAATTCCCGTGAATTGCATTCATCAAAGTCAGAAAACTATTGGCTCAAAGTCACACCCTCCATAAAGAGAAATAATCCAATAGTCAAATGTTGTGCCAATAGTATCAGCACCCTGCTGAAAAAGACACCAATGTGTTGCGCCAGAATACAAGACCTCTAAATATCATAGTTGAATCAACCATCTATAAACGATAGTCTCATTACACTCCACATAGATAACACTGAGACACAATCCAATTTTTTGTATATCCCTTGTTGCTAATTTCACAAATCTGAAATCAACACATGCTGCAATGCTTTAGATAGCCACACCATCAGTCAGACCCTTCCAATTCAAATTTTACACAACACCTTCCAGCTCGTAACAACTTGACACTTTGATAATATTACCGCATACCTTTCAATATGTGATGCAATGAAAACAAGTCCTTCCCATGTTCCAATACTGATTCATCACGCCTACTATCAACACCGAAACTCAACTTGAGCTACCACTCAGTCTCTGATAAGTGTTTAAAAGTGATATATTTCGCATAGGAGTTTAGGCGTTTTAGTGACTTGTTTTGCAAGATTCTCTATGGAAAACTCCAAATATTGTGTTAATATGTCATTTATGCTTTTGAGCCTTAGTCTACCCTTTTTGTGCAGGAAATTACAAGCAAGGAGCAAGAAATGTCAAAGTTCAAAGAAGCTACGCCATTAGCGTGTCCTACGCTATTGGCGTGATGAAGAAATGCCAAAGGTCAGAGGGATACGCCATTAGCGCACCTGGGGCGTGGATCTGGAGCACTCTTGAAGAGTACGCTAATAGCGTATTATGAGCTATTAGCGTACAATGTCCAGAGAGCTACGCTATATGCGTACCTGGAGCGTGGAAGCAGAAGCTGGGTTTGAAGAGCTACGCTATTAGCGTATTTCACGCTATTAGCGTAAATGCTCCAGAGAGCCACGCTATTAGCGTGGCTGGAGCGTAGCAGCAGGGCAAGAACATCGTGGCAGGCTCCCATTGGCCAAATTATAGGCTGCCTTACCACGCTTTTAGCGTGAGTTGCGCTATTAGCGCAGGTGCAAAAACACAGGCCATTTAAATAGCATTTTTACCTCTCTTTTAGGTATTCACTATTCCATTGAAACATTATATACATTTCTAGAGAGAGGTTAGAGCTATTTCATAAGAGAGAAACACAAAGCAAGTGATTAAGGAGTAGATTCAACCCTAGATTCATTGAGACATCAAGGATCTTGGCATGGAATCTTCATCTTTCCTTCCTTCCTTGCATTAGTTTACATGTCTATATGTAACTATCACCTTCTTTGTAGTATTGAGGTAACAATCAAGCTATTATGTAATCTTTTGATCTTTTAATATATAAGGTTCTAGCTTAATGATTCAATATTGTTGTTATTCTTGCTTTTAATGCTTTCAAAGAGATTCAAGATGATTTGGACACAAACTCTTGAATCTAGAACTAGAATAACAATCTATCTTATGTTATATCACTCTTGACAAGTTTGTAAACCTTTGATAATTACTTTTAATCAAGATTTTAATGCTTTCGGATACTTAATCAGGCTGGACACGGTCGATTAAGTTATCCGATCGACTTTGTTATCGTTTAAGGAATTTGGACACGAATGTTTAAACGCTAACTTGGAAATAACGATGTCGCTTTGGACACGAAGGATATTGTAGAAATGATTGTAATAATATTGGTTATAAAGCTAGAGTCTGTTAATCGATCGAGAGATTGCTGCTGTTATGCTTGCTCGTTATCTTATACCGCAAGCGAAATAGTTCGATCCCCTCTCGTTTTTACTTTAGTGTAATTTATGGATATAGTGTTACAAACAAACAAATTATATCCAAACCCTTAATATGAACGATTGTGTAAATGCTTATGATTAACGTAACTCCCTGTGGAAACGATCCTATATATACTCACGTGTACATAGTTGTATGACATGTAGGAAAAATCTTACATCAAAATGGCGCCGTTGCCGGGGAGTAACGGAAATTTTTATCATAAGTATTGAAACAATTTTGTCATGTTAAGTCAATTTTTGCACAAAATTCTTTCATGCATATACTTATACACTTATGTCATTCATTATTTTTTTTATGCTAACCACCTGGTATAGTCTTGGTGAACTTTGTTTATGCGAGGTACCGTTGATAAAGAAGACCTACAATTTGATCCTGAAATTGAGAAAACTGCTAGGTTACTTAGAAAGCAAGCAAAGGAAGCTAGGAGATTAGCCAGGCTGGCTCAGCCGGAATCTTTACTTTTTATTCCTTCTCCGTCAGGTTCGGTGCATACTATATCACTAGGTGATTCTTCATCACATTCTTCTGCACATTCATCTCCGAGGAGTGATCCAGAAGTAGTCATGGCTAATGAAGATGAGAATGCTCTACCTATGTGGGTTAGTCCGAGGAGGCTAGCTAATCTTGGCAACCGTAATGCCAAATCTTTTGAGCTGAAGTCTGGGTTGATAAACTTGATAACTCATAACCAGTTTACCGGTATGGATCATGAGGATCCATATAGACATCTTACCAACTTCTATGTTACCGCCGGTACACTTGGTATGAAGGAAGATGAGGAAGAGGGTGTGTTTGTGCAATTGTTTCCTCATTCTTTGATCGGGAAGGCTAAGGAGTGGTATCTTGATCAACCAACTTCTTTGATGGAAAATTGGGGTGAGCTAGAGAAAGCATTTCAAGAAAGGTTCTTTCTGGAGGATAGGCATCTTGAGGCTAAAACTTCAATTACAACTTTTGCTCAAGGCCAAAGTGAGACTCTTTGTGAAGCTTGGGAGCGCTATAAATCATTGCTAAGGAATTGTCCAAAGCATGGTTTTGATAGCCAAATGCAACTATATCTTTTTCGTCAAGGGCTACAAGACATGTCCAAGACGATGCTAGATGCAAGTGCTGGAGGTTCTATTGCTTTGAAAAACCCAGCTGAAGCTGTCAAAATCATTAATCAAATGGCTCTCAACACAAGAAAATCCTCTCACAACCGGAATCCTAATCAAAGGAAAGTCGGTATTCTGGAACTAGAAGCAAATGATGCGGTCTTAGCTCAAAATAAGCTTCTCACTCAACAATTAGAAGCTATGCAAAAGGAGATGAAAGCTATGCCTAAACAAATTCTTGAATCTCTCAAGCAAGAAGGAGGAACCGCTCAAGTCTATACTTGTGGACTTTGTACGGGGGATCATCCCACCGGCTATTGTCCCGAGCCCGGTTCTTTTGAAGGGGAAGAGGTCAACTATGTGGGAAACCAACAAAGGCCTAACCAATCACAACAAGCCGGAACCTCACAACAAAATCCGGGTACTTCCAATTTCCAAGGAAGGTATCCGGCCAACCAAAACCAACAAAGACCTTGGAGAACACCGTACAACAATAACTATCAATATCCACCATCAAACTACTACCAACAACCTTACCAACAACCATTCAATAATCAATACCAAAATCCACCACCAAATAACCCCCAACAACCGAATAATTCCCAAAGCACAGAGGAGGTCTTGAAACAATTCATGCAAGTGTCCATGGCTAACCAGAAAAACACCGACGCGTCCATCAAAGGCCTTGAAACGCAAGTTGGTCAGTTAGCTCAACAAATGGCTCAAGGTCCTCCGCAAGGTGGAGCTTTCACCGCTAACACTCAACCAAATCCTAAGGAGCACAACAAGGCATAGCAGTCAAAAGCTATAGCTACAAGGAGTGGGAGAGTAGTAGGTATAGGGGTAGGTGATGATATTGTTGTTGAAGAAAAGGATGATGAAGTTGTCAATGAGGAGGACAAAGAGGAGTTCGAGGAGGATAGTGTAGAGATAGAGGAGGAAGTGTATATAAAAAATAAAGAAGCATTAGTTGAAAAAGAAAAAAATCAAAAAAGAGATCTTGAGGTACAAGTGGAGATGGAGAGGAAGAATAAAGATGTGGGGGAAGATAAAGGGAAGAAACAAGTAGTTGAGAAGCAAGAGGTGGCTCAACGCTTACCATACCCACATGCTCCATCGAAGAAAGACAAAGAGCGGCAGTACGCAAGGTTTCTTGAACTCTTCAAGAAGTTGCAAATTGATATACCATTCTCGGAAGCCTTGGAGCAAATGCCGGTCTATGCAAAGTTCATGAAAGATATCCTTTCCAAGAAAAGAAGAATCAACGATGAAGAGACGATCCAAATCGATGCCAATTGTAGTGCTATTATTCAAAGAACAATGCCAAAGAAAGAGCAAGATCCGGGAAGAGTCACTCTACCGGTAGCTATTGGCACAACACATGTAGGTAAAGCACTACTTGATCTTGGATCAAGCATCAATCTCATGCCTTTGTCCGTTGCCAAAAGAGTTGGTGACCTTTGTATAAAGCGGACTAGGATGATGTTGCAATTGGCCGACAAATCCTTTGCAAAACCACTAGGTATGGCCGAAGATGTTCTTGTAAAAGTGGACAAATTTATTTTTCCGGCTGATTTTGTGGTTATGGATGTCGAAGAAGATGAGGATGTGCCTATCTTAATGGGAAGGAATTTCATGCAAACGGCTAGGATGATGATTGATCTTGATGATAATATCATGAAGGTCAAGGTAAATGATGAAGAGGTTACCTTCAACATCCGAGAAGCTTTGAAGTACTCGAAAGACAAGGGTGCATGTTTCAAAATGGATGCAACCGAAGAAGTCATCTTGACTACTCGGAAGCAAATGCACAATAGAACACCCCTTGAGAGTGCTTTGGTGGACGCACTCAATGCTATTGATGAAGACGAAGCAAGTGCCATTGAAGAGTGTTTAAAGGAGCTAGATTCCTTGAAGGAGGTTCTTCCTAATCAAGCCATACTTGAAGATTTGAAAGAAGAATCCAAGGAAGAAGCCAAAGTTGATGACACCAAGGTAGAATTAAAAGTTTTACCATCTAATTTGAAATATGTTTTTCTTGAGAAAGATGGTACAAAACCGGTGATCATTAGTAGCTCCTTGTCCATCGATGAAGAAACAAAGTTGGTAGAGGTTCTCAAGGCCAACAAGGAAGCGATAGGGTGGAAGTTATCCGACTTGAAAGGGATAAGTCCATCTTATTGTATGCATAAGATCATGATGGAAGAAAATTTTAAACCGGTAGCACAACCGCAACGCCGCTTGAATCCAAACATGAAAGAGGTGGTGCGAAAGGAAGTAGTAAAGTTACTTGAAGCCGGCATGATCTATCCTATCTCGGATAGTGCTTGGGTAAGCCCGGTTCAAGTAGTGCCCAAGAAAGGAGGAATGACGGTGATCACTAATGATAAAAATGAGTTGATCCCAACTAGAACCGTCACCGGATGGAGGATGTGTATAGATTATAGAAGACTCAATCAAGCAACAAGGAAGGATCACTTTCCCTTGCCCTTCATGGACCAAATGCTTGAAAGACTCTCCGGTCAATCCTTTTATTGCTTCCTAGATGGTTACTCCGGTTACAATCAAATCGCCATGAACCCAGATGATCACGAGAAGACAGCTTTCACTTGCCCCTTTGGTATTTTTGCTTATCGAAGAATGCCATTTGGCTTGTGTAATGCACCCGCAACTTTTCAACGGTGTGTTCAAGCAATCTTCTCCAAACTTATTGGTAAATGCATGGAGGTGTTCATGGATGATTTCTCAGTTTTCGGTTCGTCATTTGATACGTGTTTGAATAGCTTGGATACCGTGCTGAAGCGGTGTATTGAAACTAGCTTGGTGCTCAATTGGGAGAAATGTCACTTCATGGTTACCGAGGGTATTGTCCTTGGTCATAAGATTTCTTCAAGGGGTATCGAGGTAGACCAAGCAAAGGTCGATGTCATAGGAAAGCTTCCTCCACCGGTAAATGTCAAAGGTGTGCGGAGTTTTCTTGGTCATGTCGGTTTCTACCGGAGGTTCATCAAAGACTTCTCAAAGATTGCAAAGCCTATGAGCAACTTGCTCAACAAAGATAAGTCTTTTGTTTTTGATAATGAATGTCTTGATGCATTTGAATCTTTAAAAGAAAAGTTGACCACCGCACCAATAATCATTGCTCCTAATTGGGATTTAAATTTTGAATTAATGTGTGATGCAAGTGATTATGCTGTTGGTGCAGTCTTGGGTCAACGTAAGGACAAAATTTTTTATGCTATTCACTATGCAAGTAAGGTTCTAAATGAGGCACAAATCAATTATGCCACAACTGAAAAAGAGTTACTTGCAATAGTATATGCAATGGAGAAATTTCGTTCTTACTTTGTAGGTTCCAAAATTGTTGTTTATACTGACCATGCAGCTATCAAGTATCTCCTTACTAAGTCCGACTCAAAGCCTAGACTCATCCGGTGGATGTTGTTGCTTCAAGAGTTTGACTTAGAGATTAAGGATAAGAAAGGCACGGAGAATCTTGTAGCTGATCACCTTTCAAGGTTGACAAACAATGAGGTAACCAAGAATGAACCGGAGGTTCGTGAAGAATTTCCAGATGAACGGTTGCTAGCTATCAATGTGAGACCGTGGTTTGCCGACTTGGTGAACTACAAAGCAACCGGGTTCATTCCGGAAGATTTTGAATGGCAACAACGCAAGAAGTTCCTCCATGATGCTAACCACTTTGTGTGGGATGAGCCTTATTTGTTCAAAATTGGAGCGGACAATCTCTTGCGTAGGTGTGTGGATGATGAAGAGGCAAAGAAGATCCTATGGCAATGTCATAATTCGCCCTATGGAGGTCACTTCAACGGGGAGAGAACAGCCGCAAAGGTACTTCAATCCGGGTTCTATTGGCCAACTTTATTCAAAGATGCCAATTTACATTGCAAGTATTGTGATGAATGCCAAAGAACCGGATCAATGTCAAAAAGAAATGAGATGCCTCTACAACTCATCCTTGAAGTGGAAGTGTTTGATTGTTGGGGTATAGATTTTGTTGGCCCTTTTCCTTCATCATATTCAAATGAGTACATCTTGGTCGCTGTTGATTATGTGTCAAAGTGGGTGGAAGCCGTAGCATCGCCTAAAGCCGATAGCAAGACGGTGGTGAAGTTCCTAAAAAAGAATATTTTCACCCGGTTTGGTACACCAAGAGTTCTCATTAGTGATGGAGGGTCACACTTTTGCAACACACAACTTGCCAAGGCCCTAGATCATTATGGAGTCAAGCACAAAGTAGCATCACCGTATCATCCGCAAACGAATGGACAAGCCGAAGTTTCTAACCGGGAGGTCAAACGCATACTTGAGAAGACGGTCTCTACATCTCGGAAGGATTGGTCGGCTAAACTTGATGAAGCTTTGTGGGCATATAGGACTGCATACAAGTCTCCTATAGGCCTCACTCCTTTCCAAATGGTTTATGGCAAATCTTGTCATTTACCGGTCGAGCTCGAACATAAAGCCTTTTGGGCATTGAAGTTCCTAAACTTCGATCAAGAGAAAGCCGGTGAAAGAAGAAAAGTTCAAATGCATGAGCTTGAAGAATTGAGAAATCAAGCTTATGAATCTTCAAAGCTCTACAAAGAAAGGACCAAGAAGTATCATGACAAGAAGATCACTCTGAGACAATTCATGCCGGGACAAATGGTATTACTTTTCAATTCAAGACTGAGGTTGTTTCCGGGCAAATTGAAGTCTAAGTGGTCCGGACCTTTCATGGTTAAAAAGGTCAAACCGTACGGAGCTGTGGAACTTGAGGACCCAGTCACCAAAGCCAACTGGACTGTTAATGGGCAAAGGCTTAAGCCCTACTTCGGTGGTGAAATTGATCGGTGTTTGACGACAATTTCACTAATCGAGCCATGATTTCTTCAAAATGCGTCAAGCTCAGGACGTAAAACAAGCTCTTGCTGGGAGGCACACCCAGTTTTGTAAGTATTTATATGTTTATTGCATATAGTGGTAGTACATATACATTTACAAGCAGAATGAAAAACTTTGAAAAACTGATCCTGAAGCCTCACGCCATTAGCGTATTTGTCGCTATTAGCGTGGGAGCTCCAGAGAGCTACGCTAATAGCGTGGTTTTGGCGTGAGGGAAAATTTTTTGTGGGCCCAAGGGGAGTAACTCCCCTTAACTTCCCACAACCCACTCCTCTTATTCCTTTTACGGTTTCATTCTTCCCTTTCTCACTCTCACACACAAAAACTTCTCTCACTCACACACTAACCCTAAAAATCAAAACCCTTTTCTTTTGGGTCAATTGGTTCCAAGCATTCATCTTTGCATCATTCATTCTATTGATTGCATCCAATCACTGCACTAACAGGTTTGATTCTCTTCCTATCTTTGTTCTTAAATTTGAAAAAAAAAACCATGCTTTTGACATGATTAGAGATGGTTAGGTTAGGGTTAGAGTTTTGATTTGTGAATAGAGATTGTTCTTTAATGATAATAGTTGGAAAAGGAACAATAATCATAACCCACATGCAACAAACATTCATCTTTTGATTTTGACCCATTTTGTAAATTTGAAAAACAAGGGTTTTGAATGATTTGTGTGTCAATGTTGTGATTCTGATTCCTTTTCATGATTTTATTGTGTTTTAGAGACATAGGATGAAACCTAGGGTTGAAATATGCTGGGTTGTGCTGAGAAATTGCAGGAACAAAGATTTTGAAAATTTGAAAATTGCAGGAACGAAGAAGTACGCTATTAGCGAAATATACGCTAATAGCGCAACTTTTCCAGAAAAATTTCGCTAATAGCGTATCCTACGCTAATAGCGAAAGTTTCCCAGAAAAATTTCGCTATGAGCGTGACTGGCGCTATTAGCGTAGTTCTTCATACTTGTCCAGATTTTCAAAAATTTTGATATTTTTAAATGACCAATTGTAGTTTGTGCTAATATTTTCTATGCAATATGTTGGTGTTTCCTGGTTTTGTTGCAGATGGCACCGAAAAATGTTGAAAAAACTACCGGGACTAAGCGTCCTAGAGGCAAAGGTGCCTCTTCCTCTGCTGCACCTGCAATCCCAAACCGTTTCCCCACCCCTGCCCACTCTGCCAGGTTTAAGAAGATGGCACAGTACAAAACCTGGCACGAGAAAACTTTTGACATTCATCCTAGTGGTGAGCATGCTGATATGCTCCACATTTTCACTGGTCGCAAATGGACCAAACTCCTTGTGCCCGCAACCGAGATTAACACTGACCTAATCAGGGAGTTCTATTGTAATGCTGTCCCTGATGCCTCACCCGCTACCTTTGCTGAGACTTTCTCTTGGACTTCTTATGTCCGAGGAAAGCAAATCCCATTTGATAGGGATGCAATCAATGATTTCCTTGATAATGCCTTAAACCTTGAGCCATCACCTGACCCCACAGTGCCCACCTTGTGTACCTATGGTAAGAGGAACGCTCAAGGAAATTGGAAATTTCAGCAAATTGAGCGTGATATTATGAACAAGGGCAGACTCTTTGTAAAGAATGACAAGGGAGAGATTAGGCATGCACTTACCAAGGAGATGACCGCTACTGCCCGTTTAGTTTTCCAATTCCTAGTCCACAATGCCCTGCCTAGAGCCCATACTTCCGATGCCCCAAAAGCCGTTCTACCACTCATCTGGTGCATTATGAAAGAAGTGCCTGTTGATATTGCTCGCATCATTGCTAATGAGATGAAGGCTGTGGCTTTGAAAGTAGCCACTGGTGCTAAGAAGGTGGCTTTGTTCTACCCGGGTTTGATTATGGGATTGCTGAAGGCCAATGGAGTGGCCATTACTGGACCCTATGATGAGGATATTGAGGGGGCCATTACTGACACTCATATTCGCACTTGGGAGAAAACAGAGCAGAGGGCAGCCCAATACCATTTCTCTGATGATGAAGGTGGCCCATCTGAGGCTGCTGGTTCTTTTGACTTTTCAGGTTTGCAGACCTTTATGCTGGAGCAGCAGATGCATAACCAGTACGTGAGGGACCAGAACAGCTTCTTAATGGACCAGAATGAGGCAATTTGGAGGAGCAACATGGGCATACACCAGGACCTCTACAATGCTCACATGCATCCGGGAAATGCTGAGTACCCGGTTATGACTCCTGAGCAGTACCAGGCTTATGTTCATTGGCCTGAGGGCAGGCCAAATCCTTATGTGGGGGTGGCTGATGCTGTTGATGATGAGGCGACACCTGATGATGCTGGAGTCGTGGGTGATGATGATGATGTGTACCAGGATCTTGATATGGATGATGCTGGAGAGGATGATCAGTGAACTTGAGTTTTTAGTGATGTTTTTCTTTTTGCTTTATAACTCTTCGTTTTTATTTCATGTTGGAACATATGTTTATTTTGGTTGTATTTTGTACTCTTCAAGCACTGTGGTTTTTAGTGCTTGATTTGTTACTTTGTTACTTTGTTACTTTATATTTGGTTTAATAACTTAGTTTTTTTTGGTTTAATAACTTATGCTTTGGATGAAATTTTTGTTTACATCTTGCTTGTGTCTCTCAAAAGAAAATTGCTCATGAACAATAAATTTTAAAGTGCTCCATGGAGCCATGTTTGAGCAAAAGCAGGTGAGTGATAATGATATTACTTGTGATAAAGCGTAAGGCCAAGGTATTGGTTTTCTTTTATTCTAGGTTTTTAATAAGAATTTGAAACTTGTACTTTGCACAAAATATATATCATTTAATTCTTTTCATAGACATAAATATTTTTGAACCACTTAGTACTTAACATAAATGTGAGGTAGCTTCAATCTGTTGTATATATGCTGGAGACCAATAATCACCGTCTAACTTGTTTTAGTTATGTTAAATCTGATAATTATTTTGAATTGTTTGAAAGCATGGAAAGGATCAAGGCACTTTTTGAATTGAGAGTAACCTACTTGACCACATAAAGCCTACCTGTGAGAAGAGCGAGTATCTGATACCCCAATCCGAGCCTAATGAATCAAGTCCTCAAACATGAACTGTCAATATTCATAAGCACAATGCTTGTTGAATTTGCCTGAAATTTTTCAAAAATCCAGTTCATGGTTGAATCTTATAGGACTTTGATATTTTTACTTTGTTGAACCCTTAACCTTTTTGTACTTTGTCCCTTGCCTTAGGATAGGGGAACATTCAATTAGAGTTTTTGTTGTATTCAAGTTGGGGAGAAAAAGGAGGCATTATATGTTAAGTTCTGGTGAAGTTGTAAAATAACCTGACAACATTGAATCAAAGAAAAAATTGTACATTTGAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGAAAGTGAAAAATCAAAAATAGAATAAGTTGTCAAGGTTATAAGTTTGATGGTTAATCACCAAAGGTTTTAATTCTTGGTAGGGAAGTATATGGATTTCAAGTTGTGATACAAAAAAATGTTCCTCTTTGATAGGCTTTCTGATCAATTGCCCCACATATGACATTTCTTTTGTAGCCCGGCCAAGTTATAACCCTTGCAAGACCTTTTGATCCATGCTTTTATGCTTTTTGAGACGATATTTGGATGGACACCTAACTTAAATAGGATGTTAGCATGATTGTTGGATGTGTGTTCATTACCTCATTCATTGTCATCATTATATTGCATTTACTTTCAAAGAAGTGTGTTAGGTGTGGTTCATAGATAAATATGTTTATGTCTTGAAGTTTATGATGTATAGTTTGTGCTTAGGACATTTGTCGCATTCTTAGTTTGAACCTAGAGTAGCGGAGGACTTCATGCTTGTCCACGCGATCATTTTTGAATCACCATTTGTTTATTTTTGTTTTGAATTGTTTGACACCATGTTGAAAACCTTGTCCAAAGCCTTGTTAGTTTCCTTTTCAATTGATTTGTTTGAGGACAAACAAATAGCCAAGTTGGGGAGAGTTTGATAAGTGTTTAAAAGTGATATATTTCGCATAGGAGTTTAGGCGTTTTAGTGACTTGTTTTGCAAGATTCTCTATGGAAAACTCCAAATATTGTGTTAATATGTCATTTATGCTTTTGAGCCTTAGTCTACCCTTTTTGTGCAGGAAATTACAAGCAAGGAGCAAGAAATGTCAAAGTTCAAAGAAGCTACGCCATTAGCGTGTCCTACGCTATTGGCGTGATGAAGAAATGCCAAAGGTCAGAGGGATACGCCATTAGCGCACCTGGGGCGTGGATCTGGAGCACTCTTGAAGAGTACGCTAATAGCGTATTATGAGCTATTAGCGTACAATGTCCAGAGAGCTACGCTATATGCGTACCTGGAGCGTGGAAGCAGAAGCTGGGTTTGAAGAGCTACGCTATTAGCGTATTTCACGCTATTAGCGTAAATGCTCCAGAGAGCCACGCTATTAGCGTGGCTGGAGCGTAGCAGCAGGGCAAGAACATCGTGGCAGGCTCCCATTGGCCAAATTATAGGCCGCCTTACCACGCTTTTAGCGTGAGTTGCGCTATTAGCGCAGGTGCAAAAACACAGACCATTTAAATAGCATTTTTACCTCTCTTTTAGGTATTCACTATTCCATTGAAACATTATATACATTTCTAGAGAGAGGTTAGAGCTATTTCATAAGAGAGAAACACAAAGCAAGTGATTAAGGAGTAGATTCAACCCTAGATTCATTGAGACATCAAGGATCTTGGCATGGAATCTTCATCTTTCCTTCCTTCCTTGCATTAGTTTACATGTCTATATGTAACTATCACCTTCTTTGTAGTATTGAGGTAACAATCAAGCTATTATGTAATCTTTTGATCTTTTAATATATAAGGTTCTAGCTTAATGATTCAATATTGTTGTTATTCTTGCTTTTAATGCTTTCAAAGAGATTCAAGATGATTTGGACACAAACTCTTGAATCTAGAACTAGAATAACAATCTATCTTATGTTATATCACTCTTGACAAGTTTGTAAACCTTTGATAATTACTTTTAATCAAGATTTTAATGCTTTCGGATACTTAATCAGGTTGGACACGGTCGATTAAGTTATCCGATCGACTTTGTTATCGTTTAAGGAATTTGGACACGAATGTTTAAACACTAACTTGGAAATAACGATGTCGCTTTGGACACGAAGGATATTGTAGAAATGATTGTAATAATATTGGTTATAAAGCTAGAGTCTGTTAATCGATCGAGAGATTGCTGCTGTTATGCTTGCTCGTTATCTTATACCGCAAGCGAAATAGTTCGATCCCCTCTCGTTTTTACTTTAGTGTAATTTATGGATATAGTGTTACAAACAAACAAATTATATCCAAACCCTTAATATGAACGATTGTGTAAATGCTTATGATTAACGTAACTCCCTGTGGAAACGATCCTATATATACTCACGTGTACATAGTTATATGACATGTAGGAAAAATCTTACATCAGTCTCCTAGCCACATATGCAGAATACATTACCTAGAACATTAACAGCAACTGCCTCAAAAATTAGATCGCCAAACTAGCATAATACCGAGAAATGAGAATTGGCACAAGAAAGAGACTACTTATGATGATAATAGATCCTCTTTAGAACTGCTGATTGACAAGCCAACTGATGATAGTGGCCTTCGCATATTTGGTTACTTATGTTATATATGCTTCCACTATTCCATCCCAAAGGAACAAGTTCTGGTTTCTCTGCATGTTCAGCAGACAATCCCCTCTTTCACTAAAGGGAAAGGAAGTCATTTGGGGGTTTTTCAAGTCTATGTTGACCACATCATCATAGATTCATAG

Protein sequence

>MS.gene057086.t1

MATINLTTTSSLHPSPSFLTRKHNNLIKFNHASSLSKTCAQSQGTETGVSEDDSSIGSLSSSRAQLDLLEQFTSTSSSVTGYESDGSSQRLTIREQLAQLVGERDDDFSLPLGKNLKKEVLPNQAILEDLKEESKEEAKVDDTKEQVLVSLHVQQTIPSFTKGKGSHLGVFQVYVDHIIIDS