AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280007706.01


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MsG0280007706.01.T01 AT1G07570 43.648 307 159 4 484 777 54 359 3.33e-77 256
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MsG0280007706.01.T01 AT4G29180 42.384 302 159 2 484 772 553 852 1.49e-68 244
MsG0280007706.01.T01 AT1G49730 44.194 310 153 9 479 778 340 639 1.69e-68 241
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MsG0280007706.01.T01 AT2G02800 41.830 306 166 3 475 769 60 364 4.71e-68 232
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MsG0280007706.01.T01 AT1G56720 41.237 291 168 2 481 769 162 451 2.31e-65 227
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MsG0280007706.01.T01 AT1G07570 45.041 242 129 3 539 777 3 243 1.37e-64 218
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MsG0280007706.01.T01 AT1G09440 39.796 294 168 3 481 769 140 429 1.38e-64 224
MsG0280007706.01.T01 AT5G38210 35.142 424 254 9 360 771 231 645 1.55e-64 229
MsG0280007706.01.T01 AT5G38210 35.142 424 254 9 360 771 213 627 1.69e-64 229
MsG0280007706.01.T01 AT3G09010 38.125 320 184 4 486 803 34 341 1.91e-64 221
MsG0280007706.01.T01 AT5G49770 45.791 297 149 4 484 774 620 910 3.61e-64 233
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MsG0280007706.01.T01 AT1G24030 40.138 289 166 5 491 772 1 289 3.69e-64 218
MsG0280007706.01.T01 AT3G14840 42.657 286 161 2 486 769 660 944 3.87e-64 233
MsG0280007706.01.T01 AT5G38210 36.829 391 226 9 393 771 252 633 4.52e-64 228
MsG0280007706.01.T01 AT3G53840 40.777 309 169 4 476 773 332 637 6.12e-64 227
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MsG0280007706.01.T01 AT2G23450 42.123 292 159 4 486 771 336 623 1.08e-59 216
MsG0280007706.01.T01 AT2G23450 42.123 292 159 4 486 771 336 623 1.08e-59 216
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MsG0280007706.01.T01 AT4G11460 39.041 292 167 5 485 768 333 621 1.28e-54 201
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MsG0280007706.01.T01 AT4G23270 38.591 298 177 4 475 768 303 598 1.61e-54 200
MsG0280007706.01.T01 AT4G23270 38.591 298 177 4 475 768 303 598 1.61e-54 200
MsG0280007706.01.T01 AT5G24080 39.510 286 168 3 486 769 393 675 1.72e-54 202
MsG0280007706.01.T01 AT5G24080 39.510 286 168 3 486 769 393 675 1.72e-54 202
MsG0280007706.01.T01 AT1G70530 36.426 291 181 3 486 775 311 598 2.06e-54 200
MsG0280007706.01.T01 AT5G16000 33.495 412 229 11 364 769 212 584 2.12e-54 200
MsG0280007706.01.T01 AT1G78530 34.349 361 209 5 413 771 13 347 2.41e-54 192
MsG0280007706.01.T01 AT5G42440 36.897 290 172 7 486 769 69 353 2.57e-54 192
MsG0280007706.01.T01 AT1G52540 35.398 339 196 6 477 801 16 345 2.60e-54 192
MsG0280007706.01.T01 AT1G70740 38.947 285 166 5 484 764 48 328 2.72e-54 194
MsG0280007706.01.T01 AT4G32710 39.655 290 169 2 486 769 377 666 3.18e-54 201
MsG0280007706.01.T01 AT3G45430 35.762 302 177 4 471 768 324 612 3.51e-54 200
MsG0280007706.01.T01 AT3G45430 35.762 302 177 4 471 768 324 612 3.51e-54 200
MsG0280007706.01.T01 AT3G45430 35.762 302 177 4 471 768 324 612 3.51e-54 200
MsG0280007706.01.T01 AT1G52540 35.398 339 196 6 477 801 19 348 3.84e-54 191
MsG0280007706.01.T01 AT1G55610 38.889 288 169 4 484 765 845 1131 4.51e-54 204
MsG0280007706.01.T01 AT1G55610 38.889 288 169 4 484 765 845 1131 4.51e-54 204
MsG0280007706.01.T01 AT4G23240 38.567 293 176 4 479 768 9 300 4.51e-54 191
MsG0280007706.01.T01 AT1G21240 41.667 264 152 2 507 769 163 425 4.71e-54 195
MsG0280007706.01.T01 AT1G70130 36.393 305 192 2 485 788 321 624 4.90e-54 199
MsG0280007706.01.T01 AT1G31420 40.370 270 153 3 503 769 311 575 5.85e-54 197
MsG0280007706.01.T01 AT1G31420 40.370 270 153 3 503 769 311 575 5.85e-54 197
MsG0280007706.01.T01 AT5G24080 39.510 286 168 3 486 769 520 802 6.57e-54 202
MsG0280007706.01.T01 AT5G53890 39.236 288 172 2 484 769 740 1026 1.04e-53 202
MsG0280007706.01.T01 AT4G32300 37.667 300 176 6 480 774 477 770 1.08e-53 201
MsG0280007706.01.T01 AT4G04490 40.850 306 164 6 482 786 324 613 1.11e-53 198
MsG0280007706.01.T01 AT3G15890 36.452 310 190 3 458 765 4 308 1.14e-53 191
MsG0280007706.01.T01 AT2G23950 43.852 244 132 4 481 722 282 522 1.15e-53 195
MsG0280007706.01.T01 AT5G48380 34.390 410 222 13 386 771 203 589 1.24e-53 197
MsG0280007706.01.T01 AT5G35370 36.050 319 182 4 475 774 494 809 1.32e-53 201
MsG0280007706.01.T01 AT1G11050 38.393 336 185 7 486 800 283 617 2.20e-53 196
MsG0280007706.01.T01 AT1G29730 44.398 241 128 4 477 713 650 888 2.22e-53 201
MsG0280007706.01.T01 AT2G28940 43.154 241 130 4 532 765 25 265 2.24e-53 189
MsG0280007706.01.T01 AT5G62230 39.858 281 159 5 487 764 589 862 2.55e-53 200
MsG0280007706.01.T01 AT5G62230 39.858 281 159 5 487 764 637 910 3.53e-53 200
MsG0280007706.01.T01 AT1G70110 36.333 300 183 3 485 780 331 626 3.57e-53 197
MsG0280007706.01.T01 AT1G79620 46.371 248 113 4 417 663 575 803 3.73e-53 199
MsG0280007706.01.T01 AT4G13190 40.000 255 150 2 520 771 5 259 3.96e-53 187
MsG0280007706.01.T01 AT1G61420 32.869 359 218 3 408 765 276 612 4.02e-53 196
MsG0280007706.01.T01 AT5G03140 39.792 289 163 6 484 765 360 644 4.46e-53 197
MsG0280007706.01.T01 AT5G18910 37.456 283 170 4 484 765 178 454 4.47e-53 193
MsG0280007706.01.T01 AT2G25220 33.766 385 229 7 403 768 44 421 4.95e-53 191
MsG0280007706.01.T01 AT1G21590 35.816 282 178 2 486 765 357 637 5.08e-53 197
MsG0280007706.01.T01 AT2G19130 39.667 300 172 6 481 775 478 773 5.09e-53 199
MsG0280007706.01.T01 AT1G48220 35.739 291 178 3 490 772 60 349 5.50e-53 189
MsG0280007706.01.T01 AT2G25220 37.195 328 191 6 403 728 13 327 5.57e-53 189
MsG0280007706.01.T01 AT1G31420 40.370 270 152 4 503 769 311 574 6.08e-53 194
MsG0280007706.01.T01 AT2G47060 42.128 235 128 2 488 715 63 296 7.23e-53 187
MsG0280007706.01.T01 AT1G21590 35.816 282 178 2 486 765 397 677 7.58e-53 197
MsG0280007706.01.T01 AT4G11460 38.408 289 170 5 485 768 258 543 8.75e-53 195
MsG0280007706.01.T01 AT1G61420 32.869 359 218 3 408 765 426 762 1.08e-52 197
MsG0280007706.01.T01 AT1G54820 39.852 271 142 6 486 740 135 400 1.28e-52 189
MsG0280007706.01.T01 AT3G55950 37.736 318 168 7 484 774 482 796 1.29e-52 197
MsG0280007706.01.T01 AT2G25220 37.195 328 191 6 403 728 62 376 1.33e-52 189
MsG0280007706.01.T01 AT3G45860 39.189 296 171 7 479 768 332 624 1.39e-52 195
MsG0280007706.01.T01 AT1G21270 39.000 300 181 2 471 769 377 675 1.66e-52 196
MsG0280007706.01.T01 AT4G23190 36.585 287 178 2 486 768 260 546 1.71e-52 193
MsG0280007706.01.T01 AT4G23190 36.585 287 178 2 486 768 260 546 1.71e-52 193
MsG0280007706.01.T01 AT5G62710 37.063 286 176 3 486 769 266 549 2.24e-52 192
MsG0280007706.01.T01 AT5G57670 36.879 282 171 3 486 765 255 531 2.27e-52 192
MsG0280007706.01.T01 AT3G53380 38.514 296 169 5 482 768 360 651 2.34e-52 195
MsG0280007706.01.T01 AT4G11460 38.408 289 170 5 485 768 333 618 2.37e-52 195
MsG0280007706.01.T01 AT1G51940 38.806 335 176 10 486 803 329 651 2.45e-52 194

Find 193 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 221 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATCCGGACCTTTGGAGAATT+TGG 0.118918 2:+19473505 MsG0280007706.01.T01:CDS
AGAGAAAAGTGAAATGATTT+TGG 0.235530 2:+19474544 MsG0280007706.01.T01:CDS
ACTCTAAGAAGTCATCTATT+TGG 0.251422 2:+19474590 MsG0280007706.01.T01:CDS
CCGGAATCGTTGTCTAAGTT+TGG 0.262472 2:+19475067 MsG0280007706.01.T01:CDS
TGGCGACCGATATTCCTTTA+TGG 0.273575 2:+19474197 MsG0280007706.01.T01:CDS
TCAAGATGAAGAAGTTGATT+TGG 0.276034 2:+19475294 MsG0280007706.01.T01:CDS
AATGTGAACCTGCAGAATTC+TGG 0.276178 2:+19473228 MsG0280007706.01.T01:intron
AGGCTTTGGTAAGGTGTATA+AGG 0.277997 2:+19474379 MsG0280007706.01.T01:CDS
TTCAAAAGCAGGACCGTCTT+TGG 0.289043 2:-19474789 None:intergenic
AAATCAGATGTTTACTCTTT+CGG 0.294766 2:+19474893 MsG0280007706.01.T01:CDS
TAGGAAATGGATTGGGGATA+TGG 0.295415 2:+19472922 MsG0280007706.01.T01:CDS
ATCGTTGATCCACGTCTTAA+CGG 0.304207 2:+19475034 MsG0280007706.01.T01:CDS
GCAAGATTGATTTGATCTTT+AGG 0.307105 2:-19474968 None:intergenic
CCAAAGGTCCGGATCTTGAT+TGG 0.310835 2:-19473496 None:intergenic
CGCAGAAGCATATGTAATAT+TGG 0.320086 2:-19473586 None:intergenic
ATTTGACTTGGCTGGGAAAT+CGG 0.320219 2:+19474025 MsG0280007706.01.T01:CDS
CGGAATCGTTGTCTAAGTTT+GGG 0.321969 2:+19475068 MsG0280007706.01.T01:CDS
CTAAGGGTAACATTGTTATT+AGG 0.330877 2:-19472947 None:intergenic
ATTCTCGTCTAACAATATAT+TGG 0.334282 2:-19474735 None:intergenic
TGCACGAAGCTTGGCTCAAT+AGG 0.337742 2:+19475179 MsG0280007706.01.T01:CDS
GTCATCGGAGTTGGAGGCTT+TGG 0.340812 2:+19474365 MsG0280007706.01.T01:CDS
GCAGCACCAGCAGCCGTATC+AGG 0.346014 2:-19473927 None:intergenic
AATGAGAATGAGTCGTCTTT+TGG 0.351963 2:+19473141 MsG0280007706.01.T01:CDS
GGTGTTGTTGCTTCCACTGA+TGG 0.352814 2:+19472980 MsG0280007706.01.T01:CDS
TCTTGATTGGATTGAATCTC+AGG 0.356609 2:-19473483 None:intergenic
TTGATTTCCTGTTGATCCCT+TGG 0.360195 2:-19474249 None:intergenic
CTTCCCAGTGGAAATTCGTT+TGG 0.369273 2:+19473327 MsG0280007706.01.T01:CDS
ACAGGAAATCAAAAGTTATA+TGG 0.369412 2:+19474260 MsG0280007706.01.T01:CDS
ATTGAGATTGTTCCCGTTGT+TGG 0.375551 2:+19473363 MsG0280007706.01.T01:CDS
CTCTAAGAAGTCATCTATTT+GGG 0.377282 2:+19474591 MsG0280007706.01.T01:CDS
TTTGATCAAAGAGTATATTC+TGG 0.377462 2:+19473272 MsG0280007706.01.T01:CDS
ACTGCTGTGAAAGGAAGTTT+TGG 0.382964 2:+19474827 MsG0280007706.01.T01:CDS
TGGAAGAGTCGAGGTTGTTC+AGG 0.383039 2:+19475261 MsG0280007706.01.T01:CDS
AATTCTTCTGTGAATGTTGA+TGG 0.383925 2:+19472899 MsG0280007706.01.T01:CDS
ATTGAGGATGGACACACTTT+GGG 0.388847 2:+19473893 MsG0280007706.01.T01:CDS
TCCGGACCTTTGGAGAATTT+GGG 0.390372 2:+19473506 MsG0280007706.01.T01:CDS
TACACTATCAAAGATGTTCA+TGG 0.394928 2:+19473070 MsG0280007706.01.T01:CDS
CCAAACTTAGACAACGATTC+CGG 0.394993 2:-19475067 None:intergenic
CGACCATGGGAGAGGTGTTA+TGG 0.396611 2:+19475134 MsG0280007706.01.T01:CDS
GTGGAGAAATTTGACTTGGC+TGG 0.397989 2:+19474017 MsG0280007706.01.T01:CDS
TTGATGGTAGGAAATGGATT+GGG 0.398013 2:+19472915 MsG0280007706.01.T01:CDS
TTCATGGAAACTATGTTGTT+AGG 0.398243 2:+19473086 MsG0280007706.01.T01:CDS
TCAAATCAATCTTGCAGAAT+GGG 0.399597 2:+19474976 MsG0280007706.01.T01:CDS
CCAATCAAGATCCGGACCTT+TGG 0.399906 2:+19473496 MsG0280007706.01.T01:CDS
TTTGACTTGGCTGGGAAATC+GGG 0.402599 2:+19474026 MsG0280007706.01.T01:CDS
GGAAGTCGATTCTAGCTATA+TGG 0.408647 2:+19473527 MsG0280007706.01.T01:CDS
AGACATCTTGTGTCTTTGAT+TGG 0.409955 2:+19474512 MsG0280007706.01.T01:CDS
CATTGAGGATGGACACACTT+TGG 0.411683 2:+19473892 MsG0280007706.01.T01:CDS
GTTACCCTTAGTTCTTCTCC+TGG 0.412130 2:+19472959 MsG0280007706.01.T01:CDS
TATGGTACTGTCACCTCAAC+AGG 0.413619 2:+19474278 MsG0280007706.01.T01:CDS
AGACGCTGCTTCCAAGTTAG+TGG 0.414900 2:-19474626 None:intergenic
GTTTATGAGTACATGGCAAA+TGG 0.419798 2:+19474566 MsG0280007706.01.T01:CDS
GCCCCTCCATAAAGGAATAT+CGG 0.428968 2:-19474203 None:intergenic
AGTCGAACGAGAGAATATTC+AGG 0.429606 2:+19473769 MsG0280007706.01.T01:CDS
TTGGCGCGCTTAATTGCAGC+GGG 0.430926 2:-19474422 None:intergenic
GATACGGCTGCTGGTGCTGC+GGG 0.442280 2:+19473930 MsG0280007706.01.T01:CDS
TCCACAGTCTGAACAAGGTC+TGG 0.442684 2:+19474445 MsG0280007706.01.T01:CDS
GCGATCTCCCTCCACTAACT+TGG 0.445089 2:+19474615 MsG0280007706.01.T01:CDS
CGGACAACATAATCAAAATC+AGG 0.446051 2:-19473717 None:intergenic
AGCACAGAAAATTCCTTCTC+TGG 0.446057 2:+19475211 MsG0280007706.01.T01:CDS
GTAGGTGCCAAGGGATCAAC+AGG 0.448331 2:+19474242 MsG0280007706.01.T01:CDS
CTTTGGATTGGAGTAGGAGC+AGG 0.457077 2:+19474071 MsG0280007706.01.T01:CDS
ATTTATGTCCCTTTGAGATG+TGG 0.459221 2:+19473113 MsG0280007706.01.T01:CDS
GACAGTTTGGTCATCGGAGT+TGG 0.461817 2:+19474356 MsG0280007706.01.T01:CDS
GGCTTTGGTAAGGTGTATAA+GGG 0.466144 2:+19474380 MsG0280007706.01.T01:CDS
ATCAAATCAATCTTGCAGAA+TGG 0.467124 2:+19474975 MsG0280007706.01.T01:CDS
GATGGTTCGGTTGGTAAAGT+TGG 0.468399 2:+19473396 MsG0280007706.01.T01:CDS
GACCGATATTCCTTTATGGA+GGG 0.469112 2:+19474201 MsG0280007706.01.T01:CDS
TCTTGCAGCTGCACGAAGCT+TGG 0.469781 2:+19475170 MsG0280007706.01.T01:CDS
TTACAGCAGCCCCTCCATAA+AGG 0.475576 2:-19474211 None:intergenic
AAATCAATTCTTATAAATTG+TGG 0.477228 2:+19472872 MsG0280007706.01.T01:CDS
AGGAATATCGGTCGCCAACC+AGG 0.478854 2:-19474191 None:intergenic
TCCCCTTGCAGCACCTATGC+AGG 0.480453 2:-19474654 None:intergenic
ATTTGATCTTTAGGCAAGGT+AGG 0.481269 2:-19474959 None:intergenic
AAAATTCTTTGGATTGGAGT+AGG 0.483006 2:+19474065 MsG0280007706.01.T01:CDS
ACAAAAGATTTAACATGTCA+TGG 0.484299 2:+19473679 MsG0280007706.01.T01:CDS
CATGATGGGGAAGGTTATTG+AGG 0.484314 2:+19472790 None:intergenic
TCCCAAATTCTCCAAAGGTC+CGG 0.487593 2:-19473507 None:intergenic
CGACCGATATTCCTTTATGG+AGG 0.492254 2:+19474200 MsG0280007706.01.T01:CDS
CCCTTGCAGTTTCATACACA+AGG 0.496908 2:-19473632 None:intergenic
GCACGAAGCTTGGCTCAATA+GGG 0.500806 2:+19475180 MsG0280007706.01.T01:CDS
GAAGAATAAAGCGTATCATC+AGG 0.501378 2:+19473851 MsG0280007706.01.T01:CDS
CAACACCAGGAGAAGAACTA+AGG 0.501794 2:-19472964 None:intergenic
AACTTGAATTTGACTGGACA+CGG 0.502855 2:+19473426 MsG0280007706.01.T01:CDS
GGAACCGATGCTCTCTTGAA+TGG 0.503595 2:+19473951 MsG0280007706.01.T01:CDS
ATAACACCTCTCCCATGGTC+GGG 0.505943 2:-19475132 None:intergenic
GACACACTTTGGGTTCAACT+AGG 0.507200 2:+19473903 MsG0280007706.01.T01:CDS
CTATGTGGAGAAATTTGACT+TGG 0.511322 2:+19474013 MsG0280007706.01.T01:CDS
CTAGGTCCTGATACGGCTGC+TGG 0.512686 2:+19473921 MsG0280007706.01.T01:CDS
TATTGGTTGTCTTGACATCC+CGG 0.512686 2:-19474718 None:intergenic
AGTTTGGTCATCGGAGTTGG+AGG 0.514047 2:+19474359 MsG0280007706.01.T01:CDS
TGAATGTTGATGGTAGGAAA+TGG 0.515273 2:+19472909 MsG0280007706.01.T01:CDS
CGGAGTTGGAGGCTTTGGTA+AGG 0.516723 2:+19474370 MsG0280007706.01.T01:CDS
GTTGATGGTAGGAAATGGAT+TGG 0.520120 2:+19472914 MsG0280007706.01.T01:CDS
ACGGGATGGAGACTATGTAT+AGG 0.525230 2:+19473445 MsG0280007706.01.T01:CDS
GGTGGAAACTTGAATTTGAC+TGG 0.525325 2:+19473420 MsG0280007706.01.T01:CDS
CATAACACCTCTCCCATGGT+CGG 0.526784 2:-19475133 None:intergenic
GCTTTGAGTGGTCTAAATGA+TGG 0.528706 2:+19475241 MsG0280007706.01.T01:CDS
GGGAGAGGTGTTATGGCACT+TGG 0.530880 2:+19475141 MsG0280007706.01.T01:CDS
CGATTCCGCATCATTGAGGA+TGG 0.531597 2:+19473881 MsG0280007706.01.T01:CDS
ACCGATATTCCTTTATGGAG+GGG 0.533199 2:+19474202 MsG0280007706.01.T01:CDS
GAAGCCAAACGAATTTCCAC+TGG 0.534052 2:-19473331 None:intergenic
ACCTTGTTCAGACTGTGGAT+TGG 0.536481 2:-19474441 None:intergenic
TCAGCTCGCAGAAATGTAAA+CGG 0.536622 2:-19473737 None:intergenic
TCGGTTGGTAAAGTTGGCGG+TGG 0.536684 2:+19473402 MsG0280007706.01.T01:CDS
GAGCCGCCCGACCATGGGAG+AGG 0.540202 2:+19475126 MsG0280007706.01.T01:CDS
GGTAAGAGCCGCCCGACCAT+GGG 0.540786 2:+19475121 MsG0280007706.01.T01:CDS
TGGTAAGGTGTATAAGGGAG+AGG 0.541297 2:+19474385 MsG0280007706.01.T01:CDS
TTTGATCTTTAGGCAAGGTA+GGG 0.542159 2:-19474958 None:intergenic
TGCTGGTAAGCGGTTTACAT+TGG 0.542450 2:+19474301 MsG0280007706.01.T01:CDS
GCTTCCACTGATGGATTAAG+TGG 0.542583 2:+19472989 MsG0280007706.01.T01:CDS
ATGTATAGGTTAAATGTTGG+TGG 0.543144 2:+19473459 MsG0280007706.01.T01:CDS
TGGAGAAATTTGACTTGGCT+GGG 0.543247 2:+19474018 MsG0280007706.01.T01:CDS
GTAGCTATAGTTGCATGTGT+TGG 0.543392 2:+19474104 MsG0280007706.01.T01:CDS
CGGGCGGCTCTTACCATCAT+CGG 0.543869 2:-19475113 None:intergenic
TGATACGGCTGCTGGTGCTG+CGG 0.543981 2:+19473929 MsG0280007706.01.T01:CDS
ACTGTCACCTCAACAGGTGC+TGG 0.545307 2:+19474284 MsG0280007706.01.T01:CDS
AATGTCAAACACAGAAGTCT+TGG 0.545551 2:+19473656 MsG0280007706.01.T01:CDS
TGATGGTAGGAAATGGATTG+GGG 0.545629 2:+19472916 MsG0280007706.01.T01:CDS
CAGCGTCTTGAAGCCTGCAT+AGG 0.546260 2:+19474641 MsG0280007706.01.T01:CDS
GGTTCGGTTGGTAAAGTTGG+CGG 0.548290 2:+19473399 MsG0280007706.01.T01:CDS
TTTGACGACAGTTTGGTCAT+CGG 0.550421 2:+19474350 MsG0280007706.01.T01:CDS
ACATGAGTATGTTCAAAAGC+AGG 0.551969 2:-19474800 None:intergenic
ATTGTGGTCCACATCTCAAA+GGG 0.552536 2:-19473121 None:intergenic
GATTCAATCCAATCAAGATC+CGG 0.553897 2:+19473488 MsG0280007706.01.T01:CDS
CATGTTAGCACTGCTGTGAA+AGG 0.555738 2:+19474818 MsG0280007706.01.T01:CDS
GGTTCAACTAGGTCCTGATA+CGG 0.555809 2:+19473914 MsG0280007706.01.T01:CDS
TATATTCTGGATGTCAATGA+TGG 0.556045 2:+19473285 MsG0280007706.01.T01:CDS
CACGGTCGGCTCCTGTGTGA+AGG 0.557669 2:-19474685 None:intergenic
GCTGTTCTTAATTGCTGCAC+CGG 0.560900 2:-19473562 None:intergenic
ACTATGTATAGGTTAAATGT+TGG 0.562505 2:+19473456 MsG0280007706.01.T01:CDS
CATTGTGGTCCACATCTCAA+AGG 0.563397 2:-19473122 None:intergenic
AGCCTGCATAGGTGCTGCAA+GGG 0.564451 2:+19474652 MsG0280007706.01.T01:CDS
CGCTGCTTCCAAGTTAGTGG+AGG 0.569437 2:-19474623 None:intergenic
ATTACGATTCCGCATCATTG+AGG 0.573343 2:+19473877 MsG0280007706.01.T01:CDS
TGTTGTCTTCTGAAGTACTC+CGG 0.573644 2:-19474860 None:intergenic
TGGTAAGAGCCGCCCGACCA+TGG 0.573938 2:+19475120 MsG0280007706.01.T01:CDS
GAATTTGACTGGACACGGGA+TGG 0.574569 2:+19473431 MsG0280007706.01.T01:CDS
TTGCAGAATGGGCAATGAGA+TGG 0.574859 2:+19474987 MsG0280007706.01.T01:CDS
AAACAGCACTGTAGGTGCCA+AGG 0.577753 2:+19474232 MsG0280007706.01.T01:CDS
AAATGGGAATCTCGCCTATG+TGG 0.579612 2:+19473998 MsG0280007706.01.T01:CDS
GCCAGACCTTGTTCAGACTG+TGG 0.582328 2:-19474446 None:intergenic
TCTGGTAGTCAAGCTTTGAG+TGG 0.582782 2:+19475229 MsG0280007706.01.T01:CDS
CCGGTGAATTATTCCACGGT+CGG 0.583245 2:-19474699 None:intergenic
TCAGTGGAAGCAACAACACC+AGG 0.584777 2:-19472977 None:intergenic
CAATAGTTTCCGTTAAGACG+TGG 0.584805 2:-19475043 None:intergenic
TCTTAACGGAAACTATTGTC+CGG 0.587241 2:+19475048 MsG0280007706.01.T01:CDS
CAAAGCTTGACTACCAGAGA+AGG 0.588375 2:-19475224 None:intergenic
CGATTCTAGCTATATGGTCA+CGG 0.589359 2:+19473533 MsG0280007706.01.T01:CDS
GATTTCGGTTTGTCCAAAGA+CGG 0.589745 2:+19474776 MsG0280007706.01.T01:CDS
TTGATTGAGTTTCTTCCCAG+TGG 0.590112 2:+19473315 MsG0280007706.01.T01:CDS
ATGGGGAAGGTTATTGAGGA+AGG 0.590258 2:+19472794 MsG0280007706.01.T01:CDS
CCGACCGTGGAATAATTCAC+CGG 0.591254 2:+19474699 MsG0280007706.01.T01:CDS
ACTTGAATTTGACTGGACAC+GGG 0.592020 2:+19473427 MsG0280007706.01.T01:CDS
AACAACGGGAACAATCTCAA+TGG 0.593472 2:-19473361 None:intergenic
GTGCCATAACACCTCTCCCA+TGG 0.593811 2:-19475137 None:intergenic
AAGCCTGCATAGGTGCTGCA+AGG 0.594144 2:+19474651 MsG0280007706.01.T01:CDS
GCCAATCCACAGTCTGAACA+AGG 0.594848 2:+19474440 MsG0280007706.01.T01:CDS
CCGCTTACCAGCACCTGTTG+AGG 0.595223 2:-19474291 None:intergenic
CCTCAACAGGTGCTGGTAAG+CGG 0.596734 2:+19474291 MsG0280007706.01.T01:CDS
TCCTTGTGTATGAAACTGCA+AGG 0.596813 2:+19473631 MsG0280007706.01.T01:CDS
AACAGCACTGTAGGTGCCAA+GGG 0.601059 2:+19474233 MsG0280007706.01.T01:CDS
CGACCGTGGAATAATTCACC+GGG 0.605218 2:+19474700 MsG0280007706.01.T01:CDS
GCTGCTGTAAACAGCACTGT+AGG 0.608988 2:+19474224 MsG0280007706.01.T01:CDS
ATTGGCGCGCTTAATTGCAG+CGG 0.609085 2:-19474423 None:intergenic
CTTCTGTGAATGTTGATGGT+AGG 0.612013 2:+19472903 MsG0280007706.01.T01:CDS
CGACTTCCCAAATTCTCCAA+AGG 0.613736 2:-19473512 None:intergenic
CAAGTCAAATTTCTCCACAT+AGG 0.615454 2:-19474012 None:intergenic
ATTGATTTGATCTTTAGGCA+AGG 0.615687 2:-19474963 None:intergenic
CTTGATTGGATTGAATCTCA+GGG 0.615738 2:-19473482 None:intergenic
AACACCAGGAGAAGAACTAA+GGG 0.616395 2:-19472963 None:intergenic
GCAGTTTCATACACAAGGAG+AGG 0.619743 2:-19473627 None:intergenic
TATAAGGGAGAGGTTGATGA+TGG 0.623999 2:+19474395 MsG0280007706.01.T01:CDS
GGAATCGTTGTCTAAGTTTG+GGG 0.633651 2:+19475069 MsG0280007706.01.T01:CDS
AAGAAGAATCATGATGGGGA+AGG 0.633772 2:+19472781 None:intergenic
CATCCCGGTGAATTATTCCA+CGG 0.637361 2:-19474703 None:intergenic
ATTTCCACTTAATCCATCAG+TGG 0.638207 2:-19472993 None:intergenic
CCTTGTGTATGAAACTGCAA+GGG 0.647422 2:+19473632 MsG0280007706.01.T01:CDS
GCTGCTTCCAAGTTAGTGGA+GGG 0.647599 2:-19474622 None:intergenic
AAGACGACTCATTCTCATTG+TGG 0.647675 2:-19473137 None:intergenic
TAGACCATTCAAGAGAGCAT+CGG 0.647959 2:-19473955 None:intergenic
CTTCACACAGGAGCCGACCG+TGG 0.650180 2:+19474686 MsG0280007706.01.T01:CDS
ACACCTCTCCCATGGTCGGG+CGG 0.651048 2:-19475129 None:intergenic
TGTGTCCATCCTCAATGATG+CGG 0.652040 2:-19473886 None:intergenic
GCCTGCATAGGTGCTGCAAG+GGG 0.663597 2:+19474653 MsG0280007706.01.T01:CDS
CATAAACAACAGAACAGCTG+CGG 0.665105 2:+19473797 MsG0280007706.01.T01:CDS
TAGACTCTTACACACTGCTG+TGG 0.670780 2:-19475342 None:intergenic
AAGCCAAACGAATTTCCACT+GGG 0.680028 2:-19473330 None:intergenic
TTCTGCGAATGATACTTCAG+TGG 0.688780 2:+19473602 MsG0280007706.01.T01:CDS
TCTAAATGATGGAAGAGTCG+AGG 0.690528 2:+19475252 MsG0280007706.01.T01:CDS
GGACTTCACTACCTTCACAC+AGG 0.699174 2:+19474674 MsG0280007706.01.T01:CDS
TATATGGTCACGGAAAACGC+CGG 0.726249 2:+19473543 MsG0280007706.01.T01:CDS
TGGCGCGCTTAATTGCAGCG+GGG 0.747077 2:-19474421 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAATCAATTCTTATAAATTG+TGG + Chr2:19472872-19472891 MsG0280007706.01.T01:CDS 15.0%
! AAAGCAAAAATTCTTTGGAT+TGG + Chr2:19474059-19474078 MsG0280007706.01.T01:CDS 25.0%
! AAATCAGATGTTTACTCTTT+CGG + Chr2:19474893-19474912 MsG0280007706.01.T01:CDS 25.0%
! ACAAAAGATTTAACATGTCA+TGG + Chr2:19473679-19473698 MsG0280007706.01.T01:CDS 25.0%
! ACAGGAAATCAAAAGTTATA+TGG + Chr2:19474260-19474279 MsG0280007706.01.T01:CDS 25.0%
! ACTATGTATAGGTTAAATGT+TGG + Chr2:19473456-19473475 MsG0280007706.01.T01:CDS 25.0%
! ATTCTCGTCTAACAATATAT+TGG - Chr2:19474738-19474757 None:intergenic 25.0%
! GTTCAAAAGCAAAAATTCTT+TGG + Chr2:19474054-19474073 MsG0280007706.01.T01:CDS 25.0%
!! AGAGAAAAGTGAAATGATTT+TGG + Chr2:19474544-19474563 MsG0280007706.01.T01:CDS 25.0%
!! AGAGTAAACATCTGATTTTT+CGG - Chr2:19474891-19474910 None:intergenic 25.0%
!! TTTGATCAAAGAGTATATTC+TGG + Chr2:19473272-19473291 MsG0280007706.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAATAATTTTGACGACAGTT+TGG + Chr2:19474343-19474362 MsG0280007706.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTCTAGCTGTTTTATAAAG+TGG - Chr2:19473031-19473050 None:intergenic 25.0%
!!! ATTTTTAAGCTTAGCAGAAA+TGG + Chr2:19473981-19474000 MsG0280007706.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTTAAGCTTAGCAGAAAT+GGG + Chr2:19473982-19474001 MsG0280007706.01.T01:CDS 25.0%
AATTCTTCTGTGAATGTTGA+TGG + Chr2:19472899-19472918 MsG0280007706.01.T01:CDS 30.0%
ATCAAATCAATCTTGCAGAA+TGG + Chr2:19474975-19474994 MsG0280007706.01.T01:CDS 30.0%
ATGTATAGGTTAAATGTTGG+TGG + Chr2:19473459-19473478 MsG0280007706.01.T01:CDS 30.0%
CAATGGTATGAAACTATTGT+CGG + Chr2:19473173-19473192 MsG0280007706.01.T01:intron 30.0%
TACACTATCAAAGATGTTCA+TGG + Chr2:19473070-19473089 MsG0280007706.01.T01:CDS 30.0%
TATATTCTGGATGTCAATGA+TGG + Chr2:19473285-19473304 MsG0280007706.01.T01:CDS 30.0%
TCAAATCAATCTTGCAGAAT+GGG + Chr2:19474976-19474995 MsG0280007706.01.T01:CDS 30.0%
TTCATGGAAACTATGTTGTT+AGG + Chr2:19473086-19473105 MsG0280007706.01.T01:CDS 30.0%
! AAAATTCTTTGGATTGGAGT+AGG + Chr2:19474065-19474084 MsG0280007706.01.T01:CDS 30.0%
! ACTCTAAGAAGTCATCTATT+TGG + Chr2:19474590-19474609 MsG0280007706.01.T01:CDS 30.0%
! CGAGAATTTTGTAGCAAAAA+TGG + Chr2:19474751-19474770 MsG0280007706.01.T01:CDS 30.0%
! CTAAGGGTAACATTGTTATT+AGG - Chr2:19472950-19472969 None:intergenic 30.0%
! CTCTAAGAAGTCATCTATTT+GGG + Chr2:19474591-19474610 MsG0280007706.01.T01:CDS 30.0%
! TCAAGATGAAGAAGTTGATT+TGG + Chr2:19475294-19475313 MsG0280007706.01.T01:CDS 30.0%
! TTCTTTTCAGATATCTTACC+CGG - Chr2:19473210-19473229 None:intergenic 30.0%
!! ATTGATTTGATCTTTAGGCA+AGG - Chr2:19474966-19474985 None:intergenic 30.0%
!! GCAAGATTGATTTGATCTTT+AGG - Chr2:19474971-19474990 None:intergenic 30.0%
!!! GATTTTGGTTTATGAGTACA+TGG + Chr2:19474559-19474578 MsG0280007706.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTCTGTTTCTGCAAAAGA+AGG + Chr2:19474135-19474154 MsG0280007706.01.T01:CDS 30.0%
AACTTGAATTTGACTGGACA+CGG + Chr2:19473426-19473445 MsG0280007706.01.T01:CDS 35.0%
AATGTCAAACACAGAAGTCT+TGG + Chr2:19473656-19473675 MsG0280007706.01.T01:CDS 35.0%
AATTCTTTCCAGAATTCTGC+AGG - Chr2:19473239-19473258 None:intergenic 35.0%
ACATGAGTATGTTCAAAAGC+AGG - Chr2:19474803-19474822 None:intergenic 35.0%
AGACATCTTGTGTCTTTGAT+TGG + Chr2:19474512-19474531 MsG0280007706.01.T01:CDS 35.0%
ATTGTCGGAGTTTAATGTTC+CGG + Chr2:19473188-19473207 MsG0280007706.01.T01:intron 35.0%
ATTTCCACTTAATCCATCAG+TGG - Chr2:19472996-19473015 None:intergenic 35.0%
ATTTGATCTTTAGGCAAGGT+AGG - Chr2:19474962-19474981 None:intergenic 35.0%
CAAGTCAAATTTCTCCACAT+AGG - Chr2:19474015-19474034 None:intergenic 35.0%
CGGACAACATAATCAAAATC+AGG - Chr2:19473720-19473739 None:intergenic 35.0%
CTATGTGGAGAAATTTGACT+TGG + Chr2:19474013-19474032 MsG0280007706.01.T01:CDS 35.0%
CTTGATTGGATTGAATCTCA+GGG - Chr2:19473485-19473504 None:intergenic 35.0%
GAAGAATAAAGCGTATCATC+AGG + Chr2:19473851-19473870 MsG0280007706.01.T01:CDS 35.0%
GATTCAATCCAATCAAGATC+CGG + Chr2:19473488-19473507 MsG0280007706.01.T01:CDS 35.0%
GATTGTGAGCAAAAATGTAG+AGG + Chr2:19472841-19472860 MsG0280007706.01.T01:CDS 35.0%
GTTTATGAGTACATGGCAAA+TGG + Chr2:19474566-19474585 MsG0280007706.01.T01:CDS 35.0%
TCTTAACGGAAACTATTGTC+CGG + Chr2:19475048-19475067 MsG0280007706.01.T01:CDS 35.0%
TCTTGATTGGATTGAATCTC+AGG - Chr2:19473486-19473505 None:intergenic 35.0%
TTTGATCTTTAGGCAAGGTA+GGG - Chr2:19474961-19474980 None:intergenic 35.0%
! AATGAGAATGAGTCGTCTTT+TGG + Chr2:19473141-19473160 MsG0280007706.01.T01:CDS 35.0%
! CGCAGAAGCATATGTAATAT+TGG - Chr2:19473589-19473608 None:intergenic 35.0%
! GTAGCAAAAATGGCTGATTT+CGG + Chr2:19474761-19474780 MsG0280007706.01.T01:CDS 35.0%
! TTGATGGTAGGAAATGGATT+GGG + Chr2:19472915-19472934 MsG0280007706.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTTATGTCCCTTTGAGATG+TGG + Chr2:19473113-19473132 MsG0280007706.01.T01:CDS 35.0%
!! TGAATGTTGATGGTAGGAAA+TGG + Chr2:19472909-19472928 MsG0280007706.01.T01:CDS 35.0%
!!! TCTTTTGGTGTTGTTGTCAA+TGG + Chr2:19473156-19473175 MsG0280007706.01.T01:CDS 35.0%
AACAACGGGAACAATCTCAA+TGG - Chr2:19473364-19473383 None:intergenic 40.0%
AACACCAGGAGAAGAACTAA+GGG - Chr2:19472966-19472985 None:intergenic 40.0%
AAGACGACTCATTCTCATTG+TGG - Chr2:19473140-19473159 None:intergenic 40.0%
AAGCCAAACGAATTTCCACT+GGG - Chr2:19473333-19473352 None:intergenic 40.0%
AATGTGAACCTGCAGAATTC+TGG + Chr2:19473228-19473247 MsG0280007706.01.T01:intron 40.0%
ACCGATATTCCTTTATGGAG+GGG + Chr2:19474202-19474221 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
ACTTGAATTTGACTGGACAC+GGG + Chr2:19473427-19473446 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
AGCACAGAAAATTCCTTCTC+TGG + Chr2:19475211-19475230 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
AGTCGAACGAGAGAATATTC+AGG + Chr2:19473769-19473788 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
ATCAAAAAGCTCGCCAACAA+CGG - Chr2:19473379-19473398 None:intergenic 40.0%
ATCGTTGATCCACGTCTTAA+CGG + Chr2:19475034-19475053 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
ATTACGATTCCGCATCATTG+AGG + Chr2:19473877-19473896 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
ATTGAGATTGTTCCCGTTGT+TGG + Chr2:19473363-19473382 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
ATTGAGGATGGACACACTTT+GGG + Chr2:19473893-19473912 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
ATTGTGGTCCACATCTCAAA+GGG - Chr2:19473124-19473143 None:intergenic 40.0%
CAATAGTTTCCGTTAAGACG+TGG - Chr2:19475046-19475065 None:intergenic 40.0%
CATAAACAACAGAACAGCTG+CGG + Chr2:19473797-19473816 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
CCAAACTTAGACAACGATTC+CGG - Chr2:19475070-19475089 None:intergenic 40.0%
CCTTGTGTATGAAACTGCAA+GGG + Chr2:19473632-19473651 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
CGGAATCGTTGTCTAAGTTT+GGG + Chr2:19475068-19475087 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
GACCGATATTCCTTTATGGA+GGG + Chr2:19474201-19474220 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
GATACCAAAAACAACTCTCC+TGG + Chr2:19474173-19474192 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
GGAATCGTTGTCTAAGTTTG+GGG + Chr2:19475069-19475088 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
GGTGGAAACTTGAATTTGAC+TGG + Chr2:19473420-19473439 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
GTAGCTATAGTTGCATGTGT+TGG + Chr2:19474104-19474123 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
TCAGCTCGCAGAAATGTAAA+CGG - Chr2:19473740-19473759 None:intergenic 40.0%
TCCTTGTGTATGAAACTGCA+AGG + Chr2:19473631-19473650 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
TTCTGCGAATGATACTTCAG+TGG + Chr2:19473602-19473621 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
TTGATTGAGTTTCTTCCCAG+TGG + Chr2:19473315-19473334 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
TTGATTTCCTGTTGATCCCT+TGG - Chr2:19474252-19474271 None:intergenic 40.0%
TTGTCGGAGTTTAATGTTCC+GGG + Chr2:19473189-19473208 MsG0280007706.01.T01:intron 40.0%
TTTGACGACAGTTTGGTCAT+CGG + Chr2:19474350-19474369 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
! ACTGCTGTGAAAGGAAGTTT+TGG + Chr2:19474827-19474846 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
! AGGCTTTGGTAAGGTGTATA+AGG + Chr2:19474379-19474398 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
! CGATTCTAGCTATATGGTCA+CGG + Chr2:19473533-19473552 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
! GATTTCGGTTTGTCCAAAGA+CGG + Chr2:19474776-19474795 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
! GCTTTGAGTGGTCTAAATGA+TGG + Chr2:19475241-19475260 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
! GGAAGTCGATTCTAGCTATA+TGG + Chr2:19473527-19473546 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
! GGCTTTGGTAAGGTGTATAA+GGG + Chr2:19474380-19474399 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
! TAGACCATTCAAGAGAGCAT+CGG - Chr2:19473958-19473977 None:intergenic 40.0%
! TATTGGTTGTCTTGACATCC+CGG - Chr2:19474721-19474740 None:intergenic 40.0%
! TCTAAATGATGGAAGAGTCG+AGG + Chr2:19475252-19475271 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
!! ATGTTTTTGTTCGAGCAGGA+GGG + Chr2:19473829-19473848 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTTGACTTGGCTGGGAAAT+CGG + Chr2:19474025-19474044 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
!! CTTCTGTGAATGTTGATGGT+AGG + Chr2:19472903-19472922 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGATGGTAGGAAATGGAT+TGG + Chr2:19472914-19472933 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGATGTTTTTGTTCGAGC+AGG + Chr2:19473825-19473844 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
!! TAGGAAATGGATTGGGGATA+TGG + Chr2:19472922-19472941 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
!! TATAAGGGAGAGGTTGATGA+TGG + Chr2:19474395-19474414 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
!! TGATGGTAGGAAATGGATTG+GGG + Chr2:19472916-19472935 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
!! TGGAGAAATTTGACTTGGCT+GGG + Chr2:19474018-19474037 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
!! TGTTGTCTTCTGAAGTACTC+CGG - Chr2:19474863-19474882 None:intergenic 40.0%
!!! AAGTTTTGGCTATCTCGATC+CGG + Chr2:19474841-19474860 MsG0280007706.01.T01:CDS 40.0%
AAATGGGAATCTCGCCTATG+TGG + Chr2:19473998-19474017 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
ACCTTGTTCAGACTGTGGAT+TGG - Chr2:19474444-19474463 None:intergenic 45.0%
ACGGGATGGAGACTATGTAT+AGG + Chr2:19473445-19473464 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
ATGGGGAAGGTTATTGAGGA+AGG + Chr2:19472794-19472813 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
CAAAGCTTGACTACCAGAGA+AGG - Chr2:19475227-19475246 None:intergenic 45.0%
CAACACCAGGAGAAGAACTA+AGG - Chr2:19472967-19472986 None:intergenic 45.0%
CATCCCGGTGAATTATTCCA+CGG - Chr2:19474706-19474725 None:intergenic 45.0%
CATGTTAGCACTGCTGTGAA+AGG + Chr2:19474818-19474837 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
CATTGAGGATGGACACACTT+TGG + Chr2:19473892-19473911 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
CATTGTGGTCCACATCTCAA+AGG - Chr2:19473125-19473144 None:intergenic 45.0%
CCAAAAACAACTCTCCTGGT+TGG + Chr2:19474177-19474196 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
CCCTTGCAGTTTCATACACA+AGG - Chr2:19473635-19473654 None:intergenic 45.0%
CCGGAATCGTTGTCTAAGTT+TGG + Chr2:19475067-19475086 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
CGACCGATATTCCTTTATGG+AGG + Chr2:19474200-19474219 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
CGACTTCCCAAATTCTCCAA+AGG - Chr2:19473515-19473534 None:intergenic 45.0%
CTTCCCAGTGGAAATTCGTT+TGG + Chr2:19473327-19473346 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
GAAAAATGTCTCGCCGATGA+TGG + Chr2:19475100-19475119 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
GAAGCCAAACGAATTTCCAC+TGG - Chr2:19473334-19473353 None:intergenic 45.0%
GCAGTTTCATACACAAGGAG+AGG - Chr2:19473630-19473649 None:intergenic 45.0%
GCCCCTCCATAAAGGAATAT+CGG - Chr2:19474206-19474225 None:intergenic 45.0%
GCTGTTCTTAATTGCTGCAC+CGG - Chr2:19473565-19473584 None:intergenic 45.0%
GGTTCAACTAGGTCCTGATA+CGG + Chr2:19473914-19473933 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
TATATGGTCACGGAAAACGC+CGG + Chr2:19473543-19473562 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
TATGGTACTGTCACCTCAAC+AGG + Chr2:19474278-19474297 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
TCAAAAAGCTCGCCAACAAC+GGG - Chr2:19473378-19473397 None:intergenic 45.0%
TCCCAAATTCTCCAAAGGTC+CGG - Chr2:19473510-19473529 None:intergenic 45.0%
TGCTGGTAAGCGGTTTACAT+TGG + Chr2:19474301-19474320 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
TGGCGACCGATATTCCTTTA+TGG + Chr2:19474197-19474216 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
TGGTAAGGTGTATAAGGGAG+AGG + Chr2:19474385-19474404 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
TGTGTCCATCCTCAATGATG+CGG - Chr2:19473889-19473908 None:intergenic 45.0%
TTCAAAAGCAGGACCGTCTT+TGG - Chr2:19474792-19474811 None:intergenic 45.0%
TTGCAGAATGGGCAATGAGA+TGG + Chr2:19474987-19475006 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
! ATCCGGACCTTTGGAGAATT+TGG + Chr2:19473505-19473524 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
! GACACACTTTGGGTTCAACT+AGG + Chr2:19473903-19473922 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
! GTTACCCTTAGTTCTTCTCC+TGG + Chr2:19472959-19472978 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
! GTTGTTGGCGAGCTTTTTGA+TGG + Chr2:19473378-19473397 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
! TCCGGACCTTTGGAGAATTT+GGG + Chr2:19473506-19473525 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
!! CCAACCAGGAGAGTTGTTTT+TGG - Chr2:19474180-19474199 None:intergenic 45.0%
!! GATGGTTCGGTTGGTAAAGT+TGG + Chr2:19473396-19473415 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
!! GATGTTTTTGTTCGAGCAGG+AGG + Chr2:19473828-19473847 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
!! GCTTCCACTGATGGATTAAG+TGG + Chr2:19472989-19473008 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
!! GTGGAGAAATTTGACTTGGC+TGG + Chr2:19474017-19474036 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
!! TCTGGTAGTCAAGCTTTGAG+TGG + Chr2:19475229-19475248 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
!! TGGCGAGCTTTTTGATGGTT+CGG + Chr2:19473383-19473402 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
!! TTTGACTTGGCTGGGAAATC+GGG + Chr2:19474026-19474045 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
!!! GAGCTTTTTGATGGTTCGGT+TGG + Chr2:19473387-19473406 MsG0280007706.01.T01:CDS 45.0%
AAACAGCACTGTAGGTGCCA+AGG + Chr2:19474232-19474251 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
AACAGCACTGTAGGTGCCAA+GGG + Chr2:19474233-19474252 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
AGACGCTGCTTCCAAGTTAG+TGG - Chr2:19474629-19474648 None:intergenic 50.0%
AGTTTGGTCATCGGAGTTGG+AGG + Chr2:19474359-19474378 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
ATAACACCTCTCCCATGGTC+GGG - Chr2:19475135-19475154 None:intergenic 50.0%
ATTGGCGCGCTTAATTGCAG+CGG - Chr2:19474426-19474445 None:intergenic 50.0%
CATAACACCTCTCCCATGGT+CGG - Chr2:19475136-19475155 None:intergenic 50.0%
CCAAAGGTCCGGATCTTGAT+TGG - Chr2:19473499-19473518 None:intergenic 50.0%
CCAATCAAGATCCGGACCTT+TGG + Chr2:19473496-19473515 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
CCGACCGTGGAATAATTCAC+CGG + Chr2:19474699-19474718 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
CCGGTGAATTATTCCACGGT+CGG - Chr2:19474702-19474721 None:intergenic 50.0%
CGACCGTGGAATAATTCACC+GGG + Chr2:19474700-19474719 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
CGATTCCGCATCATTGAGGA+TGG + Chr2:19473881-19473900 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
GAATTTGACTGGACACGGGA+TGG + Chr2:19473431-19473450 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
GACAGTTTGGTCATCGGAGT+TGG + Chr2:19474356-19474375 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
GCACGAAGCTTGGCTCAATA+GGG + Chr2:19475180-19475199 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
GCCAATCCACAGTCTGAACA+AGG + Chr2:19474440-19474459 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
GCTGCTGTAAACAGCACTGT+AGG + Chr2:19474224-19474243 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
GCTGCTTCCAAGTTAGTGGA+GGG - Chr2:19474625-19474644 None:intergenic 50.0%
GGAACCGATGCTCTCTTGAA+TGG + Chr2:19473951-19473970 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
GGACTTCACTACCTTCACAC+AGG + Chr2:19474674-19474693 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
TCAGTGGAAGCAACAACACC+AGG - Chr2:19472980-19472999 None:intergenic 50.0%
TCCACAGTCTGAACAAGGTC+TGG + Chr2:19474445-19474464 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
TGCACGAAGCTTGGCTCAAT+AGG + Chr2:19475179-19475198 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
TGGAAGAGTCGAGGTTGTTC+AGG + Chr2:19475261-19475280 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
TTACAGCAGCCCCTCCATAA+AGG - Chr2:19474214-19474233 None:intergenic 50.0%
! CTTTGGATTGGAGTAGGAGC+AGG + Chr2:19474071-19474090 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
!! GGTGTTGTTGCTTCCACTGA+TGG + Chr2:19472980-19472999 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
!! GGTTCGGTTGGTAAAGTTGG+CGG + Chr2:19473399-19473418 MsG0280007706.01.T01:CDS 50.0%
ACTGTCACCTCAACAGGTGC+TGG + Chr2:19474284-19474303 MsG0280007706.01.T01:CDS 55.0%
AGGAATATCGGTCGCCAACC+AGG - Chr2:19474194-19474213 None:intergenic 55.0%
CAGCGTCTTGAAGCCTGCAT+AGG + Chr2:19474641-19474660 MsG0280007706.01.T01:CDS 55.0%
CGCTGCTTCCAAGTTAGTGG+AGG - Chr2:19474626-19474645 None:intergenic 55.0%
GCCAGACCTTGTTCAGACTG+TGG - Chr2:19474449-19474468 None:intergenic 55.0%
GCGATCTCCCTCCACTAACT+TGG + Chr2:19474615-19474634 MsG0280007706.01.T01:CDS 55.0%
GTAGGTGCCAAGGGATCAAC+AGG + Chr2:19474242-19474261 MsG0280007706.01.T01:CDS 55.0%
GTCATCGGAGTTGGAGGCTT+TGG + Chr2:19474365-19474384 MsG0280007706.01.T01:CDS 55.0%
GTGCCATAACACCTCTCCCA+TGG - Chr2:19475140-19475159 None:intergenic 55.0%
TCTTGCAGCTGCACGAAGCT+TGG + Chr2:19475170-19475189 MsG0280007706.01.T01:CDS 55.0%
TTGGCGCGCTTAATTGCAGC+GGG - Chr2:19474425-19474444 None:intergenic 55.0%
! AAGCCTGCATAGGTGCTGCA+AGG + Chr2:19474651-19474670 MsG0280007706.01.T01:CDS 55.0%
! AGCCTGCATAGGTGCTGCAA+GGG + Chr2:19474652-19474671 MsG0280007706.01.T01:CDS 55.0%
! CGGAGTTGGAGGCTTTGGTA+AGG + Chr2:19474370-19474389 MsG0280007706.01.T01:CDS 55.0%
!! CCTCAACAGGTGCTGGTAAG+CGG + Chr2:19474291-19474310 MsG0280007706.01.T01:CDS 55.0%
!! CGACCATGGGAGAGGTGTTA+TGG + Chr2:19475134-19475153 MsG0280007706.01.T01:CDS 55.0%
!! GGGAGAGGTGTTATGGCACT+TGG + Chr2:19475141-19475160 MsG0280007706.01.T01:CDS 55.0%
!! TCGGTTGGTAAAGTTGGCGG+TGG + Chr2:19473402-19473421 MsG0280007706.01.T01:CDS 55.0%
CCGCTTACCAGCACCTGTTG+AGG - Chr2:19474294-19474313 None:intergenic 60.0%
CGGGCGGCTCTTACCATCAT+CGG - Chr2:19475116-19475135 None:intergenic 60.0%
CTAGGTCCTGATACGGCTGC+TGG + Chr2:19473921-19473940 MsG0280007706.01.T01:CDS 60.0%
TCCCCTTGCAGCACCTATGC+AGG - Chr2:19474657-19474676 None:intergenic 60.0%
TGGCGCGCTTAATTGCAGCG+GGG - Chr2:19474424-19474443 None:intergenic 60.0%
! GCCTGCATAGGTGCTGCAAG+GGG + Chr2:19474653-19474672 MsG0280007706.01.T01:CDS 60.0%
! TGATACGGCTGCTGGTGCTG+CGG + Chr2:19473929-19473948 MsG0280007706.01.T01:CDS 60.0%
ACACCTCTCCCATGGTCGGG+CGG - Chr2:19475132-19475151 None:intergenic 65.0%
CTTCACACAGGAGCCGACCG+TGG + Chr2:19474686-19474705 MsG0280007706.01.T01:CDS 65.0%
GCAGCACCAGCAGCCGTATC+AGG - Chr2:19473930-19473949 None:intergenic 65.0%
GGTAAGAGCCGCCCGACCAT+GGG + Chr2:19475121-19475140 MsG0280007706.01.T01:CDS 65.0%
TGGTAAGAGCCGCCCGACCA+TGG + Chr2:19475120-19475139 MsG0280007706.01.T01:CDS 65.0%
! CACGGTCGGCTCCTGTGTGA+AGG - Chr2:19474688-19474707 None:intergenic 65.0%
!! GATACGGCTGCTGGTGCTGC+GGG + Chr2:19473930-19473949 MsG0280007706.01.T01:CDS 65.0%
GAGCCGCCCGACCATGGGAG+AGG + Chr2:19475126-19475145 MsG0280007706.01.T01:CDS 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 19472794 19475357 19472794 ID=MsG0280007706.01;Name=MsG0280007706.01
Chr2 mRNA 19472794 19475357 19472794 ID=MsG0280007706.01.T01;Parent=MsG0280007706.01;Name=MsG0280007706.01.T01;_AED=0.17;_eAED=0.17;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|832
Chr2 exon 19472794 19473177 19472794 ID=MsG0280007706.01.T01:exon:10158;Parent=MsG0280007706.01.T01
Chr2 exon 19473243 19475357 19473243 ID=MsG0280007706.01.T01:exon:10159;Parent=MsG0280007706.01.T01
Chr2 CDS 19472794 19473177 19472794 ID=MsG0280007706.01.T01:cds;Parent=MsG0280007706.01.T01
Chr2 CDS 19473243 19475357 19473243 ID=MsG0280007706.01.T01:cds;Parent=MsG0280007706.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280007706.01.T01

ATGGGGAAGGTTATTGAGGAAGGACTATTGATTGTGTTGATTTTGATGATTGTGAGCAAAAATGTAGAGGCTCAACAAAAATCAATTCTTATAAATTGTGGTTCAAATTCTTCTGTGAATGTTGATGGTAGGAAATGGATTGGGGATATGGCACCTAATAACAATGTTACCCTTAGTTCTTCTCCTGGTGTTGTTGCTTCCACTGATGGATTAAGTGGAAATTCAATCTATGAGCCACTTTATAAAACAGCTAGAATTTTCACAGCTTCTTTGAATTACACTATCAAAGATGTTCATGGAAACTATGTTGTTAGGTTTCATTTATGTCCCTTTGAGATGTGGACCACAATGAGAATGAGTCGTCTTTTGGTGTTGTTGTCAATGAATTCTGGAAAGAATTCGAGTTCGTTCTTTTTGATCAAAGAGTATATTCTGGATGTCAATGATGGTATGCTTTTGATTGAGTTTCTTCCCAGTGGAAATTCGTTTGGCTTCATCAATGCCATTGAGATTGTTCCCGTTGTTGGCGAGCTTTTTGATGGTTCGGTTGGTAAAGTTGGCGGTGGAAACTTGAATTTGACTGGACACGGGATGGAGACTATGTATAGGTTAAATGTTGGTGGCCCTGAGATTCAATCCAATCAAGATCCGGACCTTTGGAGAATTTGGGAAGTCGATTCTAGCTATATGGTCACGGAAAACGCCGGTGCAGCAATTAAGAACAGCTCCAATATTACATATGCTTCTGCGAATGATACTTCAGTGGCTCCTCTCCTTGTGTATGAAACTGCAAGGGCAATGTCAAACACAGAAGTCTTGGACAAAAGATTTAACATGTCATGGAAGTTTGAAGTAGATCCTGATTTTGATTATGTTGTCCGTTTACATTTCTGCGAGCTGATGTATGATAAGTCGAACGAGAGAATATTCAGGATCTACATAAACAACAGAACAGCTGCGGATAATGTTGATGTTTTTGTTCGAGCAGGAGGGAAGAATAAAGCGTATCATCAGGATCATTACGATTCCGCATCATTGAGGATGGACACACTTTGGGTTCAACTAGGTCCTGATACGGCTGCTGGTGCTGCGGGAACCGATGCTCTCTTGAATGGTCTAGAGATTTTTAAGCTTAGCAGAAATGGGAATCTCGCCTATGTGGAGAAATTTGACTTGGCTGGGAAATCGGGAAGCAGTTCAAAAGCAAAAATTCTTTGGATTGGAGTAGGAGCAGGTATAGCTTCTGTAGCTATAGTTGCATGTGTTGGTGTCTTTGTTTTCTGTTTCTGCAAAAGAAGGAGAAAAGAATCAAGTGATACCAAAAACAACTCTCCTGGTTGGCGACCGATATTCCTTTATGGAGGGGCTGCTGTAAACAGCACTGTAGGTGCCAAGGGATCAACAGGAAATCAAAAGTTATATGGTACTGTCACCTCAACAGGTGCTGGTAAGCGGTTTACATTGGCTGAAATCAACGCTGCAACAAATAATTTTGACGACAGTTTGGTCATCGGAGTTGGAGGCTTTGGTAAGGTGTATAAGGGAGAGGTTGATGATGGTGTCCCCGCTGCAATTAAGCGCGCCAATCCACAGTCTGAACAAGGTCTGGCTGAATTTGAGACAGAAATTGAGATGCTCTCAAAACTAAGACACAGACATCTTGTGTCTTTGATTGGTTTCTGTGAAGAGAAAAGTGAAATGATTTTGGTTTATGAGTACATGGCAAATGGAACTCTAAGAAGTCATCTATTTGGGAGCGATCTCCCTCCACTAACTTGGAAGCAGCGTCTTGAAGCCTGCATAGGTGCTGCAAGGGGACTTCACTACCTTCACACAGGAGCCGACCGTGGAATAATTCACCGGGATGTCAAGACAACCAATATATTGTTAGACGAGAATTTTGTAGCAAAAATGGCTGATTTCGGTTTGTCCAAAGACGGTCCTGCTTTTGAACATACTCATGTTAGCACTGCTGTGAAAGGAAGTTTTGGCTATCTCGATCCGGAGTACTTCAGAAGACAACAATTAACCGAAAAATCAGATGTTTACTCTTTCGGAGTTGTTCTTTTTGAAGCTGTTTGTGCTAGAGCTGTGATAAACCCTACCTTGCCTAAAGATCAAATCAATCTTGCAGAATGGGCAATGAGATGGCAAAAAGAAAGATCACTTGAAAAAATCGTTGATCCACGTCTTAACGGAAACTATTGTCCGGAATCGTTGTCTAAGTTTGGGGAAATAGCTGAAAAATGTCTCGCCGATGATGGTAAGAGCCGCCCGACCATGGGAGAGGTGTTATGGCACTTGGAGTATGTCTTGCAGCTGCACGAAGCTTGGCTCAATAGGGACAACAATAGCACAGAAAATTCCTTCTCTGGTAGTCAAGCTTTGAGTGGTCTAAATGATGGAAGAGTCGAGGTTGTTCAGGAGCATTCAAATCAAGATGAAGAAGTTGATTTGGATTCTAAAAATACAACTGATTTAGTCCACAGCAGTGTGTAA

Protein sequence

>MsG0280007706.01.T01

MGKVIEEGLLIVLILMIVSKNVEAQQKSILINCGSNSSVNVDGRKWIGDMAPNNNVTLSSSPGVVASTDGLSGNSIYEPLYKTARIFTASLNYTIKDVHGNYVVRFHLCPFEMWTTMRMSRLLVLLSMNSGKNSSSFFLIKEYILDVNDGMLLIEFLPSGNSFGFINAIEIVPVVGELFDGSVGKVGGGNLNLTGHGMETMYRLNVGGPEIQSNQDPDLWRIWEVDSSYMVTENAGAAIKNSSNITYASANDTSVAPLLVYETARAMSNTEVLDKRFNMSWKFEVDPDFDYVVRLHFCELMYDKSNERIFRIYINNRTAADNVDVFVRAGGKNKAYHQDHYDSASLRMDTLWVQLGPDTAAGAAGTDALLNGLEIFKLSRNGNLAYVEKFDLAGKSGSSSKAKILWIGVGAGIASVAIVACVGVFVFCFCKRRRKESSDTKNNSPGWRPIFLYGGAAVNSTVGAKGSTGNQKLYGTVTSTGAGKRFTLAEINAATNNFDDSLVIGVGGFGKVYKGEVDDGVPAAIKRANPQSEQGLAEFETEIEMLSKLRHRHLVSLIGFCEEKSEMILVYEYMANGTLRSHLFGSDLPPLTWKQRLEACIGAARGLHYLHTGADRGIIHRDVKTTNILLDENFVAKMADFGLSKDGPAFEHTHVSTAVKGSFGYLDPEYFRRQQLTEKSDVYSFGVVLFEAVCARAVINPTLPKDQINLAEWAMRWQKERSLEKIVDPRLNGNYCPESLSKFGEIAEKCLADDGKSRPTMGEVLWHLEYVLQLHEAWLNRDNNSTENSFSGSQALSGLNDGRVEVVQEHSNQDEEVDLDSKNTTDLVHSSV*