AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780036623.01

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MsG0780036623.01.T01 AT5G18610 41.967 305 169 5 496 796 59 359 1.94e-64 225
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MsG0780036623.01.T01 AT2G28590 48.936 235 116 3 510 741 86 319 1.77e-63 217
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MsG0780036623.01.T01 AT1G07570 43.421 304 150 7 508 795 54 351 3.50e-62 216
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MsG0780036623.01.T01 AT5G01950 41.639 305 161 5 508 805 612 906 5.34e-62 227
MsG0780036623.01.T01 AT1G61860 41.781 292 166 4 508 796 71 361 6.12e-62 214
MsG0780036623.01.T01 AT1G51820 36.364 374 221 8 458 825 511 873 6.28e-62 226
MsG0780036623.01.T01 AT3G28690 41.722 302 164 4 504 795 57 356 1.12e-61 215
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MsG0780036623.01.T01 AT4G35600 39.262 298 168 5 508 795 72 366 2.72e-61 214
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MsG0780036623.01.T01 AT1G56720 40.199 301 172 5 500 795 154 451 4.40e-61 215
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MsG0780036623.01.T01 AT1G05700 39.394 297 175 4 510 806 560 851 5.35e-57 211
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MsG0780036623.01.T01 AT2G20300 38.754 289 172 2 508 796 335 618 1.03e-56 209
MsG0780036623.01.T01 AT1G66150 39.262 298 172 5 510 800 576 871 1.21e-56 211
MsG0780036623.01.T01 AT4G21410 33.158 380 225 10 432 790 131 502 1.38e-56 204
MsG0780036623.01.T01 AT1G52290 38.047 297 176 4 510 801 131 424 1.38e-56 203
MsG0780036623.01.T01 AT3G18810 39.735 302 176 4 510 808 325 623 1.57e-56 207
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MsG0780036623.01.T01 AT4G00960 38.028 284 170 5 515 794 49 330 1.81e-56 199
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MsG0780036623.01.T01 AT2G18470 38.411 302 180 3 510 808 272 570 1.47e-54 200
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MsG0780036623.01.T01 AT5G58940 38.333 300 176 5 510 804 135 430 3.32e-54 196
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MsG0780036623.01.T01 AT1G51790 32.134 389 249 8 430 814 487 864 1.24e-53 201
MsG0780036623.01.T01 AT4G05200 34.463 354 214 9 446 791 272 615 1.36e-53 198
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MsG0780036623.01.T01 AT1G48210 38.144 291 170 4 512 795 58 345 1.76e-53 190
MsG0780036623.01.T01 AT1G48210 38.144 291 170 4 512 795 58 345 1.76e-53 190
MsG0780036623.01.T01 AT1G21240 34.711 363 224 6 450 804 337 694 1.86e-53 199
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MsG0780036623.01.T01 AT5G24080 34.104 346 208 8 456 795 344 675 2.26e-53 199
MsG0780036623.01.T01 AT5G24080 34.104 346 208 8 456 795 344 675 2.26e-53 199
MsG0780036623.01.T01 AT2G43690 38.676 287 169 5 510 794 325 606 2.33e-53 197
MsG0780036623.01.T01 AT2G43690 38.676 287 169 5 510 794 325 606 2.33e-53 197
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MsG0780036623.01.T01 AT4G04510 34.054 370 219 11 428 791 255 605 2.47e-51 191
MsG0780036623.01.T01 AT4G17660 36.508 315 187 3 508 813 77 387 2.48e-51 185
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MsG0780036623.01.T01 AT3G62220 38.754 289 167 5 514 795 61 346 2.79e-51 184
MsG0780036623.01.T01 AT3G59350 36.391 327 190 7 484 799 77 396 2.85e-51 186
MsG0780036623.01.T01 AT3G59350 36.391 327 190 7 484 799 77 396 2.85e-51 186
MsG0780036623.01.T01 AT1G48210 42.308 234 126 3 512 738 58 289 2.86e-51 182
MsG0780036623.01.T01 AT1G48210 42.308 234 126 3 512 738 58 289 2.86e-51 182
MsG0780036623.01.T01 AT1G48210 42.308 234 126 3 512 738 58 289 2.86e-51 182
MsG0780036623.01.T01 AT1G26150 43.966 232 122 2 510 738 418 644 3.08e-51 191
MsG0780036623.01.T01 AT3G59350 36.391 327 190 7 484 799 92 411 3.23e-51 186
MsG0780036623.01.T01 AT3G17410 37.716 289 170 5 514 795 61 346 3.26e-51 184
MsG0780036623.01.T01 AT3G17410 37.716 289 170 5 514 795 61 346 3.26e-51 184
MsG0780036623.01.T01 AT1G61390 40.809 272 152 7 510 778 340 605 3.39e-51 191
MsG0780036623.01.T01 AT5G45780 39.865 296 169 6 504 795 283 573 3.47e-51 190
MsG0780036623.01.T01 AT4G23310 38.889 288 170 5 510 794 496 780 3.74e-51 193
MsG0780036623.01.T01 AT2G23950 36.605 377 221 11 426 795 204 569 3.85e-51 191
MsG0780036623.01.T01 AT1G49730 39.362 282 151 6 462 730 258 532 4.19e-51 190
MsG0780036623.01.T01 AT1G70530 40.000 270 146 7 458 721 262 521 4.30e-51 188
MsG0780036623.01.T01 AT1G61370 34.043 376 203 10 467 808 283 647 4.73e-51 191
MsG0780036623.01.T01 AT4G23190 33.923 339 207 9 459 791 216 543 5.00e-51 189
MsG0780036623.01.T01 AT4G23190 33.923 339 207 9 459 791 216 543 5.00e-51 189
MsG0780036623.01.T01 AT1G55610 32.048 415 245 9 422 807 740 1146 5.03e-51 195
MsG0780036623.01.T01 AT1G55610 32.048 415 245 9 422 807 740 1146 5.03e-51 195
MsG0780036623.01.T01 AT3G13380 38.816 304 179 5 508 807 844 1144 5.06e-51 195
MsG0780036623.01.T01 AT4G23130 36.000 325 200 7 473 794 293 612 5.78e-51 191
MsG0780036623.01.T01 AT4G13190 41.667 252 144 2 547 796 8 258 6.81e-51 181
MsG0780036623.01.T01 AT1G31420 35.083 362 226 7 438 795 219 575 7.08e-51 189
MsG0780036623.01.T01 AT1G31420 35.083 362 226 7 438 795 219 575 7.08e-51 189
MsG0780036623.01.T01 AT1G61480 33.598 378 239 7 453 822 422 795 7.18e-51 192
MsG0780036623.01.T01 AT3G53810 34.595 370 225 8 436 800 268 625 7.44e-51 191
MsG0780036623.01.T01 AT3G13690 35.736 333 199 6 508 833 397 721 8.21e-51 191
MsG0780036623.01.T01 AT3G13690 35.736 333 199 6 508 833 397 721 8.21e-51 191
MsG0780036623.01.T01 AT3G13690 35.736 333 199 6 508 833 397 721 8.21e-51 191
MsG0780036623.01.T01 AT4G39400 39.384 292 169 6 508 795 869 1156 8.51e-51 194
MsG0780036623.01.T01 AT1G11340 37.324 284 172 5 510 791 503 782 8.97e-51 192
MsG0780036623.01.T01 AT4G11900 35.207 338 210 6 458 791 404 736 9.15e-51 192
MsG0780036623.01.T01 AT2G01950 34.715 386 206 10 458 807 761 1136 9.93e-51 194
MsG0780036623.01.T01 AT4G03230 40.767 287 159 7 510 791 521 801 1.01e-50 192
MsG0780036623.01.T01 AT4G03230 40.767 287 159 7 510 791 513 793 1.05e-50 192
MsG0780036623.01.T01 AT4G04570 38.488 291 166 8 434 720 101 382 1.08e-50 184
MsG0780036623.01.T01 AT4G03230 40.767 287 159 7 510 791 606 886 1.14e-50 193
MsG0780036623.01.T01 AT4G11900 35.207 338 210 6 458 791 473 805 1.14e-50 192
MsG0780036623.01.T01 AT4G23130 37.847 288 173 6 510 794 332 616 1.18e-50 189
MsG0780036623.01.T01 AT4G03230 40.767 287 159 7 510 791 578 858 1.18e-50 192
MsG0780036623.01.T01 AT4G03230 40.767 287 159 7 510 791 578 858 1.18e-50 192
MsG0780036623.01.T01 AT4G03230 39.032 310 173 8 487 791 502 800 1.21e-50 192
MsG0780036623.01.T01 AT4G02420 32.267 375 233 8 430 795 260 622 1.32e-50 189
MsG0780036623.01.T01 AT4G23190 33.923 339 207 9 459 791 294 621 1.34e-50 189
MsG0780036623.01.T01 AT4G21380 39.860 286 158 8 514 791 518 797 1.34e-50 192
MsG0780036623.01.T01 AT5G12000 36.184 304 173 9 480 776 292 581 1.37e-50 189
MsG0780036623.01.T01 AT1G61370 34.043 376 203 10 467 808 434 798 1.41e-50 191
MsG0780036623.01.T01 AT5G35370 33.247 385 222 9 491 850 487 861 1.46e-50 192
MsG0780036623.01.T01 AT1G61390 40.809 272 152 7 510 778 508 773 1.52e-50 191
MsG0780036623.01.T01 AT1G11303 39.161 286 164 4 510 794 497 773 1.73e-50 191
MsG0780036623.01.T01 AT1G29730 45.070 213 114 2 510 721 628 838 1.73e-50 192
MsG0780036623.01.T01 AT2G43700 34.332 367 210 9 441 800 245 587 1.79e-50 189
MsG0780036623.01.T01 AT2G43700 34.332 367 210 9 441 800 245 587 1.79e-50 189
MsG0780036623.01.T01 AT2G43700 34.332 367 210 9 441 800 245 587 1.79e-50 189

Find 167 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 213 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GTGGCTAAGGTTTCTGATTT+TGG 0.097091 7:+10820575 MsG0780036623.01.T01:CDS
ATTCACTTGGTTTCACTTAT+TGG 0.098196 7:+10820326 MsG0780036623.01.T01:CDS
CTGCCTTAGATGGACGAATT+TGG 0.153082 7:+10818746 MsG0780036623.01.T01:CDS
GCTTCTGGTGCAATGTAATT+TGG 0.160243 7:-10819474 None:intergenic
ACATTGACATTTGTGGTTTC+TGG 0.182329 7:-10818611 None:intergenic
GAAGGAAAAGGAAGTTTAAA+AGG 0.184783 7:-10818642 None:intergenic
GAAAGGTAGTCTTGGGTATT+TGG 0.197060 7:+10820652 MsG0780036623.01.T01:CDS
GGGATATTTGAAAAGGAATT+AGG 0.217289 7:-10818847 None:intergenic
TAAGGATTATGCTGTGACTA+TGG 0.225844 7:+10819731 MsG0780036623.01.T01:CDS
GTTAATTATGCTTTCATTAA+CGG 0.250089 7:+10819162 MsG0780036623.01.T01:CDS
GCTTCTCATTTGGTTTGATT+TGG 0.253701 7:-10819110 None:intergenic
CTTTGTCGCATGTAGTATTC+TGG 0.254469 7:-10820677 None:intergenic
AAAGTGGAATGAATAGAAAT+AGG 0.258299 7:-10821335 None:intergenic
ATACAGGCATGTTACGTAAT+TGG 0.260176 7:+10819358 MsG0780036623.01.T01:CDS
GGAGATACAGACATGGGTTT+TGG 0.273006 7:-10819900 None:intergenic
TCAATCCGAACAAAGATTAA+AGG 0.277207 7:+10821389 MsG0780036623.01.T01:three_prime_UTR
AAATTACTTGTTCCATTGTT+TGG 0.288441 7:-10821255 None:intergenic
GCAGTTAAGTAAACAGCTTC+TGG 0.317749 7:-10819489 None:intergenic
TGCAATAAAACGTCTTAAAC+CGG 0.324089 7:+10820241 MsG0780036623.01.T01:CDS
AGTCTATGTGAATATCTTTA+TGG 0.324957 7:+10820404 MsG0780036623.01.T01:CDS
ATCATAGGGGTTGGAGGGTT+CGG 0.328878 7:+10820179 MsG0780036623.01.T01:CDS
TGCCTTAGATGGACGAATTT+GGG 0.330118 7:+10818747 MsG0780036623.01.T01:CDS
CAAAATATTGATATGAAGTT+GGG 0.333446 7:-10818969 None:intergenic
TCAAAATATTGATATGAAGT+TGG 0.347080 7:-10818970 None:intergenic
GCAGAGGCTTGAGATTCTAT+TGG 0.349107 7:+10820454 MsG0780036623.01.T01:CDS
CTTATTGGATATTGCAATGA+AGG 0.360853 7:+10820341 MsG0780036623.01.T01:CDS
AACCCAAATTCGTCCATCTA+AGG 0.366442 7:-10818749 None:intergenic
ATGTCACTTGATACACTAGA+TGG 0.367966 7:-10819417 None:intergenic
TATACTTGAACGGAATATAA+TGG 0.368357 7:-10821361 None:intergenic
ACAAACAATACTGCCTTAGA+TGG 0.372032 7:+10818736 MsG0780036623.01.T01:CDS
ATGCCTGTATCTTGGTTTGC+TGG 0.375995 7:-10819345 None:intergenic
GCGATGGCTAAACTGTAATC+AGG 0.381250 7:-10818700 None:intergenic
TTCAGTTCTGATTGAATTGG+TGG 0.382881 7:-10821140 None:intergenic
TACGTAACATGCCTGTATCT+TGG 0.386051 7:-10819353 None:intergenic
AAGTCTGATGTGTACTCTTT+CGG 0.392093 7:+10820710 MsG0780036623.01.T01:CDS
TACAGGCATGTTACGTAATT+GGG 0.399847 7:+10819359 MsG0780036623.01.T01:CDS
CTCATTCTAGCATCTGTTGT+TGG 0.400657 7:+10819999 MsG0780036623.01.T01:CDS
TTCTTCAGTTCTGATTGAAT+TGG 0.404929 7:-10821143 None:intergenic
TATACCGTAGGCATAGGTTT+TGG 0.405105 7:-10819807 None:intergenic
CAGAGGCTTGAGATTCTATT+GGG 0.406853 7:+10820455 MsG0780036623.01.T01:CDS
GTTGGTAAAACTTGTTCCTT+GGG 0.407235 7:-10819921 None:intergenic
TAATACCTTTAATCTTTGTT+CGG 0.409873 7:-10821394 None:intergenic
TATCGTGATGTCACGTTGAA+TGG 0.412973 7:+10819828 MsG0780036623.01.T01:CDS
ACATATTGTTGGATGAGAAA+TGG 0.414286 7:+10820552 MsG0780036623.01.T01:CDS
CAGATAACGAACCTCTTACT+TGG 0.416830 7:+10820429 MsG0780036623.01.T01:CDS
AGTTGGTAAAACTTGTTCCT+TGG 0.418699 7:-10819922 None:intergenic
GTTATGTTTAGCTTCTCATT+TGG 0.418954 7:-10819120 None:intergenic
GATTCTATTGGGTGCCGCGC+GGG 0.420568 7:+10820466 MsG0780036623.01.T01:CDS
AAGCTTTGTCGTTAAGAACT+TGG 0.420966 7:-10819281 None:intergenic
TACTTAACTGCAAGAAGTTA+CGG 0.430070 7:+10819501 MsG0780036623.01.T01:CDS
CTGAAATGGAAGAAAGTTCA+TGG 0.430462 7:+10820054 MsG0780036623.01.T01:CDS
TTGCAATGGGATATTTGAAA+AGG 0.438195 7:-10818854 None:intergenic
AAGTGGAATGAATAGAAATA+GGG 0.445177 7:-10821334 None:intergenic
ACGGAATTCTCATACTGAAA+TGG 0.445802 7:+10820040 MsG0780036623.01.T01:CDS
AGCCTCTGCTTCCAAGTAAG+AGG 0.447381 7:-10820440 None:intergenic
TCCTTATGAACAGGAACAAA+AGG 0.451449 7:-10819714 None:intergenic
CATATTGTTGGATGAGAAAT+GGG 0.451587 7:+10820553 MsG0780036623.01.T01:CDS
GTTTGTTGGCACTAAGGAAA+AGG 0.454452 7:+10821024 MsG0780036623.01.T01:CDS
GTGTACAAAGGTTATATTGA+TGG 0.457874 7:+10820206 MsG0780036623.01.T01:CDS
TTGTAAAATAGCGACACAAA+TGG 0.458145 7:-10820112 None:intergenic
CAAAGGATTATAATGTAACT+TGG 0.458986 7:+10819535 MsG0780036623.01.T01:CDS
TTTCAAACATGTTACAATGA+AGG 0.459565 7:+10820815 MsG0780036623.01.T01:CDS
ACAGCATAATCCTTATGAAC+AGG 0.461258 7:-10819723 None:intergenic
GTAAATTGATACGATAATCT+TGG 0.464354 7:-10819236 None:intergenic
CACCTTATCACATCGGCACT+TGG 0.465986 7:-10819681 None:intergenic
TAGTAAGTTTGTTGGCACTA+AGG 0.466290 7:+10821018 MsG0780036623.01.T01:CDS
GAGGAGGATAGTAAGTTTGT+TGG 0.466467 7:+10821010 MsG0780036623.01.T01:CDS
ATTCTATTGGGTGCCGCGCG+GGG 0.466901 7:+10820467 MsG0780036623.01.T01:CDS
TTATCAAAAGTGGGACCGAC+GGG 0.467270 7:+10820599 MsG0780036623.01.T01:CDS
AACAGAGAAAAGTGCAATTG+AGG 0.470975 7:-10818995 None:intergenic
TGGTGTTACATTGACATTTG+TGG 0.471973 7:-10818618 None:intergenic
TTTGTGTAATAGAGAAAAGA+AGG 0.472288 7:-10819204 None:intergenic
AAGGAAAAGGAAGTTTAAAA+GGG 0.472886 7:-10818641 None:intergenic
GTTTGATTGGCATATCAAAC+AGG 0.477992 7:+10819611 MsG0780036623.01.T01:CDS
GAAGTAATAAGAGAAGGAAA+AGG 0.481411 7:-10818654 None:intergenic
GAAGAGTACAAACATATTGT+TGG 0.481672 7:+10820541 MsG0780036623.01.T01:CDS
ATCGTATAATACTCAAACAC+TGG 0.484297 7:+10821288 MsG0780036623.01.T01:three_prime_UTR
AAAACTTCAACCCTTCACTT+TGG 0.485185 7:+10819046 MsG0780036623.01.T01:CDS
TTGGGCTGTTTGCATGATGA+TGG 0.485327 7:+10820920 MsG0780036623.01.T01:CDS
CTTAAACCGGGTTCTCATCA+AGG 0.487827 7:+10820254 MsG0780036623.01.T01:CDS
TGTAAAATAGCGACACAAAT+GGG 0.488108 7:-10820111 None:intergenic
GATTTCCTCCATTGTTGAGT+TGG 0.488931 7:-10819939 None:intergenic
GTTCCAGCAAACCAAGATAC+AGG 0.489926 7:+10819342 MsG0780036623.01.T01:CDS
ATTAGAGTTTGCATTGCAGT+TGG 0.491251 7:+10820979 MsG0780036623.01.T01:CDS
CTATGGTGAAAGGTAGTCTT+GGG 0.492433 7:+10820645 MsG0780036623.01.T01:CDS
AGCATAATTAACATTTGATG+TGG 0.498014 7:-10819151 None:intergenic
CGGAATATAATGGAATAAAG+TGG 0.505290 7:-10821351 None:intergenic
CTTTCACCATAGTGCTGACA+TGG 0.507543 7:-10820634 None:intergenic
GGATGAGAAATGGGTGGCTA+AGG 0.508274 7:+10820562 MsG0780036623.01.T01:CDS
TCCATTGTTTGGAAAATGAA+CGG 0.514726 7:-10821244 None:intergenic
AACCAAGTGCCGATGTGATA+AGG 0.515610 7:+10819679 MsG0780036623.01.T01:CDS
ACTATGGTGAAAGGTAGTCT+TGG 0.518007 7:+10820644 MsG0780036623.01.T01:CDS
TCAACTTCGTCATATTCACT+TGG 0.521872 7:+10820313 MsG0780036623.01.T01:CDS
CAACGATTATCCTCGTTACT+CGG 0.525119 7:+10819383 MsG0780036623.01.T01:CDS
AAGGATTATGCTGTGACTAT+GGG 0.526033 7:+10819732 MsG0780036623.01.T01:CDS
GATTATCGTATCAATTTACC+AGG 0.528957 7:+10819240 MsG0780036623.01.T01:CDS
GGGTTGCATTATCTGCATGC+AGG 0.531214 7:+10820488 MsG0780036623.01.T01:CDS
TACAGTTTAGCCATCGCTTG+TGG 0.531221 7:+10818706 MsG0780036623.01.T01:CDS
GTTGACCCATGTCAGCACTA+TGG 0.536925 7:+10820628 MsG0780036623.01.T01:CDS
TTGTATGAATCAGCAATTAG+AGG 0.537866 7:-10818676 None:intergenic
TTTCGGTGTTGTGCTTCTTG+AGG 0.537997 7:+10820727 MsG0780036623.01.T01:CDS
TATCCAAAGAACGAACCAAA+GGG 0.539238 7:-10820766 None:intergenic
TTAGAGGAAGTAATAAGAGA+AGG 0.539345 7:-10818660 None:intergenic
TGAATAGAAATAGGGCGGAA+TGG 0.542713 7:-10821326 None:intergenic
GTGCGGTTGTGAATTGCAAT+GGG 0.551452 7:-10818867 None:intergenic
TTCTATTGGGTGCCGCGCGG+GGG 0.551498 7:+10820468 MsG0780036623.01.T01:CDS
TGTCGATGAGTGATGTTGTT+GGG 0.555331 7:+10820954 MsG0780036623.01.T01:CDS
GTTATCAAAAGTGGGACCGA+CGG 0.561695 7:+10820598 MsG0780036623.01.T01:CDS
AAAAGGAAAAGAGTGAGCAA+AGG 0.564346 7:+10821041 MsG0780036623.01.T01:CDS
GCATAATTAACATTTGATGT+GGG 0.564585 7:-10819150 None:intergenic
CGTGCGGTTGTGAATTGCAA+TGG 0.566063 7:-10818868 None:intergenic
TCATGATGAAGCCAAAGTGA+AGG 0.578219 7:-10819057 None:intergenic
TCATGGAAGACAAAGAAAGA+AGG 0.582945 7:+10820071 MsG0780036623.01.T01:CDS
ATTACCAAAACCTATGCCTA+CGG 0.590230 7:+10819803 MsG0780036623.01.T01:CDS
CATGATGAAGCCAAAGTGAA+GGG 0.592823 7:-10819056 None:intergenic
CAAATGGGATGGTAAAGTTG+TGG 0.595640 7:-10820096 None:intergenic
GTATGTGAAATTTGAGAGAG+AGG 0.599087 7:-10818893 None:intergenic
ACGGTTTATAGAGTCAATGT+TGG 0.599457 7:+10819309 MsG0780036623.01.T01:CDS
ATTGATGAAATATACTTGAA+CGG 0.600329 7:-10821371 None:intergenic
AGTGTTTGAGTATTATACGA+TGG 0.603017 7:-10821286 None:intergenic
TATTCCGTGTTGTCAAAACC+TGG 0.603079 7:-10819258 None:intergenic
CATGTCAGCACTATGGTGAA+AGG 0.603764 7:+10820635 MsG0780036623.01.T01:CDS
TTTACACCTTGATGAGAACC+CGG 0.604867 7:-10820260 None:intergenic
TGTTTGTACTCTTCACATCA+CGG 0.605808 7:-10820532 None:intergenic
TTACGGAATGTATGAGACAA+AGG 0.607025 7:+10819518 MsG0780036623.01.T01:CDS
AAATAGCGACACAAATGGGA+TGG 0.607490 7:-10820107 None:intergenic
ACCCATGTCTGTATCTCCCA+AGG 0.610352 7:+10819905 MsG0780036623.01.T01:CDS
GAAAAGGAAGTTTAAAAGGG+TGG 0.611970 7:-10818638 None:intergenic
AACCTCTTACTTGGAAGCAG+AGG 0.612984 7:+10820438 MsG0780036623.01.T01:CDS
GATTGGCATATCAAACAGGA+TGG 0.614294 7:+10819615 MsG0780036623.01.T01:CDS
TCACGATATACCGTAGGCAT+AGG 0.615968 7:-10819813 None:intergenic
ATGTCGATGAGTGATGTTGT+TGG 0.617473 7:+10820953 MsG0780036623.01.T01:CDS
TCCTTGGGAGATACAGACAT+GGG 0.618541 7:-10819906 None:intergenic
TGGAATGAATAGAAATAGGG+CGG 0.618754 7:-10821331 None:intergenic
TAACGACAAAGCTTTAGAGA+CGG 0.620010 7:+10819290 MsG0780036623.01.T01:CDS
GCAATAAAACGTCTTAAACC+GGG 0.621085 7:+10820242 MsG0780036623.01.T01:CDS
TGTCACTTGATACACTAGAT+GGG 0.621636 7:-10819416 None:intergenic
TTATCCAAAGAACGAACCAA+AGG 0.623367 7:-10820767 None:intergenic
AGGTGTGGTAATTGAAGAGA+TGG 0.623751 7:+10820835 MsG0780036623.01.T01:CDS
TCCAAAGAACGAACCAAAGG+GGG 0.634303 7:-10820764 None:intergenic
GATTATGCTGTGACTATGGG+CGG 0.635021 7:+10819735 MsG0780036623.01.T01:CDS
CGATGGCTAAACTGTAATCA+GGG 0.635635 7:-10818699 None:intergenic
AACATGTTACAATGAAGGTG+TGG 0.638925 7:+10820820 MsG0780036623.01.T01:CDS
CAAGTGCCGATGTGATAAGG+TGG 0.639455 7:+10819682 MsG0780036623.01.T01:CDS
TTCCTTGGGAGATACAGACA+TGG 0.639542 7:-10819907 None:intergenic
ATTTGAGAGAGAGGCACGTG+CGG 0.639780 7:-10818884 None:intergenic
AGATTCTATTGGGTGCCGCG+CGG 0.644621 7:+10820465 MsG0780036623.01.T01:CDS
GGGTTCGGCAATGTGTACAA+AGG 0.655881 7:+10820194 MsG0780036623.01.T01:CDS
TGTGGTAATTGAAGAGATGG+TGG 0.656157 7:+10820838 MsG0780036623.01.T01:CDS
ATGAAACAGCAACCACAGCA+AGG 0.656159 7:-10819974 None:intergenic
TGTTGATGAGCCACAAGCGA+TGG 0.661470 7:-10818716 None:intergenic
TACGATAATCTTGGTCACTG+AGG 0.663101 7:-10819227 None:intergenic
ACCACTCCACCTTATCACAT+CGG 0.664013 7:-10819688 None:intergenic
TATCAAAAGTGGGACCGACG+GGG 0.674996 7:+10820600 MsG0780036623.01.T01:CDS
TACTCTTTCTCCGAGTAACG+AGG 0.679128 7:-10819393 None:intergenic
GCAGTTGGAGATGAGTGAGG+AGG 0.681127 7:+10820994 MsG0780036623.01.T01:CDS
TTTCACCATAGTGCTGACAT+GGG 0.686954 7:-10820633 None:intergenic
ATCCAAAGAACGAACCAAAG+GGG 0.691676 7:-10820765 None:intergenic
CACTATATAGCAGAAAACAA+AGG 0.692332 7:-10821169 None:intergenic
GTGACATCACGATATACCGT+AGG 0.693080 7:-10819819 None:intergenic
TGGGTCAACGACATCCCCGT+CGG 0.698337 7:-10820614 None:intergenic
GTTTATGACTTCATGCAACG+TGG 0.700524 7:+10820380 MsG0780036623.01.T01:CDS
GCCGATGTGATAAGGTGGAG+TGG 0.701290 7:+10819687 MsG0780036623.01.T01:CDS
ACAAGTAGTAGTGATGACGA+TGG 0.716710 7:+10821109 MsG0780036623.01.T01:CDS
ATTGCAGTTGGAGATGAGTG+AGG 0.730101 7:+10820991 MsG0780036623.01.T01:CDS
ATTGTTGGATGAGAAATGGG+TGG 0.739963 7:+10820556 MsG0780036623.01.T01:CDS
TGCATGATGATGGAAATCAA+CGG 0.754214 7:+10820930 MsG0780036623.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TTTAAAATGTTATTTTCAAA+TGG + Chr7:10820895-10820914 MsG0780036623.01.T01:CDS 10.0%
!!! TGATATTGTTTTTATATGTT+AGG - Chr7:10819452-10819471 None:intergenic 15.0%
!! AGTGATAAAAATAATCTCTT+TGG + Chr7:10819870-10819889 MsG0780036623.01.T01:CDS 20.0%
!! ATTGATGAAATATACTTGAA+CGG - Chr7:10821374-10821393 None:intergenic 20.0%
!! CAAAATATTGATATGAAGTT+GGG - Chr7:10818972-10818991 None:intergenic 20.0%
!! GTTAATTATGCTTTCATTAA+CGG + Chr7:10819162-10819181 MsG0780036623.01.T01:CDS 20.0%
!! TAATACCTTTAATCTTTGTT+CGG - Chr7:10821397-10821416 None:intergenic 20.0%
!! TCAAAATATTGATATGAAGT+TGG - Chr7:10818973-10818992 None:intergenic 20.0%
!!! TCGAAGATATTTTTATCATA+GGG + Chr7:10820165-10820184 MsG0780036623.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTCGAAGATATTTTTATCAT+AGG + Chr7:10820164-10820183 MsG0780036623.01.T01:CDS 20.0%
! AAAGTGGAATGAATAGAAAT+AGG - Chr7:10821338-10821357 None:intergenic 25.0%
! AAATTACTTGTTCCATTGTT+TGG - Chr7:10821258-10821277 None:intergenic 25.0%
! AAGGAAAAGGAAGTTTAAAA+GGG - Chr7:10818644-10818663 None:intergenic 25.0%
! AAGTGGAATGAATAGAAATA+GGG - Chr7:10821337-10821356 None:intergenic 25.0%
! AGCATAATTAACATTTGATG+TGG - Chr7:10819154-10819173 None:intergenic 25.0%
! AGTCTATGTGAATATCTTTA+TGG + Chr7:10820404-10820423 MsG0780036623.01.T01:CDS 25.0%
! CAAAGGATTATAATGTAACT+TGG + Chr7:10819535-10819554 MsG0780036623.01.T01:CDS 25.0%
! GCATAATTAACATTTGATGT+GGG - Chr7:10819153-10819172 None:intergenic 25.0%
! GTAAATTGATACGATAATCT+TGG - Chr7:10819239-10819258 None:intergenic 25.0%
! TATACTTGAACGGAATATAA+TGG - Chr7:10821364-10821383 None:intergenic 25.0%
! TTTCAAACATGTTACAATGA+AGG + Chr7:10820815-10820834 MsG0780036623.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGTGTAATAGAGAAAAGA+AGG - Chr7:10819207-10819226 None:intergenic 25.0%
!! GAATAACAGTTTTTGTTAGA+CGG + Chr7:10820021-10820040 MsG0780036623.01.T01:CDS 25.0%
!! GATTTTCATAGATGATAGTT+TGG + Chr7:10819653-10819672 MsG0780036623.01.T01:CDS 25.0%
!! GTCATAGAATCTTTTATGAA+CGG - Chr7:10820866-10820885 None:intergenic 25.0%
!! TACAATAGCGGAAATAAAAA+CGG + Chr7:10820130-10820149 MsG0780036623.01.T01:CDS 25.0%
!! TACATTTTTGTGAGTTTGAT+TGG + Chr7:10819598-10819617 MsG0780036623.01.T01:CDS 25.0%
!! TCATAGAATCTTTTATGAAC+GGG - Chr7:10820865-10820884 None:intergenic 25.0%
!!! AGAGAATGATTTGTGTTTTT+TGG - Chr7:10818817-10818836 None:intergenic 25.0%
!!! ATGTTATTTTCAAATGGTGT+TGG + Chr7:10820901-10820920 MsG0780036623.01.T01:CDS 25.0%
!!! CGAAGATATTTTTATCATAG+GGG + Chr7:10820166-10820185 MsG0780036623.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGATTCTGCTTTTACTTATA+TGG + Chr7:10819569-10819588 MsG0780036623.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGTTATTTTCAAATGGTGTT+GGG + Chr7:10820902-10820921 MsG0780036623.01.T01:CDS 25.0%
AAATGAAGGCGAAGAAAAAT+AGG - Chr7:10818946-10818965 None:intergenic 30.0%
AACAAAAAAAATCCTTGCTG+TGG + Chr7:10819962-10819981 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
AATGAAGGCGAAGAAAAATA+GGG - Chr7:10818945-10818964 None:intergenic 30.0%
ACATATTGTTGGATGAGAAA+TGG + Chr7:10820552-10820571 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
AGTGTTTGAGTATTATACGA+TGG - Chr7:10821289-10821308 None:intergenic 30.0%
ATCGTATAATACTCAAACAC+TGG + Chr7:10821288-10821307 MsG0780036623.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
ATGAAGTTGGGTAAAAATGA+AGG - Chr7:10818960-10818979 None:intergenic 30.0%
ATTCACTTGGTTTCACTTAT+TGG + Chr7:10820326-10820345 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
CACTATATAGCAGAAAACAA+AGG - Chr7:10821172-10821191 None:intergenic 30.0%
CATATTGTTGGATGAGAAAT+GGG + Chr7:10820553-10820572 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
CTTATTGGATATTGCAATGA+AGG + Chr7:10820341-10820360 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
GAAGGAAAAGGAAGTTTAAA+AGG - Chr7:10818645-10818664 None:intergenic 30.0%
GAAGTAATAAGAGAAGGAAA+AGG - Chr7:10818657-10818676 None:intergenic 30.0%
GATTATCGTATCAATTTACC+AGG + Chr7:10819240-10819259 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
GGATAAGAAAAAAGCAAGTT+TGG + Chr7:10820784-10820803 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
GGGATATTTGAAAAGGAATT+AGG - Chr7:10818850-10818869 None:intergenic 30.0%
GTGTACAAAGGTTATATTGA+TGG + Chr7:10820206-10820225 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
TACTTAACTGCAAGAAGTTA+CGG + Chr7:10819501-10819520 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
TCAATCCGAACAAAGATTAA+AGG + Chr7:10821389-10821408 MsG0780036623.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
TCCATTGTTTGGAAAATGAA+CGG - Chr7:10821247-10821266 None:intergenic 30.0%
TGCAATAAAACGTCTTAAAC+CGG + Chr7:10820241-10820260 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
TGTAAAATAGCGACACAAAT+GGG - Chr7:10820114-10820133 None:intergenic 30.0%
TTAGAGGAAGTAATAAGAGA+AGG - Chr7:10818663-10818682 None:intergenic 30.0%
TTGCAATGGGATATTTGAAA+AGG - Chr7:10818857-10818876 None:intergenic 30.0%
TTGTAAAATAGCGACACAAA+TGG - Chr7:10820115-10820134 None:intergenic 30.0%
TTGTATGAATCAGCAATTAG+AGG - Chr7:10818679-10818698 None:intergenic 30.0%
! AAGTTTTACCAACTCAACAA+TGG + Chr7:10819931-10819950 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
! CGGAATATAATGGAATAAAG+TGG - Chr7:10821354-10821373 None:intergenic 30.0%
! GAAGAGTACAAACATATTGT+TGG + Chr7:10820541-10820560 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
! GTTATGTTTAGCTTCTCATT+TGG - Chr7:10819123-10819142 None:intergenic 30.0%
! TGTCACATTTTACTGATGAA+GGG + Chr7:10821071-10821090 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
! TTCTTCAGTTCTGATTGAAT+TGG - Chr7:10821146-10821165 None:intergenic 30.0%
! TTGTCACATTTTACTGATGA+AGG + Chr7:10821070-10821089 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
!! CTGCTTTTACTTATATGGTA+AGG + Chr7:10819574-10819593 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
!! GATATTTTTATCATAGGGGT+TGG + Chr7:10820170-10820189 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
!! TTAAGACGTTTTATTGCAAC+TGG - Chr7:10820239-10820258 None:intergenic 30.0%
!!! GATTTTGGGTTATCAAAAGT+GGG + Chr7:10820590-10820609 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGATTTTGGGTTATCAAAAG+TGG + Chr7:10820589-10820608 MsG0780036623.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGTGTTTTTTGGTTCAATGA+AGG - Chr7:10818806-10818825 None:intergenic 30.0%
AAAAAGCAAGTTTGGCTGTT+TGG + Chr7:10820792-10820811 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
AAAACTTCAACCCTTCACTT+TGG + Chr7:10819046-10819065 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
AAAAGGAAAAGAGTGAGCAA+AGG + Chr7:10821041-10821060 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
AACATGTTACAATGAAGGTG+TGG + Chr7:10820820-10820839 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
AAGGATTATGCTGTGACTAT+GGG + Chr7:10819732-10819751 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
AAGTCTGATGTGTACTCTTT+CGG + Chr7:10820710-10820729 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
ACAAACAATACTGCCTTAGA+TGG + Chr7:10818736-10818755 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
ACAGCATAATCCTTATGAAC+AGG - Chr7:10819726-10819745 None:intergenic 35.0%
ACATTGACATTTGTGGTTTC+TGG - Chr7:10818614-10818633 None:intergenic 35.0%
ACGGAATTCTCATACTGAAA+TGG + Chr7:10820040-10820059 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
ACGGTTTATAGAGTCAATGT+TGG + Chr7:10819309-10819328 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
ATACAGGCATGTTACGTAAT+TGG + Chr7:10819358-10819377 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
ATGAAGGCGAAGAAAAATAG+GGG - Chr7:10818944-10818963 None:intergenic 35.0%
ATTACCAAAACCTATGCCTA+CGG + Chr7:10819803-10819822 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
ATTAGAGTTTGCATTGCAGT+TGG + Chr7:10820979-10820998 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
CTGAAATGGAAGAAAGTTCA+TGG + Chr7:10820054-10820073 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
GAAAAGGAAGTTTAAAAGGG+TGG - Chr7:10818641-10818660 None:intergenic 35.0%
GCAATAAAACGTCTTAAACC+GGG + Chr7:10820242-10820261 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
GTATGTGAAATTTGAGAGAG+AGG - Chr7:10818896-10818915 None:intergenic 35.0%
GTTTGATTGGCATATCAAAC+AGG + Chr7:10819611-10819630 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
TAAGGATTATGCTGTGACTA+TGG + Chr7:10819731-10819750 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
TACAGGCATGTTACGTAATT+GGG + Chr7:10819359-10819378 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
TATCCAAAGAACGAACCAAA+GGG - Chr7:10820769-10820788 None:intergenic 35.0%
TCAACTTCGTCATATTCACT+TGG + Chr7:10820313-10820332 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
TCATGGAAGACAAAGAAAGA+AGG + Chr7:10820071-10820090 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
TCCTTATGAACAGGAACAAA+AGG - Chr7:10819717-10819736 None:intergenic 35.0%
TGGAATGAATAGAAATAGGG+CGG - Chr7:10821334-10821353 None:intergenic 35.0%
TGTTTGTACTCTTCACATCA+CGG - Chr7:10820535-10820554 None:intergenic 35.0%
TTACGGAATGTATGAGACAA+AGG + Chr7:10819518-10819537 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
TTATCCAAAGAACGAACCAA+AGG - Chr7:10820770-10820789 None:intergenic 35.0%
! AACAGAGAAAAGTGCAATTG+AGG - Chr7:10818998-10819017 None:intergenic 35.0%
! AAGCTTTGTCGTTAAGAACT+TGG - Chr7:10819284-10819303 None:intergenic 35.0%
! ATGTCACTTGATACACTAGA+TGG - Chr7:10819420-10819439 None:intergenic 35.0%
! ATTTTTATCATAGGGGTTGG+AGG + Chr7:10820173-10820192 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
! GTTGGTAAAACTTGTTCCTT+GGG - Chr7:10819924-10819943 None:intergenic 35.0%
! TCCGTTCATTTTCCAAACAA+TGG + Chr7:10821243-10821262 MsG0780036623.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
! TCCTTTTGTTCCTGTTCATA+AGG + Chr7:10819713-10819732 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
! TGGCTAAGGTTTCTGATTTT+GGG + Chr7:10820576-10820595 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
! TGTCACTTGATACACTAGAT+GGG - Chr7:10819419-10819438 None:intergenic 35.0%
! TTCAGTTCTGATTGAATTGG+TGG - Chr7:10821143-10821162 None:intergenic 35.0%
! TTTTACCAACTCAACAATGG+AGG + Chr7:10819934-10819953 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTTATCATAGGGGTTGGA+GGG + Chr7:10820174-10820193 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGGGTTGAAGTTTTCAAGA+AGG - Chr7:10819041-10819060 None:intergenic 35.0%
!! AGGGTTGAAGTTTTCAAGAA+GGG - Chr7:10819040-10819059 None:intergenic 35.0%
!! AGTTGGTAAAACTTGTTCCT+TGG - Chr7:10819925-10819944 None:intergenic 35.0%
!! GCTTCTCATTTGGTTTGATT+TGG - Chr7:10819113-10819132 None:intergenic 35.0%
!! GTGTCGCTATTTTACAATAG+CGG + Chr7:10820118-10820137 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
!! TAACGACAAAGCTTTAGAGA+CGG + Chr7:10819290-10819309 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
!! TAGTAAGTTTGTTGGCACTA+AGG + Chr7:10821018-10821037 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
!! TGCATGATGATGGAAATCAA+CGG + Chr7:10820930-10820949 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
!! TGGTGTTACATTGACATTTG+TGG - Chr7:10818621-10818640 None:intergenic 35.0%
!! TTTACCAGGTTTTGACAACA+CGG + Chr7:10819254-10819273 MsG0780036623.01.T01:CDS 35.0%
AAATAGCGACACAAATGGGA+TGG - Chr7:10820110-10820129 None:intergenic 40.0%
AACCCAAATTCGTCCATCTA+AGG - Chr7:10818752-10818771 None:intergenic 40.0%
ACTATGGTGAAAGGTAGTCT+TGG + Chr7:10820644-10820663 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
AGGTGTGGTAATTGAAGAGA+TGG + Chr7:10820835-10820854 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
ATCCAAAGAACGAACCAAAG+GGG - Chr7:10820768-10820787 None:intergenic 40.0%
ATGTCGATGAGTGATGTTGT+TGG + Chr7:10820953-10820972 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
ATTGTTGGATGAGAAATGGG+TGG + Chr7:10820556-10820575 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
CAAATGGGATGGTAAAGTTG+TGG - Chr7:10820099-10820118 None:intergenic 40.0%
CAACGATTATCCTCGTTACT+CGG + Chr7:10819383-10819402 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
CAGAGGCTTGAGATTCTATT+GGG + Chr7:10820455-10820474 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
CAGATAACGAACCTCTTACT+TGG + Chr7:10820429-10820448 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
CATGATGAAGCCAAAGTGAA+GGG - Chr7:10819059-10819078 None:intergenic 40.0%
CGATGGCTAAACTGTAATCA+GGG - Chr7:10818702-10818721 None:intergenic 40.0%
CTATGGTGAAAGGTAGTCTT+GGG + Chr7:10820645-10820664 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
CTCATTCTAGCATCTGTTGT+TGG + Chr7:10819999-10820018 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
CTTTGTCGCATGTAGTATTC+TGG - Chr7:10820680-10820699 None:intergenic 40.0%
GAGGAGGATAGTAAGTTTGT+TGG + Chr7:10821010-10821029 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
GATTGGCATATCAAACAGGA+TGG + Chr7:10819615-10819634 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
GATTTCCTCCATTGTTGAGT+TGG - Chr7:10819942-10819961 None:intergenic 40.0%
GCAGTTAAGTAAACAGCTTC+TGG - Chr7:10819492-10819511 None:intergenic 40.0%
GCTTCTGGTGCAATGTAATT+TGG - Chr7:10819477-10819496 None:intergenic 40.0%
GTTTATGACTTCATGCAACG+TGG + Chr7:10820380-10820399 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
TACGATAATCTTGGTCACTG+AGG - Chr7:10819230-10819249 None:intergenic 40.0%
TACGTAACATGCCTGTATCT+TGG - Chr7:10819356-10819375 None:intergenic 40.0%
TATCGTGATGTCACGTTGAA+TGG + Chr7:10819828-10819847 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
TATTCCGTGTTGTCAAAACC+TGG - Chr7:10819261-10819280 None:intergenic 40.0%
TCATGATGAAGCCAAAGTGA+AGG - Chr7:10819060-10819079 None:intergenic 40.0%
TGAATAGAAATAGGGCGGAA+TGG - Chr7:10821329-10821348 None:intergenic 40.0%
TGCCTTAGATGGACGAATTT+GGG + Chr7:10818747-10818766 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
TGTCGATGAGTGATGTTGTT+GGG + Chr7:10820954-10820973 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
TGTGGTAATTGAAGAGATGG+TGG + Chr7:10820838-10820857 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
TTTACACCTTGATGAGAACC+CGG - Chr7:10820263-10820282 None:intergenic 40.0%
! ACAAGTAGTAGTGATGACGA+TGG + Chr7:10821109-10821128 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
! GAAAGGTAGTCTTGGGTATT+TGG + Chr7:10820652-10820671 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
! GTGGCTAAGGTTTCTGATTT+TGG + Chr7:10820575-10820594 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
! GTTTGTTGGCACTAAGGAAA+AGG + Chr7:10821024-10821043 MsG0780036623.01.T01:CDS 40.0%
! TATACCGTAGGCATAGGTTT+TGG - Chr7:10819810-10819829 None:intergenic 40.0%
!! TTTCACCATAGTGCTGACAT+GGG - Chr7:10820636-10820655 None:intergenic 40.0%
AACCTCTTACTTGGAAGCAG+AGG + Chr7:10820438-10820457 MsG0780036623.01.T01:CDS 45.0%
ACCACTCCACCTTATCACAT+CGG - Chr7:10819691-10819710 None:intergenic 45.0%
ATGAAACAGCAACCACAGCA+AGG - Chr7:10819977-10819996 None:intergenic 45.0%
ATTGCAGTTGGAGATGAGTG+AGG + Chr7:10820991-10821010 MsG0780036623.01.T01:CDS 45.0%
CATGTCAGCACTATGGTGAA+AGG + Chr7:10820635-10820654 MsG0780036623.01.T01:CDS 45.0%
CTGCCTTAGATGGACGAATT+TGG + Chr7:10818746-10818765 MsG0780036623.01.T01:CDS 45.0%
CTTAAACCGGGTTCTCATCA+AGG + Chr7:10820254-10820273 MsG0780036623.01.T01:CDS 45.0%
GATTATGCTGTGACTATGGG+CGG + Chr7:10819735-10819754 MsG0780036623.01.T01:CDS 45.0%
GCAGAGGCTTGAGATTCTAT+TGG + Chr7:10820454-10820473 MsG0780036623.01.T01:CDS 45.0%
GCGATGGCTAAACTGTAATC+AGG - Chr7:10818703-10818722 None:intergenic 45.0%
GTGACATCACGATATACCGT+AGG - Chr7:10819822-10819841 None:intergenic 45.0%
GTGCGGTTGTGAATTGCAAT+GGG - Chr7:10818870-10818889 None:intergenic 45.0%
GTTATCAAAAGTGGGACCGA+CGG + Chr7:10820598-10820617 MsG0780036623.01.T01:CDS 45.0%
GTTCCAGCAAACCAAGATAC+AGG + Chr7:10819342-10819361 MsG0780036623.01.T01:CDS 45.0%
TACAGTTTAGCCATCGCTTG+TGG + Chr7:10818706-10818725 MsG0780036623.01.T01:CDS 45.0%
TACTCTTTCTCCGAGTAACG+AGG - Chr7:10819396-10819415 None:intergenic 45.0%
TCACGATATACCGTAGGCAT+AGG - Chr7:10819816-10819835 None:intergenic 45.0%
TCCAAAGAACGAACCAAAGG+GGG - Chr7:10820767-10820786 None:intergenic 45.0%
TCCTTGGGAGATACAGACAT+GGG - Chr7:10819909-10819928 None:intergenic 45.0%
TTATCAAAAGTGGGACCGAC+GGG + Chr7:10820599-10820618 MsG0780036623.01.T01:CDS 45.0%
TTCCTTGGGAGATACAGACA+TGG - Chr7:10819910-10819929 None:intergenic 45.0%
TTGGGCTGTTTGCATGATGA+TGG + Chr7:10820920-10820939 MsG0780036623.01.T01:CDS 45.0%
! GGAGATACAGACATGGGTTT+TGG - Chr7:10819903-10819922 None:intergenic 45.0%
!! AACCAAGTGCCGATGTGATA+AGG + Chr7:10819679-10819698 MsG0780036623.01.T01:CDS 45.0%
!! ATGCCTGTATCTTGGTTTGC+TGG - Chr7:10819348-10819367 None:intergenic 45.0%
!! CTTTCACCATAGTGCTGACA+TGG - Chr7:10820637-10820656 None:intergenic 45.0%
!! TTTCGGTGTTGTGCTTCTTG+AGG + Chr7:10820727-10820746 MsG0780036623.01.T01:CDS 45.0%
ACCCATGTCTGTATCTCCCA+AGG + Chr7:10819905-10819924 MsG0780036623.01.T01:CDS 50.0%
AGCCTCTGCTTCCAAGTAAG+AGG - Chr7:10820443-10820462 None:intergenic 50.0%
ATCATAGGGGTTGGAGGGTT+CGG + Chr7:10820179-10820198 MsG0780036623.01.T01:CDS 50.0%
ATTGTGTGCAAGACCCCCTT+TGG + Chr7:10820751-10820770 MsG0780036623.01.T01:CDS 50.0%
CACCTTATCACATCGGCACT+TGG - Chr7:10819684-10819703 None:intergenic 50.0%
CGTGCGGTTGTGAATTGCAA+TGG - Chr7:10818871-10818890 None:intergenic 50.0%
GGATGAGAAATGGGTGGCTA+AGG + Chr7:10820562-10820581 MsG0780036623.01.T01:CDS 50.0%
GGGTTCGGCAATGTGTACAA+AGG + Chr7:10820194-10820213 MsG0780036623.01.T01:CDS 50.0%
GGGTTGCATTATCTGCATGC+AGG + Chr7:10820488-10820507 MsG0780036623.01.T01:CDS 50.0%
GTTGACCCATGTCAGCACTA+TGG + Chr7:10820628-10820647 MsG0780036623.01.T01:CDS 50.0%
TATCAAAAGTGGGACCGACG+GGG + Chr7:10820600-10820619 MsG0780036623.01.T01:CDS 50.0%
! ACCCCCTTTGGTTCGTTCTT+TGG + Chr7:10820763-10820782 MsG0780036623.01.T01:CDS 50.0%
! ATTTGAGAGAGAGGCACGTG+CGG - Chr7:10818887-10818906 None:intergenic 50.0%
! TGTTGATGAGCCACAAGCGA+TGG - Chr7:10818719-10818738 None:intergenic 50.0%
!! CAAGTGCCGATGTGATAAGG+TGG + Chr7:10819682-10819701 MsG0780036623.01.T01:CDS 50.0%
!! GTGGTTTCTGGAGTTTGCCA+TGG - Chr7:10818602-10818621 None:intergenic 50.0%
GCAGTTGGAGATGAGTGAGG+AGG + Chr7:10820994-10821013 MsG0780036623.01.T01:CDS 55.0%
GCCGATGTGATAAGGTGGAG+TGG + Chr7:10819687-10819706 MsG0780036623.01.T01:CDS 55.0%
! AGATTCTATTGGGTGCCGCG+CGG + Chr7:10820465-10820484 MsG0780036623.01.T01:CDS 55.0%
CAGATAATGCAACCCCCGCG+CGG - Chr7:10820483-10820502 None:intergenic 60.0%
TGGGTCAACGACATCCCCGT+CGG - Chr7:10820617-10820636 None:intergenic 60.0%
! ATTCTATTGGGTGCCGCGCG+GGG + Chr7:10820467-10820486 MsG0780036623.01.T01:CDS 60.0%
! GATTCTATTGGGTGCCGCGC+GGG + Chr7:10820466-10820485 MsG0780036623.01.T01:CDS 60.0%
! TTCTATTGGGTGCCGCGCGG+GGG + Chr7:10820468-10820487 MsG0780036623.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 10818601 10821420 10818601 ID=MsG0780036623.01;Name=MsG0780036623.01
Chr7 mRNA 10818601 10821420 10818601 ID=MsG0780036623.01.T01;Parent=MsG0780036623.01;Name=MsG0780036623.01.T01;_AED=0.48;_eAED=0.48;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|231|862
Chr7 exon 10818601 10821420 10818601 ID=MsG0780036623.01.T01:exon:2048;Parent=MsG0780036623.01.T01
Chr7 CDS 10818601 10821189 10818601 ID=MsG0780036623.01.T01:cds;Parent=MsG0780036623.01.T01
Chr7 three_prime_UTR 10821190 10821420 10821190 ID=MsG0780036623.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0780036623.01.T01
Gene Sequence

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