AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880044629.01


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MsG0880044629.01.T01 AT4G23220 55.019 269 111 2 386 644 355 623 4.54e-92 300
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MsG0880044629.01.T01 AT1G61430 28.242 347 203 14 1 308 29 368 2.02e-24 109
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MsG0880044629.01.T01 AT4G23280 56.701 194 82 1 453 644 388 581 1.03e-66 231
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MsG0880044629.01.T01 AT5G40380 44.840 281 140 4 383 650 331 609 6.92e-66 229
MsG0880044629.01.T01 AT1G70530 44.280 271 140 4 384 646 340 607 1.06e-64 226
MsG0880044629.01.T01 AT1G16670 43.798 258 132 3 384 629 58 314 1.28e-64 219
MsG0880044629.01.T01 AT1G67520 50.000 264 111 6 279 524 326 586 3.55e-64 223
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MsG0880044629.01.T01 AT1G53430 47.656 256 123 3 384 629 686 940 1.55e-62 225
MsG0880044629.01.T01 AT1G07650 44.727 275 140 3 384 647 669 942 2.55e-62 224
MsG0880044629.01.T01 AT1G07650 44.727 275 140 3 384 647 695 968 3.19e-62 224
MsG0880044629.01.T01 AT1G07650 44.727 275 140 3 384 647 701 974 3.82e-62 224
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MsG0880044629.01.T01 AT4G21380 29.818 550 284 13 5 453 64 612 9.95e-62 217
MsG0880044629.01.T01 AT4G28670 43.273 275 140 5 384 644 348 620 1.40e-61 217
MsG0880044629.01.T01 AT1G56120 44.238 269 140 4 384 644 727 993 1.87e-61 222
MsG0880044629.01.T01 AT1G56120 44.238 269 140 4 384 644 709 975 2.34e-61 222
MsG0880044629.01.T01 AT4G23210 56.383 188 74 1 384 563 375 562 2.29e-60 213
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MsG0880044629.01.T01 AT1G56130 44.186 258 134 4 384 633 512 767 4.28e-59 214
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MsG0880044629.01.T01 AT1G56130 44.186 258 134 4 384 633 563 818 1.10e-58 213
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MsG0880044629.01.T01 AT4G11890 40.449 267 145 3 384 639 54 317 1.82e-58 201
MsG0880044629.01.T01 AT1G70520 42.049 283 148 4 384 651 342 623 1.97e-58 209
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MsG0880044629.01.T01 AT3G09010 40.234 256 141 4 384 629 63 316 9.24e-58 201
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MsG0880044629.01.T01 AT1G29730 42.308 260 139 3 384 633 657 915 1.64e-57 210
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MsG0880044629.01.T01 AT4G11900 32.389 565 262 21 7 455 66 626 2.96e-57 205
MsG0880044629.01.T01 AT1G53420 42.578 256 136 3 384 629 641 895 3.66e-57 209
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MsG0880044629.01.T01 AT1G29750 41.219 279 152 4 384 652 698 974 9.61e-57 208
MsG0880044629.01.T01 AT1G61860 42.915 247 130 3 392 627 111 357 6.80e-56 195
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MsG0880044629.01.T01 AT1G65800 30.411 559 274 19 2 453 59 609 1.13e-54 197
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MsG0880044629.01.T01 AT1G65790 29.764 551 282 16 3 453 60 605 1.11e-53 195
MsG0880044629.01.T01 AT3G55550 39.080 261 140 5 392 640 372 625 6.79e-53 194
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MsG0880044629.01.T01 AT2G42960 39.382 259 146 3 384 632 200 457 2.32e-51 186
MsG0880044629.01.T01 AT2G42960 39.382 259 146 3 384 632 200 457 2.32e-51 186
MsG0880044629.01.T01 AT2G42960 39.382 259 146 3 384 632 200 457 2.32e-51 186
MsG0880044629.01.T01 AT4G23200 62.416 149 48 1 384 524 353 501 3.82e-51 185
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MsG0880044629.01.T01 AT3G59110 38.610 259 148 3 384 632 207 464 9.61e-51 184
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MsG0880044629.01.T01 AT2G18470 39.068 279 156 5 384 649 301 578 1.10e-50 187
MsG0880044629.01.T01 AT2G18470 39.068 279 156 5 384 649 301 578 1.10e-50 187
MsG0880044629.01.T01 AT4G02630 34.965 286 174 3 384 658 179 463 1.42e-50 184
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MsG0880044629.01.T01 AT1G01540 36.328 256 152 3 384 629 171 425 2.88e-50 182
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MsG0880044629.01.T01 AT4G34440 39.464 261 144 5 384 632 329 587 1.15e-49 184
MsG0880044629.01.T01 AT4G02010 41.406 256 137 4 384 626 397 652 1.50e-49 185
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MsG0880044629.01.T01 AT5G59270 38.577 267 146 8 384 638 369 629 4.76e-49 183
MsG0880044629.01.T01 AT5G59270 38.577 267 146 8 384 638 385 645 5.86e-49 182
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MsG0880044629.01.T01 AT5G18610 37.687 268 156 3 392 648 109 376 7.26e-49 179
MsG0880044629.01.T01 AT3G08870 37.086 302 169 6 340 626 338 633 7.46e-49 182
MsG0880044629.01.T01 AT5G01550 39.286 252 139 3 391 632 405 652 1.16e-48 182
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MsG0880044629.01.T01 AT5G24080 36.129 310 177 8 383 673 414 721 1.24e-48 182
MsG0880044629.01.T01 AT4G13190 38.931 262 149 3 389 639 94 355 1.28e-48 176
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MsG0880044629.01.T01 AT1G09440 36.680 259 153 3 384 632 174 431 1.59e-48 177
MsG0880044629.01.T01 AT1G26150 39.245 265 134 6 384 629 447 703 1.62e-48 182
MsG0880044629.01.T01 AT1G70460 41.016 256 136 6 384 626 370 623 1.79e-48 182
MsG0880044629.01.T01 AT5G01560 37.589 282 156 4 367 632 358 635 1.99e-48 181
MsG0880044629.01.T01 AT4G35600 40.400 250 132 5 392 629 122 366 2.06e-48 176
MsG0880044629.01.T01 AT4G35600 40.400 250 132 5 392 629 121 365 2.34e-48 176
MsG0880044629.01.T01 AT1G56720 35.985 264 158 3 384 637 196 458 2.90e-48 177
MsG0880044629.01.T01 AT1G56720 35.985 264 158 3 384 637 196 458 2.90e-48 177
MsG0880044629.01.T01 AT1G56720 35.985 264 158 3 384 637 196 458 2.90e-48 177
MsG0880044629.01.T01 AT1G56720 35.985 264 158 3 384 637 196 458 2.90e-48 177
MsG0880044629.01.T01 AT5G10530 37.879 264 151 5 392 643 361 623 3.40e-48 180
MsG0880044629.01.T01 AT5G24080 36.129 310 177 8 383 673 541 848 4.94e-48 182
MsG0880044629.01.T01 AT3G17420 36.293 259 154 3 384 632 171 428 5.05e-48 176
MsG0880044629.01.T01 AT5G13160 38.492 252 144 3 389 629 109 360 6.09e-48 175
MsG0880044629.01.T01 AT1G23540 39.608 255 141 5 384 626 388 641 6.58e-48 180
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MsG0880044629.01.T01 AT4G01330 35.547 256 154 3 384 629 179 433 7.50e-48 176
MsG0880044629.01.T01 AT3G58690 37.597 258 145 3 384 626 104 360 7.90e-48 174
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MsG0880044629.01.T01 AT3G13380 39.062 256 144 3 386 629 877 1132 6.14e-45 173
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MsG0880044629.01.T01 AT1G55200 36.822 258 153 4 384 632 396 652 1.39e-44 170
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MsG0880044629.01.T01 AT1G55200 36.822 258 153 4 384 632 396 652 1.39e-44 170
MsG0880044629.01.T01 AT1G55200 36.822 258 153 4 384 632 396 652 1.39e-44 170
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MsG0880044629.01.T01 AT3G45430 39.918 243 136 4 392 626 369 609 2.48e-44 169
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MsG0880044629.01.T01 AT4G13190 45.556 180 89 1 389 559 94 273 3.48e-44 160
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MsG0880044629.01.T01 AT2G43700 34.962 266 155 5 383 632 321 584 5.30e-44 167
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MsG0880044629.01.T01 AT2G35620 37.308 260 151 7 388 639 325 580 2.11e-43 165
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MsG0880044629.01.T01 AT2G02220 36.905 252 148 3 386 627 753 1003 3.94e-43 167
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MsG0880044629.01.T01 AT1G48210 34.351 262 156 3 383 629 84 344 6.08e-43 159
MsG0880044629.01.T01 AT1G48210 34.351 262 156 3 383 629 84 344 6.08e-43 159
MsG0880044629.01.T01 AT5G35580 36.905 252 149 3 387 629 115 365 6.84e-43 162
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MsG0880044629.01.T01 AT3G25560 37.743 257 151 4 384 632 329 584 9.16e-43 164
MsG0880044629.01.T01 AT3G25560 37.743 257 151 4 384 632 330 585 9.50e-43 164
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MsG0880044629.01.T01 AT3G28690 34.657 277 164 4 389 648 58 334 1.78e-42 158
MsG0880044629.01.T01 AT1G69790 36.145 249 147 4 388 627 115 360 1.86e-42 158
MsG0880044629.01.T01 AT2G23950 38.340 253 147 4 388 632 320 571 1.88e-42 163
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MsG0880044629.01.T01 AT4G23210 53.691 149 61 1 384 524 375 523 2.70e-42 161
MsG0880044629.01.T01 AT3G28690 34.532 278 165 4 388 648 106 383 3.07e-42 159
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MsG0880044629.01.T01 AT3G13690 36.047 258 155 4 384 632 428 684 4.69e-42 163
MsG0880044629.01.T01 AT3G13690 36.047 258 155 4 384 632 428 684 4.69e-42 163
MsG0880044629.01.T01 AT1G60800 35.315 286 159 5 384 644 318 602 5.04e-42 162
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MsG0880044629.01.T01 AT4G39400 37.548 261 143 4 384 629 900 1155 5.36e-42 164
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MsG0880044629.01.T01 AT1G07570 36.437 247 145 4 392 627 103 348 6.49e-42 157
MsG0880044629.01.T01 AT1G07570 36.437 247 145 4 392 627 103 348 6.49e-42 157
MsG0880044629.01.T01 AT1G07570 36.437 247 145 4 392 627 103 348 6.49e-42 157
MsG0880044629.01.T01 AT2G43690 33.955 268 166 4 379 637 348 613 6.85e-42 162
MsG0880044629.01.T01 AT2G43690 33.955 268 166 4 379 637 348 613 6.85e-42 162
MsG0880044629.01.T01 AT5G60270 36.719 256 148 7 391 637 368 618 7.24e-42 162
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MsG0880044629.01.T01 AT5G65240 33.333 291 178 6 384 660 301 589 9.22e-42 161
MsG0880044629.01.T01 AT5G10290 34.471 293 172 6 384 660 307 595 9.92e-42 161
MsG0880044629.01.T01 AT5G10290 34.471 293 172 6 384 660 307 595 9.92e-42 161
MsG0880044629.01.T01 AT1G07570 36.437 247 145 4 392 627 114 359 1.01e-41 157
MsG0880044629.01.T01 AT5G42440 38.346 266 142 8 382 629 91 352 1.02e-41 155
MsG0880044629.01.T01 AT1G70450 37.500 256 146 6 384 626 66 320 1.24e-41 156
MsG0880044629.01.T01 AT1G52310 35.686 255 152 3 384 626 285 539 1.24e-41 159
MsG0880044629.01.T01 AT1G72300 34.241 257 158 3 388 634 824 1079 1.46e-41 163
MsG0880044629.01.T01 AT2G01950 36.940 268 143 3 386 627 857 1124 1.57e-41 163
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MsG0880044629.01.T01 AT1G31420 35.714 266 156 7 388 644 327 586 3.47e-41 159
MsG0880044629.01.T01 AT5G37450 36.296 270 156 4 384 642 648 912 3.98e-41 161
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MsG0880044629.01.T01 AT1G21590 34.601 263 161 3 384 636 426 687 2.07e-40 158
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MsG0880044629.01.T01 AT3G45440 35.424 271 160 7 384 643 359 625 2.13e-40 157
MsG0880044629.01.T01 AT1G14370 35.081 248 143 5 392 626 121 363 2.15e-40 153
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MsG0880044629.01.T01 AT1G70250 37.218 266 151 6 391 642 484 747 2.48e-40 158
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MsG0880044629.01.T01 AT2G28930 35.628 247 147 4 392 627 107 352 2.52e-40 153
MsG0880044629.01.T01 AT2G28930 35.600 250 149 4 389 627 101 349 2.64e-40 153
MsG0880044629.01.T01 AT1G24030 34.109 258 155 6 384 626 79 336 2.68e-40 152
MsG0880044629.01.T01 AT3G55450 35.227 264 158 4 388 639 129 391 3.30e-40 153

Find 137 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 236 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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AACTTAAGGCTTGGGATCTT+TGG 0.192664 8:+45904535 MsG0880044629.01.T01:intron
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CGTTTGATATTGGAAGCTTA+TGG 0.203971 8:+45902062 MsG0880044629.01.T01:CDS
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TTTGGAATGGCTAGGATATT+TGG 0.224087 8:+45904032 MsG0880044629.01.T01:CDS
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AACACCTCCATTGATATTAA+TGG 0.267077 8:+45902497 MsG0880044629.01.T01:CDS
TAGATTCCTCTGACCAGTTT+TGG 0.272515 8:-45902097 None:intergenic
GATCTTTGGACCAACGATTC+TGG 0.275120 8:+45904549 MsG0880044629.01.T01:CDS
CGTAGGTATAAGGTCTAAAA+AGG 0.285355 8:+45901572 MsG0880044629.01.T01:CDS
TTTACTGTTATTGCTGTTGC+AGG 0.295034 8:-45902300 None:intergenic
TAGCAATTCTCGTTTGATAT+TGG 0.308135 8:+45902052 MsG0880044629.01.T01:CDS
TACCAAATGACAAGATTGTT+TGG 0.324618 8:+45901595 MsG0880044629.01.T01:CDS
CCCATCCTTGACCAGATCTT+CGG 0.325438 8:-45903602 None:intergenic
AACAATCTTGTTAGACTTCT+CGG 0.329959 8:+45903669 MsG0880044629.01.T01:CDS
GTTTGATATTGGAAGCTTAT+GGG 0.344587 8:+45902063 MsG0880044629.01.T01:CDS
CTAACCAGTTTGGATTGAAT+TGG 0.345548 8:+45901994 MsG0880044629.01.T01:CDS
TCTGGCTCATTGACTCTATC+AGG 0.349953 8:+45901945 MsG0880044629.01.T01:CDS
TCATCAAATTGGAGAGTATA+TGG 0.350707 8:-45901921 None:intergenic
ACCCAAACAATCTTGTCATT+TGG 0.358700 8:-45901597 None:intergenic
TTGATTGACGCTAACCAGTT+TGG 0.364499 8:+45901984 MsG0880044629.01.T01:CDS
AACCATCTGATGCTGAATCT+TGG 0.365395 8:+45902231 MsG0880044629.01.T01:CDS
ACCATCTGATGCTGAATCTT+GGG 0.366186 8:+45902232 MsG0880044629.01.T01:CDS
ATGAGCCAGAATCATCAAAT+TGG 0.371805 8:-45901932 None:intergenic
TTCATCAATATTCTAGGTTC+CGG 0.374405 8:+45903940 MsG0880044629.01.T01:CDS
GGTAACATTCGCCTCATAGA+TGG 0.381128 8:+45901678 MsG0880044629.01.T01:CDS
ACGCTTACAAAACTGAATAA+TGG 0.382465 8:-45903375 None:intergenic
TTCTAGGGTATATTATTGAA+TGG 0.387533 8:+45903552 MsG0880044629.01.T01:intron
TCTAGGGTATATTATTGAAT+GGG 0.389596 8:+45903553 MsG0880044629.01.T01:intron
AGAGTATATGGTCCCTTACT+AGG 0.395477 8:-45901909 None:intergenic
ATAAGTGGCAAGAAGAATAC+TGG 0.395570 8:+45904287 MsG0880044629.01.T01:CDS
ATTATTACCATTAATATCAA+TGG 0.397771 8:-45902504 None:intergenic
GGGTTCTTAAATACCAAAAC+TGG 0.402173 8:+45902084 MsG0880044629.01.T01:CDS
AAATCCGACGTCTTTAGCTT+TGG 0.403098 8:+45904245 MsG0880044629.01.T01:CDS
ACCAAATGACAAGATTGTTT+GGG 0.405183 8:+45901596 MsG0880044629.01.T01:CDS
GCAAATACAAATCGGATTGT+TGG 0.412549 8:+45904071 MsG0880044629.01.T01:CDS
TCTTGGTACTAAATGTTTGT+TGG 0.415641 8:-45904607 None:intergenic
CCATCCTTGACCAGATCTTC+GGG 0.415953 8:-45903601 None:intergenic
CCAAGTACTACGTAGGTATA+AGG 0.418076 8:+45901562 MsG0880044629.01.T01:CDS
AATGCTGGTGGCTTTGGACT+TGG 0.418768 8:-45904729 None:intergenic
TGTTCCAATTCAATCCAAAC+TGG 0.424383 8:-45901998 None:intergenic
GGAGCTAATTGACTCAGAAT+TGG 0.425267 8:+45904575 MsG0880044629.01.T01:CDS
TGTTATTGCTGTTGCAGGAC+AGG 0.425341 8:-45902295 None:intergenic
GACATGGTTGGCCTATCATC+TGG 0.428290 8:-45904666 None:intergenic
GTACCAAGATACGTGAATAT+AGG 0.435772 8:+45904621 MsG0880044629.01.T01:CDS
CGGATTGTCTGTGGCACACT+TGG 0.439863 8:-45902144 None:intergenic
AACGCTGAGGATGTAACAAA+TGG 0.445733 8:-45901639 None:intergenic
GTCTAACAAGATTGTTATGT+TGG 0.449563 8:-45903662 None:intergenic
TCTGATGTTGTATCAATGTT+TGG 0.453725 8:+45904687 MsG0880044629.01.T01:CDS
CCTTATACCTACGTAGTACT+TGG 0.457532 8:-45901562 None:intergenic
GGCCTTCCATTGCATATTCA+GGG 0.460411 8:-45904211 None:intergenic
GATGAAGATAAAGCAGTCCT+TGG 0.461498 8:-45903923 None:intergenic
AGTCCTATATTCACGTATCT+TGG 0.468023 8:-45904624 None:intergenic
AAGAGCTTGCGGATTACAAA+TGG 0.471335 8:-45902180 None:intergenic
ACACTTCGTTAATGCAATCA+TGG 0.473609 8:+45901871 MsG0880044629.01.T01:CDS
AAAAGGCTATCCCGAAGATC+TGG 0.475071 8:+45903591 MsG0880044629.01.T01:CDS
AACTCTGCCACAAGATCGCC+TGG 0.479014 8:-45901803 None:intergenic
TTAGATCTCGATGAATGATC+CGG 0.486364 8:-45903959 None:intergenic
GAGTGAAGATGACCCTAGTA+AGG 0.487866 8:+45901896 MsG0880044629.01.T01:CDS
GTCAGAGGAATCTAAGAGTT+GGG 0.488811 8:+45902106 MsG0880044629.01.T01:CDS
AGCTTCAAGCAAATACAAAT+CGG 0.490184 8:+45904063 MsG0880044629.01.T01:CDS
TTCAACAAAGTCCAGATGAT+AGG 0.493826 8:+45904655 MsG0880044629.01.T01:CDS
GACCCTTGTCAATGTCTCGA+TGG 0.497503 8:+45902203 MsG0880044629.01.T01:CDS
TAGTATCTACGCAACTCTCT+TGG 0.503866 8:+45901746 MsG0880044629.01.T01:CDS
TGCGTACGAGCAGGTGGATA+CGG 0.504914 8:+45902364 MsG0880044629.01.T01:CDS
AAACGAGAATTGCTATCAGT+TGG 0.506173 8:-45902044 None:intergenic
CCCGAAGATCTGGTCAAGGA+TGG 0.509035 8:+45903601 MsG0880044629.01.T01:CDS
TAGAGTTGTTCACCAGTACC+AGG 0.510239 8:-45901779 None:intergenic
TCCAGGCAAAAGGGTGTCTG+AGG 0.524846 8:-45901835 None:intergenic
CTAGGGTATATTATTGAATG+GGG 0.525553 8:+45903554 MsG0880044629.01.T01:intron
CGTCGGATTTAACTGAGAAA+AGG 0.525773 8:-45904232 None:intergenic
TCTCTTGGACACAGGAAACC+TGG 0.526499 8:+45901761 MsG0880044629.01.T01:CDS
ACAGGTCAGATGGATGTGTC+AGG 0.534547 8:+45902264 MsG0880044629.01.T01:CDS
ACCACCTCATGCGTACGAGC+AGG 0.534994 8:+45902355 MsG0880044629.01.T01:CDS
GGGCTGGGAGACAGGTCAGA+TGG 0.535798 8:+45902254 MsG0880044629.01.T01:CDS
GGGGTGAGGTTGCTGTGAAA+AGG 0.538859 8:+45903574 MsG0880044629.01.T01:CDS
TGCTCGTACGCATGAGGTGG+TGG 0.539746 8:-45902353 None:intergenic
TGGTGGCTTTGGACTTGGAA+GGG 0.542988 8:-45904724 None:intergenic
TTTGATATTGGAAGCTTATG+GGG 0.543001 8:+45902064 MsG0880044629.01.T01:CDS
ATTCATGCCCAATAAAAGCT+TGG 0.543734 8:+45903731 MsG0880044629.01.T01:CDS
GGTCAGAGGAATCTAAGAGT+TGG 0.544538 8:+45902105 MsG0880044629.01.T01:CDS
TAGCTCCATTCCAGAATCGT+TGG 0.550553 8:-45904559 None:intergenic
TTGAATTGGAACAAGGATAA+CGG 0.555383 8:+45902008 MsG0880044629.01.T01:CDS
ACACGGGTTCGAATAATTGA+AGG 0.555665 8:+45903894 MsG0880044629.01.T01:CDS
GGATGCTAGATTGGGGAACA+CGG 0.557345 8:+45903877 MsG0880044629.01.T01:intron
GAGTATATGGTCCCTTACTA+GGG 0.557445 8:-45901908 None:intergenic
GGACACAGGAAACCTGGTAC+TGG 0.557743 8:+45901767 MsG0880044629.01.T01:CDS
CCATCTGATGCTGAATCTTG+GGG 0.558193 8:+45902233 MsG0880044629.01.T01:CDS
GCGTATTATCTCCATCTATG+AGG 0.558782 8:-45901689 None:intergenic
TTGGACCAACGATTCTGGAA+TGG 0.561498 8:+45904554 MsG0880044629.01.T01:CDS
GCGAATGTTACCATTGTGAA+TGG 0.561889 8:-45901667 None:intergenic
CTGGTGGCTTTGGACTTGGA+AGG 0.562235 8:-45904725 None:intergenic
CCCCAAGATTCAGCATCAGA+TGG 0.562791 8:-45902233 None:intergenic
ATGAAGATAAAGCAGTCCTT+GGG 0.567739 8:-45903922 None:intergenic
CACTTCGTTAATGCAATCAT+GGG 0.573576 8:+45901872 MsG0880044629.01.T01:CDS
CCGAAGATCTGGTCAAGGAT+GGG 0.574869 8:+45903602 MsG0880044629.01.T01:CDS
ACGCTGAGGATGTAACAAAT+GGG 0.576690 8:-45901638 None:intergenic
TACGCAACTCTCTTGGACAC+AGG 0.579026 8:+45901753 MsG0880044629.01.T01:CDS
CCAGGCAAAAGGGTGTCTGA+GGG 0.579494 8:-45901834 None:intergenic
TCCCCTGAATATGCAATGGA+AGG 0.581737 8:+45904209 MsG0880044629.01.T01:CDS
ATGATATTTCCACAACATGC+AGG 0.587553 8:-45902459 None:intergenic
TGACAAGGGTCAAGAGCTTG+CGG 0.598346 8:-45902191 None:intergenic
ATTACCATTAATATCAATGG+AGG 0.599064 8:-45902501 None:intergenic
CATGTCCCCTGAATATGCAA+TGG 0.600275 8:+45904205 MsG0880044629.01.T01:CDS
TAGGGTATATTATTGAATGG+GGG 0.601369 8:+45903555 MsG0880044629.01.T01:intron
ACCTGCTCGTACGCATGAGG+TGG 0.602430 8:-45902356 None:intergenic
ATGGAGGTGTTCTTGAGAGT+CGG 0.604558 8:-45902485 None:intergenic
ACTCTAACCAGGCGATCTTG+TGG 0.606608 8:+45901796 MsG0880044629.01.T01:CDS
CATTGATACAACATCAGACA+TGG 0.607136 8:-45904682 None:intergenic
GTTTGGATTGAATTGGAACA+AGG 0.607145 8:+45902001 MsG0880044629.01.T01:CDS
TTGACGGTACCTGCATGTTG+TGG 0.610146 8:+45902450 MsG0880044629.01.T01:CDS
ACCTCATGCGTACGAGCAGG+TGG 0.622026 8:+45902358 MsG0880044629.01.T01:CDS
GCCTTCCATTGCATATTCAG+GGG 0.624854 8:-45904210 None:intergenic
GATGCTAGATTGGGGAACAC+GGG 0.625247 8:+45903878 MsG0880044629.01.T01:intron
TAGATTCTTGAATATGTCAG+TGG 0.632184 8:+45902325 MsG0880044629.01.T01:CDS
TCCACCTGCTCGTACGCATG+AGG 0.636558 8:-45902359 None:intergenic
ACTGGTGAACAACTCTAACC+AGG 0.637836 8:+45901785 MsG0880044629.01.T01:CDS
CGTAGCAGACAAGAGCACAA+AGG 0.640183 8:+45903329 MsG0880044629.01.T01:CDS
TAAATACCAAAACTGGTCAG+AGG 0.640707 8:+45902091 MsG0880044629.01.T01:CDS
CTATCCCGAAGATCTGGTCA+AGG 0.644491 8:+45903597 MsG0880044629.01.T01:CDS
GATACAACATCAGACATGGT+TGG 0.646414 8:-45904678 None:intergenic
AGTGAAGATGACCCTAGTAA+GGG 0.648185 8:+45901897 MsG0880044629.01.T01:CDS
CCAGCATTTCAAAATGTGAG+AGG 0.651348 8:+45904744 MsG0880044629.01.T01:CDS
AAGATCTGGTCAAGGATGGG+AGG 0.659059 8:+45903605 MsG0880044629.01.T01:CDS
ATAATTGAAGGAATTGCCCA+AGG 0.663576 8:+45903906 MsG0880044629.01.T01:CDS
AACTCCAAAGCTAAAGACGT+CGG 0.665068 8:-45904249 None:intergenic
CATCTGATGCTGAATCTTGG+GGG 0.689744 8:+45902234 MsG0880044629.01.T01:CDS
CAGGCAAAAGGGTGTCTGAG+GGG 0.691073 8:-45901833 None:intergenic
AAACCATCGAGACATTGACA+AGG 0.707319 8:-45902206 None:intergenic
AACCATCGAGACATTGACAA+GGG 0.712727 8:-45902205 None:intergenic
ATGTAACAAATGGGTACACG+AGG 0.717230 8:-45901629 None:intergenic
GCGTTGCTAACCATTCACAA+TGG 0.726213 8:+45901657 MsG0880044629.01.T01:CDS
AACTCGACCAAGTACTACGT+AGG 0.739337 8:+45901555 MsG0880044629.01.T01:CDS
TGTGCCACAGACAATCCGTG+TGG 0.740829 8:+45902149 MsG0880044629.01.T01:CDS
GTGAATGGTTAGCAACGCTG+AGG 0.762231 8:-45901652 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TATATAAGCTAAATATTTAT+AGG + Chr8:45902690-45902709 MsG0880044629.01.T01:intron 10.0%
!!! AGATAGATAATATTTTTATT+AGG - Chr8:45904483-45904502 None:intergenic 10.0%
!! ATAATAGTATAAAGTGTAAA+TGG - Chr8:45903511-45903530 None:intergenic 15.0%
!! ATATAAATGAAAGATGTAAT+TGG - Chr8:45902675-45902694 None:intergenic 15.0%
!! ATTATTACCATTAATATCAA+TGG - Chr8:45902507-45902526 None:intergenic 15.0%
!! ATTTGTATCTGAAAAATTAT+TGG - Chr8:45903412-45903431 None:intergenic 15.0%
!! AAAATCATGTATCCTATTAT+TGG - Chr8:45902630-45902649 None:intergenic 20.0%
!! AACTAACATATGTGTTAATA+AGG + Chr8:45902792-45902811 MsG0880044629.01.T01:intron 20.0%
!! ATAATTCATTGCAATTACTT+TGG - Chr8:45902949-45902968 None:intergenic 20.0%
!! ATCAATCAACTTATTATTGT+TGG + Chr8:45904170-45904189 MsG0880044629.01.T01:intron 20.0%
!! TTTATCTTCATCAATATTCT+AGG + Chr8:45903934-45903953 MsG0880044629.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATCCTAAAATATCAGATTT+TGG + Chr8:45904014-45904033 MsG0880044629.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATACATGATTTTATTTAGCT+TGG + Chr8:45902638-45902657 MsG0880044629.01.T01:intron 20.0%
!!! ATCTATCTATGTGATAATTT+TGG + Chr8:45904495-45904514 MsG0880044629.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTCCAAAATCTGATATTTT+AGG - Chr8:45904020-45904039 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTTGAAGCAATTTTTCAT+TGG - Chr8:45904138-45904157 None:intergenic 20.0%
!!! TAAAATATCAGATTTTGGAA+TGG + Chr8:45904019-45904038 MsG0880044629.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATGCTTATGATTATTTTGA+CGG + Chr8:45902434-45902453 MsG0880044629.01.T01:CDS 20.0%
!!! TCTATCTATGTGATAATTTT+GGG + Chr8:45904496-45904515 MsG0880044629.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTCAGATACAAATAAACT+TGG + Chr8:45903417-45903436 MsG0880044629.01.T01:intron 20.0%
! AAAAGAATATGTAATGCCAA+TGG + Chr8:45902920-45902939 MsG0880044629.01.T01:intron 25.0%
! AAACAAATGCTGTAAAAAGA+AGG + Chr8:45903856-45903875 MsG0880044629.01.T01:intron 25.0%
! AATGATGTCATTAATCATGT+AGG - Chr8:45902899-45902918 None:intergenic 25.0%
! ATTACCATTAATATCAATGG+AGG - Chr8:45902504-45902523 None:intergenic 25.0%
! GAGAAAGATAACATGATAAA+GGG - Chr8:45902604-45902623 None:intergenic 25.0%
! TACAACTTCATTTATTGCTT+TGG + Chr8:45903185-45903204 MsG0880044629.01.T01:intron 25.0%
! TGAGAAAGATAACATGATAA+AGG - Chr8:45902605-45902624 None:intergenic 25.0%
! TTATAGGCAAAATTGATAAG+AGG + Chr8:45902706-45902725 MsG0880044629.01.T01:intron 25.0%
! TTCAATAATATACCCTAGAA+AGG - Chr8:45903552-45903571 None:intergenic 25.0%
!! CTTTTGTTAGAGATTATAAG+TGG + Chr8:45904272-45904291 MsG0880044629.01.T01:CDS 25.0%
!! TCTAGGGTATATTATTGAAT+GGG + Chr8:45903553-45903572 MsG0880044629.01.T01:intron 25.0%
!!! CTATTATTTCTTTTACTGCT+TGG + Chr8:45903068-45903087 MsG0880044629.01.T01:intron 25.0%
!!! CTTATTATTGTTGGTTTTAG+TGG + Chr8:45904179-45904198 MsG0880044629.01.T01:intron 25.0%
!!! CTTTACTTGTTGATAACTTA+AGG + Chr8:45904521-45904540 MsG0880044629.01.T01:intron 25.0%
!!! GATTTGCTAAATTTTGAAGT+GGG + Chr8:45903276-45903295 MsG0880044629.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGATATTTTAGGATTCATGT+TGG - Chr8:45904009-45904028 None:intergenic 25.0%
!!! TGATTTGCTAAATTTTGAAG+TGG + Chr8:45903275-45903294 MsG0880044629.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTCTAGGGTATATTATTGAA+TGG + Chr8:45903552-45903571 MsG0880044629.01.T01:intron 25.0%
AAAAAGAAGGATGCTAGATT+GGG + Chr8:45903869-45903888 MsG0880044629.01.T01:intron 30.0%
AAAGATGTCACAACTAGATT+CGG - Chr8:45903829-45903848 None:intergenic 30.0%
AACAATCTTGTTAGACTTCT+CGG + Chr8:45903669-45903688 MsG0880044629.01.T01:CDS 30.0%
AACACCTCCATTGATATTAA+TGG + Chr8:45902497-45902516 MsG0880044629.01.T01:CDS 30.0%
ACCAAATGACAAGATTGTTT+GGG + Chr8:45901596-45901615 MsG0880044629.01.T01:CDS 30.0%
ACGCTTACAAAACTGAATAA+TGG - Chr8:45903378-45903397 None:intergenic 30.0%
AGACCAATTCAGTTGAATTT+AGG - Chr8:45904357-45904376 None:intergenic 30.0%
AGATTCGGAGTTATAATGAA+TGG - Chr8:45903814-45903833 None:intergenic 30.0%
AGCTTCAAGCAAATACAAAT+CGG + Chr8:45904063-45904082 MsG0880044629.01.T01:CDS 30.0%
ATCTTTCTCATGCCAATAAT+AGG + Chr8:45902615-45902634 MsG0880044629.01.T01:intron 30.0%
CTAGGGTATATTATTGAATG+GGG + Chr8:45903554-45903573 MsG0880044629.01.T01:intron 30.0%
GAACGATTCAACCAATTAAA+AGG + Chr8:45902824-45902843 MsG0880044629.01.T01:intron 30.0%
GTACCTAAATTCAACTGAAT+TGG + Chr8:45904351-45904370 MsG0880044629.01.T01:intron 30.0%
GTCTAACAAGATTGTTATGT+TGG - Chr8:45903665-45903684 None:intergenic 30.0%
GTTTGATATTGGAAGCTTAT+GGG + Chr8:45902063-45902082 MsG0880044629.01.T01:CDS 30.0%
TAAAAAGAAGGATGCTAGAT+TGG + Chr8:45903868-45903887 MsG0880044629.01.T01:intron 30.0%
TAACATGATAAAGGGAAAGT+AGG - Chr8:45902596-45902615 None:intergenic 30.0%
TACCAAATGACAAGATTGTT+TGG + Chr8:45901595-45901614 MsG0880044629.01.T01:CDS 30.0%
TAGATTCTTGAATATGTCAG+TGG + Chr8:45902325-45902344 MsG0880044629.01.T01:CDS 30.0%
TAGCAATTCTCGTTTGATAT+TGG + Chr8:45902052-45902071 MsG0880044629.01.T01:CDS 30.0%
TAGGGTATATTATTGAATGG+GGG + Chr8:45903555-45903574 MsG0880044629.01.T01:intron 30.0%
TCTGATGTTGTATCAATGTT+TGG + Chr8:45904687-45904706 MsG0880044629.01.T01:CDS 30.0%
TCTTCAGATTCTAATCCAAT+TGG + Chr8:45902990-45903009 MsG0880044629.01.T01:intron 30.0%
TCTTGGTACTAAATGTTTGT+TGG - Chr8:45904610-45904629 None:intergenic 30.0%
TTAGAATCTGAAGAAGAGAA+TGG - Chr8:45902984-45903003 None:intergenic 30.0%
TTCATCAATATTCTAGGTTC+CGG + Chr8:45903940-45903959 MsG0880044629.01.T01:CDS 30.0%
TTGAATTGGAACAAGGATAA+CGG + Chr8:45902008-45902027 MsG0880044629.01.T01:CDS 30.0%
TTTGATATTGGAAGCTTATG+GGG + Chr8:45902064-45902083 MsG0880044629.01.T01:CDS 30.0%
! AAAACAGTCCAAGCTTTTAT+TGG - Chr8:45903742-45903761 None:intergenic 30.0%
! AAACAGTCCAAGCTTTTATT+GGG - Chr8:45903741-45903760 None:intergenic 30.0%
! AATCTAGTTGTGACATCTTT+TGG + Chr8:45903829-45903848 MsG0880044629.01.T01:intron 30.0%
! AATTTTCATTCCAGGCAAAA+GGG - Chr8:45901847-45901866 None:intergenic 30.0%
! AATTTTTATCTCAAGCTTGC+TGG + Chr8:45902536-45902555 MsG0880044629.01.T01:CDS 30.0%
! ATTGCTTTGGATATCTGTTA+TGG + Chr8:45903198-45903217 MsG0880044629.01.T01:intron 30.0%
! CAAATGGAAAATTTTCCACA+CGG - Chr8:45902167-45902186 None:intergenic 30.0%
! CTTACAACTTTTCCTTTCTA+GGG + Chr8:45903537-45903556 MsG0880044629.01.T01:intron 30.0%
! GAAGAAAACTTTTCTGTGAA+TGG + Chr8:45904798-45904817 MsG0880044629.01.T01:CDS 30.0%
! TCATCAAATTGGAGAGTATA+TGG - Chr8:45901924-45901943 None:intergenic 30.0%
! TCTTACAACTTTTCCTTTCT+AGG + Chr8:45903536-45903555 MsG0880044629.01.T01:intron 30.0%
! TTTGGTTGATGTGATAAGTT+GGG - Chr8:45903234-45903253 None:intergenic 30.0%
!! TTGTTGATAACTTAAGGCTT+GGG + Chr8:45904527-45904546 MsG0880044629.01.T01:intron 30.0%
!!! TATTTTAGGATTCATGTTGG+TGG - Chr8:45904006-45904025 None:intergenic 30.0%
!!! TCTGTTGGTAACCTTTTAAT+TGG - Chr8:45902838-45902857 None:intergenic 30.0%
AAAAGAAGGATGCTAGATTG+GGG + Chr8:45903870-45903889 MsG0880044629.01.T01:intron 35.0%
AAACGAGAATTGCTATCAGT+TGG - Chr8:45902047-45902066 None:intergenic 35.0%
ACAAGCTCTTTCAATCTTCT+TGG + Chr8:45904320-45904339 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
ACACTTCGTTAATGCAATCA+TGG + Chr8:45901871-45901890 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
ACCCAAACAATCTTGTCATT+TGG - Chr8:45901600-45901619 None:intergenic 35.0%
ACTAGAAAGCAAAGGAGAAA+TGG + Chr8:45903107-45903126 MsG0880044629.01.T01:intron 35.0%
AGTCCTATATTCACGTATCT+TGG - Chr8:45904627-45904646 None:intergenic 35.0%
AGTGAAGAGAATTGTTCTGT+TGG - Chr8:45902853-45902872 None:intergenic 35.0%
ATAAGTGGCAAGAAGAATAC+TGG + Chr8:45904287-45904306 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
ATAATTGAAGGAATTGCCCA+AGG + Chr8:45903906-45903925 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
ATGAAGATAAAGCAGTCCTT+GGG - Chr8:45903925-45903944 None:intergenic 35.0%
ATGAGCCAGAATCATCAAAT+TGG - Chr8:45901935-45901954 None:intergenic 35.0%
ATGATATTTCCACAACATGC+AGG - Chr8:45902462-45902481 None:intergenic 35.0%
ATTCATGCCCAATAAAAGCT+TGG + Chr8:45903731-45903750 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
CAATTGGAAGACATGGAAAA+GGG + Chr8:45903006-45903025 MsG0880044629.01.T01:intron 35.0%
CACTTCGTTAATGCAATCAT+GGG + Chr8:45901872-45901891 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
CATTGATACAACATCAGACA+TGG - Chr8:45904685-45904704 None:intergenic 35.0%
CCAAACTCTTCAAATTTCGT+AGG + Chr8:45903249-45903268 MsG0880044629.01.T01:intron 35.0%
CCTACGAAATTTGAAGAGTT+TGG - Chr8:45903252-45903271 None:intergenic 35.0%
CGTAGGTATAAGGTCTAAAA+AGG + Chr8:45901572-45901591 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
CGTTTGATATTGGAAGCTTA+TGG + Chr8:45902062-45902081 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
CTAACCAGTTTGGATTGAAT+TGG + Chr8:45901994-45902013 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
GATACAAATAAACTTGGCGA+AGG + Chr8:45903423-45903442 MsG0880044629.01.T01:intron 35.0%
GCAAATACAAATCGGATTGT+TGG + Chr8:45904071-45904090 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
GGGTTCTTAAATACCAAAAC+TGG + Chr8:45902084-45902103 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
GTACCAAGATACGTGAATAT+AGG + Chr8:45904621-45904640 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
GTTTGGATTGAATTGGAACA+AGG + Chr8:45902001-45902020 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
TAAATACCAAAACTGGTCAG+AGG + Chr8:45902091-45902110 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
TATATTATTGAATGGGGGTG+AGG + Chr8:45903560-45903579 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
TCTAATCCAATTGGAAGACA+TGG + Chr8:45902999-45903018 MsG0880044629.01.T01:intron 35.0%
TGTTCCAATTCAATCCAAAC+TGG - Chr8:45902001-45902020 None:intergenic 35.0%
TTAGATCTCGATGAATGATC+CGG - Chr8:45903962-45903981 None:intergenic 35.0%
TTCAACAAAGTCCAGATGAT+AGG + Chr8:45904655-45904674 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
TTCTAGTCCGGTAAACAAAT+AGG - Chr8:45903094-45903113 None:intergenic 35.0%
! AAGTTTTCTTCTATGCGTGT+AGG - Chr8:45904789-45904808 None:intergenic 35.0%
! ACTCTCCAATTTGATGATTC+TGG + Chr8:45901927-45901946 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
! ACTTATCGCAAGTAAGTTGA+AGG + Chr8:45902568-45902587 MsG0880044629.01.T01:intron 35.0%
! AGTTTTCTTCTATGCGTGTA+GGG - Chr8:45904788-45904807 None:intergenic 35.0%
! CAATTTTCATTCCAGGCAAA+AGG - Chr8:45901848-45901867 None:intergenic 35.0%
! CTTTTGCCTGGAATGAAAAT+TGG + Chr8:45901846-45901865 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
! GTGTTTCCAATTTTCATTCC+AGG - Chr8:45901855-45901874 None:intergenic 35.0%
! GTTTGGTTGATGTGATAAGT+TGG - Chr8:45903235-45903254 None:intergenic 35.0%
! TTTACTGTTATTGCTGTTGC+AGG - Chr8:45902303-45902322 None:intergenic 35.0%
! TTTGGAATGGCTAGGATATT+TGG + Chr8:45904032-45904051 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTGTTGATAACTTAAGGCT+TGG + Chr8:45904526-45904545 MsG0880044629.01.T01:intron 35.0%
!!! TATCAGATTTTGGAATGGCT+AGG + Chr8:45904024-45904043 MsG0880044629.01.T01:CDS 35.0%
AAACCATCGAGACATTGACA+AGG - Chr8:45902209-45902228 None:intergenic 40.0%
AACCATCGAGACATTGACAA+GGG - Chr8:45902208-45902227 None:intergenic 40.0%
AACCATCTGATGCTGAATCT+TGG + Chr8:45902231-45902250 MsG0880044629.01.T01:CDS 40.0%
AACGCTGAGGATGTAACAAA+TGG - Chr8:45901642-45901661 None:intergenic 40.0%
AACTCCAAAGCTAAAGACGT+CGG - Chr8:45904252-45904271 None:intergenic 40.0%
AACTTAAGGCTTGGGATCTT+TGG + Chr8:45904535-45904554 MsG0880044629.01.T01:intron 40.0%
ACAAATAAACTTGGCGAAGG+TGG + Chr8:45903426-45903445 MsG0880044629.01.T01:intron 40.0%
ACACGGGTTCGAATAATTGA+AGG + Chr8:45903894-45903913 MsG0880044629.01.T01:CDS 40.0%
ACCATCTGATGCTGAATCTT+GGG + Chr8:45902232-45902251 MsG0880044629.01.T01:CDS 40.0%
ACGCTGAGGATGTAACAAAT+GGG - Chr8:45901641-45901660 None:intergenic 40.0%
AGAGTATATGGTCCCTTACT+AGG - Chr8:45901912-45901931 None:intergenic 40.0%
AGTGAAGATGACCCTAGTAA+GGG + Chr8:45901897-45901916 MsG0880044629.01.T01:CDS 40.0%
ATAAGAGGCAGAAAACACAC+TGG + Chr8:45902721-45902740 MsG0880044629.01.T01:intron 40.0%
ATGTAACAAATGGGTACACG+AGG - Chr8:45901632-45901651 None:intergenic 40.0%
CCAAGTACTACGTAGGTATA+AGG + Chr8:45901562-45901581 MsG0880044629.01.T01:CDS 40.0%
CCAATTGGAAGACATGGAAA+AGG + Chr8:45903005-45903024 MsG0880044629.01.T01:intron 40.0%
CCAGCATTTCAAAATGTGAG+AGG + Chr8:45904744-45904763 MsG0880044629.01.T01:CDS 40.0%
CCTTATACCTACGTAGTACT+TGG - Chr8:45901565-45901584 None:intergenic 40.0%
CGTCGGATTTAACTGAGAAA+AGG - Chr8:45904235-45904254 None:intergenic 40.0%
GAGTATATGGTCCCTTACTA+GGG - Chr8:45901911-45901930 None:intergenic 40.0%
GATACAACATCAGACATGGT+TGG - Chr8:45904681-45904700 None:intergenic 40.0%
GATGAAGATAAAGCAGTCCT+TGG - Chr8:45903926-45903945 None:intergenic 40.0%
GCGAATGTTACCATTGTGAA+TGG - Chr8:45901670-45901689 None:intergenic 40.0%
GCGTATTATCTCCATCTATG+AGG - Chr8:45901692-45901711 None:intergenic 40.0%
GTCAGAGGAATCTAAGAGTT+GGG + Chr8:45902106-45902125 MsG0880044629.01.T01:CDS 40.0%
TAAGAGGCAGAAAACACACT+GGG + Chr8:45902722-45902741 MsG0880044629.01.T01:intron 40.0%
TAGTATCTACGCAACTCTCT+TGG + Chr8:45901746-45901765 MsG0880044629.01.T01:CDS 40.0%
TCAGAGCATGCCTTATAAAC+AGG - Chr8:45903459-45903478 None:intergenic 40.0%
TGCTTGGCCTATTTGTTTAC+CGG + Chr8:45903084-45903103 MsG0880044629.01.T01:intron 40.0%
TTGATTGACGCTAACCAGTT+TGG + Chr8:45901984-45902003 MsG0880044629.01.T01:CDS 40.0%
! AAATCCGACGTCTTTAGCTT+TGG + Chr8:45904245-45904264 MsG0880044629.01.T01:CDS 40.0%
! AAGAGCTTGCGGATTACAAA+TGG - Chr8:45902183-45902202 None:intergenic 40.0%
! AGCTTGGACTGTTTTCTCTT+CGG + Chr8:45903747-45903766 MsG0880044629.01.T01:CDS 40.0%
! CCTTTTCCATGTCTTCCAAT+TGG - Chr8:45903008-45903027 None:intergenic 40.0%
! GGAGCTAATTGACTCAGAAT+TGG + Chr8:45904575-45904594 MsG0880044629.01.T01:CDS 40.0%
! TAGATTCCTCTGACCAGTTT+TGG - Chr8:45902100-45902119 None:intergenic 40.0%
! TTCTCCTTTGCTTTCTAGTC+CGG - Chr8:45903106-45903125 None:intergenic 40.0%
! TTTACCGGACTAGAAAGCAA+AGG + Chr8:45903099-45903118 MsG0880044629.01.T01:intron 40.0%
!! CAGTTTTGTAAGCGTTTCAG+CGG + Chr8:45903383-45903402 MsG0880044629.01.T01:intron 40.0%
!! GCAATTACTTTGGTGTCCAT+TGG - Chr8:45902939-45902958 None:intergenic 40.0%
!! TGGCTTTGGACCTGTTTATA+AGG + Chr8:45903446-45903465 MsG0880044629.01.T01:intron 40.0%
!!! CCTCTCACATTTTGAAATGC+TGG - Chr8:45904747-45904766 None:intergenic 40.0%
!!! CTCACATTTTGAAATGCTGG+TGG - Chr8:45904744-45904763 None:intergenic 40.0%
!!! TTTTGAAATGCTGGTGGCTT+TGG - Chr8:45904738-45904757 None:intergenic 40.0%
AAAAGGCTATCCCGAAGATC+TGG + Chr8:45903591-45903610 MsG0880044629.01.T01:CDS 45.0%
AACTCGACCAAGTACTACGT+AGG + Chr8:45901555-45901574 MsG0880044629.01.T01:CDS 45.0%
ACTGGTGAACAACTCTAACC+AGG + Chr8:45901785-45901804 MsG0880044629.01.T01:CDS 45.0%
AGGCCTTCCATTGCATATTC+AGG - Chr8:45904215-45904234 None:intergenic 45.0%
CATCTGATGCTGAATCTTGG+GGG + Chr8:45902234-45902253 MsG0880044629.01.T01:CDS 45.0%
CATGTCCCCTGAATATGCAA+TGG + Chr8:45904205-45904224 MsG0880044629.01.T01:CDS 45.0%
CCATCTGATGCTGAATCTTG+GGG + Chr8:45902233-45902252 MsG0880044629.01.T01:CDS 45.0%
GAAGACATGGAAAAGGGAAG+AGG + Chr8:45903012-45903031 MsG0880044629.01.T01:intron 45.0%
GAGTGAAGATGACCCTAGTA+AGG + Chr8:45901896-45901915 MsG0880044629.01.T01:CDS 45.0%
GATCTTTGGACCAACGATTC+TGG + Chr8:45904549-45904568 MsG0880044629.01.T01:CDS 45.0%
GCCTTCCATTGCATATTCAG+GGG - Chr8:45904213-45904232 None:intergenic 45.0%
GCGTTGCTAACCATTCACAA+TGG + Chr8:45901657-45901676 MsG0880044629.01.T01:CDS 45.0%
GGCCTTCCATTGCATATTCA+GGG - Chr8:45904214-45904233 None:intergenic 45.0%
GGTAACATTCGCCTCATAGA+TGG + Chr8:45901678-45901697 MsG0880044629.01.T01:CDS 45.0%
GGTCAGAGGAATCTAAGAGT+TGG + Chr8:45902105-45902124 MsG0880044629.01.T01:CDS 45.0%
TAGAGTTGTTCACCAGTACC+AGG - Chr8:45901782-45901801 None:intergenic 45.0%
TAGCTCCATTCCAGAATCGT+TGG - Chr8:45904562-45904581 None:intergenic 45.0%
TCCCCTGAATATGCAATGGA+AGG + Chr8:45904209-45904228 MsG0880044629.01.T01:CDS 45.0%
! TGTTATTGCTGTTGCAGGAC+AGG - Chr8:45902298-45902317 None:intergenic 45.0%
! TTGGACCAACGATTCTGGAA+TGG + Chr8:45904554-45904573 MsG0880044629.01.T01:CDS 45.0%
!! ATGGAGGTGTTCTTGAGAGT+CGG - Chr8:45902488-45902507 None:intergenic 45.0%
!! TCTGGCTCATTGACTCTATC+AGG + Chr8:45901945-45901964 MsG0880044629.01.T01:CDS 45.0%
!! TTTTCCACACGGATTGTCTG+TGG - Chr8:45902156-45902175 None:intergenic 45.0%
AAACTTGGCGAAGGTGGCTT+TGG + Chr8:45903432-45903451 MsG0880044629.01.T01:intron 50.0%
AAGATCTGGTCAAGGATGGG+AGG + Chr8:45903605-45903624 MsG0880044629.01.T01:CDS 50.0%
ACAGGTCAGATGGATGTGTC+AGG + Chr8:45902264-45902283 MsG0880044629.01.T01:CDS 50.0%
ACTCTAACCAGGCGATCTTG+TGG + Chr8:45901796-45901815 MsG0880044629.01.T01:CDS 50.0%
CCATCCTTGACCAGATCTTC+GGG - Chr8:45903604-45903623 None:intergenic 50.0%
CCCATCCTTGACCAGATCTT+CGG - Chr8:45903605-45903624 None:intergenic 50.0%
CCCCAAGATTCAGCATCAGA+TGG - Chr8:45902236-45902255 None:intergenic 50.0%
CCGAAGATCTGGTCAAGGAT+GGG + Chr8:45903602-45903621 MsG0880044629.01.T01:CDS 50.0%
CTATCCCGAAGATCTGGTCA+AGG + Chr8:45903597-45903616 MsG0880044629.01.T01:CDS 50.0%
GACCCTTGTCAATGTCTCGA+TGG + Chr8:45902203-45902222 MsG0880044629.01.T01:CDS 50.0%
GATGCTAGATTGGGGAACAC+GGG + Chr8:45903878-45903897 MsG0880044629.01.T01:intron 50.0%
GGATGCTAGATTGGGGAACA+CGG + Chr8:45903877-45903896 MsG0880044629.01.T01:intron 50.0%
GTGAATGGTTAGCAACGCTG+AGG - Chr8:45901655-45901674 None:intergenic 50.0%
TACGCAACTCTCTTGGACAC+AGG + Chr8:45901753-45901772 MsG0880044629.01.T01:CDS 50.0%
TCTCTTGGACACAGGAAACC+TGG + Chr8:45901761-45901780 MsG0880044629.01.T01:CDS 50.0%
TGACAAGGGTCAAGAGCTTG+CGG - Chr8:45902194-45902213 None:intergenic 50.0%
TTGACGGTACCTGCATGTTG+TGG + Chr8:45902450-45902469 MsG0880044629.01.T01:CDS 50.0%
! CGTAGCAGACAAGAGCACAA+AGG + Chr8:45903329-45903348 MsG0880044629.01.T01:CDS 50.0%
!! AATGCTGGTGGCTTTGGACT+TGG - Chr8:45904732-45904751 None:intergenic 50.0%
!! GACATGGTTGGCCTATCATC+TGG - Chr8:45904669-45904688 None:intergenic 50.0%
!! TGGTGGCTTTGGACTTGGAA+GGG - Chr8:45904727-45904746 None:intergenic 50.0%
AACTCTGCCACAAGATCGCC+TGG - Chr8:45901806-45901825 None:intergenic 55.0%
CCCGAAGATCTGGTCAAGGA+TGG + Chr8:45903601-45903620 MsG0880044629.01.T01:CDS 55.0%
CGGATTGTCTGTGGCACACT+TGG - Chr8:45902147-45902166 None:intergenic 55.0%
GATGCTGAATCTTGGGGGCT+GGG + Chr8:45902239-45902258 MsG0880044629.01.T01:CDS 55.0%
GGACACAGGAAACCTGGTAC+TGG + Chr8:45901767-45901786 MsG0880044629.01.T01:CDS 55.0%
GGGGTGAGGTTGCTGTGAAA+AGG + Chr8:45903574-45903593 MsG0880044629.01.T01:CDS 55.0%
TGATGCTGAATCTTGGGGGC+TGG + Chr8:45902238-45902257 MsG0880044629.01.T01:CDS 55.0%
TGCGTACGAGCAGGTGGATA+CGG + Chr8:45902364-45902383 MsG0880044629.01.T01:CDS 55.0%
TGTGCCACAGACAATCCGTG+TGG + Chr8:45902149-45902168 MsG0880044629.01.T01:CDS 55.0%
!! CAGGCAAAAGGGTGTCTGAG+GGG - Chr8:45901836-45901855 None:intergenic 55.0%
!! CCAGGCAAAAGGGTGTCTGA+GGG - Chr8:45901837-45901856 None:intergenic 55.0%
!! CTGGTGGCTTTGGACTTGGA+AGG - Chr8:45904728-45904747 None:intergenic 55.0%
!! TCCAGGCAAAAGGGTGTCTG+AGG - Chr8:45901838-45901857 None:intergenic 55.0%
AATCTTGGGGGCTGGGAGAC+AGG + Chr8:45902246-45902265 MsG0880044629.01.T01:CDS 60.0%
ACCACCTCATGCGTACGAGC+AGG + Chr8:45902355-45902374 MsG0880044629.01.T01:CDS 60.0%
ACCTCATGCGTACGAGCAGG+TGG + Chr8:45902358-45902377 MsG0880044629.01.T01:CDS 60.0%
ACCTGCTCGTACGCATGAGG+TGG - Chr8:45902359-45902378 None:intergenic 60.0%
TCCACCTGCTCGTACGCATG+AGG - Chr8:45902362-45902381 None:intergenic 60.0%
TGCTCGTACGCATGAGGTGG+TGG - Chr8:45902356-45902375 None:intergenic 60.0%
! CCCTCAGACACCCTTTTGCC+TGG + Chr8:45901834-45901853 MsG0880044629.01.T01:CDS 60.0%
GGGCTGGGAGACAGGTCAGA+TGG + Chr8:45902254-45902273 MsG0880044629.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 45901549 45904851 45901549 ID=MsG0880044629.01;Name=MsG0880044629.01
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Chr8 exon 45903271 45903389 45903271 ID=MsG0880044629.01.T01:exon:18541;Parent=MsG0880044629.01.T01
Chr8 exon 45903558 45903768 45903558 ID=MsG0880044629.01.T01:exon:18542;Parent=MsG0880044629.01.T01
Chr8 exon 45903886 45904099 45903886 ID=MsG0880044629.01.T01:exon:18543;Parent=MsG0880044629.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0880044629.01.T01

ATGGAGAACTCGACCAAGTACTACGTAGGTATAAGGTCTAAAAAGGTACCAAATGACAAGATTGTTTGGGTTGAAAGATACCTCGTGTACCCATTTGTTACATCCTCAGCGTTGCTAACCATTCACAATGGTAACATTCGCCTCATAGATGGAGATAATACGCACAACGTGACAAGAAATCAGAACAGCAATAGCATTAGTATCTACGCAACTCTCTTGGACACAGGAAACCTGGTACTGGTGAACAACTCTAACCAGGCGATCTTGTGGCAGAGTTTTGATAACCCCTCAGACACCCTTTTGCCTGGAATGAAAATTGGAAACACTTCGTTAATGCAATCATGGGAGAGTGAAGATGACCCTAGTAAGGGACCATATACTCTCCAATTTGATGATTCTGGCTCATTGACTCTATCAGGTATGAGTTCTGTTTTGTTGATTGACGCTAACCAGTTTGGATTGAATTGGAACAAGGATAACGGATATTACACTCTTCCAACTGATAGCAATTCTCGTTTGATATTGGAAGCTTATGGGGTTCTTAAATACCAAAACTGGTCAGAGGAATCTAAGAGTTGGGTTCTTCTACAGTCATCCAAGTGTGCCACAGACAATCCGTGTGGAAAATTTTCCATTTGTAATCCGCAAGCTCTTGACCCTTGTCAATGTCTCGATGGTTTTAAACCATCTGATGCTGAATCTTGGGGGCTGGGAGACAGGTCAGATGGATGTGTCAGGATAAATGACCTGTCCTGCAACAGCAATAACAGTAAAGATAGATTCTTGAATATGTCAGTGGAATCACCACCACCTCATGCGTACGAGCAGGTGGATACGGCAGCACATTGTAATTATACTTGCTTCACTGATTGCTCTTGTGTTGCATATGCTTATGATTATTTTGACGGTACCTGCATGTTGTGGAAATATCATGTACCGACTCTCAAGAACACCTCCATTGATATTAATGGTAATAATGATAAAACAAATTTTTATCTCAAGCTTGCTGGCTCAGACAGACTTATCGCAAGCGATGATTTGCTAAATTTTGAAGTGGGCATGAGCATGAAAGTTAATAAAGACTCAGACGTAGCAGACAAGAGCACAAAGGTTAAGAAGAAAGAAGTAAAGTTGCCATTATTCAGTTTTGGTATATTATTGAATGGGGGTGAGGTTGCTGTGAAAAGGCTATCCCGAAGATCTGGTCAAGGATGGGAGGAGTTAAGAAATGAAGCATTGTTGATTGCAAAACTCCAACATAACAATCTTGTTAGACTTCTCGGCTGTTGCATTGATCGAGATGAAAAAATGCTTATTTATGAATTCATGCCCAATAAAAGCTTGGACTGTTTTCTCTTCGATTGGGGAACACGGGTTCGAATAATTGAAGGAATTGCCCAAGGACTGCTTTATCTTCATCAATATTCTAGGTTCCGGATCATTCATCGAGATCTAAAAGCTAGCAACATATTGTTAGCCACCAACATGAATCCTAAAATATCAGATTTTGGAATGGCTAGGATATTTGGTGAGAATGAGCTTCAAGCAAATACAAATCGGATTGTTGGAACTTATGGCTACATGTCCCCTGAATATGCAATGGAAGGCCTTTTCTCAGTTAAATCCGACGTCTTTAGCTTTGGAGTTCTTTTGTTAGAGATTATAAGTGGCAAGAAGAATACTGGTTTTTATCAAACAAGCTCTTTCAATCTTCTTGGATATGCTTGGGATCTTTGGACCAACGATTCTGGAATGGAGCTAATTGACTCAGAATTGGTTGATATCTCCAACAAACATTTAGTACCAAGATACGTGAATATAGGACTTCTCTGTGTTCAACAAAGTCCAGATGATAGGCCAACCATGTCTGATGTTGTATCAATGTTTGGTAATGACACTGCATCCCTTCCAAGTCCAAAGCCACCAGCATTTCAAAATGTGAGAGGTATTGAATATACAAGACTCCCTACACGCATAGAAGAAAACTTTTCTGTGAATGGCATCACAGATTCACTCATTGAAGCAAGATGA

Protein sequence

>MsG0880044629.01.T01

MENSTKYYVGIRSKKVPNDKIVWVERYLVYPFVTSSALLTIHNGNIRLIDGDNTHNVTRNQNSNSISIYATLLDTGNLVLVNNSNQAILWQSFDNPSDTLLPGMKIGNTSLMQSWESEDDPSKGPYTLQFDDSGSLTLSGMSSVLLIDANQFGLNWNKDNGYYTLPTDSNSRLILEAYGVLKYQNWSEESKSWVLLQSSKCATDNPCGKFSICNPQALDPCQCLDGFKPSDAESWGLGDRSDGCVRINDLSCNSNNSKDRFLNMSVESPPPHAYEQVDTAAHCNYTCFTDCSCVAYAYDYFDGTCMLWKYHVPTLKNTSIDINGNNDKTNFYLKLAGSDRLIASDDLLNFEVGMSMKVNKDSDVADKSTKVKKKEVKLPLFSFGILLNGGEVAVKRLSRRSGQGWEELRNEALLIAKLQHNNLVRLLGCCIDRDEKMLIYEFMPNKSLDCFLFDWGTRVRIIEGIAQGLLYLHQYSRFRIIHRDLKASNILLATNMNPKISDFGMARIFGENELQANTNRIVGTYGYMSPEYAMEGLFSVKSDVFSFGVLLLEIISGKKNTGFYQTSSFNLLGYAWDLWTNDSGMELIDSELVDISNKHLVPRYVNIGLLCVQQSPDDRPTMSDVVSMFGNDTASLPSPKPPAFQNVRGIEYTRLPTRIEENFSVNGITDSLIEAR*