AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039018.01

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Find 86 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 150 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TTTCTACCTTTGGCTTCTTC+AGG 0.207589 7:+56865966 None:intergenic
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AATATTGAAGCAGTGAAATT+TGG 0.215494 7:-56868044 MsG0780039018.01.T01:CDS
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TCTGTCACCATAAATGTTAA+TGG 0.349053 7:+56866967 None:intergenic
TTCTACCTTTGGCTTCTTCA+GGG 0.358571 7:+56865967 None:intergenic
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GATCCTAAATCCCCTATTAC+AGG 0.369144 7:-56867006 MsG0780039018.01.T01:CDS
CAGCATATCCACCTGTAATA+GGG 0.383028 7:+56866995 None:intergenic
TGCAGGTATTAGACATGTTC+AGG 0.387295 7:-56866014 MsG0780039018.01.T01:intron
AACGGCCTCAACCAGTTCAT+TGG 0.391379 7:-56866696 MsG0780039018.01.T01:intron
CATGTTTATATGTGGACAAT+AGG 0.397277 7:-56867842 MsG0780039018.01.T01:CDS
CATTTCCTCCACGTCATTAA+GGG 0.403582 7:+56866879 None:intergenic
TTAAATCTCCTTCAGAAGCT+TGG 0.404186 7:-56867657 MsG0780039018.01.T01:CDS
AAAGTTCTGTTTGCTGAGGC+AGG 0.405727 7:-56868146 MsG0780039018.01.T01:CDS
GAGTTCAGATTGAGCAGAAA+TGG 0.407484 7:+56867095 None:intergenic
TTTAGTTCTAAGTAACCAAT+TGG 0.411255 7:-56867394 MsG0780039018.01.T01:CDS
CCTTAGAGTTGTGGTGCTAA+AGG 0.411974 7:-56868177 MsG0780039018.01.T01:CDS
CCTTAATGACGTGGAGGAAA+TGG 0.412198 7:-56866878 MsG0780039018.01.T01:CDS
AGAGGAAGAATCTGATGAAA+TGG 0.420787 7:-56867352 MsG0780039018.01.T01:CDS
CTTGGTGATGTTGATATTGA+CGG 0.422369 7:+56867602 None:intergenic
TACCAATATTAACTTCCAAT+TGG 0.431128 7:+56867379 None:intergenic
ATCTTGATACACAATATCTA+TGG 0.433771 7:-56867989 MsG0780039018.01.T01:CDS
AAGATATGAAATACCATCAA+TGG 0.434003 7:+56866918 None:intergenic
GCAGAGGTAGTAGGACTTCA+AGG 0.456406 7:+56867875 None:intergenic
TAATATACTAACCAATGAAC+TGG 0.462240 7:+56866685 None:intergenic
TAAGCACCCGCTGAGTTGTT+CGG 0.463411 7:+56867936 None:intergenic
AATATGCAACACTGCTCCTA+AGG 0.469659 7:+56867233 None:intergenic
TCAAAATCTGCCTTGACAAA+CGG 0.470384 7:-56866714 MsG0780039018.01.T01:CDS
CCTATTACAGGTGGATATGC+TGG 0.481859 7:-56866994 MsG0780039018.01.T01:CDS
TTCATATCTTGAAAGAATGA+AGG 0.484244 7:-56866905 MsG0780039018.01.T01:CDS
AGCTTACAAAAGAGAATCCT+TGG 0.499942 7:+56867208 None:intergenic
TGAGTTCAGACAAGTGTTTG+AGG 0.508556 7:-56867152 MsG0780039018.01.T01:CDS
CTACCTTTGGCTTCTTCAGG+GGG 0.513478 7:+56865969 None:intergenic
GATTTCTTTACTCAAAATCC+GGG 0.515721 7:+56867755 None:intergenic
CAAAGTTTCCCTTAGAGTTG+TGG 0.516766 7:-56868186 MsG0780039018.01.T01:CDS
TTGAGCAGAAATGGTTGGAC+TGG 0.524156 7:+56867104 None:intergenic
TATCAACATCACCAAGAAAG+AGG 0.532453 7:-56867595 MsG0780039018.01.T01:intron
TCTGTTTGCTGAGGCAGGGA+AGG 0.534123 7:-56868141 MsG0780039018.01.T01:CDS
CTGGTTGAGGCCGTTTGTCA+AGG 0.537345 7:+56866704 None:intergenic
CCTTGCAAAACTTGTGGCTA+AGG 0.537453 7:-56868072 MsG0780039018.01.T01:CDS
TCAGATTGAGCAGAAATGGT+TGG 0.541398 7:+56867099 None:intergenic
ACTCCAATGTCATCCATTGA+TGG 0.546893 7:-56866931 MsG0780039018.01.T01:CDS
TCTACCTTTGGCTTCTTCAG+GGG 0.550005 7:+56865968 None:intergenic
GAACGTGTCATGTTTATATG+TGG 0.557536 7:-56867850 MsG0780039018.01.T01:CDS
CATTGACTCCAAGCTTCTGA+AGG 0.561296 7:+56867649 None:intergenic
AGTTAATATTGGTAAAGAAG+AGG 0.563830 7:-56867370 MsG0780039018.01.T01:CDS
CTTTAGCACCACAACTCTAA+GGG 0.565677 7:+56868178 None:intergenic
AAGTTCTGTTTGCTGAGGCA+GGG 0.567485 7:-56868145 MsG0780039018.01.T01:CDS
AGGGACCCTTGCAAAACTTG+TGG 0.575071 7:-56868078 MsG0780039018.01.T01:CDS
AGCATATCCACCTGTAATAG+GGG 0.575488 7:+56866996 None:intergenic
ATTTCCTCCACGTCATTAAG+GGG 0.575782 7:+56866880 None:intergenic
CTCAATCCGAACAACTCAGC+GGG 0.579196 7:-56867942 MsG0780039018.01.T01:CDS
ACTAACCAATGAACTGGTTG+AGG 0.582536 7:+56866691 None:intergenic
ATATGCAACACTGCTCCTAA+GGG 0.592224 7:+56867234 None:intergenic
TTAAATATAAAGTCCGACAA+AGG 0.595166 7:+56867438 None:intergenic
CCTAAATCCCCTATTACAGG+TGG 0.600307 7:-56867003 MsG0780039018.01.T01:CDS
CACGTTCTCGCAGAGGTAGT+AGG 0.601493 7:+56867866 None:intergenic
CGTTAATATTGGCCAGAAGG+AGG 0.604404 7:-56866854 MsG0780039018.01.T01:intron
TTTCTGCTCAATCTGAACTC+AGG 0.604931 7:-56867092 MsG0780039018.01.T01:CDS
ATACCATCAATGGATGACAT+TGG 0.606080 7:+56866928 None:intergenic
GGTCGTTAATATTGGCCAGA+AGG 0.607810 7:-56866857 MsG0780039018.01.T01:CDS
AAACAAAGTTCTGTTTGCTG+AGG 0.615217 7:-56868150 MsG0780039018.01.T01:CDS
GCAGTGTTGCATATTCTCCA+AGG 0.619271 7:-56867225 MsG0780039018.01.T01:CDS
GTAGTAGGACTTCAAGGACT+CGG 0.621417 7:+56867881 None:intergenic
TTTGTCGACTTGCTCAGCTG+AGG 0.622308 7:+56868205 None:intergenic
TCTATGGTCACACACCTGCA+AGG 0.646114 7:-56867973 MsG0780039018.01.T01:CDS
AACATGACACGTTCTCGCAG+AGG 0.662980 7:+56867859 None:intergenic
TTTCCTCCACGTCATTAAGG+GGG 0.685681 7:+56866881 None:intergenic
ACTCAATCCGAACAACTCAG+CGG 0.727420 7:-56867943 MsG0780039018.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! GTTTATTATAATTAAAATGT+AGG + Chr7:56867526-56867545 None:intergenic 10.0%
!!! CTTTTTTAATTTAACAATTA+AGG - Chr7:56867811-56867830 MsG0780039018.01.T01:CDS 10.0%
!!! AGTAATTTAAAATGAACAAA+AGG - Chr7:56868021-56868040 MsG0780039018.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTATAATTGTTTTTAGGTAT+CGG + Chr7:56867113-56867132 None:intergenic 15.0%
!! ATAAGTGTTAAATATGTTGT+TGG + Chr7:56867694-56867713 None:intergenic 20.0%
!! ATTTGAAGAGTGATTAAAAA+TGG - Chr7:56867647-56867666 MsG0780039018.01.T01:CDS 20.0%
!! GATACCTAAAAACAATTATA+AGG - Chr7:56867112-56867131 MsG0780039018.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTGAGTAGATTAAAATAGT+CGG + Chr7:56867845-56867864 None:intergenic 20.0%
!!! AAAATTTGGTCTCTAAATTT+TGG + Chr7:56867621-56867640 None:intergenic 20.0%
!!! AATAGTACTAATTTTCCATA+AGG - Chr7:56867923-56867942 MsG0780039018.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATATTATCTTTAGAATTGAC+TGG - Chr7:56867718-56867737 MsG0780039018.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTGTTATATTAAATGCAG+AGG + Chr7:56867906-56867925 None:intergenic 20.0%
!!! TTTGCCTTATAATTGTTTTT+AGG + Chr7:56867119-56867138 None:intergenic 20.0%
! AAATACATACAGTTACCTTA+TGG + Chr7:56867941-56867960 None:intergenic 25.0%
! AACCAATTGGAAGTTAATAT+TGG - Chr7:56866786-56866805 MsG0780039018.01.T01:intron 25.0%
! AAGATATGAAATACCATCAA+TGG + Chr7:56867252-56867271 None:intergenic 25.0%
! AATATTGAAGCAGTGAAATT+TGG - Chr7:56866123-56866142 MsG0780039018.01.T01:intron 25.0%
! AGTTAATATTGGTAAAGAAG+AGG - Chr7:56866797-56866816 MsG0780039018.01.T01:intron 25.0%
! AGTTGTTATGAATCTAATAC+AGG + Chr7:56867375-56867394 None:intergenic 25.0%
! ATCTTGATACACAATATCTA+TGG - Chr7:56866178-56866197 MsG0780039018.01.T01:intron 25.0%
! ATGTAGGATGATATTATGTT+TGG + Chr7:56867510-56867529 None:intergenic 25.0%
! CAAATATGAAAATAGTATGC+AGG + Chr7:56867750-56867769 None:intergenic 25.0%
! CTTCAAATTCCTTCAAAATT+TGG + Chr7:56867635-56867654 None:intergenic 25.0%
! GTCGGACTTTATATTTAAAA+AGG - Chr7:56866734-56866753 MsG0780039018.01.T01:CDS 25.0%
! TAATATACTAACCAATGAAC+TGG + Chr7:56867485-56867504 None:intergenic 25.0%
! TACCAATATTAACTTCCAAT+TGG + Chr7:56866791-56866810 None:intergenic 25.0%
! TTAAATATAAAGTCCGACAA+AGG + Chr7:56866732-56866751 None:intergenic 25.0%
! TTCATATCTTGAAAGAATGA+AGG - Chr7:56867262-56867281 MsG0780039018.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTAGAGACCAAATTTTGA+AGG - Chr7:56867623-56867642 MsG0780039018.01.T01:CDS 25.0%
!! TAAGGTAACTGTATGTATTT+TGG - Chr7:56867941-56867960 MsG0780039018.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAAAAGTGTTAGTGATGTAA+TGG + Chr7:56867797-56867816 None:intergenic 25.0%
!!! TAAAGAAATCGGTTTTGTTA+AGG - Chr7:56866425-56866444 MsG0780039018.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTAGTTCTAAGTAACCAAT+TGG - Chr7:56866773-56866792 MsG0780039018.01.T01:intron 25.0%
AAAATGAACAAAAGGTGAGA+AGG - Chr7:56868029-56868048 MsG0780039018.01.T01:CDS 30.0%
AAACTTGTCGTAACAACATT+TGG + Chr7:56866492-56866511 None:intergenic 30.0%
AAATGAACAAAAGGTGAGAA+GGG - Chr7:56868030-56868049 MsG0780039018.01.T01:CDS 30.0%
AGGGATCAAAAATGTATTTG+TGG - Chr7:56866366-56866385 MsG0780039018.01.T01:intron 30.0%
CAACCACATGAAATCAAATA+TGG + Chr7:56867400-56867419 None:intergenic 30.0%
CATGTTTATATGTGGACAAT+AGG - Chr7:56866325-56866344 MsG0780039018.01.T01:intron 30.0%
CGATTTCTTTACTCAAAATC+CGG + Chr7:56866416-56866435 None:intergenic 30.0%
CTCACTAATTCTTCAATATG+TGG - Chr7:56866658-56866677 MsG0780039018.01.T01:intron 30.0%
GAGTGATTAAAAATGGAAGT+TGG - Chr7:56867654-56867673 MsG0780039018.01.T01:CDS 30.0%
GATTTCTTTACTCAAAATCC+GGG + Chr7:56866415-56866434 None:intergenic 30.0%
TCTGTCACCATAAATGTTAA+TGG + Chr7:56867203-56867222 None:intergenic 30.0%
TGATCTTCTCAAATTGTCTT+TGG - Chr7:56866695-56866714 MsG0780039018.01.T01:intron 30.0%
TGGAACACCATTAACATTTA+TGG - Chr7:56867193-56867212 MsG0780039018.01.T01:CDS 30.0%
! GTACTGTTTGAGTTACTTTA+GGG - Chr7:56866347-56866366 MsG0780039018.01.T01:intron 30.0%
! TCACCATATTTGATTTCATG+TGG - Chr7:56867394-56867413 MsG0780039018.01.T01:CDS 30.0%
!! ATGGAAGTTGGTATATTTAG+AGG - Chr7:56867666-56867685 MsG0780039018.01.T01:CDS 30.0%
!! CGGATTTTGAGTAAAGAAAT+CGG - Chr7:56866414-56866433 MsG0780039018.01.T01:intron 30.0%
!! TGGAAGTTGGTATATTTAGA+GGG - Chr7:56867667-56867686 MsG0780039018.01.T01:CDS 30.0%
!!! GATTTTTTTTCTTGAAGCTG+AGG - Chr7:56866872-56866891 MsG0780039018.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTAGGTATCGGTAATATC+TGG + Chr7:56867103-56867122 None:intergenic 30.0%
AAGAAAGTAGGAGTCATGAA+GGG - Chr7:56868053-56868072 MsG0780039018.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAGCCAAAGGTAGAAAA+AGG - Chr7:56868205-56868224 MsG0780039018.01.T01:CDS 35.0%
AGAGGAAGAATCTGATGAAA+TGG - Chr7:56866815-56866834 MsG0780039018.01.T01:intron 35.0%
AGCAAAAGATACCTCTTTCT+TGG + Chr7:56866586-56866605 None:intergenic 35.0%
AGCTTACAAAAGAGAATCCT+TGG + Chr7:56866962-56866981 None:intergenic 35.0%
AGCTTCTTATCATTGCCTTT+AGG - Chr7:56866069-56866088 MsG0780039018.01.T01:intron 35.0%
ATACCATCAATGGATGACAT+TGG + Chr7:56867242-56867261 None:intergenic 35.0%
CTTCAATATGTGGTTTGAAC+AGG - Chr7:56866668-56866687 MsG0780039018.01.T01:intron 35.0%
GAACGTGTCATGTTTATATG+TGG - Chr7:56866317-56866336 MsG0780039018.01.T01:intron 35.0%
GAGGAAATGGTCGTTAATAT+TGG - Chr7:56867302-56867321 MsG0780039018.01.T01:CDS 35.0%
GCTTCTTATCATTGCCTTTA+GGG - Chr7:56866070-56866089 MsG0780039018.01.T01:intron 35.0%
TATCAACATCACCAAGAAAG+AGG - Chr7:56866572-56866591 MsG0780039018.01.T01:intron 35.0%
TCAAAATCTGCCTTGACAAA+CGG - Chr7:56867453-56867472 MsG0780039018.01.T01:CDS 35.0%
TGGATCTTCATATGATCCAA+GGG - Chr7:56867961-56867980 MsG0780039018.01.T01:CDS 35.0%
TTAAATCTCCTTCAGAAGCT+TGG - Chr7:56866510-56866529 MsG0780039018.01.T01:intron 35.0%
TTATATGTGCATGTACATGC+AGG - Chr7:56868136-56868155 MsG0780039018.01.T01:CDS 35.0%
TTGGATCTTCATATGATCCA+AGG - Chr7:56867960-56867979 MsG0780039018.01.T01:CDS 35.0%
! AAACAAAGTTCTGTTTGCTG+AGG - Chr7:56866017-56866036 MsG0780039018.01.T01:intron 35.0%
! ATTTGATTTCATGTGGTTGC+AGG - Chr7:56867401-56867420 MsG0780039018.01.T01:CDS 35.0%
! GGTACTGTTTGAGTTACTTT+AGG - Chr7:56866346-56866365 MsG0780039018.01.T01:intron 35.0%
! TCAAAATCCGGGATTTTTCT+CGG + Chr7:56866404-56866423 None:intergenic 35.0%
! TTTGATTTCATGTGGTTGCA+GGG - Chr7:56867402-56867421 MsG0780039018.01.T01:CDS 35.0%
!! AGTTTTCTCACTTTTCCCTT+AGG - Chr7:56866918-56866937 MsG0780039018.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTGGTGATGTTGATATTGA+CGG + Chr7:56866568-56866587 None:intergenic 35.0%
AATATGCAACACTGCTCCTA+AGG + Chr7:56866937-56866956 None:intergenic 40.0%
ACTAACCAATGAACTGGTTG+AGG + Chr7:56867479-56867498 None:intergenic 40.0%
ACTCCAATGTCATCCATTGA+TGG - Chr7:56867236-56867255 MsG0780039018.01.T01:CDS 40.0%
AGCATATCCACCTGTAATAG+GGG + Chr7:56867174-56867193 None:intergenic 40.0%
ATATGCAACACTGCTCCTAA+GGG + Chr7:56866936-56866955 None:intergenic 40.0%
ATTGAGTAGCATTTCCTTGC+AGG + Chr7:56866211-56866230 None:intergenic 40.0%
ATTTCCTCCACGTCATTAAG+GGG + Chr7:56867290-56867309 None:intergenic 40.0%
CAAAGTTTCCCTTAGAGTTG+TGG - Chr7:56865981-56866000 MsG0780039018.01.T01:CDS 40.0%
CAATATGTGGTTTGAACAGG+TGG - Chr7:56866671-56866690 MsG0780039018.01.T01:intron 40.0%
CAGCATATCCACCTGTAATA+GGG + Chr7:56867175-56867194 None:intergenic 40.0%
CATATGATCCAAGGGTAATG+TGG - Chr7:56867969-56867988 MsG0780039018.01.T01:CDS 40.0%
CATTTCCTCCACGTCATTAA+GGG + Chr7:56867291-56867310 None:intergenic 40.0%
CTTTAGCACCACAACTCTAA+GGG + Chr7:56865992-56866011 None:intergenic 40.0%
GAAGAAAGTAGGAGTCATGA+AGG - Chr7:56868052-56868071 MsG0780039018.01.T01:CDS 40.0%
GAGTTCAGATTGAGCAGAAA+TGG + Chr7:56867075-56867094 None:intergenic 40.0%
GATCCTAAATCCCCTATTAC+AGG - Chr7:56867161-56867180 MsG0780039018.01.T01:CDS 40.0%
GGTCTCAAAAACTCCTTTGT+CGG - Chr7:56866716-56866735 MsG0780039018.01.T01:CDS 40.0%
TCAGATTGAGCAGAAATGGT+TGG + Chr7:56867071-56867090 None:intergenic 40.0%
TGAGTTCAGACAAGTGTTTG+AGG - Chr7:56867015-56867034 MsG0780039018.01.T01:CDS 40.0%
TGCAGGTATTAGACATGTTC+AGG - Chr7:56868153-56868172 MsG0780039018.01.T01:CDS 40.0%
TGTTGAACCGAGAAAAATCC+CGG - Chr7:56866394-56866413 MsG0780039018.01.T01:intron 40.0%
TTTCTGCTCAATCTGAACTC+AGG - Chr7:56867075-56867094 MsG0780039018.01.T01:CDS 40.0%
! CTTAGCCACAAGTTTTGCAA+GGG + Chr7:56866097-56866116 None:intergenic 40.0%
! GAGCTTCCTTTTTCTACCTT+TGG + Chr7:56868214-56868233 None:intergenic 40.0%
! GTTTGTCAAGGCAGATTTTG+AGG + Chr7:56867454-56867473 None:intergenic 40.0%
! TCATGAAGGGTGTGTAATCT+TGG - Chr7:56868066-56868085 MsG0780039018.01.T01:CDS 40.0%
! TTCTACCTTTGGCTTCTTCA+GGG + Chr7:56868203-56868222 None:intergenic 40.0%
! TTTCTACCTTTGGCTTCTTC+AGG + Chr7:56868204-56868223 None:intergenic 40.0%
ACTCAATCCGAACAACTCAG+CGG - Chr7:56866224-56866243 MsG0780039018.01.T01:intron 45.0%
AGGGTAATGTGGAGTAAGGA+CGG - Chr7:56867980-56867999 MsG0780039018.01.T01:CDS 45.0%
AGGTGAGAAGGGAAGAAAGT+AGG - Chr7:56868041-56868060 MsG0780039018.01.T01:CDS 45.0%
ATTGGCCAGAAGGAGGTAAA+AGG - Chr7:56867320-56867339 MsG0780039018.01.T01:CDS 45.0%
CCACCTGTAATAGGGGATTT+AGG + Chr7:56867167-56867186 None:intergenic 45.0%
CCAGCATATCCACCTGTAAT+AGG + Chr7:56867176-56867195 None:intergenic 45.0%
CCATTTCCTCCACGTCATTA+AGG + Chr7:56867292-56867311 None:intergenic 45.0%
CCTAAATCCCCTATTACAGG+TGG - Chr7:56867164-56867183 MsG0780039018.01.T01:CDS 45.0%
CCTATTACAGGTGGATATGC+TGG - Chr7:56867173-56867192 MsG0780039018.01.T01:CDS 45.0%
CCTTAATGACGTGGAGGAAA+TGG - Chr7:56867289-56867308 MsG0780039018.01.T01:CDS 45.0%
CCTTGCAAAACTTGTGGCTA+AGG - Chr7:56866095-56866114 MsG0780039018.01.T01:intron 45.0%
CCTTTAGCACCACAACTCTA+AGG + Chr7:56865993-56866012 None:intergenic 45.0%
CGTTAATATTGGCCAGAAGG+AGG - Chr7:56867313-56867332 MsG0780039018.01.T01:CDS 45.0%
GCAGTGTTGCATATTCTCCA+AGG - Chr7:56866942-56866961 MsG0780039018.01.T01:CDS 45.0%
GGTCGTTAATATTGGCCAGA+AGG - Chr7:56867310-56867329 MsG0780039018.01.T01:CDS 45.0%
GTAGTAGGACTTCAAGGACT+CGG + Chr7:56866289-56866308 None:intergenic 45.0%
TCCAAGGGTAATGTGGAGTA+AGG - Chr7:56867976-56867995 MsG0780039018.01.T01:CDS 45.0%
TCCTTACTCCACATTACCCT+TGG + Chr7:56867980-56867999 None:intergenic 45.0%
TTGAGCAGAAATGGTTGGAC+TGG + Chr7:56867066-56867085 None:intergenic 45.0%
TTGGCCAGAAGGAGGTAAAA+GGG - Chr7:56867321-56867340 MsG0780039018.01.T01:CDS 45.0%
TTTCCTCCACGTCATTAAGG+GGG + Chr7:56867289-56867308 None:intergenic 45.0%
! AAAGTTCTGTTTGCTGAGGC+AGG - Chr7:56866021-56866040 MsG0780039018.01.T01:intron 45.0%
! AAGTTCTGTTTGCTGAGGCA+GGG - Chr7:56866022-56866041 MsG0780039018.01.T01:intron 45.0%
! AGTTTTGCAAGGGTCCCTAA+AGG + Chr7:56866087-56866106 None:intergenic 45.0%
! CCTTAGAGTTGTGGTGCTAA+AGG - Chr7:56865990-56866009 MsG0780039018.01.T01:CDS 45.0%
! CCTTAGCCACAAGTTTTGCA+AGG + Chr7:56866098-56866117 None:intergenic 45.0%
! TACTCCCTTTTACCTCCTTC+TGG + Chr7:56867328-56867347 None:intergenic 45.0%
! TCTACCTTTGGCTTCTTCAG+GGG + Chr7:56868202-56868221 None:intergenic 45.0%
!! CATTGACTCCAAGCTTCTGA+AGG + Chr7:56866521-56866540 None:intergenic 45.0%
AACATGACACGTTCTCGCAG+AGG + Chr7:56866311-56866330 None:intergenic 50.0%
AACGGCCTCAACCAGTTCAT+TGG - Chr7:56867471-56867490 MsG0780039018.01.T01:CDS 50.0%
AGGGACCCTTGCAAAACTTG+TGG - Chr7:56866089-56866108 MsG0780039018.01.T01:intron 50.0%
CTCAATCCGAACAACTCAGC+GGG - Chr7:56866225-56866244 MsG0780039018.01.T01:intron 50.0%
GCAGAGGTAGTAGGACTTCA+AGG + Chr7:56866295-56866314 None:intergenic 50.0%
TAAGCACCCGCTGAGTTGTT+CGG + Chr7:56866234-56866253 None:intergenic 50.0%
TCTATGGTCACACACCTGCA+AGG - Chr7:56866194-56866213 MsG0780039018.01.T01:intron 50.0%
! CTACCTTTGGCTTCTTCAGG+GGG + Chr7:56868201-56868220 None:intergenic 50.0%
!! TTTGTCGACTTGCTCAGCTG+AGG + Chr7:56865965-56865984 None:intergenic 50.0%
ACTCAGCGGGTGCTTATTGC+TGG - Chr7:56866238-56866257 MsG0780039018.01.T01:intron 55.0%
CACGTTCTCGCAGAGGTAGT+AGG + Chr7:56866304-56866323 None:intergenic 55.0%
CTGGTTGAGGCCGTTTGTCA+AGG + Chr7:56867466-56867485 None:intergenic 55.0%
GAAGGTCCCCCTTAATGACG+TGG - Chr7:56867280-56867299 MsG0780039018.01.T01:CDS 55.0%
! TCTGTTTGCTGAGGCAGGGA+AGG - Chr7:56866026-56866045 MsG0780039018.01.T01:intron 55.0%
GGTCCCCCTTAATGACGTGG+AGG - Chr7:56867283-56867302 MsG0780039018.01.T01:CDS 60.0%
TCGCCCCCTGAAGAAGCCAA+AGG - Chr7:56868195-56868214 MsG0780039018.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 56865949 56868240 56865949 ID=MsG0780039018.01;Name=MsG0780039018.01
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Chr7 exon 56867596 56868240 56867596 ID=MsG0780039018.01.T01:exon:8178;Parent=MsG0780039018.01.T01
Chr7 exon 56866855 56867499 56866855 ID=MsG0780039018.01.T01:exon:8177;Parent=MsG0780039018.01.T01
Chr7 exon 56866697 56866766 56866697 ID=MsG0780039018.01.T01:exon:8176;Parent=MsG0780039018.01.T01
Chr7 exon 56865949 56866031 56865949 ID=MsG0780039018.01.T01:exon:8175;Parent=MsG0780039018.01.T01
Chr7 CDS 56867596 56868240 56867596 ID=MsG0780039018.01.T01:cds;Parent=MsG0780039018.01.T01
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Chr7 CDS 56866697 56866766 56866697 ID=MsG0780039018.01.T01:cds;Parent=MsG0780039018.01.T01
Chr7 CDS 56865949 56866031 56865949 ID=MsG0780039018.01.T01:cds;Parent=MsG0780039018.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780039018.01.T01

ATGGCTGAAAATTCCTCAGCTGAGCAAGTCGACAAAGTTTCCCTTAGAGTTGTGGTGCTAAAGGAGAAAAACAAAGTTCTGTTTGCTGAGGCAGGGAAGGATTTTGTTGATGTTCTTTTGAGCTTCTTATCATTGCCTTTAGGGACCCTTGCAAAACTTGTGGCTAAGGACTCAAATATTGAAGCAGTGAAATTTGGCAGCATAAGCTCGCTGTATCAAAGTGTGTCAGATCTTGATACACAATATCTATGGTCACACACCTGCAAGGAAATGCTACTCAATCCGAACAACTCAGCGGGTGCTTATTGCTGGAATATGAAATTGAACATTGACAATACCGAGTCCTTGAAGTCCTACTACCTCTGCGAGAACGTGTCATGTTTATATGTGGACAATAGGTACTGTTTGAGTTACTTTAGGGATCAAAAATGTATTTGTGGAAAGCTGTTGAACCGAGAAAAATCCCGGATTTTGAGTAAAGAAATCGGTTTTGTTAAGGAAATGTCAACGTTTATCATATCTGATGATCTTTATGTTATGCCAAATGTTGTTACGACAAGTTTAAATCTCCTTCAGAAGCTTGGAGTCAATGACATTGATGCTATTGATAAACAAACCGTCAATATCAACATCACCAAGAAAGAGGTGGTTGATCTTCTCAAATTGTCTTTGGTCTCAAAAACTCCTTTGTCGGACTTTATATTTAAAAAGGAACATTTTGTTGAAGATTTAGTTCTAAGTAACCAATTGGAAGTTAATATTGGTAAAGAAGAGGAAGAATCTGATGAAATGGTTGTGAAAGTACTGAGAAGAAAATCAAGTAAACAGATTTTTTTTCTTGAAGCTGAGGAAGATTTTGCTGATTTTGTTTTTAGTTTTCTCACTTTTCCCTTAGGAGCAGTGTTGCATATTCTCCAAGGATTCTCTTTTGTAAGCTGCATTGATAATTTATATAAGAGCGTGACTGAGTTGAGTTCAGACAAGTGTTTGAGGTCACAGCTTTTCAAAGACATACTAACCAGTCCAACCATTTCTGCTCAATCTGAACTCAGGAACCAGATATTACCGATACCTAAAAACAATTATAAGGCAAAAAATATGTCATACAAATTTGTTGATCCTAAATCCCCTATTACAGGTGGATATGCTGGAACACCATTAACATTTATGGTGACAGACGAATTAGTTGTGACTCCAATGTCATCCATTGATGGTATTTCATATCTTGAAAGAATGAAGGTCCCCCTTAATGACGTGGAGGAAATGGTCGTTAATATTGGCCAGAAGGAGGGTCTCAGCATACTTAGAGCTTCATTGACCTCAAAATCTGCCTTGACAAACGGCCTCAACCAGTTCATTGGTATTAGACATGTTCAGGCTAATTTGTCATCTAATGCTCGCCCCCTGAAGAAGCCAAAGGTAGAAAAAGGAAGCTCGAGATAA
Protein sequence

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