AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880046319.01

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MsG0880046319.01.T01 AT4G23270 33.511 564 339 14 327 867 64 614 5.12e-76 262
MsG0880046319.01.T01 AT4G21230 33.810 559 323 16 340 867 79 621 8.51e-76 261
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MsG0880046319.01.T01 AT4G23190 30.063 632 384 18 298 880 33 655 9.19e-75 259
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MsG0880046319.01.T01 AT4G11480 33.158 570 333 17 338 876 71 623 1.37e-74 258
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MsG0880046319.01.T01 AT4G23140 30.909 605 358 18 344 902 86 676 7.96e-73 254
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MsG0880046319.01.T01 AT4G23320 32.246 521 316 14 381 892 3 495 1.20e-69 240
MsG0880046319.01.T01 AT1G56145 39.665 358 200 7 512 865 623 968 1.48e-69 251
MsG0880046319.01.T01 AT4G23320 32.246 521 316 14 381 892 24 516 1.68e-69 241
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MsG0880046319.01.T01 AT1G11330 36.250 400 235 7 501 884 429 824 7.66e-65 234
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MsG0880046319.01.T01 AT1G11300 39.879 331 189 4 569 898 497 818 3.57e-63 229
MsG0880046319.01.T01 AT4G23250 41.914 303 170 3 569 867 347 647 4.07e-63 227
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MsG0880046319.01.T01 AT4G23250 41.914 303 170 3 569 867 342 642 6.85e-63 227
MsG0880046319.01.T01 AT1G07650 37.215 395 223 9 525 902 634 1020 7.16e-63 231
MsG0880046319.01.T01 AT1G07650 37.215 395 223 9 525 902 628 1014 7.20e-63 231
MsG0880046319.01.T01 AT1G61440 38.378 370 209 9 514 873 414 774 1.39e-62 227
MsG0880046319.01.T01 AT4G21400 41.776 304 165 6 571 866 351 650 1.66e-62 225
MsG0880046319.01.T01 AT4G00960 39.362 282 159 4 627 902 13 288 1.96e-62 213
MsG0880046319.01.T01 AT1G61480 37.795 381 211 9 519 881 426 798 2.70e-62 227
MsG0880046319.01.T01 AT1G11303 42.333 300 165 4 569 867 497 789 2.71e-62 227
MsG0880046319.01.T01 AT1G67520 40.895 313 175 6 569 874 247 556 3.12e-62 222
MsG0880046319.01.T01 AT4G04500 34.361 454 245 14 441 861 200 633 3.22e-62 223
MsG0880046319.01.T01 AT1G67520 40.895 313 175 6 569 874 276 585 3.65e-62 222
MsG0880046319.01.T01 AT1G67520 40.895 313 175 6 569 874 276 585 3.65e-62 222
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MsG0880046319.01.T01 AT1G61360 37.500 368 214 7 513 867 341 705 2.06e-60 220
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MsG0880046319.01.T01 AT1G11340 38.462 299 164 6 513 795 503 797 7.79e-55 204
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MsG0880046319.01.T01 AT2G42960 36.337 344 204 6 559 898 160 492 5.44e-54 196
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MsG0880046319.01.T01 AT1G61610 40.206 291 154 5 514 786 441 729 1.31e-53 200
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MsG0880046319.01.T01 AT5G24080 34.005 397 244 7 510 899 338 723 2.51e-53 199
MsG0880046319.01.T01 AT5G45780 36.310 336 197 8 523 851 204 529 3.18e-53 196
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MsG0880046319.01.T01 AT5G18500 38.835 309 173 9 559 858 143 444 2.02e-52 191
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MsG0880046319.01.T01 AT3G45430 34.409 372 213 9 505 866 274 624 1.73e-47 181
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MsG0880046319.01.T01 AT5G18610 37.458 299 175 7 562 852 64 358 1.79e-47 178
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MsG0880046319.01.T01 AT2G18470 36.066 305 176 6 559 851 259 556 3.47e-47 179
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MsG0880046319.01.T01 AT1G68690 35.495 293 171 4 569 851 365 649 2.31e-46 178
MsG0880046319.01.T01 AT1G70130 36.667 330 191 10 527 851 288 604 2.40e-46 177
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MsG0880046319.01.T01 AT4G32300 35.650 331 199 9 569 894 483 804 4.59e-46 178
MsG0880046319.01.T01 AT5G01550 32.670 352 219 6 510 855 314 653 4.75e-46 177
MsG0880046319.01.T01 AT1G71830 36.678 289 175 4 569 851 290 576 5.43e-46 176
MsG0880046319.01.T01 AT1G68690 35.986 289 167 4 569 847 365 645 5.82e-46 176
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MsG0880046319.01.T01 AT3G45440 37.984 258 154 4 597 851 409 663 1.94e-43 169
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MsG0880046319.01.T01 AT3G26940 34.471 293 179 6 569 851 62 351 2.11e-43 164
MsG0880046319.01.T01 AT2G25220 35.127 316 193 6 540 852 111 417 2.15e-43 164
MsG0880046319.01.T01 AT2G25220 35.127 316 193 6 540 852 116 422 2.23e-43 164
MsG0880046319.01.T01 AT1G16260 30.793 328 210 5 542 854 342 667 2.33e-43 169
MsG0880046319.01.T01 AT1G16260 30.793 328 210 5 542 854 342 667 2.33e-43 169
MsG0880046319.01.T01 AT4G32710 36.721 305 178 7 557 851 366 665 2.47e-43 169
MsG0880046319.01.T01 AT5G63710 33.238 349 204 9 521 851 225 562 2.94e-43 167
MsG0880046319.01.T01 AT5G47070 37.542 301 165 10 569 853 74 367 3.13e-43 163
MsG0880046319.01.T01 AT4G29050 33.616 354 213 9 508 851 289 630 3.17e-43 168
MsG0880046319.01.T01 AT3G24240 33.038 339 203 9 530 853 736 1065 3.20e-43 171
MsG0880046319.01.T01 AT5G10520 34.694 294 178 7 568 855 140 425 3.28e-43 164
MsG0880046319.01.T01 AT5G63710 33.238 349 204 9 521 851 226 563 3.36e-43 167
MsG0880046319.01.T01 AT4G29050 33.616 354 213 9 508 851 275 616 3.61e-43 168
MsG0880046319.01.T01 AT3G01300 35.952 331 178 11 561 877 118 428 4.11e-43 164
MsG0880046319.01.T01 AT4G35600 36.054 294 165 8 574 851 79 365 4.63e-43 162
MsG0880046319.01.T01 AT4G35600 36.054 294 165 8 574 851 80 366 4.77e-43 162
MsG0880046319.01.T01 AT2G28250 35.922 309 180 9 559 852 188 493 5.13e-43 166
MsG0880046319.01.T01 AT2G28250 35.922 309 180 9 559 852 188 493 5.13e-43 166
MsG0880046319.01.T01 AT2G28250 35.922 309 180 9 559 852 188 493 5.13e-43 166
MsG0880046319.01.T01 AT2G28250 35.922 309 180 9 559 852 188 493 5.13e-43 166
MsG0880046319.01.T01 AT2G28250 35.922 309 180 9 559 852 188 493 5.13e-43 166
MsG0880046319.01.T01 AT2G28250 35.922 309 180 9 559 852 188 493 5.13e-43 166
MsG0880046319.01.T01 AT3G58690 34.812 293 179 5 569 852 75 364 5.84e-43 162
MsG0880046319.01.T01 AT5G49780 36.158 354 203 8 513 849 555 902 6.25e-43 169
MsG0880046319.01.T01 AT5G63930 36.901 355 195 14 519 855 739 1082 6.76e-43 170
MsG0880046319.01.T01 AT5G63930 36.901 355 195 14 519 855 675 1018 6.90e-43 169
MsG0880046319.01.T01 AT1G15530 34.386 285 182 4 569 851 349 630 7.23e-43 167
MsG0880046319.01.T01 AT1G09970 35.537 363 198 12 512 851 602 951 8.08e-43 169
MsG0880046319.01.T01 AT5G54590 34.138 290 176 6 567 853 101 378 8.67e-43 162
MsG0880046319.01.T01 AT5G54590 34.138 290 176 6 567 853 101 378 8.67e-43 162
MsG0880046319.01.T01 AT5G54590 34.138 290 176 6 567 853 101 378 8.67e-43 162
MsG0880046319.01.T01 AT4G35030 32.192 292 191 4 569 855 92 381 8.98e-43 162
MsG0880046319.01.T01 AT4G35030 32.192 292 191 4 569 855 92 381 8.98e-43 162
MsG0880046319.01.T01 AT4G35030 32.192 292 191 4 569 855 92 381 8.98e-43 162
MsG0880046319.01.T01 AT4G35030 32.192 292 191 4 569 855 92 381 8.98e-43 162
MsG0880046319.01.T01 AT5G59670 37.500 264 160 3 593 853 574 835 9.34e-43 169
MsG0880046319.01.T01 AT5G59670 37.500 264 160 3 593 853 574 835 9.34e-43 169
MsG0880046319.01.T01 AT2G28930 36.334 311 171 9 558 851 62 362 9.97e-43 162
MsG0880046319.01.T01 AT2G28930 36.334 311 171 9 558 851 54 354 1.07e-42 161
MsG0880046319.01.T01 AT2G28930 36.334 311 171 9 558 851 51 351 1.09e-42 161
MsG0880046319.01.T01 AT3G09830 39.427 279 151 10 591 853 91 367 1.22e-42 161
MsG0880046319.01.T01 AT3G09830 39.427 279 151 10 591 853 91 367 1.22e-42 161
MsG0880046319.01.T01 AT3G09830 39.427 279 151 10 591 853 91 367 1.22e-42 161
MsG0880046319.01.T01 AT4G35030 33.099 284 183 4 569 847 92 373 1.24e-42 160
MsG0880046319.01.T01 AT5G18910 33.746 323 192 9 540 851 146 457 1.26e-42 164
MsG0880046319.01.T01 AT1G52540 33.030 330 195 14 550 868 14 328 1.43e-42 159
MsG0880046319.01.T01 AT4G23210 29.322 457 267 15 338 746 73 521 1.82e-42 163
MsG0880046319.01.T01 AT4G23210 29.322 457 267 15 338 746 73 521 1.82e-42 163
MsG0880046319.01.T01 AT4G32000 35.069 288 181 3 568 852 159 443 1.92e-42 162
MsG0880046319.01.T01 AT5G65700 38.214 280 163 9 593 866 704 979 1.93e-42 168
MsG0880046319.01.T01 AT5G65700 38.214 280 163 9 593 866 704 979 1.93e-42 168
MsG0880046319.01.T01 AT2G18890 37.631 287 162 10 569 847 56 333 1.97e-42 159
MsG0880046319.01.T01 AT1G76370 34.722 288 177 6 568 848 62 345 1.98e-42 160
MsG0880046319.01.T01 AT5G25930 38.909 275 153 8 593 854 695 967 2.00e-42 168
MsG0880046319.01.T01 AT1G52540 33.131 329 194 14 551 868 12 325 2.29e-42 159
MsG0880046319.01.T01 AT5G66790 32.997 297 181 5 569 853 302 592 2.58e-42 164
MsG0880046319.01.T01 AT5G60270 35.069 288 177 6 569 851 329 611 2.92e-42 165
MsG0880046319.01.T01 AT4G23210 29.322 457 267 15 338 746 73 521 3.51e-42 162
MsG0880046319.01.T01 AT1G18390 36.177 293 173 8 569 853 332 618 3.54e-42 165
MsG0880046319.01.T01 AT4G11890 32.566 304 197 4 561 861 22 320 3.61e-42 158
MsG0880046319.01.T01 AT2G28590 36.567 268 163 5 591 851 105 372 3.80e-42 160
MsG0880046319.01.T01 AT4G31100 33.910 289 185 4 569 853 432 718 4.59e-42 166

Find 203 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 520 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTGCATGGCAAATGTTTATC+AGG 0.193615 8:+71973644 None:intergenic
TCATAAACCAACAAGCTTTC+AGG 0.196309 8:+71968508 None:intergenic
TTGCCATGCAGAAATGTTTC+TGG 0.200621 8:-71973632 MsG0880046319.01.T01:CDS
TAAGAATGTGGTCAAACTTT+TGG 0.211224 8:-71968548 MsG0880046319.01.T01:CDS
TGTATCTTATGAAGCTATTA+AGG 0.212607 8:-71973504 MsG0880046319.01.T01:CDS
TTGAGGAATGGTTGTTGTTT+TGG 0.226662 8:+71966698 None:intergenic
AGGGAGGTCAATTTGATTAA+TGG 0.239720 8:-71968580 MsG0880046319.01.T01:CDS
CACAAACATTAGTTGGTAAT+TGG 0.245924 8:-71969657 MsG0880046319.01.T01:CDS
TCTGCTAAGTTCAAAACTTC+AGG 0.270362 8:-71966557 MsG0880046319.01.T01:CDS
TTTGATCCTGCAAATAAATT+AGG 0.274059 8:-71968715 MsG0880046319.01.T01:CDS
TCGGGTGTTGGGTTCATGTA+TGG 0.280996 8:+71973722 None:intergenic
AGGTGCATACCAAAGGTTTC+AGG 0.285926 8:-71969544 MsG0880046319.01.T01:CDS
CCTCGTTCACCTTTGTTTCA+AGG 0.290171 8:-71973671 MsG0880046319.01.T01:CDS
TGCAAGCCTAATTTATTTGC+AGG 0.302634 8:+71968709 None:intergenic
TCTTGCTCCCGATGATAATA+AGG 0.303286 8:+71972861 None:intergenic
GGACCTAGTGATTGGACTTA+TGG 0.306537 8:-71973410 MsG0880046319.01.T01:CDS
TCAATTGATCCTGCTCTTCA+TGG 0.311006 8:-71966854 MsG0880046319.01.T01:CDS
CCAGCTACATAGGCAAAATT+AGG 0.312012 8:+71968781 None:intergenic
ATGGAGGGTACTGAAGAATT+TGG 0.314054 8:+71974066 None:intergenic
GGGAGGTCAATTTGATTAAT+GGG 0.318684 8:-71968579 MsG0880046319.01.T01:CDS
TTTCCCACAAGGTTCAAATT+TGG 0.322366 8:-71967464 MsG0880046319.01.T01:CDS
AACTTAGCAGAAGAAGAAAA+TGG 0.323603 8:+71966569 None:intergenic
GCATACTATGCCATACTTCT+TGG 0.325052 8:+71972210 None:intergenic
CTCATCAAGTAGAATGTTAC+TGG 0.334125 8:+71967852 None:intergenic
GAGGGTAGAAGCTTATTTAC+TGG 0.337373 8:-71969217 MsG0880046319.01.T01:CDS
CGGGTGTTGGGTTCATGTAT+GGG 0.358994 8:+71973723 None:intergenic
AAGGCAGATATATATGCTTT+TGG 0.359468 8:-71967529 MsG0880046319.01.T01:CDS
GACGGAGAAACCGTTGCCTT+TGG 0.360342 8:+71973760 None:intergenic
TTATAGTGTTGCACCTTTGA+AGG 0.365560 8:-71973438 MsG0880046319.01.T01:CDS
GGACTTATGGGATCCGTGTT+AGG 0.370153 8:-71973397 MsG0880046319.01.T01:CDS
TTGAATTTCATCATCTACTT+TGG 0.385993 8:+71966491 None:intergenic
TGCGGTGCTTGTCAGGCTAC+TGG 0.390469 8:-71973347 MsG0880046319.01.T01:CDS
TTGAAAAGTACCAAGAAGTA+TGG 0.396215 8:-71972220 MsG0880046319.01.T01:CDS
AAGAGTAAGTCGCGGAAACC+TGG 0.396710 8:+71973914 None:intergenic
AATGGACAGATGTGTTATTC+AGG 0.396824 8:-71968600 MsG0880046319.01.T01:CDS
GGTATGCGTAATCTATTTGT+AGG 0.399971 8:+71973840 None:intergenic
AATATGTGGGTCCACGGAAA+AGG 0.408551 8:-71969437 MsG0880046319.01.T01:CDS
GCATATCTTCATGAGGGATC+TGG 0.410983 8:-71967904 MsG0880046319.01.T01:CDS
AGTTGTGGGTATGGTTCTGA+TGG 0.412932 8:-71973320 MsG0880046319.01.T01:CDS
GACCTAGTGATTGGACTTAT+GGG 0.418628 8:-71973409 MsG0880046319.01.T01:CDS
TTTGCATGGATATCTGAATC+AGG 0.418813 8:+71966530 None:intergenic
GTTGCACCTTTGAAGGTTGA+TGG 0.422946 8:-71973431 MsG0880046319.01.T01:CDS
AACCGTTGCCTTTGGTTCCT+AGG 0.424965 8:+71973768 None:intergenic
CATTTGACATATTCCTCAAA+TGG 0.426661 8:+71966672 None:intergenic
TCGATAACAATTGTCTTGCT+TGG 0.428173 8:+71969566 None:intergenic
GTTTGCAATGGCGCAGTGTT+GGG 0.428710 8:-71969317 MsG0880046319.01.T01:CDS
CGATAACAATTGTCTTGCTT+GGG 0.430015 8:+71969567 None:intergenic
ATGAGGTTGAAAATGTTTGC+AGG 0.430766 8:-71972832 MsG0880046319.01.T01:intron
CATAAACCAACAAGCTTTCA+GGG 0.436770 8:+71968509 None:intergenic
TAAATTCTACCTGAAACCTT+TGG 0.443272 8:+71969535 None:intergenic
TGAAAACGTTGTCGGGTGTT+GGG 0.444054 8:+71973711 None:intergenic
ATGAAAACGTTGTCGGGTGT+TGG 0.445293 8:+71973710 None:intergenic
ACTGGTGGTAGTTGTGGGTA+TGG 0.446197 8:-71973329 MsG0880046319.01.T01:CDS
CGTGTTAGGTATTCTGTTCA+AGG 0.451485 8:-71973383 MsG0880046319.01.T01:CDS
GGTATGGTTCTGATGGGATT+AGG 0.452697 8:-71973313 MsG0880046319.01.T01:CDS
GTATCTTATGAAGCTATTAA+GGG 0.454558 8:-71973503 MsG0880046319.01.T01:CDS
TGTCATCCATGCTAGCATAT+AGG 0.458562 8:+71972254 None:intergenic
TGATGGCCCTGAAAGCTTGT+TGG 0.458828 8:-71968515 MsG0880046319.01.T01:CDS
AAGCTTCTACCCTCGTTACT+AGG 0.463283 8:+71969226 None:intergenic
TTGAAAGTGACTAAGGGTGC+TGG 0.463548 8:-71969376 MsG0880046319.01.T01:CDS
TGCAGTGGCCTTATTATCAT+CGG 0.468684 8:-71972869 MsG0880046319.01.T01:intron
CTGCTAAGTTCAAAACTTCA+GGG 0.468694 8:-71966556 MsG0880046319.01.T01:CDS
CATTCCTCAACAACCATTTG+AGG 0.472358 8:-71966685 MsG0880046319.01.T01:CDS
AGGCTACTGGTGGTAGTTGT+GGG 0.472568 8:-71973334 MsG0880046319.01.T01:CDS
ATATGTGGGTCCACGGAAAA+GGG 0.476926 8:-71969436 MsG0880046319.01.T01:CDS
TTCATCATCTACTTTGGTTG+AGG 0.478348 8:+71966497 None:intergenic
CAGGCTACTGGTGGTAGTTG+TGG 0.481186 8:-71973335 MsG0880046319.01.T01:CDS
CTCATGTTCCACGTAACCTC+AGG 0.481711 8:-71973875 MsG0880046319.01.T01:CDS
ATCAAGGGCATCAAAATTTG+TGG 0.482316 8:-71969010 MsG0880046319.01.T01:CDS
CATTTGAACTACTTCTGTCA+TGG 0.487690 8:+71966751 None:intergenic
TGGTTACTGAAATTGTTTGT+GGG 0.489724 8:-71967501 MsG0880046319.01.T01:CDS
GCAGTGGCCTTATTATCATC+GGG 0.491551 8:-71972868 MsG0880046319.01.T01:intron
TGTATCGTCACCTGAGGGTA+AGG 0.492333 8:+71966607 None:intergenic
ATGTTCTGACATGGGAGAAA+CGG 0.492750 8:-71967960 MsG0880046319.01.T01:CDS
TGTTTGCAATGGCGCAGTGT+TGG 0.493009 8:-71969318 MsG0880046319.01.T01:CDS
TGTCCTTTGTTGAGACACTC+TGG 0.493827 8:+71967562 None:intergenic
GTACCAAATTTGAACCTTGT+GGG 0.494216 8:+71967461 None:intergenic
TACCCATTTGCCCTTCAAAA+CGG 0.494235 8:-71973947 MsG0880046319.01.T01:CDS
ACTTCAAATTGTGACTCAGC+AGG 0.494437 8:-71973260 MsG0880046319.01.T01:CDS
CATCTCAACAATGGAAATGC+AGG 0.495482 8:-71967769 MsG0880046319.01.T01:CDS
GTTGTGGGTATGGTTCTGAT+GGG 0.495945 8:-71973319 MsG0880046319.01.T01:CDS
AATGAGCATGAAAACGTTGT+CGG 0.501170 8:+71973703 None:intergenic
AAAACTGAAACCAGCTACAT+AGG 0.503649 8:+71968771 None:intergenic
AAACGGTTTCAAATCATATG+TGG 0.503954 8:-71967943 MsG0880046319.01.T01:CDS
ATGAGCATGAAAACGTTGTC+GGG 0.504088 8:+71973704 None:intergenic
TGAAAGTGACTAAGGGTGCT+GGG 0.505294 8:-71969375 MsG0880046319.01.T01:CDS
CTCAAATGGTTGTTGAGGAA+TGG 0.507201 8:+71966686 None:intergenic
TGGCATCCAATGTATGCATT+AGG 0.508842 8:-71969637 MsG0880046319.01.T01:CDS
ATGCAGAAATGTTTCTGGTA+TGG 0.510318 8:-71973627 MsG0880046319.01.T01:CDS
CACTTTCTTTGATGAAAGTG+TGG 0.511372 8:-71969479 MsG0880046319.01.T01:CDS
GTAAGGAACTAGTGGTGCTA+TGG 0.512557 8:+71966624 None:intergenic
TCCCTAGTGTATGTATGAGC+AGG 0.516659 8:-71968938 MsG0880046319.01.T01:CDS
GCAAATAAATTAGGCTTGCA+TGG 0.519201 8:-71968706 MsG0880046319.01.T01:CDS
TAAGTATGATGTGCTTGAGA+AGG 0.520162 8:-71968749 MsG0880046319.01.T01:CDS
ACGTGCGACACACTAGTCCT+AGG 0.524081 8:-71973785 MsG0880046319.01.T01:CDS
CAATGTTCTTTGTAGATCAA+GGG 0.524289 8:-71969025 MsG0880046319.01.T01:intron
TTGTCCTGCTTGGAATATGA+TGG 0.524635 8:-71973585 MsG0880046319.01.T01:CDS
AAGTATGATGTGCTTGAGAA+GGG 0.524638 8:-71968748 MsG0880046319.01.T01:CDS
TCTATGTTCAAAATGATACA+TGG 0.525198 8:-71969153 MsG0880046319.01.T01:CDS
AGTACTATGATTGTCCTGCT+TGG 0.525763 8:-71973595 MsG0880046319.01.T01:CDS
TTGGTTACTGAAATTGTTTG+TGG 0.526537 8:-71967502 MsG0880046319.01.T01:CDS
CGGGAGCAAGAAGGCCTATG+AGG 0.531175 8:-71972849 MsG0880046319.01.T01:CDS
CATTTGAGGAATATGTCAAA+TGG 0.533120 8:-71966671 MsG0880046319.01.T01:CDS
TTCAAAGGAACACTCCCCTC+AGG 0.535009 8:-71968664 MsG0880046319.01.T01:CDS
GTGTTGTTAGAACAACTTGA+AGG 0.536835 8:+71974004 None:intergenic
TTCATGTATGGGGTTCGCCA+CGG 0.537725 8:+71973734 None:intergenic
TGCAGAAATGTTTCTGGTAT+GGG 0.539299 8:-71973626 MsG0880046319.01.T01:CDS
ATGGACAGATGTGTTATTCA+GGG 0.539388 8:-71968599 MsG0880046319.01.T01:CDS
TGGGGAGCACAAACATTAGT+TGG 0.540113 8:-71969664 MsG0880046319.01.T01:CDS
CTAAGTAAGCTTGAGTGTGA+AGG 0.541978 8:-71973473 MsG0880046319.01.T01:CDS
ATAATATAATGATTAGATGA+TGG 0.543194 8:+71974047 None:intergenic
TCAGGTGAAACAACAAGGGT+GGG 0.544832 8:-71969683 MsG0880046319.01.T01:intron
TCTTCAGGAAATGACAGTAT+TGG 0.544937 8:-71968811 MsG0880046319.01.T01:intron
CTAGATAGTACTCACTAGAA+AGG 0.545809 8:+71968455 None:intergenic
CATTGGCCTAATGCATACAT+TGG 0.547840 8:+71969631 None:intergenic
TAAATACTACCTCGAGGAAG+AGG 0.548224 8:+71969121 None:intergenic
GATCAAGATCGCGTTGACAT+TGG 0.550080 8:+71969614 None:intergenic
TCAGGGAAGCCTTGAAACAA+AGG 0.553085 8:+71973662 None:intergenic
AAATTAGGCTTGCATGGTGA+AGG 0.555084 8:-71968700 MsG0880046319.01.T01:CDS
AGGTTGATGGACCTAGTGAT+TGG 0.555804 8:-71973418 MsG0880046319.01.T01:CDS
AATAAATCTCATCTCAACAA+TGG 0.558234 8:-71967778 MsG0880046319.01.T01:CDS
CTAGGTCCATCAACCTTCAA+AGG 0.558381 8:+71973425 None:intergenic
TATTCCTCAAATGGTTGTTG+AGG 0.558793 8:+71966681 None:intergenic
TTTGCCCTTCAAAACGGATG+TGG 0.559842 8:-71973941 MsG0880046319.01.T01:CDS
TAAGTAAGCTTGAGTGTGAA+GGG 0.560178 8:-71973472 MsG0880046319.01.T01:CDS
TGAACTACTTCTGTCATGGA+TGG 0.560960 8:+71966755 None:intergenic
ACAACAACAATTCTTCCTGA+GGG 0.564370 8:+71968649 None:intergenic
GGGTGTTGGGTTCATGTATG+GGG 0.564735 8:+71973724 None:intergenic
GCTCGTGAAGTGTGAGAGCT+TGG 0.565272 8:+71973819 None:intergenic
ACCACTAGTTCCTTACCCTC+AGG 0.566377 8:-71966617 MsG0880046319.01.T01:CDS
TTCCTGCTCATACATACACT+AGG 0.568740 8:+71968936 None:intergenic
TGGCCCATCATATTCCAAGC+AGG 0.569795 8:+71973581 None:intergenic
TGCATGGCAAATGTTTATCA+GGG 0.573889 8:+71973645 None:intergenic
TCATTTCAGGTGAAACAACA+AGG 0.575509 8:-71969688 MsG0880046319.01.T01:intron
ATATAATGATTAGATGATGG+AGG 0.576829 8:+71974050 None:intergenic
GGAGAAGGTTCTGTGTTCAA+AGG 0.582519 8:-71968679 MsG0880046319.01.T01:CDS
AACGGTTTCAAATCATATGT+GGG 0.582617 8:-71967942 MsG0880046319.01.T01:CDS
AACAACAACAATTCTTCCTG+AGG 0.583820 8:+71968648 None:intergenic
AGAGTAAGTCGCGGAAACCT+GGG 0.586825 8:+71973915 None:intergenic
TATCTTATGAAGCTATTAAG+GGG 0.587092 8:-71973502 MsG0880046319.01.T01:CDS
TAGGACTCTGTAGGAACCTG+AGG 0.590231 8:+71973859 None:intergenic
ATCATATGTGGGATAGCTGA+GGG 0.590534 8:-71967931 MsG0880046319.01.T01:CDS
GTTATCGAGGTGCATACCAA+AGG 0.590956 8:-71969551 MsG0880046319.01.T01:CDS
AGTACCAAATTTGAACCTTG+TGG 0.591343 8:+71967460 None:intergenic
ATTAGGCAAGTTTGTATGTG+TGG 0.591730 8:-71973296 MsG0880046319.01.T01:CDS
GTGTTAGGTATTCTGTTCAA+GGG 0.592070 8:-71973382 MsG0880046319.01.T01:CDS
CCAGGTATGGAAGAATTACA+AGG 0.594239 8:-71966894 MsG0880046319.01.T01:intron
TGGGGTTCGCCACGGTTCGA+CGG 0.594648 8:+71973742 None:intergenic
TTCAGGTGAAACAACAAGGG+TGG 0.595419 8:-71969684 MsG0880046319.01.T01:intron
CAAAACGGATGTGGCCACCC+AGG 0.596075 8:-71973932 MsG0880046319.01.T01:CDS
TATAATGATTAGATGATGGA+GGG 0.605453 8:+71974051 None:intergenic
GAGGCAACACAATGTTTGCA+TGG 0.605741 8:+71966516 None:intergenic
TCAGGTAGAATTTACCTCGA+CGG 0.605815 8:-71969526 MsG0880046319.01.T01:CDS
AACACATGTAGATCATATTG+TGG 0.606078 8:-71973986 MsG0880046319.01.T01:CDS
GGCTTGCATGGTGAAGGAGA+AGG 0.608316 8:-71968694 MsG0880046319.01.T01:CDS
ACCTGAGGGTAAGGAACTAG+TGG 0.608470 8:+71966616 None:intergenic
ACGGTTTCTCCGTCGAACCG+TGG 0.613058 8:-71973751 MsG0880046319.01.T01:CDS
GTCATGGATGGTCTAAGAGT+AGG 0.615297 8:+71966767 None:intergenic
GGAAGGTGGTCTGTTTGCAA+TGG 0.617123 8:-71969329 MsG0880046319.01.T01:CDS
TAGCATGGATGACAACCAGC+TGG 0.617310 8:-71972245 MsG0880046319.01.T01:CDS
TGTCCTGCTTGGAATATGAT+GGG 0.617971 8:-71973584 MsG0880046319.01.T01:CDS
TATTATCATCGGGAGCAAGA+AGG 0.618389 8:-71972858 MsG0880046319.01.T01:CDS
CAAAGGACAACTTACAGAGA+AGG 0.618551 8:-71967548 MsG0880046319.01.T01:CDS
CCTTGAAACAAAGGTGAACG+AGG 0.620322 8:+71973671 None:intergenic
AAACAAATGTTGCATTGTGT+CGG 0.625589 8:+71969592 None:intergenic
TTGCATGGATATCTGAATCA+GGG 0.626378 8:+71966531 None:intergenic
TCCTGCTCATACATACACTA+GGG 0.627324 8:+71968937 None:intergenic
AGCGTTGTATCGTCACCTGA+GGG 0.627730 8:+71966602 None:intergenic
GTCCTAGGAACCAAAGGCAA+CGG 0.628622 8:-71973770 MsG0880046319.01.T01:CDS
CTTGAACAGAATACCTAACA+CGG 0.629047 8:+71973384 None:intergenic
TGTAGGAACCTGAGGTTACG+TGG 0.629711 8:+71973867 None:intergenic
GGGCTTAGCATATCTTCATG+AGG 0.630487 8:-71967911 MsG0880046319.01.T01:CDS
GTGTACAAAGAAGTGCAGCT+TGG 0.632071 8:+71966798 None:intergenic
ATCTATTTGTAGGACTCTGT+AGG 0.633162 8:+71973850 None:intergenic
TAGCGTTGTATCGTCACCTG+AGG 0.634751 8:+71966601 None:intergenic
GAAAGTGACTAAGGGTGCTG+GGG 0.634979 8:-71969374 MsG0880046319.01.T01:CDS
AATCATATGTGGGATAGCTG+AGG 0.636725 8:-71967932 MsG0880046319.01.T01:CDS
GGCTTAGCATATCTTCATGA+GGG 0.638308 8:-71967910 MsG0880046319.01.T01:CDS
CAGGTGAAACAACAAGGGTG+GGG 0.639020 8:-71969682 MsG0880046319.01.T01:CDS
ACACTAGTCCTAGGAACCAA+AGG 0.639572 8:-71973776 MsG0880046319.01.T01:CDS
TGTTGTTAGAACAACTTGAA+GGG 0.642633 8:+71974005 None:intergenic
GCTCCAGAGTGTCTCAACAA+AGG 0.644549 8:-71967565 MsG0880046319.01.T01:CDS
TAAGATACAGCACAACACTC+AGG 0.645417 8:+71973518 None:intergenic
CACGGAAAAGGGAGAGACGG+TGG 0.647470 8:-71969425 MsG0880046319.01.T01:CDS
TGGGATTCAACATAAGAATG+TGG 0.647751 8:-71968560 MsG0880046319.01.T01:CDS
ATCCCATAAGTCCAATCACT+AGG 0.648619 8:+71973407 None:intergenic
GTCCACGGAAAAGGGAGAGA+CGG 0.649122 8:-71969428 MsG0880046319.01.T01:CDS
AAGCAAGACAATTGTTATCG+AGG 0.655599 8:-71969564 MsG0880046319.01.T01:CDS
ATACCAGAAACATTTCTGCA+TGG 0.663576 8:+71973629 None:intergenic
GATACAGCACAACACTCAGG+TGG 0.668833 8:+71973521 None:intergenic
GGTGCTTGTCAGGCTACTGG+TGG 0.671063 8:-71973344 MsG0880046319.01.T01:CDS
CAACAACAATTCTTCCTGAG+GGG 0.672218 8:+71968650 None:intergenic
GAATGTGTTCCTAGTAACGA+GGG 0.677675 8:-71969235 MsG0880046319.01.T01:CDS
GTGTCGCACGTAGACATGTG+TGG 0.685953 8:+71973797 None:intergenic
CTATGTTCAAAATGATACAT+GGG 0.685967 8:-71969152 MsG0880046319.01.T01:CDS
GGAATGTGTTCCTAGTAACG+AGG 0.687081 8:-71969236 MsG0880046319.01.T01:CDS
GTTGAAATTCCTCTTCCTCG+AGG 0.687925 8:-71969130 MsG0880046319.01.T01:intron
GGACGCGAAACATGTTGAGA+CGG 0.688971 8:-71969404 MsG0880046319.01.T01:CDS
AACGAAGAAAACAACCGTCG+AGG 0.700791 8:+71969512 None:intergenic
GACAGATGTGTTATTCAGGG+AGG 0.710705 8:-71968596 MsG0880046319.01.T01:CDS
TTATGCAGAAGAGTAAGTCG+CGG 0.714681 8:+71973906 None:intergenic
CATTTCAGGTGAAACAACAA+GGG 0.720879 8:-71969687 MsG0880046319.01.T01:intron
GTAAGTCGCGGAAACCTGGG+TGG 0.729190 8:+71973918 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATTTCATTAAAAAATACAA+AGG - Chr8:71969778-71969797 MsG0880046319.01.T01:intron 10.0%
!! ATGATAAATAATATCAATTA+CGG - Chr8:71967554-71967573 MsG0880046319.01.T01:CDS 10.0%
!! ATTAGAAATATGATTATTAA+TGG + Chr8:71970341-71970360 None:intergenic 10.0%
!! TAATTGATATTATTTATCAT+CGG + Chr8:71967554-71967573 None:intergenic 10.0%
!! TATAAGATAATAAAATTATG+TGG + Chr8:71968677-71968696 None:intergenic 10.0%
!!! ATACACTAATTTATTTTTTA+TGG - Chr8:71971508-71971527 MsG0880046319.01.T01:intron 10.0%
!!! ATTTTATTTTATTCCTTATT+TGG + Chr8:71970296-71970315 None:intergenic 10.0%
!!! TTTTATTTTATTCCTTATTT+GGG + Chr8:71970295-71970314 None:intergenic 10.0%
!! AAATTATCCTTATTAACTAT+TGG - Chr8:71968015-71968034 MsG0880046319.01.T01:intron 15.0%
!! AATAGTTAATAAGGATAATT+TGG + Chr8:71968016-71968035 None:intergenic 15.0%
!! AATTGATATTATTTATCATC+GGG + Chr8:71967553-71967572 None:intergenic 15.0%
!! ATAATATAATGATTAGATGA+TGG + Chr8:71966531-71966550 None:intergenic 15.0%
!! TAATACAAAGTAAGAATTTA+AGG + Chr8:71973170-71973189 None:intergenic 15.0%
!! TTAATTATTGAGCAAAATTT+AGG - Chr8:71973187-71973206 MsG0880046319.01.T01:intron 15.0%
!! TTATTATTGTGTCAAAAAAT+TGG + Chr8:71969943-71969962 None:intergenic 15.0%
!!! AAATATACCTATTTTTTATC+AGG - Chr8:71973274-71973293 MsG0880046319.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATGTGTAGAATTTATTTTTT+TGG + Chr8:71969750-71969769 None:intergenic 15.0%
!!! TAAATAACTTATTTTAGAGA+GGG + Chr8:71967378-71967397 None:intergenic 15.0%
!!! TAGTTTTAAATGTAATACTT+TGG - Chr8:71968039-71968058 MsG0880046319.01.T01:intron 15.0%
!!! TATTAGTTGACTTAAAAATA+AGG - Chr8:71969806-71969825 MsG0880046319.01.T01:intron 15.0%
!!! TATTTTTCTATTTTTTTCCT+AGG + Chr8:71968516-71968535 None:intergenic 15.0%
!!! TCAAGATTCTATTAATTTTT+TGG - Chr8:71967350-71967369 MsG0880046319.01.T01:intron 15.0%
!!! TTAAATAACTTATTTTAGAG+AGG + Chr8:71967379-71967398 None:intergenic 15.0%
!!! TTTCATTACTTTTGTTAATT+AGG - Chr8:71967816-71967835 MsG0880046319.01.T01:CDS 15.0%
!! AAAAATATTACATGAGACTA+TGG + Chr8:71968962-71968981 None:intergenic 20.0%
!! AAAACTAAGATATGGTTATT+TGG + Chr8:71970569-71970588 None:intergenic 20.0%
!! AAACTAACCAATAGTTAATA+AGG + Chr8:71968025-71968044 None:intergenic 20.0%
!! AAATGAGTAGTATTAATATG+CGG - Chr8:71970048-71970067 MsG0880046319.01.T01:intron 20.0%
!! ACATTTGTCTATAAGAAAAT+TGG + Chr8:71972147-71972166 None:intergenic 20.0%
!! AGAAAAAGTTATTATTGCAT+TGG - Chr8:71968102-71968121 MsG0880046319.01.T01:intron 20.0%
!! AGAAATATGATTATTAATGG+TGG + Chr8:71970338-71970357 None:intergenic 20.0%
!! AGAACAAAATATTCAATTTG+TGG - Chr8:71968612-71968631 MsG0880046319.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAATTGTAATTGTCAAAGT+AGG + Chr8:71968649-71968668 None:intergenic 20.0%
!! ATATTTCTCATTTGTGAAAA+AGG + Chr8:71972564-71972583 None:intergenic 20.0%
!! ATTGATATTATTTATCATCG+GGG + Chr8:71967552-71967571 None:intergenic 20.0%
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!! CACCATTATAATATATTATG+TGG + Chr8:71973328-71973347 None:intergenic 20.0%
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AAACTAGACTAACTAGTTAG+GGG + Chr8:71972332-71972351 None:intergenic 30.0%
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AACTTAGCAGAAGAAGAAAA+TGG + Chr8:71974009-71974028 None:intergenic 30.0%
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!! CGTCATTTGATTTGCTAAAA+TGG + Chr8:71968252-71968271 None:intergenic 30.0%
!! CTATAAACAATAGGTTGGTT+CGG - Chr8:71968835-71968854 MsG0880046319.01.T01:intron 30.0%
!! GTGATTTTGAAAGTGACTAA+GGG - Chr8:71971193-71971212 MsG0880046319.01.T01:intron 30.0%
!! TATAAACAATAGGTTGGTTC+GGG - Chr8:71968836-71968855 MsG0880046319.01.T01:intron 30.0%
!! TATTCCATAGCTATTTTCCT+AGG - Chr8:71968496-71968515 MsG0880046319.01.T01:CDS 30.0%
!! TGTATACTTTTGATCGGTTT+AGG + Chr8:71968762-71968781 None:intergenic 30.0%
!! TTGAAAAGTACCAAGAAGTA+TGG - Chr8:71968355-71968374 MsG0880046319.01.T01:intron 30.0%
!!! GTGTTTCCTTTTTTCTATGT+TGG + Chr8:71970606-71970625 None:intergenic 30.0%
!!! GTTTTTTGAGGTATTCAACA+AGG - Chr8:71971383-71971402 MsG0880046319.01.T01:intron 30.0%
!!! TGTTTTTTCATGTACAGGTA+TGG - Chr8:71972583-71972602 MsG0880046319.01.T01:intron 30.0%
!!! TTCAAAATGAGTGTCGTTTT+AGG - Chr8:71967935-71967954 MsG0880046319.01.T01:CDS 30.0%
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AACAACAACAATTCTTCCTG+AGG + Chr8:71971930-71971949 None:intergenic 35.0%
AACTAGACTAACTAGTTAGG+GGG + Chr8:71972331-71972350 None:intergenic 35.0%
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AATGAGCATGAAAACGTTGT+CGG + Chr8:71966875-71966894 None:intergenic 35.0%
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! AAAATGTTCTTGTTTGGACC+AGG - Chr8:71973663-71973682 MsG0880046319.01.T01:CDS 35.0%
! AATGGACAGATGTGTTATTC+AGG - Chr8:71971975-71971994 MsG0880046319.01.T01:intron 35.0%
! AATTTCCCTTGTGTCATTGT+TGG + Chr8:71970008-71970027 None:intergenic 35.0%
! AGAATGTGGTCAAACTTTTG+GGG - Chr8:71972029-71972048 MsG0880046319.01.T01:intron 35.0%
! ATACTAAGGGCATGAATTAG+GGG - Chr8:71969285-71969304 MsG0880046319.01.T01:CDS 35.0%
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! CATTTCAGGTGAAACAACAA+GGG - Chr8:71970888-71970907 MsG0880046319.01.T01:intron 35.0%
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! GCAAACATTTTCAACCTCAT+AGG + Chr8:71967743-71967762 None:intergenic 35.0%
! GTAGTGTGCAGAGTATTAAT+TGG - Chr8:71968064-71968083 MsG0880046319.01.T01:intron 35.0%
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! TCAAATTTTCCATGAAGAGC+AGG + Chr8:71973733-71973752 None:intergenic 35.0%
! TCATTTCAGGTGAAACAACA+AGG - Chr8:71970887-71970906 MsG0880046319.01.T01:intron 35.0%
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!! AAAGACAAAGACTTGGTGTT+TGG - Chr8:71970228-71970247 MsG0880046319.01.T01:intron 35.0%
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!! TGCAGAAATGTTTCTGGTAT+GGG - Chr8:71966949-71966968 MsG0880046319.01.T01:intron 35.0%
!! TGTAACTTTTCTTTTTGGGC+AGG - Chr8:71968290-71968309 MsG0880046319.01.T01:intron 35.0%
!!! GACACTCATTTTGAAACAGA+GGG - Chr8:71968172-71968191 MsG0880046319.01.T01:intron 35.0%
!!! GGTTGGATTTACACGTTTTT+TGG - Chr8:71968792-71968811 MsG0880046319.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGAGGAATGGTTGTTGTTTT+GGG + Chr8:71973879-71973898 None:intergenic 35.0%
!!! TGTTTTTTGATACACGGCAA+TGG - Chr8:71971957-71971976 MsG0880046319.01.T01:intron 35.0%
!!! TTGAGGAATGGTTGTTGTTT+TGG + Chr8:71973880-71973899 None:intergenic 35.0%
AAATTAGGCTTGCATGGTGA+AGG - Chr8:71971875-71971894 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
AATCATATGTGGGATAGCTG+AGG - Chr8:71972643-71972662 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
ACTTCAAATTGTGACTCAGC+AGG - Chr8:71967315-71967334 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
ACTTGAACCTTGAGAACCAA+AGG - Chr8:71972499-71972518 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
ACTTTGGACCATTTCGTTGT+TGG + Chr8:71970177-71970196 None:intergenic 40.0%
AGGTTTCCATCATGAGAATG+TGG - Chr8:71969102-71969121 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
AGTACTATGATTGTCCTGCT+TGG - Chr8:71966980-71966999 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
AGTTGTTACAGGTAATGCCT+CGG + Chr8:71970260-71970279 None:intergenic 40.0%
ATCATATGTGGGATAGCTGA+GGG - Chr8:71972644-71972663 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
ATCCCATAAGTCCAATCACT+AGG + Chr8:71967171-71967190 None:intergenic 40.0%
ATGAGCATGAAAACGTTGTC+GGG + Chr8:71966874-71966893 None:intergenic 40.0%
ATGTTCTGACATGGGAGAAA+CGG - Chr8:71972615-71972634 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
ATTTGTGAAAAAGGGGAGAG+AGG + Chr8:71972555-71972574 None:intergenic 40.0%
CAAAGGACAACTTACAGAGA+AGG - Chr8:71973027-71973046 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
CAACAACAATTCTTCCTGAG+GGG + Chr8:71971928-71971947 None:intergenic 40.0%
CATCTCAACAATGGAAATGC+AGG - Chr8:71972806-71972825 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
CATTCCTCAACAACCATTTG+AGG - Chr8:71973890-71973909 MsG0880046319.01.T01:CDS 40.0%
CCAGCTACATAGGCAAAATT+AGG + Chr8:71971797-71971816 None:intergenic 40.0%
CCAGGTATGGAAGAATTACA+AGG - Chr8:71973681-71973700 MsG0880046319.01.T01:CDS 40.0%
CCTTGTAATTCTTCCATACC+TGG + Chr8:71973684-71973703 None:intergenic 40.0%
CGTGTTAGGTATTCTGTTCA+AGG - Chr8:71967192-71967211 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
CTAAGTAAGCTTGAGTGTGA+AGG - Chr8:71967102-71967121 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
CTCAAATGGTTGTTGAGGAA+TGG + Chr8:71973892-71973911 None:intergenic 40.0%
CTGCATGGCAAATGTTTATC+AGG + Chr8:71966934-71966953 None:intergenic 40.0%
CTTGAACCTTGAGAACCAAA+GGG - Chr8:71972500-71972519 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
CTTGTCAGTGTGTCTTAATC+AGG - Chr8:71967411-71967430 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
GAATGTGTTCCTAGTAACGA+GGG - Chr8:71971340-71971359 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
GACCTAGTGATTGGACTTAT+GGG - Chr8:71967166-71967185 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
GAGGGTAGAAGCTTATTTAC+TGG - Chr8:71971358-71971377 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
GATCCACCTTAAAGGTAGAT+TGG + Chr8:71970482-71970501 None:intergenic 40.0%
GCAGCCTTAAACTTGACTAA+TGG + Chr8:71973507-71973526 None:intergenic 40.0%
GCATACTATGCCATACTTCT+TGG + Chr8:71968368-71968387 None:intergenic 40.0%
GCGAGACTATCATCATAAAC+TGG - Chr8:71968386-71968405 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
GGCTTAGCATATCTTCATGA+GGG - Chr8:71972665-71972684 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
TAAAGGTAGATTGGGAGAGA+CGG + Chr8:71970473-71970492 None:intergenic 40.0%
TAAATACTACCTCGAGGAAG+AGG + Chr8:71971457-71971476 None:intergenic 40.0%
TAAGATACAGCACAACACTC+AGG + Chr8:71967060-71967079 None:intergenic 40.0%
TACCCATTTGCCCTTCAAAA+CGG - Chr8:71966628-71966647 MsG0880046319.01.T01:CDS 40.0%
TATCCCTTTAACAGGGAAAG+AGG + Chr8:71969142-71969161 None:intergenic 40.0%
TATTATCATCGGGAGCAAGA+AGG - Chr8:71967717-71967736 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
TCAATTGATCCTGCTCTTCA+TGG - Chr8:71973721-71973740 MsG0880046319.01.T01:CDS 40.0%
TCAGGTAGAATTTACCTCGA+CGG - Chr8:71971049-71971068 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
TCATATGTGACATGCTTCGA+CGG - Chr8:71970752-71970771 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
TCCTGCTCATACATACACTA+GGG + Chr8:71971641-71971660 None:intergenic 40.0%
TCTCTCCCAATCTACCTTTA+AGG - Chr8:71970473-71970492 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
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TTCCTGCTCATACATACACT+AGG + Chr8:71971642-71971661 None:intergenic 40.0%
TTGCCATGCAGAAATGTTTC+TGG - Chr8:71966943-71966962 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
TTGTCCTGCTTGGAATATGA+TGG - Chr8:71966990-71967009 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
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! AATAACGGTGTTTTCCCACA+AGG - Chr8:71973100-71973119 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
! ACCATTTCGTTGTTGGTCTA+CGG + Chr8:71970170-71970189 None:intergenic 40.0%
! ACCCCTCTTTACGAGAATTT+TGG + Chr8:71969175-71969194 None:intergenic 40.0%
! ATTTGGGGACAATGCTACTT+TGG + Chr8:71970193-71970212 None:intergenic 40.0%
! CATTGGCCTAATGCATACAT+TGG + Chr8:71970947-71970966 None:intergenic 40.0%
! CCTAATTTTGCCTATGTAGC+TGG - Chr8:71971794-71971813 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
! GTGTGCAGAGTATTAATTGG+AGG - Chr8:71968067-71968086 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
! TGGTACTTTTCAAATCCAGC+TGG + Chr8:71968348-71968367 None:intergenic 40.0%
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!! ATGGAGGGTACTGAAGAATT+TGG + Chr8:71966512-71966531 None:intergenic 40.0%
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!! TTCTTTTTGGGCAGGACTTT+TGG - Chr8:71968298-71968317 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
!!! AATGGTTGTTGTTTTGGGGT+GGG + Chr8:71973874-71973893 None:intergenic 40.0%
!!! ATCCGTTTTGAAGGGCAAAT+GGG + Chr8:71966633-71966652 None:intergenic 40.0%
!!! CGACACTCATTTTGAAACAG+AGG - Chr8:71968171-71968190 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
!!! CTTTTGGGGTGTAGTATTGA+TGG - Chr8:71972043-71972062 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
!!! GACACTCATTTTGAAACGGA+GGG + Chr8:71967930-71967949 None:intergenic 40.0%
!!! GAGGAATGGTTGTTGTTTTG+GGG + Chr8:71973878-71973897 None:intergenic 40.0%
!!! TCTTCTTCGTTTTTTGGGTC+TGG - Chr8:71967030-71967049 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
!!! TGTACATGCCTTTTTTTGGG+TGG - Chr8:71968425-71968444 MsG0880046319.01.T01:intron 40.0%
AAAGCTTGGAGATACACCGA+GGG - Chr8:71969195-71969214 MsG0880046319.01.T01:CDS 45.0%
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AAGCTTCTACCCTCGTTACT+AGG + Chr8:71971352-71971371 None:intergenic 45.0%
AATATGTGGGTCCACGGAAA+AGG - Chr8:71971138-71971157 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
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AGGTGCATACCAAAGGTTTC+AGG - Chr8:71971031-71971050 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
ATATGTGGGTCCACGGAAAA+GGG - Chr8:71971139-71971158 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
ATGAAAACGTTGTCGGGTGT+TGG + Chr8:71966868-71966887 None:intergenic 45.0%
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CTAGGTCCATCAACCTTCAA+AGG + Chr8:71967153-71967172 None:intergenic 45.0%
GAGAGGGAGAACAAGACAAT+TGG + Chr8:71972538-71972557 None:intergenic 45.0%
GAGGCAACACAATGTTTGCA+TGG + Chr8:71974062-71974081 None:intergenic 45.0%
GCATATCTTCATGAGGGATC+TGG - Chr8:71972671-71972690 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
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GGAGAAGGTTCTGTGTTCAA+AGG - Chr8:71971896-71971915 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
GGGCTTAGCATATCTTCATG+AGG - Chr8:71972664-71972683 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
GTCATGGATGGTCTAAGAGT+AGG + Chr8:71973811-71973830 None:intergenic 45.0%
GTTATCGAGGTGCATACCAA+AGG - Chr8:71971024-71971043 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
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GTTTCTTGGGAGATTGCTAG+TGG + Chr8:71969351-71969370 None:intergenic 45.0%
TAAAGCTTGGAGATACACCG+AGG - Chr8:71969194-71969213 MsG0880046319.01.T01:CDS 45.0%
TCAGGGAAGCCTTGAAACAA+AGG + Chr8:71966916-71966935 None:intergenic 45.0%
TCAGGTGAAACAACAAGGGT+GGG - Chr8:71970892-71970911 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
TCCCTAGTGTATGTATGAGC+AGG - Chr8:71971637-71971656 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
TCGTAAAGAGGGGTAAAGCT+TGG - Chr8:71969181-71969200 MsG0880046319.01.T01:CDS 45.0%
TGAAAACGTTGTCGGGTGTT+GGG + Chr8:71966867-71966886 None:intergenic 45.0%
TGGGTCCAACAATGACACAA+GGG - Chr8:71970000-71970019 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
TGTCCTTTGTTGAGACACTC+TGG + Chr8:71973016-71973035 None:intergenic 45.0%
TTCACTTGGAGCAGCAGAAA+AGG + Chr8:71969400-71969419 None:intergenic 45.0%
TTCAGGTGAAACAACAAGGG+TGG - Chr8:71970891-71970910 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
TTGTGGCCACATTCTCATGA+TGG + Chr8:71969111-71969130 None:intergenic 45.0%
TTTGCCCTTCAAAACGGATG+TGG - Chr8:71966634-71966653 MsG0880046319.01.T01:CDS 45.0%
! ATGCAAAGTGGAGTATCCCT+CGG + Chr8:71969214-71969233 None:intergenic 45.0%
! CAAGGGAGTGATGAGTTTTG+CGG - Chr8:71967210-71967229 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
! CCTCGTTCACCTTTGTTTCA+AGG - Chr8:71966904-71966923 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
! CTCCCAATCTACCTTTAAGG+TGG - Chr8:71970476-71970495 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
! GACAGATGTGTTATTCAGGG+AGG - Chr8:71971979-71971998 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
! GATCAAGATCGCGTTGACAT+TGG + Chr8:71970964-71970983 None:intergenic 45.0%
! GGGTCCTCAGAGTTTGAAAT+CGG - Chr8:71972257-71972276 MsG0880046319.01.T01:CDS 45.0%
! GGTCCTCAGAGTTTGAAATC+GGG - Chr8:71972258-71972277 MsG0880046319.01.T01:CDS 45.0%
! GTAAGGAACTAGTGGTGCTA+TGG + Chr8:71973954-71973973 None:intergenic 45.0%
! GTGTACAAAGAAGTGCAGCT+TGG + Chr8:71973780-71973799 None:intergenic 45.0%
! GTTCTTGTTTGGACCAGGTA+TGG - Chr8:71973668-71973687 MsG0880046319.01.T01:CDS 45.0%
! GTTGCACCTTTGAAGGTTGA+TGG - Chr8:71967144-71967163 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
! TGGGGAGCACAAACATTAGT+TGG - Chr8:71970911-71970930 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
! TTGAAAGTGACTAAGGGTGC+TGG - Chr8:71971199-71971218 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
!! AACAATAGGTTGGTTCGGGT+CGG - Chr8:71968840-71968859 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
!! ACAAAGACTTGGTGTTTGGC+AGG - Chr8:71970232-71970251 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
!! AGGTTGATGGACCTAGTGAT+TGG - Chr8:71967157-71967176 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
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!! GCAGTGGCCTTATTATCATC+GGG - Chr8:71967707-71967726 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
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!! TGAAAGTGACTAAGGGTGCT+GGG - Chr8:71971200-71971219 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
!! TTTTCTGTTGATGGGGAAGG+TGG - Chr8:71971232-71971251 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
!!! ACGGGCTCTTCTTCGTTTTT+TGG - Chr8:71967024-71967043 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
!!! ATGGTTGTTGTTTTGGGGTG+GGG + Chr8:71973873-71973892 None:intergenic 45.0%
!!! CATCCGTTTTGAAGGGCAAA+TGG + Chr8:71966634-71966653 None:intergenic 45.0%
!!! CGACACTCATTTTGAAACGG+AGG + Chr8:71967931-71967950 None:intergenic 45.0%
!!! CGGGCTCTTCTTCGTTTTTT+GGG - Chr8:71967025-71967044 MsG0880046319.01.T01:intron 45.0%
!!! GAATGGTTGTTGTTTTGGGG+TGG + Chr8:71973875-71973894 None:intergenic 45.0%
!! TTAAACTTATATTTAAATAT+AGG + Chr8:71973539-71973558 None:intergenic 5.0%
!!! AAAAAAAATTAATTTTTTTG+GGG + Chr8:71969642-71969661 None:intergenic 5.0%
!!! AATTTTCTTATATTTATAAT+TGG + Chr8:71968916-71968935 None:intergenic 5.0%
!!! ATATTTATATAATTCTTTTT+GGG - Chr8:71969692-71969711 MsG0880046319.01.T01:intron 5.0%
!!! GAAAAAAAATTAATTTTTTT+GGG + Chr8:71969643-71969662 None:intergenic 5.0%
!!! TATATTTATATAATTCTTTT+TGG - Chr8:71969691-71969710 MsG0880046319.01.T01:intron 5.0%
!!! TGAAAAAAAATTAATTTTTT+TGG + Chr8:71969644-71969663 None:intergenic 5.0%
AAGAGTAAGTCGCGGAAACC+TGG + Chr8:71966664-71966683 None:intergenic 50.0%
AATGGACGCGGTCTCATTTC+AGG - Chr8:71970874-71970893 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
ACCACTAGTTCCTTACCCTC+AGG - Chr8:71973958-71973977 MsG0880046319.01.T01:CDS 50.0%
ACCTGAGGGTAAGGAACTAG+TGG + Chr8:71973962-71973981 None:intergenic 50.0%
ACTGGTGGTAGTTGTGGGTA+TGG - Chr8:71967246-71967265 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
AGAGTAAGTCGCGGAAACCT+GGG + Chr8:71966663-71966682 None:intergenic 50.0%
AGCGTTGTATCGTCACCTGA+GGG + Chr8:71973976-71973995 None:intergenic 50.0%
AGGCTACTGGTGGTAGTTGT+GGG - Chr8:71967241-71967260 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
AGTGGAAGAGAATGGGAGGT+GGG - Chr8:71969981-71970000 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
CAGGTGAAACAACAAGGGTG+GGG - Chr8:71970893-71970912 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
CTCATGTTCCACGTAACCTC+AGG - Chr8:71966700-71966719 MsG0880046319.01.T01:CDS 50.0%
GATACAGCACAACACTCAGG+TGG + Chr8:71967057-71967076 None:intergenic 50.0%
GGAAGGTGGTCTGTTTGCAA+TGG - Chr8:71971246-71971265 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
GGACCCGATTTCAAACTCTG+AGG + Chr8:71972243-71972262 None:intergenic 50.0%
GGACGCGAAACATGTTGAGA+CGG - Chr8:71971171-71971190 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
GGACTTATGGGATCCGTGTT+AGG - Chr8:71967178-71967197 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
GTCCTAGGAACCAAAGGCAA+CGG - Chr8:71966805-71966824 MsG0880046319.01.T01:CDS 50.0%
GTGGGTCCAACAATGACACA+AGG - Chr8:71969999-71970018 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
GTTTGCAATGGCGCAGTGTT+GGG - Chr8:71971258-71971277 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
TAGCATGGATGACAACCAGC+TGG - Chr8:71968330-71968349 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
TAGCGTTGTATCGTCACCTG+AGG + Chr8:71973977-71973996 None:intergenic 50.0%
TAGGACTCTGTAGGAACCTG+AGG + Chr8:71966719-71966738 None:intergenic 50.0%
TAGTGGAAGAGAATGGGAGG+TGG - Chr8:71969980-71969999 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
TGATGGCCCTGAAAGCTTGT+TGG - Chr8:71972060-71972079 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
TGGCCCATCATATTCCAAGC+AGG + Chr8:71966997-71967016 None:intergenic 50.0%
TGTAGGAACCTGAGGTTACG+TGG + Chr8:71966711-71966730 None:intergenic 50.0%
TGTATCGTCACCTGAGGGTA+AGG + Chr8:71973971-71973990 None:intergenic 50.0%
TGTTTGCAATGGCGCAGTGT+TGG - Chr8:71971257-71971276 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
TTCAAAGGAACACTCCCCTC+AGG - Chr8:71971911-71971930 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
TTCATGTATGGGGTTCGCCA+CGG + Chr8:71966844-71966863 None:intergenic 50.0%
! AACCGTTGCCTTTGGTTCCT+AGG + Chr8:71966810-71966829 None:intergenic 50.0%
! ACGAAGCTGGTCTAACATGC+GGG - Chr8:71970783-71970802 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
! AGCAGCGGAGAAAAAAGTGC+AGG - Chr8:71971318-71971337 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
! CACGAAGCTGGTCTAACATG+CGG - Chr8:71970782-71970801 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
! GCTCCAGAGTGTCTCAACAA+AGG - Chr8:71973010-71973029 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
! TCGTAGTGGAAGAGAATGGG+AGG - Chr8:71969977-71969996 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
! TGAGTTTTGCGGTGCTTGTC+AGG - Chr8:71967221-71967240 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
!! AGAAGTGTTCGCAGACGGTT+TGG - Chr8:71968713-71968732 MsG0880046319.01.T01:CDS 50.0%
!! CGGGTGTTGGGTTCATGTAT+GGG + Chr8:71966855-71966874 None:intergenic 50.0%
!! GAAAGTGACTAAGGGTGCTG+GGG - Chr8:71971201-71971220 MsG0880046319.01.T01:intron 50.0%
!! GGGTGTTGGGTTCATGTATG+GGG + Chr8:71966854-71966873 None:intergenic 50.0%
!! GTGGCCACATCCGTTTTGAA+GGG + Chr8:71966641-71966660 None:intergenic 50.0%
!! TCGGGTGTTGGGTTCATGTA+TGG + Chr8:71966856-71966875 None:intergenic 50.0%
ACGTGCGACACACTAGTCCT+AGG - Chr8:71966790-71966809 MsG0880046319.01.T01:CDS 55.0%
CAGGCTACTGGTGGTAGTTG+TGG - Chr8:71967240-71967259 MsG0880046319.01.T01:intron 55.0%
CGGTTACCATACCAACCCTC+AGG + Chr8:71970453-71970472 None:intergenic 55.0%
GACGGAGAAACCGTTGCCTT+TGG + Chr8:71966818-71966837 None:intergenic 55.0%
GACGGTGCAATACACGAAGC+TGG - Chr8:71970770-71970789 MsG0880046319.01.T01:intron 55.0%
GCTCGTGAAGTGTGAGAGCT+TGG + Chr8:71966759-71966778 None:intergenic 55.0%
GGCTTGCATGGTGAAGGAGA+AGG - Chr8:71971881-71971900 MsG0880046319.01.T01:intron 55.0%
GTCCACGGAAAAGGGAGAGA+CGG - Chr8:71971147-71971166 MsG0880046319.01.T01:intron 55.0%
GTGTCGCACGTAGACATGTG+TGG + Chr8:71966781-71966800 None:intergenic 55.0%
! GGTGGCCACATCCGTTTTGA+AGG + Chr8:71966642-71966661 None:intergenic 55.0%
ACGGTTTCTCCGTCGAACCG+TGG - Chr8:71966824-71966843 MsG0880046319.01.T01:CDS 60.0%
CAAAACGGATGTGGCCACCC+AGG - Chr8:71966643-71966662 MsG0880046319.01.T01:CDS 60.0%
CACGGAAAAGGGAGAGACGG+TGG - Chr8:71971150-71971169 MsG0880046319.01.T01:intron 60.0%
CGGGAGCAAGAAGGCCTATG+AGG - Chr8:71967726-71967745 MsG0880046319.01.T01:intron 60.0%
GGTGCTTGTCAGGCTACTGG+TGG - Chr8:71967231-71967250 MsG0880046319.01.T01:intron 60.0%
GTAAGTCGCGGAAACCTGGG+TGG + Chr8:71966660-71966679 None:intergenic 60.0%
TGCGGTGCTTGTCAGGCTAC+TGG - Chr8:71967228-71967247 MsG0880046319.01.T01:intron 60.0%
! CACCGTCTCTCCCTTTTCCG+TGG + Chr8:71971152-71971171 None:intergenic 60.0%
! TTGGTGTTTGGCAGGCTCCG+AGG - Chr8:71970240-71970259 MsG0880046319.01.T01:intron 60.0%
TGGGGTTCGCCACGGTTCGA+CGG + Chr8:71966836-71966855 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
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Gene Sequence

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Protein sequence

>MsG0880046319.01.T01

MSKFFSTLHHLIIILSITYLIIPSSCSNNTCRSYCGNITIDYPFALQNGCGHPGFRDLLFCINNVLMFHVTSGSYRVLQIDYAYQALTLHEPHMSTCDTLVLGTKGNGFSVEPWRTPYMNPTPDNVFMLISCSPRSPLFQGFPDKHLPCRNVSGMGCEEYYDCPAWNMMGHKKTGSSSFFGSGPPECCAVSYEAIKGINLSKLECEGYSSAYSVAPLKVDGPSDWTYGIRVRYSVQGSDEFCGACQATGGSCGYGSDGIRQVCMCGNFNSTSNCDSAGYGLIIIGSKKAYEVENVCRTFGLYASMDDNQLDLKSTKKYGIVKQQGWGAQTLVGNWHPMYALGQCQRDLDPTQCNICFTQARQLLSRCIPKVSGRIYLDGCFLRYDNYTFFDESVDLTRDTKICGSTEKGETVDAKHVETVILKVTKGAGEHKFSVDGEGGLFAMAQCWETLDKLSCQKCLIAAEKKVQECVPSNEGRSLFTGCFLRYSTRKFYNNVYVQNDTWVEIPLPRDQGHQNLWIIIVCVVSAIVIILLIIPSVCMSRKKISSQDERNDSIGVSPNFAYVAGFSFKYDVLEKGTNYFDPANKLGLHGEGEGSVFKGTLPSGRIVVVKRLFFDTRQWTDVLFREVNLINGIQHKNVVKLLGCSIDGPESLLVYEFLPNKSLDQILSSMDSKNVLTWEKRFQIICGIAEGLAYLHEGSGTKIIHRDIKSSNILLDESLNPKIADFGLALCVAENKSHLNNGNAGTQGYIAPECLNKGQLTEKADIYAFGVLVTEIVCGKNNGVFPQGSNLVLHNVWKNYKANNITTSIDPALHGKFEIEEASNALQAALLCTQSSPTLRPSMTEVVQMLTKKDYKIPTPKQQPFLNNHLRNMSNGLASTRSSFHSTTSSLPSGDDTTLLDHPFSSSAKFKTSGSPDSDIHANIVLPQPK*