AlfalfaGEDB | MsG0180003427.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180003427.01

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MsG0180003427.01.T01	AT2G20300	37.423	163	90	3	130	287	337	492	8.47e-23	101
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Find 128 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 174 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region
CTTGCGATCACGCTTGTTTC+AGG	0.149168	1:-62162857	None:intergenic
GCTCTAAGTTTAACAATATT+AGG	0.149218	1:-62163345	None:intergenic
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GATGCTTGGGAAGGGTAGTT+TGG	0.324261	1:+62163197	MsG0180003427.01.T01:CDS
CTCTAAGTTTAACAATATTA+GGG	0.330818	1:-62163344	None:intergenic
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GCATGAGTTTGAACAGTATA+TGG	0.348481	1:+62163299	MsG0180003427.01.T01:CDS
AACAAGAATAAGCTTGGTAT+TGG	0.372374	1:+62164073	MsG0180003427.01.T01:CDS
ACCGCATAAGCCTTCATTGC+CGG	0.375056	1:-62162744	None:intergenic
CGTGCTTCTGCTGAGATGCT+TGG	0.380614	1:+62163183	MsG0180003427.01.T01:CDS
ACCATAGTTGGCCTCTTCTC+TGG	0.382033	1:-62164560	None:intergenic
GCCAGAGAAGAGGCCAACTA+TGG	0.384509	1:+62164559	MsG0180003427.01.T01:CDS
CAGGGAGGATTTCATTGGAT+TGG	0.385043	1:+62164048	MsG0180003427.01.T01:CDS
TTAACAACATCTACCATAGT+TGG	0.404706	1:-62164572	None:intergenic
CAAGAAGCCACCACCGTAAA+GGG	0.405450	1:+62162882	MsG0180003427.01.T01:CDS
GGCTTAACCCTTTACGGTGG+TGG	0.411855	1:-62162889	None:intergenic
GTTGCTTGCATATCTGACTT+TGG	0.411899	1:+62164197	MsG0180003427.01.T01:CDS
TGGACCAGGGAGGATTTCAT+TGG	0.415334	1:+62164043	MsG0180003427.01.T01:CDS
ATGCTTGGGAAGGGTAGTTT+GGG	0.418586	1:+62163198	MsG0180003427.01.T01:CDS
ATTACAATGCTCAACAAATT+CGG	0.419682	1:+62162707	None:intergenic
GAGGAATGGCTTTGAGTTGG+AGG	0.426613	1:+62163152	MsG0180003427.01.T01:CDS
AGGAGGACTGTTCTCTGTTA+AGG	0.426883	1:-62162789	None:intergenic
GAACAGTATATGGATGTGAT+TGG	0.427831	1:+62163309	MsG0180003427.01.T01:CDS
TTGCTGCACTGTACTCTGTA+TGG	0.434939	1:-62164121	None:intergenic
AATCGTGCAATTGCATGAAC+AGG	0.438922	1:-62164238	None:intergenic
GAGGGGAAGCGGAAGAGTTA+TGG	0.440228	1:+62163033	MsG0180003427.01.T01:CDS
GTGCTTCTGCTGAGATGCTT+GGG	0.445017	1:+62163184	MsG0180003427.01.T01:CDS
ACAAGAATAAGCTTGGTATT+GGG	0.445130	1:+62164074	MsG0180003427.01.T01:CDS
GAGTTATGGCAGTGAGAAGA+AGG	0.448440	1:+62163047	MsG0180003427.01.T01:CDS
CAGTCCTCCTTCCTCTGAAC+CGG	0.449904	1:+62162802	MsG0180003427.01.T01:CDS
TAGGAGGAATGGCTTTGAGT+TGG	0.457035	1:+62163149	MsG0180003427.01.T01:CDS
GAAAGCTTCTCCGGCAATGA+AGG	0.457130	1:+62162734	MsG0180003427.01.T01:CDS
GGGAAAGAACTCGGGTTTGA+AGG	0.463745	1:-62162836	None:intergenic
CTGTGGTGGATCTTCTAAAT+GGG	0.466239	1:+62164415	MsG0180003427.01.T01:CDS
AAGAAGGTGTATAATTCAAA+TGG	0.469813	1:+62163063	MsG0180003427.01.T01:CDS
CTTGTTTCAGGGAAAGAACT+CGG	0.470876	1:-62162845	None:intergenic
TACTGAAGATGGTCTTGCTT+AGG	0.473168	1:+62164682	MsG0180003427.01.T01:CDS
AGCAAGACCATCTTCAGTAG+TGG	0.479442	1:-62164678	None:intergenic
TTCGGAGATGAAAGCTTCTC+CGG	0.484077	1:+62162725	MsG0180003427.01.T01:CDS
TTTGAAGGAACAGTCTGAAC+CGG	0.489474	1:-62162821	None:intergenic
ACCTTACGAGGTGATTCGCC+GGG	0.490275	1:-62164380	None:intergenic
TTGCGATCACGCTTGTTTCA+GGG	0.493592	1:-62162856	None:intergenic
CCAAGAAGCCACCACCGTAA+AGG	0.494965	1:+62162881	MsG0180003427.01.T01:CDS
CTTCCCCTCACTACCCACTA+AGG	0.495418	1:-62163019	None:intergenic
TGTTCATGCAATTGCACGAT+TGG	0.498268	1:+62164240	MsG0180003427.01.T01:CDS
GGAGTGTGCTGAAGTTCCAC+AGG	0.499720	1:+62164331	MsG0180003427.01.T01:CDS
TGTTAATAGTAATTCCTTAG+TGG	0.503807	1:+62163005	MsG0180003427.01.T01:CDS
GTCTATGATTATCTCTCCAA+TGG	0.507379	1:+62163399	MsG0180003427.01.T01:CDS
AACAGTATATGGATGTGATT+GGG	0.512935	1:+62163310	MsG0180003427.01.T01:CDS
CCCCGGCGAATCACCTCGTA+AGG	0.519250	1:+62164379	MsG0180003427.01.T01:CDS
ACGAGGTGATTCGCCGGGGA+AGG	0.521182	1:-62164375	None:intergenic
TTGACAGGGAACCGTGGACC+AGG	0.521848	1:+62164029	MsG0180003427.01.T01:intron
GAGCAGCAAGAGGGCTTGCT+AGG	0.523123	1:+62164096	MsG0180003427.01.T01:CDS
ACCATCTTCAGTAGTGGGAA+TGG	0.527262	1:-62164672	None:intergenic
AAGGTGTATAATTCAAATGG+TGG	0.528739	1:+62163066	MsG0180003427.01.T01:CDS
GTTAATAGTAATTCCTTAGT+GGG	0.529486	1:+62163006	MsG0180003427.01.T01:CDS
AGGTGTATAATTCAAATGGT+GGG	0.530154	1:+62163067	MsG0180003427.01.T01:CDS
AATTCCTTAGTGGGTAGTGA+GGG	0.530640	1:+62163015	MsG0180003427.01.T01:CDS
GTTCATGCAATTGCACGATT+GGG	0.531907	1:+62164241	MsG0180003427.01.T01:CDS
CTCATTACAGTATCCTTCCC+CGG	0.532451	1:+62164362	MsG0180003427.01.T01:CDS
GAGAGAAGAGTGGACTGGAG+AGG	0.532651	1:+62164451	MsG0180003427.01.T01:CDS
ACAAAAGAGACTGTCTCAGC+AGG	0.534344	1:+62164291	MsG0180003427.01.T01:CDS
TCCATTCCCACTACTGAAGA+TGG	0.535120	1:+62164671	MsG0180003427.01.T01:CDS
TAGTGGGTAGTGAGGGGAAG+CGG	0.536122	1:+62163022	MsG0180003427.01.T01:CDS
TTCTGCTGAGATGCTTGGGA+AGG	0.536183	1:+62163188	MsG0180003427.01.T01:CDS
TTGTTTCAGGGAAAGAACTC+GGG	0.548077	1:-62162844	None:intergenic
TGGTGCAATTGTAGCAATTG+TGG	0.548380	1:+62162913	MsG0180003427.01.T01:CDS
GTTCTTGTCAAGTAGTACAT+TGG	0.549860	1:-62164171	None:intergenic
CACCGTAAAGGGTTAAGCCC+TGG	0.552458	1:+62162893	MsG0180003427.01.T01:CDS
TTGGACAACAAGAATAAGCT+TGG	0.552512	1:+62164067	MsG0180003427.01.T01:CDS
GTCTGAACCGGTTCAGAGGA+AGG	0.552880	1:-62162809	None:intergenic
AAGAGCATGCAAGCTCCCAT+TGG	0.556251	1:-62163415	None:intergenic
GGTGTATAATTCAAATGGTG+GGG	0.556872	1:+62163068	MsG0180003427.01.T01:CDS
TATAGAGCAGTGCTTGATGA+TGG	0.557883	1:+62163228	MsG0180003427.01.T01:CDS
TGGTGCAGCAGCCAGAGAAG+AGG	0.560325	1:+62164549	MsG0180003427.01.T01:intron
AATGATTGAGGATATTAGAG+TGG	0.562071	1:+62164595	MsG0180003427.01.T01:CDS
TCTCTGTTAAGGAACAAGCT+TGG	0.565720	1:-62162778	None:intergenic
GCAAGACCATCTTCAGTAGT+GGG	0.568271	1:-62164677	None:intergenic
TCTGCTGAGATGCTTGGGAA+GGG	0.568419	1:+62163189	MsG0180003427.01.T01:CDS
GACCTTACGAGGTGATTCGC+CGG	0.570044	1:-62164381	None:intergenic
AGATGTTGTTAAAATGATTG+AGG	0.570821	1:+62164583	MsG0180003427.01.T01:CDS
GGGGTGGTGATAGTAGTGAT+GGG	0.573209	1:+62163088	MsG0180003427.01.T01:CDS
TCTTCAGTAGTGGGAATGGA+AGG	0.574594	1:-62164668	None:intergenic
CATGCAATTGCACGATTGGG+TGG	0.581538	1:+62164244	MsG0180003427.01.T01:CDS
AACAGTCTGAACCGGTTCAG+AGG	0.581989	1:-62162813	None:intergenic
TCCGGCAATGAAGGCTTATG+CGG	0.582665	1:+62162743	MsG0180003427.01.T01:CDS
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ACAATTGCTACAATTGCACC+AGG	0.591383	1:-62162911	None:intergenic
GTTAAGGAACAAGCTTGGAA+CGG	0.594064	1:-62162773	None:intergenic
AAGATGCAAATCCTTGCGCT+AGG	0.598363	1:+62163277	MsG0180003427.01.T01:CDS
TAATTCCTTAGTGGGTAGTG+AGG	0.601151	1:+62163014	MsG0180003427.01.T01:CDS
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TTTCCTCTCTCGACCTTACG+AGG	0.614128	1:-62164392	None:intergenic
CAATCCAATGAAATCCTCCC+TGG	0.614614	1:-62164047	None:intergenic
GTAGTACAGTTGCTGTCAAG+AGG	0.621642	1:+62163250	MsG0180003427.01.T01:CDS
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CGGGGAAGGATACTGTAATG+AGG	0.628730	1:-62164361	None:intergenic
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GGAGCAATCTCCTCTGTGTG+AGG	0.638667	1:+62164616	MsG0180003427.01.T01:CDS
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ATTCCTTAGTGGGTAGTGAG+GGG	0.669863	1:+62163016	MsG0180003427.01.T01:CDS
GAGTGTGCTGAAGTTCCACA+GGG	0.698056	1:+62164332	MsG0180003427.01.T01:CDS
CAGGGCTTAACCCTTTACGG+TGG	0.711546	1:-62162892	None:intergenic
CCTTACGAGGTGATTCGCCG+GGG	0.732603	1:-62164379	None:intergenic
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CAATTGCTACAATTGCACCA+GGG	0.740240	1:-62162910	None:intergenic
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TCATCATAGTCCTCACACAG+AGG	0.746363	1:-62164626	None:intergenic
AAGGTCGAGAGAGGAAACTG+TGG	0.746419	1:+62164398	MsG0180003427.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
!!!	AATAGAACTTTTAAAATTAT+AGG	-	Chr1:62163855-62163874	None:intergenic	10.0%
!!!	ATTTAATTTATTATATTGAC+AGG	+	Chr1:62164014-62164033	MsG0180003427.01.T01:intron	10.0%
!!!	TTTAATTTATTATATTGACA+GGG	+	Chr1:62164015-62164034	MsG0180003427.01.T01:intron	10.0%
!!	ATTAAGAATTTACTTATCTT+CGG	+	Chr1:62163614-62163633	MsG0180003427.01.T01:intron	15.0%
!!	TAAATTGATTGACAATTAAA+AGG	-	Chr1:62163814-62163833	None:intergenic	15.0%
!!!	ATTTAGTCTTTTTCAAATTT+AGG	+	Chr1:62163829-62163848	MsG0180003427.01.T01:intron	15.0%
!!	CTCTAAGTTTAACAATATTA+GGG	-	Chr1:62163347-62163366	None:intergenic	20.0%
!!	GATAAGTAAATTCTTAATCA+TGG	-	Chr1:62163612-62163631	None:intergenic	20.0%
!!	TGATTATTAGGTTTCATATT+TGG	+	Chr1:62163472-62163491	MsG0180003427.01.T01:intron	20.0%
!!	TTAAGAATTTACTTATCTTC+GGG	+	Chr1:62163615-62163634	MsG0180003427.01.T01:intron	20.0%
!!!	AATTAGTGTTTTGATATGAA+AGG	-	Chr1:62163506-62163525	None:intergenic	20.0%
!!!	TGTGATTTGGTTTAATTTTA+GGG	+	Chr1:62163711-62163730	MsG0180003427.01.T01:intron	20.0%
!!!	TTAATTGGTCTATGATTATT+AGG	+	Chr1:62163460-62163479	MsG0180003427.01.T01:intron	20.0%
!!!	TTGTGATTTGGTTTAATTTT+AGG	+	Chr1:62163710-62163729	MsG0180003427.01.T01:intron	20.0%
!!!	TTTTAGTCCTTAAATTTCAA+CGG	+	Chr1:62163746-62163765	MsG0180003427.01.T01:intron	20.0%
!	AATAGAGTAAATCAGCATTT+CGG	-	Chr1:62163980-62163999	None:intergenic	25.0%
!	ACTAATAATCTCTTGTGATT+TGG	+	Chr1:62163698-62163717	MsG0180003427.01.T01:intron	25.0%
!	AGATGTTGTTAAAATGATTG+AGG	+	Chr1:62164583-62164602	MsG0180003427.01.T01:CDS	25.0%
!	AGTTCATCAAACTTATGAAA+TGG	+	Chr1:62163780-62163799	MsG0180003427.01.T01:intron	25.0%
!	GATATAACTGAAGAGATATT+TGG	+	Chr1:62163884-62163903	MsG0180003427.01.T01:intron	25.0%
!	GTAATTGAGTTCAAATATCA+TGG	+	Chr1:62163577-62163596	MsG0180003427.01.T01:intron	25.0%
!	GTTAATAGTAATTCCTTAGT+GGG	+	Chr1:62163006-62163025	MsG0180003427.01.T01:CDS	25.0%
!	TGTTAATAGTAATTCCTTAG+TGG	+	Chr1:62163005-62163024	MsG0180003427.01.T01:CDS	25.0%
!!	AAGAAGGTGTATAATTCAAA+TGG	+	Chr1:62163063-62163082	MsG0180003427.01.T01:CDS	25.0%
!!	GCTCTAAGTTTAACAATATT+AGG	-	Chr1:62163348-62163367	None:intergenic	25.0%
!!!	AAATGCTGATTTACTCTATT+TGG	+	Chr1:62163980-62163999	MsG0180003427.01.T01:intron	25.0%
!!!	AATGCTGATTTACTCTATTT+GGG	+	Chr1:62163981-62164000	MsG0180003427.01.T01:intron	25.0%
	AACAAGAATAAGCTTGGTAT+TGG	+	Chr1:62164073-62164092	MsG0180003427.01.T01:CDS	30.0%
	AACAGTATATGGATGTGATT+GGG	+	Chr1:62163310-62163329	MsG0180003427.01.T01:CDS	30.0%
	AAGGTGTATAATTCAAATGG+TGG	+	Chr1:62163066-62163085	MsG0180003427.01.T01:CDS	30.0%
	AATGATTGAGGATATTAGAG+TGG	+	Chr1:62164595-62164614	MsG0180003427.01.T01:CDS	30.0%
	AATGTACTACTTGACAAGAA+CGG	+	Chr1:62164173-62164192	MsG0180003427.01.T01:CDS	30.0%
	AATTTGTGTTGCATTGTTAG+TGG	+	Chr1:62162940-62162959	MsG0180003427.01.T01:intron	30.0%
	ACAAGAATAAGCTTGGTATT+GGG	+	Chr1:62164074-62164093	MsG0180003427.01.T01:CDS	30.0%
	AGGTGTATAATTCAAATGGT+GGG	+	Chr1:62163067-62163086	MsG0180003427.01.T01:CDS	30.0%
	CTGAAGAGATATTTGGTAAA+TGG	+	Chr1:62163891-62163910	MsG0180003427.01.T01:intron	30.0%
	CTTCATCAATATAGTATCCA+AGG	-	Chr1:62163669-62163688	None:intergenic	30.0%
	TAGAGCTTATTATTATGCCA+AGG	+	Chr1:62163362-62163381	MsG0180003427.01.T01:CDS	30.0%
	TCTATGATTATCTCTCCAAT+GGG	+	Chr1:62163400-62163419	MsG0180003427.01.T01:CDS	30.0%
	TTAACAACATCTACCATAGT+TGG	-	Chr1:62164575-62164594	None:intergenic	30.0%
!!	GTTAGTCTTCAACTCTTAAT+TGG	+	Chr1:62163445-62163464	MsG0180003427.01.T01:intron	30.0%
!!!	GTAAGCTTGTGTTTTTTGAT+AGG	+	Chr1:62163130-62163149	MsG0180003427.01.T01:CDS	30.0%
	GAACAGTATATGGATGTGAT+TGG	+	Chr1:62163309-62163328	MsG0180003427.01.T01:CDS	35.0%
	GCATGAGTTTGAACAGTATA+TGG	+	Chr1:62163299-62163318	MsG0180003427.01.T01:CDS	35.0%
	GGTGTATAATTCAAATGGTG+GGG	+	Chr1:62163068-62163087	MsG0180003427.01.T01:CDS	35.0%
	GTCTATGATTATCTCTCCAA+TGG	+	Chr1:62163399-62163418	MsG0180003427.01.T01:CDS	35.0%
	GTGTATAATTCAAATGGTGG+GGG	+	Chr1:62163069-62163088	MsG0180003427.01.T01:CDS	35.0%
	GTTCTTGTCAAGTAGTACAT+TGG	-	Chr1:62164174-62164193	None:intergenic	35.0%
	TGACTGACCGTTGAAATTTA+AGG	-	Chr1:62163756-62163775	None:intergenic	35.0%
	TTCTGCGATACAAGAAATTG+AGG	+	Chr1:62164488-62164507	MsG0180003427.01.T01:intron	35.0%
	TTGCTTGCATATCTGACTTT+GGG	+	Chr1:62164198-62164217	MsG0180003427.01.T01:CDS	35.0%
	TTGGACAACAAGAATAAGCT+TGG	+	Chr1:62164067-62164086	MsG0180003427.01.T01:CDS	35.0%
!!!	AGCTTGTGTTTTTTGATAGG+AGG	+	Chr1:62163133-62163152	MsG0180003427.01.T01:CDS	35.0%
!!!	GTGTTTTTTGATAGGAGGAA+TGG	+	Chr1:62163138-62163157	MsG0180003427.01.T01:CDS	35.0%
	AATCGTGCAATTGCATGAAC+AGG	-	Chr1:62164241-62164260	None:intergenic	40.0%
	ACAATTGCTACAATTGCACC+AGG	-	Chr1:62162914-62162933	None:intergenic	40.0%
	ACTCGACCATTATAATTCCG+AGG	+	Chr1:62163953-62163972	MsG0180003427.01.T01:intron	40.0%
	ATTATATTGACAGGGAACCG+TGG	+	Chr1:62164023-62164042	MsG0180003427.01.T01:intron	40.0%
	CAATTGCTACAATTGCACCA+GGG	-	Chr1:62162913-62162932	None:intergenic	40.0%
	CTTGTTTCAGGGAAAGAACT+CGG	-	Chr1:62162848-62162867	None:intergenic	40.0%
	GGTCGATGATAGATTGTCTA+GGG	+	Chr1:62163636-62163655	MsG0180003427.01.T01:intron	40.0%
	GTCGATGATAGATTGTCTAG+GGG	+	Chr1:62163637-62163656	MsG0180003427.01.T01:intron	40.0%
	GTTAAGGAACAAGCTTGGAA+CGG	-	Chr1:62162776-62162795	None:intergenic	40.0%
	GTTCATGCAATTGCACGATT+GGG	+	Chr1:62164241-62164260	MsG0180003427.01.T01:CDS	40.0%
	GTTGCTTGCATATCTGACTT+TGG	+	Chr1:62164197-62164216	MsG0180003427.01.T01:CDS	40.0%
	TAAATCAGCATTTCGGTCCT+CGG	-	Chr1:62163973-62163992	None:intergenic	40.0%
	TACTATTAACACTCTCCCTC+TGG	-	Chr1:62162996-62163015	None:intergenic	40.0%
	TATAGAGCAGTGCTTGATGA+TGG	+	Chr1:62163228-62163247	MsG0180003427.01.T01:CDS	40.0%
	TCTCTGTTAAGGAACAAGCT+TGG	-	Chr1:62162781-62162800	None:intergenic	40.0%
	TGCAATTGTAGCAATTGTGG+TGG	+	Chr1:62162916-62162935	MsG0180003427.01.T01:intron	40.0%
	TGGTGCAATTGTAGCAATTG+TGG	+	Chr1:62162913-62162932	MsG0180003427.01.T01:CDS	40.0%
	TGTTCATGCAATTGCACGAT+TGG	+	Chr1:62164240-62164259	MsG0180003427.01.T01:CDS	40.0%
	TTCGGTCCTCGGAATTATAA+TGG	-	Chr1:62163962-62163981	None:intergenic	40.0%
	TTGTGTCAATGCTGCATGTT+GGG	+	Chr1:62164517-62164536	MsG0180003427.01.T01:intron	40.0%
	TTGTTTCAGGGAAAGAACTC+GGG	-	Chr1:62162847-62162866	None:intergenic	40.0%
	TTTGAAGGAACAGTCTGAAC+CGG	-	Chr1:62162824-62162843	None:intergenic	40.0%
!	AATTCCTTAGTGGGTAGTGA+GGG	+	Chr1:62163015-62163034	MsG0180003427.01.T01:CDS	40.0%
!	CTCTTTTGTTCTGTCTGTTC+AGG	-	Chr1:62164280-62164299	None:intergenic	40.0%
!	GACTAGAAGCTTTTCTTCCT+TGG	-	Chr1:62163382-62163401	None:intergenic	40.0%
!	TAATTCCTTAGTGGGTAGTG+AGG	+	Chr1:62163014-62163033	MsG0180003427.01.T01:CDS	40.0%
!	TATAATTCAAATGGTGGGGG+TGG	+	Chr1:62163072-62163091	MsG0180003427.01.T01:CDS	40.0%
!!	ACTGTGGTGGATCTTCTAAA+TGG	+	Chr1:62164414-62164433	MsG0180003427.01.T01:CDS	40.0%
!!	CTGTGGTGGATCTTCTAAAT+GGG	+	Chr1:62164415-62164434	MsG0180003427.01.T01:CDS	40.0%
	AAGATGCAAATCCTTGCGCT+AGG	+	Chr1:62163277-62163296	MsG0180003427.01.T01:CDS	45.0%
	ACAAAAGAGACTGTCTCAGC+AGG	+	Chr1:62164291-62164310	MsG0180003427.01.T01:CDS	45.0%
	AGCAAGACCATCTTCAGTAG+TGG	-	Chr1:62164681-62164700	None:intergenic	45.0%
	AGCTTGCATGCTCTTCTTCA+TGG	+	Chr1:62163423-62163442	MsG0180003427.01.T01:CDS	45.0%
	AGGAGGACTGTTCTCTGTTA+AGG	-	Chr1:62162792-62162811	None:intergenic	45.0%
	ATGCAATTGCACGATTGGGT+GGG	+	Chr1:62164245-62164264	MsG0180003427.01.T01:CDS	45.0%
	ATGCTTGGGAAGGGTAGTTT+GGG	+	Chr1:62163198-62163217	MsG0180003427.01.T01:CDS	45.0%
	CAATCCAATGAAATCCTCCC+TGG	-	Chr1:62164050-62164069	None:intergenic	45.0%
	CAGGGAGGATTTCATTGGAT+TGG	+	Chr1:62164048-62164067	MsG0180003427.01.T01:CDS	45.0%
	CTCATTACAGTATCCTTCCC+CGG	+	Chr1:62164362-62164381	MsG0180003427.01.T01:CDS	45.0%
	CTTGTGTCAATGCTGCATGT+TGG	+	Chr1:62164516-62164535	MsG0180003427.01.T01:intron	45.0%
	GAGTTATGGCAGTGAGAAGA+AGG	+	Chr1:62163047-62163066	MsG0180003427.01.T01:CDS	45.0%
	GATCAGTTGTGAGAGAAGAG+TGG	+	Chr1:62164441-62164460	MsG0180003427.01.T01:CDS	45.0%
	GATGATTTCACGTTCCCATG+TGG	-	Chr1:62164152-62164171	None:intergenic	45.0%
	GCAAGACCATCTTCAGTAGT+GGG	-	Chr1:62164680-62164699	None:intergenic	45.0%
	GGGTCGATGATAGATTGTCT+AGG	+	Chr1:62163635-62163654	MsG0180003427.01.T01:intron	45.0%
	GTAGTACAGTTGCTGTCAAG+AGG	+	Chr1:62163250-62163269	MsG0180003427.01.T01:CDS	45.0%
	TCATCATAGTCCTCACACAG+AGG	-	Chr1:62164629-62164648	None:intergenic	45.0%
	TCCATTCCCACTACTGAAGA+TGG	+	Chr1:62164671-62164690	MsG0180003427.01.T01:CDS	45.0%
	TTCGGAGATGAAAGCTTCTC+CGG	+	Chr1:62162725-62162744	MsG0180003427.01.T01:CDS	45.0%
	TTGCGATCACGCTTGTTTCA+GGG	-	Chr1:62162859-62162878	None:intergenic	45.0%
	TTGCTGCACTGTACTCTGTA+TGG	-	Chr1:62164124-62164143	None:intergenic	45.0%
!	ACCATCTTCAGTAGTGGGAA+TGG	-	Chr1:62164675-62164694	None:intergenic	45.0%
!	ATTCCTTAGTGGGTAGTGAG+GGG	+	Chr1:62163016-62163035	MsG0180003427.01.T01:CDS	45.0%
!	CAGGCAGATGTCTACAGTTT+TGG	+	Chr1:62164310-62164329	MsG0180003427.01.T01:CDS	45.0%
!	GATAGTAGTGATGGGACTAG+TGG	+	Chr1:62163096-62163115	MsG0180003427.01.T01:CDS	45.0%
!	TCTTCAGTAGTGGGAATGGA+AGG	-	Chr1:62164671-62164690	None:intergenic	45.0%
!!	TAGGAGGAATGGCTTTGAGT+TGG	+	Chr1:62163149-62163168	MsG0180003427.01.T01:CDS	45.0%
	AAGGTCGAGAGAGGAAACTG+TGG	+	Chr1:62164398-62164417	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
	ACCGCATAAGCCTTCATTGC+CGG	-	Chr1:62162747-62162766	None:intergenic	50.0%
	ATGAAATCCTCCCTGGTCCA+CGG	-	Chr1:62164043-62164062	None:intergenic	50.0%
	CAAGAAGCCACCACCGTAAA+GGG	+	Chr1:62162882-62162901	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
	CACCAGGGCTTAACCCTTTA+CGG	-	Chr1:62162898-62162917	None:intergenic	50.0%
	CATGCAATTGCACGATTGGG+TGG	+	Chr1:62164244-62164263	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
	CGGGGAAGGATACTGTAATG+AGG	-	Chr1:62164364-62164383	None:intergenic	50.0%
	CTTGCGATCACGCTTGTTTC+AGG	-	Chr1:62162860-62162879	None:intergenic	50.0%
	GAAAGCTTCTCCGGCAATGA+AGG	+	Chr1:62162734-62162753	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
	GAGTGTGCTGAAGTTCCACA+GGG	+	Chr1:62164332-62164351	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
	GATGCTTGGGAAGGGTAGTT+TGG	+	Chr1:62163197-62163216	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
	GGGAAAGAACTCGGGTTTGA+AGG	-	Chr1:62162839-62162858	None:intergenic	50.0%
	GGGGTGGTGATAGTAGTGAT+GGG	+	Chr1:62163088-62163107	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
	GTAATGAGGAGCTTTCCCTG+TGG	-	Chr1:62164350-62164369	None:intergenic	50.0%
	GTGCTTCTGCTGAGATGCTT+GGG	+	Chr1:62163184-62163203	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
	GTTGTGAGAGAAGAGTGGAC+TGG	+	Chr1:62164446-62164465	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
	TCAAACTCATGCCTAGCGCA+AGG	-	Chr1:62163291-62163310	None:intergenic	50.0%
	TCCGGCAATGAAGGCTTATG+CGG	+	Chr1:62162743-62162762	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
	TCTGCTGAGATGCTTGGGAA+GGG	+	Chr1:62163189-62163208	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
	TGGACCAGGGAGGATTTCAT+TGG	+	Chr1:62164043-62164062	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
	TTCTGCTGAGATGCTTGGGA+AGG	+	Chr1:62163188-62163207	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
	TTGCTCACTGTTGTGCCAGA+GGG	+	Chr1:62162978-62162997	MsG0180003427.01.T01:intron	50.0%
	TTGTCTAGGGGTCTGTACCT+TGG	+	Chr1:62163649-62163668	MsG0180003427.01.T01:intron	50.0%
	TTTCCTCTCTCGACCTTACG+AGG	-	Chr1:62164395-62164414	None:intergenic	50.0%
!	AACAGTCTGAACCGGTTCAG+AGG	-	Chr1:62162816-62162835	None:intergenic	50.0%
!	AAGAGCATGCAAGCTCCCAT+TGG	-	Chr1:62163418-62163437	None:intergenic	50.0%
!	ACCATAGTTGGCCTCTTCTC+TGG	-	Chr1:62164563-62164582	None:intergenic	50.0%
!	TGCATGTTGGGTTGCTTGTG+TGG	+	Chr1:62164529-62164548	MsG0180003427.01.T01:intron	50.0%
!	TGGTATTGGGAGCAGCAAGA+GGG	+	Chr1:62164087-62164106	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
!	TTGGTATTGGGAGCAGCAAG+AGG	+	Chr1:62164086-62164105	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
!!	AGTGCAGCAAAAGTGCCACA+TGG	+	Chr1:62164134-62164153	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
!!	GAGGAATGGCTTTGAGTTGG+AGG	+	Chr1:62163152-62163171	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
!!	GTGCAGCAAAAGTGCCACAT+GGG	+	Chr1:62164135-62164154	MsG0180003427.01.T01:CDS	50.0%
	ACCTTACGAGGTGATTCGCC+GGG	-	Chr1:62164383-62164402	None:intergenic	55.0%
	CACCGTAAAGGGTTAAGCCC+TGG	+	Chr1:62162893-62162912	MsG0180003427.01.T01:CDS	55.0%
	CAGGGCTTAACCCTTTACGG+TGG	-	Chr1:62162895-62162914	None:intergenic	55.0%
	CAGTCCTCCTTCCTCTGAAC+CGG	+	Chr1:62162802-62162821	MsG0180003427.01.T01:CDS	55.0%
	CCAAGAAGCCACCACCGTAA+AGG	+	Chr1:62162881-62162900	MsG0180003427.01.T01:CDS	55.0%
	CGTGCTTCTGCTGAGATGCT+TGG	+	Chr1:62163183-62163202	MsG0180003427.01.T01:CDS	55.0%
	CTTCCCCTCACTACCCACTA+AGG	-	Chr1:62163022-62163041	None:intergenic	55.0%
	GACCTTACGAGGTGATTCGC+CGG	-	Chr1:62164384-62164403	None:intergenic	55.0%
	GAGGGGAAGCGGAAGAGTTA+TGG	+	Chr1:62163033-62163052	MsG0180003427.01.T01:CDS	55.0%
	GCCAGAGAAGAGGCCAACTA+TGG	+	Chr1:62164559-62164578	MsG0180003427.01.T01:CDS	55.0%
	GGAGCAATCTCCTCTGTGTG+AGG	+	Chr1:62164616-62164635	MsG0180003427.01.T01:CDS	55.0%
	GGAGTGTGCTGAAGTTCCAC+AGG	+	Chr1:62164331-62164350	MsG0180003427.01.T01:CDS	55.0%
	GGCTTAACCCTTTACGGTGG+TGG	-	Chr1:62162892-62162911	None:intergenic	55.0%
	GGGGGTGGTGATAGTAGTGA+TGG	+	Chr1:62163087-62163106	MsG0180003427.01.T01:CDS	55.0%
	GTCGAGAGAGGAAACTGTGG+TGG	+	Chr1:62164401-62164420	MsG0180003427.01.T01:CDS	55.0%
	GTTGCTCACTGTTGTGCCAG+AGG	+	Chr1:62162977-62162996	MsG0180003427.01.T01:intron	55.0%
	TCACCTCGTAAGGTCGAGAG+AGG	+	Chr1:62164389-62164408	MsG0180003427.01.T01:CDS	55.0%
!	CCTTTACGGTGGTGGCTTCT+TGG	-	Chr1:62162884-62162903	None:intergenic	55.0%
!	GTCTGAACCGGTTCAGAGGA+AGG	-	Chr1:62162812-62162831	None:intergenic	55.0%
!	TAGTGGGTAGTGAGGGGAAG+CGG	+	Chr1:62163022-62163041	MsG0180003427.01.T01:CDS	55.0%
!	TGAACCGGTTCAGAGGAAGG+AGG	-	Chr1:62162809-62162828	None:intergenic	55.0%
!!	GAGAGAAGAGTGGACTGGAG+AGG	+	Chr1:62164451-62164470	MsG0180003427.01.T01:CDS	55.0%
	CCTTACGAGGTGATTCGCCG+GGG	-	Chr1:62164382-62164401	None:intergenic	60.0%
	TGACAGGGAACCGTGGACCA+GGG	+	Chr1:62164030-62164049	MsG0180003427.01.T01:intron	60.0%
	TGGTGCAGCAGCCAGAGAAG+AGG	+	Chr1:62164549-62164568	MsG0180003427.01.T01:intron	60.0%
	TTGACAGGGAACCGTGGACC+AGG	+	Chr1:62164029-62164048	MsG0180003427.01.T01:intron	60.0%
!	GAGCAGCAAGAGGGCTTGCT+AGG	+	Chr1:62164096-62164115	MsG0180003427.01.T01:CDS	60.0%
	ACGAGGTGATTCGCCGGGGA+AGG	-	Chr1:62164378-62164397	None:intergenic	65.0%
	CCCCGGCGAATCACCTCGTA+AGG	+	Chr1:62164379-62164398	MsG0180003427.01.T01:CDS	65.0%
	CAGGGAACCGTGGACCAGGG+AGG	+	Chr1:62164033-62164052	MsG0180003427.01.T01:intron	70.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
Chr1	gene	62162713	62164703	62162713	ID=MsG0180003427.01;Name=MsG0180003427.01
Chr1	mRNA	62162713	62164703	62162713	ID=MsG0180003427.01.T01;Parent=MsG0180003427.01;Name=MsG0180003427.01.T01;_AED=0.32;_eAED=0.32;_QI=0\|0.33\|0\|1\|1\|0.75\|4\|0\|417
Chr1	exon	62162713	62162934	62162713	ID=MsG0180003427.01.T01:exon:23366;Parent=MsG0180003427.01.T01
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Chr1	exon	62164036	62164472	62164036	ID=MsG0180003427.01.T01:exon:23368;Parent=MsG0180003427.01.T01
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Chr1	CDS	62162713	62162934	62162713	ID=MsG0180003427.01.T01:cds;Parent=MsG0180003427.01.T01
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Chr1	CDS	62164036	62164472	62164036	ID=MsG0180003427.01.T01:cds;Parent=MsG0180003427.01.T01
Chr1	CDS	62164557	62164703	62164557	ID=MsG0180003427.01.T01:cds;Parent=MsG0180003427.01.T01

Gene Sequence

>MsG0180003427.01.T01

ATGCTCAACAAATTCGGAGATGAAAGCTTCTCCGGCAATGAAGGCTTATGCGGTTCAAAACCGTTCCAAGCTTGTTCCTTAACAGAGAACAGTCCTCCTTCCTCTGAACCGGTTCAGACTGTTCCTTCAAACCCGAGTTCTTTCCCTGAAACAAGCGTGATCGCAAGACCAAGAAGCCACCACCGTAAAGGGTTAAGCCCTGGTGCAATTGTAGCAATTGTGAGGGAGAGTGTTAATAGTAATTCCTTAGTGGGTAGTGAGGGGAAGCGGAAGAGTTATGGCAGTGAGAAGAAGGTGTATAATTCAAATGGTGGGGGTGGTGATAGTAGTGATGGGACTAGTGGAACTGATATGAGTAAGCTTGTGTTTTTTGATAGGAGGAATGGCTTTGAGTTGGAGGATTTGTTGCGTGCTTCTGCTGAGATGCTTGGGAAGGGTAGTTTGGGAACTGTTTATAGAGCAGTGCTTGATGATGGTAGTACAGTTGCTGTCAAGAGGTTAAAAGATGCAAATCCTTGCGCTAGGCATGAGTTTGAACAGTATATGGATGTGATTGGGAAGCTTAAACACCCTAATATTGTTAAACTTAGAGCTTATTATTATGCCAAGGAAGAAAAGCTTCTAGTCTATGATTATCTCTCCAATGGGAGCTTGCATGCTCTTCTTCATGGGAACCGTGGACCAGGGAGGATTTCATTGGATTGGACAACAAGAATAAGCTTGGTATTGGGAGCAGCAAGAGGGCTTGCTAGGATCCATACAGAGTACAGTGCAGCAAAAGTGCCACATGGGAACGTGAAATCATCCAATGTACTACTTGACAAGAACGGTGTTGCTTGCATATCTGACTTTGGGTTGTCACTACTGTTAAACCTGTTCATGCAATTGCACGATTGGGTGGGTACAGAGCACCTGAACAGACAGAACAAAAGAGACTGTCTCAGCAGGCAGATGTCTACAGTTTTGGAGTGTGCTGAAGTTCCACAGGGAAAGCTCCTCATTACAGTATCCTTCCCCGGCGAATCACCTCGTAAGGTCGAGAGAGGAAACTGTGGTGGATCTTCTAAATGGGTTCGATCAGTTGTGAGAGAAGAGTGGACTGGAGAGCAGCCAGAGAAGAGGCCAACTATGGTAGATGTTGTTAAAATGATTGAGGATATTAGAGTGGAGCAATCTCCTCTGTGTGAGGACTATGATGAATCACGCAATTCACTTTCACCTTCCATTCCCACTACTGAAGATGGTCTTGCTTAG

Protein sequence

>MsG0180003427.01.T01

MLNKFGDESFSGNEGLCGSKPFQACSLTENSPPSSEPVQTVPSNPSSFPETSVIARPRSHHRKGLSPGAIVAIVRESVNSNSLVGSEGKRKSYGSEKKVYNSNGGGGDSSDGTSGTDMSKLVFFDRRNGFELEDLLRASAEMLGKGSLGTVYRAVLDDGSTVAVKRLKDANPCARHEFEQYMDVIGKLKHPNIVKLRAYYYAKEEKLLVYDYLSNGSLHALLHGNRGPGRISLDWTTRISLVLGAARGLARIHTEYSAAKVPHGNVKSSNVLLDKNGVACISDFGLSLLLNLFMQLHDWVGTEHLNRQNKRDCLSRQMSTVLECAEVPQGKLLITVSFPGESPRKVERGNCGGSSKWVRSVVREEWTGEQPEKRPTMVDVVKMIEDIRVEQSPLCEDYDESRNSLSPSIPTTEDGLA*