AlfalfaGEDB | MsG0180006028.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180006028.01

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Find 87 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 238 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
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CRISPR-GE

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!!!	AATTTGTTCAGATATGTAAA+TGG	-	Chr1:99036608-99036627	MsG0180006028.01.T01:intron	20.0%
!!!	ACAATGTTGATTAACTTATA+CGG	-	Chr1:99037398-99037417	MsG0180006028.01.T01:intron	20.0%
!!!	TACATAAATGGATTAATGAA+AGG	-	Chr1:99037299-99037318	MsG0180006028.01.T01:intron	20.0%
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!!!	TTGAAATTTGAATTTTATGC+AGG	-	Chr1:99037804-99037823	MsG0180006028.01.T01:intron	20.0%
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!	AAGTATGTGATACATTGAAA+AGG	+	Chr1:99036197-99036216	None:intergenic	25.0%
!	AATATCTTAGTAGATGCATA+TGG	-	Chr1:99038229-99038248	MsG0180006028.01.T01:CDS	25.0%
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!!	GGAAGAAGTTTTAACAGTGA+TGG	-	Chr1:99038651-99038670	MsG0180006028.01.T01:intron	35.0%
!!	TTGGTTCTGGATTTGTTGAT+GGG	-	Chr1:99035910-99035929	MsG0180006028.01.T01:intron	35.0%
!!	TTTGGTTCTGGATTTGTTGA+TGG	-	Chr1:99035909-99035928	MsG0180006028.01.T01:intron	35.0%
!!!	CACATCAGGTTTTAAACCTT+TGG	+	Chr1:99038784-99038803	None:intergenic	35.0%
!!!	CACATTTCCCATTTTGGAAT+AGG	+	Chr1:99038518-99038537	None:intergenic	35.0%
!!!	GTTTTTTTTTTCCGTCCACA+AGG	-	Chr1:99035809-99035828	MsG0180006028.01.T01:intron	35.0%
!!!	TGTCAAGGTCTTATTTTAGG+CGG	+	Chr1:99037450-99037469	None:intergenic	35.0%
	AACAGCATGCTCAACTTGTA+TGG	-	Chr1:99038604-99038623	MsG0180006028.01.T01:intron	40.0%
	AACTTCGGATGAGAAAACAG+TGG	-	Chr1:99036075-99036094	MsG0180006028.01.T01:CDS	40.0%
	AAGTTTATTCACGAGCCAAC+AGG	+	Chr1:99036959-99036978	None:intergenic	40.0%
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	ACAGTGGGATTCAATCATCT+CGG	-	Chr1:99036091-99036110	MsG0180006028.01.T01:CDS	40.0%
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	ACCATGTGGGATTTCATTGT+TGG	+	Chr1:99038484-99038503	None:intergenic	40.0%
	ACTTCGGATGAGAAAACAGT+GGG	-	Chr1:99036076-99036095	MsG0180006028.01.T01:CDS	40.0%
	AGGGCATAGGTATCTTCATT+AGG	+	Chr1:99036763-99036782	None:intergenic	40.0%
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	AGTTTATTCACGAGCCAACA+GGG	+	Chr1:99036958-99036977	None:intergenic	40.0%
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	ATCAAATGATTCAAGTGGCG+TGG	-	Chr1:99035544-99035563	MsG0180006028.01.T01:intron	40.0%
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	CAACCTGTAAGCTTCCATAA+GGG	+	Chr1:99038016-99038035	None:intergenic	40.0%
	CATGAATCACAAGTTCACGA+TGG	+	Chr1:99036295-99036314	None:intergenic	40.0%
	CGATGGTGAAACATTGCAAA+AGG	+	Chr1:99036269-99036288	None:intergenic	40.0%
	CTCAACTTGTATGGAAGGTT+AGG	-	Chr1:99038613-99038632	MsG0180006028.01.T01:intron	40.0%
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	CTCATGAAGCTGCAGATATG+TGG	+	Chr1:99036728-99036747	None:intergenic	45.0%
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!!	TCTTGACATTGACTCCACCA+TGG	+	Chr1:99037607-99037626	None:intergenic	45.0%
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	ACCTTAGCTGTTCCTCCATC+TGG	+	Chr1:99038903-99038922	None:intergenic	50.0%
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	TCCAGATGGAGGAACAGCTA+AGG	-	Chr1:99038899-99038918	MsG0180006028.01.T01:intron	50.0%
	TCCCATGCATCAAGAGATGG+TGG	+	Chr1:99036032-99036051	None:intergenic	50.0%
!	AATGTAGGCAAGTTGGGTCC+TGG	+	Chr1:99037565-99037584	None:intergenic	50.0%
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!	TCAAGTTCGAGCCTTGTGGA+CGG	+	Chr1:99035823-99035842	None:intergenic	50.0%
!!	GGAAGGTACTGTAGCACAGT+TGG	-	Chr1:99036535-99036554	MsG0180006028.01.T01:intron	50.0%
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	TCTTCCCGAAACAGTCGTGC+AGG	-	Chr1:99038133-99038152	MsG0180006028.01.T01:intron	55.0%
!	GTAGGCAAGTTGGGTCCTGG+AGG	+	Chr1:99037562-99037581	None:intergenic	60.0%
	CTCTGCAGCGGCGAGCCTCC+AGG	-	Chr1:99037544-99037563	MsG0180006028.01.T01:CDS	75.0%

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Protein sequence

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