AlfalfaGEDB | MS.gene40915

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene40915

KEGG: K03165
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PFAM: PF01131.23 PF01396.22 PF01751.25 PF06839.15

Nr:

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Showing 1 to 1 of 1 entries

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Swissprot:

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Showing 1 to 1 of 1 entries

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Trembl:

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MS.gene40915.t1	A0A396IZ64	96.9	929	29	0	1	929	1	929	0.0e+00	1797.3

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TFs/TRs:

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Gene ID	Type	Classification
No data available in table

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Protein Kinases:

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Gene ID	Type	Classification
No data available in table

Showing 0 to 0 of 0 entries

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Co-expression Network:

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Gene1	Gene2	correlation coefficient	p_value	FDR
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Showing 1 to 10 of 12 entries

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PPI:

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Gene1	Gene2	Type
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MS.gene003428	MS.gene40915	PPI
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MS.gene24697	MS.gene40915	PPI

Showing 1 to 10 of 40 entries

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MS.gene40915.t1	MTR_3g084800	36.159	578	345	10	67	642	1	556	3.67e-109	355
MS.gene40915.t1	MTR_5g061930	40.749	427	230	11	175	589	19	434	7.49e-89	290
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Showing 1 to 5 of 5 entries

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MS.gene40915.t1	AT5G63920	68.240	932	277	7	2	930	5	920	0.0	1309
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MS.gene40915.t1	AT4G31210	22.977	618	369	21	116	671	548	1120	1.87e-17	88.6
MS.gene40915.t1	AT4G31210	22.977	618	369	21	116	671	544	1116	3.75e-17	87.4
MS.gene40915.t1	AT4G31210	22.977	618	369	21	116	671	548	1120	4.16e-17	87.4

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Find 263 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

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CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region
AAAAGCATCTTTCATTAACA+TGG	0.587316	3.2:+80646151	None:intergenic
AAACGTGGCGGAGAAGCCGT+CGG	0.653200	3.2:-80647215	MS.gene40915:CDS
AAATCCGCTTCACTAAGAAG+AGG	0.673563	3.2:+80642071	None:intergenic
AAATGGTTGACATTGTAGCT+TGG	0.638777	3.2:+80636511	None:intergenic
AACAACAAGGGCATCCTGAG+TGG	0.548017	3.2:-80644095	MS.gene40915:CDS
AACAGTGTAGAAGTGTTGTC+TGG	0.510106	3.2:-80637539	MS.gene40915:intron
AACATACTCTCACGCAACCA+AGG	0.603024	3.2:-80647175	MS.gene40915:CDS
AACCGGAGCCTGGAAGAGAT+CGG	0.597445	3.2:+80646991	None:intergenic
AAGAAGCTAGGCGGTGTCAG+TGG	0.631749	3.2:-80646815	MS.gene40915:CDS
AAGACATGCACCTACCCAAA+TGG	0.513721	3.2:+80636494	None:intergenic

Showing 1 to 10 of 263 entries

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CRISPR-GE

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badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
No data available in table

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chr3.2	gene	80632849	80647263	80632849	ID=MS.gene40915
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chr3.2	exon	80632849	80633092	80632849	ID=MS.gene40915.t1.exon24;Parent=MS.gene40915.t1
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Gene Sequence

>MS.gene40915

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