AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180000653.01

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MsG0180000653.01.T01 AT5G58940 43.377 302 163 5 172 467 134 433 1.30e-66 223
MsG0180000653.01.T01 AT5G58940 43.377 302 163 5 172 467 134 433 1.30e-66 223
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MsG0180000653.01.T01 AT2G23200 40.361 332 183 5 177 494 480 810 2.10e-66 230
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MsG0180000653.01.T01 AT1G24030 38.710 310 179 8 156 456 47 354 6.81e-61 205
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MsG0180000653.01.T01 AT1G56120 38.040 347 195 5 111 457 488 814 2.17e-60 214
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MsG0180000653.01.T01 AT1G07570 39.344 305 167 6 173 462 56 357 1.28e-59 202
MsG0180000653.01.T01 AT1G07570 39.344 305 167 6 173 462 56 357 1.28e-59 202
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MsG0180000653.01.T01 AT3G59110 34.746 354 219 5 148 494 147 495 1.65e-59 205
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MsG0180000653.01.T01 AT5G56890 41.297 293 164 4 170 456 708 998 2.10e-59 213
MsG0180000653.01.T01 AT1G70460 40.268 298 157 5 173 457 341 630 2.87e-59 208
MsG0180000653.01.T01 AT5G07180 35.396 404 224 10 70 452 431 818 3.21e-59 210
MsG0180000653.01.T01 AT1G23540 39.931 288 168 2 173 456 359 645 3.22e-59 208
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MsG0180000653.01.T01 AT1G51880 34.971 346 202 6 111 455 537 860 4.51e-57 204
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MsG0180000653.01.T01 AT5G54590 37.013 308 183 6 150 455 78 376 8.20e-56 193
MsG0180000653.01.T01 AT1G34210 35.583 326 205 5 173 493 293 618 8.24e-56 197
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MsG0180000653.01.T01 AT2G04300 39.085 284 168 3 173 455 572 851 8.55e-56 201
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MsG0180000653.01.T01 AT5G02290 36.364 308 178 6 173 465 56 360 9.75e-56 191
MsG0180000653.01.T01 AT2G20300 37.544 285 173 2 173 456 337 617 9.87e-56 199
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MsG0180000653.01.T01 AT2G02800 38.689 305 169 6 166 456 64 364 2.04e-55 192
MsG0180000653.01.T01 AT1G51860 35.127 353 210 7 111 455 367 708 2.07e-55 198
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MsG0180000653.01.T01 AT1G06700 37.931 290 172 4 177 458 60 349 3.56e-55 189
MsG0180000653.01.T01 AT5G38560 39.519 291 167 7 173 456 327 615 3.63e-55 196
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MsG0180000653.01.T01 AT1G61430 35.943 281 179 1 172 451 453 733 6.44e-55 197
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MsG0180000653.01.T01 AT5G18610 38.908 293 169 6 170 455 68 357 2.22e-54 191
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MsG0180000653.01.T01 AT1G55200 39.322 295 177 2 172 465 366 659 2.23e-54 194
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MsG0180000653.01.T01 AT1G61490 36.140 285 181 1 172 455 477 761 3.00e-54 196
MsG0180000653.01.T01 AT4G23150 34.875 281 182 1 176 455 327 607 3.07e-54 194
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MsG0180000653.01.T01 AT1G48210 35.986 289 177 3 177 458 60 347 3.81e-54 187
MsG0180000653.01.T01 AT1G48210 35.986 289 177 3 177 458 60 347 3.81e-54 187
MsG0180000653.01.T01 AT3G14840 35.410 305 194 3 173 475 660 963 4.14e-54 197
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MsG0180000653.01.T01 AT1G53440 36.364 286 181 1 173 457 655 940 4.70e-54 197
MsG0180000653.01.T01 AT5G10290 36.286 350 203 8 173 516 278 613 4.73e-54 192
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MsG0180000653.01.T01 AT1G11280 36.491 285 176 3 172 452 490 773 4.90e-54 195
MsG0180000653.01.T01 AT1G51890 32.796 372 222 6 107 455 494 860 4.99e-54 196
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MsG0180000653.01.T01 AT3G13690 39.041 292 176 2 172 462 398 688 5.19e-54 194
MsG0180000653.01.T01 AT3G13690 39.041 292 176 2 172 462 398 688 5.19e-54 194
MsG0180000653.01.T01 AT3G16030 37.113 291 178 4 171 457 390 679 5.38e-54 194
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MsG0180000653.01.T01 AT1G61360 38.028 284 161 4 123 397 353 630 1.00e-53 193
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MsG0180000653.01.T01 AT1G61360 38.028 284 161 4 123 397 353 630 1.00e-53 193
MsG0180000653.01.T01 AT2G01820 37.542 301 180 4 178 470 578 878 1.06e-53 195
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MsG0180000653.01.T01 AT3G16030 37.113 291 178 4 171 457 534 823 1.50e-53 194
MsG0180000653.01.T01 AT4G04540 40.860 279 153 6 181 455 320 590 1.51e-53 191
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MsG0180000653.01.T01 AT5G62710 33.333 342 218 4 118 456 249 583 1.75e-53 191
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MsG0180000653.01.T01 AT5G16000 36.949 295 179 4 173 463 300 591 2.23e-53 191
MsG0180000653.01.T01 AT4G23130 39.161 286 170 4 173 455 332 616 2.27e-53 191
MsG0180000653.01.T01 AT3G55550 37.282 287 179 1 171 456 332 618 2.39e-53 192
MsG0180000653.01.T01 AT1G01540 42.534 221 126 1 173 392 142 362 2.42e-53 185
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MsG0180000653.01.T01 AT1G67520 34.323 303 195 4 158 457 262 563 3.19e-53 190
MsG0180000653.01.T01 AT4G04570 39.785 279 156 6 181 455 344 614 3.42e-53 191
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MsG0180000653.01.T01 AT5G15730 34.286 280 173 3 173 452 104 372 5.60e-53 186
MsG0180000653.01.T01 AT5G15730 34.643 280 170 4 173 452 104 370 6.06e-53 185
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MsG0180000653.01.T01 AT1G11050 36.043 369 202 11 110 457 226 581 7.65e-53 189
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MsG0180000653.01.T01 AT3G20200 38.608 316 166 8 150 459 426 719 9.86e-53 191
MsG0180000653.01.T01 AT5G16900 39.576 283 162 5 177 456 381 657 1.01e-52 190
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MsG0180000653.01.T01 AT4G23270 38.811 286 171 4 173 455 314 598 1.54e-52 189
MsG0180000653.01.T01 AT1G61400 35.417 288 177 2 173 451 488 775 1.64e-52 191
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MsG0180000653.01.T01 AT1G61430 41.304 230 134 1 172 400 476 705 1.91e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT1G14370 36.637 333 189 8 166 484 67 391 1.94e-52 184
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MsG0180000653.01.T01 AT4G04510 35.372 376 224 11 86 455 246 608 2.47e-52 188
MsG0180000653.01.T01 AT1G78530 38.662 269 155 3 118 385 13 272 2.50e-52 179
MsG0180000653.01.T01 AT3G09010 41.038 212 124 1 172 382 33 244 2.52e-52 180
MsG0180000653.01.T01 AT1G61420 34.520 281 183 1 172 451 481 761 2.71e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT1G61420 34.520 281 183 1 172 451 483 763 2.98e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT1G61420 34.520 281 183 1 172 451 483 763 2.98e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT4G23130 47.196 214 110 3 173 384 332 544 2.99e-52 187
MsG0180000653.01.T01 AT1G11300 33.043 345 214 5 111 451 438 769 3.00e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT1G11410 33.613 357 222 6 110 455 417 769 3.08e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT2G28970 36.934 287 172 5 173 456 469 749 3.12e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT1G65790 35.357 280 176 2 181 455 515 794 3.13e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT4G04510 35.372 376 224 11 86 455 244 606 3.18e-52 188
MsG0180000653.01.T01 AT2G28970 36.934 287 172 5 173 456 434 714 3.27e-52 189
MsG0180000653.01.T01 AT1G61550 36.525 282 178 1 171 451 475 756 3.43e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT1G65800 34.948 289 183 2 172 455 510 798 3.45e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT5G16900 39.576 283 162 5 177 456 567 843 3.55e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT5G16900 39.576 283 162 5 177 456 567 843 3.55e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT1G66150 37.864 309 173 6 178 475 581 881 3.75e-52 191
MsG0180000653.01.T01 AT1G35710 32.869 359 216 7 101 452 776 1116 3.86e-52 191
MsG0180000653.01.T01 AT1G72300 39.427 279 164 5 177 452 795 1071 4.04e-52 191
MsG0180000653.01.T01 AT1G11300 36.299 281 171 2 172 451 481 754 4.15e-52 189
MsG0180000653.01.T01 AT1G67520 34.323 303 195 4 158 457 477 778 4.17e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT4G21390 37.063 286 178 2 172 456 516 800 4.28e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT1G67520 34.323 303 195 4 158 457 470 771 4.41e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT1G61610 32.258 372 235 7 95 456 432 796 4.46e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT1G16760 36.036 333 176 9 134 459 414 716 4.51e-52 189
MsG0180000653.01.T01 AT4G23180 43.612 227 125 3 176 400 339 564 4.72e-52 186
MsG0180000653.01.T01 AT5G12000 37.543 293 164 6 177 463 329 608 4.99e-52 187
MsG0180000653.01.T01 AT1G16760 36.036 333 176 9 134 459 414 716 5.24e-52 189
MsG0180000653.01.T01 AT1G11410 33.613 357 222 6 110 455 441 793 5.27e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT1G11410 33.613 357 222 6 110 455 448 800 6.01e-52 189
MsG0180000653.01.T01 AT4G11470 35.789 285 181 2 173 455 327 611 6.60e-52 187
MsG0180000653.01.T01 AT1G52540 33.788 293 191 3 161 451 15 306 6.74e-52 180
MsG0180000653.01.T01 AT4G31230 35.650 331 182 8 143 465 433 740 7.23e-52 189
MsG0180000653.01.T01 AT4G11470 35.789 285 181 2 173 455 332 616 7.92e-52 187
MsG0180000653.01.T01 AT5G65240 37.540 309 186 6 173 475 272 579 7.94e-52 187
MsG0180000653.01.T01 AT5G49780 34.963 409 224 13 102 492 551 935 8.18e-52 190
MsG0180000653.01.T01 AT1G52540 33.788 293 191 3 161 451 12 303 9.37e-52 180
MsG0180000653.01.T01 AT3G20530 42.241 232 130 3 170 397 67 298 1.01e-51 178
MsG0180000653.01.T01 AT1G76360 38.079 302 173 5 172 461 150 449 1.10e-51 183
MsG0180000653.01.T01 AT1G11340 40.741 243 141 2 159 400 557 797 1.12e-51 188
MsG0180000653.01.T01 AT1G51820 33.994 353 213 8 111 455 507 847 1.27e-51 189
MsG0180000653.01.T01 AT1G61380 39.583 240 143 2 162 400 319 557 1.37e-51 186
MsG0180000653.01.T01 AT1G29730 44.076 211 117 1 173 383 661 870 1.38e-51 189
MsG0180000653.01.T01 AT1G78940 37.500 296 163 7 177 465 369 649 1.40e-51 187
MsG0180000653.01.T01 AT4G35030 34.397 282 182 2 173 451 92 373 1.40e-51 180
MsG0180000653.01.T01 AT1G49270 39.867 301 162 7 173 462 324 616 1.42e-51 187
MsG0180000653.01.T01 AT2G07180 38.591 298 170 7 172 459 77 371 1.51e-51 182
MsG0180000653.01.T01 AT2G07180 38.591 298 170 7 172 459 77 371 1.51e-51 182
MsG0180000653.01.T01 AT2G28960 36.140 285 177 3 173 456 431 711 1.54e-51 187
MsG0180000653.01.T01 AT3G09830 40.614 293 157 7 173 451 72 361 1.55e-51 181
MsG0180000653.01.T01 AT3G09830 40.614 293 157 7 173 451 72 361 1.55e-51 181
MsG0180000653.01.T01 AT3G09830 40.614 293 157 7 173 451 72 361 1.55e-51 181
MsG0180000653.01.T01 AT5G12000 37.543 293 164 6 177 463 414 693 1.56e-51 187
MsG0180000653.01.T01 AT1G26970 36.137 321 184 7 166 471 64 378 2.00e-51 181
MsG0180000653.01.T01 AT2G02220 39.649 285 163 4 177 456 726 1006 2.13e-51 189
MsG0180000653.01.T01 AT2G28960 36.140 285 177 3 173 456 563 843 2.15e-51 188
MsG0180000653.01.T01 AT1G51910 33.516 364 209 8 100 456 503 840 2.32e-51 188
MsG0180000653.01.T01 AT2G19230 33.621 348 204 8 111 456 518 840 2.46e-51 189
MsG0180000653.01.T01 AT2G07020 37.624 303 168 7 166 462 400 687 2.49e-51 186
MsG0180000653.01.T01 AT4G29450 34.568 324 173 9 161 456 537 849 2.83e-51 188
MsG0180000653.01.T01 AT2G05940 38.538 301 168 7 171 459 73 368 2.90e-51 181
MsG0180000653.01.T01 AT4G32300 37.370 289 174 5 173 458 483 767 2.96e-51 187
MsG0180000653.01.T01 AT4G23260 36.093 302 189 4 157 455 311 611 3.14e-51 185
MsG0180000653.01.T01 AT1G61440 33.660 306 177 2 172 451 470 775 3.45e-51 187
MsG0180000653.01.T01 AT4G23190 31.105 344 228 3 116 455 208 546 3.52e-51 184
MsG0180000653.01.T01 AT4G23190 31.105 344 228 3 116 455 208 546 3.52e-51 184
MsG0180000653.01.T01 AT1G78940 37.500 296 163 7 177 465 440 720 3.89e-51 186
MsG0180000653.01.T01 AT2G47060 37.075 294 177 3 172 458 60 352 4.04e-51 179
MsG0180000653.01.T01 AT2G47060 37.075 294 177 3 172 458 60 352 4.04e-51 179
MsG0180000653.01.T01 AT3G13380 31.906 467 269 13 52 477 702 1160 4.38e-51 188
MsG0180000653.01.T01 AT5G15080 36.545 301 171 6 173 458 130 425 4.59e-51 182
MsG0180000653.01.T01 AT2G19230 33.243 367 217 9 111 475 518 858 4.59e-51 187
MsG0180000653.01.T01 AT4G11480 35.789 285 181 2 173 455 309 593 4.77e-51 185
MsG0180000653.01.T01 AT2G23950 34.868 304 177 5 105 403 228 515 5.03e-51 182
MsG0180000653.01.T01 AT1G78940 37.500 296 163 7 177 465 440 720 5.06e-51 186

Find 103 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 133 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATTGCCAAAGTCTCAGATTT+TGG 0.174133 1:-9263324 MsG0180000653.01.T01:CDS
CTTTCCCTATGGTTGTTAAT+TGG 0.184637 1:-9264777 None:intergenic
CTACCAGTTCAAGTTCTTTC+AGG 0.191491 1:+9262782 None:intergenic
CATTAATGAATTGTTCAATT+TGG 0.210658 1:+9263628 None:intergenic
TTCTGTCCGATCGGACAATT+TGG 0.222282 1:-9264168 MsG0180000653.01.T01:CDS
AGGAATGTGGTCAAACTCTT+AGG 0.233020 1:-9263576 MsG0180000653.01.T01:CDS
GCAGAACGGAGGTTCTATTT+TGG 0.237157 1:-9263844 MsG0180000653.01.T01:CDS
GCAAATTGTAACAACACTTT+TGG 0.241540 1:-9264204 MsG0180000653.01.T01:CDS
TTGGCTTTCGTCTATAGTTT+TGG 0.258368 1:+9263647 None:intergenic
ATTCAGATTATGACGGTTAC+AGG 0.274913 1:-9264672 MsG0180000653.01.T01:CDS
AGGCATAGTTATCTGTAGTT+TGG 0.284542 1:+9264725 None:intergenic
GCAAAGTGTTTGAGACTTAG+AGG 0.293671 1:-9262988 MsG0180000653.01.T01:CDS
TTAACATCTCTATGGATAAT+AGG 0.299800 1:+9263378 None:intergenic
TTTCCCTATGGTTGTTAATT+GGG 0.306118 1:-9264776 None:intergenic
TCCGACCTAACAAAACAAAA+AGG 0.315905 1:+9263138 None:intergenic
ATTGGAGGGAATGAGGTTAA+TGG 0.323004 1:-9262929 MsG0180000653.01.T01:CDS
AGCAGCAACCGTGGAGATAT+TGG 0.325811 1:-9262814 MsG0180000653.01.T01:CDS
GTTCTTGTGGAGCTGCTAAC+AGG 0.327480 1:-9263168 MsG0180000653.01.T01:CDS
GTCATAGGTAGAGGAGGTTT+TGG 0.328787 1:-9263723 MsG0180000653.01.T01:CDS
GGCATAGTTATCTGTAGTTT+GGG 0.356371 1:+9264726 None:intergenic
AGCTCCAAAATCTGAGACTT+TGG 0.366813 1:+9263320 None:intergenic
AGTGATAACATTCTCTTAGA+TGG 0.368122 1:-9263354 MsG0180000653.01.T01:CDS
GAAGGAAGTGGCTATGGAAT+TGG 0.373078 1:-9262947 MsG0180000653.01.T01:CDS
TATCACTCTTAACATCTCTA+TGG 0.373466 1:+9263370 None:intergenic
ATCTGAGACTTTGGCAATGT+TGG 0.380789 1:+9263329 None:intergenic
GAAGGAAATCCATACCTTCC+CGG 0.384802 1:-9264628 MsG0180000653.01.T01:CDS
AGAAACAGAAGTTCCTTTGT+TGG 0.394108 1:-9263544 MsG0180000653.01.T01:CDS
GCTGTCATCAAAGTTGTTAG+TGG 0.400628 1:+9263749 None:intergenic
AAAAGTGATGTATATAGCTT+TGG 0.415407 1:-9263195 MsG0180000653.01.T01:CDS
TTAGTTACCTCTGCAGCCTC+CGG 0.416588 1:+9264609 None:intergenic
AATTGAAAGAGAAATTCTTT+AGG 0.428007 1:-9263866 MsG0180000653.01.T01:CDS
TTTGATGACAGCTTAGTCAT+AGG 0.428807 1:-9263738 MsG0180000653.01.T01:CDS
CGGTTACAGGTGCAAGTGTT+TGG 0.430212 1:-9264659 MsG0180000653.01.T01:CDS
ATTTGATATGCATTTCCATC+AGG 0.433653 1:+9264114 None:intergenic
TACAGGTGCAAGTGTTTGGC+AGG 0.458781 1:-9264655 MsG0180000653.01.T01:CDS
CCGATCGGACAATTTGGAAA+TGG 0.467090 1:-9264162 MsG0180000653.01.T01:CDS
AAGTTATTCAAGATGGTATG+TGG 0.467150 1:-9263056 MsG0180000653.01.T01:CDS
CTGCAGCCTCCGGGAAGGTA+TGG 0.467405 1:+9264619 None:intergenic
GTAAGACGAACGATCTAACT+TGG 0.474648 1:-9263470 MsG0180000653.01.T01:CDS
GTGTTTGAAGTTATTCAAGA+TGG 0.478184 1:-9263063 MsG0180000653.01.T01:CDS
AGAACTTGAACTGGTAGTAT+TGG 0.481709 1:-9262776 MsG0180000653.01.T01:CDS
CAGCCTGAAAGAACTTGAAC+TGG 0.482467 1:-9262785 MsG0180000653.01.T01:CDS
TGTTACAATTTGCTTTACTT+AGG 0.483606 1:+9264214 None:intergenic
GGTTAATGGATAAGCACTCT+TGG 0.484671 1:-9262915 MsG0180000653.01.T01:CDS
AATTGAACAATTCATTAATG+AGG 0.485868 1:-9263625 MsG0180000653.01.T01:CDS
TGGCTTGTTTGCATATACTC+TGG 0.486208 1:+9263228 None:intergenic
ATAGCCACTTCCTTCATACT+AGG 0.492327 1:+9262955 None:intergenic
CAAATAGTACCAACTGTCCT+TGG 0.493608 1:-9264096 MsG0180000653.01.T01:intron
GGAAGTGGCTATGGAATTGG+AGG 0.494416 1:-9262944 MsG0180000653.01.T01:CDS
TACACTTGTTTCTGTCCGAT+CGG 0.497799 1:-9264177 MsG0180000653.01.T01:CDS
TAGTATGAAGGAAGTGGCTA+TGG 0.498673 1:-9262953 MsG0180000653.01.T01:CDS
CCATTTCCAAATTGTCCGAT+CGG 0.502658 1:+9264162 None:intergenic
TTTGGAAATGGAACAAAGCT+AGG 0.509579 1:-9264150 MsG0180000653.01.T01:CDS
GTTTATGAGTTTGTTAGCAA+TGG 0.511518 1:-9263522 MsG0180000653.01.T01:CDS
GACAGCTTAGTCATAGGTAG+AGG 0.513020 1:-9263732 MsG0180000653.01.T01:CDS
AGAAAACAAACAAGAGATCA+AGG 0.514929 1:-9263028 MsG0180000653.01.T01:CDS
TAGTTACCTCTGCAGCCTCC+GGG 0.518786 1:+9264610 None:intergenic
GGAATGTGGTCAAACTCTTA+GGG 0.520810 1:-9263575 MsG0180000653.01.T01:CDS
TTCTTGTGGAGCTGCTAACA+GGG 0.521496 1:-9263167 MsG0180000653.01.T01:CDS
CCACGGTTGCTGCTATCACC+AGG 0.527395 1:+9262823 None:intergenic
GAGAAATTCTTTAGGCAGAA+CGG 0.528152 1:-9263858 MsG0180000653.01.T01:CDS
TAGCTTTGGAGTTGTTCTTG+TGG 0.528464 1:-9263181 MsG0180000653.01.T01:CDS
TGAACAATTCATTAATGAGG+TGG 0.531581 1:-9263622 MsG0180000653.01.T01:CDS
TCTATGGATAATAGGTATTG+AGG 0.537368 1:+9263386 None:intergenic
CAAAGTGTTTGAGACTTAGA+GGG 0.538364 1:-9262987 MsG0180000653.01.T01:CDS
CTATGGAATTGGAGGGAATG+AGG 0.544662 1:-9262936 MsG0180000653.01.T01:CDS
GCTACTTCAGTTTGATCAAG+TGG 0.544794 1:+9263285 None:intergenic
AGCTTAGTCATAGGTAGAGG+AGG 0.546933 1:-9263729 MsG0180000653.01.T01:CDS
ATAGCCCAATTAACAACCAT+AGG 0.549047 1:+9264772 None:intergenic
ACAATGGTGCAAGGAACGAT+TGG 0.554258 1:-9263261 MsG0180000653.01.T01:CDS
AAGACCTAGTATGAAGGAAG+TGG 0.555792 1:-9262959 MsG0180000653.01.T01:CDS
TTGTCTCTCAAATAAATCAC+AGG 0.557031 1:-9263596 MsG0180000653.01.T01:CDS
TACAGATAACTATGCCTGCA+AGG 0.557545 1:-9264719 MsG0180000653.01.T01:CDS
TACCTTCCCGGAGGCTGCAG+AGG 0.562689 1:-9264616 MsG0180000653.01.T01:intron
TGGTAGTATTGGACGATGGA+AGG 0.565347 1:-9262765 MsG0180000653.01.T01:CDS
TCATCGAGCATTTATGAACC+TGG 0.566398 1:-9262841 MsG0180000653.01.T01:CDS
GATAAAGATTCAGATTATGA+CGG 0.574661 1:-9264679 MsG0180000653.01.T01:CDS
GGAGGAAAGACCTAGTATGA+AGG 0.583094 1:-9262965 MsG0180000653.01.T01:CDS
TACCTCTGCAGCCTCCGGGA+AGG 0.592465 1:+9264614 None:intergenic
GGAGGGTGCAAAGTACCTGA+TGG 0.592705 1:-9264129 MsG0180000653.01.T01:CDS
TCAAATAAATCACAGGAATG+TGG 0.594610 1:-9263589 MsG0180000653.01.T01:CDS
AATCGTTCCTTGCACCATTG+TGG 0.600729 1:+9263263 None:intergenic
ACAAACTCATAAACCAACAA+AGG 0.603299 1:+9263531 None:intergenic
TGTTGCTTACCAAGGACAGT+TGG 0.610282 1:+9264087 None:intergenic
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CCTGGTGATAGCAGCAACCG+TGG 0.621102 1:-9262823 MsG0180000653.01.T01:CDS
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AAAGTGTTTGAGACTTAGAG+GGG 0.676284 1:-9262986 MsG0180000653.01.T01:CDS
TCTGAATTTATACACACACA+AGG 0.677190 1:-9263492 MsG0180000653.01.T01:CDS
TGTCGTATCCAATATCTCCA+CGG 0.679564 1:+9262806 None:intergenic
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TCAAACTGAAGTAGCCACAA+TGG 0.683413 1:-9263277 MsG0180000653.01.T01:CDS
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GAACTGGTAGTATTGGACGA+TGG 0.735030 1:-9262769 MsG0180000653.01.T01:CDS
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CAGAGCTTCAGCTACCTCTG+CGG 0.761708 1:+9263428 None:intergenic

CRISPR-GE

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!! AATAAATCTAAAAATTGAAT+TGG - Chr1:9263166-9263185 MsG0180000653.01.T01:CDS 10.0%
!! ATAAATCTAAAAATTGAATT+GGG - Chr1:9263167-9263186 MsG0180000653.01.T01:CDS 10.0%
!! ATTAATCATAAACTAAAATT+AGG + Chr1:9263477-9263496 None:intergenic 10.0%
!! AAGAAAGAAAAAAAAAACTG+CGG + Chr1:9262965-9262984 None:intergenic 20.0%
!! AATTGAAAGAGAAATTCTTT+AGG - Chr1:9263665-9263684 MsG0180000653.01.T01:CDS 20.0%
!! AATTGAACAATTCATTAATG+AGG - Chr1:9263906-9263925 MsG0180000653.01.T01:CDS 20.0%
!! CATTAATGAATTGTTCAATT+TGG + Chr1:9263906-9263925 None:intergenic 20.0%
!!! AATATATTGAACCCAAATTT+TGG + Chr1:9263560-9263579 None:intergenic 20.0%
!!! AATTTGGGTTCAATATATTT+TGG - Chr1:9263561-9263580 MsG0180000653.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTGACAAGTTTCATTTTT+TGG + Chr1:9263648-9263667 None:intergenic 20.0%
!!! CATTTTTTGGTATATTAAGT+AGG + Chr1:9263635-9263654 None:intergenic 20.0%
!!! CTTTGATGTTTTTTTGAATT+TGG - Chr1:9263013-9263032 MsG0180000653.01.T01:CDS 20.0%
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! ATATAAAGTCCACAAAAATG+TGG - Chr1:9263103-9263122 MsG0180000653.01.T01:CDS 25.0%
! GATAAAGATTCAGATTATGA+CGG - Chr1:9262852-9262871 MsG0180000653.01.T01:CDS 25.0%
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! TTAACATCTCTATGGATAAT+AGG + Chr1:9264156-9264175 None:intergenic 25.0%
! TTGTGAAACAATCCAAAATT+TGG - Chr1:9263545-9263564 MsG0180000653.01.T01:CDS 25.0%
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!! CAAATTGTAACAACACTTTT+GGG - Chr1:9263328-9263347 MsG0180000653.01.T01:CDS 25.0%
!! TGTTACAATTTGCTTTACTT+AGG + Chr1:9263320-9263339 None:intergenic 25.0%
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!!! AAGCAACTCATTTTAAAAAG+TGG - Chr1:9263074-9263093 MsG0180000653.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGAAACCTTTTTGTTTTGTT+AGG - Chr1:9264388-9264407 MsG0180000653.01.T01:intron 25.0%
AAGTTATTCAAGATGGTATG+TGG - Chr1:9264475-9264494 MsG0180000653.01.T01:intron 30.0%
ACAAACTCATAAACCAACAA+AGG + Chr1:9264003-9264022 None:intergenic 30.0%
AGAAAACAAACAAGAGATCA+AGG - Chr1:9264503-9264522 MsG0180000653.01.T01:intron 30.0%
AGTGATAACATTCTCTTAGA+TGG - Chr1:9264177-9264196 MsG0180000653.01.T01:CDS 30.0%
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ATTTGATATGCATTTCCATC+AGG + Chr1:9263420-9263439 None:intergenic 30.0%
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TATCACTCTTAACATCTCTA+TGG + Chr1:9264164-9264183 None:intergenic 30.0%
TCAAATAAATCACAGGAATG+TGG - Chr1:9263942-9263961 MsG0180000653.01.T01:CDS 30.0%
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! TCTATGGATAATAGGTATTG+AGG + Chr1:9264148-9264167 None:intergenic 30.0%
!! GTTCAATATATTTTGGATGC+AGG - Chr1:9263568-9263587 MsG0180000653.01.T01:CDS 30.0%
!! GTTTATGAGTTTGTTAGCAA+TGG - Chr1:9264009-9264028 MsG0180000653.01.T01:intron 30.0%
!! TTAAAAGCATTGTTGTTTGC+CGG + Chr1:9263252-9263271 None:intergenic 30.0%
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!!! CATCACTTTTTTCAGTCAAT+TGG + Chr1:9264326-9264345 None:intergenic 30.0%
AAACAAACAAGAGATCAAGG+AGG - Chr1:9264506-9264525 MsG0180000653.01.T01:intron 35.0%
AAAGTCCACAAAAATGTGGT+TGG - Chr1:9263107-9263126 MsG0180000653.01.T01:CDS 35.0%
ACATAAATGTAGAGGAGAGT+CGG - Chr1:9264649-9264668 MsG0180000653.01.T01:CDS 35.0%
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AGAACTTGAACTGGTAGTAT+TGG - Chr1:9264755-9264774 MsG0180000653.01.T01:CDS 35.0%
AGGCATAGTTATCTGTAGTT+TGG + Chr1:9262809-9262828 None:intergenic 35.0%
ATTCAGATTATGACGGTTAC+AGG - Chr1:9262859-9262878 MsG0180000653.01.T01:CDS 35.0%
GAGAAATTCTTTAGGCAGAA+CGG - Chr1:9263673-9263692 MsG0180000653.01.T01:CDS 35.0%
GGCATAGTTATCTGTAGTTT+GGG + Chr1:9262808-9262827 None:intergenic 35.0%
TCCGACCTAACAAAACAAAA+AGG + Chr1:9264396-9264415 None:intergenic 35.0%
TTTGGAAATGGAACAAAGCT+AGG - Chr1:9263381-9263400 MsG0180000653.01.T01:CDS 35.0%
! AAAGTGTTTGAGACTTAGAG+GGG - Chr1:9264545-9264564 MsG0180000653.01.T01:intron 35.0%
! ACATTCACTATTTTCCTTGC+AGG + Chr1:9262829-9262848 None:intergenic 35.0%
! ATTGCCAAAGTCTCAGATTT+TGG - Chr1:9264207-9264226 MsG0180000653.01.T01:CDS 35.0%
! CAAAGTGTTTGAGACTTAGA+GGG - Chr1:9264544-9264563 MsG0180000653.01.T01:intron 35.0%
! TTTGATGACAGCTTAGTCAT+AGG - Chr1:9263793-9263812 MsG0180000653.01.T01:CDS 35.0%
!! GGTTTTGGTACAGTTTTCAA+AGG - Chr1:9263823-9263842 MsG0180000653.01.T01:CDS 35.0%
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!! TTGGCTTTCGTCTATAGTTT+TGG + Chr1:9263887-9263906 None:intergenic 35.0%
!!! AGATTTTGGAGCTTCAAGAT+TGG - Chr1:9264221-9264240 MsG0180000653.01.T01:CDS 35.0%
!!! GTTGGTGACACTAAGTTTTT+AGG - Chr1:9263125-9263144 MsG0180000653.01.T01:CDS 35.0%
AAATTCTTTAGGCAGAACGG+AGG - Chr1:9263676-9263695 MsG0180000653.01.T01:CDS 40.0%
AAGACCTAGTATGAAGGAAG+TGG - Chr1:9264572-9264591 MsG0180000653.01.T01:intron 40.0%
AGGAATGTGGTCAAACTCTT+AGG - Chr1:9263955-9263974 MsG0180000653.01.T01:intron 40.0%
ATAGCCACTTCCTTCATACT+AGG + Chr1:9264579-9264598 None:intergenic 40.0%
ATTGGAGGGAATGAGGTTAA+TGG - Chr1:9264602-9264621 MsG0180000653.01.T01:intron 40.0%
CAAATAGTACCAACTGTCCT+TGG - Chr1:9263435-9263454 MsG0180000653.01.T01:CDS 40.0%
CCATTTCCAAATTGTCCGAT+CGG + Chr1:9263372-9263391 None:intergenic 40.0%
GAAATGGAACAAAGCTAGGA+GGG - Chr1:9263385-9263404 MsG0180000653.01.T01:CDS 40.0%
GCTACTTCAGTTTGATCAAG+TGG + Chr1:9264249-9264268 None:intergenic 40.0%
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GGAATGTGGTCAAACTCTTA+GGG - Chr1:9263956-9263975 MsG0180000653.01.T01:intron 40.0%
GTAAGACGAACGATCTAACT+TGG - Chr1:9264061-9264080 MsG0180000653.01.T01:intron 40.0%
TACAGATAACTATGCCTGCA+AGG - Chr1:9262812-9262831 MsG0180000653.01.T01:CDS 40.0%
TAGTATGAAGGAAGTGGCTA+TGG - Chr1:9264578-9264597 MsG0180000653.01.T01:intron 40.0%
TCAAACTGAAGTAGCCACAA+TGG - Chr1:9264254-9264273 MsG0180000653.01.T01:intron 40.0%
TCATCGAGCATTTATGAACC+TGG - Chr1:9264690-9264709 MsG0180000653.01.T01:CDS 40.0%
TGTCGTATCCAATATCTCCA+CGG + Chr1:9264728-9264747 None:intergenic 40.0%
! AGCTCCAAAATCTGAGACTT+TGG + Chr1:9264214-9264233 None:intergenic 40.0%
! ATCTGAGACTTTGGCAATGT+TGG + Chr1:9264205-9264224 None:intergenic 40.0%
! CTACCAGTTCAAGTTCTTTC+AGG + Chr1:9264752-9264771 None:intergenic 40.0%
! GCAAAGTGTTTGAGACTTAG+AGG - Chr1:9264543-9264562 MsG0180000653.01.T01:intron 40.0%
! GGTTAATGGATAAGCACTCT+TGG - Chr1:9264616-9264635 MsG0180000653.01.T01:intron 40.0%
! TGTCACCAACCACATTTTTG+TGG + Chr1:9263115-9263134 None:intergenic 40.0%
!! AAGTGTTTGGCAGGTTTTGA+AGG - Chr1:9262885-9262904 MsG0180000653.01.T01:CDS 40.0%
!! GTGTGTTTTGTTGCTTACCA+AGG + Chr1:9263455-9263474 None:intergenic 40.0%
!! TACACTTGTTTCTGTCCGAT+CGG - Chr1:9263354-9263373 MsG0180000653.01.T01:CDS 40.0%
!! TAGCTTTGGAGTTGTTCTTG+TGG - Chr1:9264350-9264369 MsG0180000653.01.T01:intron 40.0%
!! TGGCTTGTTTGCATATACTC+TGG + Chr1:9264306-9264325 None:intergenic 40.0%
AATCGTTCCTTGCACCATTG+TGG + Chr1:9264271-9264290 None:intergenic 45.0%
ACAATGGTGCAAGGAACGAT+TGG - Chr1:9264270-9264289 MsG0180000653.01.T01:intron 45.0%
AGCTTAGTCATAGGTAGAGG+AGG - Chr1:9263802-9263821 MsG0180000653.01.T01:CDS 45.0%
CAGCCTGAAAGAACTTGAAC+TGG - Chr1:9264746-9264765 MsG0180000653.01.T01:CDS 45.0%
CCGATCGGACAATTTGGAAA+TGG - Chr1:9263369-9263388 MsG0180000653.01.T01:CDS 45.0%
CTATGGAATTGGAGGGAATG+AGG - Chr1:9264595-9264614 MsG0180000653.01.T01:intron 45.0%
GAAGGAAATCCATACCTTCC+CGG - Chr1:9262903-9262922 MsG0180000653.01.T01:CDS 45.0%
GAAGGAAGTGGCTATGGAAT+TGG - Chr1:9264584-9264603 MsG0180000653.01.T01:intron 45.0%
GAAGTGGCTATGGAATTGGA+GGG - Chr1:9264588-9264607 MsG0180000653.01.T01:intron 45.0%
GACAGCTTAGTCATAGGTAG+AGG - Chr1:9263799-9263818 MsG0180000653.01.T01:CDS 45.0%
GGAAATGGAACAAAGCTAGG+AGG - Chr1:9263384-9263403 MsG0180000653.01.T01:CDS 45.0%
GGAGGAAAGACCTAGTATGA+AGG - Chr1:9264566-9264585 MsG0180000653.01.T01:intron 45.0%
TCGTATTAAGATAGCCGCAG+AGG - Chr1:9264089-9264108 MsG0180000653.01.T01:intron 45.0%
TTCTGTCCGATCGGACAATT+TGG - Chr1:9263363-9263382 MsG0180000653.01.T01:CDS 45.0%
TTCTTGTGGAGCTGCTAACA+GGG - Chr1:9264364-9264383 MsG0180000653.01.T01:intron 45.0%
! GAACTGGTAGTATTGGACGA+TGG - Chr1:9264762-9264781 MsG0180000653.01.T01:CDS 45.0%
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! TGGTAGTATTGGACGATGGA+AGG - Chr1:9264766-9264785 MsG0180000653.01.T01:CDS 45.0%
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AGCAGCAACCGTGGAGATAT+TGG - Chr1:9264717-9264736 MsG0180000653.01.T01:CDS 50.0%
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GAAGTAGCCACAATGGTGCA+AGG - Chr1:9264261-9264280 MsG0180000653.01.T01:intron 50.0%
GGAAGTGGCTATGGAATTGG+AGG - Chr1:9264587-9264606 MsG0180000653.01.T01:intron 50.0%
GTTCTTGTGGAGCTGCTAAC+AGG - Chr1:9264363-9264382 MsG0180000653.01.T01:intron 50.0%
TACAGGTGCAAGTGTTTGGC+AGG - Chr1:9262876-9262895 MsG0180000653.01.T01:CDS 50.0%
TCTTGTGGAGCTGCTAACAG+GGG - Chr1:9264365-9264384 MsG0180000653.01.T01:intron 50.0%
TTAGTTACCTCTGCAGCCTC+CGG + Chr1:9262925-9262944 None:intergenic 50.0%
! GTGTTTGAGACTTAGAGGGG+AGG - Chr1:9264548-9264567 MsG0180000653.01.T01:intron 50.0%
CAGAGCTTCAGCTACCTCTG+CGG + Chr1:9264106-9264125 None:intergenic 55.0%
GGAAATCCATACCTTCCCGG+AGG - Chr1:9262906-9262925 MsG0180000653.01.T01:CDS 55.0%
TAGTTACCTCTGCAGCCTCC+GGG + Chr1:9262924-9262943 None:intergenic 55.0%
! GGAGGGTGCAAAGTACCTGA+TGG - Chr1:9263402-9263421 MsG0180000653.01.T01:CDS 55.0%
CCACGGTTGCTGCTATCACC+AGG + Chr1:9264711-9264730 None:intergenic 60.0%
CCTGGTGATAGCAGCAACCG+TGG - Chr1:9264708-9264727 MsG0180000653.01.T01:CDS 60.0%
CTGCAGCCTCCGGGAAGGTA+TGG + Chr1:9262915-9262934 None:intergenic 65.0%
TACCTCTGCAGCCTCCGGGA+AGG + Chr1:9262920-9262939 None:intergenic 65.0%
TACCTTCCCGGAGGCTGCAG+AGG - Chr1:9262915-9262934 MsG0180000653.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 9262762 9264791 9262762 ID=MsG0180000653.01;Name=MsG0180000653.01
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Chr1 CDS 9262762 9263963 9262762 ID=MsG0180000653.01.T01:cds;Parent=MsG0180000653.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180000653.01.T01

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Protein sequence

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