AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480022579.01

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MsG0480022579.01.T01 AT4G11470 31.683 303 164 12 37 309 324 613 1.74e-29 119
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MsG0480022579.01.T01 AT2G42960 28.522 291 162 7 48 307 179 454 4.77e-26 108
MsG0480022579.01.T01 AT2G42960 28.522 291 162 7 48 307 179 454 4.77e-26 108
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MsG0480022579.01.T01 AT1G48480 29.866 298 179 10 35 310 353 642 6.82e-26 108
MsG0480022579.01.T01 AT4G23150 32.245 245 134 8 10 229 299 536 7.61e-26 108
MsG0480022579.01.T01 AT3G49670 33.219 292 149 11 50 310 688 964 9.02e-26 108
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MsG0480022579.01.T01 AT4G00970 26.727 333 199 9 39 339 331 650 1.30e-25 108
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MsG0480022579.01.T01 AT4G38830 33.790 219 117 7 37 229 329 545 1.17e-24 105
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MsG0480022579.01.T01 AT2G28250 29.605 304 179 9 38 310 196 495 1.33e-24 104
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MsG0480022579.01.T01 AT5G63930 30.743 296 156 10 42 303 794 1074 1.86e-24 105
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MsG0480022579.01.T01 AT5G10290 28.065 310 186 8 24 307 266 564 1.87e-24 104
MsG0480022579.01.T01 AT2G33170 28.333 300 174 8 47 313 814 1105 1.94e-24 105
MsG0480022579.01.T01 AT2G33170 28.333 300 174 8 47 313 814 1105 1.94e-24 105
MsG0480022579.01.T01 AT1G67720 31.164 292 166 9 36 303 592 872 2.00e-24 104
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MsG0480022579.01.T01 AT4G04510 27.575 301 180 8 34 309 323 610 2.41e-24 104
MsG0480022579.01.T01 AT4G20270 30.584 291 156 10 47 305 705 981 2.59e-24 104
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MsG0480022579.01.T01 AT3G26700 26.126 333 210 8 7 314 34 355 3.54e-24 102
MsG0480022579.01.T01 AT5G35370 30.120 332 181 12 13 303 478 799 3.72e-24 103
MsG0480022579.01.T01 AT4G00970 32.110 218 119 5 39 229 331 546 3.79e-24 103
MsG0480022579.01.T01 AT4G05200 30.033 303 164 10 39 309 334 620 3.86e-24 103
MsG0480022579.01.T01 AT4G05200 30.033 303 164 10 39 309 352 638 3.93e-24 103
MsG0480022579.01.T01 AT3G46290 33.962 212 114 7 38 225 471 680 4.15e-24 103
MsG0480022579.01.T01 AT4G01330 28.777 278 164 8 48 300 158 426 4.29e-24 102
MsG0480022579.01.T01 AT1G31420 29.643 280 162 9 50 305 304 572 4.63e-24 103
MsG0480022579.01.T01 AT1G31420 29.643 280 162 9 50 305 304 572 4.63e-24 103
MsG0480022579.01.T01 AT1G30570 32.287 223 125 7 27 225 495 715 4.74e-24 103
MsG0480022579.01.T01 AT1G80640 30.576 278 165 9 48 307 145 412 4.92e-24 102
MsG0480022579.01.T01 AT5G49660 30.034 293 153 9 50 305 654 931 5.62e-24 103
MsG0480022579.01.T01 AT4G11530 33.945 218 117 7 37 229 337 552 6.05e-24 103
MsG0480022579.01.T01 AT2G23950 30.164 305 167 10 42 318 289 575 6.08e-24 103
MsG0480022579.01.T01 AT3G24540 28.188 298 183 10 42 314 173 464 6.09e-24 102
MsG0480022579.01.T01 AT4G01330 28.777 278 164 8 48 300 158 426 6.18e-24 102
MsG0480022579.01.T01 AT2G37710 27.397 292 174 10 39 303 334 614 6.28e-24 103
MsG0480022579.01.T01 AT1G76370 32.189 233 130 6 23 229 46 276 6.35e-24 101
MsG0480022579.01.T01 AT3G16030 32.877 292 156 12 41 303 393 673 6.51e-24 103
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MsG0480022579.01.T01 AT5G01950 32.407 216 115 8 41 227 615 828 2.49e-22 98.6
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MsG0480022579.01.T01 AT1G55200 30.132 302 152 14 41 305 368 647 9.26e-22 96.7
MsG0480022579.01.T01 AT4G18250 29.921 254 141 9 39 259 344 593 9.28e-22 96.7
MsG0480022579.01.T01 AT5G38260 28.931 318 185 11 39 329 310 613 9.78e-22 96.7
MsG0480022579.01.T01 AT5G01550 27.273 319 182 12 29 318 360 657 1.02e-21 96.7
MsG0480022579.01.T01 AT1G61490 34.742 213 110 7 48 234 336 545 1.04e-21 96.7
MsG0480022579.01.T01 AT1G61400 27.628 333 186 13 10 303 459 775 1.11e-21 96.7
MsG0480022579.01.T01 AT3G18810 29.911 224 126 8 42 237 327 547 1.12e-21 96.7
MsG0480022579.01.T01 AT1G49730 32.510 243 134 8 13 229 320 558 1.12e-21 96.7
MsG0480022579.01.T01 AT5G63710 28.155 309 184 10 25 307 266 562 1.13e-21 96.3
MsG0480022579.01.T01 AT5G01950 36.306 157 94 4 41 193 615 769 1.15e-21 96.7
MsG0480022579.01.T01 AT1G25390 27.184 309 189 10 41 322 280 579 1.16e-21 96.3
MsG0480022579.01.T01 AT1G25390 27.184 309 189 10 41 322 280 579 1.16e-21 96.3
MsG0480022579.01.T01 AT1G61430 29.758 289 156 10 48 303 485 759 1.17e-21 96.7
MsG0480022579.01.T01 AT1G49730 32.510 243 134 8 13 229 290 528 1.19e-21 96.3
MsG0480022579.01.T01 AT1G73080 26.948 308 172 10 42 310 817 1110 1.19e-21 96.7
MsG0480022579.01.T01 AT1G06840 27.483 302 171 10 42 312 615 899 1.23e-21 96.7
MsG0480022579.01.T01 AT5G63710 28.155 309 184 10 25 307 267 563 1.26e-21 96.3
MsG0480022579.01.T01 AT1G61490 34.742 213 110 7 48 234 460 669 1.34e-21 96.3
MsG0480022579.01.T01 AT1G61490 34.742 213 110 7 48 234 460 669 1.34e-21 96.3
MsG0480022579.01.T01 AT1G61490 34.742 213 110 7 48 234 486 695 1.38e-21 96.3
MsG0480022579.01.T01 AT1G61490 34.742 213 110 7 48 234 486 695 1.38e-21 96.3
MsG0480022579.01.T01 AT1G61490 34.742 213 110 7 48 234 486 695 1.38e-21 96.3
MsG0480022579.01.T01 AT1G61490 34.742 213 110 7 48 234 486 695 1.38e-21 96.3
MsG0480022579.01.T01 AT1G07870 27.517 298 181 9 33 303 84 373 1.55e-21 95.9
MsG0480022579.01.T01 AT4G39110 29.200 250 141 8 10 225 473 720 1.66e-21 96.3
MsG0480022579.01.T01 AT5G02800 28.814 295 175 9 36 303 57 343 1.68e-21 94.7
MsG0480022579.01.T01 AT4G04540 34.270 178 108 5 34 205 335 509 1.74e-21 95.5
MsG0480022579.01.T01 AT4G03390 26.347 334 203 11 14 314 443 766 1.76e-21 95.9
MsG0480022579.01.T01 AT4G03390 26.347 334 203 11 14 314 443 766 1.76e-21 95.9
MsG0480022579.01.T01 AT5G38240 27.425 299 178 9 37 310 258 542 1.84e-21 95.9
MsG0480022579.01.T01 AT4G23200 36.250 160 95 4 39 193 323 480 1.87e-21 95.5
MsG0480022579.01.T01 AT5G06740 24.841 314 200 8 39 323 317 623 2.05e-21 95.9
MsG0480022579.01.T01 AT4G29050 28.475 295 172 11 35 303 345 626 2.17e-21 95.5
MsG0480022579.01.T01 AT1G28390 25.714 315 179 9 41 313 41 342 2.19e-21 95.1
MsG0480022579.01.T01 AT1G28390 25.714 315 179 9 41 313 41 342 2.30e-21 95.1
MsG0480022579.01.T01 AT1G24030 26.639 244 145 7 90 307 13 248 2.41e-21 92.4
MsG0480022579.01.T01 AT4G23300 28.713 303 175 10 30 303 333 623 2.52e-21 95.5
MsG0480022579.01.T01 AT4G29050 28.475 295 172 11 35 303 331 612 2.56e-21 95.5
MsG0480022579.01.T01 AT1G78530 31.401 207 117 5 45 229 68 271 2.61e-21 92.8
MsG0480022579.01.T01 AT5G06740 24.841 314 200 8 39 323 329 635 2.67e-21 95.5
MsG0480022579.01.T01 AT5G39000 35.266 207 103 8 48 225 514 718 2.73e-21 95.5
MsG0480022579.01.T01 AT3G58690 26.578 301 174 8 41 307 76 363 2.79e-21 94.4
MsG0480022579.01.T01 AT5G60300 25.862 290 182 8 37 303 329 608 3.01e-21 95.1
MsG0480022579.01.T01 AT5G60300 25.862 290 182 8 37 303 329 608 3.01e-21 95.1
MsG0480022579.01.T01 AT5G60300 25.862 290 182 8 37 303 329 608 3.11e-21 95.1
MsG0480022579.01.T01 AT5G38240 27.575 301 179 9 39 314 306 592 3.32e-21 95.1
MsG0480022579.01.T01 AT5G07180 29.605 304 149 11 42 307 545 821 3.35e-21 95.1
MsG0480022579.01.T01 AT1G20650 30.472 233 134 6 23 229 49 279 3.44e-21 93.6
MsG0480022579.01.T01 AT3G13690 29.139 302 169 10 34 305 393 679 3.45e-21 95.1
MsG0480022579.01.T01 AT3G13690 29.139 302 169 10 34 305 393 679 3.45e-21 95.1
MsG0480022579.01.T01 AT3G13690 29.139 302 169 10 34 305 393 679 3.45e-21 95.1
MsG0480022579.01.T01 AT1G56140 27.331 311 191 10 38 324 679 978 3.58e-21 95.1
MsG0480022579.01.T01 AT3G24550 26.667 300 187 11 41 314 269 561 3.66e-21 95.1
MsG0480022579.01.T01 AT5G56790 30.097 309 161 12 32 305 370 658 3.82e-21 94.7
MsG0480022579.01.T01 AT5G18610 28.571 294 175 8 37 303 68 353 4.06e-21 94.4
MsG0480022579.01.T01 AT5G18610 28.571 294 175 8 37 303 68 353 4.06e-21 94.4
MsG0480022579.01.T01 AT5G18610 28.571 294 175 8 37 303 68 353 4.06e-21 94.4
MsG0480022579.01.T01 AT1G66920 30.035 283 158 11 57 310 312 583 4.12e-21 94.7
MsG0480022579.01.T01 AT1G61430 33.953 215 112 7 48 234 485 697 4.35e-21 94.7
MsG0480022579.01.T01 AT5G55830 27.425 299 180 11 39 309 352 641 4.44e-21 94.7
MsG0480022579.01.T01 AT3G20530 28.571 245 142 8 29 242 56 298 4.44e-21 92.4
MsG0480022579.01.T01 AT5G07180 29.605 304 149 11 42 307 641 917 4.51e-21 94.7

Find 58 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 82 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AAGAAGGATGTTTATGATTT+TGG 0.185214 4:-74305204 MsG0480022579.01.T01:CDS
CTGATTAAGGGGAAGAAATT+TGG 0.211932 4:-74305165 MsG0480022579.01.T01:CDS
AAACATGGCCCCTCGAAAAT+TGG 0.231570 4:+74305263 None:intergenic
TGAATTAGAAATAATGCTTT+TGG 0.243953 4:-74305559 MsG0480022579.01.T01:CDS
AATGATGATACTACAAAATT+AGG 0.272153 4:-74305420 MsG0480022579.01.T01:CDS
TCCATGCACAGAAACTAAAA+AGG 0.283107 4:-74305937 MsG0480022579.01.T01:CDS
GTCATTGGGGTGGGAGTGAC+TGG 0.298575 4:-74305666 MsG0480022579.01.T01:CDS
AGGGTTATTAAAATTGTTCT+TGG 0.306637 4:-74305390 MsG0480022579.01.T01:CDS
TACTTAAACAATCACTTGTT+TGG 0.306702 4:+74305142 None:intergenic
AATCTGTTGGATGACCATTC+TGG 0.311319 4:-74305075 MsG0480022579.01.T01:CDS
AGAAACATACTTCCCTTGAT+TGG 0.365465 4:-74305522 MsG0480022579.01.T01:CDS
ATGTTAATTAATAAGTATAT+TGG 0.366623 4:+74304830 None:intergenic
CCTACATTATAGCTTGCATA+TGG 0.369050 4:-74305346 MsG0480022579.01.T01:CDS
TTTAGCAAGGACAATGTCAT+TGG 0.393091 4:-74305681 MsG0480022579.01.T01:CDS
TGGTCATCCAACAGATTCAT+AGG 0.416066 4:+74305081 None:intergenic
ACAGAAAGATGGGCAACATA+TGG 0.437779 4:-74304924 MsG0480022579.01.T01:CDS
GGGTTATTAAAATTGTTCTT+GGG 0.439523 4:-74305389 MsG0480022579.01.T01:CDS
GTGTATCAATACATGTCAAA+TGG 0.454305 4:-74305462 MsG0480022579.01.T01:CDS
TTAGCAAGGACAATGTCATT+GGG 0.465281 4:-74305680 MsG0480022579.01.T01:CDS
TCCAACAGATTCATAGGATT+AGG 0.465570 4:+74305087 None:intergenic
CAAATGGAAGACTTTCTGAT+TGG 0.468898 4:-74305446 MsG0480022579.01.T01:CDS
TTCTATGCAGAAACCAATCA+AGG 0.471912 4:+74305509 None:intergenic
ATCTGTTGGATGACCATTCT+GGG 0.472701 4:-74305074 MsG0480022579.01.T01:CDS
GCTTGAGGTGTACAGAAAGA+TGG 0.481376 4:-74304935 MsG0480022579.01.T01:CDS
AATCAACAGATCAATAAAGT+TGG 0.481713 4:-74305756 MsG0480022579.01.T01:intron
AGCTGCGAAAATACAACTGT+TGG 0.482279 4:+74305620 None:intergenic
CTGTACACCTCAAGCATAGT+AGG 0.489005 4:+74304943 None:intergenic
GCTCCGAGTGTATCTTGCTA+GGG 0.491577 4:-74305308 MsG0480022579.01.T01:CDS
AAATCAATCGATAAGAAGTC+AGG 0.496396 4:+74304877 None:intergenic
GGATACGTGTACGTCGCAAA+AGG 0.498025 4:+74305108 None:intergenic
GTTGCTAGATAAAAGAATAC+AGG 0.498840 4:-74305882 MsG0480022579.01.T01:intron
TCCTAATCCTATGAATCTGT+TGG 0.505363 4:-74305088 MsG0480022579.01.T01:CDS
GAATGAATCTCTAAACATGA+TGG 0.511683 4:-74305037 MsG0480022579.01.T01:CDS
CAGAAAGATGGGCAACATAT+GGG 0.511976 4:-74304923 MsG0480022579.01.T01:CDS
CTTGAGGTGTACAGAAAGAT+GGG 0.533474 4:-74304934 MsG0480022579.01.T01:CDS
AAACATAGGATTTGGAAAGA+AGG 0.535053 4:-74305220 MsG0480022579.01.T01:CDS
CGCATCTTTATGCATAAACA+TGG 0.539522 4:+74305248 None:intergenic
CATGATGGAATTTGAAGATG+AGG 0.544367 4:-74305022 MsG0480022579.01.T01:CDS
GATCAATAAAGTTGGACGGT+TGG 0.551344 4:-74305748 MsG0480022579.01.T01:CDS
ATTGTTCTTGGGATAGCAAG+AGG 0.558165 4:-74305378 MsG0480022579.01.T01:CDS
CTACAAAATTAGGATGGCCA+AGG 0.558309 4:-74305410 MsG0480022579.01.T01:CDS
AAGGACAATGTCATTGGGGT+GGG 0.564932 4:-74305675 MsG0480022579.01.T01:CDS
AGCTCCGAGTGTATCTTGCT+AGG 0.566228 4:-74305309 MsG0480022579.01.T01:CDS
CCATATGCAAGCTATAATGT+AGG 0.573812 4:+74305346 None:intergenic
TATTGGTCTCTATTTGTCGT+AGG 0.583090 4:+74304847 None:intergenic
CAAGGACAATGTCATTGGGG+TGG 0.586816 4:-74305676 MsG0480022579.01.T01:CDS
CTGCATCATAGAACCCAGAA+TGG 0.593962 4:+74305061 None:intergenic
ATGATACTACAAAATTAGGA+TGG 0.608954 4:-74305416 MsG0480022579.01.T01:CDS
AACAGATCAATAAAGTTGGA+CGG 0.612735 4:-74305752 MsG0480022579.01.T01:intron
TCATTGGGGTGGGAGTGACT+GGG 0.620574 4:-74305665 MsG0480022579.01.T01:CDS
TACAAAATTAGGATGGCCAA+GGG 0.625659 4:-74305409 MsG0480022579.01.T01:CDS
TGCAACAGAATACTTTAGCA+AGG 0.633070 4:-74305694 MsG0480022579.01.T01:CDS
TAAAAGACCTACTATGCTTG+AGG 0.633379 4:-74304950 MsG0480022579.01.T01:CDS
TCTATGCAGAAACCAATCAA+GGG 0.633795 4:+74305510 None:intergenic
GTCCCCTAGCAAGATACACT+CGG 0.644018 4:+74305305 None:intergenic
AAAGGACAAAATGTTACCTG+TGG 0.651662 4:-74305906 MsG0480022579.01.T01:CDS
CTCCGAGTGTATCTTGCTAG+GGG 0.658381 4:-74305307 MsG0480022579.01.T01:CDS
TAGCAAGGACAATGTCATTG+GGG 0.664144 4:-74305679 MsG0480022579.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATGATGATACTACAAAATT+AGG - Chr4:74305364-74305383 MsG0480022579.01.T01:CDS 20.0%
!!! AGAAAAAAATGAAAGAGTTT+TGG - Chr4:74305300-74305319 MsG0480022579.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATCAAATGCAAATGTTTTTA+TGG - Chr4:74304944-74304963 MsG0480022579.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTCTCAATTTTGTATCAAA+AGG - Chr4:74305200-74305219 MsG0480022579.01.T01:CDS 20.0%
!!! GAATTAGAAATAATGCTTTT+GGG - Chr4:74305226-74305245 MsG0480022579.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGAATTAGAAATAATGCTTT+TGG - Chr4:74305225-74305244 MsG0480022579.01.T01:CDS 20.0%
! AATCAACAGATCAATAAAGT+TGG - Chr4:74305028-74305047 MsG0480022579.01.T01:CDS 25.0%
! AGGGTTATTAAAATTGTTCT+TGG - Chr4:74305394-74305413 MsG0480022579.01.T01:CDS 25.0%
! ATGATACTACAAAATTAGGA+TGG - Chr4:74305368-74305387 MsG0480022579.01.T01:CDS 25.0%
! GGGTTATTAAAATTGTTCTT+GGG - Chr4:74305395-74305414 MsG0480022579.01.T01:CDS 25.0%
! TACTTAAACAATCACTTGTT+TGG + Chr4:74305645-74305664 None:intergenic 25.0%
!! AAGAAGGATGTTTATGATTT+TGG - Chr4:74305580-74305599 MsG0480022579.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGAACAATTTTAATAACCCT+TGG + Chr4:74305394-74305413 None:intergenic 25.0%
!!! GTTGTCTGTTATGTTTTTTT+GGG - Chr4:74304997-74305016 MsG0480022579.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGTTGTCTGTTATGTTTTTT+TGG - Chr4:74304996-74305015 MsG0480022579.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTGTCTGTTATGTTTTTTTG+GGG - Chr4:74304998-74305017 MsG0480022579.01.T01:CDS 25.0%
AAACATAGGATTTGGAAAGA+AGG - Chr4:74305564-74305583 MsG0480022579.01.T01:CDS 30.0%
AAAGATGCGAACAAAAACAT+AGG - Chr4:74305550-74305569 MsG0480022579.01.T01:CDS 30.0%
AAATCAATCGATAAGAAGTC+AGG + Chr4:74305910-74305929 None:intergenic 30.0%
AACAGATCAATAAAGTTGGA+CGG - Chr4:74305032-74305051 MsG0480022579.01.T01:CDS 30.0%
CATTTGATCAGTGAGATTAA+TGG + Chr4:74304932-74304951 None:intergenic 30.0%
GAATGAATCTCTAAACATGA+TGG - Chr4:74305747-74305766 MsG0480022579.01.T01:CDS 30.0%
GTGTATCAATACATGTCAAA+TGG - Chr4:74305322-74305341 MsG0480022579.01.T01:CDS 30.0%
GTTGCTAGATAAAAGAATAC+AGG - Chr4:74304902-74304921 MsG0480022579.01.T01:CDS 30.0%
! CCTCGAAAATTGGATATTTT+CGG + Chr4:74305514-74305533 None:intergenic 30.0%
! CGAAAATATCCAATTTTCGA+GGG - Chr4:74305512-74305531 MsG0480022579.01.T01:CDS 30.0%
! GTAGGTCTTTTATCAAACAA+AGG + Chr4:74305826-74305845 None:intergenic 30.0%
! TAACATTTTGTCCTTTTGTC+TGG + Chr4:74304874-74304893 None:intergenic 30.0%
!! GAAAATATCCAATTTTCGAG+GGG - Chr4:74305513-74305532 MsG0480022579.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTGCTTTTTGAGCTGATTAA+GGG - Chr4:74305607-74305626 MsG0480022579.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTGCTTTTTGAGCTGATTA+AGG - Chr4:74305606-74305625 MsG0480022579.01.T01:CDS 30.0%
AAAGGACAAAATGTTACCTG+TGG - Chr4:74304878-74304897 MsG0480022579.01.T01:CDS 35.0%
AGAAACATACTTCCCTTGAT+TGG - Chr4:74305262-74305281 MsG0480022579.01.T01:CDS 35.0%
CAAATGGAAGACTTTCTGAT+TGG - Chr4:74305338-74305357 MsG0480022579.01.T01:CDS 35.0%
CCATATGCAAGCTATAATGT+AGG + Chr4:74305441-74305460 None:intergenic 35.0%
CCATGCACAGAAACTAAAAA+GGG - Chr4:74304848-74304867 MsG0480022579.01.T01:CDS 35.0%
CGCATCTTTATGCATAAACA+TGG + Chr4:74305539-74305558 None:intergenic 35.0%
CTGATTAAGGGGAAGAAATT+TGG - Chr4:74305619-74305638 MsG0480022579.01.T01:CDS 35.0%
GCGAACAAAAACATAGGATT+TGG - Chr4:74305556-74305575 MsG0480022579.01.T01:CDS 35.0%
TAAAAGACCTACTATGCTTG+AGG - Chr4:74305834-74305853 MsG0480022579.01.T01:intron 35.0%
TACAAAATTAGGATGGCCAA+GGG - Chr4:74305375-74305394 MsG0480022579.01.T01:CDS 35.0%
TCCAACAGATTCATAGGATT+AGG + Chr4:74305700-74305719 None:intergenic 35.0%
TCCATGCACAGAAACTAAAA+AGG - Chr4:74304847-74304866 MsG0480022579.01.T01:CDS 35.0%
TCCTAATCCTATGAATCTGT+TGG - Chr4:74305696-74305715 MsG0480022579.01.T01:CDS 35.0%
TCTATGCAGAAACCAATCAA+GGG + Chr4:74305277-74305296 None:intergenic 35.0%
TGCAACAGAATACTTTAGCA+AGG - Chr4:74305090-74305109 MsG0480022579.01.T01:CDS 35.0%
TTAGCAAGGACAATGTCATT+GGG - Chr4:74305104-74305123 MsG0480022579.01.T01:CDS 35.0%
TTCTATGCAGAAACCAATCA+AGG + Chr4:74305278-74305297 None:intergenic 35.0%
TTTAGCAAGGACAATGTCAT+TGG - Chr4:74305103-74305122 MsG0480022579.01.T01:CDS 35.0%
! CATGATGGAATTTGAAGATG+AGG - Chr4:74305762-74305781 MsG0480022579.01.T01:intron 35.0%
! CCGAAAATATCCAATTTTCG+AGG - Chr4:74305511-74305530 MsG0480022579.01.T01:CDS 35.0%
! CCTACATTATAGCTTGCATA+TGG - Chr4:74305438-74305457 MsG0480022579.01.T01:CDS 35.0%
! TATTGGTCTCTATTTGTCGT+AGG + Chr4:74305940-74305959 None:intergenic 35.0%
!! TGCTTTTTGAGCTGATTAAG+GGG - Chr4:74305608-74305627 MsG0480022579.01.T01:CDS 35.0%
!!! TCTGTTATGTTTTTTTGGGG+TGG - Chr4:74305001-74305020 MsG0480022579.01.T01:CDS 35.0%
AATCTGTTGGATGACCATTC+TGG - Chr4:74305709-74305728 MsG0480022579.01.T01:CDS 40.0%
ACAGAAAGATGGGCAACATA+TGG - Chr4:74305860-74305879 MsG0480022579.01.T01:intron 40.0%
ACTAAAAAGGGCCAGACAAA+AGG - Chr4:74304860-74304879 MsG0480022579.01.T01:CDS 40.0%
AGCTGCGAAAATACAACTGT+TGG + Chr4:74305167-74305186 None:intergenic 40.0%
ATCTGTTGGATGACCATTCT+GGG - Chr4:74305710-74305729 MsG0480022579.01.T01:CDS 40.0%
ATTGTTCTTGGGATAGCAAG+AGG - Chr4:74305406-74305425 MsG0480022579.01.T01:CDS 40.0%
CAGAAAGATGGGCAACATAT+GGG - Chr4:74305861-74305880 MsG0480022579.01.T01:intron 40.0%
CTACAAAATTAGGATGGCCA+AGG - Chr4:74305374-74305393 MsG0480022579.01.T01:CDS 40.0%
CTTGAGGTGTACAGAAAGAT+GGG - Chr4:74305850-74305869 MsG0480022579.01.T01:intron 40.0%
GATCAATAAAGTTGGACGGT+TGG - Chr4:74305036-74305055 MsG0480022579.01.T01:CDS 40.0%
TAGCAAGGACAATGTCATTG+GGG - Chr4:74305105-74305124 MsG0480022579.01.T01:CDS 40.0%
TGGTCATCCAACAGATTCAT+AGG + Chr4:74305706-74305725 None:intergenic 40.0%
! CTTTTATCTAGCAACTCCAC+AGG + Chr4:74304897-74304916 None:intergenic 40.0%
!!! CCCTTTTTAGTTTCTGTGCA+TGG + Chr4:74304851-74304870 None:intergenic 40.0%
AAACATGGCCCCTCGAAAAT+TGG + Chr4:74305524-74305543 None:intergenic 45.0%
AAGGACAATGTCATTGGGGT+GGG - Chr4:74305109-74305128 MsG0480022579.01.T01:CDS 45.0%
CTGCATCATAGAACCCAGAA+TGG + Chr4:74305726-74305745 None:intergenic 45.0%
CTGTACACCTCAAGCATAGT+AGG + Chr4:74305844-74305863 None:intergenic 45.0%
GCTTGAGGTGTACAGAAAGA+TGG - Chr4:74305849-74305868 MsG0480022579.01.T01:intron 45.0%
AGCTCCGAGTGTATCTTGCT+AGG - Chr4:74305475-74305494 MsG0480022579.01.T01:CDS 50.0%
CAAGGACAATGTCATTGGGG+TGG - Chr4:74305108-74305127 MsG0480022579.01.T01:CDS 50.0%
CTCCGAGTGTATCTTGCTAG+GGG - Chr4:74305477-74305496 MsG0480022579.01.T01:CDS 50.0%
GCTCCGAGTGTATCTTGCTA+GGG - Chr4:74305476-74305495 MsG0480022579.01.T01:CDS 50.0%
GGATACGTGTACGTCGCAAA+AGG + Chr4:74305679-74305698 None:intergenic 50.0%
GTCCCCTAGCAAGATACACT+CGG + Chr4:74305482-74305501 None:intergenic 50.0%
TCATTGGGGTGGGAGTGACT+GGG - Chr4:74305119-74305138 MsG0480022579.01.T01:CDS 55.0%
GTCATTGGGGTGGGAGTGAC+TGG - Chr4:74305118-74305137 MsG0480022579.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 74304837 74305969 74304837 ID=MsG0480022579.01;Name=MsG0480022579.01
Chr4 mRNA 74304837 74305969 74304837 ID=MsG0480022579.01.T01;Parent=MsG0480022579.01;Name=MsG0480022579.01.T01;_AED=0.29;_eAED=0.29;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|339
Chr4 exon 74305883 74305969 74305883 ID=MsG0480022579.01.T01:exon:22917;Parent=MsG0480022579.01.T01
Chr4 exon 74304837 74305769 74304837 ID=MsG0480022579.01.T01:exon:22916;Parent=MsG0480022579.01.T01
Chr4 CDS 74305883 74305969 74305883 ID=MsG0480022579.01.T01:cds;Parent=MsG0480022579.01.T01
Chr4 CDS 74304837 74305769 74304837 ID=MsG0480022579.01.T01:cds;Parent=MsG0480022579.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480022579.01.T01

ATGGGGCATATCCATGCACAGAAACTAAAAAGGGCCAGACAAAAGGACAAAATGTTACCTGTGGAGTTGCTAGATAAAAGAATACAGATCAATAAAGTTGGACGGTTGGCTTATAAGATGAACTTCACAAAATTCTATCATGCAACAGAATACTTTAGCAAGGACAATGTCATTGGGGTGGGAGTGACTGGGATAATGTACAAAGCAACACTTTCCAACAGTTGTATTTTCGCAGCTAAGAGACTTCATGATTCTCAATTTTGTATCAAAAGGTTTGAATTAGAAATAATGCTTTTGGGACAATACAGTCACAGAAACATACTTCCCTTGATTGGTTTCTGCATAGAAGAAGAAAAAAATGAAAGAGTTTTGGTGTATCAATACATGTCAAATGGAAGACTTTCTGATTGGTTGAATGATGATACTACAAAATTAGGATGGCCAAGGGTTATTAAAATTGTTCTTGGGATAGCAAGAGGTTTATGTTGCCTACATTATAGCTTGCATATGGTTCATCTTAATATAAGCTCCGAGTGTATCTTGCTAGGGGACAATTTTGAGCCGAAAATATCCAATTTTCGAGGGGCCATGTTTATGCATAAAGATGCGAACAAAAACATAGGATTTGGAAAGAAGGATGTTTATGATTTTGGTTGTTTGCTTTTTGAGCTGATTAAGGGGAAGAAATTTGGCCAAACAAGTGATTGTTTAAGTAATACTAATGTTCCTTTTGCGACGTACACGTATCCTAATCCTATGAATCTGTTGGATGACCATTCTGGGTTCTATGATGCAGTGAATGAATCTCTAAACATGATGGAATTTGAAGATGAGGTATCTGCTCTACTTAGAGTTGCATGTGATTGTGTTCATCCTTTGTTTGATAAAAGACCTACTATGCTTGAGGTGTACAGAAAGATGGGCAACATATGGGAGAGAGATGATATTTGTGAAGATCCTGACTTCTTATCGATTGATTTTGAAACTCCTACGACAAATAGAGACCAATATACTTATTAA
Protein sequence

>MsG0480022579.01.T01

MGHIHAQKLKRARQKDKMLPVELLDKRIQINKVGRLAYKMNFTKFYHATEYFSKDNVIGVGVTGIMYKATLSNSCIFAAKRLHDSQFCIKRFELEIMLLGQYSHRNILPLIGFCIEEEKNERVLVYQYMSNGRLSDWLNDDTTKLGWPRVIKIVLGIARGLCCLHYSLHMVHLNISSECILLGDNFEPKISNFRGAMFMHKDANKNIGFGKKDVYDFGCLLFELIKGKKFGQTSDCLSNTNVPFATYTYPNPMNLLDDHSGFYDAVNESLNMMEFEDEVSALLRVACDCVHPLFDKRPTMLEVYRKMGNIWERDDICEDPDFLSIDFETPTTNRDQYTY*