AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380012034.01


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MsG0380012034.01.T01 AT5G17680 23.554 709 441 27 136 779 133 805 8.83e-22 102
MsG0380012034.01.T01 AT1G51480 25.203 369 237 15 128 469 80 436 8.41e-21 99.0
MsG0380012034.01.T01 AT5G43740 27.941 272 175 10 207 469 174 433 1.48e-20 98.2
MsG0380012034.01.T01 AT5G43740 27.941 272 175 10 207 469 174 433 1.48e-20 98.2
MsG0380012034.01.T01 AT4G33300 31.227 269 157 10 201 464 197 442 2.32e-20 97.4
MsG0380012034.01.T01 AT4G33300 31.227 269 157 10 201 464 197 442 2.32e-20 97.4
MsG0380012034.01.T01 AT1G33560 29.900 301 163 11 206 500 188 446 6.19e-19 92.8
MsG0380012034.01.T01 AT1G63360 25.107 466 290 18 217 643 150 595 8.55e-18 89.0
MsG0380012034.01.T01 AT1G62630 24.078 461 278 20 217 631 185 619 1.00e-17 89.0
MsG0380012034.01.T01 AT1G63360 24.893 466 291 18 217 643 185 630 1.26e-17 88.6
MsG0380012034.01.T01 AT1G69550 24.799 746 433 32 196 850 268 976 1.33e-17 89.0
MsG0380012034.01.T01 AT1G12280 23.382 479 265 20 201 640 135 550 1.33e-16 85.1
MsG0380012034.01.T01 AT5G04720 26.284 331 204 10 127 454 134 427 2.46e-16 84.3
MsG0380012034.01.T01 AT5G41750 23.132 281 175 10 183 448 186 440 5.13e-15 80.5
MsG0380012034.01.T01 AT5G41750 23.132 281 175 10 183 448 186 440 5.13e-15 80.5
MsG0380012034.01.T01 AT5G36930 26.183 317 188 10 121 419 128 416 3.79e-14 77.4
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MsG0380012034.01.T01 AT5G36930 26.183 317 188 10 121 419 128 416 4.25e-14 77.4
MsG0380012034.01.T01 AT5G36930 26.183 317 188 10 121 419 131 419 4.29e-14 77.4
MsG0380012034.01.T01 AT1G27180 26.061 330 204 15 178 496 193 493 1.42e-13 75.5
MsG0380012034.01.T01 AT1G27180 26.061 330 204 15 178 496 17 317 1.45e-13 75.9
MsG0380012034.01.T01 AT1G27180 26.061 330 204 15 178 496 17 317 1.45e-13 75.9
MsG0380012034.01.T01 AT1G27180 26.061 330 204 15 178 496 17 317 1.45e-13 75.9
MsG0380012034.01.T01 AT1G27180 26.061 330 204 15 178 496 191 491 2.21e-13 75.1
MsG0380012034.01.T01 AT1G27180 26.061 330 204 15 178 496 191 491 2.21e-13 75.1
MsG0380012034.01.T01 AT1G27180 26.061 330 204 15 178 496 193 493 2.31e-13 75.1
MsG0380012034.01.T01 AT1G27180 26.061 330 204 15 178 496 355 655 2.44e-13 75.1
MsG0380012034.01.T01 AT3G44670 23.099 710 419 27 183 837 268 905 3.09e-13 74.7
MsG0380012034.01.T01 AT3G44670 23.099 710 419 27 183 837 268 905 3.09e-13 74.7
MsG0380012034.01.T01 AT1G27170 29.130 230 143 12 183 404 189 406 5.67e-13 73.9
MsG0380012034.01.T01 AT1G27170 29.130 230 143 12 183 404 189 406 6.61e-13 73.6
MsG0380012034.01.T01 AT5G51630 22.869 704 409 31 183 834 185 806 3.18e-12 71.2
MsG0380012034.01.T01 AT5G51630 22.914 707 411 31 183 837 121 745 4.26e-12 70.9
MsG0380012034.01.T01 AT5G51630 22.869 704 409 31 183 834 121 742 4.83e-12 70.9
MsG0380012034.01.T01 AT5G51630 22.869 704 409 31 183 834 121 742 4.83e-12 70.9
MsG0380012034.01.T01 AT1G63880 23.509 285 188 8 174 448 178 442 7.28e-12 69.7
MsG0380012034.01.T01 AT5G51630 22.869 704 409 31 183 834 121 742 7.41e-12 70.1
MsG0380012034.01.T01 AT1G63880 23.551 276 181 8 183 448 187 442 8.78e-12 69.7
MsG0380012034.01.T01 AT5G38850 26.236 263 168 8 165 417 160 406 1.23e-11 69.3
MsG0380012034.01.T01 AT3G25510 24.409 254 161 8 206 448 21 254 4.64e-11 67.4
MsG0380012034.01.T01 AT3G25510 24.409 254 161 8 206 448 21 254 4.64e-11 67.4
MsG0380012034.01.T01 AT3G04210 26.848 257 152 9 171 411 228 464 4.73e-11 67.0
MsG0380012034.01.T01 AT3G04210 26.848 257 152 9 171 411 228 464 4.73e-11 67.0
MsG0380012034.01.T01 AT5G40910 23.913 276 174 10 183 448 1 250 5.89e-11 67.0
MsG0380012034.01.T01 AT5G40910 23.913 276 174 10 183 448 1 250 5.89e-11 67.0
MsG0380012034.01.T01 AT5G40910 23.913 276 174 10 183 448 1 250 5.89e-11 67.0
MsG0380012034.01.T01 AT5G40910 23.913 276 174 10 183 448 1 250 5.89e-11 67.0
MsG0380012034.01.T01 AT5G40910 23.913 276 174 10 183 448 1 250 5.89e-11 67.0
MsG0380012034.01.T01 AT5G40910 23.913 276 174 10 183 448 1 250 6.08e-11 67.0
MsG0380012034.01.T01 AT5G40910 23.913 276 174 10 183 448 1 250 6.08e-11 67.0
MsG0380012034.01.T01 AT5G40910 23.913 276 174 10 183 448 185 434 6.80e-11 67.0
MsG0380012034.01.T01 AT5G40910 23.913 276 174 10 183 448 185 434 6.80e-11 67.0
MsG0380012034.01.T01 AT1G56510 24.364 275 178 9 183 448 186 439 6.99e-11 67.0
MsG0380012034.01.T01 AT5G66900 23.487 694 435 30 165 837 152 770 7.62e-11 66.6
MsG0380012034.01.T01 AT5G66900 26.129 310 196 11 165 464 200 486 9.40e-11 65.9

Find 171 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 207 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TCCTGTGTTATTGCTAATTA+AGG 0.155970 3:+9871067 None:intergenic
ATCCTACATTCTGACGAATT+TGG 0.171472 3:+9869244 None:intergenic
ATGAGCTTGTTTATCTCTTT+TGG 0.177066 3:+9870067 None:intergenic
AAACCATGCATGCTATATTT+TGG 0.187448 3:-9870684 MsG0380012034.01.T01:CDS
TTTCTCAATCATACACTATA+AGG 0.245622 3:-9871274 MsG0380012034.01.T01:CDS
AAATGACTTGGTTCATCTTT+TGG 0.247667 3:-9871429 MsG0380012034.01.T01:CDS
CCTTGAAGCAAAGAGGTATT+TGG 0.276885 3:-9871141 MsG0380012034.01.T01:CDS
GACATCTCCTCAAGTTCTAT+TGG 0.294911 3:+9870906 None:intergenic
TGCAGACACATAGTAGAAAA+TGG 0.324698 3:-9871935 MsG0380012034.01.T01:CDS
CTTTAATCTTTGAAGCAATC+TGG 0.335353 3:+9871621 None:intergenic
CCCGAAGCGTCGATCCATTC+TGG 0.336106 3:+9871701 None:intergenic
TTCACAAGATACTGGAGATT+TGG 0.339730 3:+9869653 None:intergenic
TTTCCTAAACACCTCATTGA+TGG 0.344867 3:-9870292 MsG0380012034.01.T01:CDS
CCAAATACCTCTTTGCTTCA+AGG 0.346026 3:+9871141 None:intergenic
AAATTCAGCCTAAACAAATT+AGG 0.350019 3:+9869572 None:intergenic
AATCCATCAATGAGGTGTTT+AGG 0.350615 3:+9870289 None:intergenic
GTTTCAAGATTCGGATTTGA+TGG 0.352310 3:-9870513 MsG0380012034.01.T01:CDS
TTGGTTAATGTTTCAAGATT+CGG 0.352593 3:-9870522 MsG0380012034.01.T01:CDS
AGAATTTACCTAATTTGTTT+AGG 0.354011 3:-9869580 MsG0380012034.01.T01:CDS
GAAAGGTGAGTCAGAATCTA+AGG 0.356315 3:-9870788 MsG0380012034.01.T01:CDS
AGAGTTGATACAAAGAAGTT+TGG 0.362303 3:-9870541 MsG0380012034.01.T01:CDS
TTCTCAAGTCATTGTTGGAC+AGG 0.371490 3:+9870365 None:intergenic
TTGACACAGTTAAGGAAGTT+AGG 0.380275 3:-9869869 MsG0380012034.01.T01:CDS
TGTAGGTCGAGAACAGAAAA+AGG 0.384584 3:+9870990 None:intergenic
ACTTAGAAACATTGGATCTA+AGG 0.385768 3:-9870111 MsG0380012034.01.T01:CDS
ATTGTTTCTCAAGTCATTGT+TGG 0.386370 3:+9870360 None:intergenic
GCCAGAATGGATCGACGCTT+CGG 0.389857 3:-9871702 MsG0380012034.01.T01:CDS
AGATGAACCAAGTCATTTGT+TGG 0.391801 3:+9871434 None:intergenic
GATTAACAAAGCTGCCTGAT+TGG 0.393594 3:-9869679 MsG0380012034.01.T01:CDS
CCCACAACTTGAGTCACTTC+AGG 0.394055 3:+9871467 None:intergenic
GTCTTAGCTTCACAAGATAC+TGG 0.395524 3:+9869645 None:intergenic
CCTGAAGTGACTCAAGTTGT+GGG 0.396728 3:-9871467 MsG0380012034.01.T01:CDS
CAGCAAATCCAAGGAATTGA+AGG 0.397242 3:+9869349 None:intergenic
AAAAGTTCCCATGCTTTGTC+TGG 0.398793 3:+9870957 None:intergenic
AGTAAGTCTCTTCCGATTGA+TGG 0.404185 3:+9870641 None:intergenic
TGATCAAAGCAGGAAACGTT+TGG 0.408836 3:+9871663 None:intergenic
CCAGAATGGATCGACGCTTC+GGG 0.410186 3:-9871701 MsG0380012034.01.T01:CDS
GGGACTAAAGCTCCTAGAAT+TGG 0.410972 3:-9871515 MsG0380012034.01.T01:CDS
GTGAAAATGCAAGAGGGTAT+TGG 0.420145 3:-9869971 MsG0380012034.01.T01:CDS
AAGTTGAGAACTCTAAGATT+AGG 0.420404 3:+9869710 None:intergenic
GACTCAAGTTGTGGGGTTTG+AGG 0.420750 3:-9871459 MsG0380012034.01.T01:CDS
ATTTGTTTAGGCTGAATTTG+TGG 0.421386 3:-9869568 MsG0380012034.01.T01:CDS
TTTAAGTTTCATTCTGAAAG+TGG 0.428610 3:-9871554 MsG0380012034.01.T01:CDS
ATTCGAAGGTCACCAATTCT+AGG 0.430483 3:+9871503 None:intergenic
TGGTGCGTTCCACCTTTCTC+AGG 0.433474 3:+9869294 None:intergenic
ATGCTATCAACTAGTTCAAC+TGG 0.439270 3:+9869321 None:intergenic
TGAAAATGCAAGAGGGTATT+GGG 0.442901 3:-9869970 MsG0380012034.01.T01:CDS
ATGTAATCTTTCACCAGAAA+AGG 0.444021 3:+9869538 None:intergenic
TCCACCTCGTGCAAACCCTC+TGG 0.445826 3:+9871197 None:intergenic
TTCTTTGTATCAACTCTGTC+AGG 0.448098 3:+9870547 None:intergenic
TTCTAGGAGCTTTAGTCCCT+CGG 0.459833 3:+9871519 None:intergenic
CATTGATTTGAGTAGGAATA+CGG 0.462746 3:+9869196 None:intergenic
GAATTGTATTCCTGATAACT+TGG 0.465844 3:-9870215 MsG0380012034.01.T01:CDS
TGGAGATTTGGAATCCAATC+AGG 0.466054 3:+9869665 None:intergenic
AATCTGGTATTCTGTATACT+TGG 0.467985 3:+9871637 None:intergenic
TACTTTCAAAAGCTTGAACT+TGG 0.471491 3:+9870261 None:intergenic
TCAAAAGGTTGACACAGTTA+AGG 0.471919 3:-9869877 MsG0380012034.01.T01:CDS
CGATTGATGGTGTAGTCCTC+AGG 0.475247 3:+9870654 None:intergenic
GAAAATGGAACTTTACTGAC+AGG 0.476539 3:-9871920 MsG0380012034.01.T01:CDS
CACCTTTCTCCACTCAAACA+TGG 0.478065 3:+9870803 None:intergenic
CTGGCAATTGTGGCCATTGG+AGG 0.478620 3:-9870849 MsG0380012034.01.T01:CDS
CGAGAATGATATCCTTGACT+TGG 0.479774 3:-9869753 MsG0380012034.01.T01:CDS
GTTGGTTTCTGTGGTAGGCA+TGG 0.480649 3:-9871384 MsG0380012034.01.T01:CDS
ACCTTATCCGAGAGCTCAAA+AGG 0.484696 3:-9869892 MsG0380012034.01.T01:CDS
GACTCAGGTTCAAGTACCTT+AGG 0.485775 3:+9870179 None:intergenic
CCCTGAAGTGACTCAAGTTG+TGG 0.487543 3:-9871468 MsG0380012034.01.T01:CDS
AGTCAAAACATGGGTGAAGC+AGG 0.487618 3:-9871786 MsG0380012034.01.T01:CDS
AGCAGGAAACGTTTGGAGAA+AGG 0.489956 3:+9871670 None:intergenic
ACAAGGGCTGCTGACTATAG+AGG 0.491057 3:-9871827 MsG0380012034.01.T01:CDS
TTTGTTTAGGCTGAATTTGT+GGG 0.491730 3:-9869567 MsG0380012034.01.T01:CDS
TTCAAAGATTAAAGACATCA+AGG 0.492286 3:-9871612 MsG0380012034.01.T01:CDS
TGCTACTTGCATGTTTCTTG+TGG 0.493279 3:+9871028 None:intergenic
TTCTCAATCATACACTATAA+GGG 0.494373 3:-9871273 MsG0380012034.01.T01:CDS
AGATCCAACTCCTTCAGCTT+CGG 0.495221 3:+9869497 None:intergenic
CAGCATCCTTGAGGAAGGCT+TGG 0.495679 3:+9871852 None:intergenic
CCACAACTTGAGTCACTTCA+GGG 0.496859 3:+9871468 None:intergenic
GTGGTAGGCATGGGAGGACT+CGG 0.498798 3:-9871374 MsG0380012034.01.T01:CDS
ACGGTACTTCCGAGATCCAT+TGG 0.501151 3:-9870145 MsG0380012034.01.T01:CDS
TTGGTTTCTGTGGTAGGCAT+GGG 0.503552 3:-9871383 MsG0380012034.01.T01:CDS
AGAAAGGTGGAACGCACCAT+TGG 0.504616 3:-9869290 MsG0380012034.01.T01:CDS
TAAGTTGACTAGATTGCCAA+TGG 0.510016 3:+9870129 None:intergenic
CTTAGAGTTCTCAACTTGAA+AGG 0.510163 3:-9869704 MsG0380012034.01.T01:CDS
ATAGCATGCATGGTTTCAAA+TGG 0.511001 3:+9870691 None:intergenic
GCTATATTTGTCTTTGACAA+TGG 0.512569 3:-9870319 MsG0380012034.01.T01:CDS
AATTGTATTCCTGATAACTT+GGG 0.514202 3:-9870214 MsG0380012034.01.T01:CDS
GTTTCCGAAGCTGAAGGAGT+TGG 0.515017 3:-9869501 MsG0380012034.01.T01:CDS
TCTAGTCAACTTAGAAACAT+TGG 0.516666 3:-9870119 MsG0380012034.01.T01:CDS
CGCACGTTGGTTTCTGTGGT+AGG 0.519805 3:-9871389 MsG0380012034.01.T01:CDS
CCACTGGCAATTGTGGCCAT+TGG 0.520169 3:-9870852 MsG0380012034.01.T01:CDS
GTTTCTGTGGTAGGCATGGG+AGG 0.523518 3:-9871380 MsG0380012034.01.T01:CDS
TGTGTCAGCATCCTTGAGGA+AGG 0.523736 3:+9871847 None:intergenic
CCTGAGTCATACAAAAGTTA+CGG 0.524675 3:-9870164 MsG0380012034.01.T01:CDS
TGTTGACAAAAGACCTCCAA+TGG 0.529808 3:+9870836 None:intergenic
CCAACGAAAGAGTCAAAACA+TGG 0.530459 3:-9871796 MsG0380012034.01.T01:CDS
AACCATGTTTGAGTGGAGAA+AGG 0.531709 3:-9870805 MsG0380012034.01.T01:CDS
ATGCATGGTTTCAAATGGTA+AGG 0.532699 3:+9870696 None:intergenic
CTGAAGTGACTCAAGTTGTG+GGG 0.533602 3:-9871466 MsG0380012034.01.T01:CDS
TCTCAAGTCATTGTTGGACA+GGG 0.535220 3:+9870366 None:intergenic
AGAAGGGTTTGTTGTGAATG+AGG 0.535924 3:-9870604 MsG0380012034.01.T01:CDS
CTGAGGACTACACCATCAAT+CGG 0.537359 3:-9870653 MsG0380012034.01.T01:CDS
TGTCTGGTTTCAAAAGCTGT+AGG 0.538105 3:+9870973 None:intergenic
CTCGGCAATGGATGGCAGAA+GGG 0.539725 3:-9870620 MsG0380012034.01.T01:CDS
TGAAGCAAAGAGGTATTTGG+TGG 0.542390 3:-9871138 MsG0380012034.01.T01:CDS
TCCTCAAGGATGCTGACACA+AGG 0.543359 3:-9871844 MsG0380012034.01.T01:CDS
TAAACGCACGTTGGTTTCTG+TGG 0.544536 3:-9871393 MsG0380012034.01.T01:CDS
TGAGGATCCAACAAATGACT+TGG 0.544963 3:-9871441 MsG0380012034.01.T01:CDS
GTTTATTATAGAAAATATGA+AGG 0.545622 3:-9870025 MsG0380012034.01.T01:CDS
TTTCAAACATTGATTTGAGT+AGG 0.546028 3:+9869189 None:intergenic
GATAGCATTGATCCTGAGAA+AGG 0.549082 3:-9869306 MsG0380012034.01.T01:CDS
GCTGCTGACTATAGAGGAGG+AGG 0.549610 3:-9871821 MsG0380012034.01.T01:CDS
TAAACAAGCTCATAAAGCTA+AGG 0.551565 3:-9870057 MsG0380012034.01.T01:CDS
TCCAGAGGGTTTGCACGAGG+TGG 0.552898 3:-9871198 MsG0380012034.01.T01:CDS
ACTAGATTGCCAATGGATCT+CGG 0.553332 3:+9870136 None:intergenic
TTTCAAGATTCGGATTTGAT+GGG 0.554448 3:-9870512 MsG0380012034.01.T01:CDS
TGAAAGAGCGATAACGAAAG+TGG 0.556239 3:+9871303 None:intergenic
TTGAGAAACAATAGCAACTC+AGG 0.556723 3:-9870349 MsG0380012034.01.T01:CDS
ATACCAAAATATAGCATGCA+TGG 0.557277 3:+9870681 None:intergenic
TTCTGACGAATTTGGACAAG+GGG 0.563051 3:+9869252 None:intergenic
AGGACTACCACTGGCAATTG+TGG 0.563069 3:-9870859 MsG0380012034.01.T01:CDS
CTCTGTAACATTGTAGCAGA+AGG 0.563265 3:-9871962 MsG0380012034.01.T01:CDS
GAATGAGGAGACAAGACCAT+TGG 0.565048 3:-9870589 MsG0380012034.01.T01:CDS
GGAAGAGACTTACTCGGCAA+TGG 0.568628 3:-9870632 MsG0380012034.01.T01:CDS
AGGAGGGTTTCCGAAGCTGA+AGG 0.571279 3:-9869507 MsG0380012034.01.T01:CDS
GAGACTTACTCGGCAATGGA+TGG 0.574662 3:-9870628 MsG0380012034.01.T01:CDS
ACTCGGCAATGGATGGCAGA+AGG 0.574920 3:-9870621 MsG0380012034.01.T01:CDS
TATCTTGTGAAGCTAAGACT+TGG 0.575601 3:-9869641 MsG0380012034.01.T01:CDS
TGAGGAGACAAGACCATTGG+AGG 0.576602 3:-9870586 MsG0380012034.01.T01:CDS
CCTCAAGGATGCTGACACAA+GGG 0.582443 3:-9871843 MsG0380012034.01.T01:CDS
ATAGCAAGCATGCGCCAGAA+TGG 0.586695 3:-9871715 MsG0380012034.01.T01:CDS
GTCCAAATTCGTCAGAATGT+AGG 0.587571 3:-9869246 MsG0380012034.01.T01:CDS
AAGACCATTGGAGGAAGTTG+CGG 0.589270 3:-9870577 MsG0380012034.01.T01:CDS
ACAATGTCCAATAGAACTTG+AGG 0.592887 3:-9870913 MsG0380012034.01.T01:CDS
CATTCTGACGAATTTGGACA+AGG 0.594240 3:+9869250 None:intergenic
TCTTCCGCAACTTCCTCCAA+TGG 0.595780 3:+9870573 None:intergenic
TAGAATTGGTGACCTTCGAA+TGG 0.599081 3:-9871501 MsG0380012034.01.T01:CDS
TCAGGTTCAAGTACCTTAGG+AGG 0.599769 3:+9870182 None:intergenic
GGAAATAAGTAGCCATTCGA+AGG 0.603524 3:+9871489 None:intergenic
GGAAGGCTTGGATACTCTCA+AGG 0.603648 3:+9871864 None:intergenic
CTGGCATTTCAGCAAATCCA+AGG 0.605005 3:+9869340 None:intergenic
CCCTTGTGTCAGCATCCTTG+AGG 0.607206 3:+9871843 None:intergenic
AAAATGTGGAGGACTACCAC+TGG 0.607260 3:-9870868 MsG0380012034.01.T01:CDS
GGTGAGTCAGAATCTAAGGA+TGG 0.609312 3:-9870784 MsG0380012034.01.T01:CDS
AAGCTAAAACCATGTTTGAG+TGG 0.609576 3:-9870812 MsG0380012034.01.T01:CDS
GACGATACCTTGAAGCAAAG+AGG 0.613159 3:-9871148 MsG0380012034.01.T01:CDS
AAAATGGAACTTTACTGACA+GGG 0.614834 3:-9871919 MsG0380012034.01.T01:CDS
AAAGACATCAAGGAATCACT+TGG 0.618630 3:-9871602 MsG0380012034.01.T01:CDS
TTGAGAACTCTAAGATTAGG+TGG 0.619442 3:+9869713 None:intergenic
AAATTCTTCAAAGAGTCTAG+TGG 0.622785 3:+9869596 None:intergenic
GAATATGATTGATAATCCAA+TGG 0.623152 3:+9869274 None:intergenic
TGTAACATTGTAGCAGAAGG+AGG 0.623504 3:-9871959 MsG0380012034.01.T01:CDS
AGATGCATGCAACAACAACA+TGG 0.624715 3:-9869842 MsG0380012034.01.T01:CDS
TTGATACAACATCCAAGTCA+AGG 0.625691 3:+9869741 None:intergenic
AACAGGTGTGAAAATGCAAG+AGG 0.630847 3:-9869978 MsG0380012034.01.T01:CDS
TTTGAAACCAGACAAAGCAT+GGG 0.632196 3:-9870964 MsG0380012034.01.T01:CDS
AACGATGAACGTATTCCAGA+GGG 0.637762 3:-9871212 MsG0380012034.01.T01:CDS
AGCATTGATCCTGAGAAAGG+TGG 0.640387 3:-9869303 MsG0380012034.01.T01:CDS
AGAACTCTAAGATTAGGTGG+TGG 0.643563 3:+9869716 None:intergenic
GAGTATCCAAGCCTTCCTCA+AGG 0.647324 3:-9871858 MsG0380012034.01.T01:CDS
GCCTTAATTAGCAATAACAC+AGG 0.647960 3:-9871068 MsG0380012034.01.T01:CDS
TATTCCAGAGGGTTTGCACG+AGG 0.651671 3:-9871201 MsG0380012034.01.T01:CDS
ACAGGTGTGAAAATGCAAGA+GGG 0.672370 3:-9869977 MsG0380012034.01.T01:CDS
ATTCTGACGAATTTGGACAA+GGG 0.673529 3:+9869251 None:intergenic
AGGGCTGCTGACTATAGAGG+AGG 0.674185 3:-9871824 MsG0380012034.01.T01:CDS
AGTGGATCAGAAAGCTACCG+AGG 0.675526 3:-9871536 MsG0380012034.01.T01:CDS
TCAATCGGAAGAGACTTACT+CGG 0.678877 3:-9870638 MsG0380012034.01.T01:CDS
GTGGATCAGAAAGCTACCGA+GGG 0.685287 3:-9871535 MsG0380012034.01.T01:CDS
CAACGATGAACGTATTCCAG+AGG 0.689630 3:-9871213 MsG0380012034.01.T01:CDS
CCAATGGCCACAATTGCCAG+TGG 0.699002 3:+9870852 None:intergenic
TGGCAGATAATCCATCAATG+AGG 0.699989 3:+9870281 None:intergenic
TGGAGAGAATAAACGCACGT+TGG 0.701890 3:-9871402 MsG0380012034.01.T01:CDS
CAACGAAAGAGTCAAAACAT+GGG 0.709617 3:-9871795 MsG0380012034.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! GTTTATTATAGAAAATATGA+AGG - Chr3:9871164-9871183 MsG0380012034.01.T01:CDS 15.0%
!!! TCATATTTTCTATAATAAAC+AGG + Chr3:9871164-9871183 None:intergenic 15.0%
!!! TTAAATCTTTCATTTTTCTA+AGG + Chr3:9870746-9870765 None:intergenic 15.0%
!! AATGAAATTGTTCAAAAATG+TGG - Chr3:9870307-9870326 MsG0380012034.01.T01:CDS 20.0%
!!! ACATTTTTGAACAATTTCAT+TGG + Chr3:9870308-9870327 None:intergenic 20.0%
!!! AGAATTTACCTAATTTGTTT+AGG - Chr3:9871609-9871628 MsG0380012034.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTACAAAAGCTTTACTTTT+TGG - Chr3:9871253-9871272 MsG0380012034.01.T01:CDS 20.0%
! AAATTCAGCCTAAACAAATT+AGG + Chr3:9871620-9871639 None:intergenic 25.0%
! AATTGTATTCCTGATAACTT+GGG - Chr3:9870975-9870994 MsG0380012034.01.T01:CDS 25.0%
! TTAAAAAAATCCTCAGTTGA+AGG - Chr3:9871786-9871805 MsG0380012034.01.T01:CDS 25.0%
! TTCAAAGATTAAAGACATCA+AGG - Chr3:9869577-9869596 MsG0380012034.01.T01:CDS 25.0%
! TTCTCAATCATACACTATAA+GGG - Chr3:9869916-9869935 MsG0380012034.01.T01:CDS 25.0%
! TTGGTTAATGTTTCAAGATT+CGG - Chr3:9870667-9870686 MsG0380012034.01.T01:CDS 25.0%
! TTTCTCAATCATACACTATA+AGG - Chr3:9869915-9869934 MsG0380012034.01.T01:CDS 25.0%
!! AATGATAAAGAAGTTTTGCA+AGG - Chr3:9869952-9869971 MsG0380012034.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTGAAGGTTTTTCATGTTT+TGG + Chr3:9871828-9871847 None:intergenic 25.0%
!! GAATATGATTGATAATCCAA+TGG + Chr3:9871918-9871937 None:intergenic 25.0%
!! TTTAAGTTTCATTCTGAAAG+TGG - Chr3:9869635-9869654 MsG0380012034.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATATTTTGGTATATATCCTG+AGG - Chr3:9870519-9870538 MsG0380012034.01.T01:CDS 25.0%
!!! TCTATTTTGAACTTTACAAC+AGG - Chr3:9871194-9871213 MsG0380012034.01.T01:CDS 25.0%
AAAATGGAACTTTACTGACA+GGG - Chr3:9869270-9869289 MsG0380012034.01.T01:CDS 30.0%
AAATTCTTCAAAGAGTCTAG+TGG + Chr3:9871596-9871615 None:intergenic 30.0%
AATCTGGTATTCTGTATACT+TGG + Chr3:9869555-9869574 None:intergenic 30.0%
ACTTAGAAACATTGGATCTA+AGG - Chr3:9871078-9871097 MsG0380012034.01.T01:CDS 30.0%
ATACCAAAATATAGCATGCA+TGG + Chr3:9870511-9870530 None:intergenic 30.0%
ATGAAAAACCTTCAATTCCT+TGG - Chr3:9871832-9871851 MsG0380012034.01.T01:CDS 30.0%
ATGTAATCTTTCACCAGAAA+AGG + Chr3:9871654-9871673 None:intergenic 30.0%
ATTTGTTTAGGCTGAATTTG+TGG - Chr3:9871621-9871640 MsG0380012034.01.T01:CDS 30.0%
GAAATTGTTCAAAAATGTGG+AGG - Chr3:9870310-9870329 MsG0380012034.01.T01:CDS 30.0%
GAATTGTATTCCTGATAACT+TGG - Chr3:9870974-9870993 MsG0380012034.01.T01:CDS 30.0%
GCTATATTTGTCTTTGACAA+TGG - Chr3:9870870-9870889 MsG0380012034.01.T01:CDS 30.0%
TAAACAAGCTCATAAAGCTA+AGG - Chr3:9871132-9871151 MsG0380012034.01.T01:CDS 30.0%
TACTTTCAAAAGCTTGAACT+TGG + Chr3:9870931-9870950 None:intergenic 30.0%
TCTAGTCAACTTAGAAACAT+TGG - Chr3:9871070-9871089 MsG0380012034.01.T01:CDS 30.0%
TTTCAAGATTCGGATTTGAT+GGG - Chr3:9870677-9870696 MsG0380012034.01.T01:CDS 30.0%
TTTGTTTAGGCTGAATTTGT+GGG - Chr3:9871622-9871641 MsG0380012034.01.T01:CDS 30.0%
! AAAAGTTTTCCCAAGTTATC+AGG + Chr3:9870987-9871006 None:intergenic 30.0%
! AAACCATGCATGCTATATTT+TGG - Chr3:9870505-9870524 MsG0380012034.01.T01:CDS 30.0%
! ATTGTTTCTCAAGTCATTGT+TGG + Chr3:9870832-9870851 None:intergenic 30.0%
! GAAAGATTACATTTTCAGAG+AGG - Chr3:9871662-9871681 MsG0380012034.01.T01:CDS 30.0%
! TCCTGTGTTATTGCTAATTA+AGG + Chr3:9870125-9870144 None:intergenic 30.0%
!! AAGTTGAGAACTCTAAGATT+AGG + Chr3:9871482-9871501 None:intergenic 30.0%
!! AGAGTTGATACAAAGAAGTT+TGG - Chr3:9870648-9870667 MsG0380012034.01.T01:CDS 30.0%
!! ATGAGCTTGTTTATCTCTTT+TGG + Chr3:9871125-9871144 None:intergenic 30.0%
!! CATTGATTTGAGTAGGAATA+CGG + Chr3:9871996-9872015 None:intergenic 30.0%
!! CTTTAATCTTTGAAGCAATC+TGG + Chr3:9869571-9869590 None:intergenic 30.0%
!!! AAATGACTTGGTTCATCTTT+TGG - Chr3:9869760-9869779 MsG0380012034.01.T01:CDS 30.0%
AAAGACATCAAGGAATCACT+TGG - Chr3:9869587-9869606 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
AAGCTAAAACCATGTTTGAG+TGG - Chr3:9870377-9870396 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
ACAATGTCCAATAGAACTTG+AGG - Chr3:9870276-9870295 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
AGATGAACCAAGTCATTTGT+TGG + Chr3:9869758-9869777 None:intergenic 35.0%
ATAGCATGCATGGTTTCAAA+TGG + Chr3:9870501-9870520 None:intergenic 35.0%
ATCCTACATTCTGACGAATT+TGG + Chr3:9871948-9871967 None:intergenic 35.0%
ATGCATGGTTTCAAATGGTA+AGG + Chr3:9870496-9870515 None:intergenic 35.0%
ATGCTATCAACTAGTTCAAC+TGG + Chr3:9871871-9871890 None:intergenic 35.0%
ATTCTGACGAATTTGGACAA+GGG + Chr3:9871941-9871960 None:intergenic 35.0%
CAACGAAAGAGTCAAAACAT+GGG - Chr3:9869394-9869413 MsG0380012034.01.T01:intron 35.0%
CCTGAGTCATACAAAAGTTA+CGG - Chr3:9871025-9871044 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
CTTAGAGTTCTCAACTTGAA+AGG - Chr3:9871485-9871504 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
GAAAATGGAACTTTACTGAC+AGG - Chr3:9869269-9869288 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
GCCTTAATTAGCAATAACAC+AGG - Chr3:9870121-9870140 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
GTTTCAAGATTCGGATTTGA+TGG - Chr3:9870676-9870695 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
TAGTTGATCTTGAACACTTC+AGG - Chr3:9871762-9871781 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
TATCTTGTGAAGCTAAGACT+TGG - Chr3:9871548-9871567 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
TCAAAAGGTTGACACAGTTA+AGG - Chr3:9871312-9871331 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
TGCAGACACATAGTAGAAAA+TGG - Chr3:9869254-9869273 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
TTCACAAGATACTGGAGATT+TGG + Chr3:9871539-9871558 None:intergenic 35.0%
TTCTTTGTATCAACTCTGTC+AGG + Chr3:9870645-9870664 None:intergenic 35.0%
TTGACACAGTTAAGGAAGTT+AGG - Chr3:9871320-9871339 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
TTGAGAAACAATAGCAACTC+AGG - Chr3:9870840-9870859 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
TTGATACAACATCCAAGTCA+AGG + Chr3:9871451-9871470 None:intergenic 35.0%
TTTCCTAAACACCTCATTGA+TGG - Chr3:9870897-9870916 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
! AATCCATCAATGAGGTGTTT+AGG + Chr3:9870903-9870922 None:intergenic 35.0%
! AGATTACATTTTCAGAGAGG+AGG - Chr3:9871665-9871684 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
! GATTACATTTTCAGAGAGGA+GGG - Chr3:9871666-9871685 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
! GCATGTTTTTCATAACGAGT+TGG - Chr3:9869856-9869875 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
! TAAGTTGACTAGATTGCCAA+TGG + Chr3:9871063-9871082 None:intergenic 35.0%
! TTTGAAACCAGACAAAGCAT+GGG - Chr3:9870225-9870244 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
!! GAAGGTTTTTCATGTTTTGG+AGG + Chr3:9871825-9871844 None:intergenic 35.0%
!! TACTTTTTGGAAGCAGATCA+TGG - Chr3:9871266-9871285 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
!! TGAAAATGCAAGAGGGTATT+GGG - Chr3:9871219-9871238 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
!! TTGAGAACTCTAAGATTAGG+TGG + Chr3:9871479-9871498 None:intergenic 35.0%
!!! ATGGGAACTTTTTTGCAACA+AGG - Chr3:9870243-9870262 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
!!! TACTTGGTTTTGATCAAAGC+AGG + Chr3:9869539-9869558 None:intergenic 35.0%
!!! TGGTGGTTTTTGATGATGTT+TGG - Chr3:9870068-9870087 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTTGAAACCAGACAAAGCA+TGG - Chr3:9870224-9870243 MsG0380012034.01.T01:CDS 35.0%
AAAAGTTCCCATGCTTTGTC+TGG + Chr3:9870235-9870254 None:intergenic 40.0%
AACAGGTGTGAAAATGCAAG+AGG - Chr3:9871211-9871230 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
AACCATGTTTGAGTGGAGAA+AGG - Chr3:9870384-9870403 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
AACGATGAACGTATTCCAGA+GGG - Chr3:9869977-9869996 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
ACAGGTGTGAAAATGCAAGA+GGG - Chr3:9871212-9871231 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
ACTAGATTGCCAATGGATCT+CGG + Chr3:9871056-9871075 None:intergenic 40.0%
AGATGCATGCAACAACAACA+TGG - Chr3:9871347-9871366 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
AGTAAGTCTCTTCCGATTGA+TGG + Chr3:9870551-9870570 None:intergenic 40.0%
ATTCGAAGGTCACCAATTCT+AGG + Chr3:9869689-9869708 None:intergenic 40.0%
CAGCAAATCCAAGGAATTGA+AGG + Chr3:9871843-9871862 None:intergenic 40.0%
CATTCTGACGAATTTGGACA+AGG + Chr3:9871942-9871961 None:intergenic 40.0%
CCAAATACCTCTTTGCTTCA+AGG + Chr3:9870051-9870070 None:intergenic 40.0%
CCAACGAAAGAGTCAAAACA+TGG - Chr3:9869393-9869412 MsG0380012034.01.T01:intron 40.0%
CGAGAATGATATCCTTGACT+TGG - Chr3:9871436-9871455 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
CTCTGTAACATTGTAGCAGA+AGG - Chr3:9869227-9869246 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
GAAAGGTGAGTCAGAATCTA+AGG - Chr3:9870401-9870420 MsG0380012034.01.T01:intron 40.0%
GACATCTCCTCAAGTTCTAT+TGG + Chr3:9870286-9870305 None:intergenic 40.0%
GATTAACAAAGCTGCCTGAT+TGG - Chr3:9871510-9871529 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
GGAAATAAGTAGCCATTCGA+AGG + Chr3:9869703-9869722 None:intergenic 40.0%
GTCCAAATTCGTCAGAATGT+AGG - Chr3:9871943-9871962 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
GTCTTAGCTTCACAAGATAC+TGG + Chr3:9871547-9871566 None:intergenic 40.0%
TCAATCGGAAGAGACTTACT+CGG - Chr3:9870551-9870570 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
TCTCAAGTCATTGTTGGACA+GGG + Chr3:9870826-9870845 None:intergenic 40.0%
TGAAAGAGCGATAACGAAAG+TGG + Chr3:9869889-9869908 None:intergenic 40.0%
TGAGGATCCAACAAATGACT+TGG - Chr3:9869748-9869767 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
TGATCAAAGCAGGAAACGTT+TGG + Chr3:9869529-9869548 None:intergenic 40.0%
TGGCAGATAATCCATCAATG+AGG + Chr3:9870911-9870930 None:intergenic 40.0%
TGTAACATTGTAGCAGAAGG+AGG - Chr3:9869230-9869249 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
TGTAGGTCGAGAACAGAAAA+AGG + Chr3:9870202-9870221 None:intergenic 40.0%
TGTTGACAAAAGACCTCCAA+TGG + Chr3:9870356-9870375 None:intergenic 40.0%
TTCTCAAGTCATTGTTGGAC+AGG + Chr3:9870827-9870846 None:intergenic 40.0%
TTCTGACGAATTTGGACAAG+GGG + Chr3:9871940-9871959 None:intergenic 40.0%
! CCGTAACTTTTGTATGACTC+AGG + Chr3:9871028-9871047 None:intergenic 40.0%
! GTGAAAATGCAAGAGGGTAT+TGG - Chr3:9871218-9871237 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
! TAGAATTGGTGACCTTCGAA+TGG - Chr3:9869688-9869707 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
! TGCTACTTGCATGTTTCTTG+TGG + Chr3:9870164-9870183 None:intergenic 40.0%
! TGGAGATTTGGAATCCAATC+AGG + Chr3:9871527-9871546 None:intergenic 40.0%
! TGGGAAAACTTTTCCTCCTA+AGG - Chr3:9870994-9871013 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
! TGTCTGGTTTCAAAAGCTGT+AGG + Chr3:9870219-9870238 None:intergenic 40.0%
!! AGAACTCTAAGATTAGGTGG+TGG + Chr3:9871476-9871495 None:intergenic 40.0%
!! AGAAGGGTTTGTTGTGAATG+AGG - Chr3:9870585-9870604 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
!! CCTTGAAGCAAAGAGGTATT+TGG - Chr3:9870048-9870067 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
!! GACTTGGTTCATCTTTTGGT+GGG - Chr3:9869764-9869783 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
!! GATAGCATTGATCCTGAGAA+AGG - Chr3:9871883-9871902 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
!! TGAAGCAAAGAGGTATTTGG+TGG - Chr3:9870051-9870070 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTTGCAACAAGGCGTTTAG+AGG - Chr3:9870253-9870272 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTTTGGAAGCAGATCATGG+TGG - Chr3:9871269-9871288 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
!!! CCATGTTTTGACTCTTTCGT+TGG + Chr3:9869396-9869415 None:intergenic 40.0%
!!! TGACTTGGTTCATCTTTTGG+TGG - Chr3:9869763-9869782 MsG0380012034.01.T01:CDS 40.0%
!!! TTCATGTTTTGGAGGTCTTC+TGG + Chr3:9871817-9871836 None:intergenic 40.0%
AAAATGTGGAGGACTACCAC+TGG - Chr3:9870321-9870340 MsG0380012034.01.T01:CDS 45.0%
AAGACCATTGGAGGAAGTTG+CGG - Chr3:9870612-9870631 MsG0380012034.01.T01:CDS 45.0%
ACCTTATCCGAGAGCTCAAA+AGG - Chr3:9871297-9871316 MsG0380012034.01.T01:CDS 45.0%
AGATCCAACTCCTTCAGCTT+CGG + Chr3:9871695-9871714 None:intergenic 45.0%
AGCAGGAAACGTTTGGAGAA+AGG + Chr3:9869522-9869541 None:intergenic 45.0%
AGTCAAAACATGGGTGAAGC+AGG - Chr3:9869403-9869422 MsG0380012034.01.T01:intron 45.0%
CAACGATGAACGTATTCCAG+AGG - Chr3:9869976-9869995 MsG0380012034.01.T01:CDS 45.0%
CACCTTTCTCCACTCAAACA+TGG + Chr3:9870389-9870408 None:intergenic 45.0%
CCACAACTTGAGTCACTTCA+GGG + Chr3:9869724-9869743 None:intergenic 45.0%
CTGAGGACTACACCATCAAT+CGG - Chr3:9870536-9870555 MsG0380012034.01.T01:CDS 45.0%
CTGGCATTTCAGCAAATCCA+AGG + Chr3:9871852-9871871 None:intergenic 45.0%
GAATGAGGAGACAAGACCAT+TGG - Chr3:9870600-9870619 MsG0380012034.01.T01:CDS 45.0%
GACGATACCTTGAAGCAAAG+AGG - Chr3:9870041-9870060 MsG0380012034.01.T01:CDS 45.0%
GACTCAGGTTCAAGTACCTT+AGG + Chr3:9871013-9871032 None:intergenic 45.0%
GGGACTAAAGCTCCTAGAAT+TGG - Chr3:9869674-9869693 MsG0380012034.01.T01:CDS 45.0%
GGTGAGTCAGAATCTAAGGA+TGG - Chr3:9870405-9870424 MsG0380012034.01.T01:intron 45.0%
TCAGGTTCAAGTACCTTAGG+AGG + Chr3:9871010-9871029 None:intergenic 45.0%
TCTGGTACAACCTTCAACTG+AGG + Chr3:9871799-9871818 None:intergenic 45.0%
TGGAGAGAATAAACGCACGT+TGG - Chr3:9869787-9869806 MsG0380012034.01.T01:CDS 45.0%
TTGGTTTCTGTGGTAGGCAT+GGG - Chr3:9869806-9869825 MsG0380012034.01.T01:CDS 45.0%
! ACCTTTTGAGCTCTCGGATA+AGG + Chr3:9871301-9871320 None:intergenic 45.0%
! CCTGAAGTGACTCAAGTTGT+GGG - Chr3:9869722-9869741 MsG0380012034.01.T01:CDS 45.0%
! CTGAAGTGACTCAAGTTGTG+GGG - Chr3:9869723-9869742 MsG0380012034.01.T01:CDS 45.0%
! GTGTCAACCTTTTGAGCTCT+CGG + Chr3:9871307-9871326 None:intergenic 45.0%
! TTCTAGGAGCTTTAGTCCCT+CGG + Chr3:9869673-9869692 None:intergenic 45.0%
! TTGGTTCATCTTTTGGTGGG+TGG - Chr3:9869767-9869786 MsG0380012034.01.T01:CDS 45.0%
! TTGTGGGATGATGCCTTTTC+TGG - Chr3:9871638-9871657 MsG0380012034.01.T01:CDS 45.0%
!! AGCATTGATCCTGAGAAAGG+TGG - Chr3:9871886-9871905 MsG0380012034.01.T01:CDS 45.0%
!! TAAACGCACGTTGGTTTCTG+TGG - Chr3:9869796-9869815 MsG0380012034.01.T01:CDS 45.0%
ACGGTACTTCCGAGATCCAT+TGG - Chr3:9871044-9871063 MsG0380012034.01.T01:CDS 50.0%
AGAAAGGTGGAACGCACCAT+TGG - Chr3:9871899-9871918 MsG0380012034.01.T01:CDS 50.0%
AGGACTACCACTGGCAATTG+TGG - Chr3:9870330-9870349 MsG0380012034.01.T01:CDS 50.0%
AGTGGATCAGAAAGCTACCG+AGG - Chr3:9869653-9869672 MsG0380012034.01.T01:CDS 50.0%
ATAGCAAGCATGCGCCAGAA+TGG - Chr3:9869474-9869493 MsG0380012034.01.T01:intron 50.0%
CCCACAACTTGAGTCACTTC+AGG + Chr3:9869725-9869744 None:intergenic 50.0%
CCTCAAGGATGCTGACACAA+GGG - Chr3:9869346-9869365 MsG0380012034.01.T01:CDS 50.0%
GAGACTTACTCGGCAATGGA+TGG - Chr3:9870561-9870580 MsG0380012034.01.T01:CDS 50.0%
GAGTATCCAAGCCTTCCTCA+AGG - Chr3:9869331-9869350 MsG0380012034.01.T01:CDS 50.0%
GGAAGAGACTTACTCGGCAA+TGG - Chr3:9870557-9870576 MsG0380012034.01.T01:CDS 50.0%
GGAAGGCTTGGATACTCTCA+AGG + Chr3:9869328-9869347 None:intergenic 50.0%
GTGGATCAGAAAGCTACCGA+GGG - Chr3:9869654-9869673 MsG0380012034.01.T01:CDS 50.0%
GTTTCCGAAGCTGAAGGAGT+TGG - Chr3:9871688-9871707 MsG0380012034.01.T01:CDS 50.0%
TATTCCAGAGGGTTTGCACG+AGG - Chr3:9869988-9870007 MsG0380012034.01.T01:CDS 50.0%
TCCTCAAGGATGCTGACACA+AGG - Chr3:9869345-9869364 MsG0380012034.01.T01:CDS 50.0%
TCTTCCGCAACTTCCTCCAA+TGG + Chr3:9870619-9870638 None:intergenic 50.0%
TGAGGAGACAAGACCATTGG+AGG - Chr3:9870603-9870622 MsG0380012034.01.T01:CDS 50.0%
TGTGTCAGCATCCTTGAGGA+AGG + Chr3:9869345-9869364 None:intergenic 50.0%
! ACAAGGGCTGCTGACTATAG+AGG - Chr3:9869362-9869381 MsG0380012034.01.T01:CDS 50.0%
! CCCTGAAGTGACTCAAGTTG+TGG - Chr3:9869721-9869740 MsG0380012034.01.T01:CDS 50.0%
! GACTCAAGTTGTGGGGTTTG+AGG - Chr3:9869730-9869749 MsG0380012034.01.T01:CDS 50.0%
! GTTGGTTTCTGTGGTAGGCA+TGG - Chr3:9869805-9869824 MsG0380012034.01.T01:CDS 50.0%
!! CGATTGATGGTGTAGTCCTC+AGG + Chr3:9870538-9870557 None:intergenic 50.0%
ACTCGGCAATGGATGGCAGA+AGG - Chr3:9870568-9870587 MsG0380012034.01.T01:CDS 55.0%
AGGAGGGTTTCCGAAGCTGA+AGG - Chr3:9871682-9871701 MsG0380012034.01.T01:CDS 55.0%
CAGCATCCTTGAGGAAGGCT+TGG + Chr3:9869340-9869359 None:intergenic 55.0%
CCAATGGCCACAATTGCCAG+TGG + Chr3:9870340-9870359 None:intergenic 55.0%
CCACTGGCAATTGTGGCCAT+TGG - Chr3:9870337-9870356 MsG0380012034.01.T01:CDS 55.0%
CCAGAATGGATCGACGCTTC+GGG - Chr3:9869488-9869507 MsG0380012034.01.T01:CDS 55.0%
CCCTTGTGTCAGCATCCTTG+AGG + Chr3:9869349-9869368 None:intergenic 55.0%
CTCGGCAATGGATGGCAGAA+GGG - Chr3:9870569-9870588 MsG0380012034.01.T01:CDS 55.0%
CTGGCAATTGTGGCCATTGG+AGG - Chr3:9870340-9870359 MsG0380012034.01.T01:CDS 55.0%
GCCAGAATGGATCGACGCTT+CGG - Chr3:9869487-9869506 MsG0380012034.01.T01:CDS 55.0%
GTTTCTGTGGTAGGCATGGG+AGG - Chr3:9869809-9869828 MsG0380012034.01.T01:CDS 55.0%
TGGTGCGTTCCACCTTTCTC+AGG + Chr3:9871898-9871917 None:intergenic 55.0%
! AGGGCTGCTGACTATAGAGG+AGG - Chr3:9869365-9869384 MsG0380012034.01.T01:CDS 55.0%
! GCTGCTGACTATAGAGGAGG+AGG - Chr3:9869368-9869387 MsG0380012034.01.T01:CDS 55.0%
!! CGCACGTTGGTTTCTGTGGT+AGG - Chr3:9869800-9869819 MsG0380012034.01.T01:CDS 55.0%
GTGGTAGGCATGGGAGGACT+CGG - Chr3:9869815-9869834 MsG0380012034.01.T01:CDS 60.0%
TCCACCTCGTGCAAACCCTC+TGG + Chr3:9869995-9870014 None:intergenic 60.0%
TCCAGAGGGTTTGCACGAGG+TGG - Chr3:9869991-9870010 MsG0380012034.01.T01:CDS 60.0%
!! CCCGAAGCGTCGATCCATTC+TGG + Chr3:9869491-9869510 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 9869191 9872020 9869191 ID=MsG0380012034.01;Name=MsG0380012034.01
Chr3 mRNA 9869191 9872020 9869191 ID=MsG0380012034.01.T01;Parent=MsG0380012034.01;Name=MsG0380012034.01.T01;_AED=0.45;_eAED=0.45;_QI=0|0|0|1|0.5|0.33|3|0|892
Chr3 exon 9870474 9872020 9870474 ID=MsG0380012034.01.T01:exon:1757;Parent=MsG0380012034.01.T01
Chr3 exon 9869477 9870405 9869477 ID=MsG0380012034.01.T01:exon:1756;Parent=MsG0380012034.01.T01
Chr3 exon 9869191 9869393 9869191 ID=MsG0380012034.01.T01:exon:1755;Parent=MsG0380012034.01.T01
Chr3 CDS 9870474 9872020 9870474 ID=MsG0380012034.01.T01:cds;Parent=MsG0380012034.01.T01
Chr3 CDS 9869477 9870405 9869477 ID=MsG0380012034.01.T01:cds;Parent=MsG0380012034.01.T01
Chr3 CDS 9869191 9869393 9869191 ID=MsG0380012034.01.T01:cds;Parent=MsG0380012034.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380012034.01.T01

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Protein sequence

>MsG0380012034.01.T01

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