AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene029948

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Find 58 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TATCTTGCAATTCTCTAACA+AGG 0.634296 6.2:-67999854 MS.gene029948:CDS
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TAGCATAGAACACATACTGA+TGG 0.643945 6.2:-68001284 MS.gene029948:CDS
ATTGGTGATCAAATTCGCAA+CGG 0.665624 6.2:-67999697 MS.gene029948:CDS
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ATGTTCAATTCAATACCGTG+TGG 0.772489 6.2:-68002858 MS.gene029948:CDS
GTAGGAATTGTTGAACAGTG+GGG 0.794915 6.2:-68004837 MS.gene029948:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content


Chromosome Type Strat End Strand Name
chr6.2 gene 67999654 68009269 67999654 ID=MS.gene029948
chr6.2 mRNA 67999654 68009269 67999654 ID=MS.gene029948.t1;Parent=MS.gene029948
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chr6.2 exon 68004713 68004860 68004713 ID=MS.gene029948.t1.exon2;Parent=MS.gene029948.t1
chr6.2 CDS 68004713 68004860 68004713 ID=cds.MS.gene029948.t1;Parent=MS.gene029948.t1
chr6.2 exon 68002783 68002903 68002783 ID=MS.gene029948.t1.exon3;Parent=MS.gene029948.t1
chr6.2 CDS 68002783 68002903 68002783 ID=cds.MS.gene029948.t1;Parent=MS.gene029948.t1
chr6.2 exon 68002489 68002580 68002489 ID=MS.gene029948.t1.exon4;Parent=MS.gene029948.t1
chr6.2 CDS 68002489 68002580 68002489 ID=cds.MS.gene029948.t1;Parent=MS.gene029948.t1
chr6.2 exon 68001230 68001326 68001230 ID=MS.gene029948.t1.exon5;Parent=MS.gene029948.t1
chr6.2 CDS 68001230 68001326 68001230 ID=cds.MS.gene029948.t1;Parent=MS.gene029948.t1
chr6.2 exon 67999654 68000027 67999654 ID=MS.gene029948.t1.exon6;Parent=MS.gene029948.t1
chr6.2 CDS 67999654 68000027 67999654 ID=cds.MS.gene029948.t1;Parent=MS.gene029948.t1
Gene Sequence

>MS.gene029948

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