AlfalfaGEDB | MsG0380012860.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380012860.01

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MsG0380012860.01.T01	AT5G46100	18.919	333	257	3	135	461	53	378	1.48e-12	70.1
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MsG0380012860.01.T01	AT5G15340	20.173	347	251	8	139	477	117	445	2.26e-12	69.7
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MsG0380012860.01.T01	AT5G40405	19.944	356	253	10	130	480	105	433	1.81e-11	67.0
MsG0380012860.01.T01	AT1G56570	22.277	202	146	4	202	399	311	505	1.87e-11	67.0
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MsG0380012860.01.T01	AT1G56570	20.391	358	231	12	139	459	152	492	5.06e-11	65.5
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MsG0380012860.01.T01	AT2G44880	20.308	325	239	7	135	459	187	491	2.94e-11	66.2
MsG0380012860.01.T01	AT2G44880	20.308	325	239	7	135	459	146	450	3.12e-11	66.2
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MsG0380012860.01.T01	AT5G37570	22.936	327	221	11	171	489	179	482	4.77e-11	65.5
MsG0380012860.01.T01	AT1G02150	20.714	280	203	3	203	464	168	446	5.55e-11	65.1
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MsG0380012860.01.T01	AT5G09950	25.095	263	171	7	159	411	610	856	6.06e-11	65.5
MsG0380012860.01.T01	AT2G37310	19.527	338	255	4	144	481	178	498	6.20e-11	65.5
MsG0380012860.01.T01	AT5G09950	25.095	263	171	7	159	411	604	850	6.95e-11	65.5
MsG0380012860.01.T01	AT3G61360	25.764	229	165	3	168	394	176	401	7.01e-11	64.7
MsG0380012860.01.T01	AT3G47530	21.184	321	220	8	137	445	152	451	9.53e-11	64.7

Find 103 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 253 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region
AATACAGTCATTGAAGTTTA+TGG	0.143566	3:-25736951	MsG0380012860.01.T01:CDS
GAGCAATACGTTACAGAATT+AGG	0.221344	3:+25736864	None:intergenic
AAGAAGAATTGAAGTGGTTT+TGG	0.258660	3:+25739590	None:intergenic
GAATTTGGTCGAACAGGTTA+TGG	0.285613	3:+25739618	None:intergenic
ACCGCTCTTGTAAGTGCTTA+TGG	0.287309	3:-25737482	MsG0380012860.01.T01:CDS
AACTTCTTCGAAATCAATAT+TGG	0.289193	3:-25737634	MsG0380012860.01.T01:CDS
TAGAGTTGACTAGCCTCTTT+AGG	0.306246	3:+25737551	None:intergenic
AGAAAATTCTGATGTCGTTT+TGG	0.311255	3:-25736778	MsG0380012860.01.T01:CDS
ATGCGTGATAAGTCCTTCTT+AGG	0.331942	3:+25739505	None:intergenic
GTATGATGAATTTCAGCTAA+TGG	0.340083	3:-25737105	MsG0380012860.01.T01:CDS
AAAGATGGGTGAGTTATTCT+TGG	0.342641	3:-25736700	MsG0380012860.01.T01:CDS
AATTCCATCATCGACGGATA+TGG	0.342761	3:-25737269	MsG0380012860.01.T01:CDS
GCTGTGGCCTAAGGCTGTTC+TGG	0.344519	3:-25739419	MsG0380012860.01.T01:CDS
TAAGGCTGTTCTGGAAGCTT+TGG	0.355435	3:-25739410	MsG0380012860.01.T01:CDS
GTATTATATGTTACAATTGT+TGG	0.357391	3:+25736969	None:intergenic
CTCCGTGTACAACAATTTCA+TGG	0.357937	3:-25739666	MsG0380012860.01.T01:CDS
AATTCTTTGCTAGGATCATA+TGG	0.359694	3:-25737161	MsG0380012860.01.T01:CDS
TCTTGCGGATATGTCATATT+CGG	0.364036	3:-25737318	MsG0380012860.01.T01:CDS
CAAGTGAAGGTGGTGCTATC+AGG	0.374069	3:+25736654	None:intergenic
CTTGCGGATATGTCATATTC+GGG	0.381922	3:-25737317	MsG0380012860.01.T01:CDS
CAACGTACCTGAGCTATCTT+TGG	0.392599	3:+25736560	None:intergenic
AATTTGGTCGAACAGGTTAT+GGG	0.396125	3:+25739619	None:intergenic
GTCAATGCATATAGCAAAGC+TGG	0.399880	3:-25736837	MsG0380012860.01.T01:CDS
AGCAGCCTCAGTCATGCCTT+GGG	0.402307	3:+25736611	None:intergenic
AATTGCATAATTAGTGCCTA+TGG	0.403754	3:-25736741	MsG0380012860.01.T01:CDS
TAGCAGCCTCAGTCATGCCT+TGG	0.407086	3:+25736610	None:intergenic
TTAACAGATACTAAGCTGAT+TGG	0.407240	3:-25736161	MsG0380012860.01.T01:intron
GTTTGGGAATTTGGTCGAAC+AGG	0.408055	3:+25739612	None:intergenic
TATGAAACCATGTTGTTTGA+AGG	0.409299	3:-25737530	MsG0380012860.01.T01:CDS
CACCTTCACTTGCATGATCC+AGG	0.410697	3:-25736643	MsG0380012860.01.T01:CDS
GGCTGGCAACTTAGAAAAGA+TGG	0.410721	3:-25736715	MsG0380012860.01.T01:CDS
CTGTTTATGCTTCCATGACT+TGG	0.415987	3:+25739441	None:intergenic
TATGATGAATTTCAGCTAAT+GGG	0.422387	3:-25737104	MsG0380012860.01.T01:CDS
ACATTGAACGTCTTTATGTC+TGG	0.422604	3:+25737074	None:intergenic
TTTGTATAAGTCTGGCATCT+TGG	0.422917	3:+25737605	None:intergenic
TTCTGAAGCCCTTCGTATGA+AGG	0.424156	3:+25739532	None:intergenic
ACTAATTATGCAATTAAAGA+AGG	0.436386	3:+25736749	None:intergenic
GAAGAGTGTGATGGATTTCA+TGG	0.444495	3:-25737009	MsG0380012860.01.T01:CDS
TTGCTAGGATCATATGGAAA+TGG	0.445402	3:-25737155	MsG0380012860.01.T01:CDS
ACAGAATATGTATATACATC+TGG	0.453067	3:+25737392	None:intergenic
AACGCCTCTGATAGCAGCTT+CGG	0.457919	3:+25739474	None:intergenic
GGCTGGCATGTTTGAGCAGA+TGG	0.462302	3:-25737243	MsG0380012860.01.T01:CDS
TATGGGCGCTGTTGAGGAAA+TGG	0.462830	3:+25739636	None:intergenic
TCAACAGCTTTGTATAAGTC+TGG	0.465889	3:+25737597	None:intergenic
GAATTCAGCGTGAAAACATC+TGG	0.467166	3:+25737179	None:intergenic
ATTGAAGTTTATGGCAAAGC+TGG	0.473500	3:-25736942	MsG0380012860.01.T01:CDS
TGCCTTGGGTATTATAAGCC+TGG	0.474247	3:+25736625	None:intergenic
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AGCTGGAGAAATTAAGAAGA+TGG	0.490315	3:-25736925	MsG0380012860.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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	AATACAATCAGATGACACTC+CGG	+	Chr3:25737107-25737126	None:intergenic	35.0%
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	ACATTGAACGTCTTTATGTC+TGG	+	Chr3:25738789-25738808	None:intergenic	35.0%
	ACTTGTGTACCTTTCTTCAA+TGG	-	Chr3:25737006-25737025	MsG0380012860.01.T01:CDS	35.0%
	AGCTGGAGAAATTAAGAAGA+TGG	-	Chr3:25738935-25738954	MsG0380012860.01.T01:intron	35.0%
	ATAGAGATGCATGAAATGGT+TGG	-	Chr3:25736703-25736722	MsG0380012860.01.T01:CDS	35.0%
	ATCTTTGGCAGAAATCATCA+TGG	+	Chr3:25739288-25739307	None:intergenic	35.0%
	ATGTTCCATGACAAAACAGA+AGG	+	Chr3:25738180-25738199	None:intergenic	35.0%
	ATTGAAGTTTATGGCAAAGC+TGG	-	Chr3:25738918-25738937	MsG0380012860.01.T01:intron	35.0%
	CCATCTAGTAAGATAAGACT+TGG	-	Chr3:25736765-25736784	MsG0380012860.01.T01:CDS	35.0%
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	CTTTGGATGATGCTATCAAA+GGG	-	Chr3:25736467-25736486	MsG0380012860.01.T01:intron	35.0%
	GACAAAATTATTCTCCAGCA+GGG	+	Chr3:25739501-25739520	None:intergenic	35.0%
	GACCATGAAATTGTTGTACA+CGG	+	Chr3:25736199-25736218	None:intergenic	35.0%
	GAGCAATACGTTACAGAATT+AGG	+	Chr3:25738999-25739018	None:intergenic	35.0%
	GAGTGGAATGCAATAATTCA+TGG	-	Chr3:25737635-25737654	MsG0380012860.01.T01:CDS	35.0%
	GTAAATGAGTGAATCAAGGA+TGG	+	Chr3:25738019-25738038	None:intergenic	35.0%
	GTCATCTGATTGTATTCAGA+GGG	-	Chr3:25737111-25737130	MsG0380012860.01.T01:CDS	35.0%
	TCAATGCATATAGCAAAGCT+GGG	-	Chr3:25739024-25739043	MsG0380012860.01.T01:intron	35.0%
	TCTTGCGGATATGTCATATT+CGG	-	Chr3:25738542-25738561	MsG0380012860.01.T01:intron	35.0%
	TGACAAAATTATTCTCCAGC+AGG	+	Chr3:25739502-25739521	None:intergenic	35.0%
	TGGCGGAAAAATAGATAAGA+TGG	-	Chr3:25738725-25738744	MsG0380012860.01.T01:intron	35.0%
	TGGGAATATCATAAGTGTTC+TGG	+	Chr3:25737225-25737244	None:intergenic	35.0%
	TGTCATCTGATTGTATTCAG+AGG	-	Chr3:25737110-25737129	MsG0380012860.01.T01:CDS	35.0%
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	TTTAAGCCCTTCAAACAACA+TGG	+	Chr3:25738340-25738359	None:intergenic	35.0%
	TTTCATTTCACCATCCAACT+CGG	+	Chr3:25737539-25737558	None:intergenic	35.0%
	TTTGTATAAGTCTGGCATCT+TGG	+	Chr3:25738258-25738277	None:intergenic	35.0%
!	AGCAAAAAACCAAAGCATCA+TGG	+	Chr3:25737839-25737858	None:intergenic	35.0%
!	ATCAATTCGGTCATGTTTTG+CGG	+	Chr3:25738145-25738164	None:intergenic	35.0%
!	CCAAGTCTTATCTTACTAGA+TGG	+	Chr3:25736768-25736787	None:intergenic	35.0%
!	GAGTTGTGGATTTTCTTGAT+TGG	-	Chr3:25737424-25737443	MsG0380012860.01.T01:CDS	35.0%
!	GCAAAATTGACTCAATCTTG+AGG	-	Chr3:25739054-25739073	MsG0380012860.01.T01:intron	35.0%
!	GCTGGAGAATAATTTTGTCA+CGG	-	Chr3:25739502-25739521	MsG0380012860.01.T01:CDS	35.0%
!	TATGTAGAATTGGTGGCTAT+TGG	-	Chr3:25737402-25737421	MsG0380012860.01.T01:CDS	35.0%
!	TCAACAGCTTTGTATAAGTC+TGG	+	Chr3:25738266-25738285	None:intergenic	35.0%
!!	GGTTCTTTTCTTCTGTTTCT+TGG	-	Chr3:25737149-25737168	MsG0380012860.01.T01:CDS	35.0%
!!	TGATTGGCTCTTAGTTTTCT+AGG	-	Chr3:25737440-25737459	MsG0380012860.01.T01:CDS	35.0%
!!!	GAATTGAAGTGGTTTTGGTT+TGG	+	Chr3:25736268-25736287	None:intergenic	35.0%
!!!	GACCCTGGAAAGTTTTAATT+TGG	-	Chr3:25737882-25737901	MsG0380012860.01.T01:intron	35.0%
!!!	GTGGATTTTTTTTTCCGAGT+TGG	-	Chr3:25737522-25737541	MsG0380012860.01.T01:CDS	35.0%
!!!	TTAGTTGTTTTTGATGGGGT+GGG	-	Chr3:25736602-25736621	MsG0380012860.01.T01:CDS	35.0%
!!!	TTTAGTTGTTTTTGATGGGG+TGG	-	Chr3:25736601-25736620	MsG0380012860.01.T01:CDS	35.0%
	AATTCCATCATCGACGGATA+TGG	-	Chr3:25738591-25738610	MsG0380012860.01.T01:intron	40.0%
	ACCATAAGCACTTACAAGAG+CGG	+	Chr3:25738382-25738401	None:intergenic	40.0%
	ATCCAGGCTTATAATACCCA+AGG	-	Chr3:25739233-25739252	MsG0380012860.01.T01:intron	40.0%
	ATGACACTCCGGATTACATA+AGG	+	Chr3:25737096-25737115	None:intergenic	40.0%
	ATGCGTGATAAGTCCTTCTT+AGG	+	Chr3:25736358-25736377	None:intergenic	40.0%
	ATTTCTGCCAAAGATAGCTC+AGG	-	Chr3:25739293-25739312	MsG0380012860.01.T01:intron	40.0%
	CAAGGAATGCTTAGTACACA+AGG	+	Chr3:25739394-25739413	None:intergenic	40.0%
	CATAATTAGTGCCTATGGTC+AGG	-	Chr3:25739124-25739143	MsG0380012860.01.T01:intron	40.0%
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	CTGTTTATGCTTCCATGACT+TGG	+	Chr3:25736422-25736441	None:intergenic	40.0%
	CTTCAAAGCCTTCATACGAA+GGG	-	Chr3:25736320-25736339	MsG0380012860.01.T01:intron	40.0%
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	GACTGAGGCTGCTAAAAATT+TGG	-	Chr3:25739259-25739278	MsG0380012860.01.T01:intron	40.0%
	GATGATAAAGTCGTATGGCA+AGG	-	Chr3:25738809-25738828	MsG0380012860.01.T01:intron	40.0%
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	GCTGGCAACTTAGAAAAGAT+GGG	-	Chr3:25739146-25739165	MsG0380012860.01.T01:intron	40.0%
	GTAAGTGCTTATGGTCAAAG+TGG	-	Chr3:25738387-25738406	MsG0380012860.01.T01:intron	40.0%
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	TCAAGGATGGGAGTAGAATT+AGG	+	Chr3:25738006-25738025	None:intergenic	40.0%
	TCTTCAAAGCCTTCATACGA+AGG	-	Chr3:25736319-25736338	MsG0380012860.01.T01:intron	40.0%
	TTAAAACTTTCCAGGGTCAC+AGG	+	Chr3:25737880-25737899	None:intergenic	40.0%
	TTCACGCTGAATTCTTTGCT+AGG	-	Chr3:25738690-25738709	MsG0380012860.01.T01:intron	40.0%
	TTGCACCAAAGAAAAGGTTG+CGG	+	Chr3:25739332-25739351	None:intergenic	40.0%
	TTTGGTCCTATTCTGCTTGA+TGG	-	Chr3:25739361-25739380	MsG0380012860.01.T01:intron	40.0%
!	AGTTTCCGCAACCTTTTCTT+TGG	-	Chr3:25739324-25739343	MsG0380012860.01.T01:intron	40.0%
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!	GACTTGGTTGTTGTTGTTGT+TGG	-	Chr3:25736781-25736800	MsG0380012860.01.T01:CDS	40.0%
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!!	ATAAATGTACTGGCTTCCCT+AGG	+	Chr3:25739537-25739556	None:intergenic	40.0%
!!	ATAGAACTGATGATGGCTCT+TGG	-	Chr3:25737704-25737723	MsG0380012860.01.T01:intron	40.0%
!!	ATGCTATCAAAGGGTATCAG+TGG	-	Chr3:25736476-25736495	MsG0380012860.01.T01:intron	40.0%
!!	GAAGAGTGTGATGGATTTCA+TGG	-	Chr3:25738851-25738870	MsG0380012860.01.T01:intron	40.0%
!!	TAGAACTGATGATGGCTCTT+GGG	-	Chr3:25737705-25737724	MsG0380012860.01.T01:intron	40.0%
!!	TAGAGTTGACTAGCCTCTTT+AGG	+	Chr3:25738312-25738331	None:intergenic	40.0%
!!!	GTGGTTTTGGTTTGGGAATT+TGG	+	Chr3:25736260-25736279	None:intergenic	40.0%
!!!	TGTTCTTTGGCTTGGTTTTG+TGG	-	Chr3:25737503-25737522	MsG0380012860.01.T01:CDS	40.0%
	AAAAGGGTTTCCTCCTTTGC+AGG	+	Chr3:25736959-25736978	None:intergenic	45.0%
	AAAGCTTCCAGAACAGCCTT+AGG	+	Chr3:25736451-25736470	None:intergenic	45.0%
	ACCGCTCTTGTAAGTGCTTA+TGG	-	Chr3:25738378-25738397	MsG0380012860.01.T01:intron	45.0%
	AGAGGGCTCAGATTAACTCT+AGG	-	Chr3:25737128-25737147	MsG0380012860.01.T01:CDS	45.0%
	ATAAAGTCGTATGGCAAGGC+AGG	-	Chr3:25738813-25738832	MsG0380012860.01.T01:intron	45.0%
	ATGCATACACTCACATGCCA+AGG	+	Chr3:25739412-25739431	None:intergenic	45.0%
	ATTGTTGTACACGGAGAAGG+AGG	+	Chr3:25736190-25736209	None:intergenic	45.0%
	CAACGTACCTGAGCTATCTT+TGG	+	Chr3:25739303-25739322	None:intergenic	45.0%
	CGGTTGTGCCTTATGTAATC+CGG	-	Chr3:25737085-25737104	MsG0380012860.01.T01:CDS	45.0%
	GCTTCAGAAGGATCCTAAGA+AGG	-	Chr3:25736342-25736361	MsG0380012860.01.T01:intron	45.0%
	GGCCTTTATGTTCCAGGATT+GGG	-	Chr3:25737188-25737207	MsG0380012860.01.T01:CDS	45.0%
	GGCTGGCAACTTAGAAAAGA+TGG	-	Chr3:25739145-25739164	MsG0380012860.01.T01:intron	45.0%
	GGGCTTCATCCATTGAAGAA+AGG	+	Chr3:25737018-25737037	None:intergenic	45.0%
	GTCACGGTGAAATAGTCCTA+GGG	-	Chr3:25739518-25739537	MsG0380012860.01.T01:CDS	45.0%
	GTCCCAATCCTGGAACATAA+AGG	+	Chr3:25737193-25737212	None:intergenic	45.0%
	GTGAGCGTGAAGTTGTTAAG+CGG	-	Chr3:25737065-25737084	MsG0380012860.01.T01:CDS	45.0%
	GTTTGGGAATTTGGTCGAAC+AGG	+	Chr3:25736251-25736270	None:intergenic	45.0%
	TAAAGGCCAAACAAGACGCT+CGG	+	Chr3:25737176-25737195	None:intergenic	45.0%
	TAATACCCAAGGCATGACTG+AGG	-	Chr3:25739244-25739263	MsG0380012860.01.T01:intron	45.0%
	TATGTTCCAGGATTGGGACT+TGG	-	Chr3:25737194-25737213	MsG0380012860.01.T01:CDS	45.0%
	TATTCTCCAGCAGGGAAAGA+TGG	+	Chr3:25739493-25739512	None:intergenic	45.0%
	TCAGCGTGAAAACATCTGGT+TGG	+	Chr3:25738680-25738699	None:intergenic	45.0%
	TGCCTTGGGTATTATAAGCC+TGG	+	Chr3:25739238-25739257	None:intergenic	45.0%
	TGGCCTTTATGTTCCAGGAT+TGG	-	Chr3:25737187-25737206	MsG0380012860.01.T01:CDS	45.0%
	TGTCACGGTGAAATAGTCCT+AGG	-	Chr3:25739517-25739536	MsG0380012860.01.T01:CDS	45.0%
	TTCATACGAAGGGCTTCAGA+AGG	-	Chr3:25736330-25736349	MsG0380012860.01.T01:intron	45.0%
!	ATTGGTGGCTATTGGAGTTG+TGG	-	Chr3:25737410-25737429	MsG0380012860.01.T01:CDS	45.0%
!	CATGGAAGCATAAACAGCTG+TGG	-	Chr3:25736425-25736444	MsG0380012860.01.T01:intron	45.0%
!	GATGATGGCTCTTGGGATTA+AGG	-	Chr3:25737712-25737731	MsG0380012860.01.T01:intron	45.0%
!!	GTGTGATGGATTTCATGGAG+AGG	-	Chr3:25738856-25738875	MsG0380012860.01.T01:intron	45.0%
!!	TAAGGCTGTTCTGGAAGCTT+TGG	-	Chr3:25736450-25736469	MsG0380012860.01.T01:intron	45.0%
!!	TTCTGAAGCCCTTCGTATGA+AGG	+	Chr3:25736331-25736350	None:intergenic	45.0%
!!!	TTGTTTTTGATGGGGTGGGT+GGG	-	Chr3:25736606-25736625	MsG0380012860.01.T01:CDS	45.0%
	AACGCCTCTGATAGCAGCTT+CGG	+	Chr3:25736389-25736408	None:intergenic	50.0%
	AGCCTGGATCATGCAAGTGA+AGG	+	Chr3:25739222-25739241	None:intergenic	50.0%
	ATTAGTGCCTATGGTCAGGC+TGG	-	Chr3:25739128-25739147	MsG0380012860.01.T01:intron	50.0%
	CAAGTGCAAGCAGCCTAAAG+AGG	-	Chr3:25738296-25738315	MsG0380012860.01.T01:intron	50.0%
	CACCTTCACTTGCATGATCC+AGG	-	Chr3:25739217-25739236	MsG0380012860.01.T01:intron	50.0%
	CATCATCGACGGATATGGCA+AGG	-	Chr3:25738596-25738615	MsG0380012860.01.T01:intron	50.0%
	CCACCATACAACACCTGCTA+CGG	+	Chr3:25736901-25736920	None:intergenic	50.0%
	CTGGATCATGCAAGTGAAGG+TGG	+	Chr3:25739219-25739238	None:intergenic	50.0%
	CTTGCCATATCCGTCGATGA+TGG	+	Chr3:25738598-25738617	None:intergenic	50.0%
	GCATAAACAGCTGTGGCCTA+AGG	-	Chr3:25736432-25736451	MsG0380012860.01.T01:intron	50.0%
	GCGGTGAAGACATCAACAGT+AGG	+	Chr3:25738363-25738382	None:intergenic	50.0%
	TAAGTTGCCAGCCTGACCAT+AGG	+	Chr3:25739138-25739157	None:intergenic	50.0%
	TACACGGAGAAGGAGGAGAA+GGG	+	Chr3:25736183-25736202	None:intergenic	50.0%
	TAGACTCATCGTGCACAGAG+AGG	+	Chr3:25739441-25739460	None:intergenic	50.0%
	TGAGCTGTGCCATGATGCTT+TGG	-	Chr3:25737827-25737846	MsG0380012860.01.T01:intron	50.0%
	TTCTTGCCATCTTTCCCTGC+TGG	-	Chr3:25739484-25739503	MsG0380012860.01.T01:CDS	50.0%
!	AGGTGTTGTATGGTGGAGCA+CGG	-	Chr3:25736905-25736924	MsG0380012860.01.T01:CDS	50.0%
!	GAACGCTCTCATGGTTGGTT+TGG	-	Chr3:25736501-25736520	MsG0380012860.01.T01:intron	50.0%
!	TATGGGCGCTGTTGAGGAAA+TGG	+	Chr3:25736227-25736246	None:intergenic	50.0%
!!	CAAGTGAAGGTGGTGCTATC+AGG	+	Chr3:25739209-25739228	None:intergenic	50.0%
!!	GAACGCATGAGAGTATCAGC+AGG	+	Chr3:25738041-25738060	None:intergenic	50.0%
!!!	GTTGTTTTTGATGGGGTGGG+TGG	-	Chr3:25736605-25736624	MsG0380012860.01.T01:CDS	50.0%
	ACGGTTGTACTTCGCTGGTG+TGG	-	Chr3:25736924-25736943	MsG0380012860.01.T01:CDS	55.0%
	AGCAGCCTCAGTCATGCCTT+GGG	+	Chr3:25739252-25739271	None:intergenic	55.0%
	ATCGACGGATATGGCAAGGC+TGG	-	Chr3:25738600-25738619	MsG0380012860.01.T01:intron	55.0%
	CGAACCGAAGCTGCTATCAG+AGG	-	Chr3:25736382-25736401	MsG0380012860.01.T01:intron	55.0%
	CGGTTGTACTTCGCTGGTGT+GGG	-	Chr3:25736925-25736944	MsG0380012860.01.T01:CDS	55.0%
	GGCTGGCATGTTTGAGCAGA+TGG	-	Chr3:25738617-25738636	MsG0380012860.01.T01:intron	55.0%
	GTACACGGAGAAGGAGGAGA+AGG	+	Chr3:25736184-25736203	None:intergenic	55.0%
	TAGCAGCCTCAGTCATGCCT+TGG	+	Chr3:25739253-25739272	None:intergenic	55.0%
	TCAGTGGCAGAACGCTCTCA+TGG	-	Chr3:25736492-25736511	MsG0380012860.01.T01:intron	55.0%
	TGGCAGAACGCTCTCATGGT+TGG	-	Chr3:25736496-25736515	MsG0380012860.01.T01:intron	55.0%
	TGTACTTCGCTGGTGTGGGT+TGG	-	Chr3:25736929-25736948	MsG0380012860.01.T01:CDS	55.0%
	TTCCAGGGTCACAGGCAGAA+CGG	+	Chr3:25737872-25737891	None:intergenic	55.0%
!	ACAGGTTATGGGCGCTGTTG+AGG	+	Chr3:25736233-25736252	None:intergenic	55.0%
!	CCGTAGCAGGTGTTGTATGG+TGG	-	Chr3:25736898-25736917	MsG0380012860.01.T01:CDS	55.0%
!	CTTGGACCGAGCGTCTTGTT+TGG	-	Chr3:25737167-25737186	MsG0380012860.01.T01:CDS	55.0%
!	TATGAGATGACGGCCGTAGC+AGG	-	Chr3:25736885-25736904	MsG0380012860.01.T01:CDS	55.0%
!!	GGTTGGTGAACCTGCAAAGG+AGG	-	Chr3:25736946-25736965	MsG0380012860.01.T01:CDS	55.0%
!!	GTGGGTTGGTGAACCTGCAA+AGG	-	Chr3:25736943-25736962	MsG0380012860.01.T01:CDS	55.0%
	GATGGGCCAAGTCCCAATCC+TGG	+	Chr3:25737203-25737222	None:intergenic	60.0%
	GCTGTGGCCTAAGGCTGTTC+TGG	-	Chr3:25736441-25736460	MsG0380012860.01.T01:intron	60.0%
	GGAGCACGGTTGTACTTCGC+TGG	-	Chr3:25736919-25736938	MsG0380012860.01.T01:CDS	60.0%
	TTCCGTTCTGCCTGTGACCC+TGG	-	Chr3:25737867-25737886	MsG0380012860.01.T01:intron	60.0%
!	CGGCCGTAGCAGGTGTTGTA+TGG	-	Chr3:25736895-25736914	MsG0380012860.01.T01:CDS	60.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
Chr3	gene	25736154	25739728	25736154	ID=MsG0380012860.01;Name=MsG0380012860.01
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Chr3	five_prime_UTR	25739723	25739728	25739723	ID=MsG0380012860.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0380012860.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0380012860.01.T01

ATGTGGATGGAGCTTCTTCACCCTTCTCCTCCTTCTCCGTGTACAACAATTTCATGGTCTTCATCCATTTCCTCAACAGCGCCCATAACCTGTTCGACCAAATTCCCAAACCAAAACCACTTCAATTCTTCTTCTTTTCGCGTTCAATCATTGAAACGCTCTTCAAAGCCTTCATACGAAGGGCTTCAGAAGGATCCTAAGAAGGACTTATCACGCATTCTTCGAACCGAAGCTGCTATCAGAGGCGTTGAGAATAAAGCCAAGTCATGGAAGCATAAACAGCTGTGGCCTAAGGCTGTTCTGGAAGCTTTGGATGATGCTATCAAAGGGTATCAGTGGCAGAACGCTCTCATGATTTTTGAACTTCTTCGAAATCAATATTGGTATGAACCAAGATGCCAGACTTATACAAAGCTGTTGATGATACTTAGCAAGTGCAAGCAGCCTAAAGAGGCTAGTCAACTCTATGAAACCATGTTGTTTGAAGGGCTTAAACCTACTGTTGATGTCTTCACCGCTCTTGTAAGTGCTTATGGTCAAAGTGGTCTCTTTCGTCACGCATTTTCTACTATTGAAGATATGAAATCAGTTGTTGATTGCAAACCAGATGTATATACATATTCTGTTCTTATAAGTTGCTGTGCAAAGTTTCGTCGATTTGATTTAATTGAACGTGTTCTTGCGGATATGTCATATTCGGGAATTGAATGTAACAGTGTGACATATAATTCCATCATCGACGGATATGGCAAGGCTGGCATGTTTGAGCAGATGGAGAATTCATTGACAGATATGATTGAAAATGAAAACTGCCAACCAGATGTTTTCACGCTGAATTCTTTGCTAGGATCATATGGAAATGGCGGAAAAATAGATAAGATGGAGAACTGGTATGATGAATTTCAGCTAATGGGCATAAAGCCAGACATAAAGACGTTCAATGTGATGATAAAGTCGTATGGCAAGGCAGGCATGTACGATAAGATGAAGAGTGTGATGGATTTCATGGAGAGGAGATTTTTCGCTCCAACAATTGTAACATATAATACAGTCATTGAAGTTTATGGCAAAGCTGGAGAAATTAAGAAGATGGATAAATACTTTAAAAATATGAAGCATATAGGAATGAAACCTAATTCTGTAACGTATTGCTCGCTTGTCAATGCATATAGCAAAGCTGGGCTTATTCGCAAAATTGACTCAATCTTGAGGCATGTAGAAAATTCTGATGTCGTTTTGGATACGCCCTTCTTTAATTGCATAATTAGTGCCTATGGTCAGGCTGGCAACTTAGAAAAGATGGGTGAGTTATTCTTGGCAATGAGAGCAAGAAAATGTGAGCCTGATAGCACCACCTTCACTTGCATGATCCAGGCTTATAATACCCAAGGCATGACTGAGGCTGCTAAAAATTTGGAAACCATGATGATTTCTGCCAAAGATAGCTCAGATACTAAGCTGATTGGATGCTAG

Protein sequence

>MsG0380012860.01.T01

MWMELLHPSPPSPCTTISWSSSISSTAPITCSTKFPNQNHFNSSSFRVQSLKRSSKPSYEGLQKDPKKDLSRILRTEAAIRGVENKAKSWKHKQLWPKAVLEALDDAIKGYQWQNALMIFELLRNQYWYEPRCQTYTKLLMILSKCKQPKEASQLYETMLFEGLKPTVDVFTALVSAYGQSGLFRHAFSTIEDMKSVVDCKPDVYTYSVLISCCAKFRRFDLIERVLADMSYSGIECNSVTYNSIIDGYGKAGMFEQMENSLTDMIENENCQPDVFTLNSLLGSYGNGGKIDKMENWYDEFQLMGIKPDIKTFNVMIKSYGKAGMYDKMKSVMDFMERRFFAPTIVTYNTVIEVYGKAGEIKKMDKYFKNMKHIGMKPNSVTYCSLVNAYSKAGLIRKIDSILRHVENSDVVLDTPFFNCIISAYGQAGNLEKMGELFLAMRARKCEPDSTTFTCMIQAYNTQGMTEAAKNLETMMISAKDSSDTKLIGC*