AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480020024.01


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MsG0480020024.01.T01 AT1G63130 25.000 356 192 11 335 648 258 580 7.10e-21 97.8
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MsG0480020024.01.T01 AT1G63330 27.953 254 167 4 416 666 77 317 1.08e-21 100
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MsG0480020024.01.T01 AT1G63330 19.681 376 269 7 296 669 11 355 8.48e-20 94.4
MsG0480020024.01.T01 AT1G63330 23.580 352 202 9 335 648 187 509 8.66e-18 87.8
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MsG0480020024.01.T01 AT1G63150 22.823 333 224 6 335 665 260 561 1.84e-20 96.7
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MsG0480020024.01.T01 AT1G06580 21.557 334 230 6 335 665 80 384 1.43e-14 76.6
MsG0480020024.01.T01 AT3G53700 21.856 334 199 6 337 669 263 535 1.23e-20 97.4
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MsG0480020024.01.T01 AT2G02150 20.436 367 257 10 326 669 289 643 4.14e-13 73.2
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MsG0480020024.01.T01 AT1G13800 22.535 284 180 7 308 584 607 857 8.80e-13 72.4
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MsG0480020024.01.T01 AT4G20090 23.002 513 329 15 199 669 82 570 2.81e-18 89.7
MsG0480020024.01.T01 AT4G20090 22.458 236 163 4 453 682 147 368 7.95e-11 65.9
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MsG0480020024.01.T01 AT5G65560 21.159 397 271 9 309 690 407 776 3.76e-16 83.2
MsG0480020024.01.T01 AT5G65560 21.333 375 258 9 296 665 143 485 8.66e-16 82.0
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MsG0480020024.01.T01 AT5G21222 23.009 339 227 8 348 682 334 642 1.05e-18 91.3
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MsG0480020024.01.T01 AT1G22960 21.453 289 212 4 417 702 372 648 2.05e-12 71.2
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MsG0480020024.01.T01 AT1G74750 19.814 323 228 6 352 671 342 636 2.06e-11 68.2
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MsG0480020024.01.T01 AT2G06000 21.569 306 223 4 389 691 73 364 8.01e-14 75.1
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MsG0480020024.01.T01 AT3G09060 22.157 343 227 8 328 646 6 332 2.24e-13 73.9
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MsG0480020024.01.T01 AT2G19280 20.820 317 212 7 340 624 348 657 6.18e-14 75.9
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MsG0480020024.01.T01 AT2G35130 23.460 341 229 9 311 647 157 469 2.44e-13 73.9
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MsG0480020024.01.T01 AT5G40400 24.719 178 132 2 436 611 289 466 5.51e-11 66.2
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MsG0480020024.01.T01 AT5G40400 23.482 247 169 4 410 654 163 391 3.56e-13 73.2
MsG0480020024.01.T01 AT5G40400 24.719 178 132 2 436 611 218 395 6.33e-11 66.2
MsG0480020024.01.T01 AT3G53170 22.333 300 165 8 336 625 203 444 4.61e-13 72.4
MsG0480020024.01.T01 AT1G08610 25.926 243 164 5 417 656 172 401 1.03e-12 71.6
MsG0480020024.01.T01 AT1G08610 21.003 319 193 8 342 620 148 447 7.26e-11 65.9
MsG0480020024.01.T01 AT5G61990 22.022 277 164 4 412 648 585 849 1.19e-12 72.0
MsG0480020024.01.T01 AT5G61990 20.312 384 261 10 334 690 313 678 4.27e-12 70.1
MsG0480020024.01.T01 AT5G61990 20.963 353 245 9 279 619 612 942 9.31e-11 65.9
MsG0480020024.01.T01 AT1G79080 22.059 340 203 8 330 667 102 381 1.36e-12 71.2
MsG0480020024.01.T01 AT5G28370 22.120 217 151 3 335 549 513 713 1.37e-12 71.6
MsG0480020024.01.T01 AT5G28370 18.991 337 248 7 336 669 297 611 2.71e-11 67.4
MsG0480020024.01.T01 AT5G24830 21.264 348 213 7 336 646 194 517 1.40e-12 71.2
MsG0480020024.01.T01 AT5G47360 22.222 306 211 8 376 669 85 375 1.51e-12 70.9
MsG0480020024.01.T01 AT3G53170 22.297 296 162 8 336 621 253 490 1.55e-12 70.9
MsG0480020024.01.T01 AT3G53170 22.297 296 162 8 336 621 253 490 1.55e-12 70.9
MsG0480020024.01.T01 AT5G25630 22.609 345 224 11 348 682 60 371 1.73e-12 71.2
MsG0480020024.01.T01 AT5G25630 20.000 350 238 9 336 675 118 435 2.36e-12 70.5
MsG0480020024.01.T01 AT2G39230 20.461 347 244 7 350 693 465 782 1.84e-12 71.2
MsG0480020024.01.T01 AT1G13040 23.684 228 159 4 422 646 82 297 2.00e-12 70.9
MsG0480020024.01.T01 AT1G13040 21.538 260 190 3 416 673 252 499 3.71e-12 69.7
MsG0480020024.01.T01 AT1G13040 23.684 228 159 4 422 646 82 297 2.00e-12 70.9
MsG0480020024.01.T01 AT1G13040 21.538 260 190 3 416 673 252 499 3.71e-12 69.7
MsG0480020024.01.T01 AT5G46580 22.796 329 219 11 302 620 157 460 2.02e-12 71.2
MsG0480020024.01.T01 AT1G13630 26.908 249 150 8 415 646 394 627 2.03e-12 71.2
MsG0480020024.01.T01 AT1G13630 23.529 238 161 5 415 646 288 510 3.32e-11 67.4
MsG0480020024.01.T01 AT5G46680 21.678 286 205 4 336 618 121 390 2.25e-12 70.5
MsG0480020024.01.T01 AT5G46680 25.366 205 149 4 417 618 46 249 1.25e-11 68.2
MsG0480020024.01.T01 AT1G53330 20.495 283 206 4 416 693 45 313 2.29e-12 69.7
MsG0480020024.01.T01 AT5G25630 22.609 345 224 11 348 682 9 320 2.31e-12 70.5
MsG0480020024.01.T01 AT5G25630 20.000 350 238 9 336 675 67 384 3.76e-12 69.7
MsG0480020024.01.T01 AT1G13630 26.908 249 150 8 415 646 436 669 2.49e-12 70.9
MsG0480020024.01.T01 AT1G13630 23.457 243 155 6 415 646 330 552 3.85e-11 67.0
MsG0480020024.01.T01 AT5G25630 22.346 358 234 11 348 682 60 396 2.52e-12 70.5
MsG0480020024.01.T01 AT1G13630 26.908 249 150 8 415 646 428 661 2.56e-12 70.9
MsG0480020024.01.T01 AT1G13630 23.457 243 155 6 415 646 322 544 4.17e-11 67.0
MsG0480020024.01.T01 AT1G13630 26.908 249 150 8 415 646 441 674 2.67e-12 70.9
MsG0480020024.01.T01 AT1G13630 23.457 243 155 6 415 646 335 557 4.35e-11 67.0
MsG0480020024.01.T01 AT3G13160 20.630 349 203 10 298 637 109 392 3.91e-12 69.3
MsG0480020024.01.T01 AT5G14820 20.906 287 206 7 337 620 267 535 4.46e-12 69.7
MsG0480020024.01.T01 AT3G62540 20.906 287 206 7 337 620 268 536 4.95e-12 69.7
MsG0480020024.01.T01 AT3G22670 24.000 225 158 3 442 665 227 439 5.60e-12 69.3
MsG0480020024.01.T01 AT3G22670 19.293 311 215 6 301 599 172 458 9.42e-12 68.6
MsG0480020024.01.T01 AT1G13630 26.908 249 150 8 415 646 266 499 6.84e-12 69.3
MsG0480020024.01.T01 AT1G13630 23.529 238 161 5 415 646 160 382 8.13e-11 65.9
MsG0480020024.01.T01 AT5G62370 22.159 352 222 8 342 661 486 817 8.50e-12 69.3
MsG0480020024.01.T01 AT1G13630 26.908 249 150 8 415 646 303 536 9.20e-12 68.9
MsG0480020024.01.T01 AT3G14580 21.719 221 159 4 452 670 165 373 1.04e-11 67.8
MsG0480020024.01.T01 AT2G37230 23.438 192 143 3 441 630 207 396 1.06e-11 68.9
MsG0480020024.01.T01 AT5G57250 22.647 340 217 9 320 651 262 563 1.07e-11 68.9
MsG0480020024.01.T01 AT1G19290 24.490 245 163 5 414 650 536 766 1.09e-11 68.9
MsG0480020024.01.T01 AT1G19290 24.490 245 163 5 414 650 536 766 1.09e-11 68.9
MsG0480020024.01.T01 AT3G16890 22.727 220 165 3 422 639 428 644 1.19e-11 68.6
MsG0480020024.01.T01 AT3G13150 22.368 228 156 4 336 542 160 387 1.48e-11 68.2
MsG0480020024.01.T01 AT5G15010 23.810 231 152 6 291 519 298 506 1.60e-11 67.8
MsG0480020024.01.T01 AT3G49710 22.926 458 282 17 219 650 46 458 2.33e-11 67.8
MsG0480020024.01.T01 AT2G17670 25.112 223 157 6 401 618 179 396 2.50e-11 67.0
MsG0480020024.01.T01 AT2G17670 21.352 281 202 7 415 690 155 421 5.25e-11 65.9
MsG0480020024.01.T01 AT3G16890 22.727 220 165 3 422 639 299 515 2.54e-11 67.4
MsG0480020024.01.T01 AT4G01030 20.058 344 224 10 346 681 306 606 2.59e-11 67.4
MsG0480020024.01.T01 AT3G04130 18.786 346 247 9 310 629 100 437 2.68e-11 67.0
MsG0480020024.01.T01 AT3G04130 18.786 346 247 9 310 629 100 437 2.68e-11 67.0
MsG0480020024.01.T01 AT3G06430 20.222 361 243 12 319 665 103 432 2.82e-11 67.0
MsG0480020024.01.T01 AT1G11630 25.616 203 144 4 423 620 150 350 2.88e-11 66.6
MsG0480020024.01.T01 AT1G61870 24.876 201 148 3 423 620 155 355 4.43e-11 65.9
MsG0480020024.01.T01 AT2G22070 27.711 166 90 3 516 666 460 610 4.62e-11 66.6
MsG0480020024.01.T01 AT3G29290 20.370 432 271 12 251 620 98 518 4.84e-11 66.2
MsG0480020024.01.T01 AT3G29290 20.370 432 271 12 251 620 98 518 4.84e-11 66.2
MsG0480020024.01.T01 AT3G29290 20.370 432 271 12 251 620 98 518 4.84e-11 66.2
MsG0480020024.01.T01 AT3G29290 20.370 432 271 12 251 620 98 518 4.84e-11 66.2
MsG0480020024.01.T01 AT3G29290 20.370 432 271 12 251 620 98 518 4.84e-11 66.2
MsG0480020024.01.T01 AT5G61400 20.414 338 218 9 387 688 117 439 4.92e-11 66.6
MsG0480020024.01.T01 AT1G77340 23.984 246 160 8 409 646 145 371 6.42e-11 65.5
MsG0480020024.01.T01 AT2G35130 18.783 575 386 16 138 665 27 567 7.57e-11 65.9
MsG0480020024.01.T01 AT3G58590 22.705 207 151 4 416 618 507 708 7.69e-11 65.9

Find 140 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 401 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CAGTTCTCGTGAATACATTT+TGG 0.196321 4:+32178884 MsG0480020024.01.T01:intron
ACTGCCTCTGCTTTGCATTA+TGG 0.202380 4:+32174546 MsG0480020024.01.T01:CDS
AACAGTGGGAAGGAGCATTT+TGG 0.202841 4:+32178039 MsG0480020024.01.T01:CDS
GTAGTAAGCGATTTCTTAAT+AGG 0.224178 4:+32175162 MsG0480020024.01.T01:CDS
CCTTTATTGAACTTCTTCTT+TGG 0.231234 4:-32177291 None:intergenic
TCCCCTTAACACATGCATTA+AGG 0.267194 4:-32178016 None:intergenic
TTCCACGTCTTTCCATTTCA+TGG 0.310012 4:-32178942 None:intergenic
CATACTGTTTAGCTAGCTTC+TGG 0.312371 4:-32175298 None:intergenic
ATAAAGGATCATTCATAATA+TGG 0.312412 4:-32180788 None:intergenic
CCAAAGAAGAAGTTCAATAA+AGG 0.318518 4:+32177291 MsG0480020024.01.T01:CDS
GATTGTGATAAGCCTTCTTA+TGG 0.320840 4:-32176409 None:intergenic
ATAAAGGGATATTCGAGAAT+TGG 0.328103 4:+32177307 MsG0480020024.01.T01:CDS
AGAAGGCTTATCACAATCTT+AGG 0.329702 4:+32176414 MsG0480020024.01.T01:CDS
ATGCAAGTACCTTGGCTTAT+GGG 0.331949 4:-32176505 None:intergenic
CCTCTATATGTCAATGGATT+AGG 0.332516 4:-32178781 None:intergenic
CATAGTATTGCTGTTACTCT+TGG 0.339314 4:+32177213 MsG0480020024.01.T01:CDS
ATGTTGTAAGTAACCAGATT+TGG 0.343991 4:-32180465 None:intergenic
GTATTAAATGTGTATATATC+TGG 0.346172 4:-32180606 None:intergenic
TATGCAAGTACCTTGGCTTA+TGG 0.348384 4:-32176506 None:intergenic
TAGTAAGCGATTTCTTAATA+GGG 0.356081 4:+32175163 MsG0480020024.01.T01:CDS
AGCGGAAAACAGAAGAATAA+AGG 0.361042 4:+32174786 MsG0480020024.01.T01:CDS
GCATTATAAACTACGATATC+AGG 0.364611 4:-32177345 None:intergenic
ATCATTCGAAGATGTCGTTT+TGG 0.367993 4:-32180717 None:intergenic
ATACTGGAGGCTTCAAGAAC+TGG 0.373962 4:+32180738 MsG0480020024.01.T01:CDS
GGACATTTGTGCTCCAAATC+TGG 0.379002 4:+32180452 MsG0480020024.01.T01:CDS
ATCCTTTGATCAATATTTGA+AGG 0.379968 4:+32174680 MsG0480020024.01.T01:CDS
GGTCCTTAATGCATGTGTTA+AGG 0.382540 4:+32178013 MsG0480020024.01.T01:intron
GGGTTATGATTCTGATGATT+TGG 0.383544 4:+32175184 MsG0480020024.01.T01:CDS
TTATTGAACTTCTTCTTTGG+TGG 0.394646 4:-32177288 None:intergenic
ACGACATCTTCGAATGATAC+TGG 0.395835 4:+32180722 MsG0480020024.01.T01:CDS
GTCCTTAATGCATGTGTTAA+GGG 0.400140 4:+32178014 MsG0480020024.01.T01:CDS
TGATCAATATTTGAAGGCTA+TGG 0.400483 4:+32174686 MsG0480020024.01.T01:CDS
GCCTTACTGATAACATTGTT+AGG 0.402013 4:-32175242 None:intergenic
AACAGAAGAATAAAGGGTTT+AGG 0.409845 4:+32174793 MsG0480020024.01.T01:CDS
CAACCTTCTGCCGCGACATA+TGG 0.416831 4:+32178092 MsG0480020024.01.T01:CDS
TAAAGGGATATTCGAGAATT+GGG 0.417644 4:+32177308 MsG0480020024.01.T01:CDS
ATCACAATCTTAGGCAATCT+AGG 0.421614 4:+32176423 MsG0480020024.01.T01:CDS
GGAAGAGAAAGAGAAAGAAT+TGG 0.427669 4:-32174571 None:intergenic
TTAATGACTATTCCATAAGA+AGG 0.427860 4:+32176397 MsG0480020024.01.T01:CDS
TCTTAGGCAATCTAGGAAAC+TGG 0.434146 4:+32176430 MsG0480020024.01.T01:CDS
TTATGATTCTGATGATTTGG+TGG 0.435170 4:+32175187 MsG0480020024.01.T01:CDS
ACGATATCAGGTTCCAGCCT+TGG 0.442802 4:-32177333 None:intergenic
GAAAGAAATAACAGCAGAAA+GGG 0.442933 4:+32175005 MsG0480020024.01.T01:CDS
CAAAGAAGAAGTTCAATAAA+GGG 0.447740 4:+32177292 MsG0480020024.01.T01:CDS
CCTAATCCATTGACATATAG+AGG 0.448402 4:+32178781 MsG0480020024.01.T01:CDS
CGAGAATTGGGACCCAAGGC+TGG 0.450585 4:+32177320 MsG0480020024.01.T01:CDS
CGATATCAGGTTCCAGCCTT+GGG 0.454097 4:-32177332 None:intergenic
CTGAAAGCATACGTTGATCA+TGG 0.454549 4:+32180492 MsG0480020024.01.T01:CDS
CGCGACATATGGTCTAGTTA+TGG 0.458198 4:+32178103 MsG0480020024.01.T01:CDS
GAGAGTATGACGAATAGAAA+TGG 0.459458 4:+32175113 MsG0480020024.01.T01:CDS
AATTTGAACGGTGGCCGTGG+TGG 0.466078 4:+32174924 MsG0480020024.01.T01:CDS
CTATGATAAGCTACTAAGTC+AGG 0.467929 4:-32177195 None:intergenic
ATCTTAGAAAACATCCATTC+AGG 0.476123 4:-32176351 None:intergenic
GAAGATGGTAGTTATTAGCT+TGG 0.477051 4:+32174506 MsG0480020024.01.T01:exon
ATGGAAAGACGTGGAATTGT+TGG 0.478591 4:+32178949 MsG0480020024.01.T01:CDS
TTATTAGCTTGGAATTCAAC+GGG 0.479802 4:+32174517 MsG0480020024.01.T01:CDS
ACAGATAGACAAGATATGTA+AGG 0.484304 4:+32180329 MsG0480020024.01.T01:intron
AAGCTAATAACTACCATCTT+CGG 0.485475 4:-32174504 None:intergenic
TCGAATTTGAACGGTGGCCG+TGG 0.485863 4:+32174921 MsG0480020024.01.T01:CDS
AGATTCTCAGCATATCATAA+AGG 0.486249 4:-32180804 None:intergenic
GCTGTTACTCTTGGACAAGC+AGG 0.488949 4:+32177222 MsG0480020024.01.T01:CDS
AAAGCTATGGATAGAGGGCC+GGG 0.491034 4:+32175071 MsG0480020024.01.T01:CDS
CCACTGGTGGTGACCTACAC+TGG 0.493568 4:+32180363 MsG0480020024.01.T01:CDS
GCGGAAAACAGAAGAATAAA+GGG 0.494939 4:+32174787 MsG0480020024.01.T01:CDS
AACAACAATAACACCGAAGA+TGG 0.497687 4:+32174491 MsG0480020024.01.T01:exon
ATAAAGGGTTTAGGAATGAA+AGG 0.501368 4:+32174802 MsG0480020024.01.T01:CDS
AAATATATTTCATGCAATGC+AGG 0.501866 4:+32177050 MsG0480020024.01.T01:CDS
GCTCGATGCCTCTGTACAGC+TGG 0.506290 4:+32178997 MsG0480020024.01.T01:CDS
TGTCTCGGCTGTCCATGAAA+TGG 0.507354 4:+32178930 MsG0480020024.01.T01:CDS
TTCAAATATTGATCAAAGGA+TGG 0.507683 4:-32174678 None:intergenic
GAAAGGAAGCAGAAATCTGA+TGG 0.509221 4:+32174819 MsG0480020024.01.T01:CDS
CTCGAACAGGTTGAATGGTG+TGG 0.512325 4:+32176317 MsG0480020024.01.T01:intron
AGAATACCTCTATATGTCAA+TGG 0.513075 4:-32178787 None:intergenic
AGAAAGAAATAACAGCAGAA+AGG 0.513372 4:+32175004 MsG0480020024.01.T01:CDS
AAGTCGCGAGGCACTGATGC+AGG 0.515188 4:+32179023 MsG0480020024.01.T01:CDS
AATCTGATGGGTCGAAGCGC+CGG 0.516432 4:+32174832 MsG0480020024.01.T01:CDS
GTTATTAGCTTGGAATTCAA+CGG 0.519203 4:+32174516 MsG0480020024.01.T01:CDS
TTCATGTGGCAAGTACAACT+TGG 0.521648 4:+32178720 MsG0480020024.01.T01:CDS
ATTTGAACGGTGGCCGTGGT+GGG 0.522599 4:+32174925 MsG0480020024.01.T01:CDS
TCCTAACAATGTTATCAGTA+AGG 0.526103 4:+32175241 MsG0480020024.01.T01:CDS
AACCATGGTACAGCATCCTC+TGG 0.534309 4:-32180683 None:intergenic
AGACCATATGTCGCGGCAGA+AGG 0.538896 4:-32178095 None:intergenic
AAAAGCTATGGATAGAGGGC+CGG 0.539392 4:+32175070 MsG0480020024.01.T01:CDS
TGATTCTGATGATTTGGTGG+TGG 0.541345 4:+32175190 MsG0480020024.01.T01:CDS
AATGCGGCACTTGATGCACT+TGG 0.542096 4:+32177000 MsG0480020024.01.T01:CDS
CGGAGGAATGTCAAGTCGAA+TGG 0.548309 4:+32175137 MsG0480020024.01.T01:CDS
TTGATGCACTTGGGAAGTTG+AGG 0.550612 4:+32177010 MsG0480020024.01.T01:CDS
ATGCAAGCATGTCTAGACTC+TGG 0.558158 4:+32180390 MsG0480020024.01.T01:CDS
GAGTGATACAAGTCATTGAA+TGG 0.561776 4:+32176457 MsG0480020024.01.T01:CDS
AGTAAGCGATTTCTTAATAG+GGG 0.562128 4:+32175164 MsG0480020024.01.T01:CDS
TTGAGTCTAAACTACGACTC+CGG 0.565364 4:-32174851 None:intergenic
AAAATTATCACCACCACCAA+GGG 0.569058 4:-32175036 None:intergenic
TTTCGAGAACGAGAAAGAAG+TGG 0.571219 4:-32174603 None:intergenic
AATATATTTAGTGCTTCCAC+TGG 0.573955 4:-32177036 None:intergenic
AAGGGTGGTAAAACCCTTGG+TGG 0.575745 4:+32175023 MsG0480020024.01.T01:CDS
TGGACATCAATTTACCTGAA+TGG 0.576937 4:+32176337 MsG0480020024.01.T01:CDS
AGAACGAGAAAGAAGTGGAT+AGG 0.578978 4:-32174598 None:intergenic
TAAGGTTGCAAATAAACCAC+TGG 0.579625 4:+32180347 MsG0480020024.01.T01:CDS
ATAATTAAGTCGAATTTGAA+CGG 0.580697 4:+32174912 MsG0480020024.01.T01:CDS
AGAAAGGGTGGTAAAACCCT+TGG 0.582015 4:+32175020 MsG0480020024.01.T01:CDS
TCCTTAATGCATGTGTTAAG+GGG 0.582495 4:+32178015 MsG0480020024.01.T01:CDS
CTGTTACTCTTGGACAAGCA+GGG 0.582689 4:+32177223 MsG0480020024.01.T01:CDS
AGCCTTCAAATATTGATCAA+AGG 0.583419 4:-32174682 None:intergenic
TTTAGACTCAAAATCTGATG+AGG 0.599194 4:+32174863 MsG0480020024.01.T01:CDS
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CAAAATTATCACCACCACCA+AGG 0.613926 4:-32175037 None:intergenic
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ACAGCATCCTCTGGTAAACA+TGG 0.637386 4:-32180674 None:intergenic
TGCAGCACATGCATCTAACA+TGG 0.640429 4:-32180628 None:intergenic
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TTGGATTGAAGTGATAACCA+TGG 0.644053 4:-32180698 None:intergenic
ATGTGTTAAGGGGAAACAGT+GGG 0.645396 4:+32178025 MsG0480020024.01.T01:CDS
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TACCAGAGGATGCTGTACCA+TGG 0.654808 4:+32180681 MsG0480020024.01.T01:CDS
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CATTAGGCATGTATATAATG+CGG 0.662854 4:+32176984 MsG0480020024.01.T01:intron
GGTTGCAAATAAACCACTGG+TGG 0.668287 4:+32180350 MsG0480020024.01.T01:CDS
TGCTTGCATCAAGCCAGTGT+AGG 0.668632 4:-32180376 None:intergenic
AGCAGCATTCAAGAATCTTG+AGG 0.668867 4:+32175217 MsG0480020024.01.T01:CDS
GGCACCATAATGCAAAGCAG+AGG 0.677163 4:-32174550 None:intergenic
TGGGAAGTTGAGGAGACCAG+TGG 0.680581 4:+32177020 MsG0480020024.01.T01:CDS
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GACTTCGTCCAGCTGTACAG+AGG 0.697268 4:-32179005 None:intergenic
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TCTCTACAACACTCCCACCA+CGG 0.745805 4:-32174938 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!!! ACAAATAATATTTTATTTAC+AGG - Chr4:32175910-32175929 None:intergenic 10.0%
!!! CAAATAATATTTTATTTACA+GGG - Chr4:32175909-32175928 None:intergenic 10.0%
!!! TATATATTAATTTCATTTTC+AGG + Chr4:32177992-32178011 MsG0480020024.01.T01:intron 10.0%
!! AATAAGATAATAGTAGAAAA+TGG - Chr4:32175878-32175897 None:intergenic 15.0%
!! AATAATTATTCAACCAATTT+AGG - Chr4:32177868-32177887 None:intergenic 15.0%
!! ATAAAATGTGATTTATAAGT+TGG + Chr4:32175647-32175666 MsG0480020024.01.T01:intron 15.0%
!! TATAGGTTATTATATTACTT+AGG - Chr4:32180018-32180037 None:intergenic 15.0%
!! TGTATATATGTATTATAAAG+TGG + Chr4:32176640-32176659 MsG0480020024.01.T01:intron 15.0%
!!! AAAATGTTTTGTTATATATC+AGG - Chr4:32178192-32178211 None:intergenic 15.0%
!!! TCAATATAAAGTAGAAATTT+TGG - Chr4:32179063-32179082 None:intergenic 15.0%
!!! TCATGTAAATTTATTCTTTT+AGG + Chr4:32175502-32175521 MsG0480020024.01.T01:intron 15.0%
!! AACAATCACATAATGTTATT+AGG - Chr4:32178840-32178859 None:intergenic 20.0%
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!! ATAAAGGATCATTCATAATA+TGG - Chr4:32180791-32180810 None:intergenic 20.0%
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!! GTATTAAATGTGTATATATC+TGG - Chr4:32180609-32180628 None:intergenic 20.0%
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!!! AACAAAACATTTTAATCAAC+CGG + Chr4:32178199-32178218 MsG0480020024.01.T01:intron 20.0%
!!! AAGAAAGAAACATTTTAACA+TGG - Chr4:32176280-32176299 None:intergenic 20.0%
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! AATTTGTGTAATACTTGAAC+AGG + Chr4:32178690-32178709 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
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! CAAAGAAGAAGTTCAATAAA+GGG + Chr4:32177292-32177311 MsG0480020024.01.T01:CDS 25.0%
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! CATTAATTTCAATCTAGAAG+TGG - Chr4:32177449-32177468 None:intergenic 25.0%
! CTTATATCATTCAAATTCAG+AGG - Chr4:32179604-32179623 None:intergenic 25.0%
! GGTTATTATATTACTTAGGT+AGG - Chr4:32180014-32180033 None:intergenic 25.0%
! GTAAAGATCTCAAGTATAAT+GGG - Chr4:32178533-32178552 None:intergenic 25.0%
! GTATTTAATCAATTGCTACT+TGG - Chr4:32179962-32179981 None:intergenic 25.0%
! TAAGTTGTTAAAAAGGAACT+TGG + Chr4:32177370-32177389 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
! TAATAGATATTCGTTAAGGT+TGG - Chr4:32180046-32180065 None:intergenic 25.0%
! TAGATTGAAATTAATGGCTT+TGG + Chr4:32177453-32177472 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
! TAGTAAGCGATTTCTTAATA+GGG + Chr4:32175163-32175182 MsG0480020024.01.T01:CDS 25.0%
! TATATTATCAATCTTGTAGC+AGG + Chr4:32176850-32176869 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
! TATGCAATGATTGAAACAAA+TGG + Chr4:32179932-32179951 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
! TATTAACAGTAAGTAAAGCT+GGG + Chr4:32176080-32176099 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
! TCAAAGCAATGTAAATGATT+TGG + Chr4:32179746-32179765 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
! TCAATGTCATTATAGTTTCT+TGG - Chr4:32179509-32179528 None:intergenic 25.0%
! TGTAAAGATCTCAAGTATAA+TGG - Chr4:32178534-32178553 None:intergenic 25.0%
! TGTAGATAGAAAAAAAGCTA+TGG + Chr4:32175058-32175077 MsG0480020024.01.T01:CDS 25.0%
! TGTTAATTCTAGTGTAACAA+CGG + Chr4:32180255-32180274 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
! TTAAACTTTATCACTGTTGT+GGG + Chr4:32177820-32177839 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
! TTAACTACATGAATTGTCAA+TGG + Chr4:32180077-32180096 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
! TTAATGACTATTCCATAAGA+AGG + Chr4:32176397-32176416 MsG0480020024.01.T01:CDS 25.0%
! TTATGCATACTTCAATAGTA+GGG - Chr4:32176676-32176695 None:intergenic 25.0%
! TTCAAATATTGATCAAAGGA+TGG - Chr4:32174681-32174700 None:intergenic 25.0%
! TTCAGTATTAATTGGACTAT+GGG + Chr4:32175558-32175577 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
! TTGTGAAATCTGTAATTAAC+TGG + Chr4:32175776-32175795 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
! TTTAAACTTTATCACTGTTG+TGG + Chr4:32177819-32177838 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
! TTTCAGTATTAATTGGACTA+TGG + Chr4:32175557-32175576 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
!! ATTTTCATACCATCTTTTCT+GGG + Chr4:32175828-32175847 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
!! GTAAATGATTTGGAAAGAAA+TGG + Chr4:32179756-32179775 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
!! TATTCAACCAATTTAGGTTA+TGG - Chr4:32177862-32177881 None:intergenic 25.0%
!! TATTCATTCTTTCTTGCTTT+TGG + Chr4:32175326-32175345 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
!! TCTTTACAAGATTTAGAACA+AGG + Chr4:32178546-32178565 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
!! TTTTATCTATTGTCTCCATT+GGG + Chr4:32179675-32179694 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
!!! AAAATAATTTAGCACTGATG+TGG - Chr4:32179145-32179164 None:intergenic 25.0%
!!! AACATGCATAGTTTTATTTC+TGG + Chr4:32176893-32176912 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
!!! ACATTGCTTTGAAAATTTTG+TGG - Chr4:32179738-32179757 None:intergenic 25.0%
!!! ATGTTAAATATTTTGGGAAC+AGG - Chr4:32176878-32176897 None:intergenic 25.0%
!!! ATTCATTCTTTCTTGCTTTT+GGG + Chr4:32175327-32175346 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
!!! GCTATGAAAATATTTTAGGA+AGG + Chr4:32179544-32179563 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
!!! GTAATTAACTGGTCATTTTT+AGG + Chr4:32175787-32175806 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
!!! GTTTGGTTTTCAGTATTAAT+TGG + Chr4:32175550-32175569 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
!!! TAGATCCTGATCATATTTTT+TGG + Chr4:32179211-32179230 MsG0480020024.01.T01:intron 25.0%
AAATTGTGAGTACAAAGAGT+AGG + Chr4:32178292-32178311 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
AACAGAAGAATAAAGGGTTT+AGG + Chr4:32174793-32174812 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
AAGAAGTTGTGTATCTCATA+TGG + Chr4:32175988-32176007 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
AAGAATTAGCTGCATGAAAA+TGG - Chr4:32177549-32177568 None:intergenic 30.0%
AAGCTAATAACTACCATCTT+CGG - Chr4:32174507-32174526 None:intergenic 30.0%
AATATATTTAGTGCTTCCAC+TGG - Chr4:32177039-32177058 None:intergenic 30.0%
ACAGATAGACAAGATATGTA+AGG + Chr4:32180329-32180348 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
AGAAAAAAAGCTATGGATAG+AGG + Chr4:32175065-32175084 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
AGAAAGAAATAACAGCAGAA+AGG + Chr4:32175004-32175023 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
AGAAGTTGTGTATCTCATAT+GGG + Chr4:32175989-32176008 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
AGAATACCTCTATATGTCAA+TGG - Chr4:32178790-32178809 None:intergenic 30.0%
AGCCTTCAAATATTGATCAA+AGG - Chr4:32174685-32174704 None:intergenic 30.0%
AGTAAGCGATTTCTTAATAG+GGG + Chr4:32175164-32175183 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
ATAAAGGGATATTCGAGAAT+TGG + Chr4:32177307-32177326 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
ATAAAGGGTTTAGGAATGAA+AGG + Chr4:32174802-32174821 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
ATAAGTCATAAAAACACCAG+AGG - Chr4:32178141-32178160 None:intergenic 30.0%
ATATCTTGTCTATCTGTCAA+AGG - Chr4:32180326-32180345 None:intergenic 30.0%
ATCTGTTACTCTTTGACATT+AGG + Chr4:32176968-32176987 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
ATCTTAGAAAACATCCATTC+AGG - Chr4:32176354-32176373 None:intergenic 30.0%
ATGTTATTAGGTGATTCACA+TGG - Chr4:32178828-32178847 None:intergenic 30.0%
ATGTTGTAAGTAACCAGATT+TGG - Chr4:32180468-32180487 None:intergenic 30.0%
ATTCACAATTGAAAAGGTGA+TGG + Chr4:32179706-32179725 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
ATTCGACAAAATAACACACT+CGG + Chr4:32175358-32175377 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
CATTAGGCATGTATATAATG+CGG + Chr4:32176984-32177003 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
CCAAAGAAGAAGTTCAATAA+AGG + Chr4:32177291-32177310 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
CCTTTATTGAACTTCTTCTT+TGG - Chr4:32177294-32177313 None:intergenic 30.0%
GAAAAAAAGCTATGGATAGA+GGG + Chr4:32175066-32175085 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
GAAAGAAATAACAGCAGAAA+GGG + Chr4:32175005-32175024 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
GAGTCGAATTATATTGCAAT+TGG + Chr4:32178584-32178603 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
GATCATCAAAACCTTCTTTA+TGG - Chr4:32177690-32177709 None:intergenic 30.0%
GCATTATAAACTACGATATC+AGG - Chr4:32177348-32177367 None:intergenic 30.0%
GGAAAAACAATTCAACAAGA+AGG - Chr4:32176141-32176160 None:intergenic 30.0%
GGTTTCCATGAAAAATGAAT+TGG + Chr4:32174647-32174666 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
GTAGTAAGCGATTTCTTAAT+AGG + Chr4:32175162-32175181 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
GTATTAACAGTAAGTAAAGC+TGG + Chr4:32176079-32176098 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
GTCAAAGAGTAACAGATTAA+CGG - Chr4:32176965-32176984 None:intergenic 30.0%
GTCATCCAAAAAATATGATC+AGG - Chr4:32179219-32179238 None:intergenic 30.0%
GTTACTTATTCATTCACACT+TGG + Chr4:32178398-32178417 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
GTTATGCATACTTCAATAGT+AGG - Chr4:32176677-32176696 None:intergenic 30.0%
TAAACATTACAGATATCTCG+TGG + Chr4:32176180-32176199 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
TAAAGGGATATTCGAGAATT+GGG + Chr4:32177308-32177327 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
TACATGAATTGTCAATGGTA+TGG + Chr4:32180082-32180101 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
TCAACCGGAGAATTAAAATT+AGG + Chr4:32178214-32178233 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
TCCTAACAATGTTATCAGTA+AGG + Chr4:32175241-32175260 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
TGATCAATATTTGAAGGCTA+TGG + Chr4:32174686-32174705 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
TTATTGAACTTCTTCTTTGG+TGG - Chr4:32177291-32177310 None:intergenic 30.0%
TTTAGACTCAAAATCTGATG+AGG + Chr4:32174863-32174882 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
TTTCAATCTATAACTTGGCT+TGG - Chr4:32176715-32176734 None:intergenic 30.0%
! ACACTTTTCGCATAAAGAAA+TGG + Chr4:32175265-32175284 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
! ACATTTGTTGCTGAAAGAAA+AGG - Chr4:32177167-32177186 None:intergenic 30.0%
! ATCACCTTTTCAATTGTGAA+TGG - Chr4:32179707-32179726 None:intergenic 30.0%
! ATGTGTATACCTTAGTCTTT+CGG + Chr4:32177786-32177805 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
! ATTTCGCTATATCTTTTACC+CGG - Chr4:32175092-32175111 None:intergenic 30.0%
! CAATTTAGGTTATGGAGTAT+GGG - Chr4:32177854-32177873 None:intergenic 30.0%
! CATTTTCATACCATCTTTTC+TGG + Chr4:32175827-32175846 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
! GATTGAAATTAATGGCTTTG+GGG + Chr4:32177455-32177474 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
! GTTATTAGCTTGGAATTCAA+CGG + Chr4:32174516-32174535 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
! GTTTTATCTATTGTCTCCAT+TGG + Chr4:32179674-32179693 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
! TTATGATTCTGATGATTTGG+TGG + Chr4:32175187-32175206 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
! TTATTAGCTTGGAATTCAAC+GGG + Chr4:32174517-32174536 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTCATGGAAACCATAACT+GGG - Chr4:32174641-32174660 None:intergenic 30.0%
! TTTTTCATGGAAACCATAAC+TGG - Chr4:32174642-32174661 None:intergenic 30.0%
!! GTGAATACATTTTGGAAAGA+GGG + Chr4:32178892-32178911 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
!! TAAGGGGACTTTAGAATATA+TGG - Chr4:32179306-32179325 None:intergenic 30.0%
!! TCAGTTGACATAAGTTGATT+GGG + Chr4:32180153-32180172 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
!! TCTCAATTTTAACCCAGTTA+TGG + Chr4:32174626-32174645 MsG0480020024.01.T01:CDS 30.0%
!! TTCAGTTGACATAAGTTGAT+TGG + Chr4:32180152-32180171 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
!! TTCATTCTTTCTTGCTTTTG+GGG + Chr4:32175328-32175347 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
!!! AACATATTTTGAGACTAGTG+TGG + Chr4:32179180-32179199 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
!!! ACAGCCTAATTTTAATTCTC+CGG - Chr4:32178221-32178240 None:intergenic 30.0%
!!! TAACTGGTCATTTTTAGGAA+TGG + Chr4:32175792-32175811 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTATTTCTGGCTAGTGAA+TGG + Chr4:32176904-32176923 MsG0480020024.01.T01:intron 30.0%
AAAAATTGATGAGGCTGTCT+CGG + Chr4:32178915-32178934 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
AAAATTATCACCACCACCAA+GGG - Chr4:32175039-32175058 None:intergenic 35.0%
AAAGGAAGCAGAAATCTGAT+GGG + Chr4:32174820-32174839 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
AACAACAATAACACCGAAGA+TGG + Chr4:32174491-32174510 MsG0480020024.01.T01:exon 35.0%
AACTATGTACTGCTAGACAT+GGG - Chr4:32179364-32179383 None:intergenic 35.0%
AATAGAATCAGAAACGGAGA+AGG - Chr4:32177893-32177912 None:intergenic 35.0%
AGAAGGCTTATCACAATCTT+AGG + Chr4:32176414-32176433 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
AGACATGTGTGATCAAAAGA+TGG + Chr4:32176740-32176759 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
AGCGGAAAACAGAAGAATAA+AGG + Chr4:32174786-32174805 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
ATCACAATCTTAGGCAATCT+AGG + Chr4:32176423-32176442 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
ATCATGAAACTGAGCAACAA+CGG - Chr4:32177952-32177971 None:intergenic 35.0%
ATCTAAAAAGCTGAGTATGG+TGG - Chr4:32176019-32176038 None:intergenic 35.0%
ATGTGCTGCAGAAAAAAGAT+GGG + Chr4:32180641-32180660 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
ATTAAGTCGAATTTGAACGG+TGG + Chr4:32174915-32174934 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
ATTCAACCTGTTCGAGAAAA+TGG - Chr4:32176313-32176332 None:intergenic 35.0%
CCATACTCCATAACCTAAAT+TGG + Chr4:32177852-32177871 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
CCTAATCCATTGACATATAG+AGG + Chr4:32178781-32178800 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
CCTTCTTTATGGAAATCCAA+AGG - Chr4:32177679-32177698 None:intergenic 35.0%
CCTTTGGATTTCCATAAAGA+AGG + Chr4:32177676-32177695 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
CGGTAGTTGTGCAATTTAAA+AGG + Chr4:32180275-32180294 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
CGTTAAGGTTGGAGAATTAT+AGG - Chr4:32180035-32180054 None:intergenic 35.0%
CTATGATAAGCTACTAAGTC+AGG - Chr4:32177198-32177217 None:intergenic 35.0%
CTTCTTCCCTGGATTAAAAT+GGG + Chr4:32175949-32175968 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
GAAAGAGGGAAAAATTGATG+AGG + Chr4:32178906-32178925 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
GAAGATGGTAGTTATTAGCT+TGG + Chr4:32174506-32174525 MsG0480020024.01.T01:exon 35.0%
GAGTGATACAAGTCATTGAA+TGG + Chr4:32176457-32176476 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
GATTGTGATAAGCCTTCTTA+TGG - Chr4:32176412-32176431 None:intergenic 35.0%
GCCTTACTGATAACATTGTT+AGG - Chr4:32175245-32175264 None:intergenic 35.0%
GCGGAAAACAGAAGAATAAA+GGG + Chr4:32174787-32174806 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
GGAAGAGAAAGAGAAAGAAT+TGG - Chr4:32174574-32174593 None:intergenic 35.0%
GGATCCATTCACAATTGAAA+AGG + Chr4:32179700-32179719 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
GGGTTATGATTCTGATGATT+TGG + Chr4:32175184-32175203 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
GGTATCCAAATTTGCGTAAA+TGG + Chr4:32177742-32177761 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
GTATGACGAATAGAAATGGA+CGG + Chr4:32175117-32175136 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
GTCCTTAATGCATGTGTTAA+GGG + Chr4:32178014-32178033 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
GTTGCTCAGTTTCATGATTA+AGG + Chr4:32177954-32177973 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
TAAGGTTGCAAATAAACCAC+TGG + Chr4:32180347-32180366 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
TATTCAGCAACACTAATGTC+AGG - Chr4:32176162-32176181 None:intergenic 35.0%
TCAACAGATTGTAACAGACA+AGG + Chr4:32179436-32179455 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
TCAGAGGAAATTCTTCCAAA+AGG - Chr4:32179588-32179607 None:intergenic 35.0%
TCCTTAATGCATGTGTTAAG+GGG + Chr4:32178015-32178034 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
TGGACATCAATTTACCTGAA+TGG + Chr4:32176337-32176356 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
TTAAAAGGCTTGATCACTGA+TGG + Chr4:32180290-32180309 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
TTCAGTGTAAACTCTTGAGT+TGG + Chr4:32179097-32179116 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
TTCGACAAAATAACACACTC+GGG + Chr4:32175359-32175378 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
TTCTCAATGTGTGTGATCTT+AGG + Chr4:32176233-32176252 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
TTCTTCCCTGGATTAAAATG+GGG + Chr4:32175950-32175969 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
TTGGATTGAAGTGATAACCA+TGG - Chr4:32180701-32180720 None:intergenic 35.0%
TTGTAGTAACAAGCAGCTAA+TGG - Chr4:32177632-32177651 None:intergenic 35.0%
TTTGGATACCAAAATTCACC+CGG - Chr4:32177732-32177751 None:intergenic 35.0%
! ACCATACTCAGCTTTTTAGA+TGG + Chr4:32176018-32176037 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
! AGTTTGTTCAGCATTACATC+TGG - Chr4:32179409-32179428 None:intergenic 35.0%
! ATCATCTTGAATGTTTTCCC+GGG + Chr4:32177711-32177730 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
! CAGTTCTCGTGAATACATTT+TGG + Chr4:32178884-32178903 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
! CATAGTATTGCTGTTACTCT+TGG + Chr4:32177213-32177232 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
! CATCATCTTGAATGTTTTCC+CGG + Chr4:32177710-32177729 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
! CCAATTTAGGTTATGGAGTA+TGG - Chr4:32177855-32177874 None:intergenic 35.0%
! CCATACTCAGCTTTTTAGAT+GGG + Chr4:32176019-32176038 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
! CCTCTATATGTCAATGGATT+AGG - Chr4:32178784-32178803 None:intergenic 35.0%
! CTTTTCGCATAAAGAAATGG+AGG + Chr4:32175268-32175287 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
! GAGAGTATGACGAATAGAAA+TGG + Chr4:32175113-32175132 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
! GATGATGTTTTCACATGTGA+TGG - Chr4:32179387-32179406 None:intergenic 35.0%
! TGAAAGCATACGTTGATCAT+GGG + Chr4:32180493-32180512 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
! TGATGCCATTTACGCAAATT+TGG - Chr4:32177750-32177769 None:intergenic 35.0%
! TTTATTCTTCTGTTTTCCGC+TGG - Chr4:32174787-32174806 None:intergenic 35.0%
!! ATCATTCGAAGATGTCGTTT+TGG - Chr4:32180720-32180739 None:intergenic 35.0%
!! ATTTTCTCGAACAGGTTGAA+TGG + Chr4:32176312-32176331 MsG0480020024.01.T01:intron 35.0%
!! ATTTTGACCATGTTTACCAG+AGG + Chr4:32180667-32180686 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
!! CGTGAATACATTTTGGAAAG+AGG + Chr4:32178891-32178910 MsG0480020024.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTCTCCCCATTTTAATCCA+GGG - Chr4:32175958-32175977 None:intergenic 35.0%
!! TTTTCTCCCCATTTTAATCC+AGG - Chr4:32175959-32175978 None:intergenic 35.0%
AACAAGTTAGGCCTTTGCTT+CGG + Chr4:32175596-32175615 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
AATTCGACTCAACCAGAAGT+AGG - Chr4:32178574-32178593 None:intergenic 40.0%
AATTGTCAATGGTATGGCCT+CGG + Chr4:32180088-32180107 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
ACATCTTCGAATGATACTGG+AGG + Chr4:32180725-32180744 MsG0480020024.01.T01:CDS 40.0%
ACGACATCTTCGAATGATAC+TGG + Chr4:32180722-32180741 MsG0480020024.01.T01:CDS 40.0%
ACTATGTACTGCTAGACATG+GGG - Chr4:32179363-32179382 None:intergenic 40.0%
AGAAATAACAGCAGAAAGGG+TGG + Chr4:32175008-32175027 MsG0480020024.01.T01:CDS 40.0%
AGAACGAGAAAGAAGTGGAT+AGG - Chr4:32174601-32174620 None:intergenic 40.0%
AGATCACACACATTGAGAAC+AGG - Chr4:32176232-32176251 None:intergenic 40.0%
AGCAGCATTCAAGAATCTTG+AGG + Chr4:32175217-32175236 MsG0480020024.01.T01:CDS 40.0%
ATCTATTGTCTCCATTGGGA+TGG + Chr4:32179679-32179698 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
ATGCAAGTACCTTGGCTTAT+GGG - Chr4:32176508-32176527 None:intergenic 40.0%
ATGGAAAGACGTGGAATTGT+TGG + Chr4:32178949-32178968 MsG0480020024.01.T01:CDS 40.0%
ATGTGTTAAGGGGAAACAGT+GGG + Chr4:32178025-32178044 MsG0480020024.01.T01:CDS 40.0%
ATTGGGAAACCATGATTCCA+TGG + Chr4:32178602-32178621 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
CAAAATTATCACCACCACCA+AGG - Chr4:32175040-32175059 None:intergenic 40.0%
CAGCATATCTTTGCAATTGG+AGG + Chr4:32177423-32177442 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
CATAACTAGACCATATGTCG+CGG - Chr4:32178105-32178124 None:intergenic 40.0%
CATGTGCTGCAGAAAAAAGA+TGG + Chr4:32180640-32180659 MsG0480020024.01.T01:CDS 40.0%
CCAATTGCAAAGATATGCTG+TGG - Chr4:32177423-32177442 None:intergenic 40.0%
CCACAGCATATCTTTGCAAT+TGG + Chr4:32177420-32177439 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
CCCATCTAAAAAGCTGAGTA+TGG - Chr4:32176022-32176041 None:intergenic 40.0%
CCTTCTTCCCTGGATTAAAA+TGG + Chr4:32175948-32175967 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
CGGGAAAACATTCAAGATGA+TGG - Chr4:32177712-32177731 None:intergenic 40.0%
GAAAGGAAGCAGAAATCTGA+TGG + Chr4:32174819-32174838 MsG0480020024.01.T01:CDS 40.0%
GAACTATGTACTGCTAGACA+TGG - Chr4:32179365-32179384 None:intergenic 40.0%
GACATATGGTCTAGTTATGG+AGG + Chr4:32178106-32178125 MsG0480020024.01.T01:CDS 40.0%
GCATACTTCAATAGTAGGGT+TGG - Chr4:32176672-32176691 None:intergenic 40.0%
GGTCATTCTGCTTGCATTAA+GGG - Chr4:32179323-32179342 None:intergenic 40.0%
GGTCCTTAATGCATGTGTTA+AGG + Chr4:32178013-32178032 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
GTCATTCTGCTTGCATTAAG+GGG - Chr4:32179322-32179341 None:intergenic 40.0%
TACAGATATCTCGTGGTAAG+TGG + Chr4:32176187-32176206 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
TACTTAGGTAGGTAGGAGTA+TGG - Chr4:32180003-32180022 None:intergenic 40.0%
TAGAACAAGGTTCCTACTTC+TGG + Chr4:32178559-32178578 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
TAGTATGACTAACACCTGAG+TGG + Chr4:32176543-32176562 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
TATGCAAGTACCTTGGCTTA+TGG - Chr4:32176509-32176528 None:intergenic 40.0%
TCATGCAGCTAATTCTTGAC+TGG + Chr4:32177552-32177571 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
TCCCCTTAACACATGCATTA+AGG - Chr4:32178019-32178038 None:intergenic 40.0%
TCTTAGGCAATCTAGGAAAC+TGG + Chr4:32176430-32176449 MsG0480020024.01.T01:CDS 40.0%
TTAAACTTCTGCCGAAGCAA+AGG - Chr4:32175610-32175629 None:intergenic 40.0%
TTCACACTTGGAGTTGAAGA+AGG + Chr4:32178410-32178429 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
TTCATGTGGCAAGTACAACT+TGG + Chr4:32178720-32178739 MsG0480020024.01.T01:CDS 40.0%
TTCCACGTCTTTCCATTTCA+TGG - Chr4:32178945-32178964 None:intergenic 40.0%
TTCTTGACACTGCACTTTAC+TGG + Chr4:32175528-32175547 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
TTGAGTCTAAACTACGACTC+CGG - Chr4:32174854-32174873 None:intergenic 40.0%
TTGGATACCAAAATTCACCC+GGG - Chr4:32177731-32177750 None:intergenic 40.0%
TTTCGAGAACGAGAAAGAAG+TGG - Chr4:32174606-32174625 None:intergenic 40.0%
! ATGTTTTCCCGGGTGAATTT+TGG + Chr4:32177721-32177740 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
! CATACTGTTTAGCTAGCTTC+TGG - Chr4:32175301-32175320 None:intergenic 40.0%
! CTGAAAGCATACGTTGATCA+TGG + Chr4:32180492-32180511 MsG0480020024.01.T01:CDS 40.0%
! GAACAGGTGATGTTTTCATG+TGG + Chr4:32178706-32178725 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
! GAAGTTTTCCAGTTCTTCCA+TGG - Chr4:32178622-32178641 None:intergenic 40.0%
! GACTCTGGAAACATTCAAGA+CGG + Chr4:32180405-32180424 MsG0480020024.01.T01:CDS 40.0%
! GTTTTCAATCCCATAAGCCA+AGG + Chr4:32176496-32176515 MsG0480020024.01.T01:CDS 40.0%
! TGTTGACCATTTTCTCGAAC+AGG + Chr4:32176304-32176323 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
! TTTCCTGAGTCAAGACCTTT+TGG + Chr4:32179570-32179589 MsG0480020024.01.T01:intron 40.0%
!! ATAGTTTCTTGGTGTTGCGT+GGG - Chr4:32179498-32179517 None:intergenic 40.0%
!! CCATTTTAATCCAGGGAAGA+AGG - Chr4:32175951-32175970 None:intergenic 40.0%
!! TATAGTTTCTTGGTGTTGCG+TGG - Chr4:32179499-32179518 None:intergenic 40.0%
!! TGATTCTGATGATTTGGTGG+TGG + Chr4:32175190-32175209 MsG0480020024.01.T01:CDS 40.0%
AAAAGCTATGGATAGAGGGC+CGG + Chr4:32175070-32175089 MsG0480020024.01.T01:CDS 45.0%
AACACGATGCCGAAAGACTA+AGG - Chr4:32177798-32177817 None:intergenic 45.0%
ACAGCATCCTCTGGTAAACA+TGG - Chr4:32180677-32180696 None:intergenic 45.0%
ACTGCCTCTGCTTTGCATTA+TGG + Chr4:32174546-32174565 MsG0480020024.01.T01:CDS 45.0%
ACTTTATCACTGTTGTGGGC+AGG + Chr4:32177824-32177843 MsG0480020024.01.T01:intron 45.0%
AGAAAGAAGTGGATAGGACG+AGG - Chr4:32174595-32174614 None:intergenic 45.0%
AGAAAGGGTGGTAAAACCCT+TGG + Chr4:32175020-32175039 MsG0480020024.01.T01:CDS 45.0%
ATACTGGAGGCTTCAAGAAC+TGG + Chr4:32180738-32180757 MsG0480020024.01.T01:CDS 45.0%
ATGCAAGCATGTCTAGACTC+TGG + Chr4:32180390-32180409 MsG0480020024.01.T01:CDS 45.0%
CACATGCTATGCAAGTACCT+TGG - Chr4:32176516-32176535 None:intergenic 45.0%
CATGTGTTAAGGGGAAACAG+TGG + Chr4:32178024-32178043 MsG0480020024.01.T01:CDS 45.0%
CCAGTTCTTCCATGGAATCA+TGG - Chr4:32178614-32178633 None:intergenic 45.0%
CCATGATTCCATGGAAGAAC+TGG + Chr4:32178611-32178630 MsG0480020024.01.T01:intron 45.0%
CGATGTAGGCAGAACAAGTT+AGG + Chr4:32175584-32175603 MsG0480020024.01.T01:intron 45.0%
CGCGACATATGGTCTAGTTA+TGG + Chr4:32178103-32178122 MsG0480020024.01.T01:CDS 45.0%
CTATGTACTGCTAGACATGG+GGG - Chr4:32179362-32179381 None:intergenic 45.0%
CTCGGTATGATGTGTTTCAC+AGG + Chr4:32180106-32180125 MsG0480020024.01.T01:intron 45.0%
CTGTGAAACACATCATACCG+AGG - Chr4:32180108-32180127 None:intergenic 45.0%
CTGTTACTCTTGGACAAGCA+GGG + Chr4:32177223-32177242 MsG0480020024.01.T01:CDS 45.0%
CTTCCAAAAGGTCTTGACTC+AGG - Chr4:32179576-32179595 None:intergenic 45.0%
GAGAGTTATCGACAGACACA+TGG - Chr4:32175731-32175750 None:intergenic 45.0%
GGACATTTGTGCTCCAAATC+TGG + Chr4:32180452-32180471 MsG0480020024.01.T01:CDS 45.0%
GGGTCATTCTGCTTGCATTA+AGG - Chr4:32179324-32179343 None:intergenic 45.0%
GGTTGCAAATAAACCACTGG+TGG + Chr4:32180350-32180369 MsG0480020024.01.T01:CDS 45.0%
GTCCATGAAATGGAAAGACG+TGG + Chr4:32178940-32178959 MsG0480020024.01.T01:CDS 45.0%
TATGTACTGCTAGACATGGG+GGG - Chr4:32179361-32179380 None:intergenic 45.0%
TATTCGAGAATTGGGACCCA+AGG + Chr4:32177316-32177335 MsG0480020024.01.T01:CDS 45.0%
TCTGTCGATAACTCTCAAGC+TGG + Chr4:32175735-32175754 MsG0480020024.01.T01:intron 45.0%
TGACGAATAGAAATGGACGG+AGG + Chr4:32175120-32175139 MsG0480020024.01.T01:CDS 45.0%
TGCAGCACATGCATCTAACA+TGG - Chr4:32180631-32180650 None:intergenic 45.0%
TGGGAGAGACTCGTTATTTG+TGG + Chr4:32175847-32175866 MsG0480020024.01.T01:intron 45.0%
TGTGAATGGATCCATCCCAA+TGG - Chr4:32179693-32179712 None:intergenic 45.0%
TTAGGCTATGCTCAGCAAAG+TGG - Chr4:32179839-32179858 None:intergenic 45.0%
TTGATGCACTTGGGAAGTTG+AGG + Chr4:32177010-32177029 MsG0480020024.01.T01:CDS 45.0%
! ATTCTTCTGTTTTCCGCTGG+AGG - Chr4:32174784-32174803 None:intergenic 45.0%
! CAAGGTACTTGCATAGCATG+TGG + Chr4:32176514-32176533 MsG0480020024.01.T01:intron 45.0%
! GACACTGCACTTTACTGGTT+TGG + Chr4:32175533-32175552 MsG0480020024.01.T01:intron 45.0%
! GGTGACAGATGTAACTTGTG+AGG - Chr4:32179124-32179143 None:intergenic 45.0%
!! GACATAAGTTGATTGGGCCA+TGG + Chr4:32180159-32180178 MsG0480020024.01.T01:intron 45.0%
!!! AACAGTGGGAAGGAGCATTT+TGG + Chr4:32178039-32178058 MsG0480020024.01.T01:CDS 45.0%
!!! ACAGTGGGAAGGAGCATTTT+GGG + Chr4:32178040-32178059 MsG0480020024.01.T01:CDS 45.0%
AAAGCTATGGATAGAGGGCC+GGG + Chr4:32175071-32175090 MsG0480020024.01.T01:CDS 50.0%
AACCATGGTACAGCATCCTC+TGG - Chr4:32180686-32180705 None:intergenic 50.0%
AAGGGTGGTAAAACCCTTGG+TGG + Chr4:32175023-32175042 MsG0480020024.01.T01:CDS 50.0%
AATGCGGCACTTGATGCACT+TGG + Chr4:32177000-32177019 MsG0480020024.01.T01:CDS 50.0%
ACGATATCAGGTTCCAGCCT+TGG - Chr4:32177336-32177355 None:intergenic 50.0%
ATGCGGCACTTGATGCACTT+GGG + Chr4:32177001-32177020 MsG0480020024.01.T01:CDS 50.0%
ATGGAGGTAGTAGTTGCCTC+TGG + Chr4:32178122-32178141 MsG0480020024.01.T01:intron 50.0%
CACCTGAGTGGCAAGTGATT+AGG + Chr4:32176555-32176574 MsG0480020024.01.T01:intron 50.0%
CAGGCGTGTGATGAGTATGA+TGG + Chr4:32180125-32180144 MsG0480020024.01.T01:intron 50.0%
CGAGTCTCTCCCAGAAAAGA+TGG - Chr4:32175840-32175859 None:intergenic 50.0%
CGATATCAGGTTCCAGCCTT+GGG - Chr4:32177335-32177354 None:intergenic 50.0%
CGGAGGAATGTCAAGTCGAA+TGG + Chr4:32175137-32175156 MsG0480020024.01.T01:CDS 50.0%
GCTGTTACTCTTGGACAAGC+AGG + Chr4:32177222-32177241 MsG0480020024.01.T01:CDS 50.0%
GGAAGAAGGCTACTCACAGA+TGG - Chr4:32175937-32175956 None:intergenic 50.0%
GGAGGCTTCAAGAACTGGAA+AGG + Chr4:32180743-32180762 MsG0480020024.01.T01:CDS 50.0%
GGCACCATAATGCAAAGCAG+AGG - Chr4:32174553-32174572 None:intergenic 50.0%
GGGGGGAGGTTTAGATGATA+GGG - Chr4:32179344-32179363 None:intergenic 50.0%
GTTAAGGGGAAACAGTGGGA+AGG + Chr4:32178029-32178048 MsG0480020024.01.T01:CDS 50.0%
TACCAGAGGATGCTGTACCA+TGG + Chr4:32180681-32180700 MsG0480020024.01.T01:CDS 50.0%
TCTCTACAACACTCCCACCA+CGG - Chr4:32174941-32174960 None:intergenic 50.0%
TGAAACTGAGCAACAACGGC+AGG - Chr4:32177948-32177967 None:intergenic 50.0%
TGCCTAATCACTTGCCACTC+AGG - Chr4:32176560-32176579 None:intergenic 50.0%
TGCTTGCATCAAGCCAGTGT+AGG - Chr4:32180379-32180398 None:intergenic 50.0%
TGGACTATGGGAGTCGATGT+AGG + Chr4:32175570-32175589 MsG0480020024.01.T01:intron 50.0%
TGGGGGGAGGTTTAGATGAT+AGG - Chr4:32179345-32179364 None:intergenic 50.0%
TGTCTCGGCTGTCCATGAAA+TGG + Chr4:32178930-32178949 MsG0480020024.01.T01:CDS 50.0%
! CTCGAACAGGTTGAATGGTG+TGG + Chr4:32176317-32176336 MsG0480020024.01.T01:intron 50.0%
! GATGAAGTATCCTCCTCCAG+CGG + Chr4:32174768-32174787 MsG0480020024.01.T01:CDS 50.0%
!! CTGTGATGTGCTGTTTCTGG+AGG - Chr4:32178326-32178345 None:intergenic 50.0%
!! GCTCTGTGATGTGCTGTTTC+TGG - Chr4:32178329-32178348 None:intergenic 50.0%
!! GTAGGTGGATGGTGGGATAT+TGG - Chr4:32179476-32179495 None:intergenic 50.0%
!! TTTCTTGGTGTTGCGTGGGT+AGG - Chr4:32179494-32179513 None:intergenic 50.0%
AATTTGAACGGTGGCCGTGG+TGG + Chr4:32174924-32174943 MsG0480020024.01.T01:CDS 55.0%
AGACCATATGTCGCGGCAGA+AGG - Chr4:32178098-32178117 None:intergenic 55.0%
ATTTGAACGGTGGCCGTGGT+GGG + Chr4:32174925-32174944 MsG0480020024.01.T01:CDS 55.0%
CAACCTTCTGCCGCGACATA+TGG + Chr4:32178092-32178111 MsG0480020024.01.T01:CDS 55.0%
CTGTGAGTAGCCTTCTTCCC+TGG + Chr4:32175938-32175957 MsG0480020024.01.T01:intron 55.0%
GACTTCGTCCAGCTGTACAG+AGG - Chr4:32179008-32179027 None:intergenic 55.0%
GGTGGTAAAACCCTTGGTGG+TGG + Chr4:32175026-32175045 MsG0480020024.01.T01:CDS 55.0%
TCGAATTTGAACGGTGGCCG+TGG + Chr4:32174921-32174940 MsG0480020024.01.T01:CDS 55.0%
TGGGAAGTTGAGGAGACCAG+TGG + Chr4:32177020-32177039 MsG0480020024.01.T01:CDS 55.0%
! AATCTGATGGGTCGAAGCGC+CGG + Chr4:32174832-32174851 MsG0480020024.01.T01:CDS 55.0%
! CTTCTGTTTTCCGCTGGAGG+AGG - Chr4:32174781-32174800 None:intergenic 55.0%
!! GGTGGGAGTGTTGTAGAGAG+AGG + Chr4:32174942-32174961 MsG0480020024.01.T01:CDS 55.0%
CCAGTGTAGGTCACCACCAG+TGG - Chr4:32180366-32180385 None:intergenic 60.0%
CGAGAATTGGGACCCAAGGC+TGG + Chr4:32177320-32177339 MsG0480020024.01.T01:CDS 60.0%
GCTCGATGCCTCTGTACAGC+TGG + Chr4:32178997-32179016 MsG0480020024.01.T01:CDS 60.0%
GTACTGCTAGACATGGGGGG+AGG - Chr4:32179358-32179377 None:intergenic 60.0%
GTGTTGCGTGGGTAGGTGGA+TGG - Chr4:32179487-32179506 None:intergenic 60.0%
TACAGCTGGACGAAGTCGCG+AGG + Chr4:32179011-32179030 MsG0480020024.01.T01:CDS 60.0%
TGCGTGGGTAGGTGGATGGT+GGG - Chr4:32179483-32179502 None:intergenic 60.0%
TTGCGTGGGTAGGTGGATGG+TGG - Chr4:32179484-32179503 None:intergenic 60.0%
! CCACTGGTGGTGACCTACAC+TGG + Chr4:32180363-32180382 MsG0480020024.01.T01:CDS 60.0%
!! AAGTCGCGAGGCACTGATGC+AGG + Chr4:32179023-32179042 MsG0480020024.01.T01:CDS 60.0%
!! CTTGGTGTTGCGTGGGTAGG+TGG - Chr4:32179491-32179510 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 32174491 32180812 32174491 ID=MsG0480020024.01;Name=MsG0480020024.01
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Gene Sequence

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Protein sequence

>MsG0480020024.01.T01

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