AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880043924.01


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MsG0880043924.01.T01 AT1G63360 25.458 491 297 19 204 655 185 645 2.31e-21 99.8
MsG0880043924.01.T01 AT1G63360 25.458 491 297 19 204 655 150 610 2.75e-21 99.4
MsG0880043924.01.T01 AT5G47250 24.066 482 300 15 193 655 178 612 3.97e-21 99.0
MsG0880043924.01.T01 AT4G26090 25.292 514 320 22 156 641 144 621 6.11e-20 95.1
MsG0880043924.01.T01 AT1G63750 25.543 552 315 24 166 655 190 707 1.08e-19 94.7
MsG0880043924.01.T01 AT1G63750 25.543 552 315 24 166 655 23 540 1.40e-19 94.4
MsG0880043924.01.T01 AT1G63750 25.543 552 315 24 166 655 23 540 1.40e-19 94.4
MsG0880043924.01.T01 AT1G12280 23.975 488 290 19 167 632 119 547 2.19e-19 93.6
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MsG0880043924.01.T01 AT5G11250 25.331 529 284 21 187 655 171 648 6.20e-18 89.0
MsG0880043924.01.T01 AT5G40910 25.599 543 309 20 167 655 185 686 1.08e-17 88.2
MsG0880043924.01.T01 AT5G40910 25.599 543 309 20 167 655 185 686 1.08e-17 88.2
MsG0880043924.01.T01 AT5G40910 25.599 543 309 20 167 655 1 502 1.35e-17 87.8
MsG0880043924.01.T01 AT5G40910 25.599 543 309 20 167 655 1 502 1.35e-17 87.8
MsG0880043924.01.T01 AT5G40910 25.599 543 309 20 167 655 1 502 1.73e-17 87.4
MsG0880043924.01.T01 AT5G40910 25.599 543 309 20 167 655 1 502 1.73e-17 87.4
MsG0880043924.01.T01 AT5G40910 25.599 543 309 20 167 655 1 502 1.73e-17 87.4
MsG0880043924.01.T01 AT5G40910 25.599 543 309 20 167 655 1 502 1.73e-17 87.4
MsG0880043924.01.T01 AT5G40910 25.599 543 309 20 167 655 1 502 1.73e-17 87.4
MsG0880043924.01.T01 AT3G44670 25.461 542 275 22 187 655 285 770 2.39e-17 87.0
MsG0880043924.01.T01 AT3G44670 25.461 542 275 22 187 655 285 770 2.39e-17 87.0
MsG0880043924.01.T01 AT5G18350 24.783 577 323 25 156 655 181 723 2.48e-17 87.0
MsG0880043924.01.T01 AT5G18360 25.636 550 320 25 156 655 174 684 6.69e-17 85.5
MsG0880043924.01.T01 AT1G17600 24.007 554 333 24 150 655 167 680 1.72e-16 84.3
MsG0880043924.01.T01 AT2G14080 24.820 693 370 32 43 656 109 729 1.85e-16 84.3
MsG0880043924.01.T01 AT5G41540 24.762 525 294 20 187 655 201 680 3.33e-16 83.6
MsG0880043924.01.T01 AT3G44480 25.216 579 273 24 187 656 289 816 3.69e-16 83.2
MsG0880043924.01.T01 AT3G44480 25.216 579 273 24 187 656 289 816 3.69e-16 83.2
MsG0880043924.01.T01 AT3G44480 25.216 579 273 24 187 656 289 816 3.74e-16 83.2
MsG0880043924.01.T01 AT3G44480 25.216 579 273 24 187 656 289 816 3.74e-16 83.2
MsG0880043924.01.T01 AT3G44480 25.632 554 276 24 187 655 289 791 4.05e-16 83.2
MsG0880043924.01.T01 AT2G14080 25.234 535 283 23 187 656 114 596 1.01e-15 82.0
MsG0880043924.01.T01 AT5G47260 22.289 498 311 15 190 655 168 621 2.47e-15 80.5
MsG0880043924.01.T01 AT5G41550 25.182 548 300 24 167 655 186 682 4.22e-15 79.7
MsG0880043924.01.T01 AT1G10920 26.842 380 235 15 315 659 1 372 2.27e-14 77.0
MsG0880043924.01.T01 AT1G10920 26.842 380 235 15 315 659 1 372 2.27e-14 77.0
MsG0880043924.01.T01 AT5G41740 24.165 509 295 20 187 647 193 658 7.12e-14 75.9
MsG0880043924.01.T01 AT5G41740 24.272 515 299 20 187 653 193 664 8.32e-14 75.9
MsG0880043924.01.T01 AT5G41740 24.165 509 295 20 187 647 41 506 1.04e-13 75.5
MsG0880043924.01.T01 AT5G38340 23.361 595 325 24 130 655 201 733 1.34e-13 75.1
MsG0880043924.01.T01 AT5G38340 23.361 595 325 24 130 655 201 733 1.34e-13 75.1
MsG0880043924.01.T01 AT1G63880 24.517 518 300 25 187 653 204 681 2.08e-13 74.3
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MsG0880043924.01.T01 AT1G63880 24.517 518 300 25 187 653 204 681 3.51e-13 73.6
MsG0880043924.01.T01 AT4G14370 23.757 543 308 21 166 653 186 677 4.11e-13 73.6
MsG0880043924.01.T01 AT4G14370 23.757 543 308 21 166 653 186 677 4.11e-13 73.6
MsG0880043924.01.T01 AT4G08450 25.143 525 291 21 193 656 204 687 4.26e-13 73.6
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MsG0880043924.01.T01 AT1G27180 26.250 320 170 15 154 455 16 287 6.16e-13 72.8
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MsG0880043924.01.T01 AT1G27180 26.250 320 170 15 154 455 16 287 6.16e-13 72.8
MsG0880043924.01.T01 AT5G48770 23.921 556 324 22 151 653 170 679 6.54e-13 72.8
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MsG0880043924.01.T01 AT1G27180 26.250 320 170 15 154 455 190 461 7.46e-13 72.8
MsG0880043924.01.T01 AT1G27180 26.250 320 170 15 154 455 192 463 7.73e-13 72.8
MsG0880043924.01.T01 AT1G27170 26.280 293 165 11 167 442 189 447 8.05e-13 72.8
MsG0880043924.01.T01 AT1G27170 26.280 293 165 11 167 442 189 447 8.12e-13 72.8
MsG0880043924.01.T01 AT1G27180 26.250 320 170 15 154 455 192 463 8.28e-13 72.4
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MsG0880043924.01.T01 AT5G17680 24.717 530 292 23 193 664 209 689 2.26e-12 71.2
MsG0880043924.01.T01 AT5G17680 24.717 530 292 23 193 664 208 688 2.49e-12 70.9
MsG0880043924.01.T01 AT5G58120 22.478 565 316 20 166 667 187 692 3.05e-12 70.5
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MsG0880043924.01.T01 AT3G04220 27.103 321 182 13 157 462 225 508 4.57e-12 70.1
MsG0880043924.01.T01 AT3G04220 26.769 325 178 14 157 462 225 508 4.60e-12 69.7
MsG0880043924.01.T01 AT4G16920 24.466 421 238 19 57 452 78 443 6.86e-12 69.7
MsG0880043924.01.T01 AT4G16920 24.466 421 238 19 57 452 78 443 6.86e-12 69.7
MsG0880043924.01.T01 AT4G16920 24.466 421 238 19 57 452 78 443 7.39e-12 69.3
MsG0880043924.01.T01 AT4G16920 24.466 421 238 19 57 452 78 443 7.54e-12 69.3
MsG0880043924.01.T01 AT4G16920 24.466 421 238 19 57 452 78 443 8.62e-12 69.3
MsG0880043924.01.T01 AT4G16920 24.466 421 238 19 57 452 78 443 8.72e-12 69.3
MsG0880043924.01.T01 AT4G16920 24.466 421 238 19 57 452 78 443 8.72e-12 69.3
MsG0880043924.01.T01 AT4G16920 24.466 421 238 19 57 452 78 443 1.04e-11 68.9
MsG0880043924.01.T01 AT4G16920 24.466 421 238 19 57 452 78 443 1.04e-11 68.9
MsG0880043924.01.T01 AT5G46450 24.575 529 290 23 187 655 203 682 2.13e-11 67.8
MsG0880043924.01.T01 AT5G46450 24.575 529 290 23 187 655 203 682 2.17e-11 67.8
MsG0880043924.01.T01 AT5G44510 23.339 557 303 22 166 655 212 711 2.97e-11 67.4
MsG0880043924.01.T01 AT5G44510 23.339 557 303 22 166 655 212 711 3.45e-11 67.4
MsG0880043924.01.T01 AT5G44510 23.214 560 300 22 166 655 212 711 3.62e-11 67.4
MsG0880043924.01.T01 AT1G63870 23.529 544 292 23 187 655 207 701 4.26e-11 67.0
MsG0880043924.01.T01 AT3G44630 28.137 263 132 11 187 429 285 510 5.25e-11 66.6
MsG0880043924.01.T01 AT5G44510 23.160 557 304 22 166 655 212 711 5.30e-11 66.6
MsG0880043924.01.T01 AT3G44630 28.159 277 139 12 187 440 285 524 5.94e-11 66.6
MsG0880043924.01.T01 AT3G44630 28.159 277 139 12 187 440 285 524 5.94e-11 66.6
MsG0880043924.01.T01 AT3G44630 28.159 277 139 12 187 440 285 524 5.94e-11 66.6
MsG0880043924.01.T01 AT2G16870 24.460 556 277 28 187 667 202 689 8.72e-11 65.9

Find 104 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 136 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TGGAGTTTGCACACTGAATT+AGG 0.147515 8:-32677842 None:intergenic
TACCAATACATCATACATTT+TGG 0.176462 8:+32676980 MsG0880043924.01.T01:CDS
TGTATTGGTACCCATCATTT+TGG 0.218169 8:-32676967 None:intergenic
CTCTCTGTTATTCCTATTGT+TGG 0.226847 8:+32676564 MsG0880043924.01.T01:CDS
TTATCAGGGACAGTGAAATT+TGG 0.237187 8:+32677198 MsG0880043924.01.T01:CDS
GAGAACTCCCCAAAGTTCTT+AGG 0.239616 8:-32677142 None:intergenic
TCTTGTTTATCGCCTTAAAA+TGG 0.259573 8:+32676329 MsG0880043924.01.T01:CDS
CCTTTGGCCCTAAGAACTTT+GGG 0.262679 8:+32677134 MsG0880043924.01.T01:CDS
CTAAAGTTCTCTTGGTGAAT+TGG 0.263500 8:-32676762 None:intergenic
TAGAGGAGTGGAAGTTTATC+AGG 0.282898 8:+32677183 MsG0880043924.01.T01:CDS
ATTGTTGGAATTGGAGGATT+AGG 0.291264 8:+32676579 MsG0880043924.01.T01:CDS
GTTATTCCTATTGTTGGAAT+TGG 0.297903 8:+32676570 MsG0880043924.01.T01:CDS
GAGAGTTTGCCCCGCTCTAT+TGG 0.308912 8:+32677761 MsG0880043924.01.T01:CDS
GTGATAATCGTGTTGTAAAA+AGG 0.324657 8:+32676433 MsG0880043924.01.T01:CDS
ACATGGATGTTAGCGTGCTT+TGG 0.326497 8:+32677345 MsG0880043924.01.T01:CDS
GAACTTTAGAAACCTTGATT+TGG 0.326647 8:+32676776 MsG0880043924.01.T01:CDS
TATCAGGGACAGTGAAATTT+GGG 0.331852 8:+32677199 MsG0880043924.01.T01:CDS
CTCAATTCAGCTAGTGTTAG+TGG 0.338249 8:+32676720 MsG0880043924.01.T01:CDS
CCATGTCTGTATTTGTCAAA+TGG 0.339805 8:+32677030 MsG0880043924.01.T01:CDS
TCCTTTGGCCCTAAGAACTT+TGG 0.343192 8:+32677133 MsG0880043924.01.T01:CDS
TTGCTTCTCCCTCTTTGAAA+AGG 0.345018 8:+32677307 MsG0880043924.01.T01:CDS
GAAGAACTACTCAGAATTGA+TGG 0.357275 8:+32677073 MsG0880043924.01.T01:CDS
TATCACTATCATTGATTTGA+AGG 0.358942 8:-32676416 None:intergenic
TAAAGTTCTCTTGGTGAATT+GGG 0.363088 8:-32676761 None:intergenic
CAGCCTTCGGCAGCTACATA+TGG 0.366518 8:+32677937 MsG0880043924.01.T01:CDS
CATGGATGTTAGCGTGCTTT+GGG 0.376160 8:+32677346 MsG0880043924.01.T01:CDS
GCTACATATGGGTGTGGTTA+TGG 0.379676 8:+32677949 MsG0880043924.01.T01:CDS
TGCTTCTCCCTCTTTGAAAA+GGG 0.381857 8:+32677308 MsG0880043924.01.T01:CDS
GTCGGTGACGTGCTTTCTTA+AGG 0.382552 8:-32676253 None:intergenic
ATCAAATTTCCTATTCCATT+GGG 0.384235 8:-32677914 None:intergenic
CATGTCTGTATTTGTCAAAT+GGG 0.387089 8:+32677031 MsG0880043924.01.T01:CDS
GTTTCAAAGAGCGTAGATTC+TGG 0.387874 8:-32677862 None:intergenic
TGCTTGTCTTGGACGATGTA+TGG 0.387910 8:+32676847 MsG0880043924.01.T01:CDS
CAAGGTTTCTAAAGTTCTCT+TGG 0.389181 8:-32676770 None:intergenic
TTCTGCTACTGCATGAGCTT+TGG 0.390831 8:+32677426 MsG0880043924.01.T01:CDS
AATCCTCCAATTCCAACAAT+AGG 0.391682 8:-32676576 None:intergenic
CGTCAAGGTGCAAATTCTTA+CGG 0.395109 8:+32677711 MsG0880043924.01.T01:CDS
GTCAAGGTGCAAATTCTTAC+GGG 0.400154 8:+32677712 MsG0880043924.01.T01:CDS
CAAACATTACCCAATGGAAT+AGG 0.400360 8:+32677905 MsG0880043924.01.T01:CDS
GGAGTTTGCACACTGAATTA+GGG 0.400426 8:-32677841 None:intergenic
GTGAGTGATTCTGATGTAAT+AGG 0.400447 8:+32676477 MsG0880043924.01.T01:CDS
AAGCACGTCACCGACACTTC+AGG 0.403302 8:+32676261 MsG0880043924.01.T01:CDS
TTCCAAAATGTATGATGTAT+TGG 0.413747 8:-32676982 None:intergenic
GCAATTATGCACGGTGCATA+AGG 0.418173 8:-32677985 None:intergenic
GATCAAATTTCCTATTCCAT+TGG 0.421940 8:-32677915 None:intergenic
TTCTCTTGGTGAATTGGGTT+AGG 0.434524 8:-32676756 None:intergenic
TTTGTAGCTGCTCCAAATCA+AGG 0.438799 8:-32676788 None:intergenic
GCTTCATTGTTGGCTTCCTT+AGG 0.445033 8:-32677671 None:intergenic
ATTCCTATTGTTGGAATTGG+AGG 0.449059 8:+32676573 MsG0880043924.01.T01:CDS
CTTTGGCCCTAAGAACTTTG+GGG 0.450108 8:+32677135 MsG0880043924.01.T01:CDS
CCACTCAATTGCCAAAATGA+TGG 0.450847 8:+32676956 MsG0880043924.01.T01:CDS
GGAGTTGCAGAGTCATTCAT+TGG 0.452651 8:+32676015 MsG0880043924.01.T01:CDS
AATCTGTTATTGCAAGATAG+TGG 0.457122 8:+32676528 MsG0880043924.01.T01:CDS
GCTGCTGATAGACATAAGTT+TGG 0.459448 8:+32676393 MsG0880043924.01.T01:CDS
TACTCAGAATTGATGGAGAT+TGG 0.462778 8:+32677080 MsG0880043924.01.T01:CDS
TATCAAGGAGAGATTTGATA+AGG 0.465292 8:+32676368 MsG0880043924.01.T01:CDS
AAAATGTGGAGGGCTTCCTT+TGG 0.466071 8:+32677118 MsG0880043924.01.T01:CDS
GGAATGAGGATCGTGTCAAA+TGG 0.466938 8:+32676868 MsG0880043924.01.T01:CDS
CATCTGAGAAATGAGATTGC+TGG 0.467713 8:+32676813 MsG0880043924.01.T01:CDS
TTGAAGAATTTAATAGAAGT+AGG 0.471310 8:+32676897 MsG0880043924.01.T01:CDS
CTACGCTCTTTGAAACTCAA+TGG 0.475814 8:+32677869 MsG0880043924.01.T01:CDS
GTTCTCAGACCAGTGGGAAC+TGG 0.478979 8:-32677638 None:intergenic
AGAACTCCCCAAAGTTCTTA+GGG 0.482831 8:-32677141 None:intergenic
ATTCTTAAAAGATGATATAG+AGG 0.491133 8:+32677166 MsG0880043924.01.T01:CDS
AGCGTGCTTTGGGAGGCGCT+TGG 0.497797 8:+32677356 MsG0880043924.01.T01:CDS
ACACAAACCCACATCTTCAA+TGG 0.501425 8:-32676657 None:intergenic
TCATAACTTAATTTGATAGC+AGG 0.506255 8:-32677251 None:intergenic
TAGGAAATTTGATCAGCCTT+CGG 0.508372 8:+32677924 MsG0880043924.01.T01:CDS
TTAATAGAAGTAGGTGCTGA+AGG 0.511554 8:+32676906 MsG0880043924.01.T01:CDS
AAAATCATCGATTACATCCT+CGG 0.515918 8:-32676220 None:intergenic
GGGCTTTCAATTTACTAACA+TGG 0.516654 8:+32677328 MsG0880043924.01.T01:CDS
CACTCAATTGCCAAAATGAT+GGG 0.520387 8:+32676957 MsG0880043924.01.T01:CDS
GGGTGTGGTTATGGTGCATA+AGG 0.522516 8:+32677958 MsG0880043924.01.T01:CDS
ATGGCAGAATCACTACTCTT+CGG 0.526944 8:+32675994 MsG0880043924.01.T01:CDS
GCATCAAATCAAACATATCA+AGG 0.531976 8:+32676353 MsG0880043924.01.T01:CDS
CCCAAAGTTCTTAGGGCCAA+AGG 0.543547 8:-32677134 None:intergenic
CACTAACACTAGCTGAATTG+AGG 0.545365 8:-32676719 None:intergenic
AGCCTTCGGCAGCTACATAT+GGG 0.551855 8:+32677938 MsG0880043924.01.T01:CDS
GGCGTAACACCAGTTCCCAC+TGG 0.563417 8:+32677629 MsG0880043924.01.T01:CDS
ACGAAACAGGGGTAAAACCT+TGG 0.571021 8:+32677391 MsG0880043924.01.T01:CDS
CAGAATGCTAGTATCTTCCA+AGG 0.571236 8:-32677408 None:intergenic
GAGAACTATACTATTTCCTA+AGG 0.581988 8:+32677655 MsG0880043924.01.T01:CDS
GGATGTTAGCGTGCTTTGGG+AGG 0.585529 8:+32677349 MsG0880043924.01.T01:CDS
AGTATAGTTCTCAGACCAGT+GGG 0.588864 8:-32677644 None:intergenic
GAATGAGGATCGTGTCAAAT+GGG 0.591467 8:+32676869 MsG0880043924.01.T01:CDS
AAAGAAGCTTCTCTAGCACT+AGG 0.593334 8:+32676060 MsG0880043924.01.T01:CDS
TTCAGGTAGCATCAGAAGGA+AGG 0.599450 8:+32676278 MsG0880043924.01.T01:CDS
TAAAAGATGATATAGAGGAG+TGG 0.607288 8:+32677171 MsG0880043924.01.T01:CDS
TTGTTCAACGTCTAATAACA+CGG 0.612936 8:-32676133 None:intergenic
CACCCATATGTAGCTGCCGA+AGG 0.613779 8:-32677940 None:intergenic
TAGACGTTGAACAAAAGCAA+TGG 0.614185 8:+32676142 MsG0880043924.01.T01:CDS
TCGGCAGCTACATATGGGTG+TGG 0.614247 8:+32677943 MsG0880043924.01.T01:CDS
ACACTTCAGGTAGCATCAGA+AGG 0.621296 8:+32676274 MsG0880043924.01.T01:CDS
AAGCTTCAAACATTACCCAA+TGG 0.631933 8:+32677899 MsG0880043924.01.T01:CDS
AGAACAATGAGCTACGTGAA+TGG 0.632616 8:+32676166 MsG0880043924.01.T01:CDS
TAGTATAGTTCTCAGACCAG+TGG 0.634576 8:-32677645 None:intergenic
CTTGGACGATGTATGGAATG+AGG 0.636358 8:+32676854 MsG0880043924.01.T01:CDS
AGAGGAGTGGAAGTTTATCA+GGG 0.638283 8:+32677184 MsG0880043924.01.T01:CDS
GTGTAGAAAGCAATTATGCA+CGG 0.639309 8:-32677994 None:intergenic
TCTGATGCTACCTGAAGTGT+CGG 0.645666 8:-32676271 None:intergenic
TTTCTTCCGCCACGAAACAG+GGG 0.655950 8:+32677380 MsG0880043924.01.T01:CDS
GTTTGCACACTGAATTAGGG+AGG 0.656466 8:-32677838 None:intergenic
CACGGCTTTGATGAGTGAGA+CGG 0.675772 8:-32676115 None:intergenic
CCATTTGACAAATACAGACA+TGG 0.677381 8:-32677030 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TTTATTAAAAATGATTTGCT+TGG + Chr8:32677608-32677627 MsG0880043924.01.T01:CDS 15.0%
!! AAAGAAATTGTACAAAAATG+TGG + Chr8:32677104-32677123 MsG0880043924.01.T01:CDS 20.0%
!! ATTCTTAAAAGATGATATAG+AGG + Chr8:32677166-32677185 MsG0880043924.01.T01:CDS 20.0%
!! TTGAAGAATTTAATAGAAGT+AGG + Chr8:32676897-32676916 MsG0880043924.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAACATCGTTTTAAATAAGA+AGG - Chr8:32677284-32677303 None:intergenic 20.0%
!!! TGAAGCTTTTTTAAAAACTT+TGG + Chr8:32677688-32677707 MsG0880043924.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTAAAAAAGCTTCATTGT+TGG - Chr8:32677684-32677703 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTAATAAATGACAGATGA+AGG - Chr8:32677598-32677617 None:intergenic 20.0%
! AAATTGTACAAAAATGTGGA+GGG + Chr8:32677108-32677127 MsG0880043924.01.T01:CDS 25.0%
! ATCAAATTTCCTATTCCATT+GGG - Chr8:32677917-32677936 None:intergenic 25.0%
! TTCCAAAATGTATGATGTAT+TGG - Chr8:32676985-32677004 None:intergenic 25.0%
!! CTTCAAGATTTTATAGACTA+TGG + Chr8:32677461-32677480 MsG0880043924.01.T01:CDS 25.0%
!! TACCAATACATCATACATTT+TGG + Chr8:32676980-32676999 MsG0880043924.01.T01:CDS 25.0%
!! TCATAACTTAATTTGATAGC+AGG - Chr8:32677254-32677273 None:intergenic 25.0%
!!! GTTTTAATTTTCCAATAGAG+CGG - Chr8:32677775-32677794 None:intergenic 25.0%
!!! TATCACTATCATTGATTTGA+AGG - Chr8:32676419-32676438 None:intergenic 25.0%
!!! TCATACATTTTGGAATTGAA+AGG + Chr8:32676990-32677009 MsG0880043924.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTAATTTTCCAATAGAGC+GGG - Chr8:32677774-32677793 None:intergenic 25.0%
AATCTGTTATTGCAAGATAG+TGG + Chr8:32676528-32676547 MsG0880043924.01.T01:CDS 30.0%
CATGTCTGTATTTGTCAAAT+GGG + Chr8:32677031-32677050 MsG0880043924.01.T01:CDS 30.0%
GAAATTGTACAAAAATGTGG+AGG + Chr8:32677107-32677126 MsG0880043924.01.T01:CDS 30.0%
GAGAACTATACTATTTCCTA+AGG + Chr8:32677655-32677674 MsG0880043924.01.T01:CDS 30.0%
GATCAAATTTCCTATTCCAT+TGG - Chr8:32677918-32677937 None:intergenic 30.0%
GCATCAAATCAAACATATCA+AGG + Chr8:32676353-32676372 MsG0880043924.01.T01:CDS 30.0%
GTGATAATCGTGTTGTAAAA+AGG + Chr8:32676433-32676452 MsG0880043924.01.T01:CDS 30.0%
GTTATTCCTATTGTTGGAAT+TGG + Chr8:32676570-32676589 MsG0880043924.01.T01:CDS 30.0%
TAAAAAGTTCTTGCTTGTCT+TGG + Chr8:32676836-32676855 MsG0880043924.01.T01:CDS 30.0%
TAAAAGATGATATAGAGGAG+TGG + Chr8:32677171-32677190 MsG0880043924.01.T01:CDS 30.0%
TAAAGTTCTCTTGGTGAATT+GGG - Chr8:32676764-32676783 None:intergenic 30.0%
TATCAAGGAGAGATTTGATA+AGG + Chr8:32676368-32676387 MsG0880043924.01.T01:CDS 30.0%
TTGTTCAACGTCTAATAACA+CGG - Chr8:32676136-32676155 None:intergenic 30.0%
! AAAATCATCGATTACATCCT+CGG - Chr8:32676223-32676242 None:intergenic 30.0%
! AAAATGTCGTCATCTTTTTG+TGG - Chr8:32677230-32677249 None:intergenic 30.0%
! AATCGATGATTTTGAATGTG+AGG + Chr8:32676230-32676249 MsG0880043924.01.T01:CDS 30.0%
! CAAGATTTTATAGACTATGG+TGG + Chr8:32677464-32677483 MsG0880043924.01.T01:CDS 30.0%
! GAACTTTAGAAACCTTGATT+TGG + Chr8:32676776-32676795 MsG0880043924.01.T01:CDS 30.0%
! TCTTGTTTATCGCCTTAAAA+TGG + Chr8:32676329-32676348 MsG0880043924.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTGAAAGGTCTTTTTAGAG+AGG + Chr8:32677004-32677023 MsG0880043924.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTAATTTTCCAATAGAGCG+GGG - Chr8:32677773-32677792 None:intergenic 30.0%
!! TTTTAAAAACTTTGGCGTCA+AGG + Chr8:32677696-32677715 MsG0880043924.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATTTTAAGGCGATAAACAAG+AGG - Chr8:32676330-32676349 None:intergenic 30.0%
AAGCTTCAAACATTACCCAA+TGG + Chr8:32677899-32677918 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
AATCCTCCAATTCCAACAAT+AGG - Chr8:32676579-32676598 None:intergenic 35.0%
AGGAAAAACTACACTTGCAA+AGG + Chr8:32676599-32676618 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
ATTCCTATTGTTGGAATTGG+AGG + Chr8:32676573-32676592 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
ATTGTTGGAATTGGAGGATT+AGG + Chr8:32676579-32676598 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
CAAACATTACCCAATGGAAT+AGG + Chr8:32677905-32677924 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
CACTCAATTGCCAAAATGAT+GGG + Chr8:32676957-32676976 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
CCATGTCTGTATTTGTCAAA+TGG + Chr8:32677030-32677049 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
CCATTTGACAAATACAGACA+TGG - Chr8:32677033-32677052 None:intergenic 35.0%
CTAAAGTTCTCTTGGTGAAT+TGG - Chr8:32676765-32676784 None:intergenic 35.0%
CTCTCTGTTATTCCTATTGT+TGG + Chr8:32676564-32676583 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
GAAGAACTACTCAGAATTGA+TGG + Chr8:32677073-32677092 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
GGGCTTTCAATTTACTAACA+TGG + Chr8:32677328-32677347 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
GTGAGTGATTCTGATGTAAT+AGG + Chr8:32676477-32676496 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
TACTCAGAATTGATGGAGAT+TGG + Chr8:32677080-32677099 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
TAGACGTTGAACAAAAGCAA+TGG + Chr8:32676142-32676161 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
TAGGAAATTTGATCAGCCTT+CGG + Chr8:32677924-32677943 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
TATCAGGGACAGTGAAATTT+GGG + Chr8:32677199-32677218 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
TTATCAGGGACAGTGAAATT+TGG + Chr8:32677198-32677217 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
! AGACTTTTCCATTGAAGATG+TGG + Chr8:32676649-32676668 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
! ATTGAAAGCCCTTTTCAAAG+AGG - Chr8:32677319-32677338 None:intergenic 35.0%
! GACTTTTCCATTGAAGATGT+GGG + Chr8:32676650-32676669 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
! TTGAAAGCCCTTTTCAAAGA+GGG - Chr8:32677318-32677337 None:intergenic 35.0%
!! CAAGGTTTCTAAAGTTCTCT+TGG - Chr8:32676773-32676792 None:intergenic 35.0%
!! TGATTTGATGCGCCATTTTA+AGG - Chr8:32676344-32676363 None:intergenic 35.0%
!! TGTATTGGTACCCATCATTT+TGG - Chr8:32676970-32676989 None:intergenic 35.0%
!! TTAATAGAAGTAGGTGCTGA+AGG + Chr8:32676906-32676925 MsG0880043924.01.T01:CDS 35.0%
AAAGAAGCTTCTCTAGCACT+AGG + Chr8:32676060-32676079 MsG0880043924.01.T01:CDS 40.0%
ACACAAACCCACATCTTCAA+TGG - Chr8:32676660-32676679 None:intergenic 40.0%
AGAACAATGAGCTACGTGAA+TGG + Chr8:32676166-32676185 MsG0880043924.01.T01:CDS 40.0%
AGAACTCCCCAAAGTTCTTA+GGG - Chr8:32677144-32677163 None:intergenic 40.0%
AGAGGAGTGGAAGTTTATCA+GGG + Chr8:32677184-32677203 MsG0880043924.01.T01:CDS 40.0%
AGTATAGTTCTCAGACCAGT+GGG - Chr8:32677647-32677666 None:intergenic 40.0%
ATGGCAGAATCACTACTCTT+CGG + Chr8:32675994-32676013 MsG0880043924.01.T01:CDS 40.0%
CACTAACACTAGCTGAATTG+AGG - Chr8:32676722-32676741 None:intergenic 40.0%
CAGAATGCTAGTATCTTCCA+AGG - Chr8:32677411-32677430 None:intergenic 40.0%
CATCTGAGAAATGAGATTGC+TGG + Chr8:32676813-32676832 MsG0880043924.01.T01:CDS 40.0%
CCACTCAATTGCCAAAATGA+TGG + Chr8:32676956-32676975 MsG0880043924.01.T01:CDS 40.0%
CGTCAAGGTGCAAATTCTTA+CGG + Chr8:32677711-32677730 MsG0880043924.01.T01:CDS 40.0%
CTCAATTCAGCTAGTGTTAG+TGG + Chr8:32676720-32676739 MsG0880043924.01.T01:CDS 40.0%
GAATGAGGATCGTGTCAAAT+GGG + Chr8:32676869-32676888 MsG0880043924.01.T01:CDS 40.0%
GCTGCTGATAGACATAAGTT+TGG + Chr8:32676393-32676412 MsG0880043924.01.T01:CDS 40.0%
GGAGTTTGCACACTGAATTA+GGG - Chr8:32677844-32677863 None:intergenic 40.0%
GTCAAGGTGCAAATTCTTAC+GGG + Chr8:32677712-32677731 MsG0880043924.01.T01:CDS 40.0%
TAGAGGAGTGGAAGTTTATC+AGG + Chr8:32677183-32677202 MsG0880043924.01.T01:CDS 40.0%
TAGTATAGTTCTCAGACCAG+TGG - Chr8:32677648-32677667 None:intergenic 40.0%
TGGAGTTTGCACACTGAATT+AGG - Chr8:32677845-32677864 None:intergenic 40.0%
TTCTCTTGGTGAATTGGGTT+AGG - Chr8:32676759-32676778 None:intergenic 40.0%
TTTGTAGCTGCTCCAAATCA+AGG - Chr8:32676791-32676810 None:intergenic 40.0%
! GTTTCAAAGAGCGTAGATTC+TGG - Chr8:32677865-32677884 None:intergenic 40.0%
! TGCTTCTCCCTCTTTGAAAA+GGG + Chr8:32677308-32677327 MsG0880043924.01.T01:CDS 40.0%
! TTGCTTCTCCCTCTTTGAAA+AGG + Chr8:32677307-32677326 MsG0880043924.01.T01:CDS 40.0%
!! CCATCATTTTGGCAATTGAG+TGG - Chr8:32676959-32676978 None:intergenic 40.0%
!! CTACGCTCTTTGAAACTCAA+TGG + Chr8:32677869-32677888 MsG0880043924.01.T01:CDS 40.0%
!! GTCAAATGGGCTTTTGAAGA+GGG + Chr8:32677044-32677063 MsG0880043924.01.T01:CDS 40.0%
!! TGTCAAATGGGCTTTTGAAG+AGG + Chr8:32677043-32677062 MsG0880043924.01.T01:CDS 40.0%
AAAATGTGGAGGGCTTCCTT+TGG + Chr8:32677118-32677137 MsG0880043924.01.T01:CDS 45.0%
ACACTTCAGGTAGCATCAGA+AGG + Chr8:32676274-32676293 MsG0880043924.01.T01:CDS 45.0%
ACATGGATGTTAGCGTGCTT+TGG + Chr8:32677345-32677364 MsG0880043924.01.T01:CDS 45.0%
ACGAAACAGGGGTAAAACCT+TGG + Chr8:32677391-32677410 MsG0880043924.01.T01:CDS 45.0%
CATGGATGTTAGCGTGCTTT+GGG + Chr8:32677346-32677365 MsG0880043924.01.T01:CDS 45.0%
CCTTTGGCCCTAAGAACTTT+GGG + Chr8:32677134-32677153 MsG0880043924.01.T01:CDS 45.0%
CTTGGACGATGTATGGAATG+AGG + Chr8:32676854-32676873 MsG0880043924.01.T01:CDS 45.0%
CTTTGGCCCTAAGAACTTTG+GGG + Chr8:32677135-32677154 MsG0880043924.01.T01:CDS 45.0%
GAGAACTCCCCAAAGTTCTT+AGG - Chr8:32677145-32677164 None:intergenic 45.0%
GCTACATATGGGTGTGGTTA+TGG + Chr8:32677949-32677968 MsG0880043924.01.T01:CDS 45.0%
GGAATGAGGATCGTGTCAAA+TGG + Chr8:32676868-32676887 MsG0880043924.01.T01:CDS 45.0%
GGAGTTGCAGAGTCATTCAT+TGG + Chr8:32676015-32676034 MsG0880043924.01.T01:CDS 45.0%
GTTTGCACACTGAATTAGGG+AGG - Chr8:32677841-32677860 None:intergenic 45.0%
TCCTTTGGCCCTAAGAACTT+TGG + Chr8:32677133-32677152 MsG0880043924.01.T01:CDS 45.0%
TCTGATGCTACCTGAAGTGT+CGG - Chr8:32676274-32676293 None:intergenic 45.0%
TGCTTGTCTTGGACGATGTA+TGG + Chr8:32676847-32676866 MsG0880043924.01.T01:CDS 45.0%
TTCAGGTAGCATCAGAAGGA+AGG + Chr8:32676278-32676297 MsG0880043924.01.T01:CDS 45.0%
TTCTGCTACTGCATGAGCTT+TGG + Chr8:32677426-32677445 MsG0880043924.01.T01:CDS 45.0%
! AAGGTTTTACCCCTGTTTCG+TGG - Chr8:32677392-32677411 None:intergenic 45.0%
! TTTTCTTCCGCCACGAAACA+GGG + Chr8:32677379-32677398 MsG0880043924.01.T01:CDS 45.0%
!! GCTTCATTGTTGGCTTCCTT+AGG - Chr8:32677674-32677693 None:intergenic 45.0%
AGCCTTCGGCAGCTACATAT+GGG + Chr8:32677938-32677957 MsG0880043924.01.T01:CDS 50.0%
CCCAAAGTTCTTAGGGCCAA+AGG - Chr8:32677137-32677156 None:intergenic 50.0%
GGGTGTGGTTATGGTGCATA+AGG + Chr8:32677958-32677977 MsG0880043924.01.T01:CDS 50.0%
GTCGGTGACGTGCTTTCTTA+AGG - Chr8:32676256-32676275 None:intergenic 50.0%
TTTCTTCCGCCACGAAACAG+GGG + Chr8:32677380-32677399 MsG0880043924.01.T01:CDS 50.0%
! CACGGCTTTGATGAGTGAGA+CGG - Chr8:32676118-32676137 None:intergenic 50.0%
! GCGTGTTTTCTATGATGCCG+AGG + Chr8:32676203-32676222 MsG0880043924.01.T01:CDS 50.0%
! GTTTTACCCCTGTTTCGTGG+CGG - Chr8:32677389-32677408 None:intergenic 50.0%
! GTTTTCTTCCGCCACGAAAC+AGG + Chr8:32677378-32677397 MsG0880043924.01.T01:CDS 50.0%
AAGCACGTCACCGACACTTC+AGG + Chr8:32676261-32676280 MsG0880043924.01.T01:CDS 55.0%
CACCCATATGTAGCTGCCGA+AGG - Chr8:32677943-32677962 None:intergenic 55.0%
CAGCCTTCGGCAGCTACATA+TGG + Chr8:32677937-32677956 MsG0880043924.01.T01:CDS 55.0%
GAGAGTTTGCCCCGCTCTAT+TGG + Chr8:32677761-32677780 MsG0880043924.01.T01:CDS 55.0%
GTTCTCAGACCAGTGGGAAC+TGG - Chr8:32677641-32677660 None:intergenic 55.0%
TCGGCAGCTACATATGGGTG+TGG + Chr8:32677943-32677962 MsG0880043924.01.T01:CDS 55.0%
! GGATGTTAGCGTGCTTTGGG+AGG + Chr8:32677349-32677368 MsG0880043924.01.T01:CDS 55.0%
GGCGTAACACCAGTTCCCAC+TGG + Chr8:32677629-32677648 MsG0880043924.01.T01:CDS 60.0%
!! AGCGTGCTTTGGGAGGCGCT+TGG + Chr8:32677356-32677375 MsG0880043924.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 32675994 32678003 32675994 ID=MsG0880043924.01;Name=MsG0880043924.01
Chr8 mRNA 32675994 32678003 32675994 ID=MsG0880043924.01.T01;Parent=MsG0880043924.01;Name=MsG0880043924.01.T01;_AED=0.14;_eAED=0.14;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|669
Chr8 exon 32675994 32678003 32675994 ID=MsG0880043924.01.T01:exon:9769;Parent=MsG0880043924.01.T01
Chr8 CDS 32675994 32678003 32675994 ID=MsG0880043924.01.T01:cds;Parent=MsG0880043924.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880043924.01.T01

ATGGCAGAATCACTACTCTTCGGAGTTGCAGAGTCATTCATTGGTAAGCTTGCTTCTGTTGCTGTAAAAGAAGCTTCTCTAGCACTAGGTGTCTATGACGATCTTCGAGAAATCAAAAACACCGTCTCACTCATCAAAGCCGTGTTATTAGACGTTGAACAAAAGCAATGGCAGAACAATGAGCTACGTGAATGGCTGAAACAGATTAAGCGTGTTTTCTATGATGCCGAGGATGTAATCGATGATTTTGAATGTGAGGCCTTAAGAAAGCACGTCACCGACACTTCAGGTAGCATCAGAAGGAAGGTAAAACGTTTCTTCTCAATTTCTAATCCTCTTGTTTATCGCCTTAAAATGGCGCATCAAATCAAACATATCAAGGAGAGATTTGATAAGGTTGCTGCTGATAGACATAAGTTTGGCCTTCAAATCAATGATAGTGATAATCGTGTTGTAAAAAGGCGTGAATTGACACATTCATATGTGAGTGATTCTGATGTAATAGGAAGAGAACATGATAAACAAAAAATCATTAATCTGTTATTGCAAGATAGTGGTGATAGTAATAGTCTCTCTGTTATTCCTATTGTTGGAATTGGAGGATTAGGAAAAACTACACTTGCAAAGGCAGTGTTTAATGATAAGAGTTTAGATGAGACTTTTCCATTGAAGATGTGGGTTTGTGTCTCTGATGATTTTCAACTTAAGAATCTGCTTGTTAAAATCCTCAATTCAGCTAGTGTTAGTGGTTCTGCTGCTGCTCCTAACCCAATTCACCAAGAGAACTTTAGAAACCTTGATTTGGAGCAGCTACAAAATCATCTGAGAAATGAGATTGCTGGTAAAAAGTTCTTGCTTGTCTTGGACGATGTATGGAATGAGGATCGTGTCAAATGGGTTGATTTGAAGAATTTAATAGAAGTAGGTGCTGAAGGAAGTAAAGTCTTAGTGACTACACGTAGCCACTCAATTGCCAAAATGATGGGTACCAATACATCATACATTTTGGAATTGAAAGGTCTTTTTAGAGAGGATTCCATGTCTGTATTTGTCAAATGGGCTTTTGAAGAGGGAGAAGAGAAGAACTACTCAGAATTGATGGAGATTGGTAAAGAAATTGTACAAAAATGTGGAGGGCTTCCTTTGGCCCTAAGAACTTTGGGGAGTTCTCTATTCTTAAAAGATGATATAGAGGAGTGGAAGTTTATCAGGGACAGTGAAATTTGGGATTTACCACAAAAAGATGACGACATTTTGCCTGCTATCAAATTAAGTTATGATCAGTTACCTTCTTATTTAAAACGATGTTTTGCTTGCTTCTCCCTCTTTGAAAAGGGCTTTCAATTTACTAACATGGATGTTAGCGTGCTTTGGGAGGCGCTTGGTTTTCTTCCGCCACGAAACAGGGGTAAAACCTTGGAAGATACTAGCATTCTGCTACTGCATGAGCTTTGGTCAAGATCATTTCTTCAAGATTTTATAGACTATGGTGGTTTTTGTGCATTTAAATTGCATGATTTAGTGCATGATCTTGCATTGTATGTTGCAAGAGATGAGTTTCAATTGATGAAATTTCATAATGAAAATATACTCGAGAATGTCCTTCATCTGTCATTTATTAAAAATGATTTGCTTGGCGTAACACCAGTTCCCACTGGTCTGAGAACTATACTATTTCCTAAGGAAGCCAACAATGAAGCTTTTTTAAAAACTTTGGCGTCAAGGTGCAAATTCTTACGGGTTTTACAGTTAACTGATTCTACTTATGAGAGTTTGCCCCGCTCTATTGGAAAATTAAAACAAATAAGATATCTCAATCTCAAGAATAATGAAGAATTGAAGAGCCTCCCTAATTCAGTGTGCAAACTCCAGAATCTACGCTCTTTGAAACTCAATGGATGCATAAAGCTTCAAACATTACCCAATGGAATAGGAAATTTGATCAGCCTTCGGCAGCTACATATGGGTGTGGTTATGGTGCATAAGGAGATCCTTATGCACCGTGCATAA

Protein sequence

>MsG0880043924.01.T01

MAESLLFGVAESFIGKLASVAVKEASLALGVYDDLREIKNTVSLIKAVLLDVEQKQWQNNELREWLKQIKRVFYDAEDVIDDFECEALRKHVTDTSGSIRRKVKRFFSISNPLVYRLKMAHQIKHIKERFDKVAADRHKFGLQINDSDNRVVKRRELTHSYVSDSDVIGREHDKQKIINLLLQDSGDSNSLSVIPIVGIGGLGKTTLAKAVFNDKSLDETFPLKMWVCVSDDFQLKNLLVKILNSASVSGSAAAPNPIHQENFRNLDLEQLQNHLRNEIAGKKFLLVLDDVWNEDRVKWVDLKNLIEVGAEGSKVLVTTRSHSIAKMMGTNTSYILELKGLFREDSMSVFVKWAFEEGEEKNYSELMEIGKEIVQKCGGLPLALRTLGSSLFLKDDIEEWKFIRDSEIWDLPQKDDDILPAIKLSYDQLPSYLKRCFACFSLFEKGFQFTNMDVSVLWEALGFLPPRNRGKTLEDTSILLLHELWSRSFLQDFIDYGGFCAFKLHDLVHDLALYVARDEFQLMKFHNENILENVLHLSFIKNDLLGVTPVPTGLRTILFPKEANNEAFLKTLASRCKFLRVLQLTDSTYESLPRSIGKLKQIRYLNLKNNEELKSLPNSVCKLQNLRSLKLNGCIKLQTLPNGIGNLISLRQLHMGVVMVHKEILMHRA*