AlfalfaGEDB | MsG0880047211.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880047211.01

KEGG: K09422
GO: GO:0003677
PFAM: PF00249

Nr:

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Swissprot:

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Trembl:

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TFs/TRs:

Gene ID	Type	Classification
MsG0880047211.01.T04	TF	MYB
MsG0880047211.01.T01	TF	MYB

Protein Kinases:

Gene ID	Type	Classification

Network:

Co-expression Network

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PPI

Gene1	Gene2	Type

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MsG0880047211.01.T02	AT2G02820	33.333	135	70	3	8	134	33	155	1.17e-14	73.6
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MsG0880047211.01.T01	AT4G21440	55.856	111	49	0	3	113	12	122	3.66e-42	148
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Find 70 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 145 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
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CRISPR-GE

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!!	CTTAAAATTTATATTATTAC+CGG	+	Chr8:83334796-83334815	None:intergenic	10.0%
!!	TATATTTGTAAAATTTGAAT+TGG	+	Chr8:83334909-83334928	None:intergenic	10.0%
!!!	TATGATCTTTTTTTTTTATT+TGG	+	Chr8:83335933-83335952	None:intergenic	10.0%
!!	AAAGATTATTTGTTTAATGA+TGG	-	Chr8:83335164-83335183	MsG0880047211.01.T01:intron	15.0%
!!	AAATACTAATAGGATTTATA+CGG	+	Chr8:83334579-83334598	None:intergenic	15.0%
!!	AATAATTTGAATTAGCATTA+GGG	+	Chr8:83335632-83335651	None:intergenic	15.0%
!!	ATAATCTTTGTCAAAATTAA+TGG	+	Chr8:83335153-83335172	None:intergenic	15.0%
!!	ATCAATTAAAAATAAATGTC+TGG	-	Chr8:83335000-83335019	MsG0880047211.01.T01:intron	15.0%
!!	GAAAAAAGGAAAAAATAAAA+TGG	-	Chr8:83334456-83334475	MsG0880047211.01.T01:intron	15.0%
!!	TAATAATTTGAATTAGCATT+AGG	+	Chr8:83335633-83335652	None:intergenic	15.0%
!!	TCAATTAAAAATAAATGTCT+GGG	-	Chr8:83335001-83335020	MsG0880047211.01.T01:intron	15.0%
!!!	AACATTAATCATATGATTTT+TGG	+	Chr8:83334497-83334516	None:intergenic	15.0%
!!!	ATTTTTTCTTCAAATTTTAG+AGG	-	Chr8:83336076-83336095	MsG0880047211.01.T01:CDS	15.0%
!!!	TTTTAATTGATTTTTTTTGG+TGG	+	Chr8:83335032-83335051	None:intergenic	15.0%
!!	AATACCTCATACAATAATAA+CGG	-	Chr8:83335411-83335430	MsG0880047211.01.T01:CDS	20.0%
!!	AATACTAATAGGATTTATAC+GGG	+	Chr8:83334578-83334597	None:intergenic	20.0%
!!	AATTAAAGAGAAGAAATTAG+TGG	-	Chr8:83336024-83336043	MsG0880047211.01.T01:intron	20.0%
!!	AATTCATAGTTTATAGTTGT+TGG	+	Chr8:83335459-83335478	None:intergenic	20.0%
!!	ATAATCCACAATTTAGATAT+AGG	+	Chr8:83335984-83336003	None:intergenic	20.0%
!!	ATATATATTGTGATATGCAT+TGG	-	Chr8:83334319-83334338	MsG0880047211.01.T03:three_prime_UTR	20.0%
!!	ATGTAAAAACCATTCATTAA+TGG	-	Chr8:83335840-83335859	MsG0880047211.01.T01:intron	20.0%
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!!	GACAAAATACAAATACTAAT+AGG	+	Chr8:83334589-83334608	None:intergenic	20.0%
!!	GATTAGAAGAAGAAAATAAT+TGG	+	Chr8:83335084-83335103	None:intergenic	20.0%
!!	TAATGAAAAGAAGTGATAAA+AGG	+	Chr8:83334220-83334239	None:intergenic	20.0%
!!	TGAAATTTGTCAATATTCAT+TGG	-	Chr8:83334406-83334425	MsG0880047211.01.T01:CDS	20.0%
!!	TGTAAAAACCATTCATTAAT+GGG	-	Chr8:83335841-83335860	MsG0880047211.01.T01:intron	20.0%
!!!	AAAGCTCATAAATACATTTT+TGG	+	Chr8:83334836-83334855	None:intergenic	20.0%
!!!	ATTAATCATATGATTTTTGG+TGG	+	Chr8:83334494-83334513	None:intergenic	20.0%
!!!	ATTTTTAATTGATTGATGCA+TGG	+	Chr8:83334993-83335012	None:intergenic	20.0%
!!!	TTGCATTCTTTTGTTATATT+AGG	-	Chr8:83334644-83334663	MsG0880047211.01.T01:CDS	20.0%
!	AAAATAGCTCAATATTTACC+AGG	-	Chr8:83335204-83335223	MsG0880047211.01.T01:intron	25.0%
!	AAGAATGAAACCATAAAGAA+CGG	+	Chr8:83336130-83336149	None:intergenic	25.0%
!	ATCAGATTCATTTGAGAATA+AGG	-	Chr8:83335542-83335561	MsG0880047211.01.T01:intron	25.0%
!	ATTCATTGGATATAATTGCT+TGG	-	Chr8:83334420-83334439	MsG0880047211.01.T01:CDS	25.0%
!	GTTATTATTGTATGAGGTAT+TGG	+	Chr8:83335412-83335431	None:intergenic	25.0%
!	TAGCTAGGTTTATAATAAGT+TGG	-	Chr8:83334377-83334396	MsG0880047211.01.T01:CDS	25.0%
!	TCCACATGTATCATATAATA+AGG	+	Chr8:83334345-83334364	None:intergenic	25.0%
!	TGTAATTTAACCGTTCTTTA+TGG	-	Chr8:83336117-83336136	MsG0880047211.01.T01:CDS	25.0%
!	TTAAAGAGAAGAAATTAGTG+GGG	-	Chr8:83336026-83336045	MsG0880047211.01.T01:intron	25.0%
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!!	ATTGTTTTCTCAAGGATTAA+TGG	-	Chr8:83335704-83335723	MsG0880047211.01.T01:intron	25.0%
!!	GCTTTTCAATGGTAATTTAA+TGG	+	Chr8:83334266-83334285	None:intergenic	25.0%
!!	TCAATGGTAATTTAATGGAT+CGG	+	Chr8:83334261-83334280	None:intergenic	25.0%
!!!	ATTTTAAGAGTTTCATATGC+CGG	-	Chr8:83334808-83334827	MsG0880047211.01.T01:CDS	25.0%
!!!	CATAAATACATTTTTGGTTC+CGG	+	Chr8:83334830-83334849	None:intergenic	25.0%
!!!	TTTTTTCCTTTTTTCACAAG+TGG	+	Chr8:83334451-83334470	None:intergenic	25.0%
	ACTCTGCTGGTAAATATTAT+TGG	-	Chr8:83334134-83334153	MsG0880047211.01.T03:three_prime_UTR	30.0%
	AGTAGCAATGTAATTCATGA+GGG	+	Chr8:83334083-83334102	None:intergenic	30.0%
	ATAATATTTACCAGCAGAGT+TGG	+	Chr8:83334134-83334153	None:intergenic	30.0%
	ATGAATTACATTGCTACTCA+TGG	-	Chr8:83334085-83334104	MsG0880047211.01.T03:three_prime_UTR	30.0%
	ATTAATGGGAATATAGGAGA+AGG	-	Chr8:83335855-83335874	MsG0880047211.01.T01:intron	30.0%
	ATTGATGCATGGATAATGTT+CGG	+	Chr8:83334982-83335001	None:intergenic	30.0%
	CCATTCATTAATGGGAATAT+AGG	-	Chr8:83335849-83335868	MsG0880047211.01.T01:intron	30.0%
	CCTATATTCCCATTAATGAA+TGG	+	Chr8:83335852-83335871	None:intergenic	30.0%
	GTATAACTTTGTGTCATATG+TGG	+	Chr8:83335495-83335514	None:intergenic	30.0%
	TAAAGAGAAGAAATTAGTGG+GGG	-	Chr8:83336027-83336046	MsG0880047211.01.T01:intron	30.0%
!	ATTGGCCTATATCTAAATTG+TGG	-	Chr8:83335976-83335995	MsG0880047211.01.T01:intron	30.0%
!	CATATTTAGGACACACAAAA+AGG	-	Chr8:83335949-83335968	MsG0880047211.01.T01:intron	30.0%
!	CTTCTTTTCATTACCACAAA+TGG	-	Chr8:83334227-83334246	MsG0880047211.01.T03:three_prime_UTR	30.0%
!	GAATAAGGTGTCAACATTAT+CGG	-	Chr8:83335557-83335576	MsG0880047211.01.T01:intron	30.0%
!	GCCTTATTATATGATACATG+TGG	-	Chr8:83334341-83334360	MsG0880047211.01.T03:intron	30.0%
!	TTTTCATTACCACAAATGGA+TGG	-	Chr8:83334231-83334250	MsG0880047211.01.T03:three_prime_UTR	30.0%
!!	ATTAATGGATTTCCAATCCA+TGG	-	Chr8:83335719-83335738	MsG0880047211.01.T01:intron	30.0%
!!!	AATCATATGATTTTTGGTGG+AGG	+	Chr8:83334491-83334510	None:intergenic	30.0%
	AGTCACAAAACCACAAACTT+TGG	+	Chr8:83334288-83334307	None:intergenic	35.0%
	ATATTAGGTCTCAAACGAAC+CGG	-	Chr8:83334659-83334678	MsG0880047211.01.T01:CDS	35.0%
	ATTTCATTGTCTGTTCTTCC+TGG	+	Chr8:83335225-83335244	None:intergenic	35.0%
	CATTGAAAAGCCAAAGTTTG+TGG	-	Chr8:83334275-83334294	MsG0880047211.01.T03:three_prime_UTR	35.0%
	CTAATTCAGCTTCACGAAAT+TGG	+	Chr8:83334885-83334904	None:intergenic	35.0%
	GACACACAAAAAGGATGTAT+TGG	-	Chr8:83335958-83335977	MsG0880047211.01.T01:intron	35.0%
	GAGTAGCAATGTAATTCATG+AGG	+	Chr8:83334084-83334103	None:intergenic	35.0%
	GTGTCAACATTATCGGATTT+GGG	-	Chr8:83335564-83335583	MsG0880047211.01.T01:intron	35.0%
	TAATAACGGCAGCAAAATGA+CGG	-	Chr8:83335425-83335444	MsG0880047211.01.T01:CDS	35.0%
	TAGAGAGAAGAGGCTAATTT+AGG	+	Chr8:83334163-83334182	None:intergenic	35.0%
	TTCTCATCAACTTAGCTTCT+CGG	-	Chr8:83335659-83335678	MsG0880047211.01.T01:intron	35.0%
!!	TAATGATGGATTGCATCAGA+TGG	-	Chr8:83335178-83335197	MsG0880047211.01.T01:intron	35.0%
!!!	CACAAACTTTGGCTTTTCAA+TGG	+	Chr8:83334277-83334296	None:intergenic	35.0%
	AATAACGGCAGCAAAATGAC+GGG	-	Chr8:83335426-83335445	MsG0880047211.01.T01:CDS	40.0%
	ATCACATAGGTAGAGAGAAG+AGG	+	Chr8:83334173-83334192	None:intergenic	40.0%
	ATCGGATAACCATCCATTTG+TGG	+	Chr8:83334243-83334262	None:intergenic	40.0%
	ATGTTTCCACGTCTAACATC+GGG	+	Chr8:83334722-83334741	None:intergenic	40.0%
	CCTTAATCTGCAACTCTTAC+CGG	+	Chr8:83334681-83334700	None:intergenic	40.0%
	CCTTGAGAAAACAATCCAGA+CGG	+	Chr8:83335699-83335718	None:intergenic	40.0%
	CGTGAATAGCAAGCAATTCA+AGG	-	Chr8:83335299-83335318	MsG0880047211.01.T01:intron	40.0%
	CTTGAGAAAACAATCCAGAC+GGG	+	Chr8:83335698-83335717	None:intergenic	40.0%
	GATGTTTCCACGTCTAACAT+CGG	+	Chr8:83334723-83334742	None:intergenic	40.0%
	GCTGCCGTTATTATTGTATG+AGG	+	Chr8:83335418-83335437	None:intergenic	40.0%
	GGATGTAATTGTCTCTAGCT+AGG	-	Chr8:83334362-83334381	MsG0880047211.01.T01:CDS	40.0%
	GGTGTCAACATTATCGGATT+TGG	-	Chr8:83335563-83335582	MsG0880047211.01.T01:intron	40.0%
	GTAAGAGTTGCAGATTAAGG+TGG	-	Chr8:83334681-83334700	MsG0880047211.01.T01:CDS	40.0%
	TACATTGCTACTCATGGTGA+AGG	-	Chr8:83334091-83334110	MsG0880047211.01.T03:three_prime_UTR	40.0%
	TCTCTCTACCTATGTGATTG+TGG	-	Chr8:83334175-83334194	MsG0880047211.01.T03:three_prime_UTR	40.0%
!	AGTTGTGTTGCTGTTCTCTA+GGG	+	Chr8:83335517-83335536	None:intergenic	40.0%
!!	ATTGTATGAGGTATTGGTCG+CGG	+	Chr8:83335406-83335425	None:intergenic	40.0%
!!	GAGAAGCTAAGTTGATGAGA+AGG	+	Chr8:83335660-83335679	None:intergenic	40.0%
!!!	GGGACTCATCTGACATTTTT+TGG	-	Chr8:83335769-83335788	MsG0880047211.01.T01:intron	40.0%
	AACAACACGTGGATGCAAAG+TGG	-	Chr8:83335747-83335766	MsG0880047211.01.T01:intron	45.0%
	ACAACACGTGGATGCAAAGT+GGG	-	Chr8:83335748-83335767	MsG0880047211.01.T01:intron	45.0%
	CCGGTAAGAGTTGCAGATTA+AGG	-	Chr8:83334678-83334697	MsG0880047211.01.T01:CDS	45.0%
	TACGTGCACCACAATCACAT+AGG	+	Chr8:83334186-83334205	None:intergenic	45.0%
	TGTTTCCACGTCTAACATCG+GGG	+	Chr8:83334721-83334740	None:intergenic	45.0%
!	CAGTTGTGTTGCTGTTCTCT+AGG	+	Chr8:83335518-83335537	None:intergenic	45.0%
!	CCGTCTGGATTGTTTTCTCA+AGG	-	Chr8:83335696-83335715	MsG0880047211.01.T01:intron	45.0%
!	CTTTGCATCCACGTGTTGTT+TGG	+	Chr8:83335747-83335766	None:intergenic	45.0%
!	TGTTGTTTGGCTCCATGGAT+TGG	+	Chr8:83335734-83335753	None:intergenic	45.0%
!!	CACGTCGCATTTGAGTTGTT+TGG	+	Chr8:83335283-83335302	None:intergenic	45.0%
!!	TGAATACGTTCGACTAGCCT+CGG	+	Chr8:83335348-83335367	None:intergenic	45.0%
!!!	TTTTTTTAATTGATTTTTTT+TGG	+	Chr8:83335035-83335054	None:intergenic	5.0%
	ATTTACCAGCAGAGTTGGCG+AGG	+	Chr8:83334129-83334148	None:intergenic	50.0%
	CAACACGTGGATGCAAAGTG+GGG	-	Chr8:83335749-83335768	MsG0880047211.01.T01:intron	50.0%
	CTACTCATGGTGAAGGTCGT+TGG	-	Chr8:83334098-83334117	MsG0880047211.01.T03:three_prime_UTR	50.0%
	GAGGGTTAAGTCCTCATCCA+CGG	+	Chr8:83334065-83334084	None:intergenic	50.0%
	GATTGTATCACAAGCCCGTC+TGG	-	Chr8:83335681-83335700	MsG0880047211.01.T01:intron	50.0%
	GCGCGACCACTTGTGAAAAA+AGG	-	Chr8:83334442-83334461	MsG0880047211.01.T01:intron	50.0%
	TCCATACTCGTTGGGGTAAC+CGG	-	Chr8:83334774-83334793	MsG0880047211.01.T01:CDS	50.0%
	TCTCGAGCTCCATACTCGTT+GGG	-	Chr8:83334766-83334785	MsG0880047211.01.T01:CDS	50.0%
	TGGACCTTAGAAGAGGTCCT+TGG	-	Chr8:83334038-83334057	MsG0880047211.01.T03:three_prime_UTR	50.0%
	TTCTCGAGCTCCATACTCGT+TGG	-	Chr8:83334765-83334784	MsG0880047211.01.T01:CDS	50.0%
	TTTACCAGCAGAGTTGGCGA+GGG	+	Chr8:83334128-83334147	None:intergenic	50.0%
	AAGTCCTCATCCACGGTCCA+AGG	+	Chr8:83334058-83334077	None:intergenic	55.0%
	AATACCCTCGCCAACTCTGC+TGG	-	Chr8:83334121-83334140	MsG0880047211.01.T03:three_prime_UTR	55.0%
	ACCGGTTACCCCAACGAGTA+TGG	+	Chr8:83334778-83334797	None:intergenic	55.0%
	AGGACACCATGCGCTACCTT+TGG	-	Chr8:83335319-83335338	MsG0880047211.01.T01:intron	55.0%
	CCATGGAGCCAAACAACACG+TGG	-	Chr8:83335736-83335755	MsG0880047211.01.T01:intron	55.0%
	CGGTCCAAGGACCTCTTCTA+AGG	+	Chr8:83334045-83334064	None:intergenic	55.0%
	CTCGAGCTCCATACTCGTTG+GGG	-	Chr8:83334767-83334786	MsG0880047211.01.T01:CDS	55.0%
	TAGAAGAGGTCCTTGGACCG+TGG	-	Chr8:83334045-83334064	MsG0880047211.01.T03:three_prime_UTR	55.0%
	TTCCACGTCTAACATCGGGG+CGG	+	Chr8:83334718-83334737	None:intergenic	55.0%
!!	CCACGTGTTGTTTGGCTCCA+TGG	+	Chr8:83335739-83335758	None:intergenic	55.0%
!!	GTATGAGGTATTGGTCGCGG+TGG	+	Chr8:83335403-83335422	None:intergenic	55.0%
	AGGTCCTTGGACCGTGGATG+AGG	-	Chr8:83334051-83334070	MsG0880047211.01.T03:three_prime_UTR	60.0%
	CGGCATCCAAAGGTAGCGCA+TGG	+	Chr8:83335328-83335347	None:intergenic	60.0%
	TGCGCTACCTTTGGATGCCG+AGG	-	Chr8:83335328-83335347	MsG0880047211.01.T01:intron	60.0%
!!	CGACTAGCCTCGGCATCCAA+AGG	+	Chr8:83335338-83335357	None:intergenic	60.0%
	ATTGGTCGCGGTGGCTGTGG+TGG	+	Chr8:83335394-83335413	None:intergenic	65.0%
	CTCCGCCCCGATGTTAGACG+TGG	-	Chr8:83334713-83334732	MsG0880047211.01.T01:CDS	65.0%
!!	GGCTGTGGTGGTGGTGGTAG+TGG	+	Chr8:83335382-83335401	None:intergenic	65.0%
!!	GGTATTGGTCGCGGTGGCTG+TGG	+	Chr8:83335397-83335416	None:intergenic	65.0%
!!	GGTGGTGGTAGTGGCAGCAG+CGG	+	Chr8:83335373-83335392	None:intergenic	65.0%
	GGTCGCGGTGGCTGTGGTGG+TGG	+	Chr8:83335391-83335410	None:intergenic	75.0%
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Gene Sequence

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