AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180005681.01


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MsG0180005681.01.T01 AT1G61430 49.851 335 164 3 278 612 446 776 4.78e-101 325
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MsG0180005681.01.T01 AT1G61390 51.923 312 146 3 288 599 508 815 2.77e-99 322
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MsG0180005681.01.T01 AT1G61360 48.903 319 160 2 288 604 405 722 4.55e-98 316
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MsG0180005681.01.T01 AT4G00960 60.465 215 83 1 286 498 42 256 2.77e-91 283
MsG0180005681.01.T01 AT1G61610 63.111 225 83 0 276 500 501 725 1.10e-90 296
MsG0180005681.01.T01 AT4G23280 43.220 354 145 3 251 603 300 598 1.39e-89 290
MsG0180005681.01.T01 AT4G23280 30.263 228 151 4 28 253 21 242 9.99e-24 106
MsG0180005681.01.T01 AT1G61460 46.364 330 156 3 285 614 439 747 9.82e-87 286
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MsG0180005681.01.T01 AT4G23210 28.511 235 147 7 40 258 27 256 3.74e-18 89.0
MsG0180005681.01.T01 AT4G04540 34.292 487 248 10 47 465 36 518 1.32e-85 277
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MsG0180005681.01.T01 AT1G61430 61.435 223 84 1 278 500 469 689 4.74e-85 281
MsG0180005681.01.T01 AT1G70530 31.793 541 321 11 86 587 75 606 1.57e-84 278
MsG0180005681.01.T01 AT1G70740 39.669 363 194 5 270 610 17 376 1.16e-83 269
MsG0180005681.01.T01 AT5G40380 34.019 535 287 13 3 500 9 514 4.44e-83 271
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MsG0180005681.01.T01 AT4G11890 44.595 296 161 2 286 581 25 317 1.21e-81 261
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MsG0180005681.01.T01 AT2G18470 38.988 336 182 8 241 571 239 556 1.89e-70 240
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MsG0180005681.01.T01 AT4G23210 28.448 232 145 7 40 255 27 253 2.55e-18 89.0
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MsG0180005681.01.T01 AT4G23210 59.677 186 73 1 280 465 340 523 2.67e-69 234
MsG0180005681.01.T01 AT4G23210 28.448 232 145 7 40 255 27 253 2.28e-18 89.4
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MsG0180005681.01.T01 AT1G68690 41.259 286 157 4 288 567 365 645 1.29e-67 234
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MsG0180005681.01.T01 AT2G42960 37.389 337 193 6 288 619 171 494 1.64e-66 226
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MsG0180005681.01.T01 AT3G13690 38.966 290 174 3 288 576 399 686 7.29e-66 230
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MsG0180005681.01.T01 AT5G18610 36.716 335 198 5 288 608 71 405 1.32e-65 224
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MsG0180005681.01.T01 AT1G23540 40.411 292 164 4 287 572 358 645 1.58e-65 228
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MsG0180005681.01.T01 AT2G18470 46.473 241 114 6 262 500 255 482 2.76e-65 224
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MsG0180005681.01.T01 AT4G11900 63.006 173 64 0 293 465 530 702 9.08e-65 226
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MsG0180005681.01.T01 AT1G55610 41.333 300 170 3 274 567 831 1130 1.25e-64 231
MsG0180005681.01.T01 AT4G35600 39.867 301 155 7 288 571 75 366 1.36e-64 218
MsG0180005681.01.T01 AT2G28590 37.667 300 184 3 276 572 74 373 1.37e-64 219
MsG0180005681.01.T01 AT1G10620 37.821 312 184 4 268 573 338 645 1.38e-64 226
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MsG0180005681.01.T01 AT5G37450 41.000 300 165 5 274 568 604 896 2.40e-64 228
MsG0180005681.01.T01 AT1G52290 45.540 213 114 2 288 500 131 341 2.46e-64 217
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MsG0180005681.01.T01 AT3G18810 39.929 283 165 3 288 567 325 605 3.02e-64 224
MsG0180005681.01.T01 AT4G01330 38.328 287 175 2 288 573 150 435 5.05e-64 218
MsG0180005681.01.T01 AT5G01550 39.655 290 166 4 287 572 366 650 5.63e-64 224
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MsG0180005681.01.T01 AT3G24790 40.636 283 165 3 288 567 53 335 5.78e-64 216
MsG0180005681.01.T01 AT4G02630 38.305 295 171 4 288 576 150 439 7.55e-64 219
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MsG0180005681.01.T01 AT1G56720 39.057 297 171 5 288 579 167 458 7.87e-64 218
MsG0180005681.01.T01 AT1G56720 39.057 297 171 5 288 579 167 458 7.87e-64 218
MsG0180005681.01.T01 AT1G56720 39.057 297 171 5 288 579 167 458 7.87e-64 218
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MsG0180005681.01.T01 AT5G18500 39.100 289 170 4 288 573 154 439 9.27e-64 218
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MsG0180005681.01.T01 AT5G18500 39.100 289 170 4 288 573 154 439 9.27e-64 218
MsG0180005681.01.T01 AT5G18500 39.100 289 170 4 288 573 154 439 9.27e-64 218
MsG0180005681.01.T01 AT5G18500 39.100 289 170 4 288 573 154 439 9.27e-64 218
MsG0180005681.01.T01 AT5G18500 39.100 289 170 4 288 573 154 439 9.27e-64 218
MsG0180005681.01.T01 AT5G13160 38.621 290 171 4 288 572 74 361 9.66e-64 217
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MsG0180005681.01.T01 AT1G09440 39.100 289 170 4 288 573 145 430 1.26e-63 217
MsG0180005681.01.T01 AT5G10290 39.933 298 166 5 287 576 277 569 1.28e-63 221
MsG0180005681.01.T01 AT5G10290 39.933 298 166 5 287 576 277 569 1.28e-63 221
MsG0180005681.01.T01 AT4G21400 51.887 212 72 2 284 465 345 556 1.30e-63 219
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MsG0180005681.01.T01 AT4G21400 51.887 212 72 2 284 465 345 556 1.30e-63 219
MsG0180005681.01.T01 AT4G21400 28.689 244 165 6 38 274 35 276 2.74e-22 101
MsG0180005681.01.T01 AT4G21400 51.887 212 72 2 284 465 345 556 1.30e-63 219
MsG0180005681.01.T01 AT4G21400 28.689 244 165 6 38 274 35 276 2.74e-22 101
MsG0180005681.01.T01 AT1G07870 35.542 332 199 5 276 594 79 408 1.36e-63 219
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MsG0180005681.01.T01 AT4G02010 38.111 307 184 5 267 567 345 651 1.98e-63 223
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MsG0180005681.01.T01 AT1G70130 39.863 291 164 5 287 572 321 605 4.53e-63 220
MsG0180005681.01.T01 AT5G59270 37.793 299 178 4 287 580 339 634 4.59e-63 221
MsG0180005681.01.T01 AT5G59270 37.793 299 178 4 287 580 355 650 5.20e-63 221
MsG0180005681.01.T01 AT4G39400 41.463 287 157 4 287 567 870 1151 7.31e-63 226
MsG0180005681.01.T01 AT1G29730 50.442 226 110 2 274 499 647 870 8.79e-63 224
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MsG0180005681.01.T01 AT5G60300 39.145 304 179 4 283 586 327 624 9.96e-63 221
MsG0180005681.01.T01 AT1G71830 40.345 290 166 5 287 571 289 576 1.04e-62 219
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MsG0180005681.01.T01 AT4G02410 38.111 307 184 6 287 591 342 644 5.55e-62 218
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MsG0180005681.01.T01 AT5G65240 39.262 298 168 5 287 576 271 563 7.82e-61 213
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MsG0180005681.01.T01 AT1G60800 40.956 293 159 7 287 571 288 574 9.42e-61 214
MsG0180005681.01.T01 AT2G48010 38.538 301 176 4 278 573 263 559 9.68e-61 213
MsG0180005681.01.T01 AT5G18910 35.366 328 193 6 288 605 180 498 1.09e-60 211
MsG0180005681.01.T01 AT5G65240 39.262 298 168 5 287 576 271 563 1.21e-60 213
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MsG0180005681.01.T01 AT3G45430 39.274 303 172 6 287 586 331 624 1.44e-60 214
MsG0180005681.01.T01 AT3G45430 39.274 303 172 6 287 586 331 624 1.44e-60 214
MsG0180005681.01.T01 AT2G37710 38.206 301 179 6 287 583 334 631 1.57e-60 214
MsG0180005681.01.T01 AT5G10530 37.417 302 180 6 287 582 322 620 1.70e-60 213
MsG0180005681.01.T01 AT3G28690 37.627 295 163 5 288 567 63 351 2.94e-60 207
MsG0180005681.01.T01 AT5G35370 39.934 303 155 7 287 568 504 800 3.53e-60 216
MsG0180005681.01.T01 AT1G49270 39.236 288 169 4 288 571 324 609 3.57e-60 213
MsG0180005681.01.T01 AT5G24080 37.618 319 182 7 270 579 374 684 4.46e-60 214
MsG0180005681.01.T01 AT5G24080 37.618 319 182 7 270 579 374 684 4.46e-60 214
MsG0180005681.01.T01 AT5G02290 35.135 333 186 6 288 605 56 373 5.01e-60 205
MsG0180005681.01.T01 AT5G02290 35.135 333 186 6 288 605 56 373 5.01e-60 205
MsG0180005681.01.T01 AT1G61590 37.179 312 175 6 273 573 77 378 5.39e-60 206
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MsG0180005681.01.T01 AT5G63710 38.776 294 166 6 287 572 241 528 5.65e-60 210
MsG0180005681.01.T01 AT5G15080 36.860 293 170 4 287 567 129 418 5.91e-60 208
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MsG0180005681.01.T01 AT1G72540 36.808 307 183 5 288 586 72 375 8.97e-60 206
MsG0180005681.01.T01 AT3G28690 37.627 295 163 5 288 567 114 402 9.74e-60 207
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MsG0180005681.01.T01 AT1G69790 36.728 324 182 6 258 567 33 347 1.15e-59 204
MsG0180005681.01.T01 AT5G63710 38.776 294 166 6 287 572 276 563 1.20e-59 210
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MsG0180005681.01.T01 AT1G15530 37.954 303 177 6 287 584 348 644 4.76e-59 209
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MsG0180005681.01.T01 AT1G07570 36.250 320 179 6 270 571 38 350 1.64e-58 202
MsG0180005681.01.T01 AT4G04960 40.210 286 159 6 290 568 337 617 1.85e-58 208
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MsG0180005681.01.T01 AT2G43700 37.333 300 177 7 287 582 299 591 2.07e-56 202
MsG0180005681.01.T01 AT2G43700 37.333 300 177 7 287 582 299 591 2.07e-56 202
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MsG0180005681.01.T01 AT3G09830 34.936 312 183 6 275 572 61 366 3.45e-56 196
MsG0180005681.01.T01 AT2G28930 35.625 320 183 6 267 571 51 362 3.58e-56 196
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MsG0180005681.01.T01 AT4G32000 37.193 285 176 2 288 571 118 400 4.96e-56 196
MsG0180005681.01.T01 AT4G13190 43.636 220 122 2 283 500 54 273 5.21e-56 192
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MsG0180005681.01.T01 AT2G28590 41.850 227 130 2 276 500 74 300 6.47e-56 192
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MsG0180005681.01.T01 AT1G31420 38.869 283 165 6 303 583 309 585 6.65e-56 199
MsG0180005681.01.T01 AT2G37050 40.351 285 160 7 288 567 593 872 6.93e-56 204
MsG0180005681.01.T01 AT1G26970 35.030 334 179 7 278 580 45 371 7.07e-56 195
MsG0180005681.01.T01 AT2G32800 39.157 332 166 11 288 588 105 431 7.89e-56 203
MsG0180005681.01.T01 AT2G32800 30.530 321 195 8 296 602 528 834 3.64e-43 166
MsG0180005681.01.T01 AT3G02810 35.959 292 178 5 288 572 52 341 8.32e-56 198
MsG0180005681.01.T01 AT1G54820 35.093 322 186 6 263 571 117 428 1.01e-55 196
MsG0180005681.01.T01 AT2G23200 36.025 322 182 7 286 598 474 780 1.04e-55 202
MsG0180005681.01.T01 AT4G32000 37.193 285 176 2 288 571 160 442 1.08e-55 196
MsG0180005681.01.T01 AT5G01950 36.426 291 173 4 288 573 529 812 1.14e-55 203
MsG0180005681.01.T01 AT1G30570 39.583 288 167 6 287 571 507 790 1.24e-55 202
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MsG0180005681.01.T01 AT5G59700 37.716 289 175 5 285 571 467 752 1.54e-55 202
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MsG0180005681.01.T01 AT5G53890 39.007 282 160 6 296 571 750 1025 2.46e-55 203
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MsG0180005681.01.T01 AT5G01950 36.426 291 173 4 288 573 614 897 2.65e-55 202

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Find 228 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!!! CTAATTATATTTTCATTAGA+GGG - Chr1:94859595-94859614 None:intergenic 15.0%
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!! ATATATCTTCTATAAGAACT+TGG + Chr1:94859531-94859550 MsG0180005681.01.T01:intron 20.0%
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!!! AGTCTTGATTACTTTTTATT+TGG + Chr1:94861009-94861028 MsG0180005681.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATAGAATATGGTTTTTCAAA+TGG + Chr1:94859998-94860017 MsG0180005681.01.T01:intron 20.0%
!!! ATATTTTATCAATTAGGAGA+GGG + Chr1:94859622-94859641 MsG0180005681.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTTTCTCATTTACATAACA+GGG + Chr1:94860168-94860187 MsG0180005681.01.T01:intron 20.0%
!!! TATTTTCTCATTTACATAAC+AGG + Chr1:94860167-94860186 MsG0180005681.01.T01:intron 20.0%
!!! TTCTTGTTTTTCATATATAG+TGG + Chr1:94861447-94861466 MsG0180005681.01.T01:intron 20.0%
! AAAAAAACCACTTCAACTAA+TGG + Chr1:94861718-94861737 MsG0180005681.01.T01:CDS 25.0%
! ACAAATAAATATTGTAGGCT+TGG + Chr1:94861681-94861700 MsG0180005681.01.T01:intron 25.0%
! AGTTACATACACAAATCAAT+TGG + Chr1:94859965-94859984 MsG0180005681.01.T01:intron 25.0%
! ATAATGTATAGTGTTGCAAA+AGG - Chr1:94859790-94859809 None:intergenic 25.0%
! ATATGTTAAACGATTTGAGA+AGG + Chr1:94859110-94859129 MsG0180005681.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTTTATTAGGAGAAGATA+GGG + Chr1:94859887-94859906 MsG0180005681.01.T01:intron 25.0%
! CCATCATAAAGATGTTTATT+AGG + Chr1:94859876-94859895 MsG0180005681.01.T01:intron 25.0%
! CCTAATAAACATCTTTATGA+TGG - Chr1:94859879-94859898 None:intergenic 25.0%
! GATAATCAAAAGTTTAAACC+TGG - Chr1:94859427-94859446 None:intergenic 25.0%
! GATATAGTAATCACTAATCA+TGG - Chr1:94859502-94859521 None:intergenic 25.0%
! GTTACATACACAAATCAATT+GGG + Chr1:94859966-94859985 MsG0180005681.01.T01:intron 25.0%
! TATGTTAAACGATTTGAGAA+GGG + Chr1:94859111-94859130 MsG0180005681.01.T01:CDS 25.0%
!! AAACAAGAAAGTTTGTTTAG+TGG - Chr1:94861436-94861455 None:intergenic 25.0%
!! ACACTAACTATATTTGAGAT+TGG + Chr1:94860402-94860421 MsG0180005681.01.T01:intron 25.0%
!! ATCTACAATGTTAGTTTCTT+TGG - Chr1:94861100-94861119 None:intergenic 25.0%
!! ATGCCAAAATCTGATATTTT+TGG - Chr1:94861276-94861295 None:intergenic 25.0%
!! CAACTTCTTTATTGTTATTC+AGG + Chr1:94860798-94860817 MsG0180005681.01.T01:intron 25.0%
!!! AAAAATATCAGATTTTGGCA+TGG + Chr1:94861275-94861294 MsG0180005681.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGCATAATCATTTTTCTTGA+TGG + Chr1:94860324-94860343 MsG0180005681.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTGTTTTTAGTGTCTTCTT+TGG - Chr1:94860142-94860161 None:intergenic 25.0%
AAAATGATCAGAGAGAACTT+TGG - Chr1:94860079-94860098 None:intergenic 30.0%
AAATCCGATGTGTATAGTTT+CGG + Chr1:94861513-94861532 MsG0180005681.01.T01:CDS 30.0%
AAATTGTAACGATTCCAAAG+TGG - Chr1:94860634-94860653 None:intergenic 30.0%
AACAAATATATGGCTATGCT+TGG + Chr1:94859191-94859210 MsG0180005681.01.T01:CDS 30.0%
AACAAGGAATTGGACAATAT+TGG + Chr1:94861944-94861963 MsG0180005681.01.T01:CDS 30.0%
AAGCATAGCCATATATTTGT+TGG - Chr1:94859192-94859211 None:intergenic 30.0%
AAGTAATCAAGACTCTTGTT+TGG - Chr1:94861003-94861022 None:intergenic 30.0%
AATATTGTCCAATTCCTTGT+TGG - Chr1:94861945-94861964 None:intergenic 30.0%
AATCTCTTTCATGAACGAAA+AGG + Chr1:94859045-94859064 MsG0180005681.01.T01:CDS 30.0%
ACAGGAAACCAACAAATATA+TGG + Chr1:94859181-94859200 MsG0180005681.01.T01:CDS 30.0%
AGAAATCTAGTGAGATTACT+AGG + Chr1:94860931-94860950 MsG0180005681.01.T01:CDS 30.0%
AGCATCAGTAAAACAACAAT+TGG - Chr1:94860432-94860451 None:intergenic 30.0%
ATGAACGAAAAGGATTATGT+GGG + Chr1:94859055-94859074 MsG0180005681.01.T01:CDS 30.0%
ATTATTAGTGGAAAGAGGAA+AGG + Chr1:94861552-94861571 MsG0180005681.01.T01:CDS 30.0%
GAAGTTGAATGAAGTAAAGT+AGG - Chr1:94861373-94861392 None:intergenic 30.0%
GATGTTTATTAGGAGAAGAT+AGG + Chr1:94859886-94859905 MsG0180005681.01.T01:intron 30.0%
GGAAACTGAAAATAACACAA+AGG + Chr1:94860345-94860364 MsG0180005681.01.T01:intron 30.0%
GGGTAAAACAACATAGAATA+TGG + Chr1:94859986-94860005 MsG0180005681.01.T01:intron 30.0%
TAGATTTCTGTGTTGAAGTT+TGG - Chr1:94860920-94860939 None:intergenic 30.0%
TCAATATTATATCCCAGTTG+TGG + Chr1:94859310-94859329 MsG0180005681.01.T01:CDS 30.0%
TGAATTATATCCATTCCACA+AGG + Chr1:94859342-94859361 MsG0180005681.01.T01:CDS 30.0%
TGTTTATTAGGAGAAGATAG+GGG + Chr1:94859888-94859907 MsG0180005681.01.T01:intron 30.0%
TTCTTTGGATGGTCAATAAA+AGG - Chr1:94861085-94861104 None:intergenic 30.0%
TTGCAAGTAAAAACAGCAAA+TGG - Chr1:94858616-94858635 None:intergenic 30.0%
TTTCCTCTACGCTTAAAATA+TGG - Chr1:94861905-94861924 None:intergenic 30.0%
! AATATTGGTGATTCAACCAA+CGG + Chr1:94861959-94861978 MsG0180005681.01.T01:CDS 30.0%
! ACAATGTTAGTTTCTTTGGA+TGG - Chr1:94861096-94861115 None:intergenic 30.0%
! ATTAGCTTATTGTGTGTGTT+CGG - Chr1:94860119-94860138 None:intergenic 30.0%
! ATTTTGTACTCACATATCTC+CGG - Chr1:94861611-94861630 None:intergenic 30.0%
! GAGATTACTAGGATTTTGTT+TGG + Chr1:94860942-94860961 MsG0180005681.01.T01:CDS 30.0%
! TATATTTTCATTAGAGGGAC+AGG - Chr1:94859590-94859609 None:intergenic 30.0%
! TGTTATGTTTCTACTTTCTG+TGG + Chr1:94859678-94859697 MsG0180005681.01.T01:intron 30.0%
!! AGAATATCATGCTGATTCTT+TGG - Chr1:94860495-94860514 None:intergenic 30.0%
!! GATCACGGTGTATTATTTTA+AGG - Chr1:94861215-94861234 None:intergenic 30.0%
AAGGTAATAGCTTTCGCTTA+TGG - Chr1:94861125-94861144 None:intergenic 35.0%
AATGCTATTGTTGCCATTGT+AGG - Chr1:94861836-94861855 None:intergenic 35.0%
ACTGATATTGATGCAGGAAA+AGG + Chr1:94860369-94860388 MsG0180005681.01.T01:intron 35.0%
AGGTAATAGCTTTCGCTTAT+GGG - Chr1:94861124-94861143 None:intergenic 35.0%
AGTTATCTGCAGATAGGTAT+GGG - Chr1:94859222-94859241 None:intergenic 35.0%
ATAAGCGAAAGCTATTACCT+TGG + Chr1:94861124-94861143 MsG0180005681.01.T01:CDS 35.0%
ATTGTAGGCTTGGACAAAAT+GGG + Chr1:94861691-94861710 MsG0180005681.01.T01:intron 35.0%
CAACGTCAGAAAATCATCAA+AGG + Chr1:94861150-94861169 MsG0180005681.01.T01:CDS 35.0%
CATCAAAAGAAGCCATTGTT+TGG + Chr1:94858957-94858976 MsG0180005681.01.T01:CDS 35.0%
CATGAACGAAAAGGATTATG+TGG + Chr1:94859054-94859073 MsG0180005681.01.T01:CDS 35.0%
CTATCTAACAAGACATTGCT+AGG - Chr1:94861243-94861262 None:intergenic 35.0%
GAACACATAACAAACCAATG+TGG - Chr1:94861793-94861812 None:intergenic 35.0%
GAATAAGTTCCTTCTATGCT+AGG - Chr1:94861746-94861765 None:intergenic 35.0%
GATTCCGAAACTATACACAT+CGG - Chr1:94861520-94861539 None:intergenic 35.0%
GGTCAATATCTCTTACACAA+AGG - Chr1:94858877-94858896 None:intergenic 35.0%
GTCATCAAATACATCCACAT+TGG + Chr1:94861776-94861795 MsG0180005681.01.T01:CDS 35.0%
TAAAATATGGTGGCTCAAGA+GGG - Chr1:94861892-94861911 None:intergenic 35.0%
TATCCATGCATTGCATATTC+TGG - Chr1:94861483-94861502 None:intergenic 35.0%
TATTGTAGGCTTGGACAAAA+TGG + Chr1:94861690-94861709 MsG0180005681.01.T01:intron 35.0%
TCAAATCTAACACCACAACT+GGG - Chr1:94859325-94859344 None:intergenic 35.0%
TCCTCCAATAGTAGTAACAA+TGG + Chr1:94858791-94858810 MsG0180005681.01.T01:CDS 35.0%
TCGAGAAAAAAGTTTCTGCT+AGG + Chr1:94859655-94859674 MsG0180005681.01.T01:intron 35.0%
TCGTTCATGAAAGAGATTTC+TGG - Chr1:94859043-94859062 None:intergenic 35.0%
TCTCAAAGAAAGCTGTAATG+TGG + Chr1:94860512-94860531 MsG0180005681.01.T01:intron 35.0%
TCTGCCATTGTTACTACTAT+TGG - Chr1:94858798-94858817 None:intergenic 35.0%
TGCACTAGAGTTTAAAAACG+AGG + Chr1:94860882-94860901 MsG0180005681.01.T01:CDS 35.0%
TGGAAATGATGTTACCACTT+TGG + Chr1:94860617-94860636 MsG0180005681.01.T01:CDS 35.0%
TGGAAATGCTTCTGCTAAAT+CGG + Chr1:94859138-94859157 MsG0180005681.01.T01:CDS 35.0%
TGGAGATTATTAGTGGAAAG+AGG + Chr1:94861547-94861566 MsG0180005681.01.T01:CDS 35.0%
TGTGTATAGTTTCGGAATCA+TGG + Chr1:94861521-94861540 MsG0180005681.01.T01:CDS 35.0%
TTAAAATATGGTGGCTCAAG+AGG - Chr1:94861893-94861912 None:intergenic 35.0%
TTAGCTTATTGTGTGTGTTC+GGG - Chr1:94860118-94860137 None:intergenic 35.0%
TTCAAATCTAACACCACAAC+TGG - Chr1:94859326-94859345 None:intergenic 35.0%
! AACAATGGCTTCTTTTGATG+TGG - Chr1:94858957-94858976 None:intergenic 35.0%
! ATACAAGCTGCTGTTGATAA+TGG + Chr1:94858677-94858696 MsG0180005681.01.T01:CDS 35.0%
! ATGGAGATAAAGTATTCCAC+GGG - Chr1:94861181-94861200 None:intergenic 35.0%
! ATGTTTCTACTTTCTGTGGT+GGG + Chr1:94859682-94859701 MsG0180005681.01.T01:intron 35.0%
! CATGGAGATAAAGTATTCCA+CGG - Chr1:94861182-94861201 None:intergenic 35.0%
! GCACAGTGATGATATGATTT+TGG - Chr1:94858933-94858952 None:intergenic 35.0%
! TATGTTTCTACTTTCTGTGG+TGG + Chr1:94859681-94859700 MsG0180005681.01.T01:intron 35.0%
! TTCAAACGTGTTGTTGTAGT+TGG + Chr1:94860597-94860616 MsG0180005681.01.T01:intron 35.0%
!! AAAGGTACTGATATTGATGC+AGG + Chr1:94860363-94860382 MsG0180005681.01.T01:intron 35.0%
!! ATATTTGTTGGTTTCCTGTG+AGG - Chr1:94859180-94859199 None:intergenic 35.0%
!! ATGGTTCTGGAGATTATTAG+TGG + Chr1:94861540-94861559 MsG0180005681.01.T01:CDS 35.0%
!! TTACTGATGCTGTTAGTCTT+CGG + Chr1:94860441-94860460 MsG0180005681.01.T01:intron 35.0%
!!! TTTTAAGGCGAGAATCTTCA+TGG - Chr1:94861200-94861219 None:intergenic 35.0%
!!! TTTTTTCAAGTTGACCGATC+AGG - Chr1:94859750-94859769 None:intergenic 35.0%
AAAATATGGTGGCTCAAGAG+GGG - Chr1:94861891-94861910 None:intergenic 40.0%
AAGGAGAGCAATGAACAAAG+AGG - Chr1:94858649-94858668 None:intergenic 40.0%
ACATCAAAACACTCCTAGAC+TGG + Chr1:94858765-94858784 MsG0180005681.01.T01:CDS 40.0%
AGGAGAGCAATGAACAAAGA+GGG - Chr1:94858648-94858667 None:intergenic 40.0%
ATATTGACCCCAAAATCTGC+CGG + Chr1:94858888-94858907 MsG0180005681.01.T01:CDS 40.0%
ATCAACAGCAGCTTGTATGA+TGG - Chr1:94858675-94858694 None:intergenic 40.0%
ATTCAGGGAATTCTTCCAGA+TGG + Chr1:94860814-94860833 MsG0180005681.01.T01:intron 40.0%
ATTGTCCAATTCCTTGTTGG+AGG - Chr1:94861942-94861961 None:intergenic 40.0%
ATTTACATAACAGGGCTCAG+GGG + Chr1:94860176-94860195 MsG0180005681.01.T01:intron 40.0%
CAGTTATCTGCAGATAGGTA+TGG - Chr1:94859223-94859242 None:intergenic 40.0%
CATTGCTAGGTTTCAGATCA+CGG - Chr1:94861230-94861249 None:intergenic 40.0%
CATTTACATAACAGGGCTCA+GGG + Chr1:94860175-94860194 MsG0180005681.01.T01:intron 40.0%
CCTCTACGCTTAAAATATGG+TGG - Chr1:94861902-94861921 None:intergenic 40.0%
CTAGGATCCATTAGTTGAAG+TGG - Chr1:94861728-94861747 None:intergenic 40.0%
GCCATTGTTACTACTATTGG+AGG - Chr1:94858795-94858814 None:intergenic 40.0%
GCGGTTCAACAACATTCTTT+GGG + Chr1:94859087-94859106 MsG0180005681.01.T01:CDS 40.0%
GGTAATAGCTTTCGCTTATG+GGG - Chr1:94861123-94861142 None:intergenic 40.0%
GTTGGAACGGTAAGAGTTAT+CGG - Chr1:94858747-94858766 None:intergenic 40.0%
TAGTTTCGGAATCATGGTTC+TGG + Chr1:94861527-94861546 MsG0180005681.01.T01:CDS 40.0%
TCAACAGCAGCTTGTATGAT+GGG - Chr1:94858674-94858693 None:intergenic 40.0%
TCATTTACATAACAGGGCTC+AGG + Chr1:94860174-94860193 MsG0180005681.01.T01:intron 40.0%
TCCTGTGAACAAATCCTGAT+CGG + Chr1:94859733-94859752 MsG0180005681.01.T01:intron 40.0%
TCTCCAGAATATGCAATGCA+TGG + Chr1:94861477-94861496 MsG0180005681.01.T01:CDS 40.0%
TGGATTTGGAGAAGTCTACA+AGG + Chr1:94860716-94860735 MsG0180005681.01.T01:CDS 40.0%
TTTGCTGCAGAAAACAGGAT+AGG + Chr1:94860687-94860706 MsG0180005681.01.T01:CDS 40.0%
! ATTTTCTGACGTTGAGACCA+AGG - Chr1:94861144-94861163 None:intergenic 40.0%
! CTAATGGATCCTAGCATAGA+AGG + Chr1:94861734-94861753 MsG0180005681.01.T01:CDS 40.0%
! GAAAGTACATGCACGATTGT+AGG + Chr1:94861327-94861346 MsG0180005681.01.T01:CDS 40.0%
! TTAGTGGACGTCACTGATAA+TGG - Chr1:94861420-94861439 None:intergenic 40.0%
!! ACAGATTTGCTGCAGAAAAC+AGG + Chr1:94860682-94860701 MsG0180005681.01.T01:CDS 40.0%
!! CCACCATATTTTAAGCGTAG+AGG + Chr1:94861899-94861918 MsG0180005681.01.T01:CDS 40.0%
!! GATTTCTGGACTTTTCTCCA+CGG - Chr1:94859029-94859048 None:intergenic 40.0%
!!! GGAGTGTTTTGATGTTGGAA+CGG - Chr1:94858760-94858779 None:intergenic 40.0%
!!! GTCTAGGAGTGTTTTGATGT+TGG - Chr1:94858765-94858784 None:intergenic 40.0%
AACACTGTGGACACTGTCTA+TGG + Chr1:94858845-94858864 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
AACGATTTGAGAAGGGAGAC+TGG + Chr1:94859118-94859137 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
AAGAGGCTTACAAGAAGCTC+TGG + Chr1:94860853-94860872 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
AATGCTTCTGCTAAATCGGC+TGG + Chr1:94859142-94859161 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
AATTATTGCCGTCTGCCTTG+TGG - Chr1:94859360-94859379 None:intergenic 45.0%
ACAGCAACTTCTTGTCCATC+TGG - Chr1:94860832-94860851 None:intergenic 45.0%
ACTGGTTGGAACTTCAGCTA+TGG - Chr1:94859266-94859285 None:intergenic 45.0%
AGAAAACGCAACCTCCAACA+AGG + Chr1:94861928-94861947 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
AGCTGCAGTTATCTGCAGAT+AGG - Chr1:94859228-94859247 None:intergenic 45.0%
AGGCAGACGGCAATAATTCT+TGG + Chr1:94859362-94859381 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
AGTTGCAAGCAACAACACTG+TGG + Chr1:94858832-94858851 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
AGTTGCTGCAGAGGAAAATC+TGG + Chr1:94859283-94859302 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
ATCATCAAAGGAATTGCCCG+TGG + Chr1:94861162-94861181 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
CTGCTTCTATCACACACAAC+CGG - Chr1:94858910-94858929 None:intergenic 45.0%
GAAAACAGGATAGGCAAAGG+TGG + Chr1:94860696-94860715 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
GACAAGAAGTTGCTGTGAAG+AGG + Chr1:94860836-94860855 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
GCAGAAAACAGGATAGGCAA+AGG + Chr1:94860693-94860712 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
GGCAGACGGCAATAATTCTT+GGG + Chr1:94859363-94859382 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
GGCGGTTCAACAACATTCTT+TGG + Chr1:94859086-94859105 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
TAGGAGAAGATAGGGGAATC+AGG + Chr1:94859895-94859914 MsG0180005681.01.T01:intron 45.0%
TATCCATTCCACAAGGCAGA+CGG + Chr1:94859349-94859368 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
TATCTGCAGATAACTGCAGC+TGG + Chr1:94859227-94859246 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
TATCTGCAGATAGGTATGGG+AGG - Chr1:94859219-94859238 None:intergenic 45.0%
TCCAGATGACAGACCTACAA+TGG + Chr1:94861820-94861839 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
TTAAACCTGGTCGAGCTGAA+AGG - Chr1:94859414-94859433 None:intergenic 45.0%
TTGAGTGACAGTGATTCCGT+TGG - Chr1:94861978-94861997 None:intergenic 45.0%
TTTACATAACAGGGCTCAGG+GGG + Chr1:94860177-94860196 MsG0180005681.01.T01:intron 45.0%
! ACACACAACCGGCAGATTTT+GGG - Chr1:94858899-94858918 None:intergenic 45.0%
! ACCGATCAGGATTTGTTCAC+AGG - Chr1:94859737-94859756 None:intergenic 45.0%
! AGATTTTCCTCTGCAGCAAC+TGG - Chr1:94859284-94859303 None:intergenic 45.0%
! AGGATAGGCAAAGGTGGATT+TGG + Chr1:94860702-94860721 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
! AGTGTTGTTGCTTGCAACTG+TGG - Chr1:94858831-94858850 None:intergenic 45.0%
!! CAGAGTGTGTTGATGACATC+CGG + Chr1:94861589-94861608 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
!! CGTCACTGATAATGGTTGCT+TGG - Chr1:94861412-94861431 None:intergenic 45.0%
!! CTTACAAGAAGCTCTGGACA+AGG + Chr1:94860859-94860878 MsG0180005681.01.T01:CDS 45.0%
AAGGATTATGTGGGCGACGT+TGG + Chr1:94859064-94859083 MsG0180005681.01.T01:CDS 50.0%
AGCTGAAAGGCGAGGATTTG+TGG - Chr1:94859401-94859420 None:intergenic 50.0%
AGGATTATGTGGGCGACGTT+GGG + Chr1:94859065-94859084 MsG0180005681.01.T01:CDS 50.0%
CGCAACCTCCAACAAGGAAT+TGG + Chr1:94861934-94861953 MsG0180005681.01.T01:CDS 50.0%
GCATGCGCTGTACCAAACAA+TGG - Chr1:94858972-94858991 None:intergenic 50.0%
GCCATTGTAGGTCTGTCATC+TGG - Chr1:94861824-94861843 None:intergenic 50.0%
GCTGAAAGGCGAGGATTTGT+GGG - Chr1:94859400-94859419 None:intergenic 50.0%
GGTTGATTGAAGGGCTGTTG+AGG - Chr1:94861862-94861881 None:intergenic 50.0%
TATTGGAGGAGAGCCAGTCT+AGG - Chr1:94858781-94858800 None:intergenic 50.0%
TGCTGCAGAGGAAAATCTGG+AGG + Chr1:94859286-94859305 MsG0180005681.01.T01:CDS 50.0%
TTTCCTCTGCAGCAACTGGT+TGG - Chr1:94859280-94859299 None:intergenic 50.0%
! CACACAACCGGCAGATTTTG+GGG - Chr1:94858898-94858917 None:intergenic 50.0%
! CACACACAACCGGCAGATTT+TGG - Chr1:94858900-94858919 None:intergenic 50.0%
! GCAGCTTGTATGATGGGAGA+AGG - Chr1:94858668-94858687 None:intergenic 50.0%
! TTCTGGACTTTTCTCCACGG+TGG - Chr1:94859026-94859045 None:intergenic 50.0%
!! GGGATGGCAGGTTGATTGAA+GGG - Chr1:94861871-94861890 None:intergenic 50.0%
ATTATGTGGGCGACGTTGGG+CGG + Chr1:94859068-94859087 MsG0180005681.01.T01:CDS 55.0%
GAAAGGCGAGGATTTGTGGG+TGG - Chr1:94859397-94859416 None:intergenic 55.0%
GGCAAGTCAGTGAACCTCAC+AGG + Chr1:94859163-94859182 MsG0180005681.01.T01:CDS 55.0%
GTTCCAACCAGTTGCTGCAG+AGG + Chr1:94859274-94859293 MsG0180005681.01.T01:CDS 55.0%
TATGGTGGCTCAAGAGGGGA+TGG - Chr1:94861887-94861906 None:intergenic 55.0%
TTGCCGTCTGCCTTGTGGAA+TGG - Chr1:94859355-94859374 None:intergenic 55.0%
! TCGTCGCTTCTTTTCCACCG+TGG + Chr1:94859009-94859028 MsG0180005681.01.T01:CDS 55.0%
!! CTGTGGTGGGCACAAGAGAA+GGG + Chr1:94859695-94859714 MsG0180005681.01.T01:intron 55.0%
!! GGGGATGGCAGGTTGATTGA+AGG - Chr1:94861872-94861891 None:intergenic 55.0%
!! TCTGTGGTGGGCACAAGAGA+AGG + Chr1:94859694-94859713 MsG0180005681.01.T01:intron 55.0%
!! TGTGGTGGGCACAAGAGAAG+GGG + Chr1:94859696-94859715 MsG0180005681.01.T01:intron 55.0%
AGGCGAGGATTTGTGGGTGG+AGG - Chr1:94859394-94859413 None:intergenic 60.0%
CCTCGCCTTTCAGCTCGACC+AGG + Chr1:94859406-94859425 MsG0180005681.01.T01:CDS 65.0%
CCTGGTCGAGCTGAAAGGCG+AGG - Chr1:94859409-94859428 None:intergenic 65.0%
GTGGCTCAAGAGGGGATGGC+AGG - Chr1:94861883-94861902 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 94858602 94862012 94858602 ID=MsG0180005681.01;Name=MsG0180005681.01
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Chr1 exon 94860616 94860737 94860616 ID=MsG0180005681.01.T01:exon:19230;Parent=MsG0180005681.01.T01
Chr1 exon 94860820 94861030 94860820 ID=MsG0180005681.01.T01:exon:19231;Parent=MsG0180005681.01.T01
Chr1 exon 94861118 94861355 94861118 ID=MsG0180005681.01.T01:exon:19232;Parent=MsG0180005681.01.T01
Chr1 exon 94861467 94861617 94861467 ID=MsG0180005681.01.T01:exon:19233;Parent=MsG0180005681.01.T01
Chr1 exon 94861698 94862012 94861698 ID=MsG0180005681.01.T01:exon:19234;Parent=MsG0180005681.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0180005681.01.T01

ATGGCTTCATTCCATTTGCTGTTTTTACTTGCAACTTTCTTTTCCCTCTTTGTTCATTGCTCTCCTTCTCCCATCATACAAGCTGCTGTTGATAATGGCACACATGCTTACTATAACTGCACACGAAACAACACTTCTAATACCGATAACTCTTACCGTTCCAACATCAAAACACTCCTAGACTGGCTCTCCTCCAATAGTAGTAACAATGGCAGATACTACAACGCCACAGTTGCAAGCAACAACACTGTGGACACTGTCTATGGTCTCTTCCTTTGTGTAAGAGATATTGACCCCAAAATCTGCCGGTTGTGTGTGATAGAAGCAGCCAAAATCATATCATCACTGTGCACCACATCAAAAGAAGCCATTGTTTGGTACAGCGCATGCTATGTGCACTATTCTGATCGTCGCTTCTTTTCCACCGTGGAGAAAAGTCCAGAAATCTCTTTCATGAACGAAAAGGATTATGTGGGCGACGTTGGGCGGTTCAACAACATTCTTTGGGATATGTTAAACGATTTGAGAAGGGAGACTGGAAATGCTTCTGCTAAATCGGCTGGCAAGTCAGTGAACCTCACAGGAAACCAACAAATATATGGCTATGCTTGGTGCCTCCCATACCTATCTGCAGATAACTGCAGCTGGTGTCTTAGTGATGCCATAGCTGAAGTTCCAACCAGTTGCTGCAGAGGAAAATCTGGAGGCTCAATATTATATCCCAGTTGTGGTGTTAGATTTGAATTATATCCATTCCACAAGGCAGACGGCAATAATTCTTGGGTGCTGCCTCCACCCACAAATCCTCGCCTTTCAGCTCGACCAGTTGGAAATGATGTTACCACTTTGGAATCGTTACAATTTGAATTTGCGAAAATTGAAGCAGCAACAAACAGATTTGCTGCAGAAAACAGGATAGGCAAAGGTGGATTTGGAGAAGTCTACAAGGGAATTCTTCCAGATGGACAAGAAGTTGCTGTGAAGAGGCTTACAAGAAGCTCTGGACAAGGTGCACTAGAGTTTAAAAACGAGGTTCAAGTTATAGCCAAACTTCAACACAGAAATCTAGTGAGATTACTAGGATTTTGTTTGGAAGATGAAGAGAAGATACTTATCTATGAGTACGTGCCAAACAAGAGTCTTGATTACTTTTTATTTGATCCCCATAAGCGAAAGCTATTACCTTGGTCTCAACGTCAGAAAATCATCAAAGGAATTGCCCGTGGAATACTTTATCTCCATGAAGATTCTCGCCTTAAAATAATACACCGTGATCTGAAACCTAGCAATGTCTTGTTAGATAGTAACATGAATCCAAAAATATCAGATTTTGGCATGGCTAGAATTGTATCTATAGATCAAATTGAAGAAAGTACATGCACGATTGTAGGAACATATGGTTATATATCTCCAGAATATGCAATGCATGGATACTTTTCTGTGAAATCCGATGTGTATAGTTTCGGAATCATGGTTCTGGAGATTATTAGTGGAAAGAGGAAAGGTTGTTCTGCTGAATCAGAGTGTGTTGATGACATCCGGAGATATGCTTGGACAAAATGGGAAGAAAAAAAACCACTTCAACTAATGGATCCTAGCATAGAAGGAACTTATTCACATGAAGAAGTCATCAAATACATCCACATTGGTTTGTTATGTGTTCAAGAAAATCCAGATGACAGACCTACAATGGCAACAATAGCATTCTACCTCAACAGCCCTTCAATCAACCTGCCATCCCCTCTTGAGCCACCATATTTTAAGCGTAGAGGAAATGAAGAAAACGCAACCTCCAACAAGGAATTGGACAATATTGGTGATTCAACCAACGGAATCACTGTCACTCAATTCTTTCCTCGTTAA

Protein sequence

>MsG0180005681.01.T01

MASFHLLFLLATFFSLFVHCSPSPIIQAAVDNGTHAYYNCTRNNTSNTDNSYRSNIKTLLDWLSSNSSNNGRYYNATVASNNTVDTVYGLFLCVRDIDPKICRLCVIEAAKIISSLCTTSKEAIVWYSACYVHYSDRRFFSTVEKSPEISFMNEKDYVGDVGRFNNILWDMLNDLRRETGNASAKSAGKSVNLTGNQQIYGYAWCLPYLSADNCSWCLSDAIAEVPTSCCRGKSGGSILYPSCGVRFELYPFHKADGNNSWVLPPPTNPRLSARPVGNDVTTLESLQFEFAKIEAATNRFAAENRIGKGGFGEVYKGILPDGQEVAVKRLTRSSGQGALEFKNEVQVIAKLQHRNLVRLLGFCLEDEEKILIYEYVPNKSLDYFLFDPHKRKLLPWSQRQKIIKGIARGILYLHEDSRLKIIHRDLKPSNVLLDSNMNPKISDFGMARIVSIDQIEESTCTIVGTYGYISPEYAMHGYFSVKSDVYSFGIMVLEIISGKRKGCSAESECVDDIRRYAWTKWEEKKPLQLMDPSIEGTYSHEEVIKYIHIGLLCVQENPDDRPTMATIAFYLNSPSINLPSPLEPPYFKRRGNEENATSNKELDNIGDSTNGITVTQFFPR*