AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180003617.01


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MsG0180003617.01.T01 AT3G24000 24.262 305 197 7 360 648 230 516 1.85e-14 79.0
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MsG0180003617.01.T01 AT2G35130 22.185 302 204 6 354 655 247 517 1.43e-12 72.8
MsG0180003617.01.T01 AT5G55740 22.874 341 222 7 173 512 257 557 7.44e-14 77.0
MsG0180003617.01.T01 AT2G35130 27.358 212 121 7 355 556 329 517 7.47e-14 76.6
MsG0180003617.01.T01 AT2G35130 22.185 302 204 6 354 655 222 492 2.08e-13 75.5
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MsG0180003617.01.T01 AT3G06430 25.306 245 151 9 323 556 124 347 1.38e-13 75.5
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Find 347 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 609 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TTGAATTATTAGCAGCAATT+TGG 0.194750 1:+65269538 None:intergenic
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GTTGGGTTTCTAAGGATTTA+GGG 0.238438 1:-65271138 MsG0180003617.01.T01:intron
ACCACATGCATCAATATTTC+TGG 0.238968 1:-65270554 MsG0180003617.01.T01:CDS
GAAACCTGATGAAGGGCTTT+TGG 0.263985 1:-65274535 MsG0180003617.01.T01:CDS
GAGGAGATGGCTGAGGATAT+TGG 0.276081 1:-65275029 MsG0180003617.01.T01:CDS
GTGGCTTGCATGGAAGAAAA+TGG 0.295454 1:-65274456 MsG0180003617.01.T01:CDS
CTTCCATAGGTGCTCACATT+AGG 0.296087 1:+65274681 None:intergenic
ACCGTGTATCTGATTTAGTA+TGG 0.297314 1:-65270406 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATTCAAAAGATGAAGGAAAA+TGG 0.308685 1:-65274711 MsG0180003617.01.T01:CDS
TTCCTATACCACGGTGGTTT+CGG 0.309341 1:-65275201 MsG0180003617.01.T01:CDS
TGCTGAAATTAGCCCAAATT+CGG 0.311838 1:-65268989 MsG0180003617.01.T01:CDS
TGAATTATTAGCAGCAATTT+GGG 0.315028 1:+65269452 None:intergenic
TGAATTATTAGCAGCAATTT+GGG 0.315028 1:+65269539 None:intergenic
TGTTAATAAAGAAGACTCTT+TGG 0.318766 1:-65270663 MsG0180003617.01.T01:CDS
GTAAAAGTGTTAGAAGCTTT+TGG 0.320325 1:+65276242 None:intergenic
ACTTACTGAATTTGATAGAT+TGG 0.320374 1:-65269997 MsG0180003617.01.T01:CDS
CTTAATGTTTGTGCTAATTT+GGG 0.320429 1:-65275767 MsG0180003617.01.T01:CDS
TTGGGCAAGGTTTCCAGTTT+GGG 0.321530 1:+65269362 None:intergenic
CACATATATTCTAGTATACT+TGG 0.321842 1:+65274416 None:intergenic
CGGCTGAGGCAAGTGGGGTT+AGG 0.323311 1:+65276166 None:intergenic
AGGAGATGGCTGAGGATATT+GGG 0.325091 1:-65275028 MsG0180003617.01.T01:CDS
CGATCAAGCATTGCAAATTC+AGG 0.334337 1:+65269912 None:intergenic
ATTGGGCAAGGTTTCCAGTT+TGG 0.336602 1:+65269361 None:intergenic
CGGCGACGGCAAGGAGGCCG+AGG 0.339807 1:+65276032 None:intergenic
GGCAAGGAGGCCGAGGGAAT+TGG 0.342000 1:+65276039 None:intergenic
TGATATATCATCAGCAATTT+GGG 0.345457 1:+65269626 None:intergenic
TGTTTCAATAATTCCCAAAC+TGG 0.350476 1:-65269375 MsG0180003617.01.T01:CDS
GTGTTAGGTGTATATGCTTT+TGG 0.357144 1:+65275341 None:intergenic
TACCCTGAAATTTACAAACT+TGG 0.363494 1:-65268878 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATGCTGTCACGCGCCGGCTT+AGG 0.367239 1:-65275853 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGAGTGTTTGATGTTGTTGA+TGG 0.374926 1:-65271065 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGAATTATTGAAACAATCAT+TGG 0.374943 1:+65269560 None:intergenic
ACATTGATGCCTTCCACATA+TGG 0.381220 1:+65270683 None:intergenic
CAGGTGAAGCACTTATACTT+TGG 0.382852 1:-65274626 MsG0180003617.01.T01:CDS
AATGGAGAAACAGAGTGATA+TGG 0.383356 1:-65270207 MsG0180003617.01.T01:CDS
CAAGTGGGGTTAGGGAGGTG+AGG 0.385256 1:+65276175 None:intergenic
AACATAAGAATATTGTGAAT+TGG 0.387027 1:+65275457 None:intergenic
TCACTTCCATAATAAGAATT+AGG 0.390048 1:+65274286 None:intergenic
GTTGCTTCCAAATTTGTTGA+TGG 0.392405 1:-65275405 MsG0180003617.01.T01:CDS
AGGAGCCATCCTTGGTGGCC+TGG 0.393178 1:-65270374 MsG0180003617.01.T01:CDS
GCGGATCTCAACAAGATCTT+TGG 0.395116 1:-65268838 MsG0180003617.01.T01:CDS
CTGAATTTGCAATGCTTGAT+CGG 0.397821 1:-65269911 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATATGGAAATTCTACTTGTA+AGG 0.398845 1:-65269875 MsG0180003617.01.T01:CDS
GTCAAATCCATGCTTCGTTC+CGG 0.399976 1:-65275971 MsG0180003617.01.T01:CDS
CAAATTCAGTAAGTGGAGAT+TGG 0.401543 1:+65270006 None:intergenic
TGGAGTCGAGACGGTGGAGC+TGG 0.401741 1:+65276059 None:intergenic
GAAATTTACAAACTTGGATT+CGG 0.403344 1:-65268872 MsG0180003617.01.T01:CDS
GATGCATTAAACCCGAATTT+GGG 0.404304 1:+65268977 None:intergenic
GAAGACCCTTTGACCAGCTT+TGG 0.407913 1:+65274840 None:intergenic
TACCCTAATGTGAGCACCTA+TGG 0.408329 1:-65274684 MsG0180003617.01.T01:CDS
GAAGTATTGTAAGATGCCTT+TGG 0.408799 1:+65269582 None:intergenic
TCCGCCGCCATTTCAAGGTC+AGG 0.409434 1:+65275824 None:intergenic
TTCCATAGGTGCTCACATTA+GGG 0.411981 1:+65274682 None:intergenic
GATCCCCAAAATATGCTATC+AGG 0.412408 1:+65270288 None:intergenic
TCGGTTGTTTGAGAATGATA+TGG 0.413400 1:-65269892 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGCTGAGGCAAGTGGGGTTA+GGG 0.413865 1:+65276167 None:intergenic
AACTGCTGAGAAAATTGTTC+AGG 0.417262 1:-65275525 MsG0180003617.01.T01:CDS
GCTGAAATTAGCCCAAATTC+GGG 0.417690 1:-65268988 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATCCAAGTTTGTAAATTTCA+GGG 0.419252 1:+65268876 None:intergenic
TTTGGCGTACATTCACCATT+TGG 0.421159 1:+65269735 None:intergenic
TGAAGGCCGGTTTCATGGAC+CGG 0.425843 1:-65275172 MsG0180003617.01.T01:CDS
AATGGATACATTCTGTAATT+GGG 0.426020 1:+65269344 None:intergenic
CAACTTCAAAACGGCGTGGC+AGG 0.429280 1:-65269431 MsG0180003617.01.T01:CDS
CTTGGATTCGGTTCCTTCAA+CGG 0.432171 1:-65268860 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATTTAGTATGGGGAAAGGTT+AGG 0.432324 1:-65270394 MsG0180003617.01.T01:CDS
TGCAGAGTCTGATAAAGGTT+TGG 0.433252 1:-65270955 MsG0180003617.01.T01:CDS
TGCCGAAACCACCGTGGTAT+AGG 0.434397 1:+65275199 None:intergenic
GCCGTCGCCGCTGCTAAAGC+TGG 0.435646 1:-65276019 MsG0180003617.01.T01:CDS
TTTGATGAAATGCCTGGGTT+TGG 0.435754 1:-65275719 MsG0180003617.01.T01:CDS
AGAAAATTGTTCAGGCTATG+AGG 0.436199 1:-65275517 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATGAAGCTTTGTTGTGGAAA+TGG 0.436417 1:-65275662 MsG0180003617.01.T01:CDS
TGCTTTCTTTAGAAAGGCCT+TGG 0.436537 1:-65274484 MsG0180003617.01.T01:CDS
TTGGTGAAGTTGAATGATGA+TGG 0.439802 1:+65276364 None:intergenic
TCGTATAATATACTTATTGA+TGG 0.440888 1:-65274987 MsG0180003617.01.T01:CDS
GTTGTGTAAATCCTAGTGTT+AGG 0.442744 1:+65275326 None:intergenic
GCGACTCCGCCGCCATTTCA+AGG 0.444840 1:+65275819 None:intergenic
ACTTGTGAAGGCCGGTTTCA+TGG 0.445365 1:-65275177 MsG0180003617.01.T01:CDS
TTAATGAACAGCACATCTCT+TGG 0.445602 1:-65269827 MsG0180003617.01.T01:CDS
CTGATGATATATCAACTTCA+AGG 0.446971 1:-65269617 MsG0180003617.01.T01:CDS
CTGTCTTGTCCATGTATGCC+TGG 0.448788 1:-65270122 MsG0180003617.01.T01:CDS
TTCTGATCCGAGATTTCCAT+TGG 0.449054 1:+65268948 None:intergenic
ACGTGCCCGGTCCATGAAAC+CGG 0.449725 1:+65275166 None:intergenic
AGCTCAGGATACGTTTCTCC+AGG 0.451463 1:+65270104 None:intergenic
GCTTCCGACGATGATGCTTC+CGG 0.453928 1:-65275902 MsG0180003617.01.T01:CDS
AGTGGGGTTAGGGAGGTGAG+GGG 0.454454 1:+65276177 None:intergenic
GGTCAGGGAGCTTCCTAAGC+CGG 0.455363 1:+65275840 None:intergenic
AATCTATCAAATTCAGTAAG+TGG 0.457730 1:+65269999 None:intergenic
AAATTCAGTAAGTGGAGATT+GGG 0.458227 1:+65270007 None:intergenic
GAATCGGTGTGCCTGCGAAT+CGG 0.458720 1:-65275121 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGAGGTGCAGAGTCTGATAA+AGG 0.458753 1:-65270960 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATGGCATTCCATCCTGCAAT+TGG 0.459753 1:+65270702 None:intergenic
GCTCGAGGCAATGCGTTGTC+AGG 0.459778 1:-65275252 MsG0180003617.01.T01:CDS
TCAGCTTTCTATCGCTCAAA+AGG 0.460953 1:-65269948 MsG0180003617.01.T01:CDS
GAAGTATTGTAAGCTGCCTT+CGG 0.462553 1:+65269495 None:intergenic
CTGCTAATAATTCAACTTCA+CGG 0.466031 1:-65269530 MsG0180003617.01.T01:CDS
CTGAGACTGCATCTCATCAA+TGG 0.466473 1:+65269326 None:intergenic
CAAGAATCCAATGGAAATCT+CGG 0.468450 1:-65268955 MsG0180003617.01.T01:CDS
GTGTCCAAAAGCCCTTCATC+AGG 0.468461 1:+65274531 None:intergenic
TGTTGCAACCTACCAATTGC+AGG 0.468552 1:-65270714 MsG0180003617.01.T01:CDS
GTATACTTGGTCTTATTTGG+AGG 0.468686 1:+65274429 None:intergenic
GTTTCTAAGGATTTAGGGTG+TGG 0.469301 1:-65271133 MsG0180003617.01.T01:intron
AGGATATGGTAGGTTAGGGT+TGG 0.469684 1:-65274754 MsG0180003617.01.T01:intron
ACAATCATATTGAATATTCT+CGG 0.472054 1:+65270520 None:intergenic
AAGGGAGTTGCTTGAGGAGA+TGG 0.472170 1:-65275042 MsG0180003617.01.T01:CDS
TTGGGGATCAAACATTTGCT+TGG 0.472690 1:-65270274 MsG0180003617.01.T01:CDS
GCATTGAACGCCACAGTATC+CGG 0.474050 1:+65275794 None:intergenic
GAGGGCTGCTTTCTTTAGAA+AGG 0.477036 1:-65274490 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATATTATAACTCAAAGAATC+AGG 0.477103 1:+65275689 None:intergenic
GTATACAATCCAAGCTTCTT+CGG 0.477281 1:+65276207 None:intergenic
TTTGGGCTAATTTCAGCAGC+TGG 0.478155 1:+65268994 None:intergenic
TTGTTGAGATCCGCCGTTGA+AGG 0.479549 1:+65268847 None:intergenic
GTTGTTGATGGAGGGTGTGA+TGG 0.481480 1:-65271053 MsG0180003617.01.T01:CDS
TTGCTTCCAAATTTGTTGAT+GGG 0.481630 1:-65275404 MsG0180003617.01.T01:CDS
CCACCTTTGAAACCTGATGA+AGG 0.482430 1:-65274543 MsG0180003617.01.T01:CDS
GATTTAGGGTGTGGAAAAGA+GGG 0.483870 1:-65271124 MsG0180003617.01.T01:CDS
AGGTGTGAGTTGGCAAAGGA+AGG 0.483921 1:-65274588 MsG0180003617.01.T01:CDS
GTGTTTGATGTTGTTGATGG+AGG 0.485258 1:-65271062 MsG0180003617.01.T01:CDS
GTCAACCAAAGCTGGTCAAA+GGG 0.485342 1:-65274845 MsG0180003617.01.T01:intron
ACCCTTGAGGAGAATATTGT+AGG 0.485357 1:+65275094 None:intergenic
AAGTGGGGTTAGGGAGGTGA+GGG 0.486001 1:+65276176 None:intergenic
GTGGTATAGGAAACATGGTC+AGG 0.487048 1:+65275212 None:intergenic
TTTCACGACGAGGCAGGAAA+CGG 0.487271 1:-65269689 MsG0180003617.01.T01:CDS
ACCTTCCTCATGTCAAAGCT+TGG 0.487313 1:-65275946 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGATAGTGTGCCTAGGGAAT+CGG 0.487480 1:-65270447 MsG0180003617.01.T01:CDS
AACGTAAAACCGAAGAAGCT+TGG 0.488246 1:-65276216 MsG0180003617.01.T01:CDS
CTTGAGCAACTTTCTCCTGC+AGG 0.489123 1:+65269282 None:intergenic
CTGAGCGCGCGTGAGGGAAG+AGG 0.489241 1:+65276111 None:intergenic
CTTGCTGAAATGACAAGAAT+CGG 0.490145 1:-65275137 MsG0180003617.01.T01:CDS
CAAAACGGCGTGGCAGGAAA+CGG 0.490391 1:-65269425 MsG0180003617.01.T01:CDS
GAAGCTCCCTGACCTTGAAA+TGG 0.492130 1:-65275831 MsG0180003617.01.T01:CDS
TACTGAAGATTCCCGTGTCT+CGG 0.492812 1:-65270738 MsG0180003617.01.T01:CDS
ACGGATAGCCTCAGCTGGAC+CGG 0.494035 1:+65275883 None:intergenic
TGCATCAATATTTCTGGAGC+AGG 0.494976 1:-65270548 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGATTTAGGGTGTGGAAAAG+AGG 0.497186 1:-65271125 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGTAAGAGTGGCAATGGCAA+TGG 0.497405 1:-65275383 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGCGAGTTGCGGATACTGTA+AGG 0.498095 1:-65275277 MsG0180003617.01.T01:CDS
CAAGTGTTTGATGAAATGCC+TGG 0.499008 1:-65275725 MsG0180003617.01.T01:CDS
CCGTGTATCTGATTTAGTAT+GGG 0.499449 1:-65270405 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGTGGAGCTGGGATTCATTA+CGG 0.502017 1:+65276071 None:intergenic
TTCTTTCTTTAATGAGATGA+GGG 0.503474 1:-65274931 MsG0180003617.01.T01:CDS
GTGAGTTGGCAAAGGAAGGA+GGG 0.503511 1:-65274584 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATTCACATGTTCCACATGGT+TGG 0.503686 1:+65268921 None:intergenic
CACCTTTGAAACCTGATGAA+GGG 0.504054 1:-65274542 MsG0180003617.01.T01:CDS
TGCTTGTGTTTGTGTTAGAG+AGG 0.504110 1:-65275628 MsG0180003617.01.T01:CDS
AATTTCAGGGTAAGAGAAGT+GGG 0.504128 1:+65268889 None:intergenic
TAGAAAGGCCTTGGAAATTG+TGG 0.504536 1:-65274475 MsG0180003617.01.T01:CDS
ACCAGCTTTAGCAGCGGCGA+CGG 0.505484 1:+65276018 None:intergenic
TGTGAGTTGGCAAAGGAAGG+AGG 0.505895 1:-65274585 MsG0180003617.01.T01:CDS
GTTCAATTTCACGACGAGGC+AGG 0.507270 1:-65269695 MsG0180003617.01.T01:CDS
CTTTAGCAGCGGCGACGGCA+AGG 0.511164 1:+65276023 None:intergenic
ATGAAAGGTTATATGAAGGC+GGG 0.511529 1:-65275299 MsG0180003617.01.T01:CDS
TGTTTGATGTTGTTGATGGA+GGG 0.513700 1:-65271061 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATATTATACGACACAACATC+AGG 0.514325 1:+65274999 None:intergenic
GAAGGTAATTCAAAAGATGA+AGG 0.515466 1:-65274718 MsG0180003617.01.T01:CDS
CAATCATCAGAAGTATTGTA+AGG 0.516131 1:+65269396 None:intergenic
GTTTCGGCACTTGTGAAGGC+CGG 0.516373 1:-65275185 MsG0180003617.01.T01:CDS
CAAGTATACTAGAATATATG+TGG 0.517444 1:-65274415 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATTCAACTTCACGGCGTGGC+AGG 0.518159 1:-65269521 MsG0180003617.01.T01:CDS
TGCCTTCTCTGATGCAACCG+AGG 0.518835 1:+65270337 None:intergenic
CCCTGACCTTGAAATGGCGG+CGG 0.520324 1:-65275825 MsG0180003617.01.T01:CDS
CAGCAAGAACTTGACGTGCC+CGG 0.520352 1:+65275153 None:intergenic
GCCTTCTCTGATGCAACCGA+GGG 0.520659 1:+65270338 None:intergenic
TTTCTTTCTTTAATGAGATG+AGG 0.521160 1:-65274932 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGTCAACCAAAGCTGGTCAA+AGG 0.522445 1:-65274846 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATTGTCTGGTCAACCAAAGC+TGG 0.522741 1:-65274853 MsG0180003617.01.T01:CDS
AAAGGAGTTAGAGTTAGAGT+TGG 0.523414 1:+65276324 None:intergenic
GGTGGTTTCGGCACTTGTGA+AGG 0.525713 1:-65275189 MsG0180003617.01.T01:CDS
TCTTGCCAATGAAATTGCAT+TGG 0.526282 1:+65274653 None:intergenic
AGCTGCAGATGGACAAGGCA+AGG 0.527030 1:-65275061 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGAGGGTGTGATGGGAAAGG+AGG 0.527264 1:-65271044 MsG0180003617.01.T01:CDS
CGTTGATTGTGCTTTAGAAG+AGG 0.527589 1:-65270168 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATTTCATTGGCAAGAAAACC+AGG 0.527682 1:-65274645 MsG0180003617.01.T01:CDS
GTTGGTTGAAGAGGTAAAGA+AGG 0.528852 1:-65274736 MsG0180003617.01.T01:CDS
TGAGCGCGCGTGAGGGAAGA+GGG 0.529483 1:+65276112 None:intergenic
TAATGTCCGAGGAGAACGTC+TGG 0.530392 1:-65269761 MsG0180003617.01.T01:CDS
TATCAACTTCAAGGCGTGGC+AGG 0.531971 1:-65269608 MsG0180003617.01.T01:CDS
AAGGTAGCCGGAACGAAGCA+TGG 0.532493 1:+65275964 None:intergenic
GATGGAGGGTGTGATGGGAA+AGG 0.533935 1:-65271047 MsG0180003617.01.T01:CDS
TTGTAGGTTATCCGATTCGC+AGG 0.535025 1:+65275110 None:intergenic
AAATTTCAGGGTAAGAGAAG+TGG 0.535044 1:+65268888 None:intergenic
AGCCCTTCATCAGGTTTCAA+AGG 0.535626 1:+65274540 None:intergenic
TTTAGAAGAGGCCTCAAGAC+GGG 0.535656 1:-65270156 MsG0180003617.01.T01:CDS
TTACTAGTAACATGCTTCAA+AGG 0.536176 1:-65274374 MsG0180003617.01.T01:CDS
AGTGTGATTCAATGTTCTGA+TGG 0.536475 1:-65270981 MsG0180003617.01.T01:CDS
CTTGGAAATTGTGGCTTGCA+TGG 0.537108 1:-65274466 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGAAAGGTGTGAGTTGGCAA+AGG 0.538157 1:-65274592 MsG0180003617.01.T01:CDS
CATTCCATCCTGCAATTGGT+AGG 0.538501 1:+65270706 None:intergenic
TTGAAATGGCGGCGGAGTCG+CGG 0.539959 1:-65275817 MsG0180003617.01.T01:CDS
GAAGGCAAAGAAGCAGCGAA+AGG 0.541218 1:-65270321 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATTACGGAGGCGCGTGAGGA+TGG 0.541294 1:+65276087 None:intergenic
GAGAACGTCTGGACTCCAAA+TGG 0.542550 1:-65269750 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGAGTCGAGACGGTGGAGCT+GGG 0.544287 1:+65276060 None:intergenic
ATGCGTTGTCAGGAGGATAG+TGG 0.545795 1:-65275242 MsG0180003617.01.T01:CDS
AATGGCGGCGGAGTCGCGGC+CGG 0.546032 1:-65275813 MsG0180003617.01.T01:CDS
TACGTTTCTCCAGGCATACA+TGG 0.546454 1:+65270113 None:intergenic
CAAAGTATAAGTGCTTCACC+TGG 0.546635 1:+65274627 None:intergenic
GTTTGTGCTAATTTGGGTGA+TGG 0.547358 1:-65275761 MsG0180003617.01.T01:CDS
CTAATAATTCAACTTCAAAA+CGG 0.548246 1:-65269440 MsG0180003617.01.T01:CDS
TATGAAGGCGGGGCGAGTTG+CGG 0.549393 1:-65275288 MsG0180003617.01.T01:CDS
GTTTGTGTAGTTTAAGACAA+AGG 0.549496 1:+65276306 None:intergenic
GTAAGAGTGGCAATGGCAAT+GGG 0.549975 1:-65275382 MsG0180003617.01.T01:CDS
TGGCTTGCATGGAAGAAAAT+GGG 0.550378 1:-65274455 MsG0180003617.01.T01:CDS
CGTGTATCTGATTTAGTATG+GGG 0.550685 1:-65270404 MsG0180003617.01.T01:CDS
TGGTCAGATCTATGATCCCT+CGG 0.550968 1:-65270354 MsG0180003617.01.T01:CDS
TCTGACCAGGCCACCAAGGA+TGG 0.553811 1:+65270369 None:intergenic
GAAAATTGTTCAGGCTATGA+GGG 0.554387 1:-65275516 MsG0180003617.01.T01:CDS
ACATGTTCCACATGGTTGGA+AGG 0.555198 1:+65268925 None:intergenic
CTCTTCTAAAGCACAATCAA+CGG 0.557272 1:+65270169 None:intergenic
GAGTAGACGGCTGAGGCAAG+TGG 0.559374 1:+65276159 None:intergenic
TCTAATGAAAGGTTATATGA+AGG 0.559381 1:-65275303 MsG0180003617.01.T01:CDS
CATGCAAGCCACAATTTCCA+AGG 0.559777 1:+65274467 None:intergenic
AACCTACAATATTCTCCTCA+AGG 0.560602 1:-65275096 MsG0180003617.01.T01:CDS
TTGTTGATGGAGGGTGTGAT+GGG 0.560971 1:-65271052 MsG0180003617.01.T01:CDS
TATACTTTGGAATGAAGTGA+AGG 0.561001 1:-65274613 MsG0180003617.01.T01:CDS
TGCATTGGCAAAACTTCCAT+AGG 0.563731 1:+65274668 None:intergenic
GCAAGTTGAATTGAGTAATG+AGG 0.563748 1:-65270880 MsG0180003617.01.T01:intron
GGAGAGGAAAAGAGCAGCCG+AGG 0.564132 1:-65274332 MsG0180003617.01.T01:CDS
TAGGTTAGGGTTGGTTGAAG+AGG 0.564429 1:-65274745 MsG0180003617.01.T01:CDS
GAAAGGTTAGGAGCCATCCT+TGG 0.564583 1:-65270382 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATACATTCTGTAATTGGGCA+AGG 0.565507 1:+65269349 None:intergenic
AGTAGACGGCTGAGGCAAGT+GGG 0.565832 1:+65276160 None:intergenic
GCTGAGAGAGTAGACGGCTG+AGG 0.566056 1:+65276152 None:intergenic
AAGAGACGGATAGCCTCAGC+TGG 0.566424 1:+65275878 None:intergenic
CCGCCGCCATTTCAAGGTCA+GGG 0.567255 1:+65275825 None:intergenic
TAACCGCAGTTGTGGGATGA+CGG 0.570213 1:-65270791 MsG0180003617.01.T01:intron
TCAGATAACTCCGATTCCCT+AGG 0.570973 1:+65270437 None:intergenic
TATGGAAATTCTACTTGTAA+GGG 0.572905 1:-65269874 MsG0180003617.01.T01:CDS
ACAAAATTGACAAGTTCTGT+CGG 0.573070 1:+65270041 None:intergenic
GATGGACTGAGCGCGCGTGA+GGG 0.573804 1:+65276105 None:intergenic
TAAGCCGGCGCGTGACAGCA+TGG 0.574073 1:+65275855 None:intergenic
TTTGTCAGATTTAATGTCCG+AGG 0.574179 1:-65269772 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGATGGACTGAGCGCGCGTG+AGG 0.574656 1:+65276104 None:intergenic
CAGGCATACATGGACAAGAC+AGG 0.576486 1:+65270123 None:intergenic
GAAGGCCGGTTTCATGGACC+GGG 0.577693 1:-65275171 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATCTGATTTAGTATGGGGAA+AGG 0.577777 1:-65270399 MsG0180003617.01.T01:CDS
TTTGGAATGAAGTGAAGGAA+AGG 0.579166 1:-65274608 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATTCTTATTATGGAAGTGAG+TGG 0.580178 1:-65274282 MsG0180003617.01.T01:CDS
CAACCAAAACTTAAAAGCCT+CGG 0.582005 1:+65274315 None:intergenic
CCACCGTGGTATAGGAAACA+TGG 0.583207 1:+65275207 None:intergenic
TGATGGTGTTCAGATTGAAA+AGG 0.583514 1:-65270919 MsG0180003617.01.T01:CDS
ACTTTCTCCTGCAGGATCTG+TGG 0.583640 1:+65269290 None:intergenic
TGGAGTCCAGACGTTCTCCT+CGG 0.584122 1:+65269755 None:intergenic
GACAAACTCAACCCGTCTTG+AGG 0.584431 1:+65270145 None:intergenic
TCAGAAGGATAGTGTGCCTA+GGG 0.585413 1:-65270453 MsG0180003617.01.T01:CDS
TGAGGCAAGTGGGGTTAGGG+AGG 0.586452 1:+65276170 None:intergenic
TTTGACATGAGGAAGGTAGC+CGG 0.586505 1:+65275952 None:intergenic
CTCAGAAGGATAGTGTGCCT+AGG 0.588844 1:-65270454 MsG0180003617.01.T01:CDS
CGAGGCAATGCGTTGTCAGG+AGG 0.589240 1:-65275249 MsG0180003617.01.T01:CDS
TTAGCTGCCACAGATCCTGC+AGG 0.589398 1:-65269297 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGATTCGGTTCCTTCAACGG+CGG 0.589479 1:-65268857 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATTTACACAACTCTAATGAA+AGG 0.590413 1:-65275314 MsG0180003617.01.T01:CDS
AAGAAAGCTGAGAGAGTAGA+CGG 0.590919 1:+65276146 None:intergenic
TCTTGGAATACGAAGCAGAC+CGG 0.591431 1:-65269810 MsG0180003617.01.T01:CDS
ACGGCGTGGCAGGAAACCGA+AGG 0.593088 1:-65269511 MsG0180003617.01.T01:CDS
TTACTGTAAACAGCTGCAGA+TGG 0.593119 1:-65275072 MsG0180003617.01.T01:CDS
ACCTACAATATTCTCCTCAA+GGG 0.595747 1:-65275095 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATATTAGTTGATGACAGTGC+TGG 0.597186 1:-65274960 MsG0180003617.01.T01:CDS
CTTATTATGGAAGTGAGTGG+AGG 0.597945 1:-65274279 MsG0180003617.01.T01:intron
AGGTTGCAACATCCGAGACA+CGG 0.600612 1:+65270726 None:intergenic
GCTGCAGATGGACAAGGCAA+GGG 0.600624 1:-65275060 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGCGACGGCAAGGAGGCCGA+GGG 0.601367 1:+65276033 None:intergenic
TCTTCCATGCTGTCACGCGC+CGG 0.601425 1:-65275859 MsG0180003617.01.T01:CDS
CAAGGCAAGGGAGTTGCTTG+AGG 0.601430 1:-65275048 MsG0180003617.01.T01:CDS
CATCATCGTCGGAAGCGAGA+CGG 0.602455 1:+65275909 None:intergenic
GCGTGACAGCATGGAAGAGA+CGG 0.602923 1:+65275864 None:intergenic
GGAGTCGCGGCCGGATACTG+TGG 0.604962 1:-65275804 MsG0180003617.01.T01:CDS
CCTTCATCAGGTTTCAAAGG+TGG 0.606165 1:+65274543 None:intergenic
GTGAAGTTGAATGATGATGG+AGG 0.606561 1:+65276367 None:intergenic
TGATGCTTCCGGTCCAGCTG+AGG 0.606578 1:-65275891 MsG0180003617.01.T01:CDS
GTTGCTTGAGGAGATGGCTG+AGG 0.607954 1:-65275036 MsG0180003617.01.T01:CDS
AAGGCGTGGCAGGAAACCAA+AGG 0.611408 1:-65269598 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGCTAGACAAGACAGAAGAG+TGG 0.612277 1:-65274353 MsG0180003617.01.T01:CDS
GCACTCCAAGCTTTGACATG+AGG 0.614623 1:+65275941 None:intergenic
AGGTTAGGAGCCATCCTTGG+TGG 0.616016 1:-65270379 MsG0180003617.01.T01:CDS
GAGGGATCATAGATCTGACC+AGG 0.616163 1:+65270356 None:intergenic
ATTGTTATGAAGCTTTGTTG+TGG 0.617201 1:-65275668 MsG0180003617.01.T01:CDS
TGAAAAGGAGTGTCAGAATG+TGG 0.617424 1:-65270904 MsG0180003617.01.T01:CDS
TGAAAGGTTATATGAAGGCG+GGG 0.618534 1:-65275298 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATTCATTACGGAGGCGCGTG+AGG 0.618807 1:+65276083 None:intergenic
GCAGGATGGAATGCCATATG+TGG 0.619247 1:-65270696 MsG0180003617.01.T01:CDS
AGAAAGTTGCTCAAGTGACA+TGG 0.623471 1:-65269274 MsG0180003617.01.T01:intron
TAGCAGCGGCGACGGCAAGG+AGG 0.623843 1:+65276026 None:intergenic
CGTCTCGACTCCAATTCCCT+CGG 0.626238 1:-65276049 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGTTGCAACATCCGAGACAC+GGG 0.626285 1:+65270727 None:intergenic
TTGATGGGTAAGAGTGGCAA+TGG 0.626790 1:-65275389 MsG0180003617.01.T01:CDS
GATGGAATGCCATATGTGGA+AGG 0.628342 1:-65270692 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGGAATTGGAGTCGAGACGG+TGG 0.629694 1:+65276053 None:intergenic
AGTGAAGGAAAGGTGTGAGT+TGG 0.630151 1:-65274598 MsG0180003617.01.T01:CDS
AAGCATATACACCTAACACT+AGG 0.630921 1:-65275337 MsG0180003617.01.T01:CDS
CTAAAGCACAATCAACGGCA+TGG 0.633247 1:+65270174 None:intergenic
TCCAAGCTTTGACATGAGGA+AGG 0.634626 1:+65275945 None:intergenic
AATGAAAGGTTATATGAAGG+CGG 0.637511 1:-65275300 MsG0180003617.01.T01:CDS
ACGACGAGGCAGGAAACGGA+AGG 0.640842 1:-65269685 MsG0180003617.01.T01:CDS
CCCATACTAAATCAGATACA+CGG 0.640931 1:+65270405 None:intergenic
TGGTATAGGAAACATGGTCA+GGG 0.641385 1:+65275213 None:intergenic
AAGTGTTTGATGAAATGCCT+GGG 0.641449 1:-65275724 MsG0180003617.01.T01:CDS
TCCAGAAATATTGATGCATG+TGG 0.642262 1:+65270553 None:intergenic
GAAAGTAATTGCTAATAATG+CGG 0.642826 1:-65270075 MsG0180003617.01.T01:CDS
AATATTCAATATGATTGTCG+CGG 0.644323 1:-65270515 MsG0180003617.01.T01:CDS
CGAGGGAATTGGAGTCGAGA+CGG 0.644790 1:+65276050 None:intergenic
TAGATCTGACCAGGCCACCA+AGG 0.646060 1:+65270365 None:intergenic
GATATATCAACTTCAAGGCG+TGG 0.646088 1:-65269612 MsG0180003617.01.T01:CDS
GCTCCCTGACCTTGAAATGG+CGG 0.647769 1:-65275828 MsG0180003617.01.T01:CDS
TAAACAGCTGCAGATGGACA+AGG 0.648363 1:-65275066 MsG0180003617.01.T01:CDS
TCCCTCGGTTGCATCAGAGA+AGG 0.651392 1:-65270339 MsG0180003617.01.T01:CDS
TTAATGCATCAAGAATCCAA+TGG 0.651496 1:-65268964 MsG0180003617.01.T01:CDS
AATTTGTTGATGGGTAAGAG+TGG 0.654168 1:-65275395 MsG0180003617.01.T01:CDS
CTTTAGAAGAGGCCTCAAGA+CGG 0.657201 1:-65270157 MsG0180003617.01.T01:CDS
CACTTGCTGATATATGTGTG+AGG 0.657709 1:-65274509 MsG0180003617.01.T01:CDS
ATCAGAACCTTCCAACCATG+TGG 0.661816 1:-65268932 MsG0180003617.01.T01:CDS
GCAACCTACCAATTGCAGGA+TGG 0.663273 1:-65270710 MsG0180003617.01.T01:CDS
ACGGCGTGGCAGGAAACGGA+AGG 0.668039 1:-65269421 MsG0180003617.01.T01:CDS
GCGTGAGCTAGTCTTTCTGT+CGG 0.669612 1:-65270606 MsG0180003617.01.T01:CDS
TGACCATGTTTCCTATACCA+CGG 0.671862 1:-65275210 MsG0180003617.01.T01:CDS
GACAAGACAGAAGAGTGGAG+AGG 0.673238 1:-65274348 MsG0180003617.01.T01:CDS
TCTCATTCACATGTTCCACA+TGG 0.678985 1:+65268917 None:intergenic
TGCAAAGTAGTCATACACAA+AGG 0.684061 1:+65275587 None:intergenic
TGGACCGGAAGCATCATCGT+CGG 0.691122 1:+65275898 None:intergenic
TCAGGCACAACACCAAACCC+AGG 0.691172 1:+65275707 None:intergenic
ACTTGCTGATATATGTGTGA+GGG 0.691891 1:-65274508 MsG0180003617.01.T01:CDS
GTAGACGGCTGAGGCAAGTG+GGG 0.696130 1:+65276161 None:intergenic
CCATGTTTCCTATACCACGG+TGG 0.696695 1:-65275207 MsG0180003617.01.T01:CDS
AATAATTCAACTTCACGGCG+TGG 0.697549 1:-65269525 MsG0180003617.01.T01:CDS
GTGATTCAATGTTCTGATGG+AGG 0.699387 1:-65270978 MsG0180003617.01.T01:CDS
AAGCATGGATTTGACAACGG+AGG 0.705697 1:+65275979 None:intergenic
ACGAAGCATGGATTTGACAA+CGG 0.710772 1:+65275976 None:intergenic
AATTCAACTTCAAAACGGCG+TGG 0.712687 1:-65269435 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGATACTGTAAGGATGCTCG+AGG 0.719302 1:-65275267 MsG0180003617.01.T01:CDS
GGAGCTGGGATTCATTACGG+AGG 0.727598 1:+65276074 None:intergenic
AGTGTGACCAGCTTTAGCAG+CGG 0.740142 1:+65276012 None:intergenic
AAGCACAATCAACGGCATGG+CGG 0.740895 1:+65270177 None:intergenic
GATAGTTCAATTTCACGACG+AGG 0.744216 1:-65269699 MsG0180003617.01.T01:CDS
GCTGTTTACAGTAACCCTTG+AGG 0.751390 1:+65275081 None:intergenic
CACAAGTGCCGAAACCACCG+TGG 0.752742 1:+65275193 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TAAAATTAAATAAATTAATA+AGG + Chr1:65271431-65271450 None:intergenic 0.0%
!! AAAAAAAAAGATTATCTTGA+TGG - Chr1:65272637-65272656 MsG0180003617.01.T01:intron 15.0%
!! AAAATTAAAAATCACTTGAT+TGG - Chr1:65273088-65273107 MsG0180003617.01.T01:intron 15.0%
!! AAATAAATTAATAAGGTGTA+CGG + Chr1:65271424-65271443 None:intergenic 15.0%
!! AAATTAAAAATCACTTGATT+GGG - Chr1:65273089-65273108 MsG0180003617.01.T01:intron 15.0%
!! AATAAAATAGTAAAAGATGA+AGG + Chr1:65273780-65273799 None:intergenic 15.0%
!! AATGTAACTTCTATTAATTA+TGG + Chr1:65271305-65271324 None:intergenic 15.0%
!! CTACTATAATTAAATTATTG+AGG + Chr1:65273257-65273276 None:intergenic 15.0%
!! GTGTGAATAATAATAATTAA+GGG - Chr1:65271910-65271929 MsG0180003617.01.T01:intron 15.0%
!! TGTGTGAATAATAATAATTA+AGG - Chr1:65271909-65271928 MsG0180003617.01.T01:intron 15.0%
!! TTCTCTAGTTAATATTTATT+AGG + Chr1:65272980-65272999 None:intergenic 15.0%
!!! AATTAATAGAAGTTACATTT+TGG - Chr1:65271306-65271325 MsG0180003617.01.T01:intron 15.0%
!!! ATAAAATTAGGTTGTATTAT+AGG - Chr1:65272434-65272453 MsG0180003617.01.T01:intron 15.0%
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AAAAAACCAGAATGAAAGAG+AGG - Chr1:65276185-65276204 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
AAAAAAGGAGAGATCTTTGT+AGG - Chr1:65269717-65269736 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
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AATGAAAGGTTATATGAAGG+CGG - Chr1:65269910-65269929 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
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ATATTATACGACACAACATC+AGG + Chr1:65270214-65270233 None:intergenic 30.0%
ATGACAATTATGTCCTTCAT+TGG - Chr1:65272340-65272359 MsG0180003617.01.T01:intron 30.0%
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CAATGGATACATTCTGTAAT+TGG + Chr1:65275870-65275889 None:intergenic 30.0%
CAGAAAATCTTGTACATTCT+TGG + Chr1:65273340-65273359 None:intergenic 30.0%
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CCTTATCAGAAATTCAATTG+CGG - Chr1:65271572-65271591 MsG0180003617.01.T01:intron 30.0%
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TAAATTAATAAGGTGTACGG+TGG + Chr1:65271421-65271440 None:intergenic 30.0%
TACCCTGAAATTTACAAACT+TGG - Chr1:65276332-65276351 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
TCCAATAAGAATCATTGCAA+AGG + Chr1:65276121-65276140 None:intergenic 30.0%
TGAAGAAAACTCGTATTACT+TGG - Chr1:65272765-65272784 MsG0180003617.01.T01:intron 30.0%
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TGTTTCAATAATTCCCAAAC+TGG - Chr1:65275835-65275854 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
TTAATGAGATGAGGGAAAAA+GGG - Chr1:65270287-65270306 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
TTAATGCATCAAGAATCCAA+TGG - Chr1:65276246-65276265 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
TTACTAGTAACATGCTTCAA+AGG - Chr1:65270836-65270855 MsG0180003617.01.T01:intron 30.0%
TTCATCTCTGTTTGTCAATT+TGG - Chr1:65271338-65271357 MsG0180003617.01.T01:intron 30.0%
TTGCAACTTAATTGAGATCA+TGG - Chr1:65271671-65271690 MsG0180003617.01.T01:intron 30.0%
TTTAATGAGATGAGGGAAAA+AGG - Chr1:65270286-65270305 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
! AAAGGAGGAAAATTTTCATG+TGG - Chr1:65274181-65274200 MsG0180003617.01.T01:intron 30.0%
! AAGGAGGAAAATTTTCATGT+GGG - Chr1:65274182-65274201 MsG0180003617.01.T01:intron 30.0%
! AATATGTTGGTTGAAGGATA+TGG - Chr1:65270442-65270461 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
! GAGGCTTTTATAGTAATTTC+AGG + Chr1:65273479-65273498 None:intergenic 30.0%
! GTTACCTGATAGCATATTTT+GGG - Chr1:65274918-65274937 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
! GTTTGTGTAGTTTAAGACAA+AGG + Chr1:65268907-65268926 None:intergenic 30.0%
! TGGTCCCTTAATTAATTTTC+AGG - Chr1:65271266-65271285 MsG0180003617.01.T01:intron 30.0%
! TGTTACCTGATAGCATATTT+TGG - Chr1:65274917-65274936 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
! TTACCTGATAGCATATTTTG+GGG - Chr1:65274919-65274938 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTGCCAATGCAATTTCAT+TGG - Chr1:65270552-65270571 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
!! ACTTTGACTTTTATCAAGGA+CGG - Chr1:65271731-65271750 MsG0180003617.01.T01:intron 30.0%
!! AGTGCCATTATTTGTTGTTA+TGG + Chr1:65273575-65273594 None:intergenic 30.0%
!! ATTCAAAGCATTTTCTGATG+AGG - Chr1:65276152-65276171 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTGTTATGAAGCTTTGTTG+TGG - Chr1:65269542-65269561 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
!! CAATCATCAGAAGTATTGTA+AGG + Chr1:65275817-65275836 None:intergenic 30.0%
!! CACAACTTTTTCCTTAACAA+AGG + Chr1:65272747-65272766 None:intergenic 30.0%
!! CTAGTATACTTGGTCTTATT+TGG + Chr1:65270787-65270806 None:intergenic 30.0%
!! CTGTTTTATTGATCAAGAGA+AGG - Chr1:65273925-65273944 MsG0180003617.01.T01:intron 30.0%
!! TATACTTTGGAATGAAGTGA+AGG - Chr1:65270597-65270616 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
!! TTATCTTTAGAACAAGAGCA+TGG - Chr1:65276023-65276042 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGCTTCCAAATTTGTTGAT+GGG - Chr1:65269806-65269825 MsG0180003617.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGGTTTTTGGATTGAATGA+TGG - Chr1:65274274-65274293 MsG0180003617.01.T01:intron 30.0%
!! TTTGTTGTTATGGTTTGGTT+TGG + Chr1:65273565-65273584 None:intergenic 30.0%
!!! AAACTTAATGGTTTTGAGGA+TGG - Chr1:65274121-65274140 MsG0180003617.01.T01:intron 30.0%
!!! ACGTGTTTGTTTTGTGTTTT+AGG - Chr1:65273850-65273869 MsG0180003617.01.T01:intron 30.0%
!!! GGAAGACTTTATTTTAGACA+AGG + Chr1:65272067-65272086 None:intergenic 30.0%
!!! GTAAAAGTGTTAGAAGCTTT+TGG + Chr1:65268971-65268990 None:intergenic 30.0%
!!! TATAGAATTTTGGAACAGCA+AGG - Chr1:65271136-65271155 MsG0180003617.01.T01:intron 30.0%
!!! TCTGATAAAGGTTTGGTTTT+TGG - Chr1:65274262-65274281 MsG0180003617.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTTTTATAATGATGCGCG+AGG + Chr1:65272675-65272694 None:intergenic 30.0%
AAAAGAGTGAGAAAATCTCG+AGG + Chr1:65273625-65273644 None:intergenic 35.0%
AAAGAGTGAGAAAATCTCGA+GGG + Chr1:65273624-65273643 None:intergenic 35.0%
AAAGGAGTTAGAGTTAGAGT+TGG + Chr1:65268889-65268908 None:intergenic 35.0%
AAAGGGGCAAACATTAAGAA+TGG - Chr1:65272243-65272262 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
AAAGTTCCTCTCTTTCATTC+TGG + Chr1:65276194-65276213 None:intergenic 35.0%
AAATTTCAGGGTAAGAGAAG+TGG + Chr1:65276325-65276344 None:intergenic 35.0%
AACCTACAATATTCTCCTCA+AGG - Chr1:65270114-65270133 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
AACGAGAATTTACAACATGG+AGG - Chr1:65272268-65272287 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
AACTGCTGAGAAAATTGTTC+AGG - Chr1:65269685-65269704 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
AAGCATATACACCTAACACT+AGG - Chr1:65269873-65269892 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
AAGTGCTTCATTCCAAACTT+AGG + Chr1:65271772-65271791 None:intergenic 35.0%
AAGTGTTTGATGAAATGCCT+GGG - Chr1:65269486-65269505 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
AATGGAGAAACAGAGTGATA+TGG - Chr1:65275003-65275022 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
AATTTCAGGGTAAGAGAAGT+GGG + Chr1:65276324-65276343 None:intergenic 35.0%
ACCACATGCATCAATATTTC+TGG - Chr1:65274656-65274675 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
ACCGTGTATCTGATTTAGTA+TGG - Chr1:65274804-65274823 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
ACCTACAATATTCTCCTCAA+GGG - Chr1:65270115-65270134 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
AGAAAATTGTTCAGGCTATG+AGG - Chr1:65269693-65269712 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
AGAATGAATAAACGTAGCTC+TGG + Chr1:65273533-65273552 None:intergenic 35.0%
AGAGACAAAGATAAAGACAG+AGG + Chr1:65273730-65273749 None:intergenic 35.0%
AGAGCTACGTTTATTCATTC+TGG - Chr1:65273532-65273551 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
AGGGATTTAGAGAGAGAAAA+TGG + Chr1:65273605-65273624 None:intergenic 35.0%
AGTGTGATTCAATGTTCTGA+TGG - Chr1:65274229-65274248 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
AGTTAAAGATGATGTGACTG+AGG - Chr1:65274360-65274379 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
ATACATTCTGTAATTGGGCA+AGG + Chr1:65275864-65275883 None:intergenic 35.0%
ATCTGATTTAGTATGGGGAA+AGG - Chr1:65274811-65274830 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
ATGAAAGGTTATATGAAGGC+GGG - Chr1:65269911-65269930 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
ATTACTTGGACATGTTCTTG+TGG - Chr1:65272779-65272798 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
ATTTAGTATGGGGAAAGGTT+AGG - Chr1:65274816-65274835 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
ATTTCATTGGCAAGAAAACC+AGG - Chr1:65270565-65270584 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
CAAATTCAGTAAGTGGAGAT+TGG + Chr1:65275207-65275226 None:intergenic 35.0%
CAACCAAAACTTAAAAGCCT+CGG + Chr1:65270898-65270917 None:intergenic 35.0%
CAAGAATCCAATGGAAATCT+CGG - Chr1:65276255-65276274 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
CATGTCAACAAAACCATCAT+TGG + Chr1:65274034-65274053 None:intergenic 35.0%
CCCATACTAAATCAGATACA+CGG + Chr1:65274808-65274827 None:intergenic 35.0%
CCCTTTGCAATGATTCTTAT+TGG - Chr1:65276117-65276136 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
CCGCAATTGAATTTCTGATA+AGG + Chr1:65271575-65271594 None:intergenic 35.0%
CCGTGTATCTGATTTAGTAT+GGG - Chr1:65274805-65274824 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
CGTGTATCTGATTTAGTATG+GGG - Chr1:65274806-65274825 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
CTCTTACCCATCAACAAATT+TGG + Chr1:65269815-65269834 None:intergenic 35.0%
CTGAATTTGCAATGCTTGAT+CGG - Chr1:65275299-65275318 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
CTTGCTGAAATGACAAGAAT+CGG - Chr1:65270073-65270092 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
GAAAATTGTTCAGGCTATGA+GGG - Chr1:65269694-65269713 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
GAAACCCTAATTAGTGATGT+TGG - Chr1:65274003-65274022 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
GAAGCTCGACATTAATATAG+TGG + Chr1:65271634-65271653 None:intergenic 35.0%
GACAACGAGAATTTACAACA+TGG - Chr1:65272265-65272284 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
GACAATTATGTCCTTCATTG+GGG - Chr1:65272342-65272361 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
GATGCATTAAACCCGAATTT+GGG + Chr1:65276236-65276255 None:intergenic 35.0%
GGTAAAAGGTGGCAAAAATT+AGG - Chr1:65272158-65272177 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
GTATACAATCCAAGCTTCTT+CGG + Chr1:65269006-65269025 None:intergenic 35.0%
GTCAAGGAAAAAAAAGTCCT+TGG + Chr1:65273405-65273424 None:intergenic 35.0%
GTTAAAGATGATGTGACTGA+GGG - Chr1:65274361-65274380 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
GTTGTGTAAATCCTAGTGTT+AGG + Chr1:65269887-65269906 None:intergenic 35.0%
TAACAGATCAACCTAATGAC+AGG + Chr1:65270989-65271008 None:intergenic 35.0%
TACAACATGGAGGAAGTTAA+GGG - Chr1:65272278-65272297 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
TCAAATTTAACCGCAGTTGT+GGG - Chr1:65274412-65274431 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
TCCAGAAATATTGATGCATG+TGG + Chr1:65274660-65274679 None:intergenic 35.0%
TCCTCCAACATCACTAATTA+GGG + Chr1:65274010-65274029 None:intergenic 35.0%
TCGGTTGTTTGAGAATGATA+TGG - Chr1:65275318-65275337 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
TCTTGCCAATGAAATTGCAT+TGG + Chr1:65270560-65270579 None:intergenic 35.0%
TCTTTCTGCTTCAAAACACT+TGG + Chr1:65273427-65273446 None:intergenic 35.0%
TGATGCATTAAACCCGAATT+TGG + Chr1:65276237-65276256 None:intergenic 35.0%
TGCAAAGTAGTCATACACAA+AGG + Chr1:65269626-65269645 None:intergenic 35.0%
TGCTGAAATTAGCCCAAATT+CGG - Chr1:65276221-65276240 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
TTAATGAACAGCACATCTCT+TGG - Chr1:65275383-65275402 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
TTACAACATGGAGGAAGTTA+AGG - Chr1:65272277-65272296 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
TTCCTCCAACATCACTAATT+AGG + Chr1:65274011-65274030 None:intergenic 35.0%
TTGAAGGATATGGTAGGTTA+GGG - Chr1:65270452-65270471 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
TTGGTGAAGTTGAATGATGA+TGG + Chr1:65268849-65268868 None:intergenic 35.0%
TTTGTCAGATTTAATGTCCG+AGG - Chr1:65275438-65275457 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
! AACAAGATCTTTGGCGTTTT+GGG - Chr1:65276381-65276400 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
! ACTTGCTGATATATGTGTGA+GGG - Chr1:65270702-65270721 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
! AGGAAAATTTTCATGTGGGT+TGG - Chr1:65274186-65274205 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
! AGGGAAAACTGATTCTTCTT+TGG - Chr1:65271839-65271858 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
! ATCAAGAGAAGGATGTTTTG+GGG - Chr1:65273936-65273955 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
! ATGAAAGCTTTTGCATTGTC+TGG - Chr1:65270343-65270362 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
! ATTACTTTCGTTTTCAGCTC+AGG + Chr1:65275124-65275143 None:intergenic 35.0%
! CAAAAGTTTTTGCTTCTTGC+CGG + Chr1:65275422-65275441 None:intergenic 35.0%
! GATCAAGAGAAGGATGTTTT+GGG - Chr1:65273935-65273954 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
! GCAAGTTGAATTGAGTAATG+AGG - Chr1:65274330-65274349 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
! GGAATGAAGCACTTATACTT+TGG - Chr1:65271778-65271797 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
! GTATATGCTTTTGGCAACAA+AGG + Chr1:65269863-65269882 None:intergenic 35.0%
! GTGTTAGGTGTATATGCTTT+TGG + Chr1:65269872-65269891 None:intergenic 35.0%
! GTTGGGTTTCTAAGGATTTA+GGG - Chr1:65274072-65274091 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
! TGATCAAGAGAAGGATGTTT+TGG - Chr1:65273934-65273953 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
! TGATGGTGTTCAGATTGAAA+AGG - Chr1:65274291-65274310 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
! TGTTTGATGTTGTTGATGGA+GGG - Chr1:65274149-65274168 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
! TTTGGAATGAAGTGAAGGAA+AGG - Chr1:65270602-65270621 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
!! AATTTGTTGATGGGTAAGAG+TGG - Chr1:65269815-65269834 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
!! ATATTAGTTGATGACAGTGC+TGG - Chr1:65270250-65270269 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
!! ATGAAGCTTTGTTGTGGAAA+TGG - Chr1:65269548-65269567 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTCTAGGTGAAGCATTGAA+AGG - Chr1:65272225-65272244 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
!! CTCTTCTAAAGCACAATCAA+CGG + Chr1:65275044-65275063 None:intergenic 35.0%
!! GAAGTATTGTAAGATGCCTT+TGG + Chr1:65275631-65275650 None:intergenic 35.0%
!! GTATACTTGGTCTTATTTGG+AGG + Chr1:65270784-65270803 None:intergenic 35.0%
!! GTTGCTTCCAAATTTGTTGA+TGG - Chr1:65269805-65269824 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTTTGTTGACATGCTTTCT+GGG - Chr1:65274040-65274059 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
!! TCAAGAATTAGAAGTACCCT+TGG - Chr1:65272612-65272631 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
!! TTCTAGGTGAAGCATTGAAA+GGG - Chr1:65272226-65272245 MsG0180003617.01.T01:intron 35.0%
!!! CTATCACCAGCTTTCTTTTT+TGG + Chr1:65275496-65275515 None:intergenic 35.0%
!!! GAGGCTTTTAAGTTTTGGTT+GGG - Chr1:65270897-65270916 MsG0180003617.01.T01:CDS 35.0%
AAAAACAGAATCGTTGCAGC+CGG + Chr1:65275991-65276010 None:intergenic 40.0%
AACGTAAAACCGAAGAAGCT+TGG - Chr1:65268994-65269013 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
AAGAAAGCTGAGAGAGTAGA+CGG + Chr1:65269067-65269086 None:intergenic 40.0%
AATAATTCAACTTCACGGCG+TGG - Chr1:65275685-65275704 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
AATTCAACTTCAAAACGGCG+TGG - Chr1:65275775-65275794 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
ACAACATGGAGGAAGTTAAG+GGG - Chr1:65272279-65272298 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
ACACAAAACAAACACGTGCA+TGG + Chr1:65273847-65273866 None:intergenic 40.0%
ACATTGATGCCTTCCACATA+TGG + Chr1:65274530-65274549 None:intergenic 40.0%
ACCCTAATTAGTGATGTTGG+AGG - Chr1:65274006-65274025 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
ACCCTTGAGGAGAATATTGT+AGG + Chr1:65270119-65270138 None:intergenic 40.0%
ACGAAGCATGGATTTGACAA+CGG + Chr1:65269237-65269256 None:intergenic 40.0%
AGAAAGTTGCTCAAGTGACA+TGG - Chr1:65275936-65275955 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
ATTCACATGTTCCACATGGT+TGG + Chr1:65276292-65276311 None:intergenic 40.0%
CAAAGTATAAGTGCTTCACC+TGG + Chr1:65270586-65270605 None:intergenic 40.0%
CAAGTGTTTGATGAAATGCC+TGG - Chr1:65269485-65269504 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
CACTCACAGCTAAAGATTCT+AGG - Chr1:65272210-65272229 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
CCAAAATGAGCAACCAACAA+GGG + Chr1:65272138-65272157 None:intergenic 40.0%
CTAATGTGGTTGGGTTTCTA+AGG - Chr1:65274064-65274083 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
CTTATTATGGAAGTGAGTGG+AGG - Chr1:65270931-65270950 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
GAATTGAGTAATGAGGTTCG+AGG - Chr1:65274337-65274356 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
GATAGTTCAATTTCACGACG+AGG - Chr1:65275511-65275530 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
GATATATCAACTTCAAGGCG+TGG - Chr1:65275598-65275617 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
GATCCCCAAAATATGCTATC+AGG + Chr1:65274925-65274944 None:intergenic 40.0%
GCACTCAGGTTTAACAAAGA+AGG + Chr1:65272088-65272107 None:intergenic 40.0%
GCTGAAATTAGCCCAAATTC+GGG - Chr1:65276222-65276241 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
GTCAAATTTAACCGCAGTTG+TGG - Chr1:65274411-65274430 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
GTGATTCAATGTTCTGATGG+AGG - Chr1:65274232-65274251 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
GTTGAAGGATATGGTAGGTT+AGG - Chr1:65270451-65270470 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
GTTGGTTGAAGAGGTAAAGA+AGG - Chr1:65270474-65270493 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
GTTTGTGCTAATTTGGGTGA+TGG - Chr1:65269449-65269468 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
TAACACACCTCATTGATGGA+CGG + Chr1:65272307-65272326 None:intergenic 40.0%
TAGAAAGGCCTTGGAAATTG+TGG - Chr1:65270735-65270754 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
TAGGAAAACCTATCCCTTGT+TGG - Chr1:65272122-65272141 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
TATGTCAACACCAACACCAA+TGG - Chr1:65276094-65276113 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
TCAAAGGGTCTTCGATGAAA+TGG - Chr1:65270380-65270399 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
TCAGAAATTCAATTGCGGGT+TGG - Chr1:65271577-65271596 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
TCAGCTTTCTATCGCTCAAA+AGG - Chr1:65275262-65275281 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
TCCTTCATTGGGGACAAATT+AGG - Chr1:65272352-65272371 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
TCTCATTCACATGTTCCACA+TGG + Chr1:65276296-65276315 None:intergenic 40.0%
TGAAAGGTTATATGAAGGCG+GGG - Chr1:65269912-65269931 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
TGACCATGTTTCCTATACCA+CGG - Chr1:65270000-65270019 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
TGCAGAGTCTGATAAAGGTT+TGG - Chr1:65274255-65274274 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
TGCTTCAAAACACTTGGTCA+AGG + Chr1:65273421-65273440 None:intergenic 40.0%
TGCTTGTGTTTGTGTTAGAG+AGG - Chr1:65269582-65269601 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
TGGTATAGGAAACATGGTCA+GGG + Chr1:65270000-65270019 None:intergenic 40.0%
TGTACGCCAAAAAAGAAAGC+TGG - Chr1:65275487-65275506 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
TGTCACTCATATCCATCAAG+AGG + Chr1:65270963-65270982 None:intergenic 40.0%
TTACTGTAAACAGCTGCAGA+TGG - Chr1:65270138-65270157 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
TTCAGGCTATGAGGGAAAAA+AGG - Chr1:65269702-65269721 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
TTCCATAGGTGCTCACATTA+GGG + Chr1:65270531-65270550 None:intergenic 40.0%
TTCGTAACACACCTCATTGA+TGG + Chr1:65272311-65272330 None:intergenic 40.0%
TTCTGATCCGAGATTTCCAT+TGG + Chr1:65276265-65276284 None:intergenic 40.0%
TTCTTGCAAAAACGCTCAGA+AGG - Chr1:65274742-65274761 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
TTGGGGATCAAACATTTGCT+TGG - Chr1:65274936-65274955 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
TTGTCTCTGTCTCTGTTAAC+AGG - Chr1:65273742-65273761 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
TTTGATGAAATGCCTGGGTT+TGG - Chr1:65269491-65269510 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
TTTGGCGTACATTCACCATT+TGG + Chr1:65275478-65275497 None:intergenic 40.0%
! AAACTCTTTGTTTGACGCGT+GGG + Chr1:65273501-65273520 None:intergenic 40.0%
! ACCTAATTTGTCCCCAATGA+AGG + Chr1:65272356-65272375 None:intergenic 40.0%
! AGTGCTGCTGAAGAGAAAAT+AGG - Chr1:65272103-65272122 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
! CAACAAGATCTTTGGCGTTT+TGG - Chr1:65276380-65276399 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
! CACTTGCTGATATATGTGTG+AGG - Chr1:65270701-65270720 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
! CAGGTGAAGCACTTATACTT+TGG - Chr1:65270584-65270603 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
! CGATCAAGCATTGCAAATTC+AGG + Chr1:65275301-65275320 None:intergenic 40.0%
! GATTTAGGGTGTGGAAAAGA+GGG - Chr1:65274086-65274105 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
! GCTTGGAATATGTTGGTTGA+AGG - Chr1:65270436-65270455 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
! GGAGTGTTTGATGTTGTTGA+TGG - Chr1:65274145-65274164 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
! GGTTGGGTTTCTAAGGATTT+AGG - Chr1:65274071-65274090 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
! GTGTTTGATGTTGTTGATGG+AGG - Chr1:65274148-65274167 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
! GTTTCTAAGGATTTAGGGTG+TGG - Chr1:65274077-65274096 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
! TGCATTGGCAAAACTTCCAT+AGG + Chr1:65270545-65270564 None:intergenic 40.0%
! TGCTTTCTTTAGAAAGGCCT+TGG - Chr1:65270726-65270745 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
! TGGCTTGCATGGAAGAAAAT+GGG - Chr1:65270755-65270774 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
! TGTTGGTTGAAGGATATGGT+AGG - Chr1:65270446-65270465 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
!! CACCTTTGAAACCTGATGAA+GGG - Chr1:65270668-65270687 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
!! CCTTGTTGGTTGCTCATTTT+GGG - Chr1:65272136-65272155 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
!! CGTTGATTGTGCTTTAGAAG+AGG - Chr1:65275042-65275061 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
!! CTGCAACGATTCTGTTTTTC+TGG - Chr1:65275992-65276011 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
!! CTTGTTGGTTGCTCATTTTG+GGG - Chr1:65272137-65272156 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
!! GAAGTATTGTAAGCTGCCTT+CGG + Chr1:65275718-65275737 None:intergenic 40.0%
!! GTGAAGTTGAATGATGATGG+AGG + Chr1:65268846-65268865 None:intergenic 40.0%
!! TCTAGGTGAAGCATTGAAAG+GGG - Chr1:65272227-65272246 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
!! TCTTTAGAACAAGAGCATGG+TGG - Chr1:65276026-65276045 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
!! TGAAAAGGAGTGTCAGAATG+TGG - Chr1:65274306-65274325 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
!! TGCATCAATATTTCTGGAGC+AGG - Chr1:65274662-65274681 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTCTGGGACTAATGTGGTT+GGG - Chr1:65274055-65274074 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
!!! AGAGTTGGTGTTTTTGACGT+TGG + Chr1:65268874-65268893 None:intergenic 40.0%
!!! CGAGGCTTTTAAGTTTTGGT+TGG - Chr1:65270896-65270915 MsG0180003617.01.T01:CDS 40.0%
!!! CTTAATGGTTTTGAGGATGG+TGG - Chr1:65274124-65274143 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
!!! GCGACGCTCATTTTAAAATG+AGG - Chr1:65271990-65272009 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
!!! GGTGTTTTTGACGTTGGTTT+TGG + Chr1:65268868-65268887 None:intergenic 40.0%
!!! GGTTTTGTTGACATGCTTTC+TGG - Chr1:65274039-65274058 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
!!! GTTGCTCATTTTGGGGTAAA+AGG - Chr1:65272144-65272163 MsG0180003617.01.T01:intron 40.0%
AACCCTGGAAGATCAGGATT+TGG - Chr1:65271546-65271565 MsG0180003617.01.T01:intron 45.0%
AAGCATGGATTTGACAACGG+AGG + Chr1:65269234-65269253 None:intergenic 45.0%
ACAGCAAGGCTGATGAAACA+TGG - Chr1:65271150-65271169 MsG0180003617.01.T01:intron 45.0%
ACATGTTCCACATGGTTGGA+AGG + Chr1:65276288-65276307 None:intergenic 45.0%
ACCTTCCTCATGTCAAAGCT+TGG - Chr1:65269264-65269283 MsG0180003617.01.T01:intron 45.0%
AGCCCTTCATCAGGTTTCAA+AGG + Chr1:65270673-65270692 None:intergenic 45.0%
AGGAGATGGCTGAGGATATT+GGG - Chr1:65270182-65270201 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
AGGATATGGTAGGTTAGGGT+TGG - Chr1:65270456-65270475 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
ATCAGAACCTTCCAACCATG+TGG - Chr1:65276278-65276297 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
ATGAGCAACCAACAAGGGAT+AGG + Chr1:65272133-65272152 None:intergenic 45.0%
ATGGCATTCCATCCTGCAAT+TGG + Chr1:65274511-65274530 None:intergenic 45.0%
ATTGGGCAAGGTTTCCAGTT+TGG + Chr1:65275852-65275871 None:intergenic 45.0%
ATTGTCTGGTCAACCAAAGC+TGG - Chr1:65270357-65270376 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
CATGCAAGCCACAATTTCCA+AGG + Chr1:65270746-65270765 None:intergenic 45.0%
CATTCCAAACTTAGGTGCGT+AGG + Chr1:65271764-65271783 None:intergenic 45.0%
CATTCCATCCTGCAATTGGT+AGG + Chr1:65274507-65274526 None:intergenic 45.0%
CCCAAAATGAGCAACCAACA+AGG + Chr1:65272139-65272158 None:intergenic 45.0%
CCTTCATCAGGTTTCAAAGG+TGG + Chr1:65270670-65270689 None:intergenic 45.0%
CTAAAGCACAATCAACGGCA+TGG + Chr1:65275039-65275058 None:intergenic 45.0%
CTGAGACTGCATCTCATCAA+TGG + Chr1:65275887-65275906 None:intergenic 45.0%
CTTCCATAGGTGCTCACATT+AGG + Chr1:65270532-65270551 None:intergenic 45.0%
GAATCATTGCAAAGGGCCAT+TGG + Chr1:65276113-65276132 None:intergenic 45.0%
GAGGGGGTGATTTAATTGCT+TGG - Chr1:65270419-65270438 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
GATGGAATGCCATATGTGGA+AGG - Chr1:65274518-65274537 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
GATGTTGGAGGAACCAATGA+TGG - Chr1:65274018-65274037 MsG0180003617.01.T01:intron 45.0%
GCGGATCTCAACAAGATCTT+TGG - Chr1:65276372-65276391 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
GCTGTTTACAGTAACCCTTG+AGG + Chr1:65270132-65270151 None:intergenic 45.0%
GTAAGAGTGGCAATGGCAAT+GGG - Chr1:65269828-65269847 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
GTCAAATCCATGCTTCGTTC+CGG - Chr1:65269239-65269258 MsG0180003617.01.T01:intron 45.0%
GTCAACCAAAGCTGGTCAAA+GGG - Chr1:65270365-65270384 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
GTGGTATAGGAAACATGGTC+AGG + Chr1:65270001-65270020 None:intergenic 45.0%
TAAACAGCTGCAGATGGACA+AGG - Chr1:65270144-65270163 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
TACCCTAATGTGAGCACCTA+TGG - Chr1:65270526-65270545 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
TACGTTTCTCCAGGCATACA+TGG + Chr1:65275100-65275119 None:intergenic 45.0%
TACTGAAGATTCCCGTGTCT+CGG - Chr1:65274472-65274491 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
TCAGAAGGATAGTGTGCCTA+GGG - Chr1:65274757-65274776 MsG0180003617.01.T01:intron 45.0%
TCAGATAACTCCGATTCCCT+AGG + Chr1:65274776-65274795 None:intergenic 45.0%
TCTTGGAATACGAAGCAGAC+CGG - Chr1:65275400-65275419 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
TGCCAAATCCTGATCTTCCA+GGG + Chr1:65271551-65271570 None:intergenic 45.0%
TGGAGGTTAGAACCTCTTGA+TGG - Chr1:65270948-65270967 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
TGGTCAGATCTATGATCCCT+CGG - Chr1:65274856-65274875 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
TGTAGCAGCAGCTTCTATAG+AGG + Chr1:65276069-65276088 None:intergenic 45.0%
TGTTGCAACCTACCAATTGC+AGG - Chr1:65274496-65274515 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
TTCCTATACCACGGTGGTTT+CGG - Chr1:65270009-65270028 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
TTGGGCAAGGTTTCCAGTTT+GGG + Chr1:65275851-65275870 None:intergenic 45.0%
TTTAGAAGAGGCCTCAAGAC+GGG - Chr1:65275054-65275073 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
TTTGACATGAGGAAGGTAGC+CGG + Chr1:65269261-65269280 None:intergenic 45.0%
TTTGGGCTAATTTCAGCAGC+TGG + Chr1:65276219-65276238 None:intergenic 45.0%
! AGTGAAGGAAAGGTGTGAGT+TGG - Chr1:65270612-65270631 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
! ATTGGTAACCCTGGAAGATC+AGG - Chr1:65271540-65271559 MsG0180003617.01.T01:intron 45.0%
! CAAACTCTTTGTTTGACGCG+TGG + Chr1:65273502-65273521 None:intergenic 45.0%
! CTTGGAAATTGTGGCTTGCA+TGG - Chr1:65270744-65270763 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
! CTTGGATTCGGTTCCTTCAA+CGG - Chr1:65276350-65276369 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
! CTTTAGAAGAGGCCTCAAGA+CGG - Chr1:65275053-65275072 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
! GAAACCTGATGAAGGGCTTT+TGG - Chr1:65270675-65270694 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
! GAGCTTCGTGCTATTCTCAA+TGG - Chr1:65271647-65271666 MsG0180003617.01.T01:intron 45.0%
! GAGGGCTGCTTTCTTTAGAA+AGG - Chr1:65270720-65270739 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
! GGATTTAGGGTGTGGAAAAG+AGG - Chr1:65274085-65274104 MsG0180003617.01.T01:intron 45.0%
! GGTAATTCGATTGGTAACCC+TGG - Chr1:65271531-65271550 MsG0180003617.01.T01:intron 45.0%
! GTGGCTTGCATGGAAGAAAA+TGG - Chr1:65270754-65270773 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
! GTGTGGAAAAGAGGGTTTTG+TGG - Chr1:65274094-65274113 MsG0180003617.01.T01:intron 45.0%
! TCCAAGCTTTGACATGAGGA+AGG + Chr1:65269268-65269287 None:intergenic 45.0%
! TTGATGGGTAAGAGTGGCAA+TGG - Chr1:65269821-65269840 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
! TTGTAGGTTATCCGATTCGC+AGG + Chr1:65270103-65270122 None:intergenic 45.0%
! TTGTTGATGGAGGGTGTGAT+GGG - Chr1:65274158-65274177 MsG0180003617.01.T01:intron 45.0%
! TTTTCTCTTCAGCAGCACTC+AGG + Chr1:65272102-65272121 None:intergenic 45.0%
!! CATGCTTTCTGGGACTAATG+TGG - Chr1:65274050-65274069 MsG0180003617.01.T01:intron 45.0%
!! CCACCTTTGAAACCTGATGA+AGG - Chr1:65270667-65270686 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
!! CCCTTGTTGGTTGCTCATTT+TGG - Chr1:65272135-65272154 MsG0180003617.01.T01:intron 45.0%
!! CTTTCTGGGACTAATGTGGT+TGG - Chr1:65274054-65274073 MsG0180003617.01.T01:intron 45.0%
!! TAAACGTAGCTCTGGTGTCA+TGG + Chr1:65273525-65273544 None:intergenic 45.0%
!! TAGGTTAGGGTTGGTTGAAG+AGG - Chr1:65270465-65270484 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
!!! CAGCCGAGGCTTTTAAGTTT+TGG - Chr1:65270892-65270911 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
!!! CGCGGTTTTGATTTTGTTGC+TGG - Chr1:65274713-65274732 MsG0180003617.01.T01:CDS 45.0%
!!! CGTGGTTCTGATTTTGAGGT+TGG + Chr1:65268945-65268964 None:intergenic 45.0%
!!! GCTCATTTTGGGGTAAAAGG+TGG - Chr1:65272147-65272166 MsG0180003617.01.T01:intron 45.0%
!!! TGTAAATTTTTTATTTTTTA+TGG + Chr1:65272036-65272055 None:intergenic 5.0%
!!! TTTTCTTTAAAAAAAAATTA+TGG - Chr1:65272469-65272488 MsG0180003617.01.T01:intron 5.0%
!!! TTTTTTTTTATTGTAAAATT+TGG + Chr1:65273456-65273475 None:intergenic 5.0%
AAGCACAATCAACGGCATGG+CGG + Chr1:65275036-65275055 None:intergenic 50.0%
AAGGGAGTTGCTTGAGGAGA+TGG - Chr1:65270168-65270187 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
ACTTTCTCCTGCAGGATCTG+TGG + Chr1:65275923-65275942 None:intergenic 50.0%
AGCTCAGGATACGTTTCTCC+AGG + Chr1:65275109-65275128 None:intergenic 50.0%
AGGTTGCAACATCCGAGACA+CGG + Chr1:65274487-65274506 None:intergenic 50.0%
ATGCGTTGTCAGGAGGATAG+TGG - Chr1:65269968-65269987 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
CAGGCATACATGGACAAGAC+AGG + Chr1:65275090-65275109 None:intergenic 50.0%
CCAAACTTAGGTGCGTAGGT+GGG + Chr1:65271760-65271779 None:intergenic 50.0%
CCACCGTGGTATAGGAAACA+TGG + Chr1:65270006-65270025 None:intergenic 50.0%
CCATGTTTCCTATACCACGG+TGG - Chr1:65270003-65270022 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
CTCAGAAGGATAGTGTGCCT+AGG - Chr1:65274756-65274775 MsG0180003617.01.T01:intron 50.0%
CTGCCAAATCCTGATCTTCC+AGG + Chr1:65271552-65271571 None:intergenic 50.0%
CTGTCTTGTCCATGTATGCC+TGG - Chr1:65275088-65275107 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
CTTGAGCAACTTTCTCCTGC+AGG + Chr1:65275931-65275950 None:intergenic 50.0%
GAAAGGTTAGGAGCCATCCT+TGG - Chr1:65274828-65274847 MsG0180003617.01.T01:intron 50.0%
GAAGACCCTTTGACCAGCTT+TGG + Chr1:65270373-65270392 None:intergenic 50.0%
GAAGCTCCCTGACCTTGAAA+TGG - Chr1:65269379-65269398 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
GAAGGCAAAGAAGCAGCGAA+AGG - Chr1:65274889-65274908 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
GACAAACTCAACCCGTCTTG+AGG + Chr1:65275068-65275087 None:intergenic 50.0%
GACAAGACAGAAGAGTGGAG+AGG - Chr1:65270862-65270881 MsG0180003617.01.T01:intron 50.0%
GAGAACGTCTGGACTCCAAA+TGG - Chr1:65275460-65275479 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
GAGGAGATGGCTGAGGATAT+TGG - Chr1:65270181-65270200 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
GAGGGATCATAGATCTGACC+AGG + Chr1:65274857-65274876 None:intergenic 50.0%
GAGTGACACTGCCTGTCATT+AGG - Chr1:65270975-65270994 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
GCAACCTACCAATTGCAGGA+TGG - Chr1:65274500-65274519 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
GCAGGATGGAATGCCATATG+TGG - Chr1:65274514-65274533 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
GCATTGAACGCCACAGTATC+CGG + Chr1:65269419-65269438 None:intergenic 50.0%
GGATACTGTAAGGATGCTCG+AGG - Chr1:65269943-65269962 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
GGATAGTGTGCCTAGGGAAT+CGG - Chr1:65274763-65274782 MsG0180003617.01.T01:intron 50.0%
GGCTAGACAAGACAGAAGAG+TGG - Chr1:65270857-65270876 MsG0180003617.01.T01:intron 50.0%
GGTAAGAGTGGCAATGGCAA+TGG - Chr1:65269827-65269846 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
GGTCAACCAAAGCTGGTCAA+AGG - Chr1:65270364-65270383 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
GGTGGAGCTGGGATTCATTA+CGG + Chr1:65269142-65269161 None:intergenic 50.0%
GTGTCCAAAAGCCCTTCATC+AGG + Chr1:65270682-65270701 None:intergenic 50.0%
GTTCAATTTCACGACGAGGC+AGG - Chr1:65275515-65275534 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
TAACCGCAGTTGTGGGATGA+CGG - Chr1:65274419-65274438 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
TAATGTCCGAGGAGAACGTC+TGG - Chr1:65275449-65275468 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
TATCAACTTCAAGGCGTGGC+AGG - Chr1:65275602-65275621 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
TCCAAACTTAGGTGCGTAGG+TGG + Chr1:65271761-65271780 None:intergenic 50.0%
TGTGACTGAGGGCGATTACA+AGG - Chr1:65274372-65274391 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
TTGCAAAGGGCCATTGGTGT+TGG + Chr1:65276107-65276126 None:intergenic 50.0%
TTGTTGAGATCCGCCGTTGA+AGG + Chr1:65276366-65276385 None:intergenic 50.0%
TTTCACGACGAGGCAGGAAA+CGG - Chr1:65275521-65275540 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
! ACTTGTGAAGGCCGGTTTCA+TGG - Chr1:65270033-65270052 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
! AGGTGTGAGTTGGCAAAGGA+AGG - Chr1:65270622-65270641 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
! AGTGTGACCAGCTTTAGCAG+CGG + Chr1:65269201-65269220 None:intergenic 50.0%
! GCACTCCAAGCTTTGACATG+AGG + Chr1:65269272-65269291 None:intergenic 50.0%
! GGAAAGGTGTGAGTTGGCAA+AGG - Chr1:65270618-65270637 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
! GGAGGTGCAGAGTCTGATAA+AGG - Chr1:65274250-65274269 MsG0180003617.01.T01:intron 50.0%
! GTGAGTTGGCAAAGGAAGGA+GGG - Chr1:65270626-65270645 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
! GTTAGAAGCTTTTGGTCGCG+TGG + Chr1:65268963-65268982 None:intergenic 50.0%
! GTTGTTGATGGAGGGTGTGA+TGG - Chr1:65274157-65274176 MsG0180003617.01.T01:intron 50.0%
! TGTGAGTTGGCAAAGGAAGG+AGG - Chr1:65270625-65270644 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
!! GCGTGAGCTAGTCTTTCTGT+CGG - Chr1:65274604-65274623 MsG0180003617.01.T01:CDS 50.0%
!! TCAATTGCGGGTTGGATCAC+TGG - Chr1:65271585-65271604 MsG0180003617.01.T01:intron 50.0%
!!! ACTGGTTTTGCGGGAAGTTG+TGG - Chr1:65271603-65271622 MsG0180003617.01.T01:intron 50.0%
!!! GGGTTGGATCACTGGTTTTG+CGG - Chr1:65271593-65271612 MsG0180003617.01.T01:intron 50.0%
!!! GGTTGGATCACTGGTTTTGC+GGG - Chr1:65271594-65271613 MsG0180003617.01.T01:intron 50.0%
!!! GTCGCGTGGTTCTGATTTTG+AGG + Chr1:65268949-65268968 None:intergenic 50.0%
AAGAGACGGATAGCCTCAGC+TGG + Chr1:65269335-65269354 None:intergenic 55.0%
AAGGCGTGGCAGGAAACCAA+AGG - Chr1:65275612-65275631 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
AAGGTAGCCGGAACGAAGCA+TGG + Chr1:65269249-65269268 None:intergenic 55.0%
AAGTGGGGTTAGGGAGGTGA+GGG + Chr1:65269037-65269056 None:intergenic 55.0%
AGCTGCAGATGGACAAGGCA+AGG - Chr1:65270149-65270168 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
AGGTTAGGAGCCATCCTTGG+TGG - Chr1:65274831-65274850 MsG0180003617.01.T01:intron 55.0%
AGTAGACGGCTGAGGCAAGT+GGG + Chr1:65269053-65269072 None:intergenic 55.0%
ATGCCGTCATCCCACAACTG+CGG + Chr1:65274425-65274444 None:intergenic 55.0%
ATTCAACTTCACGGCGTGGC+AGG - Chr1:65275689-65275708 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
CAAAACGGCGTGGCAGGAAA+CGG - Chr1:65275785-65275804 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
CAACTTCAAAACGGCGTGGC+AGG - Chr1:65275779-65275798 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
CAAGGCAAGGGAGTTGCTTG+AGG - Chr1:65270162-65270181 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
CAGCAAGAACTTGACGTGCC+CGG + Chr1:65270060-65270079 None:intergenic 55.0%
CATCATCGTCGGAAGCGAGA+CGG + Chr1:65269304-65269323 None:intergenic 55.0%
CCCACCTACGCACCTAAGTT+TGG - Chr1:65271757-65271776 MsG0180003617.01.T01:intron 55.0%
CGAGGGAATTGGAGTCGAGA+CGG + Chr1:65269163-65269182 None:intergenic 55.0%
CGTCTCGACTCCAATTCCCT+CGG - Chr1:65269161-65269180 MsG0180003617.01.T01:intron 55.0%
GAATCGGTGTGCCTGCGAAT+CGG - Chr1:65270089-65270108 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
GCCTTCTCTGATGCAACCGA+GGG + Chr1:65274875-65274894 None:intergenic 55.0%
GCGTGACAGCATGGAAGAGA+CGG + Chr1:65269349-65269368 None:intergenic 55.0%
GCTCCCTGACCTTGAAATGG+CGG - Chr1:65269382-65269401 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
GCTGCAGATGGACAAGGCAA+GGG - Chr1:65270150-65270169 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
GCTTCCGACGATGATGCTTC+CGG - Chr1:65269308-65269327 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
GGAGCTGGGATTCATTACGG+AGG + Chr1:65269139-65269158 None:intergenic 55.0%
GGCGAGTTGCGGATACTGTA+AGG - Chr1:65269933-65269952 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
GGTGAACGATGCTCGAGTGA+GGG - Chr1:65270401-65270420 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
GGTGGTTTCGGCACTTGTGA+AGG - Chr1:65270021-65270040 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
GGTTGCAACATCCGAGACAC+GGG + Chr1:65274486-65274505 None:intergenic 55.0%
GTGAACGATGCTCGAGTGAG+GGG - Chr1:65270402-65270421 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
GTTGCTTGAGGAGATGGCTG+AGG - Chr1:65270174-65270193 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
GTTTCGGCACTTGTGAAGGC+CGG - Chr1:65270025-65270044 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
TAGATCTGACCAGGCCACCA+AGG + Chr1:65274848-65274867 None:intergenic 55.0%
TCAGGCACAACACCAAACCC+AGG + Chr1:65269506-65269525 None:intergenic 55.0%
TCCCTCGGTTGCATCAGAGA+AGG - Chr1:65274871-65274890 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
TGAACGATGCTCGAGTGAGG+GGG - Chr1:65270403-65270422 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
TGCCGAAACCACCGTGGTAT+AGG + Chr1:65270014-65270033 None:intergenic 55.0%
TGCCTTCTCTGATGCAACCG+AGG + Chr1:65274876-65274895 None:intergenic 55.0%
TGGAGTCCAGACGTTCTCCT+CGG + Chr1:65275458-65275477 None:intergenic 55.0%
TGGTGAACGATGCTCGAGTG+AGG - Chr1:65270400-65270419 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
TTAGCTGCCACAGATCCTGC+AGG - Chr1:65275913-65275932 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
! ATTCATTACGGAGGCGCGTG+AGG + Chr1:65269130-65269149 None:intergenic 55.0%
! CTCTTTGTTTGACGCGTGGG+AGG + Chr1:65273498-65273517 None:intergenic 55.0%
! GATGGAGGGTGTGATGGGAA+AGG - Chr1:65274163-65274182 MsG0180003617.01.T01:intron 55.0%
! GCATGGTGGTGAGACTGAAG+TGG - Chr1:65276040-65276059 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
! GGATTCGGTTCCTTCAACGG+CGG - Chr1:65276353-65276372 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
! TGAAGGCCGGTTTCATGGAC+CGG - Chr1:65270038-65270057 MsG0180003617.01.T01:CDS 55.0%
!! TGGACCGGAAGCATCATCGT+CGG + Chr1:65269315-65269334 None:intergenic 55.0%
ACGACGAGGCAGGAAACGGA+AGG - Chr1:65275525-65275544 MsG0180003617.01.T01:CDS 60.0%
ACGGATAGCCTCAGCTGGAC+CGG + Chr1:65269330-65269349 None:intergenic 60.0%
ACGTGCCCGGTCCATGAAAC+CGG + Chr1:65270047-65270066 None:intergenic 60.0%
AGTGGGGTTAGGGAGGTGAG+GGG + Chr1:65269036-65269055 None:intergenic 60.0%
CAAGTGGGGTTAGGGAGGTG+AGG + Chr1:65269038-65269057 None:intergenic 60.0%
CCCTGACCTTGAAATGGCGG+CGG - Chr1:65269385-65269404 MsG0180003617.01.T01:CDS 60.0%
CCGCCGCCATTTCAAGGTCA+GGG + Chr1:65269388-65269407 None:intergenic 60.0%
CGAGGCAATGCGTTGTCAGG+AGG - Chr1:65269961-65269980 MsG0180003617.01.T01:CDS 60.0%
GAGTAGACGGCTGAGGCAAG+TGG + Chr1:65269054-65269073 None:intergenic 60.0%
GCTCGAGGCAATGCGTTGTC+AGG - Chr1:65269958-65269977 MsG0180003617.01.T01:CDS 60.0%
GCTGAGAGAGTAGACGGCTG+AGG + Chr1:65269061-65269080 None:intergenic 60.0%
GGAGAGGAAAAGAGCAGCCG+AGG - Chr1:65270878-65270897 MsG0180003617.01.T01:intron 60.0%
GGCTGAGGCAAGTGGGGTTA+GGG + Chr1:65269046-65269065 None:intergenic 60.0%
GGGAATTGGAGTCGAGACGG+TGG + Chr1:65269160-65269179 None:intergenic 60.0%
GGTCAGGGAGCTTCCTAAGC+CGG + Chr1:65269373-65269392 None:intergenic 60.0%
GTAGACGGCTGAGGCAAGTG+GGG + Chr1:65269052-65269071 None:intergenic 60.0%
TATGAAGGCGGGGCGAGTTG+CGG - Chr1:65269922-65269941 MsG0180003617.01.T01:CDS 60.0%
TCCGCCGCCATTTCAAGGTC+AGG + Chr1:65269389-65269408 None:intergenic 60.0%
TCTGACCAGGCCACCAAGGA+TGG + Chr1:65274844-65274863 None:intergenic 60.0%
TCTTCCATGCTGTCACGCGC+CGG - Chr1:65269351-65269370 MsG0180003617.01.T01:CDS 60.0%
TGAGGCAAGTGGGGTTAGGG+AGG + Chr1:65269043-65269062 None:intergenic 60.0%
TGATGCTTCCGGTCCAGCTG+AGG - Chr1:65269319-65269338 MsG0180003617.01.T01:CDS 60.0%
TTGAAATGGCGGCGGAGTCG+CGG - Chr1:65269393-65269412 MsG0180003617.01.T01:CDS 60.0%
! ACCAGCTTTAGCAGCGGCGA+CGG + Chr1:65269195-65269214 None:intergenic 60.0%
! ATTACGGAGGCGCGTGAGGA+TGG + Chr1:65269126-65269145 None:intergenic 60.0%
! GAAGGCCGGTTTCATGGACC+GGG - Chr1:65270039-65270058 MsG0180003617.01.T01:CDS 60.0%
! GGAGGGTGTGATGGGAAAGG+AGG - Chr1:65274166-65274185 MsG0180003617.01.T01:intron 60.0%
!! CACAAGTGCCGAAACCACCG+TGG + Chr1:65270020-65270039 None:intergenic 60.0%
ACGGCGTGGCAGGAAACCGA+AGG - Chr1:65275699-65275718 MsG0180003617.01.T01:CDS 65.0%
ACGGCGTGGCAGGAAACGGA+AGG - Chr1:65275789-65275808 MsG0180003617.01.T01:CDS 65.0%
CGGCTGAGGCAAGTGGGGTT+AGG + Chr1:65269047-65269066 None:intergenic 65.0%
CTTTAGCAGCGGCGACGGCA+AGG + Chr1:65269190-65269209 None:intergenic 65.0%
GCGACTCCGCCGCCATTTCA+AGG + Chr1:65269394-65269413 None:intergenic 65.0%
GGAGTCGAGACGGTGGAGCT+GGG + Chr1:65269153-65269172 None:intergenic 65.0%
GGCAAGGAGGCCGAGGGAAT+TGG + Chr1:65269174-65269193 None:intergenic 65.0%
TAAGCCGGCGCGTGACAGCA+TGG + Chr1:65269358-65269377 None:intergenic 65.0%
TGAGCGCGCGTGAGGGAAGA+GGG + Chr1:65269101-65269120 None:intergenic 65.0%
TGGAGTCGAGACGGTGGAGC+TGG + Chr1:65269154-65269173 None:intergenic 65.0%
! AGGAGCCATCCTTGGTGGCC+TGG - Chr1:65274836-65274855 MsG0180003617.01.T01:intron 65.0%
!! AGGGGCGCCGTCCATCAATG+AGG - Chr1:65272297-65272316 MsG0180003617.01.T01:intron 65.0%
!! ATGCTGTCACGCGCCGGCTT+AGG - Chr1:65269357-65269376 MsG0180003617.01.T01:CDS 65.0%
!! GATGGACTGAGCGCGCGTGA+GGG + Chr1:65269108-65269127 None:intergenic 65.0%
CTGAGCGCGCGTGAGGGAAG+AGG + Chr1:65269102-65269121 None:intergenic 70.0%
GCCGTCGCCGCTGCTAAAGC+TGG - Chr1:65269191-65269210 MsG0180003617.01.T01:intron 70.0%
GGAGTCGCGGCCGGATACTG+TGG - Chr1:65269406-65269425 MsG0180003617.01.T01:CDS 70.0%
TAGCAGCGGCGACGGCAAGG+AGG + Chr1:65269187-65269206 None:intergenic 70.0%
!! GGATGGACTGAGCGCGCGTG+AGG + Chr1:65269109-65269128 None:intergenic 70.0%
AATGGCGGCGGAGTCGCGGC+CGG - Chr1:65269397-65269416 MsG0180003617.01.T01:CDS 75.0%
GGCGACGGCAAGGAGGCCGA+GGG + Chr1:65269180-65269199 None:intergenic 75.0%
! CGGCGACGGCAAGGAGGCCG+AGG + Chr1:65269181-65269200 None:intergenic 80.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 65268822 65276410 65268822 ID=MsG0180003617.01;Name=MsG0180003617.01
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Chr1 exon 65274280 65274764 65274280 ID=MsG0180003617.01.T01:exon:50580;Parent=MsG0180003617.01.T01
Chr1 exon 65270881 65271146 65270881 ID=MsG0180003617.01.T01:exon:50579;Parent=MsG0180003617.01.T01
Chr1 exon 65269275 65270804 65269275 ID=MsG0180003617.01.T01:exon:50578;Parent=MsG0180003617.01.T01
Chr1 exon 65268822 65269037 65268822 ID=MsG0180003617.01.T01:exon:50577;Parent=MsG0180003617.01.T01
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Chr1 CDS 65270881 65271146 65270881 ID=MsG0180003617.01.T01:cds;Parent=MsG0180003617.01.T01
Chr1 CDS 65269275 65270804 65269275 ID=MsG0180003617.01.T01:cds;Parent=MsG0180003617.01.T01
Chr1 CDS 65268822 65269037 65268822 ID=MsG0180003617.01.T01:cds;Parent=MsG0180003617.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180003617.01.T01

ATGAACATTACTCTACTACAACCTCCATCATCATTCAACTTCACCAAAACCAACGTCAAAAACACCAACTCTAACTCTAACTCCTTTGTCTTAAACTACACAAACACAACATCAATAACACCAACCTCAAAATCAGAACCACGCGACCAAAAGCTTCTAACACTTTTACAACAACGTAAAACCGAAGAAGCTTGGATTGTATACACTCACTCCCCTCACCTCCCTAACCCCACTTGCCTCAGCCGTCTACTCTCTCAGCTTTCTTACAACAACACTCCCTCTTCCCTCACGCGCGCTCAGTCCATCCTCACGCGCCTCCGTAATGAATCCCAGCTCCACCGTCTCGACTCCAATTCCCTCGGCCTCCTTGCCGTCGCCGCTGCTAAAGCTGGTCACACTATCTACGCTTCCTCCGTTGTCAAATCCATGCTTCGTTCCGGCTACCTTCCTCATGTCAAAGCTTGGAGTGCTGTAGTAAGCCGTCTCGCTTCCGACGATGATGCTTCCGGTCCAGCTGAGGCTATCCGTCTCTTCCATGCTGTCACGCGCCGGCTTAGGAAGCTCCCTGACCTTGAAATGGCGGCGGAGTCGCGGCCGGATACTGTGGCGTTCAATGCTGTGCTTAATGTTTGTGCTAATTTGGGTGATGGTAAGATGTTTTTACAAGTGTTTGATGAAATGCCTGGGTTTGGTGTTGTGCCTGATTCTTTGAGTTATAATATTGTTATGAAGCTTTGTTGTGGAAATGGTAGAAAAGATTTGCTTGTGTTTGTGTTAGAGAGGATTCTTGAGTTGAATATACCTTTGTGTATGACTACTTTGCATTCACTTGTTGCTGCTTATGTTGATTTTAATGATTTGGAAACTGCTGAGAAAATTGTTCAGGCTATGAGGGAAAAAAGGAGAGATCTTTGTAGGATACTTAGAGAGTCCAATTCACAATATTCTTATGTTGATGATGATGTTGATTCTGTTTTTCATAAGTTGCTTCCAAATTTGTTGATGGGTAAGAGTGGCAATGGCAATGGGAATGATTTACCTTTGTTGCCAAAAGCATATACACCTAACACTAGGATTTACACAACTCTAATGAAAGGTTATATGAAGGCGGGGCGAGTTGCGGATACTGTAAGGATGCTCGAGGCAATGCGTTGTCAGGAGGATAGTGGCAGTCACCCTGACCATGTTTCCTATACCACGGTGGTTTCGGCACTTGTGAAGGCCGGTTTCATGGACCGGGCACGTCAAGTTCTTGCTGAAATGACAAGAATCGGTGTGCCTGCGAATCGGATAACCTACAATATTCTCCTCAAGGGTTACTGTAAACAGCTGCAGATGGACAAGGCAAGGGAGTTGCTTGAGGAGATGGCTGAGGATATTGGGATTGAGCCTGATGTTGTGTCGTATAATATACTTATTGATGGTTGTATATTAGTTGATGACAGTGCTGGTGCTCTTTCTTTCTTTAATGAGATGAGGGAAAAAGGGATAGCTCCTACAAAAATTAGTTACACTACTTTGATGAAAGCTTTTGCATTGTCTGGTCAACCAAAGCTGGTCAAAGGGTTAGGGTTGGTTGAAGAGGTAAAGAAGGTAATTCAAAAGATGAAGGAAAATGGATTTTACCCTAATGTGAGCACCTATGGAAGTTTTGCCAATGCAATTTCATTGGCAAGAAAACCAGGTGAAGCACTTATACTTTGGAATGAAGTGAAGGAAAGGTGTGAGTTGGCAAAGGAAGGAGGGAAAACTGATTCTTCTGTTCCACCTTTGAAACCTGATGAAGGGCTTTTGGACACACTTGCTGATATATGTGTGAGGGCTGCTTTCTTTAGAAAGGCCTTGGAAATTGTGGCTTGCATGGAAGAAAATGGGATACCTCCAAATAAGACCAAGTATACTAGAATATATGTGGAAATGCATTCAAGAATGTTTACTAGTAACATGCTTCAAAGGCTAGACAAGACAGAAGAGTGGAGAGGAAAAGAGCAGCCGAGGCTTTTAAGTTTTGGTTGGGTTTGCCTAATTCTTATTATGGAAGTGAGTGGAGGATTTAGGGTGTGGAAAAGAGGGTTTTGTGGTGAAAAACTTAATGGTTTTGAGGATGGTGGAGTGTTTGATGTTGTTGATGGAGGGTGTGATGGGAAAGGAGGAAAATTTTCATGTGGGTTGGTGAAGAATGATGATGAGAAAAGTGTGATTCAATGTTCTGATGGAGGTGCAGAGTCTGATAAAGGTTTGGTTTTTGGATTGAATGATGGTGTTCAGATTGAAAAGGAGTGTCAGAATGTGGCGCAAGTTGAATTGAGTAATGAGTTGTGGGATGACGGCATGATAAAAGCTGCTGATTGTTTTGTTACTACTGAAGATTCCCGTGTCTCGGATGTTGCAACCTACCAATTGCAGGATGGAATGCCATATGTGGAAGGCATCAATGTTAATAAAGAAGACTCTTTGGATGTGAAAGACTTGTCTTCGAGAAATTGTCACGAGCGTGAGCTAGTCTTTCTGTCGGATGCACAAGTAAATGTGATTCAGAATCAAACCACATGCATCAATATTTCTGGAGCAGGTGTATCCGAGAATATTCAATATGATTGTCGCGGTTTTGATTTTGTTGCTGGTCTTAATTCTTGCAAAAACGCTCAGAAGGATAGTGTGCCTAGGGAATCGGAGTTATCTGAAGCTAATTACCGTGTATCTGATTTAGTATGGGGAAAGGTTAGGAGCCATCCTTGGTGGCCTGGTCAGATCTATGATCCCTCGGTTGCATCAGAGAAGGCAAAGAAGCAGCGAAAGGAAAACTGTTACCTGATAGCATATTTTGGGGATCAAACATTTGCTTGGAATGATGCATCAGTAATAAAGCCATTTCATAAACATTTTTCTGAAATGGAGAAACAGAGTGATATGGAAAATTTCCGCCATGCCGTTGATTGTGCTTTAGAAGAGGCCTCAAGACGGGTTGAGTTTGTCCTGTCTTGTCCATGTATGCCTGGAGAAACGTATCCTGAGCTGAAAACGAAAGTAATTGCTAATAATGCGGCATCTTTTGAACCGACAGAACTTGTCAATTTTGTTAAATCTTTAGCCCAATCTCCACTTACTGAATTTGATAGATTGGATTTTGTAAGTGCACGTGCTCGATTGTCAGCTTTCTATCGCTCAAAAGGCTACTCTCAACTGCCTGAATTTGCAATGCTTGATCGGTTGTTTGAGAATGATATGGAAATTCTACTTGTAAGGGAGAATGAGCAGTGCGATGATCAAATTAATGAACAGCACATCTCTTGGAATACGAAGCAGACCGGCAAGAAGCAAAAACTTTTGTCAGATTTAATGTCCGAGGAGAACGTCTGGACTCCAAATGGTGAATGTACGCCAAAAAAGAAAGCTGGTGATAGTTCAATTTCACGACGAGGCAGGAAACGGAAGGCAGCGTATGATACTTCATATGATTATTTTCATCATTCCCAAATTGCTGATGATATATCAACTTCAAGGCGTGGCAGGAAACCAAAGGCATCTTACAATACTTCCAATGATTGTTTCAATAATTCCCAAATTGCTGCTAATAATTCAACTTCACGGCGTGGCAGGAAACCGAAGGCAGCTTACAATACTTCTTATGATTGTTTCAATGATTCCCAAATTGCTGCTAATAATTCAACTTCAAAACGGCGTGGCAGGAAACGGAAGGTACCTTACAATACTTCTGATGATTGTTTCAATAATTCCCAAACTGGAAACCTTGCCCAATTACAGAATGTATCCATTGATGAGATGCAGTCTCAGCTTTGCTTAGCTGCCACAGATCCTGCAGGAGAAAGTTGCTCAAGTGACATGAATGAAAGAGAGGAACTTTTGCCAGCTGCTGAAATTAGCCCAAATTCGGGTTTAATGCATCAAGAATCCAATGGAAATCTCGGATCAGAACCTTCCAACCATGTGGAACATGTGAATGAGAGTTCTCCCACTTCTCTTACCCTGAAATTTACAAACTTGGATTCGGTTCCTTCAACGGCGGATCTCAACAAGATCTTTGGCGTTTTGGGCCGCTAA

Protein sequence

>MsG0180003617.01.T01

MNITLLQPPSSFNFTKTNVKNTNSNSNSFVLNYTNTTSITPTSKSEPRDQKLLTLLQQRKTEEAWIVYTHSPHLPNPTCLSRLLSQLSYNNTPSSLTRAQSILTRLRNESQLHRLDSNSLGLLAVAAAKAGHTIYASSVVKSMLRSGYLPHVKAWSAVVSRLASDDDASGPAEAIRLFHAVTRRLRKLPDLEMAAESRPDTVAFNAVLNVCANLGDGKMFLQVFDEMPGFGVVPDSLSYNIVMKLCCGNGRKDLLVFVLERILELNIPLCMTTLHSLVAAYVDFNDLETAEKIVQAMREKRRDLCRILRESNSQYSYVDDDVDSVFHKLLPNLLMGKSGNGNGNDLPLLPKAYTPNTRIYTTLMKGYMKAGRVADTVRMLEAMRCQEDSGSHPDHVSYTTVVSALVKAGFMDRARQVLAEMTRIGVPANRITYNILLKGYCKQLQMDKARELLEEMAEDIGIEPDVVSYNILIDGCILVDDSAGALSFFNEMREKGIAPTKISYTTLMKAFALSGQPKLVKGLGLVEEVKKVIQKMKENGFYPNVSTYGSFANAISLARKPGEALILWNEVKERCELAKEGGKTDSSVPPLKPDEGLLDTLADICVRAAFFRKALEIVACMEENGIPPNKTKYTRIYVEMHSRMFTSNMLQRLDKTEEWRGKEQPRLLSFGWVCLILIMEVSGGFRVWKRGFCGEKLNGFEDGGVFDVVDGGCDGKGGKFSCGLVKNDDEKSVIQCSDGGAESDKGLVFGLNDGVQIEKECQNVAQVELSNELWDDGMIKAADCFVTTEDSRVSDVATYQLQDGMPYVEGINVNKEDSLDVKDLSSRNCHERELVFLSDAQVNVIQNQTTCINISGAGVSENIQYDCRGFDFVAGLNSCKNAQKDSVPRESELSEANYRVSDLVWGKVRSHPWWPGQIYDPSVASEKAKKQRKENCYLIAYFGDQTFAWNDASVIKPFHKHFSEMEKQSDMENFRHAVDCALEEASRRVEFVLSCPCMPGETYPELKTKVIANNAASFEPTELVNFVKSLAQSPLTEFDRLDFVSARARLSAFYRSKGYSQLPEFAMLDRLFENDMEILLVRENEQCDDQINEQHISWNTKQTGKKQKLLSDLMSEENVWTPNGECTPKKKAGDSSISRRGRKRKAAYDTSYDYFHHSQIADDISTSRRGRKPKASYNTSNDCFNNSQIAANNSTSRRGRKPKAAYNTSYDCFNDSQIAANNSTSKRRGRKRKVPYNTSDDCFNNSQTGNLAQLQNVSIDEMQSQLCLAATDPAGESCSSDMNEREELLPAAEISPNSGLMHQESNGNLGSEPSNHVEHVNESSPTSLTLKFTNLDSVPSTADLNKIFGVLGR*