AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380013813.01


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MsG0380013813.01.T01 AT1G17230 29.499 739 423 21 173 868 29 712 6.59e-60 223
MsG0380013813.01.T01 AT1G47890 26.609 932 476 28 183 920 87 1004 9.58e-60 222
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MsG0380013813.01.T01 AT1G07390 26.131 685 383 30 187 840 26 618 6.20e-22 102
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MsG0380013813.01.T01 AT5G49290 29.162 871 471 34 187 924 40 897 5.39e-58 216
MsG0380013813.01.T01 AT3G24982 28.867 821 441 24 200 901 94 890 9.86e-58 215
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MsG0380013813.01.T01 AT4G39400 28.696 805 396 26 172 868 36 770 8.24e-57 214
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MsG0380013813.01.T01 AT5G40170 27.217 823 483 21 154 926 36 792 6.70e-56 208
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MsG0380013813.01.T01 AT5G20480 30.769 624 393 15 298 899 53 659 1.63e-55 209
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MsG0380013813.01.T01 AT4G13880 32.007 578 323 17 342 868 114 672 1.94e-55 205
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MsG0380013813.01.T01 AT5G63930 31.120 482 309 11 370 841 14 482 3.59e-46 180
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MsG0380013813.01.T01 AT4G26540 31.522 368 202 10 315 647 333 685 1.82e-25 114
MsG0380013813.01.T01 AT2G24130 29.982 557 333 11 318 863 83 593 1.08e-49 191
MsG0380013813.01.T01 AT2G24130 28.015 539 256 16 196 639 67 568 3.64e-29 126
MsG0380013813.01.T01 AT5G65700 28.870 575 314 14 365 868 69 619 2.69e-49 190
MsG0380013813.01.T01 AT5G65700 28.870 575 314 14 365 868 69 619 2.69e-49 190
MsG0380013813.01.T01 AT5G62230 33.962 530 294 14 196 712 57 543 3.12e-49 189
MsG0380013813.01.T01 AT5G62230 29.057 530 314 8 362 862 68 564 3.96e-46 180
MsG0380013813.01.T01 AT1G28440 29.272 591 328 14 338 874 58 612 3.43e-49 189
MsG0380013813.01.T01 AT1G28440 30.851 564 345 20 181 712 30 580 4.10e-42 167
MsG0380013813.01.T01 AT1G28440 28.440 436 277 11 434 841 57 485 9.10e-28 121
MsG0380013813.01.T01 AT5G01890 30.127 551 310 15 364 875 67 581 5.64e-49 189
MsG0380013813.01.T01 AT5G01890 28.497 572 356 14 156 712 13 546 1.62e-47 184
MsG0380013813.01.T01 AT5G65710 28.765 591 345 15 321 874 79 630 1.33e-48 187
MsG0380013813.01.T01 AT5G65710 27.207 555 368 16 183 718 41 578 2.33e-37 152
MsG0380013813.01.T01 AT5G56040 28.849 669 375 20 181 841 42 617 1.88e-48 187
MsG0380013813.01.T01 AT5G56040 28.436 422 230 10 432 843 69 428 5.16e-26 115
MsG0380013813.01.T01 AT5G56040 29.293 297 174 10 206 485 395 672 8.31e-16 82.8
MsG0380013813.01.T01 AT5G56040 28.912 671 372 21 181 841 42 617 2.02e-48 187
MsG0380013813.01.T01 AT5G56040 28.436 422 230 10 432 843 69 428 2.19e-26 117
MsG0380013813.01.T01 AT5G56040 29.293 297 174 10 206 485 395 672 8.04e-16 83.2
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MsG0380013813.01.T01 AT1G73066 28.571 644 325 15 187 793 48 593 1.66e-47 180
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MsG0380013813.01.T01 AT5G49290 25.917 409 215 15 528 854 100 502 6.39e-17 86.3
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MsG0380013813.01.T01 AT3G47110 28.442 661 358 20 187 817 58 633 5.02e-34 141
MsG0380013813.01.T01 AT2G15042 28.571 350 222 6 570 906 68 402 1.95e-38 149
MsG0380013813.01.T01 AT2G15042 27.303 304 165 9 443 719 59 333 2.86e-16 82.8
MsG0380013813.01.T01 AT2G15042 28.796 191 108 4 285 454 143 326 7.21e-13 72.4
MsG0380013813.01.T01 AT1G12460 26.471 476 312 8 413 882 67 510 2.35e-38 155
MsG0380013813.01.T01 AT1G12460 25.730 548 287 17 176 712 31 469 5.18e-27 119
MsG0380013813.01.T01 AT1G12460 31.111 270 168 5 590 841 56 325 3.24e-23 106
MsG0380013813.01.T01 AT1G09970 27.312 465 311 10 390 841 73 523 4.71e-38 154
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MsG0380013813.01.T01 AT1G09970 27.808 543 302 14 198 721 61 532 9.16e-34 140
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MsG0380013813.01.T01 AT1G09970 27.312 465 311 10 390 841 73 523 5.10e-38 154
MsG0380013813.01.T01 AT1G09970 27.759 580 343 18 312 879 93 608 4.35e-36 148
MsG0380013813.01.T01 AT1G09970 27.808 543 302 14 198 721 61 532 9.75e-34 140
MsG0380013813.01.T01 AT1G09970 24.249 466 260 10 405 860 64 446 9.25e-23 105
MsG0380013813.01.T01 AT3G19700 27.895 570 345 17 180 715 38 575 7.62e-38 154
MsG0380013813.01.T01 AT3G19700 27.252 444 278 9 431 841 94 525 1.41e-29 127
MsG0380013813.01.T01 AT3G19700 27.043 514 279 10 365 820 100 575 1.27e-26 117
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MsG0380013813.01.T01 AT1G33610 24.796 367 235 9 332 666 96 453 1.66e-18 90.1
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MsG0380013813.01.T01 AT1G56120 27.559 254 149 4 615 842 113 357 2.17e-18 91.3
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MsG0380013813.01.T01 AT4G39270 34.146 246 138 7 604 841 129 358 8.23e-25 111
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MsG0380013813.01.T01 AT1G62440 27.213 305 158 11 439 733 103 353 5.43e-15 80.1
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MsG0380013813.01.T01 AT3G57830 26.115 314 148 7 628 914 45 301 3.16e-15 80.1
MsG0380013813.01.T01 AT3G57830 35.338 133 84 2 367 498 70 201 2.56e-11 67.8
MsG0380013813.01.T01 AT5G51560 39.706 136 81 1 342 477 97 231 4.79e-17 86.7
MsG0380013813.01.T01 AT5G51560 34.177 158 103 1 370 527 76 232 8.97e-16 82.4
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MsG0380013813.01.T01 AT5G63710 33.588 131 84 2 746 875 51 179 2.35e-12 71.2
MsG0380013813.01.T01 AT5G45800 28.571 203 131 6 656 855 62 253 2.38e-12 70.9
MsG0380013813.01.T01 AT5G45800 37.059 170 93 7 289 453 79 239 5.28e-11 66.6
MsG0380013813.01.T01 AT5G45800 27.155 232 119 6 413 641 55 239 9.36e-11 65.9
MsG0380013813.01.T01 AT5G10290 36.029 136 67 2 322 457 47 162 2.52e-12 71.2
MsG0380013813.01.T01 AT5G10290 36.029 136 67 2 322 457 47 162 2.52e-12 71.2
MsG0380013813.01.T01 AT5G63710 33.588 131 84 2 746 875 86 214 2.66e-12 71.2
MsG0380013813.01.T01 AT5G63710 33.588 131 84 2 746 875 87 215 2.71e-12 71.2
MsG0380013813.01.T01 AT2G13790 34.559 136 84 2 346 477 52 186 3.33e-12 70.9
MsG0380013813.01.T01 AT2G13790 38.679 106 63 1 393 498 79 182 4.17e-11 67.4
MsG0380013813.01.T01 AT4G16162 38.261 115 61 3 399 511 37 143 4.41e-12 65.5
MsG0380013813.01.T01 AT4G18640 39.806 103 61 1 394 496 75 176 4.47e-12 70.5
MsG0380013813.01.T01 AT5G45800 28.571 203 131 6 656 855 62 253 4.53e-12 70.5
MsG0380013813.01.T01 AT5G45800 37.059 170 93 7 289 453 79 239 6.64e-11 66.6
MsG0380013813.01.T01 AT3G15410 25.581 516 332 23 367 858 70 557 5.47e-12 70.1
MsG0380013813.01.T01 AT3G15410 25.581 516 332 23 367 858 76 563 5.71e-12 70.1
MsG0380013813.01.T01 AT3G14350 33.803 142 83 4 367 508 97 227 5.90e-12 70.1
MsG0380013813.01.T01 AT3G14350 33.803 142 83 4 367 508 60 190 6.10e-12 70.1
MsG0380013813.01.T01 AT1G68400 33.775 151 75 3 755 883 94 241 6.20e-12 70.1
MsG0380013813.01.T01 AT3G14350 33.803 142 83 4 367 508 97 227 6.28e-12 70.1
MsG0380013813.01.T01 AT2G36570 37.931 116 69 3 755 869 114 227 7.18e-12 69.7
MsG0380013813.01.T01 AT1G60800 28.342 187 98 5 724 885 53 228 8.20e-12 69.7
MsG0380013813.01.T01 AT5G43020 30.573 157 84 3 730 862 76 231 9.42e-12 69.3
MsG0380013813.01.T01 AT5G65240 44.706 85 47 0 399 483 98 182 1.04e-11 69.3
MsG0380013813.01.T01 AT5G65240 44.706 85 47 0 399 483 98 182 1.05e-11 69.3
MsG0380013813.01.T01 AT1G10850 32.308 130 65 2 755 862 98 226 1.40e-11 68.9
MsG0380013813.01.T01 AT4G23740 32.948 173 80 5 685 856 82 219 1.42e-11 68.9
MsG0380013813.01.T01 AT4G23740 32.948 173 80 5 685 856 82 219 1.42e-11 68.9
MsG0380013813.01.T01 AT4G31250 33.333 135 69 2 755 868 102 236 2.46e-11 68.2
MsG0380013813.01.T01 AT5G49780 30.939 181 96 4 661 838 5 159 3.32e-11 67.8
MsG0380013813.01.T01 AT5G49780 33.099 142 86 4 342 475 19 159 3.90e-11 67.8
MsG0380013813.01.T01 AT1G14390 29.646 226 146 6 326 542 60 281 3.51e-11 67.8
MsG0380013813.01.T01 AT1G14390 26.882 279 155 7 623 888 105 347 9.90e-11 66.2
MsG0380013813.01.T01 AT1G60630 32.593 135 68 3 755 867 89 222 4.33e-11 67.4
MsG0380013813.01.T01 AT5G17680 28.613 346 210 15 262 596 707 1026 4.80e-11 67.8
MsG0380013813.01.T01 AT5G17680 28.613 346 210 15 262 596 706 1025 4.84e-11 67.8
MsG0380013813.01.T01 AT5G45780 32.402 179 95 6 756 911 83 258 4.92e-11 67.0
MsG0380013813.01.T01 AT5G45780 36.937 111 70 0 370 480 84 194 7.62e-11 66.6
MsG0380013813.01.T01 AT1G27190 43.119 109 61 1 370 477 77 185 5.18e-11 67.0
MsG0380013813.01.T01 AT1G27190 40.000 115 66 2 755 868 99 211 7.24e-11 66.6
MsG0380013813.01.T01 AT5G45780 32.402 179 95 6 756 911 40 215 5.88e-11 66.6
MsG0380013813.01.T01 AT5G45780 36.937 111 70 0 370 480 41 151 7.49e-11 66.2
MsG0380013813.01.T01 AT1G60800 30.323 155 79 4 756 885 11 161 6.87e-11 66.6
MsG0380013813.01.T01 AT4G16162 31.288 163 74 5 376 532 38 168 6.92e-11 62.8
MsG0380013813.01.T01 AT4G16162 31.288 163 74 5 376 532 38 168 6.92e-11 62.8

Find 178 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 387 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TGGGATTTGCAGTAGGTTTC+TGG 0.004389 3:+46038378 MsG0380013813.01.T01:CDS
CTGGAACTGATCCCTGTATT+TGG 0.215341 3:-46036888 None:intergenic
GTGGTTCTATGTTTCTTATT+AGG 0.239521 3:+46038408 MsG0380013813.01.T01:CDS
GACAAGTTCTTCCAACTATA+TGG 0.240573 3:-46037543 None:intergenic
ATAAAAGAGTCGTTGTATTT+AGG 0.263329 3:+46038347 MsG0380013813.01.T01:CDS
CTTGCACATAACAAACTTTC+CGG 0.270125 3:+46037795 MsG0380013813.01.T01:CDS
GAAAGTTGGCCTATTTCTTC+TGG 0.275651 3:-46036979 None:intergenic
TTATGAACCTTTGGAGTAAT+AGG 0.276524 3:+46037577 MsG0380013813.01.T01:CDS
TATATCCAAGATGGAAAGTT+TGG 0.279994 3:-46037261 None:intergenic
AGAGATCAAGGACTTGAATA+TGG 0.280636 3:-46037002 None:intergenic
TTCCAAACTCTCTAGTTTAG+AGG 0.281526 3:+46037137 MsG0380013813.01.T01:CDS
TTCCTCTAAACTAGAGAGTT+TGG 0.282923 3:-46037139 None:intergenic
GTTCATATATTCTTTCTATA+AGG 0.285366 3:-46037359 None:intergenic
GTCCGATAGAGGGTGATAAA+TGG 0.304163 3:+46034336 MsG0380013813.01.T01:CDS
TTGTCGTTGGTGCTTGTTCC+TGG 0.309929 3:+46034393 MsG0380013813.01.T01:CDS
GAACCCAATCCAAATCAAAT+TGG 0.310778 3:-46037191 None:intergenic
CAACAGATGGGAAGTTGTTC+AGG 0.334977 3:-46036672 None:intergenic
TATCTACAACTTGACTAATA+TGG 0.335088 3:+46037833 MsG0380013813.01.T01:CDS
TATTCCAATTTGATTTGGAT+TGG 0.336058 3:+46037187 MsG0380013813.01.T01:CDS
TAAATTCAAATAACTCAAAA+AGG 0.337075 3:-46038162 None:intergenic
GGGATTTGCAGTAGGTTTCT+GGG 0.342749 3:+46038379 MsG0380013813.01.T01:CDS
GGATCAATTCCAGAAGAAAT+AGG 0.347031 3:+46036970 MsG0380013813.01.T01:CDS
CAGGTACAATTCCATATAGT+TGG 0.347815 3:+46037532 MsG0380013813.01.T01:CDS
CTTTGGAGTAATAGGTTGTC+TGG 0.353780 3:+46037585 MsG0380013813.01.T01:CDS
TTCATGCCTCCAATCGTCTT+TGG 0.355327 3:-46038068 None:intergenic
CTTTCAGCCAATAGCTTGTC+TGG 0.356011 3:+46037966 MsG0380013813.01.T01:CDS
AGAGGAGCTCCGCATAGTTT+AGG 0.358998 3:-46038263 None:intergenic
ACATCTCGACGTATCGAGTT+CGG 0.361691 3:+46037302 MsG0380013813.01.T01:CDS
TCAGCCATCGGTGATATGTT+TGG 0.363050 3:-46037480 None:intergenic
GCCATGAACAATTTAGTGTT+AGG 0.364030 3:-46037422 None:intergenic
GGATCAGTTCCAGTAGAAAT+AGG 0.366626 3:+46036898 MsG0380013813.01.T01:CDS
AAGTGCCATTGGAATTGTTT+CGG 0.372808 3:+46037991 MsG0380013813.01.T01:CDS
CTTTCACAGACTAATATATA+TGG 0.375213 3:+46036805 MsG0380013813.01.T01:CDS
ATTCCAATTTGATTTGGATT+GGG 0.376326 3:+46037188 MsG0380013813.01.T01:CDS
TCAACTCACTGATCTTTCAT+TGG 0.376996 3:+46037221 MsG0380013813.01.T01:CDS
TCTAGTGGATCGACCTCATC+AGG 0.381194 3:-46032396 None:intergenic
ACCTAACACTAAATTGTTCA+TGG 0.382054 3:+46037421 MsG0380013813.01.T01:CDS
ACTTGAATTTCTTAGTTACT+TGG 0.385314 3:+46036417 MsG0380013813.01.T01:CDS
TTGTCTTACAACTCCTTCTC+AGG 0.389165 3:+46037513 MsG0380013813.01.T01:CDS
TTGAAAGGTGAGATGAATCT+TGG 0.390911 3:+46036385 MsG0380013813.01.T01:CDS
AACTGGAAGTTATGAACCTT+TGG 0.394458 3:+46037568 MsG0380013813.01.T01:CDS
CTATGTTTCTTATTAGGAAA+TGG 0.394599 3:+46038414 MsG0380013813.01.T01:CDS
ACCATCTGATATGGCAGAAA+TGG 0.396566 3:+46032485 MsG0380013813.01.T01:CDS
CAGCCATCGGTGATATGTTT+GGG 0.396705 3:-46037479 None:intergenic
CTTTGAAGCTGTGTTCCAAC+CGG 0.398056 3:-46038212 None:intergenic
AACTAACAGGAGCTCAGTTT+CGG 0.398136 3:-46038517 None:intergenic
CTGGAATTGATCCTTGTAGT+TGG 0.400906 3:-46036960 None:intergenic
AATGGAGGCATGTGTGCTTT+CGG 0.401278 3:+46038432 MsG0380013813.01.T01:CDS
GCTTCTGCAACCTCTGAATC+TGG 0.402356 3:-46034431 None:intergenic
GTTTGGGCCTTGATTTGTAT+TGG 0.404791 3:-46037244 None:intergenic
AAGGCCCAAACTTTCCATCT+TGG 0.406398 3:+46037256 MsG0380013813.01.T01:CDS
TCCGATAGAGGGTGATAAAT+GGG 0.411873 3:+46034337 MsG0380013813.01.T01:CDS
CATCTCGACGTATCGAGTTC+GGG 0.413623 3:+46037303 MsG0380013813.01.T01:CDS
TGAACGACCACCATCTGATA+TGG 0.414745 3:+46032476 MsG0380013813.01.T01:CDS
ACAATTGCAGACCATGAACT+TGG 0.415726 3:+46037638 MsG0380013813.01.T01:CDS
GAGGGTGATAAATGGGGTAT+TGG 0.418440 3:+46034344 MsG0380013813.01.T01:CDS
TCTCTCTTATAACCAAATAC+AGG 0.420066 3:+46036876 MsG0380013813.01.T01:CDS
TTGGAAGAACTTGTCAGAAC+TGG 0.420082 3:+46037551 MsG0380013813.01.T01:CDS
GTCCACTGTGACAACATTAC+TGG 0.423750 3:+46036298 MsG0380013813.01.T01:CDS
TCTGAATCTTATAGCAGAAT+CGG 0.424598 3:+46034499 MsG0380013813.01.T01:CDS
CAATAGTTCGCCTTTCTTGT+TGG 0.425384 3:-46037941 None:intergenic
ACAATTGAGTTGTTTACAAA+AGG 0.430902 3:+46037897 MsG0380013813.01.T01:CDS
GAAAGATCAGTGAGTTGAAA+AGG 0.431005 3:-46037216 None:intergenic
GAATTAACAAAATCTTCTGT+TGG 0.431577 3:-46032426 None:intergenic
TAGAAAGAATATATGAACTT+AGG 0.434575 3:+46037364 MsG0380013813.01.T01:CDS
ATTCACTATTTGAAGCCAAT+TGG 0.440922 3:-46036608 None:intergenic
AATAATAGAGCAAACGTAGT+TGG 0.442668 3:-46034567 None:intergenic
CAGGGCATCAATGATAGTTT+CGG 0.443311 3:+46036226 MsG0380013813.01.T01:intron
ATCGAGTTCGGGAATTTCAT+TGG 0.443398 3:+46037314 MsG0380013813.01.T01:CDS
TTGAGAGCTAATAAATTTGA+AGG 0.446217 3:+46037723 MsG0380013813.01.T01:CDS
GACTCATGAACATGATCAAA+AGG 0.446681 3:-46036352 None:intergenic
TGAAATATCTCAACCTGAGT+TGG 0.450120 3:+46036566 MsG0380013813.01.T01:CDS
ATTGACTCTAATAATTTCTC+TGG 0.450199 3:+46037093 MsG0380013813.01.T01:CDS
TTTGGTTATAAGAGAGATCA+AGG 0.450640 3:-46036870 None:intergenic
TATGTCTTCAGCAATCGAAT+TGG 0.452394 3:-46037394 None:intergenic
CACTTCTCCAGACAAGCTAT+TGG 0.455862 3:-46037973 None:intergenic
ATAATAGAGCAAACGTAGTT+GGG 0.459705 3:-46034566 None:intergenic
TCATTGGCCAATACAAATCA+AGG 0.461935 3:+46037237 MsG0380013813.01.T01:CDS
TCTTCATTCTCTGCATCTCC+AGG 0.464822 3:-46038314 None:intergenic
ATCTTCATAAGGAAACCAAT+TGG 0.465389 3:+46036593 MsG0380013813.01.T01:CDS
GTCAAGATAGGTGAGATCTT+TGG 0.470137 3:-46036782 None:intergenic
GAGAGGTTTCCTAGAGTTGA+AGG 0.470533 3:-46037051 None:intergenic
TTGTGGCATCTTGATTGGTA+TGG 0.475261 3:-46037682 None:intergenic
TCTGTTGGATTGATTTCTAG+TGG 0.477999 3:-46032411 None:intergenic
GGATCTATTCCTTCAACTCT+AGG 0.478153 3:+46037042 MsG0380013813.01.T01:CDS
GAGTTGGATTGATCTTCATA+AGG 0.478510 3:+46036582 MsG0380013813.01.T01:CDS
GTCAAGTTGTAGATACACTT+TGG 0.481717 3:-46037825 None:intergenic
CATTCTTCTATTGAAACTCA+TGG 0.485515 3:+46032519 MsG0380013813.01.T01:CDS
ATTCTTCTATTGAAACTCAT+GGG 0.488461 3:+46032520 MsG0380013813.01.T01:CDS
TTCACCTTTCATATACCTGA+TGG 0.488623 3:+46036745 MsG0380013813.01.T01:CDS
AGATATTTCAACGAAGAAAG+TGG 0.488661 3:-46036553 None:intergenic
GCAAGCTGGCCTATTTCTAC+TGG 0.489524 3:-46036907 None:intergenic
ATATCCAAGATGGAAAGTTT+GGG 0.489624 3:-46037260 None:intergenic
AAGGAATAGATCCTTGTAGT+TGG 0.492058 3:-46037032 None:intergenic
AGTCTGTGAAAGGTCAAGAT+AGG 0.492081 3:-46036794 None:intergenic
TCCAGGACTTTCTTCTTCTG+TGG 0.493782 3:-46038297 None:intergenic
GGACTTGAATATGGGAAAGT+TGG 0.496578 3:-46036993 None:intergenic
TGAAGGTTTAGCAAGCTTGA+AGG 0.498997 3:-46036835 None:intergenic
GATACACTTTGGCATAGAAC+CGG 0.499349 3:-46037814 None:intergenic
ATGTGTGATGTTGTGTTGAA+TGG 0.504176 3:-46036479 None:intergenic
AAACGTAGTTGGGAGATTGT+TGG 0.504187 3:-46034556 None:intergenic
AAAGATTGTTGTTCTTGGGA+AGG 0.508013 3:+46036274 MsG0380013813.01.T01:CDS
TTTGGAGTAATAGGTTGTCT+GGG 0.515010 3:+46037586 MsG0380013813.01.T01:CDS
GAGATCAAGGACTTGAATAT+GGG 0.517028 3:-46037001 None:intergenic
TGATGCAGCAGGTCCGATAG+AGG 0.517732 3:+46034325 MsG0380013813.01.T01:intron
ACCACAGAAGAAGAAAGTCC+TGG 0.518628 3:+46038296 MsG0380013813.01.T01:CDS
TTTAATGCATCGAGCTACAT+TGG 0.520337 3:+46038236 MsG0380013813.01.T01:CDS
TCTGTGGTACAGTTATTAAG+AGG 0.520432 3:-46038281 None:intergenic
GGATTTGCAGTAGGTTTCTG+GGG 0.521637 3:+46038380 MsG0380013813.01.T01:CDS
TCCATTTCTGCCATATCAGA+TGG 0.522210 3:-46032486 None:intergenic
GAGTCGTTGTATTTAGGCAT+GGG 0.523988 3:+46038353 MsG0380013813.01.T01:CDS
AACTGTAATTCTAACAATGA+AGG 0.525097 3:-46036637 None:intergenic
CAGACAAGCTATTGGCTGAA+AGG 0.525405 3:-46037965 None:intergenic
CTCTCTGAAAACCAACTACA+AGG 0.528193 3:+46036949 MsG0380013813.01.T01:CDS
CTCTCTGAAAACCAACTACA+AGG 0.528193 3:+46037021 MsG0380013813.01.T01:CDS
AGAGTCGTTGTATTTAGGCA+TGG 0.531241 3:+46038352 MsG0380013813.01.T01:CDS
AAATTGTTCATGGCTACAGT+TGG 0.540887 3:+46037431 MsG0380013813.01.T01:CDS
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TGGTAATGAAAAGACTTGCC+AGG 0.545121 3:-46034411 None:intergenic
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GTCGTCAATAACACACATTA+CGG 0.548594 3:+46032369 MsG0380013813.01.T01:CDS
TTTGAAGCTGTGTTCCAACC+GGG 0.548928 3:-46038211 None:intergenic
CTTGTCTGGAGAAGTGCCAT+TGG 0.549586 3:+46037980 MsG0380013813.01.T01:CDS
AAATTCAAATACTCAACAGA+TGG 0.550445 3:-46036685 None:intergenic
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TAAGAGAGATTGAATAGTTG+TGG 0.553599 3:-46037756 None:intergenic
CGGAAAGTTTGTTATGTGCA+AGG 0.559771 3:-46037794 None:intergenic
ATATGGAATTGTACCTGAGA+AGG 0.560860 3:-46037526 None:intergenic
CATGGGGATATTTCACAGAA+AGG 0.564740 3:+46032537 MsG0380013813.01.T01:CDS
CATATATATTAGTCTGTGAA+AGG 0.575908 3:-46036804 None:intergenic
CTCTCTTATAACCAAATACA+GGG 0.576360 3:+46036877 MsG0380013813.01.T01:CDS
GTTGTATTTAGGCATGGGAG+TGG 0.579624 3:+46038358 MsG0380013813.01.T01:CDS
TGAGAGCTAATAAATTTGAA+GGG 0.579708 3:+46037724 MsG0380013813.01.T01:CDS
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TTAAAGTTAGAGATGTACAA+TGG 0.583220 3:-46037615 None:intergenic
CTTTCGGTTAGTTGATAGAG+TGG 0.588241 3:+46038448 MsG0380013813.01.T01:CDS
CCCCATTTATCACCCTCTAT+CGG 0.589306 3:-46034338 None:intergenic
TGTTTCTTATTAGGAAATGG+AGG 0.594389 3:+46038417 MsG0380013813.01.T01:CDS
CATATCACCGATGGCTGATG+TGG 0.595255 3:+46037485 MsG0380013813.01.T01:CDS
TTTCGGTTAGTTGATAGAGT+GGG 0.596350 3:+46038449 MsG0380013813.01.T01:CDS
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GAGAGATTGAATAGTTGTGG+TGG 0.600582 3:-46037753 None:intergenic
GAAGCTTTAGCTATGCGGAA+GGG 0.601101 3:+46034449 MsG0380013813.01.T01:CDS
AATTCAAATACTCAACAGAT+GGG 0.602916 3:-46036684 None:intergenic
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CTAGTGGATCGACCTCATCA+GGG 0.687292 3:-46032395 None:intergenic
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CRISPR-GE

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!! TAATGTTTAAATTTAGTTAA+GGG - Chr3:46034097-46034116 None:intergenic 10.0%
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!!! AAAAATCAGAATTTTTTTTT+TGG - Chr3:46033188-46033207 None:intergenic 10.0%
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!! AACTTGAAAAAAGGATAAAT+TGG - Chr3:46035964-46035983 None:intergenic 20.0%
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!!! AAAGTATTTTTGTTTTGGTT+TGG + Chr3:46033672-46033691 MsG0380013813.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTTTTCCCTAAAAAAATGT+TGG - Chr3:46033144-46033163 None:intergenic 20.0%
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!!! GTTTAATTGATACTATTTTG+TGG - Chr3:46035745-46035764 None:intergenic 20.0%
!!! TATTCAAAGTCTTATAGTTT+TGG + Chr3:46035867-46035886 MsG0380013813.01.T01:intron 20.0%
!!! TTATCTCACAATAATTTTGT+TGG + Chr3:46038038-46038057 MsG0380013813.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTGTTATGAGATTTTAATG+TGG - Chr3:46036013-46036032 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTGTATTCCAATTTGATT+TGG + Chr3:46037182-46037201 MsG0380013813.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTTCCCTAAAAAAATGTT+GGG - Chr3:46033143-46033162 None:intergenic 20.0%
! AAAAGAAGATCTAATTCAAG+TGG - Chr3:46036044-46036063 None:intergenic 25.0%
! AAAGAAGATCTAATTCAAGT+GGG - Chr3:46036043-46036062 None:intergenic 25.0%
! AAATTCAAATACTCAACAGA+TGG - Chr3:46036688-46036707 None:intergenic 25.0%
! AACTGTAATTCTAACAATGA+AGG - Chr3:46036640-46036659 None:intergenic 25.0%
! AATTCAAATACTCAACAGAT+GGG - Chr3:46036687-46036706 None:intergenic 25.0%
! ACTTATCCAAAAATCTTGAT+TGG + Chr3:46036524-46036543 MsG0380013813.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTGAATTTCTTAGTTACT+TGG + Chr3:46036417-46036436 MsG0380013813.01.T01:CDS 25.0%
! ATAAAAGAGTCGTTGTATTT+AGG + Chr3:46038347-46038366 MsG0380013813.01.T01:CDS 25.0%
! ATATCATTGTATTAACCAAG+TGG + Chr3:46035516-46035535 MsG0380013813.01.T01:intron 25.0%
! ATTCTTCTATTGAAACTCAT+GGG + Chr3:46032520-46032539 MsG0380013813.01.T01:CDS 25.0%
! CAATTTCATTAATGAAAGTC+TGG - Chr3:46034767-46034786 None:intergenic 25.0%
! CAGAAAGTTCAAATTAGTTA+AGG - Chr3:46034011-46034030 None:intergenic 25.0%
! CCACTTGAATCAATAAATTA+TGG + Chr3:46033579-46033598 MsG0380013813.01.T01:intron 25.0%
! CTATGTTTCTTATTAGGAAA+TGG + Chr3:46038414-46038433 MsG0380013813.01.T01:CDS 25.0%
! CTTTCACAGACTAATATATA+TGG + Chr3:46036805-46036824 MsG0380013813.01.T01:CDS 25.0%
! GAAAGTTCAAATTAGTTAAG+GGG - Chr3:46034009-46034028 None:intergenic 25.0%
! GAATTAACAAAATCTTCTGT+TGG - Chr3:46032429-46032448 None:intergenic 25.0%
! GTCAATATATAAAGCAAACA+AGG - Chr3:46037079-46037098 None:intergenic 25.0%
! TATCTACAACTTGACTAATA+TGG + Chr3:46037833-46037852 MsG0380013813.01.T01:CDS 25.0%
! TGAAAATTGTGTAGTAAGAA+TGG - Chr3:46036095-46036114 None:intergenic 25.0%
! TGAGAGCTAATAAATTTGAA+GGG + Chr3:46037724-46037743 MsG0380013813.01.T01:CDS 25.0%
! TTAAAGTTAGAGATGTACAA+TGG - Chr3:46037618-46037637 None:intergenic 25.0%
! TTGAGAGCTAATAAATTTGA+AGG + Chr3:46037723-46037742 MsG0380013813.01.T01:CDS 25.0%
! TTTCCTTTGTCATATCAAAA+AGG + Chr3:46035683-46035702 MsG0380013813.01.T01:intron 25.0%
!! AAGATTGATAAGAAAGTATG+TGG - Chr3:46035938-46035957 None:intergenic 25.0%
!! ACAATTGAGTTGTTTACAAA+AGG + Chr3:46037897-46037916 MsG0380013813.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTATAATTTTATGTGGCCT+TGG - Chr3:46033247-46033266 None:intergenic 25.0%
!! ATTGACTCTAATAATTTCTC+TGG + Chr3:46037093-46037112 MsG0380013813.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTTACATATGGTTGTGAT+TGG - Chr3:46033758-46033777 None:intergenic 25.0%
!! CATATATATTAGTCTGTGAA+AGG - Chr3:46036807-46036826 None:intergenic 25.0%
!! CATTTTCCTTATAAATCAGA+GGG + Chr3:46035583-46035602 MsG0380013813.01.T01:intron 25.0%
!! TATGTATGTCATGTCAATTT+TGG - Chr3:46033973-46033992 None:intergenic 25.0%
!! TGAAAAAGATTGTTGTTCTT+GGG + Chr3:46036270-46036289 MsG0380013813.01.T01:CDS 25.0%
!! TTATAATTTTATGTGGCCTT+GGG - Chr3:46033246-46033265 None:intergenic 25.0%
!! TTTTGTGTATATATCCAAGA+TGG - Chr3:46037273-46037292 None:intergenic 25.0%
!!! AAGAGCTTGATAATTTCTTT+TGG + Chr3:46033428-46033447 MsG0380013813.01.T01:intron 25.0%
!!! AGAGAATAAGGTTTTGAATA+TGG - Chr3:46036933-46036952 None:intergenic 25.0%
!!! ATTCCAATTTGATTTGGATT+GGG + Chr3:46037188-46037207 MsG0380013813.01.T01:CDS 25.0%
!!! CAAAAAACTTGTTATTAGAG+AGG - Chr3:46038112-46038131 None:intergenic 25.0%
!!! CAAGACAATTTTAAAACATG+AGG + Chr3:46033608-46033627 MsG0380013813.01.T01:intron 25.0%
!!! CCATAATTTATTGATTCAAG+TGG - Chr3:46033582-46033601 None:intergenic 25.0%
!!! CTCTCTAATAACAAGTTTTT+TGG + Chr3:46038110-46038129 MsG0380013813.01.T01:CDS 25.0%
!!! GAGAATAAGGTTTTGAATAT+GGG - Chr3:46036932-46036951 None:intergenic 25.0%
!!! TATTCCAATTTGATTTGGAT+TGG + Chr3:46037187-46037206 MsG0380013813.01.T01:CDS 25.0%
!!! TCGAGATTGTATTAGTTTTA+AGG + Chr3:46034589-46034608 MsG0380013813.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTGGAGCTATATTTTTTTTG+TGG + Chr3:46033691-46033710 MsG0380013813.01.T01:intron 25.0%
AATAATAGAGCAAACGTAGT+TGG - Chr3:46034570-46034589 None:intergenic 30.0%
ACATCAGATATTGGCAAAAT+TGG - Chr3:46034267-46034286 None:intergenic 30.0%
ACCTAACACTAAATTGTTCA+TGG + Chr3:46037421-46037440 MsG0380013813.01.T01:CDS 30.0%
AGATATTTCAACGAAGAAAG+TGG - Chr3:46036556-46036575 None:intergenic 30.0%
ATAATAGAGCAAACGTAGTT+GGG - Chr3:46034569-46034588 None:intergenic 30.0%
ATATCCAAGATGGAAAGTTT+GGG - Chr3:46037263-46037282 None:intergenic 30.0%
ATCTTCATAAGGAAACCAAT+TGG + Chr3:46036593-46036612 MsG0380013813.01.T01:CDS 30.0%
ATGTGGTTATATAAGATGCT+AGG - Chr3:46035996-46036015 None:intergenic 30.0%
CATGCTAACTTATCAAACAT+TGG + Chr3:46033005-46033024 MsG0380013813.01.T01:intron 30.0%
CATTCTTCTATTGAAACTCA+TGG + Chr3:46032519-46032538 MsG0380013813.01.T01:CDS 30.0%
CCTCTGATTTATAAGGAAAA+TGG - Chr3:46035585-46035604 None:intergenic 30.0%
CTAAAAAAATGTTGGGACTT+GGG - Chr3:46033136-46033155 None:intergenic 30.0%
CTCTCTTATAACCAAATACA+GGG + Chr3:46036877-46036896 MsG0380013813.01.T01:CDS 30.0%
GACAATGCATAATATATGCA+AGG + Chr3:46035072-46035091 MsG0380013813.01.T01:intron 30.0%
GATCACCTCTCATAAAATTA+AGG - Chr3:46032614-46032633 None:intergenic 30.0%
GGAAACTTCTCTTACAAATT+TGG - Chr3:46033561-46033580 None:intergenic 30.0%
GTTACAGAAATTGATCTCAA+AGG + Chr3:46036325-46036344 MsG0380013813.01.T01:CDS 30.0%
TAAGAGAGATTGAATAGTTG+TGG - Chr3:46037759-46037778 None:intergenic 30.0%
TAGAGATTTGTAAAGCAAAG+AGG - Chr3:46032905-46032924 None:intergenic 30.0%
TATATCCAAGATGGAAAGTT+TGG - Chr3:46037264-46037283 None:intergenic 30.0%
TATGTGGACAACATTCAAAT+GGG - Chr3:46035922-46035941 None:intergenic 30.0%
TCCTTGGAAAACTTGAAAAA+AGG - Chr3:46035973-46035992 None:intergenic 30.0%
TCTCTCTTATAACCAAATAC+AGG + Chr3:46036876-46036895 MsG0380013813.01.T01:CDS 30.0%
TCTGAATCTTATAGCAGAAT+CGG + Chr3:46034499-46034518 MsG0380013813.01.T01:CDS 30.0%
TGTTAACCCTCTGATTTATA+AGG - Chr3:46035592-46035611 None:intergenic 30.0%
TGTTTCTTATTAGGAAATGG+AGG + Chr3:46038417-46038436 MsG0380013813.01.T01:CDS 30.0%
TTAACCAAGTGGTTAATGTT+CGG + Chr3:46035527-46035546 MsG0380013813.01.T01:intron 30.0%
TTCTTCTATTGAAACTCATG+GGG + Chr3:46032521-46032540 MsG0380013813.01.T01:CDS 30.0%
TTGCTAAACACACTAATGTA+AGG - Chr3:46032689-46032708 None:intergenic 30.0%
TTGGATCACAATAATTTCAC+AGG + Chr3:46037450-46037469 MsG0380013813.01.T01:CDS 30.0%
TTTGGTTATAAGAGAGATCA+AGG - Chr3:46036873-46036892 None:intergenic 30.0%
! ACTTTAAAGGATGATTAGCT+CGG + Chr3:46035271-46035290 MsG0380013813.01.T01:intron 30.0%
! AGAAAGCCAATCAAGATTTT+TGG - Chr3:46036533-46036552 None:intergenic 30.0%
! ATTCACTATTTGAAGCCAAT+TGG - Chr3:46036611-46036630 None:intergenic 30.0%
! CCATTTTCCTTATAAATCAG+AGG + Chr3:46035582-46035601 MsG0380013813.01.T01:intron 30.0%
! CTGAAAAAGATTGTTGTTCT+TGG + Chr3:46036269-46036288 MsG0380013813.01.T01:CDS 30.0%
! GTGGTTCTATGTTTCTTATT+AGG + Chr3:46038408-46038427 MsG0380013813.01.T01:CDS 30.0%
! GTTTGTTACTGATGATGTAT+TGG + Chr3:46032765-46032784 MsG0380013813.01.T01:intron 30.0%
! TGGTAATCAAAATCCCATTT+TGG + Chr3:46033711-46033730 MsG0380013813.01.T01:intron 30.0%
! TGTCTTTTAAACAACGTGAT+AGG - Chr3:46032982-46033001 None:intergenic 30.0%
! TTAATTTTGCCAAATCTGTG+CGG + Chr3:46035648-46035667 MsG0380013813.01.T01:intron 30.0%
! TTGGGAGAAAATGAATTTTC+TGG + Chr3:46037657-46037676 MsG0380013813.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTGTGGACAACAATTATG+TGG - Chr3:46035730-46035749 None:intergenic 30.0%
!! CAAGATTTTTGGATAAGTCA+AGG - Chr3:46036522-46036541 None:intergenic 30.0%
!! TGAACCTCATGTTTTAAACT+TGG - Chr3:46035815-46035834 None:intergenic 30.0%
!! TTATGAACCTTTGGAGTAAT+AGG + Chr3:46037577-46037596 MsG0380013813.01.T01:CDS 30.0%
!!! CAAGTCCCAACATTTTTTTA+GGG + Chr3:46033135-46033154 MsG0380013813.01.T01:intron 30.0%
!!! GAGTCAGTTAAAGTTTTGAA+AGG + Chr3:46036370-46036389 MsG0380013813.01.T01:CDS 30.0%
!!! TCCTTTTTTCAAGTTTTCCA+AGG + Chr3:46035969-46035988 MsG0380013813.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTTTGGTGAAATTCCTCA+GGG + Chr3:46038125-46038144 MsG0380013813.01.T01:CDS 30.0%
AAAAAGGCTCAAATGATGAC+AGG + Chr3:46035699-46035718 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
AAAAGGCTCAAATGATGACA+GGG + Chr3:46035700-46035719 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
AAACCCATCAGGTATATGAA+AGG - Chr3:46036752-46036771 None:intergenic 35.0%
AAACTTAATGTTGATGCAGC+AGG + Chr3:46034314-46034333 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
AAATTGTTCATGGCTACAGT+TGG + Chr3:46037431-46037450 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
AACTGGAAGTTATGAACCTT+TGG + Chr3:46037568-46037587 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
AAGACTGCAGAAATACAAGA+CGG - Chr3:46034728-46034747 None:intergenic 35.0%
AAGGAATAGATCCTTGTAGT+TGG - Chr3:46037035-46037054 None:intergenic 35.0%
AAGGTCGTGTAAACTAAAGT+TGG + Chr3:46033099-46033118 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
ACACTGTTAACCTTCAAACA+GGG + Chr3:46036208-46036227 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
ACATTCCACAAAACCATTTG+CGG + Chr3:46036145-46036164 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
ACATTTAGTGTGTTTGGAAG+CGG + Chr3:46032845-46032864 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
AGAGATCAAGGACTTGAATA+TGG - Chr3:46037005-46037024 None:intergenic 35.0%
AGGTCGTGTAAACTAAAGTT+GGG + Chr3:46033100-46033119 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
ATAAAGCAAACAAGGATGAG+AGG - Chr3:46037071-46037090 None:intergenic 35.0%
ATATGGAATTGTACCTGAGA+AGG - Chr3:46037529-46037548 None:intergenic 35.0%
ATCCCATGTTGATCCAAAAT+GGG - Chr3:46033727-46033746 None:intergenic 35.0%
ATGTGGACAACATTCAAATG+GGG - Chr3:46035921-46035940 None:intergenic 35.0%
ATGTGTGATGTTGTGTTGAA+TGG - Chr3:46036482-46036501 None:intergenic 35.0%
ATTGGCAATCCTAAACTATG+CGG + Chr3:46038254-46038273 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
CAGGTACAATTCCATATAGT+TGG + Chr3:46037532-46037551 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
CCTAAAAAAATGTTGGGACT+TGG - Chr3:46033137-46033156 None:intergenic 35.0%
CTATAAGACTTTGAATAGGC+AGG - Chr3:46035864-46035883 None:intergenic 35.0%
CTTGCACATAACAAACTTTC+CGG + Chr3:46037795-46037814 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
GAACCCAATCCAAATCAAAT+TGG - Chr3:46037194-46037213 None:intergenic 35.0%
GAAGACTTGGAAAAGTGATT+TGG - Chr3:46033496-46033515 None:intergenic 35.0%
GACAAGTTCTTCCAACTATA+TGG - Chr3:46037546-46037565 None:intergenic 35.0%
GACTCATGAACATGATCAAA+AGG - Chr3:46036355-46036374 None:intergenic 35.0%
GAGATCAAGGACTTGAATAT+GGG - Chr3:46037004-46037023 None:intergenic 35.0%
GAGTTGGATTGATCTTCATA+AGG + Chr3:46036582-46036601 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
GATATCCAAACAAGAAGACT+TGG - Chr3:46033509-46033528 None:intergenic 35.0%
GATCACAATAATTTCACAGG+AGG + Chr3:46037453-46037472 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
GCACACCTTACATTATTTGT+AGG + Chr3:46032585-46032604 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
GCCATGAACAATTTAGTGTT+AGG - Chr3:46037425-46037444 None:intergenic 35.0%
GGATCAATTCCAGAAGAAAT+AGG + Chr3:46036970-46036989 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
GGTTTAACATATGTGAGCTT+TGG + Chr3:46033342-46033361 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
GTATGTGGACAACATTCAAA+TGG - Chr3:46035923-46035942 None:intergenic 35.0%
GTCCAATGAACATCAGATAT+TGG - Chr3:46034276-46034295 None:intergenic 35.0%
GTCGTCAATAACACACATTA+CGG + Chr3:46032369-46032388 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
GTGAGATTAAAAAACCCATC+AGG - Chr3:46036763-46036782 None:intergenic 35.0%
GTTTCGGTATAATTTCATCG+TGG + Chr3:46036242-46036261 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
TAAATAATGAGCAGCTTGGT+TGG - Chr3:46034657-46034676 None:intergenic 35.0%
TAACCAAGTGGTTAATGTTC+GGG + Chr3:46035528-46035547 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
TAGCTAAATAATGAGCAGCT+TGG - Chr3:46034661-46034680 None:intergenic 35.0%
TATATAAGATGCTAGGTCCT+TGG - Chr3:46035989-46036008 None:intergenic 35.0%
TATCCCATGTTGATCCAAAA+TGG - Chr3:46033728-46033747 None:intergenic 35.0%
TATGAAGATCAATCCAACTC+AGG - Chr3:46036582-46036601 None:intergenic 35.0%
TATGTCTTCAGCAATCGAAT+TGG - Chr3:46037397-46037416 None:intergenic 35.0%
TCAACTCACTGATCTTTCAT+TGG + Chr3:46037221-46037240 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
TCACCTTTCATATACCTGAT+GGG + Chr3:46036746-46036765 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
TCATTGGCCAATACAAATCA+AGG + Chr3:46037237-46037256 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
TCTGTGGTACAGTTATTAAG+AGG - Chr3:46038284-46038303 None:intergenic 35.0%
TGAAATATCTCAACCTGAGT+TGG + Chr3:46036566-46036585 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
TGCATAATATATGCAAGGTC+CGG + Chr3:46035077-46035096 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
TGCCAATATCTGATGTTCAT+TGG + Chr3:46034271-46034290 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
TTCACCTTTCATATACCTGA+TGG + Chr3:46036745-46036764 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
TTCATGTCAGGGTTTATTAG+AGG + Chr3:46035454-46035473 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
TTCCTCTAAACTAGAGAGTT+TGG - Chr3:46037142-46037161 None:intergenic 35.0%
TTGAAAGGTGAGATGAATCT+TGG + Chr3:46036385-46036404 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
TTTAATGCATCGAGCTACAT+TGG + Chr3:46038236-46038255 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
! AAGTGCCATTGGAATTGTTT+CGG + Chr3:46037991-46038010 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
! AATCCCATTTTGGATCAACA+TGG + Chr3:46033721-46033740 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
! ATCCCATTTTGGATCAACAT+GGG + Chr3:46033722-46033741 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
! ATGACCACTTGTAAGTTTTG+TGG - Chr3:46037702-46037721 None:intergenic 35.0%
! CTTTAAAGGATGATTAGCTC+GGG + Chr3:46035272-46035291 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
! CTTTTCATTACCAGATTCAG+AGG + Chr3:46034421-46034440 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
! CTTTTCCAAGTCTTCTTGTT+TGG + Chr3:46033501-46033520 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
! GAAAGATCAGTGAGTTGAAA+AGG - Chr3:46037219-46037238 None:intergenic 35.0%
! GAGCCTTTTTGATATGACAA+AGG - Chr3:46035689-46035708 None:intergenic 35.0%
! GATTGGAGGCATGAAAAATA+TGG + Chr3:46038076-46038095 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
! GGGTAACTAAGTTTAAAGTC+CGG + Chr3:46035548-46035567 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
! GGTAACTAAGTTTAAAGTCC+GGG + Chr3:46035549-46035568 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
! GTCAAGTTGTAGATACACTT+TGG - Chr3:46037828-46037847 None:intergenic 35.0%
! TCTGTTGGATTGATTTCTAG+TGG - Chr3:46032414-46032433 None:intergenic 35.0%
! TCTTTGTGTCTTTTGAACAG+TGG - Chr3:46034187-46034206 None:intergenic 35.0%
! TGTTACTGATGATGTATTGG+TGG + Chr3:46032768-46032787 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
! TTACACGACCTTTTGTCTTT+CGG - Chr3:46033091-46033110 None:intergenic 35.0%
! TTCATTTTCTCCCAAGTTCA+TGG - Chr3:46037652-46037671 None:intergenic 35.0%
! TTCCAAACTCTCTAGTTTAG+AGG + Chr3:46037137-46037156 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
! TTGTGGCTTATTTGCTAGTT+TGG + Chr3:46033368-46033387 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
! TTTCGAGTATCCAACAAGAA+AGG + Chr3:46037931-46037950 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGGAGTAATAGGTTGTCT+GGG + Chr3:46037586-46037605 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGTTTTGTGGCATCTTGAT+TGG - Chr3:46037690-46037709 None:intergenic 35.0%
!! CAAGGTGTCTCAAATTTTGA+AGG - Chr3:46036855-46036874 None:intergenic 35.0%
!! TAATTTTGACGGAAGAATCC+CGG + Chr3:46038193-46038212 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
!! TATGTGAGCTTTGGAATTTG+TGG + Chr3:46033351-46033370 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
!! TTTCGGTTAGTTGATAGAGT+GGG + Chr3:46038449-46038468 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
!!! CCAAGTCCCAACATTTTTTT+AGG + Chr3:46033134-46033153 MsG0380013813.01.T01:intron 35.0%
!!! GTTGGTTTTCAGAGAGAATA+AGG - Chr3:46036945-46036964 None:intergenic 35.0%
!!! GTTTTTTGGTGAAATTCCTC+AGG + Chr3:46038124-46038143 MsG0380013813.01.T01:CDS 35.0%
!!! TATTTTCTTTTGGTGGTGTC+CGG - Chr3:46035113-46035132 None:intergenic 35.0%
AAACGTAGTTGGGAGATTGT+TGG - Chr3:46034559-46034578 None:intergenic 40.0%
AAATCAACCACATCAGCCAT+CGG - Chr3:46037495-46037514 None:intergenic 40.0%
ACAAGCCGAAACAATTCCAA+TGG - Chr3:46037999-46038018 None:intergenic 40.0%
ACAATACCAAAGACGATTGG+AGG + Chr3:46038062-46038081 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
ACAATTGCAGACCATGAACT+TGG + Chr3:46037638-46037657 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
ACCATCTGATATGGCAGAAA+TGG + Chr3:46032485-46032504 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
AGAATCGGATGCTTCTAATG+TGG + Chr3:46034514-46034533 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
AGAGTCGTTGTATTTAGGCA+TGG + Chr3:46038352-46038371 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
AGGGAAACACATTTCATGTC+AGG + Chr3:46035442-46035461 MsG0380013813.01.T01:intron 40.0%
AGTCTGTGAAAGGTCAAGAT+AGG - Chr3:46036797-46036816 None:intergenic 40.0%
ATCATTGATGCCCTGTTTGA+AGG - Chr3:46036221-46036240 None:intergenic 40.0%
ATCGAGTTCGGGAATTTCAT+TGG + Chr3:46037314-46037333 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
ATTTCTGCCATATCAGATGG+TGG - Chr3:46032486-46032505 None:intergenic 40.0%
CAATAGTTCGCCTTTCTTGT+TGG - Chr3:46037944-46037963 None:intergenic 40.0%
CAATTGCAGACCATGAACTT+GGG + Chr3:46037639-46037658 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
CAGACAACCTATTACTCCAA+AGG - Chr3:46037587-46037606 None:intergenic 40.0%
CATAATATATGCAAGGTCCG+GGG + Chr3:46035079-46035098 MsG0380013813.01.T01:intron 40.0%
CATGGGGATATTTCACAGAA+AGG + Chr3:46032537-46032556 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
CGTCTCACATTTAGTGTGTT+TGG + Chr3:46032839-46032858 MsG0380013813.01.T01:intron 40.0%
CTATGAATACCGCACAGATT+TGG - Chr3:46035660-46035679 None:intergenic 40.0%
CTGGAATTGATCCTTGTAGT+TGG - Chr3:46036963-46036982 None:intergenic 40.0%
GAAAATGGACACAAGTTACC+CGG - Chr3:46035570-46035589 None:intergenic 40.0%
GACACTGTTAACCTTCAAAC+AGG + Chr3:46036207-46036226 MsG0380013813.01.T01:intron 40.0%
GAGAGATTGAATAGTTGTGG+TGG - Chr3:46037756-46037775 None:intergenic 40.0%
GAGTCGTTGTATTTAGGCAT+GGG + Chr3:46038353-46038372 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
GATACACTTTGGCATAGAAC+CGG - Chr3:46037817-46037836 None:intergenic 40.0%
GATGCCACAAAACTTACAAG+TGG + Chr3:46037695-46037714 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
GCATAATATATGCAAGGTCC+GGG + Chr3:46035078-46035097 MsG0380013813.01.T01:intron 40.0%
GGAACAATACCAAAGACGAT+TGG + Chr3:46038059-46038078 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
GGACTTGAATATGGGAAAGT+TGG - Chr3:46036996-46037015 None:intergenic 40.0%
GGATCAGTTCCAGTAGAAAT+AGG + Chr3:46036898-46036917 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
GGATCTATTCCTTCAACTCT+AGG + Chr3:46037042-46037061 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
GGCTGCCTACAAATAATGTA+AGG - Chr3:46032593-46032612 None:intergenic 40.0%
GGGAAACACATTTCATGTCA+GGG + Chr3:46035443-46035462 MsG0380013813.01.T01:intron 40.0%
GGTCGTGTAAACTAAAGTTG+GGG + Chr3:46033101-46033120 MsG0380013813.01.T01:intron 40.0%
GTCAAGATAGGTGAGATCTT+TGG - Chr3:46036785-46036804 None:intergenic 40.0%
GTCGTGTAAACTAAAGTTGG+GGG + Chr3:46033102-46033121 MsG0380013813.01.T01:intron 40.0%
GTTGTGGTGAGAGATAATGA+AGG + Chr3:46034368-46034387 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
TACCAGTAATGTTGTCACAG+TGG - Chr3:46036303-46036322 None:intergenic 40.0%
TACCATTTGAGCTAAGCTCA+CGG - Chr3:46034985-46035004 None:intergenic 40.0%
TCCATTTCTGCCATATCAGA+TGG - Chr3:46032489-46032508 None:intergenic 40.0%
TCCGATAGAGGGTGATAAAT+GGG + Chr3:46034337-46034356 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
TGAAGGTTTAGCAAGCTTGA+AGG - Chr3:46036838-46036857 None:intergenic 40.0%
TGAGCTTAGCTCAAATGGTA+AGG + Chr3:46034985-46035004 MsG0380013813.01.T01:intron 40.0%
TTACCCGAACATTAACCACT+TGG - Chr3:46035534-46035553 None:intergenic 40.0%
TTCTCTCAACGGAAAACATG+AGG + Chr3:46033321-46033340 MsG0380013813.01.T01:intron 40.0%
TTGAATAGGCAGGAAAGACT+TGG - Chr3:46035854-46035873 None:intergenic 40.0%
TTGGAAGAACTTGTCAGAAC+TGG + Chr3:46037551-46037570 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
TTGGAGTAATAGGTTGTCTG+GGG + Chr3:46037587-46037606 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
TTGTATTTAGGCATGGGAGT+GGG + Chr3:46038359-46038378 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
TTGTCTTACAACTCCTTCTC+AGG + Chr3:46037513-46037532 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
TTGTGGCATCTTGATTGGTA+TGG - Chr3:46037685-46037704 None:intergenic 40.0%
! AGATCAGTGAGTTGAAAAGG+AGG - Chr3:46037216-46037235 None:intergenic 40.0%
! CAGGGCATCAATGATAGTTT+CGG + Chr3:46036226-46036245 MsG0380013813.01.T01:intron 40.0%
! CTCTCTGAAAACCAACTACA+AGG + Chr3:46036949-46036968 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
! GAAAGTTGGCCTATTTCTTC+TGG - Chr3:46036982-46037001 None:intergenic 40.0%
! GGCACCAAGTTTAAAACATG+AGG + Chr3:46035808-46035827 MsG0380013813.01.T01:intron 40.0%
! GGCAGCCTTAATTTTATGAG+AGG + Chr3:46032606-46032625 MsG0380013813.01.T01:intron 40.0%
! TACACGACCTTTTGTCTTTC+GGG - Chr3:46033090-46033109 None:intergenic 40.0%
! TATTGGTGGTTCATGTCGAA+CGG + Chr3:46032782-46032801 MsG0380013813.01.T01:intron 40.0%
! TGGTAATGAAAAGACTTGCC+AGG - Chr3:46034414-46034433 None:intergenic 40.0%
! TTGCAGAAGCTTTAGCTATG+CGG + Chr3:46034444-46034463 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
! TTTATGTGGCCTTGGGTAAA+GGG - Chr3:46033239-46033258 None:intergenic 40.0%
!! CGGAAAGTTTGTTATGTGCA+AGG - Chr3:46037797-46037816 None:intergenic 40.0%
!! CTTTCGGTTAGTTGATAGAG+TGG + Chr3:46038448-46038467 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
!! CTTTGGAGTAATAGGTTGTC+TGG + Chr3:46037585-46037604 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
!! GATAATGAAGGTGTTGTCGT+TGG + Chr3:46034380-46034399 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTTGGGCCTTGATTTGTAT+TGG - Chr3:46037247-46037266 None:intergenic 40.0%
!! TAAATGGGGTATTGGTGTTG+TGG + Chr3:46034352-46034371 MsG0380013813.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTTATGTGGCCTTGGGTAA+AGG - Chr3:46033240-46033259 None:intergenic 40.0%
!!! GCAAATGGTTTTGTGGAATG+TGG - Chr3:46036146-46036165 None:intergenic 40.0%
!!! GTTGGTTTTCAGAGAGATCA+AGG - Chr3:46037017-46037036 None:intergenic 40.0%
AAGGCCCAAACTTTCCATCT+TGG + Chr3:46037256-46037275 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
ACATCTCGACGTATCGAGTT+CGG + Chr3:46037302-46037321 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
ACCACAGAAGAAGAAAGTCC+TGG + Chr3:46038296-46038315 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
ACCATTTGAGCTAAGCTCAC+GGG - Chr3:46034984-46035003 None:intergenic 45.0%
ACCTTTGCCCGAAAGACAAA+AGG + Chr3:46033080-46033099 MsG0380013813.01.T01:intron 45.0%
ACTCCCAAACATATCACCGA+TGG + Chr3:46037476-46037495 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
CAACAGATGGGAAGTTGTTC+AGG - Chr3:46036675-46036694 None:intergenic 45.0%
CAATGTGTGATTGCCGCAAA+TGG - Chr3:46036161-46036180 None:intergenic 45.0%
CACTTCTCCAGACAAGCTAT+TGG - Chr3:46037976-46037995 None:intergenic 45.0%
CAGCCATCGGTGATATGTTT+GGG - Chr3:46037482-46037501 None:intergenic 45.0%
CATTTGCGGCAATCACACAT+TGG + Chr3:46036159-46036178 MsG0380013813.01.T01:intron 45.0%
CCCCATTTATCACCCTCTAT+CGG - Chr3:46034341-46034360 None:intergenic 45.0%
CCGATAGAGGGTGATAAATG+GGG + Chr3:46034338-46034357 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
CTGGAACTGATCCCTGTATT+TGG - Chr3:46036891-46036910 None:intergenic 45.0%
GAGAGGTTTCCTAGAGTTGA+AGG - Chr3:46037054-46037073 None:intergenic 45.0%
GAGGGTGATAAATGGGGTAT+TGG + Chr3:46034344-46034363 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
GCCTAAAATCCCTTTACCCA+AGG + Chr3:46033227-46033246 MsG0380013813.01.T01:intron 45.0%
GGATTTGCAGTAGGTTTCTG+GGG + Chr3:46038380-46038399 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
GGGATTTGCAGTAGGTTTCT+GGG + Chr3:46038379-46038398 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
GTCCACTGTGACAACATTAC+TGG + Chr3:46036298-46036317 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
GTCCGATAGAGGGTGATAAA+TGG + Chr3:46034336-46034355 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
GTTGTATTTAGGCATGGGAG+TGG + Chr3:46038358-46038377 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
TCAGCCATCGGTGATATGTT+TGG - Chr3:46037483-46037502 None:intergenic 45.0%
TCCAGGACTTTCTTCTTCTG+TGG - Chr3:46038300-46038319 None:intergenic 45.0%
TCTTCATTCTCTGCATCTCC+AGG - Chr3:46038317-46038336 None:intergenic 45.0%
TGAACGACCACCATCTGATA+TGG + Chr3:46032476-46032495 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
TGGGATTTGCAGTAGGTTTC+TGG + Chr3:46038378-46038397 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
TTCATGCCTCCAATCGTCTT+TGG - Chr3:46038071-46038090 None:intergenic 45.0%
! AATGGAGGCATGTGTGCTTT+CGG + Chr3:46038432-46038451 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
! ACCTTTTGTCTTTCGGGCAA+AGG - Chr3:46033084-46033103 None:intergenic 45.0%
! AGAAGCTTTAGCTATGCGGA+AGG + Chr3:46034448-46034467 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
! CAGACAAGCTATTGGCTGAA+AGG - Chr3:46037968-46037987 None:intergenic 45.0%
! CTTTCAGCCAATAGCTTGTC+TGG + Chr3:46037966-46037985 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
! GAAGCTTTAGCTATGCGGAA+GGG + Chr3:46034449-46034468 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
! GATTTGCAGTAGGTTTCTGG+GGG + Chr3:46038381-46038400 MsG0380013813.01.T01:CDS 45.0%
! GCCTTGGGTAAAGGGATTTT+AGG - Chr3:46033231-46033250 None:intergenic 45.0%
! TTTGAAGCTGTGTTCCAACC+GGG - Chr3:46038214-46038233 None:intergenic 45.0%
!! CAAGAGTGCTAGTACAGTGT+TGG + Chr3:46034221-46034240 MsG0380013813.01.T01:intron 45.0%
!! CTTTGAAGCTGTGTTCCAAC+CGG - Chr3:46038215-46038234 None:intergenic 45.0%
!! GATTGCCGCAAATGGTTTTG+TGG - Chr3:46036153-46036172 None:intergenic 45.0%
!!! GGTTTTGAATATGGGCAAGC+TGG - Chr3:46036924-46036943 None:intergenic 45.0%
!!! AAAAAATTAATGAATTTTAA+TGG + Chr3:46033801-46033820 MsG0380013813.01.T01:intron 5.0%
!!! AATTTAAATTATTTTACATA+TGG - Chr3:46033768-46033787 None:intergenic 5.0%
!!! ATATATAATAAATTTTTTGA+GGG + Chr3:46034141-46034160 MsG0380013813.01.T01:intron 5.0%
!!! TATATATAATAAATTTTTTG+AGG + Chr3:46034140-46034159 MsG0380013813.01.T01:intron 5.0%
ACATTACGGTGACCCTGATG+AGG + Chr3:46032383-46032402 MsG0380013813.01.T01:CDS 50.0%
AGAGGAGCTCCGCATAGTTT+AGG - Chr3:46038266-46038285 None:intergenic 50.0%
ATGGGAGTGGGATTTGCAGT+AGG + Chr3:46038371-46038390 MsG0380013813.01.T01:CDS 50.0%
CATATCACCGATGGCTGATG+TGG + Chr3:46037485-46037504 MsG0380013813.01.T01:CDS 50.0%
CATCTCGACGTATCGAGTTC+GGG + Chr3:46037303-46037322 MsG0380013813.01.T01:CDS 50.0%
CCATTTGAGCTAAGCTCACG+GGG - Chr3:46034983-46035002 None:intergenic 50.0%
GCTTCTGCAACCTCTGAATC+TGG - Chr3:46034434-46034453 None:intergenic 50.0%
TTGGTGGAGACACTAAGTGG+AGG + Chr3:46034240-46034259 MsG0380013813.01.T01:intron 50.0%
TTTGACGGAAGAATCCCGGT+TGG + Chr3:46038197-46038216 MsG0380013813.01.T01:CDS 50.0%
TTTGGAAGCGGACGTTTCCA+CGG + Chr3:46032857-46032876 MsG0380013813.01.T01:intron 50.0%
! CTAGTGGATCGACCTCATCA+GGG - Chr3:46032398-46032417 None:intergenic 50.0%
! GAGTGCTAGTACAGTGTTGG+TGG + Chr3:46034224-46034243 MsG0380013813.01.T01:intron 50.0%
! GTAGGTTTCTGGGGGATTTG+TGG + Chr3:46038389-46038408 MsG0380013813.01.T01:CDS 50.0%
! GTGTTGGTGGAGACACTAAG+TGG + Chr3:46034237-46034256 MsG0380013813.01.T01:intron 50.0%
! TCTAGTGGATCGACCTCATC+AGG - Chr3:46032399-46032418 None:intergenic 50.0%
! TTGTCGTTGGTGCTTGTTCC+TGG + Chr3:46034393-46034412 MsG0380013813.01.T01:CDS 50.0%
!! CTTGTCTGGAGAAGTGCCAT+TGG + Chr3:46037980-46037999 MsG0380013813.01.T01:CDS 50.0%
!! GCAAGCTGGCCTATTTCTAC+TGG - Chr3:46036910-46036929 None:intergenic 50.0%
AAGGTCCGGGGTTCGAATTC+CGG + Chr3:46035091-46035110 MsG0380013813.01.T01:intron 55.0%
ACGGTCCTGACACACAAGGT+AGG + Chr3:46032876-46032895 MsG0380013813.01.T01:intron 55.0%
AGCTCACGGGGACAGTTGTT+CGG - Chr3:46034971-46034990 None:intergenic 55.0%
CCCCGTGAGCTTAGCTCAAA+TGG + Chr3:46034980-46034999 MsG0380013813.01.T01:intron 55.0%
GATGCAGCAGGTCCGATAGA+GGG + Chr3:46034326-46034345 MsG0380013813.01.T01:intron 55.0%
GGTCACCTACCTTGTGTGTC+AGG - Chr3:46032884-46032903 None:intergenic 55.0%
GTTAAGAGCGACATGCCCTG+AGG - Chr3:46038143-46038162 None:intergenic 55.0%
TACCTTGTGTGTCAGGACCG+TGG - Chr3:46032877-46032896 None:intergenic 55.0%
TGATGCAGCAGGTCCGATAG+AGG + Chr3:46034325-46034344 MsG0380013813.01.T01:intron 55.0%
TTCCACGGTCCTGACACACA+AGG + Chr3:46032872-46032891 MsG0380013813.01.T01:intron 55.0%
GGTGTCCGGAATTCGAACCC+CGG - Chr3:46035099-46035118 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 46032297 46038526 46032297 ID=MsG0380013813.01;Name=MsG0380013813.01
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Gene Sequence

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Protein sequence

>MsG0380013813.01.T01

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