AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580026156.01


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MsG0580026156.01.T01 AT5G39020 59.076 303 114 4 302 601 485 780 8.14e-117 367
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MsG0580026156.01.T01 AT1G66980 56.269 327 128 5 289 609 810 1127 7.01e-116 372
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MsG0580026156.01.T01 AT5G24080 42.857 308 162 7 299 601 516 814 1.76e-74 255
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MsG0580026156.01.T01 AT4G00960 37.419 310 175 8 302 601 43 343 8.75e-56 194
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MsG0580026156.01.T01 AT4G23270 37.705 305 179 6 302 601 313 611 1.45e-54 197
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MsG0580026156.01.T01 AT4G05200 36.527 334 196 8 275 600 323 648 6.55e-54 196
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MsG0580026156.01.T01 AT4G03230 40.625 288 162 5 317 601 594 875 3.75e-53 196
MsG0580026156.01.T01 AT4G03230 40.625 288 162 5 317 601 694 975 4.14e-53 196
MsG0580026156.01.T01 AT4G03230 40.625 288 162 5 317 601 694 975 4.14e-53 196
MsG0580026156.01.T01 AT4G23250 35.625 320 192 8 300 611 344 657 7.44e-53 192
MsG0580026156.01.T01 AT4G11490 36.741 313 187 7 294 601 300 606 7.72e-53 192
MsG0580026156.01.T01 AT1G70530 37.097 310 182 8 303 608 311 611 8.74e-53 192
MsG0580026156.01.T01 AT1G16670 38.225 293 171 7 303 590 29 316 1.04e-52 186
MsG0580026156.01.T01 AT1G11303 39.175 291 160 7 314 601 510 786 1.04e-52 194
MsG0580026156.01.T01 AT4G23200 36.182 351 203 13 277 616 298 638 1.05e-52 192
MsG0580026156.01.T01 AT1G61370 36.810 326 186 8 283 601 318 630 1.38e-52 191
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MsG0580026156.01.T01 AT4G23250 35.604 323 194 8 297 611 336 652 2.37e-52 194
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MsG0580026156.01.T01 AT4G23320 36.585 328 190 8 294 617 172 485 2.59e-52 187
MsG0580026156.01.T01 AT4G23320 36.585 328 190 8 294 617 193 506 3.95e-52 187
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MsG0580026156.01.T01 AT5G65240 41.000 300 156 10 302 590 271 560 1.56e-51 188
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MsG0580026156.01.T01 AT4G33430 38.870 301 161 10 302 590 323 612 3.66e-51 187
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MsG0580026156.01.T01 AT1G61490 33.503 394 235 9 223 601 392 773 5.69e-51 189
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MsG0580026156.01.T01 AT1G67520 37.037 324 186 9 303 616 276 591 9.41e-51 186
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MsG0580026156.01.T01 AT1G34210 37.793 299 167 9 302 590 292 581 1.76e-50 185
MsG0580026156.01.T01 AT4G21230 36.308 325 184 10 303 614 321 635 1.77e-50 185
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MsG0580026156.01.T01 AT1G61430 37.209 301 172 8 308 601 459 749 2.37e-49 184
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MsG0580026156.01.T01 AT1G61360 36.928 306 175 8 303 601 405 699 6.86e-49 182
MsG0580026156.01.T01 AT1G07650 35.737 319 185 9 298 609 448 753 6.91e-49 183
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MsG0580026156.01.T01 AT1G07650 36.050 319 184 9 298 609 635 940 1.59e-48 183
MsG0580026156.01.T01 AT4G21410 34.985 323 190 10 304 615 346 659 1.64e-48 180
MsG0580026156.01.T01 AT5G38210 26.615 650 387 28 3 588 1 624 1.88e-48 180
MsG0580026156.01.T01 AT4G11900 36.607 336 192 10 279 605 501 824 1.94e-48 182
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MsG0580026156.01.T01 AT1G11340 38.926 298 171 6 312 605 512 802 2.55e-48 181
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MsG0580026156.01.T01 AT1G61430 44.393 214 110 4 308 518 482 689 9.19e-47 176
MsG0580026156.01.T01 AT1G53440 35.505 307 176 8 298 594 650 944 1.38e-46 177
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MsG0580026156.01.T01 AT2G13800 36.545 301 168 9 302 590 145 434 1.69e-46 171
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MsG0580026156.01.T01 AT5G63710 37.542 301 176 6 302 596 241 535 3.18e-46 172
MsG0580026156.01.T01 AT1G51830 35.192 287 174 5 302 585 382 659 3.25e-46 174
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MsG0580026156.01.T01 AT2G13800 36.545 301 168 9 302 590 262 551 3.95e-46 172
MsG0580026156.01.T01 AT1G01540 34.797 296 175 8 303 590 142 427 4.99e-46 169
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MsG0580026156.01.T01 AT1G09440 35.354 297 170 9 303 589 145 429 6.07e-46 169
MsG0580026156.01.T01 AT4G13190 32.317 328 197 8 298 618 54 363 6.53e-46 167
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MsG0580026156.01.T01 AT1G51890 38.047 297 169 7 302 594 559 844 1.14e-45 174
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MsG0580026156.01.T01 AT3G59110 34.564 298 171 8 303 589 178 462 1.80e-45 169
MsG0580026156.01.T01 AT2G04300 33.133 332 177 9 275 585 541 848 2.00e-45 173
MsG0580026156.01.T01 AT3G45410 34.535 333 186 12 286 608 316 626 2.29e-45 171
MsG0580026156.01.T01 AT5G16900 37.586 290 171 7 302 589 376 657 2.31e-45 171
MsG0580026156.01.T01 AT4G34440 36.503 326 183 10 303 616 300 613 2.96e-45 171
MsG0580026156.01.T01 AT4G34440 36.503 326 183 10 303 616 300 613 2.96e-45 171
MsG0580026156.01.T01 AT1G70460 35.197 304 179 8 303 597 341 635 3.00e-45 171
MsG0580026156.01.T01 AT4G01330 34.122 296 177 8 303 590 150 435 3.22e-45 167
MsG0580026156.01.T01 AT3G17420 34.932 292 178 7 303 589 142 426 3.48e-45 167
MsG0580026156.01.T01 AT5G63940 32.797 311 199 5 303 609 350 654 3.65e-45 171
MsG0580026156.01.T01 AT1G48210 32.353 340 209 7 279 610 36 362 4.04e-45 164
MsG0580026156.01.T01 AT1G48210 32.353 340 209 7 279 610 36 362 4.04e-45 164
MsG0580026156.01.T01 AT1G48210 32.353 340 209 7 279 610 36 362 4.04e-45 164
MsG0580026156.01.T01 AT1G48210 32.353 340 209 7 279 610 36 362 4.04e-45 164
MsG0580026156.01.T01 AT5G65600 34.462 325 181 11 293 600 331 640 4.28e-45 171
MsG0580026156.01.T01 AT4G21390 43.925 214 111 4 312 522 526 733 4.30e-45 171
MsG0580026156.01.T01 AT2G18890 34.797 296 173 9 303 590 56 339 4.54e-45 165
MsG0580026156.01.T01 AT4G29450 33.333 312 183 8 297 592 550 852 6.79e-45 171
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MsG0580026156.01.T01 AT1G61430 43.779 217 110 5 308 518 482 692 6.96e-45 171
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MsG0580026156.01.T01 AT2G42960 34.564 298 171 8 303 589 171 455 2.89e-44 165
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MsG0580026156.01.T01 AT1G68690 36.545 301 170 9 299 589 361 650 2.11e-43 166
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MsG0580026156.01.T01 AT2G18470 35.333 300 177 8 303 594 272 562 3.39e-43 164
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MsG0580026156.01.T01 AT5G59260 34.161 322 185 13 286 597 329 633 9.23e-43 164
MsG0580026156.01.T01 AT1G26150 39.076 238 133 6 303 537 418 646 9.61e-43 163
MsG0580026156.01.T01 AT1G01540 40.724 221 116 6 303 517 142 353 1.13e-42 158
MsG0580026156.01.T01 AT1G11340 44.076 211 109 4 312 519 580 784 1.18e-42 164
MsG0580026156.01.T01 AT4G02420 32.362 309 185 10 302 599 337 632 1.26e-42 163
MsG0580026156.01.T01 AT1G68690 36.824 296 166 9 299 584 361 645 1.79e-42 163
MsG0580026156.01.T01 AT5G13160 35.333 300 181 7 296 588 67 360 2.03e-42 159
MsG0580026156.01.T01 AT5G37450 34.062 320 174 11 299 602 412 710 2.19e-42 163
MsG0580026156.01.T01 AT1G61590 34.983 303 169 9 303 589 87 377 2.76e-42 158
MsG0580026156.01.T01 AT1G34110 34.138 290 159 9 316 588 775 1049 3.05e-42 164
MsG0580026156.01.T01 AT2G43700 32.036 334 194 10 274 594 298 611 3.09e-42 162
MsG0580026156.01.T01 AT5G15730 34.130 293 165 9 302 588 103 373 3.15e-42 158
MsG0580026156.01.T01 AT1G77280 34.000 300 186 6 303 596 392 685 3.20e-42 163
MsG0580026156.01.T01 AT1G77280 34.000 300 186 6 303 596 392 685 3.20e-42 163
MsG0580026156.01.T01 AT3G04690 34.000 300 185 6 302 596 504 795 3.27e-42 163
MsG0580026156.01.T01 AT5G01550 32.530 332 199 12 275 597 343 658 3.36e-42 162
MsG0580026156.01.T01 AT2G43700 32.036 334 194 10 274 594 274 587 3.62e-42 161
MsG0580026156.01.T01 AT2G43700 32.036 334 194 10 274 594 274 587 3.62e-42 161
MsG0580026156.01.T01 AT2G43700 32.036 334 194 10 274 594 274 587 3.62e-42 161
MsG0580026156.01.T01 AT2G43700 32.036 334 194 10 274 594 274 587 3.62e-42 161
MsG0580026156.01.T01 AT3G19300 34.416 308 171 10 302 597 315 603 3.71e-42 162
MsG0580026156.01.T01 AT2G47060 33.046 348 208 8 266 599 24 360 3.77e-42 156
MsG0580026156.01.T01 AT2G47060 33.046 348 208 8 266 599 24 360 3.77e-42 156
MsG0580026156.01.T01 AT1G34110 34.138 290 159 9 316 588 775 1049 4.02e-42 164
MsG0580026156.01.T01 AT1G25390 27.409 602 350 27 18 590 23 566 4.16e-42 161
MsG0580026156.01.T01 AT1G25390 27.409 602 350 27 18 590 23 566 4.16e-42 161
MsG0580026156.01.T01 AT1G74360 35.197 304 169 9 298 588 797 1085 4.21e-42 164
MsG0580026156.01.T01 AT5G37450 34.062 320 174 11 299 602 615 913 4.64e-42 163
MsG0580026156.01.T01 AT5G37450 34.062 320 174 11 299 602 591 889 4.88e-42 163
MsG0580026156.01.T01 AT2G19230 37.662 308 165 10 296 592 552 843 4.92e-42 163
MsG0580026156.01.T01 AT5G59270 32.923 325 195 12 275 591 312 621 4.92e-42 162
MsG0580026156.01.T01 AT5G59270 32.923 325 195 12 275 591 315 624 4.96e-42 162
MsG0580026156.01.T01 AT1G55200 35.099 302 179 10 303 597 367 658 5.13e-42 162
MsG0580026156.01.T01 AT1G55200 35.099 302 179 10 303 597 367 658 5.13e-42 162
MsG0580026156.01.T01 AT1G55200 35.099 302 179 10 303 597 367 658 5.13e-42 162
MsG0580026156.01.T01 AT1G55200 35.099 302 179 10 303 597 367 658 5.13e-42 162
MsG0580026156.01.T01 AT5G37450 34.062 320 174 11 299 602 639 937 5.27e-42 163
MsG0580026156.01.T01 AT2G19230 37.662 308 165 10 296 592 551 842 5.29e-42 163
MsG0580026156.01.T01 AT3G18810 35.410 305 176 8 303 597 325 618 5.41e-42 162
MsG0580026156.01.T01 AT5G59270 32.628 331 200 12 275 597 331 646 5.62e-42 162
MsG0580026156.01.T01 AT3G19700 33.779 299 165 8 316 589 674 964 5.78e-42 163
MsG0580026156.01.T01 AT5G59670 33.447 293 183 5 300 589 551 834 5.81e-42 163
MsG0580026156.01.T01 AT5G59670 33.447 293 183 5 300 589 551 834 5.81e-42 163
MsG0580026156.01.T01 AT1G51870 36.304 303 157 9 302 589 520 801 6.94e-42 162
MsG0580026156.01.T01 AT1G51870 36.304 303 157 9 302 589 572 853 7.53e-42 162
MsG0580026156.01.T01 AT5G01560 32.229 332 199 13 275 597 327 641 7.58e-42 161
MsG0580026156.01.T01 AT5G15730 33.788 293 168 9 302 588 103 375 7.76e-42 157
MsG0580026156.01.T01 AT5G15730 33.788 293 168 9 302 588 103 375 7.76e-42 157
MsG0580026156.01.T01 AT4G04960 33.123 317 183 12 287 590 322 622 7.85e-42 161
MsG0580026156.01.T01 AT1G66880 26.457 635 374 27 23 590 254 862 8.72e-42 162
MsG0580026156.01.T01 AT4G39400 32.770 296 182 10 302 589 870 1156 1.03e-41 162
MsG0580026156.01.T01 AT3G05140 32.353 306 188 8 299 598 127 419 1.10e-41 157
MsG0580026156.01.T01 AT5G02800 33.784 296 183 8 300 588 58 347 1.21e-41 155
MsG0580026156.01.T01 AT1G66880 26.224 633 378 24 23 590 633 1241 1.21e-41 162
MsG0580026156.01.T01 AT2G23450 30.700 443 255 16 202 616 231 649 1.22e-41 161
MsG0580026156.01.T01 AT2G23450 30.700 443 255 16 202 616 231 649 1.22e-41 161
MsG0580026156.01.T01 AT4G00960 35.769 260 147 6 348 601 4 249 1.58e-41 152
MsG0580026156.01.T01 AT1G15530 34.727 311 161 10 302 593 348 635 1.73e-41 160
MsG0580026156.01.T01 AT3G05140 32.353 306 188 8 299 598 175 467 2.03e-41 157
MsG0580026156.01.T01 AT3G08870 32.566 304 184 9 302 597 376 666 2.07e-41 160
MsG0580026156.01.T01 AT3G46330 33.439 314 194 7 275 585 508 809 2.11e-41 161
MsG0580026156.01.T01 AT3G46330 33.439 314 194 7 275 585 532 833 2.15e-41 161
MsG0580026156.01.T01 AT3G08870 32.566 304 184 9 302 597 355 645 2.44e-41 160
MsG0580026156.01.T01 AT2G30740 33.436 326 200 8 279 593 35 354 2.45e-41 154
MsG0580026156.01.T01 AT2G30740 33.436 326 200 8 279 593 35 354 2.45e-41 154
MsG0580026156.01.T01 AT2G30740 33.436 326 200 8 279 593 35 354 2.45e-41 154
MsG0580026156.01.T01 AT2G30740 33.436 326 200 8 279 593 35 354 2.45e-41 154
MsG0580026156.01.T01 AT2G30740 33.436 326 200 8 279 593 35 354 2.45e-41 154

Find 126 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 188 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GCTCCACAAGCTTCAAATTT+TGG 0.088187 5:-31469325 None:intergenic
GAAAGTATTGTATCCATATT+TGG 0.195964 5:+31471342 MsG0580026156.01.T01:CDS
GATACAATACTTTCCTTTCT+TGG 0.202870 5:-31471333 None:intergenic
TGTGTTCCTTTGCAGTTCTC+TGG 0.236997 5:-31469677 None:intergenic
ATTCAGTATTAGAAAGATTA+AGG 0.241520 5:-31469465 None:intergenic
TATTGTGGCTACCCTGGTTT+TGG 0.244678 5:+31469409 MsG0580026156.01.T01:CDS
TTGTTTGGATGGTTCTAAAA+AGG 0.248473 5:+31471056 MsG0580026156.01.T01:CDS
CGTTCCCCTTGCGCCAAATA+TGG 0.253094 5:-31471355 None:intergenic
TGACACCCCACCAAAATTTC+TGG 0.264843 5:-31471406 None:intergenic
TAATGGGAAAAGTGAGGTTT+TGG 0.267345 5:-31469585 None:intergenic
GAGTTGTTCTCCAGAAATTT+TGG 0.267647 5:+31471396 MsG0580026156.01.T01:CDS
ACTTTGATTCCCACATGTTT+TGG 0.283449 5:-31469347 None:intergenic
ATCACTTGTAACAATACTAT+TGG 0.303679 5:+31469433 MsG0580026156.01.T01:CDS
AAATGACAGTGGTGAGTTTA+TGG 0.304569 5:+31471619 MsG0580026156.01.T01:CDS
AAATTAGGTCAGGGAGGATA+TGG 0.316408 5:+31470886 MsG0580026156.01.T01:CDS
TGTCAATGTAGTCAGACTTT+TGG 0.319306 5:+31471029 MsG0580026156.01.T01:CDS
CAAGCGTATTGAATTGAATC+AGG 0.327821 5:+31471545 MsG0580026156.01.T01:CDS
TGCAAGATTGAACATGTTAA+TGG 0.335242 5:-31469602 None:intergenic
AAATCAGATGTTTATAGTTA+TGG 0.337910 5:+31471432 MsG0580026156.01.T01:CDS
TCCACCACTTTATGCATTGC+CGG 0.340665 5:-31471669 None:intergenic
ATTTCAGATGATAGATCATT+AGG 0.341448 5:-31471762 None:intergenic
GAAATGGGTTTAGGTTGAAT+TGG 0.349490 5:+31469851 MsG0580026156.01.T01:CDS
GGAAGGGAGCCTTCAATTGC+TGG 0.354771 5:+31471698 MsG0580026156.01.T01:CDS
AGTCACTGAGAAATGGGTTT+AGG 0.362223 5:+31469842 MsG0580026156.01.T01:CDS
TTCTCAATAATTTGATGTGT+TGG 0.362398 5:-31470781 None:intergenic
CGACCTTAATGTTCTTTCTT+CGG 0.368154 5:-31471479 None:intergenic
ATATATGAATTCATGCCTAA+TGG 0.383973 5:+31471084 MsG0580026156.01.T01:CDS
ACAGGTTTGTCTCTCTCTCT+TGG 0.384414 5:+31469988 MsG0580026156.01.T01:CDS
AGAACAGTCTCACATTAGTT+TGG 0.387064 5:-31469630 None:intergenic
AAAACCAGGGTAGCCACAAT+AGG 0.388718 5:-31469407 None:intergenic
ATTGAATTGAATCAGGATCT+TGG 0.392551 5:+31471552 MsG0580026156.01.T01:CDS
TGTATTCCTTTGATATAGAA+AGG 0.398708 5:-31469379 None:intergenic
GCTTGGTGTCAAAGAATTGC+AGG 0.405071 5:+31469767 MsG0580026156.01.T01:CDS
TTGTCACTATACGCATCGTC+TGG 0.419645 5:-31470297 None:intergenic
ATTGAAGAGTCACTGAGAAA+TGG 0.420676 5:+31469835 MsG0580026156.01.T01:CDS
CATTGGAAACTCTAAATGAA+TGG 0.434239 5:-31469516 None:intergenic
TGGCCGAAGAAAGAACATTA+AGG 0.435484 5:+31471476 MsG0580026156.01.T01:CDS
ATTGAAGGATGATCGTCAAT+TGG 0.436249 5:+31471143 MsG0580026156.01.T01:CDS
TGCAGAAAATGAAACGAGTT+CGG 0.442425 5:+31469711 MsG0580026156.01.T01:CDS
TTGAAGAGTCACTGAGAAAT+GGG 0.452587 5:+31469836 MsG0580026156.01.T01:CDS
TGTTTATAGTTATGGAATGA+TGG 0.453019 5:+31471440 MsG0580026156.01.T01:CDS
GACCCAAAATTTGAAGCTTG+TGG 0.454596 5:+31469322 MsG0580026156.01.T01:CDS
TCATGAAGTAATATATTATG+AGG 0.462414 5:-31471264 None:intergenic
TGCATTGCCGGTCGATGCGA+AGG 0.468129 5:-31471657 None:intergenic
AGTTCGGTTGTGGCATTGTA+TGG 0.468473 5:+31469727 MsG0580026156.01.T01:CDS
AATTATTGAGAAGTTTCTAA+AGG 0.470910 5:+31470792 MsG0580026156.01.T01:CDS
GTGTTCCTTTGCAGTTCTCT+GGG 0.471855 5:-31469676 None:intergenic
TGAAGAGAAAAGTCCATTGA+AGG 0.475537 5:+31471128 MsG0580026156.01.T01:CDS
ACGATGCGTATAGTGACAAT+AGG 0.477507 5:+31470301 MsG0580026156.01.T01:CDS
GTGGTATTTCCAGCAATTGA+AGG 0.485846 5:-31471707 None:intergenic
TGATCTTGAAAACACACCAT+TGG 0.487472 5:-31469533 None:intergenic
GCATAAAGTGGTGGAAATGC+TGG 0.488915 5:+31471677 MsG0580026156.01.T01:CDS
AATTGACGATCATCCTTCAA+TGG 0.495461 5:-31471141 None:intergenic
CATACTGCAAAATGTGGTAC+AGG 0.495557 5:+31469970 MsG0580026156.01.T01:CDS
AAATGAAATTGATGAAGAAA+CGG 0.497215 5:+31471590 MsG0580026156.01.T01:CDS
AAATGAAACGAGTTCGGTTG+TGG 0.502118 5:+31469717 MsG0580026156.01.T01:CDS
TTCTAAAATATGTCCAAGAA+AGG 0.502715 5:+31471320 MsG0580026156.01.T01:CDS
GCAAGATTGAACATGTTAAT+GGG 0.504160 5:-31469601 None:intergenic
GAACTGCAAAGGAACACAAT+TGG 0.507949 5:+31469682 MsG0580026156.01.T01:CDS
AACAGACCCTTCGCATCGAC+CGG 0.510529 5:+31471650 MsG0580026156.01.T01:CDS
GAAGTTAGATGATGAACGTA+TGG 0.510607 5:+31470924 MsG0580026156.01.T01:CDS
AGTTGGCGTTGCTCGTGGAT+TGG 0.512014 5:+31471191 MsG0580026156.01.T01:CDS
GTCAAAGAATTGCAGGGAAG+AGG 0.513590 5:+31469774 MsG0580026156.01.T01:CDS
CACTTGCAGTTGCAGACGCA+AGG 0.514489 5:+31470269 MsG0580026156.01.T01:intron
TATAGAGCATAGAGTGGTTG+TGG 0.515345 5:-31469299 None:intergenic
AAACCAGGGTAGCCACAATA+GGG 0.516633 5:-31469406 None:intergenic
ACATTGTATGATATTGCAGT+TGG 0.517562 5:+31471174 MsG0580026156.01.T01:CDS
GTATTAGAAAGATTAAGGAT+TGG 0.518777 5:-31469460 None:intergenic
AAATTTCTGGAGAACAACTC+TGG 0.518840 5:-31471393 None:intergenic
AACTCTGGAGCAATATATCC+TGG 0.523049 5:-31471378 None:intergenic
TGCAATGACTGTAACAGTAC+TGG 0.530517 5:+31469886 MsG0580026156.01.T01:CDS
AGCTACCCTTTCTATATCAA+AGG 0.534564 5:+31469373 MsG0580026156.01.T01:CDS
TGGTGAAAGACAACCTTTGT+TGG 0.538090 5:-31469560 None:intergenic
ACTAATGTGAGACTGTTCTT+CGG 0.538279 5:+31469634 MsG0580026156.01.T01:CDS
TGAATCAGGATCTTGGACTC+AGG 0.539222 5:+31471559 MsG0580026156.01.T01:CDS
TTTGGCGCAAGGGGAACGCC+AGG 0.546882 5:+31471360 MsG0580026156.01.T01:CDS
TTGTATCCATATTTGGCGCA+AGG 0.549354 5:+31471349 MsG0580026156.01.T01:CDS
TTAAGTGAATCTAAAGGCAA+TGG 0.550121 5:+31470961 MsG0580026156.01.T01:CDS
GAACCCTATTGTGGCTACCC+TGG 0.551186 5:+31469403 MsG0580026156.01.T01:CDS
GTATTCCTTTGATATAGAAA+GGG 0.552832 5:-31469378 None:intergenic
TGGAGAGTATTGTGAAAGGA+GGG 0.554468 5:+31469812 MsG0580026156.01.T01:CDS
TTGTACCTAGCAGCTGAAAG+AGG 0.557305 5:-31470823 None:intergenic
ATTGCAGTTGGCGTTGCTCG+TGG 0.557402 5:+31471186 MsG0580026156.01.T01:CDS
TCATAATATATTACTTCATG+AGG 0.561045 5:+31471266 MsG0580026156.01.T01:CDS
TCAAGATCAAACACCAACAA+AGG 0.561226 5:+31469547 MsG0580026156.01.T01:CDS
TTACAAGTGATGCCAAAACC+AGG 0.570125 5:-31469421 None:intergenic
GTGGAGAGTATTGTGAAAGG+AGG 0.571736 5:+31469811 MsG0580026156.01.T01:CDS
TCTCTCTCTTGGAAAATGCA+CGG 0.577166 5:+31469999 MsG0580026156.01.T01:CDS
GATATGGAAGTGTATACAGA+GGG 0.577710 5:+31470902 MsG0580026156.01.T01:CDS
TGTATCCATATTTGGCGCAA+GGG 0.580373 5:+31471350 MsG0580026156.01.T01:CDS
TGAACGTATGGTTGCAGTGA+AGG 0.581153 5:+31470936 MsG0580026156.01.T01:CDS
ACATGTTAATGGGAAAAGTG+AGG 0.582384 5:-31469591 None:intergenic
AGATCATTAGGTGATATTGA+AGG 0.591613 5:-31471750 None:intergenic
GGAATACAAGAACCCTATTG+TGG 0.594222 5:+31469394 MsG0580026156.01.T01:CDS
AACAGTACTGGAGGAAGGTG+TGG 0.599511 5:+31469898 MsG0580026156.01.T01:CDS
GAGAAGTTTCTAAAGGAACA+TGG 0.607969 5:+31470799 MsG0580026156.01.T01:CDS
AGAGGTTGTGATTGCAACGG+TGG 0.608353 5:+31469792 MsG0580026156.01.T01:CDS
TCGACCGGCAATGCATAAAG+TGG 0.609805 5:+31471665 MsG0580026156.01.T01:CDS
CATTCATTTAGAGTTTCCAA+TGG 0.610699 5:+31469517 MsG0580026156.01.T01:CDS
ATGGACCTCTTTCAGCTGCT+AGG 0.616286 5:+31470818 MsG0580026156.01.T01:CDS
TGATGATAAGAATGCAAGCT+TGG 0.618863 5:+31469750 MsG0580026156.01.T01:CDS
GTATCCATATTTGGCGCAAG+GGG 0.620873 5:+31471351 MsG0580026156.01.T01:CDS
GCTTGTGGAGCCAAAACATG+TGG 0.621075 5:+31469337 MsG0580026156.01.T01:CDS
TGTCACTATACGCATCGTCT+GGG 0.622198 5:-31470296 None:intergenic
GGATATGGAAGTGTATACAG+AGG 0.628532 5:+31470901 MsG0580026156.01.T01:CDS
ACCGGCAATGCATAAAGTGG+TGG 0.630050 5:+31471668 MsG0580026156.01.T01:CDS
AAAGTGGTGGAAATGCTGGA+AGG 0.630206 5:+31471681 MsG0580026156.01.T01:CDS
AAGTGGTGGAAATGCTGGAA+GGG 0.630371 5:+31471682 MsG0580026156.01.T01:CDS
AGCTACCCAGAGAACTGCAA+AGG 0.632448 5:+31469671 MsG0580026156.01.T01:CDS
GCATTGCCGGTCGATGCGAA+GGG 0.639468 5:-31471656 None:intergenic
CTTGGTGTCAAAGAATTGCA+GGG 0.641469 5:+31469768 MsG0580026156.01.T01:CDS
TGGGTCTATAGAGCATAGAG+TGG 0.646204 5:-31469305 None:intergenic
AGAGTTCATACTGCAAAATG+TGG 0.655526 5:+31469964 MsG0580026156.01.T01:CDS
TTCCTGAACAAAAGAAACGT+GGG 0.660473 5:-31470751 None:intergenic
ACTGTAACAGTACTGGAGGA+AGG 0.660895 5:+31469893 MsG0580026156.01.T01:CDS
ACGGTGGAGAGTATTGTGAA+AGG 0.663036 5:+31469808 MsG0580026156.01.T01:CDS
CTGAACAAAAGAAACGTGGG+AGG 0.663976 5:-31470748 None:intergenic
CTTGTGGAGCCAAAACATGT+GGG 0.664171 5:+31469338 MsG0580026156.01.T01:CDS
GGAAGAGGTTGTGATTGCAA+CGG 0.666587 5:+31469789 MsG0580026156.01.T01:CDS
TTTCCTGAACAAAAGAAACG+TGG 0.678638 5:-31470752 None:intergenic
TGAACAAAAGAAACGTGGGA+GGG 0.680571 5:-31470747 None:intergenic
AATGACTGTAACAGTACTGG+AGG 0.682642 5:+31469889 MsG0580026156.01.T01:CDS
TACAAGTGATGCCAAAACCA+GGG 0.692150 5:-31469420 None:intergenic
TAATACTGAATACATAATCG+AGG 0.692646 5:+31469477 MsG0580026156.01.T01:CDS
ATACGCTTGTAAATCCAATG+TGG 0.701007 5:-31471531 None:intergenic
GGATTGGAGTACTTGCACAG+AGG 0.709024 5:+31471207 MsG0580026156.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATCAAATTTAATCTATAAAA+TGG - Chr5:31470447-31470466 None:intergenic 10.0%
!! TCAAATTTAATCTATAAAAT+GGG - Chr5:31470446-31470465 None:intergenic 10.0%
!! TCAATTCAAATCATATTTAT+AGG - Chr5:31470591-31470610 None:intergenic 15.0%
!! AAATCAGATGTTTATAGTTA+TGG + Chr5:31471432-31471451 MsG0580026156.01.T01:CDS 20.0%
!! AAATGAAATTGATGAAGAAA+CGG + Chr5:31471590-31471609 MsG0580026156.01.T01:CDS 20.0%
!! AACTCTTTCAAAAACAAATT+AGG + Chr5:31470871-31470890 MsG0580026156.01.T01:CDS 20.0%
!! AATAATTCATTAGTTCAGTT+TGG - Chr5:31470189-31470208 None:intergenic 20.0%
!! AATTATTGAGAAGTTTCTAA+AGG + Chr5:31470792-31470811 MsG0580026156.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAGAACATGAAAATGTTTA+GGG - Chr5:31470640-31470659 None:intergenic 20.0%
!! ATTCAGTATTAGAAAGATTA+AGG - Chr5:31469468-31469487 None:intergenic 20.0%
!! TCATAATATATTACTTCATG+AGG + Chr5:31471266-31471285 MsG0580026156.01.T01:CDS 20.0%
!! TCATGAAGTAATATATTATG+AGG - Chr5:31471267-31471286 None:intergenic 20.0%
!! TTAATCTATAAAATGGGATT+AGG - Chr5:31470440-31470459 None:intergenic 20.0%
! ATATATGAATTCATGCCTAA+TGG + Chr5:31471084-31471103 MsG0580026156.01.T01:CDS 25.0%
! ATCACTTGTAACAATACTAT+TGG + Chr5:31469433-31469452 MsG0580026156.01.T01:CDS 25.0%
! ATTTATATTCGAGAGCTTAA+CGG - Chr5:31470106-31470125 None:intergenic 25.0%
! ATTTCAGATGATAGATCATT+AGG - Chr5:31471765-31471784 None:intergenic 25.0%
! CTCTCGAATATAAATGATTT+GGG + Chr5:31470111-31470130 MsG0580026156.01.T01:intron 25.0%
! GATAGAACATGAAAATGTTT+AGG - Chr5:31470641-31470660 None:intergenic 25.0%
! GTATTAGAAAGATTAAGGAT+TGG - Chr5:31469463-31469482 None:intergenic 25.0%
! GTATTCCTTTGATATAGAAA+GGG - Chr5:31469381-31469400 None:intergenic 25.0%
! TAATACTGAATACATAATCG+AGG + Chr5:31469477-31469496 MsG0580026156.01.T01:CDS 25.0%
! TGTATTCCTTTGATATAGAA+AGG - Chr5:31469382-31469401 None:intergenic 25.0%
! TGTGGTAAGAAGATAAAAAA+GGG - Chr5:31469284-31469303 None:intergenic 25.0%
! TGTTTATAGTTATGGAATGA+TGG + Chr5:31471440-31471459 MsG0580026156.01.T01:CDS 25.0%
! TTCAAAAACAAATTAGGTCA+GGG + Chr5:31470877-31470896 MsG0580026156.01.T01:CDS 25.0%
! TTCAACAAAAAAAAACACCT+AGG + Chr5:31470209-31470228 MsG0580026156.01.T01:intron 25.0%
! TTCTCAATAATTTGATGTGT+TGG - Chr5:31470784-31470803 None:intergenic 25.0%
! TTGTGGTAAGAAGATAAAAA+AGG - Chr5:31469285-31469304 None:intergenic 25.0%
! TTTCAAAAACAAATTAGGTC+AGG + Chr5:31470876-31470895 MsG0580026156.01.T01:CDS 25.0%
!! AAAAATGTTGAGTTGTACTA+AGG + Chr5:31470350-31470369 MsG0580026156.01.T01:intron 25.0%
!!! AAGGTTTTAAGTGAATCTAA+AGG + Chr5:31470955-31470974 MsG0580026156.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGGTAAATGTTTTAGATTTG+TGG + Chr5:31470321-31470340 MsG0580026156.01.T01:intron 25.0%
!!! AGTCCAAAATCTGAAATTTT+TGG - Chr5:31471300-31471319 None:intergenic 25.0%
!!! GAAAGTATTGTATCCATATT+TGG + Chr5:31471342-31471361 MsG0580026156.01.T01:CDS 25.0%
!!! GTCCAAAATCTGAAATTTTT+GGG - Chr5:31471299-31471318 None:intergenic 25.0%
!!! TTCTAAAATATGTCCAAGAA+AGG + Chr5:31471320-31471339 MsG0580026156.01.T01:CDS 25.0%
ACATTGTATGATATTGCAGT+TGG + Chr5:31471174-31471193 MsG0580026156.01.T01:CDS 30.0%
ACTAGACTAAATGTTTGCTT+TGG - Chr5:31470507-31470526 None:intergenic 30.0%
AGATCATTAGGTGATATTGA+AGG - Chr5:31471753-31471772 None:intergenic 30.0%
ATCAAACAAAAATGTCCAGT+GGG + Chr5:31470658-31470677 MsG0580026156.01.T01:intron 30.0%
ATCAAAGAGATAACCTTTAG+TGG + Chr5:31470529-31470548 MsG0580026156.01.T01:intron 30.0%
ATTGAAGGAGAAGACAAAAA+TGG - Chr5:31471738-31471757 None:intergenic 30.0%
ATTGAATTGAATCAGGATCT+TGG + Chr5:31471552-31471571 MsG0580026156.01.T01:CDS 30.0%
ATTTGGGCACAATTTCAAAT+TGG + Chr5:31470127-31470146 MsG0580026156.01.T01:intron 30.0%
CATTGGAAACTCTAAATGAA+TGG - Chr5:31469519-31469538 None:intergenic 30.0%
GATACAATACTTTCCTTTCT+TGG - Chr5:31471336-31471355 None:intergenic 30.0%
GCAAGATTGAACATGTTAAT+GGG - Chr5:31469604-31469623 None:intergenic 30.0%
GCTCTCGAATATAAATGATT+TGG + Chr5:31470110-31470129 MsG0580026156.01.T01:intron 30.0%
TATCAAACAAAAATGTCCAG+TGG + Chr5:31470657-31470676 MsG0580026156.01.T01:intron 30.0%
TCAAAGAGATAACCTTTAGT+GGG + Chr5:31470530-31470549 MsG0580026156.01.T01:intron 30.0%
TGCAAGATTGAACATGTTAA+TGG - Chr5:31469605-31469624 None:intergenic 30.0%
TTAAGTGAATCTAAAGGCAA+TGG + Chr5:31470961-31470980 MsG0580026156.01.T01:CDS 30.0%
! CATTCATTTAGAGTTTCCAA+TGG + Chr5:31469517-31469536 MsG0580026156.01.T01:CDS 30.0%
! GTGAGTTATATTTTCCACAT+TGG + Chr5:31471517-31471536 MsG0580026156.01.T01:CDS 30.0%
! TGCCCAAAAATTTCAGATTT+TGG + Chr5:31471294-31471313 MsG0580026156.01.T01:CDS 30.0%
!! AACTTTTCAAGAGATCCATT+AGG - Chr5:31471102-31471121 None:intergenic 30.0%
!! TTGTCTTAGTTTGTTGGTTT+AGG + Chr5:31470713-31470732 MsG0580026156.01.T01:intron 30.0%
!! TTGTTTGGATGGTTCTAAAA+AGG + Chr5:31471056-31471075 MsG0580026156.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATGATGGTTTTAGAAATGGT+TGG + Chr5:31471456-31471475 MsG0580026156.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGGAATGATGGTTTTAGAAA+TGG + Chr5:31471452-31471471 MsG0580026156.01.T01:CDS 30.0%
AAAAACAAATTAGGTCAGGG+AGG + Chr5:31470880-31470899 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
AAATGACAGTGGTGAGTTTA+TGG + Chr5:31471619-31471638 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
AACGGTAAGAAAAATGACAG+TGG + Chr5:31471608-31471627 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
AATTGACGATCATCCTTCAA+TGG - Chr5:31471144-31471163 None:intergenic 35.0%
ACATGTTAATGGGAAAAGTG+AGG - Chr5:31469594-31469613 None:intergenic 35.0%
ACTAATGTGAGACTGTTCTT+CGG + Chr5:31469634-31469653 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
AGAACAGTCTCACATTAGTT+TGG - Chr5:31469633-31469652 None:intergenic 35.0%
AGAGTTCATACTGCAAAATG+TGG + Chr5:31469964-31469983 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
AGATAACCTTTAGTGGGATA+AGG + Chr5:31470536-31470555 MsG0580026156.01.T01:intron 35.0%
AGCTACCCTTTCTATATCAA+AGG + Chr5:31469373-31469392 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
AGGAGAAGACAAAAATGGTT+TGG - Chr5:31471733-31471752 None:intergenic 35.0%
ATACGCTTGTAAATCCAATG+TGG - Chr5:31471534-31471553 None:intergenic 35.0%
ATTGAAGAGTCACTGAGAAA+TGG + Chr5:31469835-31469854 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
ATTGAAGGATGATCGTCAAT+TGG + Chr5:31471143-31471162 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
CAAGCGTATTGAATTGAATC+AGG + Chr5:31471545-31471564 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
CACATTAGAACTTGTGTTTC+AGG + Chr5:31470070-31470089 MsG0580026156.01.T01:intron 35.0%
CGACCTTAATGTTCTTTCTT+CGG - Chr5:31471482-31471501 None:intergenic 35.0%
GAAGTTAGATGATGAACGTA+TGG + Chr5:31470924-31470943 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
GGAGAAGACAAAAATGGTTT+GGG - Chr5:31471732-31471751 None:intergenic 35.0%
TAAATGCTTAAGACTTGCCT+AGG - Chr5:31470229-31470248 None:intergenic 35.0%
TCAAGATCAAACACCAACAA+AGG + Chr5:31469547-31469566 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
TGAAGAGAAAAGTCCATTGA+AGG + Chr5:31471128-31471147 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
TGATCTTGAAAACACACCAT+TGG - Chr5:31469536-31469555 None:intergenic 35.0%
TGATGATAAGAATGCAAGCT+TGG + Chr5:31469750-31469769 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
TGCAGAAAATGAAACGAGTT+CGG + Chr5:31469711-31469730 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
TTCCTGAACAAAAGAAACGT+GGG - Chr5:31470754-31470773 None:intergenic 35.0%
TTGAAGAGTCACTGAGAAAT+GGG + Chr5:31469836-31469855 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
TTTCCTGAACAAAAGAAACG+TGG - Chr5:31470755-31470774 None:intergenic 35.0%
! AAATTTCTGGAGAACAACTC+TGG - Chr5:31471396-31471415 None:intergenic 35.0%
! AATGGGAAAAGTGAGGTTTT+GGG - Chr5:31469587-31469606 None:intergenic 35.0%
! ACTTTGATTCCCACATGTTT+TGG - Chr5:31469350-31469369 None:intergenic 35.0%
! CTCCACAAGCTTCAAATTTT+GGG - Chr5:31469327-31469346 None:intergenic 35.0%
! CTGAAACACAAGTTCTAATG+TGG - Chr5:31470072-31470091 None:intergenic 35.0%
! GAGAAGTTTCTAAAGGAACA+TGG + Chr5:31470799-31470818 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
! GAGTTGTTCTCCAGAAATTT+TGG + Chr5:31471396-31471415 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
! GATATGGAAGTGTATACAGA+GGG + Chr5:31470902-31470921 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
! GGAAGTTTTGCATCATTTCA+TGG + Chr5:31470371-31470390 MsG0580026156.01.T01:intron 35.0%
! GTCAATGTAGTCAGACTTTT+GGG + Chr5:31471030-31471049 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
! TAATGGGAAAAGTGAGGTTT+TGG - Chr5:31469588-31469607 None:intergenic 35.0%
! TGTCAATGTAGTCAGACTTT+TGG + Chr5:31471029-31471048 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
! TTGTTCTCCAGAAATTTTGG+TGG + Chr5:31471399-31471418 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
!! GAAATGGGTTTAGGTTGAAT+TGG + Chr5:31469851-31469870 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
!! TGCTGATTGTCTTAGTTTGT+TGG + Chr5:31470707-31470726 MsG0580026156.01.T01:intron 35.0%
!! TGTTCTCCAGAAATTTTGGT+GGG + Chr5:31471400-31471419 MsG0580026156.01.T01:CDS 35.0%
AAATGAAACGAGTTCGGTTG+TGG + Chr5:31469717-31469736 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
AAATTAGGTCAGGGAGGATA+TGG + Chr5:31470886-31470905 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
ACGATGCGTATAGTGACAAT+AGG + Chr5:31470301-31470320 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
CATACTGCAAAATGTGGTAC+AGG + Chr5:31469970-31469989 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
GAACTGCAAAGGAACACAAT+TGG + Chr5:31469682-31469701 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
GGAATACAAGAACCCTATTG+TGG + Chr5:31469394-31469413 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
GTGGTATTTCCAGCAATTGA+AGG - Chr5:31471710-31471729 None:intergenic 40.0%
TACAAGTGATGCCAAAACCA+GGG - Chr5:31469423-31469442 None:intergenic 40.0%
TATAGAGCATAGAGTGGTTG+TGG - Chr5:31469302-31469321 None:intergenic 40.0%
TCTCTCTCTTGGAAAATGCA+CGG + Chr5:31469999-31470018 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
TGAACAAAAGAAACGTGGGA+GGG - Chr5:31470750-31470769 None:intergenic 40.0%
TGCAACTGCAAGTGACAAAA+TGG - Chr5:31470263-31470282 None:intergenic 40.0%
TGCAATGACTGTAACAGTAC+TGG + Chr5:31469886-31469905 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
TGGCCGAAGAAAGAACATTA+AGG + Chr5:31471476-31471495 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
TGGTGAAAGACAACCTTTGT+TGG - Chr5:31469563-31469582 None:intergenic 40.0%
TGTATCCATATTTGGCGCAA+GGG + Chr5:31471350-31471369 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
TTACAAGTGATGCCAAAACC+AGG - Chr5:31469424-31469443 None:intergenic 40.0%
TTGTATCCATATTTGGCGCA+AGG + Chr5:31471349-31471368 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
! AATGACTGTAACAGTACTGG+AGG + Chr5:31469889-31469908 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
! AGTCACTGAGAAATGGGTTT+AGG + Chr5:31469842-31469861 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
! CAGACTTTTGGGCTTTTGTT+TGG + Chr5:31471041-31471060 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
! GAAGACAAAAATGGTTTGGG+TGG - Chr5:31471729-31471748 None:intergenic 40.0%
! GACCCAAAATTTGAAGCTTG+TGG + Chr5:31469322-31469341 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
! GCTCCACAAGCTTCAAATTT+TGG - Chr5:31469328-31469347 None:intergenic 40.0%
! GGATATGGAAGTGTATACAG+AGG + Chr5:31470901-31470920 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
!! AACTCTGGAGCAATATATCC+TGG - Chr5:31471381-31471400 None:intergenic 40.0%
!! CTTGGTGTCAAAGAATTGCA+GGG + Chr5:31469768-31469787 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
!! CTTTTGGGCTTTTGTTTGGA+TGG + Chr5:31471045-31471064 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTCTCCAGAAATTTTGGTG+GGG + Chr5:31471401-31471420 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
!! TGGAGAGTATTGTGAAAGGA+GGG + Chr5:31469812-31469831 MsG0580026156.01.T01:CDS 40.0%
AAAACCAGGGTAGCCACAAT+AGG - Chr5:31469410-31469429 None:intergenic 45.0%
AAACCAGGGTAGCCACAATA+GGG - Chr5:31469409-31469428 None:intergenic 45.0%
ACAGGTTTGTCTCTCTCTCT+TGG + Chr5:31469988-31470007 MsG0580026156.01.T01:CDS 45.0%
ACCTTTAGTGGGATAAGGCT+TGG + Chr5:31470541-31470560 MsG0580026156.01.T01:intron 45.0%
AGTTCGGTTGTGGCATTGTA+TGG + Chr5:31469727-31469746 MsG0580026156.01.T01:CDS 45.0%
CTGAACAAAAGAAACGTGGG+AGG - Chr5:31470751-31470770 None:intergenic 45.0%
CTTGTGGAGCCAAAACATGT+GGG + Chr5:31469338-31469357 MsG0580026156.01.T01:CDS 45.0%
GGAAGAGGTTGTGATTGCAA+CGG + Chr5:31469789-31469808 MsG0580026156.01.T01:CDS 45.0%
GTATCCATATTTGGCGCAAG+GGG + Chr5:31471351-31471370 MsG0580026156.01.T01:CDS 45.0%
GTCAAAGAATTGCAGGGAAG+AGG + Chr5:31469774-31469793 MsG0580026156.01.T01:CDS 45.0%
GTGTTCCTTTGCAGTTCTCT+GGG - Chr5:31469679-31469698 None:intergenic 45.0%
TCCACCACTTTATGCATTGC+CGG - Chr5:31471672-31471691 None:intergenic 45.0%
TGAACGTATGGTTGCAGTGA+AGG + Chr5:31470936-31470955 MsG0580026156.01.T01:CDS 45.0%
TGAATCAGGATCTTGGACTC+AGG + Chr5:31471559-31471578 MsG0580026156.01.T01:CDS 45.0%
TGACACCCCACCAAAATTTC+TGG - Chr5:31471409-31471428 None:intergenic 45.0%
TGGGTCTATAGAGCATAGAG+TGG - Chr5:31469308-31469327 None:intergenic 45.0%
TGTCACTATACGCATCGTCT+GGG - Chr5:31470299-31470318 None:intergenic 45.0%
TGTGTTCCTTTGCAGTTCTC+TGG - Chr5:31469680-31469699 None:intergenic 45.0%
TTGTACCTAGCAGCTGAAAG+AGG - Chr5:31470826-31470845 None:intergenic 45.0%
TTGTCACTATACGCATCGTC+TGG - Chr5:31470300-31470319 None:intergenic 45.0%
! AAAGTGGTGGAAATGCTGGA+AGG + Chr5:31471681-31471700 MsG0580026156.01.T01:CDS 45.0%
! AAGTGGTGGAAATGCTGGAA+GGG + Chr5:31471682-31471701 MsG0580026156.01.T01:CDS 45.0%
! ACAAAAATGTCCAGTGGGCT+CGG + Chr5:31470663-31470682 MsG0580026156.01.T01:intron 45.0%
! ACCAAGCCTTATCCCACTAA+AGG - Chr5:31470545-31470564 None:intergenic 45.0%
! ACTGTAACAGTACTGGAGGA+AGG + Chr5:31469893-31469912 MsG0580026156.01.T01:CDS 45.0%
! CTCCCACGTTTCTTTTGTTC+AGG + Chr5:31470749-31470768 MsG0580026156.01.T01:CDS 45.0%
! GCATAAAGTGGTGGAAATGC+TGG + Chr5:31471677-31471696 MsG0580026156.01.T01:CDS 45.0%
! TATTGTGGCTACCCTGGTTT+TGG + Chr5:31469409-31469428 MsG0580026156.01.T01:CDS 45.0%
!! ACGGTGGAGAGTATTGTGAA+AGG + Chr5:31469808-31469827 MsG0580026156.01.T01:CDS 45.0%
!! GCTTGGTGTCAAAGAATTGC+AGG + Chr5:31469767-31469786 MsG0580026156.01.T01:CDS 45.0%
!! GTGGAGAGTATTGTGAAAGG+AGG + Chr5:31469811-31469830 MsG0580026156.01.T01:CDS 45.0%
!!! GGAAAAGTGAGGTTTTGGGT+TGG - Chr5:31469583-31469602 None:intergenic 45.0%
ACCGGCAATGCATAAAGTGG+TGG + Chr5:31471668-31471687 MsG0580026156.01.T01:CDS 50.0%
AGAGGTTGTGATTGCAACGG+TGG + Chr5:31469792-31469811 MsG0580026156.01.T01:CDS 50.0%
AGCTACCCAGAGAACTGCAA+AGG + Chr5:31469671-31469690 MsG0580026156.01.T01:CDS 50.0%
ATGGACCTCTTTCAGCTGCT+AGG + Chr5:31470818-31470837 MsG0580026156.01.T01:CDS 50.0%
GCTTGTGGAGCCAAAACATG+TGG + Chr5:31469337-31469356 MsG0580026156.01.T01:CDS 50.0%
TCGACCGGCAATGCATAAAG+TGG + Chr5:31471665-31471684 MsG0580026156.01.T01:CDS 50.0%
! AACAGTACTGGAGGAAGGTG+TGG + Chr5:31469898-31469917 MsG0580026156.01.T01:CDS 50.0%
! GGATTGGAGTACTTGCACAG+AGG + Chr5:31471207-31471226 MsG0580026156.01.T01:CDS 50.0%
AGTTGGCGTTGCTCGTGGAT+TGG + Chr5:31471191-31471210 MsG0580026156.01.T01:CDS 55.0%
ATTGCAGTTGGCGTTGCTCG+TGG + Chr5:31471186-31471205 MsG0580026156.01.T01:CDS 55.0%
CACTTGCAGTTGCAGACGCA+AGG + Chr5:31470269-31470288 MsG0580026156.01.T01:intron 55.0%
CGTTCCCCTTGCGCCAAATA+TGG - Chr5:31471358-31471377 None:intergenic 55.0%
GAACCCTATTGTGGCTACCC+TGG + Chr5:31469403-31469422 MsG0580026156.01.T01:CDS 55.0%
GGAAGGGAGCCTTCAATTGC+TGG + Chr5:31471698-31471717 MsG0580026156.01.T01:CDS 55.0%
! AACAGACCCTTCGCATCGAC+CGG + Chr5:31471650-31471669 MsG0580026156.01.T01:CDS 55.0%
GCATTGCCGGTCGATGCGAA+GGG - Chr5:31471659-31471678 None:intergenic 60.0%
TGCATTGCCGGTCGATGCGA+AGG - Chr5:31471660-31471679 None:intergenic 60.0%
! ATGTCCAGTGGGCTCGGTAG+CGG + Chr5:31470669-31470688 MsG0580026156.01.T01:intron 60.0%
TTTGGCGCAAGGGGAACGCC+AGG + Chr5:31471360-31471379 MsG0580026156.01.T01:CDS 65.0%
! TGTCCAGTGGGCTCGGTAGC+GGG + Chr5:31470670-31470689 MsG0580026156.01.T01:intron 65.0%
ACTCCCGCTACCGAGCCCAC+TGG - Chr5:31470676-31470695 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 31469277 31471791 31469277 ID=MsG0580026156.01;Name=MsG0580026156.01
Chr5 mRNA 31469277 31471791 31469277 ID=MsG0580026156.01.T01;Parent=MsG0580026156.01;Name=MsG0580026156.01.T01;_AED=0.33;_eAED=0.33;_QI=0|0|0|0.66|1|1|3|0|618
Chr5 exon 31469277 31470031 31469277 ID=MsG0580026156.01.T01:exon:24905;Parent=MsG0580026156.01.T01
Chr5 exon 31470278 31470322 31470278 ID=MsG0580026156.01.T01:exon:24906;Parent=MsG0580026156.01.T01
Chr5 exon 31470735 31471791 31470735 ID=MsG0580026156.01.T01:exon:24907;Parent=MsG0580026156.01.T01
Chr5 CDS 31469277 31470031 31469277 ID=MsG0580026156.01.T01:cds;Parent=MsG0580026156.01.T01
Chr5 CDS 31470278 31470322 31470278 ID=MsG0580026156.01.T01:cds;Parent=MsG0580026156.01.T01
Chr5 CDS 31470735 31471791 31470735 ID=MsG0580026156.01.T01:cds;Parent=MsG0580026156.01.T01
Gene Sequence

>MsG0580026156.01.T01

ATGACCCTTTTTTATCTTCTTACCACAACCACTCTATGCTCTATAGACCCAAAATTTGAAGCTTGTGGAGCCAAAACATGTGGGAATCAAAGTATAAGCTACCCTTTCTATATCAAAGGAATACAAGAACCCTATTGTGGCTACCCTGGTTTTGGCATCACTTGTAACAATACTATTGGTTTTCCAATCCTTAATCTTTCTAATACTGAATACATAATCGAGGAGATTTTCTATCAAAACCATTCATTTAGAGTTTCCAATGGTGTGTTTTCAAGATCAAACACCAACAAAGGTTGTCTTTCACCAACCCAAAACCTCACTTTTCCCATTAACATGTTCAATCTTGCACATAGCCAAACTAATGTGAGACTGTTCTTCGGATGCGACTCAACAAAGCTACCCAGAGAACTGCAAAGGAACACAATTGGTTGCTTTGCAGAAAATGAAACGAGTTCGGTTGTGGCATTGTATGGTGATGATAAGAATGCAAGCTTGGTGTCAAAGAATTGCAGGGAAGAGGTTGTGATTGCAACGGTGGAGAGTATTGTGAAAGGAGGGATTGAAGAGTCACTGAGAAATGGGTTTAGGTTGAATTGGATTGCTAGTGATTGCAATGACTGTAACAGTACTGGAGGAAGGTGTGGCTTTGATAATGATGCATACACTTTCAATTGTTACTGCACTGATAGAGTTCATACTGCAAAATGTGGTACAGGTTTGTCTCTCTCTCTTGGAAAATGCACGGTTTTTAGAAATTGCAGACGCAAGGAAGTCCCAGACGATGCGTATAGTGACAATAGGACAAAGATCTTCCCTCCCACGTTTCTTTTGTTCAGGAAAGACAATCCAACACATCAAATTATTGAGAAGTTTCTAAAGGAACATGGACCTCTTTCAGCTGCTAGGTACAATTATGCAGATGTCAAGAAAATAACAAACTCTTTCAAAAACAAATTAGGTCAGGGAGGATATGGAAGTGTATACAGAGGGAAGTTAGATGATGAACGTATGGTTGCAGTGAAGGTTTTAAGTGAATCTAAAGGCAATGGTGAAGATTTCATCAACGAAGTTGCAAGTATAAGTAGAACTTCACATGTCAATGTAGTCAGACTTTTGGGCTTTTGTTTGGATGGTTCTAAAAAGGCACTAATATATGAATTCATGCCTAATGGATCTCTTGAAAAGTTCATATATGAAGAGAAAAGTCCATTGAAGGATGATCGTCAATTGGATTGCAAAACATTGTATGATATTGCAGTTGGCGTTGCTCGTGGATTGGAGTACTTGCACAGAGGCTGCAACACTAGAATATTACATTTTGACATAAAACCTCATAATATATTACTTCATGAGGATTTCTGCCCAAAAATTTCAGATTTTGGACTTTCTAAAATATGTCCAAGAAAGGAAAGTATTGTATCCATATTTGGCGCAAGGGGAACGCCAGGATATATTGCTCCAGAGTTGTTCTCCAGAAATTTTGGTGGGGTGTCACATAAATCAGATGTTTATAGTTATGGAATGATGGTTTTAGAAATGGTTGGCCGAAGAAAGAACATTAAGGTCGAAGTTGATTGTTCTAGTGAGTTATATTTTCCACATTGGATTTACAAGCGTATTGAATTGAATCAGGATCTTGGACTCAGGTGTATTAAAAATGAAATTGATGAAGAAACGGTAAGAAAAATGACAGTGGTGAGTTTATGGTGCATACAAACAGACCCTTCGCATCGACCGGCAATGCATAAAGTGGTGGAAATGCTGGAAGGGAGCCTTCAATTGCTGGAAATACCACCCAAACCATTTTTGTCTTCTCCTTCAATATCACCTAATGATCTATCATCTGAAATATTGTAA

Protein sequence

>MsG0580026156.01.T01

MTLFYLLTTTTLCSIDPKFEACGAKTCGNQSISYPFYIKGIQEPYCGYPGFGITCNNTIGFPILNLSNTEYIIEEIFYQNHSFRVSNGVFSRSNTNKGCLSPTQNLTFPINMFNLAHSQTNVRLFFGCDSTKLPRELQRNTIGCFAENETSSVVALYGDDKNASLVSKNCREEVVIATVESIVKGGIEESLRNGFRLNWIASDCNDCNSTGGRCGFDNDAYTFNCYCTDRVHTAKCGTGLSLSLGKCTVFRNCRRKEVPDDAYSDNRTKIFPPTFLLFRKDNPTHQIIEKFLKEHGPLSAARYNYADVKKITNSFKNKLGQGGYGSVYRGKLDDERMVAVKVLSESKGNGEDFINEVASISRTSHVNVVRLLGFCLDGSKKALIYEFMPNGSLEKFIYEEKSPLKDDRQLDCKTLYDIAVGVARGLEYLHRGCNTRILHFDIKPHNILLHEDFCPKISDFGLSKICPRKESIVSIFGARGTPGYIAPELFSRNFGGVSHKSDVYSYGMMVLEMVGRRKNIKVEVDCSSELYFPHWIYKRIELNQDLGLRCIKNEIDEETVRKMTVVSLWCIQTDPSHRPAMHKVVEMLEGSLQLLEIPPKPFLSSPSISPNDLSSEIL*