AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780041576.01


Find 34 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 72 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE

Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 92642656 92643978 92642656 ID=MsG0780041576.01;Name=MsG0780041576.01
Chr7 mRNA 92642656 92643789 92642656 ID=MsG0780041576.01.T01;Parent=MsG0780041576.01;Name=MsG0780041576.01.T01;_AED=0.29;_eAED=0.31;_QI=0|0|0|1|0.5|0.33|3|0|306
Chr7 exon 92642656 92642759 92642656 ID=MsG0780041576.01.T01:exon:20179;Parent=MsG0780041576.01.T01
Chr7 exon 92642808 92643159 92642808 ID=MsG0780041576.01.T01:exon:20180;Parent=MsG0780041576.01.T01
Chr7 CDS 92642656 92642759 92642656 ID=MsG0780041576.01.T01:cds;Parent=MsG0780041576.01.T01
Chr7 CDS 92642808 92643159 92642808 ID=MsG0780041576.01.T01:cds;Parent=MsG0780041576.01.T01
Chr7 CDS 92643325 92643789 92643325 ID=MsG0780041576.01.T01:cds;Parent=MsG0780041576.01.T01
Chr7 mRNA 92642950 92643978 92642950 ID=MsG0780041576.01.T02;Parent=MsG0780041576.01;Name=MsG0780041576.01.T02;_AED=0.34;_eAED=0.35;_QI=0|0|0|1|1|0.66|3|0|233
Chr7 exon 92642950 92643159 92642950 ID=MsG0780041576.01.T02:exon:20182;Parent=MsG0780041576.01.T02
Chr7 CDS 92642950 92643159 92642950 ID=MsG0780041576.01.T02:cds;Parent=MsG0780041576.01.T02
Chr7 CDS 92643325 92643711 92643325 ID=MsG0780041576.01.T02:cds;Parent=MsG0780041576.01.T02
Chr7 CDS 92643874 92643978 92643874 ID=MsG0780041576.01.T02:cds;Parent=MsG0780041576.01.T02
Chr7 mRNA 92643064 92643978 92643064 ID=MsG0780041576.01.T03;Parent=MsG0780041576.01;Name=MsG0780041576.01.T03;_AED=0.37;_eAED=0.38;_QI=0|0|0|1|1|0.66|3|0|195
Chr7 exon 92643064 92643159 92643064 ID=MsG0780041576.01.T03:exon:20185;Parent=MsG0780041576.01.T03
Chr7 CDS 92643064 92643159 92643064 ID=MsG0780041576.01.T03:cds;Parent=MsG0780041576.01.T03
Chr7 CDS 92643325 92643711 92643325 ID=MsG0780041576.01.T03:cds;Parent=MsG0780041576.01.T03
Chr7 CDS 92643874 92643978 92643874 ID=MsG0780041576.01.T03:cds;Parent=MsG0780041576.01.T03
Chr7 mRNA 92642950 92643978 92642950 ID=MsG0780041576.01.T04;Parent=MsG0780041576.01;Name=MsG0780041576.01.T04;_AED=0.37;_eAED=0.38;_QI=0|0|0|1|0.5|0.33|3|0|183
Chr7 exon 92642950 92643158 92642950 ID=MsG0780041576.01.T04:exon:20186;Parent=MsG0780041576.01.T04
Chr7 exon 92643474 92643711 92643474 ID=MsG0780041576.01.T04:exon:20187;Parent=MsG0780041576.01.T04
Chr7 CDS 92642950 92643158 92642950 ID=MsG0780041576.01.T04:cds;Parent=MsG0780041576.01.T04
Chr7 CDS 92643474 92643711 92643474 ID=MsG0780041576.01.T04:cds;Parent=MsG0780041576.01.T04
Chr7 CDS 92643874 92643978 92643874 ID=MsG0780041576.01.T04:cds;Parent=MsG0780041576.01.T04
Chr7 mRNA 92642656 92643789 92642656 ID=MsG0780041576.01.T05;Parent=MsG0780041576.01;Name=MsG0780041576.01.T05;_AED=0.28;_eAED=0.30;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|322
Chr7 exon 92642656 92643159 92642656 ID=MsG0780041576.01.T05:exon:20188;Parent=MsG0780041576.01.T05
Chr7 CDS 92642656 92643159 92642656 ID=MsG0780041576.01.T05:cds;Parent=MsG0780041576.01.T05
Chr7 CDS 92643325 92643789 92643325 ID=MsG0780041576.01.T05:cds;Parent=MsG0780041576.01.T05
Chr7 mRNA 92642695 92643789 92642695 ID=MsG0780041576.01.T06;Parent=MsG0780041576.01;Name=MsG0780041576.01.T06;_AED=0.29;_eAED=0.31;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|309
Chr7 exon 92642695 92643159 92642695 ID=MsG0780041576.01.T06:exon:20189;Parent=MsG0780041576.01.T06
Chr7 CDS 92642695 92643159 92642695 ID=MsG0780041576.01.T06:cds;Parent=MsG0780041576.01.T06
Chr7 CDS 92643325 92643789 92643325 ID=MsG0780041576.01.T06:cds;Parent=MsG0780041576.01.T06
Chr7 mRNA 92643508 92643978 92643508 ID=MsG0780041576.01.T07;Parent=MsG0780041576.01;Name=MsG0780041576.01.T07;_AED=0.43;_eAED=0.45;_QI=0|0|0|1|1|0.5|2|0|102
Chr7 exon 92643508 92643711 92643508 ID=MsG0780041576.01.T07:exon:20190;Parent=MsG0780041576.01.T07
Chr7 CDS 92643508 92643711 92643508 ID=MsG0780041576.01.T07:cds;Parent=MsG0780041576.01.T07
Chr7 CDS 92643874 92643978 92643874 ID=MsG0780041576.01.T07:cds;Parent=MsG0780041576.01.T07
Chr7 mRNA 92643325 92643789 92643325 ID=MsG0780041576.01.T08;Parent=MsG0780041576.01;Name=MsG0780041576.01.T08;_AED=0.39;_eAED=0.39;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|154
Chr7 CDS 92643325 92643789 92643325 ID=MsG0780041576.01.T08:cds;Parent=MsG0780041576.01.T08
Chr7 mRNA 92643556 92643789 92643556 ID=MsG0780041576.01.T09;Parent=MsG0780041576.01;Name=MsG0780041576.01.T09;_AED=0.45;_eAED=0.45;_QI=0|-1|0|1|-1|0|1|0|77
Chr7 exon 92643556 92643789 92643556 ID=MsG0780041576.01.T09:exon:20191;Parent=MsG0780041576.01.T09
Chr7 CDS 92643556 92643789 92643556 ID=MsG0780041576.01.T09:cds;Parent=MsG0780041576.01.T09
Gene Sequence

>MsG0780041576.01.T07

ATGGGTGGTGAGGTTCAATCTCGCAATATTGCTGATATTGAAGTGACAATGGTTGAAAGCCATGCAAATCTCAAAGTAAGAACAAAGAAAAGACCAAAACAGCTCTTGAAGATGGTTTCTAGTTTGCATGGATTGTGTCTCACAATCTTGCACCTTAATGTCACTACAGCTGATGAATTTGTCTTCTATTCTATCAGCGTTAAGGTTGAAGATGATTGCAAGCTTGGATCAGTGGATGAGATAGCTGCAGCTGTATACCAAATGTTGGAAAGAATTCAACAAGAGTCATCAATCAATATATTGAATTAA

>MsG0780041576.01.T02

ATGGATGAAGTGTCAAATCCATCTTTAGATAGTTCAATTTCAACTCGTTGTTCTCGTTCCAAGAAACGCAGAGTCAAAACAAGTAAGAATAAAGAAGAAATTGAGAATCAGAGAATGACTCACATTGCTGTAGAACGCAACAGGAGAAAACAAATGAATGAGTATCTCTCTGTTCTTAGATCTCTCATGCCTGAATCTTACGTCCAAAGGGGTGATCAAGCATCAATTATTGGGGGTGCTATTAACTTTGTTAAGAAGCTTGAGCAGAAGCTACAATTTCTTGGTGGTGTTCAGAAACAAAAAGAGGAAAATAAAAACAAGCCCTTTTCTGAATTTTTCACCTTTCCACAATACTCAACAAGTGACAGTGTGTGTGAGAGTTCTGAGACAAAAATGGGTGGTGAGGTTCAATCTCGCAATATTGCTGATATTGAAGTGACAATGGTTGAAAGCCATGCAAATCTCAAAGTAAGAACAAAGAAAAGACCAAAACAGCTCTTGAAGATGGTTTCTAGTTTGCATGGATTGTGTCTCACAATCTTGCACCTTAATGTCACTACAGCTGATGAATTTGTCTTCTATTCTATCAGCGTTAAGGTTGAAGATGATTGCAAGCTTGGATCAGTGGATGAGATAGCTGCAGCTGTATACCAAATGTTGGAAAGAATTCAACAAGAGTCATCAATCAATATATTGAATTAA

>MsG0780041576.01.T08

GGTGATCAAGCATCAATTATTGGGGGTGCTATTAACTTTGTTAAGAAGCTTGAGCAGAAGCTACAATTTCTTGGTGGTGTTCAGAAACAAAAAGAGGAAAATAAAAACAAGCCCTTTTCTGAATTTTTCACCTTTCCACAATACTCAACAAGTGACAGTGTGTGTGAGAGTTCTGAGACAAAAATGGGTGGTGAGGTTCAATCTCGCAATATTGCTGATATTGAAGTGACAATGGTTGAAAGCCATGCAAATCTCAAAGTAAGAACAAAGAAAAGACCAAAACAGCTCTTGAAGATGGTTTCTAGTTTGCATGGATTGTGTCTCACAATCTTGCACCTTAATGTCACTACAGCTGATGAATTTGTCTTCTATTCTATCAGCGTTAAGGTAATTGTCTGTGGTCCCTGTCATGTTTTTTTTTTCTTCCACTTTCCAAATTCTAACCACTTTTTAGCTTTCTCTTGA

>MsG0780041576.01.T05

ATGTGTTTACCAGAGGAAAATAGAGAAAGAGAGAGATCCATGGCACTAGAACCAACTCTACTATATCCACAAGACCCTTTCACCTATGGATTCAACAAAGACCATTACAATTACAACCTGTTAACAGATTCTGAAGCAAACTTTGACTACACCAACTTCAACCTTCAAAATGAAGAAGATCAACTTTCTACTTTTCTCATCAAGAACCAACAAACAGAGAATTATGCTTATGGAAATTGGAGTAACAATTGTTCATCTCCTTCACCACCACCACCACAATCATTGTTGCCACAAATGGATGAAGTGTCAAATCCATCTTTAGATAGTTCAATTTCAACTCGTTGTTCTCGTTCCAAGAAACGCAGAGTCAAAACAAGTAAGAATAAAGAAGAAATTGAGAATCAGAGAATGACTCACATTGCTGTAGAACGCAACAGGAGAAAACAAATGAATGAGTATCTCTCTGTTCTTAGATCTCTCATGCCTGAATCTTACGTCCAAAGGGGTGATCAAGCATCAATTATTGGGGGTGCTATTAACTTTGTTAAGAAGCTTGAGCAGAAGCTACAATTTCTTGGTGGTGTTCAGAAACAAAAAGAGGAAAATAAAAACAAGCCCTTTTCTGAATTTTTCACCTTTCCACAATACTCAACAAGTGACAGTGTGTGTGAGAGTTCTGAGACAAAAATGGGTGGTGAGGTTCAATCTCGCAATATTGCTGATATTGAAGTGACAATGGTTGAAAGCCATGCAAATCTCAAAGTAAGAACAAAGAAAAGACCAAAACAGCTCTTGAAGATGGTTTCTAGTTTGCATGGATTGTGTCTCACAATCTTGCACCTTAATGTCACTACAGCTGATGAATTTGTCTTCTATTCTATCAGCGTTAAGGTAATTGTCTGTGGTCCCTGTCATGTTTTTTTTTTCTTCCACTTTCCAAATTCTAACCACTTTTTAGCTTTCTCTTGA

>MsG0780041576.01.T06

ATGGCACTAGAACCAACTCTACTATATCCACAAGACCCTTTCACCTATGGATTCAACAAAGACCATTACAATTACAACCTGTTAACAGATTCTGAAGCAAACTTTGACTACACCAACTTCAACCTTCAAAATGAAGAAGATCAACTTTCTACTTTTCTCATCAAGAACCAACAAACAGAGAATTATGCTTATGGAAATTGGAGTAACAATTGTTCATCTCCTTCACCACCACCACCACAATCATTGTTGCCACAAATGGATGAAGTGTCAAATCCATCTTTAGATAGTTCAATTTCAACTCGTTGTTCTCGTTCCAAGAAACGCAGAGTCAAAACAAGTAAGAATAAAGAAGAAATTGAGAATCAGAGAATGACTCACATTGCTGTAGAACGCAACAGGAGAAAACAAATGAATGAGTATCTCTCTGTTCTTAGATCTCTCATGCCTGAATCTTACGTCCAAAGGGGTGATCAAGCATCAATTATTGGGGGTGCTATTAACTTTGTTAAGAAGCTTGAGCAGAAGCTACAATTTCTTGGTGGTGTTCAGAAACAAAAAGAGGAAAATAAAAACAAGCCCTTTTCTGAATTTTTCACCTTTCCACAATACTCAACAAGTGACAGTGTGTGTGAGAGTTCTGAGACAAAAATGGGTGGTGAGGTTCAATCTCGCAATATTGCTGATATTGAAGTGACAATGGTTGAAAGCCATGCAAATCTCAAAGTAAGAACAAAGAAAAGACCAAAACAGCTCTTGAAGATGGTTTCTAGTTTGCATGGATTGTGTCTCACAATCTTGCACCTTAATGTCACTACAGCTGATGAATTTGTCTTCTATTCTATCAGCGTTAAGGTAATTGTCTGTGGTCCCTGTCATGTTTTTTTTTTCTTCCACTTTCCAAATTCTAACCACTTTTTAGCTTTCTCTTGA

>MsG0780041576.01.T03

ATGACTCACATTGCTGTAGAACGCAACAGGAGAAAACAAATGAATGAGTATCTCTCTGTTCTTAGATCTCTCATGCCTGAATCTTACGTCCAAAGGGGTGATCAAGCATCAATTATTGGGGGTGCTATTAACTTTGTTAAGAAGCTTGAGCAGAAGCTACAATTTCTTGGTGGTGTTCAGAAACAAAAAGAGGAAAATAAAAACAAGCCCTTTTCTGAATTTTTCACCTTTCCACAATACTCAACAAGTGACAGTGTGTGTGAGAGTTCTGAGACAAAAATGGGTGGTGAGGTTCAATCTCGCAATATTGCTGATATTGAAGTGACAATGGTTGAAAGCCATGCAAATCTCAAAGTAAGAACAAAGAAAAGACCAAAACAGCTCTTGAAGATGGTTTCTAGTTTGCATGGATTGTGTCTCACAATCTTGCACCTTAATGTCACTACAGCTGATGAATTTGTCTTCTATTCTATCAGCGTTAAGGTTGAAGATGATTGCAAGCTTGGATCAGTGGATGAGATAGCTGCAGCTGTATACCAAATGTTGGAAAGAATTCAACAAGAGTCATCAATCAATATATTGAATTAA

>MsG0780041576.01.T09

ATGGTTGAAAGCCATGCAAATCTCAAAGTAAGAACAAAGAAAAGACCAAAACAGCTCTTGAAGATGGTTTCTAGTTTGCATGGATTGTGTCTCACAATCTTGCACCTTAATGTCACTACAGCTGATGAATTTGTCTTCTATTCTATCAGCGTTAAGGTAATTGTCTGTGGTCCCTGTCATGTTTTTTTTTTCTTCCACTTTCCAAATTCTAACCACTTTTTAGCTTTCTCTTGA

>MsG0780041576.01.T04

ATGGATGAAGTGTCAAATCCATCTTTAGATAGTTCAATTTCAACTCGTTGTTCTCGTTCCAAGAAACGCAGAGTCAAAACAAGTAAGAATAAAGAAGAAATTGAGAATCAGAGAATGACTCACATTGCTGTAGAACGCAACAGGAGAAAACAAATGAATGAGTATCTCTCTGTTCTTAGATCTCTCATGCCTGAATCTTACGTCCAAAGAAGTGACAGTGTGTGTGAGAGTTCTGAGACAAAAATGGGTGGTGAGGTTCAATCTCGCAATATTGCTGATATTGAAGTGACAATGGTTGAAAGCCATGCAAATCTCAAAGTAAGAACAAAGAAAAGACCAAAACAGCTCTTGAAGATGGTTTCTAGTTTGCATGGATTGTGTCTCACAATCTTGCACCTTAATGTCACTACAGCTGATGAATTTGTCTTCTATTCTATCAGCGTTAAGGTTGAAGATGATTGCAAGCTTGGATCAGTGGATGAGATAGCTGCAGCTGTATACCAAATGTTGGAAAGAATTCAACAAGAGTCATCAATCAATATATTGAATTAA

>MsG0780041576.01.T01

ATGTGTTTACCAGAGGAAAATAGAGAAAGAGAGAGATCCATGGCACTAGAACCAACTCTACTATATCCACAAGACCCTTTCACCTATGGATTCAACAAAGACCACAACTTCAACCTTCAAAATGAAGAAGATCAACTTTCTACTTTTCTCATCAAGAACCAACAAACAGAGAATTATGCTTATGGAAATTGGAGTAACAATTGTTCATCTCCTTCACCACCACCACCACAATCATTGTTGCCACAAATGGATGAAGTGTCAAATCCATCTTTAGATAGTTCAATTTCAACTCGTTGTTCTCGTTCCAAGAAACGCAGAGTCAAAACAAGTAAGAATAAAGAAGAAATTGAGAATCAGAGAATGACTCACATTGCTGTAGAACGCAACAGGAGAAAACAAATGAATGAGTATCTCTCTGTTCTTAGATCTCTCATGCCTGAATCTTACGTCCAAAGGGGTGATCAAGCATCAATTATTGGGGGTGCTATTAACTTTGTTAAGAAGCTTGAGCAGAAGCTACAATTTCTTGGTGGTGTTCAGAAACAAAAAGAGGAAAATAAAAACAAGCCCTTTTCTGAATTTTTCACCTTTCCACAATACTCAACAAGTGACAGTGTGTGTGAGAGTTCTGAGACAAAAATGGGTGGTGAGGTTCAATCTCGCAATATTGCTGATATTGAAGTGACAATGGTTGAAAGCCATGCAAATCTCAAAGTAAGAACAAAGAAAAGACCAAAACAGCTCTTGAAGATGGTTTCTAGTTTGCATGGATTGTGTCTCACAATCTTGCACCTTAATGTCACTACAGCTGATGAATTTGTCTTCTATTCTATCAGCGTTAAGGTAATTGTCTGTGGTCCCTGTCATGTTTTTTTTTTCTTCCACTTTCCAAATTCTAACCACTTTTTAGCTTTCTCTTGA

Protein sequence

>MsG0780041576.01.T07

MGGEVQSRNIADIEVTMVESHANLKVRTKKRPKQLLKMVSSLHGLCLTILHLNVTTADEFVFYSISVKVEDDCKLGSVDEIAAAVYQMLERIQQESSINILN*

>MsG0780041576.01.T02

MDEVSNPSLDSSISTRCSRSKKRRVKTSKNKEEIENQRMTHIAVERNRRKQMNEYLSVLRSLMPESYVQRGDQASIIGGAINFVKKLEQKLQFLGGVQKQKEENKNKPFSEFFTFPQYSTSDSVCESSETKMGGEVQSRNIADIEVTMVESHANLKVRTKKRPKQLLKMVSSLHGLCLTILHLNVTTADEFVFYSISVKVEDDCKLGSVDEIAAAVYQMLERIQQESSINILN*

>MsG0780041576.01.T08

GDQASIIGGAINFVKKLEQKLQFLGGVQKQKEENKNKPFSEFFTFPQYSTSDSVCESSETKMGGEVQSRNIADIEVTMVESHANLKVRTKKRPKQLLKMVSSLHGLCLTILHLNVTTADEFVFYSISVKVIVCGPCHVFFFFHFPNSNHFLAFS*

>MsG0780041576.01.T05

MCLPEENRERERSMALEPTLLYPQDPFTYGFNKDHYNYNLLTDSEANFDYTNFNLQNEEDQLSTFLIKNQQTENYAYGNWSNNCSSPSPPPPQSLLPQMDEVSNPSLDSSISTRCSRSKKRRVKTSKNKEEIENQRMTHIAVERNRRKQMNEYLSVLRSLMPESYVQRGDQASIIGGAINFVKKLEQKLQFLGGVQKQKEENKNKPFSEFFTFPQYSTSDSVCESSETKMGGEVQSRNIADIEVTMVESHANLKVRTKKRPKQLLKMVSSLHGLCLTILHLNVTTADEFVFYSISVKVIVCGPCHVFFFFHFPNSNHFLAFS*

>MsG0780041576.01.T06

MALEPTLLYPQDPFTYGFNKDHYNYNLLTDSEANFDYTNFNLQNEEDQLSTFLIKNQQTENYAYGNWSNNCSSPSPPPPQSLLPQMDEVSNPSLDSSISTRCSRSKKRRVKTSKNKEEIENQRMTHIAVERNRRKQMNEYLSVLRSLMPESYVQRGDQASIIGGAINFVKKLEQKLQFLGGVQKQKEENKNKPFSEFFTFPQYSTSDSVCESSETKMGGEVQSRNIADIEVTMVESHANLKVRTKKRPKQLLKMVSSLHGLCLTILHLNVTTADEFVFYSISVKVIVCGPCHVFFFFHFPNSNHFLAFS*

>MsG0780041576.01.T03

MTHIAVERNRRKQMNEYLSVLRSLMPESYVQRGDQASIIGGAINFVKKLEQKLQFLGGVQKQKEENKNKPFSEFFTFPQYSTSDSVCESSETKMGGEVQSRNIADIEVTMVESHANLKVRTKKRPKQLLKMVSSLHGLCLTILHLNVTTADEFVFYSISVKVEDDCKLGSVDEIAAAVYQMLERIQQESSINILN*

>MsG0780041576.01.T09

MVESHANLKVRTKKRPKQLLKMVSSLHGLCLTILHLNVTTADEFVFYSISVKVIVCGPCHVFFFFHFPNSNHFLAFS*

>MsG0780041576.01.T04

MDEVSNPSLDSSISTRCSRSKKRRVKTSKNKEEIENQRMTHIAVERNRRKQMNEYLSVLRSLMPESYVQRSDSVCESSETKMGGEVQSRNIADIEVTMVESHANLKVRTKKRPKQLLKMVSSLHGLCLTILHLNVTTADEFVFYSISVKVEDDCKLGSVDEIAAAVYQMLERIQQESSINILN*

>MsG0780041576.01.T01

MCLPEENRERERSMALEPTLLYPQDPFTYGFNKDHNFNLQNEEDQLSTFLIKNQQTENYAYGNWSNNCSSPSPPPPQSLLPQMDEVSNPSLDSSISTRCSRSKKRRVKTSKNKEEIENQRMTHIAVERNRRKQMNEYLSVLRSLMPESYVQRGDQASIIGGAINFVKKLEQKLQFLGGVQKQKEENKNKPFSEFFTFPQYSTSDSVCESSETKMGGEVQSRNIADIEVTMVESHANLKVRTKKRPKQLLKMVSSLHGLCLTILHLNVTTADEFVFYSISVKVIVCGPCHVFFFFHFPNSNHFLAFS*