AlfalfaGEDB | MsG0380014930.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380014930.01

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CRISPR-Local

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TACAAAATGCTTGAAATAAT+AGG	0.258964	3:+62657300	MsG0380014930.01.T01:CDS
CTATTGATTCTTTGAGGTTT+CGG	0.277857	3:+62656578	MsG0380014930.01.T01:CDS
TTCATGGAGTAGTATGATAA+TGG	0.280793	3:+62656402	MsG0380014930.01.T01:CDS
ATAATGGGTTATGTTCAAAA+TGG	0.291273	3:+62656418	MsG0380014930.01.T01:CDS
AAGGTATTACTTTAAGTTAA+TGG	0.302388	3:+62656864	MsG0380014930.01.T01:CDS
AGTAGTGTTGCCCACATTAC+AGG	0.315137	3:-62657009	None:intergenic
AAGTTAATGGTGGATGGTTA+TGG	0.317068	3:+62656877	MsG0380014930.01.T01:CDS
AGTTAGAGTTCGCAGATTAA+TGG	0.320985	3:+62657170	MsG0380014930.01.T01:CDS
GCTACACAGGTAAGATGTTT+TGG	0.323223	3:-62657351	None:intergenic
AAGATGGGTTGGAGTGCTTT+AGG	0.323456	3:+62656449	MsG0380014930.01.T01:CDS
CTTGATGCTTGTAAGATTCA+TGG	0.328977	3:+62657030	MsG0380014930.01.T01:CDS
AGCGTTCCCATTAAAGTTGC+AGG	0.343773	3:+62657198	MsG0380014930.01.T01:CDS
CTCCAACCTGCAACTTTAAT+GGG	0.345012	3:-62657204	None:intergenic
GAGTCGAGAGGTTTGTTTGA+TGG	0.352574	3:+62656661	MsG0380014930.01.T01:CDS
GCTTTCTGCTTCGGCTCAGT+TGG	0.362907	3:+62656522	MsG0380014930.01.T01:CDS
GGTTACGATGCTTTCTGCTT+CGG	0.363985	3:+62656513	MsG0380014930.01.T01:CDS
TGCTTGTAGTAGGGCTGGTT+TGG	0.374451	3:+62656831	MsG0380014930.01.T01:CDS
GACTGTTATGATTTGTGGGT+TGG	0.375037	3:+62656711	MsG0380014930.01.T01:CDS
CGGCTCAGTTGGGTTTGTTA+AGG	0.376347	3:+62656533	MsG0380014930.01.T01:CDS
CCAGCGGAGATGGAGCACTA+TGG	0.380099	3:+62656904	MsG0380014930.01.T01:CDS
ATTCAACTATTGATTCTTTG+AGG	0.381384	3:+62656572	MsG0380014930.01.T01:CDS
CTATGTTGGCTGGTTTGGTT+AGG	0.381564	3:+62656320	MsG0380014930.01.T01:CDS
TGTTGCTATTGGAACTGCTT+TGG	0.381630	3:+62656606	MsG0380014930.01.T01:CDS
CTCAGTTGGGTTTGTTAAGG+TGG	0.381817	3:+62656536	MsG0380014930.01.T01:CDS
TTTCGGATAAGTGTTGCTAT+TGG	0.393638	3:+62656595	MsG0380014930.01.T01:CDS
GAATGATGGAGAGGGATGTT+TGG	0.398682	3:+62656683	MsG0380014930.01.T01:CDS
TAAGAGGGTGTTTGAGGAAG+AGG	0.400448	3:+62656261	MsG0380014930.01.T01:CDS
GTGGAAATGGGAGAAAAGAT+TGG	0.404591	3:+62657057	MsG0380014930.01.T01:CDS
ATTCATGGGTTTGTGGAAAT+GGG	0.408723	3:+62657045	MsG0380014930.01.T01:CDS
ACTTGGACTGTTATGATTTG+TGG	0.410961	3:+62656706	MsG0380014930.01.T01:CDS
GAATTCTATGTTGGCTGGTT+TGG	0.415385	3:+62656315	MsG0380014930.01.T01:CDS
TCATGGAGTAGTATGATAAT+GGG	0.416473	3:+62656403	MsG0380014930.01.T01:CDS
CTTGGACTGTTATGATTTGT+GGG	0.416503	3:+62656707	MsG0380014930.01.T01:CDS
CAAAATGGGAAATTGGAAGA+TGG	0.418114	3:+62656433	MsG0380014930.01.T01:CDS
TAATGGGTTATGTTCAAAAT+GGG	0.422453	3:+62656419	MsG0380014930.01.T01:CDS
CTTTCTGCTTCGGCTCAGTT+GGG	0.423138	3:+62656523	MsG0380014930.01.T01:CDS
CTCCTTCACGCCTGCACGAA+AGG	0.423410	3:+62656103	MsG0380014930.01.T01:CDS
CGAGGAGAGATGTTGTTTCA+TGG	0.427683	3:+62656386	MsG0380014930.01.T01:CDS
GTTGATCTCTTTGCTCGTGC+GGG	0.437642	3:+62656934	MsG0380014930.01.T01:CDS
CATGATCATGTGGTTAAGCT+TGG	0.460027	3:+62656163	MsG0380014930.01.T01:CDS
TTGATGCTTGTAAGATTCAT+GGG	0.466852	3:+62657031	MsG0380014930.01.T01:CDS
TTAAATGCTTGTAGTAGGGC+TGG	0.467248	3:+62656826	MsG0380014930.01.T01:CDS
AAAATGGGAAATTGGAAGAT+GGG	0.467441	3:+62656434	MsG0380014930.01.T01:CDS
GTATGCTAAGAGGGTGTTTG+AGG	0.467692	3:+62656255	MsG0380014930.01.T01:CDS
TACTTTAAGTTAATGGTGGA+TGG	0.472082	3:+62656871	MsG0380014930.01.T01:CDS
TCAGTTGGGTTTGTTAAGGT+GGG	0.472674	3:+62656537	MsG0380014930.01.T01:CDS
AGAGTTCATCGATTTGTAGC+AGG	0.472726	3:+62657246	MsG0380014930.01.T01:CDS
TGGAAATGGGAGAAAAGATT+GGG	0.475874	3:+62657058	MsG0380014930.01.T01:CDS
TCCTTCACGCCTGCACGAAA+GGG	0.479826	3:+62656104	MsG0380014930.01.T01:CDS
CTATGCAAAATCAAGAAAAT+GGG	0.480374	3:+62657140	MsG0380014930.01.T01:CDS
TGGGAAATTGGAAGATGGGT+TGG	0.482791	3:+62656438	MsG0380014930.01.T01:CDS
TGGGAATAAGTTGATAAAGA+TGG	0.484518	3:+62657077	MsG0380014930.01.T01:CDS
GGTCATTATGTGCAGTTAGC+TGG	0.487682	3:+62657114	MsG0380014930.01.T01:CDS
AGTTGGGTTTGTTAAGGTGG+GGG	0.494468	3:+62656539	MsG0380014930.01.T01:CDS
TGAAACAATGAGTGTTGAAC+CGG	0.497931	3:+62656984	MsG0380014930.01.T01:CDS
AGGTTTGTTTGATGGAATGA+TGG	0.500032	3:+62656669	MsG0380014930.01.T01:CDS
ACGTGGAATTCTATGTTGGC+TGG	0.503799	3:+62656310	MsG0380014930.01.T01:CDS
CAGCGGAGATGGAGCACTAT+GGG	0.507867	3:+62656905	MsG0380014930.01.T01:CDS
TTATGGTATTCCAGCGGAGA+TGG	0.509277	3:+62656894	MsG0380014930.01.T01:CDS
CCATAGTGCTCCATCTCCGC+TGG	0.509891	3:-62656904	None:intergenic
TGGAGAGGGATGTTTGGACT+TGG	0.513385	3:+62656689	MsG0380014930.01.T01:CDS
TCCCTTTCGTGCAGGCGTGA+AGG	0.517337	3:-62656105	None:intergenic
ACATTGTTTCCCTTTCGTGC+AGG	0.518143	3:-62656113	None:intergenic
GATTAATAGATGAAGCGGTT+CGG	0.519131	3:+62656956	MsG0380014930.01.T01:CDS
GTTGCCCACATTACAGGATC+CGG	0.524022	3:-62657003	None:intergenic
CAGTTGGGTTTGTTAAGGTG+GGG	0.528677	3:+62656538	MsG0380014930.01.T01:CDS
TTGATATGTATTCGAAATGT+GGG	0.530308	3:+62656629	MsG0380014930.01.T01:CDS
GTAACCAAAATAGATTCATT+CGG	0.533900	3:-62656496	None:intergenic
GTTGATATGTATTCGAAATG+TGG	0.536874	3:+62656628	MsG0380014930.01.T01:CDS
TAGGGCTGGTTTGGTTAGTG+AGG	0.544135	3:+62656840	MsG0380014930.01.T01:CDS
CTTTAGGTTGATGAGAGGGA+AGG	0.544703	3:+62656465	MsG0380014930.01.T01:CDS
TTGGCTGGTTTGGTTAGGAA+AGG	0.545547	3:+62656325	MsG0380014930.01.T01:CDS
TTTCGTGAGTTTATACGTGA+GGG	0.547010	3:+62656769	MsG0380014930.01.T01:CDS
GTATTACTTTAAGTTAATGG+TGG	0.551366	3:+62656867	MsG0380014930.01.T01:CDS
CTGGTTTGGTTAGTGAGGGA+AGG	0.552430	3:+62656845	MsG0380014930.01.T01:CDS
AGGGCTGGTTTGGTTAGTGA+GGG	0.555353	3:+62656841	MsG0380014930.01.T01:CDS
TTCCCATTAAAGTTGCAGGT+TGG	0.556425	3:+62657202	MsG0380014930.01.T01:CDS
GTGGTTAAGCTTGGTTACGC+GGG	0.556651	3:+62656172	MsG0380014930.01.T01:CDS
AGTGCTTTAGGTTGATGAGA+GGG	0.557983	3:+62656461	MsG0380014930.01.T01:CDS
GTTTCGTGAGTTTATACGTG+AGG	0.563255	3:+62656768	MsG0380014930.01.T01:CDS
TGTTACGTGGAATTCTATGT+TGG	0.564437	3:+62656306	MsG0380014930.01.T01:CDS
GGTTGATCTCTTTGCTCGTG+CGG	0.565141	3:+62656933	MsG0380014930.01.T01:CDS
GGACTGAGGATAACTGAAGC+TGG	0.565448	3:+62657321	MsG0380014930.01.T01:CDS
GTTTGATGGAATGATGGAGA+GGG	0.567294	3:+62656675	MsG0380014930.01.T01:CDS
CGTGCAGGCGTGAAGGAGGA+AGG	0.567304	3:-62656098	None:intergenic
ATGTGAGTGAGTATGCTAAG+AGG	0.568022	3:+62656245	MsG0380014930.01.T01:CDS
GAGTTCATCGATTTGTAGCA+GGG	0.572885	3:+62657247	MsG0380014930.01.T01:CDS
TTTAGGTTGATGAGAGGGAA+GGG	0.572896	3:+62656466	MsG0380014930.01.T01:CDS
TTGTAAGATTCATGGGTTTG+TGG	0.577235	3:+62657038	MsG0380014930.01.T01:CDS
TCTCCTATGTCATGCTACAC+AGG	0.577773	3:-62657364	None:intergenic
GTTTGAGGAAGAGGTTGATG+AGG	0.582039	3:+62656270	MsG0380014930.01.T01:CDS
AAGATGGATCCAACTCATGA+TGG	0.586229	3:+62657093	MsG0380014930.01.T01:CDS
TGTGAGTGAGTATGCTAAGA+GGG	0.588281	3:+62656246	MsG0380014930.01.T01:CDS
CTTTCGTGCAGGCGTGAAGG+AGG	0.598373	3:-62656102	None:intergenic
TGTGGTTAAGCTTGGTTACG+CGG	0.599379	3:+62656171	MsG0380014930.01.T01:CDS
GAGTGCTTTAGGTTGATGAG+AGG	0.605583	3:+62656460	MsG0380014930.01.T01:CDS
CATGAAACAACATCTCTCCT+CGG	0.610807	3:-62656385	None:intergenic
TGCGGGATTAATAGATGAAG+CGG	0.620883	3:+62656951	MsG0380014930.01.T01:CDS
TGTTCAAGTTCATGATCATG+TGG	0.626414	3:+62656153	MsG0380014930.01.T01:CDS
ACATAATGACCATCATGAGT+TGG	0.631266	3:-62657102	None:intergenic
GGCTTCGCATGATCGTGCAA+TGG	0.652219	3:+62656732	MsG0380014930.01.T01:CDS
GATGGAGCACTATGGGTGCA+TGG	0.655696	3:+62656912	MsG0380014930.01.T01:CDS
AGGTTGGAGCTTGATTGAAG+TGG	0.656551	3:+62657218	MsG0380014930.01.T01:CDS
TTGAACCGGATCCTGTAATG+TGG	0.659051	3:+62656998	MsG0380014930.01.T01:CDS
AGATGTTTGATGAAATGCCG+AGG	0.661621	3:+62656368	MsG0380014930.01.T01:CDS
GAAAGGCGAGGTGAAAGATG+CGG	0.663238	3:+62656342	MsG0380014930.01.T01:CDS
TGGTTTGGTTAGGAAAGGCG+AGG	0.663574	3:+62656330	MsG0380014930.01.T01:CDS
GGGTGTATTGAAGAGTCGAG+AGG	0.665623	3:+62656649	MsG0380014930.01.T01:CDS
AGTTCATCGATTTGTAGCAG+GGG	0.666313	3:+62657248	MsG0380014930.01.T01:CDS
TGTTTGATGGAATGATGGAG+AGG	0.674551	3:+62656674	MsG0380014930.01.T01:CDS
TTTGTAGTGATGTTGTTACG+TGG	0.676915	3:+62656293	MsG0380014930.01.T01:CDS
TGCTTGAAATAATAGGACTG+AGG	0.694613	3:+62657307	MsG0380014930.01.T01:CDS
TGAACCGGATCCTGTAATGT+GGG	0.700535	3:+62656999	MsG0380014930.01.T01:CDS
GGATGGTTATGGTATTCCAG+CGG	0.709233	3:+62656888	MsG0380014930.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
!!	TACAAAATGCTTGAAATAAT+AGG	+	Chr3:62657300-62657319	MsG0380014930.01.T01:CDS	20.0%
!!!	AAGGTATTACTTTAAGTTAA+TGG	+	Chr3:62656864-62656883	MsG0380014930.01.T01:CDS	20.0%
!!!	CTTATTCATTTTTACTTTGA+GGG	+	Chr3:62656217-62656236	MsG0380014930.01.T01:CDS	20.0%
!	CAATGTTTCAATATTGTTTC+AGG	+	Chr3:62656130-62656149	MsG0380014930.01.T01:CDS	25.0%
!	CTATGCAAAATCAAGAAAAT+GGG	+	Chr3:62657140-62657159	MsG0380014930.01.T01:CDS	25.0%
!	GTAACCAAAATAGATTCATT+CGG	-	Chr3:62656499-62656518	None:intergenic	25.0%
!	TCTATGCAAAATCAAGAAAA+TGG	+	Chr3:62657139-62657158	MsG0380014930.01.T01:CDS	25.0%
!	TTATGTTCAAAATGGGAAAT+TGG	+	Chr3:62656426-62656445	MsG0380014930.01.T01:CDS	25.0%
!	TTGATATGTATTCGAAATGT+GGG	+	Chr3:62656629-62656648	MsG0380014930.01.T01:CDS	25.0%
!!	GTATTACTTTAAGTTAATGG+TGG	+	Chr3:62656867-62656886	MsG0380014930.01.T01:CDS	25.0%
!!	TTTTGTAAATGTCTGAAGAA+TGG	-	Chr3:62657287-62657306	None:intergenic	25.0%
!!!	ATAATGGGTTATGTTCAAAA+TGG	+	Chr3:62656418-62656437	MsG0380014930.01.T01:CDS	25.0%
!!!	ATTCAACTATTGATTCTTTG+AGG	+	Chr3:62656572-62656591	MsG0380014930.01.T01:CDS	25.0%
!!!	GCTTATTCATTTTTACTTTG+AGG	+	Chr3:62656216-62656235	MsG0380014930.01.T01:CDS	25.0%
!!!	TAATGGGTTATGTTCAAAAT+GGG	+	Chr3:62656419-62656438	MsG0380014930.01.T01:CDS	25.0%
!!!	TGTTTTAAATGCTTGTAGTA+GGG	+	Chr3:62656822-62656841	MsG0380014930.01.T01:CDS	25.0%
	AAAATGGGAAATTGGAAGAT+GGG	+	Chr3:62656434-62656453	MsG0380014930.01.T01:CDS	30.0%
	GTTGATATGTATTCGAAATG+TGG	+	Chr3:62656628-62656647	MsG0380014930.01.T01:CDS	30.0%
	TCATGGAGTAGTATGATAAT+GGG	+	Chr3:62656403-62656422	MsG0380014930.01.T01:CDS	30.0%
	TTCATGGAGTAGTATGATAA+TGG	+	Chr3:62656402-62656421	MsG0380014930.01.T01:CDS	30.0%
	TTGATGCTTGTAAGATTCAT+GGG	+	Chr3:62657031-62657050	MsG0380014930.01.T01:CDS	30.0%
!	AAGACCGAATGAATCTATTT+TGG	+	Chr3:62656492-62656511	MsG0380014930.01.T01:CDS	30.0%
!	TACTTTAAGTTAATGGTGGA+TGG	+	Chr3:62656871-62656890	MsG0380014930.01.T01:CDS	30.0%
!!	CTATTGATTCTTTGAGGTTT+CGG	+	Chr3:62656578-62656597	MsG0380014930.01.T01:CDS	30.0%
!!	GTGTTTTAAATGCTTGTAGT+AGG	+	Chr3:62656821-62656840	MsG0380014930.01.T01:CDS	30.0%
!!	TGGGAATAAGTTGATAAAGA+TGG	+	Chr3:62657077-62657096	MsG0380014930.01.T01:CDS	30.0%
	ACATAATGACCATCATGAGT+TGG	-	Chr3:62657105-62657124	None:intergenic	35.0%
	ACTTGGACTGTTATGATTTG+TGG	+	Chr3:62656706-62656725	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
	AGTTAGAGTTCGCAGATTAA+TGG	+	Chr3:62657170-62657189	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
	ATTCATGGGTTTGTGGAAAT+GGG	+	Chr3:62657045-62657064	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
	CAAAATGGGAAATTGGAAGA+TGG	+	Chr3:62656433-62656452	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
	CCAACAAAAATCACATTCAC+AGG	-	Chr3:62656802-62656821	None:intergenic	35.0%
	CTTGATGCTTGTAAGATTCA+TGG	+	Chr3:62657030-62657049	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
	GATTAATAGATGAAGCGGTT+CGG	+	Chr3:62656956-62656975	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
	TGCTTGAAATAATAGGACTG+AGG	+	Chr3:62657307-62657326	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
	TGGAAATGGGAGAAAAGATT+GGG	+	Chr3:62657058-62657077	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
	TGTTACGTGGAATTCTATGT+TGG	+	Chr3:62656306-62656325	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
	TTGTAAGATTCATGGGTTTG+TGG	+	Chr3:62657038-62657057	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
	TTTCGTGAGTTTATACGTGA+GGG	+	Chr3:62656769-62656788	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
	TTTGTAGTGATGTTGTTACG+TGG	+	Chr3:62656293-62656312	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
!	AGGTTTGTTTGATGGAATGA+TGG	+	Chr3:62656669-62656688	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
!	CCTGTGAATGTGATTTTTGT+TGG	+	Chr3:62656799-62656818	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
!	CTTGGACTGTTATGATTTGT+GGG	+	Chr3:62656707-62656726	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
!	TGTTCAAGTTCATGATCATG+TGG	+	Chr3:62656153-62656172	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
!	TTTCGGATAAGTGTTGCTAT+TGG	+	Chr3:62656595-62656614	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
!!	AAGTTAATGGTGGATGGTTA+TGG	+	Chr3:62656877-62656896	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
!!	TGAAACAATGAGTGTTGAAC+CGG	+	Chr3:62656984-62657003	MsG0380014930.01.T01:CDS	35.0%
	AAGATGGATCCAACTCATGA+TGG	+	Chr3:62657093-62657112	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
	AGATGTTTGATGAAATGCCG+AGG	+	Chr3:62656368-62656387	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
	ATGTGAGTGAGTATGCTAAG+AGG	+	Chr3:62656245-62656264	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
	CATGAAACAACATCTCTCCT+CGG	-	Chr3:62656388-62656407	None:intergenic	40.0%
	CATGATCATGTGGTTAAGCT+TGG	+	Chr3:62656163-62656182	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
	CTCCAACCTGCAACTTTAAT+GGG	-	Chr3:62657207-62657226	None:intergenic	40.0%
	GATTCATGGGTTTGTGGAAA+TGG	+	Chr3:62657044-62657063	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
	GTGGAAATGGGAGAAAAGAT+TGG	+	Chr3:62657057-62657076	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
	GTTTCGTGAGTTTATACGTG+AGG	+	Chr3:62656768-62656787	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
	TGCGGGATTAATAGATGAAG+CGG	+	Chr3:62656951-62656970	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
	TGTGAGTGAGTATGCTAAGA+GGG	+	Chr3:62656246-62656265	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
	TTAAATGCTTGTAGTAGGGC+TGG	+	Chr3:62656826-62656845	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
	TTCCCATTAAAGTTGCAGGT+TGG	+	Chr3:62657202-62657221	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
!	GAATTCTATGTTGGCTGGTT+TGG	+	Chr3:62656315-62656334	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
!	GACTGTTATGATTTGTGGGT+TGG	+	Chr3:62656711-62656730	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
!	GCTACACAGGTAAGATGTTT+TGG	-	Chr3:62657354-62657373	None:intergenic	40.0%
!	GTTTGATGGAATGATGGAGA+GGG	+	Chr3:62656675-62656694	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
!	TGTTGCTATTGGAACTGCTT+TGG	+	Chr3:62656606-62656625	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
!	TGTTTGATGGAATGATGGAG+AGG	+	Chr3:62656674-62656693	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
!!	AGAGTTCATCGATTTGTAGC+AGG	+	Chr3:62657246-62657265	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
!!	AGTGCTTTAGGTTGATGAGA+GGG	+	Chr3:62656461-62656480	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
!!	AGTTCATCGATTTGTAGCAG+GGG	+	Chr3:62657248-62657267	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
!!	GAGTTCATCGATTTGTAGCA+GGG	+	Chr3:62657247-62657266	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
!!	TCAGTTGGGTTTGTTAAGGT+GGG	+	Chr3:62656537-62656556	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
!!	TTTAGGTTGATGAGAGGGAA+GGG	+	Chr3:62656466-62656485	MsG0380014930.01.T01:CDS	40.0%
	ACATTGTTTCCCTTTCGTGC+AGG	-	Chr3:62656116-62656135	None:intergenic	45.0%
	ACGTGGAATTCTATGTTGGC+TGG	+	Chr3:62656310-62656329	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
	AGCGTTCCCATTAAAGTTGC+AGG	+	Chr3:62657198-62657217	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
	AGGTTGGAGCTTGATTGAAG+TGG	+	Chr3:62657218-62657237	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
	AGTAGTGTTGCCCACATTAC+AGG	-	Chr3:62657012-62657031	None:intergenic	45.0%
	GCTCCAACCTGCAACTTTAA+TGG	-	Chr3:62657208-62657227	None:intergenic	45.0%
	GGATGGTTATGGTATTCCAG+CGG	+	Chr3:62656888-62656907	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
	GGTCATTATGTGCAGTTAGC+TGG	+	Chr3:62657114-62657133	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
	GGTTACGATGCTTTCTGCTT+CGG	+	Chr3:62656513-62656532	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
	TGAACCGGATCCTGTAATGT+GGG	+	Chr3:62656999-62657018	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
	TGGGAAATTGGAAGATGGGT+TGG	+	Chr3:62656438-62656457	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
	TGTGGTTAAGCTTGGTTACG+CGG	+	Chr3:62656171-62656190	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
	TTATGGTATTCCAGCGGAGA+TGG	+	Chr3:62656894-62656913	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
	TTGAACCGGATCCTGTAATG+TGG	+	Chr3:62656998-62657017	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
!	GAATGATGGAGAGGGATGTT+TGG	+	Chr3:62656683-62656702	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
!	GAGTCGAGAGGTTTGTTTGA+TGG	+	Chr3:62656661-62656680	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
!!	AAGATGGGTTGGAGTGCTTT+AGG	+	Chr3:62656449-62656468	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
!!	AGTTGGGTTTGTTAAGGTGG+GGG	+	Chr3:62656539-62656558	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
!!	CAGTTGGGTTTGTTAAGGTG+GGG	+	Chr3:62656538-62656557	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
!!	CGAGGAGAGATGTTGTTTCA+TGG	+	Chr3:62656386-62656405	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
!!	CTATGTTGGCTGGTTTGGTT+AGG	+	Chr3:62656320-62656339	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
!!	CTCAGTTGGGTTTGTTAAGG+TGG	+	Chr3:62656536-62656555	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
!!	CTTTAGGTTGATGAGAGGGA+AGG	+	Chr3:62656465-62656484	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
!!	GAGTGCTTTAGGTTGATGAG+AGG	+	Chr3:62656460-62656479	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
!!	GTATGCTAAGAGGGTGTTTG+AGG	+	Chr3:62656255-62656274	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
!!	GTTTGAGGAAGAGGTTGATG+AGG	+	Chr3:62656270-62656289	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
!!	TAAGAGGGTGTTTGAGGAAG+AGG	+	Chr3:62656261-62656280	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
!!	TTGGCTGGTTTGGTTAGGAA+AGG	+	Chr3:62656325-62656344	MsG0380014930.01.T01:CDS	45.0%
	CTTTCTGCTTCGGCTCAGTT+GGG	+	Chr3:62656523-62656542	MsG0380014930.01.T01:CDS	50.0%
	GAAAGGCGAGGTGAAAGATG+CGG	+	Chr3:62656342-62656361	MsG0380014930.01.T01:CDS	50.0%
	GGACTGAGGATAACTGAAGC+TGG	+	Chr3:62657321-62657340	MsG0380014930.01.T01:CDS	50.0%
	GGGTGTATTGAAGAGTCGAG+AGG	+	Chr3:62656649-62656668	MsG0380014930.01.T01:CDS	50.0%
	GGTTGATCTCTTTGCTCGTG+CGG	+	Chr3:62656933-62656952	MsG0380014930.01.T01:CDS	50.0%
	GTGGTTAAGCTTGGTTACGC+GGG	+	Chr3:62656172-62656191	MsG0380014930.01.T01:CDS	50.0%
	GTTGATCTCTTTGCTCGTGC+GGG	+	Chr3:62656934-62656953	MsG0380014930.01.T01:CDS	50.0%
	GTTGCCCACATTACAGGATC+CGG	-	Chr3:62657006-62657025	None:intergenic	50.0%
	TGGAGAGGGATGTTTGGACT+TGG	+	Chr3:62656689-62656708	MsG0380014930.01.T01:CDS	50.0%
!!	AGGGCTGGTTTGGTTAGTGA+GGG	+	Chr3:62656841-62656860	MsG0380014930.01.T01:CDS	50.0%
!!	CGGCTCAGTTGGGTTTGTTA+AGG	+	Chr3:62656533-62656552	MsG0380014930.01.T01:CDS	50.0%
!!	CTGGTTTGGTTAGTGAGGGA+AGG	+	Chr3:62656845-62656864	MsG0380014930.01.T01:CDS	50.0%
!!	TAGGGCTGGTTTGGTTAGTG+AGG	+	Chr3:62656840-62656859	MsG0380014930.01.T01:CDS	50.0%
!!	TGCTTGTAGTAGGGCTGGTT+TGG	+	Chr3:62656831-62656850	MsG0380014930.01.T01:CDS	50.0%
!!	TGGTTTGGTTAGGAAAGGCG+AGG	+	Chr3:62656330-62656349	MsG0380014930.01.T01:CDS	50.0%
	GCTTTCTGCTTCGGCTCAGT+TGG	+	Chr3:62656522-62656541	MsG0380014930.01.T01:CDS	55.0%
	GGCTTCGCATGATCGTGCAA+TGG	+	Chr3:62656732-62656751	MsG0380014930.01.T01:CDS	55.0%
	TCCTTCACGCCTGCACGAAA+GGG	+	Chr3:62656104-62656123	MsG0380014930.01.T01:CDS	55.0%
!	CAGCGGAGATGGAGCACTAT+GGG	+	Chr3:62656905-62656924	MsG0380014930.01.T01:CDS	55.0%
!	GATGGAGCACTATGGGTGCA+TGG	+	Chr3:62656912-62656931	MsG0380014930.01.T01:CDS	55.0%
!!	TGGGTTTGTTAAGGTGGGGG+AGG	+	Chr3:62656542-62656561	MsG0380014930.01.T01:CDS	55.0%
	CCATAGTGCTCCATCTCCGC+TGG	-	Chr3:62656907-62656926	None:intergenic	60.0%
	CTCCTTCACGCCTGCACGAA+AGG	+	Chr3:62656103-62656122	MsG0380014930.01.T01:CDS	60.0%
	CTTTCGTGCAGGCGTGAAGG+AGG	-	Chr3:62656105-62656124	None:intergenic	60.0%
	TCCCTTTCGTGCAGGCGTGA+AGG	-	Chr3:62656108-62656127	None:intergenic	60.0%
!	CCAGCGGAGATGGAGCACTA+TGG	+	Chr3:62656904-62656923	MsG0380014930.01.T01:CDS	60.0%
	CGTGCAGGCGTGAAGGAGGA+AGG	-	Chr3:62656101-62656120	None:intergenic	65.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
Chr3	gene	62656058	62657377	62656058	ID=MsG0380014930.01;Name=MsG0380014930.01
Chr3	mRNA	62656058	62657377	62656058	ID=MsG0380014930.01.T01;Parent=MsG0380014930.01;Name=MsG0380014930.01.T01;_AED=0.38;_eAED=0.38;_QI=0\|-1\|0\|1\|-1\|1\|1\|0\|439
Chr3	exon	62656058	62657377	62656058	ID=MsG0380014930.01.T01:exon:29512;Parent=MsG0380014930.01.T01
Chr3	CDS	62656058	62657377	62656058	ID=MsG0380014930.01.T01:cds;Parent=MsG0380014930.01.T01

Gene Sequence

>MsG0380014930.01.T01

ATGCGACGTCGTTTACTTAACGCTAATCAACACACATTCACCTTCCTCCTTCACGCCTGCACGAAAGGGAAACAATGTTTCAATATTGTTTCAGGTGTTCAAGTTCATGATCATGTGGTTAAGCTTGGTTACGCGGGCAATGTGTTTGTTCGTAACGCGCTTATTCATTTTTACTTTGAGGGTTTTGATGTGAGTGAGTATGCTAAGAGGGTGTTTGAGGAAGAGGTTGATGAGGTTTGTAGTGATGTTGTTACGTGGAATTCTATGTTGGCTGGTTTGGTTAGGAAAGGCGAGGTGAAAGATGCGGAGAAGATGTTTGATGAAATGCCGAGGAGAGATGTTGTTTCATGGAGTAGTATGATAATGGGTTATGTTCAAAATGGGAAATTGGAAGATGGGTTGGAGTGCTTTAGGTTGATGAGAGGGAAGGGAATAAGACCGAATGAATCTATTTTGGTTACGATGCTTTCTGCTTCGGCTCAGTTGGGTTTGTTAAGGTGGGGGAGGTTTGTTCATTCAACTATTGATTCTTTGAGGTTTCGGATAAGTGTTGCTATTGGAACTGCTTTGGTTGATATGTATTCGAAATGTGGGTGTATTGAAGAGTCGAGAGGTTTGTTTGATGGAATGATGGAGAGGGATGTTTGGACTTGGACTGTTATGATTTGTGGGTTGGCTTCGCATGATCGTGCAATGGAAGCGCTTGTGTTGTTTCGTGAGTTTATACGTGAGGGTTTTAGTCCTGTGAATGTGATTTTTGTTGGTGTTTTAAATGCTTGTAGTAGGGCTGGTTTGGTTAGTGAGGGAAGGTATTACTTTAAGTTAATGGTGGATGGTTATGGTATTCCAGCGGAGATGGAGCACTATGGGTGCATGGTTGATCTCTTTGCTCGTGCGGGATTAATAGATGAAGCGGTTCGGTTGATTGAAACAATGAGTGTTGAACCGGATCCTGTAATGTGGGCAACACTACTTGATGCTTGTAAGATTCATGGGTTTGTGGAAATGGGAGAAAAGATTGGGAATAAGTTGATAAAGATGGATCCAACTCATGATGGTCATTATGTGCAGTTAGCTGGAATCTATGCAAAATCAAGAAAATGGGATGATGTAGTTAGAGTTCGCAGATTAATGGTTGAGAGCGTTCCCATTAAAGTTGCAGGTTGGAGCTTGATTGAAGTGGATGATAGAGTTCATCGATTTGTAGCAGGGGACAGAGATCATGACCATTCTTCAGACATTTACAAAATGCTTGAAATAATAGGACTGAGGATAACTGAAGCTGGTTACTTGCCAAAACATCTTACCTGTGTAGCATGA

Protein sequence

>MsG0380014930.01.T01

MRRRLLNANQHTFTFLLHACTKGKQCFNIVSGVQVHDHVVKLGYAGNVFVRNALIHFYFEGFDVSEYAKRVFEEEVDEVCSDVVTWNSMLAGLVRKGEVKDAEKMFDEMPRRDVVSWSSMIMGYVQNGKLEDGLECFRLMRGKGIRPNESILVTMLSASAQLGLLRWGRFVHSTIDSLRFRISVAIGTALVDMYSKCGCIEESRGLFDGMMERDVWTWTVMICGLASHDRAMEALVLFREFIREGFSPVNVIFVGVLNACSRAGLVSEGRYYFKLMVDGYGIPAEMEHYGCMVDLFARAGLIDEAVRLIETMSVEPDPVMWATLLDACKIHGFVEMGEKIGNKLIKMDPTHDGHYVQLAGIYAKSRKWDDVVRVRRLMVESVPIKVAGWSLIEVDDRVHRFVAGDRDHDHSSDIYKMLEIIGLRITEAGYLPKHLTCVA*