AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180001513.01


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MsG0180001513.01.T01 AT1G58848 26.763 553 312 24 138 623 352 878 7.96e-26 115
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MsG0180001513.01.T01 AT1G12210 27.788 529 327 18 138 627 340 852 1.96e-25 114
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MsG0180001513.01.T01 AT1G58390 25.483 569 318 25 128 628 342 872 2.12e-23 107
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MsG0180001513.01.T01 AT1G61190 27.190 548 300 22 137 623 336 845 4.01e-23 106
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MsG0180001513.01.T01 AT5G43470 25.664 565 320 24 135 633 349 879 2.90e-21 100
MsG0180001513.01.T01 AT5G43470 25.664 565 320 24 135 633 349 879 2.90e-21 100
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MsG0180001513.01.T01 AT1G12290 28.947 266 172 7 138 389 297 559 1.07e-20 98.6
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MsG0180001513.01.T01 AT1G10920 26.463 393 234 13 135 502 228 590 1.12e-17 88.6
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MsG0180001513.01.T01 AT5G43730 28.623 276 166 10 137 393 334 597 2.20e-16 84.7
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MsG0180001513.01.T01 AT1G12280 25.887 282 172 7 138 413 302 552 7.88e-14 76.3
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MsG0180001513.01.T01 AT5G11250 24.041 678 375 26 133 726 418 1039 1.51e-13 75.5
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MsG0180001513.01.T01 AT1G27180 26.346 520 262 22 360 831 921 1367 6.91e-12 70.5
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MsG0180001513.01.T01 AT1G27180 26.346 520 262 22 360 831 583 1029 1.08e-11 69.7
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Find 180 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 258 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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CTATCAAGTGGGTAGTCTTT+TGG 0.217847 1:+22432646 None:intergenic
ATAGAAATTGTTTGTAATTT+GGG 0.219954 1:+22430770 None:intergenic
ACAAAATTTCTTATCTATAA+TGG 0.235064 1:-22432269 MsG0180001513.01.T01:CDS
GAAAGTGATGACTCGCTTAA+AGG 0.246242 1:-22431738 MsG0180001513.01.T01:intron
TTGGAGGGTTGAGGGGTTAT+AGG 0.248553 1:+22430928 None:intergenic
CCCTTCCTCTCTAAAGTTAC+TGG 0.264053 1:-22430405 MsG0180001513.01.T01:CDS
ACCGGATTCAGTTGGCAATT+TGG 0.265629 1:-22432170 MsG0180001513.01.T01:CDS
TCCTACCCATTGAATACTAT+TGG 0.268643 1:-22432294 MsG0180001513.01.T01:CDS
AGTCAATGTTCAATCTCTTT+AGG 0.277338 1:+22431679 None:intergenic
ACTTAAGTCAATTTCTTCTA+TGG 0.280439 1:+22431281 None:intergenic
ATCTGTCACTTCAAAATTAT+GGG 0.286517 1:-22433027 MsG0180001513.01.T01:CDS
GACAGAAACACCAAGGAAAT+TGG 0.299750 1:+22430617 None:intergenic
GACAGATTCAAGAAGAGTTT+TGG 0.309064 1:+22433043 None:intergenic
CAATTCTGAAAAGCGACTTA+TGG 0.323964 1:-22432765 MsG0180001513.01.T01:CDS
TCATACCTTTCTTCTAAAAC+AGG 0.326748 1:+22430368 None:intergenic
CAAAAGACTACCCACTTGAT+AGG 0.338754 1:-22432645 MsG0180001513.01.T01:CDS
TCCAATATGTTCTGGCAATT+CGG 0.339140 1:+22432036 None:intergenic
GATTTAGCTACAGTCGTATC+TGG 0.342301 1:-22432448 MsG0180001513.01.T01:CDS
TTGAAAGATAAGTAAGGCTT+TGG 0.343794 1:+22430699 None:intergenic
TCAAATGAGAGGGGAGATAT+TGG 0.343900 1:+22432698 None:intergenic
CATAGTGCAAACTCTAGTTT+TGG 0.344822 1:+22430812 None:intergenic
TTCAATCTCTTTAGGTCTGT+TGG 0.345091 1:+22431687 None:intergenic
TCAATCTCTTTAGGTCTGTT+GGG 0.349437 1:+22431688 None:intergenic
TCTGAAATGAAATGCTTAGA+TGG 0.354345 1:-22430581 MsG0180001513.01.T01:CDS
TCCGTTGAGGTAGTGATATA+AGG 0.355438 1:+22430879 None:intergenic
AAAAGGTTGAAAGGAAGAAT+TGG 0.371394 1:+22431455 None:intergenic
GAGGAAGGGAGATTGTGTTC+TGG 0.376095 1:+22430419 None:intergenic
TATAACAGGTATGTCGATAT+TGG 0.376838 1:-22431520 MsG0180001513.01.T01:CDS
GGCAAATGTCCCCTCAGTTC+AGG 0.377413 1:+22431318 None:intergenic
ATTAACTTTCCAATATGTTC+TGG 0.378806 1:+22432028 None:intergenic
ATGAAATGCTTAGATGGAAA+TGG 0.379062 1:-22430575 MsG0180001513.01.T01:CDS
TCAAGTTCAACAATTTGCTT+TGG 0.382433 1:+22431959 None:intergenic
TATCTGGAAAGAGTTGTTAC+AGG 0.385078 1:-22432432 MsG0180001513.01.T01:CDS
CTCAAGGACCTACGTATAAC+AGG 0.389558 1:-22431534 MsG0180001513.01.T01:CDS
TGAAGAATCTCCCAACCAAT+TGG 0.391436 1:+22431635 None:intergenic
CAACAACTGAATGGTGATTC+CGG 0.391847 1:-22432505 MsG0180001513.01.T01:CDS
ACCGAATTGCCAGAACATAT+TGG 0.399536 1:-22432037 MsG0180001513.01.T01:CDS
TTGTTTCCAATAGTATTCAA+TGG 0.406985 1:+22432288 None:intergenic
AAAATGAGAGAGGGGAGAAT+TGG 0.412263 1:-22430346 MsG0180001513.01.T01:CDS
AGGAAACAAGCCATCTTGTA+AGG 0.413358 1:+22431377 None:intergenic
ACCAAATTGCCAACTGAATC+CGG 0.415683 1:+22432169 None:intergenic
GAGATACAAACTTTCAAGAT+TGG 0.418028 1:+22430844 None:intergenic
AATTTGAGAACATGTCAAAT+TGG 0.419006 1:-22431413 MsG0180001513.01.T01:CDS
GTGGGACAAGCTTTCCCAAT+TGG 0.420444 1:-22431650 MsG0180001513.01.T01:CDS
AATGGTGATATTACTATAGT+TGG 0.430660 1:+22432195 None:intergenic
AAAGTGATGACTCGCTTAAA+GGG 0.432255 1:-22431737 MsG0180001513.01.T01:intron
GATGCCGCCATTAATTGAAT+GGG 0.433794 1:-22430726 MsG0180001513.01.T01:CDS
TAGAAGAAATTGACTTAAGT+TGG 0.433951 1:-22431278 MsG0180001513.01.T01:CDS
CACTCTCAAGCCACGACCAT+TGG 0.435487 1:+22431160 None:intergenic
ACAAGCTTTCCCAATTGGTT+GGG 0.435524 1:-22431645 MsG0180001513.01.T01:CDS
GCAATTGCTGCCAATTTCCT+TGG 0.442679 1:-22430627 MsG0180001513.01.T01:CDS
CAATCTCTTTAGGTCTGTTG+GGG 0.446723 1:+22431689 None:intergenic
CCCAGTAACTTTAGAGAGGA+AGG 0.447588 1:+22430404 None:intergenic
ACAATTGGTCCAGAGTTCTA+TGG 0.453741 1:-22431495 MsG0180001513.01.T01:CDS
AACACTGGCAATAACAATAT+AGG 0.456844 1:-22433206 MsG0180001513.01.T01:CDS
CCAGAGTTCTATGGCATAGT+TGG 0.458294 1:-22431486 MsG0180001513.01.T01:CDS
AGATGCCGCCATTAATTGAA+TGG 0.458622 1:-22430727 MsG0180001513.01.T01:CDS
TTGTCATTTATTTCTATCAC+AGG 0.460393 1:+22430305 None:intergenic
TGAAATGCTTAGATGGAAAT+GGG 0.463571 1:-22430574 MsG0180001513.01.T01:CDS
TAGAGGTTGCATGTTGTGTC+AGG 0.464749 1:+22432100 None:intergenic
TATTGTTAACACCTTGTTGA+AGG 0.464828 1:-22430651 MsG0180001513.01.T01:CDS
CAACACCACCTGCTCTGCAT+TGG 0.465485 1:-22431239 MsG0180001513.01.T01:CDS
CATTAACTACTGAACTTGAA+GGG 0.466517 1:+22433294 None:intergenic
GAGGAGAGCCAATGCAGAGC+AGG 0.477369 1:+22431231 None:intergenic
GAAGAATCTCCCAACCAATT+GGG 0.479721 1:+22431636 None:intergenic
TGAGCACCATGCTAAAATCA+AGG 0.480614 1:+22432066 None:intergenic
CCGTTGAGGTAGTGATATAA+GGG 0.480768 1:+22430880 None:intergenic
CTCTACTGAAGGATATTTCA+AGG 0.481610 1:-22431128 MsG0180001513.01.T01:CDS
TTTCTTCTATGGAAGAAAGA+TGG 0.482775 1:+22431292 None:intergenic
ATCAACCGCTTCCTATCAAG+TGG 0.484284 1:+22432634 None:intergenic
GACAAGCTTTCCCAATTGGT+TGG 0.485297 1:-22431646 MsG0180001513.01.T01:CDS
ATAGTAGGCAAGCAAAATGT+TGG 0.486424 1:-22431911 MsG0180001513.01.T01:CDS
GCACAACATAAAGATATCCT+TGG 0.488450 1:-22433353 MsG0180001513.01.T01:CDS
TTCTCAAGGCGAAATATCAA+TGG 0.488983 1:-22432578 MsG0180001513.01.T01:CDS
CCTTCCTCTCTAAAGTTACT+GGG 0.489199 1:-22430404 MsG0180001513.01.T01:CDS
CATGACAAACTTTGGTCCTC+CGG 0.495424 1:+22432486 None:intergenic
AGAGCTTTAAGGCAAGGAAA+AGG 0.496021 1:+22431357 None:intergenic
ACATGTCAAATTGGAAGGAA+TGG 0.500946 1:-22431404 MsG0180001513.01.T01:CDS
AACACTTCGATCTCAGAGCC+TGG 0.504399 1:-22433103 MsG0180001513.01.T01:CDS
GCCAACTGAATCCGGTAGAA+TGG 0.507479 1:+22432177 None:intergenic
TGCCCAAACCTAGAGGCAAT+TGG 0.508730 1:-22432883 MsG0180001513.01.T01:intron
TACTTGTCTGATCGATATCA+AGG 0.509037 1:+22431993 None:intergenic
TGTTTCCAATAGTATTCAAT+GGG 0.512150 1:+22432289 None:intergenic
TCTCAAATTGCAACATCTCA+AGG 0.513928 1:+22431427 None:intergenic
ATGTCGATATTGGAGACAAT+TGG 0.514773 1:-22431510 MsG0180001513.01.T01:CDS
TGGTAACTCAAAAGCAAAGC+AGG 0.516365 1:+22432718 None:intergenic
TCATTAACTACTGAACTTGA+AGG 0.518118 1:+22433293 None:intergenic
TGAGAACATGTCAAATTGGA+AGG 0.518575 1:-22431409 MsG0180001513.01.T01:CDS
GAAAGGTATGAAAATGAGAG+AGG 0.520241 1:-22430356 MsG0180001513.01.T01:CDS
ATCATCTGATACACAACTCC+AGG 0.523466 1:+22433085 None:intergenic
GGCTTTCTTGAACATTCTCA+AGG 0.524650 1:-22432592 MsG0180001513.01.T01:CDS
AAGTTGGTGTGACCGTCTCT+TGG 0.528451 1:-22431262 MsG0180001513.01.T01:CDS
AACTTCAGAGCTTTAAGGCA+AGG 0.533046 1:+22431351 None:intergenic
GAAATATCAATGGAGGAAGT+AGG 0.534102 1:-22432568 MsG0180001513.01.T01:CDS
AGGTCATGCATGACAAACTT+TGG 0.535985 1:+22432478 None:intergenic
ATTTAATACCCACACTTGGA+AGG 0.545246 1:-22432237 MsG0180001513.01.T01:CDS
TTCTATGGCATAGTTGGAGG+AGG 0.546256 1:-22431480 MsG0180001513.01.T01:CDS
AAAGGTATGAAAATGAGAGA+GGG 0.546762 1:-22430355 MsG0180001513.01.T01:CDS
TAGTAATATCACCATTCTAC+CGG 0.548972 1:-22432188 MsG0180001513.01.T01:CDS
AAGGTATGAAAATGAGAGAG+GGG 0.552434 1:-22430354 MsG0180001513.01.T01:CDS
TCAAGGTTTGCAAGTAGTAG+AGG 0.552715 1:+22432083 None:intergenic
TAAGTGTGAAGGAGCTTGCA+AGG 0.552751 1:-22431886 MsG0180001513.01.T01:intron
AATTGCAACATCTCAAGGGA+TGG 0.554396 1:+22431432 None:intergenic
AAAATCAAGTGTTTCAAGAG+AGG 0.554968 1:+22430538 None:intergenic
CCAACTATGCCATAGAACTC+TGG 0.556261 1:+22431486 None:intergenic
GAGTTCTATGGCATAGTTGG+AGG 0.556676 1:-22431483 MsG0180001513.01.T01:CDS
TCATTAATTCAACAACTGAA+TGG 0.559514 1:-22432514 MsG0180001513.01.T01:CDS
GAGAGCCAATGCAGAGCAGG+TGG 0.560660 1:+22431234 None:intergenic
GAAATTGTTTGTAATTTGGG+AGG 0.560791 1:+22430773 None:intergenic
TGTGTGACAGTTCCACCACT+TGG 0.562590 1:-22431570 MsG0180001513.01.T01:CDS
ATTAACTACTGAACTTGAAG+GGG 0.564359 1:+22433295 None:intergenic
GTTAATGAATCTGTCATGGT+TGG 0.565586 1:-22433278 MsG0180001513.01.T01:CDS
CTGAAAAGTTCCAATGGTCG+TGG 0.565763 1:-22431170 MsG0180001513.01.T01:CDS
TGGTGGTGATGTCTCTGAAA+AGG 0.566079 1:-22432401 MsG0180001513.01.T01:CDS
TTGAACATTGACTTGTACGG+TGG 0.566100 1:-22431669 MsG0180001513.01.T01:CDS
AAATGTTGGTTTAAGTGTGA+AGG 0.566331 1:-22431897 MsG0180001513.01.T01:CDS
AAATTTCTTATCTATAATGG+TGG 0.568883 1:-22432266 MsG0180001513.01.T01:CDS
AACATCTCAAGGGATGGAAA+AGG 0.570214 1:+22431438 None:intergenic
ATACGTAGGTCCTTGAGATA+AGG 0.570634 1:+22431540 None:intergenic
ATACAAGTGTCCTGAACTGA+GGG 0.571811 1:-22431328 MsG0180001513.01.T01:CDS
AGTAGTTAATGAATCTGTCA+TGG 0.572593 1:-22433282 MsG0180001513.01.T01:CDS
TCTATGGAAGAAAGATGGCT+AGG 0.576660 1:+22431297 None:intergenic
CATACCTTTCTTCTAAAACA+GGG 0.580784 1:+22430369 None:intergenic
TGATGACTCGCTTAAAGGGA+AGG 0.581589 1:-22431733 MsG0180001513.01.T01:CDS
CTCAAATTGCAACATCTCAA+GGG 0.583015 1:+22431428 None:intergenic
ACCATTCTACCGGATTCAGT+TGG 0.583295 1:-22432178 MsG0180001513.01.T01:CDS
CCCTTATATCACTACCTCAA+CGG 0.583405 1:-22430880 MsG0180001513.01.T01:CDS
CACACACAACCTTCCAAGTG+TGG 0.587878 1:+22432228 None:intergenic
AATGGGTAGGAAGCTTCTCA+AGG 0.593631 1:+22432306 None:intergenic
CAGCAATTGCTCCTTCAACA+AGG 0.593638 1:+22430640 None:intergenic
GGAAACAAGCCATCTTGTAA+GGG 0.598623 1:+22431378 None:intergenic
ACTACCCACTTGATAGGAAG+CGG 0.598735 1:-22432639 MsG0180001513.01.T01:CDS
GCGTTCAAAGGTAGAAGCAA+AGG 0.599709 1:-22432797 MsG0180001513.01.T01:CDS
TGGACAGCTACCTTATCTCA+AGG 0.599795 1:-22431550 MsG0180001513.01.T01:CDS
AAGGGATGGAAAAGGTTGAA+AGG 0.600123 1:+22431446 None:intergenic
TATATCACTACCTCAACGGA+TGG 0.603077 1:-22430876 MsG0180001513.01.T01:CDS
TAAGGTAGCTGTCCAAGTGG+TGG 0.603183 1:+22431558 None:intergenic
CTAGAGTTTGCACTATGTGA+AGG 0.603569 1:-22430806 MsG0180001513.01.T01:CDS
GAAATATCCTTCAGTAGAGA+CGG 0.605119 1:+22431132 None:intergenic
CAAACTTTCAAGATTGGTGA+GGG 0.605411 1:+22430850 None:intergenic
TCCAATAGTATTCAATGGGT+AGG 0.605867 1:+22432293 None:intergenic
ATTCTACTGAAAAGTTCCAA+TGG 0.606069 1:-22431176 MsG0180001513.01.T01:CDS
TGATTCACCGTCTCTACTGA+AGG 0.609407 1:-22431139 MsG0180001513.01.T01:CDS
TATACAAGTGTCCTGAACTG+AGG 0.610299 1:-22431329 MsG0180001513.01.T01:CDS
CAGGTGGTGTTGCCAAGAGA+CGG 0.611249 1:+22431250 None:intergenic
GAATGGCATCCCTTACAAGA+TGG 0.611692 1:-22431387 MsG0180001513.01.T01:CDS
CCAGTAACTTTAGAGAGGAA+GGG 0.612453 1:+22430405 None:intergenic
GTGAGGGTGTCCATCCGTTG+AGG 0.616163 1:+22430866 None:intergenic
AGATTGAACATTGACTTGTA+CGG 0.616591 1:-22431672 MsG0180001513.01.T01:CDS
ACAAACTTTCAAGATTGGTG+AGG 0.617188 1:+22430849 None:intergenic
ATGCCGCCATTAATTGAATG+GGG 0.619843 1:-22430725 MsG0180001513.01.T01:CDS
TTGCTATCAGAGAGTAACAC+TGG 0.623750 1:-22433221 MsG0180001513.01.T01:CDS
TGAACATTGACTTGTACGGT+GGG 0.624769 1:-22431668 MsG0180001513.01.T01:CDS
GATGATTTAATACCCACACT+TGG 0.633298 1:-22432241 MsG0180001513.01.T01:CDS
TCAAGGCGAAATATCAATGG+AGG 0.635001 1:-22432575 MsG0180001513.01.T01:CDS
AATGCCCAGTAACTTTAGAG+AGG 0.637553 1:+22430400 None:intergenic
AATCTCTTTAGGTCTGTTGG+GGG 0.637819 1:+22431690 None:intergenic
AAGATTGCAAGAAAGTGTGG+TGG 0.646042 1:-22432856 MsG0180001513.01.T01:CDS
ACACACAACCTTCCAAGTGT+GGG 0.649557 1:+22432229 None:intergenic
AGAAAGATTGCAAGAAAGTG+TGG 0.654425 1:-22432859 MsG0180001513.01.T01:CDS
ACAACTTGAGTCCTTGTCAG+AGG 0.656536 1:-22430504 MsG0180001513.01.T01:CDS
TGTTACAGGCTTGAATGTGG+TGG 0.660671 1:-22432418 MsG0180001513.01.T01:CDS
AGGTAACATGACCTCTGACA+AGG 0.666258 1:+22430493 None:intergenic
AAACCCCATTCAATTAATGG+CGG 0.677087 1:+22430722 None:intergenic
CTGTAGCTAAATCATTGACA+AGG 0.677106 1:+22432458 None:intergenic
CAAAGGTAGAAGCAAAGGAG+TGG 0.680247 1:-22432792 MsG0180001513.01.T01:CDS
ACTTATTGACAGAAACACCA+AGG 0.681052 1:+22430610 None:intergenic
TCAACCGCTTCCTATCAAGT+GGG 0.688218 1:+22432635 None:intergenic
CAAGTGTTTCAAGAGAGGAG+AGG 0.688679 1:+22430543 None:intergenic
AGTTGTTACAGGCTTGAATG+TGG 0.698110 1:-22432421 MsG0180001513.01.T01:CDS
AGATAAGGTAGCTGTCCAAG+TGG 0.708526 1:+22431555 None:intergenic
TCGACATACCTGTTATACGT+AGG 0.715052 1:+22431526 None:intergenic
CAACTGAATGGTGATTCCGG+AGG 0.742171 1:-22432502 MsG0180001513.01.T01:CDS
TACAAGTGTCCTGAACTGAG+GGG 0.768153 1:-22431327 MsG0180001513.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATAGAAATTGTTTGTAATT+TGG + Chr1:22432912-22432931 None:intergenic 15.0%
!! ACAAAATTTCTTATCTATAA+TGG - Chr1:22431409-22431428 MsG0180001513.01.T01:CDS 15.0%
!! ATAAAAAATATAGATATCTC+TGG - Chr1:22432471-22432490 MsG0180001513.01.T01:CDS 15.0%
!! ATAGAAATTGTTTGTAATTT+GGG + Chr1:22432911-22432930 None:intergenic 15.0%
!! TGAATTAATGAAAAATTTGA+GGG - Chr1:22430702-22430721 MsG0180001513.01.T01:CDS 15.0%
!! TTGAATTAATGAAAAATTTG+AGG - Chr1:22430701-22430720 MsG0180001513.01.T01:CDS 15.0%
!!! GATATCTATATTTTTTATTG+AGG + Chr1:22432469-22432488 None:intergenic 15.0%
!! AAATTTCTTATCTATAATGG+TGG - Chr1:22431412-22431431 MsG0180001513.01.T01:CDS 20.0%
!! GAATGACAATTATAATGATT+GGG - Chr1:22430759-22430778 MsG0180001513.01.T01:CDS 20.0%
!! TGAAGAGAAAAAAAATATTG+AGG - Chr1:22431894-22431913 MsG0180001513.01.T01:CDS 20.0%
!!! ACAATTTTGAAAGATAAGTA+AGG + Chr1:22432988-22433007 None:intergenic 20.0%
!!! ACTTTAACTGTTTTTATAGT+AGG - Chr1:22431752-22431771 MsG0180001513.01.T01:intron 20.0%
!!! ATGAAAATACACAAAGTTTT+TGG + Chr1:22432772-22432791 None:intergenic 20.0%
!!! CAAAAGATTTTTGATTGTTT+TGG - Chr1:22430726-22430745 MsG0180001513.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTTTTTTTCTCTTCAAGT+TGG + Chr1:22431891-22431910 None:intergenic 20.0%
! AATGGTGATATTACTATAGT+TGG + Chr1:22431486-22431505 None:intergenic 25.0%
! AATTTGAGAACATGTCAAAT+TGG - Chr1:22432265-22432284 MsG0180001513.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTAAGTCAATTTCTTCTA+TGG + Chr1:22432400-22432419 None:intergenic 25.0%
! ATTAACTTTCCAATATGTTC+TGG + Chr1:22431653-22431672 None:intergenic 25.0%
! GGAATGACAATTATAATGAT+TGG - Chr1:22430758-22430777 MsG0180001513.01.T01:CDS 25.0%
! TCATTAATTCAACAACTGAA+TGG - Chr1:22431164-22431183 MsG0180001513.01.T01:CDS 25.0%
! TGTTTCCAATAGTATTCAAT+GGG + Chr1:22431392-22431411 None:intergenic 25.0%
! TTGTTTCCAATAGTATTCAA+TGG + Chr1:22431393-22431412 None:intergenic 25.0%
!! AAAACATCTTTTCAAATGAG+AGG + Chr1:22430994-22431013 None:intergenic 25.0%
!! AAACATCTTTTCAAATGAGA+GGG + Chr1:22430993-22431012 None:intergenic 25.0%
!! AATCTGTCACTTCAAAATTA+TGG - Chr1:22430650-22430669 MsG0180001513.01.T01:CDS 25.0%
!! ATCTGTCACTTCAAAATTAT+GGG - Chr1:22430651-22430670 MsG0180001513.01.T01:CDS 25.0%
!! TAGAAGAAATTGACTTAAGT+TGG - Chr1:22432400-22432419 MsG0180001513.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAAATAAAGTGTTTTGAGAG+AGG + Chr1:22433212-22433231 None:intergenic 25.0%
!!! AAAATACACAAAGTTTTTGG+AGG + Chr1:22432769-22432788 None:intergenic 25.0%
!!! AAATACACAAAGTTTTTGGA+GGG + Chr1:22432768-22432787 None:intergenic 25.0%
!!! TGAACTTTCTGAAACAAAAA+TGG + Chr1:22432729-22432748 None:intergenic 25.0%
!!! TTGTCATTTATTTCTATCAC+AGG + Chr1:22433376-22433395 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTGGAAATATAGAACAGT+AGG + Chr1:22431018-22431037 None:intergenic 25.0%
AAAAGGTTGAAAGGAAGAAT+TGG + Chr1:22432226-22432245 None:intergenic 30.0%
AAAATCAAGTGTTTCAAGAG+AGG + Chr1:22433143-22433162 None:intergenic 30.0%
AACACTGGCAATAACAATAT+AGG - Chr1:22430472-22430491 MsG0180001513.01.T01:CDS 30.0%
AACCATTAATGACAAGATCT+TGG + Chr1:22432691-22432710 None:intergenic 30.0%
AGTAGTTAATGAATCTGTCA+TGG - Chr1:22430396-22430415 MsG0180001513.01.T01:CDS 30.0%
AGTCAATGTTCAATCTCTTT+AGG + Chr1:22432002-22432021 None:intergenic 30.0%
ATGAAATGCTTAGATGGAAA+TGG - Chr1:22433103-22433122 MsG0180001513.01.T01:CDS 30.0%
ATTAACTACTGAACTTGAAG+GGG + Chr1:22430386-22430405 None:intergenic 30.0%
ATTCTACTGAAAAGTTCCAA+TGG - Chr1:22432502-22432521 MsG0180001513.01.T01:CDS 30.0%
CATTAACTACTGAACTTGAA+GGG + Chr1:22430387-22430406 None:intergenic 30.0%
CTTGTCATTAATGGTTGTAT+TGG - Chr1:22432695-22432714 MsG0180001513.01.T01:CDS 30.0%
GAAATTGTTTGTAATTTGGG+AGG + Chr1:22432908-22432927 None:intergenic 30.0%
GAGATACAAACTTTCAAGAT+TGG + Chr1:22432837-22432856 None:intergenic 30.0%
TAGTAATATCACCATTCTAC+CGG - Chr1:22431490-22431509 MsG0180001513.01.T01:CDS 30.0%
TATAACAGGTATGTCGATAT+TGG - Chr1:22432158-22432177 MsG0180001513.01.T01:CDS 30.0%
TATTGTTAACACCTTGTTGA+AGG - Chr1:22433027-22433046 MsG0180001513.01.T01:CDS 30.0%
TCATTAACTACTGAACTTGA+AGG + Chr1:22430388-22430407 None:intergenic 30.0%
TGAAATGCTTAGATGGAAAT+GGG - Chr1:22433104-22433123 MsG0180001513.01.T01:CDS 30.0%
TGTATAACTTCAGAGCTTTA+AGG + Chr1:22432335-22432354 None:intergenic 30.0%
TTGAAAGATAAGTAAGGCTT+TGG + Chr1:22432982-22433001 None:intergenic 30.0%
TTTCTTCTATGGAAGAAAGA+TGG + Chr1:22432389-22432408 None:intergenic 30.0%
! AAAGGTATGAAAATGAGAGA+GGG - Chr1:22433323-22433342 MsG0180001513.01.T01:CDS 30.0%
! AACATCTTTTCAAATGAGAG+GGG + Chr1:22430992-22431011 None:intergenic 30.0%
! CAATTTTACTTTGCAAACCA+AGG + Chr1:22430345-22430364 None:intergenic 30.0%
! TCAAGTTCAACAATTTGCTT+TGG + Chr1:22431722-22431741 None:intergenic 30.0%
! TCTGAAATGAAATGCTTAGA+TGG - Chr1:22433097-22433116 MsG0180001513.01.T01:CDS 30.0%
!! AAATGTTGGTTTAAGTGTGA+AGG - Chr1:22431781-22431800 MsG0180001513.01.T01:intron 30.0%
!! AGATTGAACATTGACTTGTA+CGG - Chr1:22432006-22432025 MsG0180001513.01.T01:CDS 30.0%
!! CATACCTTTCTTCTAAAACA+GGG + Chr1:22433312-22433331 None:intergenic 30.0%
!! CTTGGTTTGCAAAGTAAAAT+TGG - Chr1:22430343-22430362 MsG0180001513.01.T01:CDS 30.0%
!! GTTGTTGCAATTTTAGGTAT+GGG - Chr1:22430496-22430515 MsG0180001513.01.T01:CDS 30.0%
!! TCATACCTTTCTTCTAAAAC+AGG + Chr1:22433313-22433332 None:intergenic 30.0%
!!! CTTTTGGAGTTGAATTTAGA+CGG - Chr1:22432617-22432636 MsG0180001513.01.T01:CDS 30.0%
AAACCCCATTCAATTAATGG+CGG + Chr1:22432959-22432978 None:intergenic 35.0%
AAAGTGATGACTCGCTTAAA+GGG - Chr1:22431941-22431960 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
AAGGTATGAAAATGAGAGAG+GGG - Chr1:22433324-22433343 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
ACAAACTTTCAAGATTGGTG+AGG + Chr1:22432832-22432851 None:intergenic 35.0%
ACATGTCAAATTGGAAGGAA+TGG - Chr1:22432274-22432293 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
ACTTATTGACAGAAACACCA+AGG + Chr1:22433071-22433090 None:intergenic 35.0%
AGAAAGATTGCAAGAAAGTG+TGG - Chr1:22430819-22430838 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
ATAGTAGGCAAGCAAAATGT+TGG - Chr1:22431767-22431786 MsG0180001513.01.T01:intron 35.0%
ATGTCGATATTGGAGACAAT+TGG - Chr1:22432168-22432187 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
ATTTAATACCCACACTTGGA+AGG - Chr1:22431441-22431460 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
CAAACTTTCAAGATTGGTGA+GGG + Chr1:22432831-22432850 None:intergenic 35.0%
CTCAAATTGCAACATCTCAA+GGG + Chr1:22432253-22432272 None:intergenic 35.0%
CTCCAAGATCTTGTCATTAA+TGG - Chr1:22432686-22432705 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
CTCTACTGAAGGATATTTCA+AGG - Chr1:22432550-22432569 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
CTGTAGCTAAATCATTGACA+AGG + Chr1:22431223-22431242 None:intergenic 35.0%
GAAATATCAATGGAGGAAGT+AGG - Chr1:22431110-22431129 MsG0180001513.01.T01:intron 35.0%
GAAATATCCTTCAGTAGAGA+CGG + Chr1:22432549-22432568 None:intergenic 35.0%
GATGATTTAATACCCACACT+TGG - Chr1:22431437-22431456 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
GCACAACATAAAGATATCCT+TGG - Chr1:22430325-22430344 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
GTTAATGAATCTGTCATGGT+TGG - Chr1:22430400-22430419 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
TACTTGTCTGATCGATATCA+AGG + Chr1:22431688-22431707 None:intergenic 35.0%
TATCTGGAAAGAGTTGTTAC+AGG - Chr1:22431246-22431265 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
TCAATCTCTTTAGGTCTGTT+GGG + Chr1:22431993-22432012 None:intergenic 35.0%
TCCAATAGTATTCAATGGGT+AGG + Chr1:22431388-22431407 None:intergenic 35.0%
TCCAATATGTTCTGGCAATT+CGG + Chr1:22431645-22431664 None:intergenic 35.0%
TCCTACCCATTGAATACTAT+TGG - Chr1:22431384-22431403 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
TCTCAAATTGCAACATCTCA+AGG + Chr1:22432254-22432273 None:intergenic 35.0%
TGAGAACATGTCAAATTGGA+AGG - Chr1:22432269-22432288 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
TGAGGAATTAACGCTACAAT+GGG - Chr1:22431912-22431931 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
TGGAAACCCCATTCAATTAA+TGG + Chr1:22432962-22432981 None:intergenic 35.0%
TTCAATCTCTTTAGGTCTGT+TGG + Chr1:22431994-22432013 None:intergenic 35.0%
TTCTCAAGGCGAAATATCAA+TGG - Chr1:22431100-22431119 MsG0180001513.01.T01:intron 35.0%
TTGAGGAATTAACGCTACAA+TGG - Chr1:22431911-22431930 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
! CAATTCTGAAAAGCGACTTA+TGG - Chr1:22430913-22430932 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
! CATTAATGGTTGTATTGGTC+TGG - Chr1:22432700-22432719 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
! GAAAGGTATGAAAATGAGAG+AGG - Chr1:22433322-22433341 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
! GACAGATTCAAGAAGAGTTT+TGG + Chr1:22430638-22430657 None:intergenic 35.0%
!! ATAGGCGTTGTTGCAATTTT+AGG - Chr1:22430490-22430509 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
!! CATAGTGCAAACTCTAGTTT+TGG + Chr1:22432869-22432888 None:intergenic 35.0%
!! CGTTGTTGCAATTTTAGGTA+TGG - Chr1:22430495-22430514 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
!! TGCAAACCTTGATTTTAGCA+TGG - Chr1:22431606-22431625 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
!!! AATGCCCTGTTTTAGAAGAA+AGG - Chr1:22433305-22433324 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
!!! CAAACTCTAGTTTTGGAAGA+TGG + Chr1:22432862-22432881 None:intergenic 35.0%
!!! TAAAGTGTTTTGAGAGAGGA+AGG + Chr1:22433208-22433227 None:intergenic 35.0%
!!! TGATTGTTTTGGATGACTTG+TGG - Chr1:22430737-22430756 MsG0180001513.01.T01:CDS 35.0%
AAAATGAGAGAGGGGAGAAT+TGG - Chr1:22433332-22433351 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
AACATCTCAAGGGATGGAAA+AGG + Chr1:22432243-22432262 None:intergenic 40.0%
AAGGGATGGAAAAGGTTGAA+AGG + Chr1:22432235-22432254 None:intergenic 40.0%
AATAACTTCCCCTGTAGCTT+AGG + Chr1:22431821-22431840 None:intergenic 40.0%
AATCTCTTTAGGTCTGTTGG+GGG + Chr1:22431991-22432010 None:intergenic 40.0%
AATTGCAACATCTCAAGGGA+TGG + Chr1:22432249-22432268 None:intergenic 40.0%
ACAAGCTTTCCCAATTGGTT+GGG - Chr1:22432033-22432052 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
ACAATTGGTCCAGAGTTCTA+TGG - Chr1:22432183-22432202 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
ACCAAATTGCCAACTGAATC+CGG + Chr1:22431512-22431531 None:intergenic 40.0%
ACCGAATTGCCAGAACATAT+TGG - Chr1:22431641-22431660 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
AGATGCCGCCATTAATTGAA+TGG - Chr1:22432951-22432970 MsG0180001513.01.T01:intron 40.0%
AGGAAACAAGCCATCTTGTA+AGG + Chr1:22432304-22432323 None:intergenic 40.0%
AGGTCATGCATGACAAACTT+TGG + Chr1:22431203-22431222 None:intergenic 40.0%
AGTTGTTACAGGCTTGAATG+TGG - Chr1:22431257-22431276 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
ATACAAGTGTCCTGAACTGA+GGG - Chr1:22432350-22432369 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
ATACGTAGGTCCTTGAGATA+AGG + Chr1:22432141-22432160 None:intergenic 40.0%
ATAGCTGCAAAAACACTTGG+GGG - Chr1:22430852-22430871 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
ATCATCTGATACACAACTCC+AGG + Chr1:22430596-22430615 None:intergenic 40.0%
ATGACAAGATCTTGGAGCTT+AGG + Chr1:22432683-22432702 None:intergenic 40.0%
ATGCCGCCATTAATTGAATG+GGG - Chr1:22432953-22432972 MsG0180001513.01.T01:intron 40.0%
CAAAAGACTACCCACTTGAT+AGG - Chr1:22431033-22431052 MsG0180001513.01.T01:intron 40.0%
CAACAACTGAATGGTGATTC+CGG - Chr1:22431173-22431192 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
CAATCTCTTTAGGTCTGTTG+GGG + Chr1:22431992-22432011 None:intergenic 40.0%
CATAGCTGCAAAAACACTTG+GGG - Chr1:22430851-22430870 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
CCATAGCTGCAAAAACACTT+GGG - Chr1:22430850-22430869 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
CCCTTATATCACTACCTCAA+CGG - Chr1:22432798-22432817 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
CCGTTGAGGTAGTGATATAA+GGG + Chr1:22432801-22432820 None:intergenic 40.0%
CTAGAGTTTGCACTATGTGA+AGG - Chr1:22432872-22432891 MsG0180001513.01.T01:intron 40.0%
GAAAGTGATGACTCGCTTAA+AGG - Chr1:22431940-22431959 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
GAAGAATCTCCCAACCAATT+GGG + Chr1:22432045-22432064 None:intergenic 40.0%
GACAGAAACACCAAGGAAAT+TGG + Chr1:22433064-22433083 None:intergenic 40.0%
GAGGAATTAACGCTACAATG+GGG - Chr1:22431913-22431932 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
GATGCCGCCATTAATTGAAT+GGG - Chr1:22432952-22432971 MsG0180001513.01.T01:intron 40.0%
GATTTAGCTACAGTCGTATC+TGG - Chr1:22431230-22431249 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
GGAAACAAGCCATCTTGTAA+GGG + Chr1:22432303-22432322 None:intergenic 40.0%
GGCTTTCTTGAACATTCTCA+AGG - Chr1:22431086-22431105 MsG0180001513.01.T01:intron 40.0%
TACCAATTGCCTCTAGGTTT+GGG + Chr1:22430800-22430819 None:intergenic 40.0%
TATACAAGTGTCCTGAACTG+AGG - Chr1:22432349-22432368 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
TATATCACTACCTCAACGGA+TGG - Chr1:22432802-22432821 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
TCAAATGAGAGGGGAGATAT+TGG + Chr1:22430983-22431002 None:intergenic 40.0%
TCAAGGCGAAATATCAATGG+AGG - Chr1:22431103-22431122 MsG0180001513.01.T01:intron 40.0%
TCAAGGTTTGCAAGTAGTAG+AGG + Chr1:22431598-22431617 None:intergenic 40.0%
TCCGTTGAGGTAGTGATATA+AGG + Chr1:22432802-22432821 None:intergenic 40.0%
TCGACATACCTGTTATACGT+AGG + Chr1:22432155-22432174 None:intergenic 40.0%
TCTATGGAAGAAAGATGGCT+AGG + Chr1:22432384-22432403 None:intergenic 40.0%
TCTTTCTACCAATTGCCTCT+AGG + Chr1:22430806-22430825 None:intergenic 40.0%
TGAAGAATCTCCCAACCAAT+TGG + Chr1:22432046-22432065 None:intergenic 40.0%
TGAGCACCATGCTAAAATCA+AGG + Chr1:22431615-22431634 None:intergenic 40.0%
TGGTAACTCAAAAGCAAAGC+AGG + Chr1:22430963-22430982 None:intergenic 40.0%
TTGAATTTAGACGGTAGCTG+TGG - Chr1:22432626-22432645 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
TTGCTATCAGAGAGTAACAC+TGG - Chr1:22430457-22430476 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
TTGTAAATGCCCAAACCTAG+AGG - Chr1:22430788-22430807 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
! AAGATTGCAAGAAAGTGTGG+TGG - Chr1:22430822-22430841 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
! AATGCCCAGTAACTTTAGAG+AGG + Chr1:22433281-22433300 None:intergenic 40.0%
! ACGCACAATTTTCGATGCAA+AGG + Chr1:22432086-22432105 None:intergenic 40.0%
! CACAGGAATGTGAGCAATTT+TGG + Chr1:22433359-22433378 None:intergenic 40.0%
! CCAGTAACTTTAGAGAGGAA+GGG + Chr1:22433276-22433295 None:intergenic 40.0%
! CGCACAATTTTCGATGCAAA+GGG + Chr1:22432085-22432104 None:intergenic 40.0%
! CTATCAAGTGGGTAGTCTTT+TGG + Chr1:22431035-22431054 None:intergenic 40.0%
! GAGCAATTACTCATCGCTTT+TGG - Chr1:22432601-22432620 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
!! AAAGTTTTTGGAGGGTTGAG+GGG + Chr1:22432760-22432779 None:intergenic 40.0%
!! AACTTCAGAGCTTTAAGGCA+AGG + Chr1:22432330-22432349 None:intergenic 40.0%
!! ACAAAGTTTTTGGAGGGTTG+AGG + Chr1:22432762-22432781 None:intergenic 40.0%
!! AGAGCTTTAAGGCAAGGAAA+AGG + Chr1:22432324-22432343 None:intergenic 40.0%
!! ATTTTAGGTATGGGAGGTGT+CGG - Chr1:22430505-22430524 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTTTGTTGTGGATGGCTGA+AGG - Chr1:22431065-22431084 MsG0180001513.01.T01:intron 40.0%
!! CAAAGTTTTTGGAGGGTTGA+GGG + Chr1:22432761-22432780 None:intergenic 40.0%
!! CCAAGTGTTTTTGCAGCTAT+GGG + Chr1:22430852-22430871 None:intergenic 40.0%
!! CCTTCCTCTCTAAAGTTACT+GGG - Chr1:22433274-22433293 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGCAATTTTAGGTATGGG+AGG - Chr1:22430499-22430518 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
!! TGAACATTGACTTGTACGGT+GGG - Chr1:22432010-22432029 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGAACATTGACTTGTACGG+TGG - Chr1:22432009-22432028 MsG0180001513.01.T01:CDS 40.0%
!!! ACTCTAGTTTTGGAAGATGG+TGG + Chr1:22432859-22432878 None:intergenic 40.0%
AATGGGTAGGAAGCTTCTCA+AGG + Chr1:22431375-22431394 None:intergenic 45.0%
ACAACTTGAGTCCTTGTCAG+AGG - Chr1:22433174-22433193 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
ACACACAACCTTCCAAGTGT+GGG + Chr1:22431452-22431471 None:intergenic 45.0%
ACCATTCTACCGGATTCAGT+TGG - Chr1:22431500-22431519 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
ACCGGATTCAGTTGGCAATT+TGG - Chr1:22431508-22431527 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
ACTACCCACTTGATAGGAAG+CGG - Chr1:22431039-22431058 MsG0180001513.01.T01:intron 45.0%
AGATAAGGTAGCTGTCCAAG+TGG + Chr1:22432126-22432145 None:intergenic 45.0%
AGCTTAGGAAAACCATCCAG+TGG + Chr1:22432668-22432687 None:intergenic 45.0%
AGGTAACATGACCTCTGACA+AGG + Chr1:22433188-22433207 None:intergenic 45.0%
ATCAACCGCTTCCTATCAAG+TGG + Chr1:22431047-22431066 None:intergenic 45.0%
CAAAGGTAGAAGCAAAGGAG+TGG - Chr1:22430886-22430905 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
CAACGTCAATGACATTCTGC+AGG + Chr1:22431853-22431872 None:intergenic 45.0%
CAAGGTTTCCTAAGCTACAG+GGG - Chr1:22431810-22431829 MsG0180001513.01.T01:intron 45.0%
CAAGTGTTTCAAGAGAGGAG+AGG + Chr1:22433138-22433157 None:intergenic 45.0%
CAGCAATTGCTCCTTCAACA+AGG + Chr1:22433041-22433060 None:intergenic 45.0%
CATGACAAACTTTGGTCCTC+CGG + Chr1:22431195-22431214 None:intergenic 45.0%
CCAACTATGCCATAGAACTC+TGG + Chr1:22432195-22432214 None:intergenic 45.0%
CCAGAGTTCTATGGCATAGT+TGG - Chr1:22432192-22432211 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
CCCATAGCTGCAAAAACACT+TGG - Chr1:22430849-22430868 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
CTACCAATTGCCTCTAGGTT+TGG + Chr1:22430801-22430820 None:intergenic 45.0%
CTCAAGGACCTACGTATAAC+AGG - Chr1:22432144-22432163 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
CTGAAAAGTTCCAATGGTCG+TGG - Chr1:22432508-22432527 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
GAATGGCATCCCTTACAAGA+TGG - Chr1:22432291-22432310 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
GAATGTCATTGACGTTGTGG+AGG - Chr1:22431856-22431875 MsG0180001513.01.T01:intron 45.0%
GACAAGCTTTCCCAATTGGT+TGG - Chr1:22432032-22432051 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
GAGTAATTGCTCCACGTTTC+AGG + Chr1:22432593-22432612 None:intergenic 45.0%
GAGTTCTATGGCATAGTTGG+AGG - Chr1:22432195-22432214 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
GCAAGGTTTCCTAAGCTACA+GGG - Chr1:22431809-22431828 MsG0180001513.01.T01:intron 45.0%
GCAATTGCTGCCAATTTCCT+TGG - Chr1:22433051-22433070 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
GCAGAATGTCATTGACGTTG+TGG - Chr1:22431853-22431872 MsG0180001513.01.T01:intron 45.0%
GCGTTCAAAGGTAGAAGCAA+AGG - Chr1:22430881-22430900 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
GCTTAGGAAAACCATCCAGT+GGG + Chr1:22432667-22432686 None:intergenic 45.0%
TAAGTGTGAAGGAGCTTGCA+AGG - Chr1:22431792-22431811 MsG0180001513.01.T01:intron 45.0%
TAATTGCTCCACGTTTCAGG+AGG + Chr1:22432590-22432609 None:intergenic 45.0%
TACAAGTGTCCTGAACTGAG+GGG - Chr1:22432351-22432370 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
TAGAGGTTGCATGTTGTGTC+AGG + Chr1:22431581-22431600 None:intergenic 45.0%
TCAACCGCTTCCTATCAAGT+GGG + Chr1:22431046-22431065 None:intergenic 45.0%
TGATGACTCGCTTAAAGGGA+AGG - Chr1:22431945-22431964 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
TGATTCACCGTCTCTACTGA+AGG - Chr1:22432539-22432558 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
TGCAAGGTTTCCTAAGCTAC+AGG - Chr1:22431808-22431827 MsG0180001513.01.T01:intron 45.0%
TGGACAGCTACCTTATCTCA+AGG - Chr1:22432128-22432147 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
TGTTACAGGCTTGAATGTGG+TGG - Chr1:22431260-22431279 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
TTCTATGGCATAGTTGGAGG+AGG - Chr1:22432198-22432217 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
! CCCAGTAACTTTAGAGAGGA+AGG + Chr1:22433277-22433296 None:intergenic 45.0%
! TGGTGGTGATGTCTCTGAAA+AGG - Chr1:22431277-22431296 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
!! CCCAAGTGTTTTTGCAGCTA+TGG + Chr1:22430853-22430872 None:intergenic 45.0%
!! CCCTTCCTCTCTAAAGTTAC+TGG - Chr1:22433273-22433292 MsG0180001513.01.T01:CDS 45.0%
!! GCGGTTGATTTTGTTGTGGA+TGG - Chr1:22431058-22431077 MsG0180001513.01.T01:intron 45.0%
!! GGAAGCGGTTGATTTTGTTG+TGG - Chr1:22431054-22431073 MsG0180001513.01.T01:intron 45.0%
AAAACCATCCAGTGGGAAGG+AGG + Chr1:22432660-22432679 None:intergenic 50.0%
AACACTTCGATCTCAGAGCC+TGG - Chr1:22430575-22430594 MsG0180001513.01.T01:CDS 50.0%
AGGAAAACCATCCAGTGGGA+AGG + Chr1:22432663-22432682 None:intergenic 50.0%
CAACTGAATGGTGATTCCGG+AGG - Chr1:22431176-22431195 MsG0180001513.01.T01:CDS 50.0%
CACACACAACCTTCCAAGTG+TGG + Chr1:22431453-22431472 None:intergenic 50.0%
CATTCTTGCCTCCTGAAACG+TGG - Chr1:22432579-22432598 MsG0180001513.01.T01:CDS 50.0%
GAGGAAGGGAGATTGTGTTC+TGG + Chr1:22433262-22433281 None:intergenic 50.0%
GCCAACTGAATCCGGTAGAA+TGG + Chr1:22431504-22431523 None:intergenic 50.0%
GTGGGACAAGCTTTCCCAAT+TGG - Chr1:22432028-22432047 MsG0180001513.01.T01:CDS 50.0%
TAAGGTAGCTGTCCAAGTGG+TGG + Chr1:22432123-22432142 None:intergenic 50.0%
TGCCCAAACCTAGAGGCAAT+TGG - Chr1:22430795-22430814 MsG0180001513.01.T01:CDS 50.0%
TGTGTGACAGTTCCACCACT+TGG - Chr1:22432108-22432127 MsG0180001513.01.T01:CDS 50.0%
TTCACTTTCCTCCTTCCCAC+TGG - Chr1:22432649-22432668 MsG0180001513.01.T01:CDS 50.0%
TTGGAGGGTTGAGGGGTTAT+AGG + Chr1:22432753-22432772 None:intergenic 50.0%
!! AAGTTGGTGTGACCGTCTCT+TGG - Chr1:22432416-22432435 MsG0180001513.01.T01:CDS 50.0%
CAACACCACCTGCTCTGCAT+TGG - Chr1:22432439-22432458 MsG0180001513.01.T01:CDS 55.0%
CACTCTCAAGCCACGACCAT+TGG + Chr1:22432521-22432540 None:intergenic 55.0%
CTTTCCTCCTTCCCACTGGA+TGG - Chr1:22432653-22432672 MsG0180001513.01.T01:CDS 55.0%
GGCAAATGTCCCCTCAGTTC+AGG + Chr1:22432363-22432382 None:intergenic 55.0%
TGGGGGACTTCTGCGTTCAA+AGG - Chr1:22430869-22430888 MsG0180001513.01.T01:CDS 55.0%
!! CAGGTGGTGTTGCCAAGAGA+CGG + Chr1:22432431-22432450 None:intergenic 55.0%
GAGAGCCAATGCAGAGCAGG+TGG + Chr1:22432447-22432466 None:intergenic 60.0%
GAGGAGAGCCAATGCAGAGC+AGG + Chr1:22432450-22432469 None:intergenic 60.0%
!! GTGAGGGTGTCCATCCGTTG+AGG + Chr1:22432815-22432834 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 22430292 22433408 22430292 ID=MsG0180001513.01;Name=MsG0180001513.01
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Chr1 exon 22433001 22433408 22433001 ID=MsG0180001513.01.T01:exon:401;Parent=MsG0180001513.01.T01
Chr1 exon 22431887 22432890 22431887 ID=MsG0180001513.01.T01:exon:402;Parent=MsG0180001513.01.T01
Chr1 exon 22431127 22431755 22431127 ID=MsG0180001513.01.T01:exon:403;Parent=MsG0180001513.01.T01
Chr1 exon 22430292 22430959 22430292 ID=MsG0180001513.01.T01:exon:404;Parent=MsG0180001513.01.T01
Chr1 CDS 22433001 22433408 22433001 ID=MsG0180001513.01.T01:cds;Parent=MsG0180001513.01.T01
Chr1 CDS 22431887 22432890 22431887 ID=MsG0180001513.01.T01:cds;Parent=MsG0180001513.01.T01
Chr1 CDS 22431127 22431755 22431127 ID=MsG0180001513.01.T01:cds;Parent=MsG0180001513.01.T01
Chr1 CDS 22430292 22430959 22430292 ID=MsG0180001513.01.T01:cds;Parent=MsG0180001513.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180001513.01.T01

ATGAAGATCATGTGTGATAGCTTGCAACTTTTCGCACAACATAAAGATATCCTTGGTTTGCAAAGTAAAATTGGTAAAGTTTCTCGTAGAACCCCTTCAAGTTCAGTAGTTAATGAATCTGTCATGGTTGGTAGAAATGATGATAAAGAGACAATAATGAACATGTTGCTATCAGAGAGTAACACTGGCAATAACAATATAGGCGTTGTTGCAATTTTAGGTATGGGAGGTGTCGGTAAAACGACACTTGCACAAGTTGTTTACAATGATGAAAAAGTTATAGAACACTTCGATCTCAGAGCCTGGAGTTGTGTATCAGATGATTTTGATATTTTGAGAGTAACCAAAACTCTTCTTGAATCTGTCACTTCAAAATTATGGGAAAGCAATAATCTTGATTTTCTTCGAGCAATTGGTAGAAAGATTGCAAGAAAGTGTGGTGGACTGCCCATAGCTGCAAAAACACTTGGGGGACTTCTGCGTTCAAAGGTAGAAGCAAAGGAGTGGTCTGCAATTCTGAAAAGCGACTTATGGAAATTAGAGAATGATAATATTCTTCCTGCTTTGCTTTTGAGTTACCAATATCTCCCCTCTCATTTGAAAAGATGTTTTTCCTACTGTTCTATATTTCCAAAAGACTACCCACTTGATAGGAAGCGGTTGATTTTGTTGTGGATGGCTGAAGGCTTTCTTGAACATTCTCAAGGCGAAATATCAATGGAGGAAGTAGGTGATGACTACTTTGCTGAACTGTTATCGAGATCATTAATTCAACAACTGAATGGTGATTCCGGAGGACCAAAGTTTGTCATGCATGACCTTGTCAATGATTTAGCTACAGTCGTATCTGGAAAGAGTTGTTACAGGCTTGAATGTGGTGGTGATGTCTCTGAAAAGGTTCGTCATTTTTCATATAATCAAGAAATGTACGACAGTTTCAAGAAGTTTAAGATTTTCAACAAATTCAAATCCTTGAGAAGCTTCCTACCCATTGAATACTATTGGAAACAAAATTTCTTATCTATAATGGTGGTTGATGATTTAATACCCACACTTGGAAGGTTGTGTGTGTTATCATTATCCAACTATAGTAATATCACCATTCTACCGGATTCAGTTGGCAATTTGGTTCAGTTGCGCTATCTAGATCTCTCACAGACTAAAATCAAAACTTTGCCTGACACAACATGCAACCTCTACTACTTGCAAACCTTGATTTTAGCATGGTGCTCAAATCTCACCGAATTGCCAGAACATATTGGAAAGTTAATTAATTTACGTCACCTTGATATCGATCAGACAAGTATAACAGCATTGCCAAAGCAAATTGTTGAACTTGAAAATCTTCAAACTTTAACTGTTTTTATAGTAGGCAAGCAAAATGTTGGTTTAAGTGTGAAGGAGCTTGCAAGTGATGACTCGCTTAAAGGGAAGGATGTGCTTGATATGTTGCAACCCCCAACAGACCTAAAGAGATTGAACATTGACTTGTACGGTGGGACAAGCTTTCCCAATTGGTTGGGAGATTCTTCATTTTCTAAATTGTTGTCCCTTTGCATCGAAAATTGTGCGTACTGTGTGACAGTTCCACCACTTGGACAGCTACCTTATCTCAAGGACCTACGTATAACAGGTATGTCGATATTGGAGACAATTGGTCCAGAGTTCTATGGCATAGTTGGAGGAGGTTCCAATTCTTCCTTTCAACCTTTTCCATCCCTTGAGATGTTGCAATTTGAGAACATGTCAAATTGGAAGGAATGGCATCCCTTACAAGATGGCTTGTTTCCTTTTCCTTGCCTTAAAGCTCTGAAGTTATACAAGTGTCCTGAACTGAGGGGACATTTGCCTAGCCATCTTTCTTCCATAGAAGAAATTGACTTAAGTTGGTGTGACCGTCTCTTGGCAACACCACCTGCTCTGCATTGGCTCTCCTCAATAAAAAATATAGATATCTCTGGAGATTTACATTCTACTGAAAAGTTCCAATGGTCGTGGCTTGAGAGTGATTCACCGTCTCTACTGAAGGATATTTCAAGGAAAAGTTCATCCTATAACCCCTCAACCCTCCAAAAACTTTGTGTATTTTCATGTAAAGCCCTTATATCACTACCTCAACGGATGGACACCCTCACCAATCTTGAAAGTTTGTATCTCCACCATCTTCCAAAACTAGAGTTTGCACTATGTGAAGGAGTTTTCTTACCTCCCAAATTACAAACAATTTCTATTACATCTGTGAGAATAACAAAGATGCCGCCATTAATTGAATGGGGTTTCCAAAGCCTTACTTATCTTTCAAAATTGTATATTAAAGATAATGATGATATTGTTAACACCTTGTTGAAGGAGCAATTGCTGCCAATTTCCTTGGTGTTTCTGTCAATAAGTAATCTCTCTGAAATGAAATGCTTAGATGGAAATGGGCTTCGACACCTCTCCTCTCTTGAAACACTTGATTTTAATAATTGTCAACAACTTGAGTCCTTGTCAGAGGTCATGTTACCTTCCTCTCTCAAAACACTTTATTTTTATAACTGTCAAAGACTTGAGTCTTTTCCAGAACACAATCTCCCTTCCTCTCTAAAGTTACTGGGCATTTCTAAATGCCCTGTTTTAGAAGAAAGGTATGAAAATGAGAGAGGGGAGAATTGGTCCAAAATTGCTCACATTCCTGTGATAGAAATAAATGACAAAATCACAATATGA

Protein sequence

>MsG0180001513.01.T01

MKIMCDSLQLFAQHKDILGLQSKIGKVSRRTPSSSVVNESVMVGRNDDKETIMNMLLSESNTGNNNIGVVAILGMGGVGKTTLAQVVYNDEKVIEHFDLRAWSCVSDDFDILRVTKTLLESVTSKLWESNNLDFLRAIGRKIARKCGGLPIAAKTLGGLLRSKVEAKEWSAILKSDLWKLENDNILPALLLSYQYLPSHLKRCFSYCSIFPKDYPLDRKRLILLWMAEGFLEHSQGEISMEEVGDDYFAELLSRSLIQQLNGDSGGPKFVMHDLVNDLATVVSGKSCYRLECGGDVSEKVRHFSYNQEMYDSFKKFKIFNKFKSLRSFLPIEYYWKQNFLSIMVVDDLIPTLGRLCVLSLSNYSNITILPDSVGNLVQLRYLDLSQTKIKTLPDTTCNLYYLQTLILAWCSNLTELPEHIGKLINLRHLDIDQTSITALPKQIVELENLQTLTVFIVGKQNVGLSVKELASDDSLKGKDVLDMLQPPTDLKRLNIDLYGGTSFPNWLGDSSFSKLLSLCIENCAYCVTVPPLGQLPYLKDLRITGMSILETIGPEFYGIVGGGSNSSFQPFPSLEMLQFENMSNWKEWHPLQDGLFPFPCLKALKLYKCPELRGHLPSHLSSIEEIDLSWCDRLLATPPALHWLSSIKNIDISGDLHSTEKFQWSWLESDSPSLLKDISRKSSSYNPSTLQKLCVFSCKALISLPQRMDTLTNLESLYLHHLPKLEFALCEGVFLPPKLQTISITSVRITKMPPLIEWGFQSLTYLSKLYIKDNDDIVNTLLKEQLLPISLVFLSISNLSEMKCLDGNGLRHLSSLETLDFNNCQQLESLSEVMLPSSLKTLYFYNCQRLESFPEHNLPSSLKLLGISKCPVLEERYENERGENWSKIAHIPVIEINDKITI*