AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380017323.01

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MsG0380017323.01.T01 AT1G07570 59.177 316 123 3 62 372 48 362 2.93e-129 377
MsG0380017323.01.T01 AT1G07570 59.177 316 123 3 62 372 48 362 2.93e-129 377
MsG0380017323.01.T01 AT1G07570 59.177 316 123 3 62 372 59 373 1.12e-128 376
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MsG0380017323.01.T01 AT5G18610 53.289 304 130 5 69 367 70 366 2.01e-101 310
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MsG0380017323.01.T01 AT1G68690 41.964 336 180 7 36 367 332 656 5.06e-75 246
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MsG0380017323.01.T01 AT2G42960 46.823 299 144 9 68 362 169 456 2.64e-74 239
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MsG0380017323.01.T01 AT1G56720 44.781 297 149 8 70 362 167 452 2.10e-73 237
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MsG0380017323.01.T01 AT3G18810 45.455 308 154 6 69 372 324 621 7.43e-73 240
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MsG0380017323.01.T01 AT1G09440 45.302 298 146 9 70 362 145 430 2.62e-72 233
MsG0380017323.01.T01 AT1G68690 42.154 325 173 7 36 356 332 645 3.80e-72 238
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MsG0380017323.01.T01 AT2G18470 43.564 303 157 6 69 367 271 563 4.90e-72 237
MsG0380017323.01.T01 AT2G18470 43.564 303 157 6 69 367 271 563 4.90e-72 237
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MsG0380017323.01.T01 AT2G30740 40.924 303 161 6 70 363 59 352 5.73e-72 229
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MsG0380017323.01.T01 AT2G41970 38.762 307 169 6 66 363 57 353 4.52e-66 214
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MsG0380017323.01.T01 AT2G28250 41.100 309 162 8 67 363 195 495 6.32e-66 219
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MsG0380017323.01.T01 AT1G07650 43.771 297 153 7 69 361 665 951 1.12e-65 225
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MsG0380017323.01.T01 AT2G25220 42.424 297 157 5 70 363 134 419 1.73e-65 214
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MsG0380017323.01.T01 AT5G54590 39.667 300 162 6 62 360 95 376 2.61e-65 214
MsG0380017323.01.T01 AT4G13190 53.266 199 89 3 165 360 1 198 2.82e-65 208
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MsG0380017323.01.T01 AT5G38990 41.414 297 161 6 70 361 513 801 2.89e-65 223
MsG0380017323.01.T01 AT4G39110 42.105 304 161 6 70 370 514 805 4.16e-65 223
MsG0380017323.01.T01 AT2G21480 41.391 302 166 5 70 370 513 804 8.20e-65 221
MsG0380017323.01.T01 AT5G01950 42.903 310 154 9 61 363 520 813 1.09e-64 221
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MsG0380017323.01.T01 AT5G16900 39.796 294 162 7 70 361 563 843 4.38e-60 208
MsG0380017323.01.T01 AT2G18890 36.686 338 189 10 36 361 14 338 4.99e-60 199
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MsG0380017323.01.T01 AT2G18890 37.059 340 188 11 36 363 14 339 8.06e-60 197
MsG0380017323.01.T01 AT5G37450 40.453 309 162 8 60 363 408 699 9.92e-60 206
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MsG0380017323.01.T01 AT1G78530 41.176 289 155 7 79 364 72 348 1.09e-59 197
MsG0380017323.01.T01 AT5G24080 40.333 300 164 7 69 365 392 679 1.40e-59 206
MsG0380017323.01.T01 AT5G24080 40.333 300 164 7 69 365 392 679 1.40e-59 206
MsG0380017323.01.T01 AT2G28960 39.796 294 162 7 70 361 431 711 1.47e-59 206
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MsG0380017323.01.T01 AT2G37050 41.368 307 155 11 64 361 587 877 5.97e-59 206
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MsG0380017323.01.T01 AT4G00330 39.726 292 159 8 70 353 107 389 6.64e-59 197
MsG0380017323.01.T01 AT2G23950 40.397 302 159 10 66 361 283 569 7.05e-59 202
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MsG0380017323.01.T01 AT2G23200 39.322 295 167 5 69 361 475 759 1.42e-58 204
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MsG0380017323.01.T01 AT1G21590 38.644 295 168 6 70 361 357 641 1.61e-58 202
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MsG0380017323.01.T01 AT1G61420 37.793 299 175 6 70 366 484 773 6.05e-57 199
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MsG0380017323.01.T01 AT2G13800 39.130 299 164 9 70 361 146 433 1.07e-56 193
MsG0380017323.01.T01 AT4G21400 40.404 297 161 8 72 362 339 625 1.26e-56 196
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MsG0380017323.01.T01 AT5G47850 41.270 315 157 10 66 362 427 731 1.98e-56 197
MsG0380017323.01.T01 AT1G11330 36.236 356 205 9 10 362 461 797 2.02e-56 198
MsG0380017323.01.T01 AT2G14510 38.095 294 166 7 70 361 561 840 2.13e-56 198
MsG0380017323.01.T01 AT5G65530 36.393 305 176 8 60 360 122 412 2.25e-56 191
MsG0380017323.01.T01 AT4G29990 39.249 293 164 6 70 361 564 843 2.45e-56 198
MsG0380017323.01.T01 AT1G52540 37.075 294 171 5 70 360 25 307 2.48e-56 188
MsG0380017323.01.T01 AT1G66460 36.943 314 180 7 59 361 133 439 2.53e-56 192
MsG0380017323.01.T01 AT5G60320 37.671 292 170 6 68 358 334 614 2.56e-56 196
MsG0380017323.01.T01 AT4G29180 36.601 306 169 6 70 361 557 851 3.15e-56 198
MsG0380017323.01.T01 AT5G62710 39.088 307 167 9 60 361 258 549 3.19e-56 194
MsG0380017323.01.T01 AT1G52540 37.075 294 171 5 70 360 28 310 3.19e-56 188
MsG0380017323.01.T01 AT5G49760 40.575 313 154 7 62 363 613 904 3.48e-56 198
MsG0380017323.01.T01 AT4G29180 36.601 306 169 6 70 361 554 848 3.78e-56 198
MsG0380017323.01.T01 AT4G29180 36.601 306 169 6 70 361 555 849 4.03e-56 198
MsG0380017323.01.T01 AT3G20200 38.636 308 157 11 70 369 441 724 4.31e-56 196
MsG0380017323.01.T01 AT5G62710 39.088 307 167 9 60 361 292 583 4.37e-56 194
MsG0380017323.01.T01 AT1G70130 37.179 312 183 5 53 363 308 607 4.45e-56 195
MsG0380017323.01.T01 AT2G20850 39.333 300 166 8 70 363 466 755 4.75e-56 196
MsG0380017323.01.T01 AT1G70740 36.452 310 183 7 50 356 30 328 6.15e-56 189
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MsG0380017323.01.T01 AT3G20200 38.636 308 157 11 70 369 441 724 7.04e-56 196
MsG0380017323.01.T01 AT4G23130 36.774 310 182 8 56 362 316 614 7.07e-56 194
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MsG0380017323.01.T01 AT2G13800 39.130 299 164 9 70 361 263 550 9.13e-56 193
MsG0380017323.01.T01 AT1G31420 40.283 283 155 8 82 362 306 576 1.01e-55 192
MsG0380017323.01.T01 AT1G31420 40.283 283 155 8 82 362 306 576 1.01e-55 192
MsG0380017323.01.T01 AT3G20200 39.322 295 148 10 70 357 441 711 1.03e-55 196
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MsG0380017323.01.T01 AT3G02130 42.761 297 155 7 71 364 846 1130 1.36e-55 197
MsG0380017323.01.T01 AT5G59270 38.435 294 168 7 70 361 340 622 1.38e-55 194
MsG0380017323.01.T01 AT5G10530 39.262 298 163 8 70 361 323 608 1.40e-55 193
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MsG0380017323.01.T01 AT1G61500 37.458 299 176 6 70 366 461 750 1.56e-55 195
MsG0380017323.01.T01 AT5G16000 38.158 304 165 10 66 361 296 584 1.57e-55 193
MsG0380017323.01.T01 AT4G30520 39.073 302 163 10 66 361 287 573 1.67e-55 193
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MsG0380017323.01.T01 AT4G31110 38.411 302 172 7 66 363 415 706 1.74e-55 195
MsG0380017323.01.T01 AT5G59670 36.928 306 178 7 58 361 542 834 1.77e-55 196
MsG0380017323.01.T01 AT5G59670 36.928 306 178 7 58 361 542 834 1.77e-55 196
MsG0380017323.01.T01 AT1G70110 36.218 312 186 5 53 363 318 617 1.78e-55 193
MsG0380017323.01.T01 AT1G61500 37.458 299 176 6 70 366 484 773 1.87e-55 195
MsG0380017323.01.T01 AT4G00960 40.800 250 130 7 52 295 28 265 1.95e-55 184
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MsG0380017323.01.T01 AT1G61480 38.284 303 176 6 65 365 479 772 3.15e-55 194
MsG0380017323.01.T01 AT4G31100 38.411 302 172 7 66 363 428 719 3.18e-55 194
MsG0380017323.01.T01 AT4G04540 39.203 301 167 7 64 362 335 621 3.56e-55 192

Find 86 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 113 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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TAGGCAGAGATTATATTTCT+TGG 0.280599 3:+94945616 MsG0380017323.01.T01:intron
TTTCTTTGATCTCTCAAAAT+AGG 0.286201 3:-94946496 None:intergenic
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CTTTGAACCAGCTAGTGAAA+TGG 0.425885 3:-94945202 None:intergenic
TATCATAGACCCAAGATTAG+AGG 0.428028 3:+94946528 MsG0380017323.01.T01:CDS
TCCTATTAAAGGAGCATTGA+AGG 0.435934 3:+94946558 MsG0380017323.01.T01:CDS
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TATCAGATAGGCTTACCCTT+TGG 0.444332 3:-94945137 None:intergenic
GACTTTGATGATGTGTTCAT+AGG 0.448746 3:+94946670 MsG0380017323.01.T01:CDS
CTCTACTACTCAAGCTATTG+AGG 0.453782 3:+94945173 MsG0380017323.01.T01:CDS
AAGAGTGATGTTTATAGCTA+TGG 0.456091 3:+94946385 MsG0380017323.01.T01:CDS
TGCTGTGAAACGACTCAACT+TGG 0.457370 3:+94945368 MsG0380017323.01.T01:CDS
ACCAGAATGAAAATTGCATT+AGG 0.466182 3:+94945886 MsG0380017323.01.T01:CDS
AAACATCACTCTTGGTAGAA+AGG 0.467637 3:-94946375 None:intergenic
GAAACTGTCCCTCTAATCTT+GGG 0.474491 3:-94946537 None:intergenic
ACATGCATAATGGGAACAAA+AGG 0.476372 3:+94946155 MsG0380017323.01.T01:CDS
TAAAACAAGGTTCTTTCCAA+AGG 0.486419 3:+94945121 MsG0380017323.01.T01:CDS
CATAGGACCATTTGTGTATG+TGG 0.486584 3:+94946687 MsG0380017323.01.T01:CDS
AATTGCATTAGGTGCAGCTA+AGG 0.490148 3:+94945897 MsG0380017323.01.T01:CDS
GGAGAGAAACCTAGTGGAAT+GGG 0.491037 3:+94946468 MsG0380017323.01.T01:CDS
AAAACAAGGTTCTTTCCAAA+GGG 0.491960 3:+94945122 MsG0380017323.01.T01:CDS
ATACATGACAAGAGGGAGCT+TGG 0.497205 3:+94945714 MsG0380017323.01.T01:CDS
GCTCACAAGGTCACAGGGAG+TGG 0.499533 3:+94945394 MsG0380017323.01.T01:CDS
TAAACTCAGACATGGTTTGA+AGG 0.501485 3:+94945335 MsG0380017323.01.T01:CDS
GCTCCTGAGTATATCATGTC+AGG 0.502339 3:+94946185 MsG0380017323.01.T01:CDS
ACATCACTCATATTAGGCCT+TGG 0.504188 3:-94946622 None:intergenic
ACAAGGTCACAGGGAGTGGC+TGG 0.507483 3:+94945398 MsG0380017323.01.T01:CDS
GACCTTGGATTAGCTAAAGA+TGG 0.507566 3:+94946101 MsG0380017323.01.T01:CDS
TAGAAATGCTTATATCAGAT+AGG 0.509793 3:-94945149 None:intergenic
CAGGTTTATCTGCTTCATGA+AGG 0.515007 3:-94945930 None:intergenic
GGGAGAGAAACCTAGTGGAA+TGG 0.517100 3:+94946467 MsG0380017323.01.T01:CDS
TGGATGGCTCACAAGGTCAC+AGG 0.518872 3:+94945388 MsG0380017323.01.T01:CDS
AATCTTGGGTCTATGATATG+AGG 0.521480 3:-94946523 None:intergenic
AGTAATTTGCTAGGTGAAGG+TGG 0.524330 3:+94945279 MsG0380017323.01.T01:CDS
TTCAAATATATTACTGGACT+CGG 0.530811 3:+94945975 MsG0380017323.01.T01:CDS
CCAATTAGCTTGACAAGATG+TGG 0.531239 3:-94945652 None:intergenic
ATAGCTATAAACATCACTCT+TGG 0.532816 3:-94946383 None:intergenic
TATTAGGCCTTGGATTAGGA+TGG 0.543288 3:-94946612 None:intergenic
CTCAACTTGGATGGCTCACA+AGG 0.543355 3:+94945381 MsG0380017323.01.T01:CDS
CTAACAGCCACATACACAAA+TGG 0.546785 3:-94946694 None:intergenic
AGGAGTAATTTGCTAGGTGA+AGG 0.554604 3:+94945276 MsG0380017323.01.T01:CDS
ACAGCTAAACTATCTGACCT+TGG 0.557307 3:+94946086 MsG0380017323.01.T01:CDS
ATCATAGACCCAAGATTAGA+GGG 0.570803 3:+94946529 MsG0380017323.01.T01:CDS
GGAATTGCTTACAGGAAAGA+GGG 0.570952 3:+94946420 MsG0380017323.01.T01:CDS
GTGAAACGACTCAACTTGGA+TGG 0.580225 3:+94945372 MsG0380017323.01.T01:CDS
TCAACAAAACCCTTATACAC+AGG 0.585983 3:-94945309 None:intergenic
TAGGTCTAGCCCATTCCACT+AGG 0.592578 3:-94946477 None:intergenic
TTAGCTAAAGATGGTCCTGA+AGG 0.597111 3:+94946110 MsG0380017323.01.T01:CDS
GCTTACAGGAAAGAGGGTAG+TGG 0.597888 3:+94946426 MsG0380017323.01.T01:CDS
TAGGCCTTGGATTAGGATGG+TGG 0.599083 3:-94946609 None:intergenic
GACCATCTTTAGCTAATCCA+AGG 0.599171 3:-94946103 None:intergenic
TGAGCCACCATCCTAATCCA+AGG 0.626249 3:+94946605 MsG0380017323.01.T01:CDS
GTGTATGAATACATGACAAG+AGG 0.627169 3:+94945706 MsG0380017323.01.T01:CDS
GGATGGCTCACAAGGTCACA+GGG 0.638535 3:+94945389 MsG0380017323.01.T01:CDS
ATACCTGACATGATATACTC+AGG 0.640058 3:-94946188 None:intergenic
TGTATGAATACATGACAAGA+GGG 0.643126 3:+94945707 MsG0380017323.01.T01:CDS
ACTGCTGTGAGGAGGAGCAG+AGG 0.648634 3:+94945677 MsG0380017323.01.T01:CDS
GTTGATGATAAACTCAGACA+TGG 0.649016 3:+94945327 MsG0380017323.01.T01:CDS
AATTGGATACTGCTGTGAGG+AGG 0.656182 3:+94945669 MsG0380017323.01.T01:CDS
ATTGCATTAGGTGCAGCTAA+GGG 0.656681 3:+94945898 MsG0380017323.01.T01:CDS
AAGGCCTAATATGAGTGATG+TGG 0.658982 3:+94946624 MsG0380017323.01.T01:CDS
AAATAGGGAGAGAAACCTAG+TGG 0.671872 3:+94946462 MsG0380017323.01.T01:CDS
GATACTCTGCTACATTACCA+TGG 0.696698 3:+94945860 MsG0380017323.01.T01:CDS
GCTAATTGGATACTGCTGTG+AGG 0.754687 3:+94945666 MsG0380017323.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AAGTTTTTAATTTTGATATA+CGG + Chr3:94945433-94945452 MsG0380017323.01.T01:intron 10.0%
!!! TAAAATAAAGTCAAATTTTA+TGG + Chr3:94946294-94946313 MsG0380017323.01.T01:intron 10.0%
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!! GAAAAAAAATTACTTGATGT+AGG - Chr3:94946046-94946065 None:intergenic 20.0%
!!! GAAAAAAAGGTTTTAAAACA+AGG + Chr3:94945108-94945127 MsG0380017323.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGGTACATTTTTTCATTTAT+AGG + Chr3:94945597-94945616 MsG0380017323.01.T01:intron 20.0%
!!! TGTTTTAAAACCTTTTTTTC+TGG - Chr3:94945108-94945127 None:intergenic 20.0%
! AGATAAACCTGTAATCTATA+GGG + Chr3:94945942-94945961 MsG0380017323.01.T01:CDS 25.0%
! ATTAGAAGAACCAGAAAAAA+AGG + Chr3:94945095-94945114 MsG0380017323.01.T01:CDS 25.0%
! TAGAAATGCTTATATCAGAT+AGG - Chr3:94945152-94945171 None:intergenic 25.0%
! TTCAAATATATTACTGGACT+CGG + Chr3:94945975-94945994 MsG0380017323.01.T01:CDS 25.0%
! TTTCTTTGATCTCTCAAAAT+AGG - Chr3:94946499-94946518 None:intergenic 25.0%
!! AAGCAACACATAATTTTTCA+AGG + Chr3:94945256-94945275 MsG0380017323.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTAATTGCCTTCAATTTTC+AGG + Chr3:94946349-94946368 MsG0380017323.01.T01:intron 25.0%
!! TGATATACGGTTTTTGTTAA+TGG + Chr3:94945446-94945465 MsG0380017323.01.T01:intron 25.0%
!!! GTATTGACATTTTACCATAT+AGG + Chr3:94946207-94946226 MsG0380017323.01.T01:intron 25.0%
!!! TGAGTTCTAAAAAGATTACA+TGG + Chr3:94945028-94945047 MsG0380017323.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTTTTCTTCCCTAAATTC+AGG + Chr3:94946058-94946077 MsG0380017323.01.T01:intron 25.0%
AAAACAAGGTTCTTTCCAAA+GGG + Chr3:94945122-94945141 MsG0380017323.01.T01:CDS 30.0%
AAGAGTGATGTTTATAGCTA+TGG + Chr3:94946385-94946404 MsG0380017323.01.T01:CDS 30.0%
AAGTCTATTGTCTTGATCTT+AGG + Chr3:94945051-94945070 MsG0380017323.01.T01:CDS 30.0%
ACCAGAATGAAAATTGCATT+AGG + Chr3:94945886-94945905 MsG0380017323.01.T01:CDS 30.0%
ATAGCTATAAACATCACTCT+TGG - Chr3:94946386-94946405 None:intergenic 30.0%
CAGATAAACCTGTAATCTAT+AGG + Chr3:94945941-94945960 MsG0380017323.01.T01:CDS 30.0%
GGATAAAAGCAGATCAAATA+GGG + Chr3:94946447-94946466 MsG0380017323.01.T01:CDS 30.0%
TAAAACAAGGTTCTTTCCAA+AGG + Chr3:94945121-94945140 MsG0380017323.01.T01:CDS 30.0%
TAGGCAGAGATTATATTTCT+TGG + Chr3:94945616-94945635 MsG0380017323.01.T01:intron 30.0%
TGGATAAAAGCAGATCAAAT+AGG + Chr3:94946446-94946465 MsG0380017323.01.T01:CDS 30.0%
TGTATGAATACATGACAAGA+GGG + Chr3:94945707-94945726 MsG0380017323.01.T01:CDS 30.0%
TTATCCAAATGGAACCTATA+TGG - Chr3:94946224-94946243 None:intergenic 30.0%
TTGAAATCCCTATAGATTAC+AGG - Chr3:94945952-94945971 None:intergenic 30.0%
TTTACCACATCACTCATATT+AGG - Chr3:94946631-94946650 None:intergenic 30.0%
TTTACCATATAGGTTCCATT+TGG + Chr3:94946217-94946236 MsG0380017323.01.T01:intron 30.0%
! ACCTAATGCAATTTTCATTC+TGG - Chr3:94945890-94945909 None:intergenic 30.0%
! GCTTAAGTTGTTTATCCAAA+TGG - Chr3:94946235-94946254 None:intergenic 30.0%
!! AAAATCTTTGGAATCACTTC+AGG + Chr3:94946648-94946667 MsG0380017323.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTCAAGGAGTAATTTGCT+AGG + Chr3:94945270-94945289 MsG0380017323.01.T01:CDS 30.0%
AAACATCACTCTTGGTAGAA+AGG - Chr3:94946378-94946397 None:intergenic 35.0%
AAAGGTGACCTGAAAATTGA+AGG - Chr3:94946360-94946379 None:intergenic 35.0%
AATCTTGGGTCTATGATATG+AGG - Chr3:94946526-94946545 None:intergenic 35.0%
ACCTTCAATGCTCCTTTAAT+AGG - Chr3:94946562-94946581 None:intergenic 35.0%
AGCTGTGTAATCCTGAATTT+AGG - Chr3:94946072-94946091 None:intergenic 35.0%
ATACCTGACATGATATACTC+AGG - Chr3:94946191-94946210 None:intergenic 35.0%
ATCATAGACCCAAGATTAGA+GGG + Chr3:94946529-94946548 MsG0380017323.01.T01:CDS 35.0%
GAGTGATGTGGTAAAATCTT+TGG + Chr3:94946636-94946655 MsG0380017323.01.T01:CDS 35.0%
GCTGTGTAATCCTGAATTTA+GGG - Chr3:94946071-94946090 None:intergenic 35.0%
GTGACAACAACATGCATAAT+GGG + Chr3:94946146-94946165 MsG0380017323.01.T01:CDS 35.0%
GTGTATGAATACATGACAAG+AGG + Chr3:94945706-94945725 MsG0380017323.01.T01:CDS 35.0%
TAAACTCAGACATGGTTTGA+AGG + Chr3:94945335-94945354 MsG0380017323.01.T01:CDS 35.0%
TATCATAGACCCAAGATTAG+AGG + Chr3:94946528-94946547 MsG0380017323.01.T01:CDS 35.0%
TCAACAAAACCCTTATACAC+AGG - Chr3:94945312-94945331 None:intergenic 35.0%
TGTGACAACAACATGCATAA+TGG + Chr3:94946145-94946164 MsG0380017323.01.T01:CDS 35.0%
! ACATGCATAATGGGAACAAA+AGG + Chr3:94946155-94946174 MsG0380017323.01.T01:CDS 35.0%
! TTCTTTGTTGTGATTCAAGC+AGG + Chr3:94945838-94945857 MsG0380017323.01.T01:intron 35.0%
!! ATTTTCATTCTGGTTGACCA+TGG - Chr3:94945880-94945899 None:intergenic 35.0%
!! GACTTTGATGATGTGTTCAT+AGG + Chr3:94946670-94946689 MsG0380017323.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTGATGATAAACTCAGACA+TGG + Chr3:94945327-94945346 MsG0380017323.01.T01:CDS 35.0%
!! TCCTATTAAAGGAGCATTGA+AGG + Chr3:94946558-94946577 MsG0380017323.01.T01:CDS 35.0%
AAATAGGGAGAGAAACCTAG+TGG + Chr3:94946462-94946481 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
AAGGCCTAATATGAGTGATG+TGG + Chr3:94946624-94946643 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
AATTGCATTAGGTGCAGCTA+AGG + Chr3:94945897-94945916 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
ACAGCTAAACTATCTGACCT+TGG + Chr3:94946086-94946105 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
ACATCACTCATATTAGGCCT+TGG - Chr3:94946625-94946644 None:intergenic 40.0%
ACATGTGTTTCTTCTCCTTC+AGG - Chr3:94946128-94946147 None:intergenic 40.0%
ATTGCATTAGGTGCAGCTAA+GGG + Chr3:94945898-94945917 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
CAGGTTTATCTGCTTCATGA+AGG - Chr3:94945933-94945952 None:intergenic 40.0%
CAGTGTATCTGATTATAGCG+TGG + Chr3:94945577-94945596 MsG0380017323.01.T01:intron 40.0%
CATAGGACCATTTGTGTATG+TGG + Chr3:94946687-94946706 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
CCACATCTTGTCAAGCTAAT+TGG + Chr3:94945652-94945671 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
CTAACAGCCACATACACAAA+TGG - Chr3:94946697-94946716 None:intergenic 40.0%
CTCATATTAGGCCTTGGATT+AGG - Chr3:94946619-94946638 None:intergenic 40.0%
CTCTACTACTCAAGCTATTG+AGG + Chr3:94945173-94945192 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
CTTTGAACCAGCTAGTGAAA+TGG - Chr3:94945205-94945224 None:intergenic 40.0%
GAAACTGTCCCTCTAATCTT+GGG - Chr3:94946540-94946559 None:intergenic 40.0%
GACCATCTTTAGCTAATCCA+AGG - Chr3:94946106-94946125 None:intergenic 40.0%
GAGGGACAGTTTCCTATTAA+AGG + Chr3:94946547-94946566 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
GATACTCTGCTACATTACCA+TGG + Chr3:94945860-94945879 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
GATCTTTCCATTTCACTAGC+TGG + Chr3:94945195-94945214 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
GGAATTGCTTACAGGAAAGA+GGG + Chr3:94946420-94946439 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
TAGCTATGGAGTAGTGTTGT+TGG + Chr3:94946399-94946418 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
TATCAGATAGGCTTACCCTT+TGG - Chr3:94945140-94945159 None:intergenic 40.0%
TGGAATTGCTTACAGGAAAG+AGG + Chr3:94946419-94946438 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
TTAGCTAAAGATGGTCCTGA+AGG + Chr3:94946110-94946129 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
! CCAATTAGCTTGACAAGATG+TGG - Chr3:94945655-94945674 None:intergenic 40.0%
! GTGTTGTTGGAATTGCTTAC+AGG + Chr3:94946412-94946431 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
! TATTAGGCCTTGGATTAGGA+TGG - Chr3:94946615-94946634 None:intergenic 40.0%
!! AGGAGTAATTTGCTAGGTGA+AGG + Chr3:94945276-94945295 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
!! AGTAATTTGCTAGGTGAAGG+TGG + Chr3:94945279-94945298 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
!! GACCTTGGATTAGCTAAAGA+TGG + Chr3:94946101-94946120 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
!!! GGTTTTGGACCTGTGTATAA+GGG + Chr3:94945300-94945319 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
!!! TGGTTTTGGACCTGTGTATA+AGG + Chr3:94945299-94945318 MsG0380017323.01.T01:CDS 40.0%
AATTGGATACTGCTGTGAGG+AGG + Chr3:94945669-94945688 MsG0380017323.01.T01:CDS 45.0%
ATACATGACAAGAGGGAGCT+TGG + Chr3:94945714-94945733 MsG0380017323.01.T01:CDS 45.0%
GCTAATTGGATACTGCTGTG+AGG + Chr3:94945666-94945685 MsG0380017323.01.T01:CDS 45.0%
GCTCCTGAGTATATCATGTC+AGG + Chr3:94946185-94946204 MsG0380017323.01.T01:CDS 45.0%
GGAAACTGTCCCTCTAATCT+TGG - Chr3:94946541-94946560 None:intergenic 45.0%
GGAGAGAAACCTAGTGGAAT+GGG + Chr3:94946468-94946487 MsG0380017323.01.T01:CDS 45.0%
GTGAAACGACTCAACTTGGA+TGG + Chr3:94945372-94945391 MsG0380017323.01.T01:CDS 45.0%
TGCTGTGAAACGACTCAACT+TGG + Chr3:94945368-94945387 MsG0380017323.01.T01:CDS 45.0%
! TTGCTAGGTGAAGGTGGTTT+TGG + Chr3:94945285-94945304 MsG0380017323.01.T01:CDS 45.0%
CTCAACTTGGATGGCTCACA+AGG + Chr3:94945381-94945400 MsG0380017323.01.T01:CDS 50.0%
GCTTACAGGAAAGAGGGTAG+TGG + Chr3:94946426-94946445 MsG0380017323.01.T01:CDS 50.0%
GGGAGAGAAACCTAGTGGAA+TGG + Chr3:94946467-94946486 MsG0380017323.01.T01:CDS 50.0%
TAGGTCTAGCCCATTCCACT+AGG - Chr3:94946480-94946499 None:intergenic 50.0%
TGAGCCACCATCCTAATCCA+AGG + Chr3:94946605-94946624 MsG0380017323.01.T01:CDS 50.0%
! TAGGCCTTGGATTAGGATGG+TGG - Chr3:94946612-94946631 None:intergenic 50.0%
GGATGGCTCACAAGGTCACA+GGG + Chr3:94945389-94945408 MsG0380017323.01.T01:CDS 55.0%
TGGATGGCTCACAAGGTCAC+AGG + Chr3:94945388-94945407 MsG0380017323.01.T01:CDS 55.0%
! TGAGGAGGAGCAGAGGCTTT+TGG + Chr3:94945684-94945703 MsG0380017323.01.T01:CDS 55.0%
ACAAGGTCACAGGGAGTGGC+TGG + Chr3:94945398-94945417 MsG0380017323.01.T01:CDS 60.0%
ACTGCTGTGAGGAGGAGCAG+AGG + Chr3:94945677-94945696 MsG0380017323.01.T01:CDS 60.0%
GCTCACAAGGTCACAGGGAG+TGG + Chr3:94945394-94945413 MsG0380017323.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 94945027 94946732 94945027 ID=MsG0380017323.01;Name=MsG0380017323.01
Chr3 mRNA 94945027 94946732 94945027 ID=MsG0380017323.01.T01;Parent=MsG0380017323.01;Name=MsG0380017323.01.T01;_AED=0.13;_eAED=0.13;_QI=0|0|0|1|1|1|5|0|384
Chr3 exon 94945027 94945419 94945027 ID=MsG0380017323.01.T01:exon:35234;Parent=MsG0380017323.01.T01
Chr3 exon 94945619 94945754 94945619 ID=MsG0380017323.01.T01:exon:35235;Parent=MsG0380017323.01.T01
Chr3 exon 94945860 94945996 94945860 ID=MsG0380017323.01.T01:exon:35236;Parent=MsG0380017323.01.T01
Chr3 exon 94946080 94946206 94946080 ID=MsG0380017323.01.T01:exon:35237;Parent=MsG0380017323.01.T01
Chr3 exon 94946371 94946732 94946371 ID=MsG0380017323.01.T01:exon:35238;Parent=MsG0380017323.01.T01
Chr3 CDS 94945027 94945419 94945027 ID=MsG0380017323.01.T01:cds;Parent=MsG0380017323.01.T01
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Chr3 CDS 94945860 94945996 94945860 ID=MsG0380017323.01.T01:cds;Parent=MsG0380017323.01.T01
Chr3 CDS 94946080 94946206 94946080 ID=MsG0380017323.01.T01:cds;Parent=MsG0380017323.01.T01
Chr3 CDS 94946371 94946732 94946371 ID=MsG0380017323.01.T01:cds;Parent=MsG0380017323.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380017323.01.T01

ATGAGTTCTAAAAAGATTACATGGAAGTCTATTGTCTTGATCTTAGGTTGTTACAAGACAAAATACTCATTAGAAGAACCAGAAAAAAAGGTTTTAAAACAAGGTTCTTTCCAAAGGGTAAGCCTATCTGATATAAGCATTTCTAGCTCTACTACTCAAGCTATTGAGGATCTTTCCATTTCACTAGCTGGTTCAAAGCTTTACACGTTTACACTAGAAGAGCTAAGAGAAGCAACACATAATTTTTCAAGGAGTAATTTGCTAGGTGAAGGTGGTTTTGGACCTGTGTATAAGGGTTTTGTTGATGATAAACTCAGACATGGTTTGAAGGCTCAATCTATTGCTGTGAAACGACTCAACTTGGATGGCTCACAAGGTCACAGGGAGTGGCTGGCAGAGATTATATTTCTTGGACAGCTTAGACATCCACATCTTGTCAAGCTAATTGGATACTGCTGTGAGGAGGAGCAGAGGCTTTTGGTGTATGAATACATGACAAGAGGGAGCTTGGAGAATCAATTGTTCAGAAGATACTCTGCTACATTACCATGGTCAACCAGAATGAAAATTGCATTAGGTGCAGCTAAGGGACTAGCTTTCCTTCATGAAGCAGATAAACCTGTAATCTATAGGGATTTCAAAACTTCAAATATATTACTGGACTCGGATTACACAGCTAAACTATCTGACCTTGGATTAGCTAAAGATGGTCCTGAAGGAGAAGAAACACATGTGACAACAACATGCATAATGGGAACAAAAGGCTATGCTGCTCCTGAGTATATCATGTCAGGTCACCTTTCTACCAAGAGTGATGTTTATAGCTATGGAGTAGTGTTGTTGGAATTGCTTACAGGAAAGAGGGTAGTGGATAAAAGCAGATCAAATAGGGAGAGAAACCTAGTGGAATGGGCTAGACCTATTTTGAGAGATCAAAGAAAGCTTCCTCATATCATAGACCCAAGATTAGAGGGACAGTTTCCTATTAAAGGAGCATTGAAGGTTGCTGCATTGACTTATAAATGTTTGAGCCACCATCCTAATCCAAGGCCTAATATGAGTGATGTGGTAAAATCTTTGGAATCACTTCAGGACTTTGATGATGTGTTCATAGGACCATTTGTGTATGTGGCTGTTAGTGAAAGTAGCCAATGA
Protein sequence

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MSSKKITWKSIVLILGCYKTKYSLEEPEKKVLKQGSFQRVSLSDISISSSTTQAIEDLSISLAGSKLYTFTLEELREATHNFSRSNLLGEGGFGPVYKGFVDDKLRHGLKAQSIAVKRLNLDGSQGHREWLAEIIFLGQLRHPHLVKLIGYCCEEEQRLLVYEYMTRGSLENQLFRRYSATLPWSTRMKIALGAAKGLAFLHEADKPVIYRDFKTSNILLDSDYTAKLSDLGLAKDGPEGEETHVTTTCIMGTKGYAAPEYIMSGHLSTKSDVYSYGVVLLELLTGKRVVDKSRSNRERNLVEWARPILRDQRKLPHIIDPRLEGQFPIKGALKVAALTYKCLSHHPNPRPNMSDVVKSLESLQDFDDVFIGPFVYVAVSESSQ*