AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780041024.01


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MsG0780041024.01.T01 AT2G31750 30.237 506 276 19 7 490 6 456 9.03e-47 170
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Find 90 sgRNAs with CRISPR-Local

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TTCTTTATTAGCCATGATTT+CGG 0.324496 7:-85637292 None:intergenic
AACAGGACTAGGAGGATTAA+AGG 0.325737 7:+85637371 MsG0780041024.01.T01:CDS
TCTCTTAAAACCCAAATAAA+AGG 0.326741 7:-85637750 None:intergenic
TCTTCCTCGCCCCATTTCAT+AGG 0.327419 7:-85638056 None:intergenic
GCTTGGTAAAATGGCTAAAA+AGG 0.328408 7:+85638181 MsG0780041024.01.T01:CDS
TAAATGTTGGTGTGAAAATT+GGG 0.334829 7:+85638024 MsG0780041024.01.T01:CDS
CTAGCTACATGAAATGTATA+TGG 0.338578 7:-85637183 None:intergenic
GTAGCACGTTATGTTGAATA+TGG 0.338975 7:+85636958 MsG0780041024.01.T01:CDS
AATGATAAAGTTTGGTGTAT+TGG 0.348119 7:+85637516 MsG0780041024.01.T01:CDS
AGGTAATAATAAAATTAATA+AGG 0.349413 7:+85637584 MsG0780041024.01.T01:CDS
AAGAGGAATAGAAATGTTAA+TGG 0.353560 7:+85638115 MsG0780041024.01.T01:CDS
ACTTAGTAACACGGATTACT+TGG 0.359179 7:+85637548 MsG0780041024.01.T01:CDS
ATATGCAAGGGATTATAAAA+AGG 0.364687 7:+85637488 MsG0780041024.01.T01:CDS
AGAGCTTGGTTTAGCATTAG+AGG 0.368487 7:+85637716 MsG0780041024.01.T01:CDS
TCAAGATTCTCACACCCTTC+TGG 0.375312 7:-85637033 None:intergenic
CTTTGTGTTGTTTCCAATGA+TGG 0.396641 7:+85636822 MsG0780041024.01.T01:CDS
GAATTTCCATGTAAAGAGTC+TGG 0.397254 7:+85637006 MsG0780041024.01.T01:CDS
GAAGCTGAAACGGGTAGTTA+TGG 0.406971 7:+85637429 MsG0780041024.01.T01:CDS
GGGTGAAGAGTCCTATGAAA+TGG 0.408750 7:+85638045 MsG0780041024.01.T01:CDS
AGTGTTATCTATGCATGCTT+TGG 0.411358 7:+85637660 MsG0780041024.01.T01:CDS
GTTGTACAAATATTAAATGT+TGG 0.418685 7:+85638011 MsG0780041024.01.T01:CDS
AGGTAAGAAATGATAAAGTT+TGG 0.421595 7:+85637508 MsG0780041024.01.T01:CDS
ATATTGTCACATCAAGCAAT+TGG 0.426271 7:+85637879 MsG0780041024.01.T01:CDS
AAGCTGAAACGGGTAGTTAT+GGG 0.431787 7:+85637430 MsG0780041024.01.T01:CDS
TTATAATCCCTTGCATATGT+TGG 0.442755 7:-85637483 None:intergenic
CAATAATATGGCCGAAATCA+TGG 0.446915 7:+85637281 MsG0780041024.01.T01:CDS
TAAGGATTCAAATGATGAAT+GGG 0.449668 7:+85637602 MsG0780041024.01.T01:CDS
CAATGCATTGAGGAAGTTTG+AGG 0.452176 7:-85637079 None:intergenic
GGTGAAGAGTCCTATGAAAT+GGG 0.457328 7:+85638046 MsG0780041024.01.T01:CDS
AGGCCTAGTGATTAAGGGTT+GGG 0.460003 7:+85637842 MsG0780041024.01.T01:CDS
ATAAGGATTCAAATGATGAA+TGG 0.460628 7:+85637601 MsG0780041024.01.T01:CDS
TCAGAGATGATACAAGTTGC+TGG 0.461033 7:-85637150 None:intergenic
CTTTACATGGAAATTCAAGT+TGG 0.470893 7:-85636999 None:intergenic
TAACACGGATTACTTGGATA+AGG 0.475459 7:+85637554 MsG0780041024.01.T01:CDS
TCTGAATACTTTGAATTGCC+TGG 0.477717 7:+85637315 MsG0780041024.01.T01:CDS
GGATTTGAGGGAAGAATCAA+TGG 0.478326 7:+85637816 MsG0780041024.01.T01:CDS
CCACCACAGTTGATAGAGCT+TGG 0.479609 7:+85637702 MsG0780041024.01.T01:CDS
GAAATGACAATAGCACAAAC+AGG 0.482540 7:+85637354 MsG0780041024.01.T01:CDS
GACTTGCTTGAAGCTGAAAC+GGG 0.486016 7:+85637420 MsG0780041024.01.T01:CDS
CTTGAGGTGAGTGGATTTGA+GGG 0.487333 7:+85637804 MsG0780041024.01.T01:CDS
TGACTTGCTTGAAGCTGAAA+CGG 0.493725 7:+85637419 MsG0780041024.01.T01:CDS
AAGAAAGAAGATGTTGAAAG+AGG 0.498045 7:+85638098 MsG0780041024.01.T01:CDS
GCTTCTTAACACACTGCGGT+TGG 0.503265 7:+85637904 MsG0780041024.01.T01:CDS
GCTTGAGGTGAGTGGATTTG+AGG 0.505611 7:+85637803 MsG0780041024.01.T01:CDS
ATGTGGCCTTGTGCCATCAT+TGG 0.505701 7:-85636835 None:intergenic
GGTAGAGGCCTAGTGATTAA+GGG 0.506430 7:+85637837 MsG0780041024.01.T01:CDS
TCCGTGTTACTAAGTGATAC+AGG 0.506827 7:-85637540 None:intergenic
CTTGACATGCTACCTGCACT+TGG 0.511668 7:+85637051 MsG0780041024.01.T01:CDS
GGTAATCCAGACTCTTTACA+TGG 0.514181 7:-85637012 None:intergenic
ACAGGACTAGGAGGATTAAA+GGG 0.516089 7:+85637372 MsG0780041024.01.T01:CDS
GAGGATTAAAGGGCGAAGCT+TGG 0.516692 7:+85637382 MsG0780041024.01.T01:CDS
AATTATGCATATTGAAGAGA+TGG 0.518442 7:-85637251 None:intergenic
CAGGTGTGCCAATGGTTACA+TGG 0.536364 7:+85637952 MsG0780041024.01.T01:CDS
ACTCTAGAAGCAATATGTGC+AGG 0.540636 7:+85637933 MsG0780041024.01.T01:CDS
TTTGAGGCCATGCCAAGTGC+AGG 0.543958 7:-85637063 None:intergenic
CATGCTACCTGCACTTGGCA+TGG 0.544149 7:+85637056 MsG0780041024.01.T01:CDS
AGGCCACATGATCCCAATGA+TGG 0.550093 7:+85636849 MsG0780041024.01.T01:CDS
TTGTCACATCAAGCAATTGG+AGG 0.555966 7:+85637882 MsG0780041024.01.T01:CDS
AAAAGTGGCCATGTAACCAT+TGG 0.565009 7:-85637960 None:intergenic
GAGGGAAGAATCAATGGTAG+AGG 0.568339 7:+85637822 MsG0780041024.01.T01:CDS
GAGGCCTAGTGATTAAGGGT+TGG 0.570136 7:+85637841 MsG0780041024.01.T01:CDS
GAGCCCAACCCTTAATCACT+AGG 0.571445 7:-85637845 None:intergenic
ACAATAGCACAAACAGGACT+AGG 0.572414 7:+85637360 MsG0780041024.01.T01:CDS
GGAAGAAGAAAGTGACGTGT+TGG 0.576555 7:+85638073 MsG0780041024.01.T01:CDS
GGAGAAACTTCAATGCATTG+AGG 0.579276 7:-85637089 None:intergenic
GAGTCCTATGAAATGGGGCG+AGG 0.588467 7:+85638052 MsG0780041024.01.T01:CDS
AAAGAGTCTGGATTACCAGA+AGG 0.592502 7:+85637018 MsG0780041024.01.T01:CDS
TGTCCATCATTGGGATCATG+TGG 0.600490 7:-85636852 None:intergenic
TGGCTTGATTCTCAGAAACA+AGG 0.602159 7:+85637636 MsG0780041024.01.T01:CDS
AGTTAGAGCCAACATATGCA+AGG 0.605309 7:+85637475 MsG0780041024.01.T01:CDS
TCCTGTATCACTTAGTAACA+CGG 0.612903 7:+85637539 MsG0780041024.01.T01:CDS
AAGAGTCTGGATTACCAGAA+GGG 0.616408 7:+85637019 MsG0780041024.01.T01:CDS
AAATGTTGGTGTGAAAATTG+GGG 0.617684 7:+85638025 MsG0780041024.01.T01:CDS
GGCTTGATTCTCAGAAACAA+GGG 0.627335 7:+85637637 MsG0780041024.01.T01:CDS
GTTAGAGCCAACATATGCAA+GGG 0.628142 7:+85637476 MsG0780041024.01.T01:CDS
TACTTGGATAAGGTTCAAAG+AGG 0.628427 7:+85637564 MsG0780041024.01.T01:CDS
CCAAGCTCTATCAACTGTGG+TGG 0.630706 7:-85637702 None:intergenic
ATGAATGGGATCACTTGAAG+TGG 0.644657 7:+85637616 MsG0780041024.01.T01:CDS
GTGAAGAGTCCTATGAAATG+GGG 0.658950 7:+85638047 MsG0780041024.01.T01:CDS
ATAGCACAAACAGGACTAGG+AGG 0.666893 7:+85637363 MsG0780041024.01.T01:CDS
TGTGACAATATCAATAGCTG+AGG 0.669080 7:-85637867 None:intergenic
AATATGTGCAGGTGTGCCAA+TGG 0.671879 7:+85637944 MsG0780041024.01.T01:CDS
TTGTTTCCAATGATGGCACA+AGG 0.685173 7:+85636829 MsG0780041024.01.T01:CDS
GGAGGCTTCTTAACACACTG+CGG 0.693423 7:+85637900 MsG0780041024.01.T01:CDS
AAACCAAGCTCTATCAACTG+TGG 0.705010 7:-85637705 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AGGTAATAATAAAATTAATA+AGG + Chr7:85637584-85637603 MsG0780041024.01.T01:CDS 10.0%
!!! TAATTTTCATGTCAATAATA+TGG + Chr7:85637269-85637288 MsG0780041024.01.T01:CDS 15.0%
!! AAGAAAGAAGAAAAAGAATT+AGG + Chr7:85638156-85638175 MsG0780041024.01.T01:CDS 20.0%
!! AGAAAGAAGAAAAAGAATTA+GGG + Chr7:85638157-85638176 MsG0780041024.01.T01:CDS 20.0%
!! CTAAACATTCATTCAAAAAT+TGG - Chr7:85637992-85638011 None:intergenic 20.0%
!! GTTGTACAAATATTAAATGT+TGG + Chr7:85638011-85638030 MsG0780041024.01.T01:CDS 20.0%
!!! AACAAAAAGACCTTTTATTT+GGG + Chr7:85637740-85637759 MsG0780041024.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTGAATTGGTATTTTCAT+TGG - Chr7:85638297-85638316 None:intergenic 20.0%
! AAGAGGAATAGAAATGTTAA+TGG + Chr7:85638115-85638134 MsG0780041024.01.T01:CDS 25.0%
! AATTATGCATATTGAAGAGA+TGG - Chr7:85637254-85637273 None:intergenic 25.0%
! AGATATCATGCAAAAAAGTA+AGG + Chr7:85638253-85638272 MsG0780041024.01.T01:CDS 25.0%
! AGGTAAGAAATGATAAAGTT+TGG + Chr7:85637508-85637527 MsG0780041024.01.T01:CDS 25.0%
! AGTTAGAAGAGTTGAAAAAA+TGG + Chr7:85637781-85637800 MsG0780041024.01.T01:CDS 25.0%
! ATAAGGATTCAAATGATGAA+TGG + Chr7:85637601-85637620 MsG0780041024.01.T01:CDS 25.0%
! ATATGCAAGGGATTATAAAA+AGG + Chr7:85637488-85637507 MsG0780041024.01.T01:CDS 25.0%
! TAAATGTTGGTGTGAAAATT+GGG + Chr7:85638024-85638043 MsG0780041024.01.T01:CDS 25.0%
! TAAGGATTCAAATGATGAAT+GGG + Chr7:85637602-85637621 MsG0780041024.01.T01:CDS 25.0%
! TCTCTTAAAACCCAAATAAA+AGG - Chr7:85637753-85637772 None:intergenic 25.0%
! TTAAATGTTGGTGTGAAAAT+TGG + Chr7:85638023-85638042 MsG0780041024.01.T01:CDS 25.0%
! TTCTTTATTAGCCATGATTT+CGG - Chr7:85637295-85637314 None:intergenic 25.0%
!! ATTCCAAGAATTTCTTTTCT+TGG + Chr7:85637216-85637235 MsG0780041024.01.T01:CDS 25.0%
!! CAACAAAAAGACCTTTTATT+TGG + Chr7:85637739-85637758 MsG0780041024.01.T01:CDS 25.0%
!!! AATGATAAAGTTTGGTGTAT+TGG + Chr7:85637516-85637535 MsG0780041024.01.T01:CDS 25.0%
!!! ACAATAACATTTTGATGTTG+TGG - Chr7:85636892-85636911 None:intergenic 25.0%
!!! ATTGTCATTTCAATTTTGTC+AGG - Chr7:85637345-85637364 None:intergenic 25.0%
!!! TACTTTTTTGCATGATATCT+TGG - Chr7:85638253-85638272 None:intergenic 25.0%
!!! TTGTCATTTCAATTTTGTCA+GGG - Chr7:85637344-85637363 None:intergenic 25.0%
!!! TTTATTTGGGTTTTAAGAGA+GGG + Chr7:85637753-85637772 MsG0780041024.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTATTTGGGTTTTAAGAG+AGG + Chr7:85637752-85637771 MsG0780041024.01.T01:CDS 25.0%
AAATGTTGGTGTGAAAATTG+GGG + Chr7:85638025-85638044 MsG0780041024.01.T01:CDS 30.0%
AAGAAAGAAGATGTTGAAAG+AGG + Chr7:85638098-85638117 MsG0780041024.01.T01:CDS 30.0%
ACTCCAAGAAAAGAAATTCT+TGG - Chr7:85637222-85637241 None:intergenic 30.0%
ATATTGTCACATCAAGCAAT+TGG + Chr7:85637879-85637898 MsG0780041024.01.T01:CDS 30.0%
CATGCAAAAAAGTAAGGATA+TGG + Chr7:85638259-85638278 MsG0780041024.01.T01:CDS 30.0%
CTAGCTACATGAAATGTATA+TGG - Chr7:85637186-85637205 None:intergenic 30.0%
CTTTACATGGAAATTCAAGT+TGG - Chr7:85637002-85637021 None:intergenic 30.0%
TTATAATCCCTTGCATATGT+TGG - Chr7:85637486-85637505 None:intergenic 30.0%
! AACAACACAAAGTGTAGTTT+TGG - Chr7:85636814-85636833 None:intergenic 30.0%
! ACAACACAAAGTGTAGTTTT+GGG - Chr7:85636813-85636832 None:intergenic 30.0%
! ATTTTTGCAATGTCCATCAT+TGG - Chr7:85636865-85636884 None:intergenic 30.0%
! TTTTTGCAATGTCCATCATT+GGG - Chr7:85636864-85636883 None:intergenic 30.0%
!!! TGAAACGAGATGCATTTTTT+GGG - Chr7:85636930-85636949 None:intergenic 30.0%
AAAAATTGGTCCGCAAAAAG+TGG - Chr7:85637978-85637997 None:intergenic 35.0%
AATTAGGGAGCTTGGTAAAA+TGG + Chr7:85638172-85638191 MsG0780041024.01.T01:CDS 35.0%
AGAAAAAGAATTAGGGAGCT+TGG + Chr7:85638164-85638183 MsG0780041024.01.T01:CDS 35.0%
AGAGTTGAAAAAATGGCTTG+AGG + Chr7:85637788-85637807 MsG0780041024.01.T01:CDS 35.0%
AGTGTTATCTATGCATGCTT+TGG + Chr7:85637660-85637679 MsG0780041024.01.T01:CDS 35.0%
CAATAATATGGCCGAAATCA+TGG + Chr7:85637281-85637300 MsG0780041024.01.T01:CDS 35.0%
CTAAAAAGGCTGTAGAAAGA+GGG + Chr7:85638195-85638214 MsG0780041024.01.T01:CDS 35.0%
GAAATGACAATAGCACAAAC+AGG + Chr7:85637354-85637373 MsG0780041024.01.T01:CDS 35.0%
GAATTTCCATGTAAAGAGTC+TGG + Chr7:85637006-85637025 MsG0780041024.01.T01:CDS 35.0%
GCTTGGTAAAATGGCTAAAA+AGG + Chr7:85638181-85638200 MsG0780041024.01.T01:CDS 35.0%
GTAGCACGTTATGTTGAATA+TGG + Chr7:85636958-85636977 MsG0780041024.01.T01:CDS 35.0%
TAAAAAGGCTGTAGAAAGAG+GGG + Chr7:85638196-85638215 MsG0780041024.01.T01:CDS 35.0%
TACTTGGATAAGGTTCAAAG+AGG + Chr7:85637564-85637583 MsG0780041024.01.T01:CDS 35.0%
TCCTGTATCACTTAGTAACA+CGG + Chr7:85637539-85637558 MsG0780041024.01.T01:CDS 35.0%
TCTGAATACTTTGAATTGCC+TGG + Chr7:85637315-85637334 MsG0780041024.01.T01:CDS 35.0%
TGTGACAATATCAATAGCTG+AGG - Chr7:85637870-85637889 None:intergenic 35.0%
! ACAGCTTTTCAACTTCTTGT+TGG - Chr7:85637113-85637132 None:intergenic 35.0%
! ACTTAGTAACACGGATTACT+TGG + Chr7:85637548-85637567 MsG0780041024.01.T01:CDS 35.0%
! TAACACGGATTACTTGGATA+AGG + Chr7:85637554-85637573 MsG0780041024.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTTGTGTTGTTTCCAATGA+TGG + Chr7:85636822-85636841 MsG0780041024.01.T01:CDS 35.0%
!!! AAAGTGTAGTTTTGGGTCTT+GGG - Chr7:85636806-85636825 None:intergenic 35.0%
!!! GAAACGAGATGCATTTTTTG+GGG - Chr7:85636929-85636948 None:intergenic 35.0%
!!! GTGAAACGAGATGCATTTTT+TGG - Chr7:85636931-85636950 None:intergenic 35.0%
AAAAAATGGCTTGAGGTGAG+TGG + Chr7:85637795-85637814 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
AAAAAGGCTGTAGAAAGAGG+GGG + Chr7:85638197-85638216 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
AAAAGTGGCCATGTAACCAT+TGG - Chr7:85637963-85637982 None:intergenic 40.0%
AAACCAAGCTCTATCAACTG+TGG - Chr7:85637708-85637727 None:intergenic 40.0%
AAAGAGTCTGGATTACCAGA+AGG + Chr7:85637018-85637037 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
AACAGGACTAGGAGGATTAA+AGG + Chr7:85637371-85637390 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
AAGAGTCTGGATTACCAGAA+GGG + Chr7:85637019-85637038 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
AAGCTGAAACGGGTAGTTAT+GGG + Chr7:85637430-85637449 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
ACAATAGCACAAACAGGACT+AGG + Chr7:85637360-85637379 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
ACAGGACTAGGAGGATTAAA+GGG + Chr7:85637372-85637391 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
AGAGCTTGGTTTAGCATTAG+AGG + Chr7:85637716-85637735 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
AGTTAGAGCCAACATATGCA+AGG + Chr7:85637475-85637494 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
ATGAATGGGATCACTTGAAG+TGG + Chr7:85637616-85637635 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
CAATGCATTGAGGAAGTTTG+AGG - Chr7:85637082-85637101 None:intergenic 40.0%
GCTAAAAAGGCTGTAGAAAG+AGG + Chr7:85638194-85638213 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
GGAGAAACTTCAATGCATTG+AGG - Chr7:85637092-85637111 None:intergenic 40.0%
GGATTTGAGGGAAGAATCAA+TGG + Chr7:85637816-85637835 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
GGCTTGATTCTCAGAAACAA+GGG + Chr7:85637637-85637656 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
GGTAATCCAGACTCTTTACA+TGG - Chr7:85637015-85637034 None:intergenic 40.0%
GGTGAAGAGTCCTATGAAAT+GGG + Chr7:85638046-85638065 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
GTGAAGAGTCCTATGAAATG+GGG + Chr7:85638047-85638066 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
GTTAGAGCCAACATATGCAA+GGG + Chr7:85637476-85637495 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
TCAGAGATGATACAAGTTGC+TGG - Chr7:85637153-85637172 None:intergenic 40.0%
TGGCTTGATTCTCAGAAACA+AGG + Chr7:85637636-85637655 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
TTGTCACATCAAGCAATTGG+AGG + Chr7:85637882-85637901 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
TTGTTTCCAATGATGGCACA+AGG + Chr7:85636829-85636848 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
! ACTCTAGAAGCAATATGTGC+AGG + Chr7:85637933-85637952 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
! TCAATTTTGTCAGGGATACC+AGG - Chr7:85637336-85637355 None:intergenic 40.0%
! TCCGTGTTACTAAGTGATAC+AGG - Chr7:85637543-85637562 None:intergenic 40.0%
!! TGACTTGCTTGAAGCTGAAA+CGG + Chr7:85637419-85637438 MsG0780041024.01.T01:CDS 40.0%
!!! CAAAGTGTAGTTTTGGGTCT+TGG - Chr7:85636807-85636826 None:intergenic 40.0%
AATATGTGCAGGTGTGCCAA+TGG + Chr7:85637944-85637963 MsG0780041024.01.T01:CDS 45.0%
AGGCCTAGTGATTAAGGGTT+GGG + Chr7:85637842-85637861 MsG0780041024.01.T01:CDS 45.0%
ATAGCACAAACAGGACTAGG+AGG + Chr7:85637363-85637382 MsG0780041024.01.T01:CDS 45.0%
GAAGCTGAAACGGGTAGTTA+TGG + Chr7:85637429-85637448 MsG0780041024.01.T01:CDS 45.0%
GAGGGAAGAATCAATGGTAG+AGG + Chr7:85637822-85637841 MsG0780041024.01.T01:CDS 45.0%
GGAAGAAGAAAGTGACGTGT+TGG + Chr7:85638073-85638092 MsG0780041024.01.T01:CDS 45.0%
GGGTGAAGAGTCCTATGAAA+TGG + Chr7:85638045-85638064 MsG0780041024.01.T01:CDS 45.0%
GGTAGAGGCCTAGTGATTAA+GGG + Chr7:85637837-85637856 MsG0780041024.01.T01:CDS 45.0%
TCAAGATTCTCACACCCTTC+TGG - Chr7:85637036-85637055 None:intergenic 45.0%
TGGTAGAGGCCTAGTGATTA+AGG + Chr7:85637836-85637855 MsG0780041024.01.T01:CDS 45.0%
TGTCCATCATTGGGATCATG+TGG - Chr7:85636855-85636874 None:intergenic 45.0%
! CTTGAGGTGAGTGGATTTGA+GGG + Chr7:85637804-85637823 MsG0780041024.01.T01:CDS 45.0%
! GACTTGCTTGAAGCTGAAAC+GGG + Chr7:85637420-85637439 MsG0780041024.01.T01:CDS 45.0%
!!! ACGAGATGCATTTTTTGGGG+TGG - Chr7:85636926-85636945 None:intergenic 45.0%
!!! GGTTACATGGCCACTTTTTG+CGG + Chr7:85637965-85637984 MsG0780041024.01.T01:CDS 45.0%
AGGCCACATGATCCCAATGA+TGG + Chr7:85636849-85636868 MsG0780041024.01.T01:CDS 50.0%
CAGGTGTGCCAATGGTTACA+TGG + Chr7:85637952-85637971 MsG0780041024.01.T01:CDS 50.0%
CCAAGCTCTATCAACTGTGG+TGG - Chr7:85637705-85637724 None:intergenic 50.0%
CTTGACATGCTACCTGCACT+TGG + Chr7:85637051-85637070 MsG0780041024.01.T01:CDS 50.0%
GAGCCCAACCCTTAATCACT+AGG - Chr7:85637848-85637867 None:intergenic 50.0%
GAGGATTAAAGGGCGAAGCT+TGG + Chr7:85637382-85637401 MsG0780041024.01.T01:CDS 50.0%
GAGGCCTAGTGATTAAGGGT+TGG + Chr7:85637841-85637860 MsG0780041024.01.T01:CDS 50.0%
GCTTCTTAACACACTGCGGT+TGG + Chr7:85637904-85637923 MsG0780041024.01.T01:CDS 50.0%
GGAGGCTTCTTAACACACTG+CGG + Chr7:85637900-85637919 MsG0780041024.01.T01:CDS 50.0%
TCTTCCTCGCCCCATTTCAT+AGG - Chr7:85638059-85638078 None:intergenic 50.0%
! GCTTGAGGTGAGTGGATTTG+AGG + Chr7:85637803-85637822 MsG0780041024.01.T01:CDS 50.0%
!! ATGTGGCCTTGTGCCATCAT+TGG - Chr7:85636838-85636857 None:intergenic 50.0%
!! CCACCACAGTTGATAGAGCT+TGG + Chr7:85637702-85637721 MsG0780041024.01.T01:CDS 50.0%
CATGCTACCTGCACTTGGCA+TGG + Chr7:85637056-85637075 MsG0780041024.01.T01:CDS 55.0%
GAGTCCTATGAAATGGGGCG+AGG + Chr7:85638052-85638071 MsG0780041024.01.T01:CDS 55.0%
! TTTGAGGCCATGCCAAGTGC+AGG - Chr7:85637066-85637085 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 85636796 85638319 85636796 ID=MsG0780041024.01;Name=MsG0780041024.01
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Chr7 exon 85636796 85638319 85636796 ID=MsG0780041024.01.T01:exon:17885;Parent=MsG0780041024.01.T01
Chr7 CDS 85636796 85638319 85636796 ID=MsG0780041024.01.T01:cds;Parent=MsG0780041024.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780041024.01.T01

ATGGTATCCCAAGACCCAAAACTACACTTTGTGTTGTTTCCAATGATGGCACAAGGCCACATGATCCCAATGATGGACATTGCAAAAATATTGCCACAACATCAAAATGTTATTGTTACAATAGTAACCACCCCAAAAAATGCATCTCGTTTCACATCAATTGTAGCACGTTATGTTGAATATGGTCTTCACATTCAATTAGTCCAACTTGAATTTCCATGTAAAGAGTCTGGATTACCAGAAGGGTGTGAGAATCTTGACATGCTACCTGCACTTGGCATGGCCTCAAACTTCCTCAATGCATTGAAGTTTCTCCAACAAGAAGTTGAAAAGCTGTTTGAAGAGTTCACAACACCAGCAACTTGTATCATCTCTGATATGTGTTTGCCATATACATTTCATGTAGCTAGAAAGTTCAATATTCCAAGAATTTCTTTTCTTGGAGTAAGTTGCTTCCATCTCTTCAATATGCATAATTTTCATGTCAATAATATGGCCGAAATCATGGCTAATAAAGAATCTGAATACTTTGAATTGCCTGGTATCCCTGACAAAATTGAAATGACAATAGCACAAACAGGACTAGGAGGATTAAAGGGCGAAGCTTGGAAACAATTTAATGATGACTTGCTTGAAGCTGAAACGGGTAGTTATGGGATGCTCGTGAATTCTTTTGAAGAGTTAGAGCCAACATATGCAAGGGATTATAAAAAGGTAAGAAATGATAAAGTTTGGTGTATTGGTCCTGTATCACTTAGTAACACGGATTACTTGGATAAGGTTCAAAGAGGTAATAATAAAATTAATAAGGATTCAAATGATGAATGGGATCACTTGAAGTGGCTTGATTCTCAGAAACAAGGGAGTGTTATCTATGCATGCTTTGGAAGTTTATGCAATTTAACACCACCACAGTTGATAGAGCTTGGTTTAGCATTAGAGGCAACAAAAAGACCTTTTATTTGGGTTTTAAGAGAGGGAAATCAGTTAGAAGAGTTGAAAAAATGGCTTGAGGTGAGTGGATTTGAGGGAAGAATCAATGGTAGAGGCCTAGTGATTAAGGGTTGGGCTCCTCAGCTATTGATATTGTCACATCAAGCAATTGGAGGCTTCTTAACACACTGCGGTTGGAATTCTACTCTAGAAGCAATATGTGCAGGTGTGCCAATGGTTACATGGCCACTTTTTGCGGACCAATTTTTGAATGAATGTTTAGTTGTACAAATATTAAATGTTGGTGTGAAAATTGGGGTGAAGAGTCCTATGAAATGGGGCGAGGAAGAAGAAAGTGACGTGTTGGTCAAGAAAGAAGATGTTGAAAGAGGAATAGAAATGTTAATGGATGATACAAGTGAAAGTGAAGAAAGAAGAAAAAGAATTAGGGAGCTTGGTAAAATGGCTAAAAAGGCTGTAGAAAGAGGGGGATCTTCTCACTCTAATTTTACATTGTTTATCCAAGATATCATGCAAAAAAGTAAGGATATGGTGTCATCATTTGCCAATGAAAATACCAATTCAAAATGA

Protein sequence

>MsG0780041024.01.T01

MVSQDPKLHFVLFPMMAQGHMIPMMDIAKILPQHQNVIVTIVTTPKNASRFTSIVARYVEYGLHIQLVQLEFPCKESGLPEGCENLDMLPALGMASNFLNALKFLQQEVEKLFEEFTTPATCIISDMCLPYTFHVARKFNIPRISFLGVSCFHLFNMHNFHVNNMAEIMANKESEYFELPGIPDKIEMTIAQTGLGGLKGEAWKQFNDDLLEAETGSYGMLVNSFEELEPTYARDYKKVRNDKVWCIGPVSLSNTDYLDKVQRGNNKINKDSNDEWDHLKWLDSQKQGSVIYACFGSLCNLTPPQLIELGLALEATKRPFIWVLREGNQLEELKKWLEVSGFEGRINGRGLVIKGWAPQLLILSHQAIGGFLTHCGWNSTLEAICAGVPMVTWPLFADQFLNECLVVQILNVGVKIGVKSPMKWGEEEESDVLVKKEDVERGIEMLMDDTSESEERRKRIRELGKMAKKAVERGGSSHSNFTLFIQDIMQKSKDMVSSFANENTNSK*