AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780041022.01


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MsG0780041022.01.T01 AT2G43840 26.735 490 297 18 11 488 7 446 4.25e-36 139
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MsG0780041022.01.T01 AT3G55710 26.369 493 310 15 13 494 10 460 1.31e-34 135
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MsG0780041022.01.T01 AT5G17050 31.673 281 159 8 211 490 210 458 1.15e-33 133
MsG0780041022.01.T01 AT5G38040 26.939 490 280 17 19 488 18 449 2.13e-33 132
MsG0780041022.01.T01 AT3G22250 25.150 501 306 20 10 488 7 460 1.82e-32 129
MsG0780041022.01.T01 AT2G15490 32.796 186 118 3 11 191 7 190 4.92e-32 124
MsG0780041022.01.T01 AT1G30530 25.400 500 289 18 12 490 16 452 4.43e-31 125
MsG0780041022.01.T01 AT1G64910 26.282 468 279 15 11 466 6 419 1.59e-30 124
MsG0780041022.01.T01 AT2G22930 27.887 459 281 18 11 465 6 418 1.73e-30 123
MsG0780041022.01.T01 AT4G27570 26.327 471 275 15 11 469 7 417 9.82e-29 119
MsG0780041022.01.T01 AT3G29630 28.051 467 299 14 11 473 6 439 1.16e-28 118
MsG0780041022.01.T01 AT4G09500 28.478 460 279 17 11 466 6 419 7.68e-28 116
MsG0780041022.01.T01 AT4G27560 26.552 467 279 15 11 469 7 417 8.05e-28 116
MsG0780041022.01.T01 AT3G21750 24.603 504 321 17 11 491 4 471 9.04e-28 116
MsG0780041022.01.T01 AT5G53990 25.813 461 290 15 11 466 6 419 2.91e-26 111
MsG0780041022.01.T01 AT5G54010 25.726 482 295 16 11 484 6 432 1.04e-23 103
MsG0780041022.01.T01 AT1G50580 26.483 472 296 16 11 472 6 436 6.68e-22 98.6
MsG0780041022.01.T01 AT5G37950 25.993 277 177 9 125 390 84 343 9.71e-22 97.1
MsG0780041022.01.T01 AT5G37950 26.182 275 173 10 125 390 84 337 1.54e-21 96.3
MsG0780041022.01.T01 AT5G54060 26.277 411 255 16 13 406 15 394 1.80e-20 94.4
MsG0780041022.01.T01 AT1G64920 24.892 462 295 15 11 465 6 422 6.61e-20 92.8
MsG0780041022.01.T01 AT4G09500 35.638 188 109 4 279 466 219 394 1.32e-19 91.7
MsG0780041022.01.T01 AT3G29630 33.163 196 128 2 279 473 220 413 1.82e-19 91.3
MsG0780041022.01.T01 AT4G01070 25.134 374 222 14 9 357 6 346 5.72e-17 82.8

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTCCATTTATTTGGGTTATT+AGG 0.082328 7:+85618827 MsG0780041022.01.T01:CDS
CAAACATAAACAACAGATTT+TGG 0.188263 7:-85618733 None:intergenic
CTTTCTCGTGCTGTTTCTTC+TGG 0.208524 7:+85618046 MsG0780041022.01.T01:CDS
TCCATTTATTTGGGTTATTA+GGG 0.257459 7:+85618828 MsG0780041022.01.T01:CDS
TCCCTAATAACCCAAATAAA+TGG 0.262232 7:-85618829 None:intergenic
GAGATAATGCAACTTGGTTT+TGG 0.285528 7:-85618244 None:intergenic
ACAACTTATTGAATTGGCTT+TGG 0.313920 7:+85618786 MsG0780041022.01.T01:CDS
CAACTTATTGAATTGGCTTT+GGG 0.324638 7:+85618787 MsG0780041022.01.T01:CDS
TCCTTCACAACTTATTGAAT+TGG 0.328350 7:+85618780 MsG0780041022.01.T01:CDS
TGGGGAGAGGAAGAGAAATT+AGG 0.332295 7:+85619147 MsG0780041022.01.T01:CDS
ACACTTGAAGGGGTAAGTTT+TGG 0.355382 7:+85619015 MsG0780041022.01.T01:CDS
AATGTGGCCTTGTGCTATTA+AGG 0.356754 7:-85617927 None:intergenic
CACCCTCCATTGCATGTTCA+AGG 0.363554 7:+85618348 MsG0780041022.01.T01:CDS
GGAAGAGGACTTATAATTAG+AGG 0.369456 7:+85618919 MsG0780041022.01.T01:CDS
TCTTCCTCTCCCCACTTCAA+TGG 0.382180 7:-85619138 None:intergenic
ATATTATCACATTCTTCAAT+TGG 0.388820 7:+85618961 MsG0780041022.01.T01:CDS
AAGTTTGAGGAAAGGAATAA+AGG 0.389160 7:+85618898 MsG0780041022.01.T01:CDS
CAACAAAGATGGTTTAGATA+AGG 0.393148 7:+85618645 MsG0780041022.01.T01:CDS
GGGTTACAAGTTTGATTTGA+AGG 0.407161 7:-85618069 None:intergenic
TCGAAATTCTCGCAACCATC+TGG 0.415028 7:-85618121 None:intergenic
ATATGTTAATGATTACAAAA+AGG 0.417587 7:+85618579 MsG0780041022.01.T01:CDS
TTGAGGATTGGAGTGAGTCT+TGG 0.418604 7:+85619105 MsG0780041022.01.T01:CDS
TCTTTGTTGCAAAGTGCAAC+AGG 0.420174 7:-85618631 None:intergenic
ATTAGGTGTAGTTGTGAAGA+AGG 0.440802 7:+85619164 MsG0780041022.01.T01:CDS
TGCAGTTTCCTTGCTTCAAA+AGG 0.442568 7:+85618192 MsG0780041022.01.T01:CDS
TGTGATAATATCACCATTTG+TGG 0.442976 7:-85618949 None:intergenic
AATTTATAAAAGTGAAGAGT+TGG 0.446438 7:+85618855 MsG0780041022.01.T01:CDS
AGAGAAAGGGCTAGTGAACT+TGG 0.466709 7:+85619249 MsG0780041022.01.T01:CDS
GAAGCTGAAATGAAATCATA+TGG 0.470511 7:+85618520 MsG0780041022.01.T01:CDS
AATAATGGCCAAGTTATCAT+TGG 0.473706 7:-85619042 None:intergenic
TCTGTTGTTTATGTTTGTCT+TGG 0.481477 7:+85618739 MsG0780041022.01.T01:CDS
GAAGAAGGAAGTTATTAAAG+AGG 0.481479 7:+85619179 MsG0780041022.01.T01:CDS
GTTGCACTTTGCAACAAAGA+TGG 0.481793 7:+85618634 MsG0780041022.01.T01:CDS
TAGAGGGTGGGCCCCACAAA+TGG 0.489245 7:+85618936 MsG0780041022.01.T01:CDS
GATTAGTGATGAAAAGTTTG+AGG 0.489897 7:+85618885 MsG0780041022.01.T01:CDS
ATGTGGCCTTGTGCTATTAA+GGG 0.490527 7:-85617926 None:intergenic
AAACCATGGAATGAAATCCT+TGG 0.492801 7:-85618316 None:intergenic
AGGTAAGAAATGATAAGGTT+TGG 0.505595 7:+85618599 MsG0780041022.01.T01:CDS
GAGTAAAGAGAGAAGAGAAA+GGG 0.506105 7:+85619236 MsG0780041022.01.T01:CDS
AGTGAAAGAGGAAAAGATGA+AGG 0.506840 7:+85618477 MsG0780041022.01.T01:CDS
TTGGTGTACCAATGATAACT+TGG 0.507348 7:+85619034 MsG0780041022.01.T01:CDS
TTATCACATTCTTCAATTGG+TGG 0.512435 7:+85618964 MsG0780041022.01.T01:CDS
AATGATAAGGTTTGGTGTGT+TGG 0.518019 7:+85618607 MsG0780041022.01.T01:CDS
GTGATAATATCACCATTTGT+GGG 0.524159 7:-85618948 None:intergenic
GGTTGGAATTCAACACTTGA+AGG 0.524519 7:+85619003 MsG0780041022.01.T01:CDS
TTTATTTGGGTTATTAGGGA+AGG 0.529565 7:+85618832 MsG0780041022.01.T01:CDS
GCCAATTCAATAAGTTGTGA+AGG 0.529773 7:-85618781 None:intergenic
AGAGTAAAGAGAGAAGAGAA+AGG 0.531044 7:+85619235 MsG0780041022.01.T01:CDS
GAGGAAAGGAATAAAGGAAG+AGG 0.533642 7:+85618904 MsG0780041022.01.T01:CDS
GAAGAGGACTTATAATTAGA+GGG 0.533771 7:+85618920 MsG0780041022.01.T01:CDS
GAGTTGAATTTCCATTGAAG+TGG 0.533871 7:+85619127 MsG0780041022.01.T01:CDS
ATTCCAAGGATTTCATTCCA+TGG 0.536945 7:+85618313 MsG0780041022.01.T01:CDS
GATACCAGGAACAGTGAAAG+AGG 0.542581 7:+85618465 MsG0780041022.01.T01:CDS
GTGATGAAAAGTTTGAGGAA+AGG 0.545461 7:+85618890 MsG0780041022.01.T01:CDS
GTTTCCTTGCTTCAAAAGGA+AGG 0.551819 7:+85618196 MsG0780041022.01.T01:CDS
AGTTGAATTTCCATTGAAGT+GGG 0.556714 7:+85619128 MsG0780041022.01.T01:CDS
GTGAAAGAGGAAAAGATGAA+GGG 0.559698 7:+85618478 MsG0780041022.01.T01:CDS
ATTTCCATTGAAGTGGGGAG+AGG 0.563986 7:+85619134 MsG0780041022.01.T01:CDS
AAGGGAAATAACACAAAGTG+TGG 0.580044 7:-85617908 None:intergenic
TGTCTATCATTGGGATAATG+TGG 0.581455 7:-85617943 None:intergenic
TGAAAGAGGAAAAGATGAAG+GGG 0.597981 7:+85618479 MsG0780041022.01.T01:CDS
GTTGGAATTCAACACTTGAA+GGG 0.598355 7:+85619004 MsG0780041022.01.T01:CDS
GTCACAAAAGAACAGATACC+AGG 0.600200 7:+85618451 MsG0780041022.01.T01:CDS
AAATCAGAGATAATGCAACT+TGG 0.600269 7:-85618250 None:intergenic
TTGGAATTCAACACTTGAAG+GGG 0.605118 7:+85619005 MsG0780041022.01.T01:CDS
TTTGAAGCAAGGAAACTGCA+TGG 0.606448 7:-85618189 None:intergenic
AAACAAGTTGGATTACCAGA+TGG 0.606732 7:+85618106 MsG0780041022.01.T01:CDS
TGTGTACCTTGAACATGCAA+TGG 0.612530 7:-85618354 None:intergenic
AGGACTTATAATTAGAGGGT+GGG 0.612847 7:+85618924 MsG0780041022.01.T01:CDS
GAGGACTTATAATTAGAGGG+TGG 0.614085 7:+85618923 MsG0780041022.01.T01:CDS
TTATTTCCCTTAATAGCACA+AGG 0.627711 7:+85617920 MsG0780041022.01.T01:CDS
GTTGAATTTCCATTGAAGTG+GGG 0.641339 7:+85619129 MsG0780041022.01.T01:CDS
GTACCTTGAACATGCAATGG+AGG 0.658506 7:-85618351 None:intergenic
TGATAATATCACCATTTGTG+GGG 0.664196 7:-85618947 None:intergenic
TACCTTGAACATGCAATGGA+GGG 0.667815 7:-85618350 None:intergenic
GGTTTAGATAAGGCTCAAAG+AGG 0.681265 7:+85618655 MsG0780041022.01.T01:CDS
TGGTTGCGAGAATTTCGACA+TGG 0.685831 7:+85618126 MsG0780041022.01.T01:CDS
AATATGCAATGTGATGAATG+AGG 0.691994 7:+85619203 MsG0780041022.01.T01:CDS
GCAAAACTCTTAGCACAACG+TGG 0.754542 7:+85617968 MsG0780041022.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AACAAAAATTCCATTTATTT+GGG + Chr7:85618819-85618838 MsG0780041022.01.T01:CDS 15.0%
!! ATATGTTAATGATTACAAAA+AGG + Chr7:85618579-85618598 MsG0780041022.01.T01:CDS 15.0%
!! AATTTATAAAAGTGAAGAGT+TGG + Chr7:85618855-85618874 MsG0780041022.01.T01:CDS 20.0%
!! ATATTATCACATTCTTCAAT+TGG + Chr7:85618961-85618980 MsG0780041022.01.T01:CDS 20.0%
!! CAACAAAAATTCCATTTATT+TGG + Chr7:85618818-85618837 MsG0780041022.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTGTTTTGATGGAAAATTTA+GGG - Chr7:85618092-85618111 None:intergenic 20.0%
! AAAAATTGGTCAGCAAATAA+TGG - Chr7:85619060-85619079 None:intergenic 25.0%
! CAAAAAGGTAAGAAATGATA+AGG + Chr7:85618594-85618613 MsG0780041022.01.T01:CDS 25.0%
! CAAGTTTCTCATTCAAAAAT+TGG - Chr7:85619074-85619093 None:intergenic 25.0%
!! AATTTTCCATCAAAACAAGT+TGG + Chr7:85618094-85618113 MsG0780041022.01.T01:CDS 25.0%
!! CAAACATAAACAACAGATTT+TGG - Chr7:85618736-85618755 None:intergenic 25.0%
!! TCCATTTATTTGGGTTATTA+GGG + Chr7:85618828-85618847 MsG0780041022.01.T01:CDS 25.0%
!! TGTAATCATAAACAGTTTTG+AGG + Chr7:85618543-85618562 MsG0780041022.01.T01:CDS 25.0%
!! TTCCATTTATTTGGGTTATT+AGG + Chr7:85618827-85618846 MsG0780041022.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTTTTTGGTGTAGTGAATA+TGG - Chr7:85618005-85618024 None:intergenic 25.0%
!!! CTTGTTTTGATGGAAAATTT+AGG - Chr7:85618093-85618112 None:intergenic 25.0%
AAAAAAGCTGTTGAAAAAGG+TGG + Chr7:85619282-85619301 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
AAAGTGAAGAGTTGGAAAAA+TGG + Chr7:85618863-85618882 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
AAATCAGAGATAATGCAACT+TGG - Chr7:85618253-85618272 None:intergenic 30.0%
AAGTTTGAGGAAAGGAATAA+AGG + Chr7:85618898-85618917 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
AATAATGGCCAAGTTATCAT+TGG - Chr7:85619045-85619064 None:intergenic 30.0%
AATATGCAATGTGATGAATG+AGG + Chr7:85619203-85619222 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
AGGTAAGAAATGATAAGGTT+TGG + Chr7:85618599-85618618 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
AGTTGAATTTCCATTGAAGT+GGG + Chr7:85619128-85619147 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
CAACAAAGATGGTTTAGATA+AGG + Chr7:85618645-85618664 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
GAAGAAGGAAGTTATTAAAG+AGG + Chr7:85619179-85619198 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
GAAGAGGACTTATAATTAGA+GGG + Chr7:85618920-85618939 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
GAAGCTGAAATGAAATCATA+TGG + Chr7:85618520-85618539 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
GATTAGTGATGAAAAGTTTG+AGG + Chr7:85618885-85618904 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
GCAAAAAAAGCTGTTGAAAA+AGG + Chr7:85619279-85619298 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
GTGATAATATCACCATTTGT+GGG - Chr7:85618951-85618970 None:intergenic 30.0%
TCCCTAATAACCCAAATAAA+TGG - Chr7:85618832-85618851 None:intergenic 30.0%
TCCTTCACAACTTATTGAAT+TGG + Chr7:85618780-85618799 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
TGATAATATCACCATTTGTG+GGG - Chr7:85618950-85618969 None:intergenic 30.0%
TGTGATAATATCACCATTTG+TGG - Chr7:85618952-85618971 None:intergenic 30.0%
TTATCACATTCTTCAATTGG+TGG + Chr7:85618964-85618983 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
TTATTTCCCTTAATAGCACA+AGG + Chr7:85617920-85617939 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
! ACAACTTATTGAATTGGCTT+TGG + Chr7:85618786-85618805 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
! TCTCTGATTTTTGCATAACT+TGG + Chr7:85618263-85618282 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
! TCTGTTGTTTATGTTTGTCT+TGG + Chr7:85618739-85618758 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
! TTTATTTGGGTTATTAGGGA+AGG + Chr7:85618832-85618851 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGTGACTTGAATTTTGTC+AGG - Chr7:85618439-85618458 None:intergenic 30.0%
!! AGTTTTGCTATGTCTATCAT+TGG - Chr7:85617956-85617975 None:intergenic 30.0%
!! CAACTTATTGAATTGGCTTT+GGG + Chr7:85618787-85618806 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
!! GTTTTGCTATGTCTATCATT+GGG - Chr7:85617955-85617974 None:intergenic 30.0%
!!! AACTTGTTACTCAAGTTTTG+AGG + Chr7:85619088-85619107 MsG0780041022.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTAAAACGTGATGCATTTTT+TGG - Chr7:85618019-85618038 None:intergenic 30.0%
AAACCATGGAATGAAATCCT+TGG - Chr7:85618319-85618338 None:intergenic 35.0%
AAGGGAAATAACACAAAGTG+TGG - Chr7:85617911-85617930 None:intergenic 35.0%
AGAGTAAAGAGAGAAGAGAA+AGG + Chr7:85619235-85619254 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
AGGACTTATAATTAGAGGGT+GGG + Chr7:85618924-85618943 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
AGTGAAAGAGGAAAAGATGA+AGG + Chr7:85618477-85618496 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
ATTAGGTGTAGTTGTGAAGA+AGG + Chr7:85619164-85619183 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
ATTCCAAGGATTTCATTCCA+TGG + Chr7:85618313-85618332 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
CTGAAAAACATCACATTCCA+AGG + Chr7:85618299-85618318 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
GAGTAAAGAGAGAAGAGAAA+GGG + Chr7:85619236-85619255 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
GAGTTGAATTTCCATTGAAG+TGG + Chr7:85619127-85619146 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
GCCAATTCAATAAGTTGTGA+AGG - Chr7:85618784-85618803 None:intergenic 35.0%
GGAAGAGGACTTATAATTAG+AGG + Chr7:85618919-85618938 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
GTGAAAGAGGAAAAGATGAA+GGG + Chr7:85618478-85618497 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
GTGATGAAAAGTTTGAGGAA+AGG + Chr7:85618890-85618909 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
GTTGAATTTCCATTGAAGTG+GGG + Chr7:85619129-85619148 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
GTTGGAATTCAACACTTGAA+GGG + Chr7:85619004-85619023 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
TGAAAGAGGAAAAGATGAAG+GGG + Chr7:85618479-85618498 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
TGTCTATCATTGGGATAATG+TGG - Chr7:85617946-85617965 None:intergenic 35.0%
TTGGAATTCAACACTTGAAG+GGG + Chr7:85619005-85619024 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
TTGGTGTACCAATGATAACT+TGG + Chr7:85619034-85619053 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
! AAACAAGTTGGATTACCAGA+TGG + Chr7:85618106-85618125 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
! ACAGAGTTTTTCTCTATTCC+TGG + Chr7:85618409-85618428 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
! GAGATAATGCAACTTGGTTT+TGG - Chr7:85618247-85618266 None:intergenic 35.0%
!! AATGATAAGGTTTGGTGTGT+TGG + Chr7:85618607-85618626 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
!! GATTTTTGACTCATTGTGGT+TGG + Chr7:85618986-85619005 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
!! GGGTTACAAGTTTGATTTGA+AGG - Chr7:85618072-85618091 None:intergenic 35.0%
!!! GGTAATCCAACTTGTTTTGA+TGG - Chr7:85618103-85618122 None:intergenic 35.0%
!!! GTTACTCAAGTTTTGAGGAT+TGG + Chr7:85619093-85619112 MsG0780041022.01.T01:CDS 35.0%
GAGGAAAGGAATAAAGGAAG+AGG + Chr7:85618904-85618923 MsG0780041022.01.T01:CDS 40.0%
GAGGACTTATAATTAGAGGG+TGG + Chr7:85618923-85618942 MsG0780041022.01.T01:CDS 40.0%
GGGTGAAACAACAAAAACCA+TGG - Chr7:85618333-85618352 None:intergenic 40.0%
GGTTGGAATTCAACACTTGA+AGG + Chr7:85619003-85619022 MsG0780041022.01.T01:CDS 40.0%
GGTTTAGATAAGGCTCAAAG+AGG + Chr7:85618655-85618674 MsG0780041022.01.T01:CDS 40.0%
GTCACAAAAGAACAGATACC+AGG + Chr7:85618451-85618470 MsG0780041022.01.T01:CDS 40.0%
GTTGCACTTTGCAACAAAGA+TGG + Chr7:85618634-85618653 MsG0780041022.01.T01:CDS 40.0%
GTTTCCTTGCTTCAAAAGGA+AGG + Chr7:85618196-85618215 MsG0780041022.01.T01:CDS 40.0%
TACCTTGAACATGCAATGGA+GGG - Chr7:85618353-85618372 None:intergenic 40.0%
TCTTTGTTGCAAAGTGCAAC+AGG - Chr7:85618634-85618653 None:intergenic 40.0%
TGCAGTTTCCTTGCTTCAAA+AGG + Chr7:85618192-85618211 MsG0780041022.01.T01:CDS 40.0%
TGTGTACCTTGAACATGCAA+TGG - Chr7:85618357-85618376 None:intergenic 40.0%
! ACACTTGAAGGGGTAAGTTT+TGG + Chr7:85619015-85619034 MsG0780041022.01.T01:CDS 40.0%
! TGAATTTTGTCAGGTATGCC+AGG - Chr7:85618430-85618449 None:intergenic 40.0%
! TTTGAAGCAAGGAAACTGCA+TGG - Chr7:85618192-85618211 None:intergenic 40.0%
! TTTTCCTCTTTCACTGTTCC+TGG - Chr7:85618472-85618491 None:intergenic 40.0%
!! AATGTGGCCTTGTGCTATTA+AGG - Chr7:85617930-85617949 None:intergenic 40.0%
!! ATGTGGCCTTGTGCTATTAA+GGG - Chr7:85617929-85617948 None:intergenic 40.0%
!! GGTGGATTTTTGACTCATTG+TGG + Chr7:85618982-85619001 MsG0780041022.01.T01:CDS 40.0%
!!! TTCACCTTCCTTTTGAAGCA+AGG - Chr7:85618203-85618222 None:intergenic 40.0%
ATTTCCATTGAAGTGGGGAG+AGG + Chr7:85619134-85619153 MsG0780041022.01.T01:CDS 45.0%
GATACCAGGAACAGTGAAAG+AGG + Chr7:85618465-85618484 MsG0780041022.01.T01:CDS 45.0%
GCAAAACTCTTAGCACAACG+TGG + Chr7:85617968-85617987 MsG0780041022.01.T01:CDS 45.0%
GTACCTTGAACATGCAATGG+AGG - Chr7:85618354-85618373 None:intergenic 45.0%
TCGAAATTCTCGCAACCATC+TGG - Chr7:85618124-85618143 None:intergenic 45.0%
TGGGGAGAGGAAGAGAAATT+AGG + Chr7:85619147-85619166 MsG0780041022.01.T01:CDS 45.0%
TGGTTGCGAGAATTTCGACA+TGG + Chr7:85618126-85618145 MsG0780041022.01.T01:CDS 45.0%
TTGAGGATTGGAGTGAGTCT+TGG + Chr7:85619105-85619124 MsG0780041022.01.T01:CDS 45.0%
! AGAGAAAGGGCTAGTGAACT+TGG + Chr7:85619249-85619268 MsG0780041022.01.T01:CDS 45.0%
!! CTTTCTCGTGCTGTTTCTTC+TGG + Chr7:85618046-85618065 MsG0780041022.01.T01:CDS 45.0%
CACCCTCCATTGCATGTTCA+AGG + Chr7:85618348-85618367 MsG0780041022.01.T01:CDS 50.0%
TCTTCCTCTCCCCACTTCAA+TGG - Chr7:85619141-85619160 None:intergenic 50.0%
TAGAGGGTGGGCCCCACAAA+TGG + Chr7:85618936-85618955 MsG0780041022.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 85617881 85619380 85617881 ID=MsG0780041022.01;Name=MsG0780041022.01
Chr7 mRNA 85617881 85619380 85617881 ID=MsG0780041022.01.T01;Parent=MsG0780041022.01;Name=MsG0780041022.01.T01;_AED=0.32;_eAED=0.32;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|499
Chr7 exon 85617881 85619380 85617881 ID=MsG0780041022.01.T01:exon:17883;Parent=MsG0780041022.01.T01
Chr7 CDS 85617881 85619380 85617881 ID=MsG0780041022.01.T01:cds;Parent=MsG0780041022.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780041022.01.T01

ATGGTTTTGCAAGCAAACATTAATGCTCCACACTTTGTGTTATTTCCCTTAATAGCACAAGGCCACATTATCCCAATGATAGACATAGCAAAACTCTTAGCACAACGTGGTGTTATTGTTACCATATTCACTACACCAAAAAATGCATCACGTTTTACTTCAGTTCTTTCTCGTGCTGTTTCTTCTGGCCTTCAAATCAAACTTGTAACCCTAAATTTTCCATCAAAACAAGTTGGATTACCAGATGGTTGCGAGAATTTCGACATGGTTAACATTTCAAAAGACATGAATATGATGTACAATCTATTCCATGCAGTTTCCTTGCTTCAAAAGGAAGGTGAAGATTTGTTTGATAAATTGTCACCAAAACCAAGTTGCATTATCTCTGATTTTTGCATAACTTGGACTTCTCAAATAGCTGAAAAACATCACATTCCAAGGATTTCATTCCATGGTTTTTGTTGTTTCACCCTCCATTGCATGTTCAAGGTACACACTTCAAATATTCTTGAAAGCATCAATTCAGAAACAGAGTTTTTCTCTATTCCTGGCATACCTGACAAAATTCAAGTCACAAAAGAACAGATACCAGGAACAGTGAAAGAGGAAAAGATGAAGGGGTTTGCTGAGAAAATGCAAGAAGCTGAAATGAAATCATATGGTGTAATCATAAACAGTTTTGAGGAGTTAGAGAAAGAATATGTTAATGATTACAAAAAGGTAAGAAATGATAAGGTTTGGTGTGTTGGTCCTGTTGCACTTTGCAACAAAGATGGTTTAGATAAGGCTCAAAGAGGTAACATTGCTTCAATAAGTGAACATAGTTGTTTAAAGTTTCTAGATTTGCATAAACCAAAATCTGTTGTTTATGTTTGTCTTGGAAGTTTATGCAATTTAATTCCTTCACAACTTATTGAATTGGCTTTGGGATTAGAAGCAACAAAAATTCCATTTATTTGGGTTATTAGGGAAGGAATTTATAAAAGTGAAGAGTTGGAAAAATGGATTAGTGATGAAAAGTTTGAGGAAAGGAATAAAGGAAGAGGACTTATAATTAGAGGGTGGGCCCCACAAATGGTGATATTATCACATTCTTCAATTGGTGGATTTTTGACTCATTGTGGTTGGAATTCAACACTTGAAGGGGTAAGTTTTGGTGTACCAATGATAACTTGGCCATTATTTGCTGACCAATTTTTGAATGAGAAACTTGTTACTCAAGTTTTGAGGATTGGAGTGAGTCTTGGAGTTGAATTTCCATTGAAGTGGGGAGAGGAAGAGAAATTAGGTGTAGTTGTGAAGAAGGAAGTTATTAAAGAGGCAATATGCAATGTGATGAATGAGGAAGATCAAGAGAGTAAAGAGAGAAGAGAAAGGGCTAGTGAACTTGGTGAGATTGCAAAAAAAGCTGTTGAAAAAGGTGGATCTTCTTATCTTAATATCACTTTGCTTATTCAAGATATCATGCAACAACAATCAAGCATCAAAGTTGAAACTTGA

Protein sequence

>MsG0780041022.01.T01

MVLQANINAPHFVLFPLIAQGHIIPMIDIAKLLAQRGVIVTIFTTPKNASRFTSVLSRAVSSGLQIKLVTLNFPSKQVGLPDGCENFDMVNISKDMNMMYNLFHAVSLLQKEGEDLFDKLSPKPSCIISDFCITWTSQIAEKHHIPRISFHGFCCFTLHCMFKVHTSNILESINSETEFFSIPGIPDKIQVTKEQIPGTVKEEKMKGFAEKMQEAEMKSYGVIINSFEELEKEYVNDYKKVRNDKVWCVGPVALCNKDGLDKAQRGNIASISEHSCLKFLDLHKPKSVVYVCLGSLCNLIPSQLIELALGLEATKIPFIWVIREGIYKSEELEKWISDEKFEERNKGRGLIIRGWAPQMVILSHSSIGGFLTHCGWNSTLEGVSFGVPMITWPLFADQFLNEKLVTQVLRIGVSLGVEFPLKWGEEEKLGVVVKKEVIKEAICNVMNEEDQESKERRERASELGEIAKKAVEKGGSSYLNITLLIQDIMQQQSSIKVET*