AlfalfaGEDB | MS.gene73596

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene73596

KEGG: -
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PFAM: PF13881.9

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Swissprot:

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Trembl:

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Protein Kinases:

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Co-expression Network:

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PPI:

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Gene1	Gene2	Type
No data available in table

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MS.gene73596.t1	MTR_7g108180	52.041	98	45	2	4	100	5	101	4.66e-32	110

Showing 1 to 8 of 8 entries

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MS.gene73596.t1	AT3G26980	72.115	104	29	0	1	104	1	104	4.83e-54	166
MS.gene73596.t1	AT4G24990	56.780	118	50	1	1	118	1	117	9.48e-48	150
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MS.gene73596.t1	AT1G22050	53.125	96	44	1	3	97	4	99	3.74e-34	115
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MS.gene73596.t1	AT3G01050	50.000	86	43	0	7	92	8	93	7.48e-27	97.1
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Find 36 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

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CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region
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ATTCGACTCGTGCGGCGCAC+GGG	0.504669	7.1:+70202068	MS.gene73596:CDS
ATTGGGTACCTTCGATTGAT+CGG	0.500713	7.1:-70197564	None:intergenic
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CAGACAAGAAAATTATACCA+AGG	0.653948	7.1:+70194545	MS.gene73596:intron
CAGATTGAGTAACTTTGGTG+TGG	0.574769	7.1:+70197516	MS.gene73596:CDS

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CRISPR-GE

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badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
No data available in table

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Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
chr7.1	gene	70191623	70202106	70191623	ID=MS.gene73596
chr7.1	mRNA	70191623	70202106	70191623	ID=MS.gene73596.t1;Parent=MS.gene73596
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chr7.1	CDS	70191623	70191752	70191623	ID=cds.MS.gene73596.t1;Parent=MS.gene73596.t1
chr7.1	exon	70194548	70194718	70194548	ID=MS.gene73596.t1.exon2;Parent=MS.gene73596.t1
chr7.1	CDS	70194548	70194718	70194548	ID=cds.MS.gene73596.t1;Parent=MS.gene73596.t1
chr7.1	exon	70197512	70197577	70197512	ID=MS.gene73596.t1.exon3;Parent=MS.gene73596.t1
chr7.1	CDS	70197512	70197577	70197512	ID=cds.MS.gene73596.t1;Parent=MS.gene73596.t1
chr7.1	exon	70202060	70202106	70202060	ID=MS.gene73596.t1.exon4;Parent=MS.gene73596.t1
chr7.1	CDS	70202060	70202106	70202060	ID=cds.MS.gene73596.t1;Parent=MS.gene73596.t1

Gene Sequence

>MS.gene73596

ATGCCTGATGATGAATTGGTGGAGCTGAAGTTCCGTATATACGATGGATCAGATATTGGACCCTTTTCTTATTCACCAACTTCAACTGTTTCTATGCTCAAGGAAAGGATTTTTGCTGAATGGCCCAAAGGTTAATTAATTACTTAATCACTTTTATTTTTGTTTTGTTGATTAATCACTTGTTGTTAATCTGTGTTTTGTTTTGGTTTTTGTTTGGTGGGTGTTTTTTATTTTTTTGATATTTTGATTGTAGTTTTGATGTCTTAAGTGATTTGAGTTCTTGAGCTTGAATGAAGTCAGTGATATACAGCTCCTTTTGTTTGCTCTCTTGCACTGACACTTCTGATTGAAGGCTTGTCCCAGTGTCCGACACAGACACATGTGATTATATTGAACTATGTCTATGTCCAGTGTCCGTGTGTCTGTGCTTCATAGGGTTTGAGTTTCTCTTGCTATTGAATTTTGAGCTGTTTTTGGTTATTGGGCAAATAGCTATGTAGCACTAACATGCAGGTGCAAACACCTGGACATTGGACACGATGTGTCAGACACCGACATGTGTCAGACACCAATAGTAATTTGAGAAAGTGGAAGTGAATGAATGTAATAATGTAATACATGTGTAAGTATCGTGTTTGTGTAGTGTACTGACACGTGTCAGACACACTTTCAGTTTGAAGTATCAGTGCTACTGACATGGCTTTGTATTGGATAAATAGTTTAATTTGCAGCTTATAATTGTGTTTATGTATAAGCTATTTCTTGAACACAAGATTAAGTTAAATTGTTTAGTTTATTAGCTATAAACTGTTTGCATAAACTATCTTGGAGAACTTGTGAAAATAAGCTGAAAACGTCTTATGAACATGTCATAAGTTGTTTTCATAAGTTCTTCTGAACAGTTTCACAAGTGCTTATGCCGGTAGATAGGTTCAAATAAGCCAATCCAAACAAGCCCTTAGGCATAGAAGGGGTTTCTTATTTTATTTTATGTTTGATTCTGTTTTTAGGAAAAGGTTTTTAATTTTTAATATGTTTATTCTCAAATGGGGCAAGTTGTGTGTTAATTTATTTTTGTTTTGTAGTTCTATATGTGCAATTTGTTAGAAGTTAGATAAATTTGCTTATAATAAAAATGCTTTTGTATTCAATTGGGTAGTTGAATTAGGTGTTGTCATAAGATTCTTTGCTTTATCTGGTCAAGAAAATTAGTGAATGTGATGTCATAAGCTATTGGGTTTTTGTTTCTTGTCTTGTGTCATTAAAGAGAAAGAAAGCTTTACTGTTTTTGGTTTTTGAACCGTTTCAGGAAATACCGATAAACATTAATATTTGTTGGATTAGTAATGGAAACTATTTGGTAGGCTTTATCCAGAAAAGGTTCAGTGGTGATCTTTAAGCATTTGAATATGAGTATGGAAATTGGATATGCAAAATAAAAACAAAAACAATTTATTATCATATGTTCACGTATACTTATTGTTTGGTTTCACTTTTGATAAATGTGATTTGAATGAACTTGATTTTGTAAATTCATTCGGTCAAAATTTAGTTTAAAACATGACATGTCAATACATTACCTAGATTTCTATTGGTTGATAAAGGAAAAGTGTGTCTATGCTACATTTCGCTATAAATAAGTGGTTAGATTTGGTTGGCAAATGGTTATAAAGGTCACTGAGAGGCTTTTATTTCTTTGTTTATTTACTTTGCTATGTCATCACTTTCTTGTGGTTGTTATGGTGATGCAATTGACTATTTTGGCTCTTTTTACATCATCATGTAGAATGATATCATTGTTAAATATATATTTAAATGTAAAGCTATAATTGTATTGTCAAATTGCCTCCATGGCATTATGGCATGGTGAATTCTGTGTCAGCCAACAACAACTATTTTATCCGCCATGTTTCCACCATAGGCTGAAATACCATGTTTATGTAGAGGGTTTTTTGCTTGCTGCCATAACCCGCCACCGGTAATTGTATTAAGATGGATGAATGGTCACATTAGACAAGATAAAGAGTAAGACTAGAAATACAATCCTTAGAGAGAAGATTTCAATAGTTTCATTATCAAAATGCTGGCTGAGTCTCGTCTAAGGTGGTCTAGGCATTTAGAAGACCTGTAGGGGCACTAGTTAGTACAGTTGACCAGAAATCTCATCTTTTTGACTTTTTGTTGGAAAAGGTACACTTAGATTTCTAATTTTTAGCTGACACTGCATCCGAGTTAAACAGGAATATTTTTCCAACTGATTGGTTACTTGCAATTATGTTTCAGGATATCTGTATCATGATATTCTGGTTTTGTTAGTAACATTAACTGGACAACAGTTTCCGTTACTAAACTCTCTTTCAGATATGCAAATGTCCTACATATGATGTAATAACTCTTTGTATCCTGTTCTAAATGTATTACCTTTAGTGACCTATATTTGATAGAATACTCCCTTTGATGTTGCCGTCTACAAGGTTGTCTGGTTCTTTATATTATGGATGATTATTTTGTACTTTTTTACTATGGATGCATGGGGCAGAGCTCCTGTGATTTTTCCCTTTATGTTTGGATTATTGGAAAGGAATGAAATTGAATCATCATTAAATGTGTTATTGTTTGAATTATTTAAAATAGGATAAGATGGAATAATTCTATTCTATTCCACTCACTTTCTACTATTTCTTCTTCAATTTGGGTGGATGGTATGCAATGAGTCTTTTTCTCAAACAATGGAATGATGAGTGTATTCCCTCTCATTTCATTTCGTTCAATTCTATTCATTTCGTTCCATTCTATTTCATTCAATTATATTATGCTCCACTCATCGCTTAATATCCAATTACCGTTGCTTTAATGCTATATTCTTGTCCCTTATTTCTTAACGGTTTTCTTTACCATTTATAAAAATGTGTCTTTTTTTCACAGACAAGAAAATTATACCAAGGGCAGCAAGTGATATTAAACTCATAAATGCTGGCAAAATTTTGGAGAACAACAAGACGGTGGGCCAATGTAGAGTACCTTTTGGCGAGCTTCCTTCTGGGGTCATCACCATGCATGTTGTCGTTCAGCCATCTTTGGCAAAAGCGAAAACAGGTAGATTTTACTCTGAAGTATATTATGTGATTATTAATTACTGTTTTGATAGTCAAGTAGTTTGTTCCAGAAGTTAATGTATTTATACTTCTATGCCACCATTGAAATAATAGAGATTTAAATAAGGAAGGAGGAACAGAGTCAAAAGCTCAAAATAATCCAATTATATTGGTATTATTGTGATTTTGAGGGATATGATGCATAAAAGAAAGTACTAATCCATGATTGTGTCAATTATCATGCTTATCAATAGACAAATCTTAAAATATGGAAACAACTCTTAGCTCTTAAGATATTAATAATGCCTCTAAGATGTTATAGAATGACAATATTATGATATATTTTGTAGATATTCTTAAAATGTGTTATTCTGTTAAATCAACAAGATCGAATAGTTCAATTACAATATAACAGCTTATAAATGAGGCCTAGTTAATTAATTTTGGTTGTGTTCACATATGTTTTGTTCTACTATGTAGTTACTCCTTTTAATTTTAGGGCCATATTATTTATTTTAGGGGATATTACTTGCACCTCCCCTGTGGTTTACACAAATGTCACTCAGACCCCCTCTATTTCCCTAAAAGCACATACCTCCCCTACTGTCTTACACCGTTTGGAAACTGTTCAAACTTTAAACTTTGCTTTGTCTAACATCTACAAAAACCCTGCAGCGATAGAGACATCAAAGCAATTATAGTTTCATGAACTTGTTTTGTGTTTTGTGGCAGTTTTCACTCCTAGAGCTACCTTCTTTCAATCAATATTTGGCTAAAAATTGAATTTTGGGGAAACCTAGAATTGAAGTGAATCTGTCAAAACTATCACAGCGAGATTCTACTTCTGTTGTGAAATAGATGCTAGAATATTTATTTGTTTGAAGCATTAAACTTTTTTCTGGTTTGACCAACAAACATTGGAATGAGGGGTTAAAAGATGTTATTTATTGAAAATATAAGGAGTTTGGTGCTCATTTGATAAATAGAGGGGGTGTCGGTGACATTTGAGCAAAACTCAAGGGAGGTTAGTGTAATTACCCTTTTATTTTAAATAGTTGAATAGTTGAATTCTTCTAATTTATGAGTTCCATTCAGTTCTTGTGTCACTCCCACCAGTCGCACCCCAAAACAAAATAATACACCCACACGAGTCACTGATGTTCTTGAAAATGGTGGGTGGGACATAGTTTGTGATTTTGGTATATCTGCTATACCTATGATTCTCTGCTGGGTTTTGTTTGCCCGACTACATGTCATGATCACTGTTACTTTTAGGGATTAGGGTACCCCAAGGTTTTCATATTGTGTAAATATCCAATTTGATCCTTGAAATTGTATGAGTGTCTGCACATTTCATTATTCTAAAATGACCCATTGAATTGCAAAATATTAATCAGATTTGTTCCTCATTCTGGTTCTGTTATCAAATGTATCTCCGATATTATTCACTTAGTTTCAAATGCATCCATGACATTGCCTATTTAATGTCATTGTGGTCGTTGCAAATACCAATGGAGGGACGGACATGATTAAGTTTTTACAATTTCAAATATCATTTTAGAATATTAACAGTGTGGGGGATTAAGTAATGATGTAAGATCTGCCACTTGGGCAGACCGTAGTCTAGCACCCCTCCTATGTGCAATGGAGGTCATTCACCCATCGAGACTCCATCTAGGTAAGTGTTTGGCAGATTAAGTTGATATGGTCTTACAATTTTAGAGACAAAATTAGGTATTTAGGATTTTGTTATTATAAGCATTCCCTGGCACGGTTTATTATAATTATTGAACACTTGTAATTGTATGAGTCTAGAAATGTATATAATTTGAATCATTTTAGAAACCTTCCATAGGTGGCACCCCCCTGTCTGCATTGACATTTTAGATGCGTTCTCAAAAGGCT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Protein sequence

>MS.gene73596.t1

MPDDELVELKFRIYDGSDIGPFSYSPTSTVSMLKERIFAEWPKDKKIIPRAASDIKLINAGKILENNKTVGQCRVPFGELPSGVITMHVVVQPSLAKAKTGSRLSNFGVGKLCNTLTIRSIEVHSIRLVRRTGQQSS