AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880042085.01


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MsG0880042085.01.T01 AT3G07070 37.353 340 188 12 504 824 52 385 1.01e-55 198
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MsG0880042085.01.T01 AT1G55200 38.776 294 170 5 515 805 365 651 2.53e-54 200
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MsG0880042085.01.T01 AT1G68690 39.796 294 163 6 517 804 365 650 5.18e-54 200
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MsG0880042085.01.T01 AT3G13690 38.435 294 171 5 515 805 397 683 1.39e-53 199
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MsG0880042085.01.T01 AT1G11280 25.710 739 417 25 5 693 11 667 2.96e-53 197
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MsG0880042085.01.T01 AT5G03320 37.821 312 181 7 511 812 63 371 3.43e-53 191
MsG0880042085.01.T01 AT5G61350 36.842 304 177 5 515 810 511 807 3.51e-53 199
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MsG0880042085.01.T01 AT4G39110 36.242 298 181 4 515 810 512 802 3.94e-53 199
MsG0880042085.01.T01 AT4G23290 39.145 304 172 7 517 813 308 605 4.06e-53 196
MsG0880042085.01.T01 AT1G68690 40.138 289 159 6 517 799 365 645 4.34e-53 196
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MsG0880042085.01.T01 AT1G69790 37.025 316 175 8 503 804 58 363 6.72e-53 189
MsG0880042085.01.T01 AT1G74360 39.597 298 155 8 517 803 802 1085 6.96e-53 200
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MsG0880042085.01.T01 AT4G11900 29.506 749 390 36 9 685 9 691 1.15e-52 196
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MsG0880042085.01.T01 AT5G63930 34.711 363 197 11 460 803 737 1078 1.84e-52 199
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MsG0880042085.01.T01 AT5G48740 31.649 376 239 7 441 811 523 885 5.21e-51 193
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MsG0880042085.01.T01 AT5G01950 36.364 308 175 7 510 809 607 901 5.37e-51 193
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MsG0880042085.01.T01 AT5G11020 36.991 319 188 9 497 811 71 380 7.93e-51 184
MsG0880042085.01.T01 AT2G11520 35.395 291 178 4 517 803 213 497 8.54e-51 186
MsG0880042085.01.T01 AT1G61370 29.978 447 269 14 383 815 368 784 8.82e-51 192
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MsG0880042085.01.T01 AT1G26150 38.206 301 167 7 517 808 418 708 9.84e-51 191
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MsG0880042085.01.T01 AT4G11460 36.842 304 181 7 517 815 334 631 1.24e-50 190
MsG0880042085.01.T01 AT4G13190 37.458 299 167 8 515 803 57 345 1.42e-50 182
MsG0880042085.01.T01 AT1G76370 38.667 300 163 9 515 804 61 349 1.47e-50 182
MsG0880042085.01.T01 AT1G01540 40.891 247 130 5 515 750 140 381 1.58e-50 182
MsG0880042085.01.T01 AT2G33170 36.964 303 165 7 517 803 807 1099 1.60e-50 192
MsG0880042085.01.T01 AT2G33170 36.964 303 165 7 517 803 807 1099 1.60e-50 192
MsG0880042085.01.T01 AT1G29750 39.394 297 169 6 517 809 669 958 1.98e-50 192
MsG0880042085.01.T01 AT1G29750 39.394 297 169 6 517 809 654 943 2.20e-50 192
MsG0880042085.01.T01 AT1G61390 31.096 447 255 14 389 816 222 634 2.68e-50 188
MsG0880042085.01.T01 AT1G17230 37.584 298 167 7 515 803 785 1072 2.84e-50 192
MsG0880042085.01.T01 AT4G29180 34.169 319 191 4 510 815 547 859 2.86e-50 191
MsG0880042085.01.T01 AT2G01950 37.658 316 167 8 511 804 820 1127 2.91e-50 192
MsG0880042085.01.T01 AT4G29180 34.169 319 191 4 510 815 550 862 3.01e-50 191
MsG0880042085.01.T01 AT4G02010 37.771 323 183 10 501 812 352 667 3.04e-50 189
MsG0880042085.01.T01 AT1G17230 38.176 296 164 7 517 803 787 1072 3.16e-50 192
MsG0880042085.01.T01 AT3G26940 35.849 318 183 9 504 808 47 356 3.22e-50 183
MsG0880042085.01.T01 AT4G23250 36.250 320 188 9 503 815 328 638 3.42e-50 189
MsG0880042085.01.T01 AT4G17660 38.436 307 170 8 513 808 75 373 3.68e-50 181
MsG0880042085.01.T01 AT4G29180 34.169 319 191 4 510 815 548 860 3.75e-50 191
MsG0880042085.01.T01 AT4G05200 36.545 301 179 8 517 812 335 628 3.86e-50 188
MsG0880042085.01.T01 AT2G14510 33.333 366 218 10 448 809 494 837 4.86e-50 190
MsG0880042085.01.T01 AT2G28990 37.241 290 171 5 517 804 567 847 4.93e-50 190
MsG0880042085.01.T01 AT2G28990 37.241 290 171 5 517 804 567 847 4.93e-50 190
MsG0880042085.01.T01 AT4G11460 36.482 307 181 7 517 815 334 634 5.01e-50 188
MsG0880042085.01.T01 AT2G18890 37.162 296 171 6 515 805 54 339 5.18e-50 181
MsG0880042085.01.T01 AT2G04300 34.810 316 192 7 490 800 501 807 5.18e-50 190
MsG0880042085.01.T01 AT4G23200 37.542 301 178 6 519 815 326 620 5.19e-50 187
MsG0880042085.01.T01 AT4G05200 36.545 301 179 8 517 812 353 646 5.31e-50 188
MsG0880042085.01.T01 AT2G14510 33.333 366 218 10 448 809 502 845 5.55e-50 190
MsG0880042085.01.T01 AT5G54590 34.354 294 180 4 517 810 103 383 6.27e-50 182
MsG0880042085.01.T01 AT5G54590 34.354 294 180 4 517 810 103 383 6.27e-50 182
MsG0880042085.01.T01 AT5G54590 34.354 294 180 4 517 810 103 383 6.27e-50 182
MsG0880042085.01.T01 AT5G56890 38.721 297 168 7 515 804 709 998 6.63e-50 191
MsG0880042085.01.T01 AT2G39360 36.242 298 179 6 517 810 475 765 6.76e-50 189
MsG0880042085.01.T01 AT1G51830 30.886 395 236 9 428 800 280 659 6.85e-50 187
MsG0880042085.01.T01 AT2G04300 34.810 316 192 7 490 800 542 848 7.18e-50 190
MsG0880042085.01.T01 AT1G51830 30.886 395 236 9 428 800 273 652 7.40e-50 187
MsG0880042085.01.T01 AT1G67520 37.097 310 182 8 514 816 244 547 9.06e-50 185
MsG0880042085.01.T01 AT4G23250 36.391 327 189 10 499 815 326 643 1.00e-49 187
MsG0880042085.01.T01 AT5G59260 35.135 333 199 8 482 809 310 630 1.08e-49 187
MsG0880042085.01.T01 AT3G58690 37.582 306 167 9 511 803 69 363 1.19e-49 180
MsG0880042085.01.T01 AT1G70530 42.491 273 141 9 465 730 259 522 1.25e-49 184
MsG0880042085.01.T01 AT5G18910 38.095 294 167 6 515 805 178 459 1.28e-49 183
MsG0880042085.01.T01 AT1G67520 37.097 310 182 8 514 816 273 576 1.45e-49 185
MsG0880042085.01.T01 AT1G67520 37.097 310 182 8 514 816 273 576 1.45e-49 185
MsG0880042085.01.T01 AT1G51790 32.749 342 216 4 474 811 521 852 1.48e-49 189
MsG0880042085.01.T01 AT1G51790 32.749 342 216 4 474 811 521 852 1.48e-49 189
MsG0880042085.01.T01 AT1G66880 39.333 300 162 10 514 805 333 620 1.50e-49 186
MsG0880042085.01.T01 AT4G00960 38.430 242 133 5 568 803 5 236 1.66e-49 176
MsG0880042085.01.T01 AT5G59270 34.203 345 198 9 481 809 312 643 1.72e-49 186
MsG0880042085.01.T01 AT1G07870 36.789 299 169 8 515 803 89 377 1.79e-49 181
MsG0880042085.01.T01 AT4G23210 36.601 306 181 7 517 818 348 644 1.91e-49 186
MsG0880042085.01.T01 AT5G59270 34.203 345 198 9 481 809 296 627 2.01e-49 186
MsG0880042085.01.T01 AT5G59270 34.203 345 198 9 481 809 293 624 2.06e-49 186
MsG0880042085.01.T01 AT4G23250 36.250 320 188 9 503 815 328 638 2.15e-49 189
MsG0880042085.01.T01 AT4G34500 36.054 294 175 6 517 804 133 419 2.26e-49 181
MsG0880042085.01.T01 AT1G26150 43.644 236 124 4 517 750 418 646 2.68e-49 185
MsG0880042085.01.T01 AT2G19190 33.861 316 199 4 493 807 540 846 2.77e-49 188
MsG0880042085.01.T01 AT1G69270 34.364 291 182 3 517 804 249 533 2.90e-49 183
MsG0880042085.01.T01 AT5G01950 36.102 313 174 8 510 809 607 906 3.12e-49 188
MsG0880042085.01.T01 AT1G51850 35.314 303 183 6 502 800 531 824 3.15e-49 187
MsG0880042085.01.T01 AT1G51850 35.314 303 183 6 502 800 551 844 3.20e-49 187
MsG0880042085.01.T01 AT1G67520 37.097 310 182 8 514 816 438 741 3.82e-49 186
MsG0880042085.01.T01 AT3G53590 32.520 369 195 10 462 808 559 895 3.91e-49 188
MsG0880042085.01.T01 AT1G66920 36.102 313 151 9 513 815 293 566 4.23e-49 183
MsG0880042085.01.T01 AT3G23750 37.417 302 169 8 522 812 571 863 4.34e-49 187
MsG0880042085.01.T01 AT3G09010 42.241 232 125 4 500 727 17 243 4.36e-49 176
MsG0880042085.01.T01 AT5G01560 33.832 334 205 6 475 803 310 632 4.43e-49 185
MsG0880042085.01.T01 AT2G20300 37.627 295 171 6 513 804 333 617 4.60e-49 186
MsG0880042085.01.T01 AT3G45410 36.190 315 189 6 491 803 306 610 4.87e-49 184
MsG0880042085.01.T01 AT5G18610 37.627 295 172 7 515 803 69 357 5.54e-49 181
MsG0880042085.01.T01 AT5G18610 37.627 295 172 7 515 803 69 357 5.54e-49 181
MsG0880042085.01.T01 AT5G18610 37.627 295 172 7 515 803 69 357 5.54e-49 181
MsG0880042085.01.T01 AT1G72540 36.721 305 182 7 513 810 68 368 5.71e-49 180
MsG0880042085.01.T01 AT2G29000 35.714 322 187 8 490 804 527 835 6.24e-49 187
MsG0880042085.01.T01 AT1G67520 37.097 310 182 8 514 816 488 791 6.25e-49 186
MsG0880042085.01.T01 AT1G07560 32.955 352 216 7 454 804 505 837 6.38e-49 187
MsG0880042085.01.T01 AT1G67520 37.097 310 182 8 514 816 481 784 6.82e-49 186
MsG0880042085.01.T01 AT4G29990 32.432 333 210 5 481 807 523 846 7.26e-49 186

Find 151 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 181 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AATGCAAGAATTTCTGATTT+TGG 0.113428 8:+3529220 MsG0880042085.01.T01:CDS
CAAGGAAAATTTGGAGAAAT+TGG 0.162388 8:+3529528 MsG0880042085.01.T01:CDS
ACATGGCTGCTTTCCCCTTC+TGG 0.219772 8:+3527342 MsG0880042085.01.T01:CDS
ATGCATCGTTCTTCAGTAAA+AGG 0.233838 8:-3528368 None:intergenic
ACCAATGGCTATTGTACTTT+TGG 0.240569 8:-3527289 None:intergenic
CTTCACTGCCACACGAGTTT+TGG 0.274048 8:-3528870 None:intergenic
CCTTCTGGTGACTTTGCCTT+TGG 0.279563 8:+3527357 MsG0880042085.01.T01:CDS
CAAAGGATCTATATGAGTTT+CGG 0.282941 8:+3528297 MsG0880042085.01.T01:CDS
ATTCAACTGATAGTGGAAAT+TGG 0.289365 8:+3528060 MsG0880042085.01.T01:CDS
ATTGTTGGACAAGGAAAATT+TGG 0.297882 8:+3529519 MsG0880042085.01.T01:CDS
TACTATGAAAGTAAAACTTT+TGG 0.302271 8:+3527834 MsG0880042085.01.T01:CDS
AAGAACTTGGTTCGTTTACT+TGG 0.306259 8:+3528971 MsG0880042085.01.T01:CDS
AATTGGTTATGATTGCTATT+TGG 0.306426 8:+3529545 MsG0880042085.01.T01:CDS
TGAACTAGTGAGTAACTATT+TGG 0.307215 8:-3528203 None:intergenic
AAAGGATCTATATGAGTTTC+GGG 0.310055 8:+3528298 MsG0880042085.01.T01:CDS
TGTAAATATATTGTTGGTTC+AGG 0.318159 8:+3528113 MsG0880042085.01.T01:CDS
TTGTTCACGGTCATTGGATT+TGG 0.323617 8:-3528557 None:intergenic
GAACTTCATTTACAAGATAA+TGG 0.331598 8:+3527759 MsG0880042085.01.T01:CDS
TTATACTTGTTCACGGTCAT+TGG 0.343582 8:-3528563 None:intergenic
CTCCAAATGGTGACCAGTTA+TGG 0.345283 8:+3527535 MsG0880042085.01.T01:CDS
GCACATCCTTGTACGAAATC+TGG 0.351074 8:-3528254 None:intergenic
AATATATGTAAATATATTGT+TGG 0.360464 8:+3528107 MsG0880042085.01.T01:CDS
AAAGCTTTCTTCAAGGCTTA+AGG 0.365527 8:+3527710 MsG0880042085.01.T01:CDS
ATCAAGCTCATAGGGAATTC+AGG 0.366186 8:+3528915 MsG0880042085.01.T01:CDS
GAGCTAGGAAGGGGAGCTTT+TGG 0.370757 8:+3528809 MsG0880042085.01.T01:CDS
TTCCATAACTGGTCACCATT+TGG 0.370779 8:-3527537 None:intergenic
GTCCCTCAGTATTCCATAAC+TGG 0.384254 8:-3527548 None:intergenic
CCACTATCAGTTGAATTCTT+CGG 0.384272 8:-3528053 None:intergenic
TAGAAAATGTGTTGAAGAAA+TGG 0.385751 8:+3529399 MsG0880042085.01.T01:CDS
TTATGTTGGATCAAGCTCAT+AGG 0.395176 8:+3528906 MsG0880042085.01.T01:CDS
TATAATAGCATATGCACTTT+GGG 0.396861 8:+3528152 MsG0880042085.01.T01:CDS
ATAAGTGAAGCAACGCAAAT+TGG 0.404939 8:-3528750 None:intergenic
AAGCAGCCATGTAGAGTTGC+TGG 0.407403 8:-3527331 None:intergenic
AAGAAGTTACCACTCTCAAA+TGG 0.410332 8:+3528458 MsG0880042085.01.T01:CDS
CAAAACCAACACTGGCATAA+GGG 0.411177 8:+3529273 MsG0880042085.01.T01:CDS
GTTCATCCTGATGATCCTTA+TGG 0.414651 8:+3528221 MsG0880042085.01.T01:CDS
ATCAGTGAGAAGAGTAGAAA+GGG 0.422634 8:-3527237 None:intergenic
AAGGGTATGTTGCACTTGAA+TGG 0.425674 8:+3529302 MsG0880042085.01.T01:CDS
CCGAAGAATTCAACTGATAG+TGG 0.426641 8:+3528053 MsG0880042085.01.T01:CDS
AAAAGATTAGTGTCTTTAAG+TGG 0.429127 8:-3527387 None:intergenic
TTAGGGACGGTAATAGTTGT+TGG 0.433625 8:+3528432 MsG0880042085.01.T01:CDS
GCAAAACCAACACTGGCATA+AGG 0.434511 8:+3529272 MsG0880042085.01.T01:CDS
TCTATTATTATACTTGTTCA+CGG 0.437813 8:-3528570 None:intergenic
AAGATGGAAAGCTTTCTTCA+AGG 0.438926 8:+3527703 MsG0880042085.01.T01:CDS
AGTTGCAGCACTAGATGTAT+TGG 0.439303 8:-3527859 None:intergenic
CAGCTACCATAAGGATCATC+AGG 0.442390 8:-3528227 None:intergenic
CTAAGGCTAGAACTTGCAAT+AGG 0.445674 8:+3529100 MsG0880042085.01.T01:CDS
AAGAAGAAGCTTAGAAGAGT+TGG 0.447986 8:+3528698 MsG0880042085.01.T01:CDS
TGCTTTAGATGCATTGGTTG+AGG 0.450168 8:+3529483 MsG0880042085.01.T01:CDS
ACGATGCATGAAAGCTTGTA+TGG 0.451881 8:+3528382 MsG0880042085.01.T01:CDS
GAGCTTGAAGAAGCTACTAA+TGG 0.455366 8:+3528776 MsG0880042085.01.T01:CDS
AATGATAAATTCTATATGTC+AGG 0.457064 8:+3527930 MsG0880042085.01.T01:CDS
TGTTCCCCTTATGCCAGTGT+TGG 0.460234 8:-3529278 None:intergenic
AGAAACCAAGTTGGAAACTA+AGG 0.460604 8:+3529083 MsG0880042085.01.T01:CDS
TTCACGGTCATTGGATTTGG+AGG 0.462783 8:-3528554 None:intergenic
GTGGAACTCAATGCCAATGA+TGG 0.463907 8:+3527498 MsG0880042085.01.T01:CDS
AGGAATGAACTGAATGTCAT+TGG 0.472292 8:+3528935 MsG0880042085.01.T01:CDS
TTCTATATGTCAGGAGAAGA+TGG 0.477287 8:+3527939 MsG0880042085.01.T01:CDS
TATATTGTTGGTTCAGGTAG+CGG 0.478209 8:+3528119 MsG0880042085.01.T01:CDS
TTGATTCATGTTCAACAACT+TGG 0.481887 8:-3529248 None:intergenic
AAGGAGTCAAATTTCAGTAA+AGG 0.482523 8:+3527729 MsG0880042085.01.T01:CDS
AATCAGTGAGAAGAGTAGAA+AGG 0.483464 8:-3527238 None:intergenic
AGTTAGCACCAACCCATCAT+TGG 0.485736 8:-3527511 None:intergenic
TATGTTGGATCAAGCTCATA+GGG 0.486112 8:+3528907 MsG0880042085.01.T01:CDS
GCTTTAGATGCATTGGTTGA+GGG 0.492786 8:+3529484 MsG0880042085.01.T01:CDS
TCTAGCCTTAGTTTCCAACT+TGG 0.493488 8:-3529088 None:intergenic
CTGAAACCAGCAACTCTACA+TGG 0.498407 8:+3527325 MsG0880042085.01.T01:CDS
GGGTGACAATGAGGCATTGT+TGG 0.499814 8:+3529504 MsG0880042085.01.T01:CDS
ATCTAGTGCTGCAACTCTAC+TGG 0.499885 8:+3527866 MsG0880042085.01.T01:CDS
CTCATGGTTGGTCTAAGACA+TGG 0.502812 8:-3529583 None:intergenic
TCTGGCTTGCAGCTACCATA+AGG 0.505830 8:-3528236 None:intergenic
ACTGGCATAAGGGGAACAAA+AGG 0.510314 8:+3529283 MsG0880042085.01.T01:CDS
GGAAGATTGTTTGTGTTCTG+TGG 0.512724 8:+3528403 MsG0880042085.01.T01:CDS
CTACTGGTCTTTGACAGATC+AGG 0.517249 8:+3527882 MsG0880042085.01.T01:CDS
ACATCCACCTTAGCAGTGAT+AGG 0.517443 8:-3529337 None:intergenic
AGAAGTTACCACTCTCAAAT+GGG 0.519368 8:+3528459 MsG0880042085.01.T01:CDS
AGATGGTGCTTTAGATGCAT+TGG 0.520683 8:+3529477 MsG0880042085.01.T01:CDS
TTGCATTGAAGTAATCATCA+AGG 0.520849 8:-3529204 None:intergenic
TCTCACTCATCACAAGAACT+TGG 0.521525 8:+3528958 MsG0880042085.01.T01:CDS
CACTGGCAACTTTGTGCTTG+AGG 0.521550 8:+3527605 MsG0880042085.01.T01:CDS
GATTTGACAAAGAGCTAGGA+AGG 0.528280 8:+3528798 MsG0880042085.01.T01:CDS
GGCAACTTTGTGCTTGAGGA+TGG 0.530802 8:+3527609 MsG0880042085.01.T01:CDS
GGTTCAGGTAGCGGTGTTTG+TGG 0.533080 8:+3528128 MsG0880042085.01.T01:CDS
AGTCAAATTTCAGTAAAGGA+AGG 0.535382 8:+3527733 MsG0880042085.01.T01:CDS
ATATAATAGCATATGCACTT+TGG 0.535594 8:+3528151 MsG0880042085.01.T01:CDS
TGTACCACGTTTCTCATGGT+TGG 0.535732 8:-3529595 None:intergenic
TAGAAAGGGAAGAAGTAGAG+TGG 0.536747 8:-3527223 None:intergenic
AGAGACAGTCCTGCACCAAA+AGG 0.541319 8:+3527468 MsG0880042085.01.T01:CDS
CATATGTACCACGTTTCTCA+TGG 0.542007 8:-3529599 None:intergenic
CATGCCTATCACTGCTAAGG+TGG 0.547572 8:+3529333 MsG0880042085.01.T01:CDS
GGTACATATGCTTGAAGGTA+CGG 0.548152 8:+3529612 MsG0880042085.01.T01:CDS
CGCGGTGTGTTCAATGACAC+TGG 0.549901 8:+3527588 MsG0880042085.01.T01:CDS
AGTAAAAGGCTTTAGAAGCA+CGG 0.552406 8:-3528354 None:intergenic
AAACATGCCTATCACTGCTA+AGG 0.553049 8:+3529330 MsG0880042085.01.T01:CDS
AATGGATTTGACAAAGAGCT+AGG 0.553883 8:+3528794 MsG0880042085.01.T01:CDS
AAAACCAACACTGGCATAAG+GGG 0.554678 8:+3529274 MsG0880042085.01.T01:CDS
TTGGTGCTAACTTCTCCAAA+TGG 0.556777 8:+3527522 MsG0880042085.01.T01:CDS
CTGGCATAAGGGGAACAAAA+GGG 0.557737 8:+3529284 MsG0880042085.01.T01:CDS
AAAGGCAAAGTCACCAGAAG+GGG 0.558811 8:-3527355 None:intergenic
ACCAAAAGTACAATAGCCAT+TGG 0.560244 8:+3527288 MsG0880042085.01.T01:CDS
TGCTATTTGGTGTGTTCAAG+AGG 0.562805 8:+3529558 MsG0880042085.01.T01:CDS
TGCACCAAAAGGATCAAAAG+TGG 0.563251 8:+3527479 MsG0880042085.01.T01:CDS
GGTTTGGGCTACAACACTGA+TGG 0.563744 8:-3527268 None:intergenic
AGAGTTGATGCAACACTTGA+TGG 0.565175 8:+3528482 MsG0880042085.01.T01:CDS
GCTTATGATTGCTACAAAGA+TGG 0.566889 8:+3529460 MsG0880042085.01.T01:CDS
AACGTGGTACATATGCTTGA+AGG 0.567972 8:+3529607 MsG0880042085.01.T01:CDS
ATACTAATTTGTGAGGGGTA+TGG 0.570380 8:-3529652 None:intergenic
AAGAGAAACAGAAACCAAGT+TGG 0.571061 8:+3529074 MsG0880042085.01.T01:CDS
TGCAAGCCAGATTTCGTACA+AGG 0.574786 8:+3528248 MsG0880042085.01.T01:CDS
TGCAACACTTGATGGTGCTA+AGG 0.575064 8:+3528490 MsG0880042085.01.T01:CDS
CTAATTTGTGAGGGGTATGG+TGG 0.575259 8:-3529649 None:intergenic
TATTGAATACTAATTTGTGA+GGG 0.576236 8:-3529658 None:intergenic
AGAAGCACGGAATCTGATAG+AGG 0.577946 8:-3528341 None:intergenic
TGGATTTGGAGGAAAATCAA+AGG 0.579770 8:-3528543 None:intergenic
AAGGTGGATGTGTATAGTTA+TGG 0.582669 8:+3529349 MsG0880042085.01.T01:CDS
CCAAAGGCAAAGTCACCAGA+AGG 0.587532 8:-3527357 None:intergenic
CTATTTGGACACTGACATGT+TGG 0.592360 8:-3528188 None:intergenic
CTCAGTGTTGGAGTTTCTCG+CGG 0.594018 8:+3527570 MsG0880042085.01.T01:CDS
GTACATGAGCAATAGCACTT+TGG 0.594956 8:+3529033 MsG0880042085.01.T01:CDS
ATATTGAATACTAATTTGTG+AGG 0.598109 8:-3529659 None:intergenic
TTTGACAAAGAGCTAGGAAG+GGG 0.600593 8:+3528800 MsG0880042085.01.T01:CDS
CAAAGGCAAAGTCACCAGAA+GGG 0.602530 8:-3527356 None:intergenic
CAATGAGGCATTGTTGGACA+AGG 0.602734 8:+3529510 MsG0880042085.01.T01:CDS
AAGAAACTGGGAAGGCAACA+AGG 0.603495 8:-3527676 None:intergenic
AATACTGAGGGACTCAGTGT+TGG 0.606339 8:+3527558 MsG0880042085.01.T01:CDS
TGGTGAATTCAAAAGTCAGT+GGG 0.609102 8:+3527629 MsG0880042085.01.T01:CDS
GAAGGCAACAAGGTATCACT+AGG 0.611424 8:-3527666 None:intergenic
ACTCAATGCCAATGATGGGT+TGG 0.616591 8:+3527503 MsG0880042085.01.T01:CDS
AATCAAAGCAAAACCAACAC+TGG 0.617595 8:+3529265 MsG0880042085.01.T01:CDS
TTTAAGTGGAAGAAAACCAA+AGG 0.631979 8:-3527373 None:intergenic
ATTGAATACTAATTTGTGAG+GGG 0.632216 8:-3529657 None:intergenic
TGGAACTCAATGCCAATGAT+GGG 0.642913 8:+3527499 MsG0880042085.01.T01:CDS
AGATGAACTAAGTAAAACAA+AGG 0.647735 8:+3528280 MsG0880042085.01.T01:CDS
AGCAGTAAAAGAATCACCAA+TGG 0.648839 8:-3527304 None:intergenic
ATGGTGAATTCAAAAGTCAG+TGG 0.652603 8:+3527628 MsG0880042085.01.T01:CDS
TTCCTGAGAAAACAGTTGTG+TGG 0.653842 8:+3527436 MsG0880042085.01.T01:CDS
CTTCTTGTACTGATAAACGA+AGG 0.655410 8:-3528681 None:intergenic
ATTTGACAAAGAGCTAGGAA+GGG 0.656890 8:+3528799 MsG0880042085.01.T01:CDS
GACCAGTTATGGAATACTGA+GGG 0.660014 8:+3527546 MsG0880042085.01.T01:CDS
TACATGAAGAGTGCATCACT+AGG 0.660747 8:+3529146 MsG0880042085.01.T01:CDS
TCAACTCTCCCATTTGAGAG+TGG 0.665246 8:-3528467 None:intergenic
CTTGTACTGATAAACGAAGG+AGG 0.668868 8:-3528678 None:intergenic
CACAGCTTCCAAAACTCGTG+TGG 0.670359 8:+3528862 MsG0880042085.01.T01:CDS
TCATCAAGGAGTATGTTCTG+AGG 0.689139 8:-3529190 None:intergenic
ATTGGTTGAGGGTGACAATG+AGG 0.691332 8:+3529495 MsG0880042085.01.T01:CDS
CTTGCAATAGGAATAGCTAG+AGG 0.700553 8:+3529112 MsG0880042085.01.T01:CDS
GTGGAAATTGGACTACAGTG+TGG 0.705463 8:+3528072 MsG0880042085.01.T01:CDS
TCTGAGGCTTTATGTCACAA+TGG 0.705958 8:-3529174 None:intergenic
ATTTGGAGGAAAATCAAAGG+AGG 0.706692 8:-3528540 None:intergenic
TGACCAGTTATGGAATACTG+AGG 0.709109 8:+3527545 MsG0880042085.01.T01:CDS
TAGACCAACCATGAGAAACG+TGG 0.745629 8:+3529591 MsG0880042085.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATATATGTAAATATATTGT+TGG + Chr8:3528107-3528126 MsG0880042085.01.T01:CDS 10.0%
!! GTATAATAATAGAAAAACTT+TGG + Chr8:3528580-3528599 MsG0880042085.01.T01:CDS 15.0%
!! AATGATAAATTCTATATGTC+AGG + Chr8:3527930-3527949 MsG0880042085.01.T01:CDS 20.0%
!! TCTATTATTATACTTGTTCA+CGG - Chr8:3528573-3528592 None:intergenic 20.0%
!!! ATATTGAATACTAATTTGTG+AGG - Chr8:3529662-3529681 None:intergenic 20.0%
!!! ATCTTTTTTTGCTTTCTATT+TGG + Chr8:3527403-3527422 MsG0880042085.01.T01:CDS 20.0%
!!! TACTATGAAAGTAAAACTTT+TGG + Chr8:3527834-3527853 MsG0880042085.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTGAATACTAATTTGTGA+GGG - Chr8:3529661-3529680 None:intergenic 20.0%
!!! TCTAAGATAAAAATTAGTAG+TGG - Chr8:3527991-3528010 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTCATTTTCATAATCAGA+TGG - Chr8:3527813-3527832 None:intergenic 20.0%
! AAAAGATTAGTGTCTTTAAG+TGG - Chr8:3527390-3527409 None:intergenic 25.0%
! AGATGAACTAAGTAAAACAA+AGG + Chr8:3528280-3528299 MsG0880042085.01.T01:CDS 25.0%
! ATATAATAGCATATGCACTT+TGG + Chr8:3528151-3528170 MsG0880042085.01.T01:CDS 25.0%
! GAACTTCATTTACAAGATAA+TGG + Chr8:3527759-3527778 MsG0880042085.01.T01:CDS 25.0%
! TAATAGAAAAACTTTGGTTG+TGG + Chr8:3528586-3528605 MsG0880042085.01.T01:CDS 25.0%
! TAGAAAATGTGTTGAAGAAA+TGG + Chr8:3529399-3529418 MsG0880042085.01.T01:CDS 25.0%
! TATAATAGCATATGCACTTT+GGG + Chr8:3528152-3528171 MsG0880042085.01.T01:CDS 25.0%
!! AATGCAAGAATTTCTGATTT+TGG + Chr8:3529220-3529239 MsG0880042085.01.T01:CDS 25.0%
!! AATTGGTTATGATTGCTATT+TGG + Chr8:3529545-3529564 MsG0880042085.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTGAATACTAATTTGTGAG+GGG - Chr8:3529660-3529679 None:intergenic 25.0%
!!! ACAAAGCTATTTTAACTGAT+TGG + Chr8:3529437-3529456 MsG0880042085.01.T01:CDS 25.0%
!!! CAAAGCTATTTTAACTGATT+GGG + Chr8:3529438-3529457 MsG0880042085.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGTAAATATATTGTTGGTTC+AGG + Chr8:3528113-3528132 MsG0880042085.01.T01:CDS 25.0%
AAAGGATCTATATGAGTTTC+GGG + Chr8:3528298-3528317 MsG0880042085.01.T01:CDS 30.0%
AAGGAGTCAAATTTCAGTAA+AGG + Chr8:3527729-3527748 MsG0880042085.01.T01:CDS 30.0%
AGTCAAATTTCAGTAAAGGA+AGG + Chr8:3527733-3527752 MsG0880042085.01.T01:CDS 30.0%
ATTGTTGGACAAGGAAAATT+TGG + Chr8:3529519-3529538 MsG0880042085.01.T01:CDS 30.0%
CAAAGGATCTATATGAGTTT+CGG + Chr8:3528297-3528316 MsG0880042085.01.T01:CDS 30.0%
CAAGGAAAATTTGGAGAAAT+TGG + Chr8:3529528-3529547 MsG0880042085.01.T01:CDS 30.0%
TGAACTAGTGAGTAACTATT+TGG - Chr8:3528206-3528225 None:intergenic 30.0%
TTGATTCATGTTCAACAACT+TGG - Chr8:3529251-3529270 None:intergenic 30.0%
TTGCATTGAAGTAATCATCA+AGG - Chr8:3529207-3529226 None:intergenic 30.0%
TTTAAGTGGAAGAAAACCAA+AGG - Chr8:3527376-3527395 None:intergenic 30.0%
! AACTGTTTTCTCAGGAATTT+TGG - Chr8:3527433-3527452 None:intergenic 30.0%
! ACTGTTTTCTCAGGAATTTT+GGG - Chr8:3527432-3527451 None:intergenic 30.0%
! AGAGCAACTCTAAATTTTGA+TGG + Chr8:3528008-3528027 MsG0880042085.01.T01:CDS 30.0%
! GCTTTTGGTATTGTTTATGA+AGG + Chr8:3528824-3528843 MsG0880042085.01.T01:CDS 30.0%
!! ATCTTTTCTCACTTTGAAGA+AGG - Chr8:3528516-3528535 None:intergenic 30.0%
!! ATTCAACTGATAGTGGAAAT+TGG + Chr8:3528060-3528079 MsG0880042085.01.T01:CDS 30.0%
!! GAAGTTGAACAGTTTTATGT+TGG + Chr8:3528892-3528911 MsG0880042085.01.T01:CDS 30.0%
!! TCCATCTTTTTGAAGAAACT+GGG - Chr8:3527691-3527710 None:intergenic 30.0%
!! TTCCATCTTTTTGAAGAAAC+TGG - Chr8:3527692-3527711 None:intergenic 30.0%
AAAGCTTTCTTCAAGGCTTA+AGG + Chr8:3527710-3527729 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAGAAGCTTAGAAGAGT+TGG + Chr8:3528698-3528717 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAGTTACCACTCTCAAA+TGG + Chr8:3528458-3528477 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
AAGAGAAACAGAAACCAAGT+TGG + Chr8:3529074-3529093 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
AAGATGGAAAGCTTTCTTCA+AGG + Chr8:3527703-3527722 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
AAGGTGGATGTGTATAGTTA+TGG + Chr8:3529349-3529368 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
AATCAAAGCAAAACCAACAC+TGG + Chr8:3529265-3529284 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
AATCAGTGAGAAGAGTAGAA+AGG - Chr8:3527241-3527260 None:intergenic 35.0%
AGAAAAACTTTGGTTGTGGT+TGG + Chr8:3528590-3528609 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
AGAAGTTACCACTCTCAAAT+GGG + Chr8:3528459-3528478 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
AGCAGTAAAAGAATCACCAA+TGG - Chr8:3527307-3527326 None:intergenic 35.0%
AGGAATGAACTGAATGTCAT+TGG + Chr8:3528935-3528954 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
ATAAGTGAAGCAACGCAAAT+TGG - Chr8:3528753-3528772 None:intergenic 35.0%
ATCAGTGAGAAGAGTAGAAA+GGG - Chr8:3527240-3527259 None:intergenic 35.0%
ATGCATCGTTCTTCAGTAAA+AGG - Chr8:3528371-3528390 None:intergenic 35.0%
ATGGTGAATTCAAAAGTCAG+TGG + Chr8:3527628-3527647 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
ATTTGACAAAGAGCTAGGAA+GGG + Chr8:3528799-3528818 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
ATTTGGAGGAAAATCAAAGG+AGG - Chr8:3528543-3528562 None:intergenic 35.0%
CCACTATCAGTTGAATTCTT+CGG - Chr8:3528056-3528075 None:intergenic 35.0%
GCTTATGATTGCTACAAAGA+TGG + Chr8:3529460-3529479 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
TATGTTGGATCAAGCTCATA+GGG + Chr8:3528907-3528926 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
TCCCAGTTTCTTCAAAAAGA+TGG + Chr8:3527687-3527706 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
TGGATTTGGAGGAAAATCAA+AGG - Chr8:3528546-3528565 None:intergenic 35.0%
TGGTGAATTCAAAAGTCAGT+GGG + Chr8:3527629-3527648 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
TTATACTTGTTCACGGTCAT+TGG - Chr8:3528566-3528585 None:intergenic 35.0%
TTATGTTGGATCAAGCTCAT+AGG + Chr8:3528906-3528925 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
TTCTATATGTCAGGAGAAGA+TGG + Chr8:3527939-3527958 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
! AAGAACTTGGTTCGTTTACT+TGG + Chr8:3528971-3528990 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
! AATGGATTTGACAAAGAGCT+AGG + Chr8:3528794-3528813 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
! ACCAAAAGTACAATAGCCAT+TGG + Chr8:3527288-3527307 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
! ACCAATGGCTATTGTACTTT+TGG - Chr8:3527292-3527311 None:intergenic 35.0%
! AGAAACCAAGTTGGAAACTA+AGG + Chr8:3529083-3529102 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
! ATACTAATTTGTGAGGGGTA+TGG - Chr8:3529655-3529674 None:intergenic 35.0%
! CTTCTTGTACTGATAAACGA+AGG - Chr8:3528684-3528703 None:intergenic 35.0%
! TTACTTGGATTTTGTGAGAG+TGG + Chr8:3528986-3529005 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
!! AGTAAAAGGCTTTAGAAGCA+CGG - Chr8:3528357-3528376 None:intergenic 35.0%
!! AGTTCCACTTTTGATCCTTT+TGG - Chr8:3527486-3527505 None:intergenic 35.0%
!! TATATTGTTGGTTCAGGTAG+CGG + Chr8:3528119-3528138 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
!! TCTTTTTGAAGAAACTGGGA+AGG - Chr8:3527687-3527706 None:intergenic 35.0%
!! TGGCTATTGTACTTTTGGTT+TGG - Chr8:3527287-3527306 None:intergenic 35.0%
!!! GGCTATTGTACTTTTGGTTT+GGG - Chr8:3527286-3527305 None:intergenic 35.0%
!!! GTGTTCTGTGGCTATTTTTA+GGG + Chr8:3528415-3528434 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGTGTTCTGTGGCTATTTTT+AGG + Chr8:3528414-3528433 MsG0880042085.01.T01:CDS 35.0%
AAAACCAACACTGGCATAAG+GGG + Chr8:3529274-3529293 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
AAACATGCCTATCACTGCTA+AGG + Chr8:3529330-3529349 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
AACGTGGTACATATGCTTGA+AGG + Chr8:3529607-3529626 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
ACGATGCATGAAAGCTTGTA+TGG + Chr8:3528382-3528401 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
AGTTGCAGCACTAGATGTAT+TGG - Chr8:3527862-3527881 None:intergenic 40.0%
ATCAAGCTCATAGGGAATTC+AGG + Chr8:3528915-3528934 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
CAAAACCAACACTGGCATAA+GGG + Chr8:3529273-3529292 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
CATATGTACCACGTTTCTCA+TGG - Chr8:3529602-3529621 None:intergenic 40.0%
CCGAAGAATTCAACTGATAG+TGG + Chr8:3528053-3528072 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
CTAAGGCTAGAACTTGCAAT+AGG + Chr8:3529100-3529119 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
CTATTTGGACACTGACATGT+TGG - Chr8:3528191-3528210 None:intergenic 40.0%
CTTGCAATAGGAATAGCTAG+AGG + Chr8:3529112-3529131 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
GACCAGTTATGGAATACTGA+GGG + Chr8:3527546-3527565 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
GAGCTTGAAGAAGCTACTAA+TGG + Chr8:3528776-3528795 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
GATTTGACAAAGAGCTAGGA+AGG + Chr8:3528798-3528817 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
GGAAGATTGTTTGTGTTCTG+TGG + Chr8:3528403-3528422 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
GGTACATATGCTTGAAGGTA+CGG + Chr8:3529612-3529631 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
GTACATGAGCAATAGCACTT+TGG + Chr8:3529033-3529052 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
GTTCATCCTGATGATCCTTA+TGG + Chr8:3528221-3528240 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
TAGAAAGGGAAGAAGTAGAG+TGG - Chr8:3527226-3527245 None:intergenic 40.0%
TCTCACTCATCACAAGAACT+TGG + Chr8:3528958-3528977 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
TGACCAGTTATGGAATACTG+AGG + Chr8:3527545-3527564 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
TGCACCAAAAGGATCAAAAG+TGG + Chr8:3527479-3527498 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
TGGAACTCAATGCCAATGAT+GGG + Chr8:3527499-3527518 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
TTAGGGACGGTAATAGTTGT+TGG + Chr8:3528432-3528451 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
TTCCATAACTGGTCACCATT+TGG - Chr8:3527540-3527559 None:intergenic 40.0%
TTCCTGAGAAAACAGTTGTG+TGG + Chr8:3527436-3527455 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
TTGTTCACGGTCATTGGATT+TGG - Chr8:3528560-3528579 None:intergenic 40.0%
TTTGACAAAGAGCTAGGAAG+GGG + Chr8:3528800-3528819 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
! AAGGGTATGTTGCACTTGAA+TGG + Chr8:3529302-3529321 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
! AGATGGTGCTTTAGATGCAT+TGG + Chr8:3529477-3529496 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
! CTTGTACTGATAAACGAAGG+AGG - Chr8:3528681-3528700 None:intergenic 40.0%
! TACATGAAGAGTGCATCACT+AGG + Chr8:3529146-3529165 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
! TACCACACAACTGTTTTCTC+AGG - Chr8:3527441-3527460 None:intergenic 40.0%
! TCATCAAGGAGTATGTTCTG+AGG - Chr8:3529193-3529212 None:intergenic 40.0%
! TCTGAGGCTTTATGTCACAA+TGG - Chr8:3529177-3529196 None:intergenic 40.0%
!! ACTTTTGATCCTTTTGGTGC+AGG - Chr8:3527480-3527499 None:intergenic 40.0%
!! AGAGTTGATGCAACACTTGA+TGG + Chr8:3528482-3528501 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
!! GCTTTAGATGCATTGGTTGA+GGG + Chr8:3529484-3529503 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
!! TCTAGCCTTAGTTTCCAACT+TGG - Chr8:3529091-3529110 None:intergenic 40.0%
!! TGCTATTTGGTGTGTTCAAG+AGG + Chr8:3529558-3529577 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
!! TGCTTTAGATGCATTGGTTG+AGG + Chr8:3529483-3529502 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGGTGCTAACTTCTCCAAA+TGG + Chr8:3527522-3527541 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
!!! TCTGTGGCTATTTTTAGGGA+CGG + Chr8:3528419-3528438 MsG0880042085.01.T01:CDS 40.0%
AAAGGCAAAGTCACCAGAAG+GGG - Chr8:3527358-3527377 None:intergenic 45.0%
AAGAAACTGGGAAGGCAACA+AGG - Chr8:3527679-3527698 None:intergenic 45.0%
AATACTGAGGGACTCAGTGT+TGG + Chr8:3527558-3527577 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
ACATCCACCTTAGCAGTGAT+AGG - Chr8:3529340-3529359 None:intergenic 45.0%
ACTGGCATAAGGGGAACAAA+AGG + Chr8:3529283-3529302 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
AGTTAGCACCAACCCATCAT+TGG - Chr8:3527514-3527533 None:intergenic 45.0%
ATCTAGTGCTGCAACTCTAC+TGG + Chr8:3527866-3527885 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
ATTGGTTGAGGGTGACAATG+AGG + Chr8:3529495-3529514 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
CAAAGGCAAAGTCACCAGAA+GGG - Chr8:3527359-3527378 None:intergenic 45.0%
CAGCTACCATAAGGATCATC+AGG - Chr8:3528230-3528249 None:intergenic 45.0%
CTCCAAATGGTGACCAGTTA+TGG + Chr8:3527535-3527554 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
CTGAAACCAGCAACTCTACA+TGG + Chr8:3527325-3527344 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
CTGGCATAAGGGGAACAAAA+GGG + Chr8:3529284-3529303 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
GCAAAACCAACACTGGCATA+AGG + Chr8:3529272-3529291 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
GCACATCCTTGTACGAAATC+TGG - Chr8:3528257-3528276 None:intergenic 45.0%
GTCCCTCAGTATTCCATAAC+TGG - Chr8:3527551-3527570 None:intergenic 45.0%
GTGGAAATTGGACTACAGTG+TGG + Chr8:3528072-3528091 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
GTGGAACTCAATGCCAATGA+TGG + Chr8:3527498-3527517 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
TAGACCAACCATGAGAAACG+TGG + Chr8:3529591-3529610 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
TCAACTCTCCCATTTGAGAG+TGG - Chr8:3528470-3528489 None:intergenic 45.0%
TGCAAGCCAGATTTCGTACA+AGG + Chr8:3528248-3528267 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
TGTACCACGTTTCTCATGGT+TGG - Chr8:3529598-3529617 None:intergenic 45.0%
TTCACGGTCATTGGATTTGG+AGG - Chr8:3528557-3528576 None:intergenic 45.0%
! AGAAGCACGGAATCTGATAG+AGG - Chr8:3528344-3528363 None:intergenic 45.0%
! CTAATTTGTGAGGGGTATGG+TGG - Chr8:3529652-3529671 None:intergenic 45.0%
! GAAGGCAACAAGGTATCACT+AGG - Chr8:3527669-3527688 None:intergenic 45.0%
!! ACTCAATGCCAATGATGGGT+TGG + Chr8:3527503-3527522 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
!! CAATGAGGCATTGTTGGACA+AGG + Chr8:3529510-3529529 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
!! CTACTGGTCTTTGACAGATC+AGG + Chr8:3527882-3527901 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
!! CTCATGGTTGGTCTAAGACA+TGG - Chr8:3529586-3529605 None:intergenic 45.0%
!! TGCAACACTTGATGGTGCTA+AGG + Chr8:3528490-3528509 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
!!! GGGTTTTGAATGACACTGAC+TGG + Chr8:3528318-3528337 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
!!! GTGGTTGGTTCTGTGCTTTT+CGG + Chr8:3528605-3528624 MsG0880042085.01.T01:CDS 45.0%
!!! ATATATTTACATATATTTTT+AGG - Chr8:3528104-3528123 None:intergenic 5.0%
AAGCAGCCATGTAGAGTTGC+TGG - Chr8:3527334-3527353 None:intergenic 50.0%
AGAGACAGTCCTGCACCAAA+AGG + Chr8:3527468-3527487 MsG0880042085.01.T01:CDS 50.0%
CACAGCTTCCAAAACTCGTG+TGG + Chr8:3528862-3528881 MsG0880042085.01.T01:CDS 50.0%
CACTGGCAACTTTGTGCTTG+AGG + Chr8:3527605-3527624 MsG0880042085.01.T01:CDS 50.0%
CATGCCTATCACTGCTAAGG+TGG + Chr8:3529333-3529352 MsG0880042085.01.T01:CDS 50.0%
CCAAAGGCAAAGTCACCAGA+AGG - Chr8:3527360-3527379 None:intergenic 50.0%
CCTTCTGGTGACTTTGCCTT+TGG + Chr8:3527357-3527376 MsG0880042085.01.T01:CDS 50.0%
GGCAACTTTGTGCTTGAGGA+TGG + Chr8:3527609-3527628 MsG0880042085.01.T01:CDS 50.0%
GGTTTGGGCTACAACACTGA+TGG - Chr8:3527271-3527290 None:intergenic 50.0%
TGTTCCCCTTATGCCAGTGT+TGG - Chr8:3529281-3529300 None:intergenic 50.0%
! CTCAGTGTTGGAGTTTCTCG+CGG + Chr8:3527570-3527589 MsG0880042085.01.T01:CDS 50.0%
! CTTCACTGCCACACGAGTTT+TGG - Chr8:3528873-3528892 None:intergenic 50.0%
! TCTGGCTTGCAGCTACCATA+AGG - Chr8:3528239-3528258 None:intergenic 50.0%
!! GGGTGACAATGAGGCATTGT+TGG + Chr8:3529504-3529523 MsG0880042085.01.T01:CDS 50.0%
CGCGGTGTGTTCAATGACAC+TGG + Chr8:3527588-3527607 MsG0880042085.01.T01:CDS 55.0%
! ACATGGCTGCTTTCCCCTTC+TGG + Chr8:3527342-3527361 MsG0880042085.01.T01:CDS 55.0%
! GAGCTAGGAAGGGGAGCTTT+TGG + Chr8:3528809-3528828 MsG0880042085.01.T01:CDS 55.0%
! GGTTCAGGTAGCGGTGTTTG+TGG + Chr8:3528128-3528147 MsG0880042085.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 3527216 3529693 3527216 ID=MsG0880042085.01;Name=MsG0880042085.01
Chr8 mRNA 3527216 3529693 3527216 ID=MsG0880042085.01.T01;Parent=MsG0880042085.01;Name=MsG0880042085.01.T01;_AED=0.36;_eAED=0.36;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|825
Chr8 exon 3527216 3529693 3527216 ID=MsG0880042085.01.T01:exon:2211;Parent=MsG0880042085.01.T01
Chr8 CDS 3527216 3529693 3527216 ID=MsG0880042085.01.T01:cds;Parent=MsG0880042085.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880042085.01.T01

ATGGCTTCCACTCTACTTCTTCCCTTTCTACTCTTCTCACTGATTCTTCAATCCATCAGTGTTGTAGCCCAAACCAAAAGTACAATAGCCATTGGTGATTCTTTTACTGCTGAAACCAGCAACTCTACATGGCTGCTTTCCCCTTCTGGTGACTTTGCCTTTGGTTTTCTTCCACTTAAAGACACTAATCTTTTTTTGCTTTCTATTTGGTATCCCAAAATTCCTGAGAAAACAGTTGTGTGGTATGCTAATAGAGACAGTCCTGCACCAAAAGGATCAAAAGTGGAACTCAATGCCAATGATGGGTTGGTGCTAACTTCTCCAAATGGTGACCAGTTATGGAATACTGAGGGACTCAGTGTTGGAGTTTCTCGCGGTGTGTTCAATGACACTGGCAACTTTGTGCTTGAGGATGGTGAATTCAAAAGTCAGTGGGAAACTTTCAACTTTCCTAGTGATACCTTGTTGCCTTCCCAGTTTCTTCAAAAAGATGGAAAGCTTTCTTCAAGGCTTAAGGAGTCAAATTTCAGTAAAGGAAGGTTTGAACTTCATTTACAAGATAATGGTGATCTTGTTATGTATTCTATTAATTTACCATCTGATTATGAAAATGAAAACTACTATGAAAGTAAAACTTTTGGATCCAATACATCTAGTGCTGCAACTCTACTGGTCTTTGACAGATCAGGAGACTTGTATCTCTTGAGAGAGAACAATGATAAATTCTATATGTCAGGAGAAGATGGTGCAGAAGATGAAGAGAGTAAAGTCTCCACTACTAATTTTTATCTTAGAGCAACTCTAAATTTTGATGGAGTGTTTTCACTTTTCAAGCATCCGAAGAATTCAACTGATAGTGGAAATTGGACTACAGTGTGGTCTCATCCTAAAAATATATGTAAATATATTGTTGGTTCAGGTAGCGGTGTTTGTGGATATAATAGCATATGCACTTTGGGAGATGATAAGAGACCAACATGTCAGTGTCCAAATAGTTACTCACTAGTTCATCCTGATGATCCTTATGGTAGCTGCAAGCCAGATTTCGTACAAGGATGTGCAGAAGATGAACTAAGTAAAACAAAGGATCTATATGAGTTTCGGGTTTTGAATGACACTGACTGGCCTCTATCAGATTCCGTGCTTCTAAAGCCTTTTACTGAAGAACGATGCATGAAAGCTTGTATGGAAGATTGTTTGTGTTCTGTGGCTATTTTTAGGGACGGTAATAGTTGTTGGAAAAAGAAGTTACCACTCTCAAATGGGAGAGTTGATGCAACACTTGATGGTGCTAAGGCCTTCTTCAAAGTGAGAAAAGATAACGCCTCCTTTGATTTTCCTCCAAATCCAATGACCGTGAACAAGTATAATAATAGAAAAACTTTGGTTGTGGTTGGTTCTGTGCTTTTCGGTAGCTCTGCTATTCTAAATTTTGTACTGATTGTAGCAATTTGTGTCAGCACCTCCTTCGTTTATCAGTACAAGAAGAAGCTTAGAAGAGTTGGCAAAAGTGACGCTAGCGTTGAAATTGAATCCAATTTGCGTTGCTTCACTTATGCAGAGCTTGAAGAAGCTACTAATGGATTTGACAAAGAGCTAGGAAGGGGAGCTTTTGGTATTGTTTATGAAGGAGTCGTCAACAACAACACAGCTTCCAAAACTCGTGTGGCAGTGAAGAAGTTGAACAGTTTTATGTTGGATCAAGCTCATAGGGAATTCAGGAATGAACTGAATGTCATTGGTCTCACTCATCACAAGAACTTGGTTCGTTTACTTGGATTTTGTGAGAGTGGAAGTGAAAGACTGCTTGTTTATGAGTACATGAGCAATAGCACTTTGGCAAGTTTTCTATTCAATGAAGAGAAACAGAAACCAAGTTGGAAACTAAGGCTAGAACTTGCAATAGGAATAGCTAGAGGACTTGTGTATTTACATGAAGAGTGCATCACTAGGATCATCCATTGTGACATAAAGCCTCAGAACATACTCCTTGATGATTACTTCAATGCAAGAATTTCTGATTTTGGATTAGCCAAGTTGTTGAACATGAATCAAAGCAAAACCAACACTGGCATAAGGGGAACAAAAGGGTATGTTGCACTTGAATGGTTTAAAAACATGCCTATCACTGCTAAGGTGGATGTGTATAGTTATGGTGTAGTGCTACTTGAGATAATATCATGTAGAAAATGTGTTGAAGAAATGGATGAAGAAGATGAAGACAAAGCTATTTTAACTGATTGGGCTTATGATTGCTACAAAGATGGTGCTTTAGATGCATTGGTTGAGGGTGACAATGAGGCATTGTTGGACAAGGAAAATTTGGAGAAATTGGTTATGATTGCTATTTGGTGTGTTCAAGAGGATCCATGTCTTAGACCAACCATGAGAAACGTGGTACATATGCTTGAAGGTACGGTTGAAGTGCAAGTTCCACCATACCCCTCACAAATTAGTATTCAATATTCTCTAAATTAA

Protein sequence

>MsG0880042085.01.T01

MASTLLLPFLLFSLILQSISVVAQTKSTIAIGDSFTAETSNSTWLLSPSGDFAFGFLPLKDTNLFLLSIWYPKIPEKTVVWYANRDSPAPKGSKVELNANDGLVLTSPNGDQLWNTEGLSVGVSRGVFNDTGNFVLEDGEFKSQWETFNFPSDTLLPSQFLQKDGKLSSRLKESNFSKGRFELHLQDNGDLVMYSINLPSDYENENYYESKTFGSNTSSAATLLVFDRSGDLYLLRENNDKFYMSGEDGAEDEESKVSTTNFYLRATLNFDGVFSLFKHPKNSTDSGNWTTVWSHPKNICKYIVGSGSGVCGYNSICTLGDDKRPTCQCPNSYSLVHPDDPYGSCKPDFVQGCAEDELSKTKDLYEFRVLNDTDWPLSDSVLLKPFTEERCMKACMEDCLCSVAIFRDGNSCWKKKLPLSNGRVDATLDGAKAFFKVRKDNASFDFPPNPMTVNKYNNRKTLVVVGSVLFGSSAILNFVLIVAICVSTSFVYQYKKKLRRVGKSDASVEIESNLRCFTYAELEEATNGFDKELGRGAFGIVYEGVVNNNTASKTRVAVKKLNSFMLDQAHREFRNELNVIGLTHHKNLVRLLGFCESGSERLLVYEYMSNSTLASFLFNEEKQKPSWKLRLELAIGIARGLVYLHEECITRIIHCDIKPQNILLDDYFNARISDFGLAKLLNMNQSKTNTGIRGTKGYVALEWFKNMPITAKVDVYSYGVVLLEIISCRKCVEEMDEEDEDKAILTDWAYDCYKDGALDALVEGDNEALLDKENLEKLVMIAIWCVQEDPCLRPTMRNVVHMLEGTVEVQVPPYPSQISIQYSLN*