AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380015896.01


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MsG0380015896.01.T01 AT2G28080 30.323 310 174 6 72 351 175 472 3.68e-35 134
MsG0380015896.01.T01 AT5G05870 29.592 294 158 5 97 350 170 454 4.28e-35 134
MsG0380015896.01.T01 AT2G23250 27.181 298 168 8 92 350 148 435 6.89e-35 133
MsG0380015896.01.T01 AT4G34131 30.464 302 159 8 94 350 184 479 1.13e-34 133
MsG0380015896.01.T01 AT2G15490 31.418 261 138 5 127 350 221 477 2.69e-34 132
MsG0380015896.01.T01 AT2G15490 31.061 264 138 5 127 350 221 480 7.08e-34 130
MsG0380015896.01.T01 AT5G05860 32.342 269 141 4 113 351 191 448 7.33e-34 130
MsG0380015896.01.T01 AT1G05530 26.966 356 195 10 45 351 116 455 9.11e-34 130
MsG0380015896.01.T01 AT5G14860 32.270 282 142 8 105 350 207 475 1.13e-33 130
MsG0380015896.01.T01 AT2G36770 30.882 272 139 6 127 353 224 491 8.12e-33 128
MsG0380015896.01.T01 AT3G53160 33.212 274 132 8 127 354 218 486 8.25e-33 128
MsG0380015896.01.T01 AT2G36780 32.472 271 134 7 127 352 224 490 1.14e-32 127
MsG0380015896.01.T01 AT2G23260 28.283 297 175 10 86 350 163 453 1.49e-32 127
MsG0380015896.01.T01 AT4G14090 31.164 292 154 10 92 349 176 454 1.60e-32 126
MsG0380015896.01.T01 AT3G02100 34.286 245 126 8 127 348 228 460 1.68e-32 127
MsG0380015896.01.T01 AT2G36750 33.574 277 123 9 127 352 219 485 2.86e-32 126
MsG0380015896.01.T01 AT2G15480 31.034 261 139 5 127 350 224 480 4.46e-32 125
MsG0380015896.01.T01 AT1G10400 32.997 297 148 11 84 350 187 462 6.51e-32 125
MsG0380015896.01.T01 AT2G30140 29.801 302 172 8 80 354 166 454 1.08e-31 124
MsG0380015896.01.T01 AT2G30140 29.801 302 172 8 80 354 167 455 1.15e-31 124
MsG0380015896.01.T01 AT1G24100 29.276 304 166 7 86 350 165 458 2.88e-31 123
MsG0380015896.01.T01 AT2G30150 29.043 303 174 7 75 350 148 436 3.73e-31 122
MsG0380015896.01.T01 AT2G36790 32.727 275 128 9 127 352 223 489 3.84e-31 123
MsG0380015896.01.T01 AT2G30150 29.043 303 174 7 75 350 164 452 4.75e-31 122
MsG0380015896.01.T01 AT2G36800 32.364 275 129 8 127 352 223 489 5.32e-31 123
MsG0380015896.01.T01 AT5G26310 26.708 322 158 9 86 349 165 466 1.57e-30 121
MsG0380015896.01.T01 AT2G15480 30.258 271 138 6 127 350 224 490 1.77e-30 121
MsG0380015896.01.T01 AT4G36770 32.174 230 96 6 150 335 235 448 6.01e-30 119
MsG0380015896.01.T01 AT2G36760 29.412 272 143 6 127 353 224 491 7.24e-30 120
MsG0380015896.01.T01 AT4G34135 28.904 301 166 6 94 350 185 481 9.92e-30 119
MsG0380015896.01.T01 AT1G01420 30.081 246 115 6 127 327 213 446 1.72e-29 118
MsG0380015896.01.T01 AT1G01420 30.081 246 115 6 127 327 210 443 1.76e-29 118
MsG0380015896.01.T01 AT5G66690 28.014 282 133 7 123 349 200 466 2.90e-29 118
MsG0380015896.01.T01 AT3G16520 28.383 303 159 9 86 348 173 457 6.17e-28 114
MsG0380015896.01.T01 AT3G50740 27.465 284 131 7 127 352 209 475 7.09e-28 114
MsG0380015896.01.T01 AT2G16890 30.888 259 131 8 127 350 222 467 7.26e-28 114
MsG0380015896.01.T01 AT5G37950 33.796 216 96 7 84 268 138 337 2.27e-27 110
MsG0380015896.01.T01 AT5G37950 33.796 216 96 7 84 268 144 343 3.00e-27 110
MsG0380015896.01.T01 AT2G18570 27.575 301 140 10 105 345 179 461 4.22e-27 112
MsG0380015896.01.T01 AT3G22250 27.820 266 146 6 95 320 176 435 4.43e-27 111
MsG0380015896.01.T01 AT3G53150 27.492 331 174 10 86 356 191 515 5.35e-27 112
MsG0380015896.01.T01 AT4G34138 28.399 331 183 9 66 350 156 478 8.63e-27 111
MsG0380015896.01.T01 AT1G01390 29.268 287 145 5 103 343 186 460 1.08e-26 110
MsG0380015896.01.T01 AT1G01390 29.268 287 145 5 103 343 203 477 1.15e-26 110
MsG0380015896.01.T01 AT3G16520 28.679 265 134 7 86 310 173 422 6.71e-26 108
MsG0380015896.01.T01 AT3G16520 28.679 265 134 7 86 310 173 422 8.04e-26 108
MsG0380015896.01.T01 AT3G21790 27.737 274 136 6 127 350 217 478 1.22e-25 107
MsG0380015896.01.T01 AT1G07250 28.517 263 139 6 127 351 222 473 2.35e-25 107
MsG0380015896.01.T01 AT2G18560 26.910 301 142 10 105 345 89 371 4.41e-25 105
MsG0380015896.01.T01 AT1G07240 28.358 268 137 8 127 351 221 476 6.32e-25 105
MsG0380015896.01.T01 AT2G29740 28.854 253 128 9 127 340 225 464 1.44e-24 104
MsG0380015896.01.T01 AT3G21800 28.114 281 137 8 127 355 213 480 4.70e-24 103
MsG0380015896.01.T01 AT1G07260 27.820 266 138 8 127 351 220 472 5.15e-24 103
MsG0380015896.01.T01 AT5G03490 29.200 250 139 9 128 350 224 462 5.21e-23 100
MsG0380015896.01.T01 AT4G15260 24.915 293 156 6 113 355 81 359 6.09e-23 98.6
MsG0380015896.01.T01 AT2G29730 27.027 259 145 9 127 351 215 463 6.90e-23 99.8
MsG0380015896.01.T01 AT2G29750 27.407 270 141 9 127 356 225 479 1.55e-22 99.0
MsG0380015896.01.T01 AT4G15280 26.165 279 139 8 127 353 213 476 2.50e-22 98.2
MsG0380015896.01.T01 AT4G15280 26.165 279 139 8 127 353 245 508 2.81e-22 98.2
MsG0380015896.01.T01 AT2G29710 25.589 297 168 9 92 351 183 463 6.40e-22 97.1
MsG0380015896.01.T01 AT3G21760 24.038 312 170 7 90 350 185 480 9.58e-22 96.7
MsG0380015896.01.T01 AT3G21750 24.924 329 181 12 80 351 150 469 2.33e-21 95.5
MsG0380015896.01.T01 AT3G21780 24.830 294 160 6 111 355 192 473 7.22e-21 94.0
MsG0380015896.01.T01 AT1G73880 24.232 293 177 7 93 351 186 467 3.00e-19 89.0
MsG0380015896.01.T01 AT2G16890 27.962 211 105 7 127 303 222 419 4.31e-17 82.4
MsG0380015896.01.T01 AT1G51210 25.869 259 152 9 93 324 186 431 2.98e-16 80.1
MsG0380015896.01.T01 AT5G65550 30.114 176 84 4 187 328 270 440 8.33e-16 79.0
MsG0380015896.01.T01 AT5G49690 29.630 162 87 4 187 322 267 427 3.90e-15 76.6
MsG0380015896.01.T01 AT5G12890 26.159 302 154 12 94 339 182 470 1.15e-14 75.5
MsG0380015896.01.T01 AT1G06000 24.719 267 147 12 127 350 178 433 7.70e-14 72.8
MsG0380015896.01.T01 AT4G27560 23.221 267 155 9 120 351 196 447 2.58e-13 71.2
MsG0380015896.01.T01 AT1G64910 25.316 237 125 9 120 321 193 412 1.67e-12 68.6

Find 83 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 188 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CGGCAAGTGGTTCGAGTTTA+TGG 0.083284 3:-76431782 MsG0380015896.01.T01:CDS
TTATGCAACACTTGGAAAAT+AGG 0.198741 3:-76431367 MsG0380015896.01.T01:CDS
AAATTAACCATGATGTTAAA+AGG 0.220501 3:-76431339 MsG0380015896.01.T01:CDS
ACTATTTGTTGGCCTTTCTT+TGG 0.270197 3:-76431415 MsG0380015896.01.T01:CDS
AATCAACACATTTGAAGAAT+TGG 0.298250 3:-76431910 MsG0380015896.01.T01:CDS
GCATAACATGGTTGAATAGA+TGG 0.304278 3:-76431743 MsG0380015896.01.T01:CDS
CATCATTTCCATCACAAGTT+TGG 0.304396 3:+76431306 None:intergenic
CGGTTGCGGCGGAGGTTAAA+TGG 0.305793 3:-76432658 MsG0380015896.01.T01:CDS
TATGCAACACTTGGAAAATA+GGG 0.331166 3:-76431366 MsG0380015896.01.T01:CDS
GGACCAATGTCATATATGTT+TGG 0.332878 3:+76431852 None:intergenic
GACCAATGTCATATATGTTT+GGG 0.345790 3:+76431853 None:intergenic
TTCGCCACATGTAGTTCCTT+GGG 0.346769 3:+76433814 None:intergenic
AAAGCTAAGTTAAACTACTT+TGG 0.351860 3:-76433864 MsG0380015896.01.T01:CDS
TAATCTAACCAGTCTCATTT+AGG 0.354293 3:+76433784 None:intergenic
GAAATGATGGAAGGAGAAAA+AGG 0.359746 3:-76431292 MsG0380015896.01.T01:CDS
CTAGATGAAGTTAAGGATAG+AGG 0.360667 3:-76431553 MsG0380015896.01.T01:intron
TCAGTCCTATATGTTAATTA+TGG 0.370543 3:-76431711 MsG0380015896.01.T01:CDS
AGTAAGTTAGGTTCAGAGAA+TGG 0.382736 3:-76432590 MsG0380015896.01.T01:CDS
CTTTGGAAACAAGTTTAGAT+TGG 0.385572 3:-76432061 MsG0380015896.01.T01:CDS
TTCAGATACGGTTGCGGCGG+AGG 0.393588 3:-76432666 MsG0380015896.01.T01:intron
GTGAGCAACAAACAAATTGT+AGG 0.402362 3:-76431393 MsG0380015896.01.T01:CDS
TTTCGCCACATGTAGTTCCT+TGG 0.404466 3:+76433813 None:intergenic
GCTATCGATGGTAGTAAGTT+AGG 0.408879 3:-76432602 MsG0380015896.01.T01:CDS
CAGGTGTGCCTACTATTTGT+TGG 0.410855 3:-76431426 MsG0380015896.01.T01:CDS
GTGAAGCACTTGACACCCTT+AGG 0.440930 3:-76431884 MsG0380015896.01.T01:CDS
GTAAGTTAGGTTCAGAGAAT+GGG 0.449402 3:-76432589 MsG0380015896.01.T01:CDS
CACTTCCATAATTAACATAT+AGG 0.451185 3:+76431706 None:intergenic
CTGATGGATGATCAAGAACT+TGG 0.453339 3:+76431503 None:intergenic
TCTGTGATTCTTATGAAGCT+TGG 0.465282 3:+76432002 None:intergenic
CACAGGCGATGGTGCGTGTA+CGG 0.466509 3:-76432634 MsG0380015896.01.T01:CDS
ACAAGTTTAGATTGGATCTC+GGG 0.469911 3:-76432053 MsG0380015896.01.T01:CDS
GTTTGTTGCTCACCAAAGAA+AGG 0.473094 3:+76431403 None:intergenic
CAAACTTGTGATGGAAATGA+TGG 0.476926 3:-76431305 MsG0380015896.01.T01:CDS
AATTCCAACCACAATGAGTC+AGG 0.479825 3:+76431470 None:intergenic
GATGTAATGTTTAATTTCCA+AGG 0.484094 3:-76431972 MsG0380015896.01.T01:CDS
AACAAGTTTAGATTGGATCT+CGG 0.488590 3:-76432054 MsG0380015896.01.T01:CDS
CCCATGCAAATTCTTTCAAG+TGG 0.489947 3:+76431664 None:intergenic
AATTAACCATGATGTTAAAA+GGG 0.491706 3:-76431338 MsG0380015896.01.T01:CDS
CTTGATCATCCATCAGTTGG+AGG 0.492019 3:-76431496 MsG0380015896.01.T01:CDS
CACTTTCCTGAGATGGAACA+TGG 0.494914 3:-76431810 MsG0380015896.01.T01:CDS
GGTTCCTGACTCATTGTGGT+TGG 0.497226 3:-76431474 MsG0380015896.01.T01:CDS
GTAAAACCATGTTCCATCTC+AGG 0.499581 3:+76431804 None:intergenic
ACCACTTGAAAGAATTTGCA+TGG 0.503004 3:-76431665 MsG0380015896.01.T01:CDS
TGGTAGGCACTTTCCTGAGA+TGG 0.504695 3:-76431817 MsG0380015896.01.T01:CDS
ACACTTGAAACTATTTCAGC+AGG 0.509242 3:-76431445 MsG0380015896.01.T01:CDS
AAGAAAGGCCAACAAATAGT+AGG 0.513282 3:+76431418 None:intergenic
GTTCTTGATCATCCATCAGT+TGG 0.519116 3:-76431499 MsG0380015896.01.T01:CDS
GGTTAAATGGCCACAGGCGA+TGG 0.520853 3:-76432645 MsG0380015896.01.T01:CDS
ATTGGTCCACTTCACATGCT+TGG 0.530255 3:-76431837 MsG0380015896.01.T01:CDS
TTGATCATCCATCAGTTGGA+GGG 0.530662 3:-76431495 MsG0380015896.01.T01:CDS
AGAGATGAGACAAAACTGCT+TGG 0.532493 3:-76431266 MsG0380015896.01.T01:CDS
AGAGATAACCAAACTTGTGA+TGG 0.538882 3:-76431314 MsG0380015896.01.T01:CDS
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AACTACATGTGGCGAAAACA+TGG 0.541606 3:-76433807 MsG0380015896.01.T01:CDS
GTCAGGAACCCTCCAACTGA+TGG 0.542338 3:+76431487 None:intergenic
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AGCTACAGATGCTACTAATG+TGG 0.548442 3:-76431230 MsG0380015896.01.T01:CDS
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GTAGGTATTTATGCAACACT+TGG 0.560031 3:-76431375 MsG0380015896.01.T01:CDS
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CAACACTTGGAAAATAGGGA+TGG 0.580082 3:-76431362 MsG0380015896.01.T01:CDS
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GCTACAGATGCTACTAATGT+GGG 0.582080 3:-76431229 MsG0380015896.01.T01:CDS
TGCCTACCAAGCATGTGAAG+TGG 0.583854 3:+76431831 None:intergenic
GTCAGATTCAGATACGGTTG+CGG 0.587989 3:-76432672 MsG0380015896.01.T01:intron
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TTAACATATAGGACTGAGCA+AGG 0.608706 3:+76431717 None:intergenic
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CGGCGGAGAACTGCTATCGA+TGG 0.626309 3:-76432614 MsG0380015896.01.T01:CDS
TCGCCACATGTAGTTCCTTG+GGG 0.633012 3:+76433815 None:intergenic
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CGTACACGCACCATCGCCTG+TGG 0.651629 3:+76432635 None:intergenic
CACTTGAAAGAATTTGCATG+GGG 0.652156 3:-76431663 MsG0380015896.01.T01:CDS
AGGCGATGGTGCGTGTACGG+CGG 0.656774 3:-76432631 MsG0380015896.01.T01:CDS
CTACCCCAAGGAACTACATG+TGG 0.663249 3:-76433818 MsG0380015896.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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!! TAATTAAAAGAAATTGATAA+AGG + Chr3:76431901-76431920 None:intergenic 10.0%
!!! TATTTAAATTTGTATTTTTG+TGG + Chr3:76431984-76432003 None:intergenic 10.0%
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!! AATTAACCATGATGTTAAAA+GGG - Chr3:76433703-76433722 MsG0380015896.01.T01:intron 20.0%
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!! TTTGGAAAAAGAAGTTATAA+TGG - Chr3:76431195-76431214 MsG0380015896.01.T01:CDS 20.0%
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!!! TTGTATTTTTGTGGTTTTAT+TGG + Chr3:76431975-76431994 None:intergenic 20.0%
!!! TTTAGGTTTAAATTAGGTTT+AGG - Chr3:76432562-76432581 MsG0380015896.01.T01:intron 20.0%
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! AATCAACACATTTGAAGAAT+TGG - Chr3:76433131-76433150 MsG0380015896.01.T01:intron 25.0%
! CACTTCCATAATTAACATAT+AGG + Chr3:76433338-76433357 None:intergenic 25.0%
! CTATCCAAATATGATATTGT+TGG + Chr3:76431378-76431397 None:intergenic 25.0%
! TCAGTCCTATATGTTAATTA+TGG - Chr3:76433330-76433349 MsG0380015896.01.T01:intron 25.0%
!! AGATTTTCTAGATGAAGTTA+AGG - Chr3:76433481-76433500 MsG0380015896.01.T01:intron 25.0%
!! CTAGGTTTAGGTTAAAATTA+GGG - Chr3:76432627-76432646 MsG0380015896.01.T01:CDS 25.0%
!! GATGTAATGTTTAATTTCCA+AGG - Chr3:76433069-76433088 MsG0380015896.01.T01:intron 25.0%
!! GTTAGGTTTAGGTTTAAATT+AGG - Chr3:76432556-76432575 MsG0380015896.01.T01:intron 25.0%
!! TTACCATTTTATGGATAATG+AGG - Chr3:76433417-76433436 MsG0380015896.01.T01:intron 25.0%
!!! CTAATTTTAACCTAAACCTA+GGG + Chr3:76432628-76432647 None:intergenic 25.0%
!!! GAAATTTCTTATGTTTTGAC+AGG + Chr3:76431805-76431824 None:intergenic 25.0%
AAAATGAGAGAGAAAAACAG+AGG - Chr3:76432317-76432336 MsG0380015896.01.T01:intron 30.0%
AAACAAATGCATTACCTGAA+TGG - Chr3:76431723-76431742 MsG0380015896.01.T01:CDS 30.0%
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! GATGAAAATTTTATTGCGGA+TGG - Chr3:76432955-76432974 MsG0380015896.01.T01:intron 30.0%
! GGTAATTAAGCTTTATGTCA+GGG - Chr3:76432583-76432602 MsG0380015896.01.T01:CDS 30.0%
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!! GAGGAAAATTTGTTAGGTTT+AGG - Chr3:76432545-76432564 MsG0380015896.01.T01:intron 30.0%
!! GTCATATATGTTTGGGTTTT+TGG + Chr3:76433184-76433203 None:intergenic 30.0%
!!! AATTTTGTGCTTTAGAACCT+TGG + Chr3:76433089-76433108 None:intergenic 30.0%
!!! TGGTTTTATTGGGTAAACAA+TGG + Chr3:76431964-76431983 None:intergenic 30.0%
AAGAAAGGCCAACAAATAGT+AGG + Chr3:76433626-76433645 None:intergenic 35.0%
ACAAGTTTAGATTGGATCTC+GGG - Chr3:76432988-76433007 MsG0380015896.01.T01:intron 35.0%
ACACTTGAAACTATTTCAGC+AGG - Chr3:76433596-76433615 MsG0380015896.01.T01:intron 35.0%
ACCACTTGAAAGAATTTGCA+TGG - Chr3:76433376-76433395 MsG0380015896.01.T01:intron 35.0%
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CATCATTTCCATCACAAGTT+TGG + Chr3:76433738-76433757 None:intergenic 35.0%
CCACTTGAAAGAATTTGCAT+GGG - Chr3:76433377-76433396 MsG0380015896.01.T01:intron 35.0%
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CTTCATTGACCATCATTCAA+TGG - Chr3:76431533-76431552 MsG0380015896.01.T01:CDS 35.0%
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TTAAAAACTATCCACGCTGA+CGG + Chr3:76432768-76432787 None:intergenic 35.0%
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TTAGGGCTAACATTTGCTTA+TGG - Chr3:76432644-76432663 MsG0380015896.01.T01:CDS 35.0%
TTGATGTGTGATTCTCTTCA+GGG - Chr3:76432154-76432173 MsG0380015896.01.T01:intron 35.0%
TTTGATGTGTGATTCTCTTC+AGG - Chr3:76432153-76432172 MsG0380015896.01.T01:intron 35.0%
! AATGTGATCGATTTAGTACC+TGG - Chr3:76432083-76432102 MsG0380015896.01.T01:CDS 35.0%
! CAAACTTGTGATGGAAATGA+TGG - Chr3:76433736-76433755 MsG0380015896.01.T01:intron 35.0%
! GAAATGATGGAAGGAGAAAA+AGG - Chr3:76433749-76433768 MsG0380015896.01.T01:intron 35.0%
! GTGTTGTTGAGAATGAAAAG+TGG + Chr3:76431942-76431961 None:intergenic 35.0%
! TCTCTTCCCTTTTAACATCA+TGG + Chr3:76433712-76433731 None:intergenic 35.0%
!! ACTATTTGTTGGCCTTTCTT+TGG - Chr3:76433626-76433645 MsG0380015896.01.T01:intron 35.0%
!! TGAGATGGAACATGGTTTTA+CGG - Chr3:76433239-76433258 MsG0380015896.01.T01:intron 35.0%
AAACATGGCCTAAATGAGAC+TGG - Chr3:76431249-76431268 MsG0380015896.01.T01:CDS 40.0%
AACTACATGTGGCGAAAACA+TGG - Chr3:76431234-76431253 MsG0380015896.01.T01:CDS 40.0%
AAGAGAATGAGTGTCTCAGA+TGG - Chr3:76431296-76431315 MsG0380015896.01.T01:CDS 40.0%
AATGAGGCCAGATGTAGTAA+TGG - Chr3:76433433-76433452 MsG0380015896.01.T01:intron 40.0%
AATTCCAACCACAATGAGTC+AGG + Chr3:76433574-76433593 None:intergenic 40.0%
ACATGTTCACTTCACTGTTG+TGG + Chr3:76431337-76431356 None:intergenic 40.0%
ACCAACAAATCAAGATGCAG+AGG - Chr3:76432116-76432135 MsG0380015896.01.T01:intron 40.0%
AGAAAAGGGAGAGAGAATTG+GGG - Chr3:76432487-76432506 MsG0380015896.01.T01:intron 40.0%
AGAGAAAAGGGAGAGAGAAT+TGG - Chr3:76432485-76432504 MsG0380015896.01.T01:intron 40.0%
AGAGATGAGACAAAACTGCT+TGG - Chr3:76433775-76433794 MsG0380015896.01.T01:intron 40.0%
AGCTACAGATGCTACTAATG+TGG - Chr3:76433811-76433830 MsG0380015896.01.T01:CDS 40.0%
ATGAGGCCAGATGTAGTAAT+GGG - Chr3:76433434-76433453 MsG0380015896.01.T01:intron 40.0%
CAACACTTGGAAAATAGGGA+TGG - Chr3:76433679-76433698 MsG0380015896.01.T01:intron 40.0%
CCCATGCAAATTCTTTCAAG+TGG + Chr3:76433380-76433399 None:intergenic 40.0%
CGATTTAGTACCTGGAGAAA+TGG - Chr3:76432091-76432110 MsG0380015896.01.T01:intron 40.0%
GACACAATATAAGGGACTTC+CGG - Chr3:76431623-76431642 MsG0380015896.01.T01:intron 40.0%
GAGAAAAGGGAGAGAGAATT+GGG - Chr3:76432486-76432505 MsG0380015896.01.T01:intron 40.0%
GCTACAGATGCTACTAATGT+GGG - Chr3:76433812-76433831 MsG0380015896.01.T01:CDS 40.0%
GCTATCGATGGTAGTAAGTT+AGG - Chr3:76432439-76432458 MsG0380015896.01.T01:intron 40.0%
GTAAAACCATGTTCCATCTC+AGG + Chr3:76433240-76433259 None:intergenic 40.0%
GTTCTTGATCATCCATCAGT+TGG - Chr3:76433542-76433561 MsG0380015896.01.T01:intron 40.0%
TCTTCACCCATTACTACATC+TGG + Chr3:76433443-76433462 None:intergenic 40.0%
TGACAGAAACACTTCAAGGA+TGG + Chr3:76431847-76431866 None:intergenic 40.0%
TTGATCATCCATCAGTTGGA+GGG - Chr3:76433546-76433565 MsG0380015896.01.T01:intron 40.0%
! CTGATGGATGATCAAGAACT+TGG + Chr3:76433541-76433560 None:intergenic 40.0%
! CTTGTGATGGAAATGATGGA+AGG - Chr3:76433740-76433759 MsG0380015896.01.T01:intron 40.0%
! GTTTGTTGCTCACCAAAGAA+AGG + Chr3:76433641-76433660 None:intergenic 40.0%
! TTTTATTGCGGATGGCACTT+TGG - Chr3:76432963-76432982 MsG0380015896.01.T01:intron 40.0%
!! TCCTCTGCATCTTGATTTGT+TGG + Chr3:76432120-76432139 None:intergenic 40.0%
!! TTGTTGGTTTCCATTTCTCC+AGG + Chr3:76432104-76432123 None:intergenic 40.0%
AAAAGGGAGAGAGAATTGGG+GGG - Chr3:76432489-76432508 MsG0380015896.01.T01:intron 45.0%
ACAGATGCTACTAATGTGGG+AGG - Chr3:76433815-76433834 MsG0380015896.01.T01:CDS 45.0%
ATTGGTCCACTTCACATGCT+TGG - Chr3:76433204-76433223 MsG0380015896.01.T01:intron 45.0%
CACTTTCCTGAGATGGAACA+TGG - Chr3:76433231-76433250 MsG0380015896.01.T01:intron 45.0%
CAGAAACACTTCAAGGATGG+TGG + Chr3:76431844-76431863 None:intergenic 45.0%
CAGGTGTGCCTACTATTTGT+TGG - Chr3:76433615-76433634 MsG0380015896.01.T01:intron 45.0%
CCAAATCGTCACAGCAACAA+AGG - Chr3:76431752-76431771 MsG0380015896.01.T01:CDS 45.0%
CCTTTGTTGCTGTGACGATT+TGG + Chr3:76431755-76431774 None:intergenic 45.0%
CTTGATCATCCATCAGTTGG+AGG - Chr3:76433545-76433564 MsG0380015896.01.T01:intron 45.0%
GAAAAGGGAGAGAGAATTGG+GGG - Chr3:76432488-76432507 MsG0380015896.01.T01:intron 45.0%
GGTGTGACTGTGAGAGAAAA+GGG - Chr3:76432473-76432492 MsG0380015896.01.T01:intron 45.0%
GTCAGATTCAGATACGGTTG+CGG - Chr3:76432369-76432388 MsG0380015896.01.T01:intron 45.0%
TCAACTCACAGTTCTTGCAG+CGG - Chr3:76432190-76432209 MsG0380015896.01.T01:intron 45.0%
TGAGACAAAACTGCTTGGAG+TGG - Chr3:76433780-76433799 MsG0380015896.01.T01:intron 45.0%
TTCGCCACATGTAGTTCCTT+GGG + Chr3:76431230-76431249 None:intergenic 45.0%
TTTCGCCACATGTAGTTCCT+TGG + Chr3:76431231-76431250 None:intergenic 45.0%
! ACAGTTCTTGCAGCGGTTTT+CGG - Chr3:76432197-76432216 MsG0380015896.01.T01:intron 45.0%
! ATAATGGGAAAGCTACCCCA+AGG - Chr3:76431211-76431230 MsG0380015896.01.T01:CDS 45.0%
! TGAAGCACTTGACACCCTTA+GGG - Chr3:76433158-76433177 MsG0380015896.01.T01:intron 45.0%
!! CGATTTGGTTTCGACCATTC+AGG + Chr3:76431740-76431759 None:intergenic 45.0%
!! GAACATGGTTTTACGGCAAG+TGG - Chr3:76433246-76433265 MsG0380015896.01.T01:intron 45.0%
!!! GTTTGGGTTTTTGGCCCTAA+GGG + Chr3:76433175-76433194 None:intergenic 45.0%
!!! TGTTTGGGTTTTTGGCCCTA+AGG + Chr3:76433176-76433195 None:intergenic 45.0%
AGATTCAGATACGGTTGCGG+CGG - Chr3:76432372-76432391 MsG0380015896.01.T01:intron 50.0%
ATTTGCATACACCGTCAGCG+TGG - Chr3:76432754-76432773 MsG0380015896.01.T01:intron 50.0%
CTACCCCAAGGAACTACATG+TGG - Chr3:76431223-76431242 MsG0380015896.01.T01:CDS 50.0%
GCAAAAGCAGCGATTGAGAG+AGG - Chr3:76432262-76432281 MsG0380015896.01.T01:intron 50.0%
GGGTGTGACTGTGAGAGAAA+AGG - Chr3:76432472-76432491 MsG0380015896.01.T01:intron 50.0%
GGTTCCTGACTCATTGTGGT+TGG - Chr3:76433567-76433586 MsG0380015896.01.T01:intron 50.0%
GTCCACTTCACATGCTTGGT+AGG - Chr3:76433208-76433227 MsG0380015896.01.T01:intron 50.0%
GTTGGAGAAGAAACGCGTGA+GGG - Chr3:76432517-76432536 MsG0380015896.01.T01:intron 50.0%
TCGCCACATGTAGTTCCTTG+GGG + Chr3:76431229-76431248 None:intergenic 50.0%
TGCCTACCAAGCATGTGAAG+TGG + Chr3:76433213-76433232 None:intergenic 50.0%
TGGTAGGCACTTTCCTGAGA+TGG - Chr3:76433224-76433243 MsG0380015896.01.T01:intron 50.0%
! ACAGAGGTTCTGATGTGAGC+AGG - Chr3:76432333-76432352 MsG0380015896.01.T01:intron 50.0%
! AGTTCTTGCAGCGGTTTTCG+GGG - Chr3:76432199-76432218 MsG0380015896.01.T01:intron 50.0%
! CAGTTCTTGCAGCGGTTTTC+GGG - Chr3:76432198-76432217 MsG0380015896.01.T01:intron 50.0%
! CGGCAAGTGGTTCGAGTTTA+TGG - Chr3:76433259-76433278 MsG0380015896.01.T01:intron 50.0%
! GTGAAGCACTTGACACCCTT+AGG - Chr3:76433157-76433176 MsG0380015896.01.T01:intron 50.0%
AGACGGAACTGGAGGAGATG+AGG - Chr3:76432226-76432245 MsG0380015896.01.T01:intron 55.0%
CATCAACTCTCGCACGACAC+CGG + Chr3:76431645-76431664 None:intergenic 55.0%
GAAACGCGTGAGGGAAAGAG+AGG - Chr3:76432526-76432545 MsG0380015896.01.T01:intron 55.0%
GAGAGAGAATTGGGGGGAGA+GGG - Chr3:76432495-76432514 MsG0380015896.01.T01:intron 55.0%
GGAGGGTTCCTGACTCATTG+TGG - Chr3:76433563-76433582 MsG0380015896.01.T01:intron 55.0%
GGTTAAATGGCCACAGGCGA+TGG - Chr3:76432396-76432415 MsG0380015896.01.T01:intron 55.0%
GGTTGGAGAAGAAACGCGTG+AGG - Chr3:76432516-76432535 MsG0380015896.01.T01:intron 55.0%
GTCAGGAACCCTCCAACTGA+TGG + Chr3:76433557-76433576 None:intergenic 55.0%
CACAGGCGATGGTGCGTGTA+CGG - Chr3:76432407-76432426 MsG0380015896.01.T01:intron 60.0%
CGGCGGAGAACTGCTATCGA+TGG - Chr3:76432427-76432446 MsG0380015896.01.T01:intron 60.0%
CGGTTGCGGCGGAGGTTAAA+TGG - Chr3:76432383-76432402 MsG0380015896.01.T01:intron 60.0%
GAGAATTGGGGGGAGAGGGT+TGG - Chr3:76432499-76432518 MsG0380015896.01.T01:intron 60.0%
GGAGAGAGAATTGGGGGGAG+AGG - Chr3:76432494-76432513 MsG0380015896.01.T01:intron 60.0%
GGCGGAGGTTAAATGGCCAC+AGG - Chr3:76432390-76432409 MsG0380015896.01.T01:intron 60.0%
TTCAGATACGGTTGCGGCGG+AGG - Chr3:76432375-76432394 MsG0380015896.01.T01:intron 60.0%
TTCGGGGAGGTAGACGGAAC+TGG - Chr3:76432215-76432234 MsG0380015896.01.T01:intron 60.0%
!! GCGGTTTTCGGGGAGGTAGA+CGG - Chr3:76432209-76432228 MsG0380015896.01.T01:intron 60.0%
!! TCTTGCAGCGGTTTTCGGGG+AGG - Chr3:76432202-76432221 MsG0380015896.01.T01:intron 60.0%
AGGCGATGGTGCGTGTACGG+CGG - Chr3:76432410-76432429 MsG0380015896.01.T01:intron 65.0%
CGTACACGCACCATCGCCTG+TGG + Chr3:76432409-76432428 None:intergenic 65.0%
GGGGAGGTAGACGGAACTGG+AGG - Chr3:76432218-76432237 MsG0380015896.01.T01:intron 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 76431165 76433898 76431165 ID=MsG0380015896.01;Name=MsG0380015896.01
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Chr3 exon 76433793 76433898 76433793 ID=MsG0380015896.01.T01:exon:1348;Parent=MsG0380015896.01.T01
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Chr3 exon 76431652 76432107 76431652 ID=MsG0380015896.01.T01:exon:1346;Parent=MsG0380015896.01.T01
Chr3 exon 76431165 76431571 76431165 ID=MsG0380015896.01.T01:exon:1345;Parent=MsG0380015896.01.T01
Chr3 CDS 76433793 76433898 76433793 ID=MsG0380015896.01.T01:cds;Parent=MsG0380015896.01.T01
Chr3 CDS 76432582 76432683 76432582 ID=MsG0380015896.01.T01:cds;Parent=MsG0380015896.01.T01
Chr3 CDS 76431652 76432107 76431652 ID=MsG0380015896.01.T01:cds;Parent=MsG0380015896.01.T01
Chr3 CDS 76431165 76431571 76431165 ID=MsG0380015896.01.T01:cds;Parent=MsG0380015896.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380015896.01.T01

ATGTGTACATTCAAAGCTAAGTTAAACTACTTTGGAAAAAGAAGTTATAATGGGAAAGCTACCCCAAGGAACTACATGTGGCGAAAACATGGCCTAAATGAGACTGATACGGTTGCGGCGGAGGTTAAATGGCCACAGGCGATGGTGCGTGTACGGCGGAGAACTGCTATCGATGGTAGTAAGTTAGGTTCAGAGAATGGGTGTGACTATGAAAATTTTATTGCGGATGGCACTTTGGAAACAAGTTTAGATTGGATCTCGGGAATGAAAGATATTAGACTAAAAGACCTTCCAAGCTTCATAAGAATCACAGATCTTAATGATGTAATGTTTAATTTCCAAGGTTCTAAAGCACAAAATTGTTTAAGATCATCAATGATTATAATCAACACATTTGAAGAATTGGAAGGTGAAGCACTTGACACCCTTAGGGCCAAAAACCCAAACATATATGACATTGGTCCACTTCACATGCTTGGTAGGCACTTTCCTGAGATGGAACATGGTTTTACGGCAAGTGGTTCGAGTTTATGGAAATCTGACATAGAATGCATAACATGGTTGAATAGATGGAAACCTTGCTCAGTCCTATATGTTAATTATGGAAGTGTAACTGTTATGACTGATCACCACTTGAAAGAATTTGCATGGGGAATAGCAAATAATGAAGTTAAGGATAGAGGATACATAACTAGTTGGTGCATGCAAGACCAAGTTCTTGATCATCCATCAGTTGGAGGGTTCCTGACTCATTGTGGTTGGAATTCTACACTTGAAACTATTTCAGCAGGTGTGCCTACTATTTGTTGGCCTTTCTTTGGTGAGCAACAAACAAATTGTAGGTATTTATGCAACACTTGGAAAATAGGGATGGAAATTAACCATGATGTTAAAAGGGAAGAGATAACCAAACTTGTGATGGAAATGATGGAAGGAGAAAAAGGAAAAGAGATGAGACAAAACTGCTTGGAGTGGAAGAAGAAAGCTACAGATGCTACTAATGTGGGAGGATCATCATACAATAATTTCTATAATTTAATTAAAGAGCTTCTTCATCACAATGCTATTTGA

Protein sequence

>MsG0380015896.01.T01

MCTFKAKLNYFGKRSYNGKATPRNYMWRKHGLNETDTVAAEVKWPQAMVRVRRRTAIDGSKLGSENGCDYENFIADGTLETSLDWISGMKDIRLKDLPSFIRITDLNDVMFNFQGSKAQNCLRSSMIIINTFEELEGEALDTLRAKNPNIYDIGPLHMLGRHFPEMEHGFTASGSSLWKSDIECITWLNRWKPCSVLYVNYGSVTVMTDHHLKEFAWGIANNEVKDRGYITSWCMQDQVLDHPSVGGFLTHCGWNSTLETISAGVPTICWPFFGEQQTNCRYLCNTWKIGMEINHDVKREEITKLVMEMMEGEKGKEMRQNCLEWKKKATDATNVGGSSYNNFYNLIKELLHHNAI*