AlfalfaGEDB | MS.gene039275

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene039275

KEGG: -
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Nr:

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Swissprot:

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Trembl:

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TFs/TRs:

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Gene ID	Type	Classification
No data available in table

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Protein Kinases:

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Gene ID	Type	Classification
No data available in table

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Network:

Co-expression Network:

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Gene1	Gene2	correlation coefficient	p_value	FDR
No data available in table

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PPI:

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MS.gene000494	MS.gene039275	PPI
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Showing 1 to 10 of 311 entries

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MS.gene039275.t1	AT3G14690	58.641	515	206	3	3	516	4	512	647
MS.gene039275.t1	AT3G14690	58.641	515	206	3	3	516	39	547	646
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MS.gene039275.t1	AT3G14630	55.078	512	222	3	7	516	3	508	602

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Find 108 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

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CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region
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AAGAAAACCTGCACTCCGGC+TGG	0.494384	2.2:+20310616	None:intergenic
AAGAACCTCATACAAAATCA+TGG	0.535819	2.2:+20310711	None:intergenic
AAGACCATTAGCTAGTATCT+TGG	0.440605	2.2:+20312073	None:intergenic
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AAGTTTATATCCCTGGATGG+AGG	0.683994	2.2:-20311594	MS.gene039275:intron
AATACATCTTTAATTTGCTC+AGG	0.428901	2.2:+20312140	None:intergenic
AATGGTCTTGTAAGTCTTGA+GGG	0.465656	2.2:-20312059	MS.gene039275:CDS

Showing 1 to 10 of 108 entries

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CRISPR-GE

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badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
No data available in table

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Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
chr2.2	gene	20310306	20322651	20310306	ID=MS.gene039275
chr2.2	mRNA	20310306	20322651	20310306	ID=MS.gene039275.t1;Parent=MS.gene039275
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chr2.2	CDS	20311595	20311839	20311595	ID=cds.MS.gene039275.t1;Parent=MS.gene039275.t1
chr2.2	exon	20310817	20311204	20310817	ID=MS.gene039275.t1.exon4;Parent=MS.gene039275.t1
chr2.2	CDS	20310817	20311204	20310817	ID=cds.MS.gene039275.t1;Parent=MS.gene039275.t1
chr2.2	exon	20310306	20310737	20310306	ID=MS.gene039275.t1.exon5;Parent=MS.gene039275.t1
chr2.2	CDS	20310306	20310737	20310306	ID=cds.MS.gene039275.t1;Parent=MS.gene039275.t1

Gene Sequence

>MS.gene039275

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Protein sequence

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