AlfalfaGEDB | MsG0280008088.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280008088.01

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MsG0280008088.01.T01	AT1G13630	23.662	355	226	11	300	620	226	569	5.46e-12	70.1
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MsG0280008088.01.T01	AT5G14770	22.669	547	364	17	21	548	130	636	1.51e-12	72.0
MsG0280008088.01.T01	AT5G14770	22.669	547	364	17	21	548	130	636	1.51e-12	72.0
MsG0280008088.01.T01	AT5G14770	22.669	547	364	17	21	548	130	636	1.51e-12	72.0
MsG0280008088.01.T01	AT1G13630	22.768	448	300	13	110	539	205	624	1.60e-12	71.6
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MsG0280008088.01.T01	AT2G06000	21.886	297	191	7	225	508	241	509	1.63e-12	71.2
MsG0280008088.01.T01	AT5G04810	22.030	463	285	12	200	592	455	911	2.19e-12	71.2
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MsG0280008088.01.T01	AT5G16420	24.786	351	228	10	241	582	206	529	5.25e-12	69.7
MsG0280008088.01.T01	AT5G16420	24.786	351	228	10	241	582	206	529	5.25e-12	69.7
MsG0280008088.01.T01	AT1G79540	21.930	570	319	19	197	693	121	637	7.69e-12	69.3
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MsG0280008088.01.T01	AT2G19280	21.483	391	274	8	139	503	287	670	1.87e-11	68.2
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MsG0280008088.01.T01	AT1G51965	21.267	442	268	14	195	620	239	616	1.96e-11	68.2
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Find 164 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 198 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TTTCACCAATTTCTAAATTT+TGG	0.103940	2:+25359358	None:intergenic
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TGTACGGTGCGAAACATTCT+TGG	0.328641	2:-25360249	MsG0280008088.01.T01:CDS
ACAGAGTTTCAAGATATTCA+TGG	0.339720	2:+25359109	None:intergenic
GAGACAGCAATAGGGAAATA+AGG	0.343512	2:-25359635	MsG0280008088.01.T01:CDS
CTAAGTAATGGGTTGTTACT+TGG	0.347128	2:-25360854	MsG0280008088.01.T01:CDS
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TACCAGGAGAAGTATTTAAA+AGG	0.354196	2:+25358965	None:intergenic
CTTGTTCAAATCTAAGTAAT+GGG	0.355627	2:-25360865	MsG0280008088.01.T01:CDS
GCAATATAGGTCACTTCATT+AGG	0.357754	2:+25359612	None:intergenic
AATCTTTGATAAGAATTTAG+TGG	0.359597	2:+25358891	None:intergenic
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AATTGTAAGCAACCTGAAAA+AGG	0.363559	2:-25360446	MsG0280008088.01.T01:CDS
GTTACAATGTATGCTAAGTT+AGG	0.371404	2:-25360767	MsG0280008088.01.T01:CDS
CATTTGGCTCCAAGACAAAT+AGG	0.371652	2:+25359322	None:intergenic
TTGGACAAAGAAGGGATTCA+TGG	0.372803	2:-25360230	MsG0280008088.01.T01:CDS
GTCATTAGAGTCACAGAATT+CGG	0.373186	2:+25359930	None:intergenic
TCTGTCATTAAGAATGAAAA+AGG	0.380627	2:-25359091	MsG0280008088.01.T01:CDS
TTATGCTTCAAAGTGGTGTT+AGG	0.381451	2:-25360619	MsG0280008088.01.T01:CDS
TCATGGAGCTCTTTACTTTG+TGG	0.384002	2:+25359126	None:intergenic
GCTTCCTGGCTGTGCCGCTT+TGG	0.386569	2:-25359904	MsG0280008088.01.T01:CDS
TTCATGGTTGTGTAGTGAAA+TGG	0.388883	2:-25360214	MsG0280008088.01.T01:CDS
TCATGGTTGTGTAGTGAAAT+GGG	0.389980	2:-25360213	MsG0280008088.01.T01:CDS
TTCTTGGAATGTTCTTATCA+TGG	0.391138	2:-25359721	MsG0280008088.01.T01:CDS
GAGTCACAGAATTCGGCTTA+AGG	0.393786	2:+25359937	None:intergenic
GTCTTGTGGACTTGCTTGGC+CGG	0.394043	2:-25359482	MsG0280008088.01.T01:CDS
GTGGACTTGCTTGGCCGGTC+AGG	0.394803	2:-25359477	MsG0280008088.01.T01:CDS
TAGGAAGAAAATGAAGGAAA+TGG	0.397293	2:-25359229	MsG0280008088.01.T01:CDS
AGATTCCATCATTTCAGAAA+TGG	0.399542	2:-25358835	MsG0280008088.01.T01:CDS
TGTGCCGCTTTGGCAGCACT+TGG	0.407460	2:-25359894	MsG0280008088.01.T01:CDS
GTTTGGAATGCTATGATTGC+TGG	0.409519	2:-25360383	MsG0280008088.01.T01:CDS
CATTCTCCAACAACATTAAC+CGG	0.411264	2:+25360927	None:intergenic
ATGTTCTTATCATGGCTTAT+GGG	0.413206	2:-25359713	MsG0280008088.01.T01:CDS
CTTATCAAAGATTGTGGATA+GGG	0.414834	2:-25358881	MsG0280008088.01.T01:CDS
AATCTCTATCCTCCCCATTC+TGG	0.417842	2:+25360142	None:intergenic
GTGGTTGCTTGAACTTATCT+AGG	0.421076	2:-25359779	MsG0280008088.01.T01:CDS
TTTAGAAGAATGGTGGAAGA+AGG	0.423941	2:-25359657	MsG0280008088.01.T01:CDS
TGTGTTTGATGACAAAGATT+TGG	0.425338	2:-25360714	MsG0280008088.01.T01:CDS
GCTTGTTCAAATCTAAGTAA+TGG	0.428099	2:-25360866	MsG0280008088.01.T01:CDS
TTCTCAAAATGATAGATTTG+AGG	0.431424	2:-25360663	MsG0280008088.01.T01:CDS
AACTCCCTTGTTAACATGTA+TGG	0.431957	2:-25361076	None:intergenic
GAAATGGAACTTGCTCTTGT+GGG	0.432713	2:-25358819	MsG0280008088.01.T01:CDS
GGGACCAAGCAATCGATGTT+AGG	0.434803	2:-25359248	MsG0280008088.01.T01:CDS
ACATAATGGCTAGCCACATT+TGG	0.436095	2:+25359306	None:intergenic
ATGGACATGTATTCCAGAAT+GGG	0.437736	2:-25360155	MsG0280008088.01.T01:CDS
TTAGGAGGACGGTTGCGGTT+TGG	0.438399	2:-25360400	MsG0280008088.01.T01:CDS
TCATTGTATGGAATAACATA+AGG	0.439956	2:+25359547	None:intergenic
TGAAGTACACAAGAAGTATC+AGG	0.441344	2:+25359057	None:intergenic
TGGAAGAAGGAGACAGCAAT+AGG	0.441684	2:-25359644	MsG0280008088.01.T01:CDS
TGATGGGATGTTTAGGAGGA+CGG	0.446717	2:-25360411	MsG0280008088.01.T01:CDS
CAACACAGTGTGTCGGTTTG+AGG	0.453214	2:-25360975	MsG0280008088.01.T01:CDS
AGTGTGTCGGTTTGAGGAAT+GGG	0.453773	2:-25360969	MsG0280008088.01.T01:CDS
GCTTGTCTTGTGGACTTGCT+TGG	0.455151	2:-25359486	MsG0280008088.01.T01:CDS
ACTTGCTTGGCCGGTCAGGC+CGG	0.455597	2:-25359473	MsG0280008088.01.T01:CDS
TCTTCCTAACATCGATTGCT+TGG	0.456810	2:+25359244	None:intergenic
CTTATGGGATGCATGGGAAA+GGG	0.459689	2:-25359698	MsG0280008088.01.T01:CDS
TTCTCTTAGTCACTCTGGTA+TGG	0.461253	2:-25359580	MsG0280008088.01.T01:CDS
ATGTTCTCATTTAGAGATGT+TGG	0.461537	2:-25360561	MsG0280008088.01.T01:CDS
AGGAAGAAAATGAAGGAAAT+GGG	0.462257	2:-25359228	MsG0280008088.01.T01:CDS
TTGTGTTGAGGAATGGTGAT+TGG	0.463097	2:-25360814	MsG0280008088.01.T01:CDS
AGTCACAGAATTCGGCTTAA+GGG	0.463790	2:+25359938	None:intergenic
ACTTATACGCCTCTTCGATC+CGG	0.467202	2:+25359454	None:intergenic
AGAAAGAAACTATGCTTTGT+GGG	0.470500	2:-25359017	MsG0280008088.01.T01:CDS
AGCAAAGAACCTATTTGTCT+TGG	0.470792	2:-25359331	MsG0280008088.01.T01:CDS
TGTTCTCATTTAGAGATGTT+GGG	0.470824	2:-25360560	MsG0280008088.01.T01:CDS
GTATATTTGGAAGCATGAAT+AGG	0.472722	2:-25360112	MsG0280008088.01.T01:CDS
AGTCCACAAGACAAGCATAA+TGG	0.474934	2:+25359493	None:intergenic
TGGGGAGGATAGAGATTGCA+AGG	0.478273	2:-25360136	MsG0280008088.01.T01:CDS
GCTGCCAAAGCGGCACAGCC+AGG	0.479043	2:+25359900	None:intergenic
TCTAACATTTACTCTTCAGC+TGG	0.479900	2:-25359276	MsG0280008088.01.T01:CDS
CCGACACACTGTGTTGATCA+TGG	0.481011	2:+25360982	None:intergenic
TTTGCTTCTCTTAGTCACTC+TGG	0.481083	2:-25359585	MsG0280008088.01.T01:CDS
AAGTTCCATTTCTGAAATGA+TGG	0.484215	2:+25358830	None:intergenic
CAGTGTGTCGGTTTGAGGAA+TGG	0.484229	2:-25360970	MsG0280008088.01.T01:CDS
TAAGTAATGGGTTGTTACTT+GGG	0.486612	2:-25360853	MsG0280008088.01.T01:CDS
AATGGACATGTATTCCAGAA+TGG	0.487787	2:-25360156	MsG0280008088.01.T01:CDS
CAGAATTCGGCTTAAGGGGA+AGG	0.489154	2:+25359943	None:intergenic
CATTTAGAGATGTTGGGATG+TGG	0.489292	2:-25360554	MsG0280008088.01.T01:CDS
CTAGCTAAGGTAACTCCATC+AGG	0.491547	2:+25360596	None:intergenic
GTTAATGTTGTTGGAGAATG+TGG	0.494690	2:-25360924	MsG0280008088.01.T01:CDS
GATGCATGGAGCAGCTTGCT+TGG	0.497295	2:-25359396	MsG0280008088.01.T01:CDS
ATCATGGCTTATGGGATGCA+TGG	0.497762	2:-25359705	MsG0280008088.01.T01:CDS
GAGAAAGAAACTATGCTTTG+TGG	0.498670	2:-25359018	MsG0280008088.01.T01:CDS
TGTTAGACAGTAGAACATAA+TGG	0.499167	2:+25359292	None:intergenic
TTACTCTTCAGCTGGACTAT+GGG	0.499742	2:-25359268	MsG0280008088.01.T01:CDS
TTGTGGGCACAGTGAGAGAT+TGG	0.499814	2:-25359001	MsG0280008088.01.T01:CDS
GAAACATTCTTGGACAAAGA+AGG	0.504952	2:-25360239	MsG0280008088.01.T01:CDS
AGAAATGGAACTTGCTCTTG+TGG	0.506270	2:-25358820	MsG0280008088.01.T01:CDS
CACTCTGGTATGGTGGATGA+AGG	0.506682	2:-25359570	MsG0280008088.01.T01:CDS
CAAAGTGGTGTTAGGCCTGA+TGG	0.507950	2:-25360611	MsG0280008088.01.T01:CDS
GAAAAGAACCTGGATGTAGT+TGG	0.508593	2:-25359200	MsG0280008088.01.T01:CDS
TAAATTCTTATCAAAGATTG+TGG	0.511714	2:-25358887	MsG0280008088.01.T01:CDS
GCTTATGGGATGCATGGGAA+AGG	0.512040	2:-25359699	MsG0280008088.01.T01:CDS
GTGCCGCTTTGGCAGCACTT+GGG	0.512703	2:-25359893	MsG0280008088.01.T01:CDS
GCGCAATGAGTTTGATTATG+AGG	0.513818	2:-25360354	MsG0280008088.01.T01:CDS
GATGCATGGGAAAGGGGAAG+AGG	0.518547	2:-25359691	MsG0280008088.01.T01:CDS
TCTTATCAAAGATTGTGGAT+AGG	0.529374	2:-25358882	MsG0280008088.01.T01:CDS
CCTCTTCGATCCGGCCTGAC+CGG	0.539725	2:+25359463	None:intergenic
TCTTAGTCACTCTGGTATGG+TGG	0.539892	2:-25359577	MsG0280008088.01.T01:CDS
CTATCAAAGGATGTTGCTGT+TGG	0.541544	2:-25359831	MsG0280008088.01.T01:CDS
AAACATTCTTGGACAAAGAA+GGG	0.544852	2:-25360238	MsG0280008088.01.T01:CDS
GGGACCTACTTCGTTTACAT+TGG	0.546291	2:-25360903	MsG0280008088.01.T01:CDS
GGACCATTATGCTTGTCTTG+TGG	0.549120	2:-25359496	MsG0280008088.01.T01:CDS
CATACAATGAAAGCTAAACA+TGG	0.551212	2:-25359534	MsG0280008088.01.T01:CDS
CGTTAAACAAATGCTATCAA+AGG	0.555432	2:-25359844	MsG0280008088.01.T01:CDS
TTATGGGATGCATGGGAAAG+GGG	0.555574	2:-25359697	MsG0280008088.01.T01:CDS
TGTTGCTGTTGGAAGTGCAC+TGG	0.556497	2:-25359820	MsG0280008088.01.T01:CDS
TGCAGGCAAAACACTAGCTA+AGG	0.558984	2:+25360583	None:intergenic
TCATGGCTTATGGGATGCAT+GGG	0.559372	2:-25359704	MsG0280008088.01.T01:CDS
AGAGAGGTCAAGCAGAACAT+AGG	0.562593	2:-25360001	MsG0280008088.01.T01:CDS
GATGTTTAGGAGGACGGTTG+CGG	0.562973	2:-25360405	MsG0280008088.01.T01:CDS
CCATGAGACATCATCTCGGT+TGG	0.565400	2:+25361009	None:intergenic
CAAGCATAATGGTCCGATGT+AGG	0.566296	2:+25359504	None:intergenic
CATGGTTGTGTAGTGAAATG+GGG	0.568628	2:-25360212	MsG0280008088.01.T01:CDS
GGAAGAAGGAGACAGCAATA+GGG	0.568926	2:-25359643	MsG0280008088.01.T01:CDS
CTCTCTGCATGTCATGCAGA+AGG	0.573896	2:+25360018	None:intergenic
CGATGTTAGGAAGAAAATGA+AGG	0.575742	2:-25359235	MsG0280008088.01.T01:CDS
GGCAGTCATTACAAACCCTA+AGG	0.576074	2:+25358920	None:intergenic
ATTTGTCTTGGAGCCAAATG+TGG	0.577736	2:-25359319	MsG0280008088.01.T01:CDS
GCTTTGGCAGCACTTGGGAA+AGG	0.579621	2:-25359888	MsG0280008088.01.T01:CDS
CTAACCAATGTAAACGAAGT+AGG	0.580091	2:+25360899	None:intergenic
ATCTCTAAATGAGAACATGC+AGG	0.582062	2:+25360566	None:intergenic
GTTTCGCACCGTACACAAGC+AGG	0.582175	2:+25360257	None:intergenic
GTCACAGAATTCGGCTTAAG+GGG	0.583731	2:+25359939	None:intergenic
TCGGTTTGAGGAATGGGAGC+TGG	0.583968	2:-25360963	MsG0280008088.01.T01:CDS
CCAACCGAGATGATGTCTCA+TGG	0.594292	2:-25361009	MsG0280008088.01.T01:CDS
AAATGGAACTTGCTCTTGTG+GGG	0.606154	2:-25358818	MsG0280008088.01.T01:CDS
GCAACTCTAATGGTAGTACC+AGG	0.613050	2:+25358949	None:intergenic
TTGGATTGAGCATGGTGATG+AGG	0.615761	2:-25359181	MsG0280008088.01.T01:CDS
TGCTCAATCCAACTACATCC+AGG	0.615858	2:+25359192	None:intergenic
ATATGAAGAAAATAGATGCA+TGG	0.617255	2:-25359410	MsG0280008088.01.T01:CDS
CCGGTCAGGCCGGATCGAAG+AGG	0.617300	2:-25359463	MsG0280008088.01.T01:CDS
ACATGGGATTGAACCTACAT+CGG	0.617906	2:-25359517	MsG0280008088.01.T01:CDS
TTACATGTTATGCTTCAAAG+TGG	0.618187	2:-25360626	MsG0280008088.01.T01:CDS
GTTAACATGTATGGCAAATG+TGG	0.627999	2:-25361067	None:intergenic
ATACAATGAAAGCTAAACAT+GGG	0.632756	2:-25359533	MsG0280008088.01.T01:CDS
ATGGGAGTAAGAAAAGAACC+TGG	0.651781	2:-25359210	MsG0280008088.01.T01:CDS
CAAAACACTCGATAAAGTCA+CGG	0.654541	2:+25360280	None:intergenic
TAACACATTTGATGATTACG+AGG	0.655810	2:-25359976	MsG0280008088.01.T01:CDS
ATAAGAATTTAGTGGCAACA+TGG	0.659440	2:+25358899	None:intergenic
TTTCCCAAGTGCTGCCAAAG+CGG	0.659639	2:+25359890	None:intergenic
TGTACTTCACAATGTTGATG+AGG	0.659713	2:-25359043	MsG0280008088.01.T01:CDS
TGGACATGTATTCCAGAATG+GGG	0.666401	2:-25360154	MsG0280008088.01.T01:CDS
CCATGATCAACACAGTGTGT+CGG	0.673982	2:-25360982	MsG0280008088.01.T01:CDS
TTAATGTTGTTGGAGAATGT+GGG	0.680987	2:-25360923	MsG0280008088.01.T01:CDS
ACATGTATTCCAGAATGGGG+AGG	0.689832	2:-25360151	MsG0280008088.01.T01:CDS
GGATGTAGTTGGATTGAGCA+TGG	0.691112	2:-25359189	MsG0280008088.01.T01:CDS
AATGTGGCGATATTGACGCA+CGG	0.697499	2:-25361051	MsG0280008088.01.T01:CDS
GTTGACATGTATGCAAAATG+TGG	0.701664	2:-25359798	MsG0280008088.01.T01:CDS
AGTTCCATGAGACATCATCT+CGG	0.705985	2:+25361005	None:intergenic
CTTCTGCATGACATGCAGAG+AGG	0.708309	2:-25360017	MsG0280008088.01.T01:CDS
GAAGGTTAAGTGCATCATCG+TGG	0.714374	2:+25360036	None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
!!	AATCTTTGATAAGAATTTAG+TGG	+	Chr2:25360980-25360999	None:intergenic	20.0%
!!	TAAATTCTTATCAAAGATTG+TGG	-	Chr2:25360981-25361000	MsG0280008088.01.T01:CDS	20.0%
!!!	TTGATTGAAAATTCTTTTGT+CGG	-	Chr2:25359374-25359393	MsG0280008088.01.T01:CDS	20.0%
!!!	TTTCACCAATTTCTAAATTT+TGG	+	Chr2:25360513-25360532	None:intergenic	20.0%
!	AGAAGCAAAAATAGCAATAT+AGG	+	Chr2:25360272-25360291	None:intergenic	25.0%
!	ATACAATGAAAGCTAAACAT+GGG	-	Chr2:25360335-25360354	MsG0280008088.01.T01:CDS	25.0%
!	ATATGAAGAAAATAGATGCA+TGG	-	Chr2:25360458-25360477	MsG0280008088.01.T01:CDS	25.0%
!	ATCCACCAAAATTTAGAAAT+TGG	-	Chr2:25360505-25360524	MsG0280008088.01.T01:CDS	25.0%
!	CTTGTTCAAATCTAAGTAAT+GGG	-	Chr2:25359003-25359022	MsG0280008088.01.T01:CDS	25.0%
!	TCATTAAGAATGAAAAAGGA+GGG	-	Chr2:25360781-25360800	MsG0280008088.01.T01:CDS	25.0%
!	TCATTGTATGGAATAACATA+AGG	+	Chr2:25360324-25360343	None:intergenic	25.0%
!	TCTGTCATTAAGAATGAAAA+AGG	-	Chr2:25360777-25360796	MsG0280008088.01.T01:CDS	25.0%
!	TTCTCAAAATGATAGATTTG+AGG	-	Chr2:25359205-25359224	MsG0280008088.01.T01:CDS	25.0%
!!	AACTTTTACTAACAATGCTT+TGG	-	Chr2:25359079-25359098	MsG0280008088.01.T01:CDS	25.0%
!!	ATAGGAAAGATATTGTTTCT+TGG	-	Chr2:25359774-25359793	MsG0280008088.01.T01:CDS	25.0%
!!	CTTTGATAGCATTTGTTTAA+CGG	+	Chr2:25360026-25360045	None:intergenic	25.0%
!!	TCTATTTTCTTCATATTGGA+TGG	+	Chr2:25360454-25360473	None:intergenic	25.0%
!!	TGCATCTATTTTCTTCATAT+TGG	+	Chr2:25360458-25360477	None:intergenic	25.0%
!!!	CTGTAAGAAATGTTATTTCT+TGG	-	Chr2:25360131-25360150	MsG0280008088.01.T01:CDS	25.0%
!!!	TTTGAAGCTTTTTAGAAGAA+TGG	-	Chr2:25360201-25360220	MsG0280008088.01.T01:CDS	25.0%
	AAACATTCTTGGACAAAGAA+GGG	-	Chr2:25359630-25359649	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	AATGTTCTTATCATGGCTTA+TGG	-	Chr2:25360154-25360173	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	AATTGTAAGCAACCTGAAAA+AGG	-	Chr2:25359422-25359441	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	ACAGAGTTTCAAGATATTCA+TGG	+	Chr2:25360762-25360781	None:intergenic	30.0%
	AGAAAGAAACTATGCTTTGT+GGG	-	Chr2:25360851-25360870	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	AGATTCCATCATTTCAGAAA+TGG	-	Chr2:25361033-25361052	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	AGGAAGAAAATGAAGGAAAT+GGG	-	Chr2:25360640-25360659	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	ATAAGAATTTAGTGGCAACA+TGG	+	Chr2:25360972-25360991	None:intergenic	30.0%
	ATGTTCTCATTTAGAGATGT+TGG	-	Chr2:25359307-25359326	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	ATGTTCTTATCATGGCTTAT+GGG	-	Chr2:25360155-25360174	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	CATACAATGAAAGCTAAACA+TGG	-	Chr2:25360334-25360353	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	CGTTAAACAAATGCTATCAA+AGG	-	Chr2:25360024-25360043	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	CTTATCAAAGATTGTGGATA+GGG	-	Chr2:25360987-25361006	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	GCTTGTTCAAATCTAAGTAA+TGG	-	Chr2:25359002-25359021	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	GTATGTGCAAAATGCATTAA+TGG	-	Chr2:25359694-25359713	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	GTCATTAAGAATGAAAAAGG+AGG	-	Chr2:25360780-25360799	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	GTTACAATGTATGCTAAGTT+AGG	-	Chr2:25359101-25359120	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	TAGAGTTGCTAAAAACCTTA+GGG	-	Chr2:25360933-25360952	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	TAGGAAGAAAATGAAGGAAA+TGG	-	Chr2:25360639-25360658	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	TCTTATCAAAGATTGTGGAT+AGG	-	Chr2:25360986-25361005	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	TGTTAGACAGTAGAACATAA+TGG	+	Chr2:25360579-25360598	None:intergenic	30.0%
	TGTTCTCATTTAGAGATGTT+GGG	-	Chr2:25359308-25359327	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	TTAATGTTGTTGGAGAATGT+GGG	-	Chr2:25358945-25358964	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	TTACATGTTATGCTTCAAAG+TGG	-	Chr2:25359242-25359261	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	TTAGAGTTGCTAAAAACCTT+AGG	-	Chr2:25360932-25360951	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
	TTCTTGGAATGTTCTTATCA+TGG	-	Chr2:25360147-25360166	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
!	ATGACAAAGATTTGGTTTCT+TGG	-	Chr2:25359162-25359181	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
!	CACCAATTTCTAAATTTTGG+TGG	+	Chr2:25360510-25360529	None:intergenic	30.0%
!	GTATATTTGGAAGCATGAAT+AGG	-	Chr2:25359756-25359775	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
!	TAACACATTTGATGATTACG+AGG	-	Chr2:25359892-25359911	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
!	TGATGAGGTTCATAAGTTTT+TGG	-	Chr2:25360702-25360721	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
!	TGTGTTTGATGACAAAGATT+TGG	-	Chr2:25359154-25359173	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
!!	AAGTTCCATTTCTGAAATGA+TGG	+	Chr2:25361041-25361060	None:intergenic	30.0%
!!	CATGTTTAGCTTTCATTGTA+TGG	+	Chr2:25360336-25360355	None:intergenic	30.0%
!!	TAAGTAATGGGTTGTTACTT+GGG	-	Chr2:25359015-25359034	MsG0280008088.01.T01:CDS	30.0%
!!	TACCAGGAGAAGTATTTAAA+AGG	+	Chr2:25360906-25360925	None:intergenic	30.0%
!!!	AAGGTTTTTAGCAACTCTAA+TGG	+	Chr2:25360932-25360951	None:intergenic	30.0%
	AATGGACATGTATTCCAGAA+TGG	-	Chr2:25359712-25359731	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
	AGCAAAGAACCTATTTGTCT+TGG	-	Chr2:25360537-25360556	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
	ATCTCTAAATGAGAACATGC+AGG	+	Chr2:25359305-25359324	None:intergenic	35.0%
	ATGGACATGTATTCCAGAAT+GGG	-	Chr2:25359713-25359732	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
	CAAAACACTCGATAAAGTCA+CGG	+	Chr2:25359591-25359610	None:intergenic	35.0%
	CATCTCAACAAAAAGCTCAA+TGG	+	Chr2:25359540-25359559	None:intergenic	35.0%
	CATTCTCCAACAACATTAAC+CGG	+	Chr2:25358944-25358963	None:intergenic	35.0%
	CGATGTTAGGAAGAAAATGA+AGG	-	Chr2:25360633-25360652	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
	CTAACCAATGTAAACGAAGT+AGG	+	Chr2:25358972-25358991	None:intergenic	35.0%
	GAAACATTCTTGGACAAAGA+AGG	-	Chr2:25359629-25359648	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
	GAGAAAGAAACTATGCTTTG+TGG	-	Chr2:25360850-25360869	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
	GCAATATAGGTCACTTCATT+AGG	+	Chr2:25360259-25360278	None:intergenic	35.0%
	GTCATTAGAGTCACAGAATT+CGG	+	Chr2:25359941-25359960	None:intergenic	35.0%
	GTTAATGTTGTTGGAGAATG+TGG	-	Chr2:25358944-25358963	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
	GTTGACATGTATGCAAAATG+TGG	-	Chr2:25360070-25360089	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
	TCATGGTTGTGTAGTGAAAT+GGG	-	Chr2:25359655-25359674	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
	TCTAACATTTACTCTTCAGC+TGG	-	Chr2:25360592-25360611	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
	TGTACTTCACAATGTTGATG+AGG	-	Chr2:25360825-25360844	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
	TTATGCTTCAAAGTGGTGTT+AGG	-	Chr2:25359249-25359268	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
	TTCATGGTTGTGTAGTGAAA+TGG	-	Chr2:25359654-25359673	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
!	AAAACCAACGTACCTTTTTC+AGG	+	Chr2:25359437-25359456	None:intergenic	35.0%
!	AAGTTCATGCTTTTGTGTTG+AGG	-	Chr2:25359042-25359061	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
!	CATTGAGCTTTTTGTTGAGA+TGG	-	Chr2:25359538-25359557	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
!	GAGATTGCAAGGAGTATATT+TGG	-	Chr2:25359743-25359762	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
!	TCTTTTCCGGTTAATGTTGT+TGG	-	Chr2:25358935-25358954	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
!	TGGTTTTTGATGGGATGTTT+AGG	-	Chr2:25359450-25359469	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
!	TTTAGAAGAATGGTGGAAGA+AGG	-	Chr2:25360211-25360230	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
!	TTTTTGATGGGATGTTTAGG+AGG	-	Chr2:25359453-25359472	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
!!	CTAAGTAATGGGTTGTTACT+TGG	-	Chr2:25359014-25359033	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
!!	GAAGCTTTTTAGAAGAATGG+TGG	-	Chr2:25360204-25360223	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
!!	TAAATTTTGGTGGATCTTGC+AGG	+	Chr2:25360500-25360519	None:intergenic	35.0%
!!	TGAAGTACACAAGAAGTATC+AGG	+	Chr2:25360814-25360833	None:intergenic	35.0%
!!!	AAAGGTACGTTGGTTTTTGA+TGG	-	Chr2:25359440-25359459	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
!!!	AAGGTACGTTGGTTTTTGAT+GGG	-	Chr2:25359441-25359460	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
!!!	AGGTTCATAAGTTTTTGGCA+GGG	-	Chr2:25360707-25360726	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
!!!	GTTGAGATGGTTTTTGAGTT+GGG	-	Chr2:25359551-25359570	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
!!!	TGTTGAGATGGTTTTTGAGT+TGG	-	Chr2:25359550-25359569	MsG0280008088.01.T01:CDS	35.0%
	ACATGGGATTGAACCTACAT+CGG	-	Chr2:25360351-25360370	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	AGTCACAGAATTCGGCTTAA+GGG	+	Chr2:25359933-25359952	None:intergenic	40.0%
	AGTCCACAAGACAAGCATAA+TGG	+	Chr2:25360378-25360397	None:intergenic	40.0%
	AGTTCCATGAGACATCATCT+CGG	+	Chr2:25358866-25358885	None:intergenic	40.0%
	ATGGGAGTAAGAAAAGAACC+TGG	-	Chr2:25360658-25360677	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	ATTTGTCTTGGAGCCAAATG+TGG	-	Chr2:25360549-25360568	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	CATGGTTGTGTAGTGAAATG+GGG	-	Chr2:25359656-25359675	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	CATTTAGAGATGTTGGGATG+TGG	-	Chr2:25359314-25359333	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	CTATCAAAGGATGTTGCTGT+TGG	-	Chr2:25360037-25360056	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	CTCGATAAAGTCACGGAATT+CGG	+	Chr2:25359584-25359603	None:intergenic	40.0%
	GAAAAGAACCTGGATGTAGT+TGG	-	Chr2:25360668-25360687	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	GAGACAGCAATAGGGAAATA+AGG	-	Chr2:25360233-25360252	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	GCGCAATGAGTTTGATTATG+AGG	-	Chr2:25359514-25359533	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	GTGGTTGCTTGAACTTATCT+AGG	-	Chr2:25360089-25360108	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	TCATGGAGCTCTTTACTTTG+TGG	+	Chr2:25360745-25360764	None:intergenic	40.0%
	TCTTGGAACACGATGATTAC+TGG	-	Chr2:25359791-25359810	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	TGGACATGTATTCCAGAATG+GGG	-	Chr2:25359714-25359733	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	TTACTCTTCAGCTGGACTAT+GGG	-	Chr2:25360600-25360619	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	TTCTCTTAGTCACTCTGGTA+TGG	-	Chr2:25360288-25360307	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	TTGGACAAAGAAGGGATTCA+TGG	-	Chr2:25359638-25359657	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	TTGTGTTGAGGAATGGTGAT+TGG	-	Chr2:25359054-25359073	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	TTTACTCTTCAGCTGGACTA+TGG	-	Chr2:25360599-25360618	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	TTTGCTTCTCTTAGTCACTC+TGG	-	Chr2:25360283-25360302	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
!	AAATGGAACTTGCTCTTGTG+GGG	-	Chr2:25361050-25361069	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
!	ACATAATGGCTAGCCACATT+TGG	+	Chr2:25360565-25360584	None:intergenic	40.0%
!	AGAAATGGAACTTGCTCTTG+TGG	-	Chr2:25361048-25361067	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
!	CATGCTTTTGTGTTGAGGAA+TGG	-	Chr2:25359047-25359066	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
!	CATTTGGCTCCAAGACAAAT+AGG	+	Chr2:25360549-25360568	None:intergenic	40.0%
!	GAAATGGAACTTGCTCTTGT+GGG	-	Chr2:25361049-25361068	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
!	GAGAGATTGGCAATAGCTTT+TGG	-	Chr2:25360880-25360899	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
!	GGCCTTTTAAATACTTCTCC+TGG	-	Chr2:25360901-25360920	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
!	GTTTGGAATGCTATGATTGC+TGG	-	Chr2:25359485-25359504	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
!	TCTTCCTAACATCGATTGCT+TGG	+	Chr2:25360627-25360646	None:intergenic	40.0%
!	TTCTTTTGTCGGTAGTGCTT+TGG	-	Chr2:25359385-25359404	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
!!!	AGTGAAATGGGGTTTTGAGA+AGG	-	Chr2:25359667-25359686	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
!!!	GAGGTTCATAAGTTTTTGGC+AGG	-	Chr2:25360706-25360725	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
!!!	GGTTCATAAGTTTTTGGCAG+GGG	-	Chr2:25360708-25360727	MsG0280008088.01.T01:CDS	40.0%
	AATCTCTATCCTCCCCATTC+TGG	+	Chr2:25359729-25359748	None:intergenic	45.0%
	AATGTGGCGATATTGACGCA+CGG	-	Chr2:25358817-25358836	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
	ACATGTATTCCAGAATGGGG+AGG	-	Chr2:25359717-25359736	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
	ACTCTAATGACTGTGCTTCC+TGG	-	Chr2:25359950-25359969	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
	ACTTATACGCCTCTTCGATC+CGG	+	Chr2:25360417-25360436	None:intergenic	45.0%
	AGAGAGGTCAAGCAGAACAT+AGG	-	Chr2:25359867-25359886	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
	ATCATGGCTTATGGGATGCA+TGG	-	Chr2:25360163-25360182	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
	CAAGCATAATGGTCCGATGT+AGG	+	Chr2:25360367-25360386	None:intergenic	45.0%
	CCATGATCAACACAGTGTGT+CGG	-	Chr2:25358886-25358905	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
	CTAGCTAAGGTAACTCCATC+AGG	+	Chr2:25359275-25359294	None:intergenic	45.0%
	CTTATGGGATGCATGGGAAA+GGG	-	Chr2:25360170-25360189	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
	GAAGGTTAAGTGCATCATCG+TGG	+	Chr2:25359835-25359854	None:intergenic	45.0%
	GAGTCACAGAATTCGGCTTA+AGG	+	Chr2:25359934-25359953	None:intergenic	45.0%
	GCAACTCTAATGGTAGTACC+AGG	+	Chr2:25360922-25360941	None:intergenic	45.0%
	GGAAGAAGGAGACAGCAATA+GGG	-	Chr2:25360225-25360244	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
	GGACCATTATGCTTGTCTTG+TGG	-	Chr2:25360372-25360391	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
	GGATGTAGTTGGATTGAGCA+TGG	-	Chr2:25360679-25360698	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
	GGCAGTCATTACAAACCCTA+AGG	+	Chr2:25360951-25360970	None:intergenic	45.0%
	GGGACCTACTTCGTTTACAT+TGG	-	Chr2:25358965-25358984	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
	GTCACAGAATTCGGCTTAAG+GGG	+	Chr2:25359932-25359951	None:intergenic	45.0%
	TCATGGCTTATGGGATGCAT+GGG	-	Chr2:25360164-25360183	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
	TCTTAGTCACTCTGGTATGG+TGG	-	Chr2:25360291-25360310	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
	TGATGGGATGTTTAGGAGGA+CGG	-	Chr2:25359457-25359476	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
	TGCAGGCAAAACACTAGCTA+AGG	+	Chr2:25359288-25359307	None:intergenic	45.0%
	TGCTCAATCCAACTACATCC+AGG	+	Chr2:25360679-25360698	None:intergenic	45.0%
	TGGAAGAAGGAGACAGCAAT+AGG	-	Chr2:25360224-25360243	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
	TGTACGGTGCGAAACATTCT+TGG	-	Chr2:25359619-25359638	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
	TTATGGGATGCATGGGAAAG+GGG	-	Chr2:25360171-25360190	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
!	AGCTGGCAGTTCATCTTTTC+CGG	-	Chr2:25358922-25358941	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
!	GCAACCTGAAAAAGGTACGT+TGG	-	Chr2:25359430-25359449	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
!	GTGTTTTGCCTGCTTGTGTA+CGG	-	Chr2:25359603-25359622	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
!	TTGGATTGAGCATGGTGATG+AGG	-	Chr2:25360687-25360706	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
!!	AGTGTGTCGGTTTGAGGAAT+GGG	-	Chr2:25358899-25358918	MsG0280008088.01.T01:CDS	45.0%
	CAGAATTCGGCTTAAGGGGA+AGG	+	Chr2:25359928-25359947	None:intergenic	50.0%
	CCAACCGAGATGATGTCTCA+TGG	-	Chr2:25358859-25358878	MsG0280008088.01.T01:CDS	50.0%
	CCATGAGACATCATCTCGGT+TGG	+	Chr2:25358862-25358881	None:intergenic	50.0%
	CTCTCTGCATGTCATGCAGA+AGG	+	Chr2:25359853-25359872	None:intergenic	50.0%
	CTTCTGCATGACATGCAGAG+AGG	-	Chr2:25359851-25359870	MsG0280008088.01.T01:CDS	50.0%
	CTTGCTCTTGTGGGGACTAT+TGG	-	Chr2:25361058-25361077	MsG0280008088.01.T01:CDS	50.0%
	GATGTTTAGGAGGACGGTTG+CGG	-	Chr2:25359463-25359482	MsG0280008088.01.T01:CDS	50.0%
	GCTTATGGGATGCATGGGAA+AGG	-	Chr2:25360169-25360188	MsG0280008088.01.T01:CDS	50.0%
	GGGACCAAGCAATCGATGTT+AGG	-	Chr2:25360620-25360639	MsG0280008088.01.T01:CDS	50.0%
	TGGGGAGGATAGAGATTGCA+AGG	-	Chr2:25359732-25359751	MsG0280008088.01.T01:CDS	50.0%
	TTGTGGGCACAGTGAGAGAT+TGG	-	Chr2:25360867-25360886	MsG0280008088.01.T01:CDS	50.0%
!	CAAAGTGGTGTTAGGCCTGA+TGG	-	Chr2:25359257-25359276	MsG0280008088.01.T01:CDS	50.0%
!	CCGACACACTGTGTTGATCA+TGG	+	Chr2:25358889-25358908	None:intergenic	50.0%
!	GCTTGTCTTGTGGACTTGCT+TGG	-	Chr2:25360382-25360401	MsG0280008088.01.T01:CDS	50.0%
!	TGTTGCTGTTGGAAGTGCAC+TGG	-	Chr2:25360048-25360067	MsG0280008088.01.T01:CDS	50.0%
!	TTTCCCAAGTGCTGCCAAAG+CGG	+	Chr2:25359981-25360000	None:intergenic	50.0%
!!	CAACACAGTGTGTCGGTTTG+AGG	-	Chr2:25358893-25358912	MsG0280008088.01.T01:CDS	50.0%
!!	CACTCTGGTATGGTGGATGA+AGG	-	Chr2:25360298-25360317	MsG0280008088.01.T01:CDS	50.0%
!!	CAGTGTGTCGGTTTGAGGAA+TGG	-	Chr2:25358898-25358917	MsG0280008088.01.T01:CDS	50.0%
	GATGCATGGGAAAGGGGAAG+AGG	-	Chr2:25360177-25360196	MsG0280008088.01.T01:CDS	55.0%
	GCTTTGGCAGCACTTGGGAA+AGG	-	Chr2:25359980-25359999	MsG0280008088.01.T01:CDS	55.0%
	GTTTCGCACCGTACACAAGC+AGG	+	Chr2:25359614-25359633	None:intergenic	55.0%
	TTAGGAGGACGGTTGCGGTT+TGG	-	Chr2:25359468-25359487	MsG0280008088.01.T01:CDS	55.0%
!	GATGCATGGAGCAGCTTGCT+TGG	-	Chr2:25360472-25360491	MsG0280008088.01.T01:CDS	55.0%
!	GTCTTGTGGACTTGCTTGGC+CGG	-	Chr2:25360386-25360405	MsG0280008088.01.T01:CDS	55.0%
!	TCGGTTTGAGGAATGGGAGC+TGG	-	Chr2:25358905-25358924	MsG0280008088.01.T01:CDS	55.0%
!!	GTGCCGCTTTGGCAGCACTT+GGG	-	Chr2:25359975-25359994	MsG0280008088.01.T01:CDS	60.0%
!!	TGTGCCGCTTTGGCAGCACT+TGG	-	Chr2:25359974-25359993	MsG0280008088.01.T01:CDS	60.0%
	ACTTGCTTGGCCGGTCAGGC+CGG	-	Chr2:25360395-25360414	MsG0280008088.01.T01:CDS	65.0%
	CCTCTTCGATCCGGCCTGAC+CGG	+	Chr2:25360408-25360427	None:intergenic	65.0%
!	GTGGACTTGCTTGGCCGGTC+AGG	-	Chr2:25360391-25360410	MsG0280008088.01.T01:CDS	65.0%
!!	GCTTCCTGGCTGTGCCGCTT+TGG	-	Chr2:25359964-25359983	MsG0280008088.01.T01:CDS	65.0%
	CCGGTCAGGCCGGATCGAAG+AGG	-	Chr2:25360405-25360424	MsG0280008088.01.T01:CDS	70.0%
	GCTGCCAAAGCGGCACAGCC+AGG	+	Chr2:25359971-25359990	None:intergenic	70.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
Chr2	gene	25358807	25361083	25358807	ID=MsG0280008088.01;Name=MsG0280008088.01
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Gene Sequence

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Protein sequence

>MsG0280008088.01.T01

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