AlfalfaGEDB | MsG0780036664.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780036664.01

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CRISPR-Local

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AATACTCTCATTAATGCTTT+GGG	0.277204	7:-11530853	MsG0780036664.01.T01:CDS
AATATTTGTATTCATGCTTT+TGG	0.277356	7:-11532209	MsG0780036664.01.T01:CDS
GTCTCCACACATGGATAAAT+TGG	0.282671	7:-11531298	MsG0780036664.01.T01:CDS
ACTTATAATATTCTGATTCA+TGG	0.290942	7:-11531789	MsG0780036664.01.T01:CDS
TTTAACGAGATGAAGGATAA+TGG	0.294980	7:-11531936	MsG0780036664.01.T01:CDS
TAATACTCTCATTAATGCTT+TGG	0.306329	7:-11530854	MsG0780036664.01.T01:CDS
TACTTACACGATTCTCGTTC+GGG	0.311700	7:-11532000	MsG0780036664.01.T01:CDS
AAGGAGGATAAGAATTTGTT+TGG	0.312543	7:-11532140	MsG0780036664.01.T01:CDS
TTCTCGTTCGGGGTTGTTGT+AGG	0.315205	7:-11531989	MsG0780036664.01.T01:CDS
AGTTTGAGAATGTGTTTAAT+AGG	0.316104	7:-11532274	MsG0780036664.01.T01:CDS
GGACAAAGAGTTCAACAAAA+AGG	0.318515	7:-11531219	MsG0780036664.01.T01:CDS
AATATGATAATTCAAGGTTT+AGG	0.332141	7:-11530958	MsG0780036664.01.T01:CDS
GCTTGTGTATAATTGTGTTT+TGG	0.341970	7:-11531898	MsG0780036664.01.T01:CDS
GGGGTTGTTGTAGGACTTAT+AGG	0.370302	7:-11531980	MsG0780036664.01.T01:CDS
TGATATGTGTACTTATAATT+CGG	0.372772	7:-11532114	MsG0780036664.01.T01:CDS
TCTCAAACTCTTTCTTCATC+CGG	0.372900	7:+11532288	None:intergenic
TTTGGAGTTGGTGGAGGAAA+TGG	0.373194	7:-11531631	MsG0780036664.01.T01:CDS
ACGATAACGTCTCTCTTGAT+TGG	0.383819	7:-11531579	MsG0780036664.01.T01:CDS
TTAACGAGATGAAGGATAAT+GGG	0.387768	7:-11531935	MsG0780036664.01.T01:CDS
CAGGTAACAAATCGCCTTCC+CGG	0.393366	7:+11531505	None:intergenic
AATTCAAGGTTTAGGAAAGA+TGG	0.395725	7:-11530950	MsG0780036664.01.T01:CDS
CCACCTCATCATCCTCATAT+CGG	0.396950	7:+11531355	None:intergenic
ATAGGCTCATCAGGCATGTC+CGG	0.398626	7:-11531524	MsG0780036664.01.T01:CDS
ACTATGTAAAGAGGGTCTAT+TGG	0.401468	7:-11531661	MsG0780036664.01.T01:CDS
GGGTCTATTGGAAGAGGCTT+TGG	0.405853	7:-11531649	MsG0780036664.01.T01:CDS
CATATTGTACGTCGCTATAT+CGG	0.409872	7:+11530975	None:intergenic
GATCTCACTAAAACCTCCTT+TGG	0.412773	7:+11531398	None:intergenic
TTGGGCTATTCTGAGTGAAA+TGG	0.415594	7:-11531016	MsG0780036664.01.T01:CDS
ATTTGTTACCTGGTGTTCTC+AGG	0.420724	7:-11531494	MsG0780036664.01.T01:CDS
TTACTTACACGATTCTCGTT+CGG	0.421508	7:-11532001	MsG0780036664.01.T01:CDS
CTCAAACTCTTTCTTCATCC+GGG	0.426679	7:+11532289	None:intergenic
GGGCTATTTCAATGAGGCTT+GGG	0.428302	7:-11531034	MsG0780036664.01.T01:CDS
CATAACTCGTTCCCGATATG+AGG	0.430472	7:-11531367	MsG0780036664.01.T01:CDS
TATCAGTTCTTTGTAAGGTT+GGG	0.432481	7:-11532088	MsG0780036664.01.T01:CDS
GGAAGAGGCTTTGGAGTTGG+TGG	0.437040	7:-11531640	MsG0780036664.01.T01:CDS
CGGGAAGGCGATTTGTTACC+TGG	0.437315	7:-11531504	MsG0780036664.01.T01:CDS
CGATAACGTCTCTCTTGATT+GGG	0.437645	7:-11531578	MsG0780036664.01.T01:CDS
ACTTGTTCACCTCATTGATT+CGG	0.440019	7:+11530821	None:intergenic
AGAATGTGTTTAATAGGTTG+AGG	0.441527	7:-11532268	MsG0780036664.01.T01:CDS
ATTGTGTGGGATGAGCTTAA+AGG	0.445336	7:-11532047	MsG0780036664.01.T01:CDS
CTAGCCAGTTCTGTTCTTGA+CGG	0.446976	7:-11530916	MsG0780036664.01.T01:CDS
GGTGTTCTCAGGTGGAAGGC+TGG	0.453667	7:-11531483	MsG0780036664.01.T01:CDS
AGGGCTATTTCAATGAGGCT+TGG	0.456835	7:-11531035	MsG0780036664.01.T01:CDS
TGAACTCTTTGTCCACGGTC+AGG	0.457176	7:+11531228	None:intergenic
TTGTGTGGGATGAGCTTAAA+GGG	0.457643	7:-11532046	MsG0780036664.01.T01:CDS
TAAGAAGAAAGGTCAATTTG+TGG	0.463850	7:-11531715	MsG0780036664.01.T01:CDS
GATTCACAAGTACGGTCGTT+GGG	0.464255	7:-11531556	MsG0780036664.01.T01:CDS
TTATCAGTTCTTTGTAAGGT+TGG	0.469322	7:-11532089	MsG0780036664.01.T01:CDS
ATTCAAGGTTTAGGAAAGAT+GGG	0.470932	7:-11530949	MsG0780036664.01.T01:CDS
ATTGGAAGAGGCTTTGGAGT+TGG	0.473498	7:-11531643	MsG0780036664.01.T01:CDS
AATTTGGATTCTGTTATTGT+TGG	0.475012	7:-11532347	MsG0780036664.01.T01:CDS
AGAGGCTTTGGAGTTGGTGG+AGG	0.476632	7:-11531637	MsG0780036664.01.T01:CDS
TTCGTCGAATTACTTACTTT+CGG	0.476734	7:-11532324	MsG0780036664.01.T01:CDS
AATGGACTGATAGGCTCATC+AGG	0.477053	7:-11531533	MsG0780036664.01.T01:CDS
GAATGTGTTTAATAGGTTGA+GGG	0.480039	7:-11532267	MsG0780036664.01.T01:CDS
AGCAAGGCTGGCCGGACTGA+AGG	0.480474	7:-11530727	MsG0780036664.01.T01:CDS
TGGGCTATTCTGAGTGAAAT+GGG	0.481911	7:-11531015	MsG0780036664.01.T01:CDS
ACGTACAATATGATAATTCA+AGG	0.484955	7:-11530964	MsG0780036664.01.T01:CDS
ATTAATGCTTTGGGGAAGGC+AGG	0.486453	7:-11530844	MsG0780036664.01.T01:CDS
CACCTCATCATCCTCATATC+GGG	0.490560	7:+11531356	None:intergenic
TTGTTGTAGGACTTATAGGA+TGG	0.490778	7:-11531976	MsG0780036664.01.T01:CDS
ATTGAAATTCACAGCAAGGC+TGG	0.495929	7:-11530739	MsG0780036664.01.T01:CDS
GAATTATAAGTACACATATC+AGG	0.497199	7:+11532116	None:intergenic
TAAAGGGTGTGGTTATGAAC+CGG	0.501421	7:-11532030	MsG0780036664.01.T01:CDS
TAGCCCGTCAAGAACAGAAC+TGG	0.505344	7:+11530912	None:intergenic
AAGAAAGGTCAATTTGTGGA+TGG	0.506156	7:-11531711	MsG0780036664.01.T01:CDS
CCTCCTTTGGAAGGGAACAT+TGG	0.508518	7:+11531411	None:intergenic
AGAAAGGTCAATTTGTGGAT+GGG	0.511681	7:-11531710	MsG0780036664.01.T01:CDS
TTTAATAATATTATGACACT+TGG	0.516389	7:-11532386	None:intergenic
CAATTATACACAAGCACACC+GGG	0.523015	7:+11531906	None:intergenic
ATCGTGTAAGTAAACTCATC+CGG	0.523890	7:+11532011	None:intergenic
ACAAGTACGGTCGTTGGGAA+TGG	0.524061	7:-11531551	MsG0780036664.01.T01:CDS
TCTCAGGTGGAAGGCTGGAA+TGG	0.525138	7:-11531478	MsG0780036664.01.T01:CDS
TAGCCAGTTCTGTTCTTGAC+GGG	0.525673	7:-11530915	MsG0780036664.01.T01:CDS
CCAATGTTCCCTTCCAAAGG+AGG	0.525687	7:-11531411	MsG0780036664.01.T01:CDS
GTATTATAAGTGACAACGTC+AGG	0.526470	7:+11530766	None:intergenic
TTTGTTGAACTCTTTGTCCA+CGG	0.529004	7:+11531223	None:intergenic
TGTTTAATAGGTTGAGGGAA+AGG	0.532560	7:-11532262	MsG0780036664.01.T01:CDS
TCACTAAAACCTCCTTTGGA+AGG	0.541470	7:+11531402	None:intergenic
GAATTATATGTATAACTGAC+AGG	0.542662	7:+11531081	None:intergenic
ACCTGGTGTTCTCAGGTGGA+AGG	0.548025	7:-11531487	MsG0780036664.01.T01:CDS
AAATTCACAGCAAGGCTGGC+CGG	0.548528	7:-11530735	MsG0780036664.01.T01:CDS
TAAAGAGGGTCTATTGGAAG+AGG	0.551220	7:-11531655	MsG0780036664.01.T01:CDS
TGTTACCTGGTGTTCTCAGG+TGG	0.554040	7:-11531491	MsG0780036664.01.T01:CDS
TCGAGCAAATGAAGAGCAGC+GGG	0.554241	7:-11530795	MsG0780036664.01.T01:CDS
AAGGATAATGGGTTTCGTCC+CGG	0.558220	7:-11531924	MsG0780036664.01.T01:CDS
TAGGCTCATCAGGCATGTCC+GGG	0.558969	7:-11531523	MsG0780036664.01.T01:CDS
TTTGAGAAAATGGCTCAAGA+AGG	0.559919	7:-11531831	MsG0780036664.01.T01:CDS
GCCTTCCACCTGAGAACACC+AGG	0.562747	7:+11531486	None:intergenic
TGGGATGAGCTTAAAGGGTG+TGG	0.563069	7:-11532041	MsG0780036664.01.T01:CDS
TGGAGGAAATGGAAGCTAGA+GGG	0.564279	7:-11531620	MsG0780036664.01.T01:CDS
CTTATAAGCATCCTTCAGTC+CGG	0.568539	7:+11530716	None:intergenic
GTCGTTGGGAATGGACTGAT+AGG	0.570502	7:-11531542	MsG0780036664.01.T01:CDS
TTGAGAAAATGGCTCAAGAA+GGG	0.570509	7:-11531830	MsG0780036664.01.T01:CDS
GGATTCACAAGTACGGTCGT+TGG	0.574526	7:-11531557	MsG0780036664.01.T01:CDS
TTTGATTGAAATTCACAGCA+AGG	0.575015	7:-11530743	MsG0780036664.01.T01:CDS
TCACCAATGTTCCCTTCCAA+AGG	0.575940	7:-11531414	MsG0780036664.01.T01:CDS
ATTCATGGACTTATTAAGAA+CGG	0.577090	7:-11531774	MsG0780036664.01.T01:CDS
CACTAAAACCTCCTTTGGAA+GGG	0.579125	7:+11531403	None:intergenic
TTGTACGTCGCTATATCGGT+CGG	0.579359	7:+11530979	None:intergenic
TCTCATTAATGCTTTGGGGA+AGG	0.580158	7:-11530848	MsG0780036664.01.T01:CDS
GTGGTCATCGTCTCCACACA+TGG	0.580772	7:-11531307	MsG0780036664.01.T01:CDS
CTCATCAGGCATGTCCGGGA+AGG	0.582413	7:-11531519	MsG0780036664.01.T01:CDS
TGTACGTCGCTATATCGGTC+GGG	0.585311	7:+11530980	None:intergenic
TGGTTTATTCAAGGCTGCGA+AGG	0.587369	7:-11531874	MsG0780036664.01.T01:CDS
GACAGGATCCACGCCCGCGT+CGG	0.591802	7:+11531098	None:intergenic
TTGATTGGGATTCACAAGTA+CGG	0.592376	7:-11531564	MsG0780036664.01.T01:CDS
ATACTCTCATTAATGCTTTG+GGG	0.595033	7:-11530852	MsG0780036664.01.T01:CDS
TAATGATGCGCTTATTGTGT+GGG	0.595219	7:-11532060	MsG0780036664.01.T01:CDS
AGAGAGACGTTATCGTTACA+AGG	0.599588	7:+11531586	None:intergenic
GTGGAGGAAATGGAAGCTAG+AGG	0.600884	7:-11531621	MsG0780036664.01.T01:CDS
TGTGTTGCAACTATGTAAAG+AGG	0.601075	7:-11531670	MsG0780036664.01.T01:CDS
TAGGACTTATAGGATGGATG+TGG	0.602114	7:-11531970	MsG0780036664.01.T01:CDS
ACAATTATACACAAGCACAC+CGG	0.602407	7:+11531905	None:intergenic
AGGCTGCGAAGGTTAATGAC+GGG	0.603203	7:-11531863	MsG0780036664.01.T01:CDS
AAGAACGGAAGATCAGAAGC+TGG	0.606214	7:-11531759	MsG0780036664.01.T01:CDS
AAGGCTGCGAAGGTTAATGA+CGG	0.620954	7:-11531864	MsG0780036664.01.T01:CDS
CCGATATGAGGATGATGAGG+TGG	0.622950	7:-11531355	MsG0780036664.01.T01:CDS
TTCGAGCAAATGAAGAGCAG+CGG	0.626778	7:-11530796	MsG0780036664.01.T01:CDS
CTTGACGGGCTACTGAAGCA+AGG	0.643708	7:-11530901	MsG0780036664.01.T01:CDS
TTCCCGATATGAGGATGATG+AGG	0.644048	7:-11531358	MsG0780036664.01.T01:CDS
TTTGCCAATTTATCCATGTG+TGG	0.646839	7:+11531294	None:intergenic
ATAGGATGGATGTGGCGTTG+AGG	0.648799	7:-11531962	MsG0780036664.01.T01:CDS
TGAGAAAATGGCTCAAGAAG+GGG	0.653559	7:-11531829	MsG0780036664.01.T01:CDS
CGTCTGAACAAATCGATGAG+TGG	0.661073	7:-11531326	MsG0780036664.01.T01:CDS
GTGTTGCAACTATGTAAAGA+GGG	0.667745	7:-11531669	MsG0780036664.01.T01:CDS
TTTAGGAAAGATGGGAAGAG+CGG	0.672619	7:-11530941	MsG0780036664.01.T01:CDS
CGAATGTTTACTCCTGACCG+TGG	0.673988	7:-11531240	MsG0780036664.01.T01:CDS
ACTTACACGATTCTCGTTCG+GGG	0.675583	7:-11531999	MsG0780036664.01.T01:CDS
GAAGGCAGGCCGAATCAATG+AGG	0.682761	7:-11530830	MsG0780036664.01.T01:CDS
TTAATGATGCGCTTATTGTG+TGG	0.683387	7:-11532061	MsG0780036664.01.T01:CDS
GACGGGCTACTGAAGCAAGG+CGG	0.756029	7:-11530898	MsG0780036664.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
!!	AATATGATAATTCAAGGTTT+AGG	-	Chr7:11532133-11532152	MsG0780036664.01.T01:CDS	20.0%
!!	ACTTATAATATTCTGATTCA+TGG	-	Chr7:11531302-11531321	MsG0780036664.01.T01:CDS	20.0%
!!	TGATATGTGTACTTATAATT+CGG	-	Chr7:11530977-11530996	MsG0780036664.01.T01:CDS	20.0%
!!!	AAAGTTTTGATTTTGATTTG+TGG	-	Chr7:11530853-11530872	MsG0780036664.01.T01:CDS	20.0%
!!!	AAGTTTTGATTTTGATTTGT+GGG	-	Chr7:11530854-11530873	MsG0780036664.01.T01:CDS	20.0%
!!!	AATATTTGTATTCATGCTTT+TGG	-	Chr7:11530882-11530901	MsG0780036664.01.T01:CDS	20.0%
!!!	TATCAATAATTTTCATTCCA+AGG	-	Chr7:11531643-11531662	MsG0780036664.01.T01:CDS	20.0%
!	AATACTCTCATTAATGCTTT+GGG	-	Chr7:11532238-11532257	MsG0780036664.01.T01:CDS	25.0%
!	AATTTGGATTCTGTTATTGT+TGG	-	Chr7:11530744-11530763	MsG0780036664.01.T01:CDS	25.0%
!	ACGTACAATATGATAATTCA+AGG	-	Chr7:11532127-11532146	MsG0780036664.01.T01:CDS	25.0%
!	AGTTTGAGAATGTGTTTAAT+AGG	-	Chr7:11530817-11530836	MsG0780036664.01.T01:CDS	25.0%
!	ATTCATGGACTTATTAAGAA+CGG	-	Chr7:11531317-11531336	MsG0780036664.01.T01:CDS	25.0%
!	GAATTATAAGTACACATATC+AGG	+	Chr7:11530978-11530997	None:intergenic	25.0%
!	GAATTATATGTATAACTGAC+AGG	+	Chr7:11532013-11532032	None:intergenic	25.0%
!	TAATACTCTCATTAATGCTT+TGG	-	Chr7:11532237-11532256	MsG0780036664.01.T01:CDS	25.0%
!!	ATGAGCTCATTTGTTAAAAA+GGG	-	Chr7:11532037-11532056	MsG0780036664.01.T01:CDS	25.0%
!!	TAATTTTCATTCCAAGGAAA+AGG	-	Chr7:11531649-11531668	MsG0780036664.01.T01:CDS	25.0%
!!	TGATGATGATTGTTTGAATT+TGG	-	Chr7:11530728-11530747	MsG0780036664.01.T01:CDS	25.0%
!!	TGATTCTTTTGATGTTGATA+TGG	-	Chr7:11531898-11531917	MsG0780036664.01.T01:CDS	25.0%
!!!	AGTTTTGATTTTGATTTGTG+GGG	-	Chr7:11530855-11530874	MsG0780036664.01.T01:CDS	25.0%
	AATTCAAGGTTTAGGAAAGA+TGG	-	Chr7:11532141-11532160	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
	AGAATGTGTTTAATAGGTTG+AGG	-	Chr7:11530823-11530842	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
	ATACTCTCATTAATGCTTTG+GGG	-	Chr7:11532239-11532258	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
	ATTCAAGGTTTAGGAAAGAT+GGG	-	Chr7:11532142-11532161	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
	GACAAAGAGTTCAACAAAAA+GGG	-	Chr7:11531873-11531892	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
	TAAGAAGAAAGGTCAATTTG+TGG	-	Chr7:11531376-11531395	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
	TATCAGTTCTTTGTAAGGTT+GGG	-	Chr7:11531003-11531022	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
	TTAACGAGATGAAGGATAAT+GGG	-	Chr7:11531156-11531175	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
	TTATCAGTTCTTTGTAAGGT+TGG	-	Chr7:11531002-11531021	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
	TTCGTCGAATTACTTACTTT+CGG	-	Chr7:11530767-11530786	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
	TTTAACGAGATGAAGGATAA+TGG	-	Chr7:11531155-11531174	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
	TTTGATTGAAATTCACAGCA+AGG	-	Chr7:11532348-11532367	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
!	AAGGAGGATAAGAATTTGTT+TGG	-	Chr7:11530951-11530970	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
!	CATGAGCTCATTTGTTAAAA+AGG	-	Chr7:11532036-11532055	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
!	GAAGCTTTTTAATGAGATGA+AGG	-	Chr7:11530932-11530951	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
!	GAATGTGTTTAATAGGTTGA+GGG	-	Chr7:11530824-11530843	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
!	GCTTGTGTATAATTGTGTTT+TGG	-	Chr7:11531193-11531212	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
!	TAAAAAGGGCTATTTCAATG+AGG	-	Chr7:11532051-11532070	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
!	TTTTGCGATCTTAAGAAGAA+AGG	-	Chr7:11531365-11531384	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
!!	GGTTTTATCAGTTCTTTGTA+AGG	-	Chr7:11530998-11531017	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
!!	GTGTATAATTGTGTTTTGGA+TGG	-	Chr7:11531197-11531216	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
!!	TGTTTTGGATGGTTTATTCA+AGG	-	Chr7:11531208-11531227	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
!!!	TATTCATGCTTTTGGTTCAT+GGG	-	Chr7:11530890-11530909	MsG0780036664.01.T01:CDS	30.0%
	AAGAAAGGTCAATTTGTGGA+TGG	-	Chr7:11531380-11531399	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
	ACAATTATACACAAGCACAC+CGG	+	Chr7:11531189-11531208	None:intergenic	35.0%
	ACTATGTAAAGAGGGTCTAT+TGG	-	Chr7:11531430-11531449	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
	AGAAAGGTCAATTTGTGGAT+GGG	-	Chr7:11531381-11531400	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
	ATCGTGTAAGTAAACTCATC+CGG	+	Chr7:11531083-11531102	None:intergenic	35.0%
	CATATTGTACGTCGCTATAT+CGG	+	Chr7:11532119-11532138	None:intergenic	35.0%
	GGACAAAGAGTTCAACAAAA+AGG	-	Chr7:11531872-11531891	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
	GTATTATAAGTGACAACGTC+AGG	+	Chr7:11532328-11532347	None:intergenic	35.0%
	GTGTCAGATGTTTGAGAAAA+TGG	-	Chr7:11531250-11531269	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
	GTGTTGCAACTATGTAAAGA+GGG	-	Chr7:11531422-11531441	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
	TAATGATGCGCTTATTGTGT+GGG	-	Chr7:11531031-11531050	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
	TCTCAAACTCTTTCTTCATC+CGG	+	Chr7:11530806-11530825	None:intergenic	35.0%
	TGTGTTGCAACTATGTAAAG+AGG	-	Chr7:11531421-11531440	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
	TTAATGATGCGCTTATTGTG+TGG	-	Chr7:11531030-11531049	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
	TTACTTACACGATTCTCGTT+CGG	-	Chr7:11531090-11531109	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
	TTGAGAAAATGGCTCAAGAA+GGG	-	Chr7:11531261-11531280	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
	TTGATTGGGATTCACAAGTA+CGG	-	Chr7:11531527-11531546	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
	TTGTTGTAGGACTTATAGGA+TGG	-	Chr7:11531115-11531134	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
	TTTGAGAAAATGGCTCAAGA+AGG	-	Chr7:11531260-11531279	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
	TTTGCCAATTTATCCATGTG+TGG	+	Chr7:11531800-11531819	None:intergenic	35.0%
	TTTGTTGAACTCTTTGTCCA+CGG	+	Chr7:11531871-11531890	None:intergenic	35.0%
!	ACTTGTTCACCTCATTGATT+CGG	+	Chr7:11532273-11532292	None:intergenic	35.0%
!	GAGGATTTTTAACGAGATGA+AGG	-	Chr7:11531148-11531167	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
!	GCTTTTTAATGAGATGAAGG+AGG	-	Chr7:11530935-11530954	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
!	TGTTTAATAGGTTGAGGGAA+AGG	-	Chr7:11530829-11530848	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
!!	CCTGTCTATATTTTTGTCGA+GGG	-	Chr7:11531931-11531950	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
!!	CTGTCTATATTTTTGTCGAG+GGG	-	Chr7:11531932-11531951	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
!!	TCCTGTCTATATTTTTGTCG+AGG	-	Chr7:11531930-11531949	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
!!!	ATTCATGCTTTTGGTTCATG+GGG	-	Chr7:11530891-11530910	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
!!!	GTATTCATGCTTTTGGTTCA+TGG	-	Chr7:11530889-11530908	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
!!!	TTTCGGTTTTAAGAAAAGCC+CGG	-	Chr7:11530784-11530803	MsG0780036664.01.T01:CDS	35.0%
	ACGATAACGTCTCTCTTGAT+TGG	-	Chr7:11531512-11531531	MsG0780036664.01.T01:CDS	40.0%
	AGAGAGACGTTATCGTTACA+AGG	+	Chr7:11531508-11531527	None:intergenic	40.0%
	ATTGAAATTCACAGCAAGGC+TGG	-	Chr7:11532352-11532371	MsG0780036664.01.T01:CDS	40.0%
	ATTGTGTGGGATGAGCTTAA+AGG	-	Chr7:11531044-11531063	MsG0780036664.01.T01:CDS	40.0%
	CAATTATACACAAGCACACC+GGG	+	Chr7:11531188-11531207	None:intergenic	40.0%
	CCCTCGACAAAAATATAGAC+AGG	+	Chr7:11531934-11531953	None:intergenic	40.0%
	CGATAACGTCTCTCTTGATT+GGG	-	Chr7:11531513-11531532	MsG0780036664.01.T01:CDS	40.0%
	CTCAAACTCTTTCTTCATCC+GGG	+	Chr7:11530805-11530824	None:intergenic	40.0%
	GATCTCACTAAAACCTCCTT+TGG	+	Chr7:11531696-11531715	None:intergenic	40.0%
	GTCTCCACACATGGATAAAT+TGG	-	Chr7:11531793-11531812	MsG0780036664.01.T01:CDS	40.0%
	TAAAGAGGGTCTATTGGAAG+AGG	-	Chr7:11531436-11531455	MsG0780036664.01.T01:CDS	40.0%
	TACTTACACGATTCTCGTTC+GGG	-	Chr7:11531091-11531110	MsG0780036664.01.T01:CDS	40.0%
	TAGGACTTATAGGATGGATG+TGG	-	Chr7:11531121-11531140	MsG0780036664.01.T01:CDS	40.0%
	TCACTAAAACCTCCTTTGGA+AGG	+	Chr7:11531692-11531711	None:intergenic	40.0%
	TGAGAAAATGGCTCAAGAAG+GGG	-	Chr7:11531262-11531281	MsG0780036664.01.T01:CDS	40.0%
	TGGGCTATTCTGAGTGAAAT+GGG	-	Chr7:11532076-11532095	MsG0780036664.01.T01:CDS	40.0%
	TTGGGCTATTCTGAGTGAAA+TGG	-	Chr7:11532075-11532094	MsG0780036664.01.T01:CDS	40.0%
	TTGTGTGGGATGAGCTTAAA+GGG	-	Chr7:11531045-11531064	MsG0780036664.01.T01:CDS	40.0%
	TTTAGGAAAGATGGGAAGAG+CGG	-	Chr7:11532150-11532169	MsG0780036664.01.T01:CDS	40.0%
!	ATTTGTTACCTGGTGTTCTC+AGG	-	Chr7:11531597-11531616	MsG0780036664.01.T01:CDS	40.0%
!	CACTAAAACCTCCTTTGGAA+GGG	+	Chr7:11531691-11531710	None:intergenic	40.0%
!	TAAAGGGTGTGGTTATGAAC+CGG	-	Chr7:11531061-11531080	MsG0780036664.01.T01:CDS	40.0%
!	TGGTGAGTAATCCTTTTCCT+TGG	+	Chr7:11531663-11531682	None:intergenic	40.0%
!!	TCTCATTAATGCTTTGGGGA+AGG	-	Chr7:11532243-11532262	MsG0780036664.01.T01:CDS	40.0%
!!!	TTTTGGTTCATGGGGTGATT+TGG	-	Chr7:11530899-11530918	MsG0780036664.01.T01:CDS	40.0%
	AAGAACGGAAGATCAGAAGC+TGG	-	Chr7:11531332-11531351	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
	AAGGCTGCGAAGGTTAATGA+CGG	-	Chr7:11531227-11531246	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
	ACTTACACGATTCTCGTTCG+GGG	-	Chr7:11531092-11531111	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
	CACCTCATCATCCTCATATC+GGG	+	Chr7:11531738-11531757	None:intergenic	45.0%
	CATAACTCGTTCCCGATATG+AGG	-	Chr7:11531724-11531743	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
	CCACCTCATCATCCTCATAT+CGG	+	Chr7:11531739-11531758	None:intergenic	45.0%
	CGTCTGAACAAATCGATGAG+TGG	-	Chr7:11531765-11531784	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
	CTAGCCAGTTCTGTTCTTGA+CGG	-	Chr7:11532175-11532194	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
	GATTCACAAGTACGGTCGTT+GGG	-	Chr7:11531535-11531554	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
	GGGGTTGTTGTAGGACTTAT+AGG	-	Chr7:11531111-11531130	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
	TAGCCAGTTCTGTTCTTGAC+GGG	-	Chr7:11532176-11532195	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
	TCACCAATGTTCCCTTCCAA+AGG	-	Chr7:11531677-11531696	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
	TGGAGGAAATGGAAGCTAGA+GGG	-	Chr7:11531471-11531490	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
	TGGTTTATTCAAGGCTGCGA+AGG	-	Chr7:11531217-11531236	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
	TTCCCGATATGAGGATGATG+AGG	-	Chr7:11531733-11531752	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
	TTCGAGCAAATGAAGAGCAG+CGG	-	Chr7:11532295-11532314	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
	TTGTACGTCGCTATATCGGT+CGG	+	Chr7:11532115-11532134	None:intergenic	45.0%
!	AGGGCTATTTCAATGAGGCT+TGG	-	Chr7:11532056-11532075	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
!	GGGCTATTTCAATGAGGCTT+GGG	-	Chr7:11532057-11532076	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
!!	AAGGATAATGGGTTTCGTCC+CGG	-	Chr7:11531167-11531186	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
!!	AATGGACTGATAGGCTCATC+AGG	-	Chr7:11531558-11531577	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
!!	ATTAATGCTTTGGGGAAGGC+AGG	-	Chr7:11532247-11532266	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
!!	ATTGGAAGAGGCTTTGGAGT+TGG	-	Chr7:11531448-11531467	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
!!	GTTTGAGATTTTCACCGACG+CGG	-	Chr7:11531979-11531998	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
!!	TTTGAGATTTTCACCGACGC+GGG	-	Chr7:11531980-11531999	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
!!	TTTGGAGTTGGTGGAGGAAA+TGG	-	Chr7:11531460-11531479	MsG0780036664.01.T01:CDS	45.0%
	AAATTCACAGCAAGGCTGGC+CGG	-	Chr7:11532356-11532375	MsG0780036664.01.T01:CDS	50.0%
	ACAAGTACGGTCGTTGGGAA+TGG	-	Chr7:11531540-11531559	MsG0780036664.01.T01:CDS	50.0%
	AGGCTGCGAAGGTTAATGAC+GGG	-	Chr7:11531228-11531247	MsG0780036664.01.T01:CDS	50.0%
	ATAGGATGGATGTGGCGTTG+AGG	-	Chr7:11531129-11531148	MsG0780036664.01.T01:CDS	50.0%
	ATAGGCTCATCAGGCATGTC+CGG	-	Chr7:11531567-11531586	MsG0780036664.01.T01:CDS	50.0%
	CAGGTAACAAATCGCCTTCC+CGG	+	Chr7:11531589-11531608	None:intergenic	50.0%
	CCAATGTTCCCTTCCAAAGG+AGG	-	Chr7:11531680-11531699	MsG0780036664.01.T01:CDS	50.0%
	CCGATATGAGGATGATGAGG+TGG	-	Chr7:11531736-11531755	MsG0780036664.01.T01:CDS	50.0%
	CGAATGTTTACTCCTGACCG+TGG	-	Chr7:11531851-11531870	MsG0780036664.01.T01:CDS	50.0%
	GGATTCACAAGTACGGTCGT+TGG	-	Chr7:11531534-11531553	MsG0780036664.01.T01:CDS	50.0%
	GGGTCTATTGGAAGAGGCTT+TGG	-	Chr7:11531442-11531461	MsG0780036664.01.T01:CDS	50.0%
	GTGGAGGAAATGGAAGCTAG+AGG	-	Chr7:11531470-11531489	MsG0780036664.01.T01:CDS	50.0%
	TAGCCCGTCAAGAACAGAAC+TGG	+	Chr7:11532182-11532201	None:intergenic	50.0%
	TCGAGCAAATGAAGAGCAGC+GGG	-	Chr7:11532296-11532315	MsG0780036664.01.T01:CDS	50.0%
	TGAACTCTTTGTCCACGGTC+AGG	+	Chr7:11531866-11531885	None:intergenic	50.0%
	TGGGATGAGCTTAAAGGGTG+TGG	-	Chr7:11531050-11531069	MsG0780036664.01.T01:CDS	50.0%
	TGTACGTCGCTATATCGGTC+GGG	+	Chr7:11532114-11532133	None:intergenic	50.0%
	TGTTACCTGGTGTTCTCAGG+TGG	-	Chr7:11531600-11531619	MsG0780036664.01.T01:CDS	50.0%
	TTCTCGTTCGGGGTTGTTGT+AGG	-	Chr7:11531102-11531121	MsG0780036664.01.T01:CDS	50.0%
!	CCTCCTTTGGAAGGGAACAT+TGG	+	Chr7:11531683-11531702	None:intergenic	50.0%
!!	GTCGTTGGGAATGGACTGAT+AGG	-	Chr7:11531549-11531568	MsG0780036664.01.T01:CDS	50.0%
	ACCTGGTGTTCTCAGGTGGA+AGG	-	Chr7:11531604-11531623	MsG0780036664.01.T01:CDS	55.0%
	GAAGGCAGGCCGAATCAATG+AGG	-	Chr7:11532261-11532280	MsG0780036664.01.T01:CDS	55.0%
	GTGGTCATCGTCTCCACACA+TGG	-	Chr7:11531784-11531803	MsG0780036664.01.T01:CDS	55.0%
	TAGGCTCATCAGGCATGTCC+GGG	-	Chr7:11531568-11531587	MsG0780036664.01.T01:CDS	55.0%
	TCTCAGGTGGAAGGCTGGAA+TGG	-	Chr7:11531613-11531632	MsG0780036664.01.T01:CDS	55.0%
!!	AGAGGCTTTGGAGTTGGTGG+AGG	-	Chr7:11531454-11531473	MsG0780036664.01.T01:CDS	55.0%
!!	CGGGAAGGCGATTTGTTACC+TGG	-	Chr7:11531587-11531606	MsG0780036664.01.T01:CDS	55.0%
!!	CTTGACGGGCTACTGAAGCA+AGG	-	Chr7:11532190-11532209	MsG0780036664.01.T01:CDS	55.0%
!!	GGAAGAGGCTTTGGAGTTGG+TGG	-	Chr7:11531451-11531470	MsG0780036664.01.T01:CDS	55.0%
	CTCATCAGGCATGTCCGGGA+AGG	-	Chr7:11531572-11531591	MsG0780036664.01.T01:CDS	60.0%
	GCCTTCCACCTGAGAACACC+AGG	+	Chr7:11531608-11531627	None:intergenic	60.0%
	GGTGTTCTCAGGTGGAAGGC+TGG	-	Chr7:11531608-11531627	MsG0780036664.01.T01:CDS	60.0%
!!	GACGGGCTACTGAAGCAAGG+CGG	-	Chr7:11532193-11532212	MsG0780036664.01.T01:CDS	60.0%
!	AGCAAGGCTGGCCGGACTGA+AGG	-	Chr7:11532364-11532383	MsG0780036664.01.T01:CDS	65.0%
!	GATTTTCACCGACGCGGGCG+TGG	-	Chr7:11531985-11532004	MsG0780036664.01.T01:CDS	65.0%
	GACAGGATCCACGCCCGCGT+CGG	+	Chr7:11531996-11532015	None:intergenic	70.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
Chr7	gene	11530717	11532396	11530717	ID=MsG0780036664.01;Name=MsG0780036664.01
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Chr7	exon	11530717	11532396	11530717	ID=MsG0780036664.01.T01:exon:1803;Parent=MsG0780036664.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0780036664.01.T01

ATGACACTTGGTGATGATGATTGTTTGAATTTGGATTCTGTTATTGTTGGTTCGTCGAATTACTTACTTTCGGTTTTAAGAAAAGCCCGGATGAAGAAAGAGTTTGAGAATGTGTTTAATAGGTTGAGGGAAAGGAAAAGTTTTGATTTTGATTTGTGGGGTTATAATATTTGTATTCATGCTTTTGGTTCATGGGGTGATTTGGTTACTTCTATGAAGCTTTTTAATGAGATGAAGGAGGATAAGAATTTGTTTGGACCTGATATGTGTACTTATAATTCGGTTTTATCAGTTCTTTGTAAGGTTGGGAAGATTAATGATGCGCTTATTGTGTGGGATGAGCTTAAAGGGTGTGGTTATGAACCGGATGAGTTTACTTACACGATTCTCGTTCGGGGTTGTTGTAGGACTTATAGGATGGATGTGGCGTTGAGGATTTTTAACGAGATGAAGGATAATGGGTTTCGTCCCGGTGTGCTTGTGTATAATTGTGTTTTGGATGGTTTATTCAAGGCTGCGAAGGTTAATGACGGGTGTCAGATGTTTGAGAAAATGGCTCAAGAAGGGGTGAAAGCTTCTTGTTCGACTTATAATATTCTGATTCATGGACTTATTAAGAACGGAAGATCAGAAGCTGGTTATATGCTTTTTTGCGATCTTAAGAAGAAAGGTCAATTTGTGGATGGGATTACTTACAGCATTGTTGTGTTGCAACTATGTAAAGAGGGTCTATTGGAAGAGGCTTTGGAGTTGGTGGAGGAAATGGAAGCTAGAGGGTTTTCTGTTGACCTTGTAACGATAACGTCTCTCTTGATTGGGATTCACAAGTACGGTCGTTGGGAATGGACTGATAGGCTCATCAGGCATGTCCGGGAAGGCGATTTGTTACCTGGTGTTCTCAGGTGGAAGGCTGGAATGGAAGCTTCTATCAATAATTTTCATTCCAAGGAAAAGGATTACTCACCAATGTTCCCTTCCAAAGGAGGTTTTAGTGAGATCATGAGTTTCATAACTCGTTCCCGATATGAGGATGATGAGGTGGAAACTTCGTCTGAACAAATCGATGAGTGGTCATCGTCTCCACACATGGATAAATTGGCAAAGCGTGTTGTGAATTCAACTAGCAATGCTTCTCGAATGTTTACTCCTGACCGTGGACAAAGAGTTCAACAAAAAGGGTCTGATTCTTTTGATGTTGATATGGTGAATACTTTCCTGTCTATATTTTTGTCGAGGGGAAAGTTAAGTCTCGCTTGCAAATTGTTTGAGATTTTCACCGACGCGGGCGTGGATCCTGTCAGTTATACATATAATTCTATCATGAGCTCATTTGTTAAAAAGGGCTATTTCAATGAGGCTTGGGCTATTCTGAGTGAAATGGGAGAAAAGCTCTGCCCGACCGATATAGCGACGTACAATATGATAATTCAAGGTTTAGGAAAGATGGGAAGAGCGGATCTAGCCAGTTCTGTTCTTGACGGGCTACTGAAGCAAGGCGGTTATCTTGACATAGTTATGTATAATACTCTCATTAATGCTTTGGGGAAGGCAGGCCGAATCAATGAGGTGAACAAGTTCTTCGAGCAAATGAAGAGCAGCGGGATAAATCCTGACGTTGTCACTTATAATACTTTGATTGAAATTCACAGCAAGGCTGGCCGGACTGAAGGATGCTTATAA

Protein sequence

>MsG0780036664.01.T01

MTLGDDDCLNLDSVIVGSSNYLLSVLRKARMKKEFENVFNRLRERKSFDFDLWGYNICIHAFGSWGDLVTSMKLFNEMKEDKNLFGPDMCTYNSVLSVLCKVGKINDALIVWDELKGCGYEPDEFTYTILVRGCCRTYRMDVALRIFNEMKDNGFRPGVLVYNCVLDGLFKAAKVNDGCQMFEKMAQEGVKASCSTYNILIHGLIKNGRSEAGYMLFCDLKKKGQFVDGITYSIVVLQLCKEGLLEEALELVEEMEARGFSVDLVTITSLLIGIHKYGRWEWTDRLIRHVREGDLLPGVLRWKAGMEASINNFHSKEKDYSPMFPSKGGFSEIMSFITRSRYEDDEVETSSEQIDEWSSSPHMDKLAKRVVNSTSNASRMFTPDRGQRVQQKGSDSFDVDMVNTFLSIFLSRGKLSLACKLFEIFTDAGVDPVSYTYNSIMSSFVKKGYFNEAWAILSEMGEKLCPTDIATYNMIIQGLGKMGRADLASSVLDGLLKQGGYLDIVMYNTLINALGKAGRINEVNKFFEQMKSSGINPDVVTYNTLIEIHSKAGRTEGCL*