AlfalfaGEDB | MsG0780039369.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039369.01

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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CRISPR-GE

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!	GGATATTTTGTTGAAAAGTC+GGG	-	Chr7:62912881-62912900	MsG0780039369.01.T01:intron	30.0%
!!	AAAAAGTAAGCTTTTGGAGA+TGG	+	Chr7:62912594-62912613	None:intergenic	30.0%
!!	AAAAGTAAGCTTTTGGAGAT+GGG	+	Chr7:62912593-62912612	None:intergenic	30.0%
!!	GCCATTTTCTGAATTTTCTT+AGG	+	Chr7:62912410-62912429	None:intergenic	30.0%
!!	GGCAATTCAAACTTGTTAAT+CGG	-	Chr7:62911545-62911564	MsG0780039369.01.T01:CDS	30.0%
!!	TGAAGTGTTGTTATTGGTTA+TGG	+	Chr7:62912628-62912647	None:intergenic	30.0%
!!	TGCGTTTTTGAGAATTTGTA+TGG	+	Chr7:62912484-62912503	None:intergenic	30.0%
!!!	ATGATTAGGTTTTTGGTGAA+GGG	-	Chr7:62913158-62913177	MsG0780039369.01.T01:intron	30.0%
!!!	CACCATTTTTGGATTTGTTA+AGG	+	Chr7:62912355-62912374	None:intergenic	30.0%
!!!	GAGTTTTTGGGTTTTGATTA+AGG	-	Chr7:62912929-62912948	MsG0780039369.01.T01:intron	30.0%
!!!	TATGATTAGGTTTTTGGTGA+AGG	-	Chr7:62913157-62913176	MsG0780039369.01.T01:intron	30.0%
!!!	TTGTTGTTGTTTTGTGTTTG+AGG	+	Chr7:62912516-62912535	None:intergenic	30.0%
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!!!	TGTTTGCGGTTTTGGATAAT+GGG	+	Chr7:62912383-62912402	None:intergenic	35.0%
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	AAATGATTTGACTAGCGTCG+AGG	-	Chr7:62913070-62913089	MsG0780039369.01.T01:intron	40.0%
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	AATGAAGGAGATGAGGTTGA+AGG	-	Chr7:62913523-62913542	MsG0780039369.01.T01:intron	40.0%
	AATGCTTGAGTCCTGTTGTT+TGG	-	Chr7:62911432-62911451	MsG0780039369.01.T01:CDS	40.0%
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	ATGAAGGAGATGAGGTTGAA+GGG	-	Chr7:62913524-62913543	MsG0780039369.01.T01:intron	40.0%
	ATTCAAGTGCCAACGAAATG+AGG	+	Chr7:62910754-62910773	None:intergenic	40.0%
	CCAGAAGATCGTCATTAGTT+AGG	-	Chr7:62911151-62911170	MsG0780039369.01.T01:CDS	40.0%
	CCTAACTAATGACGATCTTC+TGG	+	Chr7:62911154-62911173	None:intergenic	40.0%
	CCTCAACAATCCAACAAATG+TGG	+	Chr7:62913831-62913850	None:intergenic	40.0%
	CGTACATCAAATGTGCCAAA+AGG	-	Chr7:62913685-62913704	MsG0780039369.01.T01:CDS	40.0%
	GACTGACGAATATTGGATGA+AGG	+	Chr7:62912273-62912292	None:intergenic	40.0%
	GAGATTTAGGTAAGGCAAAG+AGG	-	Chr7:62913498-62913517	MsG0780039369.01.T01:intron	40.0%
	GATCGTCATTAGTTAGGGTA+AGG	-	Chr7:62911157-62911176	MsG0780039369.01.T01:CDS	40.0%
	GGATTTGAAGATTCGTCTTG+AGG	-	Chr7:62912902-62912921	MsG0780039369.01.T01:intron	40.0%
	GGGGAAATATGAGGAAACTA+GGG	-	Chr7:62913105-62913124	MsG0780039369.01.T01:intron	40.0%
	GGGTTTACCCTTTGATTGTA+TGG	+	Chr7:62912252-62912271	None:intergenic	40.0%
	GGTAAGACAGTTGTTGTAGT+TGG	-	Chr7:62911481-62911500	MsG0780039369.01.T01:CDS	40.0%
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	TAAGGCAAAGAGGGTAATGA+AGG	-	Chr7:62913508-62913527	MsG0780039369.01.T01:intron	40.0%
	TCAAGATGCTCATCGAATGT+TGG	-	Chr7:62910782-62910801	MsG0780039369.01.T01:CDS	40.0%
	TCAAGATGCTCATCGAATGT+TGG	+	Chr7:62910801-62910782	None:intergenic	40.0%
	TCAAGGAATGGACCTCATTT+CGG	-	Chr7:62910739-62910758	MsG0780039369.01.T01:CDS	40.0%
	TCTATGTCTTCAGAACTGCT+CGG	-	Chr7:62912049-62912068	MsG0780039369.01.T01:intron	40.0%
	TGGGGAAATATGAGGAAACT+AGG	-	Chr7:62913104-62913123	MsG0780039369.01.T01:intron	40.0%
	TGGTTGTTTGGGGAAATATG+AGG	-	Chr7:62913096-62913115	MsG0780039369.01.T01:intron	40.0%
	TTGGTACAATCCATTACACC+CGG	+	Chr7:62913137-62913156	None:intergenic	40.0%
	TTTGAATTTGCCCCATTCAG+TGG	-	Chr7:62910824-62910843	MsG0780039369.01.T01:CDS	40.0%
!	CAACTGTCTTACCTCTGAAA+TGG	+	Chr7:62911474-62911493	None:intergenic	40.0%
!	CCACATTTGTTGGATTGTTG+AGG	-	Chr7:62913828-62913847	MsG0780039369.01.T01:CDS	40.0%
!	GATGTTTTGTAAGGTGAGTG+TGG	+	Chr7:62912432-62912451	None:intergenic	40.0%
!	GGAGTGTTTGAAAATGGTTC+CGG	-	Chr7:62912860-62912879	MsG0780039369.01.T01:intron	40.0%
!	GTCTTGAGGAATCGAGTTTT+TGG	-	Chr7:62912916-62912935	MsG0780039369.01.T01:intron	40.0%
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!!	ACTGTCTTACCTCTGAAATG+GGG	+	Chr7:62911472-62911491	None:intergenic	40.0%
!!	ATTCAAACTTGCTAAGCAGC+AGG	+	Chr7:62910811-62910830	None:intergenic	40.0%
!!	GAAGAGGGAGTGTTTGAAAA+TGG	-	Chr7:62912854-62912873	MsG0780039369.01.T01:intron	40.0%
!!	GATGAAGGTATTAGGTGTCA+AGG	-	Chr7:62911314-62911333	MsG0780039369.01.T01:CDS	40.0%
!!	TGTTAGGCTGGTTTAGATGA+AGG	-	Chr7:62911299-62911318	MsG0780039369.01.T01:CDS	40.0%
!!!	ATTAGGTTTTTGGTGAAGGG+AGG	-	Chr7:62913161-62913180	MsG0780039369.01.T01:intron	40.0%
!!!	TTAGGTTTTTGGTGAAGGGA+GGG	-	Chr7:62913162-62913181	MsG0780039369.01.T01:intron	40.0%
	AGAGGGTAATGAAGGAGATG+AGG	-	Chr7:62913516-62913535	MsG0780039369.01.T01:intron	45.0%
	AGGAATGGACCTCATTTCGT+TGG	-	Chr7:62910742-62910761	MsG0780039369.01.T01:CDS	45.0%
	ATTCAAGTGCCACCGAAATG+AGG	+	Chr7:62911346-62911365	None:intergenic	45.0%
	GTTGGTGTGCATCTAAACCT+CGG	+	Chr7:62912795-62912814	None:intergenic	45.0%
	TCGATGAGCATCTTGAACGA+TGG	+	Chr7:62911601-62911582	None:intergenic	45.0%
	TGTTCCAGTGGATCGATATG+CGG	-	Chr7:62911080-62911099	MsG0780039369.01.T01:CDS	45.0%
	TTCAAACTTGCCAAACGGTC+AGG	-	Chr7:62911223-62911242	MsG0780039369.01.T01:CDS	45.0%
!	CTTAACTGCTGAGGTTTGCT+CGG	-	Chr7:62912074-62912093	MsG0780039369.01.T01:intron	45.0%
!	TAAAAGACGGTTTTGCCCCT+CGG	+	Chr7:62912172-62912191	None:intergenic	45.0%
!	TGCAGTTGGAAGGTACATTC+CGG	-	Chr7:62910859-62910878	MsG0780039369.01.T01:CDS	45.0%
!!	AAGTTTTGATCCAGGAGCCA+AGG	-	Chr7:62913754-62913773	MsG0780039369.01.T01:CDS	45.0%
!!	AGGAAACTAGGGTTTTGTCC+GGG	-	Chr7:62913116-62913135	MsG0780039369.01.T01:intron	45.0%
!!	GAGGAAACTAGGGTTTTGTC+CGG	-	Chr7:62913115-62913134	MsG0780039369.01.T01:intron	45.0%
!!	TTTTTGGTGAAGGGAGGGAA+GGG	-	Chr7:62913167-62913186	MsG0780039369.01.T01:intron	45.0%
	AAGCAGTGCTTCCCAAACCT+TGG	+	Chr7:62913774-62913793	None:intergenic	50.0%
	ACGCTATCGCAATATCGACG+AGG	-	Chr7:62910985-62911004	MsG0780039369.01.T01:CDS	50.0%
	AGGAATGGACCTCATTTCGG+TGG	-	Chr7:62911334-62911353	MsG0780039369.01.T01:CDS	50.0%
	AGGGAAGGGTAAGGATGCTT+TGG	-	Chr7:62913181-62913200	MsG0780039369.01.T01:intron	50.0%
	ATGCTTGAGTCCTGACCGTT+TGG	+	Chr7:62911236-62911255	None:intergenic	50.0%
	CAGGACTCAAGCATTTCGCT+CGG	-	Chr7:62911242-62911261	MsG0780039369.01.T01:CDS	50.0%
	CGCTATCGCAATATCGACGA+GGG	-	Chr7:62910986-62911005	MsG0780039369.01.T01:CDS	50.0%
	GCTATCGCAATATCGACGAG+GGG	-	Chr7:62910987-62911006	MsG0780039369.01.T01:CDS	50.0%
	GTTCCAGTGGATCGATATGC+GGG	-	Chr7:62911081-62911100	MsG0780039369.01.T01:CDS	50.0%
	TGATCCAGGAGCCAAGGTTT+GGG	-	Chr7:62913760-62913779	MsG0780039369.01.T01:CDS	50.0%
	TGCTCGGTACTTAACTGCTG+AGG	-	Chr7:62912065-62912084	MsG0780039369.01.T01:intron	50.0%
	TTGATCCAGGAGCCAAGGTT+TGG	-	Chr7:62913759-62913778	MsG0780039369.01.T01:CDS	50.0%
!	CGTCGAGGCTTTGGTTGTTT+GGG	-	Chr7:62913085-62913104	MsG0780039369.01.T01:intron	50.0%
!	GTCGAGGCTTTGGTTGTTTG+GGG	-	Chr7:62913086-62913105	MsG0780039369.01.T01:intron	50.0%
!	TTTGACTAGCGTCGAGGCTT+TGG	-	Chr7:62913076-62913095	MsG0780039369.01.T01:intron	50.0%
!!	AGGGGAGGGTATCATTCACT+TGG	-	Chr7:62911005-62911024	MsG0780039369.01.T01:CDS	50.0%
!!	AGGGTTTTGTCCGGGTGTAA+TGG	-	Chr7:62913124-62913143	MsG0780039369.01.T01:intron	50.0%
!!	GAGGGTATCATTCACTTGGG+TGG	-	Chr7:62911009-62911028	MsG0780039369.01.T01:CDS	50.0%
!!	GGGGAGGGTATCATTCACTT+GGG	-	Chr7:62911006-62911025	MsG0780039369.01.T01:CDS	50.0%
!!!	GTTTTTGGTGAAGGGAGGGA+AGG	-	Chr7:62913166-62913185	MsG0780039369.01.T01:intron	50.0%
	ATCGCAATATCGACGAGGGG+AGG	-	Chr7:62910990-62911009	MsG0780039369.01.T01:CDS	55.0%
	CCTTGGCAGTAAACTGCAGC+CGG	-	Chr7:62912117-62912136	MsG0780039369.01.T01:intron	55.0%
	TCACCCGCATATCGATCCAC+TGG	+	Chr7:62911087-62911106	None:intergenic	55.0%
	TCGCAATATCGACGAGGGGA+GGG	-	Chr7:62910991-62911010	MsG0780039369.01.T01:CDS	55.0%
!	GCGTCGAGGCTTTGGTTGTT+TGG	-	Chr7:62913084-62913103	MsG0780039369.01.T01:intron	55.0%
!	GGGAGCACAACATGTTCCAG+TGG	-	Chr7:62911068-62911087	MsG0780039369.01.T01:CDS	55.0%
	CCGGCTGCAGTTTACTGCCA+AGG	+	Chr7:62912120-62912139	None:intergenic	60.0%
	GCTTCCCAAACCTTGGCTCC+TGG	+	Chr7:62913767-62913786	None:intergenic	60.0%
	GGTGAAGGGAGGGAAGGGTA+AGG	-	Chr7:62913172-62913191	MsG0780039369.01.T01:intron	60.0%
!	AAGACGGTTTTGCCCCTCGG+CGG	+	Chr7:62912169-62912188	None:intergenic	60.0%
	CGGCAGTTAACTGCCGCCGA+GGG	-	Chr7:62912153-62912172	MsG0780039369.01.T01:intron	65.0%
	GGCAGTTAACTGCCGCCGAG+GGG	-	Chr7:62912154-62912173	MsG0780039369.01.T01:intron	65.0%
	TCGGCAGTTAACTGCCGCCG+AGG	-	Chr7:62912152-62912171	MsG0780039369.01.T01:intron	65.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
Chr7	gene	62910725	62913859	62910725	ID=MsG0780039369.01;Name=MsG0780039369.01
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Chr7	CDS	62910725	62911847	62910725	ID=MsG0780039369.01.T01:cds;Parent=MsG0780039369.01.T01

Gene Sequence

>MsG0780039369.01.T01

ATGATATTCAAGTGTCAAGGAATGGACCTCATTTCGTTGGCACTTGAATACCATCGTTCAAGATGCTCATCGAATGTTGGAGTCCTGCTGCTTAGCAAGTTTGAATTTGCCCCATTCAGTGGTAAGATAATTGTTGCAGTTGGAAGGTACATTCCGGAATGTAATGTAATTGTTGACATACATGTCGTTTATTTAATATTCTATGGTTTTAATGATAGGGTTCAAGATGCTGTTGATTTGTTTTTTAGAATTCCGAGGTTTAGATGCACACCAACTGTTTGTAGTTTGAATTTGTTGCTTTCATTGCTTTGTAGGAAGAGGGAGTGTTTGAAAATGGTTCCGGATATTTTGTTGAAAAGTCGGGATTTGAAGATTCGTCTTGAGGAATCGAGTTTTTGGGTTTTGATTAAGGCGTTGTGTAGGATTAAGAGAGTTGATTATGCTATTAAGATGATGAATTGTATGGTAGAAGATGGTTATGGTTTGGATGATAAGATATGTTCTTTGATAATATCGTCGTTGTTTGAGCAAAATGATTTGACTAGCGTCGAGGCTTTGGTTGTTTGGGGAAATATGAGGAAACTAGGGTTTTGTCCGGGTGTAATGGATTGTACCAATATGATTAGGTTTTTGGTGAAGGGAGGGAAGGGTAAGGATGCTTTGGAGATTTTGAATCAGCTTAAGGAAGATGGAATTAAGCCTGATATTGTTTGTTATACTATTGTTTTGAGTGGAATTGTTAAAGAAGGTGATTATGTGAAGTTAGATGAATTGTTTGATGAAATACTTGTATTAGGACTCGTTCCTGATGTTTATACTTATAATGTGTATATAAATGGTTTGTGTAAGCAGAATAATTTTGATGAGGCACTTAAGATTGTTGTTTCTATGGAAAAATTAGGATGCAAACCAAATGTGGTTACTTATAATACTTTATTAGGTGCATTGTGTATGAATGGAGATTTAGGTAAGGCAAAGAGGGTAATGAAGGAGATGAGGTTGAAGGGTGTTGAGCTAAACTTGCATACATATAGGATCATGCTTGATGGTTTGATTGGTAAAGGTGAGATTGGTGAAGCATGTGTTTTCTTGGAGGAAATGTTGGAGAAGTGTTTTTATCCTAGATCTTCAACATTTGATAGTATCGTACATCAAATGTGCCAAAAGGGTTTGATTAGTGATGCACTTGTGTTGATGAATAAAATTGCTGAAAAAAGTTTTGATCCAGGAGCCAAGGTTTGGGAAGCACTGCTTCTTAACTCAGAATCTAAGGTTGCCTATTCAGAAACCACATTTGTTGGATTGTTGAGGCTAAAATAA

Protein sequence

>MsG0780039369.01.T01

MIFKCQGMDLISLALEYHRSRCSSNVGVLLLSKFEFAPFSGKIIVAVGRYIPECNVIVDIHVVYLIFYGFNDRVQDAVDLFFRIPRFRCTPTVCSLNLLLSLLCRKRECLKMVPDILLKSRDLKIRLEESSFWVLIKALCRIKRVDYAIKMMNCMVEDGYGLDDKICSLIISSLFEQNDLTSVEALVVWGNMRKLGFCPGVMDCTNMIRFLVKGGKGKDALEILNQLKEDGIKPDIVCYTIVLSGIVKEGDYVKLDELFDEILVLGLVPDVYTYNVYINGLCKQNNFDEALKIVVSMEKLGCKPNVVTYNTLLGALCMNGDLGKAKRVMKEMRLKGVELNLHTYRIMLDGLIGKGEIGEACVFLEEMLEKCFYPRSSTFDSIVHQMCQKGLISDALVLMNKIAEKSFDPGAKVWEALLLNSESKVAYSETTFVGLLRLK*