AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780038491.01


Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g056393 95.174 373 18 0 1 373 1 373 0.0 711
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g119410 83.914 373 60 0 1 373 1 373 0.0 627
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g006930 79.625 373 76 0 1 373 1 373 0.0 604
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g056347 74.799 373 94 0 1 373 1 373 0.0 592
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g078010 76.408 373 88 0 1 373 1 373 0.0 576
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g093110 64.499 369 123 3 11 373 8 374 2.95e-177 498
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g063070 61.662 373 143 0 1 373 1 373 3.95e-177 497
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g024660 62.466 373 140 0 1 373 1 373 2.06e-176 495
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g062600 61.930 373 142 0 1 373 1 373 1.24e-175 493
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g093120 63.710 372 126 4 8 373 2 370 1.99e-175 493
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g093140 64.690 371 121 3 12 373 9 378 3.92e-175 492
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g469400 62.198 373 128 2 1 373 1 360 9.44e-171 480
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g078010 75.694 288 70 0 1 288 1 288 8.39e-156 440
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g069010 58.333 360 146 3 17 373 17 375 8.63e-154 438
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g069060 57.909 373 133 3 1 373 1 349 2.60e-152 433
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g068950 59.167 360 143 3 17 373 11 369 5.53e-152 433
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g069020 59.195 348 138 3 17 362 15 360 6.45e-152 433
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g069020 59.195 348 138 3 17 362 15 360 2.75e-151 432
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g068960 58.889 360 144 3 17 373 11 369 1.25e-150 430
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g041600 52.128 376 175 4 1 373 1 374 3.13e-146 419
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g041620 52.394 376 174 4 1 373 1 374 3.77e-146 419
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g009090 53.639 371 159 5 6 373 4 364 1.06e-140 404
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g069210 54.945 364 160 2 11 373 7 367 1.26e-140 404
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g028435 53.803 355 154 4 22 373 17 364 1.39e-140 404
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g009080 52.139 374 175 2 1 373 27 397 1.26e-139 403
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g069090 54.054 370 165 3 6 373 6 372 1.94e-138 399
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g009170 52.661 357 157 6 22 373 17 366 1.80e-137 396
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g009160 51.977 354 164 4 21 373 16 364 1.31e-136 394
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g069190 53.495 372 161 4 7 373 7 371 7.64e-136 392
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g008930 52.279 373 164 6 5 373 3 365 2.63e-135 390
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g009110 52.394 355 162 5 21 373 16 365 1.70e-133 386
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g056353 54.496 367 139 3 6 372 8 346 2.30e-133 391
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g069300 52.514 358 165 3 18 373 4 358 1.91e-132 383
MsG0780038491.01.T01 MTR_0032s0040 50.938 373 164 6 13 373 8 373 6.14e-132 382
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g043760 49.857 349 171 2 18 366 5 349 5.76e-127 369
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g029655 48.913 368 176 5 13 373 8 370 1.38e-125 366
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g117880 50.678 369 169 7 11 373 5 366 2.03e-125 365
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g070185 49.162 358 173 3 17 373 18 367 6.43e-124 362
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g043810 49.432 352 173 3 18 368 5 352 1.28e-123 360
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g043770 49.307 361 176 4 13 373 2 355 7.97e-123 358
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g043775 49.148 352 174 3 18 368 5 352 3.69e-118 347
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g009150 47.458 354 159 6 22 373 17 345 7.32e-115 338
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g009120 48.870 354 162 7 22 373 17 353 1.09e-114 338
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g041600 49.485 291 144 2 1 288 1 291 1.75e-107 318
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g105070 44.780 364 195 4 12 373 3 362 1.25e-106 318
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g009080 52.083 288 137 1 1 287 27 314 2.54e-104 310
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g009080 51.579 285 137 1 1 284 27 311 8.42e-102 305
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g009170 51.481 270 123 4 22 287 17 282 4.37e-100 298
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g069060 56.126 253 107 2 44 294 2 252 2.71e-99 295
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g043770 50.545 275 132 3 13 287 2 272 3.26e-93 281
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g043810 45.902 305 157 3 18 321 5 302 1.41e-92 280
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g032220 41.783 359 198 5 17 372 21 371 1.89e-90 276
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g032140 42.897 359 194 5 17 372 14 364 2.86e-90 276
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g043775 44.904 314 155 4 18 322 5 309 1.07e-88 270
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g032250 40.548 365 204 6 6 365 8 364 6.32e-86 265
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g056370 65.385 182 63 0 27 208 6 187 2.17e-84 256
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g009180 49.393 247 106 3 138 368 46 289 8.58e-79 244
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g092890 33.721 344 209 6 36 372 5 336 4.41e-60 197
MsG0780038491.01.T01 MTR_6g015950 39.677 310 165 9 60 361 32 327 5.28e-56 187
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g099380 56.098 164 65 2 19 180 124 282 6.07e-56 185
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g032870 35.526 304 179 5 66 360 37 332 1.73e-54 183
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g024120 31.831 355 217 6 31 373 2 343 1.97e-54 183
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g102820 33.333 369 206 12 32 373 25 380 6.02e-54 182
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g043840 50.000 172 85 1 183 353 52 223 9.59e-54 181
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g043840 36.735 98 56 3 58 150 232 328 6.18e-12 66.6
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g070085 34.177 316 186 5 66 372 36 338 2.89e-53 180
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g070085 34.177 316 186 5 66 372 36 338 2.89e-53 180
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g062110 33.053 357 215 9 32 373 26 373 7.39e-52 177
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g069070 49.444 180 73 1 1 180 1 162 1.87e-50 167
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g068840 30.899 356 207 8 32 368 21 356 7.15e-50 171
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g091350 32.958 355 212 12 12 354 2 342 1.25e-49 171
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g102720 32.622 328 195 7 51 369 21 331 1.41e-49 170
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g072910 27.299 348 238 7 32 373 16 354 8.48e-49 168
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g070135 32.803 314 192 8 66 372 37 338 9.23e-49 168
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g032880 35.000 300 182 3 66 358 375 668 1.82e-48 174
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g032880 33.993 303 179 5 66 361 37 325 1.83e-47 171
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g045230 33.141 347 210 8 32 369 17 350 1.08e-47 166
MsG0780038491.01.T01 MTR_0009s0050 28.977 352 225 10 32 373 12 348 1.57e-47 165
MsG0780038491.01.T01 MTR_0009s0050 28.977 352 225 10 32 373 12 348 1.73e-47 165
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g070120 32.692 312 193 6 66 371 37 337 2.04e-47 164
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g072890 27.726 321 217 7 59 373 44 355 2.58e-47 164
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g091360 33.962 318 193 10 44 354 28 335 3.92e-47 164
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g043900 33.621 348 206 10 32 369 17 349 9.29e-47 163
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g055680 30.000 350 222 9 33 373 13 348 1.86e-46 162
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g070080 31.498 327 201 6 56 373 27 339 2.32e-46 162
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g048570 29.107 347 221 10 32 369 12 342 2.80e-46 162
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g082750 32.857 350 217 9 33 372 14 355 3.25e-46 162
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g068650 29.315 365 229 8 23 369 5 358 5.40e-46 161
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g015790 30.000 360 222 8 33 369 14 366 5.53e-46 161
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g063180 29.462 353 227 9 33 373 10 352 1.83e-45 159
MsG0780038491.01.T01 MTR_0328s0030 29.885 348 227 8 32 373 10 346 4.04e-45 159
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g055820 29.014 355 222 9 32 373 12 349 5.68e-45 158
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g016090 31.529 314 188 8 58 361 30 326 8.33e-45 157
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g016090 31.529 314 188 8 58 361 32 328 8.55e-45 157
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g065010 31.034 348 226 10 32 373 3 342 9.43e-45 157
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g048850 30.086 349 217 11 32 369 12 344 1.21e-44 157
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g064200 27.635 351 232 9 32 373 17 354 6.57e-44 155
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g064200 27.635 351 232 9 32 373 22 359 8.51e-44 155
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g048740 29.310 348 220 10 33 369 11 343 1.16e-43 155
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g048550 28.653 349 230 8 32 373 12 348 1.25e-43 155
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g055900 28.612 353 225 11 32 373 12 348 5.41e-43 153
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g074050 34.084 311 184 10 61 361 46 345 6.60e-43 153
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g058610 35.938 256 155 4 67 315 39 292 8.49e-43 152
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g093840 31.731 312 201 7 67 373 62 366 1.11e-42 152
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g083030 29.316 307 196 5 54 353 18 310 1.29e-42 151
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g055690 29.462 353 223 12 32 373 12 349 2.63e-42 151
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g083370 32.895 304 171 12 66 357 3 285 3.15e-42 150
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g034120 30.330 333 190 9 49 355 14 330 3.30e-42 151
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g034140 31.392 309 179 7 67 356 27 321 4.41e-42 150
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g074070 32.716 324 192 10 61 373 46 354 4.47e-42 150
MsG0780038491.01.T01 MTR_0009s0480 28.779 344 226 8 33 369 12 343 7.69e-42 150
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g070085 32.472 271 163 4 111 372 1 260 1.14e-41 147
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g083000 29.730 296 182 4 64 353 30 305 1.59e-41 148
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g070860 31.481 324 205 8 58 372 41 356 1.96e-41 149
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g033810 29.022 317 208 8 59 368 39 345 2.34e-41 149
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g048470 27.479 353 231 11 32 373 17 355 2.36e-41 149
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g081710 31.412 347 219 8 35 373 16 351 2.39e-41 149
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g034060 30.030 333 191 9 49 355 14 330 4.17e-41 148
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g025120 31.475 305 176 11 66 357 3 287 7.09e-41 146
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g055800 27.586 348 234 8 32 373 12 347 9.09e-41 147
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g075890 34.241 257 158 5 67 315 39 292 9.47e-41 147
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g117420 31.090 312 192 8 61 361 46 345 1.22e-40 147
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g116010 32.107 299 185 7 56 348 39 325 1.38e-40 147
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g062110 32.404 287 169 8 32 303 26 302 1.65e-40 145
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g087110 29.305 331 196 8 49 356 14 329 2.16e-40 146
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g068800 32.056 287 153 8 32 304 21 279 4.51e-40 143
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g087090 30.968 310 179 9 66 353 29 325 4.96e-40 145
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g088565 30.921 304 185 11 65 357 1 290 7.30e-40 144
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g044105 42.262 168 90 3 18 179 5 171 8.49e-40 139
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g087120 29.003 331 197 8 49 356 14 329 1.29e-39 144
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g437380 27.879 330 220 8 54 373 35 356 2.27e-39 144
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g062570 27.684 354 228 11 32 373 19 356 2.37e-39 144
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g070100 32.819 259 154 4 123 372 9 256 2.56e-39 141
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g074070 32.595 316 184 9 61 373 46 335 6.07e-39 142
MsG0780038491.01.T01 MTR_6g464620 30.573 314 188 6 64 358 61 363 1.82e-38 142
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g022020 32.862 283 175 4 67 339 39 316 2.20e-38 141
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g085330 30.476 315 174 10 65 359 3 292 2.34e-38 140
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g062580 29.508 305 194 9 67 363 55 346 3.47e-38 140
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g102570 29.945 364 186 14 41 370 25 353 4.20e-38 140
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g087100 30.699 329 190 8 49 354 14 327 4.55e-38 140
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g087140 29.841 315 186 8 67 356 26 330 6.28e-38 139
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g063730 28.896 308 200 9 66 366 63 358 8.67e-38 139
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g075830 33.846 260 155 7 67 315 39 292 2.23e-37 138
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g016080 29.836 305 187 8 63 361 37 320 2.63e-37 137
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g081840 30.745 322 186 11 61 359 47 354 4.13e-37 138
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g451860 31.864 295 174 8 67 353 41 316 6.86e-37 136
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g047670 31.864 295 174 8 67 353 41 316 6.86e-37 136
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g026150 29.102 323 205 10 60 373 53 360 4.99e-36 135
MsG0780038491.01.T01 MTR_0009s0050 31.646 237 144 7 147 373 22 250 3.03e-35 130
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g048940 28.613 346 224 11 38 373 18 350 4.31e-35 132
MsG0780038491.01.T01 MTR_6g092620 31.061 264 158 9 65 316 1 252 4.80e-35 130
MsG0780038491.01.T01 MTR_0009s0050 31.646 237 144 7 147 373 22 250 4.84e-35 129
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g059130 29.042 334 196 11 40 354 16 327 5.16e-35 131
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g011250 27.326 344 219 9 33 356 8 340 5.57e-35 132
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g102070 29.508 305 182 7 64 349 56 346 1.16e-34 131
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g070135 32.314 229 144 5 66 288 37 260 1.66e-34 129
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g005570 30.769 312 192 7 47 353 17 309 2.19e-34 129
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g096500 28.986 345 214 10 44 369 45 377 2.20e-34 130
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g099390 68.235 85 26 1 289 373 1 84 2.80e-34 122
MsG0780038491.01.T01 MTR_0009s0050 37.584 149 86 3 226 373 26 168 1.49e-33 123
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g062560 27.184 309 206 7 67 373 62 353 4.36e-33 127
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g033380 29.043 303 185 6 64 349 51 340 1.37e-32 125
MsG0780038491.01.T01 MTR_0056s0160 30.631 222 143 5 157 373 18 233 1.81e-32 122
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g437380 28.517 263 166 6 127 373 6 262 6.73e-32 121
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g045650 31.076 251 158 8 58 300 51 294 6.99e-32 122
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g087130 28.754 313 190 7 67 356 26 328 1.00e-31 123
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g072820 26.791 321 210 8 44 353 18 324 1.55e-31 122
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g062600 27.476 313 197 12 67 366 51 346 1.87e-31 122
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g059140 28.527 319 201 10 38 343 12 316 1.93e-31 122
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g117485 28.896 308 196 8 61 357 43 338 2.11e-31 122
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g048850 31.111 270 165 10 32 290 12 271 2.23e-31 120
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g062550 26.748 329 192 11 67 373 60 361 3.21e-31 122
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g074130 29.831 295 179 9 67 353 40 314 5.65e-31 120
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g088745 30.094 319 183 11 64 358 33 335 1.14e-30 120
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g026150 32.159 227 140 6 153 373 39 257 2.12e-30 117
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g072910 27.820 266 183 6 32 291 16 278 3.32e-30 117
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g032240 35.885 209 101 3 165 372 1 177 5.09e-30 114
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g093930 26.571 350 214 9 29 354 7 337 8.21e-30 118
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g055690 30.147 272 170 10 32 292 12 274 2.88e-29 114
MsG0780038491.01.T01 MTR_0009s0480 27.863 262 180 5 32 288 11 268 3.14e-29 114
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g084360 49.701 167 37 2 181 346 10 130 3.31e-29 110
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g040410 30.000 260 160 7 67 315 6 254 3.61e-29 115
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g083370 31.489 235 135 9 66 288 3 223 4.83e-29 112
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g011580 29.154 319 170 12 67 364 63 346 6.10e-29 115
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g072810 27.697 343 199 10 33 353 6 321 6.69e-29 115
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g093980 27.044 318 192 8 60 356 52 350 4.89e-28 113
MsG0780038491.01.T01 MTR_0009s0400 36.242 149 88 3 226 373 2 144 8.23e-28 107
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g025120 29.787 235 139 8 66 288 3 223 1.95e-27 108
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g117485 29.368 269 168 7 99 357 10 266 4.15e-27 108
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g025050 28.431 306 197 11 67 368 5 292 4.72e-27 109
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g027230 31.864 295 173 16 66 353 5 278 5.88e-27 108
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g025090 27.885 312 203 10 66 373 4 297 5.95e-27 108
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g070110 28.413 271 150 7 108 372 1 233 1.56e-26 106
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g132770 44.248 113 56 3 228 339 32 138 2.87e-26 103
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g025060 28.339 307 175 14 66 369 5 269 5.50e-26 105
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g027290 27.385 325 211 10 63 373 25 338 1.25e-25 106
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g026150 31.092 238 147 8 60 288 53 282 5.69e-25 103
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g030880 28.521 284 187 5 66 333 4 287 7.11e-25 103
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g464530 29.210 291 170 10 58 332 25 295 7.70e-25 103
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g019370 26.235 324 201 11 67 372 28 331 1.24e-24 103
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g123020 27.329 322 196 10 67 372 20 319 2.60e-24 102
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g086550 27.729 339 191 13 65 373 18 332 5.47e-24 101
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g115990 30.544 239 140 7 120 348 82 304 2.93e-23 99.4
MsG0780038491.01.T01 MTR_6g088665 28.446 341 182 15 57 358 9 326 7.04e-23 98.6
MsG0780038491.01.T01 MTR_6g088665 28.529 340 182 15 57 358 9 325 7.30e-23 98.6
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g033270 29.368 269 152 10 65 315 17 265 9.92e-23 97.8
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g461330 26.235 324 189 11 67 365 27 325 1.55e-22 97.4
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g070870 26.814 317 189 13 66 365 27 317 2.60e-22 96.7
MsG0780038491.01.T01 MTR_5g024940 26.498 317 174 12 66 369 5 275 6.96e-22 94.7
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g102600 26.032 315 196 10 70 360 15 316 9.73e-22 95.1
MsG0780038491.01.T01 MTR_7g077670 29.605 304 193 10 59 354 3 293 1.03e-21 94.7
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g008960 50.667 75 34 1 299 373 31 102 2.39e-20 85.5
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g464530 27.126 247 145 9 58 288 25 252 1.77e-17 81.6
MsG0780038491.01.T01 MTR_8g102600 27.805 205 127 6 170 360 69 266 4.20e-17 80.9
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g011720 28.177 181 122 4 181 360 126 299 1.50e-16 80.1
MsG0780038491.01.T01 MTR_2g069130 49.474 95 42 2 71 163 12 102 3.09e-16 75.1
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g027310 23.988 321 185 11 63 373 45 316 1.65e-15 77.0
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g096840 23.676 321 199 12 67 365 29 325 2.21e-15 76.6
MsG0780038491.01.T01 MTR_1g032230 33.793 145 72 3 12 154 10 132 3.02e-15 75.5
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g100590 25.566 309 186 15 70 354 7 295 5.42e-15 75.5
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g040440 48.438 64 33 0 238 301 15 78 1.17e-14 73.6
MsG0780038491.01.T01 MTR_3g108520 22.393 326 199 11 63 359 3 303 2.20e-14 73.6
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g011690 27.072 181 123 5 182 360 127 300 4.78e-14 72.8
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g100590 29.310 174 104 8 189 354 86 248 2.41e-11 63.9
MsG0780038491.01.T01 MTR_4g021380 22.364 313 218 11 62 359 2 304 7.50e-11 63.2
Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0780038491.01.T01 AT1G06620 54.085 355 159 2 15 368 9 360 2.61e-140 403
MsG0780038491.01.T01 AT5G59540 52.486 362 163 5 17 373 9 366 2.85e-136 393
MsG0780038491.01.T01 AT2G30840 54.795 365 154 6 15 373 3 362 3.93e-134 387
MsG0780038491.01.T01 AT5G59530 50.556 360 172 4 17 373 8 364 9.51e-133 384
MsG0780038491.01.T01 AT1G06650 51.648 364 165 6 17 373 10 369 2.15e-132 384
MsG0780038491.01.T01 AT2G30830 53.611 360 158 5 17 373 5 358 1.19e-131 381
MsG0780038491.01.T01 AT2G30840 53.973 365 151 7 15 373 3 356 2.12e-128 373
MsG0780038491.01.T01 AT1G06640 49.462 372 175 6 11 373 2 369 4.95e-126 367
MsG0780038491.01.T01 AT1G04350 49.030 361 174 5 17 373 6 360 1.49e-124 363
MsG0780038491.01.T01 AT2G25450 50.278 360 173 4 16 373 4 359 1.62e-124 363
MsG0780038491.01.T01 AT5G43450 49.435 354 171 3 18 368 9 357 5.74e-123 359
MsG0780038491.01.T01 AT1G06645 47.230 379 187 6 2 373 7 379 8.49e-123 359
MsG0780038491.01.T01 AT5G43440 48.889 360 175 5 19 373 10 365 1.39e-122 358
MsG0780038491.01.T01 AT1G03410 48.680 341 167 4 18 353 5 342 4.53e-119 349
MsG0780038491.01.T01 AT1G03410 47.851 349 174 4 10 353 34 379 1.02e-118 350
MsG0780038491.01.T01 AT1G04380 47.977 346 170 4 28 373 10 345 4.95e-117 343
MsG0780038491.01.T01 AT3G61400 44.715 369 192 6 9 368 1 366 6.03e-115 339
MsG0780038491.01.T01 AT1G03400 46.286 350 174 4 18 364 5 343 1.14e-114 338
MsG0780038491.01.T01 AT1G03400 42.857 378 174 5 18 364 5 371 4.28e-108 322
MsG0780038491.01.T01 AT1G06620 53.650 274 126 1 15 287 9 282 1.61e-107 317
MsG0780038491.01.T01 AT2G30840 51.701 294 132 3 15 298 3 296 1.80e-101 302
MsG0780038491.01.T01 AT1G06650 51.799 278 127 4 17 288 10 286 2.37e-100 300
MsG0780038491.01.T01 AT5G59540 50.181 277 132 4 17 288 9 284 1.29e-98 294
MsG0780038491.01.T01 AT1G06640 48.123 293 143 4 11 295 2 293 1.52e-95 288
MsG0780038491.01.T01 AT1G06640 48.951 286 137 4 11 288 2 286 1.01e-94 285
MsG0780038491.01.T01 AT5G43450 47.500 280 142 2 18 294 9 286 2.83e-94 283
MsG0780038491.01.T01 AT5G43440 48.029 279 139 4 19 292 10 287 1.96e-93 281
MsG0780038491.01.T01 AT3G61400 43.750 288 154 4 9 288 1 288 1.33e-87 266
MsG0780038491.01.T01 AT1G04380 45.247 263 137 3 28 290 10 265 2.79e-81 249
MsG0780038491.01.T01 AT5G24530 35.821 335 192 5 41 371 23 338 1.14e-64 209
MsG0780038491.01.T01 AT4G10490 34.936 312 190 4 66 372 41 344 5.95e-63 205
MsG0780038491.01.T01 AT4G10500 35.048 311 190 4 66 372 43 345 9.35e-60 197
MsG0780038491.01.T01 AT3G13610 31.953 338 214 7 32 364 26 352 1.33e-55 186
MsG0780038491.01.T01 AT2G36690 33.989 356 213 8 30 373 18 363 3.46e-55 186
MsG0780038491.01.T01 AT2G36690 33.989 356 213 8 30 373 18 363 3.46e-55 186
MsG0780038491.01.T01 AT1G55290 33.913 345 199 10 32 364 25 352 3.18e-54 183
MsG0780038491.01.T01 AT3G12900 29.912 341 227 5 32 369 21 352 3.18e-50 172
MsG0780038491.01.T01 AT5G05600 32.133 361 227 9 19 369 13 365 3.34e-49 170
MsG0780038491.01.T01 AT4G25310 30.564 337 215 9 44 373 29 353 1.50e-45 160
MsG0780038491.01.T01 AT3G11180 31.728 353 211 9 33 369 56 394 1.55e-44 158
MsG0780038491.01.T01 AT3G11180 32.047 337 199 9 33 353 56 378 3.98e-43 155
MsG0780038491.01.T01 AT2G44800 30.769 364 230 11 19 372 2 353 8.74e-43 152
MsG0780038491.01.T01 AT4G25300 29.651 344 225 10 38 373 22 356 9.59e-43 152
MsG0780038491.01.T01 AT1G17020 29.275 345 226 10 38 373 23 358 1.49e-42 152
MsG0780038491.01.T01 AT2G38240 29.651 344 221 9 33 366 12 344 1.61e-42 152
MsG0780038491.01.T01 AT4G16330 31.212 330 193 11 52 369 53 360 1.72e-42 152
MsG0780038491.01.T01 AT1G78550 29.217 332 196 10 61 373 45 356 1.74e-42 152
MsG0780038491.01.T01 AT1G77330 32.609 276 166 8 65 329 1 267 8.59e-42 149
MsG0780038491.01.T01 AT3G19000 31.818 308 180 7 67 354 32 329 1.78e-40 146
MsG0780038491.01.T01 AT3G55970 31.304 345 212 10 33 361 14 349 9.56e-40 145
MsG0780038491.01.T01 AT4G21200 31.000 300 172 9 64 353 39 313 4.48e-39 142
MsG0780038491.01.T01 AT3G51240 33.969 262 152 7 67 315 38 291 5.30e-39 142
MsG0780038491.01.T01 AT5G12270 30.894 369 220 13 22 373 9 359 7.30e-39 142
MsG0780038491.01.T01 AT3G19010 30.341 323 184 12 58 355 19 325 8.88e-39 142
MsG0780038491.01.T01 AT3G19010 30.341 323 184 12 58 355 19 325 8.88e-39 142
MsG0780038491.01.T01 AT3G60290 29.834 362 236 9 19 372 2 353 4.34e-38 140
MsG0780038491.01.T01 AT1G17010 27.937 315 209 8 67 373 54 358 4.38e-38 140
MsG0780038491.01.T01 AT1G62380 30.916 262 165 8 62 316 2 254 5.78e-38 139
MsG0780038491.01.T01 AT1G78550 28.328 293 174 8 98 373 5 278 2.49e-37 136
MsG0780038491.01.T01 AT4G22880 29.155 343 215 10 33 356 7 340 2.86e-37 138
MsG0780038491.01.T01 AT4G22880 29.155 343 215 10 33 356 7 340 2.86e-37 138
MsG0780038491.01.T01 AT4G22880 29.155 343 215 10 33 356 7 340 2.86e-37 138
MsG0780038491.01.T01 AT1G12010 31.179 263 157 8 65 316 5 254 4.58e-37 136
MsG0780038491.01.T01 AT4G25420 28.205 351 211 6 40 359 21 361 4.83e-37 138
MsG0780038491.01.T01 AT5G07480 31.000 300 186 7 67 354 44 334 5.42e-37 137
MsG0780038491.01.T01 AT5G08640 31.438 299 179 8 66 353 42 325 1.70e-36 135
MsG0780038491.01.T01 AT5G08640 31.438 299 179 8 66 353 42 325 1.70e-36 135
MsG0780038491.01.T01 AT3G21420 28.490 351 228 9 33 369 17 358 3.63e-36 135
MsG0780038491.01.T01 AT5G05600 31.900 279 180 7 19 288 13 290 3.39e-35 130
MsG0780038491.01.T01 AT1G05010 32.432 259 158 9 66 316 3 252 4.48e-35 131
MsG0780038491.01.T01 AT5G20400 29.032 341 220 9 33 361 9 339 1.06e-33 128
MsG0780038491.01.T01 AT4G16330 33.333 222 126 6 156 369 47 254 1.07e-33 126
MsG0780038491.01.T01 AT1G15550 29.938 324 170 14 66 362 56 349 1.48e-32 125
MsG0780038491.01.T01 AT1G50960 30.258 271 182 5 50 317 23 289 4.33e-32 124
MsG0780038491.01.T01 AT2G19590 30.418 263 164 10 62 316 6 257 2.88e-31 120
MsG0780038491.01.T01 AT5G20550 29.642 307 197 9 65 361 43 340 6.90e-31 120
MsG0780038491.01.T01 AT3G19010 27.273 319 169 11 58 355 19 295 7.89e-31 120
MsG0780038491.01.T01 AT4G25300 33.673 196 122 4 180 373 73 262 9.75e-31 118
MsG0780038491.01.T01 AT5G63590 29.618 314 172 9 63 353 10 297 1.70e-30 119
MsG0780038491.01.T01 AT4G25310 26.786 336 201 9 44 373 29 325 2.53e-30 119
MsG0780038491.01.T01 AT5G07200 28.297 364 221 10 21 359 14 362 3.31e-30 119
MsG0780038491.01.T01 AT3G51240 36.872 179 94 6 150 315 35 207 8.90e-30 116
MsG0780038491.01.T01 AT3G55970 31.734 271 168 8 33 288 14 282 2.17e-29 115
MsG0780038491.01.T01 AT1G80340 29.524 315 180 9 59 355 42 332 5.63e-29 115
MsG0780038491.01.T01 AT5G51810 27.653 311 199 5 64 359 60 359 5.69e-29 116
MsG0780038491.01.T01 AT3G19000 29.046 241 149 5 67 288 32 269 1.20e-28 113
MsG0780038491.01.T01 AT1G49390 28.431 306 203 7 64 361 42 339 1.36e-28 114
MsG0780038491.01.T01 AT4G25420 27.941 272 165 4 40 284 21 288 2.24e-28 112
MsG0780038491.01.T01 AT1G60980 27.302 315 198 7 65 359 55 358 7.53e-28 113
MsG0780038491.01.T01 AT1G30040 27.070 314 190 10 66 362 30 321 9.38e-28 112
MsG0780038491.01.T01 AT5G54000 29.642 307 198 9 64 361 43 340 1.60e-27 111
MsG0780038491.01.T01 AT1G80330 27.778 324 197 11 66 370 48 353 2.78e-27 110
MsG0780038491.01.T01 AT3G19010 29.572 257 146 10 58 289 19 265 2.14e-26 107
MsG0780038491.01.T01 AT5G63600 27.451 306 195 11 57 353 22 309 3.80e-26 107
MsG0780038491.01.T01 AT1G78440 26.625 323 187 12 67 365 18 314 3.48e-25 104
MsG0780038491.01.T01 AT5G63600 28.296 311 187 12 57 353 22 310 4.26e-25 104
MsG0780038491.01.T01 AT5G07480 34.043 188 110 5 174 354 45 225 6.61e-25 102
MsG0780038491.01.T01 AT5G63595 28.244 262 154 7 57 311 15 249 1.04e-24 102
MsG0780038491.01.T01 AT2G19590 30.973 226 139 9 99 316 26 242 1.34e-24 102
MsG0780038491.01.T01 AT5G51810 28.033 239 156 3 64 291 60 293 3.46e-24 101
MsG0780038491.01.T01 AT1G44090 27.679 336 185 13 44 349 43 350 1.44e-23 101
MsG0780038491.01.T01 AT4G21690 27.389 314 172 13 89 372 61 348 2.29e-23 100
MsG0780038491.01.T01 AT1G49390 28.090 267 166 9 114 361 1 260 4.85e-23 97.4
MsG0780038491.01.T01 AT5G54000 29.368 269 172 9 102 361 1 260 1.89e-22 95.9
MsG0780038491.01.T01 AT4G23340 27.687 307 187 11 63 354 6 292 3.11e-21 93.6
MsG0780038491.01.T01 AT5G58660 27.972 286 159 12 65 317 32 303 1.17e-20 92.4
MsG0780038491.01.T01 AT1G47990 27.083 336 182 13 67 372 15 317 2.74e-20 90.9
MsG0780038491.01.T01 AT1G02400 27.301 326 200 13 56 363 13 319 3.64e-20 90.5
MsG0780038491.01.T01 AT2G34555 27.445 317 182 12 67 362 27 316 1.06e-19 89.4
MsG0780038491.01.T01 AT5G43935 27.365 296 174 12 67 353 19 282 2.15e-19 87.8
MsG0780038491.01.T01 AT1G14130 26.190 294 183 11 67 349 9 279 2.40e-19 87.8
MsG0780038491.01.T01 AT4G23340 34.667 150 88 4 209 354 31 174 1.68e-18 83.6
MsG0780038491.01.T01 AT1G30040 25.833 240 145 8 66 288 30 253 3.48e-18 84.0
MsG0780038491.01.T01 AT3G46490 27.052 329 203 9 57 358 2 320 6.95e-18 84.0
MsG0780038491.01.T01 AT1G14120 28.094 299 171 14 67 349 8 278 2.19e-17 82.4
MsG0780038491.01.T01 AT1G14120 28.094 299 171 14 67 349 8 278 2.19e-17 82.4
MsG0780038491.01.T01 AT1G14120 28.094 299 171 14 67 349 8 278 2.19e-17 82.4
MsG0780038491.01.T01 AT1G52820 30.387 181 118 3 182 361 130 303 3.71e-17 81.6
MsG0780038491.01.T01 AT3G47190 24.806 258 152 8 67 301 32 270 1.18e-16 80.5
MsG0780038491.01.T01 AT2G06960 37.594 133 63 5 228 360 33 145 1.18e-16 76.6
MsG0780038491.01.T01 AT3G46490 27.609 297 180 9 57 322 2 294 1.77e-16 79.7
MsG0780038491.01.T01 AT3G46500 25.697 323 208 8 57 358 2 313 3.11e-16 79.3
MsG0780038491.01.T01 AT5G63580 27.706 231 151 6 66 288 18 240 2.74e-15 75.1
MsG0780038491.01.T01 AT5G63580 28.194 227 147 6 66 284 18 236 3.17e-15 75.1
MsG0780038491.01.T01 AT5G58660 26.848 257 141 12 65 288 32 274 3.56e-15 75.5
MsG0780038491.01.T01 AT3G49620 25.166 302 199 7 43 321 14 311 1.21e-14 74.7
MsG0780038491.01.T01 AT4G03070 30.168 179 112 4 186 358 133 304 5.84e-14 72.4
MsG0780038491.01.T01 AT3G46500 31.868 182 109 5 185 358 3 177 1.24e-13 69.3
MsG0780038491.01.T01 AT4G16765 28.713 202 127 6 172 359 47 245 1.42e-13 70.5
MsG0780038491.01.T01 AT4G16765 28.713 202 127 6 172 359 47 245 1.42e-13 70.5
MsG0780038491.01.T01 AT4G16765 28.713 202 127 6 172 359 47 245 1.42e-13 70.5
MsG0780038491.01.T01 AT3G46500 31.868 182 109 5 185 358 65 239 2.79e-13 69.7
MsG0780038491.01.T01 AT3G46500 31.868 182 109 5 185 358 65 239 2.79e-13 69.7
MsG0780038491.01.T01 AT4G16765 28.191 188 114 6 172 345 47 227 1.89e-12 67.0
MsG0780038491.01.T01 AT3G46480 35.433 127 70 3 239 360 156 275 4.29e-12 66.6
MsG0780038491.01.T01 AT4G16765 32.812 128 78 3 237 359 75 199 8.96e-12 64.3
MsG0780038491.01.T01 AT1G35190 26.962 293 176 9 57 321 2 284 2.21e-11 64.7
MsG0780038491.01.T01 AT3G50210 35.484 93 58 2 233 323 118 210 8.82e-11 62.0

Find 92 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 166 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ACTTGGTCATATTGGATTAT+TGG 0.189907 7:+47642501 None:intergenic
GTCAAAGGTTTGGTGGAGTC+TGG 0.222236 7:+47642823 MsG0780038491.01.T01:CDS
AAGTTCTTCATGAGGATAAA+TGG 0.250135 7:+47644227 MsG0780038491.01.T01:CDS
CCCTGAACCTGAATTAACTA+TGG 0.268558 7:+47644138 MsG0780038491.01.T01:CDS
AAAGGTTTATGGTCCTATTA+AGG 0.275771 7:+47644788 MsG0780038491.01.T01:CDS
GAAGGTACATCAAAGGTTTA+TGG 0.290841 7:+47644777 MsG0780038491.01.T01:CDS
CATATGGATGGTAGTTCATT+TGG 0.297189 7:-47643240 None:intergenic
CCCATAGTTAATTCAGGTTC+AGG 0.297523 7:-47644139 None:intergenic
TCTGAAAGGAGCTCCTTAAT+AGG 0.307082 7:-47644801 None:intergenic
GGAATTGAATTAAAGAGAAT+TGG 0.312739 7:-47642647 None:intergenic
AAGCTTGCTACCGAAATTCT+TGG 0.320171 7:-47644729 None:intergenic
CCTAGATGGAAACTCTTTCT+TGG 0.320238 7:+47644890 MsG0780038491.01.T01:CDS
TTAGTGGCCAAGCTGCTAAT+TGG 0.324449 7:+47643175 MsG0780038491.01.T01:CDS
CACAACAATTCAACTCTTTG+AGG 0.325281 7:-47644078 None:intergenic
TTTGCCTTTAACGTAAAATC+TGG 0.327849 7:-47642668 None:intergenic
TGTTTGTTTCCCTCTCAATA+TGG 0.343333 7:+47642708 MsG0780038491.01.T01:exon
TTATTTATATAGATAGATTA+TGG 0.344847 7:-47644970 None:intergenic
AAACATTGGCCCAAGAATTT+CGG 0.349346 7:+47644719 MsG0780038491.01.T01:CDS
GGTAGTTCATTTGGTTTGAA+TGG 0.352643 7:-47643231 None:intergenic
GCGGTGCCCATAGTTAATTC+AGG 0.357522 7:-47644145 None:intergenic
TCAAAGGTTTGGTGGAGTCT+GGG 0.361579 7:+47642824 MsG0780038491.01.T01:CDS
TCCAATGGAACCTTGTTTAG+TGG 0.367156 7:+47643159 MsG0780038491.01.T01:CDS
TATTATGCAAAAGGCCTAGA+TGG 0.373788 7:+47644876 MsG0780038491.01.T01:CDS
GAAGCTACTATCAGTATGTT+TGG 0.373995 7:-47644167 None:intergenic
ATGGTAATGTCTTTGTAGAT+TGG 0.378270 7:-47644834 None:intergenic
ACCTTTGATGTACCTTCAAT+TGG 0.399600 7:-47644771 None:intergenic
GGCAGAACATTAAAATAGAA+TGG 0.404263 7:-47642620 None:intergenic
TGTGAAGGACTCTTTATTCA+AGG 0.426667 7:+47644097 MsG0780038491.01.T01:CDS
TTTGCACATTATTATGCAAA+AGG 0.427901 7:+47644867 MsG0780038491.01.T01:CDS
TGATATTCCCATTGATGTCT+TGG 0.433144 7:+47643038 MsG0780038491.01.T01:CDS
AGCTTGCTACCGAAATTCTT+GGG 0.447441 7:-47644728 None:intergenic
ATTTCATCCAAGACATCAAT+GGG 0.461977 7:-47643045 None:intergenic
CATAATCTTTGAGTTATTGT+CGG 0.462657 7:+47644030 MsG0780038491.01.T01:CDS
GTCTTGGATGAAATGATTCA+TGG 0.464116 7:+47643054 MsG0780038491.01.T01:CDS
CATTTCATCCAAGACATCAA+TGG 0.465403 7:-47643046 None:intergenic
ATGTTGAATTCACAACTTGA+AGG 0.473909 7:-47644916 None:intergenic
TAATTAGGACTACCTGCATA+TGG 0.474925 7:-47643256 None:intergenic
TGCAGCTTATCTCAAATGAC+AGG 0.482185 7:+47644664 MsG0780038491.01.T01:intron
TCATTTGGTTTGAATGGATG+AGG 0.483777 7:-47643225 None:intergenic
GCCACTAAACAAGGTTCCAT+TGG 0.486760 7:-47643160 None:intergenic
CCAAGAAAGAGTTTCCATCT+AGG 0.487963 7:-47644890 None:intergenic
GTAATGTCTTTGTAGATTGG+AGG 0.488313 7:-47644831 None:intergenic
GCTAATTGGAGAGATACAAT+TGG 0.490360 7:+47643189 MsG0780038491.01.T01:CDS
AAAGTTATGTATTTCTCCAA+TGG 0.490517 7:+47643144 MsG0780038491.01.T01:CDS
GAGTTATTGTCGGAGGCACT+AGG 0.492714 7:+47644040 MsG0780038491.01.T01:CDS
GCAGAACATTAAAATAGAAT+GGG 0.499997 7:-47642619 None:intergenic
AAAAGCGGGTGTCAAAGGTT+TGG 0.504940 7:+47642813 MsG0780038491.01.T01:CDS
CCATAGTTAATTCAGGTTCA+GGG 0.505790 7:-47644138 None:intergenic
AATTCTCATGAACCAATTGA+AGG 0.506027 7:+47644759 MsG0780038491.01.T01:CDS
TATATCTTTGAGATCTATGA+TGG 0.506672 7:-47642929 None:intergenic
GATTCAAAAGCGGGTGTCAA+AGG 0.507740 7:+47642808 MsG0780038491.01.T01:CDS
GGCAAAAGACAGTGCTACTC+AGG 0.516065 7:+47642685 MsG0780038491.01.T01:five_prime_UTR
TTATTGGTTGCGTGCAGAAA+AGG 0.519103 7:+47642517 MsG0780038491.01.T01:five_prime_UTR
TCCTATACATGGAGCTCTTG+TGG 0.520084 7:+47644261 MsG0780038491.01.T01:CDS
TCTATCATAAGTGGAATTGG+TGG 0.523018 7:-47642761 None:intergenic
ATCAATGTTCCTCCTATACA+TGG 0.523389 7:+47644250 MsG0780038491.01.T01:CDS
TATCTCTCCAATTAGCAGCT+TGG 0.523678 7:-47643182 None:intergenic
AGCAGCTTGGCCACTAAACA+AGG 0.524987 7:-47643169 None:intergenic
TAATGTCTTTGTAGATTGGA+GGG 0.537461 7:-47644830 None:intergenic
CATCTTGTTCATGAAAACTA+CGG 0.539165 7:-47643080 None:intergenic
AGCGGGTGTCAAAGGTTTGG+TGG 0.539761 7:+47642816 MsG0780038491.01.T01:CDS
GTTAATTCAGGTTCAGGGCA+TGG 0.544520 7:-47644133 None:intergenic
CAAAGGTTTGGTGGAGTCTG+GGG 0.546548 7:+47642825 MsG0780038491.01.T01:CDS
TTGTTTCCCTCTCAATATGG+TGG 0.548488 7:+47642711 MsG0780038491.01.T01:exon
ATGAACTACCATCCATATGC+AGG 0.551179 7:+47643244 MsG0780038491.01.T01:CDS
ACCACAAGAGCTCCATGTAT+AGG 0.554318 7:-47644262 None:intergenic
TGTTGAATTCACAACTTGAA+GGG 0.564135 7:-47644915 None:intergenic
AAAGAGTTGAATTGTTGTGA+AGG 0.564849 7:+47644082 MsG0780038491.01.T01:CDS
AATTCAAAGTGCATGTCATG+TGG 0.565388 7:+47642990 MsG0780038491.01.T01:CDS
CCTGAACCTGAATTAACTAT+GGG 0.568541 7:+47644139 MsG0780038491.01.T01:CDS
ACCAATTGAAGGTACATCAA+AGG 0.570655 7:+47644770 MsG0780038491.01.T01:CDS
CTTCTACAAGATCAACTTGG+TGG 0.583500 7:+47644199 MsG0780038491.01.T01:CDS
AAACGTAGGAGATCTTCTAC+AGG 0.589430 7:+47644285 MsG0780038491.01.T01:CDS
AATCTTTGAGTTATTGTCGG+AGG 0.598747 7:+47644033 MsG0780038491.01.T01:CDS
CGATCAAGCTCGGCGCGTAG+AGG 0.602691 7:+47642957 MsG0780038491.01.T01:CDS
CATACTAGCAAGTTGGACAT+CGG 0.603580 7:+47642871 MsG0780038491.01.T01:CDS
GCTACTATCAGTATGTTTGG+CGG 0.610036 7:-47644164 None:intergenic
TGGTCTTCAAGTTCTTCATG+AGG 0.614016 7:+47644219 MsG0780038491.01.T01:CDS
TAGGACTACCTGCATATGGA+TGG 0.614260 7:-47643252 None:intergenic
ACAAGAGCTCCATGTATAGG+AGG 0.615446 7:-47644259 None:intergenic
CATATAGAGTCTGCTTAACA+CGG 0.617414 7:-47645006 None:intergenic
ATTCAAAGTGCATGTCATGT+GGG 0.618809 7:+47642991 MsG0780038491.01.T01:CDS
ATATACACATCGATCAAGCT+CGG 0.631334 7:+47642947 MsG0780038491.01.T01:CDS
TTACTTCTACAAGATCAACT+TGG 0.634996 7:+47644196 MsG0780038491.01.T01:CDS
CGAGTCTTATCACAAAACAT+TGG 0.635353 7:+47644705 MsG0780038491.01.T01:CDS
TTTGAATGGATGAGGAGCAA+CGG 0.642538 7:-47643217 None:intergenic
ATATCTTTGAGATCTATGAT+GGG 0.645832 7:-47642928 None:intergenic
CAAAGTGCATGTCATGTGGG+AGG 0.657705 7:+47642994 MsG0780038491.01.T01:CDS
GGAGCTCTTGTGGTAAACGT+AGG 0.667919 7:+47644271 MsG0780038491.01.T01:CDS
AATTCAGGTTCAGGGCATGG+TGG 0.681896 7:-47644130 None:intergenic
GAATTAAAGAGAATTGGACA+TGG 0.700282 7:-47642641 None:intergenic
TAGAGAAGATCAATCCAACG+AGG 0.800030 7:-47642596 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAATATTCCAAAAAAATAA+GGG + Chr7:47643997-47644016 MsG0780038491.01.T01:CDS 10.0%
!! TAAAATATTCCAAAAAAATA+AGG + Chr7:47643996-47644015 MsG0780038491.01.T01:CDS 10.0%
!! TTATTTATATAGATAGATTA+TGG - Chr7:47644973-47644992 None:intergenic 10.0%
!! AAAAACTCAATATAAATTGA+TGG - Chr7:47643291-47643310 None:intergenic 15.0%
!! AAAACTCAATATAAATTGAT+GGG - Chr7:47643290-47643309 None:intergenic 15.0%
!! ATAAAATATTCCAAAAGATA+AGG + Chr7:47643928-47643947 MsG0780038491.01.T01:intron 15.0%
!! TAAAATATTCCAAAAGATAA+GGG + Chr7:47643929-47643948 MsG0780038491.01.T01:intron 15.0%
!!! ATCAGTTATATTTTTTGTAA+GGG - Chr7:47644468-47644487 None:intergenic 15.0%
!!! TTATTGACATTTTCTAATAA+TGG + Chr7:47645069-47645088 MsG0780038491.01.T01:three_prime_UTR 15.0%
!! AAAAAACACAAATCAATTAG+AGG + Chr7:47642735-47642754 MsG0780038491.01.T01:CDS 20.0%
!! AGTAATATACTAATATGCAA+TGG - Chr7:47644522-47644541 None:intergenic 20.0%
!! CATTAAAACAGTAATAGATA+TGG + Chr7:47643673-47643692 MsG0780038491.01.T01:intron 20.0%
!! CATTCAATAAATAATGTATG+TGG + Chr7:47643800-47643819 MsG0780038491.01.T01:intron 20.0%
!! TAACATCTATAAGAACTTTA+TGG + Chr7:47643707-47643726 MsG0780038491.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTTTCTAATAATGGTATGT+TGG + Chr7:47645077-47645096 MsG0780038491.01.T01:three_prime_UTR 20.0%
!!! GATCAGTTATATTTTTTGTA+AGG - Chr7:47644469-47644488 None:intergenic 20.0%
!!! TGAATTTATGCATAATCTTT+TGG + Chr7:47644347-47644366 MsG0780038491.01.T01:intron 20.0%
! AAAGTTATGTATTTCTCCAA+TGG + Chr7:47643144-47643163 MsG0780038491.01.T01:CDS 25.0%
! AATTATAATTGTCCTCAAGA+CGG + Chr7:47644413-47644432 MsG0780038491.01.T01:intron 25.0%
! ATTATAGTGAACTGCAATTA+TGG + Chr7:47644553-47644572 MsG0780038491.01.T01:intron 25.0%
! GAATGAAAATAGCAAGAAAA+CGG - Chr7:47644378-47644397 None:intergenic 25.0%
! GACATGATATATAGTTGAAA+TGG - Chr7:47643877-47643896 None:intergenic 25.0%
! GCAGAACATTAAAATAGAAT+GGG - Chr7:47642622-47642641 None:intergenic 25.0%
! GGAATTGAATTAAAGAGAAT+TGG - Chr7:47642650-47642669 None:intergenic 25.0%
! TCCAAAAAAATAAGGGATTT+GGG + Chr7:47644004-47644023 MsG0780038491.01.T01:CDS 25.0%
! TTATAGTGAACTGCAATTAT+GGG + Chr7:47644554-47644573 MsG0780038491.01.T01:intron 25.0%
! TTCAAATTATACTCGTAGTT+AGG - Chr7:47643586-47643605 None:intergenic 25.0%
! TTCCAAAAAAATAAGGGATT+TGG + Chr7:47644003-47644022 MsG0780038491.01.T01:CDS 25.0%
! TTGACTTAAACAATGACAAA+GGG - Chr7:47644322-47644341 None:intergenic 25.0%
! TTTGCACATTATTATGCAAA+AGG + Chr7:47644867-47644886 MsG0780038491.01.T01:CDS 25.0%
!! AATTCCAGATTTTACGTTAA+AGG + Chr7:47642664-47642683 MsG0780038491.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
!! ATGTGCAAAGAAATCTTTTA+TGG - Chr7:47644856-47644875 None:intergenic 25.0%
!! ATTGACTTAAACAATGACAA+AGG - Chr7:47644323-47644342 None:intergenic 25.0%
!! CATAATCTTTGAGTTATTGT+CGG + Chr7:47644030-47644049 MsG0780038491.01.T01:CDS 25.0%
!! CATTTGAAATATTCCCAAAA+GGG + Chr7:47643897-47643916 MsG0780038491.01.T01:intron 25.0%
!! TTCAGTTTTTCTATCATAAG+TGG - Chr7:47642773-47642792 None:intergenic 25.0%
!! TTTTCTATCATAAGTGGAAT+TGG - Chr7:47642767-47642786 None:intergenic 25.0%
!! TTTTTGCTTATATTTGTGAC+CGG - Chr7:47643765-47643784 None:intergenic 25.0%
!!! AGTTTTTGTTGTAGTTTTAG+AGG + Chr7:47643304-47643323 MsG0780038491.01.T01:intron 25.0%
!!! ATATCTTTGAGATCTATGAT+GGG - Chr7:47642931-47642950 None:intergenic 25.0%
!!! TATATCTTTGAGATCTATGA+TGG - Chr7:47642932-47642951 None:intergenic 25.0%
AAAGAGTTGAATTGTTGTGA+AGG + Chr7:47644082-47644101 MsG0780038491.01.T01:CDS 30.0%
AAAGGTTTATGGTCCTATTA+AGG + Chr7:47644788-47644807 MsG0780038491.01.T01:CDS 30.0%
AAGTTCTTCATGAGGATAAA+TGG + Chr7:47644227-47644246 MsG0780038491.01.T01:CDS 30.0%
AATTCTCATGAACCAATTGA+AGG + Chr7:47644759-47644778 MsG0780038491.01.T01:CDS 30.0%
ATGTTGAATTCACAACTTGA+AGG - Chr7:47644919-47644938 None:intergenic 30.0%
ATTCCAAAAGATAAGGGATT+TGG + Chr7:47643935-47643954 MsG0780038491.01.T01:intron 30.0%
ATTTCATCCAAGACATCAAT+GGG - Chr7:47643048-47643067 None:intergenic 30.0%
CATCTTGTTCATGAAAACTA+CGG - Chr7:47643083-47643102 None:intergenic 30.0%
GAATTAAAGAGAATTGGACA+TGG - Chr7:47642644-47642663 None:intergenic 30.0%
GGCAGAACATTAAAATAGAA+TGG - Chr7:47642623-47642642 None:intergenic 30.0%
TAACATTGTTGAAGGGAATA+TGG - Chr7:47644439-47644458 None:intergenic 30.0%
TAATGTCTTTGTAGATTGGA+GGG - Chr7:47644833-47644852 None:intergenic 30.0%
TGTTGAATTCACAACTTGAA+GGG - Chr7:47644918-47644937 None:intergenic 30.0%
TTACTTCTACAAGATCAACT+TGG + Chr7:47644196-47644215 MsG0780038491.01.T01:CDS 30.0%
TTCCAAAAGATAAGGGATTT+GGG + Chr7:47643936-47643955 MsG0780038491.01.T01:intron 30.0%
TTTGCCTTTAACGTAAAATC+TGG - Chr7:47642671-47642690 None:intergenic 30.0%
! ATGGTAATGTCTTTGTAGAT+TGG - Chr7:47644837-47644856 None:intergenic 30.0%
! CAATGTTTTGTGATAAGACT+CGG - Chr7:47644707-47644726 None:intergenic 30.0%
! CATTTTTCATACTAGCAAGT+TGG + Chr7:47642864-47642883 MsG0780038491.01.T01:CDS 30.0%
! CCATTTGAAATATTCCCAAA+AGG + Chr7:47643896-47643915 MsG0780038491.01.T01:intron 30.0%
! GTCTTGTTAACATTGTTGAA+GGG - Chr7:47644446-47644465 None:intergenic 30.0%
! TCTTATAGATGTTACTTCCT+CGG - Chr7:47643701-47643720 None:intergenic 30.0%
! TTTATCACACTATCCCTTTT+GGG - Chr7:47643913-47643932 None:intergenic 30.0%
! TTTTATCACACTATCCCTTT+TGG - Chr7:47643914-47643933 None:intergenic 30.0%
! TTTTTACCACCATATTGAGA+GGG - Chr7:47642720-47642739 None:intergenic 30.0%
!! AGCTTTTGATGATTCAAAAG+CGG + Chr7:47642798-47642817 MsG0780038491.01.T01:CDS 30.0%
!! CCTTTTGGGAATATTTCAAA+TGG - Chr7:47643899-47643918 None:intergenic 30.0%
!!! ACCCAAATCCCTTATTTTTT+TGG - Chr7:47644008-47644027 None:intergenic 30.0%
!!! GTAGTTTTAGAGGTTGATTT+AGG + Chr7:47643314-47643333 MsG0780038491.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTTTACCACCATATTGAG+AGG - Chr7:47642721-47642740 None:intergenic 30.0%
AAACATTGGCCCAAGAATTT+CGG + Chr7:47644719-47644738 MsG0780038491.01.T01:CDS 35.0%
AATTCAAAGTGCATGTCATG+TGG + Chr7:47642990-47643009 MsG0780038491.01.T01:CDS 35.0%
ACCTTTGATGTACCTTCAAT+TGG - Chr7:47644774-47644793 None:intergenic 35.0%
ATATACACATCGATCAAGCT+CGG + Chr7:47642947-47642966 MsG0780038491.01.T01:CDS 35.0%
ATCAATGTTCCTCCTATACA+TGG + Chr7:47644250-47644269 MsG0780038491.01.T01:CDS 35.0%
ATTCAAAGTGCATGTCATGT+GGG + Chr7:47642991-47643010 MsG0780038491.01.T01:CDS 35.0%
CACAACAATTCAACTCTTTG+AGG - Chr7:47644081-47644100 None:intergenic 35.0%
CATATAGAGTCTGCTTAACA+CGG - Chr7:47645009-47645028 None:intergenic 35.0%
CATATGGATGGTAGTTCATT+TGG - Chr7:47643243-47643262 None:intergenic 35.0%
CATTTCATCCAAGACATCAA+TGG - Chr7:47643049-47643068 None:intergenic 35.0%
CCTGAACCTGAATTAACTAT+GGG + Chr7:47644139-47644158 MsG0780038491.01.T01:CDS 35.0%
GAAGCTACTATCAGTATGTT+TGG - Chr7:47644170-47644189 None:intergenic 35.0%
GCTAATTGGAGAGATACAAT+TGG + Chr7:47643189-47643208 MsG0780038491.01.T01:CDS 35.0%
GTAATGTCTTTGTAGATTGG+AGG - Chr7:47644834-47644853 None:intergenic 35.0%
GTCTTGGATGAAATGATTCA+TGG + Chr7:47643054-47643073 MsG0780038491.01.T01:CDS 35.0%
TAATTAGGACTACCTGCATA+TGG - Chr7:47643259-47643278 None:intergenic 35.0%
TATTATGCAAAAGGCCTAGA+TGG + Chr7:47644876-47644895 MsG0780038491.01.T01:CDS 35.0%
TCGCGAAACATTCGTAATAA+TGG + Chr7:47643487-47643506 MsG0780038491.01.T01:intron 35.0%
TCTATCATAAGTGGAATTGG+TGG - Chr7:47642764-47642783 None:intergenic 35.0%
TGATATTCCCATTGATGTCT+TGG + Chr7:47643038-47643057 MsG0780038491.01.T01:CDS 35.0%
TGCTAGTATGAAAAATGCGT+GGG - Chr7:47642861-47642880 None:intergenic 35.0%
TGTGAAGGACTCTTTATTCA+AGG + Chr7:47644097-47644116 MsG0780038491.01.T01:CDS 35.0%
TGTTTGTTTCCCTCTCAATA+TGG + Chr7:47642708-47642727 MsG0780038491.01.T01:exon 35.0%
TTGCTAGTATGAAAAATGCG+TGG - Chr7:47642862-47642881 None:intergenic 35.0%
! AACCCAAATCCCTTATCTTT+TGG - Chr7:47643941-47643960 None:intergenic 35.0%
! AATCTTTGAGTTATTGTCGG+AGG + Chr7:47644033-47644052 MsG0780038491.01.T01:CDS 35.0%
! ACCAATTGAAGGTACATCAA+AGG + Chr7:47644770-47644789 MsG0780038491.01.T01:CDS 35.0%
! CCATAGTTAATTCAGGTTCA+GGG - Chr7:47644141-47644160 None:intergenic 35.0%
! CGAGTCTTATCACAAAACAT+TGG + Chr7:47644705-47644724 MsG0780038491.01.T01:CDS 35.0%
! CGCAAATGGCAAATTTTCAT+TGG + Chr7:47643452-47643471 MsG0780038491.01.T01:intron 35.0%
! GAAGGTACATCAAAGGTTTA+TGG + Chr7:47644777-47644796 MsG0780038491.01.T01:CDS 35.0%
! TGATGGGCAAGAACATAATT+AGG - Chr7:47643274-47643293 None:intergenic 35.0%
! TTGTGATTTTTACACCTCGT+TGG + Chr7:47642582-47642601 MsG0780038491.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
! TTTGCCATTTGCGTAATACA+AGG - Chr7:47643445-47643464 None:intergenic 35.0%
!! GAACAAGCTTTTGATTCTCA+TGG + Chr7:47644941-47644960 MsG0780038491.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
!! GCTTTTGATGATTCAAAAGC+GGG + Chr7:47642799-47642818 MsG0780038491.01.T01:CDS 35.0%
!! GGTAGTTCATTTGGTTTGAA+TGG - Chr7:47643234-47643253 None:intergenic 35.0%
!! GGTCTTGTTAACATTGTTGA+AGG - Chr7:47644447-47644466 None:intergenic 35.0%
!! TCATTTGGTTTGAATGGATG+AGG - Chr7:47643228-47643247 None:intergenic 35.0%
AAACGTAGGAGATCTTCTAC+AGG + Chr7:47644285-47644304 MsG0780038491.01.T01:CDS 40.0%
ATGAACTACCATCCATATGC+AGG + Chr7:47643244-47643263 MsG0780038491.01.T01:CDS 40.0%
CACTCCTTGTATTACGCAAA+TGG + Chr7:47643438-47643457 MsG0780038491.01.T01:intron 40.0%
CAGTAATAGATATGGAACCG+AGG + Chr7:47643681-47643700 MsG0780038491.01.T01:intron 40.0%
CATTTGCGTAATACAAGGAG+TGG - Chr7:47643440-47643459 None:intergenic 40.0%
CCAAGAAAGAGTTTCCATCT+AGG - Chr7:47644893-47644912 None:intergenic 40.0%
CCCTGAACCTGAATTAACTA+TGG + Chr7:47644138-47644157 MsG0780038491.01.T01:CDS 40.0%
CCTAGATGGAAACTCTTTCT+TGG + Chr7:47644890-47644909 MsG0780038491.01.T01:CDS 40.0%
CTTCTACAAGATCAACTTGG+TGG + Chr7:47644199-47644218 MsG0780038491.01.T01:CDS 40.0%
GCTACTATCAGTATGTTTGG+CGG - Chr7:47644167-47644186 None:intergenic 40.0%
TAGAGAAGATCAATCCAACG+AGG - Chr7:47642599-47642618 None:intergenic 40.0%
TATCTCTCCAATTAGCAGCT+TGG - Chr7:47643185-47643204 None:intergenic 40.0%
TCAATAAGTGCCACATGTGT+CGG - Chr7:47643382-47643401 None:intergenic 40.0%
TCTGAAAGGAGCTCCTTAAT+AGG - Chr7:47644804-47644823 None:intergenic 40.0%
TGCAGCTTATCTCAAATGAC+AGG + Chr7:47644664-47644683 MsG0780038491.01.T01:intron 40.0%
TGCTTATATTTGTGACCGGA+CGG - Chr7:47643761-47643780 None:intergenic 40.0%
TTGTTTCCCTCTCAATATGG+TGG + Chr7:47642711-47642730 MsG0780038491.01.T01:exon 40.0%
TTTGAATGGATGAGGAGCAA+CGG - Chr7:47643220-47643239 None:intergenic 40.0%
! CATACTAGCAAGTTGGACAT+CGG + Chr7:47642871-47642890 MsG0780038491.01.T01:CDS 40.0%
! CCCATAGTTAATTCAGGTTC+AGG - Chr7:47644142-47644161 None:intergenic 40.0%
! TCCAATGGAACCTTGTTTAG+TGG + Chr7:47643159-47643178 MsG0780038491.01.T01:CDS 40.0%
! TGGTCTTCAAGTTCTTCATG+AGG + Chr7:47644219-47644238 MsG0780038491.01.T01:CDS 40.0%
! TTATTGGTTGCGTGCAGAAA+AGG + Chr7:47642517-47642536 MsG0780038491.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
! TTGGAGGGTTTTCTTCTGAA+AGG - Chr7:47644818-47644837 None:intergenic 40.0%
!! AAGCTTGCTACCGAAATTCT+TGG - Chr7:47644732-47644751 None:intergenic 40.0%
!! AGCTTGCTACCGAAATTCTT+GGG - Chr7:47644731-47644750 None:intergenic 40.0%
!!! TCATGTGGGAGGATTTTTTC+AGG + Chr7:47643005-47643024 MsG0780038491.01.T01:CDS 40.0%
AAAAGCGGGTGTCAAAGGTT+TGG + Chr7:47642813-47642832 MsG0780038491.01.T01:CDS 45.0%
ACAAGAGCTCCATGTATAGG+AGG - Chr7:47644262-47644281 None:intergenic 45.0%
ACATGTGTCGGGTAATGCTT+GGG - Chr7:47643370-47643389 None:intergenic 45.0%
ACCACAAGAGCTCCATGTAT+AGG - Chr7:47644265-47644284 None:intergenic 45.0%
CAATAAGTGCCACATGTGTC+GGG - Chr7:47643381-47643400 None:intergenic 45.0%
CACTTATGACATACACCGTC+CGG + Chr7:47643743-47643762 MsG0780038491.01.T01:intron 45.0%
GATTCAAAAGCGGGTGTCAA+AGG + Chr7:47642808-47642827 MsG0780038491.01.T01:CDS 45.0%
GCCACTAAACAAGGTTCCAT+TGG - Chr7:47643163-47643182 None:intergenic 45.0%
TAGGACTACCTGCATATGGA+TGG - Chr7:47643255-47643274 None:intergenic 45.0%
TCCTATACATGGAGCTCTTG+TGG + Chr7:47644261-47644280 MsG0780038491.01.T01:CDS 45.0%
TTAGTGGCCAAGCTGCTAAT+TGG + Chr7:47643175-47643194 MsG0780038491.01.T01:CDS 45.0%
TTGCGTAATACAAGGAGTGG+TGG - Chr7:47643437-47643456 None:intergenic 45.0%
! GTTAATTCAGGTTCAGGGCA+TGG - Chr7:47644136-47644155 None:intergenic 45.0%
! TGTGGCACTTATTGACTGCA+TGG + Chr7:47643387-47643406 MsG0780038491.01.T01:intron 45.0%
!! TCAAAGGTTTGGTGGAGTCT+GGG + Chr7:47642824-47642843 MsG0780038491.01.T01:CDS 45.0%
AAGGGAATATGGCCGTCTTG+AGG - Chr7:47644428-47644447 None:intergenic 50.0%
AGCAGCTTGGCCACTAAACA+AGG - Chr7:47643172-47643191 None:intergenic 50.0%
CAAAGTGCATGTCATGTGGG+AGG + Chr7:47642994-47643013 MsG0780038491.01.T01:CDS 50.0%
CAAGCATTACCCGACACATG+TGG + Chr7:47643369-47643388 MsG0780038491.01.T01:intron 50.0%
CACATGTGTCGGGTAATGCT+TGG - Chr7:47643371-47643390 None:intergenic 50.0%
GCGGTGCCCATAGTTAATTC+AGG - Chr7:47644148-47644167 None:intergenic 50.0%
GGAGCTCTTGTGGTAAACGT+AGG + Chr7:47644271-47644290 MsG0780038491.01.T01:CDS 50.0%
! AATTCAGGTTCAGGGCATGG+TGG - Chr7:47644133-47644152 None:intergenic 50.0%
! GGCAAAAGACAGTGCTACTC+AGG + Chr7:47642685-47642704 MsG0780038491.01.T01:five_prime_UTR 50.0%
!! CAAAGGTTTGGTGGAGTCTG+GGG + Chr7:47642825-47642844 MsG0780038491.01.T01:CDS 50.0%
!! GAGTTATTGTCGGAGGCACT+AGG + Chr7:47644040-47644059 MsG0780038491.01.T01:CDS 50.0%
!! GTCAAAGGTTTGGTGGAGTC+TGG + Chr7:47642823-47642842 MsG0780038491.01.T01:CDS 50.0%
AGCGGGTGTCAAAGGTTTGG+TGG + Chr7:47642816-47642835 MsG0780038491.01.T01:CDS 55.0%
CGATCAAGCTCGGCGCGTAG+AGG + Chr7:47642957-47642976 MsG0780038491.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 47642511 47645114 47642511 ID=MsG0780038491.01;Name=MsG0780038491.01
Chr7 mRNA 47642511 47645114 47642511 ID=MsG0780038491.01.T01;Parent=MsG0780038491.01;Name=MsG0780038491.01.T01;_AED=0.22;_eAED=0.22;_QI=216|1|1|1|1|1|3|185|373
Chr7 exon 47642511 47643265 47642511 ID=MsG0780038491.01.T01:exon:4970;Parent=MsG0780038491.01.T01
Chr7 exon 47643985 47644306 47643985 ID=MsG0780038491.01.T01:exon:4971;Parent=MsG0780038491.01.T01
Chr7 exon 47644669 47645114 47644669 ID=MsG0780038491.01.T01:exon:4972;Parent=MsG0780038491.01.T01
Chr7 five_prime_UTR 47642511 47642726 47642511 ID=MsG0780038491.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0780038491.01.T01
Chr7 CDS 47642727 47643265 47642727 ID=MsG0780038491.01.T01:cds;Parent=MsG0780038491.01.T01
Chr7 CDS 47643985 47644306 47643985 ID=MsG0780038491.01.T01:cds;Parent=MsG0780038491.01.T01
Chr7 CDS 47644669 47644929 47644669 ID=MsG0780038491.01.T01:cds;Parent=MsG0780038491.01.T01
Chr7 three_prime_UTR 47644930 47645114 47644930 ID=MsG0780038491.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0780038491.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780038491.01.T01

ATGGTGGTAAAAAACACAAATCAATTAGAGGAATCCACCAATTCCACTTATGATAGAAAAACTGAAGTGAAAGCTTTTGATGATTCAAAAGCGGGTGTCAAAGGTTTGGTGGAGTCTGGGGTGTCAAAGATCCCACGCATTTTTCATACTAGCAAGTTGGACATCGGTGAAAACTCAACTAGTGATTCTAAGATGAGTATTCCCATCATAGATCTCAAAGATATACACATCGATCAAGCTCGGCGCGTAGAGGTAATTGATCAAATTCAAAGTGCATGTCATGTGGGAGGATTTTTTCAGGTAATAAATCATGATATTCCCATTGATGTCTTGGATGAAATGATTCATGGAATCCGTAGTTTTCATGAACAAGATGTTGATGTAAGAAAAGAGTTTTACACTCGTGATTTAAAGAAAAAAGTTATGTATTTCTCCAATGGAACCTTGTTTAGTGGCCAAGCTGCTAATTGGAGAGATACAATTGGTTTTGCCGTTGCTCCTCATCCATTCAAACCAAATGAACTACCATCCATATGCAGAGATAGTGTGATAAAATATTCCAAAAAAATAAGGGATTTGGGTTTCATAATCTTTGAGTTATTGTCGGAGGCACTAGGACTTGATCGTGATTACCTCAAAGAGTTGAATTGTTGTGAAGGACTCTTTATTCAAGGTCATTACTATCCACCATGCCCTGAACCTGAATTAACTATGGGCACCGCCAAACATACTGATAGTAGCTTCATAACATTACTTCTACAAGATCAACTTGGTGGTCTTCAAGTTCTTCATGAGGATAAATGGATCAATGTTCCTCCTATACATGGAGCTCTTGTGGTAAACGTAGGAGATCTTCTACAGCTTATCTCAAATGACAGGTTTGTAAGTGTTTATCACCGAGTCTTATCACAAAACATTGGCCCAAGAATTTCGGTAGCAAGCTTCTTTGTGAATTCTCATGAACCAATTGAAGGTACATCAAAGGTTTATGGTCCTATTAAGGAGCTCCTTTCAGAAGAAAACCCTCCAATCTACAAAGACATTACCATAAAAGATTTCTTTGCACATTATTATGCAAAAGGCCTAGATGGAAACTCTTTCTTGGAGCCCTTCAAGTTGTGA

Protein sequence

>MsG0780038491.01.T01

MVVKNTNQLEESTNSTYDRKTEVKAFDDSKAGVKGLVESGVSKIPRIFHTSKLDIGENSTSDSKMSIPIIDLKDIHIDQARRVEVIDQIQSACHVGGFFQVINHDIPIDVLDEMIHGIRSFHEQDVDVRKEFYTRDLKKKVMYFSNGTLFSGQAANWRDTIGFAVAPHPFKPNELPSICRDSVIKYSKKIRDLGFIIFELLSEALGLDRDYLKELNCCEGLFIQGHYYPPCPEPELTMGTAKHTDSSFITLLLQDQLGGLQVLHEDKWINVPPIHGALVVNVGDLLQLISNDRFVSVYHRVLSQNIGPRISVASFFVNSHEPIEGTSKVYGPIKELLSEENPPIYKDITIKDFFAHYYAKGLDGNSFLEPFKL*