AlfalfaGEDB | MsG0880042062.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880042062.01

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MsG0880042062.01.T01	AT1G59620	26.562	512	341	15	156	647	16	512	2.02e-38	152
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Find 121 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 148 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region
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ATCCACTTCATTGTCGTCAT+TGG	0.373125	8:-3283709	None:intergenic
AAAGACAGCTCTTGCTCAAC+TGG	0.377671	8:+3282657	MsG0880042062.01.T01:CDS
CTTTGATGCTGTTTCTATGT+TGG	0.379217	8:+3283641	MsG0880042062.01.T01:CDS
GCTCTTTATATCCTAAGGAT+TGG	0.390120	8:+3283331	MsG0880042062.01.T01:CDS
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TTCAAGTGTCTCGTCTTTGA+AGG	0.399582	8:-3284003	None:intergenic
GTTTCTGTGGTTGCTATTGT+TGG	0.410681	8:+3282619	MsG0880042062.01.T01:CDS
ATTGTTGGTATTGGTGGTTT+GGG	0.411748	8:+3282634	MsG0880042062.01.T01:CDS
TGCGAAGTAAAAGGGAAGAA+AGG	0.421661	8:+3283184	MsG0880042062.01.T01:CDS
AACCAAACTCTTGAATCAAT+TGG	0.423008	8:+3283099	MsG0880042062.01.T01:CDS
TCTTGTTTGTTTACTGACAT+TGG	0.428372	8:+3283896	MsG0880042062.01.T01:CDS
CTTGTTTCTCTTCAGCATCA+AGG	0.429709	8:-3282198	None:intergenic
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TTGAAGATATGATACGCAAA+AGG	0.433124	8:+3282305	MsG0880042062.01.T01:CDS
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ATCAAGGAGGACAACTTTGA+TGG	0.436069	8:-3282182	None:intergenic
TTGTTACTTTGATTCAAGTA+AGG	0.436970	8:+3283578	MsG0880042062.01.T01:CDS
TTTCTTGACTGTTCAGTTGA+AGG	0.439598	8:+3283399	MsG0880042062.01.T01:CDS
TTTGTTGAGGCGACAAGTTA+TGG	0.447312	8:-3283290	None:intergenic
ATGGCTGAACAAATTCCATT+TGG	0.448931	8:+3281914	MsG0880042062.01.T01:CDS
TTATTGCTCTTTATATCCTA+AGG	0.454246	8:+3283326	MsG0880042062.01.T01:CDS
ATTTGTTTGAAAAGCATATG+TGG	0.454688	8:+3282704	MsG0880042062.01.T01:CDS
GATCTTGCAACACGGGTATC+GGG	0.455631	8:+3283546	MsG0880042062.01.T01:CDS
GCGAAGTAAAAGGGAAGAAA+GGG	0.464520	8:+3283185	MsG0880042062.01.T01:CDS
GTTGCTATTGTTGGTATTGG+TGG	0.469810	8:+3282628	MsG0880042062.01.T01:CDS
GATAAAGTCACCTGTTAAAG+AGG	0.470174	8:-3281949	None:intergenic
GTTTAACTCCAAAAGAATCA+TGG	0.470429	8:+3283031	MsG0880042062.01.T01:CDS
TTCTTGACTGTTCAGTTGAA+GGG	0.482335	8:+3283400	MsG0880042062.01.T01:CDS
TTCCTAAATTCCCAATCCTT+AGG	0.485739	8:-3283342	None:intergenic
TTTAACTCCAAAAGAATCAT+GGG	0.486870	8:+3283032	MsG0880042062.01.T01:CDS
GTGTTAGAATCAGATATCAT+TGG	0.490008	8:+3282535	MsG0880042062.01.T01:CDS
AGCAGCTCTGCTTAGAGATA+AGG	0.491956	8:-3282368	None:intergenic
TTTGTTTGAAAAGCATATGT+GGG	0.493351	8:+3282705	MsG0880042062.01.T01:CDS
ATACTTACGCGTCTTGCGGC+TGG	0.497165	8:+3283764	MsG0880042062.01.T01:CDS
AGGCTTTCAGCAATACCAAA+TGG	0.497878	8:-3281929	None:intergenic
CTTACGCGTCTTGCGGCTGG+TGG	0.498900	8:+3283767	MsG0880042062.01.T01:CDS
TTTACGATACCTCCCACCAT+TGG	0.508931	8:+3284078	MsG0880042062.01.T01:CDS
ACCTTTCGGGATGATGCCGT+TGG	0.509716	8:+3283072	MsG0880042062.01.T01:CDS
TCATCTATCAAATCATCTGC+AGG	0.511123	8:-3282274	None:intergenic
TTGAGAAAACTAATGATGTA+AGG	0.516437	8:+3282494	MsG0880042062.01.T01:CDS
AGAAAACTAATGATGTAAGG+AGG	0.524133	8:+3282497	MsG0880042062.01.T01:CDS
TCAAATACTTACGCGTCTTG+CGG	0.527897	8:+3283760	MsG0880042062.01.T01:CDS
TTTCTCAACCACCACAACAT+TGG	0.531235	8:-3282479	None:intergenic
TGGAATCATTGGATTCAAGT+AGG	0.533878	8:+3283661	MsG0880042062.01.T01:CDS
AACTTGCAAAATAAGCTTCG+TGG	0.538091	8:+3282823	MsG0880042062.01.T01:CDS
AGTTGATGACATGTTATCGT+TGG	0.538383	8:+3282798	MsG0880042062.01.T01:CDS
CATTGGATTCAAGTAGGTTG+CGG	0.538681	8:+3283667	MsG0880042062.01.T01:CDS
AACTTAAGTGACTTAAGGAA+TGG	0.540789	8:-3284109	None:intergenic
AAGAGTTTGGTTCACTCCAA+CGG	0.540879	8:-3283088	None:intergenic
GAAAACTAATGATGTAAGGA+GGG	0.543940	8:+3282498	MsG0880042062.01.T01:CDS
ATTGCATGATCTTGCAACAC+GGG	0.549101	8:+3283539	MsG0880042062.01.T01:CDS
TGAAGATATGATACGCAAAA+GGG	0.550820	8:+3282306	MsG0880042062.01.T01:CDS
TTCAAGATTATATTTGTGAG+TGG	0.551952	8:-3284032	None:intergenic
GCTCAACTGGTATACAATGA+TGG	0.556795	8:+3282670	MsG0880042062.01.T01:CDS
AGGCATATTGCGAAGTAAAA+GGG	0.558841	8:+3283176	MsG0880042062.01.T01:CDS
TTCCAATGACGACAATGAAG+TGG	0.560680	8:+3283707	MsG0880042062.01.T01:CDS
AACTATTCTGAAGAACATGT+TGG	0.561889	8:+3282756	MsG0880042062.01.T01:CDS
GAAAGAACTAGGTGGCTAAG+AGG	0.564008	8:-3283792	None:intergenic
GTGTGGTGCTCAAGGCAGTA+AGG	0.565399	8:+3282936	MsG0880042062.01.T01:CDS
CTTATCTTGTCAGAGTGTGA+TGG	0.569585	8:+3283843	MsG0880042062.01.T01:CDS
GCAAAACATTGCCTTTGTTG+AGG	0.573325	8:-3283303	None:intergenic
TGAAAATCAACAAGTTTCTG+TGG	0.576885	8:+3282606	MsG0880042062.01.T01:CDS
TATTTGATGTGTGGTGCTCA+AGG	0.577403	8:+3282928	MsG0880042062.01.T01:CDS
AATGGAAGACGTTCCAATGG+TGG	0.578145	8:-3284091	None:intergenic
AAGTCCACTAAAACATGCAC+AGG	0.584003	8:-3283621	None:intergenic
TGAGTTAATTCAAATGTGGA+TGG	0.588262	8:+3283368	MsG0880042062.01.T01:CDS
TAAGGATTGGGAATTTAGGA+AGG	0.589798	8:+3283344	MsG0880042062.01.T01:CDS
AGGATGAGTTAATTCAAATG+TGG	0.590157	8:+3283364	MsG0880042062.01.T01:CDS
TTACGCGTCTTGCGGCTGGT+GGG	0.594025	8:+3283768	MsG0880042062.01.T01:CDS
TTCAGTTGAAGGGAAATGCA+TGG	0.594832	8:+3283410	MsG0880042062.01.T01:CDS
AGAAGATTATAAGCTTGTTG+AGG	0.597102	8:+3282575	MsG0880042062.01.T01:CDS
ATGGAAGACGTTCCAATGGT+GGG	0.599970	8:-3284090	None:intergenic
TGGACGAATTTATGGCGTGA+TGG	0.601420	8:+3282126	MsG0880042062.01.T01:CDS
AAGATAGCAGAAAAGTGCAA+AGG	0.602878	8:+3283126	MsG0880042062.01.T01:CDS
GGAAGATGTTGGTAATCACT+TGG	0.605249	8:+3283431	MsG0880042062.01.T01:CDS
GAATCTTAACTCCAATGTTG+TGG	0.605601	8:+3282468	MsG0880042062.01.T01:CDS
GTAAAAGGGAAGAAAGGGAG+TGG	0.608570	8:+3283190	MsG0880042062.01.T01:CDS
AATTCGTCCAAATTCACGAA+AGG	0.612190	8:-3282113	None:intergenic
ATAACTTGTCGCCTCAACAA+AGG	0.612727	8:+3283292	MsG0880042062.01.T01:CDS
GGGAAATGCATGGAAGATGT+TGG	0.615926	8:+3283420	MsG0880042062.01.T01:CDS
ACAACGCAGTTAGAGAAGAT+CGG	0.620899	8:-3281873	None:intergenic
TTGAGGACTTATTTGATGTG+TGG	0.622743	8:+3282919	MsG0880042062.01.T01:CDS
TTAAACCACTCAAAACATAG+TGG	0.627394	8:-3283014	None:intergenic
TGATAAGAACAAAGCGACAC+AGG	0.627693	8:+3282336	MsG0880042062.01.T01:CDS
TCTTAACTCCAATGTTGTGG+TGG	0.628593	8:+3282471	MsG0880042062.01.T01:CDS
TATTGCATGATCTTGCAACA+CGG	0.630101	8:+3283538	MsG0880042062.01.T01:CDS
GATGCAAAATTGAATGACAA+TGG	0.635944	8:+3283486	MsG0880042062.01.T01:CDS
GGGTTGCTGTGAATGAATGT+AGG	0.637753	8:-3281824	None:intergenic
TTAACTCCAAAAGAATCATG+GGG	0.641090	8:+3283033	MsG0880042062.01.T01:CDS
AGGAATGGAAGACGTTCCAA+TGG	0.643543	8:-3284094	None:intergenic
GACACCTTAAGATAAATCAT+GGG	0.650099	8:+3283979	MsG0880042062.01.T01:CDS
TCCAACGGCATCATCCCGAA+AGG	0.663240	8:-3283073	None:intergenic
GTTTCTCTTCAGCATCAAGG+AGG	0.673420	8:-3282195	None:intergenic
GCGTGATGGATGAATTGGAA+AGG	0.681103	8:+3282140	MsG0880042062.01.T01:CDS
TTAGCAATTAGATCATTGGG+AGG	0.688744	8:+3283156	MsG0880042062.01.T01:CDS
TTTCAATGGAAAGAACTAGG+TGG	0.693420	8:-3283800	None:intergenic
GAAGACGTTCCAATGGTGGG+AGG	0.699896	8:-3284087	None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
!!	ATATATATATATATATTCGT+TGG	-	Chr8:3282010-3282029	None:intergenic	10.0%
!!	AATCTTGAAATATCTCTTTA+TGG	+	Chr8:3284046-3284065	MsG0880042062.01.T01:CDS	20.0%
!!	TGTTAAAGAATATTACCTTT+CGG	+	Chr8:3283058-3283077	MsG0880042062.01.T01:CDS	20.0%
!!!	AACAAGATTGTTGATTAAAT+TGG	-	Chr8:3283883-3283902	None:intergenic	20.0%
!!!	ACAAGATTGTTGATTAAATT+GGG	-	Chr8:3283882-3283901	None:intergenic	20.0%
!!!	TAAATGCTTCAATTTTTCAA+TGG	-	Chr8:3283817-3283836	None:intergenic	20.0%
!!!	TTGAAAAATTGAAGCATTTA+AGG	+	Chr8:3283817-3283836	MsG0880042062.01.T01:CDS	20.0%
!	AAAGTCATTCTGTAAAAAAC+TGG	+	Chr8:3282224-3282243	MsG0880042062.01.T01:CDS	25.0%
!	AAGTCATTCTGTAAAAAACT+GGG	+	Chr8:3282225-3282244	MsG0880042062.01.T01:CDS	25.0%
!	GTTAAAGAATATTACCTTTC+GGG	+	Chr8:3283059-3283078	MsG0880042062.01.T01:CDS	25.0%
!	TTATTGCTCTTTATATCCTA+AGG	+	Chr8:3283326-3283345	MsG0880042062.01.T01:CDS	25.0%
!	TTCAAGATTATATTTGTGAG+TGG	-	Chr8:3284035-3284054	None:intergenic	25.0%
!	TTGAGAAAACTAATGATGTA+AGG	+	Chr8:3282494-3282513	MsG0880042062.01.T01:CDS	25.0%
!	TTTAACTCCAAAAGAATCAT+GGG	+	Chr8:3283032-3283051	MsG0880042062.01.T01:CDS	25.0%
!!	AATATTTTCTCTTCATAGGT+TGG	+	Chr8:3282081-3282100	MsG0880042062.01.T01:intron	25.0%
!!	AGTTATGGTAACTCAATTTT+AGG	-	Chr8:3283278-3283297	None:intergenic	25.0%
!!	ATTTGTTTGAAAAGCATATG+TGG	+	Chr8:3282704-3282723	MsG0880042062.01.T01:CDS	25.0%
!!	TTTGTTTGAAAAGCATATGT+GGG	+	Chr8:3282705-3282724	MsG0880042062.01.T01:CDS	25.0%
!!!	ATTTTTCAATGGAAAGAACT+AGG	-	Chr8:3283806-3283825	None:intergenic	25.0%
!!!	TTGTTACTTTGATTCAAGTA+AGG	+	Chr8:3283578-3283597	MsG0880042062.01.T01:CDS	25.0%
!!!	TTTTAGTCTTAGATGACATT+TGG	+	Chr8:3282869-3282888	MsG0880042062.01.T01:CDS	25.0%
	AAAAAGTTTGCAGAGTTTGA+GGG	-	Chr8:3281847-3281866	None:intergenic	30.0%
	AACCAAACTCTTGAATCAAT+TGG	+	Chr8:3283099-3283118	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	AACTTAAGTGACTTAAGGAA+TGG	-	Chr8:3284112-3284131	None:intergenic	30.0%
	AGAAAACTAATGATGTAAGG+AGG	+	Chr8:3282497-3282516	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	AGACACCTTAAGATAAATCA+TGG	+	Chr8:3283978-3283997	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	AGGATGAGTTAATTCAAATG+TGG	+	Chr8:3283364-3283383	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	AGTAAGGCAAAAAAATGTCT+AGG	+	Chr8:3283594-3283613	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	ATGAAAAATGGGATCAATTG+AGG	+	Chr8:3282902-3282921	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	CCATTAGCAATTAGATCATT+GGG	+	Chr8:3283153-3283172	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	CTCTTTATATCCTAAGGATT+GGG	+	Chr8:3283332-3283351	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	GAAAACTAATGATGTAAGGA+GGG	+	Chr8:3282498-3282517	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	GAACGAGAGTTATGAAAAAT+GGG	+	Chr8:3282891-3282910	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	GACACCTTAAGATAAATCAT+GGG	+	Chr8:3283979-3283998	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	GATGCAAAATTGAATGACAA+TGG	+	Chr8:3283486-3283505	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	GTGTTAGAATCAGATATCAT+TGG	+	Chr8:3282535-3282554	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	GTTTAACTCCAAAAGAATCA+TGG	+	Chr8:3283031-3283050	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	TAAAAAGTTTGCAGAGTTTG+AGG	-	Chr8:3281848-3281867	None:intergenic	30.0%
	TCCATTAGCAATTAGATCAT+TGG	+	Chr8:3283152-3283171	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	TGAAAATCAACAAGTTTCTG+TGG	+	Chr8:3282606-3282625	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	TGAAGATATGATACGCAAAA+GGG	+	Chr8:3282306-3282325	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	TGAGTTAATTCAAATGTGGA+TGG	+	Chr8:3283368-3283387	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	TTAAACCACTCAAAACATAG+TGG	-	Chr8:3283017-3283036	None:intergenic	30.0%
	TTAACTCCAAAAGAATCATG+GGG	+	Chr8:3283033-3283052	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
	TTGAAGATATGATACGCAAA+AGG	+	Chr8:3282305-3282324	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
!	AACTATTCTGAAGAACATGT+TGG	+	Chr8:3282756-3282775	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
!	ATGTCTTACAAGATGACTTT+TGG	+	Chr8:3283217-3283236	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
!	GCTGAATATTTTCTCTTCAT+AGG	+	Chr8:3282077-3282096	MsG0880042062.01.T01:intron	30.0%
!	GTTGTGTGTTCTCTTTTTAA+AGG	+	Chr8:3281891-3281910	MsG0880042062.01.T01:five_prime_UTR	30.0%
!	TACCAATTGATTCAAGAGTT+TGG	-	Chr8:3283104-3283123	None:intergenic	30.0%
!	TCTTGTTTGTTTACTGACAT+TGG	+	Chr8:3283896-3283915	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
!	TGTCATTCAATTTTGCATCT+TGG	-	Chr8:3283485-3283504	None:intergenic	30.0%
!	TGTTTCTATGTTGGAATCAT+TGG	+	Chr8:3283650-3283669	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
!!	AGAAGATTATAAGCTTGTTG+AGG	+	Chr8:3282575-3282594	MsG0880042062.01.T01:CDS	30.0%
!!	TGTGTTCTCTTTTTAAAGGA+TGG	+	Chr8:3281895-3281914	MsG0880042062.01.T01:exon	30.0%
	AAAAATGTGGCAGAGACAAT+GGG	+	Chr8:3282979-3282998	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	AACTTGCAAAATAAGCTTCG+TGG	+	Chr8:3282823-3282842	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	AAGCTTCGTGGAAGTTTAAT+TGG	+	Chr8:3282835-3282854	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	AATTCGTCCAAATTCACGAA+AGG	-	Chr8:3282116-3282135	None:intergenic	35.0%
	AGGCATATTGCGAAGTAAAA+GGG	+	Chr8:3283176-3283195	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	AGGTCCCATGATTTATCTTA+AGG	-	Chr8:3283986-3284005	None:intergenic	35.0%
	ATCCTAAGGATTGGGAATTT+AGG	+	Chr8:3283340-3283359	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	ATGGCTGAACAAATTCCATT+TGG	+	Chr8:3281914-3281933	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	CATGTCATCAACTTTGTTCT+TGG	-	Chr8:3282791-3282810	None:intergenic	35.0%
	CCCAATGATCTAATTGCTAA+TGG	-	Chr8:3283156-3283175	None:intergenic	35.0%
	CGTGAATTTGGACGAATTTA+TGG	+	Chr8:3282118-3282137	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	GAATCTTAACTCCAATGTTG+TGG	+	Chr8:3282468-3282487	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	GACAACTCGTAGTAAAAATG+TGG	+	Chr8:3282966-3282985	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	GATAAAGTCACCTGTTAAAG+AGG	-	Chr8:3281952-3281971	None:intergenic	35.0%
	GCTCTTTATATCCTAAGGAT+TGG	+	Chr8:3283331-3283350	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	GGAACGAGAGTTATGAAAAA+TGG	+	Chr8:3282890-3282909	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	TAAAAATGTGGCAGAGACAA+TGG	+	Chr8:3282978-3282997	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	TAAGGATTGGGAATTTAGGA+AGG	+	Chr8:3283344-3283363	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	TATTGCATGATCTTGCAACA+CGG	+	Chr8:3283538-3283557	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	TCATCTATCAAATCATCTGC+AGG	-	Chr8:3282277-3282296	None:intergenic	35.0%
	TGGAATCATTGGATTCAAGT+AGG	+	Chr8:3283661-3283680	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	TTAGCAATTAGATCATTGGG+AGG	+	Chr8:3283156-3283175	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	TTCCTAAATTCCCAATCCTT+AGG	-	Chr8:3283345-3283364	None:intergenic	35.0%
	TTCTTGACTGTTCAGTTGAA+GGG	+	Chr8:3283400-3283419	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	TTGAGGACTTATTTGATGTG+TGG	+	Chr8:3282919-3282938	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
	TTTCAATGGAAAGAACTAGG+TGG	-	Chr8:3283803-3283822	None:intergenic	35.0%
	TTTCTTGACTGTTCAGTTGA+AGG	+	Chr8:3283399-3283418	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
!	AACAAACCCCATGATTCTTT+TGG	-	Chr8:3283042-3283061	None:intergenic	35.0%
!	AAGATAGCAGAAAAGTGCAA+AGG	+	Chr8:3283126-3283145	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
!	CTGTAAAAAACTGGGTTAGA+AGG	+	Chr8:3282233-3282252	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
!!	AGTTGATGACATGTTATCGT+TGG	+	Chr8:3282798-3282817	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
!!	ATTGTTGGTATTGGTGGTTT+GGG	+	Chr8:3282634-3282653	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
!!	CAATCTCAAGAGCCATTTTA+CGG	-	Chr8:3282399-3282418	None:intergenic	35.0%
!!	CTTTGATGCTGTTTCTATGT+TGG	+	Chr8:3283641-3283660	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
!!	TATTGTTGGTATTGGTGGTT+TGG	+	Chr8:3282633-3282652	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
!!	TGACTTTTGGAAATTGTGTG+AGG	+	Chr8:3283230-3283249	MsG0880042062.01.T01:CDS	35.0%
!!!	TGGTAACTCAATTTTAGGAC+AGG	-	Chr8:3283273-3283292	None:intergenic	35.0%
	AAGTCCACTAAAACATGCAC+AGG	-	Chr8:3283624-3283643	None:intergenic	40.0%
	ACAACGCAGTTAGAGAAGAT+CGG	-	Chr8:3281876-3281895	None:intergenic	40.0%
	AGGCTTTCAGCAATACCAAA+TGG	-	Chr8:3281932-3281951	None:intergenic	40.0%
	ATCAAGGAGGACAACTTTGA+TGG	-	Chr8:3282185-3282204	None:intergenic	40.0%
	ATCCACTTCATTGTCGTCAT+TGG	-	Chr8:3283712-3283731	None:intergenic	40.0%
	ATTGCATGATCTTGCAACAC+GGG	+	Chr8:3283539-3283558	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
	CATTGGATTCAAGTAGGTTG+CGG	+	Chr8:3283667-3283686	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
	CTTATCTTGTCAGAGTGTGA+TGG	+	Chr8:3283843-3283862	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
	GAGGCATATTGCGAAGTAAA+AGG	+	Chr8:3283175-3283194	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
	GCAAAACATTGCCTTTGTTG+AGG	-	Chr8:3283306-3283325	None:intergenic	40.0%
	GCGAAGTAAAAGGGAAGAAA+GGG	+	Chr8:3283185-3283204	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
	GCTCAACTGGTATACAATGA+TGG	+	Chr8:3282670-3282689	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
	TATTTGATGTGTGGTGCTCA+AGG	+	Chr8:3282928-3282947	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
	TCAAATACTTACGCGTCTTG+CGG	+	Chr8:3283760-3283779	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
	TCTTAACTCCAATGTTGTGG+TGG	+	Chr8:3282471-3282490	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
	TGATAAGAACAAAGCGACAC+AGG	+	Chr8:3282336-3282355	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
	TGCGAAGTAAAAGGGAAGAA+AGG	+	Chr8:3283184-3283203	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
	TTCAAGTGTCTCGTCTTTGA+AGG	-	Chr8:3284006-3284025	None:intergenic	40.0%
	TTCAGTTGAAGGGAAATGCA+TGG	+	Chr8:3283410-3283429	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
	TTCCAATGACGACAATGAAG+TGG	+	Chr8:3283707-3283726	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
	TTGCTGAAAGCCTCTTTAAC+AGG	+	Chr8:3281939-3281958	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
	TTTCTCAACCACCACAACAT+TGG	-	Chr8:3282482-3282501	None:intergenic	40.0%
	TTTGTTGAGGCGACAAGTTA+TGG	-	Chr8:3283293-3283312	None:intergenic	40.0%
!	AAGAGTTTGGTTCACTCCAA+CGG	-	Chr8:3283091-3283110	None:intergenic	40.0%
!	ATAACTTGTCGCCTCAACAA+AGG	+	Chr8:3283292-3283311	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
!	CTTGTTTCTCTTCAGCATCA+AGG	-	Chr8:3282201-3282220	None:intergenic	40.0%
!	GTGGTTGCTATTGTTGGTAT+TGG	+	Chr8:3282625-3282644	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
!	GTTGCTATTGTTGGTATTGG+TGG	+	Chr8:3282628-3282647	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
!	GTTTCTGTGGTTGCTATTGT+TGG	+	Chr8:3282619-3282638	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
!!	AAGACCTGTGCATGTTTTAG+TGG	+	Chr8:3283617-3283636	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
!!	AGTGACCACTATGTTTTGAG+TGG	+	Chr8:3283009-3283028	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
!!	GGAAGATGTTGGTAATCACT+TGG	+	Chr8:3283431-3283450	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
!!	TTATGGCGTGATGGATGAAT+TGG	+	Chr8:3282135-3282154	MsG0880042062.01.T01:CDS	40.0%
	AAAGACAGCTCTTGCTCAAC+TGG	+	Chr8:3282657-3282676	MsG0880042062.01.T01:CDS	45.0%
	AATGGAAGACGTTCCAATGG+TGG	-	Chr8:3284094-3284113	None:intergenic	45.0%
	AGCAGCTCTGCTTAGAGATA+AGG	-	Chr8:3282371-3282390	None:intergenic	45.0%
	AGGAATGGAAGACGTTCCAA+TGG	-	Chr8:3284097-3284116	None:intergenic	45.0%
	ATGGAAGACGTTCCAATGGT+GGG	-	Chr8:3284093-3284112	None:intergenic	45.0%
	GAAAGAACTAGGTGGCTAAG+AGG	-	Chr8:3283795-3283814	None:intergenic	45.0%
	GGGAAATGCATGGAAGATGT+TGG	+	Chr8:3283420-3283439	MsG0880042062.01.T01:CDS	45.0%
	GTAAAAGGGAAGAAAGGGAG+TGG	+	Chr8:3283190-3283209	MsG0880042062.01.T01:CDS	45.0%
	GTTTCTCTTCAGCATCAAGG+AGG	-	Chr8:3282198-3282217	None:intergenic	45.0%
	TCTGCAGCCTTTCGTGAATT+TGG	+	Chr8:3282106-3282125	MsG0880042062.01.T01:CDS	45.0%
	TGATCTTGCAACACGGGTAT+CGG	+	Chr8:3283545-3283564	MsG0880042062.01.T01:CDS	45.0%
	TGGACGAATTTATGGCGTGA+TGG	+	Chr8:3282126-3282145	MsG0880042062.01.T01:CDS	45.0%
	TTTACGATACCTCCCACCAT+TGG	+	Chr8:3284078-3284097	MsG0880042062.01.T01:CDS	45.0%
!!	GCGTGATGGATGAATTGGAA+AGG	+	Chr8:3282140-3282159	MsG0880042062.01.T01:CDS	45.0%
!!!	AGCTGCTTTTCGCCGTAAAA+TGG	+	Chr8:3282384-3282403	MsG0880042062.01.T01:CDS	45.0%
	GATCTTGCAACACGGGTATC+GGG	+	Chr8:3283546-3283565	MsG0880042062.01.T01:CDS	50.0%
	ACCTTTCGGGATGATGCCGT+TGG	+	Chr8:3283072-3283091	MsG0880042062.01.T01:CDS	55.0%
	ATACTTACGCGTCTTGCGGC+TGG	+	Chr8:3283764-3283783	MsG0880042062.01.T01:CDS	55.0%
	GTGTGGTGCTCAAGGCAGTA+AGG	+	Chr8:3282936-3282955	MsG0880042062.01.T01:CDS	55.0%
	TCCAACGGCATCATCCCGAA+AGG	-	Chr8:3283076-3283095	None:intergenic	55.0%
!	GAAGACGTTCCAATGGTGGG+AGG	-	Chr8:3284090-3284109	None:intergenic	55.0%
	TTACGCGTCTTGCGGCTGGT+GGG	+	Chr8:3283768-3283787	MsG0880042062.01.T01:CDS	60.0%
	CTTACGCGTCTTGCGGCTGG+TGG	+	Chr8:3283767-3283786	MsG0880042062.01.T01:CDS	65.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
Chr8	gene	3281827	3284133	3281827	ID=MsG0880042062.01;Name=MsG0880042062.01
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Chr8	exon	3281827	3281960	3281827	ID=MsG0880042062.01.T01:exon:2118;Parent=MsG0880042062.01.T01
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Chr8	five_prime_UTR	3281827	3281913	3281827	ID=MsG0880042062.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0880042062.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0880042062.01.T01

ATGGCTGAACAAATTCCATTTGGTATTGCTGAAAGCCTCTTTAACAGGTTGGCTTCTGCAGCCTTTCGTGAATTTGGACGAATTTATGGCGTGATGGATGAATTGGAAAGGCTTAAGAACACAGTTGAATCCATCAAAGTTGTCCTCCTTGATGCTGAAGAGAAACAAGAGCAAAGTCATTCTGTAAAAAACTGGGTTAGAAGGCTCAACGATGTGCTTCTTCCTGCAGATGATTTGATAGATGAGTTTCTTATTGAAGATATGATACGCAAAAGGGATAAAGCTGATAAGAACAAAGCGACACAGGTATTTCATTCCTTATCTCTAAGCAGAGCTGCTTTTCGCCGTAAAATGGCTCTTGAGATTGAAAAAATACAAAAAAGTTTTAATGATGTCGTGAAAGATATGTCTGTGTTGAATCTTAACTCCAATGTTGTGGTGGTTGAGAAAACTAATGATGTAAGGAGGGAAACTAGTTCTTTTGTGTTAGAATCAGATATCATTGGAAGAGAAGATGATAAAAAGAAGATTATAAGCTTGTTGAGGCAATCACATGAAAATCAACAAGTTTCTGTGGTTGCTATTGTTGGTATTGGTGGTTTGGGAAAGACAGCTCTTGCTCAACTGGTATACAATGATGGTGAAGTGCAAAATTTGTTTGAAAAGCATATGTGGGTATGTGTCTCTGATAGCTTTGATGTCAAAACTATTCTGAAGAACATGTTGGAGTCATTAACCAAGAACAAAGTTGATGACATGTTATCGTTGGATAACTTGCAAAATAAGCTTCGTGGAAGTTTAATTGGTAAAAGATACATTTTAGTCTTAGATGACATTTGGAACGAGAGTTATGAAAAATGGGATCAATTGAGGACTTATTTGATGTGTGGTGCTCAAGGCAGTAAGGTTGTAGTGACAACTCGTAGTAAAAATGTGGCAGAGACAATGGGTGTTATAAGTGACCACTATGTTTTGAGTGGTTTAACTCCAAAAGAATCATGGGGTTTGTTAAAGAATATTACCTTTCGGGATGATGCCGTTGGAGTGAACCAAACTCTTGAATCAATTGGTAAGAAGATAGCAGAAAAGTGCAAAGGAGTTCCATTAGCAATTAGATCATTGGGAGGCATATTGCGAAGTAAAAGGGAAGAAAGGGAGTGGATCGATGTCTTACAAGATGACTTTTGGAAATTGTGTGAGGATGAAGATAGCATCATGCCTGTCCTAAAATTGAGTTACCATAACTTGTCGCCTCAACAAAGGCAATGTTTTGCTTATTGCTCTTTATATCCTAAGGATTGGGAATTTAGGAAGGATGAGTTAATTCAAATGTGGATGGCACAAGATTTTCTTGACTGTTCAGTTGAAGGGAAATGCATGGAAGATGTTGGTAATCACTTGGTAAATATTTTCTTGACGAAATCATTCTTCCAAGATGCAAAATTGAATGACAATGGTGACGTATATAAATTTAAAATGCACGATTTATTGCATGATCTTGCAACACGGGTATCGGGAAATGATTGTTGTTACTTTGATTCAAGTAAGGCAAAAAAATGTCTAGGAAGACCTGTGCATGTTTTAGTGGACTTTGATGCTGTTTCTATGTTGGAATCATTGGATTCAAGTAGGTTGCGGACTTTGATTATGTTATATTCCAATGACGACAATGAAGTGGATGCAAAGAAACTATTAGTTATTTCATATTTCAAATACTTACGCGTCTTGCGGCTGGTGGGTCCTCTTAGCCACCTAGTTCTTTCCATTGAAAAATTGAAGCATTTAAGGCATCTTATCTTGTCAGAGTGTGATGGACTAAAAAGTCATCCCAATTTAATCAACAATCTTGTTTGTTTACTGACATTGGAATTGTTTTTGTCTGAAGTTGTAGTTTCTACAAAAGTTGTTTCAAAATTAATCAATTTGAGACACCTTAAGATAAATCATGGGACCTTCAAAGACGAGACACTTGAAATATCTCCACTCACAAATATAATCTTGAAATATCTCTTTATGGTTGCTCAAATTTACGATACCTCCCACCATTGGAACGTCTTCCATTCCTTAAGTCACTTAAGTTAA

Protein sequence

>MsG0880042062.01.T01

MAEQIPFGIAESLFNRLASAAFREFGRIYGVMDELERLKNTVESIKVVLLDAEEKQEQSHSVKNWVRRLNDVLLPADDLIDEFLIEDMIRKRDKADKNKATQVFHSLSLSRAAFRRKMALEIEKIQKSFNDVVKDMSVLNLNSNVVVVEKTNDVRRETSSFVLESDIIGREDDKKKIISLLRQSHENQQVSVVAIVGIGGLGKTALAQLVYNDGEVQNLFEKHMWVCVSDSFDVKTILKNMLESLTKNKVDDMLSLDNLQNKLRGSLIGKRYILVLDDIWNESYEKWDQLRTYLMCGAQGSKVVVTTRSKNVAETMGVISDHYVLSGLTPKESWGLLKNITFRDDAVGVNQTLESIGKKIAEKCKGVPLAIRSLGGILRSKREEREWIDVLQDDFWKLCEDEDSIMPVLKLSYHNLSPQQRQCFAYCSLYPKDWEFRKDELIQMWMAQDFLDCSVEGKCMEDVGNHLVNIFLTKSFFQDAKLNDNGDVYKFKMHDLLHDLATRVSGNDCCYFDSSKAKKCLGRPVHVLVDFDAVSMLESLDSSRLRTLIMLYSNDDNEVDAKKLLVISYFKYLRVLRLVGPLSHLVLSIEKLKHLRHLILSECDGLKSHPNLINNLVCLLTLELFLSEVVVSTKVVSKLINLRHLKINHGTFKDETLEISPLTNIILKYLFMVAQIYDTSHHWNVFHSLSHLS*