AlfalfaGEDB | MsG0380014240.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380014240.01

KEGG: -
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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TGGAGATGGAGACACGAGTA+CGG	0.515157	3:+51745366	None:intergenic
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GTATTATAAGTATACAAATC+CGG	0.532622	3:+51744747	None:intergenic
CACCATCTGAACTTTAAGCC+GGG	0.533225	3:+51744471	None:intergenic
CAACAAGTGTTGTTCGGAGT+GGG	0.536718	3:+51746621	None:intergenic
AAGTAACAACAAGTGTTGTT+CGG	0.537175	3:+51746615	None:intergenic
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TAGCTGCCTTGGCTCGAGGA+GGG	0.540312	3:-51743985	MsG0380014240.01.T01:CDS
CTACTTCATGCCTATGCCAA+TGG	0.540757	3:-51743884	MsG0380014240.01.T01:CDS
TGGTAATCGTGGAATGTTTG+TGG	0.542451	3:-51744290	MsG0380014240.01.T01:CDS
GCATTCAGAGTAGTTAGGCC+AGG	0.542780	3:+51743698	None:intergenic
TTTCCAAGGAGGAGAAAAGT+AGG	0.543210	3:-51743172	MsG0380014240.01.T01:CDS
TTCAATATATGGGAGGAAGC+AGG	0.545249	3:-51743669	MsG0380014240.01.T01:CDS
AAGTAGGTTACTGAAGAGAA+TGG	0.545553	3:-51743156	MsG0380014240.01.T01:CDS
ACGCATATTGCAGAAATGGC+AGG	0.549392	3:-51743457	MsG0380014240.01.T01:CDS
ATCAAAATGCATGGTAATCG+TGG	0.549524	3:-51744301	MsG0380014240.01.T01:CDS
CGAAGCACGGACACGGACAC+CGG	0.549914	3:+51746210	None:intergenic
TTAAAACACTCGAAAACGAT+GGG	0.550336	3:-51744989	MsG0380014240.01.T01:CDS
TGTCGGGGTTTGAGAAGGCT+GGG	0.550745	3:-51744405	MsG0380014240.01.T01:CDS
TTGCAGAAATGGCAGGATGA+AGG	0.551456	3:-51743450	MsG0380014240.01.T01:CDS
GAGTCGGGTGTGGATGAGGT+TGG	0.552857	3:+51745201	None:intergenic
ATTAGTGCATACAGCAGATG+TGG	0.553073	3:-51744091	MsG0380014240.01.T01:CDS
AGGATGTATTTCAATAATGC+CGG	0.553092	3:+51743817	None:intergenic
TGTTAATATTCTTGGAAAAG+CGG	0.553524	3:-51745039	MsG0380014240.01.T01:CDS
TCCTCCTCTGACCCCAACTC+TGG	0.554473	3:-51745341	MsG0380014240.01.T01:CDS
TACGAAGAAATGAAAGCGGC+GGG	0.558677	3:-51744358	MsG0380014240.01.T01:CDS
CGGAGTGGGTTGCATCTCGA+AGG	0.559487	3:+51746635	None:intergenic
TGGGTTGCATCTCGAAGGTG+TGG	0.560147	3:+51746640	None:intergenic
TCTCCTCCTTGGAAACATGT+GGG	0.561730	3:+51743180	None:intergenic
GGAAACGCAGGAAACCTTAG+TGG	0.565089	3:+51746662	None:intergenic
GGAGATGGAGACACGAGTAC+GGG	0.565606	3:+51745367	None:intergenic
GTTTGTTGGAGGAAGCATCC+CGG	0.567096	3:-51744489	MsG0380014240.01.T01:intron
TGGAGGAGAGAGGTGATGGT+TGG	0.568227	3:+51745307	None:intergenic
CTTAAAACACTCGAAAACGA+TGG	0.569362	3:-51744990	MsG0380014240.01.T01:CDS
TTTGACCGGATTAAGTCTGC+GGG	0.570970	3:-51744672	MsG0380014240.01.T01:CDS
GTTTGACCGGATTAAGTCTG+CGG	0.572131	3:-51744673	MsG0380014240.01.T01:CDS
ACCAGAGTTGGGGTCAGAGG+AGG	0.572535	3:+51745340	None:intergenic
ACCAGGGTTTACCAGAGTTG+GGG	0.574952	3:+51745330	None:intergenic
GACCTGGAGGAGAGAGGTGA+TGG	0.578308	3:+51745303	None:intergenic
AATGCTCTTATCAAAATGCA+TGG	0.580224	3:-51744310	MsG0380014240.01.T01:CDS
TCATGCCTATGCCAATGGTA+AGG	0.582078	3:-51743879	MsG0380014240.01.T01:CDS
GTGTTGAGAACATGCTGACC+TGG	0.582606	3:+51745287	None:intergenic
TTAGCTGCCTTGGCTCGAGG+AGG	0.582695	3:-51743986	MsG0380014240.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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!!!	GCGTGCTTTTTTTGAATTAA+GGG	-	Chr3:51746147-51746166	MsG0380014240.01.T01:intron	30.0%
	AAATTGAGGATAGAACCCAT+CGG	+	Chr3:51744157-51744176	None:intergenic	35.0%
	AACAGTTTCGTGAAAAACCT+TGG	-	Chr3:51746670-51746689	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
	AAGCTGTTAATGTGTTTGAC+CGG	-	Chr3:51745196-51745215	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
	AAGTAGGTTACTGAAGAGAA+TGG	-	Chr3:51746726-51746745	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
	AATAACAGCAATAGCAGAAC+CGG	+	Chr3:51744824-51744843	None:intergenic	35.0%
	AATATTGTTGAGGTGAATGG+GGG	+	Chr3:51744644-51744663	None:intergenic	35.0%
	ATAAGATGGCTCCAAAATTG+AGG	+	Chr3:51744171-51744190	None:intergenic	35.0%
	ATATCACGAGATAAACGAGT+CGG	+	Chr3:51744700-51744719	None:intergenic	35.0%
	ATCAAAATGCATGGTAATCG+TGG	-	Chr3:51745581-51745600	MsG0380014240.01.T01:intron	35.0%
	ATGATAATAGATGATGCCGA+TGG	-	Chr3:51744138-51744157	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
	ATTCGATACATGATCAAGCA+AGG	-	Chr3:51746574-51746593	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
	CACTAGATAATTAACCTGTC+TGG	-	Chr3:51744048-51744067	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
	CTTAAAACACTCGAAAACGA+TGG	-	Chr3:51744892-51744911	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
	CTTACAATACCAATCAACGA+TGG	+	Chr3:51746629-51746648	None:intergenic	35.0%
	CTTATAACTCCATCGTTGAT+TGG	-	Chr3:51746617-51746636	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
	CTTTCATTTCATTCGTGTTC+TGG	-	Chr3:51743364-51743383	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
	GAAAACAAATGGAGTTGTTC+CGG	-	Chr3:51745116-51745135	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
	GAATATTGTTGAGGTGAATG+GGG	+	Chr3:51744645-51744664	None:intergenic	35.0%
	GACATGTGTAGTGTAACTTA+AGG	+	Chr3:51743552-51743571	None:intergenic	35.0%
	GAGAATATTGTTGAGGTGAA+TGG	+	Chr3:51744647-51744666	None:intergenic	35.0%
	GCATTATAAGTAACCCTATC+AGG	+	Chr3:51745243-51745262	None:intergenic	35.0%
	GCATTATAAGTAGAGAGATC+AGG	+	Chr3:51745872-51745891	None:intergenic	35.0%
	GTCCTTGTCTCATTATAACA+AGG	-	Chr3:51743821-51743840	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
	GTGGTGTAAGTAAAAACATC+CGG	+	Chr3:51745452-51745471	None:intergenic	35.0%
	GTGTTCCAAGTAACAATATC+AGG	+	Chr3:51745662-51745681	None:intergenic	35.0%
	GTTCTCCTGATATTGTTACT+TGG	-	Chr3:51745654-51745673	MsG0380014240.01.T01:intron	35.0%
	TCATTGCATTCAGAGTAGTT+AGG	+	Chr3:51746192-51746211	None:intergenic	35.0%
	TGAATATTGTGTTCCTTGCT+GGG	+	Chr3:51743307-51743326	None:intergenic	35.0%
	TGATAATAGATGATGCCGAT+GGG	-	Chr3:51744139-51744158	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
	TGGTTCATTTGATCAAGCAA+TGG	-	Chr3:51745811-51745830	MsG0380014240.01.T01:intron	35.0%
	TGTGTTTGGACAGAATCAAA+TGG	-	Chr3:51745691-51745710	MsG0380014240.01.T01:intron	35.0%
	TTAAAGAGATGAAGAGATCC+GGG	-	Chr3:51745735-51745754	MsG0380014240.01.T01:intron	35.0%
	TTAGGGACTAATTTGGGTAT+TGG	+	Chr3:51743777-51743796	None:intergenic	35.0%
	TTGACGAGATTAAGGAATGT+GGG	-	Chr3:51745630-51745649	MsG0380014240.01.T01:intron	35.0%
	TTGATATCTGCTCATGTTAG+AGG	-	Chr3:51745368-51745387	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
	TTTGACGAGATTAAGGAATG+TGG	-	Chr3:51745629-51745648	MsG0380014240.01.T01:intron	35.0%
!	AATCCTTGACAGTTTTCTTG+CGG	+	Chr3:51743914-51743933	None:intergenic	35.0%
!	ATGGGTTCTATCCTCAATTT+TGG	-	Chr3:51744157-51744176	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
!	CTTGCTACTTACTAGAACAA+GGG	+	Chr3:51746104-51746123	None:intergenic	35.0%
!	GAAGAGTATGTTAGCTCATT+CGG	+	Chr3:51745977-51745996	None:intergenic	35.0%
!	GTCCTTGTTATAATGAGACA+AGG	+	Chr3:51743826-51743845	None:intergenic	35.0%
!	TACTTACACCACACTTTTGT+CGG	-	Chr3:51745460-51745479	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
!	TATAAAAGCATGCTGGAATC+TGG	-	Chr3:51745839-51745858	MsG0380014240.01.T01:intron	35.0%
!	TCTGAAGAAAGGTATGAAAC+CGG	-	Chr3:51746375-51746394	MsG0380014240.01.T01:intron	35.0%
!	TCTTGCTACTTACTAGAACA+AGG	+	Chr3:51746105-51746124	None:intergenic	35.0%
!	TTTCATTCGTGTTCTGGATA+AGG	-	Chr3:51743370-51743389	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
!	TTTTCAGTCAAGACCCTATT+TGG	-	Chr3:51743725-51743744	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
!!	ATTGAAAGGATGAAAGCACT+TGG	-	Chr3:51746028-51746047	MsG0380014240.01.T01:intron	35.0%
!!	CTTGCTATTCTCAAAGCTTT+AGG	-	Chr3:51744721-51744740	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
!!	TGCTTTGTTTCTTATCACAC+AGG	-	Chr3:51744384-51744403	MsG0380014240.01.T01:CDS	35.0%
!!	TTAAGGGAAGTTCTGAAGAA+AGG	-	Chr3:51746364-51746383	MsG0380014240.01.T01:intron	35.0%
!!!	GTTTTCGAGTGTTTTAAGCA+AGG	+	Chr3:51744890-51744909	None:intergenic	35.0%
	AACCTTAAGAAGGTCTTTGC+AGG	-	Chr3:51744442-51744461	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
	AACTGTTTGCTTCATCTTGC+CGG	+	Chr3:51746657-51746676	None:intergenic	40.0%
	AAGAACTTGCAAAGCCTCTT+TGG	+	Chr3:51745298-51745317	None:intergenic	40.0%
	AATCTCCTTACCATTGGCAT+AGG	+	Chr3:51746011-51746030	None:intergenic	40.0%
	ACATGATCAAGCAAGGATGT+AGG	-	Chr3:51746581-51746600	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
	ACCTTAAGAAGGTCTTTGCA+GGG	-	Chr3:51744443-51744462	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
	AGAACTTGCAAAGCCTCTTT+GGG	+	Chr3:51745297-51745316	None:intergenic	40.0%
	ATATCTGCTCATGTTAGAGG+TGG	-	Chr3:51745371-51745390	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
	ATATTCTTGGAAAAGCGGGT+CGG	-	Chr3:51744848-51744867	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
	ATGGCAAAATGGGTATGTCT+TGG	-	Chr3:51745064-51745083	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
	ATTAGTGCATACAGCAGATG+TGG	-	Chr3:51745791-51745810	MsG0380014240.01.T01:intron	40.0%
	ATTGGTATTGTAAGCACAGC+CGG	-	Chr3:51746635-51746654	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
	CAGCAAGGAACACAATATTC+AGG	-	Chr3:51743306-51743325	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
	CCAATGGTAAGGAGATTGAA+AGG	-	Chr3:51746014-51746033	MsG0380014240.01.T01:intron	40.0%
	CCTTTCAATCTCCTTACCAT+TGG	+	Chr3:51746017-51746036	None:intergenic	40.0%
	CTGAATATTGTGTTCCTTGC+TGG	+	Chr3:51743308-51743327	None:intergenic	40.0%
	CTGCTTATGCTAGTAAAGGT+CGG	-	Chr3:51744953-51744972	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
	CTTCGATGAGAACCTTAAGA+AGG	-	Chr3:51744432-51744451	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
	GTTACTGAAGAGAATGGCAA+GGG	-	Chr3:51746732-51746751	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
	TATCACGAGATAAACGAGTC+GGG	+	Chr3:51744699-51744718	None:intergenic	40.0%
	TCTTGTACTGTAACGAAGCA+CGG	+	Chr3:51743688-51743707	None:intergenic	40.0%
	TGGTAATCGTGGAATGTTTG+TGG	-	Chr3:51745592-51745611	MsG0380014240.01.T01:intron	40.0%
	TTACGAAGAAATGAAAGCGG+CGG	-	Chr3:51745523-51745542	MsG0380014240.01.T01:intron	40.0%
	TTAGTAGTTCATAGCCAGAC+AGG	+	Chr3:51744065-51744084	None:intergenic	40.0%
	TTCAACAAAATGCAACGCGA+CGG	-	Chr3:51744997-51745016	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
	TTCAATATATGGGAGGAAGC+AGG	-	Chr3:51746213-51746232	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
	TTGCTGAAATGAAGGATGGT+CGG	-	Chr3:51745945-51745964	MsG0380014240.01.T01:intron	40.0%
	TTTCCAAGGAGGAGAAAAGT+AGG	-	Chr3:51746710-51746729	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
	TTTGCAGGGAGAGATGAATT+TGG	-	Chr3:51744457-51744476	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
!	ACTTACACCACACTTTTGTC+GGG	-	Chr3:51745461-51745480	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
!	GAATCAAATGGACTCTGAAG+TGG	-	Chr3:51745703-51745722	MsG0380014240.01.T01:intron	40.0%
!	GCGTTGCATTTTGTTGAACA+CGG	+	Chr3:51744995-51745014	None:intergenic	40.0%
!	GGCTGTTTATAAAAGCATGC+TGG	-	Chr3:51745832-51745851	MsG0380014240.01.T01:intron	40.0%
!	GTTCAAAATCTCATTGGCCT+TGG	+	Chr3:51746245-51746264	None:intergenic	40.0%
!	TCATGTTAGAGGTGGTTTGT+TGG	-	Chr3:51745379-51745398	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
!	TTCATTCAGAATGGTTGGTG+AGG	-	Chr3:51743461-51743480	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
!!	AAAGTTCAGATGGTGGAGAA+AGG	-	Chr3:51745419-51745438	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
!!	AACACGCTTTTAGCTGTGTT+TGG	-	Chr3:51745677-51745696	MsG0380014240.01.T01:intron	40.0%
!!	AAGTTCAGATGGTGGAGAAA+GGG	-	Chr3:51745420-51745439	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
!!	TAACCTACTTTTCTCCTCCT+TGG	+	Chr3:51746716-51746735	None:intergenic	40.0%
!!	TGCTGACTCAATGTTTGTTG+AGG	-	Chr3:51746540-51746559	MsG0380014240.01.T01:CDS	40.0%
!!	TGTTTTAAGCAAGGATGCAG+CGG	+	Chr3:51744881-51744900	None:intergenic	40.0%
!!!	GAATAGGCCTCTTGTTTTCA+GGG	+	Chr3:51744411-51744430	None:intergenic	40.0%
!!!	TAATGCTGTTTTAGCTGCCT+TGG	-	Chr3:51745886-51745905	MsG0380014240.01.T01:intron	40.0%
	AATATATGGGAGGAAGCAGG+TGG	-	Chr3:51746216-51746235	MsG0380014240.01.T01:CDS	45.0%
	ACAAGGGTCTTCAACAGAAC+AGG	+	Chr3:51746088-51746107	None:intergenic	45.0%
	ACGCATATTGCAGAAATGGC+AGG	-	Chr3:51746425-51746444	MsG0380014240.01.T01:intron	45.0%
	AGCCCAATCGAAAACAGAGA+AGG	+	Chr3:51744770-51744789	None:intergenic	45.0%
	AGGGAAAGAGGAATTACACC+TGG	-	Chr3:51746166-51746185	MsG0380014240.01.T01:intron	45.0%
	AGGTTCTCATCGAAGCGAAT+AGG	+	Chr3:51744427-51744446	None:intergenic	45.0%
	ATCCCGGCTTAAAGTTCAGA+TGG	-	Chr3:51745409-51745428	MsG0380014240.01.T01:CDS	45.0%
	CAAAACCCGCAGACTTAATC+CGG	+	Chr3:51745218-51745237	None:intergenic	45.0%
	CACCATCTGAACTTTAAGCC+GGG	+	Chr3:51745414-51745433	None:intergenic	45.0%
	CATGTGGGTCGATATTACCA+AGG	+	Chr3:51746690-51746709	None:intergenic	45.0%
	CCACCATCTGAACTTTAAGC+CGG	+	Chr3:51745415-51745434	None:intergenic	45.0%
	CTACTTCATGCCTATGCCAA+TGG	-	Chr3:51745998-51746017	MsG0380014240.01.T01:intron	45.0%
	GAAAACAGAGAAGGCGAGTT+GGG	+	Chr3:51744761-51744780	None:intergenic	45.0%
	GGAAACCTTAGTGGTTGTTG+AGG	+	Chr3:51743214-51743233	None:intergenic	45.0%
	GGGGAGAGAGAATATTGTTG+AGG	+	Chr3:51744654-51744673	None:intergenic	45.0%
	GGTTACTGAAGAGAATGGCA+AGG	-	Chr3:51746731-51746750	MsG0380014240.01.T01:CDS	45.0%
	GTTTGACCGGATTAAGTCTG+CGG	-	Chr3:51745209-51745228	MsG0380014240.01.T01:CDS	45.0%
	TACGAAGAAATGAAAGCGGC+GGG	-	Chr3:51745524-51745543	MsG0380014240.01.T01:intron	45.0%
	TAGCAAGAGTGATCTCCTTG+TGG	-	Chr3:51746117-51746136	MsG0380014240.01.T01:intron	45.0%
	TAGTGGTTGTTGAGGTCTGA+GGG	+	Chr3:51743206-51743225	None:intergenic	45.0%
	TATCGACCCACATGTTTCCA+AGG	-	Chr3:51746696-51746715	MsG0380014240.01.T01:CDS	45.0%
	TATTCTTGGAAAAGCGGGTC+GGG	-	Chr3:51744849-51744868	MsG0380014240.01.T01:CDS	45.0%
	TCAGACCTCAACAACCACTA+AGG	-	Chr3:51743206-51743225	MsG0380014240.01.T01:CDS	45.0%
	TCATGCCTATGCCAATGGTA+AGG	-	Chr3:51746003-51746022	MsG0380014240.01.T01:intron	45.0%
	TCCCTGCAAAGACCTTCTTA+AGG	+	Chr3:51744447-51744466	None:intergenic	45.0%
	TCTCCTCCTTGGAAACATGT+GGG	+	Chr3:51746705-51746724	None:intergenic	45.0%
	TGGATGAGGTTGGGCAAAAA+GGG	+	Chr3:51744674-51744693	None:intergenic	45.0%
	TTAGTGGTTGTTGAGGTCTG+AGG	+	Chr3:51743207-51743226	None:intergenic	45.0%
	TTCTCCTCCTTGGAAACATG+TGG	+	Chr3:51746706-51746725	None:intergenic	45.0%
	TTGCAGAAATGGCAGGATGA+AGG	-	Chr3:51746432-51746451	MsG0380014240.01.T01:intron	45.0%
	TTTGACCGGATTAAGTCTGC+GGG	-	Chr3:51745210-51745229	MsG0380014240.01.T01:CDS	45.0%
!	ACAACAAGTGTTGTTCGGAG+TGG	+	Chr3:51743265-51743284	None:intergenic	45.0%
!	ACTTTTGTCGGGGTTTGAGA+AGG	-	Chr3:51745472-51745491	MsG0380014240.01.T01:CDS	45.0%
!	ATTAGAGGGTGTGTCAAGCA+AGG	+	Chr3:51744620-51744639	None:intergenic	45.0%
!	CAACAAGTGTTGTTCGGAGT+GGG	+	Chr3:51743264-51743283	None:intergenic	45.0%
!	CGCCTTCTCTGTTTTCGATT+GGG	-	Chr3:51744765-51744784	MsG0380014240.01.T01:CDS	45.0%
!	CTTACACCACACTTTTGTCG+GGG	-	Chr3:51745462-51745481	MsG0380014240.01.T01:CDS	45.0%
!	TCGCCTTCTCTGTTTTCGAT+TGG	-	Chr3:51744764-51744783	MsG0380014240.01.T01:CDS	45.0%
!!	AGGTGAATGGGGGTATTAGA+GGG	+	Chr3:51744634-51744653	None:intergenic	45.0%
!!	CTTATCACTTGTTGTCGTCG+AGG	-	Chr3:51745159-51745178	MsG0380014240.01.T01:CDS	45.0%
!!	TGTTAGAGGTGGTTTGTTGG+AGG	-	Chr3:51745382-51745401	MsG0380014240.01.T01:CDS	45.0%
!!!	CGAATAGGCCTCTTGTTTTC+AGG	+	Chr3:51744412-51744431	None:intergenic	45.0%
!!!	TGCGGGTTTTGTTCCTGATA+GGG	-	Chr3:51745227-51745246	MsG0380014240.01.T01:CDS	45.0%
	AAAGGCTAGACGACCCAAAG+AGG	-	Chr3:51745281-51745300	MsG0380014240.01.T01:CDS	50.0%
	AAGCACGCTCTGTTTCCACA+AGG	+	Chr3:51746135-51746154	None:intergenic	50.0%
	ACCAGGGTTTACCAGAGTTG+GGG	+	Chr3:51744555-51744574	None:intergenic	50.0%
	ACTGTAACGAAGCACGGACA+CGG	+	Chr3:51743682-51743701	None:intergenic	50.0%
	CACAGGACCCTGAAAACAAG+AGG	-	Chr3:51744401-51744420	MsG0380014240.01.T01:CDS	50.0%
	CAGAAATGGCAGGATGAAGG+AGG	-	Chr3:51746435-51746454	MsG0380014240.01.T01:intron	50.0%
	CCGGCTTAAAGTTCAGATGG+TGG	-	Chr3:51745412-51745431	MsG0380014240.01.T01:CDS	50.0%
	CGAAAACAGAGAAGGCGAGT+TGG	+	Chr3:51744762-51744781	None:intergenic	50.0%
	CTCAAACCCCGACAAAAGTG+TGG	+	Chr3:51745471-51745490	None:intergenic	50.0%
	CTTGGCGAGGAGATTTACTC+CGG	-	Chr3:51746046-51746065	MsG0380014240.01.T01:intron	50.0%
	GACCAGGGTTTACCAGAGTT+GGG	+	Chr3:51744556-51744575	None:intergenic	50.0%
	GAGGTTTCAATGGCAGCAAC+GGG	-	Chr3:51743142-51743161	MsG0380014240.01.T01:CDS	50.0%
	GCATTCAGAGTAGTTAGGCC+AGG	+	Chr3:51746187-51746206	None:intergenic	50.0%
	GGAAACGCAGGAAACCTTAG+TGG	+	Chr3:51743223-51743242	None:intergenic	50.0%
	GGAGGTTTCAATGGCAGCAA+CGG	-	Chr3:51743141-51743160	MsG0380014240.01.T01:CDS	50.0%
	GGATGAGGTTGGGCAAAAAG+GGG	+	Chr3:51744673-51744692	None:intergenic	50.0%
	GGTGGAGAAAGGGATTAAGC+CGG	-	Chr3:51745430-51745449	MsG0380014240.01.T01:CDS	50.0%
	GTCAGAGGAGGATTTGGAGA+TGG	+	Chr3:51744533-51744552	None:intergenic	50.0%
	GTGGATGAGGTTGGGCAAAA+AGG	+	Chr3:51744675-51744694	None:intergenic	50.0%
	GTGTTGAGAACATGCTGACC+TGG	+	Chr3:51744598-51744617	None:intergenic	50.0%
	TCGTCGAGGTTCGTTGTATG+AGG	-	Chr3:51745173-51745192	MsG0380014240.01.T01:CDS	50.0%
	TGGAGATGGAGACACGAGTA+CGG	+	Chr3:51744519-51744538	None:intergenic	50.0%
	TTGAGAACATGCTGACCTGG+AGG	+	Chr3:51744595-51744614	None:intergenic	50.0%
	TTGAGGTCTGAGGGTTAGAG+TGG	+	Chr3:51743197-51743216	None:intergenic	50.0%
	TTTACCAGAGTTGGGGTCAG+AGG	+	Chr3:51744548-51744567	None:intergenic	50.0%
!!	AAGGATGAAAGCACTTGGCG+AGG	-	Chr3:51746033-51746052	MsG0380014240.01.T01:intron	50.0%
!!	CAAATGGACTCTGAAGTGGC+AGG	-	Chr3:51745707-51745726	MsG0380014240.01.T01:intron	50.0%
!!	GAGGTGAATGGGGGTATTAG+AGG	+	Chr3:51744635-51744654	None:intergenic	50.0%
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!!	TACAAGTGTCGGTGTCGTGT+CGG	+	Chr3:51743585-51743604	None:intergenic	50.0%
!!!	CTGCGGGTTTTGTTCCTGAT+AGG	-	Chr3:51745226-51745245	MsG0380014240.01.T01:CDS	50.0%
	AAACGAGTCGGGTGTGGATG+AGG	+	Chr3:51744688-51744707	None:intergenic	55.0%
	AACCATCACCTCTCTCCTCC+AGG	-	Chr3:51744577-51744596	MsG0380014240.01.T01:CDS	55.0%
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	AGTCGGGTGTGGATGAGGTT+GGG	+	Chr3:51744683-51744702	None:intergenic	55.0%
	ATCCGGGTTTGTGCCAGAGA+GGG	-	Chr3:51745751-51745770	MsG0380014240.01.T01:intron	55.0%
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	GCAGGATGAAGGAGGCTTTG+AGG	-	Chr3:51746443-51746462	MsG0380014240.01.T01:intron	55.0%
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	GGGCCGCAAGAAAACTGTCA+AGG	-	Chr3:51743908-51743927	MsG0380014240.01.T01:CDS	55.0%
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	GTTGGGGTCAGAGGAGGATT+TGG	+	Chr3:51744539-51744558	None:intergenic	55.0%
	TGGGTTGCATCTCGAAGGTG+TGG	+	Chr3:51743245-51743264	None:intergenic	55.0%
	TGTCGGGGTTTGAGAAGGCT+GGG	-	Chr3:51745477-51745496	MsG0380014240.01.T01:CDS	55.0%
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!	AGAGAGGTGATGGTTGGACC+AGG	+	Chr3:51744572-51744591	None:intergenic	55.0%
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!	GGGTTGCATCTCGAAGGTGT+GGG	+	Chr3:51743244-51743263	None:intergenic	55.0%
!	TGGAGGAGAGAGGTGATGGT+TGG	+	Chr3:51744578-51744597	None:intergenic	55.0%
!!	CTTGGCTCGAGGAGGGTTTT+GGG	-	Chr3:51745904-51745923	MsG0380014240.01.T01:intron	55.0%
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	CATGCTGACCTGGAGGAGAG+AGG	+	Chr3:51744588-51744607	None:intergenic	60.0%
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	GACCTGGAGGAGAGAGGTGA+TGG	+	Chr3:51744582-51744601	None:intergenic	60.0%
	GAGACACGAGTACGGGAGTG+AGG	+	Chr3:51744511-51744530	None:intergenic	60.0%
	GAGGAAGCAGGTGGTGTCCA+AGG	-	Chr3:51746225-51746244	MsG0380014240.01.T01:CDS	60.0%
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	GATCCGGGTTTGTGCCAGAG+AGG	-	Chr3:51745750-51745769	MsG0380014240.01.T01:intron	60.0%
	GTCCCTCTCTGGCACAAACC+CGG	+	Chr3:51745756-51745775	None:intergenic	60.0%
	TCCTCCTCTGACCCCAACTC+TGG	-	Chr3:51744541-51744560	MsG0380014240.01.T01:intron	60.0%
	TTCCTTGCTGGGAGAGACGG+TGG	+	Chr3:51743296-51743315	None:intergenic	60.0%
!	CTCGAAGGTGTGGGAAACGC+AGG	+	Chr3:51743235-51743254	None:intergenic	60.0%
!	TAGCTGCCTTGGCTCGAGGA+GGG	-	Chr3:51745897-51745916	MsG0380014240.01.T01:intron	60.0%
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!!	CCTTGGCTCGAGGAGGGTTT+TGG	-	Chr3:51745903-51745922	MsG0380014240.01.T01:intron	60.0%
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	CGAAGCACGGACACGGACAC+CGG	+	Chr3:51743675-51743694	None:intergenic	65.0%
	TGCCACCGTCTCTCCCAGCA+AGG	-	Chr3:51743291-51743310	MsG0380014240.01.T01:CDS	65.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
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Gene Sequence

>MsG0380014240.01.T01

ATGGAGGTTTCAATGGCAGCAACGGGACTATTATTCTCTACTACTACATCATCATCCACTCTAACCCTCAGACCTCAACAACCACTAAGGTTTCCTGCGTTTCCCACACCTTCGAGATGCAACCCACTCCGAACAACACTTGTTGTTACTTCTGCCACCGTCTCTCCCAGCAAGGAACACAATATTCAGGTTCAATTCAATAAACCCATTCTCTCCTTTTTCAATCTTTCATTTCATTCTGTCTGTGTCGTGTCCGGTGTCCGTGTCCGTGCTTCGTTACAGTACAAGACCATTCTTCATATTTTATTTTCAGACCCTGAAAACAAGAGGCCTATTCGCTTCGATGAGAACCTTAAGAAGGTCTTTGCAGGGAGAGATGAATTTGGTATGCTTGAGATTGCTGAGTTGACAAGTCCTCACTCCCGTACTCGTGTCTCCATCTCCAAATCCTCCTCTGACCCCAACTCTGGTAAACCCTGGTCCAACCATCACCTCTCTCCTCCAGGTCAGCATGTTCTCAACACCTTGCTTGACACACCCTCTAATACCCCCATTCACCTCAACAATATTCTCTCTCCCCTTTTTGCCCAACCTCATCCACACCCGACTCGTTTATCTCGTGATATTCTTGCTATTCTCAAAGCTTTAGGCTTTCGCAAAAAAACCCAACTCGCCTTCTCTGTTTTCGATTGGGCTCGCAACCATCAAGATTCTTCTAATCTTTTAACCGGTTCTGCTATTGCTGTTATTGTTAATATTCTTGGAAAAGCGGGTCGGGTTTCAACCGCTGCATCCTTGCTTAAAACACTCGAAAACGATGGGTTTGAGATTGATGTTTATGCTTATACTTGTTTGATAACTGCTTATGCTAGTAAAGGTCGGTATAATGATGCTGTTTCCGTGTTCAACAAAATGCAACGCGACGGTTGTACCCCTACTCTTGTTACTTACAATTCCATTTTGAATGTTTATGGCAAAATGGGTATGTCTTGGTCTCGTGTTACTGCCATTTTTGATTCTATGAAAACAAATGGAGTTGTTCCGGATTTGTATACTTATAATACACTTATCACTTGTTGTCGTCGAGGTTCGTTGTATGAGGAAGCTGTTAATGTGTTTGACCGGATTAAGTCTGCGGGTTTTGTTCCTGATAGGGTTACTTATAATGCGTTGTTAGATGTTTTTGCAAAGGCTAGACGACCCAAAGAGGCTTTGCAAGTTCTTAAAGATATGAAAGAAGCATCCCGGCTTAAAGTTCAGATGGTGGAGAAAGGGATTAAGCCGGATGTTTTTACTTACACCACACTTTTGTCGGGGTTTGAGAAGGCTGGGAAAGATGAGTTTGCTTTTCAAGTTTACGAAGAAATGAAAGCGGCGGGATGCAAACCGAATATTTGTACCTTTAATGCTCTTATCAAAATGCATGGTAATCGTGGAATGTTTGTGGAAATGATGAAAGTTTTTGACGAGATTAAGGAATGTGGGTGTTCTCCTGATATTGTTACTTGGAACACGCTTTTAGCTGTGTTTGGACAGAATCAAATGGACTCTGAAGTGGCAGGAGTATTTAAAGAGATGAAGAGATCCGGGTTTGTGCCAGAGAGGGACACTTTCAACACTTTAATTAGTGCATACAGCAGATGTGGTTCATTTGATCAAGCAATGGCTGTTTATAAAAGCATGCTGGAATCTGGAGTGTCTCCTGATCTCTCTACTTATAATGCTGTTTTAGCTGCCTTGGCTCGAGGAGGGTTTTGGGAACAGTCTGAGAAAATTATTGCTGAAATGAAGGATGGTCGGTGTAGACCGAATGAGCTAACATACTCTTCTCTACTTCATGCCTATGCCAATGGTAAGGAGATTGAAAGGATGAAAGCACTTGGCGAGGAGATTTACTCCGGCATTATTGAAATACATCCTGTTCTGTTGAAGACCCTTGTTCTAGTAAGTAGCAAGAGTGATCTCCTTGTGGAAACAGAGCGTGCTTTTTTTGAATTAAGGGAAAGAGGAATTACACCTGGCCTAACTACTCTGAATGCAATGATTTCAATATATGGGAGGAAGCAGGTGGTGTCCAAGGCCAATGAGATTTTGAACTTCATGTATGAGAATGGTTTTACTCCAAGTTTGACTACATATAATGGCTTGATGTATATGTACAGCCGTTCTGATAAGTTCCAAAAATCAGAAGAAATCTTAAGGGAAGTTCTGAAGAAAGGTATGAAACCGGATAAAATTTCATATAATACTGTTATTTACGCATATTGCAGAAATGGCAGGATGAAGGAGGCTTTGAGGATATTTTCTGAAATGAAAGATTCTGCACTTGTTCCAAATGTTGTAACTTACAACACATTTGTTGCAACTTATGCTGCTGACTCAATGTTTGTTGAGGCTATCGATGTTATTCGATACATGATCAAGCAAGGATGTAGGCCTGACCAAAATACTTATAACTCCATCGTTGATTGGTATTGTAAGCACAGCCGGCAAGATGAAGCAAACAGTTTCGTGAAAAACCTTGGTAATATCGACCCACATGTTTCCAAGGAGGAGAAAAGTAGGTTACTGAAGAGAATGGCAAGGGAATTGCCATGA

Protein sequence

>MsG0380014240.01.T01

MEVSMAATGLLFSTTTSSSTLTLRPQQPLRFPAFPTPSRCNPLRTTLVVTSATVSPSKEHNIQVQFNKPILSFFNLSFHSVCVVSGVRVRASLQYKTILHILFSDPENKRPIRFDENLKKVFAGRDEFGMLEIAELTSPHSRTRVSISKSSSDPNSGKPWSNHHLSPPGQHVLNTLLDTPSNTPIHLNNILSPLFAQPHPHPTRLSRDILAILKALGFRKKTQLAFSVFDWARNHQDSSNLLTGSAIAVIVNILGKAGRVSTAASLLKTLENDGFEIDVYAYTCLITAYASKGRYNDAVSVFNKMQRDGCTPTLVTYNSILNVYGKMGMSWSRVTAIFDSMKTNGVVPDLYTYNTLITCCRRGSLYEEAVNVFDRIKSAGFVPDRVTYNALLDVFAKARRPKEALQVLKDMKEASRLKVQMVEKGIKPDVFTYTTLLSGFEKAGKDEFAFQVYEEMKAAGCKPNICTFNALIKMHGNRGMFVEMMKVFDEIKECGCSPDIVTWNTLLAVFGQNQMDSEVAGVFKEMKRSGFVPERDTFNTLISAYSRCGSFDQAMAVYKSMLESGVSPDLSTYNAVLAALARGGFWEQSEKIIAEMKDGRCRPNELTYSSLLHAYANGKEIERMKALGEEIYSGIIEIHPVLLKTLVLVSSKSDLLVETERAFFELRERGITPGLTTLNAMISIYGRKQVVSKANEILNFMYENGFTPSLTTYNGLMYMYSRSDKFQKSEEILREVLKKGMKPDKISYNTVIYAYCRNGRMKEALRIFSEMKDSALVPNVVTYNTFVATYAADSMFVEAIDVIRYMIKQGCRPDQNTYNSIVDWYCKHSRQDEANSFVKNLGNIDPHVSKEEKSRLLKRMARELP*