AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene020426

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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GAAATTTCTTGAACAATAAT+TGG 0.158024 3.3:+82799044 None:intergenic
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TCTGGCCTTGCCTTTGAAAT+AGG 0.222999 3.3:-82801379 MS.gene020426:intron
GTGATCACTCAGGCTATTTC+AGG 0.228981 3.3:-82786640 MS.gene020426:intron
CTTTCAGACAAAATGTGTTT+TGG 0.232652 3.3:+82796975 None:intergenic
TCCATTGTGCAGTTCCTTCC+TGG 0.242720 3.3:-82801578 MS.gene020426:CDS
TGTGGCCTCAATAGCAAATT+TGG 0.253583 3.3:+82799504 None:intergenic
CCAAGGACTTCCGTTGGATT+TGG 0.262567 3.3:+82786571 None:intergenic
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GGCTATTTCAGGAGTTAATA+TGG 0.286850 3.3:-82786629 MS.gene020426:CDS
ATATTTCCTTTCTGCCTATT+GGG 0.295205 3.3:-82785514 MS.gene020426:CDS
AGTGCCATGCCATGATTAAA+TGG 0.313993 3.3:+82797162 None:intergenic
TGGTGTTGGCCTTATGAATA+AGG 0.319668 3.3:+82786539 None:intergenic
TTCAGGGAAGTATAGGAAAA+TGG 0.324426 3.3:-82785341 MS.gene020426:intron
ATCGTCACTTGGTGCTGTTA+TGG 0.339839 3.3:+82797197 None:intergenic
TCGTCACTTGGTGCTGTTAT+GGG 0.342595 3.3:+82797198 None:intergenic
TGATATGTTAGTTCCATTCA+TGG 0.351362 3.3:-82785098 MS.gene020426:CDS
ACCCAGTTTCGAGTAGAAAA+AGG 0.354070 3.3:+82801539 None:intergenic
CCTCTCTTGCTTTGGCTAAC+CGG 0.354261 3.3:-82801424 MS.gene020426:CDS
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CCTGGTTGCTCTGCTTTCTC+TGG 0.363794 3.3:-82801397 MS.gene020426:CDS
TCCTCTTTATTAAATGATAG+TGG 0.366917 3.3:+82799543 None:intergenic
GGCAAACGAAACTCGCAATT+CGG 0.368962 3.3:+82786592 None:intergenic
AAATGGAAGCGTTGTGACTA+TGG 0.369341 3.3:-82785324 MS.gene020426:CDS
CAAGGCTCGGTTGGCATCAC+AGG 0.375971 3.3:-82801682 MS.gene020426:CDS
ATTGTCGTCGTTGGCCCAAT+AGG 0.385707 3.3:+82785500 None:intergenic
TTGGATTTGCCTGTGGGTAC+TGG 0.395039 3.3:-82799324 MS.gene020426:CDS
GTTTACCAAATTTGCTATTG+AGG 0.416688 3.3:-82799509 MS.gene020426:CDS
TTTGCAATTCAGGGAAGTAT+AGG 0.417087 3.3:-82785348 MS.gene020426:intron
ACTATTCTATCATCGATGAT+TGG 0.422714 3.3:-82785048 MS.gene020426:CDS
ACGAAGATCCTCTCTTGCTT+TGG 0.432410 3.3:-82801432 MS.gene020426:CDS
ATTGTTCAAGAAATTTCATC+AGG 0.432442 3.3:-82799038 MS.gene020426:intron
CCAAATCCAACGGAAGTCCT+TGG 0.437491 3.3:-82786571 MS.gene020426:CDS
CTTTGGCTAACCGGTGGTCC+TGG 0.437882 3.3:-82801415 MS.gene020426:CDS
GCTATCGTTCATTAATATAC+AGG 0.447112 3.3:-82785239 MS.gene020426:intron
GGCTTACCTCCTCGTAGGAT+TGG 0.448667 3.3:+82796948 None:intergenic
CATGTAAATCTTAGCAGAAA+AGG 0.449874 3.3:-82785261 MS.gene020426:CDS
CATTCTTCAGGTTTGTACTC+TGG 0.453945 3.3:+82784610 None:intergenic
CAAGCTTGAGTCGCCATGAA+TGG 0.457327 3.3:+82785085 None:intergenic
TGCATGCATACCCTGCAACT+TGG 0.459563 3.3:+82785005 None:intergenic
TGCTATTGAGGCCACATTCG+TGG 0.462565 3.3:-82799497 MS.gene020426:CDS
GAGGAGACTCCTTATTCATA+AGG 0.465408 3.3:-82786548 MS.gene020426:CDS
TTTATTTAGGGATACATACT+TGG 0.469891 3.3:-82797225 MS.gene020426:intron
GCATGCATACCCTGCAACTT+GGG 0.473113 3.3:+82785006 None:intergenic
TCCACTATCATTTAATAAAG+AGG 0.473116 3.3:-82799544 MS.gene020426:CDS
TGCAAAGACAAGATAGGAAG+AGG 0.476020 3.3:+82801610 None:intergenic
TGGCGACTCAAGCTTGGATA+AGG 0.476293 3.3:-82785078 MS.gene020426:CDS
GAGGCCACATTCGTGGACTA+AGG 0.477225 3.3:-82799490 MS.gene020426:intron
CATTCATGGCGACTCAAGCT+TGG 0.480052 3.3:-82785084 MS.gene020426:CDS
TGATGTTGCAAAGACAAGAT+AGG 0.480679 3.3:+82801604 None:intergenic
CATTGCTGGTGACTCATACT+CGG 0.481483 3.3:-82799078 MS.gene020426:CDS
CAAATCCAACGGAAGTCCTT+GGG 0.483918 3.3:-82786570 MS.gene020426:CDS
TCAAATGAAGTGTACATTGC+TGG 0.486070 3.3:-82799092 MS.gene020426:CDS
TACAGAATACCATTTAATCA+TGG 0.487451 3.3:-82797171 MS.gene020426:CDS
TATAGTGTTACCTATTTCAA+AGG 0.490680 3.3:+82801369 None:intergenic
ATGAAGGTGGTCTTCAACCG+TGG 0.492407 3.3:-82797399 MS.gene020426:CDS
CAAAGCACTGCACATTCAAA+AGG 0.494581 3.3:-82785472 MS.gene020426:intron
ATGATACTCAAAACTGCTAA+GGG 0.496441 3.3:+82785281 None:intergenic
CATGATACTCAAAACTGCTA+AGG 0.496902 3.3:+82785280 None:intergenic
ATTGCCACATTTGACCTGTC+GGG 0.497636 3.3:-82786497 MS.gene020426:intron
ATTGCTGGTGACTCATACTC+GGG 0.500332 3.3:-82799077 MS.gene020426:CDS
TTTGCGAACATTGTCGTCGT+TGG 0.502052 3.3:+82785491 None:intergenic
TGCTCATCAATTTCTTAGGA+AGG 0.511515 3.3:-82799241 MS.gene020426:intron
AGCAAGAGAGGATCTTCGTT+AGG 0.515445 3.3:+82801436 None:intergenic
AGCATTGTGAGCTAGCTTCA+AGG 0.516727 3.3:+82799260 None:intergenic
GTTTCAAGAAGTTACCCGAC+AGG 0.526929 3.3:+82786483 None:intergenic
CTCCTCCCAAGGACTTCCGT+TGG 0.528793 3.3:+82786565 None:intergenic
GGAAGAGGGCCTTCAAAACC+AGG 0.530480 3.3:+82801560 None:intergenic
CATTGCCACATTTGACCTGT+CGG 0.533372 3.3:-82786498 MS.gene020426:CDS
TCAACCGTGGGTAAACCTCC+AGG 0.538154 3.3:-82797386 MS.gene020426:intron
CCAGAGAAAGCAGAGCAACC+AGG 0.549843 3.3:+82801397 None:intergenic
ATTCTATCATCGATGATTGG+AGG 0.553565 3.3:-82785045 MS.gene020426:CDS
AGCAGAGCAACCAGGACCAC+CGG 0.561403 3.3:+82801405 None:intergenic
CGTTGGCCCAATAGGCAGAA+AGG 0.562203 3.3:+82785508 None:intergenic
TGTTACCTATTTCAAAGGCA+AGG 0.572107 3.3:+82801374 None:intergenic
CTAAGGGGTTCGTACTTGAA+AGG 0.575311 3.3:+82785297 None:intergenic
TCATCGATGATTGGAGGCAA+TGG 0.575445 3.3:-82785039 MS.gene020426:CDS
AGATATCCACCTACTGAACA+TGG 0.576385 3.3:+82784582 None:intergenic
CCGGTTAGCCAAAGCAAGAG+AGG 0.586525 3.3:+82801424 None:intergenic
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CRISPR-GE

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