AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880044638.01


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MsG0880044638.01.T01 AT1G67520 43.249 511 215 13 366 817 324 818 5.11e-116 371
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MsG0880044638.01.T01 AT3G16030 31.734 646 343 15 20 595 19 636 4.16e-76 260
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MsG0880044638.01.T01 AT1G53440 42.815 341 191 4 449 787 608 946 7.64e-75 264
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MsG0880044638.01.T01 AT1G56130 44.872 312 163 4 476 781 657 965 7.25e-72 255
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MsG0880044638.01.T01 AT5G40380 47.143 280 127 4 447 715 252 521 1.41e-67 234
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MsG0880044638.01.T01 AT4G23210 60.112 178 69 1 495 672 348 523 5.01e-61 216
MsG0880044638.01.T01 AT4G23210 60.112 178 69 1 495 672 348 523 6.12e-61 216
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MsG0880044638.01.T01 AT1G07870 43.945 289 157 5 495 779 91 378 1.67e-60 214
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MsG0880044638.01.T01 AT1G68690 42.759 290 151 5 494 775 364 646 2.11e-60 218
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MsG0880044638.01.T01 AT1G55200 39.604 303 178 4 495 796 367 665 2.47e-59 214
MsG0880044638.01.T01 AT1G55200 39.604 303 178 4 495 796 367 665 2.47e-59 214
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MsG0880044638.01.T01 AT2G18470 39.249 293 167 4 495 781 272 559 4.41e-58 210
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MsG0880044638.01.T01 AT5G56890 38.994 318 172 7 473 785 701 1001 1.22e-57 214
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MsG0880044638.01.T01 AT4G34440 39.863 291 170 4 494 781 299 587 4.88e-57 207
MsG0880044638.01.T01 AT1G60800 39.172 314 185 5 495 804 289 600 6.62e-57 206
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MsG0880044638.01.T01 AT4G21400 51.152 217 76 2 486 672 340 556 7.17e-57 205
MsG0880044638.01.T01 AT3G13380 41.216 296 165 4 489 778 840 1132 8.50e-57 212
MsG0880044638.01.T01 AT5G13160 41.869 289 163 5 495 779 74 361 1.20e-56 201
MsG0880044638.01.T01 AT3G13690 38.699 292 176 3 494 784 398 687 1.33e-56 208
MsG0880044638.01.T01 AT3G13690 38.699 292 176 3 494 784 398 687 1.33e-56 208
MsG0880044638.01.T01 AT3G13690 38.699 292 176 3 494 784 398 687 1.33e-56 208
MsG0880044638.01.T01 AT1G20650 40.594 303 164 7 495 789 66 360 1.58e-56 199
MsG0880044638.01.T01 AT3G02810 39.241 316 178 6 492 802 49 355 1.71e-56 204
MsG0880044638.01.T01 AT1G01540 36.677 319 184 4 467 784 130 431 1.79e-56 201
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MsG0880044638.01.T01 AT5G37450 40.214 281 153 5 495 769 619 890 2.06e-52 197
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MsG0880044638.01.T01 AT2G35620 38.384 297 178 4 491 787 289 580 2.33e-52 192
MsG0880044638.01.T01 AT2G35620 38.384 297 178 4 491 787 289 580 2.33e-52 192
MsG0880044638.01.T01 AT1G69730 36.770 291 182 2 494 783 434 723 2.35e-52 196
MsG0880044638.01.T01 AT5G37450 40.214 281 153 5 495 769 643 914 2.72e-52 197
MsG0880044638.01.T01 AT2G48010 36.129 310 189 4 488 790 264 571 3.04e-52 193
MsG0880044638.01.T01 AT2G39360 38.129 278 170 2 495 771 475 751 3.18e-52 196
MsG0880044638.01.T01 AT4G30520 37.500 368 204 10 470 817 253 614 3.71e-52 193
MsG0880044638.01.T01 AT3G15890 35.179 307 194 2 476 781 12 314 4.61e-52 186
MsG0880044638.01.T01 AT5G01540 40.824 267 147 4 520 782 380 639 5.95e-52 193
MsG0880044638.01.T01 AT5G15730 36.066 305 177 6 474 774 79 369 6.98e-52 187
MsG0880044638.01.T01 AT1G17910 34.797 296 189 3 494 788 441 733 7.62e-52 194
MsG0880044638.01.T01 AT5G63710 36.127 346 206 7 454 786 192 535 8.85e-52 191
MsG0880044638.01.T01 AT5G63710 36.127 346 206 7 454 786 192 535 8.85e-52 191
MsG0880044638.01.T01 AT5G48740 34.615 364 221 6 423 778 523 877 9.85e-52 195
MsG0880044638.01.T01 AT5G11020 35.880 301 189 2 476 775 49 346 1.23e-51 185
MsG0880044638.01.T01 AT5G40380 45.887 231 106 2 447 666 252 474 1.41e-51 188
MsG0880044638.01.T01 AT3G45420 35.224 335 205 6 479 807 319 647 1.49e-51 192
MsG0880044638.01.T01 AT1G21230 34.682 346 201 6 452 780 343 680 1.56e-51 193
MsG0880044638.01.T01 AT2G23950 35.135 370 207 9 429 783 222 573 1.77e-51 191
MsG0880044638.01.T01 AT5G16500 38.006 321 184 7 487 802 54 364 2.03e-51 191
MsG0880044638.01.T01 AT5G63710 36.127 346 206 7 454 786 227 570 2.11e-51 191
MsG0880044638.01.T01 AT1G31420 38.721 297 178 4 491 787 291 583 2.19e-51 190
MsG0880044638.01.T01 AT1G31420 38.721 297 178 4 491 787 291 583 2.19e-51 190
MsG0880044638.01.T01 AT5G11020 35.880 301 189 2 476 775 72 369 2.31e-51 185
MsG0880044638.01.T01 AT1G52540 34.234 333 202 6 487 810 20 344 2.38e-51 184
MsG0880044638.01.T01 AT5G11020 35.880 301 189 2 476 775 76 373 2.44e-51 185
MsG0880044638.01.T01 AT2G28590 46.930 228 114 5 495 719 86 309 2.62e-51 182
MsG0880044638.01.T01 AT1G52540 34.234 333 202 6 487 810 17 341 2.68e-51 183
MsG0880044638.01.T01 AT5G63710 36.127 346 206 7 454 786 228 571 2.84e-51 190
MsG0880044638.01.T01 AT5G54380 35.276 326 200 5 495 811 498 821 2.85e-51 193
MsG0880044638.01.T01 AT1G31420 38.384 297 178 4 491 787 291 582 2.99e-51 189
MsG0880044638.01.T01 AT5G11020 35.880 301 189 2 476 775 110 407 4.14e-51 185
MsG0880044638.01.T01 AT2G17220 38.361 305 167 7 490 779 69 367 5.15e-51 184
MsG0880044638.01.T01 AT2G17220 38.361 305 167 7 490 779 70 368 5.27e-51 184
MsG0880044638.01.T01 AT3G17420 35.202 321 190 5 468 787 131 434 6.18e-51 186
MsG0880044638.01.T01 AT1G79680 35.216 301 193 2 494 793 420 719 7.98e-51 191
MsG0880044638.01.T01 AT4G39110 35.312 320 199 4 495 810 514 829 8.96e-51 192
MsG0880044638.01.T01 AT5G39000 37.500 288 176 3 495 778 506 793 9.88e-51 192
MsG0880044638.01.T01 AT2G25220 37.943 282 172 2 495 775 85 364 1.34e-50 182
MsG0880044638.01.T01 AT1G79620 39.373 287 161 4 495 775 626 905 1.94e-50 192
MsG0880044638.01.T01 AT1G79620 39.373 287 161 4 495 775 652 931 2.29e-50 192
MsG0880044638.01.T01 AT2G25220 37.943 282 172 2 495 775 139 418 2.65e-50 183
MsG0880044638.01.T01 AT2G25220 37.943 282 172 2 495 775 134 413 2.83e-50 183
MsG0880044638.01.T01 AT4G31110 35.017 297 188 4 494 788 418 711 2.89e-50 189
MsG0880044638.01.T01 AT4G17660 37.294 303 174 7 484 775 68 365 2.99e-50 182
MsG0880044638.01.T01 AT4G31110 35.017 297 188 4 494 788 440 733 3.49e-50 189
MsG0880044638.01.T01 AT5G53890 36.879 282 176 2 495 775 742 1022 3.70e-50 191
MsG0880044638.01.T01 AT4G39400 37.374 297 173 4 489 778 865 1155 3.91e-50 191
MsG0880044638.01.T01 AT5G02070 39.041 292 165 5 494 774 350 639 4.63e-50 187
MsG0880044638.01.T01 AT1G69790 38.111 307 163 9 490 779 67 363 5.03e-50 181
MsG0880044638.01.T01 AT1G71830 37.654 324 180 8 478 783 262 581 5.30e-50 187
MsG0880044638.01.T01 AT5G38990 37.153 288 177 3 495 778 513 800 5.33e-50 190
MsG0880044638.01.T01 AT1G69790 38.111 307 163 9 490 779 56 352 5.93e-50 181
MsG0880044638.01.T01 AT1G21210 33.140 344 205 6 452 778 345 680 7.34e-50 188
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MsG0880044638.01.T01 AT1G07570 37.049 305 177 7 488 779 49 351 7.85e-50 181
MsG0880044638.01.T01 AT1G07570 37.049 305 177 7 488 779 49 351 7.85e-50 181
MsG0880044638.01.T01 AT1G07570 37.049 305 177 7 488 779 49 351 7.85e-50 181
MsG0880044638.01.T01 AT5G60320 36.393 305 186 5 479 779 317 617 1.15e-49 186
MsG0880044638.01.T01 AT2G21480 37.000 300 181 5 495 789 513 809 1.41e-49 189
MsG0880044638.01.T01 AT3G53590 33.824 340 208 8 447 780 564 892 1.52e-49 189
MsG0880044638.01.T01 AT1G07570 37.049 305 177 7 488 779 60 362 1.54e-49 181
MsG0880044638.01.T01 AT1G16110 44.444 216 117 2 494 707 419 633 1.56e-49 186
MsG0880044638.01.T01 AT1G67720 38.596 285 172 2 495 779 596 877 1.75e-49 189
MsG0880044638.01.T01 AT5G63930 35.112 356 206 10 437 778 670 1014 1.93e-49 189
MsG0880044638.01.T01 AT5G63930 35.112 356 206 10 437 778 734 1078 2.30e-49 189
MsG0880044638.01.T01 AT5G65530 36.634 303 183 4 495 794 132 428 2.33e-49 181
MsG0880044638.01.T01 AT1G21240 36.301 292 177 3 491 778 399 685 3.01e-49 186
MsG0880044638.01.T01 AT5G54590 37.063 286 166 5 495 778 103 376 3.15e-49 180
MsG0880044638.01.T01 AT5G54590 37.063 286 166 5 495 778 103 376 3.15e-49 180
MsG0880044638.01.T01 AT5G54590 37.063 286 166 5 495 778 103 376 3.15e-49 180
MsG0880044638.01.T01 AT2G13800 38.851 296 170 5 495 783 146 437 3.58e-49 181
MsG0880044638.01.T01 AT2G13800 38.851 296 170 5 495 783 146 437 3.58e-49 181
MsG0880044638.01.T01 AT4G34500 35.690 297 187 3 495 788 133 428 3.77e-49 180

Find 160 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 230 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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TCCAACCAATTTCCTTGTTT+TGG 0.207126 8:-46084034 None:intergenic
CTCCCCTTTAGGAAATTTAC+AGG 0.225201 8:+46082141 MsG0880044638.01.T01:CDS
TTCCATTGTCCAGGAAATTT+AGG 0.241789 8:-46082313 None:intergenic
TAGCAACGCCAGCAATAATA+TGG 0.251053 8:-46083864 None:intergenic
CAAAGTCCCTTCTTCAGAAT+TGG 0.257527 8:+46082624 MsG0880044638.01.T01:CDS
TTATATAAACTCTCCCCTTT+AGG 0.258094 8:+46082130 MsG0880044638.01.T01:CDS
TGAAGCCAAAACAAGGAAAT+TGG 0.269793 8:+46084029 MsG0880044638.01.T01:CDS
AATTCAAGAGGAAGATATTT+AGG 0.272185 8:+46081533 MsG0880044638.01.T01:CDS
AAACTTGGGGAAGGTGGATT+TGG 0.277862 8:+46083401 MsG0880044638.01.T01:CDS
TATCTTCCTCTTGAATTTCC+TGG 0.277969 8:-46081527 None:intergenic
AGCTTAGACTACTTCATCTT+TGG 0.284529 8:+46083706 MsG0880044638.01.T01:CDS
CACCTTCCCCAAGTTTATTT+CGG 0.287220 8:-46083394 None:intergenic
GGTTATGTTCCTAAATTTCC+TGG 0.293829 8:+46082304 MsG0880044638.01.T01:CDS
GTCTTAAAACTCAATGAAAA+TGG 0.295589 8:+46081635 MsG0880044638.01.T01:CDS
CCAGTTGCTTTAACAATGAT+TGG 0.295657 8:-46083359 None:intergenic
ACACCACTGCACAATAATTT+AGG 0.296503 8:+46081611 MsG0880044638.01.T01:CDS
GCAACCCAAACAACTGTTAA+AGG 0.307534 8:-46081578 None:intergenic
CTGACATTCCACAAGGTTCA+TGG 0.314018 8:-46082464 None:intergenic
ACAGAATAAACTCCCTTTGC+TGG 0.315796 8:-46081908 None:intergenic
CCAATCATTGTTAAAGCAAC+TGG 0.316714 8:+46083359 MsG0880044638.01.T01:CDS
TGGATTTGGACCAGTTTATA+AGG 0.317075 8:+46083415 MsG0880044638.01.T01:CDS
CGTAATCTTGTGAAGCTTCT+CGG 0.323117 8:+46083628 MsG0880044638.01.T01:CDS
TTCCATAACTGCACAGCTAT+TGG 0.325458 8:+46081730 MsG0880044638.01.T01:CDS
TAACCCCTTTAACAGTTGTT+TGG 0.331429 8:+46081573 MsG0880044638.01.T01:CDS
GTATAAAATCCCGGAGCTTT+CGG 0.334220 8:-46084574 None:intergenic
ACTAAACACATCTGATTTCA+TGG 0.335581 8:-46084183 None:intergenic
AACCCCTTTAACAGTTGTTT+GGG 0.336474 8:+46081574 MsG0880044638.01.T01:CDS
GAACACTCTCTCAACCTTCT+TGG 0.336914 8:+46084266 MsG0880044638.01.T01:CDS
AACAACCACTTCCTCCATTT+CGG 0.341467 8:-46082537 None:intergenic
ACAGTTGCCGTGATAATTTC+AGG 0.350976 8:+46082970 MsG0880044638.01.T01:CDS
AATTGATTGTTTCAAGTAAG+TGG 0.355154 8:-46084432 None:intergenic
GAAGTAGTCTAAGCTCCTAT+TGG 0.355975 8:-46083698 None:intergenic
CAACCCAAACAACTGTTAAA+GGG 0.358389 8:-46081577 None:intergenic
CTTGGATGGAACTTAGTAAC+TGG 0.359594 8:+46081845 MsG0880044638.01.T01:CDS
ACCGACTTCAAAAGTTCCTT+TGG 0.366422 8:-46081495 None:intergenic
AAATCAGATGTGTTTAGTTT+CGG 0.367177 8:+46084188 MsG0880044638.01.T01:CDS
ATGATTGGAAAACTAAATAT+TGG 0.367799 8:-46083344 None:intergenic
GGCAATGTTACCTTATAAAC+TGG 0.376555 8:-46083425 None:intergenic
TCTGTAAACATTGACATTAG+AGG 0.386408 8:+46081926 MsG0880044638.01.T01:CDS
TTCCATCCAAGCTTCATTCC+CGG 0.394401 8:-46081833 None:intergenic
GTCCAATAGCTGTGCAGTTA+TGG 0.396727 8:-46081732 None:intergenic
AAGCCTGTAAATTTCCTAAA+GGG 0.404250 8:-46082144 None:intergenic
GCAGTTATGGAATTATTTGC+TGG 0.406293 8:-46081719 None:intergenic
AAGCGTTCCCATATTATTGC+TGG 0.406312 8:+46083856 MsG0880044638.01.T01:CDS
TTTCATAGGCATGGAGACTC+TGG 0.406551 8:+46084377 MsG0880044638.01.T01:intron
GGCTAATTCTGTATGCAATA+TGG 0.408378 8:+46082249 MsG0880044638.01.T01:CDS
AAAGTCCCTTCTTCAGAATT+GGG 0.409992 8:+46082625 MsG0880044638.01.T01:CDS
AAACTAAATATTGGTAGATC+AGG 0.415406 8:-46083335 None:intergenic
AAGAAGGTTGAGAGAGTGTT+CGG 0.420085 8:-46084264 None:intergenic
TCTGTGAATTATTCTAAGTC+TGG 0.420258 8:-46083914 None:intergenic
ATCATCTTGCACCATTTCAA+TGG 0.421882 8:+46083279 MsG0880044638.01.T01:CDS
TACCATGTAGAAGACGTATC+TGG 0.427069 8:-46082433 None:intergenic
ATTGACATCTCATTTGAAGT+TGG 0.438636 8:-46084625 None:intergenic
TTTGTAATTCTTATGTTGAA+TGG 0.439031 8:+46084532 MsG0880044638.01.T01:CDS
ATCTTACGATATATACATGT+TGG 0.440759 8:+46084463 MsG0880044638.01.T01:CDS
GACAATGGAATATATCATAT+TGG 0.444285 8:+46082326 MsG0880044638.01.T01:CDS
TATCCATGATGGCCAGACTT+TGG 0.445952 8:+46081466 MsG0880044638.01.T01:CDS
TGCTGGTTTGTTTGATGCAT+CGG 0.448416 8:-46081702 None:intergenic
AAGTAGTCTAAGCTCCTATT+GGG 0.448553 8:-46083697 None:intergenic
ACGACACAAACAACGCCATT+TGG 0.454251 8:+46081675 MsG0880044638.01.T01:CDS
TCTATGAATACATGCCCAAT+AGG 0.454260 8:+46083683 MsG0880044638.01.T01:CDS
CTTTGGCTGAAACCAAAGTC+TGG 0.460613 8:-46081478 None:intergenic
GAGGAAGTGGTTGTTTACTT+TGG 0.467078 8:+46082545 MsG0880044638.01.T01:CDS
ACAAATGTGGATATCCGAAA+TGG 0.467619 8:+46082523 MsG0880044638.01.T01:CDS
GAAATTTACAGGCTTTAGCT+TGG 0.468157 8:+46082152 MsG0880044638.01.T01:CDS
TTTCTAGCCGAAATAAACTT+GGG 0.474207 8:+46083387 MsG0880044638.01.T01:CDS
TTATTCTAAGTCTGGAGTCT+TGG 0.474766 8:-46083906 None:intergenic
TCTTACGATATATACATGTT+GGG 0.476315 8:+46084464 MsG0880044638.01.T01:CDS
ATTGTCTCAGCCGAAAGCTC+CGG 0.479091 8:+46084564 MsG0880044638.01.T01:CDS
AATTTACCCAATTCTGAAGA+AGG 0.479284 8:-46082631 None:intergenic
TCCGTATCAACTGCTGCCTC+TGG 0.479895 8:-46082945 None:intergenic
CAGACTTTGGTTTCAGCCAA+AGG 0.482636 8:+46081479 MsG0880044638.01.T01:CDS
AGAATTACAAATGACATGTC+TGG 0.482732 8:-46084520 None:intergenic
CGAGAAGCTTCACAAGATTA+CGG 0.484287 8:-46083627 None:intergenic
TGAAACTAGAAGCAAACTCT+TGG 0.489705 8:+46083825 MsG0880044638.01.T01:CDS
GTGCAGTGGTGTTTCTCTGT+TGG 0.490158 8:-46081600 None:intergenic
GAAAGGATAGTGATTGATAC+AGG 0.492500 8:+46082190 MsG0880044638.01.T01:CDS
TCCTCAACTAGTTATTATGA+AGG 0.493533 8:+46081952 MsG0880044638.01.T01:CDS
CTCCACAAAATGTCCGAGCC+AGG 0.493772 8:-46083999 None:intergenic
AAACCAAAGTCTGGCCATCA+TGG 0.493923 8:-46081469 None:intergenic
TTGTCTCAGCCGAAAGCTCC+GGG 0.498816 8:+46084565 MsG0880044638.01.T01:CDS
AAAGCCTGTAAATTTCCTAA+AGG 0.499864 8:-46082145 None:intergenic
GTGATAGTTACGCGATGTGT+GGG 0.502760 8:+46082227 MsG0880044638.01.T01:CDS
TGATGCATCGGAGGACCAAA+TGG 0.503846 8:-46081690 None:intergenic
TCCATGTGATACATTACTGC+CGG 0.507158 8:+46081814 MsG0880044638.01.T01:CDS
TCTGTGATAAGATTGAGAAT+AGG 0.512304 8:+46081977 MsG0880044638.01.T01:CDS
AGAAGGTTGAGAGAGTGTTC+GGG 0.513342 8:-46084263 None:intergenic
TCTCAGACTTTGGCCTGGCT+CGG 0.515424 8:+46083986 MsG0880044638.01.T01:CDS
GAGGAAGATATTTAGGTATG+TGG 0.520293 8:+46081540 MsG0880044638.01.T01:CDS
CGACCATGCACAGCATACTC+TGG 0.520753 8:-46084155 None:intergenic
ACCAGAGGCAGCAGTTGATA+CGG 0.522888 8:+46082944 MsG0880044638.01.T01:CDS
CGAAATAAACTTGGGGAAGG+TGG 0.523108 8:+46083395 MsG0880044638.01.T01:CDS
GAAAAGAGGTAGCCATAAAA+CGG 0.523625 8:+46083533 MsG0880044638.01.T01:CDS
ATCATGGATAGATTGATTCA+AGG 0.524279 8:-46081453 None:intergenic
GACATGTCTGGTCTATCTCC+CGG 0.526809 8:-46084508 None:intergenic
TTACTGCCGGGAATGAAGCT+TGG 0.527048 8:+46081827 MsG0880044638.01.T01:CDS
GAAGTCGGTTTCTTTAGTCC+AGG 0.529205 8:+46081509 MsG0880044638.01.T01:CDS
TATGATATATTCCATTGTCC+AGG 0.535511 8:-46082322 None:intergenic
TTCCTAAATTTCCTGGACAA+TGG 0.538648 8:+46082311 MsG0880044638.01.T01:CDS
TAGTTTCGGAGTAATAGTAT+TGG 0.544058 8:+46084202 MsG0880044638.01.T01:CDS
AGCAACGCCAGCAATAATAT+GGG 0.544885 8:-46083863 None:intergenic
TGCCGGGAATGAAGCTTGGA+TGG 0.546043 8:+46081831 MsG0880044638.01.T01:CDS
GCCAAAACAAGGAAATTGGT+TGG 0.552146 8:+46084033 MsG0880044638.01.T01:CDS
CCCCTTCCAGTATAAAATCC+CGG 0.552398 8:-46084583 None:intergenic
TTGCACTTACATGGCCAAGA+AGG 0.553316 8:-46084280 None:intergenic
CCATGTGATACATTACTGCC+GGG 0.556253 8:+46081815 MsG0880044638.01.T01:CDS
ATAGTAATATTTATAAAGAG+AGG 0.557017 8:+46083012 MsG0880044638.01.T01:CDS
ATTTACCCAATTCTGAAGAA+GGG 0.557202 8:-46082630 None:intergenic
TTGAATCAATCTATCCATGA+TGG 0.558297 8:+46081455 MsG0880044638.01.T01:CDS
TAGTATTGGAGATAATAAGC+GGG 0.560530 8:+46084216 MsG0880044638.01.T01:CDS
CCCGGCAGTAATGTATCACA+TGG 0.562967 8:-46081815 None:intergenic
TACCCTGATAGGTGGAAAAG+AGG 0.566932 8:+46083519 MsG0880044638.01.T01:CDS
GGTTAAACTGTCAAGTGAAG+TGG 0.575017 8:-46081432 None:intergenic
ATTATTGCTGGCGTTGCTAG+AGG 0.575274 8:+46083868 MsG0880044638.01.T01:CDS
CTGGATTGATAACATGGCAA+TGG 0.579000 8:+46084396 MsG0880044638.01.T01:CDS
AATGTCTGATCAAGGGTTGG+AGG 0.582335 8:+46083564 MsG0880044638.01.T01:CDS
TGTGGAAACAATAACACAAG+TGG 0.582862 8:+46082382 MsG0880044638.01.T01:CDS
TGTGAACAATTGTTCATGTA+CGG 0.583338 8:+46082495 MsG0880044638.01.T01:CDS
AATATATCATATTGGTCTAG+TGG 0.585028 8:+46082334 MsG0880044638.01.T01:CDS
TAAACATGTTTGAATCGTCG+TGG 0.585919 8:+46081870 MsG0880044638.01.T01:CDS
CAATAAAACCATGAACCTTG+TGG 0.586969 8:+46082456 MsG0880044638.01.T01:CDS
ATCAAGTTGAAGCCAAAACA+AGG 0.587868 8:+46084022 MsG0880044638.01.T01:CDS
TTTCAGGGTACCCTGATAGG+TGG 0.588558 8:+46083511 MsG0880044638.01.T01:intron
AGCCTGTAAATTTCCTAAAG+GGG 0.588966 8:-46082143 None:intergenic
CTAGAAGCAAACTCTTGGAC+TGG 0.589165 8:+46083830 MsG0880044638.01.T01:CDS
CCTCAACTAGTTATTATGAA+GGG 0.591042 8:+46081953 MsG0880044638.01.T01:CDS
AGTGCAGATGATCCAGCAAA+GGG 0.591111 8:+46081896 MsG0880044638.01.T01:CDS
CTGACAAAGAAGTGTATCAT+CGG 0.593318 8:+46082077 MsG0880044638.01.T01:CDS
ATCTTGCACCATTTCAATGG+AGG 0.593433 8:+46083282 MsG0880044638.01.T01:CDS
TGAAGTGGTTGATCTCAAGC+TGG 0.594331 8:-46081417 None:intergenic
TGCCAGATACGTCTTCTACA+TGG 0.594340 8:+46082431 MsG0880044638.01.T01:CDS
TGTGATAGTTACGCGATGTG+TGG 0.596107 8:+46082226 MsG0880044638.01.T01:CDS
GAGACTCTGGATTGATAACA+TGG 0.601064 8:+46084390 MsG0880044638.01.T01:CDS
GATATCCGAAATGGAGGAAG+TGG 0.601107 8:+46082532 MsG0880044638.01.T01:CDS
GAACCTTGTGGAATGTCAGA+AGG 0.602248 8:+46082468 MsG0880044638.01.T01:CDS
CCCTTCATAATAACTAGTTG+AGG 0.602628 8:-46081953 None:intergenic
AGCCGAAATAAACTTGGGGA+AGG 0.604884 8:+46083392 MsG0880044638.01.T01:CDS
AACCCAAACAACTGTTAAAG+GGG 0.605906 8:-46081576 None:intergenic
AATTCTGTATGCAATATGGA+TGG 0.607734 8:+46082253 MsG0880044638.01.T01:CDS
TTCTAGCCGAAATAAACTTG+GGG 0.611795 8:+46083388 MsG0880044638.01.T01:CDS
GGTGCAAGATGATATACTCT+CGG 0.616061 8:-46083269 None:intergenic
AAGTGCAGATGATCCAGCAA+AGG 0.618621 8:+46081895 MsG0880044638.01.T01:CDS
GATAGTGATTGATACAGGCA+TGG 0.622218 8:+46082195 MsG0880044638.01.T01:CDS
TTTAGTCCAGGAAATTCAAG+AGG 0.622408 8:+46081521 MsG0880044638.01.T01:CDS
ATAGTATTGGAGATAATAAG+CGG 0.625479 8:+46084215 MsG0880044638.01.T01:CDS
CGGTTGTTGTATTCACAGAG+AGG 0.627478 8:+46083648 MsG0880044638.01.T01:CDS
AATGTGGATATCCGAAATGG+AGG 0.631917 8:+46082526 MsG0880044638.01.T01:CDS
TGGTTTGTTTGATGCATCGG+AGG 0.635695 8:-46081699 None:intergenic
ACTCCTAAATTATTGTGCAG+TGG 0.641899 8:-46081614 None:intergenic
CCTCCAGAGTATGCTGTGCA+TGG 0.648583 8:+46084152 MsG0880044638.01.T01:CDS
ACTGCACAGCTATTGGACAA+TGG 0.650316 8:+46081737 MsG0880044638.01.T01:CDS
ATGTACGGCTTATACAAATG+TGG 0.653168 8:+46082510 MsG0880044638.01.T01:CDS
GAGGAATCCTGAAATTATCA+CGG 0.656311 8:-46082977 None:intergenic
TTACTATGCAAGCACATGTG+AGG 0.661751 8:-46082996 None:intergenic
TAAGATTGAGAATAGGATCG+TGG 0.678631 8:+46081984 MsG0880044638.01.T01:CDS
ACGCCTTCTGACATTCCACA+AGG 0.687738 8:-46082471 None:intergenic
CCATGCACAGCATACTCTGG+AGG 0.697611 8:-46084152 None:intergenic
TGATAGTTACGCGATGTGTG+GGG 0.714475 8:+46082228 MsG0880044638.01.T01:CDS
TTGAGAATAGGATCGTGGAA+CGG 0.716289 8:+46081989 MsG0880044638.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TATCATAAACATAATTAATA+TGG - Chr8:46083087-46083106 None:intergenic 10.0%
!! ATAGTAATATTTATAAAGAG+AGG + Chr8:46083012-46083031 MsG0880044638.01.T01:CDS 15.0%
!! CAGAATTTAATAAAGTATAT+CGG - Chr8:46082702-46082721 None:intergenic 15.0%
!!! AATATTTGCTTCTTTTTTAA+TGG - Chr8:46082043-46082062 None:intergenic 15.0%
!!! ATTATTTTCATTAAAACAAG+TGG + Chr8:46083771-46083790 MsG0880044638.01.T01:intron 15.0%
!! ATATAGACAGAAAGAAAATA+TGG + Chr8:46083184-46083203 MsG0880044638.01.T01:intron 20.0%
!! ATGATTGGAAAACTAAATAT+TGG - Chr8:46083347-46083366 None:intergenic 20.0%
!! ATTAACATGTTAATGGAATA+AGG - Chr8:46083449-46083468 None:intergenic 20.0%
!! GTAGAAAATTAACATGTTAA+TGG - Chr8:46083456-46083475 None:intergenic 20.0%
!! TTAATTACTATTACAAACAC+AGG - Chr8:46083213-46083232 None:intergenic 20.0%
!! TTTAATAAAGTATATCGGAA+AGG - Chr8:46082697-46082716 None:intergenic 20.0%
!! TTTGTAATTCTTATGTTGAA+TGG + Chr8:46084532-46084551 MsG0880044638.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATGGAGGAAAAAATATTTT+AGG + Chr8:46083297-46083316 MsG0880044638.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATGAAAATGAAATTTTGAG+AGG - Chr8:46084364-46084383 None:intergenic 20.0%
!!! TCTCAAAATTTCATTTTCAT+AGG + Chr8:46084363-46084382 MsG0880044638.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTCTTTCTGTCTATATTTT+TGG - Chr8:46083181-46083200 None:intergenic 20.0%
! AAACTAAATATTGGTAGATC+AGG - Chr8:46083338-46083357 None:intergenic 25.0%
! AATTCAAGAGGAAGATATTT+AGG + Chr8:46081533-46081552 MsG0880044638.01.T01:CDS 25.0%
! ATCTTACGATATATACATGT+TGG + Chr8:46084463-46084482 MsG0880044638.01.T01:CDS 25.0%
! GACAATGGAATATATCATAT+TGG + Chr8:46082326-46082345 MsG0880044638.01.T01:CDS 25.0%
! GTCTTAAAACTCAATGAAAA+TGG + Chr8:46081635-46081654 MsG0880044638.01.T01:CDS 25.0%
! TCTTACGATATATACATGTT+GGG + Chr8:46084464-46084483 MsG0880044638.01.T01:CDS 25.0%
! TGATTTGACACAATTCAAAT+TGG - Chr8:46084320-46084339 None:intergenic 25.0%
! TTGATACATAAGGATAAGAA+AGG - Chr8:46084113-46084132 None:intergenic 25.0%
!! AAATCAGATGTGTTTAGTTT+CGG + Chr8:46084188-46084207 MsG0880044638.01.T01:CDS 25.0%
!! AAATTTCATTTTCATAGGCA+TGG + Chr8:46084368-46084387 MsG0880044638.01.T01:intron 25.0%
!! AATATATCATATTGGTCTAG+TGG + Chr8:46082334-46082353 MsG0880044638.01.T01:CDS 25.0%
!! AATCCAAATGATTGTTTTCA+GGG + Chr8:46083496-46083515 MsG0880044638.01.T01:intron 25.0%
!! AATTGATTGTTTCAAGTAAG+TGG - Chr8:46084435-46084454 None:intergenic 25.0%
!! ATAGTATTGGAGATAATAAG+CGG + Chr8:46084215-46084234 MsG0880044638.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTCGTCAAACAATATTTTG+TGG + Chr8:46081777-46081796 MsG0880044638.01.T01:CDS 25.0%
!! CCAAAAATTAAGTCTTTTTG+TGG + Chr8:46082364-46082383 MsG0880044638.01.T01:CDS 25.0%
!! CCACAAAAAGACTTAATTTT+TGG - Chr8:46082367-46082386 None:intergenic 25.0%
!! TAATCCAAATGATTGTTTTC+AGG + Chr8:46083495-46083514 MsG0880044638.01.T01:intron 25.0%
!!! GATTTTTTTAATCTGCTCTT+TGG + Chr8:46082655-46082674 MsG0880044638.01.T01:intron 25.0%
!!! GGAAAAAATATTTTAGGTTG+AGG + Chr8:46083303-46083322 MsG0880044638.01.T01:CDS 25.0%
!!! TATTTTTTCCTCCATTGAAA+TGG - Chr8:46083293-46083312 None:intergenic 25.0%
!!! TCTTTTTTAATGGTTGTGTT+GGG - Chr8:46082033-46082052 None:intergenic 25.0%
!!! TGAGATTTTTGGATTCATAA+GGG - Chr8:46083971-46083990 None:intergenic 25.0%
!!! TTCTTTTTTAATGGTTGTGT+TGG - Chr8:46082034-46082053 None:intergenic 25.0%
AAAGCCTGTAAATTTCCTAA+AGG - Chr8:46082148-46082167 None:intergenic 30.0%
AACTCAAAAATGTCTGATCA+AGG + Chr8:46083556-46083575 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
AAGAAACATTCTGATATTGC+TGG + Chr8:46082744-46082763 MsG0880044638.01.T01:intron 30.0%
AAGCCTGTAAATTTCCTAAA+GGG - Chr8:46082147-46082166 None:intergenic 30.0%
AATAAGCGGGAAAAAGATTA+AGG + Chr8:46084229-46084248 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
AATCCAAAAATCTCAGACTT+TGG + Chr8:46083976-46083995 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
AATTCTGTATGCAATATGGA+TGG + Chr8:46082253-46082272 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
ACTAAACACATCTGATTTCA+TGG - Chr8:46084186-46084205 None:intergenic 30.0%
ACTCAAAAATGTCTGATCAA+GGG + Chr8:46083557-46083576 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
AGAATTACAAATGACATGTC+TGG - Chr8:46084523-46084542 None:intergenic 30.0%
CCTAAATGTGAATGCTTAAA+AGG + Chr8:46082283-46082302 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
CCTCAACTAGTTATTATGAA+GGG + Chr8:46081953-46081972 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
TAGTTTCGGAGTAATAGTAT+TGG + Chr8:46084202-46084221 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
TATGATATATTCCATTGTCC+AGG - Chr8:46082325-46082344 None:intergenic 30.0%
TCCTCAACTAGTTATTATGA+AGG + Chr8:46081952-46081971 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
TCTGTAAACATTGACATTAG+AGG + Chr8:46081926-46081945 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
TCTGTGAATTATTCTAAGTC+TGG - Chr8:46083917-46083936 None:intergenic 30.0%
TCTGTGATAAGATTGAGAAT+AGG + Chr8:46081977-46081996 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
TGTGAACAATTGTTCATGTA+CGG + Chr8:46082495-46082514 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
TTAATAGCAACAAAAACCAG+AGG + Chr8:46082929-46082948 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
TTATATAAACTCTCCCCTTT+AGG + Chr8:46082130-46082149 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
TTGAATCAATCTATCCATGA+TGG + Chr8:46081455-46081474 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
! AATTTACCCAATTCTGAAGA+AGG - Chr8:46082634-46082653 None:intergenic 30.0%
! ATCATGGATAGATTGATTCA+AGG - Chr8:46081456-46081475 None:intergenic 30.0%
! ATTGACATCTCATTTGAAGT+TGG - Chr8:46084628-46084647 None:intergenic 30.0%
! ATTTACCCAATTCTGAAGAA+GGG - Chr8:46082633-46082652 None:intergenic 30.0%
! CCTTTTAAGCATTCACATTT+AGG - Chr8:46082286-46082305 None:intergenic 30.0%
! GATGTCAATTACAACTTTTG+AGG + Chr8:46084639-46084658 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
! GTATATTGATTGCACTTACA+TGG - Chr8:46084292-46084311 None:intergenic 30.0%
! TAGTATTGGAGATAATAAGC+GGG + Chr8:46084216-46084235 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
! TTTCTAGCCGAAATAAACTT+GGG + Chr8:46083387-46083406 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
!! CTGAGATTTTTGGATTCATA+AGG - Chr8:46083972-46083991 None:intergenic 30.0%
!! TTTTCTAGCCGAAATAAACT+TGG + Chr8:46083386-46083405 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
!!! ACATGAGAGTATTTTCTCAA+TGG + Chr8:46082584-46082603 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATGAGAGTATTTTCTCAATG+GGG + Chr8:46082586-46082605 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
!!! CATGAGAGTATTTTCTCAAT+GGG + Chr8:46082585-46082604 MsG0880044638.01.T01:CDS 30.0%
!!! CATTTTTGAGTTCCGTTTTA+TGG - Chr8:46083548-46083567 None:intergenic 30.0%
AAAAATGTCTGATCAAGGGT+TGG + Chr8:46083561-46083580 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
AAAGTCCCTTCTTCAGAATT+GGG + Chr8:46082625-46082644 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
AACCCAAACAACTGTTAAAG+GGG - Chr8:46081579-46081598 None:intergenic 35.0%
AACCCCTTTAACAGTTGTTT+GGG + Chr8:46081574-46081593 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
AAGTAGTCTAAGCTCCTATT+GGG - Chr8:46083700-46083719 None:intergenic 35.0%
ACAAATGTGGATATCCGAAA+TGG + Chr8:46082523-46082542 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
ACACCACTGCACAATAATTT+AGG + Chr8:46081611-46081630 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
ACTCCTAAATTATTGTGCAG+TGG - Chr8:46081617-46081636 None:intergenic 35.0%
AGCCTGTAAATTTCCTAAAG+GGG - Chr8:46082146-46082165 None:intergenic 35.0%
AGCTTAGACTACTTCATCTT+TGG + Chr8:46083706-46083725 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
AGGGCAAAGTCAAACAATAA+AGG - Chr8:46083738-46083757 None:intergenic 35.0%
ATACGCTGAGTACAAAATGA+AGG - Chr8:46084073-46084092 None:intergenic 35.0%
ATCATCTTGCACCATTTCAA+TGG + Chr8:46083279-46083298 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
ATGTACGGCTTATACAAATG+TGG + Chr8:46082510-46082529 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
CAACCCAAACAACTGTTAAA+GGG - Chr8:46081580-46081599 None:intergenic 35.0%
CAATAAAACCATGAACCTTG+TGG + Chr8:46082456-46082475 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
CCAATCATTGTTAAAGCAAC+TGG + Chr8:46083359-46083378 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
CCCTTCATAATAACTAGTTG+AGG - Chr8:46081956-46081975 None:intergenic 35.0%
GAAAAGAGGTAGCCATAAAA+CGG + Chr8:46083533-46083552 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
GAAAAGTTTCAAACTCGATC+TGG + Chr8:46083130-46083149 MsG0880044638.01.T01:intron 35.0%
GAAAGGATAGTGATTGATAC+AGG + Chr8:46082190-46082209 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
GAGGAAGATATTTAGGTATG+TGG + Chr8:46081540-46081559 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
GAGGAATCCTGAAATTATCA+CGG - Chr8:46082980-46082999 None:intergenic 35.0%
GCAGTTATGGAATTATTTGC+TGG - Chr8:46081722-46081741 None:intergenic 35.0%
GGCAATGTTACCTTATAAAC+TGG - Chr8:46083428-46083447 None:intergenic 35.0%
GGCTAATTCTGTATGCAATA+TGG + Chr8:46082249-46082268 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
GGTTATGTTCCTAAATTTCC+TGG + Chr8:46082304-46082323 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
GTACCCTGAAAACAATCATT+TGG - Chr8:46083502-46083521 None:intergenic 35.0%
TAAACATGTTTGAATCGTCG+TGG + Chr8:46081870-46081889 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
TAACCCCTTTAACAGTTGTT+TGG + Chr8:46081573-46081592 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
TAAGATTGAGAATAGGATCG+TGG + Chr8:46081984-46082003 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
TATCTTCCTCTTGAATTTCC+TGG - Chr8:46081530-46081549 None:intergenic 35.0%
TCTATGAATACATGCCCAAT+AGG + Chr8:46083683-46083702 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
TGAAACTAGAAGCAAACTCT+TGG + Chr8:46083825-46083844 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
TGAAGCCAAAACAAGGAAAT+TGG + Chr8:46084029-46084048 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
TGGATTTGGACCAGTTTATA+AGG + Chr8:46083415-46083434 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
TGTGGAAACAATAACACAAG+TGG + Chr8:46082382-46082401 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
TTATGTATCAACGCTTTCAG+TGG + Chr8:46084122-46084141 MsG0880044638.01.T01:intron 35.0%
TTCCATTGTCCAGGAAATTT+AGG - Chr8:46082316-46082335 None:intergenic 35.0%
TTCCTAAATTTCCTGGACAA+TGG + Chr8:46082311-46082330 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
TTCTAGCCGAAATAAACTTG+GGG + Chr8:46083388-46083407 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
TTTAGTCCAGGAAATTCAAG+AGG + Chr8:46081521-46081540 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
! AGAGAGGTAAACTTTGTTTG+TGG + Chr8:46083028-46083047 MsG0880044638.01.T01:intron 35.0%
! CCAGTTGCTTTAACAATGAT+TGG - Chr8:46083362-46083381 None:intergenic 35.0%
! CTGACAAAGAAGTGTATCAT+CGG + Chr8:46082077-46082096 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
! GAAATTTACAGGCTTTAGCT+TGG + Chr8:46082152-46082171 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
! GAAGTTGGCGATATTGTTTT+AGG - Chr8:46084613-46084632 None:intergenic 35.0%
! TTATTCTAAGTCTGGAGTCT+TGG - Chr8:46083909-46083928 None:intergenic 35.0%
!! ACTGAAAGCGTTGATACATA+AGG - Chr8:46084123-46084142 None:intergenic 35.0%
!! AGTTTGCTTCTAGTTTCATC+TGG - Chr8:46083823-46083842 None:intergenic 35.0%
!! ATCAAGTTGAAGCCAAAACA+AGG + Chr8:46084022-46084041 MsG0880044638.01.T01:CDS 35.0%
!! TCCAACCAATTTCCTTGTTT+TGG - Chr8:46084037-46084056 None:intergenic 35.0%
AAAAATCTCAGACTTTGGCC+TGG + Chr8:46083981-46084000 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
AACAACCACTTCCTCCATTT+CGG - Chr8:46082540-46082559 None:intergenic 40.0%
AAGCGTTCCCATATTATTGC+TGG + Chr8:46083856-46083875 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
AATGTGGATATCCGAAATGG+AGG + Chr8:46082526-46082545 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
ACAGAATAAACTCCCTTTGC+TGG - Chr8:46081911-46081930 None:intergenic 40.0%
ACAGTTGCCGTGATAATTTC+AGG + Chr8:46082970-46082989 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
AGCAACGCCAGCAATAATAT+GGG - Chr8:46083866-46083885 None:intergenic 40.0%
ATCTTGCACCATTTCAATGG+AGG + Chr8:46083282-46083301 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
CAAAGTCCCTTCTTCAGAAT+TGG + Chr8:46082624-46082643 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
CACCTTCCCCAAGTTTATTT+CGG - Chr8:46083397-46083416 None:intergenic 40.0%
CGAGAAGCTTCACAAGATTA+CGG - Chr8:46083630-46083649 None:intergenic 40.0%
CGTAATCTTGTGAAGCTTCT+CGG + Chr8:46083628-46083647 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
CTTGGATGGAACTTAGTAAC+TGG + Chr8:46081845-46081864 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
GAAGTAGTCTAAGCTCCTAT+TGG - Chr8:46083701-46083720 None:intergenic 40.0%
GAGGAAGTGGTTGTTTACTT+TGG + Chr8:46082545-46082564 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
GATAGTGATTGATACAGGCA+TGG + Chr8:46082195-46082214 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
GCAACCCAAACAACTGTTAA+AGG - Chr8:46081581-46081600 None:intergenic 40.0%
GCCAAAACAAGGAAATTGGT+TGG + Chr8:46084033-46084052 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
GGACAAGTGAAAAAAGCGAA+AGG + Chr8:46082173-46082192 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
GGTGCAAGATGATATACTCT+CGG - Chr8:46083272-46083291 None:intergenic 40.0%
GGTTAAACTGTCAAGTGAAG+TGG - Chr8:46081435-46081454 None:intergenic 40.0%
GTATAAAATCCCGGAGCTTT+CGG - Chr8:46084577-46084596 None:intergenic 40.0%
GTTGTGCGTACAAGAAAAAC+CGG + Chr8:46084489-46084508 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
TACCATGTAGAAGACGTATC+TGG - Chr8:46082436-46082455 None:intergenic 40.0%
TAGCAACGCCAGCAATAATA+TGG - Chr8:46083867-46083886 None:intergenic 40.0%
TCCATGTGATACATTACTGC+CGG + Chr8:46081814-46081833 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
TTACTATGCAAGCACATGTG+AGG - Chr8:46082999-46083018 None:intergenic 40.0%
TTCCATAACTGCACAGCTAT+TGG + Chr8:46081730-46081749 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
TTGAGAATAGGATCGTGGAA+CGG + Chr8:46081989-46082008 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
TTGTGCGTACAAGAAAAACC+GGG + Chr8:46084490-46084509 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
! AAAGCTCCGGGATTTTATAC+TGG + Chr8:46084577-46084596 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
! ACCGACTTCAAAAGTTCCTT+TGG - Chr8:46081498-46081517 None:intergenic 40.0%
! CTCCCCTTTAGGAAATTTAC+AGG + Chr8:46082141-46082160 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
! CTGGATTGATAACATGGCAA+TGG + Chr8:46084396-46084415 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
! GAGACTCTGGATTGATAACA+TGG + Chr8:46084390-46084409 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
! TACCTCTTTTCCACCTATCA+GGG - Chr8:46083524-46083543 None:intergenic 40.0%
! TCCGGGATTTTATACTGGAA+GGG + Chr8:46084582-46084601 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
!! AAGAAGGTTGAGAGAGTGTT+CGG - Chr8:46084267-46084286 None:intergenic 40.0%
!! AGGCCAAAGTCTGAGATTTT+TGG - Chr8:46083982-46084001 None:intergenic 40.0%
!! TGCTGGTTTGTTTGATGCAT+CGG - Chr8:46081705-46081724 None:intergenic 40.0%
!!! GCCAAAGGAACTTTTGAAGT+CGG + Chr8:46081494-46081513 MsG0880044638.01.T01:CDS 40.0%
AAACCAAAGTCTGGCCATCA+TGG - Chr8:46081472-46081491 None:intergenic 45.0%
AAGTGCAGATGATCCAGCAA+AGG + Chr8:46081895-46081914 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
AATGTCTGATCAAGGGTTGG+AGG + Chr8:46083564-46083583 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
ACGACACAAACAACGCCATT+TGG + Chr8:46081675-46081694 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
ACTGCACAGCTATTGGACAA+TGG + Chr8:46081737-46081756 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
AGCCGAAATAAACTTGGGGA+AGG + Chr8:46083392-46083411 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
AGTGCAGATGATCCAGCAAA+GGG + Chr8:46081896-46081915 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
ATTATTGCTGGCGTTGCTAG+AGG + Chr8:46083868-46083887 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
CCATGTGATACATTACTGCC+GGG + Chr8:46081815-46081834 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
CCCCTTCCAGTATAAAATCC+CGG - Chr8:46084586-46084605 None:intergenic 45.0%
CGAAATAAACTTGGGGAAGG+TGG + Chr8:46083395-46083414 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
CGGTTGTTGTATTCACAGAG+AGG + Chr8:46083648-46083667 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
CTAGAAGCAAACTCTTGGAC+TGG + Chr8:46083830-46083849 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
CTGACATTCCACAAGGTTCA+TGG - Chr8:46082467-46082486 None:intergenic 45.0%
CTTTGGCTGAAACCAAAGTC+TGG - Chr8:46081481-46081500 None:intergenic 45.0%
GAACACTCTCTCAACCTTCT+TGG + Chr8:46084266-46084285 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
GAACCTTGTGGAATGTCAGA+AGG + Chr8:46082468-46082487 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
GATATCCGAAATGGAGGAAG+TGG + Chr8:46082532-46082551 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
GTCCAATAGCTGTGCAGTTA+TGG - Chr8:46081735-46081754 None:intergenic 45.0%
GTGATAGTTACGCGATGTGT+GGG + Chr8:46082227-46082246 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
TACCCTGATAGGTGGAAAAG+AGG + Chr8:46083519-46083538 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
TATCCATGATGGCCAGACTT+TGG + Chr8:46081466-46081485 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
TGAAGTGGTTGATCTCAAGC+TGG - Chr8:46081420-46081439 None:intergenic 45.0%
TGATAGTTACGCGATGTGTG+GGG + Chr8:46082228-46082247 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
TGCCAGATACGTCTTCTACA+TGG + Chr8:46082431-46082450 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
TGTCATCTTGCACGTTTCAG+TGG + Chr8:46083244-46083263 MsG0880044638.01.T01:intron 45.0%
TGTGATAGTTACGCGATGTG+TGG + Chr8:46082226-46082245 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
TTCCATCCAAGCTTCATTCC+CGG - Chr8:46081836-46081855 None:intergenic 45.0%
TTGCACTTACATGGCCAAGA+AGG - Chr8:46084283-46084302 None:intergenic 45.0%
TTTCATAGGCATGGAGACTC+TGG + Chr8:46084377-46084396 MsG0880044638.01.T01:intron 45.0%
! AAACTTGGGGAAGGTGGATT+TGG + Chr8:46083401-46083420 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
! CAGACTTTGGTTTCAGCCAA+AGG + Chr8:46081479-46081498 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
! CCGGGATTTTATACTGGAAG+GGG + Chr8:46084583-46084602 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
! CTACCTCTTTTCCACCTATC+AGG - Chr8:46083525-46083544 None:intergenic 45.0%
! CTCCGGGATTTTATACTGGA+AGG + Chr8:46084581-46084600 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
! GAAGTCGGTTTCTTTAGTCC+AGG + Chr8:46081509-46081528 MsG0880044638.01.T01:CDS 45.0%
!! AGAAGGTTGAGAGAGTGTTC+GGG - Chr8:46084266-46084285 None:intergenic 45.0%
!! TGGTTTGTTTGATGCATCGG+AGG - Chr8:46081702-46081721 None:intergenic 45.0%
!! TGTTTTCAGGGTACCCTGAT+AGG + Chr8:46083508-46083527 MsG0880044638.01.T01:intron 45.0%
!!! AAATAATATAAAGATATTTT+AGG - Chr8:46083758-46083777 None:intergenic 5.0%
!!! AATAATATAAAGATATTTTA+GGG - Chr8:46083757-46083776 None:intergenic 5.0%
ACGCCTTCTGACATTCCACA+AGG - Chr8:46082474-46082493 None:intergenic 50.0%
ATTGTCTCAGCCGAAAGCTC+CGG + Chr8:46084564-46084583 MsG0880044638.01.T01:CDS 50.0%
CCCGGCAGTAATGTATCACA+TGG - Chr8:46081818-46081837 None:intergenic 50.0%
GACATGTCTGGTCTATCTCC+CGG - Chr8:46084511-46084530 None:intergenic 50.0%
GTGCAGTGGTGTTTCTCTGT+TGG - Chr8:46081603-46081622 None:intergenic 50.0%
TGATGCATCGGAGGACCAAA+TGG - Chr8:46081693-46081712 None:intergenic 50.0%
TTACTGCCGGGAATGAAGCT+TGG + Chr8:46081827-46081846 MsG0880044638.01.T01:CDS 50.0%
! ACCAGAGGCAGCAGTTGATA+CGG + Chr8:46082944-46082963 MsG0880044638.01.T01:CDS 50.0%
! TGGAACGGTCGTGCTTTTAC+TGG + Chr8:46082004-46082023 MsG0880044638.01.T01:CDS 50.0%
! TTTCAGGGTACCCTGATAGG+TGG + Chr8:46083511-46083530 MsG0880044638.01.T01:intron 50.0%
CCATGCACAGCATACTCTGG+AGG - Chr8:46084155-46084174 None:intergenic 55.0%
CCTCCAGAGTATGCTGTGCA+TGG + Chr8:46084152-46084171 MsG0880044638.01.T01:CDS 55.0%
CGACCATGCACAGCATACTC+TGG - Chr8:46084158-46084177 None:intergenic 55.0%
CTCCACAAAATGTCCGAGCC+AGG - Chr8:46084002-46084021 None:intergenic 55.0%
TCCGTATCAACTGCTGCCTC+TGG - Chr8:46082948-46082967 None:intergenic 55.0%
TCTCAGACTTTGGCCTGGCT+CGG + Chr8:46083986-46084005 MsG0880044638.01.T01:CDS 55.0%
TGCCGGGAATGAAGCTTGGA+TGG + Chr8:46081831-46081850 MsG0880044638.01.T01:CDS 55.0%
TTGTCTCAGCCGAAAGCTCC+GGG + Chr8:46084565-46084584 MsG0880044638.01.T01:CDS 55.0%
!!! GGCCTGGCTCGGACATTTTG+TGG + Chr8:46083997-46084016 MsG0880044638.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 46081368 46084669 46081368 ID=MsG0880044638.01;Name=MsG0880044638.01
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Chr8 exon 46083264 46083436 46083264 ID=MsG0880044638.01.T01:exon:18655;Parent=MsG0880044638.01.T01
Chr8 exon 46083517 46083727 46083517 ID=MsG0880044638.01.T01:exon:18656;Parent=MsG0880044638.01.T01
Chr8 exon 46083824 46084061 46083824 ID=MsG0880044638.01.T01:exon:18657;Parent=MsG0880044638.01.T01
Chr8 exon 46084142 46084292 46084142 ID=MsG0880044638.01.T01:exon:18658;Parent=MsG0880044638.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0880044638.01.T01

ATGGTTGATATTAGCATCAAAAAGTTATTCATTTTGTTCTTTTTATCTTCCAGCTTGAGATCAACCACTTCACTTGACAGTTTAACCTTGAATCAATCTATCCATGATGGCCAGACTTTGGTTTCAGCCAAAGGAACTTTTGAAGTCGGTTTCTTTAGTCCAGGAAATTCAAGAGGAAGATATTTAGGTATGTGGTACAGAAATTTAACCCCTTTAACAGTTGTTTGGGTTGCCAACAGAGAAACACCACTGCACAATAATTTAGGAGTCTTAAAACTCAATGAAAATGGAGTTCTTGTGATTCTCAACGACACAAACAACGCCATTTGGTCCTCCGATGCATCAAACAAACCAGCAAATAATTCCATAACTGCACAGCTATTGGACAATGGAAATCTTGTATTGAGAAATTCGTCAAACAATATTTTGTGGCAGACTTTTGATTATCCATGTGATACATTACTGCCGGGAATGAAGCTTGGATGGAACTTAGTAACTGGTTTAAACATGTTTGAATCGTCGTGGAAAAGTGCAGATGATCCAGCAAAGGGAGTTTATTCTGTAAACATTGACATTAGAGGATATCCTCAACTAGTTATTATGAAGGGATCTGTGATAAGATTGAGAATAGGATCGTGGAACGGTCGTGCTTTTACTGGATACCCAACACAACCATTAAAAAAGAAGCAAATATTTGAATTTGTCATAACTGACAAAGAAGTGTATCATCGGTATGAAGTCGTTGATAATTCTGTTGTATCTTTATATAAACTCTCCCCTTTAGGAAATTTACAGGCTTTAGCTTGGACAAGTGAAAAAAGCGAAAGGATAGTGATTGATACAGGCATGGAAGATTCATGTGATAGTTACGCGATGTGTGGGGCTAATTCTGTATGCAATATGGATGGTAATGTTCCTAAATGTGAATGCTTAAAAGGTTATGTTCCTAAATTTCCTGGACAATGGAATATATCATATTGGTCTAGTGGTTGTGTTCCAAAAATTAAGTCTTTTTGTGGAAACAATAACACAAGTGGTTTCTTGAAATACAGTGAACTGAAATTGCCAGATACGTCTTCTACATGGTACAATAAAACCATGAACCTTGTGGAATGTCAGAAGGCGTGTGTGAACAATTGTTCATGTACGGCTTATACAAATGTGGATATCCGAAATGGAGGAAGTGGTTGTTTACTTTGGTTTGATGATCTAATTGACATGAGAGTATTTTCTCAATGGGGACAAGATCTTTATATCAAAGTCCCTTCTTCAGAATTGGATGATGTTAGTGTTAATAGCAACAAAAACCAGAGGCAGCAGTTGATACGGATCACAGTTGCCGTGATAATTTCAGGATTCCTCACATGTGCTTGCATAGTAATATTTATAAAGAGAGTGGCGCCGAGAGTATATCATCTTGCACCATTTCAATGGAGGAAAAAATATTTTAGGTTGAGGAAAGAAGAGCCTGATCTACCAATATTTAGTTTTCCAATCATTGTTAAAGCAACTGGTAATTTTTCTAGCCGAAATAAACTTGGGGAAGGTGGATTTGGACCAGTTTATAAGGGTACCCTGATAGGTGGAAAAGAGGTAGCCATAAAACGGAACTCAAAAATGTCTGATCAAGGGTTGGAGGAATTTAAAAATGAAGTTTTGTTGATTGCAAAACTTCAGCACCGTAATCTTGTGAAGCTTCTCGGTTGTTGTATTCACAGAGAGGAAAAATTGTTGATCTATGAATACATGCCCAATAGGAGCTTAGACTACTTCATCTTTGATGAAACTAGAAGCAAACTCTTGGACTGGTCGAAGCGTTCCCATATTATTGCTGGCGTTGCTAGAGGACTTCTTTATCTTCACCAAGACTCCAGACTTAGAATAATTCACAGAGATTTAAAGTTAAGCAATATCTTACTAGACGCCCTTATGAATCCAAAAATCTCAGACTTTGGCCTGGCTCGGACATTTTGTGGAGATCAAGTTGAAGCCAAAACAAGGAAATTGGTTGGAACATATGGCTACATGCCTCCAGAGTATGCTGTGCATGGTCGTTACTCCATGAAATCAGATGTGTTTAGTTTCGGAGTAATAGTATTGGAGATAATAAGCGGGAAAAAGATTAAGGTGTTTTATGATCCCGAACACTCTCTCAACCTTCTTGGCCATGCATGGAGACTCTGGATTGATAACATGGCAATGGAACTAGTTGATATCCACTTACTTGAAACAATCAATTATTCTGAAATCTTACGATATATACATGTTGGGTTGTTGTGCGTACAAGAAAAACCGGGAGATAGACCAGACATGTCATTTGTAATTCTTATGTTGAATGGTGAGAAATTATTGTCTCAGCCGAAAGCTCCGGGATTTTATACTGGAAGGGGATTACCTAAAACAATATCGCCAACTTCAAATGAGATGTCAATTACAACTTTTGAGGCAAGATAA

Protein sequence

>MsG0880044638.01.T01

MVDISIKKLFILFFLSSSLRSTTSLDSLTLNQSIHDGQTLVSAKGTFEVGFFSPGNSRGRYLGMWYRNLTPLTVVWVANRETPLHNNLGVLKLNENGVLVILNDTNNAIWSSDASNKPANNSITAQLLDNGNLVLRNSSNNILWQTFDYPCDTLLPGMKLGWNLVTGLNMFESSWKSADDPAKGVYSVNIDIRGYPQLVIMKGSVIRLRIGSWNGRAFTGYPTQPLKKKQIFEFVITDKEVYHRYEVVDNSVVSLYKLSPLGNLQALAWTSEKSERIVIDTGMEDSCDSYAMCGANSVCNMDGNVPKCECLKGYVPKFPGQWNISYWSSGCVPKIKSFCGNNNTSGFLKYSELKLPDTSSTWYNKTMNLVECQKACVNNCSCTAYTNVDIRNGGSGCLLWFDDLIDMRVFSQWGQDLYIKVPSSELDDVSVNSNKNQRQQLIRITVAVIISGFLTCACIVIFIKRVAPRVYHLAPFQWRKKYFRLRKEEPDLPIFSFPIIVKATGNFSSRNKLGEGGFGPVYKGTLIGGKEVAIKRNSKMSDQGLEEFKNEVLLIAKLQHRNLVKLLGCCIHREEKLLIYEYMPNRSLDYFIFDETRSKLLDWSKRSHIIAGVARGLLYLHQDSRLRIIHRDLKLSNILLDALMNPKISDFGLARTFCGDQVEAKTRKLVGTYGYMPPEYAVHGRYSMKSDVFSFGVIVLEIISGKKIKVFYDPEHSLNLLGHAWRLWIDNMAMELVDIHLLETINYSEILRYIHVGLLCVQEKPGDRPDMSFVILMLNGEKLLSQPKAPGFYTGRGLPKTISPTSNEMSITTFEAR*