AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380017229.01


Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0380017229.01.T01 MTR_3g103320 96.222 397 15 0 1 397 1 397 0.0 781
MsG0380017229.01.T01 MTR_5g015150 43.529 425 200 8 1 397 1 413 5.62e-116 344
Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0380017229.01.T01 AT1G10150 51.531 392 179 4 7 390 13 401 2.48e-137 399
MsG0380017229.01.T01 AT1G59510 46.316 380 176 5 9 388 15 366 8.25e-118 348
MsG0380017229.01.T01 AT3G49790 41.622 370 175 6 5 373 12 341 1.19e-90 278

Find 76 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 115 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TGCTTTATATTTACATATTT+TGG 0.007902 3:+93815800 MsG0380017229.01.T01:CDS
GTTGATGGAGTTGGGGATTT+TGG 0.058264 3:+93815540 MsG0380017229.01.T01:CDS
TTCCTCGGACATGGCAATTT+TGG 0.098120 3:-93814929 None:intergenic
CGAAAAGGTGAAGGGAATTT+TGG 0.152646 3:+93815365 MsG0380017229.01.T01:CDS
TCGAAATCTGATGGTATTTC+TGG 0.188403 3:+93815186 MsG0380017229.01.T01:CDS
GGATAATTGTTTGAAACTAT+TGG 0.205140 3:-93814908 None:intergenic
TTGAGTTCACCTAGGGAAAA+TGG 0.207384 3:+93815468 MsG0380017229.01.T01:CDS
CTCAAATCAGATTTACCTTT+TGG 0.212767 3:-93815450 None:intergenic
TTTGAAAAGGGGTGTTAATA+AGG 0.254480 3:+93815695 MsG0380017229.01.T01:CDS
GAAAAGTGTGGGAAGGTTAT+AGG 0.268010 3:+93815231 MsG0380017229.01.T01:CDS
GATAATTGTTTGAAACTATT+GGG 0.292814 3:-93814907 None:intergenic
AAAAGTGTGGGAAGGTTATA+GGG 0.303415 3:+93815232 MsG0380017229.01.T01:CDS
TGAAACGGTTTCTGCGGAAC+TGG 0.346962 3:-93814833 None:intergenic
GGCTGGAACTGGGTTTGTTT+CGG 0.350057 3:+93815092 MsG0380017229.01.T01:CDS
CTTATGTCTGAGGCTGGAAC+TGG 0.363984 3:+93815081 MsG0380017229.01.T01:CDS
AAGTTGGAAAATGTTGATTC+GGG 0.380669 3:+93815162 MsG0380017229.01.T01:CDS
GAAGTTGGAAAATGTTGATT+CGG 0.393462 3:+93815161 MsG0380017229.01.T01:CDS
GAGAAATTTGTTTAAATCGT+TGG 0.399408 3:-93814863 None:intergenic
CATTTGTGGAGTTTATGTTA+TGG 0.403207 3:+93815658 MsG0380017229.01.T01:CDS
TTTGGTTAAAACATCTCATC+AGG 0.407964 3:+93815416 MsG0380017229.01.T01:CDS
AGAATCCTAAAAGCGCGATT+AGG 0.413573 3:-93814705 None:intergenic
AATTTCTGAAGAAAAGCTTC+CGG 0.430765 3:-93815501 None:intergenic
AGCTTTATAAACACCGTAAC+CGG 0.435942 3:-93814728 None:intergenic
TTTCTTCAGAAATTCAGAAA+TGG 0.437044 3:+93815510 MsG0380017229.01.T01:CDS
CGAAACTGTGAGGTCATTTG+TGG 0.447805 3:+93815644 MsG0380017229.01.T01:CDS
GAAGCTCTGTTGATGGAGTT+GGG 0.450576 3:+93815532 MsG0380017229.01.T01:CDS
AATATCAGAAGGTTTGAAAA+GGG 0.454639 3:+93815683 MsG0380017229.01.T01:CDS
ATGCAAGTTGTTAGATATGT+AGG 0.456238 3:+93815744 MsG0380017229.01.T01:CDS
AACTGGGTTTGTTTCGGTTG+TGG 0.457163 3:+93815098 MsG0380017229.01.T01:CDS
AGCACAAACCTCTGGTTAGC+TGG 0.460341 3:-93815597 None:intergenic
AACGAAAGCTTTGAGAAGCT+TGG 0.461504 3:-93814791 None:intergenic
AGGTTTGTGCTTGATGTCAC+GGG 0.461808 3:+93815609 MsG0380017229.01.T01:CDS
GGAAAATGGGCGTTTGAAAC+CGG 0.463327 3:+93815482 MsG0380017229.01.T01:CDS
AGAAATGGAAGCTCTGTTGA+TGG 0.465656 3:+93815525 MsG0380017229.01.T01:CDS
TAATGGTGCTGTTGAGACTT+TGG 0.466719 3:+93815398 MsG0380017229.01.T01:CDS
TGAGTTCACCTAGGGAAAAT+GGG 0.476331 3:+93815469 MsG0380017229.01.T01:CDS
GAATATCAGAAGGTTTGAAA+AGG 0.486731 3:+93815682 MsG0380017229.01.T01:CDS
GGAAGCTCTGTTGATGGAGT+TGG 0.496439 3:+93815531 MsG0380017229.01.T01:CDS
GGTTTCAAAGTCTTTAACAC+AGG 0.507988 3:+93814972 MsG0380017229.01.T01:CDS
ATCGTTGGAAACGATTGAAA+CGG 0.512284 3:-93814848 None:intergenic
AATTGTTATCGAAAATTCCT+CGG 0.513477 3:-93814944 None:intergenic
GAGGTTTGTGCTTGATGTCA+CGG 0.533268 3:+93815608 MsG0380017229.01.T01:CDS
TATCGAAAATTCCTCGGACA+TGG 0.538704 3:-93814938 None:intergenic
GATAAGCTTATGTCTGAGGC+TGG 0.543039 3:+93815075 MsG0380017229.01.T01:CDS
GAATCCAAAACACCACGAAA+AGG 0.544499 3:+93815350 MsG0380017229.01.T01:CDS
AACGATTGAAACGGTTTCTG+CGG 0.546930 3:-93814839 None:intergenic
ATCTGATTTGAGTTCACCTA+GGG 0.546953 3:+93815461 MsG0380017229.01.T01:CDS
CTTTGAGAAGCTTGGTGAAG+CGG 0.547949 3:-93814783 None:intergenic
GGGTGGTAGTAGGATTCTAG+TGG 0.548130 3:+93815821 MsG0380017229.01.T01:CDS
TGACATCAAGCACAAACCTC+TGG 0.548454 3:-93815605 None:intergenic
AAAGTGTGGGAAGGTTATAG+GGG 0.564724 3:+93815233 MsG0380017229.01.T01:CDS
GGGTTTGTTTCGGTTGTGGT+TGG 0.582510 3:+93815102 MsG0380017229.01.T01:CDS
GTTTCAAAGTCTTTAACACA+GGG 0.590487 3:+93814973 MsG0380017229.01.T01:CDS
GTTGGATAAGCTTATGTCTG+AGG 0.594329 3:+93815071 MsG0380017229.01.T01:CDS
TTATGTCTGAGGCTGGAACT+GGG 0.597190 3:+93815082 MsG0380017229.01.T01:CDS
TGAGAAGCTTGGTGAAGCGG+TGG 0.598441 3:-93814780 None:intergenic
GTGATTTGTGATGAAAAGTG+TGG 0.602122 3:+93815219 MsG0380017229.01.T01:CDS
GATTCGGGGTCGAAATCTGA+TGG 0.609922 3:+93815177 MsG0380017229.01.T01:CDS
ATATCAGAAGGTTTGAAAAG+GGG 0.613283 3:+93815684 MsG0380017229.01.T01:CDS
AAAACACCACGAAAAGGTGA+AGG 0.616934 3:+93815356 MsG0380017229.01.T01:CDS
ATCCAAAATTGCCATGTCCG+AGG 0.618224 3:+93814927 MsG0380017229.01.T01:CDS
ATGTTATGGAGAATATCAGA+AGG 0.618821 3:+93815672 MsG0380017229.01.T01:CDS
AATCTGATTTGAGTTCACCT+AGG 0.620883 3:+93815460 MsG0380017229.01.T01:CDS
AAAACCCTTGGAAATTGGTG+CGG 0.627520 3:+93815023 MsG0380017229.01.T01:CDS
AAGCTCTGTTGATGGAGTTG+GGG 0.629477 3:+93815533 MsG0380017229.01.T01:CDS
CATGACGACGTTGTAGACAA+AGG 0.631962 3:+93815720 MsG0380017229.01.T01:CDS
TTTCTGTGCCAGCTAACCAG+AGG 0.634765 3:+93815589 MsG0380017229.01.T01:CDS
AAACACCACGAAAAGGTGAA+GGG 0.640062 3:+93815357 MsG0380017229.01.T01:CDS
TTGTGATGAAAAGTGTGGGA+AGG 0.642371 3:+93815224 MsG0380017229.01.T01:CDS
TGTTTACGTGAGAAATTGAG+TGG 0.648714 3:-93814667 None:intergenic
TGATTTGTGATGAAAAGTGT+GGG 0.672796 3:+93815220 MsG0380017229.01.T01:CDS
AGTTGGAAAATGTTGATTCG+GGG 0.681446 3:+93815163 MsG0380017229.01.T01:CDS
ATATGTAGGAGCTAAGTCGT+CGG 0.689384 3:+93815758 MsG0380017229.01.T01:CDS
TAAATATAAAGCAAGACACA+AGG 0.689722 3:-93815790 None:intergenic
GGTTTGTGCTTGATGTCACG+GGG 0.712732 3:+93815610 MsG0380017229.01.T01:CDS
GAGTGACATTCGAAACTGTG+AGG 0.724455 3:+93815634 MsG0380017229.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! GCTTTATATTTACATATTTT+GGG + Chr3:93815801-93815820 MsG0380017229.01.T01:CDS 15.0%
!!! TGCTTTATATTTACATATTT+TGG + Chr3:93815800-93815819 MsG0380017229.01.T01:CDS 15.0%
!!! AATTTTCGATAACAATTTCT+AGG + Chr3:93814950-93814969 MsG0380017229.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTTCGATAACAATTTCTA+GGG + Chr3:93814951-93814970 MsG0380017229.01.T01:CDS 20.0%
!!! GATAATTGTTTGAAACTATT+GGG - Chr3:93814910-93814929 None:intergenic 20.0%
!!! TGTTTTTCTTGATAAAACAA+TGG + Chr3:93815290-93815309 MsG0380017229.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTATATTTACATATTTTGGG+TGG + Chr3:93815804-93815823 MsG0380017229.01.T01:CDS 20.0%
! AATATCAGAAGGTTTGAAAA+GGG + Chr3:93815683-93815702 MsG0380017229.01.T01:CDS 25.0%
! AATTGTTATCGAAAATTCCT+CGG - Chr3:93814947-93814966 None:intergenic 25.0%
! TAAATATAAAGCAAGACACA+AGG - Chr3:93815793-93815812 None:intergenic 25.0%
! TTTCTTCAGAAATTCAGAAA+TGG + Chr3:93815510-93815529 MsG0380017229.01.T01:CDS 25.0%
!! GAGAAATTTGTTTAAATCGT+TGG - Chr3:93814866-93814885 None:intergenic 25.0%
!! GGATAATTGTTTGAAACTAT+TGG - Chr3:93814911-93814930 None:intergenic 25.0%
!!! AAAAATCGAATTTTTCGGAT+AGG + Chr3:93815046-93815065 MsG0380017229.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAAATCGAATTTTTCGGATA+GGG + Chr3:93815047-93815066 MsG0380017229.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTTTGGTTTCTCTATGTAA+TGG + Chr3:93815381-93815400 MsG0380017229.01.T01:CDS 25.0%
ATATCAGAAGGTTTGAAAAG+GGG + Chr3:93815684-93815703 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
ATGCAAGTTGTTAGATATGT+AGG + Chr3:93815744-93815763 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
ATGTTATGGAGAATATCAGA+AGG + Chr3:93815672-93815691 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
CATTTGTGGAGTTTATGTTA+TGG + Chr3:93815658-93815677 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
GAATATCAGAAGGTTTGAAA+AGG + Chr3:93815682-93815701 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
GTTTCAAAGTCTTTAACACA+GGG + Chr3:93814973-93814992 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
TCCAGCAAAAATTTCATCAT+AGG - Chr3:93815325-93815344 None:intergenic 30.0%
TTTGAAAAACCCTTGGAAAT+TGG + Chr3:93815018-93815037 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
TTTGGTTAAAACATCTCATC+AGG + Chr3:93815416-93815435 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
! AATTTCTGAAGAAAAGCTTC+CGG - Chr3:93815504-93815523 None:intergenic 30.0%
! ACCTATGATGAAATTTTTGC+TGG + Chr3:93815321-93815340 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
! CTCAAATCAGATTTACCTTT+TGG - Chr3:93815453-93815472 None:intergenic 30.0%
! GAAGTTGGAAAATGTTGATT+CGG + Chr3:93815161-93815180 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
! TGATTTGTGATGAAAAGTGT+GGG + Chr3:93815220-93815239 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
! TGCGGAAAAATCGAATTTTT+CGG + Chr3:93815041-93815060 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
! TGGCGTTTTTGAACTAAATA+AGG - Chr3:93814763-93814782 None:intergenic 30.0%
! TTTAACACAGGGAATTTTGA+TGG + Chr3:93814984-93815003 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
!! AAGTTGGAAAATGTTGATTC+GGG + Chr3:93815162-93815181 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
!! TTAACACAGGGAATTTTGAT+GGG + Chr3:93814985-93815004 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTGAAAAGGGGTGTTAATA+AGG + Chr3:93815695-93815714 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTTGCTAGGAATTTGGTTT+TGG + Chr3:93815128-93815147 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTGCTAGGAATTTGGTTTT+GGG + Chr3:93815129-93815148 MsG0380017229.01.T01:CDS 30.0%
ATCGTTGGAAACGATTGAAA+CGG - Chr3:93814851-93814870 None:intergenic 35.0%
GGTTTCAAAGTCTTTAACAC+AGG + Chr3:93814972-93814991 MsG0380017229.01.T01:CDS 35.0%
TCGAAATCTGATGGTATTTC+TGG + Chr3:93815186-93815205 MsG0380017229.01.T01:CDS 35.0%
TGGTGAATTTGAAAAACCCT+TGG + Chr3:93815011-93815030 MsG0380017229.01.T01:CDS 35.0%
TGTTTACGTGAGAAATTGAG+TGG - Chr3:93814670-93814689 None:intergenic 35.0%
! AAAAGTGTGGGAAGGTTATA+GGG + Chr3:93815232-93815251 MsG0380017229.01.T01:CDS 35.0%
! AATCTGATTTGAGTTCACCT+AGG + Chr3:93815460-93815479 MsG0380017229.01.T01:CDS 35.0%
! AGCTTTATAAACACCGTAAC+CGG - Chr3:93814731-93814750 None:intergenic 35.0%
! ATCTGATTTGAGTTCACCTA+GGG + Chr3:93815461-93815480 MsG0380017229.01.T01:CDS 35.0%
! GTGATTTGTGATGAAAAGTG+TGG + Chr3:93815219-93815238 MsG0380017229.01.T01:CDS 35.0%
! TGGAAGTTTTGCTAGGAATT+TGG + Chr3:93815122-93815141 MsG0380017229.01.T01:CDS 35.0%
!! AGTTGGAAAATGTTGATTCG+GGG + Chr3:93815163-93815182 MsG0380017229.01.T01:CDS 35.0%
!! CGATTAGGATAAGTCGTTTT+TGG - Chr3:93814693-93814712 None:intergenic 35.0%
!! TAACACAGGGAATTTTGATG+GGG + Chr3:93814986-93815005 MsG0380017229.01.T01:CDS 35.0%
!! TACATATTTTGGGTGGTAGT+AGG + Chr3:93815811-93815830 MsG0380017229.01.T01:CDS 35.0%
!!! CAGGTTTTGACTAATCCAAA+AGG + Chr3:93815435-93815454 MsG0380017229.01.T01:CDS 35.0%
AAAACACCACGAAAAGGTGA+AGG + Chr3:93815356-93815375 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
AAAACCCTTGGAAATTGGTG+CGG + Chr3:93815023-93815042 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
AAACACCACGAAAAGGTGAA+GGG + Chr3:93815357-93815376 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
AAAGTGTGGGAAGGTTATAG+GGG + Chr3:93815233-93815252 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
AACGATTGAAACGGTTTCTG+CGG - Chr3:93814842-93814861 None:intergenic 40.0%
AGAAATGGAAGCTCTGTTGA+TGG + Chr3:93815525-93815544 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
ATATGTAGGAGCTAAGTCGT+CGG + Chr3:93815758-93815777 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
GAATCCAAAACACCACGAAA+AGG + Chr3:93815350-93815369 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
GTTGGATAAGCTTATGTCTG+AGG + Chr3:93815071-93815090 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
TATCGAAAATTCCTCGGACA+TGG - Chr3:93814941-93814960 None:intergenic 40.0%
TGAGTTCACCTAGGGAAAAT+GGG + Chr3:93815469-93815488 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
TTGAGTTCACCTAGGGAAAA+TGG + Chr3:93815468-93815487 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
! AAATTCCCTTCACCTTTTCG+TGG - Chr3:93815365-93815384 None:intergenic 40.0%
! AGAATCCTAAAAGCGCGATT+AGG - Chr3:93814708-93814727 None:intergenic 40.0%
! CGAAAAGGTGAAGGGAATTT+TGG + Chr3:93815365-93815384 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
! CTTATCCTAATCGCGCTTTT+AGG + Chr3:93814700-93814719 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
! GAAAAGTGTGGGAAGGTTAT+AGG + Chr3:93815231-93815250 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
! TTCACCTTTTCGTGGTGTTT+TGG - Chr3:93815357-93815376 None:intergenic 40.0%
! TTGATGGAGTTGGGGATTTT+GGG + Chr3:93815541-93815560 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
! TTGTGATGAAAAGTGTGGGA+AGG + Chr3:93815224-93815243 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
! TTGTGGTTGGAAGTTTTGCT+AGG + Chr3:93815115-93815134 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
! TTTTCCGCACCAATTTCCAA+GGG - Chr3:93815030-93815049 None:intergenic 40.0%
! TTTTTCCGCACCAATTTCCA+AGG - Chr3:93815031-93815050 None:intergenic 40.0%
!! AACGAAAGCTTTGAGAAGCT+TGG - Chr3:93814794-93814813 None:intergenic 40.0%
!! GAATTTTTCGGATAGGGTGT+TGG + Chr3:93815053-93815072 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
!! TAATGGTGCTGTTGAGACTT+TGG + Chr3:93815398-93815417 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTGGGTTTTCGTACGAAGT+TGG + Chr3:93815146-93815165 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
!!! CTTTTAGGATTCTCCGGTTA+CGG + Chr3:93814715-93814734 MsG0380017229.01.T01:CDS 40.0%
AGGTTTGTGCTTGATGTCAC+GGG + Chr3:93815609-93815628 MsG0380017229.01.T01:CDS 45.0%
ATCCAAAATTGCCATGTCCG+AGG + Chr3:93814927-93814946 MsG0380017229.01.T01:CDS 45.0%
CATGACGACGTTGTAGACAA+AGG + Chr3:93815720-93815739 MsG0380017229.01.T01:CDS 45.0%
CGAAACTGTGAGGTCATTTG+TGG + Chr3:93815644-93815663 MsG0380017229.01.T01:CDS 45.0%
GAGGTTTGTGCTTGATGTCA+CGG + Chr3:93815608-93815627 MsG0380017229.01.T01:CDS 45.0%
GAGTGACATTCGAAACTGTG+AGG + Chr3:93815634-93815653 MsG0380017229.01.T01:CDS 45.0%
TGACATCAAGCACAAACCTC+TGG - Chr3:93815608-93815627 None:intergenic 45.0%
! AACTGGGTTTGTTTCGGTTG+TGG + Chr3:93815098-93815117 MsG0380017229.01.T01:CDS 45.0%
! AAGCTCTGTTGATGGAGTTG+GGG + Chr3:93815533-93815552 MsG0380017229.01.T01:CDS 45.0%
! CTTTGAGAAGCTTGGTGAAG+CGG - Chr3:93814786-93814805 None:intergenic 45.0%
! GAAGCTCTGTTGATGGAGTT+GGG + Chr3:93815532-93815551 MsG0380017229.01.T01:CDS 45.0%
! GATAAGCTTATGTCTGAGGC+TGG + Chr3:93815075-93815094 MsG0380017229.01.T01:CDS 45.0%
! GGAAAATGGGCGTTTGAAAC+CGG + Chr3:93815482-93815501 MsG0380017229.01.T01:CDS 45.0%
! GGATTGTGTGCAGACTTTTG+TGG + Chr3:93815254-93815273 MsG0380017229.01.T01:CDS 45.0%
! TTATGTCTGAGGCTGGAACT+GGG + Chr3:93815082-93815101 MsG0380017229.01.T01:CDS 45.0%
! TTCAAACGCCCATTTTCCCT+AGG - Chr3:93815480-93815499 None:intergenic 45.0%
! TTCCTCGGACATGGCAATTT+TGG - Chr3:93814932-93814951 None:intergenic 45.0%
!! CAGGGAATTTTGATGGGGTA+TGG + Chr3:93814991-93815010 MsG0380017229.01.T01:CDS 45.0%
!! GTTGATGGAGTTGGGGATTT+TGG + Chr3:93815540-93815559 MsG0380017229.01.T01:CDS 45.0%
!!! ATCGCGCTTTTAGGATTCTC+CGG + Chr3:93814709-93814728 MsG0380017229.01.T01:CDS 45.0%
AGCACAAACCTCTGGTTAGC+TGG - Chr3:93815600-93815619 None:intergenic 50.0%
GATTCGGGGTCGAAATCTGA+TGG + Chr3:93815177-93815196 MsG0380017229.01.T01:CDS 50.0%
GGGTGGTAGTAGGATTCTAG+TGG + Chr3:93815821-93815840 MsG0380017229.01.T01:CDS 50.0%
GGTTTGTGCTTGATGTCACG+GGG + Chr3:93815610-93815629 MsG0380017229.01.T01:CDS 50.0%
TGAAACGGTTTCTGCGGAAC+TGG - Chr3:93814836-93814855 None:intergenic 50.0%
TTTCTGTGCCAGCTAACCAG+AGG + Chr3:93815589-93815608 MsG0380017229.01.T01:CDS 50.0%
! ATGGAGTTGGGGATTTTGGG+TGG + Chr3:93815544-93815563 MsG0380017229.01.T01:CDS 50.0%
! CTTATGTCTGAGGCTGGAAC+TGG + Chr3:93815081-93815100 MsG0380017229.01.T01:CDS 50.0%
! GGAAGCTCTGTTGATGGAGT+TGG + Chr3:93815531-93815550 MsG0380017229.01.T01:CDS 50.0%
! GGCTGGAACTGGGTTTGTTT+CGG + Chr3:93815092-93815111 MsG0380017229.01.T01:CDS 50.0%
! GGGTTTGTTTCGGTTGTGGT+TGG + Chr3:93815102-93815121 MsG0380017229.01.T01:CDS 50.0%
!! GGATTTTGGGTGGCTTGAAC+AGG + Chr3:93815554-93815573 MsG0380017229.01.T01:CDS 50.0%
! TGAGAAGCTTGGTGAAGCGG+TGG - Chr3:93814783-93814802 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 93814658 93815851 93814658 ID=MsG0380017229.01;Name=MsG0380017229.01
Chr3 mRNA 93814658 93815851 93814658 ID=MsG0380017229.01.T01;Parent=MsG0380017229.01;Name=MsG0380017229.01.T01;_AED=0.45;_eAED=0.45;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|397
Chr3 exon 93814658 93815851 93814658 ID=MsG0380017229.01.T01:exon:1441;Parent=MsG0380017229.01.T01
Chr3 CDS 93814658 93815851 93814658 ID=MsG0380017229.01.T01:cds;Parent=MsG0380017229.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380017229.01.T01

ATGGAACTTCCACTCAATTTCTCACGTAAACACCAAAAACGACTTATCCTAATCGCGCTTTTAGGATTCTCCGGTTACGGTGTTTATAAAGCTTATCATTTACCTTATTTAGTTCAAAAACGCCACCGCTTCACCAAGCTTCTCAAAGCTTTCGTTTCTCTTGCAGAACTCGCTTCCAGTTCCGCAGAAACCGTTTCAATCGTTTCCAACGATTTAAACAAATTTCTCAAGTCTGATTCTGATGAAATTCCCAATAGTTTCAAACAATTATCCAAAATTGCCATGTCCGAGGAATTTTCGATAACAATTTCTAGGGTTTCAAAGTCTTTAACACAGGGAATTTTGATGGGGTATGGTGAATTTGAAAAACCCTTGGAAATTGGTGCGGAAAAATCGAATTTTTCGGATAGGGTGTTGGATAAGCTTATGTCTGAGGCTGGAACTGGGTTTGTTTCGGTTGTGGTTGGAAGTTTTGCTAGGAATTTGGTTTTGGGTTTTCGTACGAAGTTGGAAAATGTTGATTCGGGGTCGAAATCTGATGGTATTTCTGGATTTGTGAGTGTGATTTGTGATGAAAAGTGTGGGAAGGTTATAGGGGATTGTGTGCAGACTTTTGTGGCTACTGCTGTTGCTGTTTTTCTTGATAAAACAATGGATGTTAACACCTATGATGAAATTTTTGCTGGAATGACGAATCCAAAACACCACGAAAAGGTGAAGGGAATTTTGGTTTCTCTATGTAATGGTGCTGTTGAGACTTTGGTTAAAACATCTCATCAGGTTTTGACTAATCCAAAAGGTAAATCTGATTTGAGTTCACCTAGGGAAAATGGGCGTTTGAAACCGGAAGCTTTTCTTCAGAAATTCAGAAATGGAAGCTCTGTTGATGGAGTTGGGGATTTTGGGTGGCTTGAACAGGTTAAATCAACTCTTTCTGTGCCAGCTAACCAGAGGTTTGTGCTTGATGTCACGGGGAGAGTGACATTCGAAACTGTGAGGTCATTTGTGGAGTTTATGTTATGGAGAATATCAGAAGGTTTGAAAAGGGGTGTTAATAAGGTTCATGACGACGTTGTAGACAAAGGAATGCAAGTTGTTAGATATGTAGGAGCTAAGTCGTCGGTTATTATTACCTTGTGTCTTGCTTTATATTTACATATTTTGGGTGGTAGTAGGATTCTAGTGGCTGCTTAG

Protein sequence

>MsG0380017229.01.T01

MELPLNFSRKHQKRLILIALLGFSGYGVYKAYHLPYLVQKRHRFTKLLKAFVSLAELASSSAETVSIVSNDLNKFLKSDSDEIPNSFKQLSKIAMSEEFSITISRVSKSLTQGILMGYGEFEKPLEIGAEKSNFSDRVLDKLMSEAGTGFVSVVVGSFARNLVLGFRTKLENVDSGSKSDGISGFVSVICDEKCGKVIGDCVQTFVATAVAVFLDKTMDVNTYDEIFAGMTNPKHHEKVKGILVSLCNGAVETLVKTSHQVLTNPKGKSDLSSPRENGRLKPEAFLQKFRNGSSVDGVGDFGWLEQVKSTLSVPANQRFVLDVTGRVTFETVRSFVEFMLWRISEGLKRGVNKVHDDVVDKGMQVVRYVGAKSSVIITLCLALYLHILGGSRILVAA*