AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180004687.01


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MsG0180004687.01.T01 AT2G42960 31.464 321 184 10 146 438 142 454 2.13e-38 146
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MsG0180004687.01.T01 AT1G06700 30.645 310 179 11 161 443 51 351 3.69e-31 123
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MsG0180004687.01.T01 AT3G09830 29.841 315 188 11 169 456 75 383 5.26e-31 124
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MsG0180004687.01.T01 AT2G35620 25.536 513 290 20 9 446 83 578 2.94e-30 124
MsG0180004687.01.T01 AT2G35620 25.536 513 290 20 9 446 83 578 2.94e-30 124
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MsG0180004687.01.T01 AT4G23130 29.245 318 188 14 158 452 324 627 7.54e-30 123
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MsG0180004687.01.T01 AT1G48210 30.284 317 171 12 158 441 48 347 1.11e-29 119
MsG0180004687.01.T01 AT1G48210 30.284 317 171 12 158 441 48 347 1.11e-29 119
MsG0180004687.01.T01 AT1G51890 29.412 306 176 11 165 447 287 575 1.15e-29 122
MsG0180004687.01.T01 AT4G11530 31.475 305 172 15 171 452 345 635 1.19e-29 122
MsG0180004687.01.T01 AT1G53730 28.671 286 174 10 169 433 407 683 1.19e-29 122
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MsG0180004687.01.T01 AT1G51890 29.373 303 180 10 165 447 495 783 2.09e-29 122
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MsG0180004687.01.T01 AT5G44700 26.305 498 292 19 6 441 751 1235 4.23e-29 121
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MsG0180004687.01.T01 AT2G41970 28.435 313 187 11 161 446 56 358 2.29e-28 115
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MsG0180004687.01.T01 AT4G02420 28.527 319 191 12 159 456 331 633 2.62e-28 119
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MsG0180004687.01.T01 AT5G49660 25.498 502 288 16 13 442 450 937 2.93e-28 119
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MsG0180004687.01.T01 AT3G18810 30.822 292 168 9 170 438 329 609 3.80e-28 118
MsG0180004687.01.T01 AT1G01540 32.377 244 132 9 170 390 146 379 3.88e-28 115
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MsG0180004687.01.T01 AT5G16900 25.991 454 287 11 9 443 424 847 5.54e-28 118
MsG0180004687.01.T01 AT1G24030 31.224 237 142 6 170 390 54 285 5.67e-28 113
MsG0180004687.01.T01 AT5G48740 29.431 299 164 10 170 440 600 879 5.72e-28 118
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MsG0180004687.01.T01 AT1G68690 28.904 301 177 12 170 447 369 655 1.87e-27 116
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MsG0180004687.01.T01 AT5G18610 29.932 294 170 11 170 438 75 357 4.39e-27 114
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MsG0180004687.01.T01 AT1G34210 26.780 295 188 10 165 438 292 579 8.08e-27 114
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MsG0180004687.01.T01 AT4G34440 28.082 292 176 9 170 438 304 584 2.42e-26 112
MsG0180004687.01.T01 AT4G34440 28.082 292 176 9 170 438 304 584 2.42e-26 112
MsG0180004687.01.T01 AT3G28690 27.419 310 177 12 169 444 17 312 2.43e-26 110
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MsG0180004687.01.T01 AT1G56145 27.368 380 182 12 135 438 621 982 3.10e-26 113
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MsG0180004687.01.T01 AT1G12460 29.448 326 187 14 146 441 564 876 3.74e-26 112
MsG0180004687.01.T01 AT1G55200 28.912 294 169 11 170 438 371 649 4.02e-26 112
MsG0180004687.01.T01 AT1G55200 28.912 294 169 11 170 438 371 649 4.02e-26 112
MsG0180004687.01.T01 AT1G55200 28.912 294 169 11 170 438 371 649 4.02e-26 112
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MsG0180004687.01.T01 AT2G28590 29.670 273 164 10 182 434 104 368 4.03e-26 110
MsG0180004687.01.T01 AT4G26540 23.958 480 303 19 6 441 580 1041 4.09e-26 112
MsG0180004687.01.T01 AT1G76360 30.640 297 173 10 170 441 155 443 4.72e-26 110
MsG0180004687.01.T01 AT3G28690 27.687 307 174 12 169 441 66 358 4.84e-26 110
MsG0180004687.01.T01 AT2G18470 28.522 291 176 10 170 438 276 556 5.02e-26 111
MsG0180004687.01.T01 AT2G18470 28.522 291 176 10 170 438 276 556 5.02e-26 111
MsG0180004687.01.T01 AT2G18470 28.522 291 176 10 170 438 276 556 5.02e-26 111
MsG0180004687.01.T01 AT1G55610 28.333 300 184 10 165 441 846 1137 5.34e-26 112
MsG0180004687.01.T01 AT1G55610 28.333 300 184 10 165 441 846 1137 5.34e-26 112
MsG0180004687.01.T01 AT2G13800 27.119 295 187 11 165 438 145 432 5.70e-26 110
MsG0180004687.01.T01 AT2G13800 27.119 295 187 11 165 438 145 432 5.70e-26 110
MsG0180004687.01.T01 AT2G39360 28.421 285 173 11 171 434 480 754 5.90e-26 112
MsG0180004687.01.T01 AT4G32710 31.818 242 136 9 170 394 381 610 5.99e-26 112
MsG0180004687.01.T01 AT3G04690 30.935 278 160 10 177 434 518 783 6.02e-26 112
MsG0180004687.01.T01 AT2G28930 27.273 319 194 11 157 445 59 369 6.37e-26 109
MsG0180004687.01.T01 AT3G53590 28.135 327 189 11 154 453 595 902 7.05e-26 112
MsG0180004687.01.T01 AT4G39400 24.481 482 304 14 13 445 692 1162 7.49e-26 112
MsG0180004687.01.T01 AT1G11130 27.740 292 180 10 169 441 410 689 7.54e-26 111
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MsG0180004687.01.T01 AT2G28930 27.273 319 194 11 157 445 48 358 7.72e-26 109
MsG0180004687.01.T01 AT1G72300 29.195 298 184 11 163 441 788 1077 7.75e-26 112
MsG0180004687.01.T01 AT1G11130 27.740 292 180 10 169 441 488 767 7.95e-26 111
MsG0180004687.01.T01 AT3G13690 28.620 297 168 11 169 438 402 681 8.80e-26 111
MsG0180004687.01.T01 AT3G13690 28.620 297 168 11 169 438 402 681 8.80e-26 111
MsG0180004687.01.T01 AT3G13690 28.620 297 168 11 169 438 402 681 8.80e-26 111
MsG0180004687.01.T01 AT1G51790 28.777 278 163 10 183 440 636 898 8.96e-26 111
MsG0180004687.01.T01 AT3G28690 27.778 306 173 12 170 441 118 409 9.08e-26 110
MsG0180004687.01.T01 AT4G05200 27.760 317 197 14 158 454 345 649 9.70e-26 111
MsG0180004687.01.T01 AT2G13800 27.119 295 187 11 165 438 262 549 9.71e-26 110
MsG0180004687.01.T01 AT2G13800 27.119 295 187 11 165 438 262 549 9.71e-26 110
MsG0180004687.01.T01 AT2G28930 27.273 319 194 11 157 445 51 361 9.86e-26 109
MsG0180004687.01.T01 AT4G23200 29.467 319 186 16 158 452 316 619 1.03e-25 110
MsG0180004687.01.T01 AT1G74490 28.716 296 176 11 170 441 83 367 1.45e-25 108
MsG0180004687.01.T01 AT4G23240 27.445 317 197 12 158 453 315 619 1.49e-25 110
MsG0180004687.01.T01 AT1G60800 26.552 290 184 11 170 438 226 507 1.49e-25 110
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MsG0180004687.01.T01 AT2G01210 26.708 322 178 10 170 441 398 711 1.66e-25 110
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MsG0180004687.01.T01 AT5G59270 27.240 279 172 8 179 438 371 637 1.75e-25 110
MsG0180004687.01.T01 AT5G59270 27.076 277 175 7 179 438 355 621 1.78e-25 110
MsG0180004687.01.T01 AT4G30520 25.466 483 292 18 6 438 108 572 1.92e-25 110
MsG0180004687.01.T01 AT1G28390 31.392 309 181 12 164 446 35 338 2.05e-25 108
MsG0180004687.01.T01 AT1G07570 26.398 322 199 10 157 448 58 371 2.06e-25 108
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MsG0180004687.01.T01 AT1G07570 26.398 322 199 10 157 448 47 360 2.16e-25 108
MsG0180004687.01.T01 AT1G60800 25.952 289 187 10 170 438 293 574 2.19e-25 109
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MsG0180004687.01.T01 AT3G21630 27.139 339 212 10 119 434 260 586 2.29e-25 109
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MsG0180004687.01.T01 AT4G21400 28.339 307 188 11 171 454 342 639 3.26e-25 109
MsG0180004687.01.T01 AT4G21400 28.339 307 188 11 171 454 354 651 3.55e-25 109
MsG0180004687.01.T01 AT2G30940 30.337 267 164 8 180 439 170 421 3.79e-25 107
MsG0180004687.01.T01 AT4G29180 25.806 310 189 8 162 440 550 849 3.99e-25 109
MsG0180004687.01.T01 AT4G23290 27.077 325 204 12 157 460 299 611 4.05e-25 108
MsG0180004687.01.T01 AT4G23290 27.077 325 204 12 157 460 342 654 4.12e-25 109
MsG0180004687.01.T01 AT3G02810 27.500 320 181 12 170 456 56 357 4.18e-25 108
MsG0180004687.01.T01 AT4G29180 25.806 310 189 8 162 440 551 850 4.25e-25 109
MsG0180004687.01.T01 AT5G66790 31.290 310 173 14 163 444 299 596 4.33e-25 108
MsG0180004687.01.T01 AT4G23320 27.848 316 195 13 158 452 163 466 4.42e-25 108
MsG0180004687.01.T01 AT4G23320 27.848 316 195 13 158 452 163 466 4.42e-25 108
MsG0180004687.01.T01 AT4G29180 25.806 310 189 8 162 440 553 852 4.54e-25 109
MsG0180004687.01.T01 AT1G69910 30.189 318 177 10 164 441 310 622 4.74e-25 108
MsG0180004687.01.T01 AT4G23140 28.990 307 188 12 165 452 338 633 5.03e-25 108
MsG0180004687.01.T01 AT3G55450 26.970 330 191 12 157 451 40 354 5.31e-25 106
MsG0180004687.01.T01 AT5G11410 30.769 247 146 9 215 444 6 244 5.53e-25 103
MsG0180004687.01.T01 AT3G55450 26.970 330 191 12 157 451 77 391 5.68e-25 107

Find 85 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 161 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CATCTTCAGCTCATTGATTT+TGG 0.068896 1:+81236641 None:intergenic
CTTGAAAGATTTGAAGATTT+TGG 0.126753 1:-81236868 MsG0180004687.01.T01:CDS
GGGCATCACATTATCTAAAA+TGG 0.146328 1:-81234545 MsG0180004687.01.T01:CDS
ATACTTTAGAAGCTCAATTT+AGG 0.256432 1:-81235513 MsG0180004687.01.T01:CDS
CTTGTTCCACCTGATCTTCT+TGG 0.263908 1:+81234478 None:intergenic
TTTAAGGAACATTCTTTCTA+TGG 0.267749 1:-81236915 MsG0180004687.01.T01:CDS
GAACTTGATTCTTCTTTGAT+AGG 0.295355 1:+81236146 None:intergenic
GGACATCTAGATGCTGATTT+TGG 0.297308 1:-81236822 MsG0180004687.01.T01:CDS
GCTCAAATAGTGTTCCATTT+GGG 0.307056 1:+81235301 None:intergenic
ATAATAGCTCACATGAAAAC+TGG 0.317579 1:-81234566 MsG0180004687.01.T01:CDS
TACCGGTCGAATTCCTTATT+CGG 0.331033 1:-81234592 MsG0180004687.01.T01:CDS
GAGCTATTATCAACCGAATA+AGG 0.332354 1:+81234579 None:intergenic
TAAAGTATTTGTCCAACTCT+TGG 0.349877 1:+81235528 None:intergenic
TTCAAGGCTACAATTTCTTC+AGG 0.351482 1:+81236885 None:intergenic
TGCTCAAATAGTGTTCCATT+TGG 0.352321 1:+81235300 None:intergenic
AATGTGTTGTGCAGTATTTA+AGG 0.353543 1:-81236931 MsG0180004687.01.T01:CDS
CACCAAAGTGGAGAAAGTTT+TGG 0.353878 1:+81234342 None:intergenic
TTCAGATGAATCTATTTCAT+TGG 0.354756 1:+81234710 None:intergenic
CAAAATCTTCAAATCTTTCA+AGG 0.361821 1:+81236869 None:intergenic
GTCGGTCTCTTGTCCGAATC+CGG 0.376219 1:+81234426 None:intergenic
GGATCCACCATTTCCTTAAG+AGG 0.376426 1:+81234516 None:intergenic
AAGTTATAAACATTACTTGA+TGG 0.379644 1:+81234639 None:intergenic
GATGGACTGATGAAGAATTC+AGG 0.379898 1:+81234775 None:intergenic
TCAAGTAATGTTTATAACTT+TGG 0.384487 1:-81234636 MsG0180004687.01.T01:CDS
CCCATTGCAATTCTAAGTCT+TGG 0.386864 1:+81234855 None:intergenic
AAAATGGGACAAACCTCTTA+AGG 0.390972 1:-81234529 MsG0180004687.01.T01:CDS
AACTTGATTCTTCTTTGATA+GGG 0.400606 1:+81236147 None:intergenic
CAAAACTTTCTCCACTTTGG+TGG 0.403248 1:-81234341 MsG0180004687.01.T01:CDS
TTTCTTGTTATTTCAAGCAT+TGG 0.404963 1:-81236088 MsG0180004687.01.T01:intron
AGATCTGATCTATTTAGCTT+TGG 0.408905 1:+81235670 None:intergenic
TTATTATTCGAAATTGTTAC+CGG 0.414131 1:-81234609 MsG0180004687.01.T01:CDS
CTGCGTGGTCATCGGTTAGA+TGG 0.418987 1:+81234757 None:intergenic
AGAAGCTCAATTTAGGAAGA+AGG 0.419558 1:-81235506 MsG0180004687.01.T01:intron
AAGAAGGTGAGCACTTGAAC+TGG 0.421067 1:-81234881 MsG0180004687.01.T01:CDS
AAAGCTAAATAGATCAGATC+TGG 0.430421 1:-81235668 MsG0180004687.01.T01:CDS
GTAATTGGTAATTCACCAAT+TGG 0.432303 1:-81235619 MsG0180004687.01.T01:CDS
GATAAGAGTTTGTGTTGATC+CGG 0.436093 1:-81234445 MsG0180004687.01.T01:CDS
CCAATCCATGCATATATTGT+AGG 0.439965 1:+81234820 None:intergenic
AGTTTGTGTTGATCCGGATT+CGG 0.446088 1:-81234439 MsG0180004687.01.T01:CDS
GGCTACAATTTCTTCAGGTA+TGG 0.446436 1:+81236890 None:intergenic
CCTTTGTACAATGTACCAAT+TGG 0.446501 1:+81235604 None:intergenic
GGCATCACATTATCTAAAAT+GGG 0.449479 1:-81234544 MsG0180004687.01.T01:CDS
GGACAAACCTCTTAAGGAAA+TGG 0.452227 1:-81234523 MsG0180004687.01.T01:CDS
TTCAGGTTAATGAGGGATAC+AGG 0.454131 1:+81234792 None:intergenic
TTCCAAAACTTTCTCCACTT+TGG 0.454336 1:-81234344 MsG0180004687.01.T01:CDS
AAAACTTTCTCCACTTTGGT+GGG 0.456023 1:-81234340 MsG0180004687.01.T01:CDS
AGATGGCATCTTATTTGCAT+TGG 0.464392 1:+81236584 None:intergenic
AGCATCTTACCAAGAAGATC+AGG 0.470897 1:-81234487 MsG0180004687.01.T01:CDS
ACACTATTTGAGCATTTACA+TGG 0.489153 1:-81235291 MsG0180004687.01.T01:intron
CTCAAATAGTGTTCCATTTG+GGG 0.498292 1:+81235302 None:intergenic
GTTTGAATTCCAGTAAAAGA+AGG 0.503023 1:-81234897 MsG0180004687.01.T01:intron
ATGAAGAATTCAGGTTAATG+AGG 0.504266 1:+81234784 None:intergenic
TCTTGGTAAGATGCTAGAGT+TGG 0.507895 1:+81234495 None:intergenic
CCTACAATATATGCATGGAT+TGG 0.509483 1:-81234820 MsG0180004687.01.T01:CDS
GGACAAGAGACCGACGATGA+AGG 0.518078 1:-81234418 MsG0180004687.01.T01:CDS
ACTTAGAATTGCAATGGGAA+TGG 0.528652 1:-81234850 MsG0180004687.01.T01:CDS
TTTGCCGGAGTAATTATTGG+TGG 0.538351 1:-81236118 MsG0180004687.01.T01:CDS
TAAGATTGACAAAATTCTTG+TGG 0.539829 1:+81235379 None:intergenic
AGAAGGTGAGCACTTGAACT+GGG 0.545235 1:-81234880 MsG0180004687.01.T01:CDS
ACTTGATTCTTCTTTGATAG+GGG 0.546840 1:+81236148 None:intergenic
ACCAAGACTTAGAATTGCAA+TGG 0.549123 1:-81234856 MsG0180004687.01.T01:CDS
AGAGCCTTTCACCAGAATGT+TGG 0.554615 1:-81235337 MsG0180004687.01.T01:CDS
CCAAGACTTAGAATTGCAAT+GGG 0.555688 1:-81234855 MsG0180004687.01.T01:CDS
TACAAAGGAACTTTATCTAG+TGG 0.558247 1:-81235589 MsG0180004687.01.T01:CDS
TTGGGATATAACAACTTCAG+TGG 0.562220 1:-81236843 MsG0180004687.01.T01:CDS
GAAGGTGAGCACTTGAACTG+GGG 0.568582 1:-81234879 MsG0180004687.01.T01:CDS
TATGTTACTAATCAACTGAA+AGG 0.574553 1:-81236537 MsG0180004687.01.T01:intron
ATTAGTAACATACCATGTGA+TGG 0.582743 1:+81236548 None:intergenic
AAAACCAACATTCTGGTGAA+AGG 0.585001 1:+81235333 None:intergenic
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TACTGCCTACAATATATGCA+TGG 0.588781 1:-81234825 MsG0180004687.01.T01:CDS
AGCACCACCAATAATTACTC+CGG 0.589578 1:+81236114 None:intergenic
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TCATCTGAAAAGAAACCTGA+TGG 0.594314 1:-81234696 MsG0180004687.01.T01:CDS
TCACTGACTTCCTTCATCGT+CGG 0.606120 1:+81234408 None:intergenic
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TGACCACGCAGCTAAAATCT+CGG 0.617417 1:-81234745 MsG0180004687.01.T01:CDS
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ATGGATCTTTCAGAACAAGA+TGG 0.638851 1:+81236567 None:intergenic
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AGGTTAATGAGGGATACAGG+AGG 0.694923 1:+81234795 None:intergenic

CRISPR-GE

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!! AACAAAACAGTAAAATTAGA+GGG - Chr1:81236231-81236250 MsG0180004687.01.T01:CDS 20.0%
!! AAGTTATAAACATTACTTGA+TGG + Chr1:81236608-81236627 None:intergenic 20.0%
!! AGATCAGTTTATAATATTAG+AGG - Chr1:81235483-81235502 MsG0180004687.01.T01:intron 20.0%
!! AGGACTAAAATAAAACAATA+AGG - Chr1:81236202-81236221 MsG0180004687.01.T01:CDS 20.0%
!! TACCTTATAATAGCATAAAA+TGG + Chr1:81234782-81234801 None:intergenic 20.0%
!! TATTGTTACTATGAATAGTT+TGG + Chr1:81235291-81235310 None:intergenic 20.0%
!! TCAAGTAATGTTTATAACTT+TGG - Chr1:81236608-81236627 MsG0180004687.01.T01:CDS 20.0%
!! TTATTATTCGAAATTGTTAC+CGG - Chr1:81236635-81236654 MsG0180004687.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAGAATTTTGTCAATCTTAT+TGG - Chr1:81235869-81235888 MsG0180004687.01.T01:intron 20.0%
!!! TTCATTTTAGAATCAGTATA+TGG + Chr1:81236172-81236191 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTTTCTTCTTTTCTTTGA+AGG - Chr1:81234834-81234853 MsG0180004687.01.T01:CDS 20.0%
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! ATATTCAAAAACCAACATTC+TGG + Chr1:81235921-81235940 None:intergenic 25.0%
! CAAAATCTTCAAATCTTTCA+AGG + Chr1:81234378-81234397 None:intergenic 25.0%
! TAAACCATAGTTAATTGGAA+AGG + Chr1:81234517-81234536 None:intergenic 25.0%
! TAAGATTGACAAAATTCTTG+TGG + Chr1:81235868-81235887 None:intergenic 25.0%
! TATGTTACTAATCAACTGAA+AGG - Chr1:81234707-81234726 MsG0180004687.01.T01:CDS 25.0%
! TTCAGATGAATCTATTTCAT+TGG + Chr1:81236537-81236556 None:intergenic 25.0%
! TTTAAGGAACATTCTTTCTA+TGG - Chr1:81234329-81234348 MsG0180004687.01.T01:CDS 25.0%
!! AGATTTGAAGATTTTGGATT+TGG - Chr1:81234382-81234401 MsG0180004687.01.T01:CDS 25.0%
!! ATACTTTAGAAGCTCAATTT+AGG - Chr1:81235731-81235750 MsG0180004687.01.T01:intron 25.0%
!! CCAACATAAACAAATTTTAC+TGG + Chr1:81236119-81236138 None:intergenic 25.0%
!! CCAGTAAAATTTGTTTATGT+TGG - Chr1:81236116-81236135 MsG0180004687.01.T01:CDS 25.0%
!! CTTGAAAGATTTGAAGATTT+TGG - Chr1:81234376-81234395 MsG0180004687.01.T01:CDS 25.0%
!! GATTTGAAGATTTTGGATTT+GGG - Chr1:81234383-81234402 MsG0180004687.01.T01:CDS 25.0%
!! GTCCATTTTATGCTATTATA+AGG - Chr1:81234777-81234796 MsG0180004687.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAACCAGAAGCATTTTTATT+AGG + Chr1:81235024-81235043 None:intergenic 25.0%
!!! CTAAAATGAACAAGTTTTGT+AGG - Chr1:81236182-81236201 MsG0180004687.01.T01:CDS 25.0%
!!! GAAGATTTTAGCAATGTAAT+TGG - Chr1:81235610-81235629 MsG0180004687.01.T01:CDS 25.0%
!!! GATATACCACTTTTTACTTT+TGG - Chr1:81236071-81236090 MsG0180004687.01.T01:intron 25.0%
!!! GTTTCCTGATTTTAATTTTC+AGG - Chr1:81235547-81235566 MsG0180004687.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTCTTGTTATTTCAAGCAT+TGG - Chr1:81235156-81235175 MsG0180004687.01.T01:intron 25.0%
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ACACTATTTGAGCATTTACA+TGG - Chr1:81235953-81235972 MsG0180004687.01.T01:intron 30.0%
ACTTGATTCTTCTTTGATAG+GGG + Chr1:81235099-81235118 None:intergenic 30.0%
AGTAAAAAGTGGTATATCTG+CGG + Chr1:81236069-81236088 None:intergenic 30.0%
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ATTAGTAACATACCATGTGA+TGG + Chr1:81234699-81234718 None:intergenic 30.0%
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ATTTAGATCTTCTCACATGT+TGG - Chr1:81235350-81235369 MsG0180004687.01.T01:CDS 30.0%
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CCAAAAGAAAAGTGGTAAAT+TGG - Chr1:81236255-81236274 MsG0180004687.01.T01:intron 30.0%
CCATAATTGTTTCCAAGTTA+AGG + Chr1:81235816-81235835 None:intergenic 30.0%
GAACTTGATTCTTCTTTGAT+AGG + Chr1:81235101-81235120 None:intergenic 30.0%
GTATGAAAGTTTGATGCATT+TGG - Chr1:81236320-81236339 MsG0180004687.01.T01:intron 30.0%
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TAAACCAATGAATCAACACT+TGG + Chr1:81236031-81236050 None:intergenic 30.0%
TAATAGCTCACATGAAAACT+GGG - Chr1:81236679-81236698 MsG0180004687.01.T01:CDS 30.0%
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TACGCTAAACCATAGTTAAT+TGG + Chr1:81234522-81234541 None:intergenic 30.0%
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TTCATGAAAATGAAGGTTCT+AGG - Chr1:81234861-81234880 MsG0180004687.01.T01:CDS 30.0%
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! ATGAAGAATTCAGGTTAATG+AGG + Chr1:81236463-81236482 None:intergenic 30.0%
! ATTTTTGCCGGAGTAATTAT+TGG - Chr1:81235123-81235142 MsG0180004687.01.T01:intron 30.0%
! CCTTAACTTGGAAACAATTA+TGG - Chr1:81235813-81235832 MsG0180004687.01.T01:intron 30.0%
! GGCATCACATTATCTAAAAT+GGG - Chr1:81236700-81236719 MsG0180004687.01.T01:intron 30.0%
! GTAATTGGTAATTCACCAAT+TGG - Chr1:81235625-81235644 MsG0180004687.01.T01:CDS 30.0%
! TAAAGTATTTGTCCAACTCT+TGG + Chr1:81235719-81235738 None:intergenic 30.0%
! TGAAGAATTCAGGTTAATGA+GGG + Chr1:81236462-81236481 None:intergenic 30.0%
!! AGATTCTGAAGCATTTCAAT+AGG + Chr1:81235001-81235020 None:intergenic 30.0%
!! CCAATTTACCACTTTTCTTT+TGG + Chr1:81236258-81236277 None:intergenic 30.0%
!!! AATCAAGTTCCTATTTTTGC+CGG - Chr1:81235111-81235130 MsG0180004687.01.T01:intron 30.0%
!!! AGTTTTGGAACTACAATTTC+AGG + Chr1:81236890-81236909 None:intergenic 30.0%
!!! ATCTTCAGCTCATTGATTTT+GGG + Chr1:81234605-81234624 None:intergenic 30.0%
AAAACCAACATTCTGGTGAA+AGG + Chr1:81235914-81235933 None:intergenic 35.0%
AAAACTTTCTCCACTTTGGT+GGG - Chr1:81236904-81236923 MsG0180004687.01.T01:CDS 35.0%
AAAATGGGACAAACCTCTTA+AGG - Chr1:81236715-81236734 MsG0180004687.01.T01:intron 35.0%
ACCAAGACTTAGAATTGCAA+TGG - Chr1:81236388-81236407 MsG0180004687.01.T01:intron 35.0%
ACTTAGAATTGCAATGGGAA+TGG - Chr1:81236394-81236413 MsG0180004687.01.T01:intron 35.0%
AGAAGCTCAATTTAGGAAGA+AGG - Chr1:81235738-81235757 MsG0180004687.01.T01:intron 35.0%
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AGTTAGCTATTGTTAGACCA+TGG - Chr1:81235199-81235218 MsG0180004687.01.T01:intron 35.0%
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CCAAGACTTAGAATTGCAAT+GGG - Chr1:81236389-81236408 MsG0180004687.01.T01:intron 35.0%
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CCAATTGGTACATTGTACAA+AGG - Chr1:81235640-81235659 MsG0180004687.01.T01:CDS 35.0%
CCTACAATATATGCATGGAT+TGG - Chr1:81236424-81236443 MsG0180004687.01.T01:intron 35.0%
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GGGCATCACATTATCTAAAA+TGG - Chr1:81236699-81236718 MsG0180004687.01.T01:intron 35.0%
GTAAAAAGTGGTATATCTGC+GGG + Chr1:81236068-81236087 None:intergenic 35.0%
TACTGCCTACAATATATGCA+TGG - Chr1:81236419-81236438 MsG0180004687.01.T01:intron 35.0%
TCATCTGAAAAGAAACCTGA+TGG - Chr1:81236548-81236567 MsG0180004687.01.T01:CDS 35.0%
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TTCCAAAACTTTCTCCACTT+TGG - Chr1:81236900-81236919 MsG0180004687.01.T01:CDS 35.0%
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! AGATGGCATCTTATTTGCAT+TGG + Chr1:81234663-81234682 None:intergenic 35.0%
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! TCAATGTGTTTTCTACCATC+AGG + Chr1:81236566-81236585 None:intergenic 35.0%
!! CTTTCCAAGTGTTGATTCAT+TGG - Chr1:81236024-81236043 MsG0180004687.01.T01:intron 35.0%
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!!! CATCTTCAGCTCATTGATTT+TGG + Chr1:81234606-81234625 None:intergenic 35.0%
!!! GAATCAGCAGCATTTTGATT+AGG + Chr1:81235048-81235067 None:intergenic 35.0%
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ATCTTACCAAGAAGATCAGG+TGG - Chr1:81236760-81236779 MsG0180004687.01.T01:intron 40.0%
ATTGTTAGACCATGGAGTAC+TGG - Chr1:81235207-81235226 MsG0180004687.01.T01:intron 40.0%
CAAAACTTTCTCCACTTTGG+TGG - Chr1:81236903-81236922 MsG0180004687.01.T01:CDS 40.0%
CAAACCTCTTAAGGAAATGG+TGG - Chr1:81236724-81236743 MsG0180004687.01.T01:intron 40.0%
CCCATTGCAATTCTAAGTCT+TGG + Chr1:81236392-81236411 None:intergenic 40.0%
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TACCGGTCGAATTCCTTATT+CGG - Chr1:81236652-81236671 MsG0180004687.01.T01:CDS 40.0%
TAGAGGGACCAAAAGAAAAG+TGG - Chr1:81236247-81236266 MsG0180004687.01.T01:intron 40.0%
TCTTGGTAAGATGCTAGAGT+TGG + Chr1:81236752-81236771 None:intergenic 40.0%
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! AAGTGCTCACCTTCTTTTAC+TGG + Chr1:81236359-81236378 None:intergenic 40.0%
! AGTTTGTGTTGATCCGGATT+CGG - Chr1:81236805-81236824 MsG0180004687.01.T01:CDS 40.0%
! CACCAAAGTGGAGAAAGTTT+TGG + Chr1:81236905-81236924 None:intergenic 40.0%
! CTGTGACATTTTCCAAGAGT+TGG - Chr1:81235704-81235723 MsG0180004687.01.T01:intron 40.0%
! TTCAGGTTAATGAGGGATAC+AGG + Chr1:81236455-81236474 None:intergenic 40.0%
!! CGGTTATGACGGTATTGATA+AGG + Chr1:81234921-81234940 None:intergenic 40.0%
!! GATGGACTGATGAAGAATTC+AGG + Chr1:81236472-81236491 None:intergenic 40.0%
!! GTTCTGAAAGATCCATCACA+TGG - Chr1:81234684-81234703 MsG0180004687.01.T01:CDS 40.0%
!!! GGACATCTAGATGCTGATTT+TGG - Chr1:81234422-81234441 MsG0180004687.01.T01:CDS 40.0%
AAGAAGGTGAGCACTTGAAC+TGG - Chr1:81236363-81236382 MsG0180004687.01.T01:intron 45.0%
AGAAGGTGAGCACTTGAACT+GGG - Chr1:81236364-81236383 MsG0180004687.01.T01:intron 45.0%
AGAGCCTTTCACCAGAATGT+TGG - Chr1:81235907-81235926 MsG0180004687.01.T01:intron 45.0%
AGGTTAATGAGGGATACAGG+AGG + Chr1:81236452-81236471 None:intergenic 45.0%
CACATTCTCCAAGTCCTCAT+CGG - Chr1:81234970-81234989 MsG0180004687.01.T01:intron 45.0%
CTTGTTCCACCTGATCTTCT+TGG + Chr1:81236769-81236788 None:intergenic 45.0%
GGATCCACCATTTCCTTAAG+AGG + Chr1:81236731-81236750 None:intergenic 45.0%
GGTTAATGAGGGATACAGGA+GGG + Chr1:81236451-81236470 None:intergenic 45.0%
GTGGTGAAGTACGGTTATGA+CGG + Chr1:81234932-81234951 None:intergenic 45.0%
TGACCACGCAGCTAAAATCT+CGG - Chr1:81236499-81236518 MsG0180004687.01.T01:intron 45.0%
TGAGGACTTGGAGAATGTGA+AGG + Chr1:81234969-81234988 None:intergenic 45.0%
!! CCATGGAGTACTGGAATAAG+CGG - Chr1:81235216-81235235 MsG0180004687.01.T01:intron 45.0%
!! GCTTCAGAAAGCACTTGTCA+CGG - Chr1:81235242-81235261 MsG0180004687.01.T01:intron 45.0%
!! TCACTGACTTCCTTCATCGT+CGG + Chr1:81236839-81236858 None:intergenic 45.0%
!!! AATCCGAGATTTTAGCTGCG+TGG + Chr1:81236505-81236524 None:intergenic 45.0%
!!! GATTTTAGCTGCGTGGTCAT+CGG + Chr1:81236498-81236517 None:intergenic 45.0%
AGGAGAATCCGATGAGGACT+TGG + Chr1:81234981-81235000 None:intergenic 50.0%
CCGCTTATTCCAGTACTCCA+TGG + Chr1:81235219-81235238 None:intergenic 50.0%
GAAGGTGAGCACTTGAACTG+GGG - Chr1:81236365-81236384 MsG0180004687.01.T01:intron 50.0%
TCAATCTCAGCCCACCAAAG+TGG + Chr1:81236917-81236936 None:intergenic 50.0%
GGACAAGAGACCGACGATGA+AGG - Chr1:81236826-81236845 MsG0180004687.01.T01:CDS 55.0%
GTCGGTCTCTTGTCCGAATC+CGG + Chr1:81236821-81236840 None:intergenic 55.0%
! CTGCGTGGTCATCGGTTAGA+TGG + Chr1:81236490-81236509 None:intergenic 55.0%
!! TGAAGGTTCTAGGAGCCTGC+AGG - Chr1:81234871-81234890 MsG0180004687.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 81234314 81236952 81234314 ID=MsG0180004687.01;Name=MsG0180004687.01
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Chr1 exon 81236795 81236952 81236795 ID=MsG0180004687.01.T01:exon:34400;Parent=MsG0180004687.01.T01
Chr1 exon 81236538 81236701 81236538 ID=MsG0180004687.01.T01:exon:34399;Parent=MsG0180004687.01.T01
Chr1 exon 81236089 81236250 81236089 ID=MsG0180004687.01.T01:exon:34398;Parent=MsG0180004687.01.T01
Chr1 exon 81235507 81235697 81235507 ID=MsG0180004687.01.T01:exon:34397;Parent=MsG0180004687.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0180004687.01.T01

ATGTGTTGTGCAGTATTTAAGGAACATTCTTTCTATGGAACCATACCTGAAGAAATTGTAGCCTTGAAAGATTTGAAGATTTTGGATTTGGGATATAACAACTTCAGTGGACATCTAGATGCTGATTTTGGTCATAATATCACATCACTAGCAATTCTTTTGCTTGACAACAATGAGCTCCTTGTTAGTTTCTCTCCCAAAATCAATGAGCTGAAGATGCTTTCTGAGTATCAAGTAGATGAAAATCAGTTAACCAATGCAAATAAGATGCCATCTTGTTCTGAAAGATCCATCACATGGTATGTTACTAATCAACTGAAAGAATCTCCTAATAAAAATGCTTCTGGTTTTCCTAATCAAAATGCTGCTGATTCTCTAATCAAATGCTTCTCACTCTCTTCTCCCCTATCAAAGAAGAATCAAGTTCCTATTTTTGCCGGAGTAATTATTGGTGGTGCTGTTTTTCTTGTTATTTCAAGCATTGGTGTGCCAAAGCTAAATAGATCAGATCTGGAAGCAGCATGTGAAGATTTTAGCAATGTAATTGGTAATTCACCAATTGGTACATTGTACAAAGGAACTTTATCTAGTGGAGTTGAAATTGCTGTAGCTTCTGTTTCTGTGACATTTTCCAAGAGTTGGACAAATACTTTAGAAGCTCAATTTAGGAAGAAGATAGAGACATTATCAAGAGTGAACCACAAGAATTTTGTCAATCTTATTGGATACTGTGAAGAAGAAGAGCCTTTCACCAGAATGTTGGTTTTTGAATATGCCCCAAATGGAACACTATTTGAGCATTTACATGTAAAAGAAGGTGAGCACTTGAACTGGGGACCAAGACTTAGAATTGCAATGGGAATGGCTTACTGCCTACAATATATGCATGGATTGGACCCTCCTGTATCCCTCATTAACCTGAATTCTTCATCAGTCCATCTAACCGATGACCACGCAGCTAAAATCTCGGATTTGAGTTTCTCCAATGAAATAGATTCATCTGAAAAGAAACCTGATGGTAGAAAACACATTGACATGATGCAATCAGCAAGTCCATCAAGTAATGTTTATAACTTTGGTGTTTTATTATTCGAAATTGTTACCGGTCGAATTCCTTATTCGGTTGATAATAGCTCACATGAAAACTGGGCATCACATTATCTAAAATGGGACAAACCTCTTAAGGAAATGGTGGATCCAACTCTAGCATCTTACCAAGAAGATCAGGTGGAACAAGTTGCTGAATTGATAAGAGTTTGTGTTGATCCGGATTCGGACAAGAGACCGACGATGAAGGAAGTCAGTGAGATATTGAGAGAGATAACAAAAATGTCGCCTGAAATTGTAGTTCCAAAACTTTCTCCACTTTGGTGGGCTGAGATTGAGATTTCTTCTGCATAA

Protein sequence

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MCCAVFKEHSFYGTIPEEIVALKDLKILDLGYNNFSGHLDADFGHNITSLAILLLDNNELLVSFSPKINELKMLSEYQVDENQLTNANKMPSCSERSITWYVTNQLKESPNKNASGFPNQNAADSLIKCFSLSSPLSKKNQVPIFAGVIIGGAVFLVISSIGVPKLNRSDLEAACEDFSNVIGNSPIGTLYKGTLSSGVEIAVASVSVTFSKSWTNTLEAQFRKKIETLSRVNHKNFVNLIGYCEEEEPFTRMLVFEYAPNGTLFEHLHVKEGEHLNWGPRLRIAMGMAYCLQYMHGLDPPVSLINLNSSSVHLTDDHAAKISDLSFSNEIDSSEKKPDGRKHIDMMQSASPSSNVYNFGVLLFEIVTGRIPYSVDNSSHENWASHYLKWDKPLKEMVDPTLASYQEDQVEQVAELIRVCVDPDSDKRPTMKEVSEILREITKMSPEIVVPKLSPLWWAEIEISSA*