AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480020225.01


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MsG0480020225.01.T01 AT1G11300 36.193 373 222 10 1 366 66 429 2.53e-68 231
MsG0480020225.01.T01 AT1G11350 32.905 389 250 8 1 383 61 444 8.41e-67 227
MsG0480020225.01.T01 AT1G11340 36.126 382 214 12 1 366 126 493 1.32e-65 222
MsG0480020225.01.T01 AT1G61380 36.170 376 223 10 1 369 59 424 1.93e-65 223
MsG0480020225.01.T01 AT1G11340 36.126 382 214 12 1 366 58 425 1.94e-65 223
MsG0480020225.01.T01 AT1G11340 36.126 382 214 12 1 366 126 493 2.70e-65 222
MsG0480020225.01.T01 AT1G11303 34.853 373 227 10 1 366 66 429 2.89e-65 223
MsG0480020225.01.T01 AT1G61610 32.292 384 238 11 1 372 68 441 7.17e-65 220
MsG0480020225.01.T01 AT1G61610 32.292 384 238 11 1 372 68 441 1.46e-64 221
MsG0480020225.01.T01 AT1G61390 35.787 394 230 15 1 382 80 462 3.60e-64 219
MsG0480020225.01.T01 AT1G61360 34.250 400 246 11 1 393 58 447 5.14e-64 219
MsG0480020225.01.T01 AT1G61480 32.533 375 240 8 1 373 62 425 2.84e-60 209
MsG0480020225.01.T01 AT1G11280 32.481 391 245 10 1 382 66 446 1.67e-59 204
MsG0480020225.01.T01 AT1G61370 32.908 392 237 12 1 383 63 437 2.86e-59 206
MsG0480020225.01.T01 AT1G61490 31.877 389 246 10 1 382 62 438 5.98e-59 205
MsG0480020225.01.T01 AT1G61490 31.877 389 246 10 1 382 62 438 5.98e-59 205
MsG0480020225.01.T01 AT1G61490 31.877 389 246 10 1 382 62 438 5.98e-59 205
MsG0480020225.01.T01 AT1G61490 31.877 389 246 10 1 382 62 438 5.98e-59 205
MsG0480020225.01.T01 AT1G11280 32.481 391 245 10 1 382 76 456 6.71e-59 205
MsG0480020225.01.T01 AT1G11280 32.481 391 245 10 1 382 66 446 6.95e-59 205
MsG0480020225.01.T01 AT1G11280 32.481 391 245 10 1 382 66 446 7.72e-59 205
MsG0480020225.01.T01 AT1G11280 32.481 391 245 10 1 382 76 456 8.05e-59 205
MsG0480020225.01.T01 AT1G61440 32.979 376 223 12 1 366 55 411 4.26e-58 202
MsG0480020225.01.T01 AT1G61440 32.979 376 223 12 1 366 55 411 4.58e-58 202
MsG0480020225.01.T01 AT1G61440 32.979 376 223 12 1 366 55 411 5.04e-58 202
MsG0480020225.01.T01 AT1G61400 32.821 390 233 11 3 383 74 443 7.13e-58 202
MsG0480020225.01.T01 AT1G61400 32.821 390 233 11 3 383 74 443 9.47e-58 202
MsG0480020225.01.T01 AT1G11410 31.937 382 230 10 1 366 37 404 1.21e-57 201
MsG0480020225.01.T01 AT1G11410 31.937 382 230 10 1 366 61 428 1.51e-57 201
MsG0480020225.01.T01 AT1G11410 31.937 382 230 10 1 366 68 435 1.58e-57 201
MsG0480020225.01.T01 AT1G61430 32.000 375 227 11 1 366 39 394 3.24e-56 194
MsG0480020225.01.T01 AT1G61430 32.447 376 224 12 1 366 62 417 7.80e-56 193
MsG0480020225.01.T01 AT1G61430 32.447 376 224 12 1 366 62 417 7.80e-56 193
MsG0480020225.01.T01 AT1G61430 32.000 375 227 11 1 366 71 426 8.70e-56 193
MsG0480020225.01.T01 AT4G00340 34.985 343 195 10 3 336 60 383 2.35e-55 195
MsG0480020225.01.T01 AT4G00340 34.985 343 195 10 3 336 60 383 2.78e-55 195
MsG0480020225.01.T01 AT1G61430 32.447 376 224 12 1 366 39 394 3.06e-55 193
MsG0480020225.01.T01 AT1G61430 32.447 376 224 12 1 366 62 417 4.48e-55 193
MsG0480020225.01.T01 AT1G61430 32.447 376 224 12 1 366 62 417 4.48e-55 193
MsG0480020225.01.T01 AT1G61430 32.447 376 224 12 1 366 62 417 4.59e-55 193
MsG0480020225.01.T01 AT1G61430 32.447 376 224 12 1 366 39 394 5.12e-55 194
MsG0480020225.01.T01 AT1G61430 32.447 376 224 12 1 366 39 394 5.12e-55 194
MsG0480020225.01.T01 AT1G61430 32.447 376 224 12 1 366 39 394 5.12e-55 194
MsG0480020225.01.T01 AT1G61430 32.447 376 224 12 1 366 62 417 6.09e-55 194
MsG0480020225.01.T01 AT1G61430 32.447 376 224 12 1 366 62 417 6.77e-55 194
MsG0480020225.01.T01 AT1G61360 35.380 342 204 11 32 366 8 339 2.82e-54 191
MsG0480020225.01.T01 AT1G61360 35.380 342 204 11 32 366 8 339 2.82e-54 191
MsG0480020225.01.T01 AT1G61360 35.380 342 204 11 32 366 8 339 2.82e-54 191
MsG0480020225.01.T01 AT1G61500 32.698 367 236 7 1 366 45 401 1.10e-53 190
MsG0480020225.01.T01 AT1G61500 32.698 367 236 7 1 366 63 419 1.65e-53 190
MsG0480020225.01.T01 AT1G61500 32.698 367 236 7 1 366 68 424 1.71e-53 190
MsG0480020225.01.T01 AT1G61420 31.608 367 240 7 1 366 62 418 2.13e-53 190
MsG0480020225.01.T01 AT1G61420 31.608 367 240 7 1 366 62 418 2.13e-53 190
MsG0480020225.01.T01 AT1G61420 31.608 367 240 7 1 366 62 418 2.14e-53 189
MsG0480020225.01.T01 AT1G61490 30.334 389 226 10 1 382 62 412 2.37e-52 186
MsG0480020225.01.T01 AT1G61490 30.334 389 226 10 1 382 62 412 2.37e-52 186
MsG0480020225.01.T01 AT1G61550 31.818 374 230 10 1 366 57 413 1.94e-51 184
MsG0480020225.01.T01 AT4G03230 31.078 399 233 14 1 381 70 444 1.73e-50 182
MsG0480020225.01.T01 AT4G03230 31.078 399 233 14 1 381 70 444 1.73e-50 182
MsG0480020225.01.T01 AT4G03230 31.186 388 225 14 1 370 70 433 3.49e-50 181
MsG0480020225.01.T01 AT4G27300 31.606 386 224 13 1 366 67 432 8.33e-48 174
MsG0480020225.01.T01 AT1G11410 31.988 322 192 8 58 366 6 313 1.65e-47 172
MsG0480020225.01.T01 AT1G61460 31.436 369 203 11 1 366 63 384 3.47e-46 169
MsG0480020225.01.T01 AT1G61380 34.783 299 178 10 95 382 2 294 6.18e-43 159
MsG0480020225.01.T01 AT1G61390 34.114 299 180 11 95 382 2 294 9.40e-43 159
MsG0480020225.01.T01 AT4G03230 29.539 369 220 12 30 381 27 372 2.14e-42 159
MsG0480020225.01.T01 AT1G61490 30.169 295 191 7 95 382 2 288 4.92e-40 151
MsG0480020225.01.T01 AT1G61370 30.479 292 183 9 100 383 7 286 9.65e-37 141
MsG0480020225.01.T01 AT1G61420 30.037 273 184 5 95 366 2 268 7.52e-35 136
MsG0480020225.01.T01 AT1G61420 30.037 273 184 5 95 366 2 268 8.28e-35 136
MsG0480020225.01.T01 AT3G16030 29.870 385 223 14 1 366 63 419 2.23e-31 126
MsG0480020225.01.T01 AT3G16030 30.263 380 217 15 3 363 77 427 8.97e-30 121
MsG0480020225.01.T01 AT3G16030 30.263 380 217 15 3 363 77 427 8.97e-30 121
MsG0480020225.01.T01 AT3G16030 30.263 380 217 15 3 363 77 427 8.97e-30 121
MsG0480020225.01.T01 AT3G16030 30.263 380 217 15 3 363 77 427 1.09e-29 121
MsG0480020225.01.T01 AT3G16030 30.263 380 217 16 3 363 77 427 1.23e-29 121
MsG0480020225.01.T01 AT3G16030 30.263 380 217 16 3 363 77 427 1.31e-29 121
MsG0480020225.01.T01 AT4G03230 25.474 369 207 11 30 381 27 344 2.79e-29 120
MsG0480020225.01.T01 AT4G03230 25.474 369 207 11 30 381 27 344 2.79e-29 120
MsG0480020225.01.T01 AT4G03230 27.368 285 178 7 112 381 17 287 3.28e-29 120
MsG0480020225.01.T01 AT4G03230 27.368 285 178 7 112 381 9 279 3.93e-29 120
MsG0480020225.01.T01 AT1G67520 36.098 205 122 5 7 207 74 273 1.60e-27 114
MsG0480020225.01.T01 AT1G67520 36.098 205 122 5 7 207 74 273 2.19e-27 114
MsG0480020225.01.T01 AT1G67520 36.098 205 122 5 7 207 74 273 3.27e-27 114
MsG0480020225.01.T01 AT1G67520 36.098 205 122 5 7 207 81 280 3.44e-27 114
MsG0480020225.01.T01 AT1G67520 38.462 182 106 4 7 187 74 250 7.22e-27 113
MsG0480020225.01.T01 AT5G39370 46.094 128 66 3 1 127 1 126 2.99e-24 97.4
MsG0480020225.01.T01 AT5G18470 40.789 152 84 4 59 205 137 287 1.83e-23 101
MsG0480020225.01.T01 AT3G16030 29.739 306 171 12 76 363 4 283 8.26e-22 98.2
MsG0480020225.01.T01 AT1G78850 26.216 370 212 16 11 352 89 425 2.17e-16 80.9
MsG0480020225.01.T01 AT2G01780 27.160 243 142 6 7 223 42 275 7.73e-15 74.7
MsG0480020225.01.T01 AT1G78820 23.901 364 215 13 4 329 86 425 3.04e-14 74.3
MsG0480020225.01.T01 AT2G41890 24.925 333 176 15 26 329 93 380 1.06e-12 70.1
MsG0480020225.01.T01 AT5G35370 24.496 347 208 14 5 332 79 390 3.92e-11 65.5

Find 71 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 76 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CCAATTCATATTTGATTCTT+TGG 0.142892 4:-36886211 MsG0480020225.01.T01:CDS
CTCAGCAGTGGAATTTATTT+TGG 0.165907 4:-36885974 MsG0480020225.01.T01:CDS
GCAAAGTTTGACCTCATTTC+AGG 0.230665 4:+36886128 None:intergenic
CCAACAGATACATGGCTTCC+TGG 0.282552 4:-36886347 MsG0480020225.01.T01:CDS
TGATGGTAATTTAGTTCTCT+TGG 0.297378 4:-36886519 MsG0480020225.01.T01:CDS
GTAATCTTATATTAAGTAAT+AGG 0.312379 4:-36886415 MsG0480020225.01.T01:CDS
CGAACTCTTTATGACTTTGC+CGG 0.316730 4:-36885730 MsG0480020225.01.T01:CDS
CCATACAAACATTTGCAGTA+TGG 0.346677 4:+36885879 None:intergenic
ACAGTAGTGTTTGTATCGTT+TGG 0.348846 4:-36885626 MsG0480020225.01.T01:CDS
CCAAAGAATCAAATATGAAT+TGG 0.357933 4:+36886211 None:intergenic
GAATGGACAAATATTCAGTT+TGG 0.358248 4:-36886153 MsG0480020225.01.T01:CDS
TTATGTTGAAATAAGATGTT+AGG 0.362926 4:-36885454 None:intergenic
TCCCAATCAGATTGTGACTT+TGG 0.367198 4:+36885849 None:intergenic
ATCAGTCTCAAAATCTAGTT+TGG 0.368058 4:-36886496 MsG0480020225.01.T01:CDS
CGTCGGTATCAGATGCTCTT+TGG 0.378345 4:-36886385 MsG0480020225.01.T01:CDS
CCATACTGCAAATGTTTGTA+TGG 0.390478 4:-36885879 MsG0480020225.01.T01:CDS
AGAGAGAATAAACCGGTTGC+TGG 0.392184 4:+36886254 None:intergenic
GATACAAACACTACTGTCAT+AGG 0.394628 4:+36885632 None:intergenic
TATCACAAAAGACATATGTT+TGG 0.400334 4:-36886598 MsG0480020225.01.T01:CDS
AACCAAAGTCACAATCTGAT+TGG 0.402016 4:-36885851 MsG0480020225.01.T01:CDS
CATGATTCTATAAGCAATGA+AGG 0.426895 4:-36885516 MsG0480020225.01.T01:CDS
ATCACAAAAGACATATGTTT+GGG 0.429461 4:-36886597 MsG0480020225.01.T01:CDS
GCATCTGATACCGACGCATT+AGG 0.432907 4:+36886392 None:intergenic
CTATCCTCGTCACCAGTAGA+AGG 0.434514 4:+36885762 None:intergenic
TATGCTTTCTGTGGTGCATT+TGG 0.434803 4:-36885924 MsG0480020225.01.T01:CDS
CGGCAAAGTCATAAAGAGTT+CGG 0.436385 4:+36885731 None:intergenic
GAATCTGCAACAGCTTTCTC+AGG 0.446704 4:-36885589 MsG0480020225.01.T01:CDS
CGTCACGAAACTGAAATCAT+AGG 0.447592 4:+36886106 None:intergenic
GGAATAAAACTAAACAGTAT+TGG 0.452289 4:-36886190 MsG0480020225.01.T01:CDS
TTCCATGCAGTGAGATATTG+AGG 0.456942 4:+36886290 None:intergenic
TAAACTTCACACTGTGCTCT+TGG 0.461734 4:+36885945 None:intergenic
TCGTTTCGTGATGGATATCT+CGG 0.475771 4:-36886030 MsG0480020225.01.T01:CDS
ATCTTATTTCAACATAAACT+TGG 0.476487 4:+36885460 None:intergenic
TCAGTTTGGTTCCTGAAATG+AGG 0.487266 4:-36886139 MsG0480020225.01.T01:CDS
GTATCTTCAAATCCTTCTAC+TGG 0.487366 4:-36885774 MsG0480020225.01.T01:CDS
ACCAAAGTCACAATCTGATT+GGG 0.487551 4:-36885850 MsG0480020225.01.T01:CDS
CTTCTACTGGTGACGAGGAT+AGG 0.495908 4:-36885761 MsG0480020225.01.T01:CDS
AGTATTGGACAAGTGGTCCT+TGG 0.496013 4:-36886175 MsG0480020225.01.T01:CDS
AACAGTGAAGATCCAGCAAC+CGG 0.496375 4:-36886266 MsG0480020225.01.T01:CDS
GTCATAGGCAAATGCAGTGC+AGG 0.513825 4:+36885647 None:intergenic
CCAGGAAGCCATGTATCTGT+TGG 0.515643 4:+36886347 None:intergenic
CGTTTCGTGATGGATATCTC+GGG 0.521935 4:-36886029 MsG0480020225.01.T01:CDS
TGGACAAGTGGTCCTTGGAA+TGG 0.529447 4:-36886170 MsG0480020225.01.T01:CDS
TACTATATCTCGTTTCGTGA+TGG 0.531416 4:-36886039 MsG0480020225.01.T01:CDS
TCAAAGTTTACTATTTCTGA+TGG 0.532395 4:-36886536 MsG0480020225.01.T01:CDS
CTGAATATTTGTCCATTCCA+AGG 0.535577 4:+36886158 None:intergenic
GATCAAGCAACTTACCTGGC+TGG 0.536022 4:-36886003 MsG0480020225.01.T01:CDS
AACAAATAAGTTTCAATGTG+AGG 0.546776 4:-36885796 MsG0480020225.01.T01:CDS
CTTTCTCAGGATGATAGTAA+TGG 0.556163 4:-36885576 MsG0480020225.01.T01:CDS
AGCCTCAATATCTCACTGCA+TGG 0.556382 4:-36886292 MsG0480020225.01.T01:CDS
GGCAGATCAAGCAACTTACC+TGG 0.566104 4:-36886007 MsG0480020225.01.T01:CDS
CTGCTGAGTACTTTCCAGCC+AGG 0.575339 4:+36885989 None:intergenic
AAATATGAATTGGTTCCACT+AGG 0.576937 4:+36886221 None:intergenic
GATCTTGCAGATTACTCACA+TGG 0.579229 4:-36885828 MsG0480020225.01.T01:CDS
ACTAAACAGTATTGGACAAG+TGG 0.582689 4:-36886182 MsG0480020225.01.T01:CDS
GGAAAATGCGCAATCTGTTG+TGG 0.584929 4:-36885709 MsG0480020225.01.T01:CDS
AATATGAATTGGTTCCACTA+GGG 0.587617 4:+36886222 None:intergenic
CAATCTGTTGTGGATGCTGT+GGG 0.588207 4:-36885699 MsG0480020225.01.T01:CDS
TAGTTCAAGAGAGAATAAAC+CGG 0.595378 4:+36886247 None:intergenic
GCAATCTGTTGTGGATGCTG+TGG 0.599454 4:-36885700 MsG0480020225.01.T01:CDS
TGTGAAGTTTATGCTTTCTG+TGG 0.600988 4:-36885933 MsG0480020225.01.T01:CDS
GCAACTACAGAATTTGAACT+AGG 0.602805 4:+36886455 None:intergenic
AAGTAATAGGCCTAATGCGT+CGG 0.628567 4:-36886402 MsG0480020225.01.T01:CDS
GGCTGGAAAGTACTCAGCAG+TGG 0.634189 4:-36885986 MsG0480020225.01.T01:CDS
AGTGTTTGTATCGTTTGGAG+CGG 0.645638 4:-36885621 MsG0480020225.01.T01:CDS
ACAGATACATGGCTTCCTGG+TGG 0.653280 4:-36886344 MsG0480020225.01.T01:CDS
TATAAGCAATGAAGGAACAA+CGG 0.654445 4:-36885508 MsG0480020225.01.T01:CDS
AAATCCTTCTACTGGTGACG+AGG 0.656699 4:-36885766 MsG0480020225.01.T01:CDS
ATCTTGCAGATTACTCACAT+GGG 0.662995 4:-36885827 MsG0480020225.01.T01:CDS
TCTCTTGAACTAGACCCTAG+TGG 0.670093 4:-36886236 MsG0480020225.01.T01:CDS
GTTTCGTGATGGATATCTCG+GGG 0.696129 4:-36886028 MsG0480020225.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! GTAATCTTATATTAAGTAAT+AGG - Chr4:36885654-36885673 MsG0480020225.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATCTTATTTCAACATAAACT+TGG + Chr4:36886612-36886631 None:intergenic 20.0%
! AACAAATAAGTTTCAATGTG+AGG - Chr4:36886273-36886292 MsG0480020225.01.T01:CDS 25.0%
! ATCACAAAAGACATATGTTT+GGG - Chr4:36885472-36885491 MsG0480020225.01.T01:CDS 25.0%
! CCAAAGAATCAAATATGAAT+TGG + Chr4:36885861-36885880 None:intergenic 25.0%
! CCAATTCATATTTGATTCTT+TGG - Chr4:36885858-36885877 MsG0480020225.01.T01:CDS 25.0%
! GGAATAAAACTAAACAGTAT+TGG - Chr4:36885879-36885898 MsG0480020225.01.T01:CDS 25.0%
! TATCACAAAAGACATATGTT+TGG - Chr4:36885471-36885490 MsG0480020225.01.T01:CDS 25.0%
!!! GAAGATTTTTTATCAGAAAC+TGG + Chr4:36885515-36885534 None:intergenic 25.0%
!!! TCAAAGTTTACTATTTCTGA+TGG - Chr4:36885533-36885552 MsG0480020225.01.T01:CDS 25.0%
ATCAGTCTCAAAATCTAGTT+TGG - Chr4:36885573-36885592 MsG0480020225.01.T01:CDS 30.0%
CATGATTCTATAAGCAATGA+AGG - Chr4:36886553-36886572 MsG0480020225.01.T01:CDS 30.0%
GAATGGACAAATATTCAGTT+TGG - Chr4:36885916-36885935 MsG0480020225.01.T01:CDS 30.0%
TAGTTCAAGAGAGAATAAAC+CGG + Chr4:36885825-36885844 None:intergenic 30.0%
TATAAGCAATGAAGGAACAA+CGG - Chr4:36886561-36886580 MsG0480020225.01.T01:CDS 30.0%
! AAATATGAATTGGTTCCACT+AGG + Chr4:36885851-36885870 None:intergenic 30.0%
! AATATGAATTGGTTCCACTA+GGG + Chr4:36885850-36885869 None:intergenic 30.0%
! TTGATTTTCCAACAGATACA+TGG - Chr4:36885714-36885733 MsG0480020225.01.T01:CDS 30.0%
!! TCAAGTTTAATTTTTCCACC+AGG + Chr4:36885743-36885762 None:intergenic 30.0%
!! TGATGGTAATTTAGTTCTCT+TGG - Chr4:36885550-36885569 MsG0480020225.01.T01:CDS 30.0%
AACCAAAGTCACAATCTGAT+TGG - Chr4:36886218-36886237 MsG0480020225.01.T01:CDS 35.0%
ACAGTAGTGTTTGTATCGTT+TGG - Chr4:36886443-36886462 MsG0480020225.01.T01:CDS 35.0%
ACCAAAGTCACAATCTGATT+GGG - Chr4:36886219-36886238 MsG0480020225.01.T01:CDS 35.0%
ATCTTGCAGATTACTCACAT+GGG - Chr4:36886242-36886261 MsG0480020225.01.T01:CDS 35.0%
CCATACAAACATTTGCAGTA+TGG + Chr4:36886193-36886212 None:intergenic 35.0%
CCATACTGCAAATGTTTGTA+TGG - Chr4:36886190-36886209 MsG0480020225.01.T01:CDS 35.0%
CTGAATATTTGTCCATTCCA+AGG + Chr4:36885914-36885933 None:intergenic 35.0%
CTTTCTCAGGATGATAGTAA+TGG - Chr4:36886493-36886512 MsG0480020225.01.T01:CDS 35.0%
GATACAAACACTACTGTCAT+AGG + Chr4:36886440-36886459 None:intergenic 35.0%
GCAACTACAGAATTTGAACT+AGG + Chr4:36885617-36885636 None:intergenic 35.0%
GTATCTTCAAATCCTTCTAC+TGG - Chr4:36886295-36886314 MsG0480020225.01.T01:CDS 35.0%
TACTATATCTCGTTTCGTGA+TGG - Chr4:36886030-36886049 MsG0480020225.01.T01:CDS 35.0%
TGTGAAGTTTATGCTTTCTG+TGG - Chr4:36886136-36886155 MsG0480020225.01.T01:CDS 35.0%
! ACTAAACAGTATTGGACAAG+TGG - Chr4:36885887-36885906 MsG0480020225.01.T01:CDS 35.0%
! CTCAGCAGTGGAATTTATTT+TGG - Chr4:36886095-36886114 MsG0480020225.01.T01:CDS 35.0%
!! GTAGTTGCTGTTCTTTTAGA+TGG - Chr4:36885629-36885648 MsG0480020225.01.T01:CDS 35.0%
AAGTAATAGGCCTAATGCGT+CGG - Chr4:36885667-36885686 MsG0480020225.01.T01:CDS 40.0%
AGTGTTTGTATCGTTTGGAG+CGG - Chr4:36886448-36886467 MsG0480020225.01.T01:CDS 40.0%
CGAACTCTTTATGACTTTGC+CGG - Chr4:36886339-36886358 MsG0480020225.01.T01:CDS 40.0%
CGGCAAAGTCATAAAGAGTT+CGG + Chr4:36886341-36886360 None:intergenic 40.0%
CGTCACGAAACTGAAATCAT+AGG + Chr4:36885966-36885985 None:intergenic 40.0%
GATCTTGCAGATTACTCACA+TGG - Chr4:36886241-36886260 MsG0480020225.01.T01:CDS 40.0%
GCAAAGTTTGACCTCATTTC+AGG + Chr4:36885944-36885963 None:intergenic 40.0%
TAAACTTCACACTGTGCTCT+TGG + Chr4:36886127-36886146 None:intergenic 40.0%
TATGCTTTCTGTGGTGCATT+TGG - Chr4:36886145-36886164 MsG0480020225.01.T01:CDS 40.0%
TCCCAATCAGATTGTGACTT+TGG + Chr4:36886223-36886242 None:intergenic 40.0%
TTCCATGCAGTGAGATATTG+AGG + Chr4:36885782-36885801 None:intergenic 40.0%
! ACAACAGATTGCGCATTTTC+CGG + Chr4:36886361-36886380 None:intergenic 40.0%
! TCAGTTTGGTTCCTGAAATG+AGG - Chr4:36885930-36885949 MsG0480020225.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGCTGTTCTTTTAGATGG+TGG - Chr4:36885632-36885651 MsG0480020225.01.T01:CDS 40.0%
!! TCGTTTCGTGATGGATATCT+CGG - Chr4:36886039-36886058 MsG0480020225.01.T01:CDS 40.0%
AACAGTGAAGATCCAGCAAC+CGG - Chr4:36885803-36885822 MsG0480020225.01.T01:CDS 45.0%
AGAGAGAATAAACCGGTTGC+TGG + Chr4:36885818-36885837 None:intergenic 45.0%
AGCCTCAATATCTCACTGCA+TGG - Chr4:36885777-36885796 MsG0480020225.01.T01:CDS 45.0%
CAATCTGTTGTGGATGCTGT+GGG - Chr4:36886370-36886389 MsG0480020225.01.T01:CDS 45.0%
GAATCTGCAACAGCTTTCTC+AGG - Chr4:36886480-36886499 MsG0480020225.01.T01:CDS 45.0%
GGAAAATGCGCAATCTGTTG+TGG - Chr4:36886360-36886379 MsG0480020225.01.T01:CDS 45.0%
TCTCTTGAACTAGACCCTAG+TGG - Chr4:36885833-36885852 MsG0480020225.01.T01:CDS 45.0%
! AAATCCTTCTACTGGTGACG+AGG - Chr4:36886303-36886322 MsG0480020225.01.T01:CDS 45.0%
! AGTATTGGACAAGTGGTCCT+TGG - Chr4:36885894-36885913 MsG0480020225.01.T01:CDS 45.0%
!! CGTTTCGTGATGGATATCTC+GGG - Chr4:36886040-36886059 MsG0480020225.01.T01:CDS 45.0%
!! GTTTCGTGATGGATATCTCG+GGG - Chr4:36886041-36886060 MsG0480020225.01.T01:CDS 45.0%
ACAGATACATGGCTTCCTGG+TGG - Chr4:36885725-36885744 MsG0480020225.01.T01:CDS 50.0%
CCAACAGATACATGGCTTCC+TGG - Chr4:36885722-36885741 MsG0480020225.01.T01:CDS 50.0%
CCAGGAAGCCATGTATCTGT+TGG + Chr4:36885725-36885744 None:intergenic 50.0%
CGTCGGTATCAGATGCTCTT+TGG - Chr4:36885684-36885703 MsG0480020225.01.T01:CDS 50.0%
CTATCCTCGTCACCAGTAGA+AGG + Chr4:36886310-36886329 None:intergenic 50.0%
GATCAAGCAACTTACCTGGC+TGG - Chr4:36886066-36886085 MsG0480020225.01.T01:CDS 50.0%
GCAATCTGTTGTGGATGCTG+TGG - Chr4:36886369-36886388 MsG0480020225.01.T01:CDS 50.0%
GCATCTGATACCGACGCATT+AGG + Chr4:36885680-36885699 None:intergenic 50.0%
GGCAGATCAAGCAACTTACC+TGG - Chr4:36886062-36886081 MsG0480020225.01.T01:CDS 50.0%
GTCATAGGCAAATGCAGTGC+AGG + Chr4:36886425-36886444 None:intergenic 50.0%
TGGACAAGTGGTCCTTGGAA+TGG - Chr4:36885899-36885918 MsG0480020225.01.T01:CDS 50.0%
! CTTCTACTGGTGACGAGGAT+AGG - Chr4:36886308-36886327 MsG0480020225.01.T01:CDS 50.0%
CTGCTGAGTACTTTCCAGCC+AGG + Chr4:36886083-36886102 None:intergenic 55.0%
!! GGCTGGAAAGTACTCAGCAG+TGG - Chr4:36886083-36886102 MsG0480020225.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 36885455 36886636 36885455 ID=MsG0480020225.01;Name=MsG0480020225.01
Chr4 mRNA 36885455 36886636 36885455 ID=MsG0480020225.01.T01;Parent=MsG0480020225.01;Name=MsG0480020225.01.T01;_AED=0.50;_eAED=0.50;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|393
Chr4 exon 36885455 36886636 36885455 ID=MsG0480020225.01.T01:exon:2890;Parent=MsG0480020225.01.T01
Chr4 CDS 36885455 36886636 36885455 ID=MsG0480020225.01.T01:cds;Parent=MsG0480020225.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480020225.01.T01

ATGTGGTACAAAAAGATATCACAAAAGACATATGTTTGGGTAGCAAATAGAGATGATCCAGTTTCTGATAAAAAATCTTCAAAGTTTACTATTTCTGATGGTAATTTAGTTCTCTTGGATCAGTCTCAAAATCTAGTTTGGTCAACAAATTTGAGTTCTCCTAGTTCAAATTCTGTAGTTGCTGTTCTTTTAGATGGTGGTAATCTTATATTAAGTAATAGGCCTAATGCGTCGGTATCAGATGCTCTTTGGCAGAGTTTTGATTTTCCAACAGATACATGGCTTCCTGGTGGAAAAATTAAACTTGATCATATAACAAAGAAGCCTCAATATCTCACTGCATGGAAGAACAGTGAAGATCCAGCAACCGGTTTATTCTCTCTTGAACTAGACCCTAGTGGAACCAATTCATATTTGATTCTTTGGAATAAAACTAAACAGTATTGGACAAGTGGTCCTTGGAATGGACAAATATTCAGTTTGGTTCCTGAAATGAGGTCAAACTTTGCCTATGATTTCAGTTTCGTGACGAATGTGAATGAGAGCTACTTCACATATTCTGTGAAACAAAAATCTACTATATCTCGTTTCGTGATGGATATCTCGGGGCAGATCAAGCAACTTACCTGGCTGGAAAGTACTCAGCAGTGGAATTTATTTTGGTCACAGCCAAGAGCACAGTGTGAAGTTTATGCTTTCTGTGGTGCATTTGGTAGCTGTAATCAGAACTCAAAGCCATACTGCAAATGTTTGTATGGTTATGAACCAAAGTCACAATCTGATTGGGATCTTGCAGATTACTCACATGGGTGTGTGAAAACAAATAAGTTTCAATGTGAGGTATCTTCAAATCCTTCTACTGGTGACGAGGATAGGTTCTTAGCCGAACTCTTTATGACTTTGCCGGAAAATGCGCAATCTGTTGTGGATGCTGTGGGATGCGAGTCAAAATGTCTGAACAACTGTTCCTGCACTGCATTTGCCTATGACAGTAGTGTTTGTATCGTTTGGAGCGGAGAACTCTTGAATCTGCAACAGCTTTCTCAGGATGATAGTAATGGACAAACATTGTATCTCAGACTTGCAGCATCTGAGTTTCATGATTCTATAAGCAATGAAGGAACAACGGATGTAAATATATTTGTTTCAGAAAACCAAGTTTATGTTGAAATAAGATGTTAG

Protein sequence

>MsG0480020225.01.T01

MWYKKISQKTYVWVANRDDPVSDKKSSKFTISDGNLVLLDQSQNLVWSTNLSSPSSNSVVAVLLDGGNLILSNRPNASVSDALWQSFDFPTDTWLPGGKIKLDHITKKPQYLTAWKNSEDPATGLFSLELDPSGTNSYLILWNKTKQYWTSGPWNGQIFSLVPEMRSNFAYDFSFVTNVNESYFTYSVKQKSTISRFVMDISGQIKQLTWLESTQQWNLFWSQPRAQCEVYAFCGAFGSCNQNSKPYCKCLYGYEPKSQSDWDLADYSHGCVKTNKFQCEVSSNPSTGDEDRFLAELFMTLPENAQSVVDAVGCESKCLNNCSCTAFAYDSSVCIVWSGELLNLQQLSQDDSNGQTLYLRLAASEFHDSISNEGTTDVNIFVSENQVYVEIRC*