AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780040601.01


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MsG0780040601.01.T01 AT1G06700 67.560 336 96 2 210 545 29 351 3.63e-160 461
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MsG0780040601.01.T01 AT1G48210 64.396 323 100 2 231 553 50 357 1.51e-150 436
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MsG0780040601.01.T01 AT1G48210 64.396 323 100 2 231 553 50 357 1.51e-150 436
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MsG0780040601.01.T01 AT1G68690 40.199 301 153 4 237 533 365 642 2.73e-67 230
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MsG0780040601.01.T01 AT3G13690 40.850 306 158 4 237 541 399 682 2.88e-66 229
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MsG0780040601.01.T01 AT1G11130 38.511 309 164 4 237 544 485 768 6.36e-57 204
MsG0780040601.01.T01 AT1G16670 37.000 300 171 4 241 540 33 314 8.02e-57 195
MsG0780040601.01.T01 AT5G62710 36.789 299 168 4 254 552 317 594 8.52e-57 201
MsG0780040601.01.T01 AT1G60800 36.393 305 174 5 238 541 223 508 9.22e-57 200
MsG0780040601.01.T01 AT1G56145 36.585 328 189 7 236 549 674 996 9.91e-57 206
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MsG0780040601.01.T01 AT2G23950 36.893 309 171 5 234 541 284 569 1.50e-56 201
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MsG0780040601.01.T01 AT1G52540 33.962 318 189 4 237 554 25 321 2.65e-56 193
MsG0780040601.01.T01 AT3G15890 33.553 304 183 3 237 540 27 311 2.70e-56 193
MsG0780040601.01.T01 AT1G56120 36.392 316 176 6 227 540 520 812 3.66e-56 203
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MsG0780040601.01.T01 AT1G56120 36.392 316 176 6 227 540 686 978 6.65e-56 203
MsG0780040601.01.T01 AT1G60800 36.393 305 174 5 238 541 290 575 6.84e-56 199
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MsG0780040601.01.T01 AT1G01540 39.669 242 126 4 238 479 143 364 8.02e-56 192
MsG0780040601.01.T01 AT1G56120 36.392 316 176 6 227 540 668 960 8.29e-56 203
MsG0780040601.01.T01 AT3G14350 36.482 307 145 4 229 534 399 656 8.80e-56 199
MsG0780040601.01.T01 AT1G56145 36.364 319 175 5 236 549 674 969 1.01e-55 202
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MsG0780040601.01.T01 AT4G23270 36.519 293 165 3 255 546 332 604 1.53e-55 198
MsG0780040601.01.T01 AT4G23270 36.519 293 165 3 255 546 332 604 1.97e-55 197
MsG0780040601.01.T01 AT3G45860 34.650 329 182 5 215 540 326 624 1.99e-55 198
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MsG0780040601.01.T01 AT2G16750 35.667 300 170 2 242 541 270 546 2.64e-55 197
MsG0780040601.01.T01 AT4G13190 50.000 188 90 2 354 540 14 198 2.71e-55 187
MsG0780040601.01.T01 AT4G13190 50.000 188 90 2 354 540 14 198 2.71e-55 187
MsG0780040601.01.T01 AT1G26970 41.404 285 139 8 274 555 3 262 3.40e-55 188
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MsG0780040601.01.T01 AT4G35600 34.891 321 173 7 241 548 79 376 5.81e-55 191
MsG0780040601.01.T01 AT1G24030 42.169 249 122 4 238 483 51 280 6.09e-55 187
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MsG0780040601.01.T01 AT3G25560 35.621 306 173 5 237 541 301 583 1.22e-54 195
MsG0780040601.01.T01 AT5G57670 36.333 300 167 4 241 540 259 534 1.26e-54 194
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MsG0780040601.01.T01 AT1G79620 36.859 312 168 6 237 544 652 938 4.46e-54 197
MsG0780040601.01.T01 AT1G51910 37.061 313 170 6 237 549 563 848 4.66e-54 197
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MsG0780040601.01.T01 AT5G39000 36.050 319 183 5 226 541 494 794 7.79e-54 196
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MsG0780040601.01.T01 AT4G23310 35.275 309 177 4 246 551 465 753 4.48e-53 193
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MsG0780040601.01.T01 AT1G55610 36.039 308 179 4 237 543 847 1137 4.84e-53 195
MsG0780040601.01.T01 AT1G49100 34.146 328 190 6 213 540 549 850 5.58e-53 194
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MsG0780040601.01.T01 AT5G28680 35.831 307 172 3 237 541 509 792 5.84e-53 194
MsG0780040601.01.T01 AT1G34210 34.405 311 183 5 233 541 289 580 6.11e-53 191
MsG0780040601.01.T01 AT1G34210 34.405 311 183 5 233 541 289 580 6.11e-53 191
MsG0780040601.01.T01 AT1G07650 33.815 346 207 4 196 541 602 925 6.23e-53 194
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MsG0780040601.01.T01 AT5G54590 35.736 333 172 9 217 547 91 383 1.31e-52 186
MsG0780040601.01.T01 AT5G45780 32.817 323 196 5 234 555 242 544 1.41e-52 188
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MsG0780040601.01.T01 AT5G65700 39.262 298 157 5 254 549 699 974 1.96e-52 193
MsG0780040601.01.T01 AT5G65240 34.615 312 181 7 233 541 268 559 2.07e-52 189
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MsG0780040601.01.T01 AT4G33430 34.084 311 184 4 233 541 273 564 2.56e-52 189
MsG0780040601.01.T01 AT5G65240 34.615 312 181 7 233 541 268 559 3.88e-52 189
MsG0780040601.01.T01 AT4G35030 36.508 252 142 3 291 541 3 237 3.90e-52 180
MsG0780040601.01.T01 AT2G39360 34.405 311 180 3 239 547 477 765 3.97e-52 191
MsG0780040601.01.T01 AT2G37050 34.853 307 176 6 237 541 594 878 4.19e-52 192
MsG0780040601.01.T01 AT2G28960 36.893 309 169 7 237 544 431 714 4.27e-52 190
MsG0780040601.01.T01 AT4G33430 34.084 311 184 4 233 541 320 611 4.29e-52 189
MsG0780040601.01.T01 AT2G37050 34.853 307 176 6 237 541 593 877 4.42e-52 191
MsG0780040601.01.T01 AT5G10520 33.234 334 193 6 213 541 114 422 4.83e-52 185
MsG0780040601.01.T01 AT4G39110 36.593 317 171 5 237 549 514 804 5.13e-52 191
MsG0780040601.01.T01 AT5G45780 32.817 323 196 5 234 555 285 587 5.53e-52 187
MsG0780040601.01.T01 AT4G28490 39.088 307 157 7 252 548 686 972 5.61e-52 191
MsG0780040601.01.T01 AT1G75820 39.189 296 146 7 254 540 697 967 5.72e-52 191
MsG0780040601.01.T01 AT4G00960 34.985 323 168 9 228 540 40 330 5.85e-52 182
MsG0780040601.01.T01 AT5G35960 34.098 305 175 4 237 541 122 400 7.11e-52 183
MsG0780040601.01.T01 AT3G46340 35.174 344 194 8 216 555 554 872 7.27e-52 191
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MsG0780040601.01.T01 AT3G46370 35.671 328 187 5 220 547 460 763 7.54e-52 190
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MsG0780040601.01.T01 AT5G58940 34.628 309 181 3 237 543 135 424 6.77e-51 182
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MsG0780040601.01.T01 AT5G01950 35.625 320 174 6 234 548 611 903 3.52e-50 186
MsG0780040601.01.T01 AT5G01950 35.625 320 174 6 234 548 611 903 3.52e-50 186
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MsG0780040601.01.T01 AT1G61490 33.333 303 179 5 233 532 471 753 8.55e-50 184
MsG0780040601.01.T01 AT1G66460 34.195 348 199 10 207 541 82 412 8.68e-50 179
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MsG0780040601.01.T01 AT1G61390 32.911 316 187 5 231 543 499 792 9.76e-50 184
MsG0780040601.01.T01 AT1G61420 30.841 321 199 5 231 548 325 625 9.79e-50 182
MsG0780040601.01.T01 AT4G35030 39.271 247 130 5 242 487 97 324 9.81e-50 175
MsG0780040601.01.T01 AT1G61480 32.907 313 187 5 231 540 475 767 9.85e-50 184
MsG0780040601.01.T01 AT1G61500 31.118 331 205 4 213 540 457 767 1.00e-49 184
MsG0780040601.01.T01 AT1G61500 31.118 331 205 4 213 540 434 744 1.09e-49 184
MsG0780040601.01.T01 AT4G23150 33.648 318 191 3 232 549 319 616 1.17e-49 182
MsG0780040601.01.T01 AT4G23190 34.333 300 170 5 246 540 347 624 1.20e-49 182
MsG0780040601.01.T01 AT5G16000 35.526 304 170 6 241 541 304 584 1.21e-49 181
MsG0780040601.01.T01 AT4G23160 34.915 295 172 2 246 540 356 630 1.21e-49 182
MsG0780040601.01.T01 AT3G46400 34.036 332 195 6 216 547 545 852 1.33e-49 184
MsG0780040601.01.T01 AT1G61370 30.982 326 204 4 227 551 479 784 1.35e-49 184
MsG0780040601.01.T01 AT1G61500 31.118 331 205 4 213 540 452 762 1.40e-49 183
MsG0780040601.01.T01 AT1G66460 33.908 348 200 10 207 541 109 439 1.47e-49 179
MsG0780040601.01.T01 AT1G80640 34.365 323 172 7 234 550 134 422 1.59e-49 177
MsG0780040601.01.T01 AT5G59700 33.956 321 185 5 237 554 470 766 1.62e-49 183
MsG0780040601.01.T01 AT5G02070 32.692 312 185 5 241 545 355 648 1.80e-49 181
MsG0780040601.01.T01 AT1G61430 32.797 311 186 4 233 540 447 737 1.83e-49 183
MsG0780040601.01.T01 AT1G61430 32.797 311 186 4 233 540 447 737 1.83e-49 183
MsG0780040601.01.T01 AT1G61430 32.797 311 186 4 233 540 447 737 1.83e-49 183
MsG0780040601.01.T01 AT5G63710 34.084 311 183 7 233 541 238 528 1.90e-49 180
MsG0780040601.01.T01 AT5G63710 34.084 311 183 7 233 541 238 528 1.90e-49 180
MsG0780040601.01.T01 AT4G11490 33.333 315 185 5 231 540 299 593 1.93e-49 181
MsG0780040601.01.T01 AT2G28990 35.714 308 174 5 237 544 567 850 2.00e-49 184
MsG0780040601.01.T01 AT2G28990 35.714 308 174 5 237 544 567 850 2.00e-49 184
MsG0780040601.01.T01 AT4G27290 29.104 402 233 9 141 537 380 734 2.19e-49 182
MsG0780040601.01.T01 AT5G63710 34.084 311 183 7 233 541 273 563 2.24e-49 181
MsG0780040601.01.T01 AT4G29180 34.097 349 195 5 218 554 537 862 2.41e-49 183
MsG0780040601.01.T01 AT1G61430 32.797 311 186 4 233 540 470 760 2.84e-49 182
MsG0780040601.01.T01 AT5G63710 34.084 311 183 7 233 541 274 564 3.26e-49 180
MsG0780040601.01.T01 AT3G46420 35.667 300 169 4 245 544 529 804 3.29e-49 182
MsG0780040601.01.T01 AT4G27290 32.278 316 193 4 223 537 485 780 3.82e-49 182
MsG0780040601.01.T01 AT4G32000 32.194 351 186 6 201 550 90 389 4.04e-49 175
MsG0780040601.01.T01 AT1G70740 32.198 323 187 5 227 549 47 337 4.47e-49 176
MsG0780040601.01.T01 AT1G51805 36.545 301 165 6 245 544 551 826 4.95e-49 182
MsG0780040601.01.T01 AT5G47070 35.312 320 171 8 237 544 74 369 4.98e-49 175
MsG0780040601.01.T01 AT1G51890 36.452 310 168 7 237 544 288 570 5.28e-49 179
MsG0780040601.01.T01 AT4G29180 34.375 352 193 6 218 554 537 865 5.58e-49 182
MsG0780040601.01.T01 AT4G00970 35.604 323 166 9 228 540 328 618 5.66e-49 180
MsG0780040601.01.T01 AT4G00330 35.197 304 169 6 237 533 107 389 6.06e-49 175
MsG0780040601.01.T01 AT4G00330 35.197 304 169 6 237 533 107 389 6.06e-49 175
MsG0780040601.01.T01 AT1G61420 30.841 321 199 5 231 548 473 773 6.21e-49 182
MsG0780040601.01.T01 AT1G51805 36.545 301 165 6 245 544 575 850 6.35e-49 182
MsG0780040601.01.T01 AT2G25220 36.331 278 154 5 239 515 87 342 6.42e-49 174
MsG0780040601.01.T01 AT4G05200 31.402 328 205 2 206 533 304 611 6.82e-49 180
MsG0780040601.01.T01 AT1G61420 30.841 321 199 5 231 548 475 775 6.86e-49 181
MsG0780040601.01.T01 AT1G61420 30.841 321 199 5 231 548 475 775 6.86e-49 181
MsG0780040601.01.T01 AT4G29180 34.375 352 193 6 218 554 535 863 6.89e-49 182
MsG0780040601.01.T01 AT4G23260 32.692 312 189 4 230 540 320 611 6.89e-49 180
MsG0780040601.01.T01 AT4G04540 36.634 303 167 6 246 548 321 598 7.25e-49 179
MsG0780040601.01.T01 AT5G62230 36.478 318 173 6 229 544 628 918 7.73e-49 182
MsG0780040601.01.T01 AT4G11460 33.663 303 180 4 239 540 261 543 7.87e-49 179
MsG0780040601.01.T01 AT5G15730 33.333 318 178 8 234 550 101 385 8.18e-49 175
MsG0780040601.01.T01 AT5G15730 33.333 318 178 8 234 550 101 385 8.18e-49 175
MsG0780040601.01.T01 AT5G62230 36.478 318 173 6 229 544 580 870 8.46e-49 182
MsG0780040601.01.T01 AT4G05200 31.402 328 205 2 206 533 322 629 9.27e-49 180
MsG0780040601.01.T01 AT2G26330 36.991 319 170 8 241 555 640 931 9.48e-49 182
MsG0780040601.01.T01 AT2G19230 35.256 312 177 5 240 550 562 849 9.81e-49 181
MsG0780040601.01.T01 AT3G46355 34.333 300 154 5 245 544 1 257 1.02e-48 171
MsG0780040601.01.T01 AT1G51850 34.868 304 174 4 237 540 548 827 1.06e-48 181
MsG0780040601.01.T01 AT1G51850 34.868 304 174 4 237 540 568 847 1.14e-48 181
MsG0780040601.01.T01 AT4G04540 36.634 303 167 6 246 548 350 627 1.21e-48 179
MsG0780040601.01.T01 AT2G19230 35.256 312 177 5 240 550 563 850 1.29e-48 182
MsG0780040601.01.T01 AT3G21340 33.866 313 183 4 237 549 582 870 1.56e-48 181
MsG0780040601.01.T01 AT2G25220 36.996 273 149 5 239 510 136 386 1.86e-48 174
MsG0780040601.01.T01 AT5G15730 33.333 318 176 8 234 550 101 383 1.89e-48 174

Find 150 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 522 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AAAAGTGATGTTTATAGTTT+TGG 0.205463 7:+79812677 MsG0780040601.01.T01:CDS
AGAAGCAGACAACAGAATTT+TGG 0.224138 7:+79811773 MsG0780040601.01.T01:CDS
AAACTCAAAGCTAAAGAAAT+TGG 0.250381 7:+79806393 MsG0780040601.01.T01:five_prime_UTR
GTGTTTGTTGGTATCGATTA+TGG 0.251697 7:-79804979 None:intergenic
GGTTTATCAATATGCAAGTT+TGG 0.256367 7:+79811794 MsG0780040601.01.T01:CDS
ACAAGACTTTGTTGCCCTTT+AGG 0.278654 7:-79812752 None:intergenic
AAGTGTTGGCCAGAGACTTT+TGG 0.299363 7:+79806148 MsG0780040601.01.T01:five_prime_UTR
GGAGAAAGTGGCTGAATCTT+TGG 0.299857 7:+79807123 MsG0780040601.01.T01:CDS
TTAGGCATTGTGTGGTCTAC+TGG 0.306924 7:-79812734 None:intergenic
TGCAATATGAAGCTGATTTC+CGG 0.309089 7:+79813851 MsG0780040601.01.T01:CDS
GACAGGTGGGACAGAGATTA+TGG 0.312010 7:-79807066 None:intergenic
GCTGAGTTAAATAGATTAAC+AGG 0.315154 7:+79811463 MsG0780040601.01.T01:CDS
TTTCTTGACTCGCTGGATCT+TGG 0.328460 7:+79806090 MsG0780040601.01.T01:five_prime_UTR
GAGTAGCCTTGTATGAATAT+AGG 0.335339 7:+79811352 MsG0780040601.01.T01:intron
CAAACCTTAGCAATTGCCTT+TGG 0.339369 7:-79812965 None:intergenic
TTGACAACAATTGTCATGTT+TGG 0.341787 7:-79813874 None:intergenic
AAACCTTAGCAATTGCCTTT+GGG 0.341988 7:-79812964 None:intergenic
CCCACCTGTCACCATGATCT+TGG 0.343411 7:+79807079 MsG0780040601.01.T01:CDS
GTTTATCAATATGCAAGTTT+GGG 0.344320 7:+79811795 MsG0780040601.01.T01:CDS
TGTTTAAGCTTTGCATAGTA+AGG 0.352415 7:-79807190 None:intergenic
ACAAGAGTCTTGGGAACATT+TGG 0.353209 7:+79812337 MsG0780040601.01.T01:CDS
TGGATCTGAGTGCTCCGTTA+TGG 0.353234 7:+79807255 MsG0780040601.01.T01:CDS
ACCATGATCTTGGGAATATA+AGG 0.354435 7:+79807089 MsG0780040601.01.T01:CDS
TCCACTAGTGTTGGATTGAA+TGG 0.361198 7:+79806557 MsG0780040601.01.T01:CDS
CTCTGGTTCCAGCTTAAAAC+TGG 0.366116 7:-79812133 None:intergenic
GAATATAAGGTGTTTGGCTC+TGG 0.367722 7:+79807102 MsG0780040601.01.T01:CDS
TTGACTTCAGATTATGAAAC+AGG 0.369439 7:+79806491 MsG0780040601.01.T01:CDS
TTTGGTTCAAAGGCCTTCAT+TGG 0.384595 7:+79811490 MsG0780040601.01.T01:CDS
TGTAAGTGAACAGTTAATCT+TGG 0.386090 7:-79806531 None:intergenic
ATTTAACTCAGCCAACGATA+TGG 0.393992 7:-79811452 None:intergenic
CAAGCTGAAATCAGCAATCT+TGG 0.395178 7:-79812275 None:intergenic
GGATCTGAGTGCTCCGTTAT+GGG 0.399413 7:+79807256 MsG0780040601.01.T01:CDS
CCTAGAGTTTCTTCATGAAA+AGG 0.399968 7:+79812186 MsG0780040601.01.T01:CDS
GAACATAACGTATGGCCATT+TGG 0.409073 7:-79807025 None:intergenic
TATCCTAGGGAAACTCTATA+AGG 0.411434 7:+79806199 MsG0780040601.01.T01:five_prime_UTR
GGGTAGTCATTGTTTAGCTT+AGG 0.412643 7:-79812941 None:intergenic
TCTTGGGAATATAAGGTGTT+TGG 0.412899 7:+79807096 MsG0780040601.01.T01:CDS
AAGTCGTTGGAGTCAGAATC+AGG 0.418607 7:-79811598 None:intergenic
AATAGATTAACAGGAAACTT+TGG 0.423697 7:+79811472 MsG0780040601.01.T01:CDS
ATTGCATTTGGTGCGGCAAA+AGG 0.435873 7:+79812163 MsG0780040601.01.T01:CDS
ATCTTCAGGTATGCAATGAC+AGG 0.436150 7:+79812641 MsG0780040601.01.T01:intron
CAGAGAGCGAAAATTGCATT+TGG 0.438025 7:+79812151 MsG0780040601.01.T01:CDS
ACATCGCGGTGAACTATAGA+AGG 0.438531 7:-79812214 None:intergenic
CCACCTGTCACCATGATCTT+GGG 0.439936 7:+79807080 MsG0780040601.01.T01:CDS
GCTTAAAACTGGACCAGGTT+CGG 0.454452 7:-79812122 None:intergenic
AACAGGAAACTTTGGTTCAA+AGG 0.456129 7:+79811480 MsG0780040601.01.T01:CDS
CCTTTAGATCGGATCAGAAA+TGG 0.457706 7:+79806424 MsG0780040601.01.T01:exon
TAGACCACACAATGCCTAAA+GGG 0.459993 7:+79812738 MsG0780040601.01.T01:CDS
CCATACAATTGTCCCTATGC+TGG 0.460910 7:+79807235 MsG0780040601.01.T01:CDS
TACTCGTGCTAGATTATCCT+AGG 0.462366 7:+79806185 MsG0780040601.01.T01:five_prime_UTR
GATATGGAGGGTATCTCAAT+TGG 0.462716 7:-79811436 None:intergenic
ATTGAATAACAAGACATTGC+TGG 0.464071 7:-79812242 None:intergenic
CTCCAACGACTTCGCTGCTC+AGG 0.464921 7:+79811609 MsG0780040601.01.T01:CDS
TCCTGCAAAAGCAAAAGCCT+TGG 0.466116 7:-79812080 None:intergenic
ACTTTGTCCTCACTCAACCT+TGG 0.466691 7:-79812902 None:intergenic
CTTACAAAATCCACTAGTGT+TGG 0.467534 7:+79806548 MsG0780040601.01.T01:CDS
CTCTTGGTAATGTTGCTCCT+TGG 0.469681 7:-79811391 None:intergenic
CCATTTCTGATCCGATCTAA+AGG 0.471216 7:-79806424 None:intergenic
TACATCAAATTGTTGCAGAC+AGG 0.476960 7:-79806629 None:intergenic
AAGCAGTGCACCTGGTGAAT+TGG 0.478324 7:-79806656 None:intergenic
CCTTGCAGATATCAGAGTCT+AGG 0.480797 7:+79807151 MsG0780040601.01.T01:CDS
CAACAATTGTCATGTTTGGC+CGG 0.481623 7:-79813870 None:intergenic
CTACATTCAACAAGAGTCTT+GGG 0.486381 7:+79812328 MsG0780040601.01.T01:CDS
CCAGCATAGGGACAATTGTA+TGG 0.489704 7:-79807235 None:intergenic
GCTACATTCAACAAGAGTCT+TGG 0.493059 7:+79812327 MsG0780040601.01.T01:CDS
TGAAGTTGCAATCAAAAGGC+TGG 0.493508 7:+79811561 MsG0780040601.01.T01:CDS
GGCAACAAAGTCTTGTGACT+TGG 0.493783 7:+79812759 MsG0780040601.01.T01:CDS
CATTCACGCCCAAAAGTCTC+TGG 0.496141 7:-79806157 None:intergenic
TTGGTGAAGGTTCGTATGGA+AGG 0.500508 7:+79811509 MsG0780040601.01.T01:CDS
TCAGAAATGGCTCCGGGAGG+AGG 0.504929 7:+79806437 MsG0780040601.01.T01:exon
TACAATTTGAACATAACGTA+TGG 0.506717 7:-79807033 None:intergenic
ATACGAACCTTCACCAATGA+AGG 0.511255 7:-79811503 None:intergenic
TTTCTGTGGACCACCACTCT+TGG 0.512454 7:-79811407 None:intergenic
ATCTCTTGTTGATCATCTCA+AGG 0.513200 7:+79807288 MsG0780040601.01.T01:CDS
ATCGGATCAGAAATGGCTCC+GGG 0.513632 7:+79806431 MsG0780040601.01.T01:exon
CTTCTCAATGCAAAACCGGC+TGG 0.514427 7:+79813910 MsG0780040601.01.T01:CDS
GCCACTTCTCAATGCAAAAC+CGG 0.514980 7:+79813906 MsG0780040601.01.T01:CDS
TCAAAGGCCTTCATTGGTGA+AGG 0.515710 7:+79811496 MsG0780040601.01.T01:CDS
TCAATTGGTAATACTTTCTG+TGG 0.515793 7:-79811421 None:intergenic
TTCATTGGTGAAGGTTCGTA+TGG 0.516649 7:+79811505 MsG0780040601.01.T01:CDS
CAGTGCACCTGGTGAATTGG+AGG 0.518998 7:-79806653 None:intergenic
GTATTGAAGTTGCAATCAAA+AGG 0.520710 7:+79811557 MsG0780040601.01.T01:CDS
ACCTTATATTCCCAAGATCA+TGG 0.520727 7:-79807090 None:intergenic
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GATCGGATCAGAAATGGCTC+CGG 0.522089 7:+79806430 MsG0780040601.01.T01:exon
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CRISPR-GE

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! TCATTGTATAGAGCTTATTA+CGG + Chr7:79808560-79808579 MsG0780040601.01.T01:intron 25.0%
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! CAAAGAATTTGAAATGCAAG+AGG - Chr7:79808161-79808180 None:intergenic 30.0%
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!!! GGTATGGTTTTGGATTTTTT+TGG + Chr7:79805225-79805244 MsG0780040601.01.T01:intron 30.0%
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!!! TTCACTTGCTGACTTTTTAT+TGG + Chr7:79805261-79805280 MsG0780040601.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTATTGTTTTTGACACGCA+TGG + Chr7:79805099-79805118 MsG0780040601.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTCAGGTTTTCAATTGCTA+TGG + Chr7:79808183-79808202 MsG0780040601.01.T01:intron 30.0%
AAACAACAACGTTGTTGTGT+TGG + Chr7:79804938-79804957 MsG0780040601.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
AAACCTTAGCAATTGCCTTT+GGG - Chr7:79812967-79812986 None:intergenic 35.0%
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AAGCGAATAACATGCATCTA+TGG + Chr7:79810149-79810168 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
AATGTTAAACAGTACTGCAG+GGG - Chr7:79807637-79807656 None:intergenic 35.0%
ACAAATCACATTGTGCAACT+GGG - Chr7:79810894-79810913 None:intergenic 35.0%
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ACCATGATCTTGGGAATATA+AGG + Chr7:79807089-79807108 MsG0780040601.01.T01:CDS 35.0%
ACCTTATATTCCCAAGATCA+TGG - Chr7:79807093-79807112 None:intergenic 35.0%
ACTCATCCAATTTAGTTGCA+TGG + Chr7:79807811-79807830 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
AGAATGTTAAACAGTACTGC+AGG - Chr7:79807639-79807658 None:intergenic 35.0%
AGATCACATGACATACACTT+AGG + Chr7:79807747-79807766 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
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AGTTGGAATGCTGTATTGTT+TGG + Chr7:79805787-79805806 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
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ATGAAGTTGAAAATGCCACA+TGG + Chr7:79807377-79807396 MsG0780040601.01.T01:CDS 35.0%
ATGGTATATAGGTTCTGCTT+TGG + Chr7:79807895-79807914 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
ATGTCATAATCTTTGCATGG+TGG - Chr7:79813245-79813264 None:intergenic 35.0%
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CAAACTTGCAAATTGGTGAA+TGG + Chr7:79808962-79808981 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
CAGCAGTGTTAAAAACTCTT+AGG + Chr7:79809202-79809221 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
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GAATGTTAAACAGTACTGCA+GGG - Chr7:79807638-79807657 None:intergenic 35.0%
GACAAATCAGTCTTCAGATA+CGG + Chr7:79812297-79812316 MsG0780040601.01.T01:CDS 35.0%
GACATGGTGTTTATATGTTG+TGG + Chr7:79805180-79805199 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
GACTAATATCTCGAGTTTCA+TGG - Chr7:79809237-79809256 None:intergenic 35.0%
GAGATATGTAGTGATTAGTG+AGG + Chr7:79805838-79805857 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
GATACACATCACGAAACAAT+AGG - Chr7:79810715-79810734 None:intergenic 35.0%
GGACTATTTGACAAGAAGAT+AGG - Chr7:79810385-79810404 None:intergenic 35.0%
GGAGGAAGAAGAGTTTAATT+TGG - Chr7:79810263-79810282 None:intergenic 35.0%
GTTAAAAACTCTTAGGGAGA+AGG + Chr7:79809209-79809228 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
TAATAATATTCGGCTAACCC+CGG + Chr7:79809291-79809310 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
TACATATCTCAGAAGACAAG+TGG - Chr7:79805828-79805847 None:intergenic 35.0%
TACATCAAATTGTTGCAGAC+AGG - Chr7:79806632-79806651 None:intergenic 35.0%
TATCCTAGGGAAACTCTATA+AGG + Chr7:79806199-79806218 MsG0780040601.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
TCAAGCGTCTATTCATGTTT+CGG + Chr7:79806697-79806716 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
TCACCAGACCAAATACTATT+AGG + Chr7:79813314-79813333 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
TCAGGCACCAACTAATTAAA+TGG + Chr7:79810657-79810676 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
TCATGACAAACAAGTATCCA+AGG - Chr7:79805318-79805337 None:intergenic 35.0%
TCCAAAACCATACCAATCAA+AGG - Chr7:79805219-79805238 None:intergenic 35.0%
TCTGTGTCTTGTGAAATTGA+AGG + Chr7:79805567-79805586 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
TGACCTAATAGTATTTGGTC+TGG - Chr7:79813320-79813339 None:intergenic 35.0%
TGATGTTGTTGTCATGTTTC+AGG + Chr7:79806055-79806074 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
TGCATGATGTATTACATGGT+AGG + Chr7:79811823-79811842 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
TGTCATGTGTAAAAACTACC+GGG - Chr7:79809312-79809331 None:intergenic 35.0%
TTATATGGCAAGGAATTCCT+AGG + Chr7:79808346-79808365 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
TTATTATCTGCAACTGCAAG+TGG + Chr7:79807664-79807683 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
TTCAATTCCACACATCTTAG+AGG + Chr7:79808657-79808676 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
TTCAGATTATGAAACAGGCA+AGG + Chr7:79806496-79806515 MsG0780040601.01.T01:CDS 35.0%
TTCAGTTACAGCTTAGAAGT+CGG + Chr7:79808306-79808325 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
TTGAGAATAAATAGGGACGT+TGG - Chr7:79809666-79809685 None:intergenic 35.0%
TTGAGATGATCAACAAGAGA+TGG - Chr7:79807289-79807308 None:intergenic 35.0%
TTGCAAATTGGTGAATGGAT+GGG + Chr7:79808967-79808986 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
! AACAGGAAACTTTGGTTCAA+AGG + Chr7:79811480-79811499 MsG0780040601.01.T01:CDS 35.0%
! AAGTATAAGGCACTAAGATC+TGG + Chr7:79805651-79805670 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
! AGAAGCAGACAACAGAATTT+TGG + Chr7:79811773-79811792 MsG0780040601.01.T01:CDS 35.0%
! AGGGTTATAACTGTGTTTTG+TGG - Chr7:79810505-79810524 None:intergenic 35.0%
! AGTATAAGGCACTAAGATCT+GGG + Chr7:79805652-79805671 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
! AGTATAATGAAGGTCCGTTT+TGG - Chr7:79810237-79810256 None:intergenic 35.0%
! ATTCTATTTATGGCTTGCCT+TGG + Chr7:79805298-79805317 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
! CAGTTTTTATGGCCTTCTTA+CGG + Chr7:79808253-79808272 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
! CCAAGACTTTCCAATTTTAG+AGG - Chr7:79813198-79813217 None:intergenic 35.0%
! CCTTTTCATGAAGAAACTCT+AGG - Chr7:79812189-79812208 None:intergenic 35.0%
! GACAATTTTGTAGAGTTGAC+TGG + Chr7:79811741-79811760 MsG0780040601.01.T01:CDS 35.0%
! GACCAATGCTTACAATTTTG+AGG - Chr7:79813139-79813158 None:intergenic 35.0%
! GCAGGCAAGTTTTCTTATTA+GGG + Chr7:79810545-79810564 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
! GTCACAGTTTCAAAGTATCT+TGG - Chr7:79813782-79813801 None:intergenic 35.0%
! TCCTTTGATTGGTATGGTTT+TGG + Chr7:79805215-79805234 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
! TCTTGGGAATATAAGGTGTT+TGG + Chr7:79807096-79807115 MsG0780040601.01.T01:CDS 35.0%
! TGCAATATGAAGCTGATTTC+CGG + Chr7:79813851-79813870 MsG0780040601.01.T01:CDS 35.0%
! TGGCATTTTCAACTTCATGT+GGG - Chr7:79807375-79807394 None:intergenic 35.0%
! TTGCAAAGTACTTCAACTTG+AGG - Chr7:79805738-79805757 None:intergenic 35.0%
! TTTCATTTGTATGCTGCTTG+CGG + Chr7:79810460-79810479 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
!! CATGTTTTGTTGTGTTTTGC+GGG - Chr7:79810204-79810223 None:intergenic 35.0%
!! CCTCTAAAATTGGAAAGTCT+TGG + Chr7:79813195-79813214 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
!! GACATATGATTTTAGCCAAG+AGG + Chr7:79809328-79809347 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
!! GAGTAGCCTTGTATGAATAT+AGG + Chr7:79811352-79811371 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
!! GCATGTTTTGTTGTGTTTTG+CGG - Chr7:79810205-79810224 None:intergenic 35.0%
!! GTGTTTGTTGGTATCGATTA+TGG - Chr7:79804982-79805001 None:intergenic 35.0%
!! TTGTAAGCATTGGTCAAGAT+TGG + Chr7:79813144-79813163 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
!!! GCTCCTTCCTTATTTTTGAA+TGG + Chr7:79812987-79813006 MsG0780040601.01.T01:intron 35.0%
AAAAAGAGCTCCTGAAGTTG+CGG - Chr7:79805028-79805047 None:intergenic 40.0%
AAATAGTCCTACTGAGCTTC+CGG + Chr7:79810396-79810415 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
AAATGCATGCATGTAGAAGG+AGG - Chr7:79810287-79810306 None:intergenic 40.0%
AACCTTAGCAATTGCCTTTG+GGG - Chr7:79812966-79812985 None:intergenic 40.0%
AATGGTGTGCATGACTTACT+CGG + Chr7:79806602-79806621 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
ACAAGACTTTGTTGCCCTTT+AGG - Chr7:79812755-79812774 None:intergenic 40.0%
ACAAGAGTCTTGGGAACATT+TGG + Chr7:79812337-79812356 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
ACTCGTGCTAGATTATCCTA+GGG + Chr7:79806186-79806205 MsG0780040601.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
AGACAGTCAGATCAACAAAC+AGG - Chr7:79807428-79807447 None:intergenic 40.0%
AGATGGAATGTCACCCATAA+CGG - Chr7:79807272-79807291 None:intergenic 40.0%
ATACGAACCTTCACCAATGA+AGG - Chr7:79811506-79811525 None:intergenic 40.0%
ATCCCCACCCGAAAAATAAA+GGG - Chr7:79808439-79808458 None:intergenic 40.0%
ATCTTCAGGTATGCAATGAC+AGG + Chr7:79812641-79812660 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
ATGGCCTTCTTACGGTTTAT+GGG + Chr7:79808261-79808280 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
CAAACCTTAGCAATTGCCTT+TGG - Chr7:79812968-79812987 None:intergenic 40.0%
CAAATCACATTGTGCAACTG+GGG - Chr7:79810893-79810912 None:intergenic 40.0%
CAACAATTGTCATGTTTGGC+CGG - Chr7:79813873-79813892 None:intergenic 40.0%
CAAGCGTCTATTCATGTTTC+GGG + Chr7:79806698-79806717 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
CAAGCTGAAATCAGCAATCT+TGG - Chr7:79812278-79812297 None:intergenic 40.0%
CACGGAACTAGTTCAAAGAA+TGG + Chr7:79806584-79806603 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
CAGAGAGCGAAAATTGCATT+TGG + Chr7:79812151-79812170 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
CATATGGGCGCAAACTTATA+TGG + Chr7:79808331-79808350 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
CCATTTCTGATCCGATCTAA+AGG - Chr7:79806427-79806446 None:intergenic 40.0%
CCTTTAGATCGGATCAGAAA+TGG + Chr7:79806424-79806443 MsG0780040601.01.T01:exon 40.0%
CGTAAGAAGGCCATAAAAAC+TGG - Chr7:79808255-79808274 None:intergenic 40.0%
CTGTGACTGATCATTTGATG+TGG + Chr7:79813795-79813814 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
CTTGCAAATTGGTGAATGGA+TGG + Chr7:79808966-79808985 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
CTTGCAGATATCAGAGTCTA+GGG + Chr7:79807152-79807171 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
GAACATAACGTATGGCCATT+TGG - Chr7:79807028-79807047 None:intergenic 40.0%
GACAAATCACATTGTGCAAC+TGG - Chr7:79810895-79810914 None:intergenic 40.0%
GAGTTGAAATTGCGAATCAC+CGG + Chr7:79808465-79808484 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
GATTAGTGAGGCATATGGAT+TGG + Chr7:79805850-79805869 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
GCAAAGTAGCTACAACTTGA+TGG + Chr7:79807997-79808016 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
GCATTTCTGTTTGCACTTTG+AGG + Chr7:79808209-79808228 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
GCTACATTCAACAAGAGTCT+TGG + Chr7:79812327-79812346 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
GGACAAAGTGAAACAATGTG+TGG + Chr7:79812916-79812935 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
GGTGAATGGATGGGAAATAT+GGG + Chr7:79808976-79808995 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
GTAGTGATTAGTGAGGCATA+TGG + Chr7:79805845-79805864 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
GTCATGTGTAAAAACTACCG+GGG - Chr7:79809311-79809330 None:intergenic 40.0%
GTGAATGGATGGGAAATATG+GGG + Chr7:79808977-79808996 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
GTTGGATTGAATGGAAAGCA+CGG + Chr7:79806566-79806585 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
TACTCGTGCTAGATTATCCT+AGG + Chr7:79806185-79806204 MsG0780040601.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
TAGACCACACAATGCCTAAA+GGG + Chr7:79812738-79812757 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
TAGATGTTGAGCAATCTACG+AGG - Chr7:79809395-79809414 None:intergenic 40.0%
TATCCCCACCCGAAAAATAA+AGG - Chr7:79808440-79808459 None:intergenic 40.0%
TATGGCCTTCTTACGGTTTA+TGG + Chr7:79808260-79808279 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
TCATCTCAAGGATGAACACA+AGG + Chr7:79807300-79807319 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
TCCATTCAATCCAACACTAG+TGG - Chr7:79806561-79806580 None:intergenic 40.0%
TCTTCAGGTATGCAATGACA+GGG + Chr7:79812642-79812661 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
TGAAGTTGCAATCAAAAGGC+TGG + Chr7:79811561-79811580 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
TGGTGAATGGATGGGAAATA+TGG + Chr7:79808975-79808994 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
TGTGTGTTTCAGTGTCCAAA+TGG + Chr7:79807010-79807029 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
TTCATTGGTGAAGGTTCGTA+TGG + Chr7:79811505-79811524 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
TTGAAGACGAGAAATCGCAT+TGG + Chr7:79808021-79808040 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
! AGCGAAAATTGCATTTGGTG+CGG + Chr7:79812156-79812175 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
! CAAATGCAATTTTCGCTCTC+TGG - Chr7:79812153-79812172 None:intergenic 40.0%
! CAATTAATAGAAGGGAGTGC+TGG + Chr7:79811987-79812006 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
! GAATATAAGGTGTTTGGCTC+TGG + Chr7:79807102-79807121 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
! GCAACAAAGTCTTGTGACTT+GGG + Chr7:79812760-79812779 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
! GCATTGGTCAAGATTGGTAT+TGG + Chr7:79813150-79813169 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
! GCTAACTACACTTTTGATGC+TGG + Chr7:79805447-79805466 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
! GGCAGGCAAGTTTTCTTATT+AGG + Chr7:79810544-79810563 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
! GGGTAGTCATTGTTTAGCTT+AGG - Chr7:79812944-79812963 None:intergenic 40.0%
! GTGGCATTTTCAACTTCATG+TGG - Chr7:79807376-79807395 None:intergenic 40.0%
! GTTGTGTTTTGCGGGAATAT+TGG - Chr7:79810196-79810215 None:intergenic 40.0%
! TCCACTAGTGTTGGATTGAA+TGG + Chr7:79806557-79806576 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
! TCTTTGAAAATACCTCCTCC+CGG - Chr7:79806452-79806471 None:intergenic 40.0%
! TGGTACAGCTCCAGTTTTTA+TGG + Chr7:79808242-79808261 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
! TGTTTTGCGGGAATATTGGT+TGG - Chr7:79810192-79810211 None:intergenic 40.0%
! TTTGGTTCAAAGGCCTTCAT+TGG + Chr7:79811490-79811509 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
!! AGTCAATGGGTTATTGAGAG+TGG + Chr7:79810969-79810988 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
!! AGTCTCTTCTAGCTTAACCA+AGG + Chr7:79809150-79809169 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
!! CCTGATAGGTTTTGTGTGAT+CGG + Chr7:79809468-79809487 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
!! GAGGCATATGGATTGGAATT+TGG + Chr7:79805857-79805876 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
!! GATATGGAGGGTATCTCAAT+TGG - Chr7:79811439-79811458 None:intergenic 40.0%
!! GCTTTGAAAGAACACTACCT+TGG - Chr7:79805429-79805448 None:intergenic 40.0%
!! TGGTTTGTTTGATGGTTCCA+AGG + Chr7:79805409-79805428 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
!! TTTGCTTTTGCAGGAAGGAA+GGG + Chr7:79812088-79812107 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTTGCTTTTGCAGGAAGGA+AGG + Chr7:79812087-79812106 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
!!! AAGCCCTTTATTTTTCGGGT+GGG + Chr7:79808433-79808452 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
!!! AGCGATGTTTTGAGTTTGAG+AGG + Chr7:79805992-79806011 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
!!! GCTTTTTTTTCTTGACTCGC+TGG + Chr7:79806083-79806102 MsG0780040601.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
!!! GTGCTTTTAGAACTCTTGAC+TGG + Chr7:79812704-79812723 MsG0780040601.01.T01:CDS 40.0%
!!! TAAAGCAGTGTTTTGGCTCT+TGG + Chr7:79811647-79811666 MsG0780040601.01.T01:intron 40.0%
AAACAATGACTACCCCCCAA+AGG + Chr7:79812949-79812968 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
AACTCAGCCAACGATATGGA+GGG - Chr7:79811451-79811470 None:intergenic 45.0%
AAGTCGTTGGAGTCAGAATC+AGG - Chr7:79811601-79811620 None:intergenic 45.0%
AATACGCTGCACCATCAAGA+GGG + Chr7:79811063-79811082 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
ACATCGCGGTGAACTATAGA+AGG - Chr7:79812217-79812236 None:intergenic 45.0%
ACCTATTTCAGGCAACTCCA+AGG + Chr7:79812885-79812904 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
ACCTTAGCAATTGCCTTTGG+GGG - Chr7:79812965-79812984 None:intergenic 45.0%
ACCTTGGAGTTGCCTGAAAT+AGG - Chr7:79812889-79812908 None:intergenic 45.0%
ACTTACAGTGAGCATCCATG+TGG - Chr7:79807395-79807414 None:intergenic 45.0%
ACTTTGTCCTCACTCAACCT+TGG - Chr7:79812905-79812924 None:intergenic 45.0%
AGCAACATTACCAAGAGTGG+TGG + Chr7:79811397-79811416 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
AGCTTAGAAGTCGGTGCATA+TGG + Chr7:79808315-79808334 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
AGGAGCAACATTACCAAGAG+TGG + Chr7:79811394-79811413 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
ATAGGCACAATTCCTGCTAG+TGG - Chr7:79810697-79810716 None:intergenic 45.0%
ATCGCCCATAAACCGTAAGA+AGG - Chr7:79808268-79808287 None:intergenic 45.0%
ATGGTGTGCATGACTTACTC+GGG + Chr7:79806603-79806622 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
ATTCCCAAGATCATGGTGAC+AGG - Chr7:79807086-79807105 None:intergenic 45.0%
CACAAGGTTGACATGCATGA+TGG + Chr7:79807316-79807335 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
CATGCCTCGTTCTTCCAAAA+CGG + Chr7:79810220-79810239 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
CCAGCATAGGGACAATTGTA+TGG - Chr7:79807238-79807257 None:intergenic 45.0%
CCATACAATTGTCCCTATGC+TGG + Chr7:79807235-79807254 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
CCGATCACACAAAACCTATC+AGG - Chr7:79809471-79809490 None:intergenic 45.0%
CCTAGACTCTGATATCTGCA+AGG - Chr7:79807154-79807173 None:intergenic 45.0%
CCTTGCAGATATCAGAGTCT+AGG + Chr7:79807151-79807170 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
CTAAAGCTGAAATCGAACCC+AGG - Chr7:79809177-79809196 None:intergenic 45.0%
CTGGGGAAGAATGATGTTCA+TGG - Chr7:79810876-79810895 None:intergenic 45.0%
CTGGTAATTTCCGCAACTTC+AGG + Chr7:79805015-79805034 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
GATGTATCCTCCAATTCACC+AGG + Chr7:79806646-79806665 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
GATTACCTCTAACGCGTTAC+CGG - Chr7:79810428-79810447 None:intergenic 45.0%
GCCACTTCTCAATGCAAAAC+CGG + Chr7:79813906-79813925 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
GCTCACTGTAAGTGACTCAA+TGG + Chr7:79807402-79807421 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
GCTTAAAACTGGACCAGGTT+CGG - Chr7:79812125-79812144 None:intergenic 45.0%
GCTTAGAAGTCGGTGCATAT+GGG + Chr7:79808316-79808335 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
GGAGAAAGTGGCTGAATCTT+TGG + Chr7:79807123-79807142 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
GGGTTATTGAGAGTGGATCT+AGG + Chr7:79810976-79810995 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
GTAGACCACACAATGCCTAA+AGG + Chr7:79812737-79812756 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
TAACTCAGCCAACGATATGG+AGG - Chr7:79811452-79811471 None:intergenic 45.0%
TAGGCACAATTCCTGCTAGT+GGG - Chr7:79810696-79810715 None:intergenic 45.0%
TATGCATTACCCCCTCTTGA+TGG - Chr7:79811077-79811096 None:intergenic 45.0%
TCAAAGGCCTTCATTGGTGA+AGG + Chr7:79811496-79811515 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
TCAAGAGGGGGTAATGCATA+TGG + Chr7:79811077-79811096 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
TCCACACATCTTAGAGGTGA+GGG + Chr7:79808663-79808682 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
TCCTGCAAAAGCAAAAGCCT+TGG - Chr7:79812083-79812102 None:intergenic 45.0%
TGAAGTATGTTGTGTTGCGG+AGG + Chr7:79811005-79811024 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
TGAGATACCCTCCATATCGT+TGG + Chr7:79811441-79811460 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
TGGTGAAGGTTCGTATGGAA+GGG + Chr7:79811510-79811529 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
TGTGGATCGTATCTCCTGAT+AGG + Chr7:79809454-79809473 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
TTCCACACATCTTAGAGGTG+AGG + Chr7:79808662-79808681 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
TTCCAGCTTAAAACTGGACC+AGG - Chr7:79812130-79812149 None:intergenic 45.0%
TTGGTGAAGGTTCGTATGGA+AGG + Chr7:79811509-79811528 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
! CTCTGGTTCCAGCTTAAAAC+TGG - Chr7:79812136-79812155 None:intergenic 45.0%
! GGCAACAAAGTCTTGTGACT+TGG + Chr7:79812759-79812778 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
! GTTTTGCATTGAGAAGTGGC+TGG - Chr7:79813906-79813925 None:intergenic 45.0%
! TCTAGCTTAACCAAGGTCCT+GGG + Chr7:79809157-79809176 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
! TTAGGCATTGTGTGGTCTAC+TGG - Chr7:79812737-79812756 None:intergenic 45.0%
! TTTCTTGACTCGCTGGATCT+TGG + Chr7:79806090-79806109 MsG0780040601.01.T01:five_prime_UTR 45.0%
!! ACCAAGGCTTTTGCTTTTGC+AGG + Chr7:79812079-79812098 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
!! AGGCTTTTGCTTTTGCAGGA+AGG + Chr7:79812083-79812102 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
!! ATTGCATTTGGTGCGGCAAA+AGG + Chr7:79812163-79812182 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
!! CTCTTGGTAATGTTGCTCCT+TGG - Chr7:79811394-79811413 None:intergenic 45.0%
!! TTCTAGCTTAACCAAGGTCC+TGG + Chr7:79809156-79809175 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
!!! AACCTGGTCCAGTTTTAAGC+TGG + Chr7:79812125-79812144 MsG0780040601.01.T01:CDS 45.0%
!!! AAGTGTTGGCCAGAGACTTT+TGG + Chr7:79806148-79806167 MsG0780040601.01.T01:five_prime_UTR 45.0%
!!! AGCCCTTTATTTTTCGGGTG+GGG + Chr7:79808434-79808453 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
!!! AGTGTTGGCCAGAGACTTTT+GGG + Chr7:79806149-79806168 MsG0780040601.01.T01:five_prime_UTR 45.0%
!!! CAAGCCCTTTATTTTTCGGG+TGG + Chr7:79808432-79808451 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
!!! TTTTTCGGGTGGGGATAAAC+AGG + Chr7:79808443-79808462 MsG0780040601.01.T01:intron 45.0%
!! AAAAATAAATTAATTGTTTA+TGG - Chr7:79810584-79810603 None:intergenic 5.0%
!! ATTATTATAAATAAAATCTA+TGG - Chr7:79809835-79809854 None:intergenic 5.0%
!! TTAATAATAAAAAATCATAT+AGG + Chr7:79811910-79811929 MsG0780040601.01.T01:intron 5.0%
!!! ATGATTTTTTATTATTAAAA+GGG - Chr7:79811908-79811927 None:intergenic 5.0%
!!! TATGATTTTTTATTATTAAA+AGG - Chr7:79811909-79811928 None:intergenic 5.0%
AAACTGGAGCTGTACCAAGC+TGG - Chr7:79808239-79808258 None:intergenic 50.0%
AAGCAGTGCACCTGGTGAAT+TGG - Chr7:79806659-79806678 None:intergenic 50.0%
ACATTGACGAGGGATCAACG+TGG - Chr7:79813295-79813314 None:intergenic 50.0%
AGAGGGGGTAATGCATATGG+TGG + Chr7:79811080-79811099 MsG0780040601.01.T01:intron 50.0%
AGTCTTCAGATACGGCAGCT+CGG + Chr7:79812305-79812324 MsG0780040601.01.T01:CDS 50.0%
ATACGCTGCACCATCAAGAG+GGG + Chr7:79811064-79811083 MsG0780040601.01.T01:intron 50.0%
ATCGGATCAGAAATGGCTCC+GGG + Chr7:79806431-79806450 MsG0780040601.01.T01:exon 50.0%
ATGCATGTAGAAGGAGGAGG+AGG - Chr7:79810281-79810300 None:intergenic 50.0%
ATGGGGAGAGCAGAAAGCAA+CGG + Chr7:79808994-79809013 MsG0780040601.01.T01:intron 50.0%
CAATACGCTGCACCATCAAG+AGG + Chr7:79811062-79811081 MsG0780040601.01.T01:intron 50.0%
CATTCACGCCCAAAAGTCTC+TGG - Chr7:79806160-79806179 None:intergenic 50.0%
CATTGCTGGATCGAACATCG+CGG - Chr7:79812231-79812250 None:intergenic 50.0%
CCAAGATCATGGTGACAGGT+GGG - Chr7:79807082-79807101 None:intergenic 50.0%
CCACCTGTCACCATGATCTT+GGG + Chr7:79807080-79807099 MsG0780040601.01.T01:CDS 50.0%
CCTTAGCAATTGCCTTTGGG+GGG - Chr7:79812964-79812983 None:intergenic 50.0%
CTTCTCAATGCAAAACCGGC+TGG + Chr7:79813910-79813929 MsG0780040601.01.T01:CDS 50.0%
GAAATTGCAAGCAGTGCACC+TGG - Chr7:79806667-79806686 None:intergenic 50.0%
GACAGGTGGGACAGAGATTA+TGG - Chr7:79807069-79807088 None:intergenic 50.0%
GAGCACTCAGATCCAGCATA+GGG - Chr7:79807250-79807269 None:intergenic 50.0%
GATCGGATCAGAAATGGCTC+CGG + Chr7:79806430-79806449 MsG0780040601.01.T01:exon 50.0%
GCAATGATAGAGGAGAGCCA+AGG + Chr7:79811374-79811393 MsG0780040601.01.T01:CDS 50.0%
GGATCTGAGTGCTCCGTTAT+GGG + Chr7:79807256-79807275 MsG0780040601.01.T01:CDS 50.0%
GGGCGCAAACTTATATGGCA+AGG + Chr7:79808336-79808355 MsG0780040601.01.T01:intron 50.0%
GGTGCAGAAGAAGATACCAG+CGG + Chr7:79811026-79811045 MsG0780040601.01.T01:intron 50.0%
TCAAATGCACACGCAATGCG+AGG - Chr7:79806259-79806278 None:intergenic 50.0%
TCTGCAACTGCAAGTGGTGT+TGG + Chr7:79807670-79807689 MsG0780040601.01.T01:intron 50.0%
TGAAATCGAACCCAGGACCT+TGG - Chr7:79809170-79809189 None:intergenic 50.0%
TGAGCAATCTACGAGGTGCA+TGG - Chr7:79809388-79809407 None:intergenic 50.0%
TGCATGCATGTAGAAGGAGG+AGG - Chr7:79810284-79810303 None:intergenic 50.0%
TGCGAATCACCGGTCGTATA+TGG + Chr7:79808475-79808494 MsG0780040601.01.T01:intron 50.0%
TGGATCTGAGTGCTCCGTTA+TGG + Chr7:79807255-79807274 MsG0780040601.01.T01:CDS 50.0%
TGGTCTGGTGACATTGACGA+GGG - Chr7:79813305-79813324 None:intergenic 50.0%
TTGGTCTGGTGACATTGACG+AGG - Chr7:79813306-79813325 None:intergenic 50.0%
TTTCTGTGGACCACCACTCT+TGG - Chr7:79811410-79811429 None:intergenic 50.0%
! AAACAGTACTGCAGGGGCAT+TGG - Chr7:79807631-79807650 None:intergenic 50.0%
! GTTGCCCTTTAGGCATTGTG+TGG - Chr7:79812745-79812764 None:intergenic 50.0%
!! ACCCTCACCTCTAAGATGTG+TGG - Chr7:79808667-79808686 None:intergenic 50.0%
!! CACTTTGAGGCTTTCCAGCT+TGG + Chr7:79808222-79808241 MsG0780040601.01.T01:intron 50.0%
!! CTCTTGATGGTGCAGCGTAT+TGG - Chr7:79811064-79811083 None:intergenic 50.0%
!! GCAGCGTATTGGTTTGAAGG+TGG - Chr7:79811053-79811072 None:intergenic 50.0%
!! GCCGGTTTTGCATTGAGAAG+TGG - Chr7:79813910-79813929 None:intergenic 50.0%
!! GGTGCAGCGTATTGGTTTGA+AGG - Chr7:79811056-79811075 None:intergenic 50.0%
!! GTGTTTGGCTCTGGAGAAAG+TGG + Chr7:79807111-79807130 MsG0780040601.01.T01:CDS 50.0%
!!! AGGTCCGTTTTGGAAGAACG+AGG - Chr7:79810227-79810246 None:intergenic 50.0%
AACGCGTTACCGGATCCAAC+CGG - Chr7:79810418-79810437 None:intergenic 55.0%
ACTGAGCTTCCGGTTGGATC+CGG + Chr7:79810406-79810425 MsG0780040601.01.T01:intron 55.0%
AGTCCTACTGAGCTTCCGGT+TGG + Chr7:79810400-79810419 MsG0780040601.01.T01:intron 55.0%
CAGTGCACCTGGTGAATTGG+AGG - Chr7:79806656-79806675 None:intergenic 55.0%
CCCAAGATCATGGTGACAGG+TGG - Chr7:79807083-79807102 None:intergenic 55.0%
CCCACCTGTCACCATGATCT+TGG + Chr7:79807079-79807098 MsG0780040601.01.T01:CDS 55.0%
CCCCCCAAAGGCAATTGCTA+AGG + Chr7:79812961-79812980 MsG0780040601.01.T01:CDS 55.0%
GATCCAACCGGAAGCTCAGT+AGG - Chr7:79810406-79810425 None:intergenic 55.0%
GCACAATTCCTGCTAGTGGG+CGG - Chr7:79810693-79810712 None:intergenic 55.0%
GCATTAGAGTCAGGACCAGC+CGG - Chr7:79813928-79813947 None:intergenic 55.0%
GGCAACTCCAAGGTTGAGTG+AGG + Chr7:79812895-79812914 MsG0780040601.01.T01:intron 55.0%
GGGGGTAATGCATATGGTGG+CGG + Chr7:79811083-79811102 MsG0780040601.01.T01:intron 55.0%
TACCTGAGCAGCGAAGTCGT+TGG - Chr7:79811614-79811633 None:intergenic 55.0%
TACGCTGCACCATCAAGAGG+GGG + Chr7:79811065-79811084 MsG0780040601.01.T01:intron 55.0%
TGACTGTCGCGTATGCTCCT+AGG - Chr7:79808366-79808385 None:intergenic 55.0%
TGGATCCGGTAACGCGTTAG+AGG + Chr7:79810420-79810439 MsG0780040601.01.T01:intron 55.0%
! GCAGGAAGGAAGGGTGTACA+AGG + Chr7:79812097-79812116 MsG0780040601.01.T01:CDS 55.0%
! GGAGCACTCAGATCCAGCAT+AGG - Chr7:79807251-79807270 None:intergenic 55.0%
! TTGGTTTGAAGGTGGACCGC+TGG - Chr7:79811045-79811064 None:intergenic 55.0%
!! GGTAATGCATATGGTGGCGG+CGG + Chr7:79811086-79811105 MsG0780040601.01.T01:intron 55.0%
CAATCTCACCGCCCACTAGC+AGG + Chr7:79810682-79810701 MsG0780040601.01.T01:intron 60.0%
CTCCAACGACTTCGCTGCTC+AGG + Chr7:79811609-79811628 MsG0780040601.01.T01:CDS 60.0%
GGAGAGCAGAAAGCAACGGC+TGG + Chr7:79808998-79809017 MsG0780040601.01.T01:intron 60.0%
GGATCAGAAATGGCTCCGGG+AGG + Chr7:79806434-79806453 MsG0780040601.01.T01:exon 60.0%
TCAGAAATGGCTCCGGGAGG+AGG + Chr7:79806437-79806456 MsG0780040601.01.T01:exon 60.0%
!! AATGCATATGGTGGCGGCGG+CGG + Chr7:79811089-79811108 MsG0780040601.01.T01:intron 60.0%
!! GGTGTACAAGGTGCCGAACC+TGG + Chr7:79812109-79812128 MsG0780040601.01.T01:CDS 60.0%
!! GCATATGGTGGCGGCGGCGG+TGG + Chr7:79811092-79811111 MsG0780040601.01.T01:intron 75.0%
!! TATGGTGGCGGCGGCGGTGG+AGG + Chr7:79811095-79811114 MsG0780040601.01.T01:intron 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 79804919 79813951 79804919 ID=MsG0780040601.01;Name=MsG0780040601.01
Chr7 mRNA 79804919 79813951 79804919 ID=MsG0780040601.01.T01;Parent=MsG0780040601.01;Name=MsG0780040601.01.T01;_AED=0.39;_eAED=0.41;_QI=313|0.33|0.4|1|0.77|0.7|10|0|555
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