AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene52608


Find 134 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE



Chromosome Type Strat End Strand Name
chr1.4 gene 65328121 65335285 65328121 ID=MS.gene52608
chr1.4 mRNA 65328121 65335285 65328121 ID=MS.gene52608.t1;Parent=MS.gene52608
chr1.4 exon 65335270 65335285 65335270 ID=MS.gene52608.t1.exon1;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 CDS 65335270 65335285 65335270 ID=cds.MS.gene52608.t1;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 exon 65335158 65335194 65335158 ID=MS.gene52608.t1.exon2;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 CDS 65335158 65335194 65335158 ID=cds.MS.gene52608.t1;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 exon 65334216 65334346 65334216 ID=MS.gene52608.t1.exon3;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 CDS 65334216 65334346 65334216 ID=cds.MS.gene52608.t1;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 exon 65333978 65334082 65333978 ID=MS.gene52608.t1.exon4;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 CDS 65333978 65334082 65333978 ID=cds.MS.gene52608.t1;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 exon 65333773 65333881 65333773 ID=MS.gene52608.t1.exon5;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 CDS 65333773 65333881 65333773 ID=cds.MS.gene52608.t1;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 exon 65333443 65333576 65333443 ID=MS.gene52608.t1.exon6;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 CDS 65333443 65333576 65333443 ID=cds.MS.gene52608.t1;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 exon 65332775 65332914 65332775 ID=MS.gene52608.t1.exon7;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 CDS 65332775 65332914 65332775 ID=cds.MS.gene52608.t1;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 exon 65332038 65332088 65332038 ID=MS.gene52608.t1.exon8;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 CDS 65332038 65332088 65332038 ID=cds.MS.gene52608.t1;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 exon 65331870 65331952 65331870 ID=MS.gene52608.t1.exon9;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 CDS 65331870 65331952 65331870 ID=cds.MS.gene52608.t1;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 exon 65331715 65331769 65331715 ID=MS.gene52608.t1.exon10;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 CDS 65331715 65331769 65331715 ID=cds.MS.gene52608.t1;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 exon 65331508 65331622 65331508 ID=MS.gene52608.t1.exon11;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 CDS 65331508 65331622 65331508 ID=cds.MS.gene52608.t1;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 exon 65329200 65329677 65329200 ID=MS.gene52608.t1.exon12;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 CDS 65329200 65329677 65329200 ID=cds.MS.gene52608.t1;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 exon 65328909 65329122 65328909 ID=MS.gene52608.t1.exon13;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 CDS 65328909 65329122 65328909 ID=cds.MS.gene52608.t1;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 exon 65328746 65328816 65328746 ID=MS.gene52608.t1.exon14;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 CDS 65328746 65328816 65328746 ID=cds.MS.gene52608.t1;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 exon 65328358 65328526 65328358 ID=MS.gene52608.t1.exon15;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 CDS 65328358 65328526 65328358 ID=cds.MS.gene52608.t1;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 exon 65328121 65328253 65328121 ID=MS.gene52608.t1.exon16;Parent=MS.gene52608.t1
chr1.4 CDS 65328121 65328253 65328121 ID=cds.MS.gene52608.t1;Parent=MS.gene52608.t1
Gene Sequence

>MS.gene52608

ATGGTTACACAAAAGGGTAACTTACTTAATTGCTTAACTTAATTAATCAACATTTTAAGCTGAATTAATAAAAATAAGTTTTTTTTTTCAGGGTCTACACAACATCGTGGTTTTGGTTATGTTCAATTGTAAGTTCAGTTTAACTCATTTGTGTATGAACTAAAGTGTAGCTAAGTATGTATATGATTATGAATCAGTAGCAGAATTTCAACAAATCACTACTGTTCTATCCTATGATATGATATTTAATAGAGTTTTGTCAAATAACAGCTATGGTGGCACGCACTATAGTGTTCCGCTGTTTAACACAAGCATCCCTATTTGATAATAATCGAAATAAGAATGTATAACTCAGTAAATAAAACTGCAAAATTTGAACAAATCGCTATTATTGTGTGATATACCGATATGTTATTTAGTACAATGTTTCCAAATAGTAGCTATATCAGCGTTGTAGCATTGTTGTGTAGTTGAATTTCAATTTACAACTATATTTGCGATCTGCGATTGATTAGACCTGAATGATTAATACTCACCACAACCCCATCTTTGTAAGTAAAAAGAGTTCGCCATTTTTGGTAAGTGCAATTTGAGTGTATTGTCTGGATGTTGAAAAATCGGAAGAAATAATACTAAACATGCTACTGTTGGTTCACCAAGCTTAGTTAAGAGGAGAATATTGATATCATGAGGACCGAGGAGGGATACAATTTTTGAACTTTATTATAGGTTTATCAGTTTTATAGTGCTTGCTTCAATAGTATCCGGGTAGTCTTTTTATGTTCACTCTGCGTGTTGTGGTAATTTGTGGTAAACTAATCCGTAATCACAATATTTTGATGGACTCTTTTTTGTGCAATTCCATTTTACATATATTATTAGAATTGTATAATTTGTAGCATGACTTTCTGATTTGTTATTAATTGATGTCATCTTCAGTGCTGTTGAGAAAGACGCTAACCAAGCCATTGAGCTGAAGAATGGTTCATTGGTTGGTGACCGGAAAATTGTAGTGAAGCACGCAATGCCTCGTCCTCCCCGTGAAAATCGAAGATCGAAACCGGATCAAGGTTGGTTGATGCTACCAATTCTGTTTCAGATAGAGATGTTACATATATTTTCCGAATGATGTACAGATGATTTGATCTTATCATTGTTCCTCCCTTGTTTTCTTTTCTCACTCTTTCTTTTATGATGCAATAGAGGGCAATGAAGGCGATCTCACACAATCAAAAAATGATGATAAAGACAGCGGATTATCTGGAGCAGAGAAGCCTGTTTCAGTTCCAAAAGAACCAAAGGAAGAAGGTTGCGATTGTGTTTACGTGCATTTGATTAGCTTTACCAGTTGTTCATTTATATATTTATTGCTTTTTTATTGATATTATATTTCATTCCTTTTAGAAGTGAAAGTTTTGGATAAACCGAAAAACTCAAGGAAGCCTGTGGAAATAAAAAAAGCAGCACTTTGTAATGACACAGCAGATGAGGGGGGTGGCTCAGAAAAACAGAAGTATTTACTCTTCTCCCTTTTCTTAGTAGTACTTCAGCCATGAAATATTTTTTTTTTTTAATTTTTTTTAATGTTTGGGATTAAGAGATAATGAGTTGATCTGATCCTTTCTTTATGGATGTATCTTTTCGTATCATGAATGTATATCTTATTTCTAAAAAGCTGTTCCTTGCTCTATGTTTTTTTCTTTTGGTAGGGTTGCTAGAACTGTTATATTTGGTGGTCTCGTGAATTCTGCTATGGCCGAAGATGTTCACCGCCAAGCCAGAGAAATCGGCACTGTGTGTTCTATTAAGCATCCCCTTTCAAGGAATGATCTTCAGCAGCATGGTAACTGCTGATTTTATCTTTTCAAATTACAGACAAGATAGGTTTTGTGTATAATTGTTATTGGTGTGTTATGTCATGTTATATTAGAAAATATTTAAAAAATATATTCTTTTCGCCTGTTTAATAATTATGATATGCTGTATTCCTGTTCTTTTCAGTTCATATTTTCCCATTGTTTTGCACTTCGTGTTGAGCCATCTCATGGTTAGTGTATGAAGCAGTTTCTAATATAGATTTGCTTCTGTCTTGTGCTGTTTTATGTGCTCTGGAAGCTGTCAATCTTATTGTTATTTTTTTTTTAATGCTAAGCCTTTTTATTTTATAATTAAACATCTAGTTGTATTGTATCCCATATGATCAATTGTTGAGTATGCTGATAAGGACATTGAAGTTTGTTCTTTCACTAAAATTTCTGATGAGATAGTTTTCCAGTTAGGATGCAAATCAAGAAGATTGAATCATGCATTATATTTATAAAGATTCTTTATACTGCTCAGGATAGTAAGGTAATTATGGTATTTTTCCCAGGTCTGCTGCAAGAAGGCTGTACTTTCAATGCTTCAGCTGTACTTTATACAAGTGTAAAATCAGCCCGTGCTTCTGTTGCAACATTGCATAAAAAAGAGATAGGAGGGGGAACTGTTTGGGCACGCCAACTTGGTGGGGAGGTAAAGTGCTCGTCATAGAACACATCAGAGGATAATATCATCATGCACCATATAGTATCTTTTATATAGAGTGATAACTGCTAGCTGATTAGGAGAGTTTGTACTGATATATATTAATAAAATGAATAATTTTGCTTTGTATTTTGATAAAAAAATCATTTTAGCTTTGTCATAAAATTTTGATGTGTTAATATTCTTCCAAAAATCAAATACAAAAAATCTTAATAACTACAGGGTTATTTCTGCTAAGCGCTGATCACGAAAATATGCATTGTCTTAAAAAATAGGGAGTTACATCATGGGAATTTGTGATATATTATGCGTCTAGAGCCTTGAAAGGGTTTTCTTTTTGGTGCTGTCCTAATTTCCCATGTTTGTAGATTAAGATATTCTTTAAATTGTTTTTATTTTCCTTGTATCTGATTCTGATACGTGACAATCAGCTCTTTAAAGTAGAAGTTTTGTTTATCCGCCCTGTTCAACATTTCTATCAACTATGTTTATCCTATAATTTGAATTTCGTAAATTGGTTTCTAACAATGATTTCATTTTCTTCATGCTTTTCACGTATTTTTTGTACTGATTTTTAATTTGGTCATAGGTAGAATGAACTTTTCCCTGTTTAATGAATATTACCATTTATGATACTTAGTTTGTTAACATTTTTGTTGTTGTATGTGGGCCAGGGAGCCAAGACTCAGAAATGGAAGCTTATTGTCAGAAACCTTCCTTTCAAGGTTCGATCTGTTGAGTTACAGAACATAAAATAATTTTTTGTTTGGAGACCTTGTTTTCTATCTACTTGACTATATATGGATACAGGCCAAAGAAAATGAAATAAGGGACGCATTTTCATCTGCGGGGACTGTATGGGAGGTATTCATTCCACAGAAGTCCGACACAGGGTATATATTCCTTTTCTTTTCCTGATATAAAGCGTTTCGATACTGTATTATACATTATGTTTTGTTACGCTGTTTTCATCGCCTCATTTCCTGTGTGCAGTCTTTCAAAGGGTTTTGCATTTGTAAAATTCACCTGCAAGCAAGATGCTGAAAATGTATGAACTGTTTCAAAAGTTTTACTTAACATACTGTTTGTATTCTAAAATCACTTGTATAATTGTATATAAGTTTCCTGTTTCTGTTTCAGGCGATTCGAAAACTCAATGGATCGAAGTTTGGGAGTCGTCTCATAGCTGTTGATTGGGCTGTTCCAAAAAAGATATTTAGTAGTGATACCAATGATGCTCCTGCTTCAGAGGAAGGTAATTTGTTTCTTTGTTGAAATGATACTGCATCTTCAAATGATTTATTATCGATTTGCTAACTAGTAGAGTTTGGTAAAGCACAATGCTTTTGAATTTTGAGTTCTGTGACATTATCATACTTCAGATGTAGACATATTGACCATTTTTTGAATGAACGTGCAGCATATCTTCCTCACAAGTGTCAAATCATTTTGTTTTTTTATATATATGAAGAAGCAAAGATAATTAAGATTAAAAAAATCCTATTGATGTAATTCTGGGTCTTAGATTTATAGAAGGTAAGAGCATCCACATTGGTAGGGTCTTTAACATTTAAGACCCGGTACCTAATAGGTACCCTCAATGTGGAAAAAAAATTTGGGGGTCTCTTAAGACTCGGGGTCTAACTTAAGACCCCCAATCTTAAGTGGACTACGACCACTTTTCAATAAAATAATCATTATTTGAATTGTTTTTGTTGCTTTTCATTAATAAATAGTTATTGGTGGGACCCATTTAGACCTTTTGATAGAGGATCTCCATTGGAGTGGTTGAGTACCTATTAGGTACTCCCTCCGTCCCATAATACTTGACACAATTAACCTTATTACGCATGCCAATGCATAACTTTGAGCTTAAATATTTTGAGTAATATATCAGAAAAAATTATGAAAATTTGATATTTTGAAAATACTCATCGAGACGAATCTAACGACATCTTATATGATATTATTCATCTTTGTATATTAGTAGAAAAATACGGTCAAAGTAAGTTAGGTCAAAATTGCACATTTTCAAATGGGTCGTCTATTGCGAGACAGAGGGAGTACTATTATTAAAAAATAATAAAAAAGTGATGTGTCCATGTGGAACCCATTTAAGACCTCAAATGTGAGGGTCTCCATTGTGGATGCTCTAAGAGACTGAAAGAAATAGAGAGAAAATGGAAGACTGCCACATATACATAAATATAATAAATAAGCATTACTGATTAAAGATAAAAAAAAGGTGAAATTCAACATAAAAAATTACTTATTTTAATGAGGTGTCTGCTACAAATATCCACAACAAATTACAAACTACCGCAACAAAACTATAAACAATAGGCACAATACATCATAACAGTGACCTCACCACGTCGGAACAGCCAAAAAGTACTTTTTTAAATGAAGGTGTCTGATACAAATATCCACAACAAATTACAAACTACCGCAACAAAACTATAAACAATAGGCACAATACATCATGAAGAAGGTGTCCCTTCACCAGAACAGTGACCTCACCACGTCGGAACAGCCAAAAAGTACTTTTTTAAATGAGGTGTCTGATAAGTATCCTGTGGTTGTCCATTTCTGAAGCGTGGACTCGCCTAAATCCAGGGCTGTCCATGCATCATAGCTACAAAATGTTCTATGAAGGCAGCTAGACTGCACTACCGGGAGGAGTATTAGACACTGGTGCAGTCTCAACCAATGCACATACAACAGTAAGAGAAACAATACAATAATAGCAAATTGTATTTTACCAAAGGGCAACTATTGCTTGTTTTTTTATTTTTTTTAAATCATTTATCTGCAGTATGTACACATGTTCCTGGGTATAACAATTATTAATTTTTATTTGAAGTTCATTGTCTGTGAAATATGTTCCCAACACTAGAACAATATGTGCTCAAACTATTTAAACAAGACATCTTTTAATTATTTTTATTTGAAGTTCATTGTCTTTGAAATATGTACCCGACATTAGAACAATATGTGGTCAAACTATTTAAACAAGACATCATTTAACTCTGTCTTAACTTTGTTTCAAACTATTTAAATAAGACATCTGTTATGATTTCTTTAGGACAACAAAAGGTGACAGATGAAGATGGTAGTACTACTACTGAGGATGATCTTGAGAATACTGACAAAGAATCTGATCAAGGAGATGATAGTGATATTGATAGTGTTGTGGAGGAAGATGTTCCTTCTGACGATGATTTTGACAAGGAAGCAGACATTGCAAGAAAAGTTCTTAACAACTTGATTACATCCTCTGCCAAAGACGAATCTGTAAATAACGATTCCGTGTCTTCTGAAGAAAAGAACAAGCCAAAATCCAAGGAAACTGTTAAGGGTGCAGATAGTAAAACATCTAAAGAGTCCGACAAGGTTTCAGATATTTCTAAGCCTGAAACTTCCAAGGAAACAGAAGTTGATTTGCACAGAACAGTTTTTATAACCAATCTTCCCTTTGAATTAGATACCGAAGAAGTGAAGCAACGGTTTTCTGCATTTGGTGAAGTAGAATATTTTGCTCCTGTTCTCCACCAAGTGACCAAGTATGTCCTAGAACAATATTTTGTGTGTGTCTGTGTTACACAGATTATTATTCATACTCCTCTATTACTCAATGCAGGCGTCCACGAGGGACTGGTTTTCTTAAGTTTAAAACCGCGGAAGCAGCTGATAATGCAATTTCAACTGCCAATACTGCTTCTGGGATGGGTATTTTGGTAAGGGGTAGACCATTAAAGGTTTTAAAGGCTCTGGACAAGAAATCGGCTCATGACAAGGAACAGGAGAAAGAAAAAAATGAAGTTCAAGACCACCGCAATCTTTACTTGGCGAAGGTTTGTATTCTCCTCTGTACCTCGTGTTCCAGGCTATGGTAGCTGATATGCAATAGGAGAGTAATTGTATTCTTTTAAATTGTAATTAATAGGAGGGACTTATTCTTGACGGAACTCCAGCTGCCGAAGGGGTTTCAGCCACTGATATGTCAAAACGCAAAAAGTGAGTATTTTATGGTTGACTTTTGAGTGCAAATGACATTTATATTCTGTGTATGTATCATTGCTACATCCACTTTACTATTCTCATTTCTTTATTATTTTATGCTGTATTTGATCTTCCATACTTGGGTGGTAAAGTTATTGTTATTTTTCTGCTTTTAGTCTAATTCCTGTAACTGATTGTAGTGATCTTACATTATTATTTGTGAAATATTTATAGTTTGGAAAGGAAAAAGAAGACGAAGCTTCAATCTCCAAATTTTCATGTTTCAAAAACTAGACTTGTTATCTACAACTTACCAAAGTCAATGACTGAAAAACAACTTAAGACGCTTTGCATTGATTCAGTCATCTCTAGAGCTACCAAGCAAATACCTGTAATTCGGCAGGTTGGTTAAATAGGTCATGACTTGAAGTTGTCAATTATTATTATTGTTTCTGTATAGCTTTATGATTTCCATTATGTTTTGAATGTTACAAATGTACTTTGCAGATAAAGATTTTGAAAGATGGCAGGAAAGGAAAGGCTACTCAAGAACAGCAGTATTCCCGTGGAGTCGCTTTTCTTGAATTTTCAGAGCATCAACATGCTCTTGTTGCTTTGAGAGTTCTTAACAATAATCCTG

Protein sequence

>MS.gene52608.t1

MVTQKGSTQHRGFGYVQFAVEKDANQAIELKNGSLVGDRKIVVKHAMPRPPRENRRSKPDQEGNEGDLTQSKNDDKDSGLSGAEKPVSVPKEPKEEEVKVLDKPKNSRKPVEIKKAALCNDTADEGGGSEKQKVARTVIFGGLVNSAMAEDVHRQAREIGTVCSIKHPLSRNDLQQHGLLQEGCTFNASAVLYTSVKSARASVATLHKKEIGGGTVWARQLGGEGAKTQKWKLIVRNLPFKAKENEIRDAFSSAGTVWEVFIPQKSDTGLSKGFAFVKFTCKQDAENAIRKLNGSKFGSRLIAVDWAVPKKIFSSDTNDAPASEEGQQKVTDEDGSTTTEDDLENTDKESDQGDDSDIDSVVEEDVPSDDDFDKEADIARKVLNNLITSSAKDESVNNDSVSSEEKNKPKSKETVKGADSKTSKESDKVSDISKPETSKETEVDLHRTVFITNLPFELDTEEVKQRFSAFGEVEYFAPVLHQVTKRPRGTGFLKFKTAEAADNAISTANTASGMGILVRGRPLKVLKALDKKSAHDKEQEKEKNEVQDHRNLYLAKEGLILDGTPAAEGVSATDMSKRKNLERKKKTKLQSPNFHVSKTRLVIYNLPKSMTEKQLKTLCIDSVISRATKQIPVIRQIKILKDGRKGKATQEQQYSRGVAFLEFSEHQHALVALRVLNNNP