AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780038829.01


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MsG0780038829.01.T01 AT4G23270 29.098 244 115 4 457 642 355 598 2.40e-24 108
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MsG0780038829.01.T01 AT4G11470 26.689 296 139 8 457 687 368 650 3.83e-24 108
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MsG0780038829.01.T01 AT5G10290 31.276 243 106 5 461 643 324 565 1.32e-23 106
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MsG0780038829.01.T01 AT1G61440 29.365 252 119 4 457 649 512 763 2.18e-23 106
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MsG0780038829.01.T01 AT1G11280 28.968 252 120 4 457 649 522 773 3.25e-23 105
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MsG0780038829.01.T01 AT1G11280 28.968 252 120 4 457 649 544 795 3.37e-23 105
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MsG0780038829.01.T01 AT1G61370 27.888 251 122 6 457 649 379 628 3.77e-23 105
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MsG0780038829.01.T01 AT1G61430 28.968 252 120 4 457 649 495 746 4.23e-23 105
MsG0780038829.01.T01 AT4G27290 30.894 246 102 6 457 639 540 780 4.37e-23 105
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MsG0780038829.01.T01 AT5G54590 29.461 241 111 4 458 644 143 378 5.53e-23 102
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MsG0780038829.01.T01 AT4G04490 29.675 246 111 5 457 645 369 609 7.18e-23 104
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MsG0780038829.01.T01 AT4G21400 28.814 295 134 9 436 658 364 654 1.31e-22 103
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MsG0780038829.01.T01 AT4G35600 30.992 242 112 5 457 643 126 367 1.74e-22 101
MsG0780038829.01.T01 AT1G61380 28.800 250 121 3 457 649 517 766 1.91e-22 103
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MsG0780038829.01.T01 AT5G24080 25.333 375 186 6 404 685 349 722 2.39e-22 102
MsG0780038829.01.T01 AT1G61380 28.800 250 121 3 457 649 370 619 2.45e-22 102
MsG0780038829.01.T01 AT2G02800 30.204 245 113 7 457 644 122 365 2.51e-22 100
MsG0780038829.01.T01 AT2G02800 30.204 245 113 7 457 644 122 365 2.51e-22 100
MsG0780038829.01.T01 AT4G23290 26.316 304 130 6 429 642 293 592 2.74e-22 102
MsG0780038829.01.T01 AT4G23290 26.316 304 130 6 429 642 336 635 2.94e-22 102
MsG0780038829.01.T01 AT5G24080 25.333 375 186 6 404 685 476 849 3.06e-22 102
MsG0780038829.01.T01 AT1G11410 30.315 254 114 6 457 649 559 810 3.07e-22 102
MsG0780038829.01.T01 AT5G45780 27.245 323 147 9 408 643 209 530 3.13e-22 101
MsG0780038829.01.T01 AT1G11410 30.315 254 114 6 457 649 528 779 3.17e-22 102
MsG0780038829.01.T01 AT1G11410 30.315 254 114 6 457 649 552 803 3.18e-22 102
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MsG0780038829.01.T01 AT1G68690 28.782 271 114 7 464 669 413 669 1.58e-19 94.0
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MsG0780038829.01.T01 AT1G61360 23.743 358 173 7 392 649 340 697 6.66e-19 92.0
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MsG0780038829.01.T01 AT2G35620 27.758 281 104 9 444 651 329 583 7.83e-19 91.3
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MsG0780038829.01.T01 AT2G42960 28.033 239 115 2 464 645 219 457 1.44e-17 86.7
MsG0780038829.01.T01 AT3G24240 29.918 244 106 8 461 644 827 1065 1.46e-17 88.2
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MsG0780038829.01.T01 AT4G28650 29.796 245 100 9 468 647 744 981 1.76e-17 87.8
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MsG0780038829.01.T01 AT5G47070 29.268 246 116 6 457 644 122 367 2.84e-17 85.1
MsG0780038829.01.T01 AT2G28960 27.869 244 117 5 458 644 471 712 3.05e-17 86.7
MsG0780038829.01.T01 AT1G29740 37.600 125 77 1 519 642 823 947 3.66e-17 86.7
MsG0780038829.01.T01 AT4G20450 27.459 244 118 4 458 644 621 862 4.27e-17 86.3
MsG0780038829.01.T01 AT1G29740 37.600 125 77 1 519 642 823 947 4.33e-17 86.3
MsG0780038829.01.T01 AT1G07550 28.631 241 114 4 458 642 589 827 5.77e-17 85.9
MsG0780038829.01.T01 AT4G01330 27.615 239 116 4 464 645 198 436 6.25e-17 84.7
MsG0780038829.01.T01 AT1G09970 28.455 246 112 10 463 647 715 957 6.28e-17 85.9
MsG0780038829.01.T01 AT3G56370 29.091 275 135 9 442 659 693 964 6.28e-17 85.9
MsG0780038829.01.T01 AT3G28040 27.126 247 118 6 464 649 764 1009 6.47e-17 85.9
MsG0780038829.01.T01 AT4G01330 27.615 239 116 4 464 645 198 436 6.56e-17 84.7
MsG0780038829.01.T01 AT1G70520 26.744 258 124 6 457 649 354 611 7.16e-17 85.1
MsG0780038829.01.T01 AT5G63940 28.033 239 108 7 466 643 399 634 7.61e-17 85.1
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MsG0780038829.01.T01 AT2G28250 40.945 127 70 2 525 647 372 497 1.64e-16 84.0
MsG0780038829.01.T01 AT2G28250 40.945 127 70 2 525 647 372 497 1.64e-16 84.0
MsG0780038829.01.T01 AT2G28250 40.945 127 70 2 525 647 372 497 1.64e-16 84.0
MsG0780038829.01.T01 AT2G28250 40.945 127 70 2 525 647 372 497 1.64e-16 84.0
MsG0780038829.01.T01 AT2G28250 40.945 127 70 2 525 647 372 497 1.64e-16 84.0
MsG0780038829.01.T01 AT2G28250 40.945 127 70 2 525 647 372 497 1.64e-16 84.0
MsG0780038829.01.T01 AT1G74360 25.692 253 111 8 457 642 843 1085 1.70e-16 84.7
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MsG0780038829.01.T01 AT1G12460 27.642 246 111 6 464 643 491 735 2.37e-16 83.6
MsG0780038829.01.T01 AT1G72180 28.692 237 108 5 470 647 729 963 2.66e-16 84.0
MsG0780038829.01.T01 AT3G46400 26.639 244 120 4 458 644 606 847 2.67e-16 83.6
MsG0780038829.01.T01 AT1G24030 28.452 239 111 5 465 643 11 249 5.41e-16 79.3
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MsG0780038829.01.T01 AT4G34500 26.829 246 111 7 464 645 181 421 6.75e-16 81.3
MsG0780038829.01.T01 AT4G36180 28.745 247 111 7 469 653 882 1125 6.87e-16 82.4
MsG0780038829.01.T01 AT4G11460 28.571 196 125 4 456 642 432 621 7.25e-16 82.0
MsG0780038829.01.T01 AT4G28670 28.902 173 116 2 484 649 441 613 8.09e-16 81.6
MsG0780038829.01.T01 AT3G46340 39.130 115 68 1 530 644 745 857 8.28e-16 82.0
MsG0780038829.01.T01 AT1G24030 28.452 239 111 5 465 643 48 286 8.52e-16 79.3
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MsG0780038829.01.T01 AT1G52540 33.333 156 96 3 487 642 160 307 1.22e-15 79.3
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MsG0780038829.01.T01 AT3G08680 29.675 246 112 8 461 647 373 616 2.59e-15 80.1
MsG0780038829.01.T01 AT4G21230 25.911 247 125 5 457 646 362 607 2.69e-15 80.1
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MsG0780038829.01.T01 AT1G16260 25.316 237 121 3 464 644 426 662 7.86e-15 79.0
MsG0780038829.01.T01 AT4G11480 29.885 174 101 5 529 694 487 647 1.00e-14 78.6
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MsG0780038829.01.T01 AT2G30740 26.275 255 124 5 452 643 97 350 3.45e-14 75.1
MsG0780038829.01.T01 AT2G30740 26.275 255 124 5 452 643 97 350 3.45e-14 75.1
MsG0780038829.01.T01 AT2G30740 26.275 255 124 5 452 643 97 350 3.45e-14 75.1
MsG0780038829.01.T01 AT2G30740 26.275 255 124 5 452 643 97 350 3.45e-14 75.1
MsG0780038829.01.T01 AT2G30740 26.275 255 124 5 452 643 97 350 3.45e-14 75.1
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MsG0780038829.01.T01 AT2G30740 26.275 255 124 5 452 643 97 350 3.45e-14 75.1

Find 141 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 292 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TCTTCTTCTGGTTTAACTTT+TGG 0.129120 7:-53702437 MsG0780038829.01.T01:CDS
CTTTGATAGTCAAGAAATTT+TGG 0.129238 7:+53706167 None:intergenic
TGACTATCAAAGTACAATTT+TGG 0.150803 7:-53706156 MsG0780038829.01.T01:CDS
TGAGGCAAAAGATGTAAATT+TGG 0.184189 7:-53702612 MsG0780038829.01.T01:CDS
GGAAAATGAAAGTGTAATTT+TGG 0.192215 7:-53702675 MsG0780038829.01.T01:CDS
TTAGCTTCTCATTATGTTCT+TGG 0.198859 7:-53703577 MsG0780038829.01.T01:CDS
TTTGTCTTATCCTTCTTCTA+TGG 0.204044 7:-53702387 MsG0780038829.01.T01:CDS
TTGATATTCATGATAACTTT+AGG 0.208384 7:-53703427 MsG0780038829.01.T01:CDS
ACTCTGCCACAAAGGGTTTC+AGG 0.211297 7:-53703309 MsG0780038829.01.T01:intron
TTATTAAAACCAACACTAAT+TGG 0.214790 7:+53703697 None:intergenic
CTCCAATTCAACCTCACTTT+TGG 0.218975 7:+53703022 None:intergenic
TCGCTTAGTTTATCTTCTTC+TGG 0.274788 7:-53702449 MsG0780038829.01.T01:CDS
GAGACAAGTTGTGCAGTATT+TGG 0.276145 7:-53702501 MsG0780038829.01.T01:CDS
CCAATATAGTGTGGGTGATA+TGG 0.276880 7:-53706021 MsG0780038829.01.T01:CDS
GAGGCAAAAGATGTAAATTT+GGG 0.281459 7:-53702611 MsG0780038829.01.T01:CDS
CCATCCACTTTGACAACCTT+TGG 0.295225 7:+53706342 None:intergenic
GAAAATTGTAGAAAGATCTT+TGG 0.308878 7:+53703645 None:intergenic
TCATCACATTTATATCTTGA+TGG 0.314259 7:-53704231 MsG0780038829.01.T01:CDS
TGATATTCATGATAACTTTA+GGG 0.316369 7:-53703426 MsG0780038829.01.T01:CDS
ACTCATTTGACTGGAACTAT+TGG 0.327799 7:-53702815 MsG0780038829.01.T01:CDS
TTGAGGTTGTTTGTGGTAGA+AGG 0.329886 7:-53702715 MsG0780038829.01.T01:CDS
TGAGTCCCTTCAACTCTGTT+GGG 0.333183 7:+53706068 None:intergenic
GTTTCACTCTACAGTATGTT+AGG 0.336819 7:+53706364 None:intergenic
TTGTATTTGCCATAAAATCT+AGG 0.345759 7:-53704071 MsG0780038829.01.T01:CDS
AGGAATCTTGTTCATCTTCA+TGG 0.365655 7:-53703127 MsG0780038829.01.T01:CDS
GTTGGATTCTCATCTTCAAC+AGG 0.373241 7:-53703607 MsG0780038829.01.T01:CDS
TTGTCTTATCCTTCTTCTAT+GGG 0.380166 7:-53702386 MsG0780038829.01.T01:CDS
TTGATGAAGTTCTTGAAGAC+TGG 0.387245 7:-53703375 MsG0780038829.01.T01:CDS
CATTAAGCTCAGAGATTTCA+AGG 0.387452 7:+53703521 None:intergenic
TATTGACTTGGTAGTGAATC+TGG 0.391307 7:+53703991 None:intergenic
GAAGACTGGGAACATGAATA+TGG 0.392253 7:-53703361 MsG0780038829.01.T01:CDS
TATGGCTCTTTCTGTATCAT+TGG 0.393713 7:+53704170 None:intergenic
CCATATCACCCACACTATAT+TGG 0.396104 7:+53706021 None:intergenic
CTCATACTTGGTCTAGCCAT+TGG 0.396633 7:+53702521 None:intergenic
ACAAATCGTGTCTTGTATCT+TGG 0.403685 7:-53706101 MsG0780038829.01.T01:CDS
TTTGTTGTTTCATCTACAAA+AGG 0.413567 7:-53704018 MsG0780038829.01.T01:CDS
TTGTTAGCATTGGTCGCCTT+CGG 0.423971 7:-53703153 MsG0780038829.01.T01:CDS
CTTCTCATTATGTTCTTGGT+TGG 0.426810 7:-53703573 MsG0780038829.01.T01:CDS
GTTGATACTGTTTCCAAGGT+TGG 0.427136 7:+53703948 None:intergenic
ATGAGTCCCTTCAACTCTGT+TGG 0.437108 7:+53706067 None:intergenic
CTCTTTAACAGTTCCAACCT+TGG 0.439351 7:-53703961 MsG0780038829.01.T01:CDS
CAATATAGTGTGGGTGATAT+GGG 0.443088 7:-53706020 MsG0780038829.01.T01:intron
GAAGGACTATTGATAATGTA+GGG 0.444359 7:-53702697 MsG0780038829.01.T01:CDS
GAAAGAAGAAACACTTCCAT+TGG 0.457179 7:+53704104 None:intergenic
AGAAGGACTATTGATAATGT+AGG 0.460839 7:-53702698 MsG0780038829.01.T01:CDS
GCTCCTGAGCATATTAGAAC+AGG 0.464981 7:-53702785 MsG0780038829.01.T01:CDS
AGGAGAAATTAGTGAGGGCC+TGG 0.467110 7:-53706124 MsG0780038829.01.T01:CDS
GAGTCCCTTCAACTCTGTTG+GGG 0.470661 7:+53706069 None:intergenic
GTGGAGTTGGTGTTGAAACT+TGG 0.474147 7:-53702566 MsG0780038829.01.T01:CDS
ACTTTAGCTCCAATTAGTGT+TGG 0.474230 7:-53703706 MsG0780038829.01.T01:CDS
CCAAAGGTTGTCAAAGTGGA+TGG 0.474958 7:-53706342 MsG0780038829.01.T01:CDS
CATGGTTGATACTGTTTCCA+AGG 0.482136 7:+53703944 None:intergenic
AGGCCATGGCCACATGTAGC+TGG 0.482390 7:+53704045 None:intergenic
CAAATCGTGTCTTGTATCTT+GGG 0.482536 7:-53706100 MsG0780038829.01.T01:CDS
CAAGATATAAATGTGATGAA+TGG 0.483645 7:+53704235 None:intergenic
AACAGTATCAACCATGTGTT+TGG 0.483873 7:-53703937 MsG0780038829.01.T01:CDS
TTGATTGTGTGTTTGAGTGT+TGG 0.484636 7:-53702652 MsG0780038829.01.T01:CDS
GTGGATATCCCATGCAGGTA+TGG 0.495464 7:-53703765 MsG0780038829.01.T01:CDS
TAGTTGTCTAAACTTGCATT+CGG 0.497738 7:+53703058 None:intergenic
TTCAACAATAGAATGTATGT+TGG 0.499557 7:-53703625 MsG0780038829.01.T01:CDS
CCTCACACAACTCATTTGAC+TGG 0.503785 7:-53702824 MsG0780038829.01.T01:CDS
ATTGCTGAGGTAAACTCAAA+TGG 0.504535 7:-53704207 MsG0780038829.01.T01:CDS
TTTCTTCTTGAGGTTGTTTG+TGG 0.504753 7:-53702722 MsG0780038829.01.T01:CDS
TGATGAAGTTCTTGAAGACT+GGG 0.507083 7:-53703374 MsG0780038829.01.T01:CDS
ATGTCAGTCACAACCACCTT+AGG 0.507439 7:+53706483 None:intergenic
TCTTTGAACTTAAATCTATG+TGG 0.507830 7:+53703337 None:intergenic
CATGGGATATCCACTGGAAA+GGG 0.508248 7:+53703774 None:intergenic
TGCACAACTTGTCTCATACT+TGG 0.511116 7:+53702509 None:intergenic
TTGTTGTTTCATCTACAAAA+GGG 0.513623 7:-53704017 MsG0780038829.01.T01:CDS
GCATTGGTCGCCTTCGGCAC+AGG 0.516651 7:-53703147 MsG0780038829.01.T01:CDS
TCAGCTAATTCAACTCCTGC+AGG 0.521793 7:-53703832 MsG0780038829.01.T01:CDS
ATGAATCAAGACAAGGGATG+AGG 0.524735 7:-53703192 MsG0780038829.01.T01:CDS
GTGTTTGAGTGTTGGAAAAG+AGG 0.525255 7:-53702644 MsG0780038829.01.T01:CDS
GTGTCGGAAATTGTTAGCAT+TGG 0.528716 7:-53703163 MsG0780038829.01.T01:CDS
TACCAAAATCTAACGACCAC+CGG 0.532419 7:+53702316 None:intergenic
GATCTATACTCTGCCACAAA+GGG 0.541529 7:-53703316 MsG0780038829.01.T01:CDS
GTAAAATAGTGATATGCCTA+AGG 0.541861 7:-53706499 None:intergenic
ATTGCTGATTCACTTCTCTC+CGG 0.542269 7:-53702335 MsG0780038829.01.T01:CDS
TTACCTGTTCTAATATGCTC+AGG 0.543461 7:+53702782 None:intergenic
TGGATAGAAAGCATATCCTA+TGG 0.549812 7:+53704152 None:intergenic
TACCTGCATGGGATATCCAC+TGG 0.551268 7:+53703768 None:intergenic
GATATTCATGATAACTTTAG+GGG 0.551924 7:-53703425 MsG0780038829.01.T01:CDS
GCATGGGATATCCACTGGAA+AGG 0.554861 7:+53703773 None:intergenic
GTGTTCACATTCAGAACCAA+TGG 0.556229 7:-53702537 MsG0780038829.01.T01:CDS
CTTTGAACTTAAATCTATGT+GGG 0.556398 7:+53703338 None:intergenic
TGAGCATATTAGAACAGGTA+AGG 0.556967 7:-53702780 MsG0780038829.01.T01:CDS
TAGTCAATCCATACCTGCAT+GGG 0.557788 7:+53703757 None:intergenic
GAAACCAAAGGTTGTCAAAG+TGG 0.560986 7:-53706346 MsG0780038829.01.T01:CDS
ATTGTGTTGCCCATAGAAGA+AGG 0.563776 7:+53702377 None:intergenic
AATGATAACAAAGGTCGTGT+TGG 0.569419 7:+53703670 None:intergenic
AAACTATGTGTCTGAAGAGG+TGG 0.572120 7:-53702585 MsG0780038829.01.T01:CDS
TAATCATCATAATATCCTGC+AGG 0.574246 7:+53703817 None:intergenic
CAGGTATGGATTGACTATGA+TGG 0.575423 7:-53703751 MsG0780038829.01.T01:CDS
CTTTCAAGGTTGCATGACCA+TGG 0.580475 7:-53702854 MsG0780038829.01.T01:intron
TGAATCAAGACAAGGGATGA+GGG 0.580752 7:-53703191 MsG0780038829.01.T01:CDS
AACAGAGTTGAAGGGACTCA+TGG 0.582129 7:-53706065 MsG0780038829.01.T01:CDS
AGTTTCATCTATAAATACAA+TGG 0.582877 7:-53704261 MsG0780038829.01.T01:CDS
GAACAAGATTCCTGTGCCGA+AGG 0.583650 7:+53703137 None:intergenic
AGATCTATACTCTGCCACAA+AGG 0.583665 7:-53703317 MsG0780038829.01.T01:CDS
ATCAAACTTAGCAAAATCAA+AGG 0.584447 7:+53703445 None:intergenic
GAAAAGAGGTGATATTCTTG+AGG 0.585554 7:-53702630 MsG0780038829.01.T01:CDS
CAAAGGTTGTCAAAGTGGAT+GGG 0.590480 7:-53706341 MsG0780038829.01.T01:CDS
AGTCCCTTCAACTCTGTTGG+GGG 0.591218 7:+53706070 None:intergenic
ATATCTTGATGGTATTGCTG+AGG 0.591995 7:-53704220 MsG0780038829.01.T01:CDS
AATGATACAGAAAGAGCCAT+AGG 0.593097 7:-53704168 MsG0780038829.01.T01:CDS
ATACAAGACACGATTTGTCC+AGG 0.595635 7:+53706106 None:intergenic
GCTGATTCACTTCTCTCCGG+TGG 0.596193 7:-53702332 MsG0780038829.01.T01:CDS
TATCCAGCTACATGTGGCCA+TGG 0.597567 7:-53704048 MsG0780038829.01.T01:CDS
TTCCAGTGGATATCCCATGC+AGG 0.598596 7:-53703770 MsG0780038829.01.T01:CDS
AAGAATTTATCCCTTTCCAG+TGG 0.599703 7:-53703784 MsG0780038829.01.T01:CDS
TGTGTCTGAAGAGGTGGAGT+TGG 0.601168 7:-53702579 MsG0780038829.01.T01:CDS
CATTGATATCAATACCAACA+TGG 0.602199 7:+53703863 None:intergenic
AGTTGTGCAGTATTTGGAGA+GGG 0.603109 7:-53702495 MsG0780038829.01.T01:CDS
ATAGTCAATCCATACCTGCA+TGG 0.607384 7:+53703756 None:intergenic
AAGAGACCAAGGTATTGACT+TGG 0.610815 7:+53703979 None:intergenic
GATATCAATGATAACCATGT+TGG 0.618451 7:-53703877 MsG0780038829.01.T01:CDS
AGGGATGAGGGAATTTGTGT+CGG 0.622460 7:-53703179 MsG0780038829.01.T01:CDS
TTGGATTCTCATCTTCAACA+GGG 0.629604 7:-53703606 MsG0780038829.01.T01:CDS
TGTTAAGGAGAAATTAGTGA+GGG 0.629809 7:-53706129 MsG0780038829.01.T01:CDS
ATAGAAGAAGGATAAGACAA+AGG 0.637588 7:+53702389 None:intergenic
AAATAGTGATATGCCTAAGG+TGG 0.638495 7:-53706496 None:intergenic
TATATAACCAACCAAAAGTG+AGG 0.639115 7:-53703033 MsG0780038829.01.T01:intron
TCACTACCAAGTCAATACCT+TGG 0.640213 7:-53703985 MsG0780038829.01.T01:CDS
GGATACAACTTTGATGAAAG+CGG 0.641513 7:-53706460 MsG0780038829.01.T01:CDS
TATTTGAGCCAATATAGTGT+GGG 0.641691 7:-53706029 MsG0780038829.01.T01:CDS
ATATTTGAGCCAATATAGTG+TGG 0.641752 7:-53706030 MsG0780038829.01.T01:CDS
AAGTTGTGCAGTATTTGGAG+AGG 0.643228 7:-53702496 MsG0780038829.01.T01:CDS
CAAGCTCAACACCAAACACA+TGG 0.645026 7:+53703926 None:intergenic
TGGAACTGTTAAAGAGACCA+AGG 0.651666 7:+53703968 None:intergenic
AAGGACTATTGATAATGTAG+GGG 0.659157 7:-53702696 MsG0780038829.01.T01:CDS
AGGCAAAAGATGTAAATTTG+GGG 0.659527 7:-53702610 MsG0780038829.01.T01:CDS
GTGTCACATGAATCAAGACA+AGG 0.666242 7:-53703199 MsG0780038829.01.T01:CDS
CCAGTCAAATGAGTTGTGTG+AGG 0.668532 7:+53702824 None:intergenic
TAAGGTGGTTGTGACTGACA+TGG 0.684781 7:-53706481 MsG0780038829.01.T01:CDS
TCTAGGTATCCAGCTACATG+TGG 0.687559 7:-53704054 MsG0780038829.01.T01:CDS
TTGTTAAGGAGAAATTAGTG+AGG 0.689483 7:-53706130 MsG0780038829.01.T01:CDS
TGTCACATGAATCAAGACAA+GGG 0.694665 7:-53703198 MsG0780038829.01.T01:CDS
GACAAACTATGTGTCTGAAG+AGG 0.700891 7:-53702588 MsG0780038829.01.T01:CDS
TCTTTGGTCAATGATAACAA+AGG 0.734400 7:+53703661 None:intergenic
TTGTGTGAGGATCAGCACCA+TGG 0.763074 7:+53702837 None:intergenic
ATACTGTAGAGTGAAACCAA+AGG 0.774249 7:-53706358 MsG0780038829.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! CTTAAATAATGATTAAAAAA+GGG + Chr7:53704028-53704047 None:intergenic 10.0%
!!! ATTTTTTTTTTTTTTGGTTA+AGG + Chr7:53703687-53703706 None:intergenic 10.0%
!!! TAAAAATTTTGACTTTTTTT+TGG + Chr7:53705334-53705353 None:intergenic 10.0%
!!! TTTTTTTTTTTTTTGGTTAA+GGG + Chr7:53703686-53703705 None:intergenic 10.0%
!! GCTTAAATAATGATTAAAAA+AGG + Chr7:53704029-53704048 None:intergenic 15.0%
!! TTTCATAAAAGATATAAGAT+TGG + Chr7:53703534-53703553 None:intergenic 15.0%
!!! AAATTTCATATTTTTCTTCA+TGG + Chr7:53703863-53703882 None:intergenic 15.0%
!!! CTGAAAATTTTATAATATCA+AGG - Chr7:53702997-53703016 MsG0780038829.01.T01:intron 15.0%
!!! GATATTATAAAATTTTCAGT+AGG + Chr7:53702996-53703015 None:intergenic 15.0%
!!! TGTTTTTGAGATATATTTTT+AGG + Chr7:53703721-53703740 None:intergenic 15.0%
!! AAAACGAACATATTTATCTT+TGG - Chr7:53703889-53703908 MsG0780038829.01.T01:CDS 20.0%
!! AAAATCATCTCAAATTACTA+TGG - Chr7:53703243-53703262 MsG0780038829.01.T01:intron 20.0%
!! AATGAAATGATGAATGAATA+CGG + Chr7:53704141-53704160 None:intergenic 20.0%
!! AGTTTCATCTATAAATACAA+TGG - Chr7:53704550-53704569 MsG0780038829.01.T01:intron 20.0%
!! TGATATTCATGATAACTTTA+GGG - Chr7:53705385-53705404 MsG0780038829.01.T01:intron 20.0%
!! TTATTAAAACCAACACTAAT+TGG + Chr7:53705117-53705136 None:intergenic 20.0%
!! TTATTAAAAGAAACATCACA+TGG + Chr7:53704314-53704333 None:intergenic 20.0%
!! TTGATATTCATGATAACTTT+AGG - Chr7:53705384-53705403 MsG0780038829.01.T01:intron 20.0%
!!! AAACTTTGTTATTTTCATGT+TGG - Chr7:53702403-53702422 MsG0780038829.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAGTCAAAATTTTTAACTGT+TGG - Chr7:53705339-53705358 MsG0780038829.01.T01:intron 20.0%
!!! AGTCAAAATTTTTAACTGTT+GGG - Chr7:53705340-53705359 MsG0780038829.01.T01:intron 20.0%
!!! TACAATTTTGGATATTGTTA+AGG - Chr7:53702667-53702686 MsG0780038829.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAGTTCATAGTATTTCTAAA+TGG + Chr7:53703183-53703202 None:intergenic 20.0%
!!! TTGACTTGTAATTTTTTCTT+AGG - Chr7:53704387-53704406 MsG0780038829.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTGAGATATATTTTTAGGT+TGG + Chr7:53703717-53703736 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTTGAAAACTATTGGATT+TGG + Chr7:53704682-53704701 None:intergenic 20.0%
! ACTATGAACTATCAGTTAAT+AGG - Chr7:53703192-53703211 MsG0780038829.01.T01:CDS 25.0%
! AGATAATGAGATCTCATTAT+AGG + Chr7:53703636-53703655 None:intergenic 25.0%
! ATAGAATAGTCATACTTCTA+TGG - Chr7:53702928-53702947 MsG0780038829.01.T01:intron 25.0%
! ATCAAACTTAGCAAAATCAA+AGG + Chr7:53705369-53705388 None:intergenic 25.0%
! ATGAAATGATGAATGAATAC+GGG + Chr7:53704140-53704159 None:intergenic 25.0%
! CAAGATATAAATGTGATGAA+TGG + Chr7:53704579-53704598 None:intergenic 25.0%
! CTTTGAACTTAAATCTATGT+GGG + Chr7:53705476-53705495 None:intergenic 25.0%
! GAAAATTGTAGAAAGATCTT+TGG + Chr7:53705169-53705188 None:intergenic 25.0%
! GATATTCATGATAACTTTAG+GGG - Chr7:53705386-53705405 MsG0780038829.01.T01:intron 25.0%
! TAGATGAAACAACAAAAACA+AGG + Chr7:53704789-53704808 None:intergenic 25.0%
! TATCTCTTCATTGCAAAAAA+TGG - Chr7:53703287-53703306 MsG0780038829.01.T01:intron 25.0%
! TCATCACATTTATATCTTGA+TGG - Chr7:53704580-53704599 MsG0780038829.01.T01:intron 25.0%
! TCTTTGAACTTAAATCTATG+TGG + Chr7:53705477-53705496 None:intergenic 25.0%
! TTAATACTGTTACCAAAAGA+TGG + Chr7:53702870-53702889 None:intergenic 25.0%
! TTCAACAATAGAATGTATGT+TGG - Chr7:53705186-53705205 MsG0780038829.01.T01:intron 25.0%
! TTGTATTTGCCATAAAATCT+AGG - Chr7:53704740-53704759 MsG0780038829.01.T01:intron 25.0%
!! ACATATTTATCTTTGGTCTT+TGG - Chr7:53703896-53703915 MsG0780038829.01.T01:CDS 25.0%
!! ACTATATTTGACTTCTTAAC+CGG - Chr7:53704065-53704084 MsG0780038829.01.T01:CDS 25.0%
!! CAAAGATTTAGAATCATCAA+AGG - Chr7:53705813-53705832 MsG0780038829.01.T01:intron 25.0%
!! CTTTGATGATTCTAAATCTT+TGG + Chr7:53705815-53705834 None:intergenic 25.0%
!! TGACTATCAAAGTACAATTT+TGG - Chr7:53702655-53702674 MsG0780038829.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTCATATTTTTCTTCATGG+AGG + Chr7:53703860-53703879 None:intergenic 25.0%
!! TTTTCTGATGTGTTTTCTTT+TGG - Chr7:53706062-53706081 MsG0780038829.01.T01:CDS 25.0%
!!! AATGCTAGATTTTGAGATTT+TGG - Chr7:53705933-53705952 MsG0780038829.01.T01:intron 25.0%
!!! CTTTGATAGTCAAGAAATTT+TGG + Chr7:53702647-53702666 None:intergenic 25.0%
!!! GAAGTGTTTTTGAAAACTAT+TGG + Chr7:53704688-53704707 None:intergenic 25.0%
!!! GGAAAATGAAAGTGTAATTT+TGG - Chr7:53706136-53706155 MsG0780038829.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTGTTGTTTCATCTACAAAA+GGG - Chr7:53704794-53704813 MsG0780038829.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTGTTGTTTCATCTACAAA+AGG - Chr7:53704793-53704812 MsG0780038829.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTTTTTTTGGTTAAGGGT+TGG + Chr7:53703682-53703701 None:intergenic 25.0%
AAACTAAGCGAAGAAAAATC+TGG + Chr7:53706353-53706372 None:intergenic 30.0%
AAGAAGAAGGAGGATAAAAA+GGG + Chr7:53703451-53703470 None:intergenic 30.0%
AATTTGCCATTGTTAAACCA+TGG - Chr7:53703562-53703581 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
AGAAAGATTGCTCAACAAAT+GGG - Chr7:53703781-53703800 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
AGGCAAAAGATGTAAATTTG+GGG - Chr7:53706201-53706220 MsG0780038829.01.T01:intron 30.0%
ATAACTTTCTTGATCTTCAC+AGG - Chr7:53703375-53703394 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
ATAGAAGAAGGATAAGACAA+AGG + Chr7:53706425-53706444 None:intergenic 30.0%
ATATTTGAGCCAATATAGTG+TGG - Chr7:53702781-53702800 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
CATTGATATCAATACCAACA+TGG + Chr7:53704951-53704970 None:intergenic 30.0%
GAAAGTCCTCAAAAAATTCT+TGG + Chr7:53706403-53706422 None:intergenic 30.0%
GAGGCAAAAGATGTAAATTT+GGG - Chr7:53706200-53706219 MsG0780038829.01.T01:intron 30.0%
GATATCAATGATAACCATGT+TGG - Chr7:53704934-53704953 MsG0780038829.01.T01:intron 30.0%
TAATCATCATAATATCCTGC+AGG + Chr7:53704997-53705016 None:intergenic 30.0%
TAGAAAGATTGCTCAACAAA+TGG - Chr7:53703780-53703799 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
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TATAGTTTATGTGCACATAC+TGG + Chr7:53703133-53703152 None:intergenic 30.0%
TATATAACCAACCAAAAGTG+AGG - Chr7:53705778-53705797 MsG0780038829.01.T01:intron 30.0%
TATCTCTATATTGTGCCAAA+CGG - Chr7:53703154-53703173 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
TATTTGAGCCAATATAGTGT+GGG - Chr7:53702782-53702801 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
TCTTTGGTCAATGATAACAA+AGG + Chr7:53705153-53705172 None:intergenic 30.0%
TGAAATGATGAATGAATACG+GGG + Chr7:53704139-53704158 None:intergenic 30.0%
TGAGGCAAAAGATGTAAATT+TGG - Chr7:53706199-53706218 MsG0780038829.01.T01:intron 30.0%
TGTTAAGGAGAAATTAGTGA+GGG - Chr7:53702682-53702701 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
TTAGCTTCTCATTATGTTCT+TGG - Chr7:53705234-53705253 MsG0780038829.01.T01:intron 30.0%
TTAGGAAACTTAAAGCATGA+GGG + Chr7:53703749-53703768 None:intergenic 30.0%
TTGTCTTATCCTTCTTCTAT+GGG - Chr7:53706425-53706444 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
TTGTTAAGGAGAAATTAGTG+AGG - Chr7:53702681-53702700 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
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! AGGAAATTTTAAGCCAAAAG+AGG - Chr7:53703958-53703977 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
! GAAAGAGAAGATTTTCAACA+AGG - Chr7:53702492-53702511 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
! GCATTAAATACTTCCTCTTT+TGG + Chr7:53703974-53703993 None:intergenic 30.0%
! GTTTTCAAAAACACTTCCAA+TGG - Chr7:53704691-53704710 MsG0780038829.01.T01:intron 30.0%
! TAACGAGATAATCCATCTTT+TGG - Chr7:53702855-53702874 MsG0780038829.01.T01:intron 30.0%
! TTTAAGTTTCCTAACTCCAT+TGG - Chr7:53703755-53703774 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
!! AAAGTTTTGCACTAGTTTCA+GGG + Chr7:53702390-53702409 None:intergenic 30.0%
!! AAGGACTATTGATAATGTAG+GGG - Chr7:53706115-53706134 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
!! ACGAAAAAACGAGTTACTTT+TGG - Chr7:53705716-53705735 MsG0780038829.01.T01:intron 30.0%
!! AGAAGGACTATTGATAATGT+AGG - Chr7:53706113-53706132 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
!! GAAGGACTATTGATAATGTA+GGG - Chr7:53706114-53706133 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTGAGATTTTGGTCTTTCA+AGG - Chr7:53705943-53705962 MsG0780038829.01.T01:intron 30.0%
!!! CTTCTTCTGGTTTAACTTTT+GGG - Chr7:53706375-53706394 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
!!! TCTTCTTCTGGTTTAACTTT+TGG - Chr7:53706374-53706393 MsG0780038829.01.T01:CDS 30.0%
AAAAGGGTTATTGAGGCAAA+AGG + Chr7:53703435-53703454 None:intergenic 35.0%
AAACAACAAAAACAAGGCCA+TGG + Chr7:53704783-53704802 None:intergenic 35.0%
AAAGGGTTATTGAGGCAAAA+GGG + Chr7:53703434-53703453 None:intergenic 35.0%
AACAGTATCAACCATGTGTT+TGG - Chr7:53704874-53704893 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
AACCAAAAGTGAGGTTGAAT+TGG - Chr7:53705787-53705806 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
AACGGTTCATGTTAAGAATG+TGG + Chr7:53703037-53703056 None:intergenic 35.0%
AAGAATTTATCCCTTTCCAG+TGG - Chr7:53705027-53705046 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
AAGGTGGAGAAAGATGAATA+GGG + Chr7:53703487-53703506 None:intergenic 35.0%
AATGATAACAAAGGTCGTGT+TGG + Chr7:53705144-53705163 None:intergenic 35.0%
AATGATACAGAAAGAGCCAT+AGG - Chr7:53704643-53704662 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
ACAAATCGTGTCTTGTATCT+TGG - Chr7:53702710-53702729 MsG0780038829.01.T01:CDS 35.0%
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ACTCATTTGACTGGAACTAT+TGG - Chr7:53705996-53706015 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
AGAACATGTGTGACTAACAA+CGG + Chr7:53703055-53703074 None:intergenic 35.0%
AGGAATCTTGTTCATCTTCA+TGG - Chr7:53705684-53705703 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
ATACTGTAGAGTGAAACCAA+AGG - Chr7:53702453-53702472 MsG0780038829.01.T01:CDS 35.0%
ATTCCAGGACATTTCTTAGT+AGG - Chr7:53704355-53704374 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
ATTGCTGAGGTAAACTCAAA+TGG - Chr7:53704604-53704623 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
ATTTCTAAATGGATGCCGTT+TGG + Chr7:53703172-53703191 None:intergenic 35.0%
ATTTGGCCATGGTTTAACAA+TGG + Chr7:53703571-53703590 None:intergenic 35.0%
CAAATCGTGTCTTGTATCTT+GGG - Chr7:53702711-53702730 MsG0780038829.01.T01:CDS 35.0%
CAATATAGTGTGGGTGATAT+GGG - Chr7:53702791-53702810 MsG0780038829.01.T01:CDS 35.0%
CATTAAGCTCAGAGATTTCA+AGG + Chr7:53705293-53705312 None:intergenic 35.0%
CTTCTCATTATGTTCTTGGT+TGG - Chr7:53705238-53705257 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
GAAAAGAGGTGATATTCTTG+AGG - Chr7:53706181-53706200 MsG0780038829.01.T01:CDS 35.0%
GAAAGAAGAAACACTTCCAT+TGG + Chr7:53704710-53704729 None:intergenic 35.0%
GAAGAAGAAGGAGGATAAAA+AGG + Chr7:53703452-53703471 None:intergenic 35.0%
GAGGATAAAAAGGGTTATTG+AGG + Chr7:53703442-53703461 None:intergenic 35.0%
GGATACAACTTTGATGAAAG+CGG - Chr7:53702351-53702370 MsG0780038829.01.T01:CDS 35.0%
GGTTTATCTACATGAAGGAT+GGG - Chr7:53705851-53705870 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
GTTAGGAAACTTAAAGCATG+AGG + Chr7:53703750-53703769 None:intergenic 35.0%
GTTTCACTCTACAGTATGTT+AGG + Chr7:53702450-53702469 None:intergenic 35.0%
TATGGCTCTTTCTGTATCAT+TGG + Chr7:53704644-53704663 None:intergenic 35.0%
TCGCTTAGTTTATCTTCTTC+TGG - Chr7:53706362-53706381 MsG0780038829.01.T01:CDS 35.0%
TCTTTGGATAATGCTAACCA+GGG - Chr7:53703912-53703931 MsG0780038829.01.T01:CDS 35.0%
TGAGCATATTAGAACAGGTA+AGG - Chr7:53706031-53706050 MsG0780038829.01.T01:CDS 35.0%
TGATGAAGTTCTTGAAGACT+GGG - Chr7:53705437-53705456 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
TGGTTTATCTACATGAAGGA+TGG - Chr7:53705850-53705869 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
TGTCACATGAATCAAGACAA+GGG - Chr7:53705613-53705632 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
TTACCTGTTCTAATATGCTC+AGG + Chr7:53706032-53706051 None:intergenic 35.0%
TTCGTAGCTAGTTATATTCC+AGG - Chr7:53704340-53704359 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
TTGATGAAGTTCTTGAAGAC+TGG - Chr7:53705436-53705455 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
TTGATTGTGTGTTTGAGTGT+TGG - Chr7:53706159-53706178 MsG0780038829.01.T01:CDS 35.0%
TTGGATTCTCATCTTCAACA+GGG - Chr7:53705205-53705224 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
TTGGTTAAGGAAGCAAAAAG+AGG - Chr7:53703938-53703957 MsG0780038829.01.T01:CDS 35.0%
TTTCTTCTTGAGGTTGTTTG+TGG - Chr7:53706089-53706108 MsG0780038829.01.T01:CDS 35.0%
! ACAAAGGGTTTCAGGTAAAA+GGG - Chr7:53705510-53705529 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
! ACTTTAGCTCCAATTAGTGT+TGG - Chr7:53705105-53705124 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
! AGCTGGATACCTAGATTTTA+TGG + Chr7:53704752-53704771 None:intergenic 35.0%
! ATATCTTGATGGTATTGCTG+AGG - Chr7:53704591-53704610 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
! GGTTTGGTTTATCTACATGA+AGG - Chr7:53705846-53705865 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
! TCTCTTTTCATTGCAGTGAA+CGG - Chr7:53703350-53703369 MsG0780038829.01.T01:CDS 35.0%
! TGGATAGAAAGCATATCCTA+TGG + Chr7:53704662-53704681 None:intergenic 35.0%
! TGTTCTTGGTTGGAGTTTTA+AGG - Chr7:53705248-53705267 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
! TTTTCTTCATGGAGGCAAAT+CGG + Chr7:53703852-53703871 None:intergenic 35.0%
!! AATTCAACCTCACTTTTGGT+TGG + Chr7:53705788-53705807 None:intergenic 35.0%
!! AGATGGATTATCTCGTTAAC+TGG + Chr7:53702853-53702872 None:intergenic 35.0%
!! CAAAGTTTTGCACTAGTTTC+AGG + Chr7:53702391-53702410 None:intergenic 35.0%
!! TATTGACTTGGTAGTGAATC+TGG + Chr7:53704823-53704842 None:intergenic 35.0%
!! TTTTGGTGCATTTCTTCTTG+AGG - Chr7:53706079-53706098 MsG0780038829.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTTGGCAGCAGATATTGT+TGG + Chr7:53705318-53705337 None:intergenic 35.0%
!!! GGTTGGAGTTTTAAGGTTAA+TGG - Chr7:53705255-53705274 MsG0780038829.01.T01:intron 35.0%
AAACTATGTGTCTGAAGAGG+TGG - Chr7:53706226-53706245 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
AACTTGAGGTTGCTGTGAAA+AGG - Chr7:53705589-53705608 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
AAGATGAATAGGGGTTGTGT+TGG + Chr7:53703477-53703496 None:intergenic 40.0%
AAGTTGTGCAGTATTTGGAG+AGG - Chr7:53706315-53706334 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
AATGATGAATGAATACGGGG+TGG + Chr7:53704136-53704155 None:intergenic 40.0%
ACTTGAGGTTGCTGTGAAAA+GGG - Chr7:53705590-53705609 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
AGATCTATACTCTGCCACAA+AGG - Chr7:53705494-53705513 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
AGATGAATAGGGGTTGTGTT+GGG + Chr7:53703476-53703495 None:intergenic 40.0%
AGCGAAGAAAAATCTGGCAA+AGG + Chr7:53706347-53706366 None:intergenic 40.0%
AGGTGGAGAAAGATGAATAG+GGG + Chr7:53703486-53703505 None:intergenic 40.0%
AGTTGTGCAGTATTTGGAGA+GGG - Chr7:53706316-53706335 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
ATACAAGACACGATTTGTCC+AGG + Chr7:53702708-53702727 None:intergenic 40.0%
ATAGTCAATCCATACCTGCA+TGG + Chr7:53705058-53705077 None:intergenic 40.0%
ATGAATCAAGACAAGGGATG+AGG - Chr7:53705619-53705638 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
ATTGTGTTGCCCATAGAAGA+AGG + Chr7:53706437-53706456 None:intergenic 40.0%
CAAAGGTTGTCAAAGTGGAT+GGG - Chr7:53702470-53702489 MsG0780038829.01.T01:CDS 40.0%
CCAATATAGTGTGGGTGATA+TGG - Chr7:53702790-53702809 MsG0780038829.01.T01:CDS 40.0%
CCACTATCAACTATCTCAGT+TGG + Chr7:53702523-53702542 None:intergenic 40.0%
CCATATCACCCACACTATAT+TGG + Chr7:53702793-53702812 None:intergenic 40.0%
CTCTTTAACAGTTCCAACCT+TGG - Chr7:53704850-53704869 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
CTTGTATACGAATCCTGAGT+AGG + Chr7:53702587-53702606 None:intergenic 40.0%
CTTTCTACTCCAATGGAGTT+AGG + Chr7:53703767-53703786 None:intergenic 40.0%
CTTTGGATAATGCTAACCAG+GGG - Chr7:53703913-53703932 MsG0780038829.01.T01:CDS 40.0%
GAAACCAAAGGTTGTCAAAG+TGG - Chr7:53702465-53702484 MsG0780038829.01.T01:CDS 40.0%
GAAGACTGGGAACATGAATA+TGG - Chr7:53705450-53705469 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
GAAGGTGGAGAAAGATGAAT+AGG + Chr7:53703488-53703507 None:intergenic 40.0%
GACAAACTATGTGTCTGAAG+AGG - Chr7:53706223-53706242 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
GAGACAAGTTGTGCAGTATT+TGG - Chr7:53706310-53706329 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
GAGCAATCTTTCTACTCCAA+TGG + Chr7:53703774-53703793 None:intergenic 40.0%
GATACCAAGTTCCAAACTTG+AGG - Chr7:53705575-53705594 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
GATCTATACTCTGCCACAAA+GGG - Chr7:53705495-53705514 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
GCCAAATCACGTTAGAAAAC+GGG - Chr7:53703584-53703603 MsG0780038829.01.T01:CDS 40.0%
GGCCAAATCACGTTAGAAAA+CGG - Chr7:53703583-53703602 MsG0780038829.01.T01:CDS 40.0%
GTCTTTGGATAATGCTAACC+AGG - Chr7:53703911-53703930 MsG0780038829.01.T01:CDS 40.0%
GTGTCACATGAATCAAGACA+AGG - Chr7:53705612-53705631 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
GTGTCGGAAATTGTTAGCAT+TGG - Chr7:53705648-53705667 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
GTGTTCACATTCAGAACCAA+TGG - Chr7:53706274-53706293 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
GTTGATACTGTTTCCAAGGT+TGG + Chr7:53704866-53704885 None:intergenic 40.0%
GTTGGATTCTCATCTTCAAC+AGG - Chr7:53705204-53705223 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
TAAACACAAGCACAAGCTTG+AGG + Chr7:53704489-53704508 None:intergenic 40.0%
TAGTCAATCCATACCTGCAT+GGG + Chr7:53705057-53705076 None:intergenic 40.0%
TCACTACCAAGTCAATACCT+TGG - Chr7:53704826-53704845 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
TGAATCAAGACAAGGGATGA+GGG - Chr7:53705620-53705639 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
TGCACAACTTGTCTCATACT+TGG + Chr7:53706305-53706324 None:intergenic 40.0%
TGGAACTGTTAAAGAGACCA+AGG + Chr7:53704846-53704865 None:intergenic 40.0%
TGTAGTAGAATCTCCTACTC+AGG - Chr7:53702571-53702590 MsG0780038829.01.T01:CDS 40.0%
TGTCCTACTAAGAAATGTCC+TGG + Chr7:53704361-53704380 None:intergenic 40.0%
TTGAGGTTGTTTGTGGTAGA+AGG - Chr7:53706096-53706115 MsG0780038829.01.T01:CDS 40.0%
TTTCACAGCAACCTCAAGTT+TGG + Chr7:53705589-53705608 None:intergenic 40.0%
! AATCGGTGGACAATTTGCTT+AGG + Chr7:53703835-53703854 None:intergenic 40.0%
! CAAAGGGTTTCAGGTAAAAG+GGG - Chr7:53705511-53705530 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
! CACAAAGGGTTTCAGGTAAA+AGG - Chr7:53705509-53705528 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
! CAGGTATGGATTGACTATGA+TGG - Chr7:53705060-53705079 MsG0780038829.01.T01:intron 40.0%
! CATGGTTGATACTGTTTCCA+AGG + Chr7:53704870-53704889 None:intergenic 40.0%
! CTCCAATTCAACCTCACTTT+TGG + Chr7:53705792-53705811 None:intergenic 40.0%
! CTTTTACCTGAAACCCTTTG+TGG + Chr7:53705511-53705530 None:intergenic 40.0%
! TCCCGTTTTCTAACGTGATT+TGG + Chr7:53703588-53703607 None:intergenic 40.0%
! TGATAATGAGCCATGCTAAC+CGG + Chr7:53704103-53704122 None:intergenic 40.0%
! TTTCTAACGTGATTTGGCCA+TGG + Chr7:53703582-53703601 None:intergenic 40.0%
!! AAGAGACCAAGGTATTGACT+TGG + Chr7:53704835-53704854 None:intergenic 40.0%
!! ATTGCTGATTCACTTCTCTC+CGG - Chr7:53706476-53706495 MsG0780038829.01.T01:CDS 40.0%
!! CCAACTGAGATAGTTGATAG+TGG - Chr7:53702520-53702539 MsG0780038829.01.T01:CDS 40.0%
!! GTGTTTGAGTGTTGGAAAAG+AGG - Chr7:53706167-53706186 MsG0780038829.01.T01:CDS 40.0%
!!! TGGGCACCAAGAATTTTTTG+AGG - Chr7:53706394-53706413 MsG0780038829.01.T01:CDS 40.0%
AACAGAGTTGAAGGGACTCA+TGG - Chr7:53702746-53702765 MsG0780038829.01.T01:CDS 45.0%
AGGGATGAGGGAATTTGTGT+CGG - Chr7:53705632-53705651 MsG0780038829.01.T01:intron 45.0%
ATGAATGAATACGGGGTGGA+GGG + Chr7:53704132-53704151 None:intergenic 45.0%
ATGAGTCCCTTCAACTCTGT+TGG + Chr7:53702747-53702766 None:intergenic 45.0%
ATGTCAGTCACAACCACCTT+AGG + Chr7:53702331-53702350 None:intergenic 45.0%
ATTCTTCACCCGAGTCTTGA+AGG + Chr7:53703506-53703525 None:intergenic 45.0%
CAAGCTCAACACCAAACACA+TGG + Chr7:53704888-53704907 None:intergenic 45.0%
CATGGGATATCCACTGGAAA+GGG + Chr7:53705040-53705059 None:intergenic 45.0%
CCAAAGGTTGTCAAAGTGGA+TGG - Chr7:53702469-53702488 MsG0780038829.01.T01:CDS 45.0%
CCAGTCAAATGAGTTGTGTG+AGG + Chr7:53705990-53706009 None:intergenic 45.0%
CCATCCACTTTGACAACCTT+TGG + Chr7:53702472-53702491 None:intergenic 45.0%
CCTCACACAACTCATTTGAC+TGG - Chr7:53705987-53706006 MsG0780038829.01.T01:intron 45.0%
CTCATACTTGGTCTAGCCAT+TGG + Chr7:53706293-53706312 None:intergenic 45.0%
CTTTCAAGGTTGCATGACCA+TGG - Chr7:53705957-53705976 MsG0780038829.01.T01:intron 45.0%
CTTTCTCCACCTTCAAGACT+CGG - Chr7:53703494-53703513 MsG0780038829.01.T01:CDS 45.0%
GCTCCTGAGCATATTAGAAC+AGG - Chr7:53706026-53706045 MsG0780038829.01.T01:CDS 45.0%
GGGTGATATGGGTACTTGTT+GGG - Chr7:53702802-53702821 MsG0780038829.01.T01:CDS 45.0%
GTTGTGTTGGGAGAAGAAGA+AGG + Chr7:53703464-53703483 None:intergenic 45.0%
TAAGGTGGTTGTGACTGACA+TGG - Chr7:53702330-53702349 MsG0780038829.01.T01:CDS 45.0%
TCAGCTAATTCAACTCCTGC+AGG - Chr7:53704979-53704998 MsG0780038829.01.T01:intron 45.0%
TCTAGGTATCCAGCTACATG+TGG - Chr7:53704757-53704776 MsG0780038829.01.T01:intron 45.0%
TGAGTCCCTTCAACTCTGTT+GGG + Chr7:53702746-53702765 None:intergenic 45.0%
TGGGTGATATGGGTACTTGT+TGG - Chr7:53702801-53702820 MsG0780038829.01.T01:CDS 45.0%
TTCAGGTAAAAGGGGCTACT+GGG - Chr7:53705519-53705538 MsG0780038829.01.T01:intron 45.0%
TTTCTCCACCTTCAAGACTC+GGG - Chr7:53703495-53703514 MsG0780038829.01.T01:CDS 45.0%
! ATAATGCTAACCAGGGGCAT+TGG - Chr7:53703919-53703938 MsG0780038829.01.T01:CDS 45.0%
! GCAACCTCAAGTTTGGAACT+TGG + Chr7:53705582-53705601 None:intergenic 45.0%
! GGATTTGGTCGAGTGTACAA+AGG - Chr7:53705549-53705568 MsG0780038829.01.T01:intron 45.0%
! TTTCAGGTAAAAGGGGCTAC+TGG - Chr7:53705518-53705537 MsG0780038829.01.T01:intron 45.0%
!! ATCATCAAAGGCGTTGCTTC+AGG - Chr7:53705825-53705844 MsG0780038829.01.T01:intron 45.0%
!! GTGGAGTTGGTGTTGAAACT+TGG - Chr7:53706245-53706264 MsG0780038829.01.T01:intron 45.0%
!! TTGTTAGCATTGGTCGCCTT+CGG - Chr7:53705658-53705677 MsG0780038829.01.T01:intron 45.0%
!!! AAAACAATTTTTTTTTTTTT+TGG + Chr7:53703693-53703712 None:intergenic 5.0%
ACTCTGCCACAAAGGGTTTC+AGG - Chr7:53705502-53705521 MsG0780038829.01.T01:intron 50.0%
AGAACCCCCAACAGAGTTGA+AGG - Chr7:53702737-53702756 MsG0780038829.01.T01:CDS 50.0%
AGGAGAAATTAGTGAGGGCC+TGG - Chr7:53702687-53702706 MsG0780038829.01.T01:CDS 50.0%
AGTCCCTTCAACTCTGTTGG+GGG + Chr7:53702744-53702763 None:intergenic 50.0%
GAACAAGATTCCTGTGCCGA+AGG + Chr7:53705677-53705696 None:intergenic 50.0%
GAACCCCCAACAGAGTTGAA+GGG - Chr7:53702738-53702757 MsG0780038829.01.T01:CDS 50.0%
GAGTCCCTTCAACTCTGTTG+GGG + Chr7:53702745-53702764 None:intergenic 50.0%
GATGAATGAATACGGGGTGG+AGG + Chr7:53704133-53704152 None:intergenic 50.0%
GCATGGGATATCCACTGGAA+AGG + Chr7:53705041-53705060 None:intergenic 50.0%
GTGGATATCCCATGCAGGTA+TGG - Chr7:53705046-53705065 MsG0780038829.01.T01:intron 50.0%
GTGTTGGGAGAAGAAGAAGG+AGG + Chr7:53703461-53703480 None:intergenic 50.0%
TAAAAGGGGCTACTGGGAGT+TGG - Chr7:53705525-53705544 MsG0780038829.01.T01:intron 50.0%
TACCTGCATGGGATATCCAC+TGG + Chr7:53705046-53705065 None:intergenic 50.0%
TATCCAGCTACATGTGGCCA+TGG - Chr7:53704763-53704782 MsG0780038829.01.T01:intron 50.0%
TCTTCATGGAGGCAAATCGG+TGG + Chr7:53703849-53703868 None:intergenic 50.0%
TGTGTCTGAAGAGGTGGAGT+TGG - Chr7:53706232-53706251 MsG0780038829.01.T01:intron 50.0%
TTCCAGTGGATATCCCATGC+AGG - Chr7:53705041-53705060 MsG0780038829.01.T01:intron 50.0%
TTGTGTGAGGATCAGCACCA+TGG + Chr7:53705977-53705996 None:intergenic 50.0%
!! CAAAGGCGTTGCTTCAGGTT+TGG - Chr7:53705830-53705849 MsG0780038829.01.T01:intron 50.0%
!! CTAACCAGGGGCATTGGTTA+AGG - Chr7:53703925-53703944 MsG0780038829.01.T01:CDS 50.0%
!! CTACTGGGAGTTGGTGGATT+TGG - Chr7:53705534-53705553 MsG0780038829.01.T01:intron 50.0%
CTTCACCCGAGTCTTGAAGG+TGG + Chr7:53703503-53703522 None:intergenic 55.0%
GCTTCCTTAACCAATGCCCC+TGG + Chr7:53703932-53703951 None:intergenic 55.0%
TGACTTCTTAACCGGTGCCC+CGG - Chr7:53704073-53704092 MsG0780038829.01.T01:CDS 55.0%
! GCTGATTCACTTCTCTCCGG+TGG - Chr7:53706479-53706498 MsG0780038829.01.T01:CDS 55.0%
AAGGGGCTACTGGGAGTTGG+TGG - Chr7:53705528-53705547 MsG0780038829.01.T01:intron 60.0%
AGCCATGCTAACCGGTGTCC+CGG + Chr7:53704095-53704114 None:intergenic 60.0%
AGGCCATGGCCACATGTAGC+TGG + Chr7:53704769-53704788 None:intergenic 60.0%
GACTTCTTAACCGGTGCCCC+GGG - Chr7:53704074-53704093 MsG0780038829.01.T01:CDS 60.0%
CCATGCTAACCGGTGTCCCG+GGG + Chr7:53704093-53704112 None:intergenic 65.0%
GCCATGCTAACCGGTGTCCC+GGG + Chr7:53704094-53704113 None:intergenic 65.0%
! GCATTGGTCGCCTTCGGCAC+AGG - Chr7:53705664-53705683 MsG0780038829.01.T01:intron 65.0%
TAACCGGTGCCCCGGGACAC+CGG - Chr7:53704081-53704100 MsG0780038829.01.T01:CDS 70.0%
TAACCGGTGTCCCGGGGCAC+CGG + Chr7:53704087-53704106 None:intergenic 70.0%
! CCCCGGGACACCGGTTAGCA+TGG - Chr7:53704090-53704109 MsG0780038829.01.T01:CDS 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 53702325 53706508 53702325 ID=MsG0780038829.01;Name=MsG0780038829.01
Chr7 mRNA 53702325 53706508 53702325 ID=MsG0780038829.01.T01;Parent=MsG0780038829.01;Name=MsG0780038829.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.49;_QI=0|0|0|1|1|1|5|0|700
Chr7 exon 53706320 53706508 53706320 ID=MsG0780038829.01.T01:exon:10121;Parent=MsG0780038829.01.T01
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Chr7 exon 53703310 53704297 53703310 ID=MsG0780038829.01.T01:exon:10119;Parent=MsG0780038829.01.T01
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Chr7 CDS 53702325 53702868 53702325 ID=MsG0780038829.01.T01:cds;Parent=MsG0780038829.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780038829.01.T01

ATGCCTAAGGTGGTTGTGACTGACATGGATACAACTTTGATGAAAGCGGTAGCAACTATTCTCCCTGAAACTAGTGCAAAACTTTGTTATTTTCATGTTGGTAGAAATGTTAGAGCAAAATGCCTAACATACTGTAGAGTGAAACCAAAGGTTGTCAAAGTGGATGGGAAAGAGAAGATTTTCAACAAGTTTCGAGTTATTTGTAAAATATTTCCAAAATTTCTTGACTATCAAAGTACAATTTTGGATATTGTTAAGGAGAAATTAGTGAGGGCCTGGACAAATCGTGTCTTGTATCTTGGGTGCAGAACCCCCAACAGAGTTGAAGGGACTCATGGTAGAATCAAGAAATATTTGAGCCAATATAGTGTGGGTGATATGGCAAGTGAAGAAAACAGTTTCATCTATAAATACAATGGATTCCATTCATCACATTTATATCTTGATGGTATTGCTGAGGTAAACTCAAATGGCTTACTAAGACTCACCAATGATACAGAAAGAGCCATAGGATATGCTTTCTATCCAAATCCAATAGTTTTCAAAAACACTTCCAATGGAAGTGTTTCTTCTTTCTCAACTACTTTTGTATTTGCCATAAAATCTAGGTATCCAGCTACATGTGGCCATGGCCTTGTTTTTGTTGTTTCATCTACAAAAGGGCTACCAGATTCACTACCAAGTCAATACCTTGGTCTCTTTAACAGTTCCAACCTTGGAAACAGTATCAACCATGTGTTTGGTGTTGAGCTTGACACTGTTCAAGATATTGAGCTTGATGATATCAATGATAACCATGTTGGTATTGATATCAATGATTTGAGATCAGCTAATTCAACTCCTGCAGGATATTATGATGATTATGATCGTCTCAAGAATTTATCCCTTTCCAGTGGATATCCCATGCAGGTATGGATTGACTATGATGGAGTGAAGAAAAAGATTGATGTTACTTTAGCTCCAATTAGTGTTGGTTTTAATAATAAACCAACACGACCTTTGTTATCATTGACCAAAGATCTTTCTACAATTTTCAACAATAGAATGTATGTTGGATTCTCATCTTCAACAGGGTTAATTTTAGCTTCTCATTATGTTCTTGGTTGGAGTTTTAAGGTTAATGGTCAAGCTCAAAACCTTGAAATCTCTGAGCTTAATGAGCCAACAATATCTGCTGCCAAAAAAAAGTCAAAATTTTTAACTGTTGGGTTACCTTTGATTTTGCTAAGTTTGATATTCATGATAACTTTAGGGGTTATGTATTATATCAAATTGAAGAAGTTTGATGAAGTTCTTGAAGACTGGGAACATGAATATGGCCCACATAGATTTAAGTTCAAAGATCTATACTCTGCCACAAAGGGTTTCAGGGTGTCACATGAATCAAGACAAGGGATGAGGGAATTTGTGTCGGAAATTGTTAGCATTGGTCGCCTTCGGCACAGGAATCTTGTTCATCTTCATGGCTATTGTAGACGAAAAAACGAGTTACTTTTGGTTTATGATTACATGCCGAATGCAAGTTTAGACAACTATCTATATAACCAACCAAAAGTGAGGTTGCATGACCATGGTGCTGATCCTCACACAACTCATTTGACTGGAACTATTGGTTATCTTGCTCCTGAGCATATTAGAACAGGTAAGGCTACTAAATTTTCTGATGTGTTTTCTTTTGGTGCATTTCTTCTTGAGGTTGTTTGTGGTAGAAGGACTATTGATAATGTAGGGGAAAATGAAAGTGTAATTTTGGTTGATTGTGTGTTTGAGTGTTGGAAAAGAGGTGATATTCTTGAGGCAAAAGATGTAAATTTGGGGACAAACTATGTGTCTGAAGAGGTGGAGTTGGTGTTGAAACTTGGTTTGTTGTGTTCACATTCAGAACCAATGGCTAGACCAAGTATGAGACAAGTTGTGCAGTATTTGGAGAGGGATACACCTTTGCCAGATTTTTCTTCGCTTAGTTTATCTTCTTCTGGTTTAACTTTTGGGCACCAAGAATTTTTTGAGGACTTTCCTTTGTCTTATCCTTCTTCTATGGGCAACACAATGTCACAAACTTCTGTGTCTATTGCTGATTCACTTCTCTCCGGTGGTCGTTAG

Protein sequence

>MsG0780038829.01.T01

MPKVVVTDMDTTLMKAVATILPETSAKLCYFHVGRNVRAKCLTYCRVKPKVVKVDGKEKIFNKFRVICKIFPKFLDYQSTILDIVKEKLVRAWTNRVLYLGCRTPNRVEGTHGRIKKYLSQYSVGDMASEENSFIYKYNGFHSSHLYLDGIAEVNSNGLLRLTNDTERAIGYAFYPNPIVFKNTSNGSVSSFSTTFVFAIKSRYPATCGHGLVFVVSSTKGLPDSLPSQYLGLFNSSNLGNSINHVFGVELDTVQDIELDDINDNHVGIDINDLRSANSTPAGYYDDYDRLKNLSLSSGYPMQVWIDYDGVKKKIDVTLAPISVGFNNKPTRPLLSLTKDLSTIFNNRMYVGFSSSTGLILASHYVLGWSFKVNGQAQNLEISELNEPTISAAKKKSKFLTVGLPLILLSLIFMITLGVMYYIKLKKFDEVLEDWEHEYGPHRFKFKDLYSATKGFRVSHESRQGMREFVSEIVSIGRLRHRNLVHLHGYCRRKNELLLVYDYMPNASLDNYLYNQPKVRLHDHGADPHTTHLTGTIGYLAPEHIRTGKATKFSDVFSFGAFLLEVVCGRRTIDNVGENESVILVDCVFECWKRGDILEAKDVNLGTNYVSEEVELVLKLGLLCSHSEPMARPSMRQVVQYLERDTPLPDFSSLSLSSSGLTFGHQEFFEDFPLSYPSSMGNTMSQTSVSIADSLLSGGR*